View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7033_low_1 (Length: 597)

Name: NF7033_low_1
Description: NF7033
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7033_low_1
NF7033_low_1
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-578)||(109540-110117)
scaffold0029 (1-543)||(95731-96273)
scaffold0029 (2-578)||(112559-113135)
[»] chr7 (65 HSPs)
chr7 (1-578)||(18177700-18178277)
chr7 (1-578)||(15160792-15161369)
chr7 (1-578)||(8198586-8199163)
chr7 (1-578)||(11236948-11237525)
chr7 (1-578)||(10870953-10871530)
chr7 (1-578)||(44791086-44791663)
chr7 (17-577)||(23516520-23517080)
chr7 (1-578)||(13686021-13686599)
chr7 (1-578)||(8707563-8708140)
chr7 (1-578)||(11552837-11553414)
chr7 (1-578)||(18551493-18552070)
chr7 (1-578)||(14332355-14332932)
chr7 (1-578)||(12687459-12688036)
chr7 (1-578)||(14954578-14955155)
chr7 (1-578)||(17051-17628)
chr7 (5-578)||(15154396-15154964)
chr7 (1-357)||(9596236-9596592)
chr7 (25-578)||(15203837-15204390)
chr7 (5-543)||(15624545-15625083)
chr7 (1-578)||(15102316-15102891)
chr7 (5-578)||(12206517-12207090)
chr7 (9-578)||(19147170-19147739)
chr7 (9-578)||(20746569-20747138)
chr7 (5-578)||(14263961-14264534)
chr7 (74-432)||(35964658-35965016)
chr7 (1-578)||(11388141-11388717)
chr7 (5-578)||(16072011-16072584)
chr7 (5-567)||(21661933-21662492)
chr7 (251-578)||(14037765-14038092)
chr7 (251-578)||(14347795-14348122)
chr7 (2-578)||(16950185-16950761)
chr7 (5-387)||(11771980-11772362)
chr7 (1-578)||(6413470-6414047)
chr7 (1-578)||(13665512-13666073)
chr7 (8-578)||(14286096-14286666)
chr7 (1-578)||(18053666-18054243)
chr7 (1-578)||(11305976-11306553)
chr7 (5-246)||(14039986-14040227)
chr7 (1-578)||(14129832-14130409)
chr7 (5-246)||(14350016-14350257)
chr7 (1-578)||(8211841-8212418)
chr7 (1-578)||(14433650-14434227)
chr7 (1-482)||(23199456-23199937)
chr7 (1-482)||(23505583-23506064)
chr7 (2-578)||(13021316-13021892)
chr7 (5-578)||(49152260-49152833)
chr7 (74-574)||(1193-1693)
chr7 (2-578)||(12455662-12456237)
chr7 (1-482)||(26118318-26118799)
chr7 (131-440)||(14936443-14936752)
chr7 (98-376)||(12456940-12457218)
chr7 (1-381)||(15340587-15340967)
chr7 (1-246)||(13968381-13968626)
chr7 (297-453)||(4440011-4440167)
chr7 (314-570)||(26288063-26288318)
chr7 (163-405)||(12368473-12368715)
chr7 (131-453)||(7823983-7824305)
chr7 (131-453)||(27107639-27107961)
chr7 (131-440)||(15364036-15364345)
chr7 (131-453)||(21674398-21674720)
chr7 (131-350)||(12193742-12193961)
chr7 (459-578)||(15340455-15340574)
chr7 (164-447)||(41044-41327)
chr7 (131-249)||(45146842-45146960)
chr7 (297-438)||(13378796-13378937)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (4-578)||(14266368-14266942)
chr4 (1-578)||(8386381-8386958)
chr4 (1-578)||(19778259-19778836)
chr4 (1-578)||(18297174-18297751)
chr4 (1-578)||(29038870-29039447)
chr4 (4-578)||(40473009-40473583)
chr4 (1-578)||(14303444-14304020)
chr4 (1-578)||(12476569-12477146)
chr4 (1-578)||(12523645-12524222)
chr4 (1-578)||(27711305-27711882)
chr4 (1-578)||(23955716-23956293)
chr4 (1-578)||(8053089-8053666)
chr4 (1-578)||(14680536-14681113)
chr4 (1-578)||(18226912-18227489)
chr4 (1-578)||(16251911-16252488)
chr4 (5-578)||(16354915-16355488)
chr4 (5-578)||(7090402-7090974)
chr4 (5-578)||(14850836-14851409)
chr4 (98-578)||(14159461-14159941)
chr4 (101-578)||(14652277-14652754)
chr4 (1-408)||(1639891-1640298)
chr4 (5-578)||(15003094-15003667)
chr4 (5-274)||(15147354-15147623)
chr4 (269-578)||(15149740-15150049)
chr4 (353-578)||(15364355-15364580)
chr4 (98-578)||(15070382-15070862)
chr4 (1-578)||(1649003-1649580)
chr4 (1-578)||(16145881-16146460)
chr4 (1-578)||(15245893-15246470)
chr4 (1-578)||(11206957-11207534)
chr4 (1-578)||(3264520-3265097)
chr4 (8-471)||(27900462-27900925)
chr4 (5-387)||(8706078-8706460)
chr4 (1-578)||(20890952-20891528)
chr4 (1-578)||(33222887-33223469)
chr4 (1-578)||(29453263-29453840)
chr4 (1-480)||(15358816-15359295)
chr4 (5-407)||(15414756-15415158)
chr4 (92-578)||(51605998-51606484)
chr4 (5-357)||(15077825-15078177)
chr4 (249-412)||(16676417-16676580)
chr4 (5-578)||(44661596-44662169)
chr4 (131-378)||(13247814-13248061)
chr4 (427-578)||(14927151-14927302)
chr4 (131-453)||(15293013-15293335)
chr4 (131-453)||(55375214-55375536)
chr4 (132-453)||(9290929-9291250)
chr4 (314-471)||(16752669-16752826)
chr4 (131-453)||(14997410-14997732)
chr4 (347-578)||(42702872-42703103)
chr4 (158-440)||(12132293-12132574)
chr4 (131-380)||(12342719-12342968)
chr4 (418-560)||(18164332-18164474)
chr4 (528-578)||(18607823-18607873)
chr4 (297-453)||(16445234-16445390)
chr4 (5-47)||(14159970-14160012)
chr4 (510-578)||(15415214-15415282)
chr4 (5-96)||(14691353-14691444)
chr4 (5-51)||(15319647-15319693)
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (1-578)||(16350397-16350974)
chr1 (1-578)||(21830287-21830864)
chr1 (1-578)||(51333291-51333868)
chr1 (1-578)||(19106351-19106928)
chr1 (1-578)||(33390827-33391404)
chr1 (1-578)||(41354267-41354844)
chr1 (1-578)||(21836934-21837511)
chr1 (1-578)||(17044813-17045390)
chr1 (1-578)||(16078450-16079008)
chr1 (5-578)||(50620046-50620619)
chr1 (35-578)||(20249834-20250377)
chr1 (36-578)||(20136762-20137304)
chr1 (17-578)||(19760680-19761241)
chr1 (5-578)||(16369281-16369854)
chr1 (154-578)||(21747519-21747942)
chr1 (5-578)||(19854298-19854870)
chr1 (74-578)||(20939934-20940438)
chr1 (1-578)||(22432914-22433491)
chr1 (1-543)||(20835686-20836231)
chr1 (1-578)||(20294396-20294973)
chr1 (1-578)||(20856559-20857136)
chr1 (5-480)||(41307907-41308382)
chr1 (272-578)||(19664945-19665251)
chr1 (1-578)||(37677063-37677641)
chr1 (161-578)||(31550139-31550556)
chr1 (389-578)||(50612602-50612791)
chr1 (325-578)||(20244184-20244437)
chr1 (5-147)||(21749356-21749498)
chr1 (464-578)||(21163264-21163378)
chr1 (314-482)||(11382674-11382842)
chr1 (314-578)||(20075170-20075434)
chr1 (2-177)||(24099402-24099577)
chr1 (131-453)||(20831320-20831642)
chr1 (5-126)||(22362046-22362167)
chr1 (92-210)||(19663025-19663143)
chr1 (134-453)||(20914319-20914638)
chr1 (131-401)||(22135486-22135756)
chr1 (404-578)||(20395194-20395368)
chr1 (1-51)||(19662939-19662989)
chr1 (287-440)||(21202371-21202524)
chr1 (14-126)||(31539808-31539920)
chr1 (279-453)||(46518830-46519004)
[»] chr5 (66 HSPs)
chr5 (1-578)||(27668398-27668975)
chr5 (1-578)||(14999647-15000224)
chr5 (1-578)||(19769861-19770438)
chr5 (1-578)||(22332795-22333372)
chr5 (1-578)||(34566395-34566972)
chr5 (1-578)||(40708681-40709258)
chr5 (1-578)||(16356403-16356980)
chr5 (1-578)||(27685308-27685885)
chr5 (1-578)||(27518308-27518885)
chr5 (1-578)||(29475981-29476558)
chr5 (1-578)||(41770743-41771320)
chr5 (1-576)||(37291404-37291979)
chr5 (1-578)||(22134569-22135146)
chr5 (1-578)||(27610255-27610832)
chr5 (1-578)||(22348326-22348901)
chr5 (5-578)||(23573643-23574216)
chr5 (5-578)||(23440126-23440699)
chr5 (1-578)||(18775678-18776248)
chr5 (5-577)||(23516443-23517015)
chr5 (5-578)||(20798661-20799234)
chr5 (5-578)||(25423090-25423663)
chr5 (36-578)||(21984248-21984790)
chr5 (5-578)||(26738617-26739190)
chr5 (5-578)||(20468008-20468581)
chr5 (5-536)||(21497948-21498479)
chr5 (5-403)||(21339198-21339596)
chr5 (5-578)||(23471130-23471703)
chr5 (2-578)||(24749463-24750039)
chr5 (4-578)||(23080000-23080574)
chr5 (5-578)||(21890671-21891244)
chr5 (5-578)||(22235832-22236405)
chr5 (1-578)||(22381082-22381659)
chr5 (2-543)||(28923677-28924218)
chr5 (1-578)||(22461835-22462412)
chr5 (1-578)||(22502562-22503139)
chr5 (8-543)||(20821371-20821906)
chr5 (2-543)||(28894851-28895392)
chr5 (140-578)||(24735658-24736096)
chr5 (1-578)||(20342165-20342742)
chr5 (16-578)||(21404737-21405285)
chr5 (1-543)||(20773678-20774219)
chr5 (1-578)||(25847958-25848535)
chr5 (1-578)||(37545404-37545982)
chr5 (5-578)||(21563885-21564451)
chr5 (19-482)||(17269259-17269722)
chr5 (5-578)||(14886903-14887476)
chr5 (14-578)||(24798318-24798882)
chr5 (272-578)||(23442472-23442778)
chr5 (320-578)||(24737012-24737270)
chr5 (374-578)||(20573422-20573626)
chr5 (72-348)||(21831722-21831998)
chr5 (401-578)||(21343666-21343843)
chr5 (1-215)||(936-1150)
chr5 (131-453)||(11210732-11211054)
chr5 (131-453)||(24581219-24581541)
chr5 (350-578)||(21662297-21662524)
chr5 (350-578)||(21665758-21665985)
chr5 (2-197)||(28916322-28916517)
chr5 (131-453)||(21937226-21937548)
chr5 (131-453)||(27011092-27011414)
chr5 (2-144)||(24716435-24716577)
chr5 (2-138)||(24620204-24620340)
chr5 (163-378)||(23503526-23503741)
chr5 (149-228)||(21229229-21229308)
chr5 (116-186)||(21680429-21680499)
chr5 (72-138)||(21496481-21496547)
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (1-578)||(17674192-17674769)
chr8 (1-578)||(19112725-19113302)
chr8 (1-578)||(19485039-19485616)
chr8 (1-578)||(20017919-20018496)
chr8 (1-578)||(22120343-22120920)
chr8 (1-578)||(15533415-15533992)
chr8 (1-578)||(30313313-30313890)
chr8 (1-578)||(22133210-22133787)
chr8 (1-578)||(32600179-32600756)
chr8 (5-575)||(16408218-16408788)
chr8 (1-578)||(22046408-22046985)
chr8 (5-578)||(19978002-19978575)
chr8 (1-578)||(22164361-22164937)
chr8 (5-570)||(21166710-21167275)
chr8 (5-578)||(23650076-23650649)
chr8 (5-578)||(21921908-21922481)
chr8 (5-578)||(21250977-21251549)
chr8 (5-578)||(21788532-21789104)
chr8 (5-578)||(21394038-21394611)
chr8 (1-337)||(18856853-18857189)
chr8 (5-578)||(22987236-22987809)
chr8 (1-310)||(22040162-22040471)
chr8 (14-575)||(20396307-20396868)
chr8 (5-458)||(22377627-22378079)
chr8 (5-458)||(22383802-22384254)
chr8 (5-375)||(23949158-23949527)
chr8 (8-576)||(19851448-19852016)
chr8 (8-576)||(19857484-19858052)
chr8 (5-578)||(20388134-20388707)
chr8 (5-578)||(1266274-1266846)
chr8 (1-578)||(22061602-22062179)
chr8 (1-578)||(23654962-23655539)
chr8 (15-578)||(20010083-20010646)
chr8 (2-578)||(31416644-31417220)
chr8 (5-578)||(21840452-21841025)
chr8 (306-578)||(22032067-22032339)
chr8 (1-578)||(29303595-29304172)
chr8 (1-578)||(31571011-31571588)
chr8 (1-578)||(14565177-14565754)
chr8 (1-578)||(6603693-6604270)
chr8 (1-578)||(6679146-6679723)
chr8 (218-579)||(21681856-21682217)
chr8 (5-468)||(22051008-22051471)
chr8 (1-578)||(12304793-12305370)
chr8 (200-578)||(20007885-20008263)
chr8 (1-578)||(803842-804419)
chr8 (227-578)||(21324804-21325156)
chr8 (340-578)||(23948924-23949162)
chr8 (374-578)||(15441216-15441420)
chr8 (1-243)||(20975820-20976062)
chr8 (341-578)||(16265127-16265364)
chr8 (131-453)||(21196801-21197123)
chr8 (131-453)||(16877394-16877716)
chr8 (131-440)||(22315364-22315673)
chr8 (134-453)||(20652635-20652954)
chr8 (1-246)||(16271393-16271638)
chr8 (338-578)||(28982392-28982632)
chr8 (338-578)||(28987612-28987852)
chr8 (403-578)||(27347261-27347436)
chr8 (131-453)||(21850636-21850958)
chr8 (5-182)||(22371371-22371548)
chr8 (131-453)||(22982596-22982916)
chr8 (131-249)||(23157310-23157428)
chr8 (1-126)||(27355035-27355160)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (1-578)||(15589357-15589934)
chr3 (1-578)||(20062019-20062596)
chr3 (1-578)||(10005188-10005765)
chr3 (1-578)||(15724899-15725475)
chr3 (1-578)||(16635361-16635938)
chr3 (1-578)||(43162685-43163262)
chr3 (1-578)||(53384983-53385560)
chr3 (1-578)||(10905798-10906375)
chr3 (1-578)||(48425035-48425612)
chr3 (1-578)||(15348210-15348787)
chr3 (1-578)||(15402475-15403052)
chr3 (5-578)||(26792368-26792941)
chr3 (1-578)||(13252278-13252855)
chr3 (9-578)||(15338857-15339426)
chr3 (1-578)||(16756550-16757127)
chr3 (1-578)||(16412247-16412824)
chr3 (1-578)||(5424895-5425471)
chr3 (1-578)||(12497836-12498413)
chr3 (1-578)||(6600335-6600901)
chr3 (1-578)||(14876464-14877041)
chr3 (5-578)||(16806895-16807468)
chr3 (5-578)||(17489438-17490011)
chr3 (1-578)||(16691748-16692325)
chr3 (5-578)||(16371001-16371574)
chr3 (5-578)||(16492150-16492723)
chr3 (5-578)||(9522307-9522880)
chr3 (5-578)||(15208479-15209052)
chr3 (5-578)||(15247735-15248308)
chr3 (5-578)||(15227247-15227820)
chr3 (1-578)||(18134300-18134877)
chr3 (1-578)||(13322606-13323183)
chr3 (2-543)||(13972075-13972616)
chr3 (1-578)||(12360496-12361073)
chr3 (1-578)||(15952922-15953499)
chr3 (2-578)||(14086271-14086847)
chr3 (1-578)||(8759036-8759613)
chr3 (8-543)||(10420006-10420541)
chr3 (1-578)||(13941622-13942199)
chr3 (74-423)||(15015782-15016131)
chr3 (1-578)||(41177120-41177697)
chr3 (5-543)||(12850237-12850775)
chr3 (1-578)||(10383567-10384144)
chr3 (2-578)||(11303728-11304304)
chr3 (1-207)||(11564646-11564852)
chr3 (5-578)||(11960992-11961565)
chr3 (5-186)||(14126563-14126744)
chr3 (1-482)||(16836464-16836945)
chr3 (5-578)||(47123542-47124115)
chr3 (2-482)||(44776941-44777421)
chr3 (1-578)||(16329615-16330190)
chr3 (1-482)||(16380882-16381362)
chr3 (2-243)||(17492563-17492804)
chr3 (314-576)||(14571448-14571710)
chr3 (1-216)||(14573889-14574104)
chr3 (1-249)||(4678365-4678613)
chr3 (5-145)||(15061777-15061917)
chr3 (14-285)||(13001800-13002070)
chr3 (131-453)||(8274494-8274816)
chr3 (1-249)||(28754245-28754493)
chr3 (1-243)||(26008947-26009189)
chr3 (131-453)||(16742798-16743120)
chr3 (132-453)||(15576473-15576794)
chr3 (149-405)||(17192865-17193121)
chr3 (163-440)||(18748401-18748678)
chr3 (131-453)||(13975141-13975462)
chr3 (131-303)||(14183007-14183179)
chr3 (133-380)||(6712506-6712753)
chr3 (1-126)||(16338466-16338591)
chr3 (491-578)||(31689067-31689154)
chr3 (491-578)||(31945070-31945157)
chr3 (131-237)||(6152946-6153052)
chr3 (1-51)||(16828156-16828206)
[»] chr6 (74 HSPs)
chr6 (1-578)||(27187269-27187846)
chr6 (1-578)||(27261394-27261971)
chr6 (1-578)||(28263068-28263645)
chr6 (1-578)||(28341817-28342394)
chr6 (1-578)||(2874674-2875251)
chr6 (1-578)||(25112385-25112962)
chr6 (1-578)||(29591791-29592368)
chr6 (1-578)||(24313039-24313616)
chr6 (1-578)||(28292243-28292820)
chr6 (1-578)||(1542955-1543532)
chr6 (9-578)||(16626596-16627165)
chr6 (5-578)||(19864520-19865093)
chr6 (5-578)||(5839094-5839667)
chr6 (111-578)||(12497859-12498326)
chr6 (111-578)||(12510575-12511042)
chr6 (5-578)||(25609736-25610309)
chr6 (5-578)||(27331308-27331881)
chr6 (5-578)||(27392048-27392621)
chr6 (5-578)||(18407817-18408391)
chr6 (5-578)||(16927515-16928088)
chr6 (5-578)||(16963242-16963815)
chr6 (111-578)||(12505188-12505655)
chr6 (5-578)||(22078565-22079136)
chr6 (5-578)||(22762330-22762903)
chr6 (5-578)||(23078302-23078875)
chr6 (152-578)||(25765312-25765737)
chr6 (5-351)||(22433929-22434275)
chr6 (14-543)||(15459204-15459733)
chr6 (5-578)||(25768024-25768597)
chr6 (5-578)||(21471434-21472007)
chr6 (93-578)||(8766111-8766596)
chr6 (2-578)||(19879131-19879707)
chr6 (1-532)||(17415365-17415896)
chr6 (1-578)||(21564003-21564580)
chr6 (1-578)||(10468720-10469297)
chr6 (321-578)||(21833172-21833429)
chr6 (5-468)||(1640715-1641178)
chr6 (1-519)||(14381338-14381856)
chr6 (1-205)||(17032589-17032793)
chr6 (2-561)||(11280377-11280936)
chr6 (391-578)||(17032395-17032582)
chr6 (5-578)||(22796507-22797080)
chr6 (1-578)||(27560488-27561065)
chr6 (191-578)||(18197608-18197995)
chr6 (2-543)||(34645458-34645999)
chr6 (92-543)||(18794558-18795009)
chr6 (1-482)||(28282684-28283165)
chr6 (1-578)||(24364245-24364822)
chr6 (314-578)||(14131363-14131627)
chr6 (92-480)||(18800873-18801261)
chr6 (320-578)||(25750642-25750900)
chr6 (212-561)||(11287680-11288029)
chr6 (1-318)||(19453513-19453830)
chr6 (305-405)||(11291818-11291918)
chr6 (131-453)||(15078365-15078687)
chr6 (131-453)||(16098008-16098330)
chr6 (131-453)||(25743089-25743410)
chr6 (131-453)||(16382374-16382696)
chr6 (484-578)||(22433830-22433924)
chr6 (131-453)||(23996206-23996528)
chr6 (1-233)||(5297077-5297308)
chr6 (333-449)||(25750908-25751024)
chr6 (1-228)||(27559859-27560086)
chr6 (131-440)||(21412939-21413248)
chr6 (132-440)||(1648786-1649094)
chr6 (140-378)||(18571684-18571922)
chr6 (134-453)||(18837912-18838231)
chr6 (133-438)||(25655456-25655760)
chr6 (149-378)||(16233242-16233471)
chr6 (490-578)||(18787721-18787809)
chr6 (1-125)||(21569862-21569986)
chr6 (500-576)||(1640634-1640710)
chr6 (131-210)||(1652274-1652353)
chr6 (1-51)||(8762804-8762854)
[»] chr2 (59 HSPs)
chr2 (1-578)||(9609736-9610313)
chr2 (1-578)||(16981752-16982329)
chr2 (1-578)||(16998600-16999177)
chr2 (1-578)||(17063317-17063894)
chr2 (1-578)||(24261970-24262547)
chr2 (1-578)||(27217616-27218193)
chr2 (1-578)||(22325122-22325699)
chr2 (1-578)||(10868450-10869027)
chr2 (1-578)||(44385835-44386412)
chr2 (1-578)||(24709633-24710210)
chr2 (1-578)||(27370869-27371446)
chr2 (1-578)||(17066978-17067552)
chr2 (61-578)||(16924860-16925377)
chr2 (1-578)||(21145307-21145873)
chr2 (61-578)||(24878321-24878838)
chr2 (5-578)||(24675089-24675662)
chr2 (5-578)||(24707752-24708325)
chr2 (5-578)||(21325536-21326109)
chr2 (2-578)||(23188608-23189183)
chr2 (5-578)||(22756735-22757306)
chr2 (5-578)||(23063677-23064250)
chr2 (1-283)||(41608651-41608933)
chr2 (5-520)||(24825552-24826067)
chr2 (5-578)||(30211187-30211760)
chr2 (17-578)||(23087050-23087611)
chr2 (5-574)||(45529121-45529684)
chr2 (1-578)||(23276376-23276953)
chr2 (1-578)||(23293558-23294135)
chr2 (2-578)||(27365346-27365922)
chr2 (1-578)||(11358140-11358717)
chr2 (1-578)||(20832585-20833162)
chr2 (305-578)||(23138637-23138910)
chr2 (305-578)||(23550427-23550700)
chr2 (365-578)||(27377101-27377314)
chr2 (1-578)||(27787341-27787918)
chr2 (5-578)||(31830258-31830831)
chr2 (1-482)||(12574049-12574530)
chr2 (438-578)||(41609047-41609187)
chr2 (1-578)||(1063351-1063928)
chr2 (1-243)||(19652318-19652557)
chr2 (338-577)||(24653946-24654185)
chr2 (131-439)||(22276018-22276326)
chr2 (134-401)||(23817452-23817719)
chr2 (409-578)||(24944967-24945136)
chr2 (131-453)||(12640315-12640637)
chr2 (134-453)||(24831586-24831905)
chr2 (131-405)||(22761965-22762239)
chr2 (1-203)||(24948564-24948766)
chr2 (1-210)||(20828227-20828436)
chr2 (131-440)||(24570064-24570373)
chr2 (132-351)||(25128474-25128693)
chr2 (1-51)||(16923016-16923066)
chr2 (297-351)||(27368394-27368448)
chr2 (1-64)||(24877015-24877078)
chr2 (1-51)||(20442779-20442829)
chr2 (1-51)||(16925487-16925537)
chr2 (517-578)||(24833355-24833416)
chr2 (131-207)||(23890753-23890829)
chr2 (1-51)||(24641869-24641919)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-578)||(620-1197)
scaffold0044 (4-578)||(14360-14934)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-578)||(6937-7516)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (1-578)||(43154-43731)
scaffold0028 (1-578)||(8485-9051)
scaffold0028 (2-284)||(15241-15512)
scaffold0028 (2-543)||(50244-50785)
scaffold0028 (281-412)||(13832-13963)
scaffold0028 (131-453)||(106432-106754)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (1-578)||(414-991)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-578)||(7377-7943)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (1-578)||(65405-65982)
scaffold0042 (5-359)||(39553-39906)
scaffold0042 (409-578)||(39926-40095)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-578)||(33302-33879)
scaffold0109 (1-578)||(8596-9173)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (8-578)||(278566-279136)
scaffold0005 (256-578)||(308659-308981)
scaffold0005 (101-578)||(164538-165015)
scaffold0005 (1-578)||(260308-260885)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (1-578)||(4134-4711)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (1-456)||(7519-7974)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (1-514)||(7854-8367)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (5-578)||(6372-6945)
scaffold0403 (1-216)||(3153-3368)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (5-578)||(63764-64337)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (5-578)||(6023-6596)
scaffold0120 (1-578)||(1253-1830)
scaffold0120 (192-453)||(22819-23080)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (5-578)||(556-1128)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (5-578)||(676-1249)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (5-578)||(6014-6587)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (1-513)||(21932-22444)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (5-578)||(14039-14612)
scaffold0106 (1-360)||(17660-18018)
scaffold0106 (1-578)||(31410-31987)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (9-578)||(431-999)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (120-477)||(628-985)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (5-570)||(5229-5794)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (5-578)||(9343-9916)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (5-578)||(229043-229616)
scaffold0012 (5-578)||(219150-219723)
scaffold0012 (131-453)||(32856-33176)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (5-578)||(180217-180772)
scaffold0020 (1-184)||(101281-101464)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (77-578)||(1139-1640)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (5-578)||(32485-33058)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (5-578)||(126932-127505)
scaffold0022 (5-97)||(80227-80319)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (5-578)||(14812-15385)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (5-565)||(49506-50066)
scaffold0081 (5-51)||(19129-19175)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (5-578)||(112021-112594)
scaffold0004 (5-578)||(203201-203774)
scaffold0004 (1-578)||(322704-323281)
scaffold0004 (5-578)||(117568-118141)
scaffold0004 (5-578)||(385819-386392)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (105-578)||(2-475)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (5-578)||(25452-26025)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (5-578)||(26266-26839)
scaffold0011 (100-578)||(195531-196008)
scaffold0011 (92-578)||(148570-149056)
scaffold0011 (409-578)||(68577-68746)
scaffold0011 (131-453)||(121809-122131)
scaffold0011 (131-351)||(180151-180371)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (5-578)||(1005-1572)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (5-578)||(14877-15450)
scaffold0040 (5-138)||(113220-113353)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (5-578)||(908-1481)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (5-578)||(4032-4604)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (5-578)||(3140-3713)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-327)||(12738-13064)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (115-578)||(16987-17450)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (5-578)||(116638-117211)
scaffold0037 (131-453)||(98140-98462)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (5-401)||(15832-16228)
scaffold0333 (241-578)||(15493-15829)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (26-275)||(46531-46780)
scaffold0007 (74-578)||(86306-86810)
[»] scaffold0507 (4 HSPs)
scaffold0507 (80-501)||(9047-9468)
scaffold0507 (290-453)||(351-514)
scaffold0507 (134-249)||(216-331)
scaffold0507 (506-578)||(6977-7049)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (80-577)||(12785-13282)
[»] scaffold0001 (7 HSPs)
scaffold0001 (122-577)||(448060-448515)
scaffold0001 (4-578)||(90664-91238)
scaffold0001 (315-578)||(162113-162376)
scaffold0001 (5-138)||(390933-391066)
scaffold0001 (1-216)||(114542-114757)
scaffold0001 (410-480)||(175361-175431)
scaffold0001 (309-453)||(78666-78810)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (5-578)||(16149-16722)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (5-578)||(24804-25377)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (14-578)||(9825-10389)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (5-578)||(3875-4448)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (5-578)||(10473-11045)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (1-578)||(6183-6761)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (1-578)||(19983-20560)
scaffold0298 (1-578)||(13090-13667)
scaffold0298 (1-578)||(16860-17437)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (182-543)||(16375-16736)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (1-578)||(42062-42639)
scaffold0010 (1-578)||(47128-47705)
scaffold0010 (5-162)||(2337-2494)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (2-578)||(27519-28095)
scaffold0139 (5-578)||(882-1454)
scaffold0139 (2-51)||(34299-34348)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (1-578)||(48936-49513)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (5-578)||(13634-14207)
scaffold0034 (1-543)||(4682-5224)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (9-578)||(5328-5896)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (5-578)||(26142-26715)
scaffold0192 (5-240)||(26862-27097)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (5-578)||(47124-47697)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-568)||(4760-5327)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (5-578)||(9798-10366)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-578)||(248613-249190)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (5-291)||(6336-6622)
scaffold0358 (518-578)||(6273-6333)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (5-291)||(1552-1838)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (5-578)||(6769-7342)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (5-578)||(98-671)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (1-578)||(528-1105)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (5-578)||(51596-52169)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (1-578)||(2751-3328)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (114-578)||(5756-6219)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (5-379)||(4187-4561)
scaffold0023 (5-360)||(58972-59327)
scaffold0023 (5-194)||(130532-130721)
scaffold0023 (92-194)||(134626-134728)
scaffold0023 (414-564)||(4567-4717)
scaffold0023 (5-51)||(29112-29158)
scaffold0023 (500-578)||(36974-37052)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-578)||(21400-21977)
scaffold0235 (131-378)||(26006-26253)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (1-578)||(60943-61519)
scaffold0067 (1-578)||(67331-67907)
scaffold0067 (1-578)||(51909-52485)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (1-578)||(19120-19697)
scaffold0058 (314-534)||(58448-58668)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (5-578)||(37202-37775)
scaffold0026 (202-480)||(38103-38382)
scaffold0026 (320-480)||(27385-27545)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (2-578)||(33407-33983)
scaffold0076 (131-453)||(40383-40705)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (14-577)||(42784-43347)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (5-578)||(18270-18843)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-578)||(27226-27802)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (5-264)||(10-269)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (74-578)||(14053-14557)
scaffold0203 (434-578)||(9039-9183)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (5-255)||(8061-8311)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (1-578)||(10888-11465)
scaffold0124 (92-578)||(219-705)
scaffold0124 (131-453)||(7669-7991)
scaffold0124 (1-51)||(133-183)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-578)||(39739-40315)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (1-578)||(48763-49339)
scaffold0053 (1-578)||(57546-58122)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (218-578)||(206-566)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (1-543)||(18884-19426)
scaffold0090 (1-480)||(23109-23588)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (1-578)||(26261-26838)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-578)||(6967-7542)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (2-578)||(43505-44081)
scaffold0114 (2-578)||(44517-45093)
scaffold0114 (4-578)||(20122-20696)
scaffold0114 (413-578)||(36055-36220)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (5-578)||(28501-29075)
scaffold0064 (5-578)||(40492-41066)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (2-578)||(25595-26171)
scaffold0113 (314-578)||(16676-16940)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (5-464)||(1908-2367)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (1-482)||(5309-5790)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (5-198)||(197211-197404)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (314-578)||(27967-28231)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (320-578)||(30-288)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (5-447)||(1-442)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-578)||(16442-17019)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (5-248)||(1-244)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (1-482)||(10865-11346)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (297-578)||(191-472)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (1-578)||(12514-13087)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (1-360)||(3084-3443)
scaffold0222 (491-578)||(3487-3574)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (1-363)||(5181-5543)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (182-578)||(4912-5308)
scaffold0249 (5-187)||(1705-1887)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (188-578)||(3891-4281)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (1-423)||(963-1385)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (92-381)||(86-375)
scaffold1710 (308-453)||(946-1091)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (5-153)||(3547-3695)
scaffold0375 (247-363)||(3694-3810)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (314-578)||(1211-1475)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (5-138)||(4832-4965)
scaffold0761 (134-453)||(248-567)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (5-186)||(18938-19119)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (314-578)||(14086-14349)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (161-578)||(38776-39193)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (393-578)||(16957-17142)
scaffold0324 (5-146)||(19735-19876)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (370-578)||(1177-1385)
scaffold0165 (5-124)||(4884-5003)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (131-453)||(46279-46601)
scaffold0066 (5-108)||(68324-68427)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (350-578)||(4217-4445)
scaffold0574 (2-51)||(939-988)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-242)||(6064-6307)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (131-249)||(7497-7615)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (131-440)||(913-1222)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (132-351)||(71446-71665)
scaffold0021 (297-432)||(13397-13532)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (419-578)||(136119-136278)
scaffold0019 (98-210)||(136278-136390)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (135-453)||(14600-14918)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (131-453)||(13033-13355)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (131-453)||(23519-23841)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (429-578)||(2023-2172)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (1-198)||(5027-5224)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (1-153)||(2604-2756)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (134-453)||(3284-3603)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (149-440)||(14661-14952)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (399-578)||(13380-13559)
scaffold0149 (1-135)||(11397-11531)
scaffold0149 (1-126)||(6966-7091)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (141-378)||(1293-1530)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (133-453)||(28127-28447)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (131-378)||(26016-26263)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (5-87)||(25465-25547)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (140-453)||(24005-24318)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (134-405)||(3806-4077)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (131-453)||(3734-4056)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (1-146)||(33048-33193)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (134-378)||(43738-43982)
scaffold0132 (131-453)||(14782-15103)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (129-380)||(8748-8999)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (158-440)||(9125-9407)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (1-153)||(41344-41494)
scaffold0126 (491-578)||(45845-45932)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (308-440)||(5879-6011)
scaffold0447 (308-440)||(10493-10625)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (308-440)||(8488-8620)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (133-237)||(14478-14582)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (116-186)||(33952-34022)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (131-210)||(17-96)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (5-51)||(1994-2040)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (163-249)||(10985-11071)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 510; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 109540 - 110117
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  109540 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 109639  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  109640 gagcaaagaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaacggcacctttcgaggctttat 109739  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109740 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 109839  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  109840 gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttg 109939  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  109940 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacgg 110039  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  110040 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 110117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Original strand, 95731 - 96273
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||  | |||| ||| || |   ||||||||||| | ||| | ||||| |||    
T  95731 ttcgaaattgaggttgagttcggcttatcatccgcagactgatggtcagtcggaaaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtactt 95830  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  95831 gagcagggtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttat 95930  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || ||||||||  | || ||||||||||| || ||||| || || || || || ||  | |||||  | ||||| |||||||||  | |    
T  95931 atggtcggaggtgtagaactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttggggccggacttggttcatgagactacggagaaagttagggt 96030  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  96031 gatcagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttttg 96130  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| |    
T  96131 agggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactg 96230  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
    |||| ||| || | ||||| || || |||||||||||||||||    
T  96231 tggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgca 96273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 113135 - 112559
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| | ||||||  || || |   |||| ||| |||||||| | ||||| ||||    
T  113135 tcgaaattgaggctgagttcggcttatcatcctcagaaagatggtcagttagagaggacgatacaatccttagaagatctgttgagggtgtgtgtacttg 113036  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
     |||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  113035 tgcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgta 112936  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| ||||||||  | || ||  |  ||    
T  112935 tggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgaatcgggggaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacataaaaggtaaacttg 112836  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    ||   |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  112835 ataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttga 112736  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||||||||| ||    
T  112735 gagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagt 112636  T
Q  502 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  112635 ggcttatagggtgggtttaccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcagttgcggaagtatg 112559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 502; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18178277 - 18177700
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18178277 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatctgttgaggatttgtgttctt 18178178  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18178177 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagctatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttat 18178078  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18178077 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagtttagat 18177978  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18177977 gattcgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttcttg 18177878  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18177877 agagtcactcctataactggtgtagaacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacgg 18177778  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18177777 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 18177700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 15160792 - 15161369
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15160792 ttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 15160891  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15160892 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttat 15160991  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15160992 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 15161091  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15161092 gatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 15161191  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15161192 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 15161291  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15161292 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 15161369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 8199163 - 8198586
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8199163 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 8199064  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  8199063 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgt 8198964  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198963 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 8198864  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  8198863 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttg 8198764  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8198763 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 8198664  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8198663 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 8198586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 11236948 - 11237525
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11236948 ttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 11237047  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237048 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttaccattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttat 11237147  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11237148 atggtcggagatgcagaaccccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggat 11237247  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11237248 gatccaagagagaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttg 11237347  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11237348 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 11237447  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11237448 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 11237525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 10871530 - 10870953
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10871530 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 10871431  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10871430 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 10871331  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871330 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 10871231  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10871230 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 10871131  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10871130 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaggttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 10871031  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10871030 tggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 10870953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 44791086 - 44791663
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44791086 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 44791185  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  44791186 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgt 44791285  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791286 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 44791385  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  44791386 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttg 44791485  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44791486 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaaattgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 44791585  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44791586 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 44791663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 577
Target Start/End: Original strand, 23516520 - 23517080
Alignment:
Q  17 agttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaactt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23516520 agttcggcgtatcatccacagaaagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagagcatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggagggactt 23516619  T
Q  117 gggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23516620 gggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcag 23516719  T
Q  217 aactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatg 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23516720 aactccgttgtgccggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacaagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatg 23516819  T
Q  317 aaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatga 416  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23516820 aaggcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatga 23516919  T
Q  417 ctggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtggg 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23516920 ctggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtggg 23517019  T
Q  517 tttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23517020 tttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 23517080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 13686599 - 13686021
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13686599 ttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 13686500  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686499 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttat 13686400  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686399 atggtcggagatgcagaactccgttgtgatggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 13686300  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13686299 gatccaagagagaatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 13686200  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||    
T  13686199 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcaaatattggaaagagttggaacgg 13686100  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatg-ttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13686099 tggcttaccgagtgggtttaccgtcgcatctttcgaatttgcacaacgtttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 13686021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 8708140 - 8707563
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8708140 ttcgaagttgagattgagtttggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 8708041  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8708040 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 8707941  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8707940 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaagttcagat 8707841  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8707840 gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 8707741  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8707740 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 8707641  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8707640 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 8707563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 11552837 - 11553414
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11552837 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagatagatggacagtcggagaggacaattcagttgctagaggatttgttgaggatccgtgttctt 11552936  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  11552937 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 11553036  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11553037 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagat 11553136  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553137 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 11553236  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  11553237 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 11553336  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553337 tggcttatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcacgacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 11553414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 18551493 - 18552070
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18551493 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 18551592  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18551593 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 18551692  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551693 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 18551792  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18551793 gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 18551892  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18551893 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 18551992  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18551993 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 18552070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14332932 - 14332355
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14332932 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttattgagaatttgtgttctt 14332833  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  14332832 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgt 14332733  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14332732 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaataaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 14332633  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14332632 gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 14332533  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  14332532 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacgg 14332433  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14332432 tggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 14332355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12688036 - 12687459
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  12688036 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtgctt 12687937  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  12687936 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 12687837  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  12687836 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttaggaccagagattgtccaacagactactgagaaagttaagat 12687737  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12687736 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 12687637  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||    
T  12687636 cgagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacgg 12687537  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12687536 tggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttgcacgacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 12687459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14955155 - 14954578
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  14955155 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgtgctt 14955056  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |    
T  14955055 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttttgagactttgt 14954956  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14954955 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtccagcagactactgagaaagttaagat 14954856  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954855 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 14954756  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |  |||| |||||||||||    
T  14954755 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccaaagtttattggtccgtataagatatcagaaagagttggaacgg 14954656  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14954655 tggcttatcgagtgagtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgttttccatgtatcgcaacttcggaagtatg 14954578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 17051 - 17628
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17051 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttctt 17150  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17151 gagcaaggaggaacttgggatagtcagtttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 17250  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17251 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttcagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgaaattgttcagcagactactgagaaagttaagat 17350  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17351 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttg 17450  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||  || ||||| || |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  17451 agagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 17550  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17551 tggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 17628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 15154396 - 15154964
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | || |  ||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  15154396 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcaatcgctagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagc 15154495  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||    
T  15154496 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattgggatggcaccttatgaagctttgtatgg 15154595  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  15154596 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttagga-----gattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgatt 15154690  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15154691 caagaaaagatgaaagtgtcaccgagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaagaaggagaccacgtatttttgagag 15154790  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  15154791 tcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggc 15154890  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  15154891 ttaccgagtgggtttaccactgcatctttcgaatttgcacgatgtatttcacgtgtcgcaacttcggaagtatg 15154964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9596592 - 9596236
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9596592 ttcgaaattgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttctt 9596493  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9596492 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagtcatcattctattattggaatggcaccttttgaggctttgt 9596393  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  9596392 atggtcggagatgtagaacttcgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagagaaagttaagat 9596293  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcg 357  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9596292 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 9596236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 25 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15204390 - 15203837
Alignment:
Q  25 gtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagt 124  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  | |||| |||||||| | | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15204390 gtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaggacaattcagtcgttggaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttggaatagt 15204291  T
Q  125 catcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgt 224  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||  | ||||||| ||| || || |||||||    
T  15204290 catcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggaaccatttgaagcgctgtatggtcagaggtgtaggactccgt 15204191  T
Q  225 tgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtc 324  Q
    |||| ||||| |||| |||||| || || || || ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| || || ||||| |||||    
T  15204190 tgtgttggttcgagtaaggtgatagtgtagttttgggaccagattttgttcagcaaactacagagaaggttaagttgatccatgaaaagatgaaagcgtc 15204091  T
Q  325 gcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgta 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |  | ||||||||||     
T  15204090 gcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgttttttagagtcacttttgtgactggtgtt 15203991  T
Q  425 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgc 524  Q
    || || || ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||  |||||||||   |||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  15203990 ggccgcgcattgaagtcaaataagttgactccgaggtttattggtctgtatcagattacagaaagaattggaacggtagagtatcgagtgggtttaccac 15203891  T
Q  525 cgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15203890 cgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15203837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15625083 - 15624545
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  | || | ||| |||| | | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||||    
T  15625083 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggaaagaacaatccagtcgttggaggacttgttgagagtttatgtacttgagc 15624984  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||  | |||||    
T  15624983 atggaggaacttgggatagtcatcttctgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattagaatgacaccattcgaagcactgtatgg 15624884  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||  | || |||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||| || |||||    
T  15624883 tcggaggtgtaggactccattgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtaattttgggaccagaaatcgttcatcaaactacttagaaggttaagttgatc 15624784  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15624783 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttatcatgataagcttaggaaagaccttgagtttcaggaaggagaccatgtatttttgagag 15624684  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||||| |  |||| | |||||||||||||    
T  15624683 tcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaaattgactccgaggtttattggttcatatcagatatcagaaagaattggaacggtggc 15624584  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15624583 gtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 15624545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 15102316 - 15102891
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||| ||||  | ||||| |||    
T  15102316 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtactt 15102415  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  15102416 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 15102515  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||| | || ||||| ||  |  |||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  15102516 atggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggttcgagtcaggaga--gagtgttgttgggaccggatttgattcatcagactacagagaaagtcaagat 15102613  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||||||    
T  15102614 gataagagaaaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttg 15102713  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |    
T  15102714 agagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacag 15102813  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15102814 tggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15102891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 12206517 - 12207090
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  || ||||||||||||||  |||| |  ||||||| | ||||||||||| | ||  | ||||| |||||||    
T  12206517 aagttgaggttgagttcagcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctaagagtgtgtgtacttgagc 12206616  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||     
T  12206617 aaggtggagcttgggatagtcacctgccgttgatagagttcacgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagttttgtatga 12206716  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat-gat 303  Q
    |||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | || ||||| || || |||||||| ||||| || |||| ||| || |||    
T  12206717 tcggaggtgcaatactccgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccggatatagttcagcagactacaga-aaaggtcaaattgat 12206815  T
Q  304 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 403  Q
      ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12206816 aaaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagtgtagaaaggatcttaagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgaga 12206915  T
Q  404 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 503  Q
    |||| |||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||| |  || | ||||| ||| ||||    
T  12206916 gtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcaaagaagttgacgccgaagtttattggttcgtaccagatatctgagagagttgcaacagtgg 12207015  T
Q  504 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12207016 catatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 12207090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 19147739 - 19147170
Alignment:
Q  9 tgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaagg 108  Q
    |||| ||||||||  | |||||||  || ||||||||||||||  |||| |  ||||| | | ||||||||||| ||||  | ||||| ||| |||||||    
T  19147739 tgaggttgagttcaacttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttaagcaagg 19147640  T
Q  109 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 208  Q
     ||| ||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  19147639 tggagcttggaatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgg 19147540  T
Q  209 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 308  Q
    || ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||   ||    
T  19147539 aggtgcaggactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagag 19147440  T
Q  309 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 408  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||     
T  19147439 aaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcac 19147340  T
Q  409 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 508  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||     
T  19147339 tcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatac 19147240  T
Q  509 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19147239 agagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19147170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20747138 - 20746569
Alignment:
Q  9 tgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaagg 108  Q
    |||| ||||||||  | |||||||  || ||||||||||||||  |||| |  ||||| | | ||||||||||| ||||  | ||||| ||| |||||||    
T  20747138 tgaggttgagttcaacttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttaagcaagg 20747039  T
Q  109 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 208  Q
     ||| ||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  20747038 tggagcttggaatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgg 20746939  T
Q  209 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 308  Q
    || ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||   ||    
T  20746938 aggtgcaggactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagag 20746839  T
Q  309 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 408  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||     
T  20746838 aaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcac 20746739  T
Q  409 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 508  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||     
T  20746738 tcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatac 20746639  T
Q  509 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20746638 agagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 20746569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 14263961 - 14264534
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||| | |||||| | | ||||||||||| ||||  | | ||| || ||||    
T  14263961 aagttaaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacaattcaatcgttagaggatttgatgagagtgtctgtactcgagc 14264060  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  14264061 aaggtggagcttgggatagtcatctactgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 14264160  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || |||||  |  | ||||| || |||||  |||| ||  |||||||     
T  14264161 tcggaggtgcaggactcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtagtgttgggaccgtatttggttcatcagactacgaagaatgtcaagatgata 14264260  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
       || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||    
T  14264261 agcgaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagag 14264360  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||    
T  14264361 tcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatcagatatctgaaagggttggaacagtggc 14264460  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| |||||||||| || || ||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  14264461 atatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcctgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatg 14264534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 74 - 432
Target Start/End: Original strand, 35964658 - 35965016
Alignment:
Q  74 gaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagta 173  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  35964658 gaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttctattgatcgagttcacttataataacagttaccattctagta 35964757  T
Q  174 ttggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgt 273  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || || || ||  | |||||||| |||||    
T  35964758 ttggaatggcaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtatgagtctggcgatagtgtagtactgggaccagacattgt 35964857  T
Q  274 tcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgag 373  Q
    ||| |||||||||||||| ||| || ||||   ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  35964858 tcaacaaactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaggcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttgag 35964957  T
Q  374 tttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgc 432  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  35964958 tttcaagaaggggaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactagtgtatgacgtgc 35965016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 11388141 - 11388717
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| |||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   |||||||| |  ||||  | ||||| |||    
T  11388141 ttcgaaattgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatctactgagagtgtgtgtactt 11388240  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| |    
T  11388241 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaatagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgt 11388340  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || |||||||| ||||| || || ||| || |    
T  11388341 atgttcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagtt 11388440  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||| | |||||| || ||||| |||    
T  11388441 gataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccatgagtttcaag-aggagatcatgtgttcttg 11388539  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| |    
T  11388540 agagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacag 11388639  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  11388640 tggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatg 11388717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 16072011 - 16072584
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||||||  ||||| | | ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  16072011 aagttaaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcagagaggacgattcaatcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 16072110  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||   |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16072111 aaggtggagcttgggatagtcacctatggttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttgtatgg 16072210  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||  ||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||  | ||||  || ||||  ||||| ||  |||||||     
T  16072211 tcggaggcgcataactcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtagtgttgggaccagatttggttcgtcagactatggagaaggtcaagatgata 16072310  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||    
T  16072311 agagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagag 16072410  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| |||||    
T  16072411 ttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggc 16072510  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |    ||||||||| || || |||||||||||||||||  || | || |||||||||||||||||||||||||    
T  16072511 atgcaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16072584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 21662492 - 21661933
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||  || |  |||||| |||||||| | | ||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  21662492 aagttgagtttgagttaggcgtatcatccgcagacagatggatagacggagaggacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagc 21662393  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||    
T  21662392 aagggggatcttgggatagtcatcttccattaatcgagttcacttacaataatagttaccattctagcattggaatggcaccgttcgaagcgttgtatgg 21662293  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||| || |||||  | |||||||| |||||||| || |||| ||| || ||| || ||||     
T  21662292 tcggagatgcagaactccgttgtgttgtgatgagtccggtgagagtgtggtactgggaccagacattgttcaacagactaatgaaaatgttaagttgatt 21662193  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  21662192 agagaaaagatgaaagcgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttgagtttc---aaggagaccatgtgtttttgagag 21662096  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    |||  ||| | || ||||| ||||| ||  | || ||||||||  | || |||| ||| ||||| || |||||||||| | ||| ||||||  |||| ||    
T  21662095 tcacccctcttaccggtgttggacgggcactaaaatcaaagaaactaactccgaggtttattggcccgtatcagatttcgcaaagagttggggcggttgc 21661996  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaact 567  Q
     |||   ||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||| || |||||||| |||||    
T  21661995 gtataacgtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaact 21661933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 251 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14038092 - 14037765
Alignment:
Q  251 gtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatg 350  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14038092 gtggttttgggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatg 14037993  T
Q  351 acaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagtt 450  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  14037992 ataagcgtaggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagtt 14037893  T
Q  451 gaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgtt 550  Q
    ||| || |  || |||||| |||||||||| | ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||     
T  14037892 gacaccaagatttattggttcatatcagatatcggaaagagtttgaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtg 14037793  T
Q  551 ttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    
T  14037792 tttcatgtatcgcaacttcggaagtatg 14037765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 251 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14348122 - 14347795
Alignment:
Q  251 gtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatg 350  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14348122 gtggttttgggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatg 14348023  T
Q  351 acaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagtt 450  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  14348022 ataagcgtaggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagtt 14347923  T
Q  451 gaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgtt 550  Q
    ||| || |  || |||||| |||||||||| | ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||     
T  14347922 gacaccaagatttattggttcatatcagatatcggaaagagtttgaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtg 14347823  T
Q  551 ttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    
T  14347822 tttcatgtatcgcaacttcggaagtatg 14347795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 578
Target Start/End: Original strand, 16950185 - 16950761
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  16950185 tcgaagttgaggttgagttcggattatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttg 16950284  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| |||   ||| ||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  16950285 agcaaggtggagtatggaatagtcacctaccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgta 16950384  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||  ||  | ||||| || ||||||||||||||  |||||    
T  16950385 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggacaggacttggttcatcagactactgagaaagtcaagatg 16950484  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    ||    || || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  | |||||||||||| || || || || ||| |||    
T  16950485 ataagggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccatgagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 16950584  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||| ||    
T  16950585 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagaaagggttggaacagt 16950684  T
Q  502 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||| ||| |||| |||||  | || ||||||||||| |||||  |||| ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  16950685 ggcatatagagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttttatgtgtcgcagcttcggaagtatg 16950761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 387
Target Start/End: Original strand, 11771980 - 11772362
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  | |  |  |||||||   | || |||||||||||  ||||||| |||||||    
T  11771980 aagttgaggttgagttcggcgtatcatctgcagacagatggttagtcggaaaaaacgattcagtcattggaagatttgttgagagtttgtgtacttgagc 11772079  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||    
T  11772080 aaggagaaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttaaggctttgtgtgg 11772179  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
      | || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||     
T  11772180 aagaaggtgcagaacttcgttgtgttgatttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccggaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgatt 11772279  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggaga 387  Q
    ||||| |  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11772280 caagaaatgatgaaaacgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggaga 11772362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6414047 - 6413470
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  6414047 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagaaggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgctt 6413948  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  6413947 gagcaaggtggggcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 6413848  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || || || |  ||  | ||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  6413847 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgaatcaggagagagtgttgtgttgggtctggatttggttcatcagactactgagaaagtcaagat 6413748  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||| || || || |||||| ||    
T  6413747 gataagggaaaacatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcctttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctg 6413648  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||| |  |||||||||  || |  |||||||| |    
T  6413647 agggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcattggttcgaatcagatttcagagagggttggaacag 6413548  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||| ||||||||    
T  6413547 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcagaagtatg 6413470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 13666073 - 13665512
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||  || || |   ||||||||||  ||||  | ||||| |||    
T  13666073 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcagagaggacgatccaatcattagaggatttactgagagtgtgtgtgctt 13665974  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  13665973 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 13665874  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||  |||  ||||| || ||||||||||||||||| || ||  | || || ||           |||| |||||||| ||||||||  ||||    
T  13665873 atggtcggaggggcatgactcctttatgctggtttgagtcaggagagagttttgtgttggg-----------ttcatcaaactacagagaaagtcaagat 13665785  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |  ||||||||||| || | ||| || || ||| ||    
T  13665784 gatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatcacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagaggaagatcatgtatttctg 13665685  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||     || ||||||||||  ||||  |||||||| |    
T  13665684 agagttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttca-----ccgtatcagatttcagaaagggttggaacag 13665590  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  13665589 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 13665512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 578
Target Start/End: Original strand, 14286096 - 14286666
Alignment:
Q  8 ttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaag 107  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   |||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||    
T  14286096 ttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgaagaggacgatacaatctttagaggatttattgagagtgtgtgtgcttgagcaag 14286195  T
Q  108 gaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcg 207  Q
    | ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  14286196 gtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcg 14286295  T
Q  208 gagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaa 307  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||   || || || || || ||||| ||  | ||||| || || |||||||| ||  |||||||        
T  14286296 gaggtgcaggactcctttgtgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataagg 14286395  T
Q  308 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 407  Q
    || || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    |||||||||||||| || || || || ||||||||||| |    
T  14286396 gaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagacccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagtta 14286495  T
Q  408 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctta 507  Q
     ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||   | |   ||||||| ||||| ||    
T  14286496 ctccgatgacaggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatttcatataggattggaacagtggcata 14286595  T
Q  508 tcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14286596 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 14286666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 18053666 - 18054243
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||| ||||||||  | ||||| |||    
T  18053666 ttcgaagttgagactgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggacttgttgagagtgtgtgtgctt 18053765  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || || || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  18053766 gaacagggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgt 18053865  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||    
T  18053866 atggtcgagggtgcaggactccgttgtgttggttcgagtcaggagaaagagttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagat 18053965  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || || || || || ||| ||    
T  18053966 gatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctg 18054065  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  || | | | |||||||    
T  18054066 agagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggcccgtatcagatttcagagagaataggaacgg 18054165  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  18054166 tggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 18054243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 11305976 - 11306553
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  | |||| |||||| |   | || |||||||||||  | ||||| |||    
T  11305976 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggaaaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgctt 11306075  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  11306076 gagcaaggtggagcttgggatagtcacttacctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 11306175  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  11306176 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttagttcatgagactactgagaaagtcaggtt 11306275  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  11306276 gataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 11306375  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | |||||| || |    
T  11306376 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacag 11306475  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  11306476 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtctctcagcttcggaagtatg 11306553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14040227 - 14039986
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |  ||||| | | ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  14040227 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgttaagagtttgtgtacttgagc 14040128  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  14040127 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatgg 14040028  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtga 246  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14040027 tcagagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtga 14039986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14130409 - 14129832
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | |||||| |||||||  | ||||| |||    
T  14130409 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatctgttgagagtgtgtgtgctt 14130310  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |    
T  14130309 gaacaaggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgt 14130210  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||  | |||||  | |  |||||||| ||  ||||    
T  14130209 atggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagatgactgagaaggtcaagat 14130110  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || || |||||     
T  14130109 gataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttt 14130010  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |   ||||||||     
T  14130009 agagttactccgatgacgagtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacga 14129910  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  14129909 tggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 14129832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14350257 - 14350016
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |  ||||| | | ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  14350257 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgttaagagtttgtgtacttgagc 14350158  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  14350157 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatgg 14350058  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtga 246  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14350057 tcagagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtga 14350016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 8211841 - 8212418
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||  | ||||| |||    
T  8211841 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgctt 8211940  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || |    
T  8211941 gagcaaggtggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcgccgttcgaagccttgt 8212040  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  8212041 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtattgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggtt 8212140  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  8212141 gataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 8212240  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| || |    
T  8212241 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacag 8212340  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  8212341 tggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcaacttcggaagtatg 8212418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14434227 - 14433650
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  || || |   | |||||| |||||||  | ||||| |||    
T  14434227 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatctgttgagagtgtgtgtgctt 14434128  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |    
T  14434127 gaacaaggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgt 14434028  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||  | |||||  | |  |||||||| ||  ||||    
T  14434027 atggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagatgactgagaaggtcaagat 14433928  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || || |||||     
T  14433927 gataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttt 14433828  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |   ||||||||     
T  14433827 agagttactccgatgacgagtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacga 14433728  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  14433727 tggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 14433650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Original strand, 23199456 - 23199937
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | || || ||||||||  | |||||||||    
T  23199456 ttcgaagttgagactgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgttctt 23199555  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || || || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  23199556 gaacagggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgt 23199655  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||  | || ||| | ||||| || |||||  || |    
T  23199656 atggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggtccaggagactacagaaaaagtcaagct 23199755  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |     
T  23199756 gatcagggagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttcta 23199855  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 482  Q
    ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23199856 agagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcagattt 23199937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Original strand, 23505583 - 23506064
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | || || ||||||||  | |||||||||    
T  23505583 ttcgaagttgagactgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgttctt 23505682  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || || || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  23505683 gaacagggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgt 23505782  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||  | || ||| | ||||| || |||||  || |    
T  23505783 atggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggtccaggagactacagaaaaagtcaagct 23505882  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |     
T  23505883 gatcagggagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttcta 23505982  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 482  Q
    ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23505983 agagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcagattt 23506064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 13021892 - 13021316
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||  ||||||  || || |   | ||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  13021892 tcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggttagtcggagaggactatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttg 13021793  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||| || | |||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  13021792 agcaaggtggagcttgggataatcacctactgttgatagagttcacttataacaacagctatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaggctttgta 13021693  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    ||||||||| ||||| |||||  | || ||||||||||||||  | || ||||| |||||||| ||  | |||||  | ||||||||||| ||  |||||    
T  13021692 tggtcggaggtgcaggactcctctatgttggtttgagtcaggaaagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactgagaaggtcaagatg 13021593  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    ||    || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  || |||||||| || || || || || ||| |||    
T  13021592 ataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggccctagagtttcaagacggtgatcatgtttttctga 13021493  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    | |||| ||||||||| || |||  |||||| |||||||| | ||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || |  |||||||| ||    
T  13021492 gggtcactcctatgacgggcgtaaaacgtgcattgaagtcgaggaagtggactccaaagtttattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagt 13021393  T
Q  502 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  13021392 ggcttatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 13021316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 49152833 - 49152260
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||  || || |||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||  | ||||| |||||||    
T  49152833 aagttgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacggatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtatgtgtgcttgagc 49152734  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  49152733 aaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 49152634  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | ||||||||||||||   | ||||     
T  49152633 tcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgata 49152534  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| |    
T  49152533 agagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgaggg 49152434  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| || |||||    
T  49152433 tcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggc 49152334  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  49152333 atatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 49152260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 74 - 574
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1693
Alignment:
Q  74 gaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagta 173  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  1193 gaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagta 1292  T
Q  174 ttggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgt 273  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||| ||||||| ||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||    
T  1293 ttggtatggcaccgttcaaagctttgtatggtcagaggtgaaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggt 1392  T
Q  274 tcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgag 373  Q
    ||| || ||||||||||| ||  |||||||    || || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |  ||||||    
T  1393 tcatcagactactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcacagattcgacagaagagttaccatgacaagaggagaaaggcccttgag 1492  T
Q  374 tttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccat 473  Q
    |||||||| || || || || ||| ||| ||| | | ||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||  |    
T  1493 tttcaggagggtgatcatgtttttgtgaaagttacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtctgt 1592  T
Q  474 atcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaa 573  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||  |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||| || ||||||||    
T  1593 atcagatttaagaaagggttggaacactggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtctcagcttcggaa 1692  T
Q  574 g 574  Q
    |    
T  1693 g 1693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12456237 - 12455662
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||| |||||||   | ||||| ||||    
T  12456237 tcgaagttgaggttgagctcggcttatcatccccagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggaattgttgacagtgtgtgtgcttg 12456138  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||    
T  12456137 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgctgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtataggtatggtaccgttcgaagctttgta 12456038  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    |||| |||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||  | || ||  | ||||||||||||||  || ||    
T  12456037 tggtaggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggtacatgagactactgagaaagtcaaggtg 12455938  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    ||    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||||||| || || || || ||| |||    
T  12455937 ataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggccctagagtttcaggagggtgatcatgtttttctga 12455838  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    | |||| |||| |||| ||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||  || | |||| |||| ||    
T  12455837 gggtcactcctttgacgggtgttggatgtgcattgaagtcgaggaagttgaatccaaagttcattggtcggtatcagatttcagagagagttagaacagt 12455738  T
Q  502 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| || | ||||| || || |||||||||||  ||||  |||| || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  12455737 ggcttatagaattggtttgccaccacatctttcgaacctgcatgatgtgtttcatgtgt-gcagcttcggaagtatg 12455662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Original strand, 26118318 - 26118799
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||| |   | || |||||||||||  | ||||| |||    
T  26118318 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgctt 26118417  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||| ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  26118418 gaacaaggtggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 26118517  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  26118518 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggtt 26118617  T
Q  301 gatccaagagaaa--atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttt 398  Q
    |||  ||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| || || || || |||     
T  26118618 gat--aagagaaaggatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggagcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttc 26118715  T
Q  399 tgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 482  Q
    |||| |||| |||| |||| ||||| || |||||| ||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  26118716 tgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagattt 26118799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 131 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14936752 - 14936443
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |    
T  14936752 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacgtcgttgtgtt 14936653  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| ||||||||| | |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||  || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  14936652 ggtttgaatcaggtgaaggtgctttgttaggaccggaagttgtgcaataaactaaggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagag 14936553  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||  ||||||||||||  || || || |||||||||||||| | || | |||||||||| || |||    
T  14936552 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcttgtgactggtgttggtcgt 14936453  T
Q  431 gctttgaagt 440  Q
    ||||||||||    
T  14936452 gctttgaagt 14936443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12457218 - 12456940
Alignment:
Q  98 cttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctt 197  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  12457218 cttgagcaaggtggaacttgagatagtcacctaccgttgattgagttcacatataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctt 12457119  T
Q  198 tatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttca 297  Q
    | ||||||||||| |  || ||||| || |||| |||||||||||| || || ||||| || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||       
T  12457118 tgtatggtcggaggtataggactcctttatgctagtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcag 12457019  T
Q  298 gatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagttt 376  Q
    | | ||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  12457018 gttcataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagttt 12456940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15340967 - 15340587
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  | ||||  ||  | |   | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  15340967 ttcgaagttgaggatgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggaaaggacgatcaaataattggaggatttgttgagagtgtgtgtgctt 15340868  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| | ||| |    
T  15340867 gaacaaggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacatttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagttttgt 15340768  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || || |||||||| ||  || |    
T  15340767 atggtcggaggtgcaggactccgttatgctagtttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagct 15340668  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 381  Q
    |||    || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  15340667 gataagggaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcagga 15340587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 13968381 - 13968626
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  13968381 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctt 13968480  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| | |||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  13968481 gaacaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattgggttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 13968580  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtga 246  Q
    |||||||||| || |  ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  13968581 atggtcggaggtgtatgactcctttatgctggtttgagtcgggtga 13968626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 297 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 4440167 - 4440011
Alignment:
Q  297 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 396  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | || || ||  ||||||||||||  || || || |||||    
T  4440167 agatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtt 4440068  T
Q  397 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  4440067 tttgagagtgaaccctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtgtaggaagttgac 4440011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 314 - 570
Target Start/End: Original strand, 26288063 - 26288318
Alignment:
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  || || |||||||| || || || || ||| |||| || | |||||    
T  26288063 atgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttaccatgacaagcggagaaaggccctaga-tttcaggagggtgatcatgtttttctgagggttactccta 26288161  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 513  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||  ||||  ||| |||| ||||| ||| ||||    
T  26288162 tgacgggtgtaggacgcgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggtacgtatcagatttcagaaagggtttgaacagtggcatatagagt 26288261  T
Q  514 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcg 570  Q
     ||||| || || |||||||| || |||||  |||| || ||||||||||| |||||    
T  26288262 tggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcg 26288318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 163 - 405
Target Start/End: Original strand, 12368473 - 12368715
Alignment:
Q  163 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttagga 262  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||| || || || ||||| |   | || |||    
T  12368473 tcattctagtattggtatggctccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggttcgaatccggagaaagtgctttgtttgga 12368572  T
Q  263 ccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaa 362  Q
    || ||  |||| ||  | |||||  | || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||    
T  12368573 ccggaagttgtgcaagagactacgaaaaaggttaagatgatccaagagaaaatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaa 12368672  T
Q  363 aagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 405  Q
    | ||| |||| |||||||  || || |||||||||||||||||    
T  12368673 aggatattgactttcaggttggtgatcacgtgtttttgagagt 12368715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 7824305 - 7823983
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  7824305 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 7824206  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| || || ||||| |   | || || || ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  7824205 ggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 7824106  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| || || || |||    
T  7824105 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgt 7824006  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||| ||||  | |||||||||    
T  7824005 gctttaaagtgtaggaagttgac 7823983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 27107639 - 27107961
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  27107639 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 27107738  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| || || ||||| |   | || || || ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  27107739 ggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 27107838  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| || || || |||    
T  27107839 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgt 27107938  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||| ||||  | |||||||||    
T  27107939 gctttaaagtgtaggaagttgac 27107961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 15364345 - 15364036
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |    
T  15364345 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacgacgttgtgtt 15364246  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| | ||| ||||| |   | ||| |||| ||  |||| ||  ||| ||  || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  15364245 ggtttgaataaggagaaagtgatatgttaagaccggaagttgtgcaaaaaaataaggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 15364146  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||  ||||||||||||  || || || |||||||||||||| | || | |||| ||||| || |||    
T  15364145 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcttgtgaccggtgttggtcgt 15364046  T
Q  431 gctttgaagt 440  Q
    ||||||||||    
T  15364045 gctttgaagt 15364036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 21674398 - 21674720
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| || || || ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || |  ||  ||||||| |    
T  21674398 ccgttgattgaatttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaagacaacgttgtgtt 21674497  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||||||||| ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || |||  | ||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||    
T  21674498 ggtttgagtcaggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaatataagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcaaag 21674597  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | || || ||  |||| ||||| |  || || || |||||||||||||| |  | | ||| |||| | ||||||    
T  21674598 tagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgaatttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccttgtgattggtattggacgt 21674697  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  ||||| |||||    
T  21674698 gctttgaagtgtaagaaattgac 21674720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12193961 - 12193742
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||  |||||  | ||| |||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  12193961 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattaaagtatcagtatgacaccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtagaactcctttgtgtt 12193862  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||| ||||||||||||||  |   | ||||||||  || |||| ||  ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||  ||||| |||||    
T  12193861 ggtatgagtcaggtgaaaatgctttgttaggaccgaaggttgtgcaagaaactacggagaaggttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcagag 12193762  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatg 350  Q
    | | || |||||||||||||    
T  12193761 taggcagaagagttatcatg 12193742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15340574 - 15340455
Alignment:
Q  459 agttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 558  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || |   ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||    
T  15340574 agttcattggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgt 15340475  T
Q  559 gtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||| || |||||||||||||    
T  15340474 gtcacagcttcggaagtatg 15340455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 447
Target Start/End: Original strand, 41044 - 41327
Alignment:
Q  164 cattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggac 263  Q
    |||||||||| ||| |||||||| || ||||| || |||||| |||||||  |||| || ||||| ||||  ||||| || || |  |  || || ||||    
T  41044 cattctagtactgggatggcaccatttgaggcgttgtatggtaggagatgtcgaacacctttgtgttggtacgagtctggcgagattgcagtgttgggac 41143  T
Q  264 cagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaa 363  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||  | | ||| |  ||| ||||||| || || || | | |||| ||||| |||||||| || || |||||    
T  41144 cagagattgttcagcagacgaccgagaaggtcaaaacgattcgggaggaaatgaaagcatcacaaattagacagaagagctatcatgataaacgaagaaa 41243  T
Q  364 agatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaa 447  Q
    | |  | |||||||||||||| || || || ||||| ||||||| |||  |||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  41244 ataattggagtttcaggaaggggatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttggacgtgctttgaagtctaagaa 41327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45146960 - 45146842
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||  ||||||||||| || ||| |||| || |||||| | ||||||||||| || || || || ||||| |    
T  45146960 ccgttgattgagtttacttacaacaacagtttgcattctagtatcggtatgacaccgttggaggctctgtatggtcggaggtgtaggacgccattgtgtt 45146861  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaag 249  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  45146860 ggtttgaatcaggtgaaag 45146842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13378937 - 13378796
Alignment:
Q  297 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 396  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||| ||||| |||| ||| | |||||  |  ||||||||||||  || || || |||||    
T  13378937 agatgatccaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagcgttattatgataagaggagaaagaaaattgagtttcaggttggtgatcatgtgtt 13378838  T
Q  397 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaa 438  Q
    ||||||||| | |||||| ||| | || || |||||||||||    
T  13378837 tttgagagtgaatcctataacttgagttggtcgtgctttgaa 13378796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 495; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 578
Target Start/End: Original strand, 14266368 - 14266942
Alignment:
Q  4 gaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266368 gaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagatagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgag 14266467  T
Q  104 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266468 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagctatcattccagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 14266567  T
Q  204 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14266568 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgat 14266667  T
Q  304 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 403  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14266668 ctgagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacatgtttttgaga 14266767  T
Q  404 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 503  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14266768 gtcacccctatgactggtgtatgacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtgg 14266867  T
Q  504 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266868 cttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 14266942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 8386958 - 8386381
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8386958 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 8386859  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  8386858 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcgccgttcgaagctttgt 8386759  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386758 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 8386659  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8386658 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 8386559  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8386558 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 8386459  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8386458 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 8386381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 19778259 - 19778836
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19778259 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagttgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 19778358  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19778359 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 19778458  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778459 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 19778558  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19778559 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 19778658  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19778659 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 19778758  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19778759 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 19778836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18297751 - 18297174
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18297751 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 18297652  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18297651 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 18297552  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297551 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 18297452  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18297451 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 18297352  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18297351 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 18297252  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18297251 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 18297174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 29038870 - 29039447
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29038870 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 29038969  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  29038970 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgt 29039069  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039070 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 29039169  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29039170 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 29039269  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29039270 agagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 29039369  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29039370 tggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 29039447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 40473583 - 40473009
Alignment:
Q  4 gaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473583 gaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgag 40473484  T
Q  104 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473483 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttattattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 40473384  T
Q  204 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40473383 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccggagattgttcagcaaactactgagaaagttcaaatgat 40473284  T
Q  304 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 403  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40473283 tcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgaga 40473184  T
Q  404 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 503  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  40473183 gtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacgatgg 40473084  T
Q  504 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40473083 cttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 40473009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 14303444 - 14304020
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14303444 ttcgaagttgaggttgagttcggcatatcatccgcagacagatggttagtcggagaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgttctt 14303543  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303544 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcatgctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 14303643  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  14303644 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcggat 14303743  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14303744 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttg 14303843  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14303844 agagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttga-cccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 14303942  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14303943 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 14304020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12477146 - 12476569
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12477146 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgcaagaggatttgttgagaatttgtgttctt 12477047  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12477046 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 12476947  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12476946 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgaggaagttcagat 12476847  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12476846 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttg 12476747  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12476746 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 12476647  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12476646 tggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtatcgcaacttcgaaagtatg 12476569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12524222 - 12523645
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12524222 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 12524123  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12524122 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 12524023  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12524022 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggttttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagat 12523923  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12523922 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttg 12523823  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  12523822 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 12523723  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12523722 tggcgtatcgagttggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 12523645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27711882 - 27711305
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27711882 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatctgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 27711783  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  27711782 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagactttgt 27711683  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711682 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 27711583  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27711582 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 27711483  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27711482 agagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 27711383  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27711382 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcaaaagtatg 27711305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23956293 - 23955716
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23956293 ttcgaagttgagattaagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 23956194  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  23956193 gaacaaggaggaacttaggaccgtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgt 23956094  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23956093 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 23955994  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23955993 gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 23955894  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23955893 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 23955794  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23955793 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcataacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 23955716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 8053089 - 8053666
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8053089 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 8053188  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  8053189 cagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgt 8053288  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8053289 atggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtttgaatcaggagagagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 8053388  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8053389 gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaagagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 8053488  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||     
T  8053489 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacga 8053588  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8053589 tggcttaccgtgtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 8053666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14681113 - 14680536
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  14681113 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtgctt 14681014  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  14681013 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcatatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 14680914  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14680913 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagat 14680814  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14680813 gattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaacgagaccacgtgtttttg 14680714  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  14680713 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaataagttgaccccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 14680614  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680613 tggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 14680536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 18226912 - 18227489
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18226912 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgtagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttctt 18227011  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18227012 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 18227111  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||||    
T  18227112 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttttagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagaagactactaagaaagttaagat 18227211  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18227212 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaagaatcttgagtttcaggaaggagagcacgtgtttttg 18227311  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |    
T  18227312 agagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacag 18227411  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18227412 tggcgtatcgagtgggattaccaccgtatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 18227489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 16251911 - 16252488
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||    |||||||||||    
T  16251911 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcattcgcagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcactagaggatttgttgtaagtttgtgttctt 16252010  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  16252011 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacgtacaataatagttatcattctattattggaatgacaccttttgaggctttgt 16252110  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  16252111 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattcttcagcagactactgagaaggttaagat 16252210  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16252211 gattcaagagaaaataaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttg 16252310  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  16252311 agagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 16252410  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16252411 tggcgtatcgagtgggattaccaccacatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcagaagtatg 16252488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 16354915 - 16355488
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16354915 aagttgagattgagttcggcgtatcatccgcaggcagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttaagc 16355014  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16355015 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtatttgaatggcaccttttgaggctttatatgg 16355114  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  16355115 tcggagatggagaattccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgatt 16355214  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16355215 caagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaataattatcatgataagcgcaggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacgtgtttttgagag 16355314  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  16355315 tcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagacttggaacggtggc 16355414  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355415 gtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16355488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 7090974 - 7090402
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||  ||||||  ||| ||| | |||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  7090974 aagttgaggttgagttcagcatatcatccgcagacagatagtcagtcggagaggacgatttagtcgttagaagatttgttgagggtttgggttctttagc 7090875  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  7090874 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattagaatggaaccttatgaggctttatatgg 7090775  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  7090774 tcggagatgcagaactcagttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgatt 7090675  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7090674 caagagaagatgaaagcgtcgaagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagag 7090575  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| | | |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  7090574 tcactcctgtgactggtgttggatgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgct-cgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 7090476  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  7090475 gtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 7090402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 14850836 - 14851409
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | || |  ||||||| | | || || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  14850836 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaatgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagc 14850935  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14850936 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacatacaataacaattatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatgg 14851035  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
      | || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||     
T  14851036 aagaaggtgcagaactccgttgtgttggctcgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactattgagaaggttaagatgata 14851135  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||    
T  14851136 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaaaaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagag 14851235  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  14851236 tcactcatgtgaccggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttaactccgaggtttattggtccgtatcagatataggaaagaattggaacggtggc 14851335  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  14851336 gtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtatttcatgtgtcgcaaattcggaagtatg 14851409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 98 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14159941 - 14159461
Alignment:
Q  98 cttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctt 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14159941 cttgagcaaggtggaacttgggatagtcaccttccattaatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctt 14159842  T
Q  198 tatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttca 297  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |    
T  14159841 tgtacggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagaatgtggttttgggaccggagattgttcaacagactactgaaaaggttaa 14159742  T
Q  298 gatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttt 397  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || |||||     
T  14159741 gatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaaggaggagatcatgtgttc 14159642  T
Q  398 ttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaa 497  Q
     ||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| | ||||||    
T  14159641 ctgagagttactcccatgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaggtttattggtccatatcagatatcagaaagaattggaa 14159542  T
Q  498 cggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14159541 cggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcggaacttcggaagtatg 14159461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 101 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14652754 - 14652277
Alignment:
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |    
T  14652754 gagcaaagatgaacttgggatattcatcttccgttgatagaattcacgtacaataacagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggctctgt 14652655  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  | || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  14652654 atggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtatttttgggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaagat 14652555  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  14652554 gattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagatcacgtatttttg 14652455  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||||| |  |||| | |||||||||    
T  14652454 agagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacgg 14652355  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  14652354 tggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgtgtttcatatgtcgcaacttcggaagtatg 14652277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Original strand, 1639891 - 1640298
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||  | || |  ||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||| |||    
T  1639891 ttcgaagttgaggtggagtttggcgtatcatccgcagacagatggttagtcggaaagaacgattcagtcgctggaggacttgttgagagtttgtgtactt 1639990  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  1639991 gagcaaggagggacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacttacaataatatttatcattctagtattggaatgtcaccttttgaggctttgt 1640090  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1640091 atggtcgaagatgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagggtggttttaggacccgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagat 1640190  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  1640191 gattcaagaaaagatgaaggcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcataggaaagaccttgagttccaagaaggagatcatgtatttttg 1640290  T
Q  401 agagtcag 408  Q
    ||| ||||    
T  1640291 agactcag 1640298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 15003094 - 15003667
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||| |  ||||| | | ||||||||||| | ||  | ||||| |||||||    
T  15003094 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgctaagcgtatgtgtacttgagc 15003193  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||    
T  15003194 aaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatgg 15003293  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||  || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||     
T  15003294 tcggaagtggaggactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatgata 15003393  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  15003394 agagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaatcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagag 15003493  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| |  || | ||||||||| |||||    
T  15003494 ttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattgatccatatcagatatctgagagagttggaacagtggc 15003593  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15003594 atatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15003667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 274
Target Start/End: Original strand, 15147354 - 15147623
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  15147354 aagttgagattgagttcgacgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagc 15147453  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15147454 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 15147553  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15147554 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtgttcttaggaccagatattgtt 15147623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 269 - 578
Target Start/End: Original strand, 15149740 - 15150049
Alignment:
Q  269 attgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatc 368  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15149740 attgttcagcagactattgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatc 15149839  T
Q  369 ttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattgg 468  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||    
T  15149840 ttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattgg 15149939  T
Q  469 tccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaactt 568  Q
    ||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  15149940 tccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgacgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaactt 15150039  T
Q  569 cggaagtatg 578  Q
    ||||||||||    
T  15150040 cggaagtatg 15150049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 353 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15364580 - 15364355
Alignment:
Q  353 aagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 452  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15364580 aagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 15364481  T
Q  453 ccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgtttt 552  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15364480 ccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgtttt 15364381  T
Q  553 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    
T  15364380 ccatatgtcgcaacttcgaaagtatg 15364355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 98 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15070862 - 15070382
Alignment:
Q  98 cttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctt 197  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  15070862 cttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctt 15070763  T
Q  198 tatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttca 297  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |    
T  15070762 tgtatggtcagaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaa 15070663  T
Q  298 gatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttt 397  Q
    ||||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  15070662 gatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgttt 15070563  T
Q  398 ttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaa 497  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||  | |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || | ||||||||    
T  15070562 ctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgtgttgaagtttatgaagttgactacgaagtttattggtccataccagatatttgagagagttggaa 15070463  T
Q  498 cggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | ||||| ||  | |||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15070462 cagtggcatacagggtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15070382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 1649003 - 1649580
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  1649003 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagtgtgtgtgtgctt 1649102  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| |    
T  1649103 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacttacaacaacagttaccattcgagtattggtatgtcaccgttcgaagctttgt 1649202  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | || || ||||| || ||||| ||  | |||||  | |||||  |||||||  ||||    
T  1649203 atggtcggaggtgcagaactcctttatgctggtttgagtcatgagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactacgaagaaagtcaagat 1649302  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
     |||  ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||||| || || || || ||| |     
T  1649303 aatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttaccacgacaagcggaggaaggaccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttcta 1649402  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |  || |   ||||||| |    
T  1649403 agagttactcctatgacgggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacttccaagttcattggtccgtatcagatatcagagaggattggaactg 1649502  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| || || || || |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  1649503 tggcatatagagttgggttgccacctcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagctacggaagtatg 1649580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16146460 - 16145881
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgtt--gaggatttgtgttc 98  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||| |   | ||||||||  |  |||  | ||||| |    
T  16146460 ttcgaagttggggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgaagaggacgattcaatctttggaggatttactaagagtgtgtgtgtgc 16146361  T
Q  99 ttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttt 198  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  16146360 ttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagaattcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagattt 16146261  T
Q  199 atatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcag 298  Q
     ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||  | || || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||    
T  16146260 gtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggacagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaagtcaag 16146161  T
Q  299 atgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttt 398  Q
     ||||    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |  || || || |||     
T  16146160 gtgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggaggatgatcatgtatttc 16146061  T
Q  399 tgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaac 498  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | |||||||||    
T  16146060 tgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaac 16145961  T
Q  499 ggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  16145960 tgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttacatgtgtcgcagcttcggaagtatg 16145881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15246470 - 15245893
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||  |||| |  || || |   ||||||||||| ||||  | ||||| |||    
T  15246470 ttcgaagttgaggttgagttcgacttatcatccccagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattagaggatttggtgagagtgtgtgtactt 15246371  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| |||  |||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  15246370 gagcaaggtggaggttgggatagtcaactaccgttgatagagttgacgtacaacaacagtcaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 15246271  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  | ||||| || |||||  |||| ||  ||||    
T  15246270 atggtcggaggtgcagaactcctttattctagtttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacgaagaaggtaaagat 15246171  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |   ||||||||||||| ||||| || || ||| ||    
T  15246170 gataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaaacgtaggaaggcctttgagtttcaggagggagatcatgtatttctg 15246071  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    || |  |||||||| |    
T  15246070 agagttacccctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagataacagagagggttggaacag 15245971  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||  ||||| |||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  15245970 tggcatacagagtgcgtttgccaccacatctttcgaatttgcattatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 15245893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 11206957 - 11207534
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  11206957 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctt 11207056  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||  | || ||| | |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  11207057 gaacaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttggttgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 11207156  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  11207157 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggtt 11207256  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  11207257 gataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 11207356  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | |||||| || |    
T  11207357 agagtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacag 11207456  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  11207457 tggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 11207534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 3264520 - 3265097
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  3264520 ttcgaagttgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctt 3264619  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  3264620 gagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 3264719  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  3264720 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggtt 3264819  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  3264820 gataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 3264919  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| || |    
T  3264920 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacag 3265019  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  3265020 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 3265097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 27900925 - 27900462
Alignment:
Q  8 ttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaag 107  Q
    ||||| |||||||| || |||||||   ||||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||    
T  27900925 ttgaggttgagttcagcttatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtgcttgagcaag 27900826  T
Q  108 gaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcg 207  Q
    | ||| ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  27900825 gtggagcttgggatagtcacctaccgttcatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcg 27900726  T
Q  208 gagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaa 307  Q
    ||| ||||| ||| | || |||||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||||||  |    
T  27900725 gaggtgcaggacttctttatgctggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcaga 27900626  T
Q  308 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 407  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||| |||| || |    
T  27900625 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtta 27900526  T
Q  408 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtcc 471  Q
     |||||||||  |||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27900525 ctcctatgacgagtgtagaacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtcc 27900462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 8706460 - 8706078
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  8706460 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagc 8706361  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  8706360 aaggtgggacttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtatatgaatgacaccattcgaagctttgtatgg 8706261  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || |||||||| || ||||  || |||||| || | ||     
T  8706260 tcggaggtgcagaacttcgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgtagtgttgggaccggatattgttcaccagactatagaaaaagttaagctaata 8706161  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggaga 387  Q
      ||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  8706160 agagaaaagatgaaagcgtcgcagaatcgacacaagagttatcacgacaagcgtaggaaagaccttgaatttaaggaaggaga 8706078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20891528 - 20890952
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  20891528 ttcgaagttgaggttgagttcgacttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtactt 20891429  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  20891428 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccattgattgagttcacatataacaatagctatcattcaagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 20891329  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || |||||  |  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  20891328 atggccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccgaatttggttcatgagactactgagaaagtcaggtt 20891229  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  20891228 gataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 20891129  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||  || |  |||||||| |    
T  20891128 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggttcgtatcagatttcagagagggttggaacag 20891029  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |  ||||||| ||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  20891028 tggcatataggatgggttt-ccaacacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 20890952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 33223469 - 33222887
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaa-----attcagttgctagaggatttgttgaggatttgtg 95  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||| |     || || |   | || |||||  ||||  | ||||    
T  33223469 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggagaggacgatccaatcattggaagatttactgagagtgtgtg 33223370  T
Q  96 ttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggc 195  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |  || || |  |||||||| ||| |||| ||| | ||    
T  33223369 tacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacataaaacaaaaaataacaatagagtattggtatgacaccattcaaagc 33223270  T
Q  196 tttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagtt 295  Q
     || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||  | |||||  ||||||||||||||||     
T  33223269 attgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagacttggttcatgaaactactgagaaagtc 33223170  T
Q  296 cagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgt 395  Q
     || ||||    || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || |    
T  33223169 aagttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggaacttgagtttcaggagggtgatcatgttt 33223070  T
Q  396 ttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgg 495  Q
    || |||| |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||   | | ||||||    
T  33223069 ttctgagggtcactcctttgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgacaccaaagttcattggtccgtatcagatttcaaagagagttgg 33222970  T
Q  496 aacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||| ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  33222969 aacagtggcatatagagttggtttgccaccccatctttcgaacatgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 33222887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 29453263 - 29453840
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||| |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  29453263 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctt 29453362  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  29453363 gagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 29453462  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||  ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  29453463 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtattgggacgggatttggttcatgagactactgagaaagtaaggtt 29453562  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  29453563 gataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 29453662  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | |||||| || |    
T  29453663 agggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacag 29453762  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  29453763 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 29453840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Original strand, 15358816 - 15359295
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||  ||||  | | ||| |||    
T  15358816 ttcgaagttgaggttgagttcgacttatcatcctcagagagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtctgtgctt 15358915  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  15358916 gaacaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcatgtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 15359015  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||| ||  ||||    
T  15359016 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtaaagat 15359115  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||  |    
T  15359116 gataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttttcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttccg 15359215  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 480  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  15359216 agagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaaatcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagat 15359295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 407
Target Start/End: Original strand, 15414756 - 15415158
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  || |||||| | |||||  |||| |  ||||| | | |||| |||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  15414756 aagttgaggttgagttcagcttatcatccgcaaacagatagccagtcggagagaacgattcaatcgttagatgatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 15414855  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  15414856 aaggtggagtttgggatagtcatctgccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaggctttgtatgg 15414955  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga-tgat 303  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || |||| ||| | ||||    
T  15414956 tcggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatatagttcaacagactacgga-aaaggtcaaattgat 15415054  T
Q  304 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 403  Q
        ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15415055 aagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaaggagaccatgtgtttttgaga 15415154  T
Q  404 gtca 407  Q
    ||||    
T  15415155 gtca 15415158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 92 - 578
Target Start/End: Original strand, 51605998 - 51606484
Alignment:
Q  92 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcg 191  Q
    ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  51605998 tgtgtgcttgaacagggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcactcgagtataggaatggcaccattcg 51606097  T
Q  192 aggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaa 291  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||  | ||||| ||  | |||||| | ||||| || ||    
T  51606098 aagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaa 51606197  T
Q  292 agttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccac 391  Q
    |||  ||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |  ||||||||||| || || || ||     
T  51606198 agtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaaacggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcat 51606297  T
Q  392 gtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaag 491  Q
    || ||| | ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || | |     
T  51606298 gtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaa 51606397  T
Q  492 ttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | ||||||||||| ||| |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  51606398 tcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 51606484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15078177 - 15077825
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||||  |||| |  ||||||| | ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  15078177 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacaaatggtcagtcgaagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 15078078  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15078077 aaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 15077978  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||     
T  15077977 tcagaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgata 15077878  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcg 357  Q
      ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15077877 agagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcg 15077825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 249 - 412
Target Start/End: Original strand, 16676417 - 16676580
Alignment:
Q  249 gagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatca 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16676417 gagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgatttaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatca 16676516  T
Q  349 tgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcct 412  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16676517 tgataagcgcaggaaggatcttgagtttcagcaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcct 16676580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 44661596 - 44662169
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||| | | | || |||||||||||  | ||||| ||||| |    
T  44661596 aagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcgaagaggacgattcaatcgttggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgaac 44661695  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttc-cgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 203  Q
    |||| ||| ||||||| |||| ||||  | ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||    
T  44661696 aaggtggagcttgggacagtc-tcttgtctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatg 44661794  T
Q  204 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 303  Q
    ||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||    
T  44661795 gtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgat 44661894  T
Q  304 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 403  Q
       ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||||     
T  44661895 aagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccgtgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagg 44661994  T
Q  404 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 503  Q
    || | |||| |||| ||||| || |||||  ||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||| ||||    
T  44661995 gttactcctttgacgggtgttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtgg 44662094  T
Q  504 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  44662095 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 44662169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13248061 - 13247814
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||| | ||||| || || |||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |    
T  13248061 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattaggatggctccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtagaacaccgttgtgtt 13247962  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| || || ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  13247961 ggtttgaatccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagag 13247862  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttca 378  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  13247861 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaagatattgagtttca 13247814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 427 - 578
Target Start/End: Original strand, 14927151 - 14927302
Alignment:
Q  427 acgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccg 526  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || |  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||    
T  14927151 acgtgcattgaagtcaaagaatttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtactgagtgggtttaccaccg 14927250  T
Q  527 catctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  14927251 catctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatg 14927302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 15293013 - 15293335
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  15293013 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 15293112  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  15293113 ggtttgagtccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacagaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 15293212  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||  | || || ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| ||| ||| || || |||    
T  15293213 tagacagaagagttatcatgataaaaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaatggagtgggtcgt 15293312  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  15293313 gctttgaagtgtaggaagttgac 15293335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 55375214 - 55375536
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |||| || || || | |||||| |    
T  55375214 ccgttgattgagtttacttacaacaacagtttacattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacactgttgtgtt 55375313  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| ||||||||||| |   | |||||||||||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||    
T  55375314 ggtttgaatcaggtgaaagtgctttgttaggaccagaagttgtacaagaaactacggaaaaggttaagatgattcagtagaagatgaaagcgtctcagag 55375413  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| | |||||||| || ||     
T  55375414 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtaactggtgttggtcga 55375513  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  55375514 gctttgaagtgtatgaagttgac 55375536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 9291250 - 9290929
Alignment:
Q  132 cgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctg 231  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |  |||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||    
T  9291250 cgttgattgagtttacttacaacagcagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccattgtgttg 9291151  T
Q  232 gtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagt 331  Q
    ||||||||| || ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  9291150 gtttgagtccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagt 9291051  T
Q  332 cgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtg 431  Q
     |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || || |||||||| || | |||| |||| | ||| || | ||    
T  9291050 agacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcaggtatttttgagggtgaatcctgtgaccgatgttggtcatg 9290951  T
Q  432 ctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    |||||||||  | |||||||||    
T  9290950 ctttgaagtgtaggaagttgac 9290929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 314 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16752826 - 16752669
Alignment:
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||||||||||| | ||| |    
T  16752826 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccga 16752727  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtcc 471  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||||||||    
T  16752726 tgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcattggtcc 16752669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 14997732 - 14997410
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  14997732 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtattggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 14997633  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||||||  | || || |   | ||||||||  |  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  14997632 ggtttgagtccagagagagtgctttgttaggaccgaaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtctcagag 14997533  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||| ||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | || | |||| || || || |||    
T  14997532 tagacagaagagtcatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcttgtgaccggagttggtcgt 14997433  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  14997432 gctttgaagtgtaggaagttgac 14997410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 42703103 - 42702872
Alignment:
Q  347 catgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaaga 446  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| | ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |    
T  42703103 catgacaaacggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaa 42703004  T
Q  447 agttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaa 546  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || | | | ||||||||||| ||| |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |    
T  42703003 agttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatga 42702904  T
Q  547 tgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  42702903 tgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 42702872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 440
Target Start/End: Original strand, 12132293 - 12132574
Alignment:
Q  158 agttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtct 257  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||| || |||||||| |||| |||| |||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||  | |    
T  12132293 agttttcattctagtatcggtatgacaccgtttgaggctttgtatgatcgg-gatgtagaacgtcgttgtgttggtatgagtcaggtgaaagtgttttgt 12132391  T
Q  258 taggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcg 357  Q
    |||| |||||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | || ||||||| |||||| ||| |    
T  12132392 taggtccagaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcaaagtaggcagaagagttgtcatgataagag 12132491  T
Q  358 tagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 440  Q
     || || ||  |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | || | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12132492 gaggaaggacattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 12132574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 380
Target Start/End: Original strand, 12342719 - 12342968
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || | || ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||| || |||||  ||||||| |    
T  12342719 ccgttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtattgggatggcaccgtttgaggctttgtatggttggaggtgtagaacgtcgttgtgtt 12342818  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||| ||||||||||||||| |   |  ||||||| ||| |||| ||  | |||||  | || ||| ||||||| |||||||| || | |||||| |||||    
T  12342819 ggtatgagtcaggtgaaagtgctttactaggaccggaggttgtgcaagagactacataaaaggttaagatgattcaagagaatataagggcgtctcagag 12342918  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 380  Q
    | | || |||||||||||||| ||| | || ||  || ||||||||||||    
T  12342919 taggcagaagagttatcatgataagaggaggaagaatattgagtttcagg 12342968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 418 - 560
Target Start/End: Original strand, 18164332 - 18164474
Alignment:
Q  418 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 517  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||  ||||||||    
T  18164332 tggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagctgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggt 18164431  T
Q  518 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgt 560  Q
    || || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||    
T  18164432 ttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgt 18164474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 528 - 578
Target Start/End: Original strand, 18607823 - 18607873
Alignment:
Q  528 atctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607823 atctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 18607873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 453
Target Start/End: Original strand, 16445234 - 16445390
Alignment:
Q  297 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 396  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | || || ||| |||||||||| |  || || || |||||    
T  16445234 agatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtt 16445333  T
Q  397 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||| || || | |||| ||||||| || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  16445334 ttttagggtgaatcctgtgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 16445390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 14160012 - 14159970
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtc 47  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14160012 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccacagacagatggtc 14159970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 578
Target Start/End: Original strand, 15415214 - 15415282
Alignment:
Q  510 gagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||| || || |||| |||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15415214 gagtgggtttgccaccacatccttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15415282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 14691444 - 14691353
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgt 96  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | || |  ||||||| | ||||||| ||||||||  |||||||    
T  14691444 aagttgaggttaagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttagaggacttgttgagagtttgtgt 14691353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 15319693 - 15319647
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtc 51  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  15319693 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtc 15319647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 494; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 16350397 - 16350974
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16350397 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 16350496  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16350497 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 16350596  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350597 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 16350696  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16350697 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 16350796  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16350797 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 16350896  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350897 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16350974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 21830864 - 21830287
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  21830864 ttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctggaggatttgttgaggatttgtgttctc 21830765  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21830764 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttaatcgagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttat 21830665  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21830664 atggtcggagatgtagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagat 21830565  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21830564 gatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtggaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttg 21830465  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21830464 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacgg 21830365  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21830364 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 21830287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 51333291 - 51333868
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51333291 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 51333390  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  51333391 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 51333490  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333491 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 51333590  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  51333591 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaataaggagaccacgtgtttttg 51333690  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||    
T  51333691 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcatatattggaaagagttggaacgg 51333790  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51333791 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 51333868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 19106928 - 19106351
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19106928 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttctt 19106829  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  19106828 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgagtctttgt 19106729  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19106728 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagat 19106629  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106628 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcggagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 19106529  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  19106528 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccatatcagatatcggaaagagttggaacgg 19106429  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106428 tggcgtatcgagttggattactaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19106351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 33390827 - 33391404
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33390827 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 33390926  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  33390927 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgt 33391026  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391027 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 33391126  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33391127 gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 33391226  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33391227 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 33391326  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33391327 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 33391404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 41354267 - 41354844
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41354267 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcaatcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 41354366  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  41354367 gagtaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 41354466  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41354467 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatccggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaaccactgagaaagttcagat 41354566  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  41354567 gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttg 41354666  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41354667 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacctcgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacgg 41354766  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354767 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 41354844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 21837511 - 21836934
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21837511 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 21837412  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  21837411 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgacgctttgt 21837312  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21837311 atggtcggagatgcacaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactactgagacagttcagat 21837212  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21837211 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgatcagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 21837112  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21837111 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 21837012  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21837011 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcaaaagtatg 21836934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 17044813 - 17045390
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17044813 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatctgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttctt 17044912  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17044913 gagcaaggatgaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 17045012  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17045013 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagat 17045112  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17045113 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttg 17045212  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  17045213 agagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 17045312  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045313 tggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 17045390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 16078450 - 16079008
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  16078450 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctggaggatttgttgagagtttgtgttctt 16078549  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  16078550 gagcaaggaggaacttgggataatcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttaaggctttgt 16078649  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16078650 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagat 16078749  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||                   ||||||||||||||||||||||||    
T  16078750 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg-------------------caggaaggagaccacgtgtttttg 16078830  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  16078831 agagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatgg 16078930  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16078931 tggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactacggaagtatg 16079008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 50620046 - 50620619
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | || |  ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  50620046 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagggtttgtgtacttgagc 50620145  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  50620146 aaggaggaaattgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaattgcaccttttgaggctttgtatgg 50620245  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||     
T  50620246 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggttttaggacctgagattgttcaataaactactgagaaggttaagatgatt 50620345  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||    
T  50620346 caacaaaagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaggaagatcacgtatttttgagag 50620445  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |  |||| |||||||| ||||||    
T  50620446 tcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaatggtggc 50620545  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  50620546 atatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatg 50620619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 35 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20250377 - 20249834
Alignment:
Q  35 cagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgt 134  Q
    ||||||||||||||||   ||||||  ||||||| | | ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20250377 cagacagatggtcagttggagaggacgattcagtcgttggaggatttgttgagagtttatgtacttgagcaaggtggaacttgggatagtcatcttccat 20250278  T
Q  135 tgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtt 234  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20250277 tgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtt 20250178  T
Q  235 tgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcga 334  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  20250177 tgagtcaagcgaaagagtggtcttaggaccagagatcgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcga 20250078  T
Q  335 caaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctt 434  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || |    
T  20250077 caaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagcgt 20249978  T
Q  435 tgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttc 534  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||| |||| |  |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  20249977 tgaagtcaaagaagttgactccgaaatttattgttccgtataagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcacctttc 20249878  T
Q  535 gaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20249877 gaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 20249834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 36 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20137304 - 20136762
Alignment:
Q  36 agacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 135  Q
    ||||||||||||||||  | || |  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20137304 agacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggagggacttgggatagtcatcttccatt 20137205  T
Q  136 gatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttt 235  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20137204 gatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtataggaatggcgccttatgaagctttgtatggtcggagatgcagaacttcgttgtgttggttt 20137105  T
Q  236 gagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgac 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  20137104 gagttaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagtgtcgcagagtcgac 20137005  T
Q  336 aaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgcttt 435  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||    
T  20137004 aaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagacctcgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcctt 20136905  T
Q  436 gaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcg 535  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||| | ||||| |||||| || ||||| ||||| || |||||||| | ||||||||||    
T  20136904 gaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttgggacagtggcgtatcgtgttggtttaccacggcatctttcg 20136805  T
Q  536 aatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20136804 aatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 20136762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 578
Target Start/End: Original strand, 19760680 - 19761241
Alignment:
Q  17 agttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaactt 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | || |  ||||||| | | || || ||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19760680 agttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttggaagacttgctgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaactt 19760779  T
Q  117 gggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcag 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| || ||    
T  19760780 gggatagtcatcttccgttgatagagttcatgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacacctttcgaagctctgtatggtcggaggtgtag 19760879  T
Q  217 aactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatg 316  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| || |||    
T  19760880 gactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcagcaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatg 19760979  T
Q  317 aaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatga 416  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | |||    
T  19760980 aaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttgtga 19761079  T
Q  417 ctggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtggg 516  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||||| || |||||||| |  |||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  19761080 ttggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggaccgtatcagatatccgaaagaattggaacggtggcgtatcgagtggg 19761179  T
Q  517 tttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||  || | || ||||| |||||||||||| ||||||    
T  19761180 tttaccaccgcacctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtatcgcaacttcggtagtatg 19761241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16369854 - 16369281
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |  ||||||| | | || || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  16369854 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagc 16369755  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||    
T  16369754 aaggaggaacgtgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatgacactttttgaggctttgtatgg 16369655  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||  |||||||     
T  16369654 taggaggtgcagaacttcgttgtgttggtttgagtgaggtgagaatgtggttttaggaccagagattgttcaacaaactattgaaaaggtaaagatgatt 16369555  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||    
T  16369554 caagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagggttatcatgataagcgtaggaaagaccttgaattccaagaaggagatcatgtatttttgagag 16369455  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  16369454 tcactcctgtgacaagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtctatatcagatatcagaaagagttggaacggtggc 16369355  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || || || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16369354 gtaccgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16369281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 154 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 21747942 - 21747519
Alignment:
Q  154 taatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtg 253  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  21747942 taataattatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatgctcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagttaggcgaaagagtg 21747843  T
Q  254 gtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgaca 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  21747842 gtcttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccataata 21747743  T
Q  354 agcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  21747742 agcgtag-aaagatcttgagtttctagaaggagaccacatatgtttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaa 21747644  T
Q  454 cccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttc 553  Q
     ||||  || |||||| | |||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||     
T  21747643 tccgagatttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgttt 21747544  T
Q  554 catgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21747543 catgtgtcgcaacttcggaagtatg 21747519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 19854870 - 19854298
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |  || ||||||||  ||||  | || || ||||| |    
T  19854870 aagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcactggaggatttactgagagtgtgcgtgcttgaac 19854771  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| ||| |    
T  19854770 aaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgat-gagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcacggttcgaagctttgtatag 19854672  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||    
T  19854671 tcggaggtgcaggactcctttacgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatc 19854572  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || || ||| ||||||    
T  19854571 agagagaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagag 19854472  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | | ||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||  || |  |||||||| |||||    
T  19854471 ttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatttcagagagggttggaacagtggc 19854372  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| |||| ||||| || ||  ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  19854371 atatagagttggtttgccaccaaatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 19854298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 74 - 578
Target Start/End: Original strand, 20939934 - 20940438
Alignment:
Q  74 gaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagta 173  Q
    |||||||| |||||  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  20939934 gaggatttattgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagta 20940033  T
Q  174 ttggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgt 273  Q
    |||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  || ||||| || |||| |||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||    
T  20940034 ttgttatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtataggactcctttatgctagtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggt 20940133  T
Q  274 tcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgag 373  Q
    ||| |||||||  ||||||||  ||||||||  ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||    
T  20940134 tcatcaaactatagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgag 20940233  T
Q  374 tttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccat 473  Q
    |||||||| || || || || ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  20940234 tttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgt 20940333  T
Q  474 atcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaa 573  Q
    ||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  20940334 atcagatatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaa 20940433  T
Q  574 gtatg 578  Q
    |||||    
T  20940434 gtatg 20940438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 22432914 - 22433491
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||| || |   | || |||||||||||| | |||||  ||    
T  22432914 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacaatccaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtggtt 22433013  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || | | |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |    
T  22433014 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctactgctgatagagttcacatataacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccattcgaagctttgt 22433113  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||| |||| || || ||||| || ||||||||||||||||| |  || ||||| || |||||  |  | |||||  | ||||| || |||||| ||||    
T  22433114 atggttggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagcgagtgtggtgttgggaccgaatttggttcatgagactacagaaaaagttaagat 22433213  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    |||||||||||||| || || || |||||  ||    
T  22433214 gatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagccccttgagtttcaggagggtgatcatgtgttcctg 22433313  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || || | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||  || |  |||| ||| |    
T  22433314 agggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggttcgtatcagatttcagagagggttgcaactg 22433413  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||| ||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22433414 tggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaatatgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 22433491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Original strand, 20835686 - 20836231
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||  |||| |  || |  |   | ||||||||| ||||  | ||||| |||    
T  20835686 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagacggtcaatcggagagaacgataccatccttggaggatttgctgagagtgtgtgtactt 20835785  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |    
T  20835786 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggctccgttcgaagctttgt 20835885  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  20835886 atggtcggaggtgtagaactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgttttgggaccagatttggttcatcagactacagagaaagtcaagat 20835985  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |  ||| ||||| |||| || || || || ||| ||    
T  20835986 gatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgttggaaggcccttaagttttaggagggtgatcatgtttttctg 20836085  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtc---aaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaa 497  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||| | || |||||    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||    
T  20836086 agagttactcctatgacgggtgtaggacgtacatttaagtcgaagaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaa 20836185  T
Q  498 cggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
    | ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  20836186 ctgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 20836231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20294973 - 20294396
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||| |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  20294973 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctt 20294874  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||| || ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  20294873 gagcagggtggagcttcggatagtcaccttccattgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 20294774  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga- 299  Q
    ||||| |||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||| || ||||     
T  20294773 atggttggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaggt-cagaa 20294675  T
Q  300 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 399  Q
    ||||    || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||| |    
T  20294674 tgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtttttct 20294575  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
    ||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || | |||||| ||     
T  20294574 gagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtaca 20294475  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  20294474 gtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 20294396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 20856559 - 20857136
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||  | ||||  || || |   ||||||||||  | || || ||||| |||    
T  20856559 ttcgaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacatatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattagaggatttactaagaatatgtgtactt 20856658  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||||| || || ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||| |||| |||||||| || || ||||| |    
T  20856659 gagcagggtggagcttgggacagtcacctaccattgatagaatttacatacaacaacagttaccattcgagtgttggtatggcaccgtttgaagctttgt 20856758  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || || |  ||  | |||||  ||||||| ||||||||  ||||    
T  20856759 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcgagtcgggagaaagtgttgtgttggggctggaattggttcatgaaactacggagaaagtcaagat 20856858  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  20856859 gattagggagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagctatcacgacaagcgtaggaaggaccttgcgtttcaggaaggtgaccatgtttttctg 20856958  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || || | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||| |    
T  20856959 agggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttaccagatttcagaaagagttggaactg 20857058  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  20857059 tggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatg 20857136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 41308382 - 41307907
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  41308382 aagttgagattgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 41308283  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  41308282 aaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacaattagcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 41308183  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||| || ||||  ||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| || ||||  ||  | ||||| || ||||| ||||||||  | || ||     
T  41308182 tcgaaggtgcatgactcctttatgttggtttgagttgggagaaagtgtggtgttgggactggatttggttcatcagactacggagaaagtcaaaataata 41308083  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| || |||||||| |||||| |||| |    
T  41308082 agagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaagccccttgagtttcaagagggagaccatgtgtttctgaggg 41307983  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 480  Q
    | | ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  41307982 ttactcctatgacgggtgtatgacgtgcattgaagtctaaaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagat 41307907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 272 - 578
Target Start/End: Original strand, 19664945 - 19665251
Alignment:
Q  272 gttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttg 371  Q
    ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  19664945 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaagcccttg 19665044  T
Q  372 agtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtcc 471  Q
    ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19665045 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggggtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactcctaagttcattggtcc 19665144  T
Q  472 atatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 571  Q
     ||||||||||  || |  |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  19665145 gtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtatttcatgtgtcgcaacttcgg 19665244  T
Q  572 aagtatg 578  Q
    |||||||    
T  19665245 aagtatg 19665251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 37677641 - 37677063
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||  | || || |||    
T  37677641 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgcgtgctt 37677542  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| || ||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  37677541 gagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 37677442  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  37677441 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggtt 37677342  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttt-tt 399  Q
    |||    || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||| ||    
T  37677341 gataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctt 37677242  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
    ||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| ||     
T  37677241 gagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtaca 37677142  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  37677141 gtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtctctcagcttcggaagtatg 37677063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 161 - 578
Target Start/End: Original strand, 31550139 - 31550556
Alignment:
Q  161 tatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 260  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  31550139 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgg 31550238  T
Q  261 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtag 360  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   | ||||   ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  31550239 gaccggatttagttcatgagactacggagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaag 31550338  T
Q  361 aaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 460  Q
    ||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| |||| |||| |||| ||||| || || ||||||||||| |  |||||||| || |||    
T  31550339 aaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaag 31550438  T
Q  461 ttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgt 560  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||| || ||||| |    
T  31550439 ttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgttt 31550538  T
Q  561 cgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | || |||||||||||||    
T  31550539 ctcagcttcggaagtatg 31550556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 389 - 578
Target Start/End: Original strand, 50612602 - 50612791
Alignment:
Q  389 cacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaa 488  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |  ||||    
T  50612602 cacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaa 50612701  T
Q  489 aagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  50612702 gagttggaatggtggcatatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatg 50612791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 325 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20244437 - 20244184
Alignment:
Q  325 gcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgta 424  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| || | ||||||||| |||||     
T  20244437 gcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggttactcctatgacgggtgtg 20244338  T
Q  425 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgc 524  Q
    |||| ||| |||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  || |  |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || |    
T  20244337 ggacatgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccatatcagatttcagagagggttggaacagtggcctatagagttggttttccac 20244238  T
Q  525 cgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  20244237 cacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 20244184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21749498 - 21749356
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| | |||| |||||||||||  ||||||| |||||||    
T  21749498 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagc 21749399  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcac 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  21749398 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgataaagttcac 21749356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 464 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 21163378 - 21163264
Alignment:
Q  464 attggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgc 563  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  21163378 attggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgcacgacattttccatgtgtcgc 21163279  T
Q  564 aacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||||||||    
T  21163278 aacttcggaagtatg 21163264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 314 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 11382842 - 11382674
Alignment:
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||| ||||||||| ||||     
T  11382842 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctt 11382743  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 482  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  11382742 tgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagattt 11382674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 314 - 578
Target Start/End: Original strand, 20075170 - 20075434
Alignment:
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||| || ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| | || |||| ||||     
T  20075170 atgaaagcttcgcaaagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctaagggtcactcctt 20075269  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 513  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | ||| ||||| ||||| |||  |||    
T  20075270 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagtgggaacagtggcatataaagt 20075369  T
Q  514 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  20075370 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 20075434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 24099402 - 24099577
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  24099402 tcgaggttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttg 24099501  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattgg 177  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  24099502 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattgg 24099577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 20831320 - 20831642
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  20831320 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 20831419  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| || || ||||| |   | || || || ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  20831420 ggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 20831519  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| || || || |||    
T  20831520 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgt 20831619  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||| ||||  | |||||||||    
T  20831620 gctttaaagtgtaggaagttgac 20831642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 22362046 - 22362167
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||| | || |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  22362046 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacatatggtcagtcggagaggacgatttagttgttggaagatttgttcagagtttgtgtacttgagc 22362145  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22362146 aaggaggaacttgggatagtca 22362167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 210
Target Start/End: Original strand, 19663025 - 19663143
Alignment:
Q  92 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcg 191  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  19663025 tgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtatcggtatggcaccgttcg 19663124  T
Q  192 aggctttatatggtcggag 210  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  19663125 aagctttgtatggtcggag 19663143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20914638 - 20914319
Alignment:
Q  134 ttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 233  Q
    ||||| ||||| || ||||| || | || |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  20914638 ttgattgagtttacttacaaaaacaattttcatactagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 20914539  T
Q  234 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 333  Q
    ||||||| || ||||| |   | |||| ||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |    
T  20914538 ttgagtccggagaaagtgctatgttagaaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtag 20914439  T
Q  334 acaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgct 433  Q
    | | |||||||||||| | ||  | ||||| ||| |||||||||| |  || || || || |||||||| || | |||| |||| ||||| || ||||||    
T  20914438 agagaagagttatcattataaatggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgct 20914339  T
Q  434 ttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    |||||||  | |||||||||    
T  20914338 ttgaagtgtaggaagttgac 20914319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 22135486 - 22135756
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| || || || ||||| || |||| | |||||||||| |  |||||||| || |||||||| |||||||| || || || || || ||||| |    
T  22135486 ccgttgattgattttacttacaacaacagtttttattctagtatcgatatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaaggtgtaggacgccattgtgtt 22135585  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||||||||||||||| |   | |||||||||||  |||| ||  |||||||  | |||||| ||||||| || | ||| ||||| ||||| |||||    
T  22135586 ggtttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccagaagttgtgcaagaaactacgaaaaaagttaagatgattcaggggaagatgaaagcgtctcagag 22135685  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    | | || |||||||||||||| ||| | ||||| ||  || |||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  22135686 taggcagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattaagtttcaggttggtgaccatgtgtttttga 22135756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 404 - 578
Target Start/End: Original strand, 20395194 - 20395368
Alignment:
Q  404 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 503  Q
    |||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||||  ||||    
T  20395194 gtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgaggaatttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaatagtgg 20395293  T
Q  504 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || ||| | || || |||||||||||||    
T  20395294 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatatttctcagcttcggaagtatg 20395368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 19662939 - 19662989
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtc 51  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19662939 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtc 19662989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Original strand, 21202371 - 21202524
Alignment:
Q  287 gagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggag 386  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||  | || |||||||||||||| ||| | | ||| ||| ||||||||||||  || |    
T  21202371 gagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagaaggcagaagagttatcatgataagaggacaaaggatattgagtttcaggttggtg 21202470  T
Q  387 accacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 440  Q
    | ||  ||||||||||||| | |||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  21202471 atcatatgtttttgagagtgaatcctataaccggtgttggacgtactttgaagt 21202524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 31539808 - 31539920
Alignment:
Q  14 ttgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaa 113  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||     
T  31539808 ttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggag 31539907  T
Q  114 cttgggatagtca 126  Q
    ||||||| |||||    
T  31539908 cttgggacagtca 31539920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 46519004 - 46518830
Alignment:
Q  279 aaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttca 378  Q
    ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| || ||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| | || || ||| ||||||||||    
T  46519004 aaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagattaagacgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttca 46518905  T
Q  379 ggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
     |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| ||||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  46518904 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 46518830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 490; Significance: 0; HSPs: 66)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 27668398 - 27668975
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27668398 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 27668497  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27668498 gaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 27668597  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668598 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 27668697  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27668698 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 27668797  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27668798 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacgg 27668897  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27668898 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccacgtgtcgcaacttcgaaagtatg 27668975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 14999647 - 15000224
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14999647 ttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacatatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 14999746  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14999747 gagcaaggaggaatttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgagactttat 14999846  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999847 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 14999946  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14999947 gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 15000046  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15000047 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 15000146  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15000147 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 15000224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 19770438 - 19769861
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19770438 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 19770339  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19770338 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 19770239  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770238 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 19770139  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19770138 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 19770039  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  19770038 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagtcggaacgg 19769939  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19769938 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 19769861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 22332795 - 22333372
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22332795 ttcgaagttgaggttgagttcggcatatcatccgcagaaagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttcagaatttgtgttctt 22332894  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332895 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacagacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttat 22332994  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  22332995 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtccggat 22333094  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22333095 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttg 22333194  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22333195 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 22333294  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333295 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22333372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 34566972 - 34566395
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34566972 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 34566873  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  34566872 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgt 34566773  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566772 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 34566673  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34566672 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 34566573  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34566572 agagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 34566473  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34566472 tggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 34566395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 40709258 - 40708681
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40709258 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 40709159  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  40709158 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 40709059  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709058 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 40708959  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  40708958 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccgcgtgtttttg 40708859  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  40708858 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 40708759  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40708758 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 40708681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16356980 - 16356403
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16356980 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 16356881  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  16356880 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgt 16356781  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356780 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 16356681  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16356680 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 16356581  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16356580 agagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 16356481  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16356480 tggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttctccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16356403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 27685308 - 27685885
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27685308 ttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 27685407  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27685408 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatgacacctttcgaggccttat 27685507  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685508 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 27685607  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27685608 gatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 27685707  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27685708 agagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 27685807  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27685808 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccacgtgtcgcaacttcgaaagtatg 27685885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27518885 - 27518308
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27518885 ttcgaagttgagattgagttcgacgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 27518786  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27518785 gagcaagggggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 27518686  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518685 atggttggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 27518586  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27518585 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagacctcgtgtttttg 27518486  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27518485 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 27518386  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27518385 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcacaacttcgaaagtatg 27518308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 29475981 - 29476558
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29475981 ttcgaagttgaggttgagttcagcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggattttttgagaatttgtgttctt 29476080  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476081 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttat 29476180  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||    
T  29476181 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacagactactgaaaaagttcggat 29476280  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476281 gatccaagagaaaatgaaggcgtcacagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 29476380  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  29476381 agagtcactcctatgacggatgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccacgaagttcattggtccatatcaggtattggaaagagttggaacgg 29476480  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29476481 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 29476558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 41771320 - 41770743
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41771320 ttcgaagttcagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 41771221  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  41771220 gaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagctcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 41771121  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41771120 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 41771021  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41771020 gatccaagagaaaatgaaggcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 41770921  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41770920 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagattttggaaagagttggaacgg 41770821  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41770820 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 41770743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 576
Target Start/End: Original strand, 37291404 - 37291979
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37291404 ttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttgttgagaatttgtgttctt 37291503  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291504 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 37291603  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37291604 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcagat 37291703  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37291704 gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagtgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 37291803  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37291804 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaaaaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 37291903  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagta 576  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37291904 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtctcaacttcgaaagta 37291979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22135146 - 22134569
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  22135146 ttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagatagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagagaatttgttgagaatttttgttctt 22135047  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135046 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttat 22134947  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22134946 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctagtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcagat 22134847  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22134846 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgcagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttg 22134747  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  22134746 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacag 22134647  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22134646 tggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 22134569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27610832 - 27610255
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27610832 ttcgaagttgagattgagttcggtgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 27610733  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27610732 gagcaaggagggacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 27610633  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610632 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 27610533  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27610532 gatccaagagaaaatgaaagcgccgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 27610433  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27610432 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 27610333  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27610332 tggcttaccgagtgggtttaccaccgcaacttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 27610255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22348901 - 22348326
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||  | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22348901 ttcgaagcagagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctcaatgatttgttggggatttgtgttctt 22348802  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22348801 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 22348702  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22348701 atggtcggaggtgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtagtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 22348602  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22348601 gattcaagagaaaattaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaa--atcttgagtttcgggaaggagaccacgtatttttg 22348504  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22348503 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 22348404  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22348403 tggcctaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 22348326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23574216 - 23573643
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  23574216 aagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagc 23574117  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23574116 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 23574017  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  23574016 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgatt 23573917  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23573916 caagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 23573817  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  23573816 tcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 23573717  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573716 gtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23573643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23440699 - 23440126
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23440699 aagttgagattgagttcggtgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaaaaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagc 23440600  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23440599 aaggtggaacttgggatagtcatcttccattgattgagtttacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttcaggctttatatgg 23440500  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  23440499 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagttaggagaaagagtggtcttaaaaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaaaatgatt 23440400  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23440399 caagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttaagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 23440300  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  23440299 tcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaatgaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 23440200  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440199 gtatcgagagggattaccaccgcatctttcgaatttgcaagaagtattccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23440126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18776248 - 18775678
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  18776248 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaaactttgtgttctt 18776149  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  18776148 gagcaaggaggaacttgggatagtcat-------tgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattcgaatggcaccttttgaggctttgt 18776056  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18776055 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagcagactactgagaaagttaagat 18775956  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18775955 gattcaagagagaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggagggagaccacgtctttttg 18775856  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  18775855 agagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccctgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 18775756  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||   ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775755 tgatgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 18775678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 23517015 - 23516443
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  23517015 aagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagc 23516916  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  23516915 aaggaggaacttgggataatcatcttccgttgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttggtatgg 23516816  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||     
T  23516815 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccaagaaggttaagatcatt 23516716  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23516715 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 23516616  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||| |||| |  |||| |||||||||||||||    
T  23516615 tcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtattagatatcagaaagagttggaacggtggc 23516516  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 577  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23516515 atatcgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcaagatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtat 23516443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20799234 - 20798661
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||  | |||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  20799234 aagttgagattgagtttggcttattatccgcggacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgcgagtttgtgttcttgagc 20799135  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20799134 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 20799035  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||     
T  20799034 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagaggtcttaggaccaaagattgttcagcagactactgagaaggttaagatgatt 20798935  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20798934 caagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 20798835  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||| || |  |||| ||||||| |||||||    
T  20798834 tcactcctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcaaatatcagaaagagttggaccggtggc 20798735  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20798734 atatcgattgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaaatatg 20798661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 25423663 - 25423090
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||  ||||||| | |||| |||||||||||  ||||||| |||||||    
T  25423663 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagacagagaagacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagc 25423564  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  25423563 aaggaggaactagggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatgg 25423464  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||     
T  25423463 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgatt 25423364  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25423363 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 25423264  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  || ||||| || |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  25423263 tcactcttgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtgaaagaagttgactccgagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 25423164  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| ||||    
T  25423163 gtatcaggtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaactatg 25423090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 36 - 578
Target Start/End: Original strand, 21984248 - 21984790
Alignment:
Q  36 agacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 135  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||||||| | |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21984248 agacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctttcatt 21984347  T
Q  136 gatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttt 235  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21984348 gatagagttcacgtacaataatagtaatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggttt 21984447  T
Q  236 gagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgac 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21984448 gagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgac 21984547  T
Q  336 aaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgcttt 435  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||    
T  21984548 aaaaaagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagagggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgattggtgttggacgtgcttt 21984647  T
Q  436 gaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcg 535  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  21984648 gaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagctggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcg 21984747  T
Q  536 aatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    || |||||| |||| || |||||||||||||||| || |||||    
T  21984748 aacttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaggtatg 21984790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 26738617 - 26739190
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||| |  ||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  26738617 aagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttatgtacttgagc 26738716  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||  ||  ||||||| |||||    
T  26738717 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttattattccagtaatggaatggcacaatttaaggctttgtatgg 26738816  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||     
T  26738817 ttggagatgcagaactccattgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgtacaacaaactactgagaaagttaagatgatt 26738916  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  | |||||||| |    
T  26738917 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaagagatcatatatttttgaggg 26739016  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |  |||| | |||||||||||||    
T  26739017 tcactcctgtgactggtgttggatgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggc 26739116  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26739117 gtatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcaagatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 26739190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 20468008 - 20468581
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||  | ||||  ||||||| | | ||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  20468008 aagttgaggttgagttcggcgtattatccgcagacagatggccagtctgaaaggatgattcagtcgttggaggacttgttgagattttgtgtacttgagc 20468107  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |  ||||    
T  20468108 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaagctctgcatgg 20468207  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  20468208 tcggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccataaatcgttcagcaaactactgagaatgttaagttgatc 20468307  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20468308 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgactgaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggagaccatgtatttttgagag 20468407  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | || ||| |||||||| | |||||| || |||| | | | ||| |||||    
T  20468408 tcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgaggtttattggtccgtgtcagatattagaaagaatagaaacagtggc 20468507  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20468508 gtattgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 20468581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 536
Target Start/End: Original strand, 21497948 - 21498479
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |  |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  21497948 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagatagatggtcagccggagagaacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttatgtacttgagc 21498047  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  21498048 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtaaaataaaagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatgg 21498147  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||     
T  21498148 tcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggttttaggacccgagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgatt 21498247  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||  | |||||||| || ||||| || ||  |||||||||    
T  21498248 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggatagacatcgagtttcaagagggagatcatgtagttttgagag 21498347  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | |||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||||||     
T  21498348 tcactcttgtgaccggtgttggacgtgaattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggt 21498447  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcga 536  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21498448 gtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcga 21498479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 403
Target Start/End: Original strand, 21339198 - 21339596
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||| | ||||||||  ||||||| |||||||    
T  21339198 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgttagagaacttgttgagagtttgtgtacttgagc 21339297  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21339298 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagaattcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccattcgaggctttgtatgg 21339397  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||     
T  21339398 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgatt 21339497  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 403  Q
    ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  21339498 caagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaacgagaccaagtatttttgaga 21339596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23471703 - 23471130
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||   ||||||||||||||||  |||| |  ||||||| | | ||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  23471703 aagttgaggtttagttaggcgtatcatccgtagacagatggtcagtcggagagaatgattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagc 23471604  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  23471603 aagggggaacttgggatagtcatctcccattaatagagttcacgtacaataacagctatcattctagtattggaatggcaccttttgatgctttgtatgg 23471504  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || || ||| | |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||     
T  23471503 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtagttttggggccataaattgttcaacaaactattgagaaggttaagatgatt 23471404  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||| | || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  23471403 caacaaaagatgaaagcgtctcagagtcggcaaaagagtaatcatgataagcgtaggcaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagag 23471304  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| ||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   || ||| |||||||| |||||| | |  |||| | |||||||||||||    
T  23471303 tcactcaagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttggaggtttattggtccgtatcaggtatcagaaagaattggaacggtggc 23471204  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23471203 gtatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23471130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 578
Target Start/End: Original strand, 24749463 - 24750039
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || ||||   ||||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  24749463 tcgaagttgaggttgagttcgacttagcatccttagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagggtgtgtgtgcttg 24749562  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  24749563 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgta 24749662  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || |||||||| ||||| || || ||| || ||    
T  24749663 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttg 24749762  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    ||   |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  24749763 ataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttga 24749862  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| ||    
T  24749863 gagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagt 24749962  T
Q  502 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  24749963 ggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatg 24750039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 578
Target Start/End: Original strand, 23080000 - 23080574
Alignment:
Q  4 gaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgag 103  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||  ||||||  || || |   | || |||||||||||  | ||||| ||||||    
T  23080000 gaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggttagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgag 23080099  T
Q  104 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 203  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  23080100 caaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttatatg 23080199  T
Q  204 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 303  Q
    ||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||  | || ||  | ||||||||||||||  |||||||    
T  23080200 gtcggaggtgcaggactcctctatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagacttggtgcatgagactactgagaaagtcaagatgat 23080299  T
Q  304 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 403  Q
        || || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||  |||||||||| || || || || ||| ||||     
T  23080300 aagggaaaagatgaaagcgtcgcagattcgacagaagagttatcatgacaagcggagaaaggccctatagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagg 23080399  T
Q  404 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 503  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| ||||    
T  23080400 gtcactcctatgacgggtgtaagacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtgg 23080499  T
Q  504 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23080500 cttatagagttggtttaccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgttgcagcttcggaagtatg 23080574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 21890671 - 21891244
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||| |  ||||||| | ||||||||||| |||| || ||||  |||||||    
T  21890671 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcagagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagaatgtgtgcacttgagc 21890770  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    || | ||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21890771 aacgtggagcttgggatactcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 21890870  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| | ||  ||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||| ||||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||     
T  21890871 tcggaggtacaagactccattatgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaacagatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgata 21890970  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||    
T  21890971 agagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagag 21891070  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | |  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |||||    
T  21891071 ttacacctatgactggtgtaggatgtgcgttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggc 21891170  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  || | || |||||||||||||||||||||||||    
T  21891171 atacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21891244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 22235832 - 22236405
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||  ||||  | ||||| |||||||    
T  22235832 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggatgatacaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagc 22235931  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| |||||    
T  22235932 aaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagaattcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcatcgttcgaagctttgtatgg 22236031  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||  ||||| || | ||||||||||||||| || || || || || ||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||  ||||| ||    
T  22236032 tcggaggtgcaagactcctttattctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggagttggttcatcagactacagagaaagtcaagatggtc 22236131  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| |    
T  22236132 agagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgaggg 22236231  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| ||| |    
T  22236232 ttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtgtc 22236331  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  22236332 atatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 22236405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22381659 - 22381082
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||   || |||||||||||||  ||||||  || || |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  22381659 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccttaggcagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctt 22381560  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||||  ||||| ||||| |    
T  22381559 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgattgagttcacatataacaacagctatcactcgagtataggtatggcactattcgaagctttgt 22381460  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||| ||  | ||    
T  22381459 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaggtcaaaat 22381360  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  22381359 gataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 22381260  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  ||||||||||    
T  22381259 agggtcactccgatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacgg 22381160  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22381159 tggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 22381082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Original strand, 28923677 - 28924218
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||| |||| ||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||  |||||| ||| || |   ||||||||||| | ||| | ||||| ||||    
T  28923677 tcgaaattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttg 28923776  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  28923777 agcagggtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttata 28923876  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    ||||||||  || || |||||  | || ||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| || |||||   ||||    
T  28923877 tggtcggaagtgtaggactcctctatgttggttcgagtcgggagaaagtgttgttttgggaccggatttggttcatgagactacggaaaaagtcaggatg 28923976  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||    
T  28923977 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctga 28924076  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||    
T  28924077 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgt 28924176  T
Q  502 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
    ||| ||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  28924177 ggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgca 28924218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22462412 - 22461835
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  | ||||  || || |   ||||||||||  | || || ||||| |||    
T  22462412 ttcgaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattagaggatttactaagaatatgtgtactt 22462313  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||||| || || ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  22462312 gagcagggtggagcttgggacagtcacctaccattgatagaatttacatacaacaacagttaccattcgagtgttggtatggcaccgttcgaagctttgt 22462213  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || || || ||  | |||||  ||||||| ||||||||  ||||    
T  22462212 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcgagtcgggagaaagtgttgtgttggggccggaattggttcatgaaactacagagaaagtcaagat 22462113  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  22462112 gattagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctg 22462013  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || || | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||| |    
T  22462012 agggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttaccagatttcagaaagagttggaactg 22461913  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  22461912 tggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatg 22461835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22503139 - 22502562
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  22503139 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctt 22503040  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  22503039 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctgccattgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggcatggcaccgttcgaagccttgt 22502940  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  22502939 atggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggtt 22502840  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  22502839 gataagggaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 22502740  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||||| |    
T  22502739 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacag 22502640  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  22502639 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 22502562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20821906 - 20821371
Alignment:
Q  8 ttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaag 107  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||  |||||| ||| || |   ||||||||||| | ||| | ||||| |||||||| |    
T  20821906 ttgaggttgagttcggcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagcagg 20821807  T
Q  108 gaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcg 207  Q
    | ||| |||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  20821806 gtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaactcacatacaacaacagttatcattcaagtattggtatggcaccatttgaagctttatatggtcg 20821707  T
Q  208 gagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaa 307  Q
    ||  || || |||||  | || ||||||||||| || ||||| || || || || || ||  | |||||  | ||||| |||||||||  |||||||  |    
T  20821706 gaagtgtaggactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttggggccggatttggttcatgagactacagagaaagttaggatgatcaga 20821607  T
Q  308 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 407  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| || || || ||| |||| || |    
T  20821606 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaagaaagaccttgaatttcaggaaggtgatcatgtttttctgagggtta 20821507  T
Q  408 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctta 507  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| ||    
T  20821506 ctcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagggttggaactgtggcgta 20821407  T
Q  508 tcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
    | || | ||||| || || |||||||||||||||||    
T  20821406 tagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgca 20821371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Original strand, 28894851 - 28895392
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||| |||| ||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||  |||||| ||| || |   ||| | ||||| | ||| | ||||| ||||    
T  28894851 tcgaaattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagtgaatttgctaagggtatgtgtacttg 28894950  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  28894951 agcagggtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttata 28895050  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    ||||||||  || || |||||  | || ||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| || |||||   ||||    
T  28895051 tggtcggaagtgtaggactcctctatgttggttcgagtcgggagaaagtgttgttttgggaccggatttggttcatgagactacggaaaaagtcaggatg 28895150  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||    
T  28895151 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctga 28895250  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||  |    
T  28895251 gagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactct 28895350  T
Q  502 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
    ||| ||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  28895351 ggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgca 28895392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 140 - 578
Target Start/End: Original strand, 24735658 - 24736096
Alignment:
Q  140 gagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 239  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  24735658 gagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 24735757  T
Q  240 caggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaa 339  Q
    | |  ||||| ||| | || |||||||| || |||||||| ||||| || || ||| || ||||   |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24735758 cggaagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaa 24735857  T
Q  340 gagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaag 439  Q
    ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||     
T  24735858 gagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaa 24735957  T
Q  440 tcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatt 539  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  24735958 tctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatt 24736057  T
Q  540 tgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  24736058 tgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatg 24736096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20342742 - 20342165
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  20342742 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctt 20342643  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  20342642 gaacaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 20342543  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  20342542 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctagtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggtt 20342443  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | || || || ||| ||    
T  20342442 gataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagcgtgatcatgtttttctg 20342343  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    |||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | |||||| || |    
T  20342342 agagtcacccctttgacaggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacag 20342243  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  20342242 tggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 20342165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 21405285 - 21404737
Alignment:
Q  16 gagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaact 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||| |||||||| | | ||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21405285 gagttcggcgtatcatccacagacagatggacagacggagaggacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttatgtacttgagcaaggaggaact 21405186  T
Q  116 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggc--tttatatggtcggagatg 213  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   || ||||||||||||||    
T  21405185 tgggatagtcatctttcattgatcgagttcacttataataacagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaagcgtgttgtatggtcggagatg 21405086  T
Q  214 cagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaa 313  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| |  ||| |  | |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| || ||||   ||| ||     
T  21405085 cagaacttcgttgtgttggtatgagtccggtgagattgtgatactgggaccagacattgttcaacagactactgagaaggttaagttgattagagaaaat 21404986  T
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||                 ||||||| || |||||||| ||||||| || |     
T  21404985 atgaaggtgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa----------------caaggagatcatgtgttttttagagtcactcttg 21404902  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 513  Q
    |||| ||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| |||  ||| |||||  | |||||||||| ||||| |||||| || || || ||| ||||    
T  21404901 tgaccggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgtggtttattggctcgtatcagatttcggaaagagttgggacagttgcgtatagagt 21404802  T
Q  514 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  21404801 gggtttaccaccacatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatg 21404737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20774219 - 20773678
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| |||| ||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||  |||||| | | || |   ||||||||||| | ||| | ||||| |||    
T  20774219 ttcgaaattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggaca-tccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtactt 20774121  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  20774120 gagcagggtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttat 20774021  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||  || |  ||||| || || ||||| ||||| || ||||  || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||    
T  20774020 atggtcggaagtgtaagactcctttatgttggttcgagtcgggagaaaatgttgttttgggaccggaattggttcatgagactacagagaaagtcaagat 20773921  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| | ||| || ||| ||    
T  20773920 gattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtcggaaagagcttcagtttcaggaagggggccatgtttttctg 20773821  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || || | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| |    
T  20773820 agggttactcctatgacgggcgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactg 20773721  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
    |||| ||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  20773720 tggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgca 20773678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 25848535 - 25847958
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||| | |||||| |   | || |||||||||||||| ||| | |||    
T  25848535 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagagaacaattcaatcattggaagatttgttgaggatgtgtatgctt 25848436  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  25848435 gagcaaggtggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 25848336  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga- 299  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||| |||||     
T  25848335 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaag-tcagat 25848237  T
Q  300 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 399  Q
    ||||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || || || |||||    
T  25848236 tgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgttttttt 25848137  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||  || | |||||||||     
T  25848136 gagagtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaact 25848037  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||| ||||||||    
T  25848036 gtggcatacagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatg 25847958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 37545404 - 37545982
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||  | ||||| |||    
T  37545404 ttcgaagttgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgctt 37545503  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||  ||||| || || |    
T  37545504 gagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcactgttcgaagccttgt 37545603  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | ||||||||||||||   | |    
T  37545604 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtaaggtt 37545703  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttt-t 399  Q
    |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || |||| |    
T  37545704 gataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaacagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgttttttct 37545803  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
    ||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| ||     
T  37545804 gagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttctgagagagttggtact 37545903  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  37545904 gtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 37545982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 21563885 - 21564451
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||  || ||| ||||||||||  |||     ||||||| | ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  21563885 aagttgaggttgagttcagcttatcatccgcaaacatatggtcagtcggagaaagcgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 21563984  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| | | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  21563985 aaggtgaagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatgg 21564084  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat-gat 303  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||       ||| || || || |||| ||| || ||||| || ||||| || |||| ||| || |||    
T  21564085 tcggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagt-------aagtgtagtgttgggactagatatagttcatcagactacaga-aaaggtcaaattgat 21564176  T
Q  304 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 403  Q
       |||||| | ||| | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  21564177 aagagagaagacgaaagtgtcgcaaagtcggcagaagagttatcatgacaagcgaagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgaga 21564276  T
Q  404 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 503  Q
    |||| || | ||||  ||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||   ||| ||||||||||||||||| |  || | |||| | || ||||    
T  21564277 gtcactcatgtgacacgtgttagtcgtgctttgaagtctaagaatttgactccacggtttattggtccatatcagatatctgatagagtttggacagtgg 21564376  T
Q  504 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21564377 catatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21564451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 482
Target Start/End: Original strand, 17269259 - 17269722
Alignment:
Q  19 ttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgg 118  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | || || ||||||||  | ||||| ||||| || || ||| |||||    
T  17269259 ttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacagggtggagcttgg 17269358  T
Q  119 gatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaa 218  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |    
T  17269359 gatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcagga 17269458  T
Q  219 ctccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaa 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||||||  |||||| |||||    
T  17269459 ctccgttgtgttggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaa 17269558  T
Q  319 ggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgact 418  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| | ||||| | ||| |||||     
T  17269559 agcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagttactccgatgacg 17269658  T
Q  419 ggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 482  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17269659 ggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattt 17269722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 14886903 - 14887476
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||  | ||||| |||||||    
T  14886903 aagttgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagc 14887002  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||    
T  14887003 aaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatgg 14887102  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
     ||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | ||||||||||||||   | ||||     
T  14887103 ccggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgata 14887202  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| |    
T  14887203 agagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgaggg 14887302  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | | |||| || |||||    
T  14887303 tcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggc 14887402  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  14887403 atatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 14887476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 578
Target Start/End: Original strand, 24798318 - 24798882
Alignment:
Q  14 ttgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaa 113  Q
    ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  | |||| |||||| |   | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||     
T  24798318 ttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggaaaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggaggag 24798417  T
Q  114 cttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatg 213  Q
    ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||    
T  24798418 cttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtg 24798517  T
Q  214 cagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga-tgatccaagagaa 312  Q
     || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||  ||  | |||||  | |||||||||||||| |||| ||||    || ||    
T  24798518 taggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggactggatttggttcacgagactactgagaaagt-cagaatgataagggaaaa 24798616  T
Q  313 aatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcct 412  Q
     ||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| || || || || ||| ||||||||| ||||    
T  24798617 gatgagagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttctggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcct 24798716  T
Q  413 atgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgag 512  Q
     |||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  || | |||||| || ||||| ||| |||    
T  24798717 ttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggcatatagag 24798816  T
Q  513 tgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  24798817 ttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 24798882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 272 - 578
Target Start/End: Original strand, 23442472 - 23442778
Alignment:
Q  272 gttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttg 371  Q
    ||||| || ||||| ||||||||  |||||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||    
T  23442472 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggctcttg 23442571  T
Q  372 agtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtcc 471  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  23442572 agtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgtgttgaagtctaagatgttgactccaaagttcattggtcc 23442671  T
Q  472 atatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 571  Q
     |||||| | |  || |  |||||||| ||||| ||   ||||| ||| || || |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  23442672 gtatcagttatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtggttttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 23442771  T
Q  572 aagtatg 578  Q
    |||||||    
T  23442772 aagtatg 23442778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 320 - 578
Target Start/End: Original strand, 24737012 - 24737270
Alignment:
Q  320 gcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactg 419  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  24737012 gcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgg 24737111  T
Q  420 gtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggttt 519  Q
    ||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  24737112 gtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggttt 24737211  T
Q  520 accgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || || |||||||||||||||||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  24737212 gccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatg 24737270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 374 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20573626 - 20573422
Alignment:
Q  374 tttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccat 473  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||| |||||||| |    
T  20573626 tttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactccactgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacttcaaggtttattggtccgt 20573527  T
Q  474 atcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaa 573  Q
    ||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  20573526 atcagatatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaa 20573427  T
Q  574 gtatg 578  Q
    |||||    
T  20573426 gtatg 20573422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 348
Target Start/End: Original strand, 21831722 - 21831998
Alignment:
Q  72 tagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctag 171  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  21831722 tagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggtgggacttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttacctttctag 21831821  T
Q  172 tattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagatt 271  Q
    ||| |||||| |||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||  | || || || ||||| || |||    
T  21831822 tataggaatgacaccatttgaagctttgtatggtcggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtcgggtgagggtgtagtgttgggaccggatatt 21831921  T
Q  272 gttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatca 348  Q
    ||||| || |||||  | || ||| || | ||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21831922 gttcaccagactacataaaaggttaagctaataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatca 21831998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 401 - 578
Target Start/End: Original strand, 21343666 - 21343843
Alignment:
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||| |||| |  |||| |||||||||||    
T  21343666 agagtcactcctgtgactggtgttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtataagatatcagaaagagttggaacgg 21343765  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  21343766 tggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatg 21343843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 936 - 1150
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||  ||||  | ||||| |||    
T  936 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatttactgagagtgtgtgtactt 1035  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  1036 gagcaaggtggagcttaggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 1135  T
Q  201 atggtcggagatgca 215  Q
    |||||||||| ||||    
T  1136 atggtcggaggtgca 1150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 11210732 - 11211054
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||| |||| || || ||  ||||||| |    
T  11210732 ccgttgattgagtttacttacaacaatagttttcattctagtattggaatgacaccgtttgaggccttgtatggtaggaggtgtaggacatcgttgtgtt 11210831  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || || || ||  | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || |||||| ||||||| || ||||| ||||| || || |||||    
T  11210832 ggtttgagtccggagagagtgttttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaagttaagatgattcaggagaagatgaaagcatctcagag 11210931  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | || |||||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| ||||| || |||    
T  11210932 tagacagaagagttatcatgataagaggaggaaagatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgt 11211031  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  11211032 gctttgaagtgtaggaagttgac 11211054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 24581541 - 24581219
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  24581541 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 24581442  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  |||| || || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  24581441 ggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaaccacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 24581342  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | || || ||| |||||||||| |  || || ||||||||| | || || | |||| |||| || || || |||    
T  24581341 tagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacgtgtttgtaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgt 24581242  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  24581241 gctttgaagtgtaggaagttgac 24581219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 350 - 578
Target Start/End: Original strand, 21662297 - 21662524
Alignment:
Q  350 gacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagt 449  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||| | ||||||| ||||||||  ||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  21662297 gacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagt 21662396  T
Q  450 tgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgt 549  Q
    ||||  ||| ||| ||||||   |||||||| | ||||| |||||||||  || | ||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||  ||||    
T  21662397 tgacttcgaggtttattggttg-tatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgt 21662495  T
Q  550 tttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || || ||||||||||||||||| ||||    
T  21662496 atttcaagtgtcgcaacttcggaaatatg 21662524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 350 - 578
Target Start/End: Original strand, 21665758 - 21665985
Alignment:
Q  350 gacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagt 449  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||| | ||||||| ||||||||  ||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  21665758 gacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagt 21665857  T
Q  450 tgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgt 549  Q
    ||||  ||| ||| ||||||   |||||||| | ||||| |||||||||  || | ||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||  ||||    
T  21665858 tgacttcgaggtttattggttg-tatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgt 21665956  T
Q  550 tttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || || ||||||||||||||||| ||||    
T  21665957 atttcaagtgtcgcaacttcggaaatatg 21665985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Original strand, 28916322 - 28916517
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||| |||| ||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||  |||||| ||| || |   ||||||||||| | ||| | ||||| ||||    
T  28916322 tcgaaattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttg 28916421  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctt 197  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  28916422 agcagggtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctt 28916517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 21937226 - 21937548
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  21937226 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 21937325  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| || || ||||| |   | || || || ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  21937326 ggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 21937425  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |||||||| || || | |||| |||| || || || |||    
T  21937426 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgt 21937525  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  21937526 gctttgaagtgtaggaagttgac 21937548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27011414 - 27011092
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  27011414 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatgacaccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 27011315  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||  || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  27011314 ggtttgagttcggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 27011215  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | || || ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | || | |||| || || || |||    
T  27011214 tagacataagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccggagttggtcgt 27011115  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  27011114 gctttgaagtgtaggaagttgac 27011092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Original strand, 24716435 - 24716577
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  24716435 tcgaagttgaggttgagttcggcttagcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagggtgtgtgtgcttg 24716534  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagtt 144  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  24716535 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtt 24716577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 138
Target Start/End: Original strand, 24620204 - 24620340
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  24620204 tcgaagttgaggttgagttcgacttagcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagggtgtgtgtgcttg 24620303  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgat 138  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  24620304 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgat 24620340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23503741 - 23503526
Alignment:
Q  163 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttagga 262  Q
    |||||||||| | || ||||| || ||  ||||||| ||||||||||| |  || || |||||||| ||||||||||| |||||||| |   | ||||||    
T  23503741 tcattctagtgtcggtatggctccgtttaaggctttgtatggtcggaggtctaggacaccgttgtgttggtttgagtctggtgaaagtgctttgttagga 23503642  T
Q  263 ccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaa 362  Q
    || ||  | || ||  | ||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||    
T  23503641 ccggaagtggtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaa 23503542  T
Q  363 aagatcttgagtttca 378  Q
    | ||| ||||||||||    
T  23503541 aggatattgagtttca 23503526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 228
Target Start/End: Original strand, 21229229 - 21229308
Alignment:
Q  149 tacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtg 228  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  21229229 tacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagcattgtatggtcgcagatgcaggactcctttgtg 21229308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 186
Target Start/End: Original strand, 21680429 - 21680499
Alignment:
Q  116 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacc 186  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  21680429 tgggatagtcacctaccgttgatagagtttacgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcacc 21680499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 21496547 - 21496481
Alignment:
Q  72 tagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgat 138  Q
    ||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  21496547 tagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctatcgttgat 21496481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 17674192 - 17674769
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17674192 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagttgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 17674291  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17674292 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 17674391  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674392 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 17674491  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17674492 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 17674591  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17674592 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 17674691  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17674692 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 17674769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 19113302 - 19112725
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19113302 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 19113203  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19113202 gagcagggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 19113103  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19113102 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattattcagcaaactactgagaaagttcagat 19113003  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19113002 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 19112903  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  19112902 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacag 19112803  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19112802 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 19112725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 19485039 - 19485616
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19485039 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcaatcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 19485138  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19485139 gagtaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 19485238  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19485239 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatccggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaaccactgagaaagttcagat 19485338  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19485339 gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttg 19485438  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19485439 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacctcgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacgg 19485538  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485539 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19485616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 20017919 - 20018496
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20017919 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgttagaggatttgttgagaatttgtgttctt 20018018  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  20018019 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgt 20018118  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018119 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 20018218  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20018219 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgaatttgaggaaggagaccacgtgtttttg 20018318  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  20018319 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacgg 20018418  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20018419 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 20018496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 22120343 - 22120920
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22120343 ttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 22120442  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120443 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 22120542  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22120543 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtgaggtgaaagagtggtcttaggatcagagattgttcagcagactactgagaaagttcggat 22120642  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22120643 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttg 22120742  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22120743 agagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacctcgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacgg 22120842  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22120843 tggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttgaacaacgttttccatgtgtcgcaactttggaagtatg 22120920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15533992 - 15533415
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15533992 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagaaagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttctt 15533893  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15533892 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 15533793  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  15533792 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaaat 15533693  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  15533692 gatacaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggtgaccacatgtttttg 15533593  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  15533592 agagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 15533493  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533492 tggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15533415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 30313313 - 30313890
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  30313313 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggattagttgagagtttgtgttctt 30313412  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  30313413 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaacggcaccttttgaggctttgt 30313512  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30313513 atggtcggagatgcagaactccattgtggtggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttagggctcgagattgttcagcagactactgagaaagttaagat 30313612  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313613 gattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 30313712  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  30313713 agagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 30313812  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313813 tggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 30313890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 22133210 - 22133787
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  22133210 ttcgaagttgagattgagttcagcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagagtttgtgttctt 22133309  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22133310 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 22133409  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22133410 atggtcggtgatgcagaactccgttgtgcgggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagcaaactactgagaaagttaagat 22133509  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  22133510 gattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggagacattgtgtttttg 22133609  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    |||| || || | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  22133610 agagacactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 22133709  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133710 tggcgtatcgagtcggaataccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22133787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 32600756 - 32600179
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||| | | || |||||||||||||  |||||||||||    
T  32600756 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcgttataggatttgttgagagtttgtgttctt 32600657  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  32600656 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 32600557  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||    
T  32600556 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttcggtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagtagactactgagaaggttaagat 32600457  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32600456 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 32600357  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  32600356 agagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 32600257  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32600256 tggcgtatcgagtgggattaccaccacgtctttcgaatttgcacgacgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 32600179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 575
Target Start/End: Original strand, 16408218 - 16408788
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16408218 aagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagc 16408317  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16408318 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 16408417  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  16408418 tcggagatacagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccggagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgatt 16408517  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  16408518 caagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttaagttccaagaaggagaccacgtattgttgagag 16408617  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  16408618 tcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 16408717  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagt 575  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408718 gtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagt 16408788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22046985 - 22046408
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22046985 ttcgaaattgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcgctagaggatttgttgagagtttgtgttctt 22046886  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22046885 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatggttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 22046786  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22046785 atggtcagagatgcagaactccgttgtgctggtttgaatcaggtgaaagagtggtcctaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagat 22046686  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22046685 gattcaagagaaaatgaaagtgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgataaacgcaggaaggatcttgagttttaggaaggagaccacgtgtttttg 22046586  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  22046585 agagtcactccagtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccgaggtttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 22046486  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046485 tggcgtatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22046408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 19978575 - 19978002
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||||    
T  19978575 aagttgagattgagctcgacgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagatttagtgtacttgagc 19978476  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19978475 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacaattatcattctagtattggaatggcacctttggaggctttatatgg 19978376  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  19978375 tcgaagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgatt 19978276  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19978275 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 19978176  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  19978175 tcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaatagttggaacggtggc 19978076  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19978075 gtaacgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19978002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 22164361 - 22164937
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||  |||||||||||    
T  22164361 ttcgaagttgagattgagttcagcgtgtcatccgcagacatatggtcagtcagagaggacaattcagtcgct-gaagatttgttgagagtttgtgttctt 22164459  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22164460 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 22164559  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22164560 acggtcggtgatgcagaactccgttgtgcaggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttcggacccgagattgttcagcaaactactgagaaagttaagat 22164659  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  22164660 gattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggagacattgtgtttttg 22164759  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    | ||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  22164760 aaagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaataagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 22164859  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22164860 tggcgcatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22164937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 570
Target Start/End: Original strand, 21166710 - 21167275
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  21166710 aagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagc 21166809  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21166810 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagtttacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 21166909  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||     
T  21166910 tcgaagatgcagaactcaattgtgttggtttgaatcaggtggaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgatt 21167009  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21167010 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 21167109  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||    
T  21167110 tcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggc 21167209  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcg 570  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  21167210 gtatcgagttgggttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcg 21167275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23650649 - 23650076
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||  |||| || |||||||    
T  23650649 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcaatcggagagaacgattcagtcgctagaggacttgttgagagtttgcgtacttgagc 23650550  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||    
T  23650549 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcgccttatgaagctttgtatgg 23650450  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  23650449 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgatt 23650350  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23650349 caagagaagataaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgagag 23650250  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | | ||| |||||||||||||||    
T  23650249 tcactcctgtgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggc 23650150  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||    
T  23650149 ttatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcttgtgttgcaacttcggaagtatg 23650076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 21921908 - 21922481
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  21921908 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgtagaggacgattcaatagctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagc 21922007  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  21922008 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctactattggaatggcaccttatgaggctttctatgg 21922107  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  21922108 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtggaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgaaaaggttaagatgatt 21922207  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21922208 caagaaaagatgaaagtgtcgcagagtccacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagag 21922307  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||  |  |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  21922308 tcactcatgtgactggtgttggacaagctttgaagtcgaagaagttgactccgagatatattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 21922407  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||    
T  21922408 gtaccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgcacgacgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21922481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 21251549 - 21250977
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21251549 aagttgaggttgagtttggcgtatcatccacagacagatagtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagc 21251450  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||   | ||||| |||||    
T  21251449 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattgagatgacaccttattacgctttgtatgg 21251350  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||     
T  21251349 tcgaagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgatt 21251250  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
     ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21251249 aaagag-agatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaataaggagaccacgtgtttttgagag 21251151  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  21251150 tcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 21251051  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21251050 gtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21250977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 21788532 - 21789104
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||| |   |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21788532 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagc 21788631  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||    
T  21788632 aaggaggaacttgggatagtcatctcccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggcttg-tatgg 21788730  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||     
T  21788731 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttaaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtttagcaaactaccgagaaggttaagatgatt 21788830  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21788831 caagagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcatgaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagag 21788930  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||| | |||||||||    
T  21788931 tcactcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggc 21789030  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  21789031 gtaccgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcctgtgtcgcaacttcagaagtatg 21789104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 21394038 - 21394611
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||| |   |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21394038 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagc 21394137  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||    
T  21394138 aaggaggaacttgggatagtcatctcccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggcttg-tatgg 21394236  T
Q  205 -tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  21394237 gtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttaaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtttagcaaactaccgagaaggttaagatgat 21394336  T
Q  304 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 403  Q
     |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21394337 tcaagagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcatgaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgaga 21394436  T
Q  404 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 503  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||| | ||||||||    
T  21394437 gtcactcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtgg 21394536  T
Q  504 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  21394537 cgtaccgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcctgtgtcgcaacttcagaagtatg 21394611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18857189 - 18856853
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18857189 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcacccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 18857090  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18857089 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataataggtatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 18856990  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18856989 atggtcggagatgcataactctgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtcgtcttaggaccagagattgttcagcaaactactaagaaagttcggat 18856890  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaa 337  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18856889 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 18856853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22987809 - 22987236
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||  | ||||  ||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  22987809 aagttgaggttgcgttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaggacgattcagtcgttagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagc 22987710  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||    
T  22987709 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcatgtacaataacaattatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtacgg 22987610  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||| |||||| || | |||||||| ||||||| |||||||| | | |||||     
T  22987609 tcggagatgcagaactccgttgtgttggttcgagttaggtgagagtgtggttttaggagcataaattgttcaacaaactattgagaaagataatatgatt 22987510  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||    
T  22987509 caagagaagatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgattttcaagaaggagatcatgtattttttagag 22987410  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||  |||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |   ||| | |||||||||||||    
T  22987409 tcactccagtgactgatgttggacatgcattgaagtcaaagaagttgactctgaagtttattggtccgtatcagatatcataaagaattggaacggtggc 22987310  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  22987309 gtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagtaatacatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22987236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22040471 - 22040162
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22040471 ttcgaaattgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagttggagaggacaattcaatcgctagaggatttgttgagagtttgtgttctt 22040372  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  22040371 gagcaaggatgaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaatattagttatcattctagtattcgaatggcaccttttgaggctttgt 22040272  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22040271 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgaatgaggtgaaagagtggtcctaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagat 22040172  T
Q  301 gatccaagag 310  Q
    ||| ||||||    
T  22040171 gattcaagag 22040162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 575
Target Start/End: Original strand, 20396307 - 20396868
Alignment:
Q  14 ttgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaa 113  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | || |  ||||||| | | ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| |  |    
T  20396307 ttgagttcggcgtatcatctgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggtgcga 20396406  T
Q  114 cttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  20396407 cttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacaattatcattctagtattggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggtg 20396506  T
Q  214 cagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaa 313  Q
     || ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || || |||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||| || |||| | ||| ||     
T  20396507 taggactccgttgtgttggttcgagtcaggcgagagtgtagttttgggactagatatcgttcaacaaactactgagaaggttaagttgatgcgagaaaag 20396606  T
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||     
T  20396607 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagtgttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaggaaggagaccatgtattttttagagtcactcctg 20396706  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 513  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||  |||| |  |  || |||||||  |||||||| |  |||| | ||| ||  ||||| ||||||||    
T  20396707 tgaccggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaaactgactctaagatttattggtctgtatcagatatcagaaagaattgaaatagtggcgtatcgagt 20396806  T
Q  514 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagt 575  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||  || |||||||  |||||||||||||    
T  20396807 gggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgatgcatttcatgtgtaacaacttcggaagt 20396868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Original strand, 22377627 - 22378079
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | || |  ||||||| | | || || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  22377627 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagc 22377726  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||    
T  22377727 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaacaatagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggcttg-tatgg 22377825  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
      | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||| |||||||     
T  22377826 aagaaggtgcagaactcctttgtgttggttcgagtcgggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttaaacaaactacggagaaggttaagatgatt 22377925  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||| |    
T  22377926 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgaggg 22378025  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 458  Q
    ||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22378026 tcactccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 22378079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Original strand, 22383802 - 22384254
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | || |  ||||||| | | || || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  22383802 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagc 22383901  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||    
T  22383902 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaacaatagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggcttg-tatgg 22384000  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
      | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||| |||||||     
T  22384001 aagaaggtgcagaactcctttgtgttggttcgagtcgggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttaaacaaactacggagaaggttaagatgatt 22384100  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||| |    
T  22384101 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgaggg 22384200  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 458  Q
    ||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22384201 tcactccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 22384254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23949527 - 23949158
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  | |  |  ||||||| | | || || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  23949527 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagatagatggtcagtcggaaataacgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagc 23949428  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23949427 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaagctctatatgg 23949328  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23949327 tcggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagaaatcgtt-agcaaactactgagaaagttaagatgatc 23949229  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtt 375  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  23949228 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggaccttgagtt 23949158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 19852016 - 19851448
Alignment:
Q  8 ttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaag 107  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||| |  ||||||| | ||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||    
T  19852016 ttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaag 19851917  T
Q  108 gaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcg 207  Q
    | ||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19851916 gtggagcttggtatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtattggtatggaaccgttcgaagctttgtatggtcg 19851817  T
Q  208 gagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaa 307  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||  | |||||  |||| ||  |||||||   |    
T  19851816 gaggtgcaggactccattgtgttggtttgagtcgggtgaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcattagactacatagaaggtcaagatgataaga 19851717  T
Q  308 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 407  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||    
T  19851716 gaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtca 19851617  T
Q  408 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctta 507  Q
     |||  |||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  || |  |||||||| ||||| ||    
T  19851616 ctccgttgacggttgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagggttggaacagtggcata 19851517  T
Q  508 tcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagta 576  Q
       ||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19851516 caaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagta 19851448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 19858052 - 19857484
Alignment:
Q  8 ttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaag 107  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||| |  ||||||| | ||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||    
T  19858052 ttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaag 19857953  T
Q  108 gaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcg 207  Q
    | ||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  19857952 gtggagcttggtatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtattggtatggaaccgttcgaagctttgtatggtcg 19857853  T
Q  208 gagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaa 307  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||  | |||||  |||| ||  |||||||   |    
T  19857852 gaggtgcaggactccattgtgttggtttgagtcgggtgaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcattagactacatagaaggtcaagatgataaga 19857753  T
Q  308 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 407  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||    
T  19857752 gaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtca 19857653  T
Q  408 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctta 507  Q
     |||  |||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  || |  |||||||| ||||| ||    
T  19857652 ctccgttgacggttgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagggttggaacagtggcata 19857553  T
Q  508 tcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagta 576  Q
       ||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19857552 caaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagta 19857484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20388707 - 20388134
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||| || ||||||| | |||||||||| |||||  | ||||| |||||||    
T  20388707 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaaagattcagtcgttagaggattttttgagagtgtgtgtacttgagc 20388608  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  20388607 aaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcatgtacaacaacagttaccattcgagtattggcatggcaccgttcgaagctttgtatgg 20388508  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat-gat 303  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || || || |||| ||| || ||||| || |||||  | |||| ||| || |||    
T  20388507 ttggaggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtcgggttaaaatgtagtgttgggacgagatatagttcatcagactacaaa-aaaggtcaaattgat 20388409  T
Q  304 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 403  Q
       |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  20388408 aagagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgaga 20388309  T
Q  404 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 503  Q
    |||| ||   |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||| |  || | |||||| || |||     
T  20388308 gtcactctagtgacaggtgttggtcgtgctttgaagtctaagaagttgaccccacggtttattggtccatattagatatctgagagagttgggacagtga 20388209  T
Q  504 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | ||| |||||||||| || || |||||||||||| ||||  |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  20388208 catatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatgtgcatgatgtgtttaatgtgtcgcaatttcggaagtatg 20388134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1266846 - 1266274
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||| |||  ||||||  || || |   ||||||||||  ||||  | ||||| |||||||    
T  1266846 aagttgagattgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcggtcggagaggacgatccaatctttagaggatttactgagagtgtgtgtacttgagc 1266747  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1266746 aaggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 1266647  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    || ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || || |||||||| ||  |||||||     
T  1266646 tcagaggtgcaggactcctttgtgctagtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggta-agatgata 1266548  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
       || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| ||||||    
T  1266547 agggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagag 1266448  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| |||||    
T  1266447 ttactccgatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggc 1266348  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1266347 atatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 1266274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 22061602 - 22062179
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||| ||||||||||  | ||||| |||    
T  22061602 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgaagaggacgatccaatcattggagtatttgttgagagtgtgtgtgctt 22061701  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||| |    
T  22061702 gaggaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgt 22061801  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||    
T  22061802 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagat 22061901  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  | | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || |||||| ||    
T  22061902 gatcagaaaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctg 22062001  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || || | ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  || |  |||||||| |    
T  22062002 agggttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcaaatatcagagagggttggaactg 22062101  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22062102 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22062179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23655539 - 23654962
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||| ||||||  || || |   ||||||||||| ||||  | ||||| |||    
T  23655539 ttcggagttgaggttgagttcgggttatcatccgcagacagatggtcagtcagagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtactt 23655440  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| |    
T  23655439 gagcaaggtggagcctgggacagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttatcattcgagtattagtatggcaccgttcgaagctttgt 23655340  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||| ||  ||||    
T  23655339 atggtcggaggtgcagaactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagat 23655240  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||  ||||| ||    
T  23655239 gataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagacggagatcatttgtttctg 23655140  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  ||| |||| |    
T  23655139 agagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggtttgaacag 23655040  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||  |||  | ||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23655039 tggtatatatattgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23654962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 578
Target Start/End: Original strand, 20010083 - 20010646
Alignment:
Q  15 tgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaac 114  Q
    |||||||||| |||||||  ||| |||||||||| ||  |||| |  ||||||| | ||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||| |    
T  20010083 tgagttcggcttatcatccgcaggcagatggtcattcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagc 20010182  T
Q  115 ttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgc 214  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||     
T  20010183 ttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcaagtattggtatggcaccgttcgaaactttgtatggtcggaggtgt 20010282  T
Q  215 agaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaa 314  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || ||||||||  | ||||| || ||||  ||||| || ||||||||   ||| || |    
T  20010283 aggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgttgttgggaccagatttagttcatcagactatagagaaggtccagatgataagagaaaaga 20010382  T
Q  315 tgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctat 414  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| ||| ||    
T  20010383 tgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaagaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgat 20010482  T
Q  415 gactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtg 514  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |  || |  |||||||| ||||| ||  |||||    
T  20010483 gacgggtgtgggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtg 20010582  T
Q  515 ggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  20010583 ggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtatttcacgtgtcgcaacttcggaagtatg 20010646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 578
Target Start/End: Original strand, 31416644 - 31417220
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  31416644 tcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttg 31416743  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||    
T  31416744 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattagtatggcaccgttcgaagctttgta 31416843  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    ||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | || || || ||||||||||||||  |||||    
T  31416844 tggtcggaggtgcatgactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttagtgcatcagactactgagaaagtcaagatg 31416943  T
Q  302 atccaagagaaaa--tgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 399  Q
    ||  ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |  |||||||||||||| || || || || ||| |    
T  31416944 at--aagggaaaaggtgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcggataaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtttttct 31417041  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
    |||||| | || |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||  ||||  ||||||||     
T  31417042 gagagttactcttatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtattagatttcagaaagggttggaaca 31417141  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| ||| |||| | ||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  31417142 gtggcatatagagttgctttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactacggaagtatg 31417220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 21841025 - 21840452
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||  || ||| ||||||||||  |||| |  ||||| |   ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  21841025 aagttgaggttgagttcggctcatcatctgcaaacaaatggtcagtcggagagaacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 21840926  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21840925 aaggtggagcttgggatagtcatctatcgttgatagaattcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 21840826  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||     
T  21840825 tcggaggtgcaggacccctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgata 21840726  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| | ||||    
T  21840725 agagaaaagataaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcgaaggaaggcacttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctaagag 21840626  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | | |||||| || ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| |||||    
T  21840625 ttactcctataacaggtgtaggaggtgcactgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggc 21840526  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||  ||||| |||| || || |||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21840525 atacagagtgagtttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgtattccacgtgtcgcaacttcggaagtatg 21840452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 306 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22032339 - 22032067
Alignment:
Q  306 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 405  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22032339 aagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaggatcttgagttttaggatggagaccacgtgtttttgagagt 22032240  T
Q  406 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 505  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||   |||||||| | ||||| ||||| |||| ||||     
T  22032239 cactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccgagatttattggtttgtatcagatatcggaaagagttgaaacgttggcg 22032140  T
Q  506 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22032139 tatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttacacgatgttttccatgtttcgcaacttcggaagtatg 22032067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 29303595 - 29304172
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | || |||||||| ||| | ||||| |||    
T  29303595 ttcgaggttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggatgatttgttaagggtgtgtgtactt 29303694  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||| || || |||||||| |||||||| || || || |  |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |    
T  29303695 gagcaaggtggagcttgggatagccacctaccgttgatagagttcacttataacaacaactatcattcgagtataggtatggcaccgttcgaagccttgt 29303794  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga- 299  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | |||||||||||||| ||||     
T  29303795 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagt-cagaa 29303893  T
Q  300 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 399  Q
    ||||    || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| |    
T  29303894 tgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttct 29303993  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
    ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||  || | | |||||||     
T  29303994 gagggtcactccaatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagatcataggtccgtatcagatttcagagagaattggaaca 29304093  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  29304094 gtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttaggaagtatg 29304172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 31571011 - 31571588
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||| |  || || |   | || || ||||||||  | ||||| |||    
T  31571011 ttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgctt 31571110  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || || || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  31571111 gaacagggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaatagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgt 31571210  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||  | ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||    
T  31571211 atggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggttcgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagat 31571310  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| ||    
T  31571311 gatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctg 31571410  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  || | | | |||||||    
T  31571411 agagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaaattcattggcccgtatcagatttcagagagaataggaacgg 31571510  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  31571511 tggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 31571588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14565754 - 14565177
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  | |||| |||||| |   | || |||||||||||  | ||||| |||    
T  14565754 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggaaaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgctt 14565655  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  14565654 gagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 14565555  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  14565554 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttggttcacgagactactgagaaagtcaggtt 14565455  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||| ||    
T  14565454 gataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 14565355  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || | |||||| || |    
T  14565354 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtacag 14565255  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| || | || ||||| || || |||||||||||||    
T  14565254 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatttgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 14565177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6604270 - 6603693
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  6604270 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctt 6604171  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  6604170 gagcaaggtggagcttgggacagtcacttacctttgattgagtttacgtataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 6604071  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  6604070 atggtcggaggtgtaggactcctttgtgttggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggtt 6603971  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  6603970 gataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 6603871  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||  || | | |||| || |    
T  6603870 agggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcaaatttcagagagaattggtacag 6603771  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  6603770 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 6603693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6679723 - 6679146
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||  | ||||| |||    
T  6679723 ttcgaagttgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgctt 6679624  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  6679623 gagcaaggtggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 6679524  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  6679523 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggtt 6679424  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  6679423 gataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 6679324  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| || |    
T  6679323 agggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacag 6679224  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  6679223 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 6679146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 218 - 579
Target Start/End: Original strand, 21681856 - 21682217
Alignment:
Q  218 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 317  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||   ||| || ||||    
T  21681856 actcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatga 21681955  T
Q  318 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 417  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||| | |||||||||    
T  21681956 aagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgac 21682055  T
Q  418 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 517  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  21682056 gggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggt 21682155  T
Q  518 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatga 579  Q
    || || || ||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21682156 ttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatga 21682217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22051471 - 22051008
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || | | | |||||| |||||||  | ||||| ||||| |    
T  22051471 aagttgagattgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcgttggaggatctgttgagagtgtgtgtgcttgaac 22051372  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || || || || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22051371 aaggtggagcttgggatagtcacctaccatttatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 22051272  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || || || ||||||||  | ||||| || || || ||||| ||  |||||||     
T  22051271 tcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcaacagacgacagagaaggtcaagatgata 22051172  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
       || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||| || || || || || ||||||| ||    
T  22051171 agggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttttgaaag 22051072  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattgg 468  Q
    | | ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22051071 ttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaggaagttgactccgaagttcattgg 22051008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12305370 - 12304793
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  12305370 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctt 12305271  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| |||||||| || || || || ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || || |    
T  12305270 gagcaaggtggagcttgggatagtcacatgccattgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagcattggtatggcaccgttcgaagccttgt 12305171  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || || || || |||||||||||||| ||||| || |  || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  12305170 atggtcggaggtgtaggacccctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgctgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggtt 12305071  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| |     
T  12305070 gataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctt 12304971  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  |||| ||| |    
T  12304970 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttgaaacag 12304871  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  12304870 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 12304793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 200 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20008263 - 20007885
Alignment:
Q  200 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 299  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||    
T  20008263 tatggtcggaggtgcatgactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaggtaaaga 20008164  T
Q  300 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 399  Q
    ||||   ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||| || || ||||| || |||||| |    
T  20008163 tgataagagaaaagatgaaagcgtcgcatagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagttccaagagggagatcatgtgtttct 20008064  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |  || |  ||||||||     
T  20008063 gagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaacaaggtgactccaaagttcattggtccatatcagatatctgagagggttggaaca 20007964  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| ||| |||||||||| |  || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20007963 gtggcatatagagtgggtttgctaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 20007885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 803842 - 804419
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||  | ||||| |||    
T  803842 ttcgaagttgaggttgagtttggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgctt 803941  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  803942 gaacaaggtggagcttgggatagtcacttacctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 804041  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||   | |    
T  804042 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcacgagactactaagaaagtcaggtt 804141  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||| ||    
T  804142 gataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 804241  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | | |||| || |    
T  804242 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagaattggtacag 804341  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  804342 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 804419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 227 - 578
Target Start/End: Original strand, 21324804 - 21325156
Alignment:
Q  227 tgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgc 326  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||   ||| || |||||  ||||||    
T  21324804 tgctggtttgagtcaggagatagtgtggtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaaacgtcgc 21324903  T
Q  327 agagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtagg 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| || | ||||||||| ||||||||    
T  21324904 agagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtagg 21325003  T
Q  427 acgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccg 526  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |   | |  |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||     
T  21325004 acgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcatagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccacca 21325103  T
Q  527 catc-tttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21325104 catcatttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21325156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 340 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23949162 - 23948924
Alignment:
Q  340 gagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaag 439  Q
    ||||||| |||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||     
T  23949162 gagttattatgataagcgtaggaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactggttttagacgtgctttgaaa 23949063  T
Q  440 tcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatt 539  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||| |||||||| |  |||| | || | |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23949062 tcaaagaagttgactccgaggtttgttggtccgtatcagatatcagaaagaattagtacggtggcgtagcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatt 23948963  T
Q  540 tgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | ||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  23948962 ttcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatg 23948924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 374 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15441420 - 15441216
Alignment:
Q  374 tttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccat 473  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |    
T  15441420 tttcaagaaggtgaccacatgtttttgagagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 15441321  T
Q  474 atcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaa 573  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15441320 atcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgtgtttgattaccacctcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgtaa 15441221  T
Q  574 gtatg 578  Q
    |||||    
T  15441220 gtatg 15441216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 20975820 - 20976062
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||  ||||  | ||||| |||    
T  20975820 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtactt 20975919  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  20975920 tagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 20976019  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcagg 243  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  20976020 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcagg 20976062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 341 - 578
Target Start/End: Original strand, 16265127 - 16265364
Alignment:
Q  341 agttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 440  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| |||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  16265127 agttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgctttgaagt 16265226  T
Q  441 caaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaattt 540  Q
    | | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| ||    
T  16265227 cgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 16265326  T
Q  541 gcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  16265327 gcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 16265364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 21196801 - 21197123
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  21196801 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 21196900  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| || || ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||   | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  21196901 ggtttgaatccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactatgtaaaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtctcagag 21197000  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | | || | |||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||| ||| || || |||||||||||||| | |||| | ||||| || || |||    
T  21197001 ttggcagaggagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggtaggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtaactggagttggtcgt 21197100  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
     |||||||||  | |||||||||    
T  21197101 actttgaagtgtaggaagttgac 21197123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 16877394 - 16877716
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |    
T  16877394 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgcaggacaccgttatgtt 16877493  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  16877494 ggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 16877593  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | || || ||| ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| || | |||  |||| ||||| || |||    
T  16877594 tagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggagatcatgtgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgt 16877693  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  16877694 gctttgaagtgtaggaagttgac 16877716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22315673 - 22315364
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || || || || |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | || || ||||| || ||||| |    
T  22315673 ccgttgattgagtttacttataacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtagaacgccattgtgtt 22315574  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||| |||||||||||||||        ||||||| ||  |||||||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  22315573 ggtatgagtcaggtgaaagttcttgggtaggaccggaagttgttcaagaaactacagaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 22315474  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | || || ||  ||||||||||||  || || || |||||||||||||| | |||| | || |||||||| |||    
T  22315473 tagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtaaccggtgtaggtcgt 22315374  T
Q  431 gctttgaagt 440  Q
    ||||||||||    
T  22315373 gctttgaagt 22315364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 453
Target Start/End: Original strand, 20652635 - 20652954
Alignment:
Q  134 ttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 233  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||| |||| || || || |||||||| ||||    
T  20652635 ttgattgagtttacttacaacaatagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 20652734  T
Q  234 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 333  Q
    || |||| || ||||| |   | |||||||| ||| | || ||  | ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  20652735 ttaagtccggagaaagtgccttgttaggaccggaggtggtgcaagagactacggagaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtgg 20652834  T
Q  334 acaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgct 433  Q
    ||| |||||||||||| | ||| | ||||| ||| | |||||||| |  || || || || ||||||||||| | || | |||| ||||| || ||||||    
T  20652835 acagaagagttatcattataagaggagaaaggatatagagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgct 20652934  T
Q  434 ttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    |||||||  | |||||||||    
T  20652935 ttgaagtgtaggaagttgac 20652954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 16271393 - 16271638
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||  | ||||| |||    
T  16271393 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgctt 16271492  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| || ||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  16271493 gagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 16271592  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtga 246  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  16271593 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgcgtcgggtga 16271638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 28982632 - 28982392
Alignment:
Q  338 aagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttga 437  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| |||| |||  |||| ||||| |||||||| ||||    
T  28982632 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgccttga 28982533  T
Q  438 agtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa 537  Q
    |||| | ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  || | | |||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||    
T  28982532 agtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 28982433  T
Q  538 tttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||| | || || ||||| || || |||||||| ||||    
T  28982432 cttgcacgacgtgtttcatgtttctcagcttcggaaatatg 28982392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 28987852 - 28987612
Alignment:
Q  338 aagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttga 437  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| |||| |||  |||| ||||| |||||||| ||||    
T  28987852 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgccttga 28987753  T
Q  438 agtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa 537  Q
    |||| | ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  || | | |||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||    
T  28987752 agtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 28987653  T
Q  538 tttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||| | || || ||||| || || |||||||| ||||    
T  28987652 cttgcacgacgtgtttcatgtttctcagcttcggaaatatg 28987612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 403 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27347436 - 27347261
Alignment:
Q  403 agtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtg 502  Q
    ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  ||||| || |||    
T  27347436 agtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttgggacagtg 27347337  T
Q  503 gcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    || |||  ||| |||||  | || ||||||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  27347336 gcatataaagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 27347261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 21850636 - 21850958
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  21850636 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggtaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 21850735  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || || || |   | ||||| || ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  21850736 ggtttgagtccggagagagtgctttgttagggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagag 21850835  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| ||||| |||||||| ||| | |  || ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| ||||| || |||    
T  21850836 tagacagaagagctatcatgataagaggatgaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgt 21850935  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    | ||||||||  | |||||||||    
T  21850936 gatttgaagtgtaggaagttgac 21850958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22371548 - 22371371
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| |||  || ||||||||| ||||  |||| |  ||||||| | ||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  22371548 aagttgaggttgggttcggcttataatccgcaaacagatggtgagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagaatgtgtgtacttgagc 22371449  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgg 182  Q
    || | ||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  22371448 aacgtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagatttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgg 22371371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 22982916 - 22982596
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || | || |||||||||| | || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  22982916 ccgttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtgtcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 22982817  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||||||| ||||  |  | ||  ||| ||| ||  |||| ||  | ||||  || || ||| |||||||||||||||| ||||| || || |||||    
T  22982816 ggtttgagtcaagtgagtgctttgt--tagaaccggaagttgtgcaagagactatggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcatctcagag 22982719  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||  |  |||||||| ||||||||||||  || || || | |||||| ||||| | || | ||| |||||| || |||    
T  22982718 tagacagaagagttatcatgataaaaggtgaaaagatattgagtttcaggttggtgatcatgcgttttttagagtgaatcatgtgattggtgttggtcgt 22982619  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||   ||||||||||    
T  22982618 gctttgaagtgtcagaagttgac 22982596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 249
Target Start/End: Original strand, 23157310 - 23157428
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || ||| |||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  23157310 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatgacaccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 23157409  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaag 249  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  23157410 ggtttgaatcaggtgaaag 23157428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 27355160 - 27355035
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || || |||||||||||  ||||||  ||||| |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  27355160 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacggatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctt 27355061  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtca 126  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||    
T  27355060 gagcaaggtggagcttgggatagtca 27355035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 482; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 15589357 - 15589934
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15589357 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 15589456  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15589457 aagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 15589556  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589557 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 15589656  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15589657 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 15589756  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15589757 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 15589856  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15589857 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 15589934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 20062019 - 20062596
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20062019 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 20062118  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20062119 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 20062218  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062219 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 20062318  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20062319 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 20062418  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20062419 agagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 20062518  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20062519 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 20062596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 10005765 - 10005188
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10005765 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 10005666  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10005665 gaacaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 10005566  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005565 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 10005466  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10005465 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 10005366  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10005365 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 10005266  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10005265 tggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 10005188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 15724899 - 15725475
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15724899 ttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 15724998  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15724999 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttat 15725098  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  15725099 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaa-ttcggat 15725197  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15725198 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttt 15725297  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15725298 agagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 15725397  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15725398 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 15725475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16635938 - 16635361
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16635938 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 16635839  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  16635838 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgt 16635739  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635738 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 16635639  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16635638 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 16635539  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16635538 agagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 16635439  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16635438 tggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16635361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 43163262 - 43162685
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43163262 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 43163163  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  43163162 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgt 43163063  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163062 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 43162963  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  43162962 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 43162863  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  43162862 agagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 43162763  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43162762 tggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 43162685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 53384983 - 53385560
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53384983 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacggatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 53385082  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  53385083 gagcaaggatgaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctctgt 53385182  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385183 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 53385282  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53385283 gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 53385382  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53385383 agagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaaaaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacgg 53385482  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53385483 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 53385560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 10906375 - 10905798
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10906375 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 10906276  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10906275 gaacgaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 10906176  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906175 atggttggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 10906076  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10906075 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaagaaggagaccacgtgtttttg 10905976  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10905975 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 10905876  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10905875 tggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 10905798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 48425612 - 48425035
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48425612 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 48425513  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  48425512 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcaaggctttgt 48425413  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425412 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggactagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 48425313  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  48425312 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttg 48425213  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48425212 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 48425113  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48425112 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 48425035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 15348210 - 15348787
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15348210 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 15348309  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  15348310 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgt 15348409  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348410 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 15348509  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15348510 gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 15348609  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15348610 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 15348709  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15348710 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 15348787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 15402475 - 15403052
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15402475 ttcgaagctgagattgagttcggcgtatcatccatagacagctggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttctc 15402574  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15402575 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttaatcgagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttac 15402674  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15402675 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagat 15402774  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402775 gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagattttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 15402874  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15402875 agagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgatgttcattggtccgtatcagatattggaaagaattggaacgg 15402974  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15402975 tggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 15403052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 26792368 - 26792941
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26792368 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttaagc 26792467  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792468 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 26792567  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792568 tcggagatgcagaactccattatgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 26792667  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  26792668 caagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttaagag 26792767  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  26792768 tcactcctatgactagtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgatggc 26792867  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26792868 ttaccgagtggatttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 26792941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 13252855 - 13252278
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13252855 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 13252756  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  13252755 gaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgt 13252656  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13252655 atggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 13252556  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13252555 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 13252456  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13252455 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 13252356  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13252355 tggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 13252278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15339426 - 15338857
Alignment:
Q  9 tgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaagg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15339426 tgagattgagttcggcgtatcatcgacagacagatggtcagtcgaagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttctcgagcaagg 15339327  T
Q  109 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15339326 aggaacttgggatagtcatcttccgttaatcgagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 15339227  T
Q  209 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15339226 agatacagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcatcaaactactgagaaggttcagatgatccaag 15339127  T
Q  309 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 408  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15339126 agcaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgagttttaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcac 15339027  T
Q  409 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 508  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| |||||     
T  15339026 tcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagaattggaacggtagcttac 15338927  T
Q  509 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15338926 cgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 15338857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 16756550 - 16757127
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  16756550 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgtgctt 16756649  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |    
T  16756650 gagcaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcatcgttcgaggccttgt 16756749  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756750 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcagatgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 16756849  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16756850 gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacatgtttttg 16756949  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  16756950 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcatattttggaaagagttgggacgg 16757049  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16757050 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16757127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 16412247 - 16412824
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16412247 ttcgaagttgaggttgagttcggagtatcaaccacaaacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 16412346  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16412347 cagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttat 16412446  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16412447 atggttggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactaagaaagttcagat 16412546  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16412547 gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttggcaaaagagttatcatgataagcgtaggaatgaccttgagtttcatgaaggagaccacgtatttttg 16412646  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16412647 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 16412746  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16412747 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttggacaacgttttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 16412824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 5424895 - 5425471
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5424895 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 5424994  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  5424995 gaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctctgt 5425094  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425095 atggtcagagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 5425194  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  5425195 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtg-ctttg 5425293  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5425294 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 5425393  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5425394 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 5425471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12498413 - 12497836
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12498413 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 12498314  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  12498313 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 12498214  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12498213 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagat 12498114  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12498113 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttg 12498014  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  12498013 agagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 12497914  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497913 tggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 12497836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6600901 - 6600335
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||           ||||||    
T  6600901 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcgctagaggatttgt-----------gttctt 6600813  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6600812 gagcaaggaggaacttgggatagtcatctttcgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 6600713  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600712 atggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 6600613  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  6600612 gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattcaaggaaggagaccacgtgtttttg 6600513  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6600512 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgggacgg 6600413  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6600412 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 6600335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 14876464 - 14877041
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  14876464 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagagtttgtgttctt 14876563  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  14876564 gagcaaggaggaacttgggatagtcatattccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 14876663  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  14876664 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagcggtcttaggacccgagattgttcagcagactaccgagaaggttaagat 14876763  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14876764 gattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttg 14876863  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  14876864 agagttactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 14876963  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876964 tggcgtatcgagttggattaccactgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 14877041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 16806895 - 16807468
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16806895 aagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagc 16806994  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  16806995 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatgg 16807094  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||     
T  16807095 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaaatgatt 16807194  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16807195 caagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagaattatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 16807294  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  ||  | ||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  16807295 tcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactctgagatttttcggtccgtatcagatatcgaaaaaatttggaacggtggc 16807394  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16807395 gtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaattatg 16807468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 17490011 - 17489438
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| | |||| ||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  17490011 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggatgattcagtcgttagaagatctgttgagagtttgtgtacttgagc 17489912  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  17489911 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatgg 17489812  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||     
T  17489811 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgatt 17489712  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17489711 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 17489612  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  17489611 tcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 17489512  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17489511 gtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 17489438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16692325 - 16691748
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16692325 ttcgaagttgagattgagttcagcttatcatccacagacggatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttctt 16692226  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16692225 gagcaagggggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaacaatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 16692126  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  16692125 atggtcggatatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagcagactactgaaaaagttaagat 16692026  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16692025 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcaagaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 16691926  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||  | ||||| || | |||||  ||||||||||    
T  16691925 agagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgggtcgtatcaaatatcggaaagggttggaacgg 16691826  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16691825 tggcatatcgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 16691748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16371574 - 16371001
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16371574 aagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcggtcggaaaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagc 16371475  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16371474 aaggaggaacttgggatattcatctttcattgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 16371375  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  16371374 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgatt 16371275  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  16371274 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttcaagaagaagactacgtgtttttgagag 16371175  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |  |||| |||||| ||||||||    
T  16371174 tcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttgggacggtggc 16371075  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371074 gtattgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgtcgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16371001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 16492150 - 16492723
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||||| | |||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16492150 aagttgaggttgagttcggtgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttaagggtttgtgttcttgagc 16492249  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  16492250 aaggaggtacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatgacaccttgtgaggctttgtatgg 16492349  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||     
T  16492350 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgtatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgatt 16492449  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16492450 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 16492549  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16492550 tcactcctgtgactggtgttggacgagctttaaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacggtggc 16492649  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16492650 gtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaattttcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16492723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 9522880 - 9522307
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||   |||||| |||||| |||||||||||  ||||||| |||||||    
T  9522880 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgtttcagtcgctagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagc 9522781  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  9522780 aaggagggacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatatttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatgg 9522681  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||     
T  9522680 tcggagatgcagaactccgttgtcttggtttgagtcaggtgagagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaaaatgatt 9522581  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9522580 caagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgactttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 9522481  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |   ||| |||||||||||||||    
T  9522480 tcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcaaaaagagttggaacggtggc 9522381  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9522380 gtaccgagtgggtttaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 9522307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15209052 - 15208479
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |  ||||||| | |||| |||||||||||  |||||||  ||||||    
T  15209052 aagttgaggttgagctcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtctgagagaatgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtatttgagc 15208953  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15208952 aaggaggaacttgggatagtcatcttctattgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 15208853  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||     
T  15208852 acggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgatt 15208753  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  15208752 caagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaaaacattgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagag 15208653  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||| |  |||| | ||||||||||||     
T  15208652 tcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtaaaagaagttgactccgaggtttattggtccgaatcagatatcagaaagaattggaacggtgga 15208553  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15208552 gtatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaattttcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15208479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15248308 - 15247735
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   |||| |  ||| ||| | ||||||||||||||||  |||||||  ||||||    
T  15248308 aagttgaggttgagctcggcgtatcatcagcagacagatggtcagttggagagaacgatttagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgtaattgagc 15248209  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  15248208 aaggaggaacttgggatagtcatcttctattgatatagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatag 15248109  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||     
T  15248108 tcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgatt 15248009  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |   ||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  15248008 caagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaaaacaatgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagag 15247909  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||| |||| | ||||| | |||||||||||||    
T  15247908 tcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtgtattggtccgtattagatatcggaaagaattggaacggtggc 15247809  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  15247808 gtatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaaatatg 15247735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15227820 - 15227247
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| | |||||| || |||||||  || |||  |||||||||  |||| |  ||||||| | ||||||||||||||||  | ||||| ||| |||    
T  15227820 aagttgaggtggagttcagcttatcatccgcaaacaattggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtgtgtgtacttaagc 15227721  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||    
T  15227720 aaggtggagcttgggatagtcacctgccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagatttgtatgg 15227621  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat-gat 303  Q
    | |||| |||||||||||||| || |||||||||||  ||||| | ||  | || ||||||||  | |||||||| |||||  | |||| ||| || |||    
T  15227620 ttggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtcgagtgaaggtgtaatgttgggaccagatttagttcagcagactacaaa-aaaggtcaaattgat 15227522  T
Q  304 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 403  Q
       |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15227521 aagagagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgaga 15227422  T
Q  404 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 503  Q
    |||| |||| |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |  || | ||||||||| ||||    
T  15227421 gtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtgg 15227322  T
Q  504 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15227321 catatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15227247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 18134300 - 18134877
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||  | |||||||  |||||||||||||||||  || |||  || || |   | ||||||||  ||||  | ||||| |||    
T  18134300 ttcgaagttgaggttgagttcaacttatcatcctcagacagatggtcagtcggagcggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtactt 18134399  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  18134400 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 18134499  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| || |||||  | ||    
T  18134500 atggtcggaggtgcaggaatcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagataaagtcaaaat 18134599  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || |  || ||| ||    
T  18134600 gatcggagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcttgtatttctg 18134699  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| |    
T  18134700 agagttactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacag 18134799  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||| |||| ||||| || || |||||||| || |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18134800 tggcttatagagttggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 18134877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 13322606 - 13323183
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||| |   ||||||||||  | ||  | ||||| |||    
T  13322606 ttcgaggttaaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgattcaatccttagaggatttcctaagagtatgtgtgctt 13322705  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| | | ||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  13322706 gagcaaggtgaagcttgggatagtcacctacctttgatagagtttacctacaacaacaattaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttgt 13322805  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    | |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| | || |  || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  13322806 acggtcggaggtgcagaactcctttatgctggtttgagtcaggtcagagtgctgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagat 13322905  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  ||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  13322906 gatcatagaaaggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagatcttgggtttcaggagggagaccatgtgtttctg 13323005  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |   ||||||| |    
T  13323006 agagttactcctatgacgggggtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatattggagaggattggaacag 13323105  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |  | ||||| || || |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13323106 tggcatataggattggttttccaccacatctttcgaatttgcatggtgtattccatgtgtcgcagcttcggaagtatg 13323183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Original strand, 13972075 - 13972616
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   |||||||| | |||||| | ||||| ||||    
T  13972075 tcgaaattgaggctgagttcggcttatcatccccagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttg 13972174  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  13972175 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgta 13972274  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || |     
T  13972275 tggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagtta 13972374  T
Q  302 atccaagagaaa--atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 399  Q
    ||  |||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||    
T  13972375 at--aagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttctt 13972472  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||     
T  13972473 gagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccttatcagatttcagaaagagttggaact 13972572  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
    ||||| ||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  13972573 gtggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgca 13972616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 12360496 - 12361073
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | |||||||| ||||   | ||||| |||    
T  12360496 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggaccatacaatctttggaggatttattgaaagtgtgtgtactt 12360595  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  12360596 gagcaaggtggagcttcggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 12360695  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |  || || ||||||||  | ||||| |  ||||| ||||||||  ||||    
T  12360696 atggtcggaggtgcaggactccattatgctggtttgagtcaggagagagtgctgtattgggaccagacttggttcatcggactacagagaaagtcaagat 12360795  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  12360796 gataagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctg 12360895  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | | |||||||  ||||||||||||| ||||| || | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || || |||||||| |    
T  12360896 agagttacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaaatcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaggttggaacag 12360995  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  12360996 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 12361073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 15952922 - 15953499
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||||  ||||||  || || |   ||||||| ||| ||||  | ||||| |||    
T  15952922 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacatatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggagttgctgagagtgtgtgtactt 15953021  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  15953022 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttgccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 15953121  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  15953122 atggtcggaggtgcagaactcctttatgtttgtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagat 15953221  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || || ||| ||    
T  15953222 gataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctg 15953321  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||| | | ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |  || |  |||||||| |    
T  15953322 agatttactcctatgacgggtgtacgacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggttcgtatcagatatctgagagggttggaacag 15953421  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||   ||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15953422 tggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15953499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14086847 - 14086271
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||| |  || || |   |||||||| | |||||| | ||||| ||||    
T  14086847 tcgaaattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttg 14086748  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  14086747 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgta 14086648  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || |     
T  14086647 tggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagtta 14086548  T
Q  302 atccaagagaaa--atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 399  Q
    ||  |||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||    
T  14086547 at--aagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttctt 14086450  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||| || ||     
T  14086449 gagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggaca 14086350  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  14086349 gtggcttatagggtgggtttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgcagttgcggaagtatg 14086271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 8759036 - 8759613
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||| ||||||||  | ||||| |||    
T  8759036 ttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggacttgttgagagtgtgtgtgctt 8759135  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || || || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  8759136 gaacagggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgt 8759235  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||    
T  8759236 atggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagat 8759335  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |     
T  8759336 gatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttcta 8759435  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || | | | |||||||    
T  8759436 agagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacgg 8759535  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || || ||||| ||||| ||||||||||    
T  8759536 tggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaactgcggaagtatg 8759613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 543
Target Start/End: Original strand, 10420006 - 10420541
Alignment:
Q  8 ttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaag 107  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||  |||||| ||| || |   ||||||||||  | ||| | ||||| |||||||| |    
T  10420006 ttgaggttgagttcggcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttactaagggtatgtgtacttgagcagg 10420105  T
Q  108 gaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcg 207  Q
    | ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  10420106 gtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttatcattcaagtattggtatggcaccatttgaagctttatatggtcg 10420205  T
Q  208 gagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaa 307  Q
    ||| || || |||||  | || ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||  | |||||  | || || ||||||||   ||||||   |    
T  10420206 gaggtgtaggactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagaccacggagaaagtcaggatgattaga 10420305  T
Q  308 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 407  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || ||| |||| || |    
T  10420306 gagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgatcatgtttttctgagggtta 10420405  T
Q  408 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctta 507  Q
     ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||| ||    
T  10420406 ctcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagtcggaactgtggcgta 10420505  T
Q  508 tcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
    | || | ||||| || || |||||||||||||||||    
T  10420506 tagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgca 10420541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 13942199 - 13941622
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||| ||||||||  | ||||| |||    
T  13942199 ttcgaagttgagactgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcaatggaggacttgttgagagtgtgtgtgctt 13942100  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || || || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  13942099 gaacagggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcacccttcgaagctttgt 13942000  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || || || ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||    
T  13941999 atggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgaataaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagat 13941900  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |     
T  13941899 gatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttcta 13941800  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || | | | |||||||    
T  13941799 agagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacgg 13941700  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  13941699 tggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 13941622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 74 - 423
Target Start/End: Original strand, 15015782 - 15016131
Alignment:
Q  74 gaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagta 173  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |    
T  15015782 gaggacttgttgagaatttgtgtacttgagcaaggcggaacttgggatagtcatctctcattgatcgagttcacttgcaataacagttaccattctagca 15015881  T
Q  174 ttggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgt 273  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| |  |||||  |||||||||| |||||    
T  15015882 ttggaatggcaccgttcgaagcattgtatgatcggagatgcagaactccattgtgttggtatgaatccggtgagaatgtggtactaggaccagaaattgt 15015981  T
Q  274 tcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgag 373  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| || ||||    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  15015982 tcaacaaactacagagaaggttaagttgattagggagaagatgaaagcgtctcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttgag 15016081  T
Q  374 tttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgt 423  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  15016082 tttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgt 15016131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 41177697 - 41177120
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||| ||||||||  | ||||| |||    
T  41177697 ttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggacttgttgagagtgtgtgtgctt 41177598  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || || || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  41177597 gaacatggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgt 41177498  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||  | ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||    
T  41177497 atggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagat 41177398  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |     
T  41177397 gatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttcta 41177298  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || | | | |||||||    
T  41177297 agagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacgg 41177198  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  41177197 tggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 41177120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 543
Target Start/End: Original strand, 12850237 - 12850775
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||  |||| |  ||||||| | ||||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  12850237 aagttgaggttgagttcggcttataatccgtagacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagattgtgtgttcttgagc 12850336  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | | ||| |||||    
T  12850337 aaggtggagcttgggatagtcatctatcgttgatagagttcacgtacaacaacaattaccattcaagtattggtatggcaccgttcaaagatttgtatgg 12850436  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||||| ||||||||  | |||||  |  ||||     
T  12850437 tcggaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcaaactacataaaaagtcaaattgata 12850536  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  ||||||||||| || | ||| || |||||| ||||||    
T  12850537 agagaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaataaaggcccttgagtttcaagaggaagatcatgtgtttctgagag 12850636  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||||||| |||||    
T  12850637 tcactcctgtgacgggtataggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagagttggaacagtggc 12850736  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
     ||  |||||||||| || || ||||||| |||||||||    
T  12850737 atacagagtgggtttgccaccacatctttggaatttgca 12850775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 10384144 - 10383567
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  10384144 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctt 10384045  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||  | || ||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  10384044 gagcaaggtggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 10383945  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  10383944 atggtcggaggtgtaggactcctttgtgctggtttgagtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttagttcatgagactactgagaaagtcaggtt 10383845  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  10383844 gataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 10383745  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||  || | |||||| || |    
T  10383744 agggtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacag 10383645  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || || |||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  10383644 tggcatatagagttggtttgccaccacacctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 10383567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 578
Target Start/End: Original strand, 11303728 - 11304304
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||||| ||  | ||||| ||||    
T  11303728 tcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttaagagtgtgtgtacttg 11303827  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||| ||    
T  11303828 agcaagttggagcttgggatagtcacctaccgttgatatagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtaaggcaccgttcgaagctttgta 11303927  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattg-ttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  ||| |||| ||  |||| ||||| ||  ||||    
T  11303928 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggacc-gaatttgattcatcaggctacggagaaggtaaagat 11304026  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  || | |||||||||||| || || || || || ||| ||    
T  11304027 gataagagaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtatgaaggctcttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctg 11304126  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    |||||    |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||  |    
T  11304127 agagttttccctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaatag 11304226  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  11304227 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcttgtgtcgcaacttcagaagtatg 11304304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 11564646 - 11564852
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  11564646 ttcgaagttgaaattgagttcggcgtatcatctgcagacagatggttagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgctgagagtgtgtgttctt 11564745  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  11564746 gagaaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 11564845  T
Q  201 atggtcg 207  Q
    |||||||    
T  11564846 atggtcg 11564852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 11960992 - 11961565
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  | ||||  || || |   | ||||||||||| ||  | ||||| |||||||    
T  11960992 aagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattggaggatttgttaagagtgtgtgtgcttgagc 11961091  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11961092 aaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgattgagttcacttataacaacagctatcattcgagtattggcatggcaccgttcgaagctttgtatgg 11961191  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | || ||||| || ||  | |||||     
T  11961192 tcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatgtggttcatgagacgactgaaaaggtcaaaatgata 11961291  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
       || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||| || || || || ||| |||| |    
T  11961292 agggaaaagatgaaggctttgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgaggg 11961391  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| ||||  ||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||  |||||    
T  11961392 tcactcctttgacgagtgtacgacgtgcattgaagtcgaggaaattgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaatagtggc 11961491  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| |||| | ||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  11961492 ttatagagttgatttgcccccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 11961565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Original strand, 14126563 - 14126744
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||   |||||  ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14126563 aagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggtgaggaggattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagc 14126662  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14126663 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacc 14126744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Original strand, 16836464 - 16836945
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||||||||  |  |||| |||    
T  16836464 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatccttggaggatttgttgagagtgcgtgtgctt 16836563  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || || ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |    
T  16836564 gaacaaggtggagcttgggatagtcacctaccattggtagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgt 16836663  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || || || ||||||||  | |||||  | || |||||||| ||  ||||    
T  16836664 atggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatgagacgactgagaaggtcaagat 16836763  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || || ||||||    
T  16836764 gataagggaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttg 16836863  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 482  Q
    ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16836864 agagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattt 16836945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 47124115 - 47123542
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  47124115 aagttgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagc 47124016  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||| |||||  | || ||||| || || || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||    
T  47124015 aaggtggagcttgggacagtcacttgcctttgattgaatttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatgg 47123916  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | ||||||||||||||   | ||||     
T  47123915 tcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgata 47123816  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||| ||||||    
T  47123815 agagaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagag 47123716  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| || |||||    
T  47123715 tcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggc 47123616  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||| || ||||| || || ||||||| |||||    
T  47123615 atatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaggtatg 47123542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 44777421 - 44776941
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | || || ||||||||  | ||||| ||||    
T  44777421 tcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttg 44777322  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    | || || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  44777321 aacagggtggagcttgggatagtcacctgccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagcattata 44777222  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| || || || ||||||||  | |||||| | ||||| || |||||  |||||    
T  44777221 tggtcgaaggtgcaggactcctttgtgttggttcgagacaggagaaagtgttgtgttgggaccagatttagttcaggagactacagaaaaagtcaagatg 44777122  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |  |||||||| || || || || || || ||| | |    
T  44777121 atcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagaggaggaaggcccttgagttccaagagggtgatcatgtatttctaa 44777022  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 482  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  44777021 gagtcactccgatgacaggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcattggcccgtatcagattt 44776941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 16329615 - 16330190
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||| |  |||| |||    
T  16329615 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggttagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggt--gtgtactt 16329712  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  16329713 tagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccattgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 16329812  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || |||||  | || ||||||||||||||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  16329813 atggtcggaggtgtaggactcctctatgttggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggtt 16329912  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  16329913 gataagggaaaagatgaaagcttcacagagtcgacataagagttaccatgacaagcaaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 16330012  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | | ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||||| |    
T  16330013 agggtcactcctttgacaggtgttggacgtgcattgaagtcgaggtagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacag 16330112  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  16330113 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 16330190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Original strand, 16380882 - 16381362
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | |||||| |||||||  | ||||| |||    
T  16380882 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcattctcagacagatggtcagtcggagaggatgatccaatcattggaggatctgttgagagtgtgtgtgctt 16380981  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||| ||| ||||||||| ||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |    
T  16380982 gaacaaggtggagcttgggataatcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatcgcaccgttcgaagctttgt 16381081  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagt---ggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttca 297  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||   ||| |  ||||| ||  | |||||  | ||||| || || ||  |    
T  16381082 atggtcgaaggtgcaggactccgttgtgctggtttgagtccggagagagtgttatggt-tggggaccggatttggttcatgagactacagaaaaggtcaa 16381180  T
Q  298 gatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttt 397  Q
    |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| || || || || |||    
T  16381181 gatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgaca---gagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcgggatggtgatcatgtattt 16381277  T
Q  398 ttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 482  Q
    || ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16381278 ttaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattt 16381362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17492804 - 17492563
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||| ||||  | ||||| ||||    
T  17492804 tcgaacttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttg 17492705  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||| ||||| ||    
T  17492704 agcaaggtggatcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaatagttatcattcgaatattggtatggcaccgatcgaagctttgta 17492605  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcagg 243  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  17492604 tggtcggaggtgcaggactcctttaagctggtttgagtcagg 17492563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 314 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 14571710 - 14571448
Alignment:
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| | |||||    
T  14571710 atgaaagcgtcgcagagtcgactgaagagttaccgtgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactccta 14571611  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 513  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||| ||||    
T  14571610 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaatttgactcctaagtttattggtccttatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagt 14571511  T
Q  514 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagta 576  Q
    ||| || || ||  ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  14571510 gggcttgccaccatatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagta 14571448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14574104 - 14573889
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||| |  ||||||| | ||||||||||| ||| | | ||| | |||    
T  14574104 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcagagagtacgattcagtcgttagaggatttgctgatggtgtgtatactt 14574005  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  14574004 gagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccaatcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 14573905  T
Q  201 atggtcggagatgcag 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  14573904 atggtcggaggtgcag 14573889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4678613 - 4678365
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||| ||||||||  | ||||| |||    
T  4678613 ttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggacttgttgagagtgtgtgtgctt 4678514  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || || || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  4678513 gaacagggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcacccttcgaagctttgt 4678414  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaag 249  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4678413 atggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaag 4678365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15061917 - 15061777
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  15061917 aagttgagattgagttcggcgtatcatacgcagacagatggtcagtcggaaaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttatgttcttgagc 15061818  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttc 145  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  15061817 aaggtggaacttgggatagtcattttccattgattgagttc 15061777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13002070 - 13001800
Alignment:
Q  14 ttgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaa 113  Q
    ||||||||||| ||||| |  || ||||||||||| ||  |||| |  ||||||| | ||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||     
T  13002070 ttgagttcggcttatcacccgcaaacagatggtcattcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgatgagagtgtgtgtacttgagcaagg-ggag 13001972  T
Q  114 cttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatg 213  Q
    |||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  13001971 cttgggatagtcatttaccgttaatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 13001872  T
Q  214 cagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactac 285  Q
    || |||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||||| ||||||||    
T  13001871 caaaactccattatgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcaaactac 13001800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 8274494 - 8274816
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  8274494 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 8274593  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  8274594 ggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 8274693  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| || || || |||    
T  8274694 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgt 8274793  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  8274794 gctttgaagtgtaggaagttgac 8274816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28754493 - 28754245
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||  | ||||| |||    
T  28754493 ttcgaagttgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgctt 28754394  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  28754393 gagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 28754294  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaag 249  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  28754293 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaag 28754245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 26008947 - 26009189
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| |||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   |||||||| |  ||||  | ||||| |||    
T  26008947 ttcgaaattgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatctactgagagtgtgtgtactt 26009046  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||  ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || |    
T  26009047 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgagagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgt 26009146  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcagg 243  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26009147 atggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcagg 26009189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 16742798 - 16743120
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |    
T  16742798 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttttgtt 16742897  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  16742898 ggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 16742997  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||| ||| |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| || || || |||    
T  16742998 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtgtcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgt 16743097  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  16743098 gctttgaagtgtaggaagttgac 16743120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 15576794 - 15576473
Alignment:
Q  132 cgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctg 231  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||  ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||    
T  15576794 cgttgattgagtttacttacaacaacagtttgcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagaacaccgttatgttg 15576695  T
Q  232 gtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagt 331  Q
    ||||||||| || || || |   | || ||||| ||  |||| |   | ||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  15576694 gtttgagtctggagagagtgctttgtttggaccggaagttgtgcgagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagt 15576595  T
Q  332 cgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtg 431  Q
     |||| ||||| |||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | |||| |||| || || || ||||    
T  15576594 agacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtg 15576495  T
Q  432 ctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    |||||||||  | |||||||||    
T  15576494 ctttgaagtgtaggaagttgac 15576473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 17193121 - 17192865
Alignment:
Q  149 tacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaa 248  Q
    ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| | ||| ||||    
T  17193121 tacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacgccgttgtgttggtttgaataaggagaaa 17193022  T
Q  249 gagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatca 348  Q
    | || || ||| |||| ||  |||| ||  | | ||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  17193021 gtgttgtgttacgaccggaagttgtgcaagagagtacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatca 17192922  T
Q  349 tgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 405  Q
    ||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |||||||| |||||    
T  17192921 tgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttttttagagt 17192865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18748678 - 18748401
Alignment:
Q  163 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttagga 262  Q
    |||||||||||| || |||||||| || |||| ||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |   | ||||||    
T  18748678 tcattctagtatcggtatggcaccgtttgagggtttgtatggtcggaggtgtaggacgtcgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagtgctttgttagga 18748579  T
Q  263 ccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaa 362  Q
    || ||| |||| ||  | ||||| || |||||| ||||||| ||||| || ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | || |    
T  18748578 ccggaggttgtgcaagagactacggaaaaagttaagatgattcaagataagatgaaagtgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagga 18748479  T
Q  363 aagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 440  Q
    |  |  |||||||||| |  || || || |||||||| ||||| |  ||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  18748478 agaacattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttaagagtgaaccctgtaactggtgttggacgtgctttgaagt 18748401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 13975141 - 13975462
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  13975141 ccgttgattgagtt-acttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 13975239  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || || ||     | ||||| || ||  ||||  |  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| |||||||| || |||||    
T  13975240 ggtttgagtccggagagagtcctttgttagggccggaagttgtggaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcatctcagag 13975339  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| ||||| |||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| || || || |||    
T  13975340 tagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgt 13975439  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    | ||||||||  | |||||||||    
T  13975440 gttttgaagtgtaggaagttgac 13975462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 303
Target Start/End: Original strand, 14183007 - 14183179
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||   ||||||| ||||| || ||||| |    
T  14183007 ccgttgattgagtttacttacaacaatagttttcatttaagtattggtatggctcctttcgatgctttgtatgagaggagatgtagaacacctttgtgtt 14183106  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 303  Q
    ||| ||||||  ||||||| || || || ||| | || ||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||    
T  14183107 ggtatgagtcgagtgaaagtgttgtgttgggatcggaaattgttcagcagactattgagaaggttaagatgat 14183179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 380
Target Start/End: Original strand, 6712506 - 6712753
Alignment:
Q  133 gttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctgg 232  Q
    |||||| ||||| || ||||| || | || || ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||    
T  6712506 gttgattgagtttacttacaacaacaattttccttctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtagaacgccgttgtgttgg 6712605  T
Q  233 tttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtc 332  Q
    | ||||||||| ||||| |   | |||||||| ||| |||| ||  | |||||  | || ||| ||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||     
T  6712606 tatgagtcaggcgaaagtgctttgttaggaccggaggttgtacaagagactacataaaaggttaagatgattcaaaagaagatgaaagcgtctcagagta 6712705  T
Q  333 gacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 380  Q
    | || |||||||||||||| ||| | || || ||  ||||||||||||    
T  6712706 ggcagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcagg 6712753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 16338466 - 16338591
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||| |   | || |||||||| ||| | ||||| |||    
T  16338466 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgtttagggtgtgtgtgctt 16338565  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtca 126  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||    
T  16338566 gaacaaggtggagcttgggatagtca 16338591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 491 - 578
Target Start/End: Original strand, 31689067 - 31689154
Alignment:
Q  491 gttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| |||||  | || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31689067 gttggaacagtggcatatagagttggtttgacaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 31689154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 491 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 31945157 - 31945070
Alignment:
Q  491 gttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||| ||||| |||  ||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31945157 gttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 31945070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 237
Target Start/End: Original strand, 6152946 - 6153052
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || | || |||||||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  6152946 ccgttgattgagtttacatacaacaacaattttcattctagtatcgagatggctccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 6153045  T
Q  231 ggtttga 237  Q
    |||||||    
T  6153046 ggtttga 6153052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 16828156 - 16828206
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtc 51  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  16828156 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgtagacagatggtcagtc 16828206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 478; Significance: 0; HSPs: 74)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27187846 - 27187269
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27187846 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 27187747  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  27187746 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctctgt 27187647  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187646 atggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 27187547  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27187546 gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgaagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttg 27187447  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27187446 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccgaaattcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacgg 27187347  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187346 tggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 27187269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 27261394 - 27261971
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27261394 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 27261493  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  27261494 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctctgt 27261593  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261594 atggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 27261693  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27261694 gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgaagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttg 27261793  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27261794 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccgaaattcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacgg 27261893  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261894 tggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 27261971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 28263068 - 28263645
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28263068 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacggatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttattgagaatttgtgttctt 28263167  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263168 gagcaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 28263267  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263268 atggtcggatatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 28263367  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28263368 gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttg 28263467  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  28263468 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgggacgg 28263567  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263568 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 28263645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 28341817 - 28342394
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28341817 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacggatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttattgagaatttgtgttctt 28341916  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28341917 gagcaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 28342016  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342017 atggtcggatatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 28342116  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28342117 gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttg 28342216  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  28342217 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgggacgg 28342316  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342317 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 28342394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 2874674 - 2875251
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2874674 ttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 2874773  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874774 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttat 2874873  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2874874 atggtcggagatgcagaaccccgttgtgctggtttgagtcgggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggat 2874973  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2874974 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagattttgagtttcaagaaggagaccacgagtttttg 2875073  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  2875074 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaataagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacag 2875173  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2875174 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 2875251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 25112962 - 25112385
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25112962 ttcgaagttgagattaagttcggcctatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 25112863  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25112862 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttat 25112763  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25112762 atggtcggagatgcagaattccgttatgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagcgatcgttcagcaaactactgagaaagttcagat 25112663  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25112662 gattcaagagaaaattaaagcgtcgcagagtcgacaaaagacttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttg 25112563  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  25112562 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagtcggaacgg 25112463  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25112462 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcagaagtatg 25112385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 29591791 - 29592368
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  29591791 ttcgaagttgagagtgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctc 29591890  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  29591891 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgt 29591990  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29591991 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 29592090  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29592091 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 29592190  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29592191 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 29592290  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29592291 tggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 29592368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 24313039 - 24313616
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24313039 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 24313138  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24313139 gaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 24313238  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24313239 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 24313338  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24313339 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcataggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 24313438  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24313439 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 24313538  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24313539 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 24313616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 28292243 - 28292820
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28292243 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagttggagaggacaattcagtcactagaggatttattgagaatttgtgttctt 28292342  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292343 gagcaaggaggaacttcggacagtcatcttccattgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 28292442  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292443 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 28292542  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28292543 gatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttg 28292642  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28292643 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagttaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacgg 28292742  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28292743 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 28292820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 1542955 - 1543532
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1542955 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttgttgagaatttgtgttctt 1543054  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1543055 gagcaaggaggagcttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttacaataatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 1543154  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1543155 atggtcggagatgcataactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagat 1543254  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1543255 gattcaagagaaaatgaaagcgtcccagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgcagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttg 1543354  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1543355 agagtcactcctatgactggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacgg 1543454  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1543455 tggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 1543532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 578
Target Start/End: Original strand, 16626596 - 16627165
Alignment:
Q  9 tgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaagg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16626596 tgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaaaatttgtgttcttgagcaagg 16626695  T
Q  109 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  16626696 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgg 16626795  T
Q  209 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16626796 agatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactattgagaaagttcagatgatccaag 16626895  T
Q  309 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16626896 agaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcac 16626995  T
Q  409 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  16626996 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttac 16627095  T
Q  509 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16627096 cgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16627165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 19865093 - 19864520
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  19865093 aagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggataggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagc 19864994  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19864993 aaggaggaacctgggctagtcatcttccgttgattgagttcacgtataataatagttatcattttggtattggaatggcaccttttgcggctttatatgg 19864894  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||     
T  19864893 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattggtcagcagactactgagaaggttaagatgatt 19864794  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19864793 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgcagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttttagag 19864694  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  19864693 tcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagatttggaacggtggc 19864594  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  19864593 gtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgtatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 19864520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 5839094 - 5839667
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5839094 aagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagc 5839193  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  5839194 agggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtataataatagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggctttgtatgg 5839293  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||     
T  5839294 tcggagatgtagaacttcgttgtgttggtttgaatcaggagatagggtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtcaagatgatt 5839393  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  5839394 taagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacacgtttttgagag 5839493  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| |||||    
T  5839494 tcactcctatgacaggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttgacttcgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggc 5839593  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5839594 gtatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttacatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 5839667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 111 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12498326 - 12497859
Alignment:
Q  111 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12498326 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggag 12498227  T
Q  211 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12498226 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttaggacccgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagag 12498127  T
Q  311 aaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtc 410  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12498126 aaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 12498027  T
Q  411 ctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcg 510  Q
     | |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12498026 ttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcg 12497927  T
Q  511 agtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497926 agtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 12497859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 111 - 578
Target Start/End: Original strand, 12510575 - 12511042
Alignment:
Q  111 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12510575 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggag 12510674  T
Q  211 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12510675 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttaggacccgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagag 12510774  T
Q  311 aaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtc 410  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12510775 aaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 12510874  T
Q  411 ctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcg 510  Q
     | |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12510875 ttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcg 12510974  T
Q  511 agtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510975 agtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 12511042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 25609736 - 25610309
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  | ||||  ||||||| | |||| |||||||||||  ||||||| |||||||    
T  25609736 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagc 25609835  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||    
T  25609836 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgataaagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgatgctttgtatgg 25609935  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||     
T  25609936 tcggagatgcagaactccattgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgatt 25610035  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25610036 caagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgagag 25610135  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    |||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||| ||| |||| | ||||| |||||||||||||||    
T  25610136 tcacacctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgattccgagatttattggtccgtattagatatcggaaagagttggaacggtggc 25610235  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25610236 gtatcgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcgcgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 25610309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 27331308 - 27331881
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  27331308 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtctgtcagagaggacgattcagtcgctagaggacttgttgagggtttgtgtgcttgagc 27331407  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  27331408 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagtgttcatgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatgg 27331507  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  27331508 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagggtggttttaggacccgagaatgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgatt 27331607  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  27331608 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggggatcacgtatttttgagag 27331707  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27331708 tcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttattggtccatatcagatatcagaaagagttggaacggtggc 27331807  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27331808 gtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttgatgtgtcgcaacttcggaagtatg 27331881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 27392048 - 27392621
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  27392048 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtctgtcagagaggacgattcagtcgctagaggacttgttgagggtttgtgtgcttgagc 27392147  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  27392148 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagtgttcatgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatgg 27392247  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  27392248 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagggtggttttaggacccgagaatgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgatt 27392347  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  27392348 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggggatcacgtatttttgagag 27392447  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27392448 tcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttattggtccatatcagatatcagaaagagttggaacggtggc 27392547  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27392548 gtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttgatgtgtcgcaacttcggaagtatg 27392621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 18407817 - 18408391
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||  ||||||| | |||| |||||||||||  ||||||| |||||||    
T  18407817 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagagggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagc 18407916  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaa-taatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18407917 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaaatactagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttatatg 18408016  T
Q  204 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  18408017 gtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtattaggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagataat 18408116  T
Q  304 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 403  Q
     |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  18408117 tcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaatagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtatttttgaga 18408216  T
Q  404 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 503  Q
    || | || | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  18408217 gtaactcgtgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgg 18408316  T
Q  504 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  18408317 cgtatcgggtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcactatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 18408391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 16927515 - 16928088
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16927515 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaggatttgttgaggatttgtgtgctagagc 16927614  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16927615 aagctggaacttgggacagtcatctcccgttaatagagttcacgtataacaatagctatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatgg 16927714  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||     
T  16927715 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagggaaagtaaagatgatt 16927814  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16927815 caagaaaagatgaaagcgccgcagagtcgaaaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 16927914  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16927915 tcactcttgtgactagtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggc 16928014  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||  | || ||||| |||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  16928015 gtatcgtcttggattaccaccgcatctttcgaattcgcacgatatattacatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 16963242 - 16963815
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||    
T  16963242 aagttgaggttgagttcagcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagagaatttgttaaggatttgtgtgctagagc 16963341  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| | ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  16963342 aaggtgaaacttgggacagtcatctcccgttaatagagttcacgtctaacaatagctatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatgg 16963441  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||     
T  16963442 tcggagatgcagaactccgttgtgttgatttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtaaagatgatt 16963541  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16963542 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccaagtgtttttgagag 16963641  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  16963642 tcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaagaagttgactccgagatttattggtccatatcagatatcggaaatagttggaacgatggc 16963741  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  16963742 gtatcgtgttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtattacatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16963815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 111 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 12505655 - 12505188
Alignment:
Q  111 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  12505655 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgtcaccttttgaggttttttatggtcggag 12505556  T
Q  211 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  12505555 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagattggtcttaggacccgagattgttcatcatactactgagaatgttaagatgattcaagag 12505456  T
Q  311 aaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtc 410  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12505455 aatatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 12505356  T
Q  411 ctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcg 510  Q
     | |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12505355 ttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcg 12505256  T
Q  511 agtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505255 agtgggattaccaccgcatctttcgatttttcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 12505188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 22078565 - 22079136
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||  ||||||| ||| || ||||||||||   ||||||  || ||||    
T  22078565 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggttagtcggagaggacgattcagtcgctggaagatttgttgaaagtttgtgaactcgagc 22078664  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  22078665 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgataaagttcacgtacaataatagttat--ttctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatgg 22078762  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||     
T  22078763 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaaaagtggtcttaggactagagattgttcaacaaaccactgagaaggttaagatgatt 22078862  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    | ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22078863 ccagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcttaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagag 22078962  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||| |||| |||||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  22078963 tcactcctgtgattggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattcgtccgtatcagatatcggaaagagttggtacggtggc 22079062  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  22079063 gtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtagcaacttcggaagtatg 22079136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 22762330 - 22762903
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||| ||||  ||||||  ||||||| | |||| |||||||||||  ||||||| ||||||     
T  22762330 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaactgatggttagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagg 22762429  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||    
T  22762430 aaggaggaacttgagatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttacgagactttgtgtgg 22762529  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| |||||||     
T  22762530 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtagtcttaggaccagagattgttcaacaaattacttagaaggttaagatgatt 22762629  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |  ||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  22762630 caagagaagatgaaagtttcggagagtcgacaatagagttacaatgataagcgtaggacagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttgtgagag 22762729  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  22762730 tcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgaccccgagatttattggtccgaatcagatatcggaaagagttggaacgatggc 22762829  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22762830 gtatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcactttgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22762903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23078875 - 23078302
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||  |||| |  ||||||| | | ||  | ||||||||  ||||||| |||||||    
T  23078875 aagttgaggttgagttcggcgtatcgtccgcagagagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttggaatacttgttgagagtttgtgtacttgagc 23078776  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23078775 aaggaggaacttgggatagtcatcttccatttatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 23078676  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  23078675 tcggagatgcataactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgatt 23078576  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||    
T  23078575 caagaaaagatgaaagcatcgcagactcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagagggagatcacgtatttttgagag 23078476  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||  || ||| || | |||||||| | ||||| ||||  |||||||||    
T  23078475 tcactcctgtgactggtgttgggcgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagtttaaacggtggc 23078376  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  23078375 gtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcaagaagtattacatgtatcgcaacttcggaagtatg 23078302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 152 - 578
Target Start/End: Original strand, 25765312 - 25765737
Alignment:
Q  152 aataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagag 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  25765312 aataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgagtcaggtgaaaaag 25765411  T
Q  252 tggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25765412 tggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtaaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatga 25765511  T
Q  352 caagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 451  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25765512 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgcttttgagagtca-cgctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 25765610  T
Q  452 accccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttt 551  Q
    || ||||  || |||||||  |||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |    
T  25765611 actccgagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggtgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgtgt 25765710  T
Q  552 tccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25765711 tccatgtgtcgtaactttggaagtatg 25765737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22434275 - 22433929
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||  ||||||  ||| ||| | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22434275 aagttgagattgagttcagcgtatcatccgcagacagatgattagtcggagaggacgattaagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgtacttgagc 22434176  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22434175 aaagaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacttacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 22434076  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  22434075 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgatt 22433976  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 351  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433975 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 22433929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15459733 - 15459204
Alignment:
Q  14 ttgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaa 113  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||  |||||| ||| || |   ||||||||||  | ||| | ||||| |||||||| || |||     
T  15459733 ttgagttcggcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttactaagggtatgtgtacttgagcagggtggag 15459634  T
Q  114 cttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatg 213  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  15459633 cttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaataacagttatcattcaagtattggtatggcaccatttgaagctttatatggtcggaggtg 15459534  T
Q  214 cagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaa 313  Q
     || |||||  | || ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   ||||||   ||||||     
T  15459533 taggactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcacgagactacggagaaagtcaggatgattagagagaag 15459434  T
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| || | |||||    
T  15459433 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttactccta 15459334  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 513  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  15459333 tgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagt 15459234  T
Q  514 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  15459233 gggattaccacctcatctttcgaatttgca 15459204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 25768597 - 25768024
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||  |  |||||||   | ||||||||| | ||  | ||||| |||||||    
T  25768597 aagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaaaacgattcagtcattcgaggatttgctaagagtgtgtgtgcttgagc 25768498  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||    
T  25768497 aaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaactgttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtgtgg 25768398  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  | ||||| |||||||| ||||| ||  || ||||     
T  25768397 tcggaggtgcaggactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtctttggaccggatttagttcatcaaactacggagaaggtcaagttgata 25768298  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||    
T  25768297 agagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagag 25768198  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||||| || ||||| |  || | ||||||||| |||||    
T  25768197 tcactcttatgacgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaaattgacttcaaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggc 25768098  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||  |||||||||| || || |||||||| ||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  25768097 atacagagtgggtttgccaccacatctttccaatttgcatgatgtgtttcacgtgtcgcagcttcggaagtatg 25768024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 21472007 - 21471434
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||   |||| |  |||||||   ||||||| ||  | ||  | ||||| |||||||    
T  21472007 aagttgagattgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtgggagagaactattcagtcattagaggactttctaagagtgtgtgtacttgagc 21471908  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21471907 aaggtggagcttgggatagtcatttaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 21471808  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |  || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||| ||  || | ||     
T  21471807 acggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgcagtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagttaata 21471708  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||    
T  21471707 agagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagag 21471608  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||| |  || | ||||||||| |||||    
T  21471607 tcactcctatgacgggggtaggacgtgcgttgaaatctaagaagttgactccgaagtttattgatccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggc 21471508  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21471507 atacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21471434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 93 - 578
Target Start/End: Original strand, 8766111 - 8766596
Alignment:
Q  93 gtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcga 192  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  8766111 gtgttcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcga 8766210  T
Q  193 ggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaa 292  Q
     ||||| |||||| |||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||| || || || || |  ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||    
T  8766211 agctttgtatggttggaggtgcaggactcatttatgctggtttgagtcaggagagagtgtcgtgtggggaccggatttggttcatgagactacagagaaa 8766310  T
Q  293 gttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacg 392  Q
    ||  ||||||||  ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || |    
T  8766311 gtcaagatgatcagagaaaagatgaaggcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatg 8766410  T
Q  393 tgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagt 492  Q
    ||||| |||| || | | |||||||  | ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  ||    
T  8766411 tgtttctgagggttacttctatgacaagggtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggt 8766510  T
Q  493 tggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8766511 tggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 8766596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 19879707 - 19879131
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||  || || |   |||||||| | |||||| | ||||| ||||    
T  19879707 tcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggacagtcagagaggacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttg 19879608  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  19879607 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgta 19879508  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || || ||||| || ||||| |||||||| || || ||| || |     
T  19879507 tggacgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgaatcgggagaaagtgtgatgttggggccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagtta 19879408  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    ||   |||  | ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  19879407 ataagagaacagatgaaagggtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttga 19879308  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||||||||| ||    
T  19879307 gagtcactcctatggcaggtgtaggccgtgcattgaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagt 19879208  T
Q  502 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  19879207 ggcttatagggtgggtttaccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaagtatg 19879131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 17415896 - 17415365
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||| |||   | ||||| |||    
T  17415896 ttcgaagttgaggttaagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgaagaggacgatccaatcattggaggatttgctgatagtgtgtgtactt 17415797  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||| |    
T  17415796 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgtcgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattgatatgacaccgttcgaagctttgt 17415697  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||| || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  17415696 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcagaagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagat 17415597  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||    
T  17415596 gataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttatg 17415497  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |    
T  17415496 agagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacag 17415397  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctt 532  Q
    |||| ||| |||||||||| || |||||||||    
T  17415396 tggcatatagagtgggtttgccaccgcatctt 17415365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 21564003 - 21564580
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||| ||||  | ||||| |||    
T  21564003 ttcgaagttgaggttgagttcgacttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtatgtgtactt 21564102  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||| |    
T  21564103 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacctacatcaatagttaccattcgagtattggtatggttccgttcgaagctttgt 21564202  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    | |||||||| ||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| | || |||||||| || |||||||| ||||   | || ||| || |    
T  21564203 acggtcggaggtgccggactcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactaaaaaaaaggttaagtt 21564302  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   |||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |||    
T  21564303 gataagagaacagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagctatcatgacaaacgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttg 21564402  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| |    
T  21564403 agagtcactcctttgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacag 21564502  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  | || || |||||||| ||| | ||||||||||    
T  21564503 tggcgtatagagtgggtttgccgcctcatctttagaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattacggaagtatg 21564580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 10468720 - 10469297
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | || |||||||||||| | ||||| ||     
T  10468720 ttcgaaattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctc 10468819  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| | | ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  10468820 gagcaaggtgaagcttgggatagtcacctaccgttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 10468919  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  10468920 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggtt 10469019  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  10469020 gataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 10469119  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| |    
T  10469120 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaactg 10469219  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  10469220 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacctgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 10469297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 321 - 578
Target Start/End: Original strand, 21833172 - 21833429
Alignment:
Q  321 cgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactgg 420  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21833172 cgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactgg 21833271  T
Q  421 tgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggttta 520  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| |||||||| | ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  21833272 tgttggaggtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttataggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggatta 21833371  T
Q  521 ccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833372 ccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21833429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1641178 - 1640715
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||| |  ||||||| | ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  1641178 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 1641079  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||    
T  1641078 aaggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgcatgg 1640979  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga-tgat 303  Q
     ||||| |||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || |||| ||| | ||||    
T  1640978 acggaggtgcagaactccgttatgttggtttaagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatatagttcatcagactacaga-aaaggtcaaattgat 1640880  T
Q  304 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 403  Q
       |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| || |||||| | |||    
T  1640879 aagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgaattttaggaaggagatcatgtgtttctaaga 1640780  T
Q  404 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattgg 468  Q
    ||||  ||| |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||    
T  1640779 gtcacccctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgaccccgaggtttattgg 1640715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 519
Target Start/End: Original strand, 14381338 - 14381856
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||  | |   | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  14381338 ttcgaagttgaggttgagttcagcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatcaaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgctt 14381437  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  14381438 aagcaaggtggaacttgggacagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 14381537  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||| | || || || || || ||| | ||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  14381538 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcatgagagagtgtcgtgttgggatcggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagat 14381637  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  14381638 gataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtggacagaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctg 14381737  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||| |  |||||||| |    
T  14381738 agggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacag 14381837  T
Q  501 tggcttatcgagtgggttt 519  Q
    |||| ||| |||| |||||    
T  14381838 tggcatatagagttggttt 14381856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17032793 - 17032589
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17032793 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggaaaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgttctt 17032694  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||    
T  17032693 gaacaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttacactaatagttatcattctagtatcagaatggcaccttttgaagctttat 17032594  T
Q  201 atggt 205  Q
    |||||    
T  17032593 atggt 17032589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 561
Target Start/End: Original strand, 11280377 - 11280936
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||| |||||  |||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||||| |||||| ||| || |   |||| ||| | |||||| | ||||| ||||    
T  11280377 tcgaaattgaggctgagttcggcttaccatcctcagaccgatggccagtcagagaggacaatgcaatccttagaagatcttttgagggtgtgtgtacttg 11280476  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||  || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  11280477 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgacagaatttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgta 11280576  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || |     
T  11280577 tgatcgaagatgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagtta 11280676  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    ||   |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  11280677 ataagagaacatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttga 11280776  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    || |||  |||||||| |||||||||| ||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||||||||| ||    
T  11280777 gaatcacacctatgacaggtgtaggacatgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagt 11280876  T
Q  502 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtc 561  Q
    ||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||||||    
T  11280877 ggcttatagggtgggtttaccccctcatctttcaaatttgcatgacgtgttccatgtgtc 11280936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 391 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 17032582 - 17032395
Alignment:
Q  391 cgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaa 490  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| |    
T  17032582 cgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaaga 17032483  T
Q  491 gttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032482 gttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 17032395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 22796507 - 22797080
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||   || ||| ||||||||||  |||| |  ||||| | |  |||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  22796507 aagttgaggttgagttcggcttatcattcgcaaacatatggtcagtcggagagaacgattcaatcgtcagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 22796606  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| |||  |||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||| || ||    
T  22796607 aaggtggagattgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtacgg 22796706  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||  |||| ||  | ||||| || ||||| ||||| ||| |||||||     
T  22796707 tcggaggtgcaggactcctttatgttgatttgagtcaggagagagtgtagtgttgcgaccggatttggttcatcagactacagagaaggttaagatgata 22796806  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
       || || ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||    
T  22796807 agggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtctacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagag 22796906  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||  ||||| || |  || |  |||||||| |||||    
T  22796907 ttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttgactcctaagtttattggtctgtatcatatatctgagagggttggaacagtggc 22797006  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22797007 atatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22797080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 27560488 - 27561065
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||| |  || || |   | || || ||||||||  | ||||| |||    
T  27560488 ttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgctt 27560587  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || || || ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  27560588 gaacagggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgt 27560687  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||    
T  27560688 atggtcgaaggtgcaggactccattgtgttggtttgaatcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttagttcaggagactacagaaaaagtcaagat 27560787  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |     
T  27560788 gatcagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttcta 27560887  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |   |||||||||    
T  27560888 agagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattggaacgg 27560987  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||    
T  27560988 tggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgttccacgtgtcacagttgcggaagtatg 27561065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 191 - 578
Target Start/End: Original strand, 18197608 - 18197995
Alignment:
Q  191 gaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgaga 290  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  18197608 gaggctttgtatggtcggaggtgcagaactccgttgtgttcgtttaagtcaggtgagaatgtggttttaggaccagcgattgtttaacagactactgaga 18197707  T
Q  291 aagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagacca 390  Q
    | ||  |||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||| || ||| | ||    
T  18197708 aggtaaagatgatttaagaaaagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtcggaaagaccttaagtttcaagagggatatca 18197807  T
Q  391 cgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaa 490  Q
     || ||| ||| ||||| || | ||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||| |||| | ||||| |    
T  18197808 tgtatttctgaaagtcactcttgtgacaagtgtaggacgcgaattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtctgtataagatatcggaaaga 18197907  T
Q  491 gttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||  ||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  18197908 atttaaacagtggcgtatcgagtgggtttgccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtttcgcaacttcggaagtatg 18197995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Original strand, 34645458 - 34645999
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||| |||| ||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||  |||||| ||| || |   ||||||||||| | ||| | ||||| ||||    
T  34645458 tcgaaattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttg 34645557  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||  | |||||||| || || || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  34645558 agcaaggtggagcgtgggatagccacttaccgttgatagaatttacttataacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgta 34645657  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || ||    
T  34645658 tggtcgcagatgcaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagttg 34645757  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    ||   |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  34645758 ataagagaacatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttga 34645857  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||||||||| ||    
T  34645858 gggtcactcctatgacaggtgtgggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaactgt 34645957  T
Q  502 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
    ||| ||| || | || ||||| || |||||||||||||||||    
T  34645958 ggcgtatagaattggattaccacctcatctttcgaatttgca 34645999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 92 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 18795009 - 18794558
Alignment:
Q  92 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcg 191  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |    
T  18795009 tgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacctacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccatttg 18794910  T
Q  192 aggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaa 291  Q
    | || || || ||||| || |||| |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||| | || || ||||| || || || || ||||| || ||    
T  18794909 aagccttgtacggtcgaaggtgcataactcctttgtgttggtttgagttaggagaaagtgtgatgttggggccagacatagtgcaacagactacagaaaa 18794810  T
Q  292 agttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccac 391  Q
     ||| || ||||   |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| ||     
T  18794809 ggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaatcgtaggaaagaccttcagtttcaagagggagatcat 18794710  T
Q  392 gtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaag 491  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |   | |  |    
T  18794709 gtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgccttaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctaagaggg 18794610  T
Q  492 ttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  18794609 ttggaacagtggcatatcgagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgca 18794558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Original strand, 28282684 - 28283165
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||| |  || || |   | || || ||||||||  | ||||| |||    
T  28282684 ttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgctt 28282783  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || || || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  28282784 gaacagggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgt 28282883  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||  | ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||    
T  28282884 atggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagat 28282983  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |     
T  28282984 gatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttcta 28283083  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 482  Q
    ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  28283084 agagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggcccgtatcagattt 28283165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 24364822 - 24364245
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||| | | | || |||||||||||  | ||||| |||    
T  24364822 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcgttggaagatttgttgagagtgtgtgtgctt 24364723  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||| | ||||| || || |    
T  24364722 gaacaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcatcgttcgaagccttgt 24364623  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||  |||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  24364622 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgagtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggtt 24364523  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  24364522 gataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 24364423  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| || |||||  ||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | |||||| || |    
T  24364422 agggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacag 24364323  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  24364322 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 24364245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 314 - 578
Target Start/End: Original strand, 14131363 - 14131627
Alignment:
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||| |||||    
T  14131363 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggacctggagtttcaggaaggagatcatgtgtttctgagggtcactccta 14131462  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 513  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || | ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  14131463 tgacaggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgacttcgaagtttattggtccgtatcagatatctgagagagttggaacagtggcatatagagt 14131562  T
Q  514 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||| || |  |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  14131563 gggtttgccacaacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcagttacggaagtatg 14131627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18801261 - 18800873
Alignment:
Q  92 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcg 191  Q
    ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || |||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||  | ||||    
T  18801261 tgtgtactagagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgtttatagagttcatttacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcctcgttcg 18801162  T
Q  192 aggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaa 291  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| |||||    
T  18801161 aagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagttaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaa 18801062  T
Q  292 agttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccac 391  Q
    |||  |||||||   ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || || || ||     
T  18801061 agtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggggatcat 18800962  T
Q  392 gtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 480  Q
    || ||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  18800961 gtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaagacgtgaattgaagtcgaagcagttgacttcaaagttcattggtccatatcagat 18800873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 320 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 25750900 - 25750642
Alignment:
Q  320 gcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactg 419  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||| || | |||| |    
T  25750900 gcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcttgtgacgg 25750801  T
Q  420 gtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggttt 519  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |  || | ||||||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  25750800 gtgtaagacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggttt 25750701  T
Q  520 accgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || || |||||||||||||||||  || | || ||||||||||| |||||||||||||    
T  25750700 gccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcatcttcggaagtatg 25750642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 212 - 561
Target Start/End: Original strand, 11287680 - 11288029
Alignment:
Q  212 tgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagaga 311  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || | ||   |||      
T  11287680 tgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagttaataagagaac 11287779  T
Q  312 aaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcc 411  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||  ||    
T  11287780 atatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcacccc 11287879  T
Q  412 tatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcga 511  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||||||||| ||||||||| |     
T  11287880 tatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagg 11287979  T
Q  512 gtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtc 561  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||||||    
T  11287980 gtgggtttaccccctcatctttcaaatttgcatgacgtgttccatgtgtc 11288029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19453830 - 19453513
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||  | |   | ||||||||   |||  | ||||| |||    
T  19453830 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatctaatcattggaggatttacagagagtgtgtgtgctt 19453731  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  19453730 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcgcatacaacaacaattaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 19453631  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  19453630 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagatttggttcatcagactacagagaaagttaagat 19453531  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaa 318  Q
    ||||  |||||| |||||    
T  19453530 gatcagagagaagatgaa 19453513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 305 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 11291918 - 11291818
Alignment:
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11291918 caagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 11291819  T
Q  405 t 405  Q
    |    
T  11291818 t 11291818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 15078365 - 15078687
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| || |  || |||||||| |    
T  15078365 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattggaatggcaccgtttgaggctttgtatgatcggaggtgtaagacaccgttgtgtt 15078464  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||||||||| ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||    
T  15078465 ggtttgagtcaggagaaagtgccttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatccgagaaaagatgaaagcgtctcagag 15078564  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| |||   ||||| ||| | ||||||||||  || || || || ||||||||| | | |||  |||||||||| || |||    
T  15078565 tagacataagagttatcatgataagaagagaaaggatatcgagtttcaggttggtgatcatgtatttttgagactgaatccagtgactggtgttggtcgt 15078664  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  15078665 gctttgaagtgtaggaagttgac 15078687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16098330 - 16098008
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || | || |||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  16098330 ccgttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtatcggtatggctccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 16098231  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||||||||| ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | |||||  | || ||| |||||||||||||||| ||||| |||||  ||||    
T  16098230 ggtttgagtcaggagaaagtgccttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacataaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtcttagag 16098131  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |||||||||||||| |  ||| |||| ||||| || |||    
T  16098130 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaacctgtgaccggtgttggtcgt 16098031  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  16098030 gctttgaagtgtaggaagttgac 16098008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 25743089 - 25743410
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  25743089 ccgttaattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattggaatggctccgtttgaggctttgtatggtcggagctgtaggacaccgttgtgtt 25743188  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtct-taggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcaga 329  Q
    |||||||||||||||||  |||| | | ||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||    
T  25743189 ggtttgagtcaggtgaa--agtgctttgtaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcaga 25743286  T
Q  330 gtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacg 429  Q
    || |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| |  | || | |||| ||||| || ||    
T  25743287 gtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcaagtgtttttgagggagaatcttgtgaccggtgttggtcg 25743386  T
Q  430 tgctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    |||||||||||  | |||||||||    
T  25743387 tgctttgaagtgtaggaagttgac 25743410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 16382374 - 16382696
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  16382374 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 16382473  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  16382474 ggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 16382573  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| || || || |||    
T  16382574 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgt 16382673  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||| ||||  | |||||||||    
T  16382674 gctttaaagtgtaggaagttgac 16382696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 484 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 22433924 - 22433830
Alignment:
Q  484 ggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22433924 ggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22433830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 23996528 - 23996206
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  23996528 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcactgtttgaggccttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 23996429  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  23996428 ggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 23996329  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | || || ||| |||||||||| |  || || ||||||||||| || || | ||||||||| || || || |||    
T  23996328 tagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacgtgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgt 23996229  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  23996228 gctttgaagtgtaggaagttgac 23996206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 5297077 - 5297308
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  5297077 ttcgaaattgaggttgggttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgctt 5297176  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  5297177 gagcaaggtggagct-gggatagtcacctaccgttgatagaattcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 5297275  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 233  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||    
T  5297276 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggt 5297308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 333 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 25751024 - 25750908
Alignment:
Q  333 gacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgc 432  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  25751024 gacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcctgtgacgggtgtaggacgtgc 25750925  T
Q  433 tttgaagtcaaagaagt 449  Q
     ||||| || |||||||    
T  25750924 gttgaaatctaagaagt 25750908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27559859 - 27560086
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||| |  || || |   | || || ||||||||  | ||||| |||    
T  27559859 ttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgctt 27559958  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || || || ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  27559959 gaacagggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgt 27560058  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtg 228  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  27560059 atggtcgaaggtgcaggactccattgtg 27560086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 131 - 440
Target Start/End: Original strand, 21412939 - 21413248
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||| |||||||| ||| || |||||||  || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  21412939 ccgttgattgagtttacttacaataacagttttcattctaatatcggtatggcactgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 21413038  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| || || ||||| |   | |||||||| |   |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  21413039 ggtttgaatccggagaaagcgcattgttaggaccgggagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtctcagag 21413138  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||  |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || ||  |||| ||| |||| | |||| | |||||||| || |||    
T  21413139 tagaccgaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatatgttcttgtgagtgaatcctgtaactggtgttggtcgt 21413238  T
Q  431 gctttgaagt 440  Q
    ||||||||||    
T  21413239 gctttgaagt 21413248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 440
Target Start/End: Original strand, 1648786 - 1649094
Alignment:
Q  132 cgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctg 231  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||    
T  1648786 cgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttg 1648885  T
Q  232 gtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagt 331  Q
    ||||||||| || || |  |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || || || ||||||||||| ||||||    
T  1648886 gtttgagtccggagagaatgctttattaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagt 1648985  T
Q  332 cgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtg 431  Q
     |||| ||||| |||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| || || || ||||    
T  1648986 agacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtg 1649085  T
Q  432 ctttgaagt 440  Q
    |||||||||    
T  1649086 ctttgaagt 1649094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18571922 - 18571684
Alignment:
Q  140 gagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 239  Q
    ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||| | || || |||||||| |||||| |||| || || || | |||||| ||||||||||    
T  18571922 gagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatgactccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacactgttgtgttggtttgagt 18571823  T
Q  240 caggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaa 339  Q
    |||||||||| |   | ||| |||||||  || | ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||    
T  18571822 caggtgaaagtgctttattaagaccagaagttatgcaagaaactacggaaaatgttaagatgattcaggagaaaaggaaagcgtctcagagtagacagaa 18571723  T
Q  340 gagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttca 378  Q
    |||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  18571722 gagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 18571684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 453
Target Start/End: Original strand, 18837912 - 18838231
Alignment:
Q  134 ttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 233  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  18837912 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatccgaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 18838011  T
Q  234 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 333  Q
    ||||||| || || || |   | |||| ||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||      
T  18838012 ttgagtccggagagagtgctatgttagcaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtctcagagtac 18838111  T
Q  334 acaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgct 433  Q
    | | |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||| | || | |||| |||| ||||| || | ||||    
T  18838112 atagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgtgggtgaatcctgtgaccggtgttggtcatgct 18838211  T
Q  434 ttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    |||||||  | |||||||||    
T  18838212 ttgaagtgtaggaagttgac 18838231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25655760 - 25655456
Alignment:
Q  133 gttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctgg 232  Q
    |||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| | ||||  |||||| |||| ||| ||||||||||| || || |   ||||||| |||    
T  25655760 gttgatggagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcgaaatgaaaccttttgaggatttgtatggtcggaggtgtaggatgtcgttgtgttgg 25655661  T
Q  233 tttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtc 332  Q
    |||||||||| |||||| |   | |||||| ||||  |||| ||  | ||||   | |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  25655660 tttgagtcag-tgaaagtgctttgttaggatcagaagttgtgcaagagactaagaaaaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagta 25655562  T
Q  333 gacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgc 432  Q
    |||| |||||||||||| | ||| | ||||| ||  ||||||||||||  || || || |||||||||||||| | ||  || |||||||| || |||||    
T  25655561 gacagaagagttatcataataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatctgataactggtgttggtcgtgc 25655462  T
Q  433 tttgaa 438  Q
    ||||||    
T  25655461 tttgaa 25655456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16233471 - 16233242
Alignment:
Q  149 tacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaa 248  Q
    ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||||||||| || || |    
T  16233471 tacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagaga 16233372  T
Q  249 gagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatca 348  Q
    | |   | |||||||  ||  |||| ||  | ||||| || || ||| |||| || ||||| || ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  16233371 gtgctttgttaggactggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagattattcaagaaaagatgaaggcgtctcaaagtagacagaagagttatca 16233272  T
Q  349 tgacaagcgtagaaaagatcttgagtttca 378  Q
    ||| ||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  16233271 tgataagaggagaaaggatattgagtttca 16233242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 490 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 18787809 - 18787721
Alignment:
Q  490 agttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||  | ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18787809 agttggaacagtggcatatagagtgggtttgccatcacatatttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 18787721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 21569862 - 21569986
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||| ||||  | ||||| |||    
T  21569862 ttcgaagttgaggttgagttcgacttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtatgtgtactt 21569961  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtc 125  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||    
T  21569962 gagcaaggtggagcttgggatagtc 21569986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 1640710 - 1640634
Alignment:
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagta 576  Q
    ||||| ||| |||||| ||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1640710 gtggcatatagagtggatttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagta 1640634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1652353 - 1652274
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggag 210  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  1652353 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggctccgtttgaggctttgtatggtcggag 1652274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 8762804 - 8762854
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtc 51  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  8762804 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtc 8762854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 478; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 9610313 - 9609736
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9610313 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 9610214  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  9610213 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagctttgt 9610114  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610113 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 9610014  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9610013 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 9609914  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9609913 agagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 9609814  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9609813 tggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 9609736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16982329 - 16981752
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16982329 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 16982230  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16982229 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 16982130  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982129 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 16982030  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  16982029 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttg 16981930  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16981929 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 16981830  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16981829 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16981752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16999177 - 16998600
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16999177 ttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 16999078  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16999077 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 16998978  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998977 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 16998878  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16998877 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 16998778  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16998777 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 16998678  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16998677 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16998600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 17063894 - 17063317
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17063894 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 17063795  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17063794 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 17063695  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063694 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 17063595  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  17063594 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttg 17063495  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17063494 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 17063395  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17063394 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 17063317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 24262547 - 24261970
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24262547 ttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 24262448  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262447 gagcaaggaggaacttgggatagtcatctcccgttgatcgagtccacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttat 24262348  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262347 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 24262248  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24262247 gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 24262148  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||||||    
T  24262147 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtctgtatcatatattggaaagagttggaacgg 24262048  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24262047 tggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 24261970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27218193 - 27217616
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | || | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27218193 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggacagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 27218094  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27218093 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttaatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 27217994  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217993 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagatttttcagcaaactactgagaaagttcagat 27217894  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27217893 gatacaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 27217794  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27217793 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 27217694  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27217693 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 27217616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 22325122 - 22325699
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22325122 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 22325221  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22325222 gaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 22325321  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325322 atggtcggagatgcagaactccgtggtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttagggccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 22325421  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22325422 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 22325521  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22325522 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaacaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 22325621  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22325622 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 22325699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 10869027 - 10868450
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10869027 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 10868928  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10868927 gagcaaggaggaacttgggatagtcatctcccgttgatcgagttcacttataacaatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 10868828  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868827 acggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagggtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 10868728  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10868727 gatccaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 10868628  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  10868627 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacag 10868528  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10868527 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 10868450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 44385835 - 44386412
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44385835 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatgatcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 44385934  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44385935 gagcaaggagggacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 44386034  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386035 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 44386134  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44386135 gatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 44386234  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44386235 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaaattcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 44386334  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44386335 tggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 44386412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 24710210 - 24709633
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24710210 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 24710111  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |    
T  24710110 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatgacaccgtttgaggccttgt 24710011  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710010 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 24709911  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24709910 gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 24709811  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  24709810 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtattagatattggaaagagttggaacgg 24709711  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24709710 tggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgtacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 24709633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27371446 - 27370869
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27371446 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 27371347  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27371346 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 27371247  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27371246 atggtcggagatgaagaactatgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 27371147  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27371146 gatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttg 27371047  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27371046 agagtcactcctatgactggtgtaggatgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 27370947  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27370946 tggcttaccgagtggatttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 27370869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 17067552 - 17066978
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17067552 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 17067453  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17067452 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgt 17067353  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067352 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 17067253  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  17067252 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttg 17067153  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17067152 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 17067053  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  17067052 tggctttacgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa-ttgcac-acgtttttcatgtgtcgc-acttcgaaagtatg 17066978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16925377 - 16924860
Alignment:
Q  61 aattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagt 160  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16925377 aattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagt 16925278  T
Q  161 tatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16925277 tatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttag 16925178  T
Q  261 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtag 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16925177 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 16925078  T
Q  361 aaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 460  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925077 aaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 16924978  T
Q  461 ttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgt 560  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16924977 ttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgt 16924878  T
Q  561 cgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||| |||||||    
T  16924877 cgcaacttcgaaagtatg 16924860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 21145307 - 21145873
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||           ||||||||||||    
T  21145307 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagagg-----------atttgtgttctt 21145395  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145396 gagcaaggaggaacttgggatagccatcttccgttgatcgagttcacatacaacaatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 21145495  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21145496 atggtcggagatgcaaaactccgttgtgctggtttgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgtccagcaaactactgagaaagttcagat 21145595  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145596 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 21145695  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||| ||||||||||     
T  21145696 agagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaagaagttgaccccgaagtttattgatctgtatcagatattggaaagagttggaacga 21145795  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145796 tggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21145873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 578
Target Start/End: Original strand, 24878321 - 24878838
Alignment:
Q  61 aattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagt 160  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878321 aattcagtcgctcgaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagt 24878420  T
Q  161 tatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 260  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878421 tatcattatagtattggaatgacacctttcgaggctttatatggtcggaggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 24878520  T
Q  261 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtag 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24878521 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 24878620  T
Q  361 aaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24878621 aaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaag 24878720  T
Q  461 ttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgt 560  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24878721 ttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatctgt 24878820  T
Q  561 cgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||| |||||||    
T  24878821 cgcaacttcgaaagtatg 24878838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 24675662 - 24675089
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  24675662 aagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggatgattcagtcgctagaggatttgctgagagtctgtgttcttgagc 24675563  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24675562 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 24675463  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  24675462 tcggagatgcagaactccattgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgatt 24675363  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24675362 caagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 24675263  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    |||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  24675262 tcacccctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 24675163  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24675162 gtatcgagttggattaccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 24675089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 24707752 - 24708325
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24707752 aagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaagatttattgagggtttgtgttcttgagc 24707851  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24707852 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 24707951  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  24707952 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcagactactgagaaagttaagatgatt 24708051  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24708052 caagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaaatatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 24708151  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||  ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  24708152 tcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcctagattttttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 24708251  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24708252 gtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 24708325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 21325536 - 21326109
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  21325536 aagttgagattgagtccggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtgcttgagc 21325635  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21325636 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttattattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatctgg 21325735  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||     
T  21325736 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcgggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaaccactgagaaagttaagatgatt 21325835  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21325836 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 21325935  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| |||||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  21325936 tcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggc 21326035  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21326036 gtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 21326109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23189183 - 23188608
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||| |||||  |||||||| |||    
T  23189183 tcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagatagatggtcagtcggagaggacagttcagtcgctagaggatttattgagagtttgtgtttttg 23189084  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||    
T  23189083 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaacaatagttatcattctagtttaggaatggcaccttttgaggctttgta 23188984  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   |    
T  23188983 tggtcggagatgcagaactccgt-gtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaggttaaatag 23188885  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23188884 attcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtgtcaggaaggagaccacatgtttttga 23188785  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |    
T  23188784 gagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccaagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgat 23188685  T
Q  502 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188684 ggcgtatcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23188608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 22756735 - 22757306
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  22756735 aagttgagattgagttcggcgtatcatacacagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagggtttgtgtacttgaga 22756834  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22756835 aaggagggacttcggatagtcatcttccgttgatagacttcacgtacaataacagttaccgttctagtattggaatggcaccctttgaggctttatatgg 22756934  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| || ||||     
T  22756935 tcggagatgtagaactccgttgtgttggt--gagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacagattactgagaaagttaaggtgatt 22757032  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22757033 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaagagaccacgtgtttttgagag 22757132  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  22757133 tcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaaatcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 22757232  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22757233 gtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22757306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23064250 - 23063677
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  |||||||   | || |||||||||||  ||||||| |||||||    
T  23064250 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggatgattcagtcttttgaagatttgttgagagtttgtgtacttgagc 23064151  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23064150 aaggaggtacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattcaagtattggaatggcaccttatgaggctttatatgg 23064051  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||| |||||||     
T  23064050 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggtcttaggaccagagattgttgaacaaactaccgagaaggttaagatgatt 23063951  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23063950 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgttttttttagag 23063851  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| | |||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  23063850 tcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtttcagatatctgaaagagttggaacggtggc 23063751  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  23063750 gtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 23063677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 41608651 - 41608933
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41608651 ttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 41608750  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41608751 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttat 41608850  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaact 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41608851 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaact 41608933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 520
Target Start/End: Original strand, 24825552 - 24826067
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  | || |  ||||||| ||| || || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  24825552 aagttgaggttaagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcaatcggaaagaacgattcagtcgctggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagc 24825651  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||||    
T  24825652 aaggtggaacttgggatagtcatctcccgttgatagagttcacgtataataatagttaacattctagtattggtatggcaccttttgaagctctgtatgg 24825751  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||||| || || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24825752 tcggaggtgtaggactccgttgtgttgggttgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgatc 24825851  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || ||||| ||||    
T  24825852 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaggagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttttaggaaggagataatgtatttttaagag 24825951  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||| |  |||| | |||| ||||||||    
T  24825952 tcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggttcgtatcagatatcagaaagaattgggacggtggc 24826051  T
Q  505 ttatcgagtgggttta 520  Q
     |||||||||||||||    
T  24826052 gtatcgagtgggttta 24826067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 30211187 - 30211760
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| |  |||||| |||||||| | | ||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  30211187 aagttgagtttgagttcggtgtatcatccgcagacagatggacagacggagaggacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagc 30211286  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  | || |||||    
T  30211287 aagggggaacttgggatagtcatcttccattggtcgagttcacttacaataacagttaccattctagcattggaatggcaccgttcgaaacgttgtatgg 30211386  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||   ||| || || ||  || ||||| | ||| |||| || ||||||||||| ||| || ||||     
T  30211387 tcggagatgcagaactctgttgtgttggtatgagtccaatgagagtgtagtactaagaccatacattattcaacagactactgagaaggttaagttgatt 30211486  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  30211487 agagaaaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccgtgataagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgttttttagag 30211586  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    |||  | | |||| ||||| ||||| ||  | || ||||||||  |||| |||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||   ||| ||    
T  30211587 tcacccatgtgaccggtgttggacgggcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccgtatcagatttcggaaaaagttggggtggttgc 30211686  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||  |||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  30211687 gtataaagtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatg 30211760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23087611 - 23087050
Alignment:
Q  17 agttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaactt 116  Q
    ||||| || |||||||  || ||||||||||||||  |||| |  ||||||| | ||||||||||| ||||  | ||||| ||| ||||||| ||| |||    
T  23087611 agttcagcttatcatcggcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtactttagcaaggtggagctt 23087512  T
Q  117 gggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcag 216  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  23087511 gggatagtcacctatcgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgactattggtatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggtgcgg 23087412  T
Q  217 aactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatg 316  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||| |||||||  || |||| ||| || ||| |  ||||   |||||| |||    
T  23087411 aactccgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatattgttcgtcagactattgaaaaggttaaattgataagagagaagatg 23087312  T
Q  317 aaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatga 416  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | |||    
T  23087311 aaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtagaaaggtccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttgtga 23087212  T
Q  417 ctggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtggg 516  Q
    | ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |  || | ||||||||| ||||| ||| ||||| |    
T  23087211 caggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaggtttattggtccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcgtatagagtgtg 23087112  T
Q  517 tttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23087111 tttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23087050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 45529684 - 45529121
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||| | | ||||| ||||| ||  ||||||| |||||||    
T  45529684 aagttgagtttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggacagacgtagaggacaattcagtcgttggaggacttgttcagagtttgtgtacttgagc 45529585  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| || || |||||    
T  45529584 aaggaggaacttgggataatcatcttccattgatcgagttcatttataataacagttaccattttagcattggaatggcaccgttcgaagcgttgtatgg 45529485  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||| || |||||| |||| ||| || ||||     
T  45529484 tcggagatgcaaaactccattgtgttggtatgagtccggtgagagtgtggtattgggaccggacattgttcaacagactactaagaaggttaagttgatt 45529385  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||      | |||||| |||||| ||||||    
T  45529384 agagaaaagatgaaagcatcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcctaggaaggatcttgagttt------gaagaccatgtgtttatgagag 45529291  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | |||||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| |||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||    
T  45529290 tcactcttgtgactggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattgacccatatcagatttcggaaagagttgggacggttgc 45529191  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaag 574  Q
     ||| ||||||||||||| | |||||||| ||| || |   |||| || |||||||| ||||||||||||    
T  45529190 gtatagagtgggtttaccactgcatcttttgaacttacgtgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaag 45529121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23276953 - 23276376
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||| |||   | | ||| |||    
T  23276953 ttcgaagttaaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgaaagtgtttgtactt 23276854  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  23276853 gagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 23276754  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||   |||    
T  23276753 atggtcggaggtgcaggacttctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaagtcatgat 23276654  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  23276653 gatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctg 23276554  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||| | | ||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |  |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| | ||| |  |||||||| |    
T  23276553 agatttactcctatgatgggtgtgggacgtgcattgaagtcgagtaagtcgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacag 23276454  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  23276453 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 23276376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23294135 - 23293558
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | |||| |||| ||||  | ||||| |||    
T  23294135 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttggagggtttgctgagagtgtgtgtgctt 23294036  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  23294035 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 23293936  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| |  || ||||| || ||  ||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||  ||||||||  ||||    
T  23293935 atggtcggaggttgaggactcctttatgtcggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactatagagaaagtcaagat 23293836  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  23293835 gatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacggaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctg 23293736  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| |    
T  23293735 agagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacag 23293636  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || |||||||| || |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23293635 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttctaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23293558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 578
Target Start/End: Original strand, 27365346 - 27365922
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   |||||||| | |||||| | ||||| ||||    
T  27365346 tcgaaattgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttg 27365445  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  27365446 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgta 27365545  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || |     
T  27365546 tggacgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagtta 27365645  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    ||   |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  27365646 ataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttga 27365745  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    | |||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||    
T  27365746 gggtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgt 27365845  T
Q  502 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||| ||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  27365846 ggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcagttgcggaagtatg 27365922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 11358140 - 11358717
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||| |   | || |||||||||||| | ||||| ||     
T  11358140 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcta 11358239  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  11358240 gagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 11358339  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | |    
T  11358340 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggtt 11358439  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  11358440 gataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 11358539  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| || |    
T  11358540 agagtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaagttggtacag 11358639  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  11358640 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 11358717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20833162 - 20832585
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||| |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  20833162 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctt 20833063  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| || ||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  20833062 gagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 20832963  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga- 299  Q
    |||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||| |||||     
T  20832962 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtattgggaccggatttggttcatgagactactgagaaag-tcagat 20832864  T
Q  300 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 399  Q
    ||||   ||| || ||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |    
T  20832863 tgataagagaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttct 20832764  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
    ||| |||| |||| |||| ||||| || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | |||||| ||     
T  20832763 gagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtaca 20832664  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  20832663 gtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 20832585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 305 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23138910 - 23138637
Alignment:
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  23138910 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgagag 23138811  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  23138810 tcactcttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggc 23138711  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23138710 atatcgagtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23138637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 305 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 23550700 - 23550427
Alignment:
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  23550700 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgagag 23550601  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  23550600 tcactcttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggc 23550501  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23550500 atatcgagtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23550427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 365 - 578
Target Start/End: Original strand, 27377101 - 27377314
Alignment:
Q  365 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  27377101 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 27377200  T
Q  465 ttggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 564  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27377201 ttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgca 27377300  T
Q  565 acttcggaagtatg 578  Q
    |||||| |||||||    
T  27377301 acttcgaaagtatg 27377314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27787918 - 27787341
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||| |  || || |   | || || ||||||||  | ||||| |||    
T  27787918 ttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgctt 27787819  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || || || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  27787818 gaacagggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcactcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgt 27787719  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||  | ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  || |    
T  27787718 atggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaaggt 27787619  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |     
T  27787618 gatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttcta 27787519  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || | | | |||||||    
T  27787518 agagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacgg 27787419  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  27787418 tggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 27787341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 31830831 - 31830258
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |   | || |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  31830831 aagttgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagc 31830732  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||| |||||  | || ||||| || || || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||    
T  31830731 aaggtggagcttgggacagtcacttgcctttgattgaatttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatgg 31830632  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | ||||||||||||||   | ||||     
T  31830631 tcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgata 31830532  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||| ||||||    
T  31830531 agagaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagag 31830432  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| || |||||    
T  31830431 tcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggc 31830332  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  31830331 atatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 31830258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 12574530 - 12574049
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | || || ||||||||  | ||||| |||    
T  12574530 ttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgctt 12574431  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || || || ||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  12574430 gaacagggtggagcttgggacagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgt 12574331  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| || || || ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||    
T  12574330 atggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggttcgagtcaagagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagat 12574231  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || || || || || ||| |     
T  12574230 gatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttcta 12574131  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 482  Q
    || || |  || ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12574130 agggttaccccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattt 12574049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 438 - 578
Target Start/End: Original strand, 41609047 - 41609187
Alignment:
Q  438 agtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa 537  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41609047 agtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttacagccgcatctttcgaa 41609146  T
Q  538 tttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  41609147 tttgcacaatgttttccacgtgtcgcaactttggaagtatg 41609187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1063928 - 1063351
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||||| |||||| |     || |||||||||||  | ||||| |||    
T  1063928 ttcgaaattgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcatgggaagatttgttgagagtgtgtgtgctt 1063829  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  1063828 gagcaaggtggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcattcaagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 1063729  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||  |||| || || || || ||||||||  | || ||  | ||||||||||||||   | |    
T  1063728 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgtgtgagagtgttgtgttgggaccagatttggtacatgagactactgagaaagtaaggtt 1063629  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  1063628 gataagagaaaagatgagagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 1063529  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | | |||| || |    
T  1063528 agggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaattggtactg 1063429  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| | ||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  1063428 tggcatatagagttgctttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 1063351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 19652318 - 19652557
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  19652318 ttcgaaattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttggaggatttgttgagagtgtgtgtgctt 19652417  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |   |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  19652418 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaaca---gttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 19652514  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcagg 243  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  19652515 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcagg 19652557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 338 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 24654185 - 24653946
Alignment:
Q  338 aagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttga 437  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| || | ||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  24654185 aagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacttgcattga 24654086  T
Q  438 agtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa 537  Q
    |||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |  || |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||    
T  24654085 agtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagtgaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 24653986  T
Q  538 tttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 577  Q
     |||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24653985 cttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtat 24653946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 131 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22276326 - 22276018
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  22276326 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 22276227  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || || || |   | |||||||  ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  22276226 ggtttgagtccggagagagtgccttgttaggactggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 22276127  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |||||||||||||| | |||| |||| ||||| || |||    
T  22276126 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgt 22276027  T
Q  431 gctttgaag 439  Q
    |||||||||    
T  22276026 gctttgaag 22276018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 401
Target Start/End: Original strand, 23817452 - 23817719
Alignment:
Q  134 ttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 233  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  23817452 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggagatgtaggacaccgttgtgttggt 23817551  T
Q  234 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 333  Q
    |||||||| |  |||| |   | |||||||| ||| |||| ||  | ||||| || |||||| |||||||||||||||| || || ||||| |||||| |    
T  23817552 ttgagtcaagataaagtgctttgttaggaccggaggttgtgcaagagactacggaaaaagttaagatgatccaagagaagatcaaagcgtctcagagtag 23817651  T
Q  334 acaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    ||| |||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||    
T  23817652 acagaagagttatcatgataaaaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttga 23817719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 24945136 - 24944967
Alignment:
Q  409 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 508  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||   | |  |||||||| ||||| |||    
T  24945136 tcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcaaagagggttggaacagtggcatat 24945037  T
Q  509 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||||    
T  24945036 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgggtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 24944967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 12640315 - 12640637
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |    
T  12640315 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttatgtt 12640414  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  12640415 ggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 12640514  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | || || ||| ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| || | |||  |||| ||||| || |||    
T  12640515 tagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggagatcatgtgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgt 12640614  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  12640615 gctttgaagtgtaggaagttgac 12640637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 453
Target Start/End: Original strand, 24831586 - 24831905
Alignment:
Q  134 ttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 233  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||  |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  24831586 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgttagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 24831685  T
Q  234 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 333  Q
    ||||||| || || |  |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||| |    
T  24831686 ttgagtccggagagaatgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggtgtctcagagtag 24831785  T
Q  334 acaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgct 433  Q
    ||| |||||||||||||| ||| | |  || ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||||||||||| || || ||||||    
T  24831786 acagaagagttatcatgataagagaacgaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctatgactggagtgggtcgtgct 24831885  T
Q  434 ttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    |||||||  | |||||||||    
T  24831886 ttgaagtgtaggaagttgac 24831905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 405
Target Start/End: Original strand, 22761965 - 22762239
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||  ||||||| |    
T  22761965 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtaggacgtcgttgtgtt 22762064  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| ||||| ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | |||||  | || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22762065 ggtttgaatcaggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacataaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagag 22762164  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 405  Q
    | |  | |||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||  || || || ||||||||||||||    
T  22762165 taggaagaagagttatcatgacaagaggatgaaagatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagt 22762239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24948766 - 24948564
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||  | |   | ||||||||   |||  | ||||| |||    
T  24948766 ttcgatgttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatctaatcattggaggatttacagagagtgtgtgtgctt 24948667  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  24948666 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 24948567  T
Q  201 atg 203  Q
    |||    
T  24948566 atg 24948564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20828436 - 20828227
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||| |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  20828436 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctt 20828337  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| || ||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  20828336 gagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 20828237  T
Q  201 atggtcggag 210  Q
    ||||||||||    
T  20828236 atggtcggag 20828227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 440
Target Start/End: Original strand, 24570064 - 24570373
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || || |||||||| |    
T  24570064 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttatatcgtcagaggtgtaggacaccgttgtgtt 24570163  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||  | |||||||| ||  ||||  |  | ||||| || || ||| ||||||  |||||||| |||||  |||| |||||    
T  24570164 ggtttgagttaggagaaagtgttttgttaggaccggaagttgtgaaagagactacggaaaaggttaagatgaatcaagagaagatgaaaacgtctcagag 24570263  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | || | ||||| |||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || || || |||||||| | || | | |||||||| || |||    
T  24570264 tagatagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaactggtgttggtcgt 24570363  T
Q  431 gctttgaagt 440  Q
    ||||||||||    
T  24570364 gctttgaagt 24570373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 25128693 - 25128474
Alignment:
Q  132 cgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctg 231  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||| ||||| || ||| |||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||    
T  25128693 cgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattcaagtatcggtatgacaccgtttgatgctttgtatggtcggaggtgtaggacgccgttatgttg 25128594  T
Q  232 gtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagt 331  Q
    ||||||||| |||||||| ||  | |||||| | ||| |||| ||  | ||||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||| || || ||||||    
T  25128593 gtttgagtcgggtgaaagtgttttgttaggatcggaggttgtccaagagactacggaaaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagt 25128494  T
Q  332 cgacaaaagagttatcatga 351  Q
     |||| ||||||||||||||    
T  25128493 agacagaagagttatcatga 25128474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 16923066 - 16923016
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtc 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16923066 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtc 16923016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 351
Target Start/End: Original strand, 27368394 - 27368448
Alignment:
Q  297 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 351  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27368394 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 27368448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 24877015 - 24877078
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaatt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  24877015 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaatt 24877078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 20442779 - 20442829
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtc 51  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20442779 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtc 20442829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 16925537 - 16925487
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtc 51  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16925537 ttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccacaaacagatggtcagtc 16925487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 517 - 578
Target Start/End: Original strand, 24833355 - 24833416
Alignment:
Q  517 tttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  24833355 tttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatg 24833416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23890829 - 23890753
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcg 207  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  23890829 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcg 23890753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 24641919 - 24641869
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtc 51  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  24641919 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggttagtc 24641869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 470; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1197 - 620
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1197 ttcgaagttgaggttgaattcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 1098  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1097 gagcaaggaggaacttaggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattaaagtattggaatggcacctttcgaggctttat 998  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  997 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactagtaagaaagttcagat 898  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  897 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcaccataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttg 798  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  797 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcaaatattggaaagagttggaacgg 698  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  697 tggcttaccaagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14934 - 14360
Alignment:
Q  4 gaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgag 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14934 gaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgag 14835  T
Q  104 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14834 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagtcatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatg 14735  T
Q  204 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14734 gtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgat 14635  T
Q  304 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 403  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14634 tcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggataccacgtgtttttgaga 14535  T
Q  404 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 503  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  14534 gtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgg 14435  T
Q  504 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14434 cgtatcgggtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtcttccatgtgtcgaaacttcggaagtatg 14360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 460; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 7516 - 6937
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  7516 ttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctggaggatttgttgaggatttgtgttctc 7417  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7416 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttaatcgagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttat 7317  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7316 atggtcggagatgtagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagat 7217  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgt-tttt 399  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7216 gatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtggaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttt 7117  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  7116 gagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacg 7017  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgca-tctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7016 gtggcttaccgagtgggtttaccgccgcattctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 43731 - 43154
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43731 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttgttgagaatttgtgttctt 43632  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43631 gagcaaggaggagcttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttacaataatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 43532  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43531 atgttcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagat 43432  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43431 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaaagagttaccatgataagtgcagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttg 43332  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  43331 agagtcactcctatgactggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgg 43232  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43231 tggcatactgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 43154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 9051 - 8485
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||           ||||||    
T  9051 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctggaggatttgt-----------gttctt 8963  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8962 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 8863  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8862 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccggagattgttcagcagactactgagaaagttcagat 8763  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  8762 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagttttaggaaggagaccacgtatttttg 8663  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  8662 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaaggg 8563  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8562 tggcttaccgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15512 - 15241
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||           |||||||    
T  15512 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgt-----------gttcttg 15424  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15423 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 15324  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaacta 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15323 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccggagattgttcagcagacta 15241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 543
Target Start/End: Original strand, 50244 - 50785
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||  |||| |  || || |   || ||||| | |||||| | ||||| ||||    
T  50244 tcgaaattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacggatggtcagtcggagagaacgatacaatccttaaaggatctattgagggtgtgtgtacttg 50343  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  50344 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgta 50443  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || |     
T  50444 tggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggggaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagtta 50543  T
Q  302 atccaagagaaa--atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 399  Q
    ||  |||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||    
T  50544 at--aagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctgtcataacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttctt 50641  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||| || ||     
T  50642 gagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggaca 50741  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
    ||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  50742 gtggcttatagggtgggtttgccccctcatctttcgaatttgca 50785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 281 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 13963 - 13832
Alignment:
Q  281 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 380  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||    
T  13963 actactaagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagttttagg 13864  T
Q  381 aaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcct 412  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13863 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcct 13832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 106432 - 106754
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||| |||| || || || |||||||| |    
T  106432 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggctccgtttgaggctttgtatggttggaggtgtaggacaccgttgtgtt 106531  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| ||  | ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || |||  |||||| || ||||| ||||| || || |||||    
T  106532 ggtttgaatccagagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaggatgattcaggagaagatgaaagcatctcagag 106631  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||| ||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| ||||| || | |    
T  106632 tagacataagatttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcct 106731  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||| ||||  | |||||||||    
T  106732 gctttaaagtgtaggaagttgac 106754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 450; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 991 - 414
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  991 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatgatcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 892  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  891 gagcaaggagggacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatgacaccgttcgaggctttgt 792  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  791 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 692  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  691 gatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttg 592  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  591 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaaattcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacag 492  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  491 tggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 7943 - 7377
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||           ||||||    
T  7943 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcaggcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgt-----------gttctt 7855  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7854 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 7755  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7754 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccggagactgttcaacagactactgagaaagttcagat 7655  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7654 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttg 7555  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||    
T  7554 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggagagagttggaacgg 7455  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7454 tggcttagcgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 7377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 65982 - 65405
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  65982 ttcgaaattgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagttagaaaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagagtttgtgttctt 65883  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  65882 gagcaaggaagaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 65783  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  65782 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagat 65683  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  65682 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttg 65583  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||    
T  65582 agagtcactcctgtgactggcgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacgg 65483  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65482 tggcttatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 65405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 359
Target Start/End: Original strand, 39553 - 39906
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  39553 aagttaagattgagttcggcgtatcatccacagacagatg-tcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagc 39651  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39652 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagatttcacatacaataacagttatcattctagtattggaatggtaccttttgaggctttatatgg 39751  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||     
T  39752 tcggagatgcagaactccgtcgtgttggtttgaatcaggtgaaaaagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgatt 39851  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgta 359  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39852 caagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgta 39906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 578
Target Start/End: Original strand, 39926 - 40095
Alignment:
Q  409 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 508  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||||||||| |||    
T  39926 tcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaatttgactccgagatttattggtccgtatcggatatgggaaagagttggaacggtggcgtat 40025  T
Q  509 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  40026 tgagttggattaccaccgcatctttcgaacttgcatgatgtctttcatgtgtcacaacttcggaagtatg 40095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 394; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 33302 - 33879
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33302 ttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagccggaaacgaaaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgttctt 33401  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  33402 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaagctttgt 33501  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  33502 atggttggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagat 33601  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33602 gattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttattg 33701  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    | ||||| || | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | | ||| ||||||||| |    
T  33702 aaagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacag 33801  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33802 tggcgtatcgagtgggattactaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 33879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 9173 - 8596
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9173 ttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggaaacgaaaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgttctt 9074  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  9073 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaagctttgt 8974  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  8973 atggtcggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagat 8874  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  8873 gattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttattg 8774  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    | ||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| |||||||| | | ||| ||||||||| |    
T  8773 aaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacag 8674  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8673 tggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagttttccatgtgtcgcaactttggaagtatg 8596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 578
Target Start/End: Original strand, 278566 - 279136
Alignment:
Q  8 ttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  278566 ttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaag 278665  T
Q  108 gaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  278666 gaggaacttgggatagtcatcttccattgattgagttcgcatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcg 278765  T
Q  208 gagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  278766 gagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcctaggacaagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaa 278865  T
Q  308 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 407  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  278866 gaaaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtca 278965  T
Q  408 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctta 507  Q
     |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  278966 ctcctgtgactggtgtgggacaagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttataggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgta 279065  T
Q  508 tcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  279066 tcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 279136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 256 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 308981 - 308659
Alignment:
Q  256 cttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaag 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  308981 cttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 308882  T
Q  356 cgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  308881 cgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttaaccc 308782  T
Q  456 cgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttcca 555  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  308781 caaagtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttcca 308682  T
Q  556 tgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  308681 tgtgtcgtaacttcgaaagtatg 308659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 101 - 578
Target Start/End: Original strand, 164538 - 165015
Alignment:
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |    
T  164538 gagcaaagatgaacttgggatattcatcttccgttgatagaattcacgtacaataacagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggctctgt 164637  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  | || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  164638 atggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtatttttgggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaagat 164737  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  164738 gattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagatcacgtatttttg 164837  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||||| |  |||| | |||||||||    
T  164838 agagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacgg 164937  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  164938 tggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgtgtttcatatgtcgcaacttcggaagtatg 165015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 260885 - 260308
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  | ||||  ||  | |   | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  260885 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggaaaggacgatctaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgctt 260786  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||| ||| ||||||| ||||| || ||  |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |    
T  260785 gaacaaggtggagcttgggacagtcacctaccactgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgt 260686  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || || |||||||| ||  ||||    
T  260685 atggtcggaggtgcaggactctgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagat 260586  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||||||    
T  260585 gataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttg 260486  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |   || ||||||    
T  260485 agagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttaaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattagaacgg 260386  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| ||||  |||| || ||  |||||||||| |||||  |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  260385 tggcatatagagtttgtttgccaccatatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 260308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 4134 - 4711
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  | | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4134 ttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggaaacgaaaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgttctt 4233  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  4234 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaagctttgt 4333  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  4334 atggtcggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagat 4433  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4434 gattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttattg 4533  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    | ||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| |||||||| | | ||| ||||||||| |    
T  4534 aaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacag 4633  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4634 tggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagttttccatgtgtcgcaactttggaagtatg 4711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 7974 - 7519
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7974 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagagaacaattcaatcgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 7875  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  7874 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggtttttt 7775  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7774 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcagcaaactactgagaaagttaagat 7675  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7674 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaatgagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttg 7575  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgacccc 456  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7574 agagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgacccc 7519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 8367 - 7854
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8367 ttcgatgttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttctt 8268  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8267 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 8168  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  8167 atggtcggtgatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaggttaagat 8068  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8067 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 7968  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| | |  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  7967 agagtcacttcggtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 7868  T
Q  501 tggcttatcgagtg 514  Q
    |||| |||||||||    
T  7867 tggcgtatcgagtg 7854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6945 - 6372
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6945 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagc 6846  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  6845 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatgg 6746  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||     
T  6745 tcggagatgcagaactctgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactacagagaaggttaagatgatt 6646  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6645 caagagtagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataaacgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagag 6546  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| ||||||| |||||| | |||||     
T  6545 tcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatattggaaagagttgggatggtggt 6446  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||    
T  6445 atatcgagtgggattaacaccgcatctttcgaatttgcacgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 6372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3368 - 3153
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||| ||||  | ||||| |||    
T  3368 ttcgaagttgaggttgagttcgtcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtactt 3269  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  3268 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaagaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 3169  T
Q  201 atggtcggagatgcag 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  3168 atggtcggaggtgcag 3153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 63764 - 64337
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  63764 aagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagc 63863  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  63864 aaagaggaacttgggataatcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacaattaacattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 63963  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||     
T  63964 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagttaggagaaagagtggtcttaggaccagatattgttcagcagactactgagaaaattaagatgatt 64063  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  64064 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagag 64163  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  64164 tcactcctgtggctggagttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactgtgagattcattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggc 64263  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  64264 gtatcgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 64337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6596 - 6023
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  6596 aagttgaggttgagttcagcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcactagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagc 6497  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6496 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttacgaggctttgtatgg 6397  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||     
T  6396 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtctggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgatt 6297  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6296 caagagaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagag 6197  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    |||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || |||||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  6196 tcacacctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccaagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggc 6097  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  6096 gtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcttgtgtcgcaacttcggaagtatg 6023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 1253 - 1830
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||| |  || || |   | ||||||||  ||||  | ||||| |||    
T  1253 ttcgaagttgtggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatacaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtactt 1352  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  1353 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggaatggcaccgttcgaagctttgt 1452  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||  ||||||||  ||||    
T  1453 atggtcggaggtgcaagactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcatcagactagagagaaagtcaagat 1552  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||  | ||| || || |||  |    
T  1553 gataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtaggaaggcccttgagtttcaggtggaagatcatgtatttcgg 1652  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |  ||||  |||||||| |    
T  1653 agagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattagtccgtatcagatatcagaaagggttggaacag 1752  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1753 tggcatatagagttggtttcccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 1830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 23080 - 22819
Alignment:
Q  192 aggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaa 291  Q
    ||||||| |||||| |||| ||  | || |||||||| |||||||||||||||||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || ||    
T  23080 aggctttgtatggtaggaggtgttggacaccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaa 22981  T
Q  292 agttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccac 391  Q
     ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||     
T  22980 ggttaagatgattcaggagaagatgaaggagtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcat 22881  T
Q  392 gtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    |||||||||||||| | || | |||| ||||| ||  ||||||||||||  | |||||||||    
T  22880 gtgtttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggttgtgctttgaagtgtaggaagttgac 22819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 556 - 1128
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  556 aagttgagattgagttcggcgtatcatcagcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagttgctagaggatttgttgagtgtttgtgtacttgagc 655  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  656 aaggaggaacttgggatagtcatcttccatggatagagttcacgtacaataacaattatcattccagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 755  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||     
T  756 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtcatcttaggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaagttaagatgatt 855  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  856 caagagaagatggaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgaaaagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgt-tttttgagag 954  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |  ||||||| ||||| |||||     
T  955 tcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatataagaaaaagatggaaaggtgga 1054  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1055 atatcgagttggattaccacagcaactttcgaaattgcatgatgtattacatgtgtcgcaacttcggaagtatg 1128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1249 - 676
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||  | ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  1249 aagttgagattgagtttggcgtatcatcctcagacatatggtcagtccgaaaggacgattcagtcgctagaggacttgttgagggtttgcgtacttgagc 1150  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  1149 aagaaggaacttgggatagtcatcttctattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatgt 1050  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  1049 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgatagtgtggttttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgatt 950  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  949 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcatagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagag 850  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | |||||  ||||||| ||||||    
T  849 tcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagggttggaatggtggc 750  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  749 gtatcgtgttggcttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6587 - 6014
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| ||||  ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |    
T  6587 aagttgagattgtgttcggcgtatcatccgtagacagatggttagtcggagaggacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttatgttcttgatc 6488  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6487 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgattgagttcacatacaataacatttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatgg 6388  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6387 tcggagatgcagaactctgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtgcagcaaactactgagaaagttaagatgatt 6288  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  6287 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcataataagcgcaggcaggatcttgagtttcaagagggagaccacgtgtttttaagag 6188  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||    
T  6187 tcactcctgtgactggtgtttgacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatattagaaagagttggaatggtggc 6088  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6087 gtatcgagttggattaccaccgcagctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 6014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 22444 - 21932
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||    
T  22444 ttcgaagttgaaattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagtggacaattcagtcgctagaggatttgttgcgagtttgtgtcctt 22345  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  22344 gagcaaggaggaacttgggataatcatcttccgttgatcgagttcacatacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgt 22245  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||    
T  22244 atggtcggagatgcagatctccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactattgagaaagttaaaat 22145  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22144 gattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttg 22045  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||    
T  22044 agagtcactcctgcgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgg 21945  T
Q  501 tggcttatcgagt 513  Q
    |||| ||||||||    
T  21944 tggcgtatcgagt 21932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14612 - 14039
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||| ||||||  ||||||  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  14612 aagttgaggttgagttcggcgtatcagccgcaaacagatgctcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagt 14513  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  14512 aaggaggaacttgggaaagtcatcttccattgatatagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatgg 14413  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||     
T  14412 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccatagattgttcagcaaactaccaagaaggttaagatgatt 14313  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  14312 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggagagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgatag 14213  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||  ||| |||| | ||||| |||||||||||||||    
T  14212 tcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagtagttgactccgagatttattggtctgtatgagatatcggaaagagttggaacggtggc 14113  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  14112 gtatcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgaactatgtgtttcatgtgtcgcaacttccgaagtatg 14039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18018 - 17660
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18018 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttgttgagagtttgtgttctt 17919  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17918 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccactgatcgagttcacataaaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 17819  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  17818 atggtcagagatgtagaacttcgttgtgttgg-ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactaagaaagttaagat 17720  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtag 360  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  17719 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagtgttataatgataagcgtag 17660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 31987 - 31410
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||| | |||||||| || |||||||  || |||||| |||||||  ||||||  || || |   ||||||||||| ||||  | ||||| |||    
T  31987 ttcgaagttggggttgagttcagcttatcatccgcaaacagattgtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtactt 31888  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| |    
T  31887 gagcaaagtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattgatatggcaccgttcgaagctttgt 31788  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || || || ||| | ||  | ||||| ||||||||  |||||||  ||||    
T  31787 atggtcggaggtgcatgactcctttatgctggtttgagttaggagaaagcgttgtgttgggatcggatttggttcatcaaactacatagaaagtcaagat 31688  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||| | || |||||| ||    
T  31687 gatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggatatcatgtgtttctg 31588  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |   ||||||| |    
T  31587 agagttacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgataggtttggaacag 31488  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  31487 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttttttgtgtcgcaacttcggaagtatg 31410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 9 - 578
Target Start/End: Original strand, 431 - 999
Alignment:
Q  9 tgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaagg 108  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  431 tgaggttgagttcggtgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggatgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagcaaga 530  T
Q  109 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 208  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||    
T  531 aggaacttgagataatcatctcccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatgacaccttatgaggctttgtatggtcgg 630  T
Q  209 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 308  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  631 agatgcaaaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaagttaagatgattcaag 730  T
Q  309 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 408  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||      
T  731 agaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttaagtttcaagaaggagaccacgtg-ttttgagagtccc 829  T
Q  409 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 508  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||    
T  830 tcgtgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcgtat 929  T
Q  509 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||  |||||||||||||||||    
T  930 cgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcaggatgtgtttcatgtggagcaacttcggaagtatg 999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 120 - 477
Target Start/End: Original strand, 628 - 985
Alignment:
Q  120 atagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  628 atagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcgttctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaac 727  T
Q  220 tccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaag 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  728 tccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaa 827  T
Q  320 gcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactg 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  828 gcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttaaggaaggagaccacgtattttttagagtcactcctatgactg 927  T
Q  420 gtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatca 477  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  928 gtgtaggacgtgcactgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 5 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 5794 - 5229
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| || ||||  ||||||  ||||||| |||||| || ||||||||  |||| || |||||||    
T  5794 aagttgaggttgagttcggcgtatcatctgtagacagattgttagtcggagaggacgattcagtcgctagaagacttgttgagagtttgcgtacttgagc 5695  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||    
T  5694 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattccagtatcggaatggcaccttatgaggctttgtatgg 5595  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  5594 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgattcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgaaaaggttaagatgatt 5495  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||    
T  5494 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatggtaaacgcaggaaagatcttgagtttaaagaaggagaccacatatttttgagag 5395  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||  || |||||||  |||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  5394 tcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaggaagtcgactccgagatttattggtctgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggc 5295  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcg 570  Q
     ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  5294 gtatcgagtgggattaccactgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcg 5229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 9916 - 9343
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||| ||||||  ||||||  ||||||| |||||| || ||||||||   |||||| |||||||    
T  9916 aagttgaggttgagttcagcgtatcatccgcaaacagatgatcagtcggagaggacgattcagtcgctagaagacttgttgagagcttgtgtacttgagc 9817  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| || |||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  9816 aaggaggaactagggttaatcatctaccattgataaagttcacgtacaatgatagttatcattctagtattggaagggcaccttacgaggctttgtatgg 9717  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| | ||| |||||||     
T  9716 tcggagatgcagaactctgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggttttaggaccagagattgtttaacaaactaccgagtaggttaagatgatt 9617  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  9616 caagagaagatgaaggcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtattgttgagag 9517  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || |  || |||||||  |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  9516 tcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaaggtgactcctagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 9417  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  9416 gtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcactatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 9343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 229616 - 229043
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||  | || |  ||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  229616 aagttaaggttgagttcggcgtatcattcgcagacaaatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagc 229517  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||    
T  229516 aaggaggaacttgggatattcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggttttgtatgg 229417  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||     
T  229416 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggttttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgatt 229317  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  229316 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataaacgtagaaaagaccttgaatttcaagaaggagatcatgtatttttgagag 229217  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  229216 tcactcctattactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttgttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 229117  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || ||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||| || | || |||||||||||||||||||||||||    
T  229116 gtaccgaatagggttaccaccgcatctttcgaatatgcacgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 229043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 219150 - 219723
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||| |  ||||| | | ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  219150 aagttgaggttgagttcggggtatcatccgcagacagatggtcagtcgaagagaacgattcattcgttagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagc 219249  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  ||||    
T  219250 aaggaggaacttgggataatcatcttccgtttatagaattcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggttttgaatgg 219349  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
      | || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||     
T  219350 aagaaggtgcagaactccgttgtgttggttcaagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaagatgatt 219449  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  219450 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaagaagatcacgtatttttgagag 219549  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |  |||| | |||||||||||||    
T  219550 tcactcctgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggc 219649  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  219650 gtatcaagtgggattaacaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatg 219723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 32856 - 33176
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||| | ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |    
T  32856 ccgttggttgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccatttaaggctttgtatggtaggaggtgtagaacaccgttgtgtt 32955  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtct--taggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcag 328  Q
    |||||||||| ||    |||||| | |  |||| |||||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || || || ||||||||||| |||    
T  32956 ggtttgagtccgg----agagtgctttgttaggcccagaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcag 33051  T
Q  329 agtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggac 428  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || |  ||| |||| ||||| || |    
T  33052 agtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaaacctgtgaccggtgttggtc 33151  T
Q  429 gtgctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||||  |||||||||||    
T  33152 gtgctttgaagtgtaagaagttgac 33176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 180772 - 180217
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||  |||| || |||||||    
T  180772 aagttgagattgagttcggcgtatcatcagcagacagatggtcagtc------------------gctagaggatttgttgagagtttgggtacttgagc 180691  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  180690 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttatatgg 180591  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||     
T  180590 tcggagatgcagaactccattgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagatattgttcagcagactattgagaaagttaagatgatt 180491  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||    
T  180490 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtgtttttgagag 180391  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | | |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| |||||||| |  |||| |||| |||| |||||    
T  180390 ttactccggtgactggtgttggacctgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagatatcagaaagagttagaacagtggc 180291  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  180290 gtatcgagttggcttaccaccgcatctttcgaattttcatgatgtctttcaagtgtcgcaacttcggaagtatg 180217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 101281 - 101464
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||  || || |   ||||||||||||||||  | ||||| |||    
T  101281 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagatagatggtcagtcagagaggatgatccaatcattagaggatttgttgagagtgtgtgtactt 101380  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggca 184  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  101381 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggca 101464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 77 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1640 - 1139
Alignment:
Q  77 gatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattg 176  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1640 gatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattg 1541  T
Q  177 gaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttca 276  Q
     |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1540 aaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcgggtgaaagagtggtcttaggactagagattgttca 1441  T
Q  277 gcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagttt 376  Q
     |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  1440 acaaactaccgagaaggttaagatgattcaagataagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttaccatgataagtgtaggaaagatcttgagttt 1341  T
Q  377 caggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatc 476  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| ||||    
T  1340 caagaaggagaccacgtattttttagagtcactcctgtgactggtgttcgacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgttccgtatc 1241  T
Q  477 agattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagta 576  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||||    
T  1240 agatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtggatttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttttatgtgttgcaacttcggaagta 1141  T
Q  577 tg 578  Q
    ||    
T  1140 tg 1139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 32485 - 33058
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |  || |||| | |||| || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  32485 aagttgaggttgagtttggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacgatccagtcgttagaagacttgttgagagtttgtgtacttgagc 32584  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||     
T  32585 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcatcttttgaggctttgtatga 32684  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||     
T  32685 tcggagatgaagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgggagtgtggttttagggccagaaattgttcaacaaactactaagaaggttaagatgatt 32784  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| || ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  32785 caagaaaagatgaaagcatcgtagggtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttttaagaaggagatcacgtatttttgagag 32884  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  32885 tcactcttgtgactggtgttggacttgcattgaagttaaagaagttgacttcgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 32984  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  32985 gtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 33058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 126932 - 127505
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||  | || |  ||||||| | || |||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  126932 aagttgaggttgagttcaacgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttataggacttgttgagagtttgtgtacttgagc 127031  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  127032 aaggagggacttgggatagtcatcgtccattgatagagttcgcgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatgg 127131  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||     
T  127132 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttaagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgatt 127231  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  127232 caagagaagatgaaagcgttccagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtgtttttgagag 127331  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||||||| |  |||| |||||||| ||||||    
T  127332 tcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgatccgtatcagatatcagaaagagttggaatggtggc 127431  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  127432 gtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttacatgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatg 127505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Original strand, 80227 - 80319
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgtt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  80227 aagttgagattgagttcggcgtatcatccgcggacagatggtcattcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtt 80319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 14812 - 15385
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||  |||| |  ||||||| ||  | ||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  14812 aagttgaggttgagttcggcgtatcacccgcggacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgccgggggacttgttgagagtttgtgtacttgagc 14911  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||    
T  14912 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaagctctgtatgg 15011  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| || |||||    
T  15012 tcggaggtgcagaacttcgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcaacaaactactgagaaggttaagttgatc 15111  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||    
T  15112 caagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggagatcatgtatctttgagag 15211  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  | ||| |||||||  |||||||| |  |||| | |||||||||||||    
T  15212 tcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctaaggttaattggtctgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggc 15311  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15312 gtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 5 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 50066 - 49506
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| |  ||| |||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  50066 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgtaagaagatttgttaagagtttgtgtacttgagc 49967  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  49966 aaggaggaactttcgatagttatcctccattgatagtgttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatgg 49867  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  49866 tcagagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggttaaagggttgttttaggactcgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgatt 49767  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || | ||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||    
T  49766 caagaaaagaggaaagcgtcgcagagttggcaaaagatttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacatattttttagag 49667  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  49666 tcactcctgtgattgttgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 49567  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaa 565  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  49566 gtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaa 49506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 19175 - 19129
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtc 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19175 aagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtc 19129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 112594 - 112021
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  | ||||  ||||||| | | ||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  112594 aagttgaagttgagttcggcgtatcatccgtagacagatggtcagtcgaaaaggacgattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagc 112495  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||| | |||||    
T  112494 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacatgcaataacagttatcattctagtattgaaatgacaccatttgaagctctgtatgg 112395  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||| || |||||    
T  112394 tcggaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagtcaggagagagtgtagttttgggaccagatatcgttcaacaaactattgagaaggttaagttgatc 112295  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  112294 caagaaaagatgatagcatcacagagtcgacaaaagagatatcatgataagcgtaagaaggaccttgagtttcaggaaggagaccatgtatttttgagag 112195  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||| |  |||| | |||||||||||||    
T  112194 tcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactcccaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggc 112095  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  112094 gtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 112021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 203201 - 203774
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  |||| |    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  203201 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattctgccattagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagc 203300  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||    
T  203301 aaggtgggacttgggatagtcatctaccgctgatagagttcacgtacaacaaaagttaccattctagtataggaatggcaccattcaaagctttgtatgg 203400  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| || || || || |||||  | |||||||| || |||||  | || ||| || | ||     
T  203401 tcggaggtgcagaactctgttatgttggtttgagtcgggtgagagtgtagtgttgggaccgaatattgttcaccagactacataaaaggttaagctaata 203500  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | ||||    
T  203501 agagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagatttatcacgataagcgcaggaaagaccttgaatttcaagaaggagaccatgtgtttctaagag 203600  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | |||| ||||  || |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |   ||| ||||||||| |||||    
T  203601 tcactcttgtgacaggtgctggccgtgctttgaagccaaagaagttgacgccgaggtttattggtccgtatcagatatctaaaagagttggaacagtggc 203700  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| |||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  203701 atatagagtgggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 203774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 323281 - 322704
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||  ||||  | ||||| |||    
T  323281 ttcgaagttgaggctgagtttggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtgctt 323182  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  323181 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattccagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 323082  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || || || || ||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  323081 atgatcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgaatcaggagagagtgttgtgttgggtccggatttggttcatcagactacggagaaagtcaagat 322982  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  322981 gatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctg 322882  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |  || |  ||||||||      
T  322881 agagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccatatcagatatcagagagggttggaacaa 322782  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  322781 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 322704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 118141 - 117568
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||| |  ||||| |   ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  118141 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 118042  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  118041 aaggtggagcttggtatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 117942  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| || |  ||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||    
T  117941 tcggaggtgtaagactcctttatgttggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcatactacggagaaagtcaagatgatc 117842  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| |    
T  117841 agagagaagatgaaagcgtcacaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgaggg 117742  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | | |||||||||  |||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||| |  |||||||| |||||    
T  117741 ttactcctatgacgagtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggc 117642  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  117641 atatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 117568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 386392 - 385819
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||  |  ||||||| | ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  386392 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagataacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 386293  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||  ||| | ||||| |||||    
T  386292 aaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcactgttctaagctttgtatgg 386193  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | |||||  | ||||| ||||| ||| |||||||     
T  386192 tcggaggtgcaggactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcattagactacggagaaggttaagatgata 386093  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||    ||||||||||| || ||||| ||  | ||| ||||||    
T  386092 agagaaaagatgaaagcgtcgcagagtccacagaagagttaccatgacaagcgaagaaagacccttgagtttcaagagggagatcatctatttctgagag 385993  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||  |||| |||||||  ||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  || | ||||||||| |||||    
T  385992 tcactcctacgacgggtgtaggttgtgcgttgaagtataagaagttgactccgaagtttataggttcataccagatatctgagagagttggaacagtggc 385893  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  385892 atacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 385819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 105 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 475 - 2
Alignment:
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  475 aaggtggaacttgtgatagccatcttccgttgatagagttcacatacaataacaattataattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 376  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||      
T  375 ttggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggactagatattgttcagcagactattgagaaagttaagatgagt 276  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||  | || |||||||||||||    
T  275 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgtagaaaggatcttgagtttcaagagggttatcatgtgtttttgagag 176  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||  |||||    
T  175 tcaatccggtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaaaaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatagtggc 76  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  75 atatcgagttggtttaccaccgcatctttcaaattttcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 25452 - 26025
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  | || | |||||||| | | ||||| ||||||||  ||||||| ||| |||    
T  25452 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccggagacagatggtcagtctgaaagaacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtactttagc 25551  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  25552 aaggtggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccattcgaagctttgtatgg 25651  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    || ||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| || | |||    
T  25652 tcagaagtgtagaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcagcaaactactgagaaggttaagttaatc 25751  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||    
T  25752 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaggactttgagtttcaggaaggaaaccatgtattttttagag 25851  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||  | || | || ||| |||||||| |||||||| |  |||| | ||||||| |||||    
T  25852 tcactcctatgactggggttggacgtgcattgaagtcaaggaaactaactcggatgtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaaccgtggc 25951  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  25952 gtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatg 26025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 26266 - 26839
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | |  |  ||||||||  | || || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  26266 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaaaacgattcagttattggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagc 26365  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  26366 aaggaggaacttgggatagtcatgttctgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggctttgtatgg 26465  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
      | || ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||     
T  26466 aagaaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagttaggtgagagtgtggttttaggacaataaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgatt 26565  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26566 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaggaaggagatcacgtatttttgagag 26665  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | | |||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||| |  ||||   ||| |||||||||    
T  26666 ttactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtgaaagaagttgactccgaggtttattggcccgtatcagatatcagaaaggattgaaacggtggc 26765  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26766 gtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttccatgatgtgtttgatgtgtcgcaacttcggaagtatg 26839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 100 - 578
Target Start/End: Original strand, 195531 - 196008
Alignment:
Q  100 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 199  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  195531 tgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccatccgagtattggtatggcaccgttcgaagcttta 195630  T
Q  200 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 299  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||    
T  195631 tatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatcagactacagagaaagtcaaga 195730  T
Q  300 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 399  Q
    |||||  |||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| |    
T  195731 tgatcatagagaagatgaaagcgtcgtagagacgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgt-tttct 195829  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
    ||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || || ||||||||     
T  195830 gagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagaaggttggaaca 195929  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  195930 gtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 196008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 92 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 149056 - 148570
Alignment:
Q  92 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcg 191  Q
    ||||| ||||| ||||| |||  |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  149056 tgtgtgcttgaacaaggtggaggttgggatagtcacctaccattgatagagttcacatacaacagcagttaccattcgagtattggtatggctccgttcg 148957  T
Q  192 aggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaa 291  Q
    |  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||  |||||    
T  148956 aacctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactatagagaa 148857  T
Q  292 agttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccac 391  Q
    |||   ||||||    || || ||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| |  ||| ||||  | || || || ||     
T  148856 agtcaggatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacggaagagttaccatgacaaccgtagaaaggcccttaagttctaagagggtgatcat 148757  T
Q  392 gtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaag 491  Q
    || ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |    
T  148756 gtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatgagagaggg 148657  T
Q  492 ttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||| ||||| ||  |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  148656 ttggaacagtggcatacagagtaggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 148570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 409 - 578
Target Start/End: Original strand, 68577 - 68746
Alignment:
Q  409 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 508  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||     
T  68577 tcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatac 68676  T
Q  509 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  68677 agagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 68746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 121809 - 122131
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || | || |||||||||||| ||| |||| || || |||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |    
T  121809 ccgttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtatcggattggctccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtagaacaccgttgtgtt 121908  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| || || ||||| ||  | |||||| | ||  |||| ||  ||| ||| || || ||| | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  121909 ggtttgaatccggggaaagtgttttgttaggaacggaagttgtgcaagaaattacggaaaaggttaacatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 122008  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || || |||||||| || | |||| |||| ||||| || |||    
T  122009 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgt 122108  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  122109 gctttgaagtgtaggaagttgac 122131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 180371 - 180151
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |||| || || || || ||||| |    
T  180371 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacaccattgtgtt 180272  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || ||||| ||  | ||||||||  |  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| |||||| |||| |||||    
T  180271 ggtttgagtccggagaaagtgttttgttaggaccgcaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaagtcgtctcagag 180172  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatga 351  Q
    | |||| ||||||||||||||    
T  180171 tagacagaagagttatcatga 180151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1572 - 1005
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |  ||| ||| | |||| |||||||| ||  ||||||| ||||||     
T  1572 aagttgaggtttagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaacgatttagtcgttagaagatttgttaagagtttgtgtacttgaga 1473  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1472 aaggaggaatttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtactataacatttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatgg 1373  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||     || |||||||||||||| ||| ||| |||     
T  1372 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagaatgtggttttaggaccagaga-----caacaaactactgagaaggttaagacgat- 1279  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
     |||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||| || || || |||||||    
T  1278 taagaaaaagtgaaatcgtcgcagagtcggcaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagttcaaagaaggagatcatgtattcttgagag 1179  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    |||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  1178 tcacccctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcggatatcggaaagagttggaacgttggc 1079  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||| |||||||    
T  1078 gtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtctttcatgtaacgcaacttcgaaagtatg 1005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15450 - 14877
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||  |||| |  ||||||| | |  |||| ||||||||   |||||| |||||||    
T  15450 aagttgaggttgagttcgacatatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttgaaggacttgttgagaggttgtgtacttgagc 15351  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  15350 aaggaggaacttgggataatcatcttccattgatagagttcacgtacaataacagttatcattccagtattggaatggcaccatttgaggctttgtatgg 15251  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    | |||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||     
T  15250 taggaagtgcagaactccattgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgatt 15151  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||| ||    
T  15150 caagaaaagatgaaagcgtctcagagtcgacatatgagttatcatgataagcttaggaaagaccttgagtttcatgaaggagatcatgtatttttgatag 15051  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || |  |||| | |||||||||||||    
T  15050 tcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaataagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaatatcagaaagaattggaacggtggc 14951  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14950 gtaccgagtgggcttaccaccgcatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 14877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Original strand, 113220 - 113353
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |  |||| ||  ||||| |||||||||||  |||| || |||||||    
T  113220 aagttgaggttgagttcggcgtgtcatccgcagacagatggtcagtcagagagaacgattcggtctctagaagatttgttgagagtttgcgtacttgagc 113319  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  113320 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgat 113353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1481 - 908
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||  | || | |||||||| | | ||||||||||||||  ||||||| |||||      
T  1481 aagttgaagttgagttcggtgtatcatccgcagacagatggttagtcgaaaagaacaattcagtcgttggaggatttgttgagagtttgtgtacttgaat 1382  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1381 aaggtggaacttgagatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattttagtattggaatggcaccattcgaagctttgtatgg 1282  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    | |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||||||||||||||||||  || ||  ||||    
T  1281 ttggaggtgcagaactctgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcagcaaactactgagaagattaagtggatc 1182  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || || || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  1181 caagaaaagattaaagcgtcgcagatttgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggagaccatgtattttttagag 1082  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| | ||||||| |||||    
T  1081 tcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaaatgaaagaaattgaatccgaggtttattggtccatatcagatatcagaaagaattggaacagtggc 982  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  981 atatcgattgggtttaccaccgcatctttcgaatatgcatgatgtgtttcacgtgtcgcaactttggaagtatg 908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 4604 - 4032
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||  ||||||| | |  |||| || |||||  ||||| | |||||||    
T  4604 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcggtcggagaggacgattcagtcgttgaaggacttcttgagagtttgtttacttgagc 4505  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  4504 aaggagaaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaataacaattatcattctagtattggaatggcaccgtttgaggctttgtatgg 4405  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
      | || ||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| || || || ||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4404 aagaag-tgcagaacttcgttgtgttggttcgaatcaggtgagagtgtagttttaggaccagaaatcgttcaataaactactgagaaggttaagatgatc 4306  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| || || ||||||||||    
T  4305 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttactatgataagcgtaggaaagaccttgagttttaagaaggagatcatgtatttttgagag 4206  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |  ||||   |||||||||||||    
T  4205 tcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccatatcagatatcagaaaggattggaacggtggc 4106  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||  || | || |||||||||||||||||||||||||    
T  4105 gtatcaagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgatttgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 4032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 3713 - 3140
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  | || |  ||| ||| | |  | || ||||||||  ||| ||| |||||||    
T  3713 aagttgaggttgagttcggcgtatcatctgcagacaaatggtcagtcggaaagaacgatttagtcgttgaaagacttgttgagagtttctgtacttgagc 3614  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3613 aaggagaaacttgggatagtcatcttccgttaatagagttcatgtacaataacagttaccattctagtattggaatggcaccattcgaggctttgtatgg 3514  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
     ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| || ||    || || ||||| || || || |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3513 ccggagatgcagaactccattgtgttagtttgagtcaagtgagagtgtaaatttggggccagaaatcgtgcaacaaactactgagaaggttaagatgatc 3414  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  3413 caagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttaagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagag 3314  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| | |||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  3313 tcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggttcgtatcagatatttgaaagaattggaacggtggc 3214  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3213 gtatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 3140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13064 - 12738
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||| |||  |||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  13064 ttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaatttagtcactagaggatttgctgagagtgtgtgttctt 12965  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  12964 gagcaaggaggaacttgggatagacatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 12865  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12864 atggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagat 12765  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgca 327  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12764 gattcaagagaaaatgaaagcgtcgca 12738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 115 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 16987
Alignment:
Q  115 ttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||     
T  17450 ttgggatagtcatcttccgttgatagaattcacgtacaataacagttatcattctagcattggaatggcaccttttgaggctctgtatggtcggaggtgt 17351  T
Q  215 agaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaa 314  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  || || || |||||||| ||  |||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  17350 agaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagattgtagttttgggaccagaaatcattcaacaaactactgtgaaggttaagatgattcaagaaaaga 17251  T
Q  315 tgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctat 414  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| || | |    
T  17250 tgaaagtgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgt 17151  T
Q  415 gactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtg 514  Q
    || | |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |  |||| | ||||||||||||| |||| ||||    
T  17150 gatttgtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcaagtg 17051  T
Q  515 ggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17050 ggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 116638 - 117211
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | || |  |||| || | | ||||| ||||||||  ||||||| || ||||    
T  116638 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgaaaagaacgattccgtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtactagagc 116737  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || || | | | |||||    
T  116738 aaggaggaacttgggttagtcatcttccgttgatagagttgacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccatttgaagttctgtatgg 116837  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| || || |||| |||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  116838 tcggaggtgtaggactctgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccataaatcgttcagcaaactactgagaaggttaagttgatc 116937  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||    
T  116938 caagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttgagtttcaagaaagagaacaagtatttttgagag 117037  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| || | ||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || |  |||| | ||| |||||||||    
T  117038 tcactcatgtgaatagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaatatcagaaagaattgtaacggtggc 117137  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  117138 gtatcgagtgggtttaccaccgtatatttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatg 117211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 98462 - 98140
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || | ||| || |||| |||| ||||||| || |||| ||| || |||| ||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  98462 ccgttgattgagtttactttcaacaacagttttcatgctagtatcggtatggtaccgtttgaggttttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 98363  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || || || ||  | |||||||||||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  98362 ggtttgagtccggagagagtgttttgttaggaccagaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 98263  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | || || ||| |||||||||| |  || || ||||||||||| || || | ||||||||| || || || |||    
T  98262 tagacagaagagttatcatgataagaggagtaaggatattgagtttcaagttggtgatcacgtgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgt 98163  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  98162 gctttgaagtgtaggaagttgac 98140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16228 - 15832
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  16228 aagttgaggttgagttcggcgtatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagc 16129  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | |||    
T  16128 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagtgttcacgtacaataatatttatcattctagtattggaatggcatcttatgaggctttttttgg 16029  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||     
T  16028 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagttaggtgaaagggtggttttaggacacgagattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgatt 15929  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15928 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaatacctcgagtttcaagaaggagaccacgtatttttga 15832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 241 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 15829 - 15493
Alignment:
Q  241 aggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaag 340  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15829 aggtgaaagggtggttttaggactcgagattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaag 15730  T
Q  341 agttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 440  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15729 agttaccatgataagcgtaggaaatacctcgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgacagtcattcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 15630  T
Q  441 caaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaattt 540  Q
    ||||||||||||| || |  || |||||| | |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||||||    
T  15629 caaagaagttgactcctagatttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcatatcgagtaggtttaccaccacat-tttcgaattt 15531  T
Q  541 gcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  15530 gcacgatgtgtttcatgggtcgcaacttcggaagtatg 15493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 26 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 46780 - 46531
Alignment:
Q  26 tatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtc 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46780 tatcatccacagacagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtc 46681  T
Q  126 atcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgtt 225  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46680 atcttccgttgatcgagttcacttacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtaggagatgcagaactccgtt 46581  T
Q  226 gtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46580 gtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttc 46531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 74 - 578
Target Start/End: Original strand, 86306 - 86810
Alignment:
Q  74 gaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagta 173  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  86306 gaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacttataataacagttaccattctagca 86405  T
Q  174 ttggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgt 273  Q
    ||| ||||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| |  |||||  | |||||||| ||| |    
T  86406 ttgcaatggtaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtatgagtccggtgagactgtggtactgggaccagacatttt 86505  T
Q  274 tcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgag 373  Q
    ||| || ||||||||||| ||| || ||||   ||| || ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||    
T  86506 tcaacagactactgagaaggttaagttgataagagaaaagatggaagcgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataatcgtaggaaggatcttgag 86605  T
Q  374 tttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccat 473  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| || | |||| ||||| ||||||||  | || ||||||||  ||||  ||| ||| ||||| || |    
T  86606 tttcaagaaggataccatgtgttttttagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgcactaaaatcaaagaaactgacttcgaggtttattggcccgt 86705  T
Q  474 atcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaa 573  Q
    |||| |||| ||||| ||||||  |||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||  |||| || |||||||| |||||||||||    
T  86706 atcaaatttcggaaagagttgggtcggttgcgtatagagtgggtttaccaccgcaactttcgaacctacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaa 86805  T
Q  574 gtatg 578  Q
    |||||    
T  86806 gtatg 86810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 4)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 80 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 9468 - 9047
Alignment:
Q  80 ttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaa 179  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9468 ttgttgagggtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacatacaataacagttatcattctagtattggaa 9369  T
Q  180 tggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagca 279  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  9368 tggcaccttttgaggctttgtatggtagaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgattcaggtgagagtctggttttagcaccagaaattgttcaaca 9269  T
Q  280 aactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcag 379  Q
    |||| ||||||| ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||     
T  9268 aactgctgagaaggttaagataatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaa 9169  T
Q  380 gaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcaga 479  Q
    ||||| || || || ||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||    
T  9168 gaaggggatcatgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcaga 9069  T
Q  480 ttttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    | |  |||| | ||||||||||    
T  9068 tatcagaaagaattggaacggt 9047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 453
Target Start/End: Original strand, 351 - 514
Alignment:
Q  290 aaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagacc 389  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||| | || |||||||||||||| ||| | || || ||| ||||||||||||  || || |    
T  351 aaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggtgatc 450  T
Q  390 acgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    | ||||| |||||||| | |||| | ||| |||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  451 atgtgttcttgagagtgaatcctgtaactagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 249
Target Start/End: Original strand, 216 - 331
Alignment:
Q  134 ttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 233  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| | |||||| || || || || | ||| || ||||    
T  216 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccatttgaggctttgtgtggtcgaaggtgtaggacgcggttatgttggt 315  T
Q  234 ttgagtcaggtgaaag 249  Q
    |||| |||||||||||    
T  316 ttgattcaggtgaaag 331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 506 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 7049 - 6977
Alignment:
Q  506 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  |||| || || ||||| |||||| | |||||||    
T  7049 tatcgagtgggtttgccaccgcatgtttcgaatttgcatgatgtgtttcaagtgtcacaacttagaaagtatg 6977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 80 - 577
Target Start/End: Original strand, 12785 - 13282
Alignment:
Q  80 ttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaa 179  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12785 ttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctcccgttgatagagttcacatataataacagttaccattctagtattggaa 12884  T
Q  180 tggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagca 279  Q
    ||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||| | || |  || || |||||||| ||| |||||||    
T  12885 tggcaccattcgaagctctgtatggtcggaggtgtaggactccattgtgttggttcgagtcaggttagagtgcagttttgggaccagaaattcttcagca 12984  T
Q  280 aactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcag 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||     
T  12985 aactactgagaaagtttagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttcaa 13084  T
Q  380 gaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcaga 479  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||  |||  || ||| || | |||||||    
T  13085 gaaggagaccatgtgttattgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtctaagaaattgacttcgagatttattagttcgtatcaga 13184  T
Q  480 ttttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 577  Q
    | |  |||| | | |||| ||| || ||| ||||||||||||| || || |||| |||||| ||  |||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  13185 tatcagaaagaatgggaatggtagcgtatggagtgggtttaccaccacaacttttgaatttacatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtat 13282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 7)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 122 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 448515 - 448060
Alignment:
Q  122 agtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactc 221  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  | || ||||||||||    
T  448515 agtcacctcccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggctttgtatggaagaaggtgcagaactc 448416  T
Q  222 cgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggc 321  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |     
T  448415 cgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtggttttttgaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagt 448316  T
Q  322 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggt 421  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| | |||  |    
T  448315 gtcgcagagtcgacagaagagctatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcacgtattttttagagtcactcctgtaactatt 448216  T
Q  422 gtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttac 521  Q
    || ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || | ||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  448215 gttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaatatcggaaagaattggaacggtggcgcatcaagtgggtttac 448116  T
Q  522 cgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 577  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  448115 caccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtat 448060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 578
Target Start/End: Original strand, 90664 - 91238
Alignment:
Q  4 gaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgag 103  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||| |   ||||||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  90664 gaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgttcttgag 90763  T
Q  104 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 203  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  90764 caaggtggagcttgggatagtcatctaccgctgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatg 90863  T
Q  204 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 303  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |  || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||    
T  90864 gtcggaggtgcagaactcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtagcgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatgat 90963  T
Q  304 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 403  Q
       ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  90964 aagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgaga 91063  T
Q  404 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 503  Q
    || | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||| ||| |||||||| |||| |  || |  |||||||| ||||    
T  91064 gttactcctacgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgacttcaaagtttattagtccatattagatatctgagagggttggaacagtgg 91163  T
Q  504 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | ||  |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  91164 catacagagtaggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactgcggaagtatg 91238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 315 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 162376 - 162113
Alignment:
Q  315 tgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctat 414  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  162376 tgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcgtaaaaaagatcttgtgtttcaagaagtagaccacgtatttttgagagtcactcctat 162277  T
Q  415 gactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtg 514  Q
    ||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||| ||||  || ||||| || |||||||| |  |||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  162276 gactggtgttggacgagcgtcgaagtcaaagaacttgactccgagatttattggcccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtg 162177  T
Q  515 ggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||| ||||||||    
T  162176 ggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttcgcaacttcagaagtatg 162113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Original strand, 390933 - 391066
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | || |  ||||||| | ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  390933 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagc 391032  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  391033 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgat 391066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 114757 - 114542
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  || |||  || || |   | ||||||||  ||||  | ||||| |||    
T  114757 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagtggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtactt 114658  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  114657 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaataacacttaccactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 114558  T
Q  201 atggtcggagatgcag 216  Q
    |||||||||| |||||    
T  114557 atggtcggaggtgcag 114542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 410 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 175431 - 175361
Alignment:
Q  410 cctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 480  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  175431 cctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgatcccgaagtttattggtccgtatcagat 175361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 453
Target Start/End: Original strand, 78666 - 78810
Alignment:
Q  309 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 408  Q
    |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |||||||||||||| |     
T  78666 agaagatgaaggcatctcagattagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaa 78765  T
Q  409 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    || | |||| || || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  78766 tcatgtgacaggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 78810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 16149 - 16722
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  |||| |  ||||||| | | ||||| ||||||||  |||| || |||||||    
T  16149 aagttgaggttaagttcggcgtatcatccgcagacaaatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgcgtacttgagc 16248  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||    
T  16249 aaggagggacttgggatagtcatcttccattaatagaattcacgtacaataatagttatcattctagtattgcaatgacaccatttgaggctttgtatgg 16348  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
       ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||     
T  16349 aacgaggtgcaaaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtggttttaagaacagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgatt 16448  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||   ||||| |||||||| || || ||||| || |    
T  16449 caagaaaagatgaaagcgtcgcagactcgacaaaagagttatcatgataagcgtagggaggatcttatatttcaagaaggagatcatgtattttttaggg 16548  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||  ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||| ||| |||| |  |||| | |||||| ||||||    
T  16549 tcactccagtgattggtgttggacgtgcattgaagtcgaagaagttgacaccgagatttattggtccgtataagatatcagaaagaattggaatggtggc 16648  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||  || |||||||| |||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16649 gtatcatgtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgtacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 24804 - 25377
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||  |||| |  ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||    
T  24804 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgtaaacagatggtcagtcggagagaatgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgtacttaagc 24903  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |||||  ||||    
T  24904 aaggtgggacttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttatcattctagtatttggatgacaccattcgaagctttgcatgg 25003  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || |||||||| || ||||| || || ||| || | ||     
T  25004 tcggaggtgcagaactccgttctgttggtttgagtcgggtgaaagtgtagtgttgggaccggatattgttcaccagactacagaaaaggttaagctaata 25103  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| | ||||    
T  25104 agagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagacttatcacgacaaacgtaggaaagatcttgaatttcaagcaggagaccatgtgtttctaagag 25203  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| | || ||| |||||  | |||||||| | ||||| ||||||||| |||||    
T  25204 tcactcctgtgacaggtgttggtcgtgctttgaaatcgaagaagttgacgctgaggtttattggctcgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggc 25303  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25304 atatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 25377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 578
Target Start/End: Original strand, 9825 - 10389
Alignment:
Q  14 ttgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaa 113  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||  |||||| ||| || |   ||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||| |||     
T  9825 ttgagttcggcttatcatccgcagacatatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagcaaggtggag 9924  T
Q  114 cttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatg 213  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  9925 cttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggtg 10024  T
Q  214 cagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaa 313  Q
    ||| ||||| || |||||||||| ||| || ||||| || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||||||  ||||||     
T  10025 caggactcctttatgctggtttgggtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaag 10124  T
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||| |||| || | |||||    
T  10125 atgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactccta 10224  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 513  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  10225 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccatatcagagttcagaaagagttggaactgtggcatatagagt 10324  T
Q  514 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||| || || |||||||||||||||||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  10325 tggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattgcggaagtatg 10389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 4448 - 3875
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||  |||| |  ||||| | | |||||||||||||||   | ||||| |||||||    
T  4448 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagagagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgttgatagtgtgtgtacttgagc 4349  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||    
T  4348 aaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccatttgagtattggtatggcaccgttcgaagcttcgtatgg 4249  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||     
T  4248 tcggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgata 4149  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||| ||    
T  4148 agagaaaagatgaaagcgtcggagaatcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagtccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgatag 4049  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| |||||    
T  4048 tcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagtgttggaacagtggc 3949  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3948 ttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 3875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 10473 - 11045
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||||||||||  |||| |  ||| ||| | ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  10473 aagttgagattgagttcagcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgatttagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 10572  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||| |||||||  |  ||||||| | ||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||    
T  10573 aaggtggagcttggaatagtcacttgtcgttgatagtgtttacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtgtgg 10672  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |  ||  ||||     
T  10673 tcggaggtgcagaactccgttacgttggtttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatatagttcaacagactacagagaaggc-caattgata 10771  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  10772 agagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagtgtagaaaggatcttgagttacaagaaggagaccatgtgtttttgagag 10871  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| |||| |||| ||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||    
T  10872 tcactcctgtgacaggtataggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacaccgaggtttattggtccatatcagatatctgagaaagttggaacagtggc 10971  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10972 atatagagtggatttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 11045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6183
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||| || |   ||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  6761 ttcgaaattgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctgaggatatgtgtactt 6662  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  6661 gagcagggaggagtttgggatagtcacctaccattgatagaattcacatacaacaatagttaccattcaagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 6562  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||  || ||||| || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||  ||||    
T  6561 atggtcggaggtgcaggactcctttatgcttgtttgagttgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaagat 6462  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttt-tt 399  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  |    
T  6461 gatcatagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttcct 6362  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
    ||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||     
T  6361 gagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagatttggaact 6262  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| ||| || | ||||| ||  | | |||||||||||||||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  6261 gtggcatatagatttggtttgccatctcttctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatg 6183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20560 - 19983
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||||| | ||||  ||||||  || || |   | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  20560 ttcgaagttgaggttgagttcggtttatcatccgcagacagatgtttagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtttgtgttctt 20461  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| |    
T  20460 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaaaagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgt 20361  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||  | ||||| || ||||  |||||| |  ||||    
T  20360 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtcttgggaccggatttggttcatcagactatagagaaactcaagat 20261  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || ||| ||    
T  20260 gataagggaaaagatgaaagcgtcccagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctg 20161  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |  || || |||||||| |    
T  20160 agagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcgttgaagtcgaagaagtttactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagaaggttggaacag 20061  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||    || || |||||||||||||||||||||||||    
T  20060 tggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatggcgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 13090 - 13667
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||  ||||  | ||||| |||    
T  13090 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgctt 13189  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  13190 gagcaaggtggagcttaggatagtcacctaccgtagatagagttcacatacaacaacagttactattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 13289  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattg-ttcagcaaactactgagaaagttcaga 299  Q
    |||||||||| || || ||||  || |||||||||||||||   || || || || || ||||| || |||| |||| || ||||| ||||||||  |||    
T  13290 atggtcggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccgga-attgattcatcagactacagagaaagtcaaga 13388  T
Q  300 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 399  Q
    |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| |    
T  13389 tgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttct 13488  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
     ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||| |  ||||||||     
T  13489 aagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaaca 13588  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13589 gtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 13667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 16860 - 17437
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  || |||  || || |   | ||||||||  ||||  | ||||| |||    
T  16860 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagcggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgctt 16959  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  16960 gagcaaggtggagcttaggatagtcacctaccgtagatagagttcacatacaacaacagttactattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 17059  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattg-ttcagcaaactactgagaaagttcaga 299  Q
    |||||||||| || || ||||  || |||||||||||||||   || || || || || ||||| || |||| |||| || ||||| ||||||||  |||    
T  17060 atggtcggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccgga-attgattcatcagactacagagaaagtcaaga 17158  T
Q  300 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 399  Q
    |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| |    
T  17159 tgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttct 17258  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
     || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||| |  ||||||||     
T  17259 tagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaaca 17358  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17359 gtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 17437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 182 - 543
Target Start/End: Original strand, 16375 - 16736
Alignment:
Q  182 gcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaa 281  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||| ||||    
T  16375 gcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccaaaaattgttcaacaaa 16474  T
Q  282 ctactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 381  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  16475 ctactgagaaggttaagatgattcaataaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaaga 16574  T
Q  382 aggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatt 481  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| | || ||| | |||||| ||||||||     
T  16575 gggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcacattgaagtcaaagaagttgactcagaggtttactggtccgtatcagata 16674  T
Q  482 ttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
    | | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16675 tcgaaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 16736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 42062 - 42639
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  42062 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgctt 42161  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  42162 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 42261  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  |  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  42262 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccgtatttggttcatcagactacagagaaagtcaagat 42361  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  ||| || ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  42362 gatcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctg 42461  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || || | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||| |    
T  42462 agggttactcctatgacgggtgtaggaagtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactg 42561  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42562 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcttgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 42639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 47128 - 47705
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||  ||||  | ||||| |||    
T  47128 ttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatttactgagagtgtgtgtgctt 47227  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||  |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  47228 gagcaaggtggagcttaagatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 47327  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  |  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  47328 atggtcggaggtgaaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccgtatttggttcatcagactacagagaaagtcaagat 47427  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  ||| || ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  47428 gatcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctg 47527  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || || | ||||||||| |||||||||  ||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||| |    
T  47528 agggttactcctatgacgggtgtaggaaatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactg 47627  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47628 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcttgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 47705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2494 - 2337
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  |||| |  ||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  2494 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagc 2395  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagtta 162  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2394 aaggaggaacttggggtagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagtta 2337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 28095 - 27519
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||  ||||  | ||||| ||||    
T  28095 tcgaagttgaggctgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttg 27996  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| ||    
T  27995 aacaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagttttgta 27896  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||    ||||| || ||||| ||||||||  |||||    
T  27895 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccagattcggttcatcagactacagagaaagtcaagatg 27796  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||    
T  27795 atcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggagatcatgtgtttctga 27696  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |  || |  |||||||| ||    
T  27695 gagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcatcgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtataagatatcagagagggttggaacagt 27596  T
Q  502 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||| ||| |||| ||||| || || ||||||| |||||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  27595 ggcatatagagttggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatg 27519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 882 - 1454
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||  |||| |  ||||| | | |||||||| || ||||  | ||||| || ||||    
T  882 aagttgaggttgagttcggcttatcgtccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatctgctgagagtgtgtgtactcgagc 981  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||    
T  982 aaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcatgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggaaccgttcgaagctttgtatgg 1081  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||| |||||  | || |||||||||||| | ||||  ||||| || ||||||||  | ||||| || |||||  |||||||  |||||||     
T  1082 tcggaggtgcaggactcctctatgttggtttgagtcaagagaaaatgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacgaagaaagtcaagatgata 1181  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||     
T  1182 agagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagaa 1281  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |||||    
T  1282 tcattcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtt-attggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggc 1380  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||   ||| |||||    || ||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1381 ataaaaagtaggtttgaaaccacatctttcgaatttgaatgatgtatttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 1454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 34348 - 34299
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtc 51  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  34348 tcgaagttgaggctgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtc 34299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 48936 - 49513
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || || |   |||||||||| |||||  | ||||| |||    
T  48936 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatttattgagagtgtgtgtgctt 49035  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |    
T  49036 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctgccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgt 49135  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||  | |||||  | ||||| || |||||  ||||    
T  49136 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagatttggttcatgagactacagaaaaagtcaagat 49235  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || |||||| ||    
T  49236 gatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtgtttctg 49335  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  |||||||| |    
T  49336 agggtcattcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaactg 49435  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  49436 tggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttacatgtatcgcagcttcggaagtatg 49513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 13634 - 14207
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||| |  || || | | | ||||||||||||||  | ||||| |||||||    
T  13634 aagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcgttggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagc 13733  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    || | ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| || || |||||    
T  13734 aaagtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattagtatggcaccgttcgaagccttgtatgg 13833  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||||||||||||  |||||||     
T  13834 tcggagatgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgata 13933  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
       || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || |||||||| ||||    
T  13934 agggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaagag 14033  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |  ||||   ||||||| |||||    
T  14034 ttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaaattgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagaaaggattggaacagtggc 14133  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| |||| || || || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14134 atatagagttgggttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 14207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Original strand, 4682 - 5224
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||  ||||  | ||||| |||    
T  4682 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcgtcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtactt 4781  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||  |||| |    
T  4782 gagaaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccatttgagtattggtatggcaccgttcgaatctttgt 4881  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| | || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||    
T  4882 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaagagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcattagactacagagaaagtcaagat 4981  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |  || || || ||| ||    
T  4982 gatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggaggatgatcatgtatttctg 5081  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |    
T  5082 agagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacag 5181  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  5182 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 5224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 578
Target Start/End: Original strand, 5328 - 5896
Alignment:
Q  9 tgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaagg 108  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||| || |||||| |||||| | | | ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  5328 tgagtttgagttcgacgtatcatccgcagaccgatggacagacagagaggacaattcattcgttcgaggatttgttgagagtttgtgtactcgagcaagg 5427  T
Q  109 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| || || | |||||||    
T  5428 aggaacttgggatagtaatcttccattgattgagttcacgtataataacagttaccattctagcattggaatgacaccgttcgaagcgttgtttggtcgg 5527  T
Q  209 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |  |||||  ||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||| || ||||   ||    
T  5528 agatgcagaactccgttgtgttggtatgagtccggtgagaatgtggtactaggacctgaaattgttcaacaaacaacagagaaggttaagttgattagag 5627  T
Q  309 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 408  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||     
T  5628 agaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgca-aaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtatttttgagagtcac 5726  T
Q  409 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 508  Q
    |||| |||| ||||| ||||| ||  | ||||| |||||  || | |||| ||| | |||| | ||||| ||||   ||| |||||| || || || |||    
T  5727 tcctgtgaccggtgttggacgagcactaaagtcgaagaaactgtctccgaggtttaatggttcgtatcatatttcataaagagttgggacagttgcgtat 5826  T
Q  509 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||| ||||||| || |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  5827 agagtgagtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacatcggaagtatg 5896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 26715 - 26142
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| |  ||| ||| | ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  26715 aagttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacgatttagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 26616  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||   |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  26615 aaggtggagctttttatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 26516  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||  ||||| |||||  |||||||||| || ||||  || || || ||| | ||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||     
T  26515 tcggaggtgcaagactcctttgtgtcggtttgagtcgggagaaaatgtagtgttgggagcggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgata 26416  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  26415 agagaaaagatcaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccattacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagag 26316  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |  || | ||||||||| |||||    
T  26315 tcactcctatgacgggtgtaggccgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggc 26216  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||  |||||||||| || || ||||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26215 atacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 26142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27097 - 26862
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||| |  ||| ||| | ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  27097 aagttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacgatttagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 26998  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  26997 aaggtggagcttcagatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcaagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 26898  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 240  Q
    |||||| ||||  ||||| |||||  ||||||||||    
T  26897 tcggaggtgcaagactcctttgtgtcggtttgagtc 26862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 47697 - 47124
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| |||| |  ||||| |   ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  47697 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacaaatggtcagtcagagagaacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 47598  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  47597 aaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatgg 47498  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||     
T  47497 tcggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatgata 47398  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||| |    
T  47397 agagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgaaaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgaggg 47298  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | | |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |||||    
T  47297 ttactcctataacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggc 47198  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  47197 atacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 47124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 180; Significance: 7e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 5327 - 4760
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||  | |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||| | | ||||||||||   |||  | ||||| |||    
T  5327 ttcgaagttgaggttgagttcaacttatcatctgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcgttagaggattttccgagagtgtgtgtactt 5228  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  5227 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 5128  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||| ||| ||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  5127 atggtcagaggtgcagaactcctttataatggtttgagtcaggagaaagtgtggtgttgggaccagatttggttcatcagactactgagaaagtcaagat 5028  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || ||| ||    
T  5027 gataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctg 4928  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||| |  || |  |||||||| |    
T  4927 agagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaaattgactccaaagttcattggtccgtataagatatctgagagggttggaacag 4828  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaactt 568  Q
    |||| ||  |||||||||| || || |||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  4827 tggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactt 4760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 10366 - 9798
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||| |  ||||| | | ||||||||||| ||||  | ||| | ||||| |    
T  10366 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgctgagagtgtgtctacttgaac 10267  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  10266 aaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 10167  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||| | || ||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||     
T  10166 tcggaggtgcagaactcctttatgttggtttgagacgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgata 10067  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |     | ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||    
T  10066 agagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagga-----cgtgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagag 9972  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | | ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |||||    
T  9971 ttactcctatggcgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccttatcagatatctgagagggttggaacagtggc 9872  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||  |||||||||| || || ||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9871 atacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 9798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 249190 - 248613
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || | | | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  249190 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtctgagaggacgatccaatcgttggaggatttgttgagagtgtgtgtgctt 249091  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |    
T  249090 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgctgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgt 248991  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||| |||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||  |  | |||||  | |||||| |||||||  ||||    
T  248990 atggtaggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccgaacttggttcatgagactactaagaaagtcaagat 248891  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    || ||||||||||| || || || || ||| ||    
T  248890 gataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 248791  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||  |    
T  248790 agggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaagttggaaaag 248691  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  248690 tggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 248613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6622 - 6336
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  || | |||| |||||||  ||||||  ||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6622 aagttgaggttgagttcggcatatcatccgcaaatagatagtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagc 6523  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  6522 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatggcaccctatgaggctttgtatgg 6423  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaa 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6422 tcggagatgcagaactccattgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaa 6336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 518 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 6333 - 6273
Alignment:
Q  518 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  6333 ttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatg 6273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1838 - 1552
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| | |||||  ||||| ||  | || ||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  1838 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagatagatggtctgtcgttgaggatgattcatttttttgatgattttttgagagtttgtgtacttgagc 1739  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1738 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattccagtgttggaatggcaccttatgaggctttatatgg 1639  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1638 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaaccactgagaa 1552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 6769 - 7342
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||||  |||| |  ||||||  | ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  6769 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacaaatggtcagtcggagagaacgattcagccgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 6868  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || | ||| ||||| |||||||| |||  ||| ||||| || || |||||    
T  6869 aaggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacgtataacaacaattaccattcgagtattggtatgataccgttcgaagcattgtatgg 6968  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||    ||||| ||||| || ||||||||  | ||||| |||||||| || || ||  || ||||     
T  6969 tcggaggtgcagaactcaattgtgttggtttgagtcgacagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcaaactacagaaaaggtcaagttgata 7068  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||||| || |||||| |||| |    
T  7069 agagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaagcccttgagtgtcaagagggagatcatgtgtttctgaggg 7168  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  || | ||||||||| |||||    
T  7169 ttactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagttcattggtccataccagatatctgagagagttggaacagtggc 7268  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  7269 ttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 7342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 671 - 98
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |  ||||||  || || |   | ||||||||||| ||  | ||||| |||||||    
T  671 aagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagacggagaggatgatccaatctttggaggatttgttaagagtgtgtgtgcttgagc 572  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| || ||    
T  571 aaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattcgtatggcaccgttcgaagctttgtacgg 472  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||     
T  471 tcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgata 372  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
       || || ||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||| || ||||| || || ||| ||||||    
T  371 agggaaaagatgaaagcatcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaagggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagag 272  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |||||    
T  271 ttactcctatgacgggtgtatgacgtgctttgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggc 172  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||  | || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  171 atacagagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaaatatg 98  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1105 - 528
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||  ||||  | ||||| |||    
T  1105 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccttagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtactt 1006  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  1005 gagcaaggtggagcttgcgatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggctcctttcgaagctttgt 906  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || |||||||| ||||| || || ||| || |    
T  905 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagtt 806  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   | |  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |||    
T  805 gataagaaaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagctatcgtgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttg 706  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||  |||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||  || |  |||||||| |    
T  705 agagttactcctatgacaggtgtaggcagtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttatcggtccgtatcaaatttcagagagggttggaacag 606  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||  |||||||    
T  605 tggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcggaacttccaaagtatg 528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 51596 - 52169
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||||  |||| | |||||| |   ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  51596 aagttaaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggttagtcggagagaacaattcaatcagtagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 51695  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    | || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| |    
T  51696 agggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatag 51795  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||  | ||||| |||||||| ||||| ||  |||||||     
T  51796 tcggaggtgcatgactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccggatttggttcatcaaactacggagaaggtcaagatgata 51895  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||    
T  51896 agagaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagag 51995  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||    
T  51996 tcactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttagtggtccatatcagatatctgaaagggttggaacagtggc 52095  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  52096 atacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatg 52169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 3328 - 2751
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||| || |   | ||||||||  ||||  | ||||| |||    
T  3328 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgaagaggacaatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgctt 3229  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||| |    
T  3228 gaacaaggtggtgcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgt 3129  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || || || ||||||||  ||||    
T  3128 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacaacagagaaagtcaagat 3029  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| | ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||| | || || ||| ||    
T  3028 gataagggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagggttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggatatcatgtatttatg 2929  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |    
T  2928 agagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctgagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacag 2829  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2828 tggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 2751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 114 - 578
Target Start/End: Original strand, 5756 - 6219
Alignment:
Q  114 cttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatg 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  5756 cttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 5855  T
Q  214 cagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaa 313  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||||  |||||||| || || ||  || ||||   ||| ||     
T  5856 cagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcgtcaaactacagaaaaggtcaagttgataagagaaaag 5955  T
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||  || |||||| |||| || | |||||    
T  5956 atgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagctcatgtgtttctgagggttactccta 6055  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 513  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  6056 tgacgggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagagttggaactgtggcatatagagt 6155  T
Q  514 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6156 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcttgatgtttt-catgtgtcgcaacttcggaagtatg 6219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 379
Target Start/End: Original strand, 4187 - 4561
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||   |||| |  ||||||| | ||||||||||||||||  ||||| | ||| |||    
T  4187 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcacacagatggtcagttggagagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtttacttcagc 4286  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  4287 aaggagtaacttgggctagtcatcatccattgatatagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggctttgtatgg 4386  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    | |||  || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||||||     
T  4387 ttggatttgtagaactcctttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgacaagcttaagatgatt 4486  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcag 379  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  4487 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatctcgagtttcag 4561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 59327 - 58972
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| || |||||| |||||||| | | ||||| ||||||||  ||||||| |||||||    
T  59327 aagttgagtttgagttcggcgtatcatccgcagacagatgggcagacagagaggacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagc 59228  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||    
T  59227 aaggaggaacttgggatagtcatctctcattgatcgagttcatgtacaataacagttaccattctagcattgggatggcaccattcgaagcattgtatgg 59128  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||| | |  |||||  ||||||| || |||||  |  |||||||  |||| ||| || ||||     
T  59127 tcggagatgcagaactccattgtgttggtatgaatccggtaagaatgtggtactaggaccggaaattgtcgaaaaaactacacagaaggttaagttgatt 59028  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtag 360  Q
       ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||    
T  59027 tgggagaagatgaaagcgtcgtagagtagacaaaagcgttatcatgatcagcgtag 58972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 130721 - 130532
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||||| | |||| |||||| ||||| | |||||||||||||    
T  130721 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgctgagggtatgtgttcttgagc 130622  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  130621 aaggatgaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgagg 130532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 134728 - 134626
Alignment:
Q  92 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcg 191  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  134728 tgtgttcttgagcaaggatgaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttg 134629  T
Q  192 agg 194  Q
    |||    
T  134628 agg 134626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 414 - 564
Target Start/End: Original strand, 4567 - 4717
Alignment:
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 513  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| |||||| | | ||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  4567 tgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagtttactccgagatttattggtccgtatcaggtatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagt 4666  T
Q  514 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 564  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||  |||| || ||| |||||||    
T  4667 gggtttaccatcgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatctgtcgca 4717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 51
Target Start/End: Original strand, 29112 - 29158
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtc 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29112 aagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtc 29158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 578
Target Start/End: Original strand, 36974 - 37052
Alignment:
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| |||| ||| || ||||| |||| |||| ||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  36974 gtggcgtatctagttggattaccaccgcctcttacgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 37052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 21400 - 21977
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||  ||| ||  || || |   | ||||||||| ||||  | ||||| |||    
T  21400 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagacggtcagtcggagacgacgatacaatctttggaggatttgctgagagtgtgtgtactt 21499  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  21500 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 21599  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |   | || || || ||||| ||  | ||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  21600 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagtgggtgttgtgttgggaccggacttggttcatcagactactgagaaagtcaagat 21699  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || ||  |||| || ||| ||    
T  21700 gataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtaaccatgtatttctg 21799  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |  |||||||| |    
T  21800 agggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgattccgaagttcattggtccgtataagatatcggagagggttggaacag 21899  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21900 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26253 - 26006
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  26253 ccgttgatcgaatttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 26154  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| || || ||||| |   | || ||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| || ||    
T  26153 ggtttgaatccggagaaagtgctttgtttggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcatag 26054  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttca 378  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  26053 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 26006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 60943 - 61519
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||  ||||||  || || |   | |||||||  |||||  | ||||| |||    
T  60943 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccttagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatta-ttgagagtgtgtgtgctt 61041  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |    
T  61042 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctacctttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgt 61141  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||| ||||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||    
T  61142 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcatgagactacagagaaagtcaagat 61241  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  61242 gatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctg 61341  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || || | ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |   |||  |||||||| |    
T  61342 agggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatatctaaaagggttggaacag 61441  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  61442 tggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 61519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 67331 - 67907
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||  ||||||  || || |   | |||||||  |||||  | ||||| |||    
T  67331 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccttagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatta-ttgagagtgtgtgtgctt 67429  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |    
T  67430 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctacctttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgt 67529  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||| ||||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||    
T  67530 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcatgagactacagagaaagtcaagat 67629  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  67630 gatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctg 67729  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || || | ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |   |||  |||||||| |    
T  67730 agggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatatctaaaagggttggaacag 67829  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  67830 tggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 67907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 51909 - 52485
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||  ||||||  || || |   | |||||||  |||||  | ||||| |||    
T  51909 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccttagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatta-ttgagagtgtgtgtgctt 52007  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |    
T  52008 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctacctttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgt 52107  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||| ||||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||    
T  52108 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcatgagactacagagaaagtcaagat 52207  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  52208 gatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctg 52307  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || || | ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |   |||  |||||||| |    
T  52308 agggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatatctaaaagggttggaacag 52407  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||||||||| || || ||||||||||| |||||  | || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  52408 tggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaaattgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 52485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 19697 - 19120
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||  ||| ||  || || |   | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  19697 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatgatcctcagacagatggtcagtcggagacgacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgctt 19598  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  19597 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctactgttgatagagttcacatacaacaacagttatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 19498  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||  | || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||    
T  19497 atggtcggaggtgcaggactcctttattctggtttgagtcaggatagagtgttgtattgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagat 19398  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||   || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  19397 gatcagggaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggaccttgagtttcaggatggtgatcatgtatttctg 19298  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || || | ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| || || ||||||||| | |||||||| | ||| |  |||||||| |    
T  19297 agggttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggttcgtatcagatatcggagagggttggaacag 19198  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19197 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgttgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 314 - 534
Target Start/End: Original strand, 58448 - 58668
Alignment:
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || |     
T  58448 atgaaagcgtcgcatagtagacaaaagagttatcatgataagcataggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagccactcatg 58547  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 513  Q
    |||| ||||| |||| |||  |||| ||||||||  |||| |||| ||| ||||| || ||||||||||  |||| | |||| ||||| || ||| ||||    
T  58548 tgaccggtgttggacatgcactgaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccgtatcagatttcagaaagaattgggacggttgcgtatagagt 58647  T
Q  514 gggtttaccgccgcatctttc 534  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  58648 gggtttaccaccgcatctttc 58668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 37775 - 37202
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||| |  |||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  37775 aagttgaggttcagttcagcctatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcactagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 37676  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  37675 aaggtggagcttgagatagtcatctaccgttgatggagttcacgtacaacaacaattaccattcgagtattggtatcgcaccgttcgaagctttgtatgg 37576  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||  || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||| |||||||     
T  37575 tcggaggtgcaggacccctttgtgttggtttgagtcaggagaaactgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaagttaagatgata 37476  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |   |||||||||| |   |||| || |||||| | ||||    
T  37475 agagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggccattgagtttcaagggagagatcatgtgtttcttagag 37376  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    |||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |  ||||  |||||||| |||||    
T  37375 tcacccctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtctatatcagatatctgaaagggttggaacagtggc 37276  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||  |||||||||| || || |||||||| ||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  37275 atacagagtgggtttgccacctcatctttcaaatttgcatgatgtgttacatgtctcgcaacttcggaagtatg 37202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 480
Target Start/End: Original strand, 38103 - 38382
Alignment:
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttt-gagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||  |   ||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  38103 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttgaatcatcagactacggagaaagtcaagat 38202  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||| | ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || || ||| ||    
T  38203 gattagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccaagacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctg 38302  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 480  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  || || |||||||| ||||||||    
T  38303 agagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatcagat 38382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 480
Target Start/End: Original strand, 27385 - 27545
Alignment:
Q  320 gcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactg 419  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || || ||| ||||||| | ||||||||| |    
T  27385 gcgtcgcagagtcgacagaagagttaccacgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgg 27484  T
Q  420 gtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 480  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  || || |||||||| ||||||||    
T  27485 gtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatcagat 27545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 165; Significance: 6e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 578
Target Start/End: Original strand, 33407 - 33983
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||| |  || || |   |||||||| | |||||| | ||||| ||||    
T  33407 tcgaaattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttg 33506  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  33507 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgta 33606  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || |     
T  33607 tggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagtta 33706  T
Q  302 atccaagagaaa--atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 399  Q
    ||  |||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||    
T  33707 at--aagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttctt 33804  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||| || ||     
T  33805 gagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggaca 33904  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  33905 gtggcttatagggtgggtttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgcagttgcggaagtatg 33983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 40705 - 40383
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  40705 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 40606  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| || || ||||| |   | || || || ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  40605 ggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 40506  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| || || || |||    
T  40505 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgt 40406  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||| ||||  | |||||||||    
T  40405 gctttaaagtgtaggaagttgac 40383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 43347 - 42784
Alignment:
Q  14 ttgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaa 113  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||     
T  43347 ttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggag 43248  T
Q  114 cttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatg 213  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||    
T  43247 cttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagcgttgtatggtcggaggtg 43148  T
Q  214 cagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaa 313  Q
     || |||||  | ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||  |||||||    || ||     
T  43147 taggactcctctatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggttcatgagactactaagaaagtcaagatgataagggaaaag 43048  T
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    || ||||||||||| || || || || ||| | || |||| |||||    
T  43047 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttcaggagggtgatcatgtttttcttagggtcactccta 42948  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 513  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || || |||||||| ||||||||| ||||    
T  42947 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaggttggaacagtggcttatagagt 42848  T
Q  514 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 577  Q
     ||||| || || ||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  42847 tggtttgccaccacatcttttgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtat 42784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 18270 - 18843
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||| | |   | ||||| | |||||    
T  18270 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgaagaggacgatccaatcattagaggatttgctaaaagtgtgtgtacatgagc 18369  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  18370 aaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 18469  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| |||| |||||| || || || ||||||||||| ||||| || |  || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||     
T  18470 tcggaggtgcaaaactcctttatgttgatttgagtcaggagaaagtgtagagttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatgata 18569  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||    
T  18570 agagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagag 18669  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 504  Q
    | | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||   |||||||| |  || |  ||| |||| |||||    
T  18670 ttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggtttgtatcagatatcagagagggttagaacagtggc 18769  T
Q  505 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||  |||||||||| || || ||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18770 atacagagtgggttttccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 18843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 27802 - 27226
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||| ||||  | ||||| |||    
T  27802 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggactatacaatcattggaggatttgctgagagtgtgtgtactt 27703  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  27702 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 27603  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||  || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  27602 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcgagtcaggagaaaatgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaagtcaagat 27503  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| ||| || |||||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||  ||||| ||||| || ||| | || || ||| ||    
T  27502 gataagagaaaagatgaaagcgccgtagagtcgacagaagagttaccatgacgagcgtag-gaaggccttgaatttcaagagggatatcatgtatttctg 27404  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |    
T  27403 agagttactcctatgtcgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaaccg 27304  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||  ||||||| || || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  27303 tggcatacagagtgggattgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaaatatg 27226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 160; Significance: 6e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 269 - 10
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  |||||||  || || |||||||||||  ||||||| |||||||    
T  269 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtctcttgaagatttgttgagagtttgtgtacttgagc 170  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  169 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttatgaggctttgtatgg 70  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacc 264  Q
    |||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69 tcggagatgcagaacttcattatgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacc 10  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 74 - 578
Target Start/End: Original strand, 14053 - 14557
Alignment:
Q  74 gaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagta 173  Q
    ||||||||  |||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  14053 gaggatttactgagaatgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagta 14152  T
Q  174 ttggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgt 273  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||    
T  14153 ttggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatcctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggt 14252  T
Q  274 tcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgag 373  Q
    | | || ||||  |||| |||  |||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||    
T  14253 ttatcagactatagagatagtcaagatgatcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgag 14352  T
Q  374 tttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccat 473  Q
    ||| |||| || || || || ||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |    
T  14353 ttttaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgt 14452  T
Q  474 atcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaa 573  Q
    |||||||||  || |  |||||||| ||||| |||  ||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || || |||||||||||||||||    
T  14453 atcagatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcaggtgtcgcaacttcggaa 14552  T
Q  574 gtatg 578  Q
    |||||    
T  14553 gtatg 14557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 434 - 578
Target Start/End: Original strand, 9039 - 9183
Alignment:
Q  434 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatcttt 533  Q
    |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| ||||| |||  ||| ||||| || || |||||||    
T  9039 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatcttt 9138  T
Q  534 cgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| |||||  |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  9139 cgaacttgcatgatgtgtttcaggtgtcgcaacttcggaagtatg 9183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 255
Target Start/End: Original strand, 8061 - 8311
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||  ||||||  ||||||| | |||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  8061 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccaaagaaaaatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtatgtgttcttgagc 8160  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  8161 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatgg 8260  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8261 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggt 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 11465 - 10888
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  || |||  || || |   | ||||||||  ||||  | ||||| |||    
T  11465 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagcggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgctt 11366  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  11365 gagcaaggtggagcttaggatagtcacctaccgtagatagagttcacatacaacaacagttactattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 11266  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattg-ttcagcaaactactgagaaagttcaga 299  Q
    |||||||||| || || ||||  || |||||||||||||||   || || || || || ||||| || |||| |||| || ||||| ||||||||  |||    
T  11265 atggtcggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccgga-attgattcatcagactacagagaaagtcaaga 11167  T
Q  300 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 399  Q
    |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| |    
T  11166 tgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttct 11067  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
     || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||| |  ||||||||     
T  11066 tagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaaca 10967  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10966 gtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 10888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 578
Target Start/End: Original strand, 219 - 705
Alignment:
Q  92 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcg 191  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  219 tgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtatcggtatggcaccgttcg 318  T
Q  192 aggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattg-ttcagcaaactactgaga 290  Q
    | ||||| ||||||||||| || || ||||  || |||||||||||||||   || || || || || ||||| || |||| |||| || ||||| ||||    
T  319 aagctttgtatggtcggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccgga-attgattcatcagactacagaga 417  T
Q  291 aagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagacca 390  Q
    ||||  ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || || ||    
T  418 aagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatca 517  T
Q  391 cgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaa 490  Q
     || ||| | || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |      
T  518 tgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagg 617  T
Q  491 gttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||    || || |||||||||||||||||||||||||    
T  618 gttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatggcgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 7669 - 7991
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  7669 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 7768  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || || |  |   | |||||||||||  |||| ||  ||||| | || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  7769 ggtttgagtccggagagaatgctttgttaggaccagaagttgtgcaagaaactgcggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 7868  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| ||||| |||||||| ||| | || || ||| |||||||||| |  || || || |||||||||||||| | |||| |||| || || || |||    
T  7869 tagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgaccggagttggtcgt 7968  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  7969 gctttgaagtgtaggaagttgac 7991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 133 - 183
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtc 51  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  133 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtc 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 40315 - 39739
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||  ||||||  |||||||   | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  40315 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaagagatggtcagtcggagaggacgattcagtcattggaggatttgttgagagtgtgtgtactt 40216  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| ||   || || ||| | |    
T  40215 gagcaaggtggagcttgggatagtcatctacctttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaatgtttgaagctctgt 40116  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||  | ||||| || ||||  ||||||||  ||||    
T  40115 atggtcggaggtgcaga-ctcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtattgggaccggatttggttcatcagactaacgagaaagtcaagat 40017  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
     ||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||| ||    
T  40016 tataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttactatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaggagggagatcatgtatttctg 39917  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |  || |  |||||||| |    
T  39916 agagttactcctatgacgggtgtaggacgcgcactcaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatccgatatctgagagggttggaacag 39817  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||  |||||||||| || || ||||| |||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  39816 tggcatacagagtgggtttgccaccacatctctcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatg 39739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 48763 - 49339
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  | ||||  ||||| |   |||||||||  || ||  | ||||| |||    
T  48763 ttcgaagttaaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggaaaggacgattcaatcattagaggattgctt-agagtgtgtgtactt 48861  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| |    
T  48862 gagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgtacgaagctttgt 48961  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||  ||  | ||||| || ||||| ||||| ||  ||||    
T  48962 atggtcggaggtgcagaactcctttatgttggttcgagtcacgtgaaagtgtggtattgggactggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagat 49061  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||   ||| || ||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||| | || |||||| ||    
T  49062 gataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggaaatcatgtgtttctg 49161  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |    
T  49162 agagtaacacctatgacaggtgtaggaagtgcgttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacag 49261  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| ||   ||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  49262 cggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaattttcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 49339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 57546 - 58122
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||  ||| ||  || || |   | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  57546 ttcgaagttgaggttgagttcgacttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaagacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgctt 57645  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || | ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  57646 gaacgaggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 57745  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || || |||||||  ||  ||||    
T  57746 atggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagagggtcaagat 57845  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||| | || || || || ||||||    
T  57846 gataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaa-agttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcagaagggtgatcatgtatttttg 57944  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  || |   |||||||||    
T  57945 agagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtctgtatcagatttcagagaggattggaacgg 58044  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  58045 tggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 58122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 218 - 578
Target Start/End: Original strand, 206 - 566
Alignment:
Q  218 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 317  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||| || |  || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||    
T  206 actctgttgtgttggttcgaatcaggtgagagtgcagttttgggaccagaaattgtacagcaaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatga 305  T
Q  318 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 417  Q
    | |||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | ||    
T  306 aagcgtcgcagagtcgacaaaacaactaccatgataagcgtaggaaagacattgagtttcaagaaggggaccatgtgtttttgagagtcaatcctgtaac 405  T
Q  418 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 517  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |  ||||   |||||| |||||| ||||||||||||    
T  406 cggtgttggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaaggattggaatggtggcgtatcgagtgggt 505  T
Q  518 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  506 ttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19426 - 18884
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| |||||  |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||  ||||||  || || |  |||||||||||  |||| || ||||| |||    
T  19426 ttcgaaattgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatgatcagtcgaagaggacgatacaatctctagaggatttactgagaatgtgtgtactt 19327  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || |    
T  19326 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttggaagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgt 19227  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | || || ||| | || ||||| || ||||| || ||  || || |    
T  19226 atggtcgaagatgcagaactcctttgtgttggttcgagtcgggagaaagtgtgatgttggggccatacatagttcaacagactacagaaaagattaagtt 19127  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||  ||||  | ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  19126 gataaaagaacagatgaaagcgtcgcagagtcaacagaagagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttgagtttcaagagggagaccatgtgttcttg 19027  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  || | |||||| || |    
T  19026 agagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttgggacag 18927  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 543  Q
    |||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  18926 tggcgtatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgca 18884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 23588 - 23109
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| |||||  |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||  ||||||  || || |  |||||||||||  |||| || ||||| |||    
T  23588 ttcgaaattgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatgatcagtcgaagaggacgatacaatctctagaggatttactgagaatgtgtgtactt 23489  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || |    
T  23488 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttggaagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgt 23389  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | || || ||| | || ||||| || ||||| || ||  || || |    
T  23388 atggtcgaagatgcagaactcctttgtgttggttcgagtcgggagaaagtgtgatgttggggccatacatagttcaacagactacagaaaagattaagtt 23289  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||  ||||  | ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  23288 gataaaagaacagatgaaagcgtcgcagagtcaacagaagagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttgagtttcaagagggagaccatgtgttcttg 23189  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 480  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  23188 agagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagat 23109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 26838 - 26261
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||| |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  26838 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtactt 26739  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||| ||| ||||| || || |    
T  26738 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctgccattgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattgggatggtaccgttcgaagccttgt 26639  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||  || || || ||||||||  | |||||  | |||||||||||||||  | |    
T  26638 atggtcggaggtgtaggactcctttatgttggtttgagtcaggtgaaaatgttgtgttgggaccagatttggttcatgagactactgagaaagttaggtt 26539  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  26538 gataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagtgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 26439  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  || ||||| |    
T  26438 agggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggtgggaacag 26339  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||| |||  ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  26338 tggcttatagagctggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 26261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 143; Significance: 8e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 6967 - 7542
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||  || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||  || |||  || || |   | ||||||||  ||||  | ||||| |||    
T  6967 ttcgaagttgaggctgcgttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagtggacgatacaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtactt 7066  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  7067 gagcaaggtggagcttgggatagtcatctaacgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcaagtattggtatggcgccgttcgaagctttat 7166  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||  | || || || ||||| ||  | ||||| ||  |||| ||||||||  ||||    
T  7167 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgtgtcaggagagggtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagtctacagagaaagtcaagat 7266  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  ||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||| || || || || ||| ||    
T  7267 gatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttaagtttcaggagggtgatcatgtatttctg 7366  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    || || | | ||||||  |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||   | || |||||||| |    
T  7367 agggttacttctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagattt--cagaaggttggaacag 7464  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || ||| ||||||| |||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  7465 tggcatatagagttggtttgccaccacatatttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatg 7542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 44081 - 43505
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| | ||||||||||  ||||||   | || |   | ||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  44081 tcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagatacatggtcagtcggagaggatggtccaatcattggaggatttgttgagagtatgtgtgcttg 43982  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || | | |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||    
T  43981 agcaaggtggagcttgggatagtcacctactgctgatagagttcgcatacaataacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgta 43882  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    ||||||||| || || ||||| || ||||||| ||||||||| || || ||||| || ||| | ||  | |||||  | ||||| || |||||| |||||    
T  43881 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtatgagtcaggagagagtgtggtgttgggaacggatttggttcatgagactacagaaaaagttaagatg 43782  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    |||  ||| || ||||| |||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || |||||| |||    
T  43781 atcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctga 43682  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    | || | ||||||||| || ||||||||||| ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  |||||||| ||    
T  43681 gggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaactgt 43582  T
Q  502 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  43581 ggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 43505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 45093 - 44517
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| | ||||||||||  ||||||   | || |   | ||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  45093 tcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagatacatggtcagtcggagaggatggtccaatcattggaggatttgttgagagtatgtgtgcttg 44994  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || | | |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||    
T  44993 agcaaggtggagcttgggatagtcacctactgctgatagagttcgcatacaataacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgta 44894  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    ||||||||| || || ||||| || ||||||| ||||||||| || || ||||| || ||| | ||  | |||||  | ||||| || |||||| |||||    
T  44893 tggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtatgagtcaggagagagtgtggtgttgggaacggatttggttcatgagactacagaaaaagttaagatg 44794  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    |||  ||| || ||||| |||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || |||||| |||    
T  44793 atcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctga 44694  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    | || | ||||||||| || ||||||||||| ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  |||||||| ||    
T  44693 gggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaactgt 44594  T
Q  502 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  44593 ggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 44517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 20696 - 20122
Alignment:
Q  4 gaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgag 103  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||| |||||| ||  ||||||  || || |   | ||||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  20696 gaagttgaggttgagttcggcttatcattgtcagacaggtggtcaatcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgag 20597  T
Q  104 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 203  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| ||   ||||| ||||| |||     
T  20596 caaggtggagcttgggatagtcacctaccactgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtataggtatgacattgttcgaagctttgtata 20497  T
Q  204 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 303  Q
    ||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||  | |||||  | |||||  | |||||  |||||||    
T  20496 gtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactacgaaaaaagtcaagatgat 20397  T
Q  304 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 403  Q
       ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || |||||| ||||     
T  20396 tagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagg 20297  T
Q  404 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 503  Q
    || | || |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  |||||||  ||||    
T  20296 gttactcttatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagtgttggaattgtgg 20197  T
Q  504 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||| ||||||||    
T  20196 cctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcagaagtatg 20122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 413 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 36220 - 36055
Alignment:
Q  413 atgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgag 512  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  |||||||  ||||| ||| |||    
T  36220 atgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagtgttggaattgtggcctatagag 36121  T
Q  513 tgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  36120 ttggtttgccaccacatctttcgaacttgcaagatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 36055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 28501 - 29075
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||||||||   |||| |  || ||||   ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  28501 aagttggggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagttggagagaacgatccagtcattagaggatttgctgagagtatgtgtacttgagc 28600  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| | | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28601 aaggtgaagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 28700  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat-gat 303  Q
    |||||| |||||||||| ||| |  | ||||||||  ||||| || |  || || |||||| | || ||||| || ||||  || |||| ||| || |||    
T  28701 tcggaggtgcagaactctgttatctttgtttgagttgggtgacagtgcagtgttgggaccatatatagttcatcagactataga-aaaggtcaaattgat 28799  T
Q  304 ccaag-agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgag 402  Q
       || |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28800 aagaggagaagatgaaagcatcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgag 28899  T
Q  403 agtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtg 502  Q
    ||||| || | |||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| |  || | |||||| || |||    
T  28900 agtcactcatgtgacaggtgtctgtcgtgctttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtg 28999  T
Q  503 gcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    || ||| |||||||||  ||  | ||||| |||||||||||  ||||  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  29000 gcatatagagtgggttacccatcacatctctcgaatttgcatgatgtgcttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 29075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 578
Target Start/End: Original strand, 40492 - 41066
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||||||||   |||| |  || ||||   ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  40492 aagttggggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagttggagagaacgatccagtcattagaggatttgctgagagtatgtgtacttgagc 40591  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| | | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  40592 aaggtgaagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 40691  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat-gat 303  Q
    |||||| |||||||||| ||| |  | ||||||||  ||||| || |  || || |||||| | || ||||| || ||||  || |||| ||| || |||    
T  40692 tcggaggtgcagaactctgttatctttgtttgagttgggtgacagtgcagtgttgggaccatatatagttcatcagactataga-aaaggtcaaattgat 40790  T
Q  304 ccaag-agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgag 402  Q
       || |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  40791 aagaggagaagatgaaagcatcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgag 40890  T
Q  403 agtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtg 502  Q
    ||||| || | |||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| |  || | |||||| || |||    
T  40891 agtcactcatgtgacaggtgtctgtcgtgctttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtg 40990  T
Q  503 gcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    || ||| |||||||||  ||  | ||||| |||||||||||  ||||  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  40991 gcatatagagtgggttacccatcacatctctcgaatttgcatgatgtgcttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 41066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 578
Target Start/End: Original strand, 25595 - 26171
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||  || || |   | ||||||||  ||||  | || || | ||    
T  25595 tcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcggtcagagaggatgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgggtacatg 25694  T
Q  102 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 201  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  25695 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgta 25794  T
Q  202 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 301  Q
    ||||||||| ||||  | ||| || ||||||||||||| ||| || || || ||  | ||||| ||  | || || || ||||| ||||| ||  |||||    
T  25795 tggtcggaggtgcaagaatcctttatgctggtttgagttaggagagagtgttgtgctgggaccggatttggtccatcagactacggagaaggtaaagatg 25894  T
Q  302 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 401  Q
    ||    || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |||    
T  25895 ataagggaaaagatgaaagcgtctcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtatttctga 25994  T
Q  402 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 501  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |   |||  |||||||| ||    
T  25995 gagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcaaaaagggttggaacagt 26094  T
Q  502 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||| ||  |||||||||| || || |||||||| || |||||  |||| || |||| ||||||||||||||| ||||    
T  26095 ggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgcgtcgcaacttcggaaatatg 26171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 314 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16940 - 16676
Alignment:
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| |||| |||| ||||     
T  16940 atgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 16841  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 513  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||  ||||| ||| | ||    
T  16840 tgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaatagtggcatatagtgt 16741  T
Q  514 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  16740 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 16676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 2367 - 1908
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||  ||||||  ||| | |   ||||||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  2367 aagttgaggttgagttcggcatatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggacgatttaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 2268  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| | | ||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  2267 aaggtgtagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaactacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgg 2168  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  |  |||  || ||||| ||||  ||  |||||||     
T  2167 tcggaggtgcaggactcctttatgttggttcgagtcaggagaaagtgtggtgttgggaccagatttgattcttcagactacggagagggtcaagatgat- 2069  T
Q  305 caagagaaaa--tgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgag 402  Q
     |||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  2068 -aagagaaaaggtgaaagcgacgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcataggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgag 1970  T
Q  403 agtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 464  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  1969 agtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttca 1908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 135; Significance: 5e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 5790 - 5309
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||  | ||||  || || | | ||||||||||||||||  | ||||| |||    
T  5790 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcgtcagaaagatggttagtcggaaaggacgatccaatcgttagaggatttgttgagagtgtgtgtgctt 5691  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||||   ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| | ||||| |    
T  5690 gagcaacttggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtaatggtatggcaccgttcaaagctttgt 5591  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || || |||||||| ||  ||||    
T  5590 atggtcggaagtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagat 5491  T
Q  301 gatccaagagaaa-atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 399  Q
    |||  | || ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || || |||||    
T  5490 gata-aggaaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttt 5392  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 482  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5391 gagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattt 5309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Original strand, 197211 - 197404
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||    
T  197211 aagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcggtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgctgagagtttgtgtacttgagc 197310  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  197311 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacatacaataacaattatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttt 197404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 314 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 28231 - 27967
Alignment:
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| | |||      
T  28231 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgaatttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactccgg 28132  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 513  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || |  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  28131 tgactggtgttggacgtgctgtgaagtcaaagaagttgaatcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagt 28032  T
Q  514 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28031 tggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 27967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 320 - 578
Target Start/End: Original strand, 30 - 288
Alignment:
Q  320 gcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactg 419  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||| || | ||||||    
T  30 gcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtgactg 129  T
Q  420 gtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggttt 519  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  130 gtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagtgttggaacggtggcgtatcgagtgagttt 229  T
Q  520 accgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  230 accaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatg 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 442 - 1
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||| |  ||||||| ||||||||||||| ||||  | ||||| ||||| |    
T  442 aagttgaggttgagttcggcttatcatccacaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgctagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgacc 343  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  |||| | | ||||| ||||| |||||    
T  342 aaggtggagcttgggatagtcatctaccgatgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattgttatgg-aacgttcgaagctttgtatgg 244  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 304  Q
    |||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||     
T  243 tcggaggtgcaggactccattatgttggtttgagtcaggagaaagtgtagtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgata 144  T
Q  305 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 404  Q
      ||| || ||||| |||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||    
T  143 agagaaaagatgaaagcgtcatagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagag 44  T
Q  405 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaa 447  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  43 tcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 16442 - 17019
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  ||||||  ||||| |   | || |||||||||||  | ||||| |||    
T  16442 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgctt 16541  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  16542 gaacaaggtggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgt 16641  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga- 299  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||||||||| |||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||| |||||     
T  16642 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttaagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaag-tcagat 16740  T
Q  300 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 399  Q
    ||||   ||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |    
T  16741 tgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagccgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttct 16840  T
Q  400 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 499  Q
    ||| |||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||  || | |||||||||     
T  16841 gagggtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtattagatttcagagagagttggaaca 16940  T
Q  500 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  16941 gtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 17019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 128; Significance: 7e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 244 - 1
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  | || |   ||||||   | || |||||||||||  |||||||||||||||    
T  244 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggttagtcggatagtacgtttcagtcttttgatgatttgttgagagtttgtgttcttgagc 145  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  144 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatgacaccttatgaggctttgtatgg 45  T
Q  205 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaa 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  44 tcggagatgcaaaactccgttgtgttggtttgaatcaggtgaaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 11346 - 10865
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  11346 ttcgaagttgaggttcagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgctt 11247  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || | | |||| |||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |    
T  11246 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctactgctgatagagttcacatacaacaacatttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgt 11147  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||| || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||    
T  11146 atggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagttaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagat 11047  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    ||||  ||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || |||||| |     
T  11046 gatcagagaaaagatgaatgcgtcttagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctt 10947  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 482  Q
    || || | | |||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  10946 agggttacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagattt 10865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 297 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 472 - 191
Alignment:
Q  297 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 396  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  472 agatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgaccatgtttt 373  T
Q  397 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 496  Q
    | |||| || | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  372 tctgagggttactcctatgacgggtataggacgtgcgttgaagttgaagaacttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagaaagagttgga 273  T
Q  497 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  272 actgtggcatatagagttggtttgcctcctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatg 191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 578
Target Start/End: Original strand, 12514 - 13087
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  | ||||  || || |   | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  12514 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgctt 12613  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    || || || ||| |||| | ||     || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |    
T  12614 gaacatggtggagcttgtgctac----ctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgt 12709  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||  | ||||| || || |||||||| ||  ||||    
T  12710 atggtcggaggtgcaggactcttttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtattaggaccagatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagat 12809  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    || || ||||| |||||| |||||||| | || ||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||||||    
T  12810 gataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttg 12909  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 500  Q
    ||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||  || |   |||||||||    
T  12910 agagttactccgatgacgggtgtagaacgtgctttgaaatcaaggaagttaactccgaagttcattggtccgtattagatttcagagaggattggaacgg 13009  T
Q  501 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||| ||  |||| || || || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  13010 tggcatacagagttggcttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 13087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 3084 - 3443
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  || | |  || || |   | |||||||||||| |  | ||||| |||    
T  3084 ttcgaagttgaggctgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagggcacgatccaatctttggaggatttgttgcgagtgtgtgtgctt 3183  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  3184 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacatagaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 3283  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||| | ||  | ||||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  3284 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaacggatttggttcatcagactacagagaaagttaagat 3383  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtag 360  Q
    ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  3384 gatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcgtgataaacgtag 3443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 578
Target Start/End: Original strand, 3487 - 3574
Alignment:
Q  491 gttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  3487 gttggaacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcatgatgtgtatcatgtgtcgctacttcggaagtatg 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 5181 - 5543
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||||||||  | ||||| |||    
T  5181 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgctt 5280  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||      
T  5281 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccaatgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgg 5380  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||  | |||||  | ||||  ||||||||  ||||    
T  5381 atggtcggaggtgtaggactcctttctgatggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactatagagaaagtcaagat 5480  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaa 363  Q
    ||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  5481 gatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaa 5543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 182 - 578
Target Start/End: Original strand, 4912 - 5308
Alignment:
Q  182 gcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaa 281  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||||| ||||| || | |||| |  | ||||| || |    
T  4912 gcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtggggagaaagtgtggtgttggaaccatatttagttcatcaga 5011  T
Q  282 ctactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 381  Q
    | || ||||| ||  |||||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  5012 ccacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaaga 5111  T
Q  382 aggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatt 481  Q
     ||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||     
T  5112 gggagatcatgtgtttctgagaatcactcctatgacgggtgtaggttgtgtgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggttcgtatcagata 5211  T
Q  482 ttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |   | |  ||||||||  |||| ||   ||||||||| || || ||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5212 tctaagagggttggaacactggcatacatagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 5308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 1705 - 1887
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  |||| |  ||| |   | ||||||||||| | ||  | ||||| |||||||    
T  1705 aagttgaagttgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaacgatttaaccgttagaggatttgctaagagtgtgtgtacttgagc 1804  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacct 187  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||  ||||||| ||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  1805 aaggtggagcttgggatagtcacctgtcgttgataaagttcacgtacaacaacaattaccattcgagtattggtatggcacct 1887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 188 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 4281 - 3891
Alignment:
Q  188 ttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactg 287  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||  | |  |||||||||||| | ||||| || || || ||||| ||  | ||| | || ||||| |    
T  4281 ttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactcctatatattggtttgagtcaagagaaagtgtagtgttgggaccggatttagtttatcagactacgg 4182  T
Q  288 agaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggaga 387  Q
    |||||||  |||||||   ||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || |||||    
T  4181 agaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagatggaga 4082  T
Q  388 ccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaa 487  Q
     || |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |  ||     
T  4081 tcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtctgtatcagatatctgag 3982  T
Q  488 aaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |  |||||||| ||||| ||   ||| | ||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3981 agggttggaacagtggcatacatagttgttttgcctccacatctttcgaatttgcattatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 3891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 963 - 1385
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||  | ||||  || || |   ||||||||||  | ||  | ||||| |||    
T  963 ttcgaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcattcggaaaggacgatccaatctttagaggatttactaagagtatgtgtactt 1062  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 200  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  1063 gagcagggtggagcttgggacagtcacctaccattgatagaatttacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgt 1162  T
Q  201 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 300  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||| | || ||||| || || || || || ||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||    
T  1163 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcgagacgggagaaagtgttgtgttggggccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaagat 1262  T
Q  301 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 400  Q
    |||    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  1263 gattagggagaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctg 1362  T
Q  401 agagtcagtcctatgactggtgt 423  Q
    || || | ||||||||| |||||    
T  1363 agggttactcctatgacgggtgt 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 375 - 86
Alignment:
Q  92 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcg 191  Q
    ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||| | |||||||| ||||    
T  375 tgtgtgcttgagcaatgtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaaccgttaccattcgagtatttgtatggcaccgttcg 276  T
Q  192 aggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaa 291  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||||||  | ||||| || ||||| |||||    
T  275 aagctttatatggtcggaggtgcaggaatcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacagagaa 176  T
Q  292 agttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 381  Q
    |||  ||||||||  |||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||| ||||    
T  175 agtcaagatgatcagagagaagatgaaagcatcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagttttagga 86  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 453
Target Start/End: Original strand, 946 - 1091
Alignment:
Q  308 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 407  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || |    
T  946 gagaagatgaaggcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 1045  T
Q  408 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
     |||| |||| ||||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  1046 atcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Original strand, 3547 - 3695
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  3547 aagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagc 3646  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaa 153  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  3647 aaggaggaacttcggatagtcatcttccgttcatagagttcacgtacaa 3695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 247 - 363
Target Start/End: Original strand, 3694 - 3810
Alignment:
Q  247 aagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttat 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3694 aagagtggtcttaggaccagagatagttcagcaaactaacgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttat 3793  T
Q  347 catgacaagcgtagaaa 363  Q
    ||||| |||||||||||    
T  3794 catgataagcgtagaaa 3810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 314 - 578
Target Start/End: Original strand, 1211 - 1475
Alignment:
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||| | |||||    
T  1211 atgaaagcgtctcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactccta 1310  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 513  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||   | |    
T  1311 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcataaaaaat 1410  T
Q  514 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1411 aggtttgccaccacatctttcgaaattgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 1475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Original strand, 4832 - 4965
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4832 aagttgggattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagc 4931  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4932 aaggaggaacttgggatagtcatcttccattgat 4965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 453
Target Start/End: Original strand, 248 - 567
Alignment:
Q  134 ttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 233  Q
    ||||| ||||| || ||||| || | || ||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  248 ttgattgagtttacttacaacaacaattttcattcttgtatcggaatggcaccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 347  T
Q  234 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 333  Q
    ||||||| |||||||| |   | |||||||| ||  ||||  |  | ||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |    
T  348 ttgagtccggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgaaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtag 447  T
Q  334 acaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgct 433  Q
    ||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || |  || ||||||||||| || | |||| |||| ||||| || ||||||    
T  448 acagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgctcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggccgtgct 547  T
Q  434 ttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||| |||  | |||||||||    
T  548 ttggagtgtaggaagttgac 567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Original strand, 18938 - 19119
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |  ||||||| | | ||||| || |||||  ||||||| |||||||    
T  18938 aagttgaggttgcgttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaatgattcagtcgttggaggacttattgagagtttgtgtacttgagc 19037  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacc 186  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038 aaggaggaacttaggatagtcatcttcctttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcacc 19119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 314 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 14349 - 14086
Alignment:
Q  314 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 413  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||||    
T  14349 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcatagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccta 14250  T
Q  414 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 513  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| | ||  |||| |  | ||| |||||||| ||||| ||   |||    
T  14249 tgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtcgaagaagttgactccgaagtttatcggttcgtactagatatctg-aaaggttggaacagtggcatacaaagt 14151  T
Q  514 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  14150 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 14086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 578
Target Start/End: Original strand, 38776 - 39193
Alignment:
Q  161 tatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 260  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || |    
T  38776 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagcgttgtgttgg 38875  T
Q  261 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaa-atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgta 359  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||  | || ||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  38876 gaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgata-aggaaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgaa 38974  T
Q  360 gaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaa 459  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || || || ||| ||||||||| |||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | ||||||||| || ||    
T  38975 gaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgccttgaagtcgaggaagttgactcctaa 39074  T
Q  460 gttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtg 559  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||| | ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||| ||| |||||| | || || |||||     
T  39075 gttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggagcagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcacgaagtgtttcatgtt 39174  T
Q  560 tcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    || || |||||||||||||    
T  39175 tctcagcttcggaagtatg 39193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 393 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 17142 - 16957
Alignment:
Q  393 tgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagt 492  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||| || | |||||||| | ||||| |||    
T  17142 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagt 17043  T
Q  493 tggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |  ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17042 tttaacggtggcgtattgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 19735 - 19876
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   || || |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19735 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggtgaagacaattcagtcgttagaggatttgttgagggtttgtgttcttgagc 19834  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttca 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  19835 aaggaggaacttgggatagtcatctcccattgatagagttca 19876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 370 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1177
Alignment:
Q  370 tgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggt 469  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1385 tgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggt 1286  T
Q  470 ccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttc 569  Q
    |  |||||||| |   | |  |||||||| ||||| ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||    
T  1285 ctgtatcagatatcttagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttc 1186  T
Q  570 ggaagtatg 578  Q
    |||||||||    
T  1185 ggaagtatg 1177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5003 - 4884
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||  |||| |  ||||| | | ||||||||||  ||||  | ||||| |||||||    
T  5003 aagttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttactgagagtgtgtgtacttgagc 4904  T
Q  105 aaggaggaacttgggatagt 124  Q
    |||| ||| ||||| |||||    
T  4903 aaggtggagcttggaatagt 4884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 46601 - 46279
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  46601 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 46502  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  46501 ggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 46402  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| | || ||||| || |||    
T  46401 tagacaaaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtaaatcctgtaaccggtgttggtcgt 46302  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  46301 gctttgaagtgtaggaagttgac 46279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Original strand, 68324 - 68427
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagc 104  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | ||| | ||||||||||||  ||||||  ||||||| | || |||||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  68324 aagttgagattgacttcggcttatcacccacaaatagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttaaaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagc 68423  T
Q  105 aagg 108  Q
    ||||    
T  68424 aagg 68427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 350 - 578
Target Start/End: Original strand, 4217 - 4445
Alignment:
Q  350 gacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagt 449  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  4217 gacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagt 4316  T
Q  450 tgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgt 549  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||||||||   | |  |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  ||||    
T  4317 tgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcaaagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 4416  T
Q  550 tttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     || |||||||||||||||||||||||||    
T  4417 gtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 4445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Original strand, 939 - 988
Alignment:
Q  2 tcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtc 51  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  939 tcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtc 988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 6064 - 6307
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgtt--c 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||||||||  | |||||   |    
T  6064 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagatagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgtgc 6163  T
Q  99 ttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttt 198  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| || | | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||| |||||    
T  6164 ttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctactgctgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtataggtatggcatcgttcgaagcttt 6263  T
Q  199 atatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcag 242  Q
     ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||    
T  6264 gtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcag 6307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7615 - 7497
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || | || |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7615 ccgttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtattggaatggcaccgtttgagactttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgtt 7516  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaag 249  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7515 ggtttgagtcaggtgaaag 7497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 131 - 440
Target Start/End: Original strand, 913 - 1222
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| | |||||  |||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||  |||| |    
T  913 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatacaagtatcagaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccaatgtgtt 1012  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||||| ||||||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1013 ggtttgagttaggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatggtccaagagaagatgaaagcgtctcagag 1112  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| ||  || || || || ||||| ||||| | |||| |||||||||| || |||    
T  1113 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaagatattgagtttctggttggcgatcatgtattttttagagtgaatcctgtgactggtgttggtcgt 1212  T
Q  431 gctttgaagt 440  Q
    ||||||||||    
T  1213 gctttgaagt 1222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 132 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 71665 - 71446
Alignment:
Q  132 cgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctg 231  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||    
T  71665 cgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacactgttgtgttg 71566  T
Q  232 gtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagt 331  Q
    |||||| || || ||||| || || |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  71565 gtttgaatctggagaaagtgttgtgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagt 71466  T
Q  332 cgacaaaagagttatcatga 351  Q
     |||| ||||||||||||||    
T  71465 agacagaagagttatcatga 71446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13532 - 13397
Alignment:
Q  297 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 396  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || | ||||| |||||||| ||  | ||||| ||| ||||||||||||  || || ||||| ||    
T  13532 agatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagctatcatgataaaaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcacgtatt 13433  T
Q  397 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgc 432  Q
     |||||||| | |||| | |||||||| || |||||    
T  13432 cttgagagttaatcctgtaactggtgttggtcgtgc 13397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 419 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 136278 - 136119
Alignment:
Q  419 ggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtt 518  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  136278 ggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtt 136179  T
Q  519 taccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    | || || ||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  136178 ttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcgcaacttcggaagtatg 136119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 136390 - 136278
Alignment:
Q  98 cttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctt 197  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  136390 cttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttacaattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctt 136291  T
Q  198 tatatggtcggag 210  Q
    | |||||||||||    
T  136290 tgtatggtcggag 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 453
Target Start/End: Original strand, 14600 - 14918
Alignment:
Q  135 tgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtt 234  Q
    |||| ||||| || ||||| || |||| |||||||| ||| |||||||| || || |||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||||    
T  14600 tgattgagtttacttacaacaacagttttcattctactatcggaatggctccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtagaacaccgttgtgttggtt 14699  T
Q  235 tgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcga 334  Q
    ||| || || ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  14700 tgaatccggagaaagcgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtaga 14799  T
Q  335 caaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctt 434  Q
    || |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||| |||||||  || || || ||||||||||| || | || | ||||  |||| || |||||||    
T  14800 cagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgaatttcaggttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccagtgttggtcgtgctt 14899  T
Q  435 tgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||  | |||||||||    
T  14900 tgaagtgtaggaagttgac 14918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13355 - 13033
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||| ||| || || || || ||||| |    
T  13355 ccgttgattgagtttacctacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcagaggtgtaggacaccattgtgtt 13256  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| || || || ||||   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  13255 ggtttgaatccggagagagagccttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaaaatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagag 13156  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||| |||||||| |  ||| |||| ||||| || |||    
T  13155 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttgttgagagtgaaccctgtgaccggtgttggtcgt 13056  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  13055 gctttgaagtgtaggaagttgac 13033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 23841 - 23519
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || | || |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |    
T  23841 ccgttgattgagtttacttacaacaacatttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttatgtt 23742  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || || || |   | |||||||| ||| |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  23741 ggtttgagtctggagagagtgctttgttaggaccggaggttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagag 23642  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |   | || |||||||||||||| || | || | |||| || || || |||    
T  23641 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttagtgatcacgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccggagttggtcgt 23542  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  23541 gctttgaagtgtaggaagttgac 23519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 429 - 578
Target Start/End: Original strand, 2023 - 2172
Alignment:
Q  429 gtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgca 528  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||| |  |||||||| ||||| ||  ||||||||||  | || ||    
T  2023 gtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatacagagtgggttttacaccaca 2122  T
Q  529 tctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2123 tctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 2172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 5027 - 5224
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||| ||  ||||| |   ||||| ||||  ||||  | |||||||||    
T  5027 ttcgaagttgaggttaagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtctgagatgacgattcaatctttagagtatttactgagagtgtgtgttctt 5126  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttt 198  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||    
T  5127 gagcaagttggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcatcgttcgaagcttt 5224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 2604 - 2756
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||| ||||  | ||||| |||    
T  2604 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtactt 2703  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaa 153  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  2704 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaa 2756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 3603 - 3284
Alignment:
Q  134 ttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 233  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |  || |||||||| | ||    
T  3603 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaagatgtaagacaccgttgtgttagt 3504  T
Q  234 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 333  Q
    |||| ||||| ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||  || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  3503 ttgaatcaggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactatggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtag 3404  T
Q  334 acaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgct 433  Q
    ||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||  | ||||||||||  || || || |||||||||||||| | |||| |||| ||| | || ||||||    
T  3403 acagaagagttatcatgataagaggagaaaggacatcgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtattggtcgtgct 3304  T
Q  434 ttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    |||||||  | |||||||||    
T  3303 ttgaagtgtaggaagttgac 3284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 149 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14952 - 14661
Alignment:
Q  149 tacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaa 248  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||| || |||||||| || |||||||| ||||||| ||| || || |   ||||||| | |||||||||||||||||    
T  14952 tacaacaacagttttcattcttgtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtccgaggtgtaggatgtcgttgtgtttgtttgagtcaggtgaaa 14853  T
Q  249 gagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatca 348  Q
    | ||  | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || ||| || |||||||  ||||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  14852 gtgttttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaatttaagatgattgaagagaagatgaaagagtctcagagtagacagaagagttatca 14753  T
Q  349 tgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 440  Q
    ||| ||| | || || ||  ||||||||||||  || || || |||||||||||||| | || | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14752 tgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggggatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 14661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 399 - 578
Target Start/End: Original strand, 13380 - 13559
Alignment:
Q  399 tgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaac 498  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||   |||||||| |  || |  ||||||||    
T  13380 tgagagttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttaattggtaagtatcagatatctgagagggttggaac 13479  T
Q  499 ggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
     ||| | ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13480 agtgacatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 13559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 11397 - 11531
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||||||||  | ||||| |||    
T  11397 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagagtgtgtgtactt 11496  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 135  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  11497 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgtt 11531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 6966 - 7091
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   ||||||||||||||||  | ||||| |||    
T  6966 ttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagagtgtgtgtactt 7065  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtca 126  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||    
T  7066 gagcaaggtggagcttgggatagtca 7091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 378
Target Start/End: Original strand, 1293 - 1530
Alignment:
Q  141 agttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 240  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| | ||| || || || |||||||| | |||||||||    
T  1293 agttcacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatgacaccgtttgaggctttgtatggactgaggtgtaggacaccgttgtgttagtttgagtc 1392  T
Q  241 aggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaag 340  Q
    ||||||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || | |||    
T  1393 aggtgaaagtgccttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaag 1492  T
Q  341 agttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttca 378  Q
    ||||||||||| |||   ||||| ||| ||||||||||    
T  1493 agttatcatgataagaagagaaaggatattgagtttca 1530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 453
Target Start/End: Original strand, 28127 - 28447
Alignment:
Q  133 gttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctgg 232  Q
    |||||| ||||| || ||||| || | || |||| ||||||| || ||| |||| || |||||||| |||||| | || || || || || ||||| |||    
T  28127 gttgattgagtttacttacaacaacaattttcatgctagtatcggtatgacaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtaggacaccattgtgttgg 28226  T
Q  233 tttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtc 332  Q
    ||||||||||||||||| |   | ||||||||  |  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| |||||||| |||||||| || || |||     
T  28227 tttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccgaaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcatctcaaagta 28326  T
Q  333 gacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgc 432  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| || | ||| || || ||||||||||| || | || | |||| ||||| || |||||    
T  28327 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagttacaagtaggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgc 28426  T
Q  433 tttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||  | |||||||||    
T  28427 tttgaagtgtaggaagttgac 28447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 378
Target Start/End: Original strand, 26016 - 26263
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||| ||| || || || |||||||| |    
T  26016 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtccgaggtgtaggacaccgttgtgtt 26115  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||| | || ||||||||     | ||||||| |||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  26116 ggttttaatccggtgaaagttctttgttaggactagaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagag 26215  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttca 378  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  26216 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 26263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 25547 - 25465
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgag 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25547 aagttgagattgagttcggcgtatcatccgcaggcagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgag 25465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 24318 - 24005
Alignment:
Q  140 gagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 239  Q
    ||||| || ||||| |||| || |||||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||| ||| || || || |||||||| | ||| ||||    
T  24318 gagtttacttacaacaataattttcattctagtatcggaatgacaccgtttgaggctttgtatggtcagaggtgtaggacaccgttgtgttagttcgagt 24219  T
Q  240 caggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaa 339  Q
    || |||| || |   | |||||||||||  |||| ||  | ||||  || || ||| ||||||| || ||||| || || || || || ||| |||| ||    
T  24218 caagtgagagtgctttgttaggaccagaagttgtccaagagactatggaaaaggttaagatgattcaggagaagattaaagcatctcaaagtagacagaa 24119  T
Q  340 gagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaag 439  Q
    |||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |||||||| ||||| | |||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  24118 gagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttttttagagttaatccggtgactggtgttggtcgtgctttgaag 24019  T
Q  440 tcaaagaagttgac 453  Q
    |  | |||||||||    
T  24018 tgtaggaagttgac 24005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 405
Target Start/End: Original strand, 3806 - 4077
Alignment:
Q  134 ttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 233  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| | |||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||    
T  3806 ttgattgagtttacttacaacaacagtttttattctagtatcggcatggctccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 3905  T
Q  234 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 333  Q
    ||||||| || || || |   | ||| |||| ||  |||| ||  | |||||  | || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| || ||| |    
T  3906 ttgagtccggagagagtgctttgttaagaccggaagttgtgcaagagactacgaaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaaagtag 4005  T
Q  334 acaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 405  Q
    ||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||||||    
T  4006 acataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagt 4077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Original strand, 3734 - 4056
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || || ||||| |    
T  3734 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccattgtgtt 3833  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    ||||||| ||  | || || |   | ||||| |  ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  3834 ggtttgaatccagagagagtgctttgttaggcctggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagag 3933  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |||||||| ||||| | |||| |||| ||||| || |||    
T  3934 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttgatgatcatgtgtttttaagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgt 4033  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||| ||||  | |||||||||    
T  4034 gctttaaagtgtaggaagttgac 4056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 33048 - 33193
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | || |||||||||||| | ||||| |||    
T  33048 ttcgaagttgaggttgagttcgacttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagggtatgtgtgctt 33147  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttca 146  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  33148 gagcaaggtggagcttgggataatcacctaccgttgatagagttca 33193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43982 - 43738
Alignment:
Q  134 ttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 233  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  | |||||||| || |||||||| |||||| |||| || |  || ||| |||| ||||    
T  43982 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcagtatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtatgacaccgctgtgttggt 43883  T
Q  234 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 333  Q
    ||||||| || ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  43882 ttgagtccggagaaagtgctttattaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtag 43783  T
Q  334 acaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttca 378  Q
    ||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  43782 acataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 43738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 15103 - 14782
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 230  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |  || ||||| || |||| ||| |||||| |||| || || || |||||||| |    
T  15103 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcgatatagcaccgtttgaggttttgtatggtaggaggtgtaggacaccgttgtg-t 15005  T
Q  231 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 330  Q
    |||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| |||||||  | ||||| ||||||| ||| |||||    
T  15004 ggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatttaggagaagatgaaggtgtctcagag 14905  T
Q  331 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 430  Q
    | |||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |||||||| || || | |||| |||||||||| || |||    
T  14904 tagacagaaaagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgactggtgttggtcgt 14805  T
Q  431 gctttgaagtcaaagaagttgac 453  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  14804 gctttgaagtgtaggaagttgac 14782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 380
Target Start/End: Original strand, 8748 - 8999
Alignment:
Q  129 ttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtg 228  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||| ||| |||||| |||  || |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||    
T  8748 ttccgttgattgagtttacttacaaaaacagttttcatactaatatcggaatgacacagtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtg 8847  T
Q  229 ctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcag 328  Q
     |||||||| || |  ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||    
T  8848 ttggtttgaatccgaagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcag 8947  T
Q  329 agtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 380  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||| | || || ||  ||||||||||||    
T  8948 agtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcagg 8999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 9407 - 9125
Alignment:
Q  158 agttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtct 257  Q
    |||| |||||||||||| |  ||| |||| || |||||||| |||||||| ||||| ||    |||||||| |||||||||||||||||||| |   | |    
T  9407 agttttcattctagtatcgcgatgacaccgtttgaggctttgtatggtcgaagatgtaggttaccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgctttgt 9308  T
Q  258 taggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcg 357  Q
    ||||||  ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| || | ||||| |||||||| |||      
T  9307 taggacaggaagttgtgcaagagactacagaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagctatcatgataagat 9208  T
Q  358 tagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 440  Q
     ||||| ||| ||||||||||||  || || || || || |||||||| | || | | |||||||| || |||||||||||||    
T  9207 gagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaactggtgttggtcgtgctttgaagt 9125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 41494 - 41344
Alignment:
Q  1 ttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtcatagaggaaaattcagttgctagaggatttgttgaggatttgtgttctt 100  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||  || || |   | ||||||||  ||||  | ||||| |||    
T  41494 ttcgaagttgaggttg--ttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtgctt 41397  T
Q  101 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaa 153  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  41396 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaa 41344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 491 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 45932 - 45845
Alignment:
Q  491 gttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 578  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || |||| ||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  45932 gttggaacagtggcatatagagttggttttccaccacatcattcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 45845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6011 - 5879
Alignment:
Q  308 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 407  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||| ||| |  || || || ||||||||||| || |    
T  6011 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 5912  T
Q  408 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 440  Q
     ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  5911 atcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 5879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10625 - 10493
Alignment:
Q  308 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 407  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || |    
T  10625 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 10526  T
Q  408 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 440  Q
     |||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  10525 atcctttgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 10493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8620 - 8488
Alignment:
Q  308 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 407  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||| ||| |  || || || ||||||||||| || |    
T  8620 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 8521  T
Q  408 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 440  Q
     ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  8520 atcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 8488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14582 - 14478
Alignment:
Q  133 gttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctgg 232  Q
    |||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||    
T  14582 gttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcgccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttgg 14483  T
Q  233 tttga 237  Q
    |||||    
T  14482 tttga 14478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 34022 - 33952
Alignment:
Q  116 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacc 186  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  34022 tgggatagtcacctaccgttgatagagtttacgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcacc 33952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 96 - 17
Alignment:
Q  131 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggag 210  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  96 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggccttgtatggtcggag 17  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 2040 - 1994
Alignment:
Q  5 aagttgagattgagttcggcgtatcatcaacagacagatggtcagtc 51  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  2040 aagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggttagtc 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11071 - 10985
Alignment:
Q  163 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaag 249  Q
    |||||||||||| || ||| |||| || ||| |||| |||||| |||| || ||||| | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  11071 tcattctagtatcgggatgacaccgtttgagactttgtatggtaggaggtgtagaacgctgttgtgttggtatgagtcaggtgaaag 10985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University