View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7042_low_4 (Length: 420)

Name: NF7042_low_4
Description: NF7042
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7042_low_4
NF7042_low_4
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (1-405)||(27272622-27273029)
chr6 (163-405)||(27629913-27630155)
chr6 (1-300)||(22934922-22935218)
chr6 (1-300)||(23857367-23857663)
chr6 (1-294)||(26918241-26918534)
chr6 (1-294)||(26999934-27000227)
chr6 (1-413)||(24304660-24305072)
chr6 (1-300)||(13298993-13299292)
chr6 (1-300)||(15424359-15424658)
chr6 (1-180)||(24863692-24863871)
chr6 (1-182)||(26988974-26989155)
chr6 (1-180)||(16749829-16750008)
chr6 (5-348)||(20160511-20160851)
chr6 (5-348)||(22171980-22172320)
chr6 (1-180)||(29572988-29573167)
chr6 (1-413)||(29549220-29549629)
chr6 (1-294)||(4757622-4757918)
chr6 (1-294)||(4525150-4525440)
chr6 (1-180)||(30558058-30558237)
chr6 (1-150)||(3696086-3696235)
chr6 (1-180)||(16944069-16944248)
chr6 (1-152)||(27044390-27044541)
chr6 (1-144)||(4545817-4545960)
chr6 (1-177)||(27360034-27360210)
chr6 (1-177)||(27450377-27450553)
chr6 (1-177)||(27485107-27485283)
chr6 (1-144)||(4724176-4724319)
chr6 (1-152)||(4773009-4773160)
chr6 (1-292)||(22477315-22477606)
chr6 (1-152)||(26116452-26116603)
chr6 (1-330)||(28162485-28162811)
chr6 (1-144)||(28207465-28207608)
chr6 (1-177)||(26777657-26777836)
chr6 (1-177)||(34463388-34463567)
chr6 (1-177)||(29501393-29501569)
chr6 (1-330)||(13522115-13522441)
chr6 (1-180)||(14143327-14143506)
chr6 (1-180)||(26787919-26788098)
chr6 (1-180)||(27196292-27196471)
chr6 (1-180)||(27252769-27252948)
chr6 (1-330)||(33374298-33374624)
chr6 (1-150)||(16674144-16674293)
chr6 (1-177)||(27007705-27007881)
chr6 (1-330)||(8892352-8892678)
chr6 (1-155)||(27290412-27290566)
chr6 (1-330)||(8903587-8903913)
chr6 (1-180)||(22456976-22457155)
chr6 (241-294)||(4772858-4772911)
chr6 (241-294)||(27360292-27360345)
chr6 (241-294)||(27450635-27450688)
chr6 (254-294)||(16673988-16674028)
chr6 (77-153)||(27629818-27629894)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (1-348)||(16503365-16503712)
chr7 (1-348)||(16518401-16518748)
chr7 (1-174)||(10916853-10917026)
chr7 (1-294)||(11424761-11425054)
chr7 (1-180)||(2154552-2154731)
chr7 (1-294)||(5127857-5128150)
chr7 (2-294)||(16736446-16736738)
chr7 (2-294)||(16751500-16751792)
chr7 (2-294)||(17523397-17523689)
chr7 (2-294)||(17529526-17529818)
chr7 (1-294)||(4145108-4145401)
chr7 (1-294)||(5147325-5147618)
chr7 (1-180)||(9618630-9618809)
chr7 (1-180)||(26275079-26275258)
chr7 (1-180)||(26319854-26320033)
chr7 (1-294)||(45387208-45387501)
chr7 (1-180)||(26669899-26670078)
chr7 (1-348)||(16041137-16041481)
chr7 (1-294)||(26435122-26435415)
chr7 (1-180)||(24592526-24592705)
chr7 (1-152)||(31564375-31564526)
chr7 (1-349)||(16449983-16450328)
chr7 (1-294)||(26537855-26538151)
chr7 (1-177)||(31124902-31125078)
chr7 (1-180)||(2108990-2109169)
chr7 (1-180)||(26484673-26484852)
chr7 (1-150)||(3445315-3445464)
chr7 (1-330)||(31088449-31088775)
chr7 (1-98)||(11441633-11441730)
chr7 (1-180)||(2775338-2775517)
chr7 (1-156)||(39211008-39211163)
chr7 (1-330)||(45733292-45733618)
chr7 (53-413)||(5159268-5159625)
chr7 (53-180)||(18540778-18540905)
chr7 (49-150)||(26485756-26485857)
chr7 (241-294)||(31564624-31564677)
chr7 (254-294)||(3445159-3445199)
chr7 (254-294)||(26485982-26486022)
chr7 (1-29)||(26682985-26683013)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (1-300)||(17013873-17014172)
chr4 (1-300)||(14664891-14665190)
chr4 (1-294)||(14763403-14763696)
chr4 (1-174)||(24592413-24592586)
chr4 (1-177)||(5005869-5006045)
chr4 (1-294)||(27163416-27163709)
chr4 (1-294)||(6569732-6570025)
chr4 (1-348)||(15227698-15228042)
chr4 (1-180)||(40105737-40105916)
chr4 (1-348)||(1900085-1900429)
chr4 (1-180)||(14098534-14098713)
chr4 (1-180)||(31126617-31126796)
chr4 (1-348)||(15285027-15285371)
chr4 (1-152)||(18800712-18800863)
chr4 (1-152)||(54833408-54833559)
chr4 (1-294)||(36344614-36344904)
chr4 (1-150)||(30753777-30753926)
chr4 (1-177)||(33673897-33674076)
chr4 (1-330)||(24460704-24461030)
chr4 (1-291)||(14235624-14235914)
chr4 (1-180)||(21969694-21969873)
chr4 (53-413)||(24112425-24112782)
chr4 (53-413)||(34189111-34189468)
chr4 (1-150)||(39850661-39850810)
chr4 (1-171)||(15391437-15391607)
chr4 (241-413)||(18800961-18801133)
chr4 (254-294)||(33674162-33674202)
chr4 (207-294)||(5005749-5005836)
chr4 (241-294)||(19373140-19373193)
chr4 (254-294)||(39850502-39850542)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-300)||(40168-40467)
scaffold0089 (1-182)||(47084-47265)
scaffold0089 (5-348)||(29573-29916)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-300)||(16283307-16283606)
chr8 (1-182)||(2137317-2137498)
chr8 (1-182)||(27608963-27609144)
chr8 (1-300)||(16277412-16277711)
chr8 (1-180)||(19688076-19688255)
chr8 (1-174)||(14557608-14557781)
chr8 (1-180)||(19208418-19208597)
chr8 (1-288)||(31489808-31490095)
chr8 (2-177)||(19674422-19674597)
chr8 (1-180)||(28362013-28362192)
chr8 (1-294)||(31354388-31354681)
chr8 (2-294)||(18710450-18710742)
chr8 (1-180)||(33258701-33258880)
chr8 (1-152)||(19286468-19286619)
chr8 (1-177)||(3329565-3329741)
chr8 (1-330)||(44562932-44563258)
chr8 (1-330)||(9354453-9354779)
chr8 (1-152)||(12092782-12092933)
chr8 (1-330)||(19659097-19659423)
chr8 (1-177)||(29829303-29829479)
chr8 (1-180)||(33244643-33244822)
chr8 (1-88)||(22080936-22081023)
chr8 (86-177)||(19518280-19518374)
chr8 (241-294)||(19518441-19518494)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (1-300)||(24688153-24688452)
chr5 (1-182)||(23752446-23752627)
chr5 (1-180)||(33777474-33777653)
chr5 (1-182)||(11549339-11549520)
chr5 (1-182)||(23717984-23718165)
chr5 (1-300)||(24969891-24970184)
chr5 (1-182)||(22999110-22999291)
chr5 (1-174)||(30934626-30934799)
chr5 (1-180)||(15658756-15658935)
chr5 (1-300)||(23892073-23892372)
chr5 (1-287)||(41674589-41674875)
chr5 (1-180)||(26480379-26480558)
chr5 (1-294)||(9548539-9548832)
chr5 (1-180)||(2511038-2511217)
chr5 (1-180)||(5637897-5638076)
chr5 (1-180)||(8665471-8665650)
chr5 (1-180)||(9317438-9317617)
chr5 (1-180)||(12132142-12132321)
chr5 (1-180)||(15758853-15759032)
chr5 (1-348)||(22888292-22888636)
chr5 (1-177)||(6874295-6874471)
chr5 (1-180)||(30152005-30152184)
chr5 (1-180)||(30168456-30168635)
chr5 (1-180)||(18375408-18375587)
chr5 (1-411)||(25198788-25199195)
chr5 (1-152)||(18500726-18500877)
chr5 (1-152)||(28649250-28649401)
chr5 (1-177)||(37770983-37771159)
chr5 (1-180)||(33516343-33516522)
chr5 (1-153)||(34616532-34616684)
chr5 (1-180)||(29967062-29967241)
chr5 (1-180)||(30029402-30029581)
chr5 (1-177)||(31431430-31431606)
chr5 (1-177)||(37671479-37671655)
chr5 (1-177)||(37754970-37755146)
chr5 (1-177)||(37358639-37358815)
chr5 (1-180)||(43078236-43078418)
chr5 (1-330)||(11325634-11325960)
chr5 (1-177)||(28959782-28959961)
chr5 (1-174)||(29889078-29889251)
chr5 (1-177)||(31826403-31826582)
chr5 (1-330)||(13184644-13184970)
chr5 (1-294)||(32599468-32599758)
chr5 (1-330)||(33877087-33877413)
chr5 (1-330)||(13440490-13440816)
chr5 (1-177)||(3789531-3789707)
chr5 (1-180)||(40473545-40473727)
chr5 (1-150)||(24681457-24681606)
chr5 (1-150)||(24723984-24724133)
chr5 (53-413)||(33292282-33292639)
chr5 (207-294)||(3789399-3789486)
chr5 (241-294)||(13325080-13325133)
chr5 (241-294)||(24681310-24681363)
chr5 (241-294)||(24723837-24723890)
chr5 (241-294)||(28649099-28649152)
chr5 (1-177)||(13324825-13325001)
chr5 (254-294)||(40473801-40473841)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (1-300)||(27434532-27434831)
chr2 (1-300)||(23128654-23128953)
chr2 (1-182)||(28882186-28882367)
chr2 (1-182)||(12655514-12655695)
chr2 (1-182)||(20837890-20838071)
chr2 (1-180)||(34286328-34286507)
chr2 (1-180)||(34291388-34291567)
chr2 (1-294)||(34279309-34279602)
chr2 (2-177)||(11635275-11635450)
chr2 (2-177)||(11641464-11641639)
chr2 (1-180)||(22926116-22926295)
chr2 (1-413)||(21677270-21677682)
chr2 (1-180)||(34861654-34861833)
chr2 (1-180)||(37685997-37686176)
chr2 (1-180)||(37701262-37701441)
chr2 (1-348)||(21703252-21703596)
chr2 (1-294)||(37925353-37925646)
chr2 (1-294)||(32049658-32049951)
chr2 (1-180)||(31876255-31876434)
chr2 (1-330)||(31891416-31891742)
chr2 (1-180)||(16829426-16829605)
chr2 (1-180)||(16891876-16892055)
chr2 (1-180)||(19416587-19416766)
chr2 (1-330)||(27118515-27118841)
chr2 (1-348)||(19456509-19456853)
chr2 (1-294)||(13936632-13936925)
chr2 (1-150)||(40233515-40233664)
chr2 (1-330)||(34303391-34303717)
chr2 (1-294)||(37375021-37375314)
chr2 (1-330)||(34156838-34157164)
chr2 (1-177)||(39890048-39890227)
chr2 (1-330)||(3784481-3784807)
chr2 (1-330)||(16163426-16163752)
chr2 (1-144)||(260841-260984)
chr2 (1-150)||(12716690-12716839)
chr2 (1-150)||(27777226-27777375)
chr2 (1-150)||(27803711-27803860)
chr2 (1-150)||(27816984-27817133)
chr2 (1-150)||(39051910-39052059)
chr2 (1-171)||(27392952-27393122)
chr2 (1-177)||(9350070-9350249)
chr2 (1-150)||(12586814-12586963)
chr2 (207-294)||(11635483-11635570)
chr2 (207-294)||(11641672-11641759)
chr2 (241-294)||(12716933-12716986)
chr2 (254-294)||(39052169-39052209)
chr2 (254-294)||(40233359-40233399)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (1-306)||(8301407-8301709)
chr3 (1-300)||(18051081-18051380)
chr3 (1-294)||(4796793-4797086)
chr3 (1-300)||(15892846-15893145)
chr3 (1-182)||(4721568-4721749)
chr3 (1-182)||(18330606-18330787)
chr3 (1-182)||(6192253-6192434)
chr3 (1-182)||(15741234-15741415)
chr3 (1-180)||(29148895-29149074)
chr3 (1-174)||(8295917-8296090)
chr3 (1-294)||(18277192-18277485)
chr3 (1-294)||(18292493-18292786)
chr3 (1-294)||(18307794-18308087)
chr3 (1-182)||(35880703-35880884)
chr3 (1-180)||(5609462-5609641)
chr3 (1-180)||(28339241-28339420)
chr3 (1-180)||(31964613-31964792)
chr3 (1-180)||(50134211-50134390)
chr3 (1-177)||(28116094-28116270)
chr3 (2-177)||(4416861-4417036)
chr3 (1-180)||(5713166-5713345)
chr3 (1-180)||(5724076-5724255)
chr3 (1-180)||(5757222-5757401)
chr3 (1-180)||(5768113-5768292)
chr3 (1-294)||(7996387-7996680)
chr3 (1-294)||(10642895-10643188)
chr3 (1-180)||(47023392-47023571)
chr3 (1-294)||(7073037-7073330)
chr3 (1-413)||(22387718-22388127)
chr3 (1-182)||(10396070-10396251)
chr3 (1-180)||(17985096-17985275)
chr3 (1-348)||(16626646-16626990)
chr3 (1-182)||(21674630-21674811)
chr3 (1-180)||(18225130-18225309)
chr3 (1-156)||(18530351-18530506)
chr3 (1-180)||(24328098-24328277)
chr3 (1-177)||(6542602-6542778)
chr3 (1-180)||(5013651-5013830)
chr3 (1-177)||(18242681-18242857)
chr3 (1-177)||(36997217-36997396)
chr3 (1-330)||(17993924-17994250)
chr3 (1-294)||(5466810-5467103)
chr3 (1-177)||(5596497-5596673)
chr3 (1-153)||(22870996-22871148)
chr3 (1-153)||(22886055-22886207)
chr3 (1-153)||(28021241-28021393)
chr3 (1-180)||(32292691-32292870)
chr3 (1-108)||(51782034-51782141)
chr3 (1-413)||(8211447-8211856)
chr3 (1-153)||(4346827-4346979)
chr3 (1-330)||(4625736-4626062)
chr3 (1-180)||(31034257-31034436)
chr3 (1-150)||(48465896-48466045)
chr3 (1-108)||(51797123-51797231)
chr3 (1-330)||(5652179-5652505)
chr3 (1-150)||(11110489-11110638)
chr3 (53-413)||(32438863-32439220)
chr3 (1-150)||(20576987-20577136)
chr3 (1-177)||(29665110-29665289)
chr3 (53-300)||(4893032-4893276)
chr3 (207-294)||(28116303-28116390)
chr3 (207-294)||(29665331-29665418)
chr3 (207-413)||(22871220-22871426)
chr3 (207-413)||(22886279-22886485)
chr3 (254-294)||(21674518-21674558)
chr3 (254-294)||(48465740-48465780)
chr3 (254-294)||(51781836-51781876)
chr3 (254-294)||(51796925-51796965)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-182)||(27268-27449)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-294)||(228-522)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (1-294)||(41793407-41793700)
chr1 (1-180)||(10962647-10962826)
chr1 (1-180)||(28584958-28585137)
chr1 (1-180)||(51638195-51638374)
chr1 (1-330)||(20340434-20340760)
chr1 (1-231)||(16208130-16208354)
chr1 (1-180)||(28151839-28152018)
chr1 (1-156)||(20461082-20461237)
chr1 (212-348)||(20460917-20461053)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-180)||(7338-7517)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-180)||(9165-9344)
scaffold0159 (1-180)||(19993-20172)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-180)||(15029-15208)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-180)||(26300-26480)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (1-300)||(30311-30609)
scaffold0124 (1-171)||(20375-20545)
scaffold0124 (212-348)||(20222-20358)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-144)||(7963-8106)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (1-153)||(9571-9723)
scaffold0336 (224-294)||(8096-8166)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (1-156)||(46907-47072)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (8-152)||(6015-6162)
scaffold0415 (1-88)||(2016-2103)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-330)||(2757-3083)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (59-237)||(1-188)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (1-174)||(127-300)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-78)||(21641-21718)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 27272622 - 27273029
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27272622 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcgacggatcaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctctggagtaga 27272721  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgtt---gttgttgttgaactgatggttgctgtggct 197  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  27272722 gtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctgacttgctgattctgttgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggct 27272821  T
Q  198 tctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgc 297  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |    
T  27272822 tctgctgcacaatagcattcacaggtacttgaggtggtcctgatggcaaaggatactaatagtaaaatggcgggtagaatggatgttgagaatacggtac 27272921  T
Q  298 ataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgtaggctgacctgttccagaggataccattccaacctctgtttccttc 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27272922 ataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgtagtctgacctgctccagaggataccattccaacctctgtttccttc 27273021  T
Q  398 ttcttgtg 405  Q
    ||||||||    
T  27273022 ttcttgtg 27273029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 163 - 405
Target Start/End: Original strand, 27629913 - 27630155
Alignment:
Q  163 ctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaa 262  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27629913 ctgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaa 27630012  T
Q  263 aatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgtaggctgacctg 362  Q
    || || |||||||| ||||| ||||| || |||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27630013 aacggtgggaagaatggatgctgagaatatggtgtacaggggtatggtggaggtagctgagcaacattaacaggggcgacagtagccgtagactgacctg 27630112  T
Q  363 ttccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtg 405  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27630113 ctcccgaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtg 27630155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 22934922 - 22935218
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22934922 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaa 22935021  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  22935022 gtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgatt---ttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatct 22935118  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  |||| ||||| ||||||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  22935119 gttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcata 22935218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 23857367 - 23857663
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23857367 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaa 23857466  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  23857467 gtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgatt---ttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatct 23857563  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  |||| ||||| ||||||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  23857564 gttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcata 23857663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26918534 - 26918241
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918534 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 26918435  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  26918434 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcgtct 26918335  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  26918334 gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 26918241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27000227 - 26999934
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27000227 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 27000128  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  27000127 gttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatct 27000028  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  27000027 gttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 26999934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Original strand, 24304660 - 24305072
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304660 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 24304759  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || |||  | |||    
T  24304760 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggaaactgttgtttcatct 24304859  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  | || ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  ||||    
T  24304860 gttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacata 24304959  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgtaggctgacctgttccagaggataccattccaacctctgtttccttcttc 400  Q
     | |||||  ||||| |  || |||||||| | ||| |||||||||||  | |  ||||| | |||||  || ||||| || || || ||||| ||||||    
T  24304960 tgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttc 24305059  T
Q  401 ttgtgatgtccat 413  Q
    ||||| |||||||    
T  24305060 ttgtggtgtccat 24305072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 13298993 - 13299292
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13298993 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 13299092  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || |||  | |||    
T  13299093 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatct 13299192  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  | || ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  13299193 gttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcata 13299292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 15424359 - 15424658
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15424359 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaa 15424458  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     || |||  | |||    
T  15424459 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttcaactggcaactgttgtttcatct 15424558  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  | || ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  15424559 gttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcata 15424658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24863871 - 24863692
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24863871 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 24863772  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24863771 gttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 24863692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26989155 - 26988974
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26989155 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaa 26989056  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26989055 gtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgatgttgttgaactg 26988974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16750008 - 16749829
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16750008 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaa 16749909  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16749908 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 16749829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20160851 - 20160511
Alignment:
Q  5 tggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtca 104  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||      
T  20160851 tggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttg 20160752  T
Q  105 gaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttctgctg 204  Q
    | || |||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||| ||| || ||  | || |||||    
T  20160751 ggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttg---ctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctg 20160655  T
Q  205 cacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggag 304  Q
      |||| ||||| ||||||||||||||| | || | ||| | |||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||  ||||| |   |    
T  20160654 agcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacagg 20160555  T
Q  305 tatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagc 348  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20160554 tatggtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagc 20160511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 348
Target Start/End: Original strand, 22171980 - 22172320
Alignment:
Q  5 tggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtca 104  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||      
T  22171980 tggaaatcacacttgagatcggaacagaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccttgcctggttgtgcaatgccctctgtgaagtaaagttg 22172079  T
Q  105 gaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttctgctg 204  Q
    | || |||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||| ||| || ||  | || |||||    
T  22172080 ggagtaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttg---ctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctg 22172176  T
Q  205 cacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggag 304  Q
      |||| ||||| ||||||||||||||| | || | ||| | |||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||  ||||| |   |    
T  22172177 agcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagtaatgtgcaaacagg 22172276  T
Q  305 tatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagc 348  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22172277 tatggtggaggtaattgagtagcattaacaggggcaacagtagc 22172320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 29573167 - 29572988
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  29573167 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 29573068  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29573067 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 29572988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 29549629 - 29549220
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  29549629 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaga 29549530  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||   ||| || |||||||||||||  ||||| ||| ||  ||    
T  29549529 gttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcgtattg---ctgctgctgttgttgaactggcggttgatgttgcacct 29549433  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  29549432 gttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacata 29549333  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgtaggctgacctgttccagaggataccattccaacctctgtttccttcttc 400  Q
     | |||||  ||||| |  ||||| ||||| | ||| || || |||||  |||  ||||| | |||||  || ||||| || || || ||||| ||||||    
T  29549332 tgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttc 29549233  T
Q  401 ttgtgatgtccat 413  Q
    |||||||||||||    
T  29549232 ttgtgatgtccat 29549220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4757918 - 4757622
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4757918 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaa 4757819  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagctt---gctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggct 197  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  |   |||| | |||||||||||||||||| |     || |||  |     
T  4757818 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttca 4757719  T
Q  198 tctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    |||| ||  |||| ||||| ||||| || |||||  | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  4757718 tctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacgg 4757622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4525440 - 4525150
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||| | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  4525440 ttgatgaaagtcacatttgggatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcaatgtcctctctggagtaaa 4525341  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | |||   ||| || || ||||||||||  ||||| ||| |   ||    
T  4525340 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactg---ctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacct 4525244  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  | || ||||| || || ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  4525243 gttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 4525150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 30558058 - 30558237
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  30558058 ttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaag 30558157  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30558158 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 30558237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3696235 - 3696086
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  3696235 ttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaa 3696136  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  3696135 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 16944069 - 16944248
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  16944069 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaga 16944168  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16944169 gttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgctgttgaac 16944248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27044541 - 27044390
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27044541 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 27044442  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  27044441 gttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 27044390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 4545817 - 4545960
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  4545817 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaga 4545916  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagt 144  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  4545917 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 4545960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 27360034 - 27360210
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  27360034 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaga 27360133  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| | |||||||||||||||    
T  27360134 gttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttgttg 27360210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 27450377 - 27450553
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  27450377 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaga 27450476  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| | |||||||||||||||    
T  27450477 gttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttgttg 27450553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27485283 - 27485107
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27485283 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaa 27485184  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| | |||||||||||||||    
T  27485183 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttgttg 27485107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 4724176 - 4724319
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| |    
T  4724176 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaga 4724275  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagt 144  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  4724276 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 4724319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 4773160 - 4773009
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||    
T  4773160 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 4773061  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4773060 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4773009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 22477315 - 22477606
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| | |  | |||| |    
T  22477315 ttgatggaaatcacacttgaggttagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccatatgagaagtaga 22477414  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || |||||  |||||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||| | ||  || ||| || | |    
T  22477415 gtcgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttgaaccggtgactgttgttgcattt 22477514  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtac 292  Q
    | ||  |||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  22477515 gttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtac 22477606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 26116452 - 26116603
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  26116452 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaa 26116551  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||| |||| |  ||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  26116552 gtcggaagaagttctgcatacaacatcggtataggaggaaaagttggtctag 26116603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28162811 - 28162485
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  28162811 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaagtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 28162712  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||   ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  28162711 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 28162615  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  28162614 gctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcata 28162515  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| | |||||||||||||||||||||    
T  28162514 cgggtacgatggaggtagctgagcagcatt 28162485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28207608 - 28207465
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| |    
T  28207608 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaga 28207509  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagt 144  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28207508 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 28207465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 26777657 - 26777836
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  26777657 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaga 26777756  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc---ttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||   |||||| | ||| |||||||||||    
T  26777757 gttggaagaagttcggcatacaacatcggtataggagggaaggttggtctagcatattgctgctgctgctgttgttgttg 26777836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 34463388 - 34463567
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||||    
T  34463388 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggctttccttgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 34463487  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc---ttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    |||||| | |||||||||||||||    
T  34463488 gttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttg 34463567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29501569 - 29501393
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  29501569 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaga 29501470  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||  | ||| | ||| |||||||||||    
T  29501469 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttg 29501393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 13522115 - 13522441
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  13522115 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 13522214  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  13522215 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 13522311  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  13522312 gctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 13522411  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  13522412 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 13522441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 14143327 - 14143506
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  || ||||||||  | |||| |    
T  14143327 ttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtaga 14143426  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || |||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||    
T  14143427 gtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaac 14143506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26788098 - 26787919
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  || ||||||||  | |||| |    
T  26788098 ttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtaga 26787999  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || |||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||    
T  26787998 gtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaac 26787919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27196471 - 27196292
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  || ||||||||  | |||| |    
T  27196471 ttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtaga 27196372  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || |||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||    
T  27196371 gtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaac 27196292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 27252769 - 27252948
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  || ||||||||  | |||| |    
T  27252769 ttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgcgcagtgccctctgagaagtaga 27252868  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || |||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||    
T  27252869 gtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaac 27252948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 33374298 - 33374624
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  33374298 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 33374397  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  33374398 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 33374494  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  33374495 gctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 33374594  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  33374595 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 33374624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16674293 - 16674144
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||    
T  16674293 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 16674194  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16674193 gttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 16674144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27007881 - 27007705
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||    
T  27007881 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 27007782  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| | ||| |||||||||||    
T  27007781 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttg 27007705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 8892352 - 8892678
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  8892352 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 8892451  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  8892452 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 8892548  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  8892549 gctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 8892648  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  8892649 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8892678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 27290412 - 27290566
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| |    
T  27290412 ttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacttgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtaga 27290511  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagctt 155  Q
    ||| | ||||||||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||||    
T  27290512 gtcgggagcaactcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagctt 27290566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 8903587 - 8903913
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  8903587 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 8903686  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  8903687 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 8903783  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||| || ||||| || |||||  |||| ||||||||  | |||||    
T  8903784 gctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgcgcata 8903883  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  8903884 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 8903913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 22456976 - 22457155
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| | |  | |||| |    
T  22456976 ttgatggaaatcacacttgaggtaagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccttatgagaagtaga 22457075  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||| | || |||||  |||||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||    
T  22457076 gtcgggagtaactcggcatacatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttgaac 22457155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4772911 - 4772858
Alignment:
Q  241 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  4772911 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacgg 4772858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Original strand, 27360292 - 27360345
Alignment:
Q  241 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  27360292 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacgg 27360345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Original strand, 27450635 - 27450688
Alignment:
Q  241 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  27450635 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacgg 27450688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16674028 - 16673988
Alignment:
Q  254 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  16674028 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 16673988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 153
Target Start/End: Original strand, 27629818 - 27629894
Alignment:
Q  77 gtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 153  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  27629818 gtacaatgacctctctgaagtaatgttggaagtaaatcagcatacaacatcgggattggaggaaaagtaggcctagc 27629894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 16503365 - 16503712
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503365 ttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 16503464  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   | || |||  | |||    
T  16503465 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatct 16503564  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  |||| ||||| ||||||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16503565 gttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcata 16503664  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagc 348  Q
     | |||||  ||||| |  || |||||||||| ||| || ||||||||    
T  16503665 tgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagc 16503712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 16518401 - 16518748
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518401 ttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 16518500  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   | || |||  | |||    
T  16518501 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatct 16518600  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  |||| ||||| ||||||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16518601 gttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcata 16518700  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagc 348  Q
     | |||||  ||||| |  || |||||||||| ||| || ||||||||    
T  16518701 tgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagc 16518748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 10916853 - 10917026
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10916853 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 10916952  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttg 174  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10916953 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 10917026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 11424761 - 11425054
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11424761 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtgcaatgccctctatggagtaaa 11424860  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || |||  | |||    
T  11424861 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatct 11424960  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  | || ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  11424961 gttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 11425054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2154731 - 2154552
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154731 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 2154632  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2154631 gttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtatgtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 2154552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5128150 - 5127857
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128150 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggattaggtgggggcttaccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 5128051  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  5128050 gttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatct 5127951  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  5127950 gttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 5127857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Original strand, 16736446 - 16736738
Alignment:
Q  2 tgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaag 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16736446 tgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaag 16736545  T
Q  102 tcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttctg 201  Q
    |  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | ||||    
T  16736546 ttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctg 16736645  T
Q  202 ctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
     ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16736646 ttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 16736738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Original strand, 16751500 - 16751792
Alignment:
Q  2 tgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaag 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16751500 tgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaag 16751599  T
Q  102 tcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttctg 201  Q
    |  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | ||||    
T  16751600 ttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctg 16751699  T
Q  202 ctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
     ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16751700 ttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 16751792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17523689 - 17523397
Alignment:
Q  2 tgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaag 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17523689 tgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaag 17523590  T
Q  102 tcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttctg 201  Q
    |  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | ||||    
T  17523589 ttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctg 17523490  T
Q  202 ctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
     ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  17523489 ttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 17523397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Original strand, 17529526 - 17529818
Alignment:
Q  2 tgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaag 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17529526 tgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaag 17529625  T
Q  102 tcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttctg 201  Q
    |  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | ||||    
T  17529626 ttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctg 17529725  T
Q  202 ctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
     ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  17529726 ttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 17529818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 4145108 - 4145401
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4145108 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 4145207  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||| ||| |   ||    
T  4145208 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacct 4145307  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  4145308 gttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 4145401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 5147325 - 5147618
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5147325 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 5147424  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |     || |||  | |||    
T  5147425 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgttgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatct 5147524  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  5147525 gttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 5147618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9618809 - 9618630
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9618809 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 9618710  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9618709 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 9618630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 26275079 - 26275258
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26275079 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 26275178  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26275179 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 26275258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 26319854 - 26320033
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26319854 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 26319953  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26319954 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 26320033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 45387501 - 45387208
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  45387501 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 45387402  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  45387401 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatct 45387302  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  45387301 gttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 45387208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 26669899 - 26670078
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26669899 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttgggggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 26669998  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26669999 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 26670078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16041481 - 16041137
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |    
T  16041481 ttgatggaaatcacactttaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtaga 16041382  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || |||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||| ||| || ||| || | |    
T  16041381 gtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcattt 16041285  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  | ||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  16041284 gctgaacgacggaattaacgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcata 16041185  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagc 348  Q
     | ||| |  ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  16041184 tgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagc 16041137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26435415 - 26435122
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  26435415 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaga 26435316  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || |||  | |||    
T  26435315 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatct 26435216  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  26435215 gttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 26435122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 24592526 - 24592705
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  24592526 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaga 24592625  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24592626 gttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaac 24592705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 31564375 - 31564526
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31564375 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaa 31564474  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  31564475 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 31564526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 16449983 - 16450328
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |    
T  16449983 ttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtaga 16450082  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || |||||  |||| | ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||   ||| ||||| |||||| ||| ||| || ||| ||   |    
T  16450083 gtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgttgctgttgagctggtggctgttgttgcactt 16450179  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| | ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | || ||    
T  16450180 gctgaacgacggcattaatgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgta 16450279  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagct 349  Q
     | ||| |  ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  16450280 cgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagct 16450328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 26537855 - 26538151
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  26537855 ttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgcacaatgccctctctggagtaaa 26537954  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc---ttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggct 197  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    |||||| | |||||||||||||||||| |     || |||  |     
T  26537955 gttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttca 26538054  T
Q  198 tctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    |||| ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | |||||  || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  26538055 tctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 26538151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31125078 - 31124902
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31125078 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaa 31124979  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| | |||||||||||||||    
T  31124978 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttgttg 31124902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 2108990 - 2109169
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||| |    
T  2108990 ttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtaga 2109089  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || |||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||    
T  2109090 gtcgggagcaactcagcatatatcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaac 2109169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26484852 - 26484673
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||| |    
T  26484852 ttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtaga 26484753  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || |||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||    
T  26484752 gtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaac 26484673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3445464 - 3445315
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  3445464 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaga 3445365  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  3445364 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 3445315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 31088449 - 31088775
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  31088449 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 31088548  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  31088549 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 31088645  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  31088646 gctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 31088745  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  31088746 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 31088775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 11441730 - 11441633
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagta 98  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11441730 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagta 11441633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2775517 - 2775338
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||| |    
T  2775517 ttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtaga 2775418  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||| | ||| ||||| |||| | ||| |||||  |||| || ||||||||||| || || | |||| ||||||| |||||    
T  2775417 gtcgggagctactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttggtgaac 2775338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 39211008 - 39211163
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||| |    
T  39211008 ttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggaagcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtaga 39211107  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 156  Q
    ||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || ||||||||||||||    
T  39211108 gtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttg 39211163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 45733618 - 45733292
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  45733618 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 45733519  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    || |  || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  45733518 gttaagagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 45733422  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  45733421 gctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 45733322  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  45733321 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 45733292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 5159625 - 5159268
Alignment:
Q  53 ggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  5159625 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 5159526  T
Q  153 cttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggata 252  Q
    | |  ||   ||| || || ||||||||||  ||||| ||| ||  ||| ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| ||    
T  5159525 catattg---ctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggta 5159429  T
Q  253 ttgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgta 352  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |  || || | |||||||||||| | ||| || ||||||||  |     
T  5159428 ctgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatg 5159329  T
Q  353 ggctgacctgttccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 413  Q
    |   ||   ||||||| || || |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  5159328 gatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtgatgtccat 5159268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18540905 - 18540778
Alignment:
Q  53 ggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||| |||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  18540905 ggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtagagtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaagtaggtctag 18540806  T
Q  153 cttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    |||| || | |||| ||||||| |||||    
T  18540805 cttgttgctgctgtcgttgttggtgaac 18540778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 150
Target Start/End: Original strand, 26485756 - 26485857
Alignment:
Q  49 atcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggt 148  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  26485756 atcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggt 26485855  T
Q  149 ct 150  Q
    ||    
T  26485856 ct 26485857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Original strand, 31564624 - 31564677
Alignment:
Q  241 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  31564624 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacgg 31564677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3445199 - 3445159
Alignment:
Q  254 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  3445199 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 3445159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 294
Target Start/End: Original strand, 26485982 - 26486022
Alignment:
Q  254 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  26485982 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 26486022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 26682985 - 26683013
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacc 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26682985 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacc 26683013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17014172 - 17013873
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17014172 ttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctttggagtaaa 17014073  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || |||  | |||    
T  17014072 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatct 17013973  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  17013972 gttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcata 17013873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14665190 - 14664891
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14665190 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaa 14665091  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || |||  | |||    
T  14665090 gttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatct 14664991  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  | || ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  14664990 gttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcata 14664891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 14763403 - 14763696
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14763403 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 14763502  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||| ||| ||  ||    
T  14763503 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacct 14763602  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  14763603 gttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 14763696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 24592413 - 24592586
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592413 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 24592512  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttg 174  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24592513 gttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 24592586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5006045 - 5005869
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5006045 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccttgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 5005946  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5005945 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 5005869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 27163416 - 27163709
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27163416 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 27163515  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  27163516 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatct 27163615  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27163616 gttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 27163709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6570025 - 6569732
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6570025 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaga 6569926  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||     || |||  | |||    
T  6569925 gttggaagaagttctgcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgctgttgaactggcatctgttgtttcatct 6569826  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  6569825 gttgggcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 6569732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15228042 - 15227698
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |||| |    
T  15228042 ttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaatggatcaggtggaggcttaccctgtctggttgtacagtgccctctgagaagtaga 15227943  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || |||||  |||| | ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||   ||| |||||||||||| ||| ||| || ||| || | |    
T  15227942 gtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcattt 15227846  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || | |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  15227845 gctgaacgacagcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 15227746  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagc 348  Q
     | ||| |  ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  15227745 cgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagc 15227698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 40105737 - 40105916
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  40105737 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaa 40105836  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40105837 gttggaagaagttcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 40105916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1900429 - 1900085
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||  | |||| |    
T  1900429 ttgatggaaatcacacttgaggtcagaacgaaacctgagaagcaacggatcaggtggaggcttaccatgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtaga 1900330  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || |||||  |||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||| ||| || ||| || | |    
T  1900329 gtcgggagtaactcggcatacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgttgttgctgttgaactggtggctgttgttgcattt 1900233  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  1900232 gctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcata 1900133  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagc 348  Q
     | ||| |  ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  1900132 tgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagc 1900085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14098713 - 14098534
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14098713 ttgatgaaaatcacatttgagatcagtcctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaga 14098614  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14098613 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 14098534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 31126617 - 31126796
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  31126617 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaga 31126716  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31126717 gttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 31126796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 15285027 - 15285371
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |    
T  15285027 ttgatggaaatcacacttgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtaga 15285126  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || ||||| | ||| | ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||  || ||| || ||| || | |    
T  15285127 gtcgggagtaactcgaaatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgttgttgttgagttggtggctgttgttgcattt 15285223  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||||||| | || ||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  15285224 gctgaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcata 15285323  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagc 348  Q
     | |||   |||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  15285324 tgggtacaatggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagc 15285371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 18800712 - 18800863
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  18800712 ttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaa 18800811  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  18800812 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 18800863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 54833559 - 54833408
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  54833559 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 54833460  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  54833459 gttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 54833408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 36344614 - 36344904
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||    
T  36344614 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaacctcggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 36344713  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  |  ||   ||| || || ||||||||||  ||||| ||| ||  ||    
T  36344714 gttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattg---ctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacct 36344810  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | |||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  36344811 gttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacgg 36344904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 30753926 - 30753777
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  30753926 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaga 30753827  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  30753826 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 30753777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 33673897 - 33674076
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  33673897 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 33673996  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc---ttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |    |||||| | |||||||||||||||    
T  33673997 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttg 33674076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 24460704 - 24461030
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  24460704 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 24460803  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  24460804 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 24460900  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  24460901 gctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 24461000  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  24461001 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 24461030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 14235624 - 14235914
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || | || | |    
T  14235624 ttgatggaaatcacatttgaggtcgaaatggaacctgggaggcaaagggttaggtggaggcttgccctgtctggttgtacagtgccctttaagaagcaga 14235723  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | |||| |||  |||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||| || | ||| |||||||| ||| | |  || || ||| || | |    
T  14235724 gtcgggagcagctcggcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgttgctgctgttgttgctgagccggcggctgttgttgcattt 14235823  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagta 291  Q
    ||||  |||| ||||| ||||||||||  ||  | || ||||| | ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  14235824 gctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagta 14235914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21969873 - 21969694
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||| |    
T  21969873 ttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtacaatgtcctctctggagtaga 21969774  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21969773 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 21969694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 24112782 - 24112425
Alignment:
Q  53 ggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  24112782 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 24112683  T
Q  153 cttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggata 252  Q
    | |  ||   ||| || || ||||||||||  ||||| ||| ||  ||| ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| ||    
T  24112682 catattg---ctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggta 24112586  T
Q  253 ttgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgta 352  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |  || || | |||||||||||| ||||| || ||||||||  |     
T  24112585 ctgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttg 24112486  T
Q  353 ggctgacctgttccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 413  Q
    |   ||   ||||||| || || |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  24112485 gatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtgatgtccat 24112425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 413
Target Start/End: Original strand, 34189111 - 34189468
Alignment:
Q  53 ggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  34189111 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 34189210  T
Q  153 cttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggata 252  Q
    | |  ||   ||| || || ||||||||||  ||||| ||| ||  ||| ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| ||    
T  34189211 catattg---ctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggta 34189307  T
Q  253 ttgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgta 352  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |  || || | |||||||||||| | ||| |||||||||||  |     
T  34189308 ctgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcgacagtagccttg 34189407  T
Q  353 ggctgacctgttccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 413  Q
    |   ||   ||||||| || || |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  34189408 gatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtgatgtccat 34189468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 39850810 - 39850661
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  39850810 ttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 39850711  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  39850710 gttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39850661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 15391437 - 15391607
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||| || |||||||| || | |||||||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||| |  | || |||    
T  15391437 ttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttcccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaa 15391536  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttg 171  Q
    ||| | ||||||||  | |||| ||| ||||| ||||| || |||||||| | ||| || | |||||||||    
T  15391537 gtcgggagcaactcggcgtacagcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgctgctgttgttg 15391607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 413
Target Start/End: Original strand, 18800961 - 18801133
Alignment:
Q  241 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcg 340  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||| | |||||  ||||| |  ||||| ||||| | ||| ||     
T  18800961 tggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgca 18801060  T
Q  341 acagtagctgtaggctgacctgttccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 413  Q
    ||||||||  |||  ||||| | |||||  || ||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18801061 acagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttctgtttctttcttcttgtggtgtccat 18801133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 294
Target Start/End: Original strand, 33674162 - 33674202
Alignment:
Q  254 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33674162 tgatggtaaaatggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 33674202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5005836 - 5005749
Alignment:
Q  207 caatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  5005836 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 5005749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19373193 - 19373140
Alignment:
Q  241 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  19373193 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 19373140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39850542 - 39850502
Alignment:
Q  254 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  39850542 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 39850502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 40168 - 40467
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40168 ttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctggggggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 40267  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  40268 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatct 40367  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  |||| ||||| ||||||||||||||| | || | ||||||||| || ||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  40368 gttgagcaattgcatttacgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcata 40467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 47084 - 47265
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47084 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaa 47183  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47184 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 47265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29916 - 29573
Alignment:
Q  5 tggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtca 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29916 tggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcg 29817  T
Q  105 gaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttctgctg 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |     || |||  | |||| ||    
T  29816 gaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttg 29717  T
Q  205 cacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggag 304  Q
      | || ||||| |||||||| |||||| | || | ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |    
T  29716 agctattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacggg 29617  T
Q  305 tatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagc 348  Q
    || | |||||| |  || |||||||||| ||| || ||||||||    
T  29616 tacgatggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagc 29573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16283606 - 16283307
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16283606 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctaaggagtaaa 16283507  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  16283506 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatct 16283407  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  |||| ||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16283406 gttgagcaattgcattaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcata 16283307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 2137317 - 2137498
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2137317 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 2137416  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2137417 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 2137498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 27608963 - 27609144
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608963 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 27609062  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27609063 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 27609144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16277711 - 16277412
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277711 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 16277612  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || |||  | |||    
T  16277611 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatct 16277512  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  | || ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16277511 gttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcata 16277412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19688255 - 19688076
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688255 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 19688156  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19688155 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 19688076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14557781 - 14557608
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557781 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgagggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 14557682  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttg 174  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14557681 gttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 14557608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 19208418 - 19208597
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19208418 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 19208517  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19208518 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 19208597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 31489808 - 31490095
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31489808 ttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 31489907  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |     ||||||  | |||    
T  31489908 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgctgtttcatct 31490007  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgaga 288  Q
    | ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  31490008 gttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31490095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19674597 - 19674422
Alignment:
Q  2 tgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaag 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19674597 tgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaag 19674498  T
Q  102 tcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    |  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19674497 ttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 19674422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 28362013 - 28362192
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28362013 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 28362112  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28362113 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 28362192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31354681 - 31354388
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31354681 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaaaggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 31354582  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||| ||| |   ||    
T  31354581 gttggaagcaactcggcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacct 31354482  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  31354481 gttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 31354388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18710742 - 18710450
Alignment:
Q  2 tgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaag 101  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18710742 tgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgagggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaag 18710643  T
Q  102 tcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttctg 201  Q
    |  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |  || | ||| || ||||||||||| |     || |||  | ||||    
T  18710642 ttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctg 18710543  T
Q  202 ctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
     ||  |||  ||||| ||||| ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  18710542 ttgagcaactgcattgacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 18710450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 33258880 - 33258701
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  33258880 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaga 33258781  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33258780 gttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaac 33258701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19286619 - 19286468
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19286619 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttgccctgcctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 19286520  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  19286519 gttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctag 19286468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 3329565 - 3329741
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||    
T  3329565 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 3329664  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| | ||| |||||||||||    
T  3329665 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttg 3329741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 44563258 - 44562932
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  44563258 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 44563159  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||   ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  44563158 gtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 44563062  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| ||    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  44563061 gctgaacggcggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcata 44562962  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  44562961 cgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 44562932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 9354779 - 9354453
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  |||||| |    
T  9354779 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtaga 9354680  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  9354679 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 9354583  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  9354582 gctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 9354483  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  9354482 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 9354453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 12092782 - 12092933
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  12092782 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaga 12092881  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  12092882 gttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 12092933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 19659097 - 19659423
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| |  | |||| |    
T  19659097 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtaga 19659196  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || ||   ||| ||| |||||||| |||  ||||| ||| || |      
T  19659197 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggttgttgttgcattc 19659293  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  19659294 gctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 19659393  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  19659394 cgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 19659423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 29829479 - 29829303
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29829479 ttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctggtggtacaatgccctctctggagtaaa 29829380  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| |  ||  | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| | ||| |||||||||||    
T  29829379 gttggaagaagttctgcgtacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttg 29829303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 33244822 - 33244643
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| | ||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| |  | |||| |    
T  33244822 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttaggaggcgacgggtcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagcgccctttgagaagtaga 33244723  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||| | || || |||||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||| || || | |||| ||||||| |||||    
T  33244722 gtcgggagtaattcaacatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttggtgaac 33244643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 22080936 - 22081023
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccct 88  Q
    |||||||||||| || |||||||| || | |||||||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  22080936 ttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggctttccctgcctggttgtgcagtgccct 22081023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 177
Target Start/End: Original strand, 19518280 - 19518374
Alignment:
Q  86 cctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc---ttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    |||||| | |||||||||||||||    
T  19518280 cctctctggagtaaagttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttg 19518374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Original strand, 19518441 - 19518494
Alignment:
Q  241 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19518441 tggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 19518494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 24688153 - 24688452
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688153 ttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 24688252  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || |||  | |||    
T  24688253 gtcggaagcaactcagcatacaatatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatct 24688352  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  |||| | ||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  24688353 gttgagcaattgtattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcata 24688452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 23752446 - 23752627
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752446 ttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 23752545  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23752546 gtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 23752627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 33777653 - 33777474
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777653 ttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 33777554  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33777553 gttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 33777474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11549520 - 11549339
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549520 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 11549421  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11549420 gtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 11549339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 23717984 - 23718165
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23717984 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 23718083  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23718084 gtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 23718165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24970184 - 24969891
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24970184 ttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 24970085  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||||||| |   | || |||  | |||    
T  24970084 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttga------tgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatct 24969991  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  |||| ||||| ||||||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  24969990 gttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcata 24969891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 22999110 - 22999291
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22999110 ttgatgaaaatcacacttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaa 22999209  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22999210 gttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 22999291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30934799 - 30934626
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30934799 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaa 30934700  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttg 174  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30934699 gtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 30934626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 15658756 - 15658935
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15658756 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 15658855  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15658856 gttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 15658935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23892372 - 23892073
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |    
T  23892372 ttgatggaaatcacatttgaggtcggaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtaga 23892273  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| ||||||||||  ||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||| || ||| || | |    
T  23892272 gtcggaagcaactcggcatacatgattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggtggctgttgttgcattt 23892173  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || || ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  23892172 gctgaacgatggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcata 23892073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41674875 - 41674589
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41674875 ttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 41674776  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  41674775 gttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatct 41674676  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgag 287  Q
    | ||  |||| ||||| |||||||| |||||||| || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  41674675 gttgggcaattgcattgacgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgag 41674589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26480558 - 26480379
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26480558 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 26480459  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26480458 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 26480379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9548539 - 9548832
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9548539 ttgatgaaaatcacacttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 9548638  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |     || |||  | |||    
T  9548639 gttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatct 9548738  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  9548739 gttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 9548832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2511217 - 2511038
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2511217 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 2511118  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2511117 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 2511038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5638076 - 5637897
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5638076 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 5637977  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5637976 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 5637897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 8665471 - 8665650
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8665471 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 8665570  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8665571 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 8665650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9317617 - 9317438
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9317617 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 9317518  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9317517 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 9317438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12132321 - 12132142
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12132321 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 12132222  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12132221 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 12132142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 15758853 - 15759032
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15758853 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 15758952  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15758953 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 15759032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22888636 - 22888292
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | | || |    
T  22888636 ttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaaataga 22888537  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||| ||| || ||| || | |    
T  22888536 gtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcattt 22888440  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| |||| |||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  22888439 gctgaacgacggcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcata 22888340  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagc 348  Q
     | ||| |  ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  22888339 tgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagc 22888292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6874471 - 6874295
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6874471 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 6874372  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6874371 gttggaagcagctcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 6874295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30152184 - 30152005
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30152184 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 30152085  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30152084 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 30152005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30168635 - 30168456
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  30168635 ttgatgaaaatcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaa 30168536  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30168535 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 30168456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 18375408 - 18375587
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18375408 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 18375507  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18375508 gttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 18375587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 25199195 - 25198788
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || | |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |    
T  25199195 ttgatggaaatcacacttgagatcagaacggaacctgggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtaga 25199096  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || |||||  |||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||| ||| || ||| || | |    
T  25199095 gtcgggagtaactcggcatacaacattggtatcggagaaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcattt 25198999  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  || || ||| ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25198998 gctgaacgacggcgttaacgagtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcata 25198899  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgtaggctgacctgttccagaggataccattccaacctctgtttccttcttc 400  Q
     | ||| |  ||||| |  || | |||||||| ||| || ||||||||  | |  ||||| | ||| | ||||||||| || || |||||||||||||||    
T  25198898 tgggtacgacggaggcaattgggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatccctacttctgtttccttcttc 25198799  T
Q  401 ttgtgatgtcc 411  Q
    || ||||||||    
T  25198798 ttatgatgtcc 25198788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 18500726 - 18500877
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  18500726 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaa 18500825  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  18500826 gttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctag 18500877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 28649401 - 28649250
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  28649401 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaaa 28649302  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  28649301 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 28649250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 37770983 - 37771159
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  37770983 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaa 37771082  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| | ||| |||||||||||    
T  37771083 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttg 37771159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 33516522 - 33516343
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  33516522 ttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaag 33516423  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33516422 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 33516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 34616684 - 34616532
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  34616684 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaga 34616585  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 153  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  34616584 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 34616532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 29967062 - 29967241
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  29967062 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaga 29967161  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29967162 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaac 29967241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30029581 - 30029402
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  30029581 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaga 30029482  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30029481 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaac 30029402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31431606 - 31431430
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |    
T  31431606 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaga 31431507  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||  | ||| | ||| |||||||||||    
T  31431506 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggcctagtatactgctgctgctgttgttgttg 31431430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 37671479 - 37671655
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || || || || ||||| |||||||||    
T  37671479 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 37671578  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| | ||| |||||||||||    
T  37671579 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttg 37671655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 37755146 - 37754970
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  37755146 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgacctctctggagtaaa 37755047  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| | ||| |||||||||||    
T  37755046 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttg 37754970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 37358639 - 37358815
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  37358639 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaga 37358738  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| | |||||||||||||||    
T  37358739 gttggaagaagttccgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttgttg 37358815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 43078418 - 43078236
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |    
T  43078418 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaga 43078319  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc---ttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |    |||||| | ||||||||||||||||||    
T  43078318 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttgaac 43078236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11325960 - 11325634
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  11325960 ttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 11325861  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  11325860 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 11325764  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  11325763 gctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 11325664  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  11325663 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 11325634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 28959782 - 28959961
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  28959782 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaga 28959881  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc---ttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||   |||||| | ||| |||||||||||    
T  28959882 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgttgttg 28959961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 29889078 - 29889251
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||  | |||| |    
T  29889078 ttgatggaaatcacatatgaggtcagaccggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggtggtgcagtgccctctgagaagtaga 29889177  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttg 174  Q
    ||  | || | |||| |||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||| || | |||| |||||||    
T  29889178 gttgggagtagctcagcatacaacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 29889251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 31826403 - 31826582
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  31826403 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaga 31826502  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc---ttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |    |||||| | |||||||||||||||    
T  31826503 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttg 31826582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 13184644 - 13184970
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  13184644 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 13184743  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  13184744 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 13184840  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  13184841 gctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 13184940  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  13184941 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 13184970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 32599468 - 32599758
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||    
T  32599468 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 32599567  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||   ||| || || ||||||||||  ||||| ||| |   ||    
T  32599568 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattg---ctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacct 32599664  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  32599665 gctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 32599758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33877413 - 33877087
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  33877413 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 33877314  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  33877313 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 33877217  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  33877216 gctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 33877117  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  33877116 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 33877087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 13440490 - 13440816
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  13440490 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 13440589  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || | | |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  13440590 gtcgggagtaatttagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 13440686  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  13440687 gctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 13440786  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  13440787 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 13440816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3789707 - 3789531
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||    
T  3789707 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 3789608  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| | ||| |||||||||||    
T  3789607 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttg 3789531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 40473545 - 40473727
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  40473545 ttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 40473644  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc---ttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    |||||| | ||||||||||||||||||    
T  40473645 gttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttgaac 40473727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24681606 - 24681457
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  24681606 ttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 24681507  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24681506 gttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24681457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24724133 - 24723984
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  24724133 ttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 24724034  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24724033 gttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 24723984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33292639 - 33292282
Alignment:
Q  53 ggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  33292639 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 33292540  T
Q  153 cttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggata 252  Q
    | |  || | ||| || |||||   |||||  ||||| ||| ||  ||| ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| ||    
T  33292539 catattgttgctgctgctgttg---aactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggta 33292443  T
Q  253 ttgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgta 352  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |  || || | |||||||||||| | ||| || ||||||||  |     
T  33292442 ctgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttg 33292343  T
Q  353 ggctgacctgttccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 413  Q
    |   ||   ||||||| || || |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  33292342 gatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtgatgtccat 33292282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3789486 - 3789399
Alignment:
Q  207 caatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||  | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  3789486 caattgcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 3789399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Original strand, 13325080 - 13325133
Alignment:
Q  241 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  13325080 tggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgttgagaatacgg 13325133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24681363 - 24681310
Alignment:
Q  241 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24681363 tggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 24681310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24723890 - 24723837
Alignment:
Q  241 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24723890 tggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 24723837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28649152 - 28649099
Alignment:
Q  241 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28649152 tggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 28649099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 13324825 - 13325001
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  13324825 ttgatgaaagtcacatttgagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 13324924  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| | ||| |||||||||||    
T  13324925 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttg 13325001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 294
Target Start/End: Original strand, 40473801 - 40473841
Alignment:
Q  254 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  40473801 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 40473841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 27434532 - 27434831
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27434532 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacttgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 27434631  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    | | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  27434632 gccggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatct 27434731  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27434732 gttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcata 27434831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 23128654 - 23128953
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128654 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 23128753  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || |||  | |||    
T  23128754 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatct 23128853  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  | || ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  23128854 gttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcata 23128953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 28882367 - 28882186
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882367 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 28882268  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28882267 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 28882186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12655695 - 12655514
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655695 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 12655596  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12655595 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 12655514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20838071 - 20837890
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20838071 ttgatggaaatcacatttaaggtcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaa 20837972  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20837971 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 20837890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34286507 - 34286328
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34286507 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 34286408  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34286407 gttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 34286328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34291567 - 34291388
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34291567 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 34291468  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34291467 gttggaagcaactcagcatataacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 34291388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34279602 - 34279309
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34279602 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 34279503  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  34279502 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatct 34279403  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  34279402 gttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 34279309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 11635275 - 11635450
Alignment:
Q  2 tgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaag 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11635275 tgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaag 11635374  T
Q  102 tcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    |  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11635375 ttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 11635450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 11641464 - 11641639
Alignment:
Q  2 tgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaag 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11641464 tgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaag 11641563  T
Q  102 tcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    |  ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11641564 ttggaagcaactcagcatataacatctgtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 11641639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 22926116 - 22926295
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22926116 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 22926215  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22926216 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 22926295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Original strand, 21677270 - 21677682
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21677270 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 21677369  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  21677370 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatct 21677469  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||   |||    
T  21677470 gttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcatata 21677569  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgtaggctgacctgttccagaggataccattccaacctctgtttccttcttc 400  Q
     | |||||| ||||| |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||  | |  ||||| | |||||  |||||||| || || || ||||| ||||||    
T  21677570 tgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttcttc 21677669  T
Q  401 ttgtgatgtccat 413  Q
    ||||| |||||||    
T  21677670 ttgtggtgtccat 21677682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34861833 - 34861654
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34861833 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 34861734  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34861733 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 34861654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 37685997 - 37686176
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37685997 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 37686096  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37686097 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 37686176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 37701262 - 37701441
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37701262 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 37701361  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37701362 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 37701441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 21703252 - 21703596
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||  | |||| |    
T  21703252 ttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgtcctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtaga 21703351  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||| ||| || ||| || | |    
T  21703352 gtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcattt 21703448  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | || || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  21703449 gttgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcata 21703548  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagc 348  Q
     | ||| |  ||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||    
T  21703549 tgggtacgacggaggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagc 21703596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37925646 - 37925353
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  37925646 ttgatggaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcgggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 37925547  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  37925546 gttggaagcaactcagcatataacattggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatct 37925447  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  37925446 gttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 37925353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32049951 - 32049658
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  32049951 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtccggtgggggtttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 32049852  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  32049851 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatct 32049752  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  32049751 gttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 32049658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 31876434 - 31876255
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  31876434 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaga 31876335  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  | |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31876334 gttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 31876255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 31891416 - 31891742
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  31891416 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 31891515  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||   ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  31891516 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 31891612  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  31891613 gctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcata 31891712  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  31891713 cgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 31891742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 16829426 - 16829605
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  16829426 ttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaag 16829525  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16829526 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 16829605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16892055 - 16891876
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  16892055 ttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaag 16891956  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16891955 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 16891876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 19416587 - 19416766
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  19416587 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaga 19416686  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19416687 gttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaagttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaac 19416766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27118841 - 27118515
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  27118841 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 27118742  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||   ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  27118741 gtcgggagtaattcagcatacaacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 27118645  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||     
T  27118644 gctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatg 27118545  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  27118544 cgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 27118515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 19456509 - 19456853
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  19456509 ttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctatgagaagtaga 19456608  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || |||||  |||| | ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||   ||| |||||||||||| ||| ||| || ||| || | |    
T  19456609 gtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcattt 19456705  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||  || || ||||| ||||| ||||||||| | || ||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||| ||||  | |||||    
T  19456706 gctaaacgatggcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcata 19456805  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagc 348  Q
     | ||| |  ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  19456806 tgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagc 19456853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 13936632 - 13936925
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  13936632 ttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 13936731  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |   | || |||  | |||    
T  13936732 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgactttgctgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatct 13936831  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  13936832 gttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 13936925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 40233664 - 40233515
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||    
T  40233664 ttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 40233565  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  |||| | |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  40233564 gttggaagaagctcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 40233515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 34303391 - 34303717
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  34303391 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 34303490  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||   ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  34303491 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 34303587  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |   |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  34303588 gctggacgacgacattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 34303687  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  34303688 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 34303717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37375314 - 37375021
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||    
T  37375314 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 37375215  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  |  || | ||| || || |||||||| |  ||||| ||| |   ||    
T  37375214 gttggaagaagctctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgctgttgaacgggcggttgatgttgtacct 37375115  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  | ||  |||| || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37375114 gttgagcgatgacattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacgg 37375021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 34157164 - 34156838
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  34157164 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 34157065  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  34157064 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 34156968  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  34156967 gctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 34156868  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  34156867 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 34156838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39890227 - 39890048
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  39890227 ttgatgaaagtcacatttgagatcagccctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaag 39890128  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc---ttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||   |||||| | ||| |||||||||||    
T  39890127 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgttgttg 39890048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3784807 - 3784481
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  3784807 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 3784708  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||  ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  3784707 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctactgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 3784611  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  3784610 gctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 3784511  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  3784510 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 3784481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16163752 - 16163426
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  16163752 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 16163653  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  16163652 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 16163556  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  16163555 gctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 16163456  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  16163455 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 16163426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 260841 - 260984
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||    
T  260841 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacagatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 260940  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagt 144  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  260941 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagt 260984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 12716690 - 12716839
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  12716690 ttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 12716789  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  12716790 gttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12716839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27777375 - 27777226
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  27777375 ttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 27777276  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27777275 gttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27803860 - 27803711
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  27803860 ttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 27803761  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27803760 gttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27803711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27817133 - 27816984
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  27817133 ttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 27817034  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27817033 gttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 27816984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 39051910 - 39052059
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  39051910 ttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 39052009  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  39052010 gttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 39052059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 27393122 - 27392952
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||   |||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |  | || |||    
T  27393122 ttgatggaaatcgcacttgaggtcagaatggaacctgggaggcaacgggttaggtggaggcttgccctgcctggttgtgcagtgccctttgagaagcaaa 27393023  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttg 171  Q
    ||| | |||| |||  |||||| ||| ||||| ||||| || |||||||| | ||| || | |||||||||    
T  27393022 gtcgggagcagctcggcatacatcattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgctgttgttg 27392952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 9350070 - 9350249
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||||| |||||||| || || || || || || ||||| |||||||||    
T  9350070 ttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccttgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 9350169  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc---ttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    |||||| | |||||||||||||||    
T  9350170 gttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttg 9350249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12586963 - 12586814
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  12586963 ttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 12586864  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  12586863 gttggaagcgactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 12586814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 294
Target Start/End: Original strand, 11635483 - 11635570
Alignment:
Q  207 caatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11635483 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 11635570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 294
Target Start/End: Original strand, 11641672 - 11641759
Alignment:
Q  207 caatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11641672 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 11641759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Original strand, 12716933 - 12716986
Alignment:
Q  241 tggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  12716933 tggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 12716986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 294
Target Start/End: Original strand, 39052169 - 39052209
Alignment:
Q  254 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  39052169 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 39052209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40233399 - 40233359
Alignment:
Q  254 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  40233399 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 40233359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 8301407 - 8301709
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301407 ttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 8301506  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||     || |||  | |||    
T  8301507 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgatt---ttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatct 8301603  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  8301604 gttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcata 8301703  T
Q  301 ggagta 306  Q
     |||||    
T  8301704 tgagta 8301709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18051380 - 18051081
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18051380 ttgatagaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgtcctctatggagtaaa 18051281  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || |||  | |||    
T  18051280 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatct 18051181  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  | || ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  18051180 gttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcata 18051081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 4796793 - 4797086
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796793 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 4796892  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  4796893 gttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatct 4796992  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  4796993 gttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 4797086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 15892846 - 15893145
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892846 ttgatggaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaaaggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 15892945  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  15892946 gtcggaagcaactcagcatacaacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatct 15893045  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15893046 gttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcata 15893145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4721749 - 4721568
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721749 ttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 4721650  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4721649 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 4721568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18330787 - 18330606
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18330787 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaag 18330688  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18330687 gtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 18330606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6192434 - 6192253
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192434 ttgatgaaaatcacatttgaggtcggacctgaaccttggaggcagcagatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 6192335  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6192334 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 6192253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 15741234 - 15741415
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741234 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacgaatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 15741333  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15741334 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 15741415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 29148895 - 29149074
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29148895 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctatggagtaaa 29148994  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29148995 gttggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 29149074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8296090 - 8295917
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8296090 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacctgggaggcaacagatcaggtaggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctgtggagtaaa 8295991  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttg 174  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8295990 gtcggaagcaactcagcatacaacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttg 8295917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 18277192 - 18277485
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18277192 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 18277291  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||| ||| ||  ||    
T  18277292 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacct 18277391  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  18277392 gttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 18277485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 18292493 - 18292786
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18292493 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 18292592  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||| ||| ||  ||    
T  18292593 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacct 18292692  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  18292693 gttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 18292786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 18307794 - 18308087
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18307794 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaactgatcaggtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 18307893  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||| ||| ||  ||    
T  18307894 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacct 18307993  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  18307994 gttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 18308087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 35880884 - 35880703
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880884 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcagcggatcaggtgggggcttgccctgtttggttgtacaatgccctctatggagtaaa 35880785  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35880784 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 35880703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 5609462 - 5609641
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5609462 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 5609561  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5609562 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 5609641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28339420 - 28339241
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28339420 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 28339321  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28339320 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 28339241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 31964613 - 31964792
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31964613 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 31964712  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31964713 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 31964792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 50134211 - 50134390
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  50134211 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 50134310  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50134311 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 50134390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 28116094 - 28116270
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28116094 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaagtgggggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 28116193  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28116194 gttggaagcaattcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttg 28116270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4417036 - 4416861
Alignment:
Q  2 tgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaag 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4417036 tgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggtttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaag 4416937  T
Q  102 tcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    |  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4416936 ttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttg 4416861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5713345 - 5713166
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5713345 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 5713246  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5713245 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaac 5713166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5724255 - 5724076
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5724255 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 5724156  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5724155 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaac 5724076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 5757222 - 5757401
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5757222 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 5757321  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5757322 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaac 5757401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 5768113 - 5768292
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5768113 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctttggagtaaa 5768212  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5768213 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaac 5768292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7996680 - 7996387
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7996680 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 7996581  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  7996580 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatct 7996481  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7996480 gttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 7996387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10643188 - 10642895
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10643188 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 10643089  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  10643088 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatct 10642989  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  10642988 gttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 10642895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 47023571 - 47023392
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  47023571 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 47023472  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47023471 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 47023392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7073330 - 7073037
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  7073330 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggcgggggcttaccttgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaa 7073231  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  7073230 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatct 7073131  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  7073130 gttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 7073037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Original strand, 22387718 - 22388127
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22387718 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 22387817  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||    || || || ||||||||||  ||||| ||| ||  ||    
T  22387818 gttggaagcaactctgcatacaacattggtataggaggaaaagtcggtctagcatattg---ttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacct 22387914  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22387915 gttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcata 22388014  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgtaggctgacctgttccagaggataccattccaacctctgtttccttcttc 400  Q
     | ||| |  || || | |||||||||||| | ||| || ||||||||  | |   ||   ||||||| || || |||||| ||||| || || ||||||    
T  22388015 agggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttc 22388114  T
Q  401 ttgtgatgtccat 413  Q
    |||||||||||||    
T  22388115 ttgtgatgtccat 22388127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 10396251 - 10396070
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  10396251 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaa 10396152  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10396151 gttggaagaagctctgcatacaacataggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 10396070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 17985096 - 17985275
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  17985096 ttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaga 17985195  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17985196 gttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 17985275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 16626646 - 16626990
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| |    
T  16626646 ttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctaagaagtaga 16626745  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  | || ||||| ||||| | ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||   ||| |||||||||||| ||| ||| || ||| || | |    
T  16626746 gtagggagtaactcgacatatatcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttg---ctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcattt 16626842  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || || ||||| ||||||||| ||||| | || ||||| | |||||| ||||| || || || || ||||| ||||| ||||||||  |||||||    
T  16626843 gctgaacgatggcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcata 16626942  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagc 348  Q
     | ||| |  ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  16626943 cgggtacgacggaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagc 16626990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21674811 - 21674630
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |    
T  21674811 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaga 21674712  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21674711 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 21674630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18225309 - 18225130
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  18225309 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaga 18225210  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18225209 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggtaggcctagcttgttgattttgttgttgttgttgaac 18225130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18530506 - 18530351
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |    
T  18530506 ttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtaga 18530407  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 156  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  18530406 gtcaggagtaactcagcatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttg 18530351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24328277 - 24328098
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  24328277 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaga 24328178  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24328177 gttggaagaagttctgcatacaacatcggtataggagggaaggttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaac 24328098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 6542602 - 6542778
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  6542602 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtgcagtgtcctctctggagtaaa 6542701  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| | ||| |||||||||||    
T  6542702 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttg 6542778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5013830 - 5013651
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5013830 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaga 5013731  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  | |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5013730 gttggaagaagttccgcgtacaacattggtataggaggaaaagttggcctggcttgctgattttgttgttgttgttgaac 5013651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18242857 - 18242681
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18242857 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgtcctctctggagtaaa 18242758  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  | ||| | |||||||||||||||    
T  18242757 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgttgttgttgttg 18242681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 36997217 - 36997396
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  36997217 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaga 36997316  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc---ttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |    |||||| | |||||||||||||||    
T  36997317 gttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttg 36997396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 17993924 - 17994250
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  17993924 ttgatggaaatcacatttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 17994023  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  17994024 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 17994120  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  17994121 gctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 17994220  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  17994221 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 17994250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5467103 - 5466810
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5467103 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaga 5467004  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| |||||  |||| ||||| |||||| | |  || | ||| || || ||||||||||  |||||  || |   ||    
T  5467003 gttggaaggagttctgcatacaacataggtataagaggaaaagttggtctatcatattgctgctgctgctgctgttgaactggcggttgacgttgtacct 5466904  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    | ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  5466903 gttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 5466810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 5596497 - 5596673
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  5596497 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaga 5596596  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||  | ||| | ||| |||||||||||    
T  5596597 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggagggaaggttggtctagtatactgctgctgctgttgttgttg 5596673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 22870996 - 22871148
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||| |    
T  22870996 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtaga 22871095  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 153  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22871096 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22871148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 22886055 - 22886207
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||| |    
T  22886055 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtaga 22886154  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 153  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  22886155 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 22886207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28021393 - 28021241
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  28021393 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggtaatggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtata 28021294  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 153  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28021293 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 28021241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 32292870 - 32292691
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||| |    
T  32292870 ttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctgggaggtaacggatcaggtggagacttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtaga 32292771  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || |||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||    
T  32292770 gtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaac 32292691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 51782141 - 51782034
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  51782141 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaga 51782042  T
Q  101 gtcagaag 108  Q
    || |||||    
T  51782041 gttagaag 51782034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 8211856 - 8211447
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||| |    
T  8211856 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtaga 8211757  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||  |  ||   ||| || || ||||||||||  ||||| ||| |   ||    
T  8211756 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttagtctagtatattg---ctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacct 8211660  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  8211659 gttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcata 8211560  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgtaggctgacctgttccagaggataccattccaacctctgtttccttcttc 400  Q
     | |||||  ||||| |  ||||| ||||| | ||| || ||||||||  | |  ||||| | |||||  || ||||| || || || ||||| ||||||    
T  8211559 tgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttc 8211460  T
Q  401 ttgtgatgtccat 413  Q
    ||||| |||||||    
T  8211459 ttgtggtgtccat 8211447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 4346827 - 4346979
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||    
T  4346827 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 4346926  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 153  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  4346927 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctagc 4346979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4626062 - 4625736
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| |    
T  4626062 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgatggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgagaagtaga 4625963  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  4625962 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 4625866  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |   |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  4625865 gctggacgacgacattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 4625766  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  4625765 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 4625736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 31034257 - 31034436
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||| |    
T  31034257 ttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtaga 31034356  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || ||||||||||| || || | |||| ||||||| |||||    
T  31034357 gtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttggtgaac 31034436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 48466045 - 48465896
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||    
T  48466045 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctttggagtaaa 48465946  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  48465945 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 48465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 51797231 - 51797123
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgg-gaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaa 99  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  51797231 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttgtgaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtag 51797132  T
Q  100 agtcagaag 108  Q
    ||| |||||    
T  51797131 agttagaag 51797123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5652505 - 5652179
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||| || |||| |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |  |||||| |    
T  5652505 ttgatggaaatcacacttgaggtccgaacggaacttgggaggcgacgggtcaggtgaaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctttgaggagtaga 5652406  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || || ||| |||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||   ||| | ||| ||| |||||||| |||  || || ||| || |      
T  5652405 gtcgggagtaattcagcatataacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattc 5652309  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    |||| || |  ||||| ||||||||||||||| | || ||| ||||| |||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | |||||    
T  5652308 gctggacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcata 5652209  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  5652208 cgtgtacgacggaggtagctgagcagcatt 5652179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 11110489 - 11110638
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||||    
T  11110489 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttaccctgtctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 11110588  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  11110589 gttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtct 11110638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 32439220 - 32438863
Alignment:
Q  53 ggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  32439220 ggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagttctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 32439121  T
Q  153 cttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggata 252  Q
    | |  ||   ||| || || ||||||||||  ||||| ||| ||  ||| ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| ||    
T  32439120 catattg---ctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggta 32439024  T
Q  253 ttgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgta 352  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |  || || | |||||||||||| ||||| || ||||||||  |     
T  32439023 ctgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttg 32438924  T
Q  353 ggctgacctgttccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtgatgtccat 413  Q
    |   ||   ||||||| || || |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  32438923 gatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttcttcttgtgatgtccat 32438863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 20576987 - 20577136
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  20576987 ttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 20577086  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtct 150  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  20577087 gttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtct 20577136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 29665110 - 29665289
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||| | || || || ||||| ||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||    
T  29665110 ttgatgaaaatcacatttaagatcagagcggaaccttggaggtaaagggtccggtggaggcttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaa 29665209  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc---ttgctgattctgttgttgttgttg 177  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |    |||||| | |||||||||||||||    
T  29665210 gttggaagcaactcagcatataacatcggtataggaggaaaagttggtctggtatattgctgctgctgttgttgttgttg 29665289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4893276 - 4893032
Alignment:
Q  53 ggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctag 152  Q
    ||||| || |||||||| || || || || || ||||| |||||||||||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4893276 ggtggaggtttgccctgcctagtcgtgcagtgtcctctctggagtaaagttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagttggtctag 4893177  T
Q  153 cttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggata 252  Q
    | |  ||   ||| || || ||||||||||  ||||| ||| ||  ||| ||  | || ||||| || || ||||||||| | || | ||||||||| ||    
T  4893176 catattg---ctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggta 4893080  T
Q  253 ttgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
     ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4893079 ctgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcata 4893032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 294
Target Start/End: Original strand, 28116303 - 28116390
Alignment:
Q  207 caatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28116303 caattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgagaatacgg 28116390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 294
Target Start/End: Original strand, 29665331 - 29665418
Alignment:
Q  207 caatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  29665331 caattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 29665418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 413
Target Start/End: Original strand, 22871220 - 22871426
Alignment:
Q  207 caatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagta 306  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||  | |||| ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   ||| | |||    
T  22871220 caattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 22871319  T
Q  307 tggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgtaggctgacctgttccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtga 406  Q
    ||  ||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||||||  |||  ||||| | |||||  || ||||| || || || ||||| |||||||||||     
T  22871320 tgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 22871419  T
Q  407 tgtccat 413  Q
    |||||||    
T  22871420 tgtccat 22871426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 413
Target Start/End: Original strand, 22886279 - 22886485
Alignment:
Q  207 caatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagta 306  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||  | |||| ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||   ||| | |||    
T  22886279 caattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggta 22886378  T
Q  307 tggtggaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagctgtaggctgacctgttccagaggataccattccaacctctgtttccttcttcttgtga 406  Q
    ||  ||||| | |||||| ||||| | ||| || ||||||||  |||  ||||| | |||||  || ||||| || || || ||||| |||||||||||     
T  22886379 tgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtgg 22886478  T
Q  407 tgtccat 413  Q
    |||||||    
T  22886479 tgtccat 22886485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21674558 - 21674518
Alignment:
Q  254 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21674558 tgatggtaaaatggcggaaagaacggatgctgagaatacgg 21674518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48465780 - 48465740
Alignment:
Q  254 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  48465780 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 48465740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 51781876 - 51781836
Alignment:
Q  254 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  51781876 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 51781836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 51796965 - 51796925
Alignment:
Q  254 tgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  51796965 tgatggtaaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacgg 51796925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27449 - 27268
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 27350  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactg 182  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27349 gtcggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactg 27268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 228 - 522
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  228 ttgatgaaaatcacatttgagatcggacctgaacttgggaggcaacggatccggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 327  T
Q  101 gtcagaagcaactcaa-catacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttc 199  Q
    ||| ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | ||    
T  328 gtcggaagcaactaaagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatc 427  T
Q  200 tgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    || ||  |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  428 tgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacgg 522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 41793407 - 41793700
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41793407 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 41793506  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |     || |||  | |||    
T  41793507 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatct 41793606  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    |  |  |||| ||||| ||||| || |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41793607 gtggagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgagaatacgg 41793700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10962826 - 10962647
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10962826 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagcaaa 10962727  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10962726 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 10962647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28585137 - 28584958
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28585137 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 28585038  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28585037 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 28584958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 51638374 - 51638195
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||| |    
T  51638374 ttgatgaaaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacgggtcaggtgggggcttaccctgcctagtcgtacaatgccctctctggagtaga 51638275  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51638274 gttggaagaagttctgcatacaacattggtatcgaagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 51638195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 20340434 - 20340760
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| |    
T  20340434 ttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtaga 20340533  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  | || | |||  |||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||   || |||||||||||| |||  || || ||| || | |    
T  20340534 gttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctga---tgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcattt 20340630  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | || || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | || ||    
T  20340631 gttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgta 20340730  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  20340731 cgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 20340760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16208130 - 16208354
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||  | |||| |    
T  16208130 ttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggttttccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtaga 16208229  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||| | || |||||   ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||      |||||||||||||||| ||| || ||| || | |    
T  16208230 gtcgggagtaactcggtatacaacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttga------tgttgttgttgaactggtggctgttgttgcattt 16208323  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgagg 231  Q
    |||| || || ||||| | ||||||||||||    
T  16208324 gctgaacgatggcattaatgggtacctgagg 16208354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28152018 - 28151839
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||| |    
T  28152018 ttgatggaaatcacatttgaggtcagaccggagcctgggaggtaacagatcaggtggaggcttcccctgtctgattgtgcagtgccctctgagaagtaga 28151919  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||| | ||||||||| |||| | ||| |||||  |||| || |||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||    
T  28151918 gtcgggagcaactcagcatatagcattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttggtgaac 28151839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20461237 - 20461082
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |    
T  20461237 ttgatgaaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtaga 20461138  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttg 156  Q
    ||| | || |||||  |||| | |||  |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  20461137 gtcgggagtaactcggcatatagcattagtatcggaggaaaggtaggtctagcttg 20461082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20461053 - 20460917
Alignment:
Q  212 gcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtg 311  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || ||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| | ||| || |    
T  20461053 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacggcg 20460954  T
Q  312 gaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagc 348  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| | ||||||    
T  20460953 gaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagc 20460917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 7338 - 7517
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7338 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 7437  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7438 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 7517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 9165 - 9344
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9165 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 9264  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9265 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 9344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20172 - 19993
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20172 ttgatgaaagtcgcatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 20073  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20072 gttggaagcaactcagcatataacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 19993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 15029 - 15208
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15029 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtaaa 15128  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15129 gttggaagaagatctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 15208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 26300 - 26480
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctg-ggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaa 99  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  26300 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaacctttggaggcaacggatcaggtgggggcttaccctgtctagttgtacaatgccctctctggagtag 26399  T
Q  100 agtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaac 180  Q
    |||  |||| | |||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26400 agttggaagaagctctgcatacaacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaac 26480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30609 - 30311
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  30609 ttgatgaaagtcacatttaagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagttgtacaatgacctctctggagtaag 30510  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || |||  | |||    
T  30509 gttggaagaagttctgcatacaacattggtatagga-ggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatct 30411  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | ||  | || ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  30410 gttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcata 30311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20545 - 20375
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||| |    
T  20545 ttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccctctgagaagtaga 20446  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttg 171  Q
    ||| | || |||||| |||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| || | |||||||||    
T  20445 gtcgggagtaactcagcatacaacattggtatcgggggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttg 20375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20358 - 20222
Alignment:
Q  212 gcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcataggagtatggtg 311  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||| |||||||| || ||||| | ||| |  |    
T  20358 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 20259  T
Q  312 gaggtagctgagcagcattaacaggggcgacagtagc 348  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  20258 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagc 20222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8106 - 7963
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| |    
T  8106 ttgatgaaagtcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccttgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaga 8007  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagt 144  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  8006 gttggaagcaactcagcatacaacattggtataggaggaaaagt 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 9723 - 9571
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |    
T  9723 ttgatgaaaatcacatttgagatcagatctgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctctggagtaga 9624  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagc 153  Q
    ||  |||| |  ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  9623 gttggaagaagttctgcatacaacataggtataggaggaaaagttggtctagc 9571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8166 - 8096
Alignment:
Q  224 acctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacgg 294  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  8166 acctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacgg 8096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 46907 - 47072
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacc-tgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggc--ttgccctgtct-ggttgtacaatg-ccctctatgga 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  46907 ttgatggaaatcacatttgagatcggaccttgaaccttggaggcaacggatcaggtgggggcgtttgccctgtctaggttgtacaatgtccctctatgga 47006  T
Q  96 gtaaa---gtcagaagcaactcaacatacaacatc-ggtattggaggg-aaagtaggtctagcttg 156  Q
    |||||   |   ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  47007 gtaaatcggggggaagcaactcagcatacaacatcgggtatcggagggaaaagtaggtctagcttg 47072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 6162 - 6015
Alignment:
Q  8 aaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagt-aaagtcaga 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||  ||    
T  6162 aaatcacatttgagatcagacctgaaccttggaggcaacggatcaggtggtggcttgccctgtctagtcgtacaatgccctctttggagtaaaagttgga 6063  T
Q  107 agcaactcaacata-caacatcggtattggagggaaag-taggtctag 152  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  6062 agcaactcagcatataaacatcggtataggaggaaaagttaggtctag 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 2016 - 2103
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccct 88  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2016 ttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgcagtgccct 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 2757 - 3083
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||| |    
T  2757 ttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctaggaggtaacggatcaggtggaggcttgccctgtctggttgtgtagtgccctctgagaagtaga 2856  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttct 200  Q
    ||  | || | |||  |||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||   || |||||||||||| |||  || || ||| || | |    
T  2857 gttgggagtagctcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctga---tgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcattt 2953  T
Q  201 gctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaatggcgggaagaacggatgttgagagtacggtgcata 300  Q
    | || || |  ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||  | || ||    
T  2954 gttgaacgacggcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgta 3053  T
Q  301 ggagtatggtggaggtagctgagcagcatt 330  Q
     | ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  3054 cgggtacgacggaggtagctgagcagcatt 3083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 188 - 1
Alignment:
Q  59 ggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaagtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagct---- 154  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||         
T  188 ggcttaccctgcctagtcgtacaatgacctctctgaagtaatgttggaagtaaatcagcatacaacatcgggattggaggaaaagtaggcctagcaaaat 89  T
Q  155 -----tgctgattctgttgttgttgttgaactgatggttgctgtggcttctgctgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcc 237  Q
         || || | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  88 gctgctgttgttgctgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 127 - 300
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgtacaatgccctctatggagtaaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||||  | |||| |    
T  127 ttgatggaaatcacacttgaggtcagaacggaacctggaaggcaacggatcaggtggaggcttgccatgtctggttgagcagtgccctctgagaagtaga 226  T
Q  101 gtcagaagcaactcaacatacaacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattctgttgttgttg 174  Q
    ||| | || |||||  |||| | ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  227 gtcgggagtaactcggcatatagcattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttg 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 21718 - 21641
Alignment:
Q  1 ttgatggaaatcacatttgaggtcggacctgaacctgggaagcaacggatcaggtgggggcttgccctgtctggttgt 78  Q
    |||||||||||| || |||||||| || | |||||||||| ||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21718 ttgatggaaatcgcacttgaggtcagaacggaacctgggaggcaacaggttaggtggaggcttgccctgcctggttgt 21641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University