View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7047_high_1 (Length: 460)

Name: NF7047_high_1
Description: NF7047
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7047_high_1
NF7047_high_1
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (18-300)||(30224173-30224456)
chr8 (18-302)||(5567367-5567652)
chr8 (19-300)||(25248955-25249231)
chr8 (18-298)||(3375439-3375709)
chr8 (18-286)||(6428699-6428967)
chr8 (47-298)||(31032038-31032285)
chr8 (69-264)||(3379172-3379366)
chr8 (17-215)||(36535855-36536035)
chr8 (182-244)||(14935576-14935638)
chr8 (247-300)||(5567676-5567729)
chr8 (151-214)||(29274786-29274849)
chr8 (47-126)||(19473649-19473728)
chr8 (47-126)||(19544574-19544653)
chr8 (47-126)||(19588043-19588122)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (18-300)||(7040304-7040587)
chr4 (18-300)||(23564680-23564963)
chr4 (18-300)||(18656051-18656334)
chr4 (18-300)||(52520542-52520828)
chr4 (18-300)||(52518700-52518986)
chr4 (18-300)||(23566375-23566628)
chr4 (116-244)||(3529251-3529379)
chr4 (116-244)||(23985773-23985901)
chr4 (55-217)||(54296454-54296617)
chr4 (47-244)||(52545137-52545333)
chr4 (111-300)||(3274538-3274728)
chr4 (144-244)||(24807423-24807522)
chr4 (47-132)||(56074680-56074766)
chr4 (194-244)||(18395816-18395866)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (18-300)||(29758063-29758346)
chr2 (69-155)||(8759121-8759207)
chr2 (121-289)||(20516053-20516227)
chr2 (232-298)||(8759203-8759269)
chr2 (47-145)||(18612074-18612174)
chr2 (243-293)||(31155713-31155763)
chr2 (184-244)||(18739671-18739730)
chr2 (106-143)||(17149025-17149062)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (18-298)||(44963108-44963389)
chr7 (18-300)||(20046500-20046787)
chr7 (18-300)||(28124592-28124878)
chr7 (18-300)||(28126419-28126705)
chr7 (18-300)||(4895525-4895810)
chr7 (121-244)||(37405559-37405682)
chr7 (19-145)||(28014279-28014406)
chr7 (212-298)||(44962228-44962314)
chr7 (18-145)||(25471776-25471904)
chr7 (36-122)||(8405628-8405715)
chr7 (104-179)||(4880267-4880343)
chr7 (132-194)||(36989570-36989632)
chr7 (111-187)||(4571066-4571144)
chr7 (255-301)||(6322930-6322976)
chr7 (196-236)||(25471955-25471995)
chr7 (266-298)||(36989612-36989644)
chr7 (257-301)||(41966676-41966720)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (18-298)||(19645305-19645586)
chr6 (18-300)||(5376818-5377104)
chr6 (18-292)||(5378681-5378959)
chr6 (18-300)||(1088658-1088945)
chr6 (86-298)||(15149112-15149331)
chr6 (121-244)||(15868391-15868514)
chr6 (121-244)||(33866098-33866221)
chr6 (121-244)||(15866579-15866702)
chr6 (121-244)||(33869245-33869368)
chr6 (135-216)||(9415095-9415176)
chr6 (230-300)||(9414962-9415032)
chr6 (116-244)||(14611083-14611210)
chr6 (243-300)||(9415050-9415107)
chr6 (173-244)||(32079909-32079980)
chr6 (21-141)||(8915570-8915691)
chr6 (117-236)||(28884359-28884479)
chr6 (17-141)||(20985812-20985937)
chr6 (116-192)||(14618975-14619050)
chr6 (184-244)||(14620510-14620570)
chr6 (260-300)||(30376225-30376265)
chr6 (17-64)||(31528957-31529004)
chr6 (45-105)||(24544757-24544818)
[»] chr3 (6 HSPs)
chr3 (18-301)||(17402787-17403074)
chr3 (18-298)||(1139958-1140227)
chr3 (18-300)||(6789563-6789846)
chr3 (111-231)||(20302639-20302760)
chr3 (152-231)||(20327181-20327259)
chr3 (144-201)||(41874441-41874497)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (18-294)||(17449260-17449536)
chr1 (18-300)||(16808583-16808869)
chr1 (121-244)||(9312028-9312151)
chr1 (121-244)||(3282800-3282923)
chr1 (121-244)||(3284501-3284624)
chr1 (121-244)||(9310411-9310534)
chr1 (193-303)||(48940616-48940726)
chr1 (152-244)||(37664695-37664787)
chr1 (152-244)||(37674417-37674509)
chr1 (152-244)||(37702185-37702277)
chr1 (17-197)||(48941646-48941831)
chr1 (144-236)||(902084-902175)
chr1 (184-244)||(5924946-5925006)
chr1 (78-162)||(5924852-5924935)
chr1 (261-300)||(51020570-51020609)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (47-244)||(58785-58982)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (121-244)||(6225-6348)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (121-244)||(39787168-39787291)
chr5 (70-244)||(25076173-25076348)
chr5 (70-244)||(25134142-25134317)
chr5 (144-188)||(6569888-6569932)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (69-244)||(39144-39318)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (18-126)||(19063-19171)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (401-446)||(3530-3575)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30224456 - 30224173
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30224456 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagagtactcatgagggagatactcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 30224357  T
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30224356 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 30224257  T
Q  217 ttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30224256 ttacttatcaactaactatagttgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 30224173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 5567652 - 5567367
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5567652 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagagtactcatgagggagatactcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 5567553  T
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5567552 tgataaaagatgatgaatgagtacaatagttttcctatatatagagattagtttgagtaactaactccaactaacttctaactaagctactaactctagt 5567453  T
Q  217 ttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaacata 302  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5567452 ttagctatcaactaactatagttgattactaactctagtctaactactttaactaacttcacataacttccagctattttaacata 5567367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25249231 - 25248955
Alignment:
Q  19 aatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25249231 aatcatagggagaaaagtcatatatgtaagcaagatagcaagcataagggtactcatgagggagatactcaaagtaactcattgtagaaatgaatagatt 25249132  T
Q  118 gataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtt 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25249131 gataaaagatcatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctttaactaacttctaaccaagctactaactctagtt 25249032  T
Q  218 tac---ttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    |||   ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25249031 tacttattatcaattaactatagttgattactaactctagtc---------taactaactccacataacttccaactatcttaaca 25248955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 298
Target Start/End: Original strand, 3375439 - 3375709
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||          ||||||||||||||||||||||    
T  3375439 gaatcatagggagaaaggtcatagatgtaagtaagatagcaagcaaaagagtactcatgtgggagata----------ctcattgtagaaatgaatagat 3375528  T
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 216  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3375529 tga-aaaagataatgaatgggtacaatagagttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaaccctagt 3375627  T
Q  217 ttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaa 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3375628 ttacttatcaactaactatagttgattactaacagaagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaa 3375709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6428967 - 6428699
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  6428967 gaatcataaggagagaagtcatagatgtaagtaagatagcaaacataagagtactcatgtgagagatactcaaagaaactcattgtagag-tgaatagat 6428869  T
Q  117 t-gat-aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactcta 214  Q
    | ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  6428868 ttgattaaaagatgatgaatgattacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttttaactaaggtactaactcta 6428769  T
Q  215 gtttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttc 286  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6428768 gtttacttatcaactaattatagttgattactaactcttgtctaactac--taactaactccacataacttc 6428699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 47 - 298
Target Start/End: Original strand, 31032038 - 31032285
Alignment:
Q  47 agcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgataaaagataatgaatgagtacaatag 145  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||     
T  31032038 agcaagaaagcaagcataagagtactcatgtgggagatactcatagaaactcattatagaa-tgaatagattgataaaagatcatgaatgagtgtagtaa 31032136  T
Q  146 tgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgattac 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31032137 tgttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaa----cttctaaccaagctactaaccctagtttacttatcaactaactatagttgattac 31032232  T
Q  246 taactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaa 298  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31032233 taactcaagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaa 31032285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 69 - 264
Target Start/End: Original strand, 3379172 - 3379366
Alignment:
Q  69 actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagt 168  Q
    ||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  3379172 actcatgtgggagatactcatagaaactcattatagaa-tgaatagattgataaaaaatgatgaatgagtacaatagttttccttaatatagagattagt 3379270  T
Q  169 ttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactacc 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3379271 ttgagtaactaactctaactaacttctaactaaactactaactctagtttaactatcaactaactatagttgattactaactctagtctaactacc 3379366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 36535855 - 36536035
Alignment:
Q  17 agaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaataga 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||                    ||||||||||||    
T  36535855 agaatcatagggagaaaggtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagagtactcatgtgggagatt-------------------gaaatgaataga 36535935  T
Q  116 ttgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctag 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36535936 ttgataaaagatgatgaatgagtacaacagtattgctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctag 36536035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14935638 - 14935576
Alignment:
Q  182 tctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14935638 tctaactaacttctaaccaagttactaactctagtttacctatcaactaactatagttgatta 14935576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 300
Target Start/End: Original strand, 5567676 - 5567729
Alignment:
Q  247 aactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  5567676 aactctagtctaactaccttaactaacttcacataacttccagctattttaaca 5567729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 214
Target Start/End: Original strand, 29274786 - 29274849
Alignment:
Q  151 ctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactcta 214  Q
    ||||||||| |||||| || |||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  29274786 ctatatataaagattaattggagtaattaactctaactaacccgtaaccaagctactaactcta 29274849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19473728 - 19473649
Alignment:
Q  47 agcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgataaaaga 126  Q
    ||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  19473728 agcaagaaagcaagaataagagtactcatgtgggagatactcatagaaactcattatagaa-tgaatagattgatagaaga 19473649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19544653 - 19544574
Alignment:
Q  47 agcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgataaaaga 126  Q
    ||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  19544653 agcaagaaagcaagaataagagtactcatgtgggagatactcatagaaactcattatagaa-tgaatagattgatagaaga 19544574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 126
Target Start/End: Original strand, 19588043 - 19588122
Alignment:
Q  47 agcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgataaaaga 126  Q
    ||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  19588043 agcaagaaagcaagaataagagtactcatgtgggagatactcatagaaactcattatagaa-tgaatagattgatagaaga 19588122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7040587 - 7040304
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7040587 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagagtactcatgagggagatactcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 7040488  T
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7040487 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 7040388  T
Q  217 ttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7040387 ttacttatcaactaactatagttgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 7040304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 23564680 - 23564963
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23564680 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaaaatagcaagcataagagtactcatgagggagatactcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 23564779  T
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23564780 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 23564879  T
Q  217 ttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23564880 ttacttatcaactaactatagttgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 23564963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18656334 - 18656051
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656334 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagagtactcatgagggagatactcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 18656235  T
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18656234 tgataaaagatgatgaatgagtacaatagttttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaactaagctactaactctagt 18656135  T
Q  217 ttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  18656134 ttagctatcaactaactatagttgattactaactctagtctaactaccttaactaacttcacataacttccggctattttaaca 18656051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 52520828 - 52520542
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||  |  |||  | |||||||| | ||    
T  52520828 gaatcatagggagaaagatcatagatgtaagaaagagagcaagcataagagtactcatgtgggagatactcatagagatccatatt-gaaatgaaaatat 52520730  T
Q  117 t-gat-aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactcta 214  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52520729 ttgattaaaagatgatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaaactactaactcta 52520630  T
Q  215 gtttacttatcaactaactataattgattac--taactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  52520629 gtttacttatcaactaactatagttgattacaattactctagtctaactaccttaactaactacacataacttccaactattttaaca 52520542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 52518986 - 52518700
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataaga-aactcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||  |  |||  | ||| |||| | ||    
T  52518986 gaatcatagggagaaagatcatagatgtaagcaagagagcaagcataagagaactcatgtgggagatactcatagagatccatattggaa-tgaaaatat 52518888  T
Q  117 t-gat-aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactcta 214  Q
    | ||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52518887 ttgattaaaagatgatgattgagtacaacagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaaactactaactcta 52518788  T
Q  215 gtttacttatcaactaactataattgattac--taactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  52518787 gtttacttatcaactaactatagttgattacaattactctagtctaactaccttaactaactacacataacttccaactattttaaca 52518700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 23566375 - 23566628
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||                    |||    
T  23566375 gaatcatagg-agaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagagtacccatgagggagatactcaaagta--------------------gat 23566453  T
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23566454 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaagtctagt 23566553  T
Q  217 ttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23566554 ttacttatcaactaactatagttgattactaactctagtc---------taactaactccacataactttcaactatcttaaca 23566628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 116 - 244
Target Start/End: Original strand, 3529251 - 3529379
Alignment:
Q  116 ttgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctag 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3529251 ttgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaactttag 3529350  T
Q  216 tttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3529351 tttacctatcaactaactacagttgatta 3529379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 116 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23985901 - 23985773
Alignment:
Q  116 ttgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctag 215  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23985901 ttgataaaagatggtgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgaataactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctag 23985802  T
Q  216 tttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23985801 tttacctatcaactaactatagttgatta 23985773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 54296617 - 54296454
Alignment:
Q  55 agcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgat-aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcct 152  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54296617 agcaagcataagagtactgatgagggagatactcatagaaactcattata-aaatgaattgattgattaaaagatcatgaatgagtacaatagtgttcct 54296519  T
Q  153 atatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54296518 atatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctagtt 54296454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 244
Target Start/End: Original strand, 52545137 - 52545333
Alignment:
Q  47 agcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgataaaagataatgaa-tgagtacaata 144  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||  |    
T  52545137 agcaagaaagcgagcataagagtactcatgtgggagatactcatagaaactcattatagaa-tgaatagattgataaaagataataaaatga-tacatga 52545234  T
Q  145 gtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  52545235 gtgttcctatatatagagtttagtt-gtgtaactaactctaaccaacttctaaccaagctactaactctagtttacctatcaactaactatagttgatta 52545333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 111 - 300
Target Start/End: Original strand, 3274538 - 3274728
Alignment:
Q  111 atagattgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcct-atatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaa 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||  || |  | ||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3274538 atagattgataaaagatgatgaatgattaccatgatgatgtttatatatagaaattaatttgagtaattaactctaactaacttctaatcaagccactaa 3274637  T
Q  210 ctctagtttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  3274638 ctcttgtttacctatcaactaattatagttgattactaactatagttttactaccttaactaacttcatataacttccaactattttaaca 3274728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24807522 - 24807423
Alignment:
Q  144 agtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgatt 243  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||  ||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24807522 agtgttcctatatatagattttagtt-gtgtaactaactcttcctaactcttaaccaagcttctaactctaatttacctatcaactaactatagttgatt 24807424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Original strand, 56074680 - 56074766
Alignment:
Q  47 agcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgataaaagataatga 132  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  56074680 agcaagaaagcaagcataagagtactcatgtgggagatactcatagaaactcgttatagaaatgaatagaatgataaaagatgatga 56074766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 244
Target Start/End: Original strand, 18395816 - 18395866
Alignment:
Q  194 ctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18395816 ctaaccaacctattaactatagtttacctatcaactaactatagttgatta 18395866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 29758346 - 29758063
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29758346 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagagtactcatgagggagatactcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 29758247  T
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29758246 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 29758147  T
Q  217 ttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29758146 ttacttatcaactaactatagttgattactaagtctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 29758063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 155
Target Start/End: Original strand, 8759121 - 8759207
Alignment:
Q  69 actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctata 155  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8759121 actcatgagggagatactcaaagaaactcattgtagaaatgaacagattgataaaagatgatgaatgagtacaatagtgttcctata 8759207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 289
Target Start/End: Original strand, 20516053 - 20516227
Alignment:
Q  121 aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttg----agtaactac-----ctctaactaacttctaaccaagctactaact 211  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    ||||||||      ||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  20516053 aaaaaataatgaatgagtacaatagtgttcttatatataaaaattagtttgtttgagtaactaaactaactctaactatcttttaaccaagctactaacc 20516152  T
Q  212 ctagtttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaa 289  Q
    |||| | |||||   |||||||||| || ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20516153 ctagctaactta---actaactatagttaattactaactccagtttaattaccttaactaactgcacataacttccaa 20516227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 232 - 298
Target Start/End: Original strand, 8759203 - 8759269
Alignment:
Q  232 ctataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaa 298  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8759203 ctatagttgattactaactcaagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaa 8759269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 145
Target Start/End: Original strand, 18612074 - 18612174
Alignment:
Q  47 agcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgataaaag-ataatgaatgagtacaata 144  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||| | |  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18612074 agcaagaaagcaagcataagagtactcatgtgggagatatttacaaaaactcattatagaaatgaatagattgataaaagtataatgattgagtacaata 18612173  T
Q  145 g 145  Q
    |    
T  18612174 g 18612174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 293
Target Start/End: Original strand, 31155713 - 31155763
Alignment:
Q  243 tactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactat 293  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31155713 tactaactctagtttaactaccttaactaactccgcataacttccaactat 31155763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18739730 - 18739671
Alignment:
Q  184 taactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18739730 taactaact-ctaaccagactactaactctagttaacgtatcaactaactataattgatta 18739671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 143
Target Start/End: Original strand, 17149025 - 17149062
Alignment:
Q  106 aatgaatagattgataaaagataatgaatgagtacaat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17149025 aatgaatagattgataaaagataatgatagagtacaat 17149062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 44963389 - 44963108
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44963389 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagtaagatagcaagcataagagtattcatgagggagatactcaaagaaattcattgtagaaatgaatagat 44963290  T
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44963289 tgataaaagatgatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattaatttgagtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaaccctagt 44963190  T
Q  217 ttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaa 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44963189 ttacttatcaactaactatagttgattactaactcaagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaa 44963108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 20046500 - 20046787
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20046500 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcgagatagcaagcataagagtactcatgtgggagatactcatagaaactcattgtagaaatgaatagat 20046599  T
Q  117 tgataaaa-gataatgaatgagtacaatagtgttcctatatata-gagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactcta 214  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20046600 tgataaaaagatattgaatgagtacaatagtgttcctatatataagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaaactactaactcta 20046699  T
Q  215 gtttacttatcaactaactataattgattac--taactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20046700 gtttacttatcaactaactatagttgattacaattactctagtctaactaccttaactaactacacataacttccaactattttaaca 20046787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 28124592 - 28124878
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||  |  |||  | ||| |||| | ||    
T  28124592 gaatcatagggagaaagatcatagatgtaagcaagagagcaagcataagagtactcatgtgggagatactcatagagatccatattggaa-tgaaaatat 28124690  T
Q  117 t-gat-aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactcta 214  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28124691 ttgattaaaagatgatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaaactactaactcta 28124790  T
Q  215 gtttacttatcaactaactataattgattac--taactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  28124791 gtttacttatcaactaactatagttgattacaattactctagtctaactaccttaactaactacacataacttccaactattttaaca 28124878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 28126419 - 28126705
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||  |  |||  | ||| |||| | ||    
T  28126419 gaatcatagggagaaagatcatagatgtaagcaagagagcaagcataagagtactcatgtgggagatactcatagagatccatattggaa-tgaaaatat 28126517  T
Q  117 t-gat-aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactcta 214  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28126518 ttgattaaaagatgatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaaactactaactcta 28126617  T
Q  215 gtttacttatcaactaactataattgattac--taactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  28126618 gtttacttatcaactaactatagttgattacaattactctagtctaactaccttaactaactacacataacttccaactattttaaca 28126705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4895810 - 4895525
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||  |||||||| ||| ||  |  |||  | ||| |||||| ||    
T  4895810 gaatcatagggagaaagatcatagatgtaagcaagagagcaaacataagagtactcatctgggagatactcatagagatccatattggaa-tgaatatat 4895712  T
Q  117 tgat-aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctag 215  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4895711 tgattaaaagatgatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaaataactctaactaacttctaaccaaactactaactctag 4895612  T
Q  216 tttacttatcaactaactataattgattac--taactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  4895611 tttacttatcaactaactatagttgattacaattactctaatctaactaccttaactaactacacataacttccaactattttaaca 4895525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 244
Target Start/End: Original strand, 37405559 - 37405682
Alignment:
Q  121 aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37405559 aaaagatagtgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttat 37405658  T
Q  221 ttatcaactaactataattgatta 244  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  37405659 ctatcaactaactatagttgatta 37405682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Original strand, 28014279 - 28014406
Alignment:
Q  19 aatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaaa-ctcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagatt 117  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28014279 aatcatagggagaaagatcatagatgtaagcaagatagcaagcataagagtgctcatgtgggagatactcatagaaactcattgtagaaatgaatagatt 28014378  T
Q  118 gataaaagataatgaatgagtacaatag 145  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  28014379 gataaaagatgaataatgagtacaatag 28014406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 212 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 44962314 - 44962228
Alignment:
Q  212 ctagtttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  44962314 ctagtttacttatcaactaactatagttgattactcactcaagtctaactaccttaactaacttcacataacttccaactatgttaa 44962228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Original strand, 25471776 - 25471904
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataaga-aactcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| | |||||||| | | || |||||||| || ||||||||||||    
T  25471776 gaatcataaggagaaagatcatagatgtaagaaagatagcaagcataagattattcacgtgggagatactaatagaaactcattatataaatgaatagat 25471875  T
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaatag 145  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  25471876 tgataaaagatgaataatgagtacaatag 25471904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 8405715 - 8405628
Alignment:
Q  36 tcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgataa 122  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8405715 tcatatatgtaagcaaaatagcaagcataagagtattcatgggggagataatcgtagaaactcattgtagaaatgactagattgataa 8405628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4880343 - 4880267
Alignment:
Q  104 gaaatgaat-agattgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaacta 179  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||||    
T  4880343 gaaatgaattagattgataaaagatgatgaatgagtataatggtgttcatatatatcgagattaattgaagtaacta 4880267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Original strand, 36989570 - 36989632
Alignment:
Q  132 aatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttc 194  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||    
T  36989570 aatgactacaataatgtttctatatatagagattagtttgaataactaactctacataacttc 36989632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4571144 - 4571066
Alignment:
Q  111 atagattgataaaagataatgaa--tgagtacaat-agtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaac 187  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| || |||||||    
T  4571144 atagattgataaaagataatgaaaatga-tacaatgagtgttcatatatatagagattagttgaagtaattaactctaac 4571066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 6322976 - 6322930
Alignment:
Q  255 tctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaacat 301  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6322976 tctaactaccgtaattaactccatataacttccaactattttaacat 6322930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Original strand, 25471955 - 25471995
Alignment:
Q  196 aaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25471955 aaccaacctactaactctagttaacctatcaactaactata 25471995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 298
Target Start/End: Original strand, 36989612 - 36989644
Alignment:
Q  266 taactaactccacataacttccaactatcttaa 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36989612 taactaactctacataacttccaactatcttaa 36989644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 257 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41966720 - 41966676
Alignment:
Q  257 taactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaacat 301  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41966720 taactactttaattaacacgacataacttccaactatcttaacat 41966676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 298
Target Start/End: Original strand, 19645305 - 19645586
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  19645305 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaaccaagatagcaagtataagagtactcatgagggagatactcaaagaaattcattgtagaaataaatagat 19645404  T
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19645405 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcttatatatagagattagtttgagtaactacctctgactaatttctaaccaagctactaactttagt 19645504  T
Q  217 ttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19645505 ttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacatatcttctaactatcttaa 19645586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5377104 - 5376818
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5377104 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagagtactcatgtgggagatactcatagaaactcattgtagaaatgaatagat 5377005  T
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatata-gagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctag 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5377004 tgataaaagatattgaatgagtacaatagtgttcctatatataagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaaactactaactctag 5376905  T
Q  216 tttacttatcaactaactataattgattac--taactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  5376904 tttacttatcaactaactatagttgattacaattactctagtctaactaccttaactaactacatataacttccaactattttaaca 5376818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5378959 - 5378681
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5378959 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagagtactcatgtgggagatactcatagaaactcattgtagaaatgaatagat 5378860  T
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatata-gagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctag 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5378859 tgataaaagatattgaatgagtacaatagtgttcctatatataagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaaactactaactctag 5378760  T
Q  216 tttacttatcaactaactataattgattac--taactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaacta 292  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5378759 tttacttatcaactaactatagttgattacaattactctagtctaactaccttaactaactacacataacttccaacta 5378681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 1088658 - 1088945
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaa-gtaactcattgtagaaatgaataga 115  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  |||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||||||    
T  1088658 gaatcataggaagagaagtcatagatgtaagcaagatagcaaacataagagtactcatatgggagatactcaaaagaaactcattatagaa-tgaataga 1088756  T
Q  116 ttgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctag 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1088757 ttgataaaagatgatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgactaactaactctaactaacttctaacaaagctactaactctaa 1088856  T
Q  216 tttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactc----cacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||     |||||||||||||| ||| ||||||    
T  1088857 tttacttatcaactaactatagttgatcactaactctaatttaactactttaactaactaacttcacataacttccaagtattttaaca 1088945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 86 - 298
Target Start/End: Original strand, 15149112 - 15149331
Alignment:
Q  86 tcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgataaaagataatgaatgagtacaata-----gt--gttcctatatatagagattagtttgagtaact 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15149112 tcaaagaaactcattgtagaaatgaatagattgataaaagataatgaatgagtacagtacaacagtacgttcctatatatagaaattaatttgagtaact 15149211  T
Q  179 acctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccac 278  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  15149212 aactctaactaacttctaaccaagctactgaccctagtttacttatcaactaactatagttgattactaactcaagtctaactaccttaactaactccgc 15149311  T
Q  279 ataacttccaactatcttaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15149312 ataacttccaactatcttaa 15149331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 121 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15868514 - 15868391
Alignment:
Q  121 aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15868514 aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaagctattaactctagtttac 15868415  T
Q  221 ttatcaactaactataattgatta 244  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  15868414 ctatcaactaactatagttgatta 15868391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33866221 - 33866098
Alignment:
Q  121 aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33866221 aaaagatagtgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtctgagtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 33866122  T
Q  221 ttatcaactaactataattgatta 244  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  33866121 ctatcaactaactatagttgatta 33866098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15866702 - 15866579
Alignment:
Q  121 aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15866702 aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctaaatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctacccaagctattaactctagtttac 15866603  T
Q  221 ttatcaactaactataattgatta 244  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  15866602 ctatcaactaactatagttgatta 15866579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33869368 - 33869245
Alignment:
Q  121 aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 220  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33869368 aaaagatagtgaatgcgtacaatagtgttcctatatatagagattagtttaagtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 33869269  T
Q  221 ttatcaactaactataattgatta 244  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  33869268 ctatcaactaactatagttgatta 33869245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9415176 - 9415095
Alignment:
Q  135 gagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9415176 gagtacaatagtgttcttatatatagagattagtttcactaactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 9415095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 230 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9415032 - 9414962
Alignment:
Q  230 aactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9415032 aactatagttgatcactaactctagtctaactaccttaactaactccgcataacttccaactattttaaca 9414962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14611210 - 14611083
Alignment:
Q  116 ttgataaaagataatgaa-tgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactcta 214  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| |||||  |||| |||||||||||||||    
T  14611210 ttgataaaagataatgaaatga-tacacgagtgttcctatatatagagtttagtt-gtgtaactaactctaaataactcttaacgaagctactaactcta 14611113  T
Q  215 gtttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
     ||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  14611112 atttacctatcaactaaccatagttgatta 14611083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9415107 - 9415050
Alignment:
Q  243 tactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9415107 tactaactctagtctaacttccttaactaactccacataacttccaactattttaaca 9415050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32079980 - 32079909
Alignment:
Q  173 gtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  32079980 gtaactaactctaactaactcttaaccaagcttctaactctagtttacctatcaactaactatagttgatta 32079909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 8915691 - 8915570
Alignment:
Q  21 tcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataaga-aactcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattga 119  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || || ||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||||| |    
T  8915691 tcatagagataaaaatcatagatgtaagcaagagagcaagcataagagtactcgtgtggaagatactcatagaaacttattatagaaatgaatagattaa 8915592  T
Q  120 taaaagataatgaatgagtaca 141  Q
    ||||||||  | ||||||||||    
T  8915591 taaaagatgctaaatgagtaca 8915570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 236
Target Start/End: Original strand, 28884359 - 28884479
Alignment:
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaat-agtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| ||  ||||||   ||||||| ||||   ||| ||||| ||||||||||    
T  28884359 tgataaaagataatgaatgagtacaatgattgttcctttatatacagattaattgaagtaaccgactctaaccaactataaacaaagcttctaactctag 28884458  T
Q  216 tttacttatcaactaactata 236  Q
    || || |||||||||||||||    
T  28884459 ttaacctatcaactaactata 28884479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Original strand, 20985812 - 20985937
Alignment:
Q  17 agaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaataga 115  Q
    |||||||||||||  ||  |||||||||||| |||| | ||||||||||||  ||||||| || ||||| | | |  || ||||| ||||||||||||||    
T  20985812 agaatcatagggatcaagatcatagatgtaatcaagtttgcaagcataagagtactcatgtggtagatacttataaaaattcattatagaaatgaataga 20985911  T
Q  116 ttgataaaagataatgaatgagtaca 141  Q
    |||||||||||||   ||||||||||    
T  20985912 ttgataaaagatagcaaatgagtaca 20985937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14619050 - 14618975
Alignment:
Q  116 ttgataaaagataatgaa-tgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaact 192  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  14619050 ttgataaaagataatgaaatga-tacatgagtgttcctatatatagagtttag-ttgtgtaactaactctaactaact 14618975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14620570 - 14620510
Alignment:
Q  184 taactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  14620570 taactaactcttaaccaagctactaactgtagtttacctatcaactaatcatagttgatta 14620510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 30376265 - 30376225
Alignment:
Q  260 ctaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30376265 ctacgttaactaactccacataacttccaactattttaaca 30376225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 31529004 - 31528957
Alignment:
Q  17 agaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcata 64  Q
    |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31529004 agaatcatagggatgaagatcatagatgtaagcaagatagcaagcata 31528957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 24544818 - 24544757
Alignment:
Q  45 taagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtaga 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||    
T  24544818 taagcaagaaagcaagcataagagtactcatgagggagatactcatagaaactcatagtaga 24544757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 6)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 301
Target Start/End: Original strand, 17402787 - 17403074
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17402787 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagagtactcatgtgggagatactcatagaaactcattgtagaaatgaatagat 17402886  T
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatata-gagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctag 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17402887 tgataaaagatattgaatgagtacaatagtgttcctatatataagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaaactactaactctag 17402986  T
Q  216 tttacttatcaactaactataattgattac--taactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaacat 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  17402987 tttacttatcaactaactatagttgattacaattactctagtctaactaccttaactaactacacataacttccaactattttaacat 17403074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1140227 - 1139958
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1140227 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagagtactcatgagggagatactcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 1140128  T
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            |||||    
T  1140127 tgataaaagatgatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaacc------------ctagt 1140040  T
Q  217 ttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaa 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1140039 ttacttatcaactaactatagttgattactaactcaagtccaactaccttaactaactccatataacttccaactatcttaa 1139958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6789846 - 6789563
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaa-gatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaataga 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  6789846 gaatcatagggagagaagtcatagatgtaagcaaagatagcaagcataagagtactcatgtgggagatactcatagaaactcattgtagaa-tgaataga 6789748  T
Q  116 ttgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctag 215  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6789747 ttgaaaaaagatagtgaatgagtacaatagtattcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctag 6789648  T
Q  216 tttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    || ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  6789647 ttcacttatccactaactatacatgattaccaactctagtctaactaccttaactaactacacattacttccaactattttaaca 6789563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20302760 - 20302639
Alignment:
Q  111 atagattgataaaagataatg--aatgagtacaat-agtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || ||||| |||| ||||||| |||||    
T  20302760 atagatttataaaagataatggaaatg-gtacgatgagtgttcttatatatagagattagtttgaataaccaactataacttactt-taaccaatctact 20302663  T
Q  208 aactctagtttacttatcaactaa 231  Q
    || ||||||| || | ||||||||    
T  20302662 aagtctagttaacctttcaactaa 20302639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20327259 - 20327181
Alignment:
Q  152 tatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaa 231  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||    
T  20327259 tatatagagagattagtttgagtaaccaactataacttactt-taaccaagctactaagtctagttaacctttcaactaa 20327181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41874497 - 41874441
Alignment:
Q  144 agtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaa 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  41874497 agtgttcctatatatagagtttag-ttgtgtaactaactctaactaactcttaaccaa 41874441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17449536 - 17449260
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||||||    
T  17449536 gaatcatagggagaaaggtcatagatgtaagcaagatagcaagcaaaagagtactcatgtgggagatactcatagaatctcattgtagacatgaatagat 17449437  T
Q  117 tgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagt 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17449436 tga-aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaacgaagctactaaccctagt 17449338  T
Q  217 ttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatc 294  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17449337 ttacttatcaactaactatagttgattactaactcaagtccaactaccttaactaactccatataacttccaactatc 17449260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 16808583 - 16808869
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||  |  |||  | ||| |||| | ||    
T  16808583 gaatcatagggagaaagatcatagatgtaagcaagagagcaagcataagagtactcatgtcggagatactcatagagatccatattggaa-tgaaaatat 16808681  T
Q  117 t-gat-aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactcta 214  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16808682 ttgattaaaagatgatgaatgagtacaatagtgttcatatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaaactactaactcta 16808781  T
Q  215 gtttacttatcaactaactataattgattac--taactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  16808782 gtttacttatcaactaactatagttgattacaattactctagtctaactaccttaactaactacacataacttccaactattttaaca 16808869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 121 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9312151 - 9312028
Alignment:
Q  121 aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9312151 aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 9312052  T
Q  221 ttatcaactaactataattgatta 244  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  9312051 ctatcaactaactatagttgatta 9312028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 121 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3282923 - 3282800
Alignment:
Q  121 aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3282923 aaaagatagtgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 3282824  T
Q  221 ttatcaactaactataattgatta 244  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  3282823 ctatcaactaactatagttgatta 3282800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 121 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3284624 - 3284501
Alignment:
Q  121 aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3284624 aaaagatagtgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 3284525  T
Q  221 ttatcaactaactataattgatta 244  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  3284524 ctatcaactaactatagttgatta 3284501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 121 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9310534 - 9310411
Alignment:
Q  121 aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9310534 aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagatattaatttgagtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 9310435  T
Q  221 ttatcaactaactataattgatta 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  9310434 ttatcaactaactatagttgatta 9310411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 193 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48940726 - 48940616
Alignment:
Q  193 tctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgattactaactctagtctaactaccttaactaactccacataacttccaacta 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48940726 tctaaccaaactactaactctagtttacttatcaactaactatagttgattactaactcttgtctaactaccttaactaactccacataacttccaacta 48940627  T
Q  293 tcttaacatat 303  Q
    | |||||||||    
T  48940626 ttttaacatat 48940616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 244
Target Start/End: Original strand, 37664695 - 37664787
Alignment:
Q  152 tatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37664695 tatatatagagattagtttgaataactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacctatcaactaactatagttgatta 37664787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 244
Target Start/End: Original strand, 37674417 - 37674509
Alignment:
Q  152 tatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37674417 tatatatagagattagtttgaataactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacctatcaactaactatagttgatta 37674509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37702277 - 37702185
Alignment:
Q  152 tatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37702277 tatatatagagattagtttgaataactaactctaactaatttctaaccaagctactaactctagtttacctatcaactaactatagttgatta 37702185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 48941831 - 48941646
Alignment:
Q  17 agaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgta--gaaatgaata 113  Q
    |||||||||||||  ||  | |||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||| | |||||| ||| |  |||||||| ||  ||||||||||    
T  48941831 agaatcatagggacgaagattatagatgtaagcaagagagcaagtataagagtattcatgtgagagatactcatataaactcattatatagaaatgaata 48941732  T
Q  114 gatt-gat-aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaa 197  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  48941731 gatttgattaaaagatactgaatgagtacaatagtgtttatatgtatagagattagtttgagtaaccaactctaactaacttctaa 48941646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 902175 - 902084
Alignment:
Q  144 agtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactata 236  Q
    |||||||||||||| |||| ||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  902175 agtgttcctatatagagagtttaatt-gtgtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacctatcaactaactata 902084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 244
Target Start/End: Original strand, 5924946 - 5925006
Alignment:
Q  184 taactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5924946 taactaacttctaaccaaactactaactctaatttacctatcaactaactatagttgatta 5925006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 162
Target Start/End: Original strand, 5924852 - 5924935
Alignment:
Q  78 ggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgataaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagag 162  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||||  ||||||| |||||||||||    
T  5924852 ggagatactcatagaaactcattatagaa-tgaatagattgataaaagatgatgaaataatacacgagtgttcttatatatagag 5924935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 51020609 - 51020570
Alignment:
Q  261 taccttaactaactccacataacttccaactatcttaaca 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51020609 taccttaaccaactccacataacttccaactattttaaca 51020570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 58982 - 58785
Alignment:
Q  47 agcaagatagcaagcataagaa-actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgataaaagataatgaatgagtacaatag 145  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  58982 agcaagaaagcaagcataagagtactcatgtgggagatactcatagaaactcattatagaa-tgaatagattgataaaagatgatgaatgagtacaatag 58884  T
Q  146 tgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  58883 tgttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacctactaactaactatagttgatta 58785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6348 - 6225
Alignment:
Q  121 aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 220  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6348 aaaagatagtgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 6249  T
Q  221 ttatcaactaactataattgatta 244  Q
     |||||| |||||||| |||||||    
T  6248 ctatcaattaactatagttgatta 6225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 244
Target Start/End: Original strand, 39787168 - 39787291
Alignment:
Q  121 aaaagataatgaatgagtacaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 220  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39787168 aaaagacagtgaatgagtaaaatagtgttcctatatatagagattagtttgagtaactaactctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttac 39787267  T
Q  221 ttatcaactaactataattgatta 244  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  39787268 ctatcaactaactatagttgatta 39787291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Original strand, 25076173 - 25076348
Alignment:
Q  70 ctcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgataaaagataatgaatgagtacaatag-tgttcctatatatagagattagt 168  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  25076173 ctcatgagagagatattcatagaaactcattatagaaatgaatatattgataaaagatgatgaaagagtacaattgttgttcctatatctagagattagt 25076272  T
Q  169 ttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
    | || | |||  ||||||||||||   |||   ||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  25076273 tggaatgacttactctaactaactctaaacttggcttctaattctagttaacctatcaactaactatagttgatta 25076348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 244
Target Start/End: Original strand, 25134142 - 25134317
Alignment:
Q  70 ctcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgataaaagataatgaatgagtacaatag-tgttcctatatatagagattagt 168  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  25134142 ctcatgagagagatattcatagaaactcattatagaaatgaatatattgataaaagatgatgaaagagtacaattgttgttcctatatctagagattagt 25134241  T
Q  169 ttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
    | || | |||  ||||||||||||   |||   ||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  25134242 tggaatgacttactctaactaactctaaacttggcttctaattctagttaacctatcaactaactatagttgatta 25134317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6569932 - 6569888
Alignment:
Q  144 agtgttcctatatatagagattagtttgagtaactacctctaact 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  6569932 agtgttcctatatatagagattagttggactaactaactctaact 6569888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 39318 - 39144
Alignment:
Q  69 actcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagattgataaaagataatgaa-tgagtacaatagtgttcctatatatagagattag 167  Q
    ||||||| |||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  39318 actcatgtgggagatactcataaaaactcattatagaaatgaatagattgataaaagatgatgaaatga-tacatgagtgttcctatatatagagtttag 39220  T
Q  168 tttgagtaactacctctaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactataattgatta 244  Q
    || | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39219 tt-gtgtaactaactttaactaacttctaaccaagctactaactctagtttacttatcaactaactatagttgatta 39144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19171 - 19063
Alignment:
Q  18 gaatcatagggagaaaagtcatagatgtaagcaagatagcaagcataaga-aactcatgagggagatattcaaagtaactcattgtagaaatgaatagat 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||  ||| || |||||||| ||| |||||||||||    
T  19171 gaatcatagggagaaaaatcatagatgtaagcaagatagaaagcataggagtactcatgtgggagatgctcatagaaactcattatag-aatgaatagat 19073  T
Q  117 tgataaaaga 126  Q
    ||||||||||    
T  19072 tgataaaaga 19063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 401 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 3575 - 3530
Alignment:
Q  401 ttactttggttagtcctcttaagcaggtacaataattatggagatt 446  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  3575 ttactttggttagtcctcttaaccagatacaataattaaggagatt 3530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University