View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7053_low_2 (Length: 783)

Name: NF7053_low_2
Description: NF7053
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7053_low_2
NF7053_low_2
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (1-312)||(27622913-27623224)
chr6 (1-306)||(27283574-27283879)
chr6 (7-312)||(13517401-13517713)
chr6 (1-306)||(30551193-30551505)
chr6 (12-245)||(33369703-33369944)
chr6 (12-245)||(29556241-29556482)
chr6 (29-245)||(4539032-4539256)
chr6 (1-245)||(27200871-27201123)
chr6 (1-245)||(27248110-27248362)
chr6 (7-243)||(34457761-34458005)
chr6 (10-245)||(29579717-29579960)
chr6 (27-245)||(26792516-26792742)
chr6 (1-230)||(27064175-27064412)
chr6 (1-245)||(28214142-28214394)
chr6 (29-245)||(26109674-26109899)
chr6 (12-245)||(27014409-27014650)
chr6 (12-245)||(29508106-29508347)
chr6 (12-230)||(14138689-14138915)
chr6 (12-306)||(27209584-27209886)
chr6 (12-306)||(27239342-27239644)
chr6 (1-306)||(27491812-27492125)
chr6 (1-245)||(27355356-27355608)
chr6 (27-230)||(4764462-4764673)
chr6 (12-245)||(26927437-26927679)
chr6 (1-245)||(26665910-26666162)
chr6 (1-245)||(26771881-26772133)
chr6 (21-245)||(28167188-28167420)
chr6 (27-306)||(4531994-4532280)
chr6 (12-245)||(16756506-16756748)
chr6 (1-245)||(4779585-4779837)
chr6 (1-245)||(16937279-16937531)
chr6 (6-245)||(8898950-8899197)
chr6 (1-245)||(16680833-16681085)
chr6 (12-312)||(24298967-24299275)
chr6 (29-245)||(15405803-15406028)
chr6 (29-245)||(15417590-15417815)
chr6 (21-245)||(24870402-24870635)
chr6 (12-306)||(27031706-27032008)
chr6 (21-306)||(22928067-22928360)
chr6 (12-306)||(13292157-13292460)
chr6 (12-306)||(27025827-27026129)
chr6 (60-306)||(20131253-20131500)
chr6 (60-306)||(22201370-22201617)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (494-771)||(15775710-15775987)
chr8 (126-312)||(15775288-15775474)
chr8 (1-245)||(29836024-29836276)
chr8 (7-243)||(28355223-28355467)
chr8 (1-250)||(33265421-33265678)
chr8 (21-245)||(18716177-18716409)
chr8 (1-243)||(31483142-31483392)
chr8 (1-306)||(12085937-12086249)
chr8 (38-306)||(31361267-31361542)
chr8 (21-307)||(22074135-22074429)
chr8 (1-245)||(44567681-44567934)
chr8 (1-243)||(19201654-19201905)
chr8 (1-245)||(19681157-19681409)
chr8 (21-306)||(18797404-18797697)
chr8 (12-306)||(21341394-21341697)
chr8 (12-306)||(14569841-14570143)
chr8 (12-306)||(15774260-15774562)
chr8 (12-245)||(2130552-2130794)
chr8 (12-312)||(19694802-19695110)
chr8 (1-245)||(9361305-9361556)
chr8 (10-245)||(22139598-22139842)
chr8 (12-306)||(33249049-33249351)
chr8 (23-306)||(16260635-16260926)
chr8 (23-245)||(19654610-19654841)
chr8 (12-306)||(27602137-27602439)
chr8 (29-245)||(19910451-19910676)
chr8 (499-648)||(15775884-15776032)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (494-771)||(24813123-24813400)
chr4 (126-312)||(24813636-24813822)
chr4 (1-306)||(54840098-54840410)
chr4 (1-306)||(31119756-31120068)
chr4 (1-306)||(21976411-21976723)
chr4 (7-243)||(20331743-20331987)
chr4 (7-245)||(27156632-27156878)
chr4 (12-306)||(14752762-14753063)
chr4 (1-306)||(40098879-40099191)
chr4 (10-245)||(6576552-6576796)
chr4 (21-306)||(5701256-5701548)
chr4 (21-307)||(15379482-15379776)
chr4 (27-245)||(18793949-18794175)
chr4 (12-245)||(36323643-36323884)
chr4 (12-245)||(36337852-36338093)
chr4 (21-245)||(39857342-39857574)
chr4 (10-245)||(5012597-5012841)
chr4 (21-312)||(15275865-15276164)
chr4 (21-305)||(15234546-15234838)
chr4 (1-245)||(33667107-33667359)
chr4 (10-244)||(1906984-1907227)
chr4 (12-245)||(24119359-24119601)
chr4 (12-306)||(24585616-24585918)
chr4 (12-245)||(34182263-34182504)
chr4 (1-245)||(14105251-14105503)
chr4 (1-245)||(30760471-30760723)
chr4 (126-306)||(24814547-24814726)
chr4 (12-245)||(17019747-17019989)
chr4 (21-167)||(14671717-14671871)
chr4 (499-648)||(24813078-24813226)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (494-771)||(13178078-13178355)
chr5 (126-312)||(13178638-13178824)
chr5 (1-306)||(15752004-15752316)
chr5 (1-306)||(30036129-30036441)
chr5 (1-306)||(33523087-33523399)
chr5 (7-312)||(33881815-33882127)
chr5 (1-245)||(31819627-31819879)
chr5 (7-243)||(40466757-40467001)
chr5 (12-245)||(6881007-6881248)
chr5 (12-245)||(9543934-9544175)
chr5 (29-306)||(37351810-37352094)
chr5 (1-306)||(18493914-18494226)
chr5 (10-305)||(22895119-22895422)
chr5 (1-245)||(37745555-37745807)
chr5 (1-245)||(28953001-28953253)
chr5 (1-306)||(43084957-43085262)
chr5 (1-245)||(9324166-9324419)
chr5 (1-245)||(26487076-26487329)
chr5 (21-245)||(2517768-2518000)
chr5 (7-306)||(30158729-30159035)
chr5 (1-247)||(12138865-12139119)
chr5 (12-245)||(18121639-18121881)
chr5 (12-245)||(15651967-15652208)
chr5 (1-245)||(3796236-3796488)
chr5 (7-243)||(11330343-11330587)
chr5 (1-245)||(32589481-32589733)
chr5 (1-245)||(37761677-37761929)
chr5 (27-245)||(31438166-31438392)
chr5 (21-306)||(8658639-8658931)
chr5 (27-312)||(24730678-24730970)
chr5 (21-305)||(25207012-25207304)
chr5 (21-305)||(25271168-25271460)
chr5 (1-245)||(34623202-34623454)
chr5 (1-245)||(5644503-5644755)
chr5 (1-312)||(13317966-13318284)
chr5 (1-245)||(28655948-28656200)
chr5 (1-312)||(30175171-30175489)
chr5 (6-245)||(37664710-37664957)
chr5 (1-245)||(13435875-13436127)
chr5 (1-245)||(18368736-18368988)
chr5 (12-306)||(23726931-23727233)
chr5 (10-306)||(23898587-23898892)
chr5 (21-245)||(41681408-41681638)
chr5 (12-306)||(11556048-11556350)
chr5 (12-245)||(23632664-23632906)
chr5 (12-306)||(22992286-22992588)
chr5 (35-306)||(13179962-13180241)
chr5 (31-245)||(33299249-33299472)
chr5 (12-306)||(33784176-33784478)
chr5 (12-306)||(24976538-24976840)
chr5 (12-245)||(24608939-24609181)
chr5 (12-245)||(30941324-30941566)
chr5 (499-648)||(13178033-13178181)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (494-771)||(3790872-3791149)
chr2 (126-312)||(3790473-3790659)
chr2 (1-306)||(19409718-19410030)
chr2 (1-306)||(13929845-13930157)
chr2 (1-306)||(37932073-37932385)
chr2 (1-245)||(3789139-3789391)
chr2 (1-306)||(16822572-16822884)
chr2 (1-306)||(16898596-16898908)
chr2 (7-306)||(37679132-37679438)
chr2 (7-306)||(37694397-37694703)
chr2 (1-306)||(32056448-32056760)
chr2 (7-243)||(253948-254192)
chr2 (1-243)||(21670469-21670719)
chr2 (7-241)||(34297851-34298093)
chr2 (7-243)||(9343283-9343527)
chr2 (7-243)||(16168180-16168424)
chr2 (21-312)||(27397051-27397350)
chr2 (7-243)||(27810405-27810649)
chr2 (7-243)||(39045178-39045423)
chr2 (10-305)||(21696423-21696726)
chr2 (1-306)||(39896765-39897077)
chr2 (7-243)||(37945161-37945405)
chr2 (1-312)||(22921372-22921690)
chr2 (21-312)||(31882987-31883285)
chr2 (7-245)||(12593516-12593762)
chr2 (21-245)||(37384371-37384603)
chr2 (1-245)||(34161537-34161789)
chr2 (27-312)||(12709852-12710144)
chr2 (1-245)||(11628479-11628731)
chr2 (1-245)||(34868330-34868582)
chr2 (10-245)||(34268216-34268460)
chr2 (21-245)||(27123216-27123448)
chr2 (1-243)||(27782919-27783169)
chr2 (21-312)||(19449639-19449939)
chr2 (27-245)||(40240245-40240471)
chr2 (12-245)||(23117481-23117723)
chr2 (21-250)||(27427761-27428000)
chr2 (12-301)||(28888939-28889236)
chr2 (12-245)||(31868102-31868344)
chr2 (12-118)||(20844600-20844706)
chr2 (12-245)||(12662175-12662418)
chr2 (584-648)||(3791130-3791194)
chr2 (205-312)||(20844802-20844908)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (12-312)||(3451936-3452244)
chr7 (1-311)||(26268209-26268526)
chr7 (7-306)||(26678233-26678539)
chr7 (494-648)||(3452501-3452655)
chr7 (7-306)||(26663041-26663347)
chr7 (1-295)||(26508848-26509150)
chr7 (7-243)||(16744711-16744955)
chr7 (1-245)||(31083812-31084065)
chr7 (12-306)||(2779929-2780230)
chr7 (27-312)||(31130616-31130909)
chr7 (1-245)||(26441939-26442191)
chr7 (7-245)||(26596356-26596603)
chr7 (1-306)||(31557533-31557846)
chr7 (1-245)||(26313052-26313305)
chr7 (1-245)||(4206070-4206322)
chr7 (1-245)||(45393914-45394166)
chr7 (1-243)||(4138436-4138686)
chr7 (12-245)||(22148573-22148814)
chr7 (1-245)||(11447583-11447835)
chr7 (21-305)||(16443134-16443426)
chr7 (1-245)||(26519502-26519754)
chr7 (21-301)||(16048027-16048315)
chr7 (21-245)||(39206353-39206585)
chr7 (21-245)||(45737995-45738227)
chr7 (494-645)||(26267899-26268050)
chr7 (12-306)||(11417931-11418233)
chr7 (1-243)||(24585726-24585977)
chr7 (12-245)||(5154768-5155010)
chr7 (35-245)||(5140526-5140744)
chr7 (21-306)||(10848299-10848592)
chr7 (12-193)||(22152800-22152989)
chr7 (12-193)||(22208715-22208904)
chr7 (21-312)||(5165078-5165377)
chr7 (12-306)||(2161257-2161558)
chr7 (12-245)||(16511637-16511879)
chr7 (12-312)||(10910072-10910380)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (1-306)||(24334836-24335148)
chr3 (1-312)||(18231852-18232170)
chr3 (1-306)||(28109250-28109563)
chr3 (21-306)||(10649750-10650042)
chr3 (1-306)||(17978238-17978550)
chr3 (1-306)||(5020371-5020683)
chr3 (12-245)||(11103731-11103972)
chr3 (7-243)||(5589705-5589949)
chr3 (7-243)||(5717721-5717965)
chr3 (7-243)||(5728631-5728875)
chr3 (7-243)||(5763493-5763737)
chr3 (1-245)||(6536090-6536342)
chr3 (1-312)||(28345831-28346149)
chr3 (7-243)||(29658316-29658560)
chr3 (12-245)||(31029613-31029854)
chr3 (12-245)||(32445801-32446042)
chr3 (21-306)||(16617776-16618070)
chr3 (21-306)||(22041087-22041381)
chr3 (7-306)||(32297297-32297603)
chr3 (10-244)||(4340047-4340289)
chr3 (12-306)||(18285666-18285967)
chr3 (12-306)||(18300967-18301268)
chr3 (12-245)||(4630430-4630671)
chr3 (1-245)||(22864211-22864463)
chr3 (1-245)||(22879270-22879522)
chr3 (1-312)||(31957737-31958055)
chr3 (1-243)||(47030115-47030366)
chr3 (27-245)||(4423582-4423808)
chr3 (1-245)||(17970227-17970480)
chr3 (1-306)||(18249378-18249690)
chr3 (1-245)||(5602660-5602912)
chr3 (1-245)||(20570203-20570455)
chr3 (12-230)||(5473638-5473864)
chr3 (1-245)||(16404139-16404391)
chr3 (21-245)||(48472590-48472822)
chr3 (27-245)||(21681406-21681632)
chr3 (1-245)||(10402812-10403064)
chr3 (21-245)||(20072693-20072925)
chr3 (1-245)||(51788682-51788934)
chr3 (21-306)||(15367923-15368217)
chr3 (10-306)||(19701064-19701368)
chr3 (1-245)||(28027931-28028183)
chr3 (12-306)||(29142063-29142365)
chr3 (12-306)||(35887409-35887711)
chr3 (1-245)||(8218285-8218537)
chr3 (12-306)||(4728275-4728577)
chr3 (12-306)||(5658783-5659085)
chr3 (12-306)||(6208544-6208846)
chr3 (12-306)||(18057917-18058219)
chr3 (12-306)||(4789940-4790242)
chr3 (12-306)||(8282769-8283071)
chr3 (10-306)||(16422854-16423158)
chr3 (126-245)||(16599406-16599525)
chr3 (12-306)||(15886026-15886328)
chr3 (12-306)||(18337273-18337575)
chr3 (12-245)||(22380949-22381191)
chr3 (126-306)||(7080022-7080201)
chr3 (12-306)||(4690324-4690626)
chr3 (29-306)||(15734425-15734710)
chr3 (12-116)||(7079877-7079981)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (1-301)||(51644922-51645229)
chr1 (1-245)||(10951792-10952044)
chr1 (27-243)||(10969369-10969593)
chr1 (1-245)||(3647847-3648099)
chr1 (1-245)||(28591781-28592033)
chr1 (10-306)||(16201276-16201580)
chr1 (21-245)||(28156425-28156657)
chr1 (21-245)||(41786640-41786872)
chr1 (29-301)||(20333667-20333947)
chr1 (12-306)||(14692162-14692464)
chr1 (12-306)||(14694844-14695146)
chr1 (12-306)||(14697528-14697830)
chr1 (12-306)||(14700209-14700511)
chr1 (21-301)||(20467504-20467792)
chr1 (12-165)||(21891136-21891297)
chr1 (137-210)||(13769558-13769631)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (7-245)||(2361-2607)
scaffold0322 (21-306)||(12769-13062)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (21-306)||(8187-8479)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-245)||(14640-14892)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (21-296)||(28012-28293)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (12-306)||(12725-13026)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (1-245)||(10616-10869)
scaffold0143 (12-306)||(33981-34283)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (1-245)||(2483-2735)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (21-312)||(25809-26108)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (21-305)||(490-782)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-245)||(16274-16526)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (12-312)||(24213-24521)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (12-245)||(3921-4163)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (12-245)||(8966-9209)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (12-117)||(40064-40171)
scaffold0099 (202-245)||(39922-39965)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (202-306)||(1309-1412)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (12-68)||(6751-6807)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (202-245)||(13281-13324)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27623224 - 27622913
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27623224 acggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctaccctcagccatggttctggtacgtctcccaacggcgtt 27623125  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27623124 atctccaaagaggatttctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactgtcaacc 27623025  T
Q  201 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27623024 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttccaa 27622925  T
Q  301 tatcaatgtcag 312  Q
    ||||||||||||    
T  27622924 tatcaatgtcag 27622913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27283879 - 27283574
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283879 acggcgttatccccagtcgggtcttccagaattctatccccagtaagttgattagctatctaccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 27283780  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtc-gtgtctacaaactatcaac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | | ||  | |||||||||||||  ||||    
T  27283779 atctccaaagaggatttctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctcttcaaaactgtgtctacaaactgccaac 27283680  T
Q  200 catcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgca 299  Q
      ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  27283679 agtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttcca 27283581  T
Q  300 atatcaa 306  Q
    || ||||    
T  27283580 atgtcaa 27283574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13517713 - 13517401
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  13517713 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 13517614  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  13517613 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaacgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 13517514  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 298  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  13517513 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatacatattgcatttcc 13517415  T
Q  299 aatatcaatgtcag 312  Q
    ||||||||| ||||    
T  13517414 aatatcaatatcag 13517401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30551505 - 30551193
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  30551505 acggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 30551406  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  30551405 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatatcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 30551306  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  30551305 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgc 30551207  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||| ||||    
T  30551206 atttccaatgtcaa 30551193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33369944 - 33369703
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33369944 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 33369845  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  33369844 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 33369745  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33369744 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 33369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 29556241 - 29556482
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  29556241 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatgcctatctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacggcgtcatcttcaaaaa 29556340  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  29556341 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 29556440  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29556441 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 29556482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4539256 - 4539032
Alignment:
Q  29 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga----- 123  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||         
T  4539256 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtg 4539157  T
Q  124 ---tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattc 220  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| |||||    
T  4539156 taatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcattc 4539057  T
Q  221 atacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  4539056 atacatgcataatcatgcatattac 4539032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 27200871 - 27201123
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  27200871 acggtgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 27200970  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatgatg--------tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | || |        |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  27200971 atctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagctcgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 27201070  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27201071 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 27201123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27248362 - 27248110
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  27248362 acggtgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 27248263  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatgatg--------tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | || |        |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  27248262 atctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagctcgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 27248163  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27248162 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 27248110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34458005 - 34457761
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  34458005 ttttccccagtcaggtcttccaagactctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 34457906  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  34457905 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactatgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 34457806  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34457805 cagtcatgcgttacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 34457761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 29579717 - 29579960
Alignment:
Q  10 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  29579717 tccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcacacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccata 29579816  T
Q  110 gaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacca 201  Q
    ||||||||| | ||        | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||      
T  29579817 gaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgggccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacag 29579916  T
Q  202 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29579917 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 29579960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Original strand, 26792516 - 26792742
Alignment:
Q  27 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||       
T  26792516 caagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcgtctccaaagaggatttccaagaatg 26792615  T
Q  124 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 218  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  26792616 tgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcat 26792715  T
Q  219 tcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26792716 tcatacatgcataatcatgcatattac 26792742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27064175 - 27064412
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||  |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||     
T  27064175 acggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatctccagcaagtcgcatacttgcctgccctcagccatggttctgatacgtctcccaacgacgtc 27064274  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  27064275 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 27064374  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcat 230  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27064375 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcat 27064412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 28214142 - 28214394
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   | ||||| |||||| ||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  28214142 acggcgttttccccagtaaagccttccgagattcaatttccagcaagttgtatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 28214241  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  28214242 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 28214341  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28214342 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 28214394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26109899 - 26109674
Alignment:
Q  29 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaa-cggcgttatctccaaagaggatttctatgatg-- 125  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| | || |      
T  26109899 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaaggt 26109800  T
Q  126 ------tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcatt 219  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| ||||    
T  26109799 gtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtctcgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcatt 26109700  T
Q  220 catacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26109699 catacatgcataatcatgcatattac 26109674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 27014409 - 27014650
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27014409 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcgagtcgcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 27014508  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  27014509 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 27014608  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27014609 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 27014650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 29508106 - 29508347
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29508106 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttacatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 29508205  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  29508206 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttctccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 29508305  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29508306 atgcattacaagcattcatacatgcataattatgcatattac 29508347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14138915 - 14138689
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14138915 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcgagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 14138816  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  14138815 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 14138716  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcat 230  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14138715 atgcattacaagcattcatacatgcat 14138689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 27209584 - 27209886
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27209584 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaaga 27209683  T
Q  112 ggattt------ctatg--atgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    ||||||       ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  27209684 ggatttactggaatatgtaatctagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctatctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 27209783  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||     
T  27209784 catgcattacaagcattcatacatgcataaccatgcatactacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttccaatg 27209882  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  27209883 tcaa 27209886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27239644 - 27239342
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27239644 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaaga 27239545  T
Q  112 ggattt------ctatg--atgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    ||||||       ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  27239544 ggatttactggaatatgtaatctagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctatctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 27239445  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||     
T  27239444 catgcattacaagcattcatacatgcataaccatgcatactacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttccaatg 27239346  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  27239345 tcaa 27239342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 27491812 - 27492125
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 99  Q
    |||| ||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||    
T  27491812 acggcgttttccccggtgaggtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttacctacctgccctcagccatggtcccgaaacgtctcccaacgacgt 27491911  T
Q  100 tatctccaaagaggatttctatgatg--------tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 191  Q
     |||||||||||||||||| | || |        |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27491912 catctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagcacgagctactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 27492011  T
Q  192 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 291  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||    
T  27492012 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattg 27492110  T
Q  292 catttgcaatatcaa 306  Q
    ||||| |||| ||||    
T  27492111 catttccaatgtcaa 27492125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27355608 - 27355356
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||     
T  27355608 acggcgttttccccggtgaggtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggctccgatacgtcccccaacgacgtc 27355509  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||| |||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  27355508 atctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 27355409  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27355408 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 27355356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 230
Target Start/End: Original strand, 4764462 - 4764673
Alignment:
Q  27 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||       
T  4764462 caagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatg 4764561  T
Q  124 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 218  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  4764562 tgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcat 4764661  T
Q  219 tcatacatgcat 230  Q
    ||||||||||||    
T  4764662 tcatacatgcat 4764673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 26927437 - 26927679
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26927437 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcgagttgattagctatctatcctcagccttggttccgatacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 26927536  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  26927537 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 26927636  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26927637 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 26927679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26666162 - 26665910
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |  |||||||||  ||| |||  ||||||||||||| |||     
T  26666162 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcccaccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtc 26666063  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26666062 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtcatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 26665963  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26665962 tgccaacagtcatacattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 26665910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26772133 - 26771881
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |  |||||||||  ||| |||  ||||||||||||| |||     
T  26772133 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcccaccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtc 26772034  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26772033 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtcatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 26771934  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26771933 tgccaacagtcatacattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 26771881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 28167188 - 28167420
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  28167188 gtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 28167287  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  28167288 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 28167387  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28167388 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 28167420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 306
Target Start/End: Original strand, 4531994 - 4532280
Alignment:
Q  27 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||       
T  4531994 caagattctatccccagcaagttgcatagctaccagccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatg 4532093  T
Q  124 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 218  Q
         | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  4532094 tgtaatatagctcgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcat 4532193  T
Q  219 tcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  4532194 tcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 4532280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 16756506 - 16756748
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16756506 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 16756605  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  16756606 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 16756705  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16756706 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 16756748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 4779585 - 4779837
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  ||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| |||     
T  4779585 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtc 4779684  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  4779685 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaaaattctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 4779784  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4779785 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 4779837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16937531 - 16937279
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||    || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  16937531 acggcgttttccccagtggagtctctcaagactctatccccagcaagtcacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 16937432  T
Q  101 atctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||| |||| || ||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16937431 atctccatagagaatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 16937332  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16937331 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 16937279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8899197 - 8898950
Alignment:
Q  6 gttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctc 105  Q
    ||||||||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  8899197 gttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctc 8899098  T
Q  106 caaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatca 197  Q
    || ||||||| ||        | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||    
T  8899097 catagaggatctccgagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgcca 8898998  T
Q  198 accatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8898997 acagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 8898950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 16680833 - 16681085
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  16680833 acggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 16680932  T
Q  101 atctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||| ||||||| ||        | | |  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16680933 atctccatagaggatctccgagaatgtgtaacatagcacgagccactatgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 16681032  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16681033 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 16681085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24299275 - 24298967
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24299275 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 24299176  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |   |||||||||||    ||||  |    
T  24299175 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgtggaactgtgtctacaaatcgccaacagt 24299076  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||     
T  24299075 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcattcatgcatattgcatttccaatg 24298977  T
Q  303 tcaatgtcag 312  Q
    ||||| ||||    
T  24298976 tcaatatcag 24298967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15406028 - 15405803
Alignment:
Q  29 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatt--------tcta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||        | |     
T  15406028 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggattttcaggaatgtg 15405929  T
Q  121 tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcatt 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||  ||||||||| ||| ||||    
T  15405928 taatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagtcatgcattacaagcatt 15405829  T
Q  220 catacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15405828 catacatgcataatcatgcatattac 15405803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15417815 - 15417590
Alignment:
Q  29 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatt--------tcta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||        | |     
T  15417815 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggattttcaggaatgtg 15417716  T
Q  121 tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcatt 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||  ||||||||| ||| ||||    
T  15417715 taatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagtcatgcattacaagcatt 15417616  T
Q  220 catacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15417615 catacatgcataatcatgcatattac 15417590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 24870402 - 24870635
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||      
T  24870402 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 24870501  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
          | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | | | |||||||||||    || |  |||||||||     
T  24870502 ggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaattgtgtctacaaatcgccagcagtcatgcatta 24870601  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24870602 caagcattcatacatgcataatcatgcatattac 24870635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 27031706 - 27032008
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27031706 cccagtagagtcttccgagatcctatccccagcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 27031805  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||| || | | | | | |||||||||||    ||||  |    
T  27031806 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatgctccagtgtcttgtctgtctctgcggaattgtgtctacaaatcgccaacagt 27031905  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  27031906 catgcattacaaacattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 27032004  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  27032005 tcaa 27032008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22928360 - 22928067
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||      
T  22928360 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacatctcccaacgatgttatctccaaagaggatttcca 22928261  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
          | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | | | |||||||||||    ||||  ||||||||      
T  22928260 ggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaattgtgtctacaaatcgccaacagtcatgcatca 22928161  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  22928160 caagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 22928067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13292460 - 13292157
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattag-ctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaag 110  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  13292460 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagactaccggccctcagccttggtcccgatacgtcccccaacgacgtcatctccaaag 13292361  T
Q  111 aggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacca 201  Q
    ||||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | ||| | |||||||||||    ||||      
T  13292360 aggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaattgtgtctacaaatcgccaacag 13292261  T
Q  202 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 301  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  13292260 tcatgcattacaagcattcatacatacataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaat 13292162  T
Q  302 atcaa 306  Q
     ||||    
T  13292161 gtcaa 13292157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 27025827 - 27026129
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27025827 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcataactaccggccctcagccttggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 27025926  T
Q  112 ggatt--------tctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||        | | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||    ||||||||||    ||||  |    
T  27025927 ggattttcaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactttgtctacaaatcgccaacagt 27026026  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  27026027 catgcattacaagcattcatacatacataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 27026125  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  27026126 tcaa 27026129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 306
Target Start/End: Original strand, 20131253 - 20131500
Alignment:
Q  60 ctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaata 151  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||        | |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  20131253 ctgccctcagccatggtttcgatacgtctcccaacgacgatatctccaaagaggatttccaggaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaaca 20131352  T
Q  152 ctctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtct 251  Q
    |||  |||||||||||     | |||   || | |||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |     
T  20131353 ctccgatgtcttgtct-----gagaaactgtct-tacaaattgccaaccatcatgcatttcaagcatccatacatgcataatcatgcatactacgtgccc 20131446  T
Q  252 atacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  20131447 atgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatgttgcatttccaatgtcaa 20131500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22201617 - 22201370
Alignment:
Q  60 ctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaata 151  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||        | |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22201617 ctgccctcagccatggtttcgatacgtctcccaacgacgatatctccaaagaggatttccaggaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaaca 22201518  T
Q  152 ctctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtct 251  Q
    |||  |||||||||||     | |||   || | |||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |     
T  22201517 ctccgatgtcttgtct-----gagaaactgtct-tacaaattgccaaccatcatgcatttcaagcatccatacatgcataatcatgcatactacgtgccc 22201424  T
Q  252 atacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  22201423 atgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatgttgcatttccaatgtcaa 22201370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 494 - 771
Target Start/End: Original strand, 15775710 - 15775987
Alignment:
Q  494 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15775710 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 15775809  T
Q  594 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtcccagtcaacttacttctacctctgttatcctgtgagccggtgcagtt 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15775810 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtcccagtcaacttacttctacctctgttatcctgtgagccggtgcagtt 15775909  T
Q  694 tggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaatcccattacaaatccccagtgatgtccatc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15775910 tggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaatcccattacaaatccccagtgatttccatc 15775987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 126 - 312
Target Start/End: Original strand, 15775288 - 15775474
Alignment:
Q  126 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcataca 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15775288 tagcacgagccaccacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactgtcaaccatcatgcatttcaatcattcatgca 15775387  T
Q  226 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15775388 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttccaatatcaatgtcag 15775474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 29836024 - 29836276
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  29836024 acggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 29836123  T
Q  101 atctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||||||||||||||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  29836124 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 29836223  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29836224 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 29836276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28355467 - 28355223
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  28355467 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 28355368  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  28355367 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 28355268  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28355267 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 28355223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 33265421 - 33265678
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||     
T  33265421 acggcgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtc 33265520  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    || ||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33265521 atttccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 33265620  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtc 250  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  33265621 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgtc 33265678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 18716177 - 18716409
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  18716177 gtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 18716276  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  18716277 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 18716376  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18716377 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 18716409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31483392 - 31483142
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  31483392 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaaattgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 31483293  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31483292 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 31483193  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  | ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31483192 tgccgacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 31483142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12086249 - 12085937
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   | ||||| |||||| ||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  12086249 acggcgttttccccagtaaagccttccgagattcaatttccagcaagttgtatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 12086150  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  12086149 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 12086050  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| | ||    
T  12086049 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatatcgc 12085951  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| ||| |||||    
T  12085950 atttccaacatcaa 12085937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 306
Target Start/End: Original strand, 31361267 - 31361542
Alignment:
Q  38 ccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagc 129  Q
    |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        | | || ||||    
T  31361267 ccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccgagaatgtgtaatatagc 31361366  T
Q  130 acgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgca 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  31361367 acgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgca 31361466  T
Q  230 tgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    | |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  31361467 taatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatatcaa 31361542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22074429 - 22074135
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||      
T  22074429 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgttatatccaaagaggatttcca 22074330  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
          | |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  22074329 agaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaatattccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 22074230  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaat 307  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| | || |||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22074229 caagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatacatttaat-aaaactattataccacccatacatgttgcatttccaatgtcaat 22074135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 44567681 - 44567934
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||     
T  44567681 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatttccagcaagttgcatagctacctgtcctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgtc 44567780  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga---------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 191  Q
    |||||||||||||||||| | ||         | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44567781 atctccaaagaggatttccaagaaatgtgtaatatagcgcgagccgctacgtgcccaatattctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 44567880  T
Q  192 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44567881 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 44567934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19201905 - 19201654
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 99  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||    
T  19201905 acggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagttacctgccctcagctgtggttccgacacgtctcccaacgacgt 19201806  T
Q  100 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 191  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  19201805 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagttgtgcttacaaa 19201706  T
Q  192 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19201705 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 19201654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 19681157 - 19681409
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||     
T  19681157 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtc 19681256  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  19681257 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgatctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 19681356  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19681357 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgtataatcatgcatattac 19681409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Original strand, 18797404 - 18797697
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||      
T  18797404 gtctcccaagattctatccttagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 18797503  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
          | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  18797504 ggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 18797603  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||    
T  18797604 caagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttataccatccatgcatatcgcatttccaatgtcaa 18797697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21341697 - 21341394
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaag 110  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21341697 cccagtagagtcttccgagattctatcctcaagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaag 21341598  T
Q  111 aggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacca 201  Q
    ||||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||      
T  21341597 aggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacag 21341498  T
Q  202 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 301  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  21341497 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaat 21341399  T
Q  302 atcaa 306  Q
     ||||    
T  21341398 gtcaa 21341394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 14569841 - 14570143
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14569841 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcgagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 14569940  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    ||||||| | ||        | ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    |||| ||    
T  14569941 ggatttccaagaatgtgtagtatagcacgagccactgtgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacaat 14570040  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  14570041 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 14570139  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  14570140 tcaa 14570143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 15774260 - 15774562
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15774260 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 15774359  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||| | ||  ||||  |    
T  15774360 ggatttccaggaatgtgtaatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctaccagctgccaacagt 15774459  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||     
T  15774460 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatgtcgcatttccaatg 15774558  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  15774559 tcaa 15774562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2130794 - 2130552
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2130794 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctatctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 2130695  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | | | | | |||||||||||    || |  |    
T  2130694 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaattgtgtctacaaatcgccagcagt 2130595  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2130594 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 2130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 312
Target Start/End: Original strand, 19694802 - 19695110
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  19694802 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctctcaacgacgtcatctccaaaga 19694901  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || || ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||    ||||  |    
T  19694902 ggatttccaggaatgtgtaatataacacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaatcgccaacagt 19695001  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  19695002 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgtccatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 19695100  T
Q  303 tcaatgtcag 312  Q
    ||||| ||||    
T  19695101 tcaatatcag 19695110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 9361305 - 9361556
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  ||||| |||||||||||| ||||   || ||| | ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||     
T  9361305 acggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagccagttacatacctaccggccctcagctatggt-ccgatacgtcccccaacgacgtc 9361403  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||  | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  9361404 atctccaaagaggattttcaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 9361503  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9361504 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 9361556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 22139598 - 22139842
Alignment:
Q  10 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 109  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22139598 tccccagtagagtcttccgagattctgtccccagcaagttgtatagctacctgccctcagtcatggttccgataagtctcccaacgacgttatctccaaa 22139697  T
Q  110 gaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 200  Q
    |||||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||||  ||||     
T  22139698 gaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaactgccaaca 22139797  T
Q  201 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
     ||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22139798 gtcatgcattacaagcattcatacacgcataatcatgcatattac 22139842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 33249049 - 33249351
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33249049 cccagtagagtcttccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagccttggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 33249148  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || | | |||   |||||||||||    ||||  |    
T  33249149 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtttgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagt 33249248  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  33249249 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 33249347  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  33249348 tcaa 33249351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 306
Target Start/End: Original strand, 16260635 - 16260926
Alignment:
Q  23 cttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc---- 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  16260635 cttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagtcatggttccgataagtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccagg 16260734  T
Q  119 ----tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttca 213  Q
        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||||  ||||  ||||||||  ||    
T  16260735 aatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcataaca 16260834  T
Q  214 atcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| ||||  |||  |||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  16260835 agcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttgat-gaaaccgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 16260926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19654841 - 19654610
Alignment:
Q  23 cttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc---- 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  19654841 cttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagtcatggttccgataagtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccagg 19654742  T
Q  119 ----tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttca 213  Q
        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | |   |||||||| |||| |||||  |||| |||| ||    
T  19654741 aatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctaccaactgtcaacagtcatacattaca 19654642  T
Q  214 atcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19654641 agcattcatacatgcataatcatgcatattac 19654610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27602439 - 27602137
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  27602439 cccagtagagtctcccaagattctatccttagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcagctccaaaga 27602340  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||| || | | |||   | |||||||||    ||||  |    
T  27602339 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccaccgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgcgaaactgcgtctacaaatcgccaacagt 27602240  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  27602239 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 27602141  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  27602140 tcaa 27602137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19910676 - 19910451
Alignment:
Q  29 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------ta 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        |     
T  19910676 agattctatcctcagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtg 19910577  T
Q  121 tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcatt 219  Q
    | || ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||    ||||  ||||||||| ||| ||||    
T  19910576 taatatagcacgagccactgtgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaatcgccaacagtcatgcattacaagcatt 19910477  T
Q  220 catacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19910476 catacatgcataatcatgcatattac 19910451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 648
Target Start/End: Original strand, 15775884 - 15776032
Alignment:
Q  499 ctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaa-tctccagtgatt 597  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||  | || |||||||||||| ||  ||  ||  ||| ||| || |||||||||    
T  15775884 ctgttatcctgtgagccggtgcagtttggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaa--tcccattacaaatccccagtgatt 15775981  T
Q  598 cccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtccc 648  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15775982 tccatccatgtttggataagtggctagttcaatccaagaacagtttgtccc 15776032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 494 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 24813400 - 24813123
Alignment:
Q  494 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813400 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccactttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 24813301  T
Q  594 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtcccagtcaacttacttctacctctgttatcctgtgagccggtgcagtt 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813300 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtcccagtcaacttacttctacctctgttatcctgtgagccggtgcagtt 24813201  T
Q  694 tggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaatcccattacaaatccccagtgatgtccatc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24813200 tggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaatcccattacaaatccccagtgatttccatc 24813123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 126 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24813822 - 24813636
Alignment:
Q  126 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcataca 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24813822 tagcacgagccaccacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccatgaagtcgtgtctacaaactgtcaaccatcatgcatttcaatcattcatgca 24813723  T
Q  226 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24813722 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttccaatatcaatgtcag 24813636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 54840098 - 54840410
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||     
T  54840098 acggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgtc 54840197  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54840198 atctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaataatccaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 54840297  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  54840298 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatacatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgc 54840396  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||| ||||    
T  54840397 atttccaatgtcaa 54840410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31120068 - 31119756
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  31120068 acggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 31119969  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  31119968 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 31119869  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  31119868 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgc 31119770  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||| ||||    
T  31119769 atttccaatgtcaa 31119756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 21976411 - 21976723
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  21976411 acggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 21976510  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21976511 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatatcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 21976610  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  21976611 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgc 21976709  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||| ||||    
T  21976710 atttccaatgtcaa 21976723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20331987 - 20331743
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  20331987 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 20331888  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  20331887 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 20331788  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20331787 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 20331743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27156878 - 27156632
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  27156878 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 27156779  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  27156778 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttctccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaa 27156679  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27156678 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 27156632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14753063 - 14752762
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14753063 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 14752964  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  14752963 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtctcgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 14752864  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatat 303  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  14752863 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccgtgcatattgcatttccaatat 14752765  T
Q  304 caa 306  Q
    |||    
T  14752764 caa 14752762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40099191 - 40098879
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  40099191 acggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 40099092  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  40099091 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 40098992  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    || ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| | ||    
T  40098991 taccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatatcgc 40098893  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||||||||    
T  40098892 atttccaatatcaa 40098879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 6576552 - 6576796
Alignment:
Q  10 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 109  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6576552 tccccagtggagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacttacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaa 6576651  T
Q  110 -gaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 200  Q
     ||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||     
T  6576652 agaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccatgaagtcgtgcctacaaactgccaaca 6576751  T
Q  201 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6576752 gtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 6576796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Original strand, 5701256 - 5701548
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  5701256 gtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggttctgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 5701355  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  5701356 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 5701455  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  5701456 aagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 5701548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15379776 - 15379482
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||      
T  15379776 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgttatatccaaagaggatttcca 15379677  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
          | |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  15379676 agaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaatattccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 15379577  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaat 307  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| | || |||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15379576 caagcgttcatacatgcataatcatgcatattacgtgtccatacatttaat-aaaactattataccacccatacatgttgcatttccaatgtcaat 15379482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18794175 - 18793949
Alignment:
Q  27 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||       
T  18794175 caagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatg 18794076  T
Q  124 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 218  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  18794075 tgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcat 18793976  T
Q  219 tcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18793975 tcatacatgcataatcatgcatattac 18793949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36323884 - 36323643
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  36323884 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatgcctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaagga 36323785  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  36323784 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 36323685  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  36323684 atgcattacaagcattcatgcatgcataatcatgcacattac 36323643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36338093 - 36337852
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  36338093 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatgcctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaagga 36337994  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  36337993 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 36337894  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  36337893 atgcattacaagcattcatgcatgcataatcatgcacattac 36337852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 39857342 - 39857574
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| |    
T  39857342 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccacagaagaattcca 39857441  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||   ||||||||| |    
T  39857442 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaatagtcatgcattac 39857541  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39857542 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 39857574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 5012597 - 5012841
Alignment:
Q  10 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 109  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5012597 tccccagtcgggtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccgtggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaa 5012696  T
Q  110 gaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtg-cccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 200  Q
    |||||||||        | | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||      
T  5012697 gaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgccccaacactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaata 5012796  T
Q  201 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
     ||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5012797 gtcacgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 5012841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15276164 - 15275865
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||      
T  15276164 gtcttccgagattctgtccccagcaagtcgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacaacgttatctccaaagaggatttcca 15276065  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
          | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  15276064 agaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 15275965  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtca 311  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| | || |||| | |||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  15275964 caagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatttaat-aaaactattataccacctatacatgttgcatttccaatgtcaatttca 15275866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 305
Target Start/End: Original strand, 15234546 - 15234838
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  15234546 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagtcatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttcca 15234645  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
          | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||| ||  | || ||||||||||     
T  15234646 ggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaagctgcccacaatcatgcatta 15234745  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatca 305  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||  |  || | |||||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15234746 caagcattcatacatgcataatcatgcataccatgtgcccatacatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttccaatatca 15234838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33667359 - 33667107
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||     
T  33667359 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtc 33667260  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  33667259 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgatctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 33667160  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33667159 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgtataatcatgcatattac 33667107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 1906984 - 1907227
Alignment:
Q  10 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 109  Q
    |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  1906984 tccccagtagagccttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagtcatggttccgatacgtctcccaatgacgttatctccaaa 1907083  T
Q  110 gaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 200  Q
    |||||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||| ||||     
T  1907084 gaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactaccaaca 1907183  T
Q  201 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatta 244  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1907184 gtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatta 1907227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 24119359 - 24119601
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||   |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  || |||||||||||    
T  24119359 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatatctactggccctcagccttggtcccgatacgtctcccaacgatgtcatctccaaaga 24119458  T
Q  112 ggatttc---------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    ||||||          | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  |    
T  24119459 ggattttccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagt 24119558  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24119559 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 24119601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24585918 - 24585616
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24585918 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctatctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 24585819  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  24585818 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 24585719  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  24585718 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 24585620  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  24585619 tcaa 24585616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34182504 - 34182263
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34182504 cccagtagagtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 34182405  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||  ||    
T  34182404 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactatgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacgaattgccaacagtc 34182305  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34182304 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 34182263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 14105251 - 14105503
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  14105251 acggcgttttccccagtggagtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctaccgaccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 14105350  T
Q  101 atctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||| ||||||| ||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  14105351 atctccatagaggatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 14105450  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  | ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14105451 tgcccacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 14105503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 30760471 - 30760723
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||     
T  30760471 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtc 30760570  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||||| |||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  30760571 atctccaaaaaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgatctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 30760670  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30760671 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgtataatcatgcatattac 30760723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24814726 - 24814547
Alignment:
Q  126 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcataca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||    
T  24814726 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtaaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcattcataca 24814627  T
Q  226 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    ||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  24814626 tgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 24814547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 17019747 - 17019989
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17019747 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 17019846  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |   |||||||||||    ||||  |    
T  17019847 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgtggaactgtgtctacaaatcgccaacagt 17019946  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17019947 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 17019989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 14671717 - 14671871
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||      
T  14671717 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 14671816  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct 167  Q
          | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14671817 ggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtct 14671871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 499 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 24813226 - 24813078
Alignment:
Q  499 ctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaa-tctccagtgatt 597  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||  | || |||||||||||| ||  ||  ||  ||| ||| || |||||||||    
T  24813226 ctgttatcctgtgagccggtgcagtttggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaa--tcccattacaaatccccagtgatt 24813129  T
Q  598 cccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtccc 648  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24813128 tccatccatgtttggataagtggctagttcaatccaagaacagcttgtccc 24813078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 494 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 13178355 - 13178078
Alignment:
Q  494 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13178355 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgatgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 13178256  T
Q  594 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtcccagtcaacttacttctacctctgttatcctgtgagccggtgcagtt 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13178255 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagttcaagaacagcttgtcccagtcaacttacttctacctctgttatcctgtgagccggtgcagtt 13178156  T
Q  694 tggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaatcccattacaaatccccagtgatgtccatc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13178155 tggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaatcccattacaaatccccagtgatttccatc 13178078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 126 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13178824 - 13178638
Alignment:
Q  126 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcataca 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13178824 tagcacgagccaccacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactgtcaaccatcatgcatttcaatcattcatgca 13178725  T
Q  226 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13178724 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttccaatatcaatgtcag 13178638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15752316 - 15752004
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  15752316 acggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 15752217  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||| |||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15752216 atccccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 15752117  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  15752116 tgccaacggtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgc 15752018  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||| ||||    
T  15752017 atttccaatgtcaa 15752004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 30036129 - 30036441
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  30036129 acggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 30036228  T
Q  101 atctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||| ||||||||||||||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  30036229 atccccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 30036328  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  30036329 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgc 30036427  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||| ||||    
T  30036428 atttccaatgtcaa 30036441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 33523087 - 33523399
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  33523087 acggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 33523186  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  33523187 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 33523286  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  33523287 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgc 33523385  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||| ||||    
T  33523386 atttccaatgtcaa 33523399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 312
Target Start/End: Original strand, 33881815 - 33882127
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  33881815 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 33881914  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  33881915 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaacgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 33882014  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 298  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  33882015 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatacatattgcatttcc 33882113  T
Q  299 aatatcaatgtcag 312  Q
    ||||||||| ||||    
T  33882114 aatatcaatatcag 33882127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31819879 - 31819627
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  31819879 acggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 31819780  T
Q  101 atctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||||||||||||||        | | || ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  31819779 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcatgagccactatgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 31819680  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31819679 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 31819627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40467001 - 40466757
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  40467001 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 40466902  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  40466901 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 40466802  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40466801 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 40466757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 6881007 - 6881248
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6881007 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 6881106  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  6881107 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 6881206  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6881207 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 6881248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9544175 - 9543934
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9544175 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcgagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 9544076  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  9544075 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 9543976  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9543975 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 9543934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37352094 - 37351810
Alignment:
Q  29 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga----- 123  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||         
T  37352094 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtg 37351995  T
Q  124 ---tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattc 220  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||  ||||||||| ||| |||||    
T  37351994 taatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctaccaaatgccaacagtcatgcattacaagcattc 37351895  T
Q  221 atacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||   || ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  37351894 atacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-ggaactgttataacatccatgcatattgcatttccaatatcaa 37351810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18494226 - 18493914
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  18494226 acggcgttttccccggtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctactggccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 18494127  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||   ||||     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18494126 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactatgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 18494027  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||| | ||| ||||    
T  18494026 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccgtgcatattgc 18493928  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||| ||||    
T  18493927 atttccaatgtcaa 18493914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 305
Target Start/End: Original strand, 22895119 - 22895422
Alignment:
Q  10 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 109  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22895119 tccccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctatctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaa 22895218  T
Q  110 gaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 200  Q
    |||||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||     
T  22895219 gaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgacttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaaca 22895318  T
Q  201 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaa 300  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  22895319 gtcatgcattgcaagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttccaa 22895417  T
Q  301 tatca 305  Q
    |||||    
T  22895418 tatca 22895422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37745807 - 37745555
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  37745807 acggtgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcgagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 37745708  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatgatg--------tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | || |        |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37745707 atctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgttttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 37745608  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37745607 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 37745555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28953253 - 28953001
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||     
T  28953253 acggcgttttccccagtaaagtcttccgagattctgtccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtc 28953154  T
Q  101 atctccaaagaggatttc------tatg--atgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||       ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28953153 atctccaaagaggattttcaagaatatgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 28953054  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28953053 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 28953001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 43084957 - 43085262
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  43084957 acggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 43085056  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga-tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaac 199  Q
    ||||||| |||||||||| | || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  43085057 atctccagagaggatttccaagaatatagcacgagccattacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaac 43085156  T
Q  200 catcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgca 299  Q
      ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  43085157 agtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttcca 43085255  T
Q  300 atatcaa 306  Q
    || ||||    
T  43085256 atgtcaa 43085262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 9324166 - 9324419
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 99  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  9324166 acggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagttacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 9324265  T
Q  100 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 191  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9324266 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 9324365  T
Q  192 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
     |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9324366 atgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 9324419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 26487076 - 26487329
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 99  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26487076 acggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagttacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 26487175  T
Q  100 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 191  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26487176 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 26487275  T
Q  192 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
     |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26487276 atgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 26487329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 2517768 - 2518000
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  2517768 gtctttcaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccgtggctccggtacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 2517867  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| |    
T  2517868 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcattac 2517967  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2517968 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 2518000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 306
Target Start/End: Original strand, 30158729 - 30159035
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||  |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| ||||||    
T  30158729 ttttccccagtcaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctatcctcagccttggttctgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 30158828  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  30158829 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttctccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaa 30158928  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 298  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  30158929 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgcatttcc 30159027  T
Q  299 aatatcaa 306  Q
    ||| ||||    
T  30159028 aatgtcaa 30159035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 12138865 - 12139119
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||     
T  12138865 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtc 12138964  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  12138965 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 12139064  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacat 247  Q
    |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12139065 tgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacat 12139119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18121881 - 18121639
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18121881 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccttggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 18121782  T
Q  112 ggatttcta--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaa-tgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    ||||||| |        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||  |    
T  18121781 ggatttccaggaatgcgtgatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaaatgtcttgtcttcccggtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagt 18121682  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18121681 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 18121639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15652208 - 15651967
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| | | |||||||||||    
T  15652208 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccttggtttcgacacgtctcccaacgacatcatctccaaaga 15652109  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  15652108 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 15652009  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15652008 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 15651967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 3796236 - 3796488
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||     
T  3796236 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtc 3796335  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  3796336 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgctctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 3796435  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3796436 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 3796488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 11330343 - 11330587
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  11330343 ttttccccagtcaggtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 11330442  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  11330443 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccgctacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 11330542  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11330543 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 11330587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32589733 - 32589481
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  32589733 acggcgttctccccagtcaggtctcccaagattctatctccagcaagttgtatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 32589634  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||| |||||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  32589633 atccccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctttcccgcgaagtcgtgcctacaaac 32589534  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32589533 tgccaacgatcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 32589481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 37761677 - 37761929
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  37761677 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcacagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 37761776  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||| ||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  37761777 atcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctgatatcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 37761876  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37761877 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 37761929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Original strand, 31438166 - 31438392
Alignment:
Q  27 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||       
T  31438166 caagattctatccccagcaagttgcatacttacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatg 31438265  T
Q  124 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 218  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  31438266 tgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcat 31438365  T
Q  219 tcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31438366 tcatacatgcataatcatgcatattac 31438392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8658931 - 8658639
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |    
T  8658931 gtcttccgagattctatttccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccagcgacgtcatctccaaagaggatttcca 8658832  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  8658831 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaacactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 8658732  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  8658731 aagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 8658639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Original strand, 24730678 - 24730970
Alignment:
Q  27 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||       
T  24730678 caagattctatccccagcaagtggcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatg 24730777  T
Q  124 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 218  Q
         | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  24730778 tgtaatatagcacgggccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcat 24730877  T
Q  219 tcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcag 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||| |||| ||||    
T  24730878 tcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatatcgcatttccaataacaatatcag 24730970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 305
Target Start/End: Original strand, 25207012 - 25207304
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |    
T  25207012 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccctggttctgatacgtctcccgacgacgttatctccaaagaggattccca 25207111  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
     ||        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || | |||||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  25207112 ggaatgtgtaatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgactatctctgtgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 25207211  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatca 305  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  25207212 caagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatacatttgat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatatca 25207304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 305
Target Start/End: Original strand, 25271168 - 25271460
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |    
T  25271168 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccctggttctgatacgtctcccgacgacgttatctccaaagaggattccca 25271267  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
     ||        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || | |||||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  25271268 ggaatgtgtaatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgactatctctgtgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 25271367  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatca 305  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  25271368 caagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatacatttgat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatatca 25271460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 34623202 - 34623454
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| |||     
T  34623202 acggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgcccccagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtc 34623301  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  34623302 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 34623401  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34623402 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 34623454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 5644503 - 5644755
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | | ||  ||||||||| ||  ||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  5644503 acggcgttttccccagtggagcctctcaagattctgtctacagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 5644602  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  5644603 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 5644702  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5644703 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 5644755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13318284 - 13317966
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  ||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| |||     
T  13318284 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtc 13318185  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13318184 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 13318085  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| | ||    
T  13318084 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatatcgc 13317986  T
Q  293 atttgcaatatcaatgtcag 312  Q
    |||| ||||| |||| ||||    
T  13317985 atttccaataacaatatcag 13317966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 28655948 - 28656200
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||| ||  || ||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||     
T  28655948 acggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaaggtgcatacctacctgccctcagccttgactccgatacgtctcccaacgacgtc 28656047  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||||||| |||||| | ||   ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  28656048 atctccaaagaagatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 28656147  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28656148 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 28656200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 30175171 - 30175489
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  30175171 acggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 30175270  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||||||| |||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30175271 atctccaaagaagatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtaaagtcgtgcctacaaac 30175370  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||| || ||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| | ||    
T  30175371 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcacaatcatgcgtaatacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatatcgc 30175469  T
Q  293 atttgcaatatcaatgtcag 312  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  30175470 atttccaatatcaatatcag 30175489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37664957 - 37664710
Alignment:
Q  6 gttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctc 105  Q
    ||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||  |  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  37664957 gttttccccagtaaagtctttcaagattctatctccagcaagttgcatacctgcccaccctcagccttggttccgaaacgtctcccaacgacgtcatctc 37664858  T
Q  106 caaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatca 197  Q
    ||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  37664857 caaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaacgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgcca 37664758  T
Q  198 accatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37664757 acagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 37664710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13436127 - 13435875
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||||||| ||| || | |||||||||||| | |||     
T  13436127 acggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctaccagccctcagccttggctctgatacgtctcccaatgacgtc 13436028  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13436027 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 13435928  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13435927 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 13435875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18368988 - 18368736
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | ||||  ||||  |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  18368988 acggcgttttccccagtggagtctctcaaggctctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 18368889  T
Q  101 atctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||| |||| || ||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  18368888 atctccatagagaatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 18368789  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18368788 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 18368736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 23726931 - 23727233
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23726931 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 23727030  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  | ||  |    
T  23727031 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccgacagt 23727130  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  23727131 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 23727229  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  23727230 tcaa 23727233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 23898587 - 23898892
Alignment:
Q  10 tccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaa 108  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  23898587 tccccagtagagtcttccgagattctatccccaagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaa 23898686  T
Q  109 agaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaac 199  Q
    ||||||||||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||    
T  23898687 agaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaac 23898786  T
Q  200 catcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgca 299  Q
      |||| |||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| || | || ||| ||||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  23898787 agtcatacattacaagcattcgtacatacataatcatgcatattacgtgcccatgcatttgat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcattttca 23898885  T
Q  300 atatcaa 306  Q
    || ||||    
T  23898886 atgtcaa 23898892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 41681408 - 41681638
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttct- 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |     
T  41681408 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagttacctgccctcagtcatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttttc 41681507  T
Q  120 -----atg----atgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatt 210  Q
         |||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||| ||    
T  41681508 caagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgacttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcgtt 41681607  T
Q  211 tcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
         ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41681608 ----acattcatacatgcataatcacgcatattac 41681638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 11556048 - 11556350
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11556048 cccagtagagtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 11556147  T
Q  112 ggatttcta--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    ||||||| |        | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  11556148 ggatttccaggaatgcgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 11556247  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  11556248 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 11556346  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  11556347 tcaa 11556350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 23632664 - 23632906
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23632664 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctatctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 23632763  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |   |||||||||||||  ||||  |    
T  23632764 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccaccgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgtggaactgtgtctacaaactgccaacagt 23632863  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23632864 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 23632906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22992588 - 22992286
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22992588 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 22992489  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||  |    
T  22992488 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagt 22992389  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  22992388 catgcattacaagcattcatacatacataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 22992290  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  22992289 tcaa 22992286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13180241 - 13179962
Alignment:
Q  35 tatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------tatgatgt 126  Q
    |||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        | | || |    
T  13180241 tatccccagcgagttgcatacctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatat 13180142  T
Q  127 agcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcataca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | | |||   ||||||||||| |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||    
T  13180141 agcacgagccactacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcattcataca 13180042  T
Q  226 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    ||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  13180041 tgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 13179962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 33299249 - 33299472
Alignment:
Q  31 attctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------tatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| |||  ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        | |     
T  33299249 attctatccccagcaagttgcatagctaccggccctccgcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaggaatgtgta 33299348  T
Q  123 atgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattca 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  33299349 atatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcattca 33299448  T
Q  222 tacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  33299449 tacatgcataatcatgcatattac 33299472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 33784176 - 33784478
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| |   ||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33784176 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcaacttaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 33784275  T
Q  112 ggatttcta--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    ||||||| |        | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  33784276 ggatttccaggaatgcgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 33784375  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  33784376 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 33784474  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  33784475 tcaa 33784478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 24976538 - 24976840
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24976538 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 24976637  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccg-tgaagtcgtgtctacaaactatcaacca 201  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| || | |  ||| | |||||||||||    ||||      
T  24976638 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgcagaact-gtgtctacaaatcgccaacag 24976736  T
Q  202 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 301  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  24976737 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatgttgcatttccaat 24976835  T
Q  302 atcaa 306  Q
     ||||    
T  24976836 gtcaa 24976840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 24608939 - 24609181
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  24608939 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctctcaacgacgtcatctccaaaga 24609038  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||    ||||  |    
T  24609039 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaatcgccaacagt 24609138  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24609139 cgtgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 24609181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 30941324 - 30941566
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  30941324 cccagtagagtctcccgagattctatcctcagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 30941423  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||| || ||| | |   |||||||||||    ||||  |    
T  30941424 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactgtgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctccgcggaactgtgtctacaaatcgccaacagt 30941523  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30941524 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 30941566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 499 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 13178181 - 13178033
Alignment:
Q  499 ctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaa-tctccagtgatt 597  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||  | || |||||||||||| ||  ||  ||  ||| ||| || |||||||||    
T  13178181 ctgttatcctgtgagccggtgcagtttggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaa--tcccattacaaatccccagtgatt 13178084  T
Q  598 cccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtccc 648  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13178083 tccatccatgtttggataagtggctagttcaatccaagaacagcttgtccc 13178033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 494 - 771
Target Start/End: Original strand, 3790872 - 3791149
Alignment:
Q  494 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3790872 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccaggttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 3790971  T
Q  594 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtcccagtcaacttacttctacctctgttatcctgtgagccggtgcagtt 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3790972 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtcccagtcaacttacttctacctctgttatcctatgagccggtgcagtt 3791071  T
Q  694 tggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaatcccattacaaatccccagtgatgtccatc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3791072 tggccaattgctacctttcaaatcaggacgacgtcaagtcaattctaatcccattacaaatccccagtgatttccatc 3791149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 126 - 312
Target Start/End: Original strand, 3790473 - 3790659
Alignment:
Q  126 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcataca 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3790473 tagcacgagccaccacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactgtcaaccatcatgcatttcaatcattcatgca 3790572  T
Q  226 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3790573 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttccaatatcaatgtcag 3790659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19410030 - 19409718
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  19410030 acggcgttttccccagtggggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 19409931  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||| |||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  19409930 atccccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 19409831  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  19409830 tgccaacggtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgc 19409732  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||| ||||    
T  19409731 atttccaatgtcaa 19409718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13930157 - 13929845
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  13930157 acggcgttctccccagtcaggtctcccaagattctatctccagcaagttgtttagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 13930058  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13930057 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 13929958  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  13929957 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgc 13929859  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||| ||||    
T  13929858 atttccaatgtcaa 13929845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 37932073 - 37932385
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||     
T  37932073 acggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgtc 37932172  T
Q  101 atctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||||||||||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  37932173 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgctctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 37932272  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||   || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  37932273 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgctcatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgc 37932371  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||||||||    
T  37932372 atttccaatatcaa 37932385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 3789139 - 3789391
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||     
T  3789139 acggcgttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgtc 3789238  T
Q  101 atctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||||||||||||||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  3789239 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 3789338  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3789339 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 3789391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16822884 - 16822572
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  16822884 acggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 16822785  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16822784 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 16822685  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  16822684 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgc 16822586  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||| ||||    
T  16822585 atttccaatgtcaa 16822572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 16898596 - 16898908
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  16898596 acggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 16898695  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16898696 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 16898795  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  16898796 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgc 16898894  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||| ||||    
T  16898895 atttccaatgtcaa 16898908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37679438 - 37679132
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  37679438 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 37679339  T
Q  107 aaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    | ||||||| ||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  37679338 atagaggatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 37679239  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 298  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  37679238 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatacatattgcatttcc 37679140  T
Q  299 aatatcaa 306  Q
    ||| ||||    
T  37679139 aatgtcaa 37679132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37694703 - 37694397
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  37694703 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 37694604  T
Q  107 aaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    | ||||||| ||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  37694603 atagaggatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 37694504  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 298  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  37694503 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatacatattgcatttcc 37694405  T
Q  299 aatatcaa 306  Q
    ||| ||||    
T  37694404 aatgtcaa 37694397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 32056448 - 32056760
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||| |||     
T  32056448 acggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacatctcccaacgacgtc 32056547  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  32056548 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 32056647  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  32056648 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgc 32056746  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||| ||||    
T  32056747 atttccaatgtcaa 32056760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 254192 - 253948
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  254192 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgtatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 254093  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  254092 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 253993  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  253992 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 253948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21670719 - 21670469
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  21670719 acggcgttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 21670620  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21670619 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 21670520  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21670519 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataagcatgcatatt 21670469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Original strand, 34297851 - 34298093
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  34297851 tttttcccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 34297950  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  34297951 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 34298050  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcata 241  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34298051 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcata 34298093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9343527 - 9343283
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  9343527 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 9343428  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  9343427 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagtcactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 9343328  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9343327 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 9343283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 16168180 - 16168424
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  16168180 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 16168279  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  16168280 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagccgtgcctacaaactgccaa 16168379  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16168380 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 16168424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 27397051 - 27397350
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  27397051 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttcca 27397150  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
          | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |   |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  27397151 agaatgtgtgatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctacgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 27397250  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtca 311  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  27397251 caagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatttaat-aaaactgttataccatccatacatgttgcatttccaatgtcaatttca 27397349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 27810405 - 27810649
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  27810405 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 27810504  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  27810505 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagccgtgcctacaaactgccaa 27810604  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27810605 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcctatt 27810649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39045423 - 39045178
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaa-gttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctc 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  39045423 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctc 39045324  T
Q  106 caaagaggatttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatca 197  Q
    ||||||||||||| | ||   ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  39045323 caaagaggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgcca 39045224  T
Q  198 accatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39045223 acagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 39045178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21696726 - 21696423
Alignment:
Q  10 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 109  Q
    |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21696726 tccccagtagagccttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacggcgttatctccaaa 21696627  T
Q  110 gaggatttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 200  Q
    ||||||||| | ||   ||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||     
T  21696626 gaggatttccaggaatgtgtaatattgcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaaca 21696527  T
Q  201 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaa 300  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  21696526 gtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatacatttaat-gaaactgttatatcatccatacatattgcatttccaa 21696428  T
Q  301 tatca 305  Q
    |||||    
T  21696427 tatca 21696423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 39896765 - 39897077
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  39896765 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 39896864  T
Q  101 atctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||||||||||||||        | | || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  39896865 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgcgcctacaaaa 39896964  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  39896965 tgccaacagtcatgcattacgagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgc 39897063  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||| ||||    
T  39897064 atttccaatgtcaa 39897077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37945405 - 37945161
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||| ||| ||||||    
T  37945405 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacatctcccaacgacgtcatctcc 37945306  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  37945305 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 37945206  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
       ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37945205 tagtcatgcattaccagcattcatacatgcataatcatgcatatt 37945161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22921690 - 22921372
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  22921690 acggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 22921591  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  22921590 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 22921491  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | || |||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  22921490 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-aaaattgttatatcatccatgcatattgc 22921392  T
Q  293 atttgcaatatcaatgtcag 312  Q
    |||| |||| ||||| ||||    
T  22921391 atttccaatgtcaatatcag 22921372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 31882987 - 31883285
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  31882987 gtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggttctgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 31883086  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  31883087 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 31883186  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcag 312  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| ||||    
T  31883187 aagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaatatcag 31883285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 12593516 - 12593762
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  12593516 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 12593615  T
Q  107 aaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    | ||||||| ||        | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12593616 atagaggatctccgagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgtcaa 12593715  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12593716 cagtcatgcattacaggcattcatacatgcataatcatgcgtattac 12593762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 37384371 - 37384603
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| |    
T  37384371 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccacagaagaattcca 37384470  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  37384471 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 37384570  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37384571 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 37384603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 34161537 - 34161789
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||||||| ||| || | |||||||||||||| |||     
T  34161537 acggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctaccagccctcagccttggctctgatacgtctcccaacgacgtc 34161636  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||   ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34161637 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 34161736  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34161737 tgccaacagtcatgcattacaaacattcatacatgcataatcatgcatattac 34161789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12710144 - 12709852
Alignment:
Q  27 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||       
T  12710144 caagattctatccccagcaagtggcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatg 12710045  T
Q  124 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 218  Q
         | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  12710044 tgtaatatagcacgggccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattacaagcat 12709945  T
Q  219 tcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcag 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||| |||| ||||    
T  12709944 tcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatatcgcatttccaataacaatatcag 12709852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11628731 - 11628479
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||     
T  11628731 acggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 11628632  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  11628631 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 11628532  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11628531 tgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatacatattac 11628479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 34868330 - 34868582
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||     
T  34868330 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtc 34868429  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34868430 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgatctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaaa 34868529  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34868530 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 34868582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34268460 - 34268216
Alignment:
Q  10 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 109  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34268460 tccccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaa 34268361  T
Q  110 gaggatttctatg-atg-------tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 200  Q
    ||||||||| | | |||       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||     
T  34268360 gaggatttccaggaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaaca 34268261  T
Q  201 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34268260 gtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 34268216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 27123216 - 27123448
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  27123216 gtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 27123315  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  27123316 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 27123415  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27123416 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 27123448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 27782919 - 27783169
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||| |||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |     
T  27782919 acggcgtttttcccagtggagtctctcaagattctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctaccaacgacatc 27783018  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||| |||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27783019 atctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 27783118  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27783119 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 27783169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19449939 - 19449639
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgatta-gctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttct 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19449939 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatatgctacccgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttct 19449840  T
Q  120 a--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatt 210  Q
    |        |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||    ||||||||||||  ||||  |||||| ||    
T  19449839 aagaatgtgtgatatagcgcgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactatgtctacaaactgccaacagtcatgcgtt 19449740  T
Q  211 tcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtc 310  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| |||| |||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||| ||||| ||    
T  19449739 acaagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatttgat-aaaactgttatatcatccatgtatattgcattttcaatgtcaatttc 19449641  T
Q  311 ag 312  Q
    ||    
T  19449640 ag 19449639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Original strand, 40240245 - 40240471
Alignment:
Q  27 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-------- 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||            
T  40240245 caagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatctccgagaatg 40240344  T
Q  119 tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 218  Q
    | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  40240345 tgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaacgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcat 40240444  T
Q  219 tcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  40240445 tcatacatacataatcatgcatattac 40240471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 23117481 - 23117723
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  23117481 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgcctcccaacgacgtcatctccaaaga 23117580  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacca- 201  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   ||||||||||| |  ||| ||     
T  23117581 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaa-tcgcaaacag 23117679  T
Q  202 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23117680 tcatgcattacaaacattcatacatgcataatcatgcatattac 23117723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27428000 - 27427761
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttg-attagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc- 118  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||     
T  27428000 gtcttccgagattctgtccccagcaagttgcataagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaggaggatttcc 27427901  T
Q  119 -------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatt 210  Q
           | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  27427900 aggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatt 27427801  T
Q  211 tcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtc 250  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27427800 acaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgtc 27427761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 301
Target Start/End: Original strand, 28888939 - 28889236
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28888939 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 28889038  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||  |    
T  28889039 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacatgcccaatactccaacatcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagt 28889138  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 301  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   | || ||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  28889139 catgcataacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacacacccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttccaat 28889236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31868344 - 31868102
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||   || ||| | ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31868344 cccagtagagtcttccgagattctatccccatcaagtttcatacctaccggccctcagcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 31868245  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   ||||||||||| |  ||||  |    
T  31868244 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaaatgccaacagt 31868145  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31868144 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 31868102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Original strand, 20844600 - 20844706
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20844600 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 20844699  T
Q  112 ggatttc 118  Q
     ||||||    
T  20844700 tgatttc 20844706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 12662175 - 12662418
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaag 110  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12662175 cccagtagagtcttccgagattctatcctcaagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaag 12662274  T
Q  111 aggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacca 201  Q
    ||||||||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |   |||| ||||||    ||||      
T  12662275 aggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgtggaactgtgtttacaaatcgccaacag 12662374  T
Q  202 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12662375 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 12662418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 584 - 648
Target Start/End: Original strand, 3791130 - 3791194
Alignment:
Q  584 aatctccagtgattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtccc 648  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3791130 aatccccagtgatttccatccatgtttggataagtggctagttcaatccaagaacagcttgtccc 3791194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 312
Target Start/End: Original strand, 20844802 - 20844908
Alignment:
Q  205 tgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatc 304  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||| ||    
T  20844802 tgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcctatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatattgcatttccaatgtc 20844900  T
Q  305 aatgtcag 312  Q
    ||| ||||    
T  20844901 aatatcag 20844908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 312
Target Start/End: Original strand, 3451936 - 3452244
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3451936 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggctccggtacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 3452035  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3452036 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgatctgatgtcttggcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactgtcaaccatc 3452135  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatat 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3452136 atgcatttcaatcattcatgcatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttccaatat 3452235  T
Q  304 caatgtcag 312  Q
    |||||||||    
T  3452236 caatgtcag 3452244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26268526 - 26268209
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  ||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| |||     
T  26268526 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagcctaggt-ccgaaacgtctcccaacgacgtc 26268428  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26268427 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 26268328  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268327 tgtcaaccatcatgcatttcaatcattcatgcatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 26268228  T
Q  293 atttgcaatatcaatgtca 311  Q
    |||| |||||  |||||||    
T  26268227 atttccaatacaaatgtca 26268209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26678539 - 26678233
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  26678539 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 26678440  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||    
T  26678439 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcatgcctacaaactgccaa 26678340  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 298  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  26678339 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatcacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttcc 26678241  T
Q  299 aatatcaa 306  Q
    ||| ||||    
T  26678240 aatgtcaa 26678233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 494 - 648
Target Start/End: Original strand, 3452501 - 3452655
Alignment:
Q  494 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3452501 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatccccagt 3452600  T
Q  594 gattcccatacatgttcggataagtggctagttcagtccaagaacagcttgtccc 648  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3452601 gatttccatccatgtttggataagtggctagttcaatccaagaacagcttgtccc 3452655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26663347 - 26663041
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  26663347 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 26663248  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||    
T  26663247 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcatgcctacaaactgccaa 26663148  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 298  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  26663147 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatcacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatacatattgcatttcc 26663049  T
Q  299 aatatcaa 306  Q
    ||| ||||    
T  26663048 aatgtcaa 26663041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26509150 - 26508848
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26509150 acggcgttatccccagtcgggtcttccaagattctacccccagcaagttgattagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtt 26509051  T
Q  101 atctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaa 191  Q
    ||||||||||||||||||        | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    
T  26509050 atctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaa 26508951  T
Q  192 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 291  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  26508950 ctgccaacagtcatgcattacaaccattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattg 26508852  T
Q  292 catt 295  Q
    ||||    
T  26508851 catt 26508848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16744955 - 16744711
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  16744955 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgtcacgtctcccaacgacgtcatctcc 16744856  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  16744855 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 16744756  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16744755 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 16744711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31084065 - 31083812
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 99  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31084065 acggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 31083966  T
Q  100 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 191  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31083965 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 31083866  T
Q  192 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31083865 ctgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 31083812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 2779929 - 2780230
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2779929 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatgcctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacggcgtcatcttcaaaga 2780028  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  2780029 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 2780128  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatat 303  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |    
T  2780129 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgt 2780227  T
Q  304 caa 306  Q
    |||    
T  2780228 caa 2780230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 312
Target Start/End: Original strand, 31130616 - 31130909
Alignment:
Q  27 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccat-ggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga-- 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||      
T  31130616 caagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccattggttccaatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaat 31130715  T
Q  124 ------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatca 217  Q
          | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||| ||    
T  31130716 gtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcattacaagca 31130815  T
Q  218 ttcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtcag 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||| |||| ||||    
T  31130816 ttcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatatcgcatttccaataacaatatcag 31130909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 26441939 - 26442191
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  26441939 acggcgttttccccggtggggtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 26442038  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||| |||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26442039 atctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 26442138  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26442139 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcgtattac 26442191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 26596356 - 26596603
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccat-ggttccggtacgtctcccaacggcgttatctc 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  26596356 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctattggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctc 26596455  T
Q  106 caaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatca 197  Q
    ||||||||||||| | ||        | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  26596456 caaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcatgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgcca 26596555  T
Q  198 accatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26596556 acagtcatgcattacaagcattcatacatacataatcatgcatattac 26596603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31557846 - 31557533
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 99  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  31557846 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatccccaagcaagttgtttacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgc 31557747  T
Q  100 tatctccaaagaggatttctatgatg--------tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 191  Q
     |||||||||||||||||| | || |        |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31557746 catctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagcacgagctactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 31557647  T
Q  192 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 291  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||    
T  31557646 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcgtaatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattg 31557548  T
Q  292 catttgcaatatcaa 306  Q
    ||||| |||| ||||    
T  31557547 catttccaatgtcaa 31557533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26313305 - 26313052
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 99  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26313305 acggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagttacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 26313206  T
Q  100 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 191  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26313205 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcttgcctacaaa 26313106  T
Q  192 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
     |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26313105 atgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 26313052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 4206070 - 4206322
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  4206070 acggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcggccatggttccggcacgtctcccaacgacgtc 4206169  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  4206170 atctccaaagaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaacactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 4206269  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4206270 tgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 4206322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 45393914 - 45394166
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||     
T  45393914 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctctcaacgacgtc 45394013  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||| | | ||        | ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  45394014 atctccaaagaggattcccaagaatgtgtaatatagcatgagccactacgtgcccaatattctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 45394113  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45394114 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 45394166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4138686 - 4138436
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  4138686 acggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 4138587  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4138586 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 4138487  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4138486 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 4138436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 22148573 - 22148814
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22148573 cccagtagagtcttccgagatcctatccccagccagttgcatgcctacctgccctcagccagggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 22148672  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  22148673 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 22148772  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22148773 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcacattac 22148814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 11447583 - 11447835
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||     
T  11447583 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtc 11447682  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  11447683 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgatctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 11447782  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447783 tgccaacagtcatgcattacaaacattcatacatgcatgatcatgcatattac 11447835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16443426 - 16443134
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  16443426 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggctccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttcca 16443327  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
          | | || |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  16443326 ggaatgtgtaatatagcacgagccactacatgcccaatacttcaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 16443227  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatca 305  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16443226 caagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatttaataaaactt-ttatatcatccatacatattgcatttccaatatca 16443134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 26519502 - 26519754
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||     
T  26519502 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtc 26519601  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  26519602 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgatctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 26519701  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26519702 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 26519754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 301
Target Start/End: Original strand, 16048027 - 16048315
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||      
T  16048027 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgactttatctccaaagaggatttcca 16048126  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
          | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  16048127 ggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 16048226  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 301  Q
    | | |||||||||||| || |||||||||| ||| || | |||||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  16048227 cgagcattcatacatgtataatcatgcatactacgtgcccatacatttgat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaat 16048315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39206585 - 39206353
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  39206585 gtctcccaagattctatcctcagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 39206486  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  39206485 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 39206386  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39206385 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 39206353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 45737995 - 45738227
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  45737995 gtctcccaagattctatccccagcaaattgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 45738094  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  45738095 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 45738194  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45738195 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 45738227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 494 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 26268050 - 26267899
Alignment:
Q  494 cacccctgttaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatctccagt 593  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26268050 cacccctattaccttgtgagccagtgcagtttggccagtttccacctttcaaactaagatgacgtcaagtcagtttcaaattcttatttcaatccccagt 26267951  T
Q  594 gattcccatacatgttcggataagtggctagttc-agtccaagaacagcttgt 645  Q
    || |    | | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26267950 gaatatgtttc-tgttcggtcaagtggctagttcaagtccaagaacagcttgt 26267899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11418233 - 11417931
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11418233 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 11418134  T
Q  112 ggatttcta--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    ||||||| |        | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  11418133 ggatttccaggaatgcgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 11418034  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  11418033 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 11417935  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  11417934 tcaa 11417931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24585977 - 24585726
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  24585977 acggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccttcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 24585878  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaa-tgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 191  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24585877 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaaatgtcttgtcttccccgtaaagtcgtgcctacaaa 24585778  T
Q  192 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    ||  ||||  |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24585777 ctgccaacagtcatgcgttacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 24585726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 5154768 - 5155010
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5154768 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 5154867  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  5154868 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 5154967  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5154968 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 5155010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5140744 - 5140526
Alignment:
Q  35 tatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------tatgatgt 126  Q
    |||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||        | | |  |    
T  5140744 tatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaatgacgtcatctccatagaggatctccgagaatgtgtaacat 5140645  T
Q  127 agcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacat 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||| |||||||||||    
T  5140644 agcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcattcatacat 5140545  T
Q  227 gcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  5140544 gcataatcatgcatattac 5140526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Original strand, 10848299 - 10848592
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||      
T  10848299 gtcttccgagattctgtccccagcaagtcgcgtagcaacccgccctcagccatggttccgatacgtctcccaatgacgttatctccaaagaggatttcca 10848398  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
          | |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||    ||||||||||||  ||||  |||||| ||     
T  10848399 agaatgtgtgatatagcgcgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactatgtctacaaactgccaacagtcatgcgtta 10848498  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  10848499 caagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatctgat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 10848592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 22152800 - 22152989
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22152800 cccagtagagtcttccgagatcctatccccagccagttgcatgcctacctgccctcagccagggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 22152899  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaact 193  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22152900 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaact 22152989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 22208715 - 22208904
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22208715 cccagtagagtcttccgagatcctatccccagccagttgcatgcctacctgccctcagccagggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 22208814  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaact 193  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22208815 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaact 22208904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Original strand, 5165078 - 5165377
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||      
T  5165078 gtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 5165177  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
          | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  5165178 ggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 5165277  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtca 311  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||    
T  5165278 caagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaatatca 5165376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 2161257 - 2161558
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2161257 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagcta-ctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcgtctccaaaga 2161355  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||| | ||  |||| ||    
T  2161356 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctaccagctgccaacaat 2161455  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  2161456 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 2161554  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  2161555 tcaa 2161558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16511879 - 16511637
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16511879 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 16511780  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||    ||||  |    
T  16511779 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagtcattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaatcgccaacagt 16511680  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16511679 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 16511637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10910380 - 10910072
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  10910380 cccagtagagtctcccgagattctatcctcagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacaacgtcatctccaaaga 10910281  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccg-tgaagtcgtgtctacaaactatcaacca 201  Q
    |||||||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | |||| | |||||||||||    ||||      
T  10910280 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgctgaact-gtgtctacaaatcgccaacag 10910182  T
Q  202 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 301  Q
    || |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  10910181 tcgtgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatacatattgcatttccaat 10910083  T
Q  302 atcaatgtcag 312  Q
     ||||| ||||    
T  10910082 gtcaatatcag 10910072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 24334836 - 24335148
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  24334836 acggcgttttccccagtggggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 24334935  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||| |||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  24334936 atccccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 24335035  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  24335036 tgccaacggtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgc 24335134  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||| ||||    
T  24335135 atttccaatgtcaa 24335148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 18231852 - 18232170
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  18231852 acggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 18231951  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  18231952 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 18232051  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  18232052 tgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgc 18232150  T
Q  293 atttgcaatatcaatgtcag 312  Q
    |||| |||| |||| |||||    
T  18232151 atttccaatgtcaacgtcag 18232170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28109563 - 28109250
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtc-gggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 99  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28109563 acggcgttttccccagtcagggttttccaagattctatctccagcaagttgtttagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgt 28109464  T
Q  100 tatctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 191  Q
     ||||||||||||||||||        | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28109463 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttcccggtgaagtcgtgcctacaaa 28109364  T
Q  192 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttg 291  Q
    ||   |||  ||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||    
T  28109363 ctgctaacagtcatgcatcacaagcattcatacatgcataaccatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattg 28109265  T
Q  292 catttgcaatatcaa 306  Q
    ||||| |||| ||||    
T  28109264 catttccaatgtcaa 28109250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Original strand, 10649750 - 10650042
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  10649750 gtcttccaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 10649849  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  10649850 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 10649949  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  10649950 aagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 10650042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17978550 - 17978238
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  17978550 acggcgttttccccggtcgggtcttccaagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 17978451  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  17978450 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgttttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 17978351  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  17978350 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgc 17978252  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    | || |||| ||||    
T  17978251 agttccaatgtcaa 17978238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 5020371 - 5020683
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||     
T  5020371 acggcgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 5020470  T
Q  101 atctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||||||||||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  5020471 atctccaaagaggatttccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaaactgtgtctacaaac 5020570  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  5020571 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgc 5020669  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||||||||    
T  5020670 atttccaatatcaa 5020683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11103972 - 11103731
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11103972 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 11103873  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||  ||    
T  11103872 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaaactgtgtctacaaactgccaacagtc 11103773  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11103772 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 11103731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5589949 - 5589705
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  5589949 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctctagcaagttgcatacctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 5589850  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  5589849 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagtcactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaa 5589750  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5589749 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 5589705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 5717721 - 5717965
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  5717721 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 5717820  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  5717821 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgccttccccgtgaagccgtgcctacaaactgccaa 5717920  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5717921 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 5717965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 5728631 - 5728875
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  5728631 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 5728730  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  5728731 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgccttccccgtgaagccgtgcctacaaactgccaa 5728830  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5728831 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 5728875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5763737 - 5763493
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  5763737 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctcc 5763638  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  5763637 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgccttccccgtgaagccgtgcctacaaactgccaa 5763538  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5763537 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 5763493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6536342 - 6536090
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  6536342 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 6536243  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||| ||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6536242 atcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 6536143  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6536142 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 6536090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 28345831 - 28346149
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  28345831 acggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 28345930  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatgatg--------tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | || |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  28345931 atctccaaagaggatttccaagaaggtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 28346030  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | || |||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  28346031 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-aaaattgttatatcatccatgcatattgc 28346129  T
Q  293 atttgcaatatcaatgtcag 312  Q
    |||| |||| ||||| ||||    
T  28346130 atttccaatgtcaatatcag 28346149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29658560 - 29658316
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||    
T  29658560 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccaacacgtctcccaacgacgtcatctcc 29658461  T
Q  107 aaagaggatttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||   ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||    
T  29658460 aaagaggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgcgcctacaaactgccaa 29658361  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29658360 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 29658316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31029854 - 31029613
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31029854 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccgtggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 31029755  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||  ||    
T  31029754 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtacctacaaaatgccaacagtc 31029655  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31029654 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 31029613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 32445801 - 32446042
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  32445801 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatcaccaaaga 32445900  T
Q  112 ggatttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||   ||||     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  32445901 ggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 32446000  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32446001 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 32446042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16618070 - 16617776
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgatta-gctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttct 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  16618070 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatatgctacccgccctcagccatggttccgatgcgtctcccaacgacgatatctccaaagaggatttcc 16617971  T
Q  120 a--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatt 210  Q
    |        |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  16617970 aagaatgtgtgatatagcacgagctactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatt 16617871  T
Q  211 tcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16617870 tcaagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgtccatacatttgat-aaaactgttataccatccatacatgttgcatttccaatgtcaa 16617776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Original strand, 22041087 - 22041381
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgatta-gctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttct 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  22041087 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatatgctacccgccctcagccatggttccgatgcgtctcccaacgacgatatctccaaagaggatttcc 22041186  T
Q  120 a--------tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatt 210  Q
    |        |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  22041187 aagaatgtgtgatatagcacgagctactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatt 22041286  T
Q  211 tcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22041287 tcaagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgtccatacatttgat-aaaactgttataccatccatacatgttgcatttccaatgtcaa 22041381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 306
Target Start/End: Original strand, 32297297 - 32297603
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  32297297 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcgagttgcatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctcc 32297396  T
Q  107 aaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    | ||||||| ||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  |||    
T  32297397 atagaggatctccgagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaaactgtgtctacaaactgccaa 32297496  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgc 298  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |    
T  32297497 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttcc 32297595  T
Q  299 aatatcaa 306  Q
    ||||||||    
T  32297596 aatatcaa 32297603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4340289 - 4340047
Alignment:
Q  10 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 109  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4340289 tccccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaa 4340190  T
Q  110 gaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacca 201  Q
    ||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||      
T  4340189 gaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacag 4340090  T
Q  202 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatta 244  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4340089 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatta 4340047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18285967 - 18285666
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18285967 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 18285868  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  18285867 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtctcgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 18285768  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatat 303  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  18285767 atgcattacaagcattcatacatgcgtaatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccgtgcatattgcatttccaatat 18285669  T
Q  304 caa 306  Q
    |||    
T  18285668 caa 18285666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18301268 - 18300967
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18301268 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 18301169  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  18301168 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtctcgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 18301069  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatat 303  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  18301068 atgcattacaagcattcatacatgcgtaatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccgtgcatattgcatttccaatat 18300970  T
Q  304 caa 306  Q
    |||    
T  18300969 caa 18300967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 4630430 - 4630671
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  4630430 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacatgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatcaccaaaga 4630529  T
Q  112 ggatttctatga---tgta-----gcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||   ||||     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  4630530 ggatttccaagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 4630629  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4630630 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 4630671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22864463 - 22864211
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  22864463 acggcgttttccccagtaaagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 22864364  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||| ||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  22864363 atcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgacgtcttgtcttccccatgaagtcgtgcctacaaaa 22864264  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22864263 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 22864211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22879522 - 22879270
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  22879522 acggcgttttccccagtaaagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 22879423  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||| ||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  22879422 atcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgacgtcttgtcttccccatgaagtcgtgcctacaaaa 22879323  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22879322 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 22879270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31958055 - 31957737
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||     
T  31958055 acggtgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacaacgtc 31957956  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  31957955 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 31957856  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | || |||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  31957855 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-aaaattgttatatcatccatgcatattgc 31957757  T
Q  293 atttgcaatatcaatgtcag 312  Q
    |||| |||| ||||| ||||    
T  31957756 atttccaatgtcaatatcag 31957737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 47030115 - 47030366
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaa-gttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 99  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  47030115 acggcgttttccccagtggagtcttccaagattctatctccagcaaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatgcgtctcccaacgacgt 47030214  T
Q  100 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 191  Q
     |||| ||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47030215 catcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 47030314  T
Q  192 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
     |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47030315 atgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatatt 47030366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Original strand, 4423582 - 4423808
Alignment:
Q  27 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||       
T  4423582 caagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccatggttccaatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatg 4423681  T
Q  124 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 218  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  4423682 tgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctataaaatgccaacagtcatgcattacaagcat 4423781  T
Q  219 tcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4423782 tcatacatgcataatcatgcatattac 4423808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17970480 - 17970227
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgt 99  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||    
T  17970480 acggcgttttccccggtggagtctctcaagattctatccccaagcaagttgtttagttacctgccctcagccatggttccaatatgtctcccaacgacgt 17970381  T
Q  100 tatctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 191  Q
     |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17970380 catctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaa 17970281  T
Q  192 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
     |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17970280 gtgccaatagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 17970227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 18249378 - 18249690
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||     
T  18249378 acggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtcccccaacgacgtc 18249477  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||| |||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18249478 atctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 18249577  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  18249578 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatacatattgc 18249676  T
Q  293 atttgcaatatcaa 306  Q
    |||| |||| ||||    
T  18249677 atttccaatgtcaa 18249690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5602912 - 5602660
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  5602912 acggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 5602813  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  5602812 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 5602713  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5602712 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 5602660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20570455 - 20570203
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||   || ||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  20570455 acggcgttttccccagtggagtctctcaagattctatccccagcaagttacatacctaccggtcctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 20570356  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||| |||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20570355 atctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtctcccccgtgaagtcgtgcctacaaac 20570256  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20570255 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 20570203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 5473638 - 5473864
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5473638 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcgagttgcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 5473737  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||    
T  5473738 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtc 5473837  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcat 230  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5473838 atgcattacaagcattcatacatgcat 5473864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16404391 - 16404139
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||     
T  16404391 acggcgttttccccggtgaggtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggctccgatacgtcccccaacgacgtc 16404292  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||| |||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16404291 atctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 16404192  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16404191 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 16404139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 48472590 - 48472822
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  48472590 gtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 48472689  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  48472690 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 48472789  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48472790 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 48472822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Original strand, 21681406 - 21681632
Alignment:
Q  27 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-------- 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||            
T  21681406 caagactctatccccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccatagaggatctccgagaatg 21681505  T
Q  119 tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 218  Q
    | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  21681506 tgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcat 21681605  T
Q  219 tcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21681606 tcatacatgcataatcatgcatattac 21681632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 10402812 - 10403064
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| | |||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  10402812 acggcgttttccccggtggggtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctaccggcccccggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 10402911  T
Q  101 atctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||| ||||||| ||        | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10402912 atctccatagaggatctccgagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 10403011  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10403012 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 10403064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 20072693 - 20072925
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  20072693 gtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 20072792  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  20072793 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgatgtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 20072892  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20072893 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 20072925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 51788682 - 51788934
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||     
T  51788682 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccttggctccgatacgtctcccaacgacgtc 51788781  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  51788782 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgatctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 51788881  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  51788882 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgtataatcatgcatattac 51788934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Original strand, 15367923 - 15368217
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgatta-gctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc- 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  15367923 gtcttccgagattctatccccagcaagttgcatatgctacccgccctcaaccatggttccgatacgtctcccaatgacgttatctccaaagaggatttcc 15368022  T
Q  119 -------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatt 210  Q
           | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||    ||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  15368023 aagaatgtgtgatgtagcgcgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgggaaactatgtctacaaactgccaacagtcatgcatt 15368122  T
Q  211 tcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  15368123 acaagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatctgat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 15368217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 19701064 - 19701368
Alignment:
Q  10 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 109  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19701064 tccccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgtatagctacctgccctcagtcatggttccgatacgtctcccaatggcgttatctccaaa 19701163  T
Q  110 gaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 200  Q
    || ||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   | |||   |||||||||||||  ||||     
T  19701164 gaagatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctatgcgaaactgtgtctacaaactgccaaca 19701263  T
Q  201 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaa 300  Q
     |||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || ||| ||||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||    
T  19701264 gtcatacattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacaagcccatgcatttgat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaa 19701362  T
Q  301 tatcaa 306  Q
    | ||||    
T  19701363 tgtcaa 19701368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 28027931 - 28028183
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| |||     
T  28027931 acggcgttttccccagtaaagtctctcaagattctatccccagcaagttgcatacctaccggccctcagcctaggtcccgacacgtctcccaacgacgtc 28028030  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||| ||||||||||| | ||        |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28028031 atctccgaagaggatttccaagaatgtgtaatgtagcacgagccactacttgcccattactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcatgcctacaaac 28028130  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28028131 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 28028183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29142365 - 29142063
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  29142365 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccgaaga 29142266  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  29142265 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 29142166  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||| ||||     
T  29142165 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatacatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatgttgcgtttccaatg 29142067  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  29142066 tcaa 29142063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 35887409 - 35887711
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35887409 cccagtagagtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 35887508  T
Q  112 ggatt--------tctatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||        | | | || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | | |||   ||||||||||||| |||||  |    
T  35887509 ggattttcaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatacttcaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgtcaacagt 35887608  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  35887609 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 35887707  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  35887708 tcaa 35887711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 8218285 - 8218537
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | ||||  ||||| |||||| ||||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  8218285 acggcgttttccccagtggagtctctcaagactctatctccagcaagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 8218384  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||| |||||||||| | ||        | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8218385 atctccatagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccaccacgtgcccaatactctaacgccttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 8218484  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8218485 tgccaacagtcatgcattacaagcgttcatacatgcataatcatgcatattac 8218537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 4728275 - 4728577
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4728275 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 4728374  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||  |    
T  4728375 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagt 4728474  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  4728475 catgcattacaagcattcatacatacataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 4728573  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  4728574 tcaa 4728577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 5658783 - 5659085
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5658783 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 5658882  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||| | ||  ||||  |    
T  5658883 ggatttccaggaaggtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctaccagctgccaacagt 5658982  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  5658983 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 5659081  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  5659082 tcaa 5659085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 6208544 - 6208846
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6208544 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 6208643  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||  |    
T  6208644 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagt 6208743  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  6208744 catgcattacaagcattcatacatacataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 6208842  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  6208843 tcaa 6208846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 18057917 - 18058219
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18057917 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 18058016  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||  |    
T  18058017 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagt 18058116  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  18058117 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 18058215  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  18058216 tcaa 18058219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4790242 - 4789940
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  4790242 cccagtagagtctcccaagattctatccttagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccgaaga 4790143  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  |    
T  4790142 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagt 4790043  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||     
T  4790042 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttataccatccatgcatatcgcatttccaatg 4789944  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  4789943 tcaa 4789940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8283071 - 8282769
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8283071 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 8282972  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||||  ||||  |    
T  8282971 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaactgccaacagt 8282872  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  8282871 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 8282773  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  8282772 tcaa 8282769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Original strand, 16422854 - 16423158
Alignment:
Q  10 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 109  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16422854 tccccagtagagtcttccgagattctatcccctgcaagttgcataactacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaa 16422953  T
Q  110 gaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 200  Q
    |||||||||        | | || |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| || | | | |   ||||||||||||   ||||     
T  16422954 gaggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtacccaatactccagtgccttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaaccgccaaca 16423053  T
Q  201 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaa 300  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| | |    
T  16423054 gtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatataat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccga 16423152  T
Q  301 tatcaa 306  Q
    ||||||    
T  16423153 tatcaa 16423158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 245
Target Start/End: Original strand, 16599406 - 16599525
Alignment:
Q  126 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcataca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||   ||||||||| ||| ||||||||||    
T  16599406 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaatagtcatgcattacaagcattcataca 16599505  T
Q  226 tgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  16599506 tgcataatcatgcatattac 16599525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15886328 - 15886026
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15886328 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaaga 15886229  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || | | | |    ||||||||||    ||||  |    
T  15886228 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactatgtctacaaatcgccaacagt 15886129  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||     
T  15886128 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatg 15886030  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  15886029 tcaa 15886026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 18337273 - 18337575
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18337273 cccagtagagtctcccaagattctatccccagcaagttgcgtagctacctgccctcagccagggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 18337372  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | | |||    ||||||||||    ||||  |    
T  18337373 ggatttccaggaaagtataatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcctgtctgtctctgcgaaactatgtctacaaatcgccaacagt 18337472  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  |||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  18337473 catgcattacgagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttgtatcatccatgcatattgcatttccaatg 18337571  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  18337572 tcaa 18337575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22381191 - 22380949
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22381191 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 22381092  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | | |||    ||||||||||    ||||  |    
T  22381091 ggatttccaggaaagtataatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcctgtctgtctctgcgaaactatgtctacaaatcgccaacagt 22380992  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22380991 catgcattacgagcattcatacatgcataatcatgcatattac 22380949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 306
Target Start/End: Original strand, 7080022 - 7080201
Alignment:
Q  126 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcattcataca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||    
T  7080022 tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacgaattgccaacggtcatgcattacaagcattcataca 7080121  T
Q  226 tgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    ||||| ||||||| |||||| || | || ||| | ||  ||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||| ||||    
T  7080122 tgcataatcatgcctattacgtgcccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccgtgcatattgcatttccaatgtcaa 7080201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 4690324 - 4690626
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4690324 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 4690423  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| || | | | |   |||||||||||    ||||  |    
T  4690424 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgcggaactgtgtctacaaatcgccaacagt 4690523  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||    
T  4690524 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatgttgcatttccaata 4690622  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  4690623 tcaa 4690626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15734710 - 15734425
Alignment:
Q  29 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------ta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||        |     
T  15734710 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcaaccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatgtg 15734611  T
Q  121 tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcatt 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |   |||   |||||||||||    ||||  ||||||||| |||  |||    
T  15734610 taatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctacgaaactgtgtctacaaatcgccaacagtcatgcattacaagaatt 15734511  T
Q  220 catacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  || |||| ||| | ||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  15734510 catacatgcatagtcatgcatattatgtgcctatgcatttaat-gaaattgttatatcattcatgcatgttgcatttccaatgtcaa 15734425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 116
Target Start/End: Original strand, 7079877 - 7079981
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  7079877 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccttggttccgacacgtctcccaacgacgttatccccagaga 7079976  T
Q  112 ggatt 116  Q
     ||||    
T  7079977 agatt 7079981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 132; Significance: 4e-68; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 51644922 - 51645229
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  51644922 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatctccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 51645021  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||| ||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51645022 atcttcaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 51645121  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgc 292  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  51645122 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatacatattgc 51645220  T
Q  293 atttgcaat 301  Q
    |||| ||||    
T  51645221 atttccaat 51645229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 10951792 - 10952044
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||     
T  10951792 acggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgtttagctacctgccctcagccgtggttccgacacgtctcccaacgacgtc 10951891  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10951892 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtaaagtcgtgcctacaaac 10951991  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10951992 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 10952044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 243
Target Start/End: Original strand, 10969369 - 10969593
Alignment:
Q  27 caagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttctatga--- 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||       
T  10969369 caagattctatccccagcaagtggcatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttccaagaatg 10969468  T
Q  124 -----tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcat 218  Q
         | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||| |||    
T  10969469 tgtaatatagcacgagtcactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcat 10969568  T
Q  219 tcatacatgcatgatcatgcatatt 243  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  10969569 tcatacatgcataatcatgcatatt 10969593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 3647847 - 3648099
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  ||||| |||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  3647847 acggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagcaagttacatacctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 3647946  T
Q  101 atctccaaagaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    ||||||| ||||||| ||        | | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3647947 atctccatagaggatctccgagaatgtgtaacatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 3648046  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3648047 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 3648099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 28591781 - 28592033
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | ||||  ||||| |||||||| ||||||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  28591781 acggcgttttccccagtggagtctctcaagactctatccctagcaagttacatacctaccagccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 28591880  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28591881 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaac 28591980  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28591981 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 28592033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16201580 - 16201276
Alignment:
Q  10 tccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 109  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16201580 tccccagtagagtcttccgagattctacccccagcaagttgcatagctacctgccctcagtcatggttccgatacgtctcccaacggtgttatctccaaa 16201481  T
Q  110 gaggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacc 200  Q
    |||||||||        | | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||     
T  16201480 gaggatttccaggaatgtgtaatatagcatgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaaca 16201381  T
Q  201 atcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaa 300  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||    
T  16201380 gtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatacatttgat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaa 16201282  T
Q  301 tatcaa 306  Q
    | ||||    
T  16201281 tgtcaa 16201276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 28156425 - 28156657
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  28156425 gtctcccaagattctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgaaacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 28156524  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  28156525 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 28156624  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28156625 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 28156657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41786872 - 41786640
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||  || ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  41786872 gtctttcaagattctatctccagcaagttgcatacctgcctgccctcagccgtggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 41786773  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  41786772 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgacgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 41786673  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41786672 aagcattcatacatgcataatcatgcatattac 41786640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 20333947 - 20333667
Alignment:
Q  29 agattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc--------ta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |     
T  20333947 agattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccaagaatgtg 20333848  T
Q  121 tgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttcaatcatt 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  ||||||||| ||| ||||    
T  20333847 taatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcattacaagcatt 20333748  T
Q  220 catacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 301  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| || | || ||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  20333747 catacatgcataatcatgcatactacgtgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttccaat 20333667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14692464 - 14692162
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14692464 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgctctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 14692365  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||       
T  14692364 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagc 14692265  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  14692264 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 14692166  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  14692165 tcaa 14692162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14695146 - 14694844
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14695146 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgctctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 14695047  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||       
T  14695046 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagc 14694947  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  14694946 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 14694848  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  14694847 tcaa 14694844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14697830 - 14697528
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14697830 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgctctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 14697731  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||       
T  14697730 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagc 14697631  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  14697630 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 14697532  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  14697531 tcaa 14697528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14700511 - 14700209
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14700511 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgctctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 14700412  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||       
T  14700411 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagc 14700312  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||     
T  14700311 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatg 14700213  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  14700212 tcaa 14700209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 301
Target Start/End: Original strand, 20467504 - 20467792
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  20467504 gtcttccgagattctatccccagcaagttacatagctacctaccctcagccatggttccgatatgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttcca 20467603  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
          | | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| || |   |||   |||||||||| ||  ||||  |||||||||     
T  20467604 ggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtggccaatactccaatgccttgtctgtctctacgaaacggtgtctacaagctgccaacagtcatgcatta 20467703  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 301  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| | || |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  20467704 caagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatttaat-aaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaat 20467792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21891297 - 21891136
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21891297 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagatgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 21891198  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgt 165  Q
    |||||||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  21891197 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgt 21891136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 210
Target Start/End: Original strand, 13769558 - 13769631
Alignment:
Q  137 actacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||    
T  13769558 actacgtgcccaatactctaatgtattgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtcatgcatt 13769631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Original strand, 2361 - 2607
Alignment:
Q  7 ttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctcc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||    
T  2361 ttttccccagtcaggtcttccaagattctatctccagcaagttgtatatctacctgccctcagctttggttccgacacgtctcccaacaacgtcatctcc 2460  T
Q  107 aaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaa 198  Q
    |||||||||||| | ||        | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||    
T  2461 aaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatgctctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaa 2560  T
Q  199 ccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2561 cagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 2607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Original strand, 12769 - 13062
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||   |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  12769 gtcttccgagattctatccgcaacaagtttcatagctacctgccctcggccgtggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttcca 12868  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
          | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||| ||||  ||||  |||| ||||     
T  12869 gggatgtgtaatgtagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctactaactgccaacagtcatacatta 12968  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| |||| |||| ||||||| || |||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  12969 caagcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatttgat-aaaactgttatatcacccatgcatattgcatttccaatgtcaa 13062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 113; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8479 - 8187
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  8479 gtcttccaagattctatctccagcaagttgcatacctacctgccctcagccttggttctgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaagaggatttcca 8380  T
Q  121 tga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttc 212  Q
     ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||  ||||||||| |    
T  8379 agaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaatgccaacagtcatgcattac 8280  T
Q  213 aatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaa 306  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | || ||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  8279 aagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtacccatgcatttaat-gaaattgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgtcaa 8187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 14640 - 14892
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   | ||||| |||||| ||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  14640 acggcgttttccccagtaaagccttccgagattcaatttccagcaagttgtatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 14739  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  14740 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 14839  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14840 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 14892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 296
Target Start/End: Original strand, 28012 - 28293
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttcta 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  28012 gtcttccgagattctatccccagcaagttatatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttcca 28111  T
Q  121 tg-atg-----tagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcatttca 213  Q
     | |||     ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||||  ||||  ||||||||| ||    
T  28112 agaatgtgtgatataacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctcagcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcattaca 28211  T
Q  214 atcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcattt 296  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| ||| || | |||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28212 agcattcatacatgcataatcatgcatactacgtgcccatacatttaat-aaaactgttataccatccatacatgttgcattt 28293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 12725 - 13026
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12725 cccagtagagtctcccaagactctatccccagcaagttgcatagctaccggccctcagcctaggtcccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 12824  T
Q  112 ggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatc 203  Q
    ||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||    
T  12825 ggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaactgccaacagtc 12924  T
Q  204 atgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatat 303  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |    
T  12925 atgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaatgt 13023  T
Q  304 caa 306  Q
    |||    
T  13024 caa 13026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 10616 - 10869
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||     
T  10616 acggcgttttccccagtaaagtcttccaagattctatttccagcaagttgcatagctacctgtcctcagccatggttccgaaacgtctcccaacgacgtc 10715  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga---------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaa 191  Q
    |||||||||||||||||| | ||         | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  10716 atctccaaagaggatttccaagaaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatattctaatgtcttgtcttccctgtgaagtcgtgcttacaaa 10815  T
Q  192 ctatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10816 ctgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 10869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 33981 - 34283
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33981 cccagtagagtctcccgagattctatcctcagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 34080  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||||||        | | || |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |   |||||||||||    ||||  |    
T  34081 ggatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaacactccagtgtcttgtctgtctctgtggaactgtgtctacaaatcgccaacagt 34180  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||    
T  34181 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcattcatgcatattgcatttccaata 34279  T
Q  303 tcaa 306  Q
    ||||    
T  34280 tcaa 34283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 108; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2735 - 2483
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| |||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||     
T  2735 acggcgttttccccagtggagcctctcaagattctatctccagcaagttgcatatctacctgccctcagctatggttccgacacgtctcccaacgacgtc 2636  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  2635 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactctgatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 2536  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2535 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 2483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26108 - 25809
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  26108 gtcttccgagattctttccccagcaagttgcttagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttcca 26009  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
          | |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| | || | | |||   |||||||||||||  ||||  |||||||||     
T  26008 agaatgtgtgatatagcatgagccactacgtgcccaatagtccaatgttttgtgtgtctctgcgaaactgtgtctacaaactgccaacagtcatgcatta 25909  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatcaatgtca 311  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  || | |||||| |||| |||| | |||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||| |||    
T  25908 caagcattcatacatgcataatcatgcatactatgtgcccatacatttgat-aaaactattataccacccatacatctttcatttccaatgtcaatttca 25810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 305
Target Start/End: Original strand, 490 - 782
Alignment:
Q  21 gtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaagaggatttc-- 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  490 gtcttccgagattctatccccagcaggttgcatagctacctgccctcaaccatggttctgatacgtctcccaacgacgttatctccaaagaggatttccg 589  T
Q  119 ------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccatcatgcattt 211  Q
          | | || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||| ||  | || ||||||||||     
T  590 ggaatgtgtaatatagcacgagacactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaagctgcccacaatcatgcatta 689  T
Q  212 caatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaatatca 305  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||  |  || | |||||| | || |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  690 caagcattcatacatgcataatcatgcatacaaagtgcccatacatttaat-aaaactgttatatcatccatacatattgcatttccaatatca 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 88; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 16274 - 16526
Alignment:
Q  1 acggggttttccccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgtt 100  Q
    |||| ||||||||| || | ||||  ||||| |||||||||||| ||||   || ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  16274 acggcgttttccccggtggagtctctcaagactctatccccagccagttacatacctaccggccctcggccatggttccgatacgtctcccaacgacgtc 16373  T
Q  101 atctccaaagaggatttctatga--------tgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtcttccccgtgaagtcgtgtctacaaac 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||        | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16374 atctccaaagaggatttccaagaatgtgtaatataacacgagccactacgtgcccaatactctgatgttttgtcttccccgtgaagtcgtgcctacaaaa 16473  T
Q  193 tatcaaccatcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16474 tgccaacagtcatgcattacaagcattcatacatgcacaatcatgcatattac 16526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24521 - 24213
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24521 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 24422  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    | |||||        | | || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| | |   | |||||||||    || |  |    
T  24421 gaatttccaggaatgtgtaatatagcacgagccattacgtgcccaatactccagtgtcttgtctgtctccgcggaactgcgtctacaaatcgccagcagt 24322  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaata 302  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| | || |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||     
T  24321 cgtgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacatgcccatgcatttaat-aaaactgttatatcattcatgcatattgcatttccaatg 24223  T
Q  303 tcaatgtcag 312  Q
    ||||| ||||    
T  24222 tcaatatcag 24213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4163 - 3921
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaaga 111  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4163 cccagtagagtctcccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgcccttagccatggtcccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaaga 4064  T
Q  112 ggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaaccat 202  Q
    |||| ||        | | || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||  |    
T  4063 ggatgtccaagaatgtgtaatatagcacgagccactgcgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacagt 3964  T
Q  203 catgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3963 catgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 3921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9209 - 8966
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatcccca-gcaagttgattagctatctgccctcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaag 110  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9209 cccagtagagtcttccgagattctatcctcaagcaagttgcatggctacctgccctcagccatggttccgacacgtctcccaacgacgtcatctccaaag 9110  T
Q  111 aggatttc--------tatgatgtagcacgagccactacgtgcccaatactctaatgtcttgtct-tccccgtgaagtcgtgtctacaaactatcaacca 201  Q
    ||||| ||        | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||   |||||||||||    ||||      
T  9109 aggatgtccaggaatgtgtaatatagcacgagccactacgtgcccaatactccaatgtcttgtctgtctctgcgaaactgtgtctacaaatcgccaacag 9010  T
Q  202 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9009 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 8966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 40171 - 40064
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttg-attagctatctgccc-tcagccatggttccggtacgtctcccaacggcgttatctccaaa 109  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  40171 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcattaactacctgcccctcagccatggttccgatacgtctcccaacgacgtcatctccaaa 40072  T
Q  110 gaggattt 117  Q
    ||||||||    
T  40071 gaggattt 40064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39965 - 39922
Alignment:
Q  202 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39965 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 39922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1412 - 1309
Alignment:
Q  202 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattacatgtctatacatctgataaaaattgttataccatccatacatgttgcatttgcaat 301  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| | ||  ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  1412 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattacgtgcccatgcatttaat-gaaactgttatatcatccatgcatattgcatttccaat 1314  T
Q  302 atcaa 306  Q
     ||||    
T  1313 gtcaa 1309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Original strand, 6751 - 6807
Alignment:
Q  12 cccagtcgggtcttccaagattctatccccagcaagttgattagctatctgccctca 68  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  6751 cccagtagagtcttccgagattctatccccagcaagttgcatagctacctgccctca 6807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13324 - 13281
Alignment:
Q  202 tcatgcatttcaatcattcatacatgcatgatcatgcatattac 245  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13324 tcatgcattacaagcattcatacatgcataatcatgcatattac 13281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University