View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7058_low_5 (Length: 297)

Name: NF7058_low_5
Description: NF7058
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7058_low_5
NF7058_low_5
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (23-283)||(113727-113987)
scaffold0029 (47-178)||(108713-108844)
scaffold0029 (191-279)||(95048-95136)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (15-283)||(19880299-19880567)
chr6 (15-272)||(34644598-34644855)
chr6 (23-283)||(18795691-18795951)
chr6 (44-283)||(21563173-21563412)
chr6 (44-283)||(21569032-21569271)
chr6 (23-282)||(19454422-19454681)
chr6 (23-283)||(15460337-15460597)
chr6 (23-265)||(8761953-8762195)
chr6 (29-273)||(5296232-5296476)
chr6 (23-267)||(14378937-14379181)
chr6 (23-267)||(14380487-14380731)
chr6 (44-267)||(21472618-21472841)
chr6 (23-270)||(10467869-10468116)
chr6 (44-282)||(15897096-15897334)
chr6 (44-270)||(22434883-22435109)
chr6 (44-270)||(22443281-22443507)
chr6 (47-271)||(27188449-27188673)
chr6 (47-271)||(27260567-27260791)
chr6 (23-267)||(24365429-24365673)
chr6 (44-282)||(22761496-22761734)
chr6 (45-282)||(20636343-20636580)
chr6 (47-178)||(16926684-16926815)
chr6 (24-267)||(19436019-19436262)
chr6 (44-267)||(19488313-19488536)
chr6 (44-180)||(23079573-23079709)
chr6 (44-144)||(29590961-29591061)
chr6 (47-178)||(16962489-16962620)
chr6 (44-178)||(16625758-16625892)
chr6 (23-177)||(28281833-28281987)
chr6 (29-178)||(25113658-25113807)
chr6 (47-283)||(5838263-5838499)
chr6 (42-195)||(19865776-19865929)
chr6 (47-283)||(1542128-1542364)
chr6 (50-197)||(25608908-25609055)
chr6 (47-178)||(28262241-28262372)
chr6 (47-178)||(28340990-28341121)
chr6 (45-214)||(27564863-27565032)
chr6 (44-144)||(2873844-2873944)
chr6 (50-180)||(18406991-18407121)
chr6 (44-131)||(18196774-18196861)
chr6 (125-267)||(25769208-25769350)
chr6 (47-144)||(18449650-18449747)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (15-283)||(6555-6823)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (23-283)||(19613802-19614062)
chr7 (42-283)||(11387309-11387550)
chr7 (23-283)||(14263106-14263366)
chr7 (23-283)||(19148338-19148598)
chr7 (23-283)||(20747737-20747997)
chr7 (23-283)||(15101465-15101725)
chr7 (23-269)||(16071157-16071403)
chr7 (23-267)||(13022500-13022744)
chr7 (44-282)||(12205683-12205921)
chr7 (23-267)||(11305125-11305369)
chr7 (23-267)||(16949334-16949578)
chr7 (23-267)||(26117467-26117711)
chr7 (23-282)||(13666665-13666924)
chr7 (23-267)||(268-513)
chr7 (23-270)||(14285238-14285485)
chr7 (26-267)||(12457783-12458024)
chr7 (23-267)||(49153444-49153688)
chr7 (44-178)||(14955785-14955919)
chr7 (50-282)||(320948-321180)
chr7 (55-214)||(15147801-15147960)
chr7 (44-178)||(8708836-8708970)
chr7 (44-214)||(11771146-11771316)
chr7 (44-178)||(18550663-18550797)
chr7 (23-177)||(23504732-23504886)
chr7 (44-178)||(44790256-44790390)
chr7 (44-214)||(10872190-10872360)
chr7 (44-270)||(14333535-14333761)
chr7 (23-177)||(18052815-18052969)
chr7 (44-144)||(8199893-8199993)
chr7 (44-260)||(11236118-11236334)
chr7 (23-267)||(13967530-13967774)
chr7 (44-144)||(15159962-15160062)
chr7 (45-144)||(18179007-18179106)
chr7 (44-210)||(16223-16389)
chr7 (23-268)||(15341573-15341818)
chr7 (45-178)||(23202519-23202652)
chr7 (45-178)||(23508646-23508779)
chr7 (44-144)||(13687329-13687429)
chr7 (45-177)||(15204851-15204983)
chr7 (168-267)||(12456845-12456944)
chr7 (44-178)||(12688731-12688866)
chr7 (29-214)||(9597252-9597437)
chr7 (45-144)||(11552008-11552107)
chr7 (45-197)||(14212886-14213038)
chr7 (44-183)||(14040921-14041060)
chr7 (44-183)||(14350951-14351090)
chr7 (65-219)||(15625744-15625898)
chr7 (20-135)||(40027-40142)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (23-283)||(32555-32815)
scaffold0076 (23-267)||(55778-56022)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (23-283)||(49392-49652)
scaffold0028 (47-283)||(44319-44555)
scaffold0028 (45-144)||(9781-9880)
scaffold0028 (45-112)||(16275-16342)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (23-283)||(21679835-21680095)
chr5 (23-282)||(22463003-22463262)
chr5 (23-282)||(20822505-20822764)
chr5 (23-267)||(24619352-24619596)
chr5 (23-267)||(24715583-24715827)
chr5 (23-267)||(24748611-24748855)
chr5 (23-282)||(28893999-28894258)
chr5 (23-282)||(28915470-28915729)
chr5 (23-282)||(28922825-28923084)
chr5 (23-273)||(23079146-23079396)
chr5 (57-282)||(20774811-20775036)
chr5 (23-267)||(14886048-14886292)
chr5 (23-282)||(22234977-22235236)
chr5 (23-267)||(24797454-24797698)
chr5 (23-231)||(28930738-28930946)
chr5 (44-270)||(21563051-21563277)
chr5 (140-283)||(21889933-21890076)
chr5 (23-267)||(37542438-37542682)
chr5 (44-180)||(23472400-23472536)
chr5 (23-267)||(25849142-25849386)
chr5 (44-270)||(27667568-27667794)
chr5 (44-144)||(16357710-16357810)
chr5 (44-144)||(27519614-27519714)
chr5 (44-144)||(34567702-34567802)
chr5 (44-144)||(40709988-40710088)
chr5 (29-267)||(22503746-22503984)
chr5 (45-271)||(23574810-23575036)
chr5 (47-144)||(41772050-41772147)
chr5 (44-144)||(27611562-27611662)
chr5 (47-178)||(19771134-19771265)
chr5 (44-283)||(23441279-23441518)
chr5 (44-142)||(21872128-21872226)
chr5 (44-142)||(21876408-21876506)
chr5 (44-270)||(22331965-22332191)
chr5 (50-180)||(25427605-25427735)
chr5 (26-267)||(20343349-20343590)
chr5 (44-144)||(14998817-14998917)
chr5 (44-144)||(22135876-22135976)
chr5 (44-144)||(27684478-27684578)
chr5 (44-144)||(29475151-29475251)
chr5 (44-231)||(26737805-26737992)
chr5 (48-126)||(21497150-21497228)
chr5 (44-178)||(37290574-37290708)
chr5 (23-177)||(17268391-17268545)
chr5 (45-283)||(21882018-21882256)
chr5 (44-105)||(20467176-20467237)
chr5 (83-252)||(21830878-21831047)
chr5 (45-197)||(18776951-18777103)
chr5 (53-144)||(21338384-21338475)
chr5 (23-100)||(846-923)
chr5 (47-260)||(21408230-21408443)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (23-283)||(13971223-13971483)
chr3 (23-283)||(14087439-14087699)
chr3 (23-283)||(10419148-10419408)
chr3 (23-282)||(12359630-12359889)
chr3 (23-259)||(17187164-17187400)
chr3 (47-283)||(14574689-14574925)
chr3 (23-283)||(17493396-17493656)
chr3 (23-270)||(31694289-31694536)
chr3 (23-270)||(31939682-31939929)
chr3 (23-267)||(47124726-47124970)
chr3 (23-282)||(13319605-13319864)
chr3 (44-283)||(16827327-16827566)
chr3 (23-276)||(16337615-16337868)
chr3 (23-267)||(11960272-11960516)
chr3 (23-283)||(16835613-16835873)
chr3 (44-282)||(15228416-15228654)
chr3 (44-282)||(15234284-15234522)
chr3 (20-283)||(14580053-14580316)
chr3 (47-214)||(15347383-15347550)
chr3 (23-153)||(12179234-12179364)
chr3 (27-267)||(18133453-18133693)
chr3 (45-180)||(16491317-16491452)
chr3 (44-270)||(5424065-5424291)
chr3 (23-177)||(44778119-44778273)
chr3 (47-144)||(6601631-6601728)
chr3 (26-267)||(16328766-16329007)
chr3 (44-144)||(15588527-15588627)
chr3 (44-144)||(16636668-16636768)
chr3 (44-144)||(20061189-20061289)
chr3 (44-144)||(43163992-43164092)
chr3 (44-144)||(48426342-48426442)
chr3 (47-214)||(53384156-53384323)
chr3 (50-196)||(17490693-17490839)
chr3 (23-177)||(41178394-41178548)
chr3 (44-144)||(10006495-10006595)
chr3 (44-144)||(10907105-10907205)
chr3 (138-270)||(11302991-11303123)
chr3 (44-144)||(13253585-13253685)
chr3 (44-180)||(15260489-15260625)
chr3 (44-270)||(15401652-15401878)
chr3 (44-270)||(15340038-15340264)
chr3 (45-214)||(14125730-14125899)
chr3 (44-144)||(15724069-15724169)
chr3 (23-177)||(13942896-13943050)
chr3 (42-178)||(12499109-12499245)
chr3 (45-280)||(14875635-14875870)
chr3 (44-177)||(16693026-16693159)
chr3 (45-144)||(16411418-16411517)
chr3 (81-144)||(16755757-16755820)
chr3 (45-214)||(16806083-16806252)
chr3 (23-177)||(16380031-16380185)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (23-283)||(24179-24439)
scaffold0090 (23-283)||(20017-20277)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (42-283)||(20060918-20061159)
chr1 (23-282)||(19855458-19855717)
chr1 (23-270)||(19662084-19662331)
chr1 (23-282)||(20855707-20855966)
chr1 (23-270)||(23197193-23197440)
chr1 (23-282)||(20939010-20939269)
chr1 (23-272)||(20834847-20835096)
chr1 (23-267)||(24098550-24098794)
chr1 (23-267)||(31538944-31539188)
chr1 (44-258)||(16373707-16373921)
chr1 (23-231)||(21952113-21952321)
chr1 (53-282)||(21750093-21750322)
chr1 (23-151)||(21744499-21744627)
chr1 (45-180)||(431085-431220)
chr1 (44-270)||(51332461-51332687)
chr1 (23-267)||(20295580-20295824)
chr1 (50-214)||(41352636-41352800)
chr1 (44-144)||(16349564-16349664)
chr1 (47-214)||(33390000-33390167)
chr1 (44-144)||(21838241-21838341)
chr1 (44-180)||(22110277-22110413)
chr1 (44-180)||(22114126-22114262)
chr1 (44-178)||(19107625-19107759)
chr1 (44-270)||(21831468-21831694)
chr1 (50-214)||(16077630-16077794)
chr1 (44-270)||(19759841-19760067)
chr1 (44-214)||(21025394-21025564)
chr1 (20-197)||(21234675-21234852)
chr1 (45-282)||(22361213-22361450)
chr1 (44-123)||(24793585-24793664)
chr1 (44-120)||(17043983-17044059)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (45-283)||(23099455-23099693)
chr2 (26-283)||(27209590-27209847)
chr2 (23-267)||(23277560-23277804)
chr2 (23-270)||(24949371-24949618)
chr2 (23-267)||(1064535-1064779)
chr2 (44-270)||(23111517-23111743)
chr2 (23-267)||(20829043-20829287)
chr2 (23-259)||(31831450-31831686)
chr2 (23-267)||(23294719-23294963)
chr2 (23-267)||(19651465-19651709)
chr2 (44-282)||(24710803-24711041)
chr2 (44-144)||(16923796-16923896)
chr2 (44-144)||(16926267-16926367)
chr2 (44-144)||(16983059-16983159)
chr2 (44-144)||(16999907-17000007)
chr2 (44-144)||(17064624-17064724)
chr2 (44-144)||(22324292-22324392)
chr2 (44-144)||(27218923-27219023)
chr2 (51-214)||(24676326-24676489)
chr2 (23-177)||(12575227-12575381)
chr2 (50-180)||(23067262-23067391)
chr2 (44-178)||(27372142-27372276)
chr2 (44-144)||(44385005-44385105)
chr2 (45-180)||(23107167-23107302)
chr2 (23-177)||(27788615-27788768)
chr2 (45-178)||(21144478-21144611)
chr2 (44-144)||(10869757-10869857)
chr2 (44-144)||(41607821-41607921)
chr2 (45-144)||(24876186-24876285)
chr2 (44-142)||(24263279-24263377)
chr2 (47-282)||(45533113-45533349)
chr2 (53-178)||(21324711-21324836)
chr2 (42-214)||(24706916-24707088)
chr2 (242-283)||(27364713-27364754)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (23-283)||(1051-1311)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (23-281)||(68540-68798)
scaffold0034 (23-272)||(3831-4080)
scaffold0034 (23-283)||(12786-13039)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (23-283)||(2208-2468)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (23-283)||(430-690)
scaffold0120 (45-270)||(13239-13464)
scaffold0120 (45-180)||(7291-7426)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (23-283)||(20984865-20985125)
chr8 (44-283)||(21841620-21841859)
chr8 (44-267)||(19852630-19852853)
chr8 (44-267)||(19858666-19858889)
chr8 (47-283)||(23656130-23656366)
chr8 (42-267)||(22372150-22372375)
chr8 (23-282)||(20974974-20975228)
chr8 (23-267)||(14566361-14566605)
chr8 (44-258)||(20395471-20395685)
chr8 (23-267)||(31415789-31416036)
chr8 (23-267)||(29302744-29302988)
chr8 (45-283)||(19979170-19979408)
chr8 (42-267)||(22376791-22377016)
chr8 (42-267)||(22382966-22383191)
chr8 (23-267)||(6604877-6605121)
chr8 (23-231)||(21324587-21324794)
chr8 (44-267)||(20009260-20009482)
chr8 (44-268)||(20389317-20389541)
chr8 (51-150)||(21921082-21921181)
chr8 (50-267)||(6680330-6680547)
chr8 (23-267)||(16270542-16270786)
chr8 (50-214)||(19483409-19483573)
chr8 (50-214)||(23651313-23651477)
chr8 (45-180)||(21252250-21252385)
chr8 (23-177)||(31570160-31570314)
chr8 (44-178)||(17673362-17673496)
chr8 (44-270)||(20017602-20017828)
chr8 (45-283)||(21165878-21166116)
chr8 (44-258)||(23886252-23886466)
chr8 (23-267)||(12305977-12306221)
chr8 (44-144)||(19114032-19114132)
chr8 (44-132)||(22247772-22247860)
chr8 (96-267)||(803064-803235)
chr8 (45-180)||(21393205-21393340)
chr8 (45-180)||(21787699-21787834)
chr8 (44-214)||(22041131-22041301)
chr8 (45-178)||(21043753-21043886)
chr8 (44-144)||(18857919-18858019)
chr8 (15-283)||(22052066-22052334)
chr8 (45-197)||(30312484-30312636)
chr8 (23-98)||(27355924-27355999)
chr8 (50-180)||(1267544-1267674)
chr8 (20-180)||(15534689-15534849)
chr8 (44-197)||(32601433-32601586)
chr8 (20-135)||(19869044-19869159)
chr8 (155-283)||(16407495-16407623)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (23-281)||(27901525-27901783)
chr4 (23-283)||(15002239-15002499)
chr4 (23-270)||(15357995-15358242)
chr4 (44-280)||(15413922-15414158)
chr4 (23-267)||(29452412-29452656)
chr4 (23-267)||(3263669-3263913)
chr4 (23-267)||(33224076-33224320)
chr4 (24-258)||(16148873-16149107)
chr4 (24-258)||(16153019-16153253)
chr4 (47-283)||(15247061-15247297)
chr4 (44-239)||(15320317-15320512)
chr4 (24-267)||(11206107-11206350)
chr4 (137-270)||(15078785-15078918)
chr4 (44-252)||(8707088-8707296)
chr4 (42-214)||(16354079-16354251)
chr4 (44-267)||(14695266-14695489)
chr4 (42-177)||(15071602-15071737)
chr4 (44-195)||(15146521-15146672)
chr4 (24-282)||(1648153-1648411)
chr4 (44-144)||(8387688-8387788)
chr4 (44-144)||(12477876-12477976)
chr4 (44-144)||(18298481-18298581)
chr4 (44-144)||(19777429-19777529)
chr4 (44-144)||(29038040-29038140)
chr4 (47-214)||(23956953-23957120)
chr4 (44-270)||(8052259-8052485)
chr4 (23-177)||(51605667-51605821)
chr4 (23-180)||(14160710-14160867)
chr4 (23-231)||(20892171-20892379)
chr4 (15-267)||(44660733-44660985)
chr4 (47-178)||(27712578-27712709)
chr4 (45-178)||(12524918-12525051)
chr4 (53-178)||(14850011-14850136)
chr4 (44-120)||(14681867-14681943)
chr4 (45-178)||(40474282-40474415)
chr4 (44-260)||(14302614-14302830)
chr4 (20-180)||(18614436-18614596)
chr4 (44-231)||(18226082-18226269)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (44-270)||(10974-11200)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (23-283)||(5598-5858)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (23-282)||(111-370)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (23-273)||(323882-324132)
scaffold0004 (44-252)||(202367-202575)
scaffold0004 (44-200)||(118477-118633)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (23-283)||(1732-1992)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (23-283)||(29225-29485)
scaffold0026 (50-180)||(30216-30346)
scaffold0026 (23-93)||(50168-50238)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (23-283)||(28385-28645)
scaffold0139 (23-283)||(34638-34898)
scaffold0139 (82-159)||(95-172)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (23-283)||(47912-48172)
scaffold0053 (23-282)||(56725-56984)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (44-267)||(27708-27931)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (23-270)||(46277-46524)
scaffold0010 (23-267)||(41211-41455)
scaffold0010 (51-267)||(3098-3314)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (24-270)||(24755-25001)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (23-272)||(13379-13628)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (23-283)||(4944-5204)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (47-283)||(48272-48508)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (23-283)||(89323-89583)
scaffold0001 (23-283)||(90001-90261)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (47-270)||(40879-41102)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (23-273)||(15290-15540)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (23-272)||(149749-149997)
scaffold0011 (23-282)||(194582-194841)
scaffold0011 (51-180)||(25439-25568)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (47-283)||(5918-6154)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (23-267)||(43967-44211)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (23-283)||(50753-51013)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (44-283)||(146-385)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (23-270)||(182-429)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (47-283)||(1037-1273)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (23-267)||(10935-11179)
scaffold0298 (23-267)||(14705-14949)
scaffold0298 (23-283)||(21151-21411)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (23-267)||(42101-42345)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (23-267)||(249797-250041)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (23-270)||(2769-3016)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (44-260)||(5988-6206)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (15-282)||(2225-2492)
scaffold0222 (23-267)||(8244-8488)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (23-268)||(6116-6361)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (23-283)||(32579-32839)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (23-283)||(566-824)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (23-267)||(20578-20822)
scaffold0104 (23-267)||(23398-23642)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (23-283)||(27793-28052)
scaffold0067 (23-282)||(51058-51317)
scaffold0067 (23-282)||(60092-60351)
scaffold0067 (23-282)||(66480-66739)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (23-267)||(100440-100684)
scaffold0020 (95-214)||(181436-181555)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (23-270)||(2363-2610)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (23-270)||(851-1098)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (47-281)||(3346-3580)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (99-283)||(16448-16632)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (79-283)||(6264-6468)
scaffold0149 (79-283)||(10695-10899)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (23-282)||(13177-13436)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (44-282)||(9707-9945)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (65-282)||(11902-12119)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (23-267)||(10335-10579)
scaffold0235 (23-267)||(20549-20793)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (23-282)||(20289-20548)
scaffold0058 (47-100)||(58093-58146)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (84-270)||(1-187)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (44-282)||(16876-17114)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (44-260)||(18114-18330)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (23-267)||(4330-4574)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (23-270)||(3932-4177)
scaffold0035 (50-237)||(43012-43199)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (20-259)||(516-755)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (42-283)||(79391-79632)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (23-267)||(7023-7267)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (23-231)||(12405-12613)
scaffold0180 (44-180)||(31652-31788)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (23-222)||(108859-109058)
scaffold0031 (44-195)||(62930-63081)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (44-267)||(218316-218539)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (44-282)||(177161-177399)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (23-260)||(3150-3387)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (42-267)||(15379-15604)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (23-260)||(30163-30400)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (47-283)||(18517-18753)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (24-264)||(32198-32438)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (23-267)||(45701-45945)
scaffold0114 (45-144)||(19241-19340)
scaffold0114 (23-200)||(21138-21315)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (24-142)||(35422-35540)
scaffold0156 (149-283)||(28393-28527)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (71-280)||(39685-39894)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (44-180)||(16925-17061)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (23-267)||(15591-15835)
scaffold0089 (44-267)||(10621-10844)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (44-180)||(16148-16284)
scaffold0040 (53-180)||(112396-112523)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (44-267)||(13652-13875)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (44-180)||(10240-10376)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (53-180)||(7561-7688)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (44-283)||(7182-7421)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (44-195)||(29470-29621)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (44-267)||(23084-23307)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (44-178)||(8670-8804)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (44-214)||(102470-102640)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (62-267)||(5215-5420)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (42-231)||(5091-5280)
scaffold0270 (42-231)||(12221-12410)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (50-267)||(5241-5458)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (51-214)||(3431-3594)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (45-180)||(7643-7778)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (45-144)||(7356-7455)
scaffold0358 (70-156)||(3534-3620)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (45-180)||(14111-14246)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (45-180)||(37-172)
scaffold0319 (45-180)||(2540-2675)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (45-180)||(25845-25979)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (23-234)||(28150-28361)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (42-177)||(277727-277862)
scaffold0005 (24-268)||(261491-261735)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (45-195)||(50688-50838)
scaffold0081 (45-270)||(19783-20008)
scaffold0081 (45-270)||(35207-35432)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (23-283)||(80710-80970)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (23-267)||(142-390)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (45-180)||(7231-7366)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (44-195)||(26230-26381)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (44-270)||(2089-2315)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (44-270)||(8120-8346)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (23-177)||(14178-14331)
scaffold0261 (23-177)||(22357-22510)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (44-252)||(23978-24179)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (45-283)||(4253-4491)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (45-178)||(8639-8772)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (53-214)||(7995-8156)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (50-179)||(38853-38982)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (44-180)||(966-1102)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (23-283)||(6381-6641)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (44-180)||(4383-4519)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (45-144)||(2200-2299)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (44-195)||(24723-24874)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (44-267)||(9915-10138)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (23-177)||(96438-96592)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (45-214)||(1655-1824)
scaffold0044 (45-214)||(15395-15564)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (47-267)||(85421-85641)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (44-267)||(6790-7013)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (45-132)||(32473-32560)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (45-178)||(38720-38853)
scaffold0042 (20-111)||(66745-66836)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (23-111)||(1712-1800)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (53-120)||(12900-12967)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (45-144)||(28268-28367)
scaffold0023 (44-180)||(3355-3491)
scaffold0023 (80-180)||(131377-131477)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (50-180)||(39828-39958)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (70-180)||(6492-6602)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (45-111)||(18967-19033)
scaffold0017 (44-120)||(196377-196453)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (44-120)||(23972-24048)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (23-177)||(11664-11818)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (44-219)||(115804-115979)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (44-114)||(13980-14050)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (47-105)||(343-401)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (47-172)||(16466-16591)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 113987 - 113727
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  113987 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaacgccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 113888  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  113887 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgtgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 113788  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  113787 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 113727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 178
Target Start/End: Original strand, 108713 - 108844
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  108713 aaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggtca 108812  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  108813 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 108844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 279
Target Start/End: Original strand, 95048 - 95136
Alignment:
Q  191 tgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttga 279  Q
    |||||||||| | | || ||||| |||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  95048 tgtgaattgtcatcgcaaagtgtacagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagcatcagagaagcacaacaagttga 95136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19880567 - 19880299
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19880567 acatgagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaacgtagttgcagatgctttgagtag 19880468  T
Q  115 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19880467 aaagacgttgcacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcaccccagagtgtg 19880368  T
Q  215 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19880367 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgagtagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 19880299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Original strand, 34644598 - 34644855
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34644598 acatgagacagaggagatggctagagttattgaaggattatgagtttgggttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgccttgagtag 34644697  T
Q  115 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  34644698 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgcgagttgtcaccccagagtgtg 34644797  T
Q  215 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 272  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  34644798 cagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttggatagtattagagaagcgcaac 34644855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18795951 - 18795691
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18795951 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 18795852  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18795851 tacacatgtcggctttaatggtaaaggaatttgagttgcttgaatagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagttggg 18795752  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18795751 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 18795691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 21563173 - 21563412
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21563173 ttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatgg 21563272  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  21563273 taaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtga 21563372  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21563373 tttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 21563412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 21569032 - 21569271
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21569032 ttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatgg 21569131  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  21569132 taaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtga 21569231  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21569232 tttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 21569271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19454681 - 19454422
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  19454681 cagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 19454582  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  19454581 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcaatttagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtgcagttggg 19454482  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| || || | ||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  19454481 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaataatatcagagaagcacaacaagtggatgt 19454422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15460597 - 15460337
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  15460597 cagaggagatggctagaattattaaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 15460498  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| || || || || |||||||||| | | || |||||||| |||||    
T  15460497 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgaattgcttgaacagtttagagacttgagtctagtgtgtgaattgtcatcgcaaagtgtgcatttggg 15460398  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  15460397 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagcacaacgagttgatgtc 15460337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 265
Target Start/End: Original strand, 8761953 - 8762195
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  8761953 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 8762052  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  8762053 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 8762152  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaa 265  Q
     ||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  8762153 gatgctgaaaattaatagtgatttcctgaatagtatccgagaa 8762195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Original strand, 5296232 - 5296476
Alignment:
Q  29 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  5296232 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacgttgcaca 5296331  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 228  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||| |||||| | || ||||| ||| |    
T  5296332 tgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagccttgtttgtgagttatcacctcagagtatacaattggggatgct 5296431  T
Q  229 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 273  Q
    || ||| || | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5296432 gagaattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcaaca 5296476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 14378937 - 14379181
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||     
T  14378937 cagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgc 14379036  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||| | |||||||| ||||| || || || ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  14379037 tgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggg 14379136  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| | || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14379137 gatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagc 14379181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 14380487 - 14380731
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||     
T  14380487 cagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgc 14380586  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||| | |||||||| ||||| || || || ||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  14380587 tgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggg 14380686  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| | || || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14380687 gatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagc 14380731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21472841 - 21472618
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  21472841 ttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 21472742  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  21472741 taaaagagtttgagttccttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgcgagttgccacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtga 21472642  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||| ||||| || |||||    
T  21472641 tttcttgaacagtattagggaagc 21472618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 10467869 - 10468116
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  10467869 cagaggagatggttagagttactgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcagaaaaacat 10467968  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||| | || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || ||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  10467969 tgcatatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaatttagagacttgagtcttgtctgagaattgtcacctcagagtatacagttggg 10468068  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     ||| |||| ||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10468069 gatgctgaagattgatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 10468116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15897334 - 15897096
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  15897334 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgcgatgatga 15897235  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||| | || |||||| ||| ||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| |||    
T  15897234 tcaaagaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 15897135  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  15897134 attcttgaacagtattaaagaagcacaaaaagttgatgt 15897096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22435109 - 22434883
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  22435109 ttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatag 22435010  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  22435009 ttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtga 22434910  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    |||  |||| ||||||| |||||||||    
T  22434909 atttctgaagagtatcaaagaagcaca 22434883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22443507 - 22443281
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  22443507 ttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatag 22443408  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  22443407 ttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 22443308  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    |||  |||| ||||||| |||||||||    
T  22443307 atttctgaagagtatcaaagaagcaca 22443281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27188673 - 27188449
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  27188673 aaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtca 27188574  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
      || |||||| |||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| ||||||    
T  27188573 gagagtttgagctacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatt 27188474  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagcacaa 271  Q
      |||| || |||| ||||||||||    
T  27188473 tctgaaaagcatcaaagaagcacaa 27188449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 271
Target Start/End: Original strand, 27260567 - 27260791
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |    
T  27260567 aaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtca 27260666  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
      || |||||| |||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| ||||||    
T  27260667 gagagtttgagctacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtgaatt 27260766  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagcacaa 271  Q
      |||| || |||| ||||||||||    
T  27260767 tctgaaaagcatcaaagaagcacaa 27260791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24365673 - 24365429
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  24365673 cagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaggaaaacct 24365574  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | ||||||||    
T  24365573 tgcacatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacattagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggg 24365474  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  24365473 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 24365429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 22761496 - 22761734
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22761496 ttgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatgg 22761595  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||  | ||||||||| ||||| |  | |||||| || | || ||| |||| ||  |||||||    
T  22761596 taaaggagttcgagttgcttgaacaattcagagatttgagtttagtttgtgaaatgttatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatga 22761695  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
    |||| |||| ||||| | |||||| ||| | ||||||||    
T  22761696 attcctgaagagtattaaagaagcgcaaaaagttgatgt 22761734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 282
Target Start/End: Original strand, 20636343 - 20636580
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||||||    
T  20636343 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttacatatgttcgctatgatggt 20636442  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 244  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||  | ||||||||| ||| | |  | |||||| || | || ||| |||| ||  ||||||||    
T  20636443 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatctgaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaa 20636542  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
    ||  |||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||    
T  20636543 tttctgaagagtattaaagaagcgcaaaaggttgatgt 20636580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 178
Target Start/End: Original strand, 16926684 - 16926815
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || |||||||| |    
T  16926684 aaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaa 16926783  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||||    
T  16926784 aagagttcgagttactggaacagtttagagat 16926815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19436262 - 19436019
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||  |||| |||||  | ||||| ||    
T  19436262 agaggatatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagccggaagacatt 19436163  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 223  Q
     || ||||| ||  |||||||| ||||||| || || || |||||||| | |||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || ||  |     
T  19436162 gcatatgtctgctttgatggtggaggaattcgatttgctagagcagttcaaagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattcagg 19436063  T
Q  224 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| |||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19436062 atgctgaaaattcatagtgatttcttgaatagtatctgagaagc 19436019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 19488313 - 19488536
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || |||||||    
T  19488313 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgaatatgtctgctatgatgg 19488412  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || || |||||| |||| || |||||||| ||||  |  ||    
T  19488413 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtgaagttaggtatgttgaagatcagcagaga 19488512  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||||| | ||||||    
T  19488513 gttcttgaatagtattaaagaagc 19488536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23079709 - 23079573
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23079709 ttgaaggattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 23079610  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || ||| | || || || ||||||||||||||    
T  23079609 taaaagagtttaattttctggaacagtttagagattt 23079573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 29590961 - 29591061
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  29590961 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 29591060  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  29591061 t 29591061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 178
Target Start/End: Original strand, 16962489 - 16962620
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||| | || |||||||| || |||||||| |    
T  16962489 aaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttggagatgcattgagtaggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaa 16962588  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||||    
T  16962589 aagagttcgagttactggaacagtttagagat 16962620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Original strand, 16625758 - 16625892
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16625758 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16625857  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  16625858 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 16625892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 28281833 - 28281987
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  28281833 cagaggagatggcttgagttgttaaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagcaaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacac 28281932  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  28281933 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 28281987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25113807 - 25113658
Alignment:
Q  29 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  25113807 agatggctagagttgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcata 25113708  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    |||| || |||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  25113707 tgtccgctatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 25113658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 283
Target Start/End: Original strand, 5838263 - 5838499
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||| |||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  5838263 aaggactatgatttcgaattgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtta 5838362  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
      || || |||||||| ||||||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| || |||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||| ||    
T  5838363 gagagttcgagttacttgagcagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcatagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgattt 5838462  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
      ||||||||||||  ||||||||  | |||||||||    
T  5838463 tctgaatagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 5838499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19865929 - 19865776
Alignment:
Q  42 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||    
T  19865929 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctatgat 19865830  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
    ||| || || || ||| | || || |||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  19865829 ggttaaagagttcgagctgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtga 19865776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 283
Target Start/End: Original strand, 1542128 - 1542364
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  1542128 aaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 1542227  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
      || || |||||||| || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||| ||    
T  1542228 gagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgagtt 1542327  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    | |||| |||||||  ||||||||  | |||||||||    
T  1542328 cctgaagagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 1542364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 197
Target Start/End: Original strand, 25608908 - 25609055
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  |    
T  25608908 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagag 25609007  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 197  Q
    | || |||||  | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  25609008 agttcgagttgttggaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaat 25609055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 178
Target Start/End: Original strand, 28262241 - 28262372
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  28262241 aaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgccatgatggtca 28262340  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  28262341 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 28262372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 178
Target Start/End: Original strand, 28340990 - 28341121
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  28340990 aaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtctgccatgatggtca 28341089  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  28341090 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 28341121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Original strand, 27564863 - 27565032
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  27564863 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 27564962  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |   | || || ||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  27564963 tagaaagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgaatagtcacctcagagtgtg 27565032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 2873844 - 2873944
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  2873844 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 2873943  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  2873944 t 2873944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Original strand, 18406991 - 18407121
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  18406991 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaacgttgttgtagacgctttgagcaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 18407090  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  18407091 agttcgagttgcttgaacagttcagagattt 18407121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Original strand, 18196774 - 18196861
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgt 131  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  18196774 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttatagatgccttaagtaggaagactttacatatgt 18196861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25769350 - 25769208
Alignment:
Q  125 cacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggca 224  Q
    |||||||| || |||||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || ||| ||||||| || | ||| ||||||||||||| ||| |    
T  25769350 cacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttctttgtgagttatcacctcagagtgtgcagtagggta 25769251  T
Q  225 tgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||| || | |||||| |||||    
T  25769250 tgttgaagatcaatagtgatttcttaaacaatatcagggaagc 25769208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18449747 - 18449650
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||| |||| || ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  18449747 aaggattataatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcatatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggt 18449650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Original strand, 6555 - 6823
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6555 acatgagacagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcggatgctttgagtag 6654  T
Q  115 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  6655 gaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtcttgtttgtgagttgtcgccccagagtgtg 6754  T
Q  215 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6755 cagttgggtatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 6823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19614062 - 19613802
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19614062 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 19613963  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19613962 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 19613863  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19613862 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 19613802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 42 - 283
Target Start/End: Original strand, 11387309 - 11387550
Alignment:
Q  42 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  11387309 tattgaaggattatgattttggattgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgtagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgat 11387408  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 241  Q
    ||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |    
T  11387409 ggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagt 11387508  T
Q  242 gaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11387509 gatttcttgaatagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 11387550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 14263106 - 14263366
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  14263106 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 14263205  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    ||||||||||  | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  14263206 tacacatgtctactataatggtaaaggagtttgagttacttgaacagtttagagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtttacagttggg 14263305  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14263306 tatgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 14263366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19148598 - 19148338
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  19148598 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 19148499  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  19148498 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagatggg 19148399  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19148398 tatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 19148338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20747997 - 20747737
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  20747997 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 20747898  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  20747897 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgggtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagatggg 20747798  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20747797 tatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 20747737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 15101465 - 15101725
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| || |||||||    
T  15101465 cagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctctgagcaggaagacgt 15101564  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  15101565 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 15101664  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  15101665 tatgttgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 15101725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 269
Target Start/End: Original strand, 16071157 - 16071403
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||| |    
T  16071157 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacat 16071256  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  16071257 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttactagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 16071356  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcac 269  Q
     ||| |||| || |||| | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  16071357 tatgctgaagattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagcac 16071403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13022744 - 13022500
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  13022744 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacat 13022645  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | || |||||    
T  13022644 tacatatgtctgctttgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacaattggg 13022545  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  13022544 gatgctgaagattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagc 13022500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 12205683 - 12205921
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || || || |||||||    
T  12205683 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatatcagctatgatgg 12205782  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || ||||||||||| || |  ||||||||||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||| | ||||| |||||||| ||||| | |||    
T  12205783 ttaaagaatttgagttgcttggtcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 12205882  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     || ||||||||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  12205883 gtttttgaatagtattaaagaagcacaggaggttgatgt 12205921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 11305125 - 11305369
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  11305125 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 11305224  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  11305225 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 11305324  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11305325 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 11305369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 16949334 - 16949578
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  16949334 cagagaaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaaaccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 16949433  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || || ||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  16949434 tgcatatgtctgctctgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagggacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggg 16949533  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||  || |||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  16949534 gatgctgaggattaatagtgacttctagaatagtatctgagaagc 16949578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 26117467 - 26117711
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||| || || || |    
T  26117467 cagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggttaagccaatgttgtggctgatgctttgagcaggaaaactt 26117566  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || || || |||||  | || ||||| |||||||||| |  ||||||| | || |||||    
T  26117567 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacatttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcattccagagtatacatttggg 26117666  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  26117667 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 26117711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13666924 - 13666665
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || |||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||    
T  13666924 cagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatcctagtaaagccaacgtggttgcaaatgccttgagtaggaaaacgt 13666825  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||| ||  ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||| |||| |||||||||  ||| || ||||| ||||||||    
T  13666824 tgcatatgtctgctttgatggtaaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagctttgtctgtgaattgacacctcaaagtgttcagttggg 13666725  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| || || | | | ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  13666724 gatgctgaagattaacagttatttcttgaatagcatccgagaagcacaacaagtagatgt 13666665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 268 - 513
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgc-agatgccttgagtagaaagacg 121  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||| | || |||||     
T  268 cagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgttgttgctaaatgcgttgcgcaggaagaca 367  T
Q  122 ttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgg 221  Q
    || || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| | ||| |||  ||| |||||| | |||||||    
T  368 ttgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgacacctcagagtattcagttgg 467  T
Q  222 gcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    | ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  468 ggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 14285238 - 14285485
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||      
T  14285238 cagaggagatggttagagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacac 14285337  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||  | ||||| || ||||| ||||  || |||||| | ||||||||    
T  14285338 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagcctggtatgtgagttgtcgcctcagagtatacagttggg 14285437  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    |||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||||  ||||||||||    
T  14285438 catgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtattcgagaagcaca 14285485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12458024 - 12457783
Alignment:
Q  26 aggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttac 125  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  12458024 aggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcagaaaaacattgc 12457925  T
Q  126 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcat 225  Q
    | ||||| ||  ||||| | || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||  ||||||||| ||| |||||| |  ||||||| ||    
T  12457924 atatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaatttagagacttgagtcttgtccgtgaattgtcacctcagagtatatagttggggat 12457825  T
Q  226 gttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    | |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||  |||||||    
T  12457824 gctgaagattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 12457783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 49153688 - 49153444
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || |    
T  49153688 cagaggaggtggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgcggacgctttgagtaggaaaactt 49153589  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| || || || || || ||||| |||||  | |||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  49153588 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagttcgaattgctagaacagttcagagacatgagccttgtctgtgaatggtcaccccagagtattcagttggg 49153489  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||| | | || ||||| |||||| |||||||    
T  49153488 aatgttgaaaattgatagtaactttttgaacagtatccgagaagc 49153444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14955919 - 14955785
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  14955919 ttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 14955820  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  14955819 ttagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 14955785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 320948 - 321180
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||||    
T  320948 gattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtgaagg 321047  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 249  Q
    | || ||||| || ||| |||| |||||||| ||  | || ||| |||||| | |  |||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| ||| |||||    
T  321048 agttcgagttgctggagtagttcagagatttgagtttggtatgttaattgtcatctaagagtgtgaagttagggatgctgaagattgatagtgatttctt 321147  T
Q  250 gaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
    ||| ||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  321148 gaagagtattaaagaagcacaaaaagttgatgt 321180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 214
Target Start/End: Original strand, 15147801 - 15147960
Alignment:
Q  55 tgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaattt 154  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| | ||| ||     
T  15147801 tgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttagggagttc 15147900  T
Q  155 gagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||| | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  15147901 gagttgcttgaacagtttagtgatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15147960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8708970 - 8708836
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  8708970 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatgg 8708871  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  8708870 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 8708836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Original strand, 11771146 - 11771316
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| || |||||||    
T  11771146 ttgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagatgttgcatatgtccgctatgatgg 11771245  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | || ||| |||| || || || || ||||||||||| ||| | || || || |||| ||| |||||||||    
T  11771246 taaaagaaattgaattgcttgaacaatttagagatttgagcttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtg 11771316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Original strand, 18550663 - 18550797
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  18550663 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatgg 18550762  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  18550763 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 18550797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 23504732 - 23504886
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||     
T  23504732 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacgc 23504831  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  23504832 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttactggaacagtttagaga 23504886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Original strand, 44790256 - 44790390
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  44790256 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 44790355  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | || || || || || || || ||||||||||||    
T  44790356 tcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagat 44790390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10872360 - 10872190
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10872360 ttgaaagattatgactttgggttggattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10872261  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| |||||||||    
T  10872260 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtg 10872190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14333761 - 14333535
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  14333761 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 14333662  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  14333661 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 14333562  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  14333561 atttctgaaaagtatcaaggaagcaca 14333535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 18052815 - 18052969
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  18052815 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgctttgagtaggaagacac 18052914  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  18052915 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 18052969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8199993 - 8199893
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8199993 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8199894  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  8199893 t 8199893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 11236118 - 11236334
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  11236118 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 11236217  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||| |||    
T  11236218 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaaaattgatagtga 11236317  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||| |||| |||||||    
T  11236318 attcctgaaaagtatca 11236334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 13967530 - 13967774
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |   | || || |    
T  13967530 cagaggaggtggttagagttattgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttaacccggaaaactt 13967629  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||  ||||| | ||||||||    
T  13967630 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccttagagtatacagttggg 13967729  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  13967730 gatgctgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 13967774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 15159962 - 15160062
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  15159962 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 15160061  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  15160062 t 15160062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18179106 - 18179007
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  18179106 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 18179007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 16223 - 16389
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  16223 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatgg 16322  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagag 210  Q
    | |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||    
T  16323 ttagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagag 16389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15341818 - 15341573
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||     
T  15341818 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattattattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaatgtagttgctgatgcattgagcaggaagacgc 15341719  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| || || || |||||||| ||  | || || || ||||| ||||   | |||||| | ||||||||    
T  15341718 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtttagggacatgagtctggtatgtgagttgtcgactcagagtatacagttggg 15341619  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagca 268  Q
    |||| |||| || |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  15341618 catgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagca 15341573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Original strand, 23202519 - 23202652
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  23202519 tgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 23202618  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  23202619 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 23202652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Original strand, 23508646 - 23508779
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  23508646 tgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 23508745  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  23508746 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 23508779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13687429 - 13687329
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  13687429 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcatatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 13687330  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  13687329 t 13687329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15204983 - 15204851
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||||||    
T  15204983 tgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatggt 15204884  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
     || || || ||| | |||||  ||||||||||    
T  15204883 taaagagttggagctgctcgaatagtttagaga 15204851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12456944 - 12456845
Alignment:
Q  168 agtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12456944 agtttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaataatgatttcttgaatagtatccgagaagc 12456845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12688866 - 12688731
Alignment:
Q  44 ttgaaggatt-atgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 142  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||    
T  12688866 ttgaaggatttatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 12688767  T
Q  143 gtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    || |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  12688766 gttagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 12688731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9597437 - 9597252
Alignment:
Q  29 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || || |    
T  9597437 agatggctagaactactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcatgaagacattgcata 9597338  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    |||| ||  ||||||| |  || || || ||||| || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  9597337 tgtccgctttgatggttagagagttcgaattacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 9597252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 11552008 - 11552107
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||||||    
T  11552008 tgaaggattataactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaaaaagacattgcatatgtccgctatgatggt 11552107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14213038 - 14212886
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  14213038 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 14212939  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 197  Q
     |  || ||||||||||| || || || |||||||| ||| | ||||||||||    
T  14212938 tagagagtttgagttacttgaacaattcagagatttgagcttggtttgtgaat 14212886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14041060 - 14040921
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||| | || |||||||    
T  14041060 ttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatgg 14040961  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaag 183  Q
    | || || || |||||  | || ||||||| |||||||||    
T  14040960 taaaagagttcgagttgttggaacagtttacagatttaag 14040921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14351090 - 14350951
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| | || |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||| | || |||||||    
T  14351090 ttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacattgcatatgcccgctatgatgg 14350991  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaag 183  Q
    | || || || |||||  | || ||||||| |||||||||    
T  14350990 taaaagagttcgagttgttggaacagtttacagatttaag 14350951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15625898 - 15625744
Alignment:
Q  65 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcg 164  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || |||||||| || || || ||| | ||||    
T  15625898 ttgaattatcatccaggtaaagataatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctgctatgatggttaaagagttggagctgctcg 15625799  T
Q  165 agcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    | |||||||||||| | || || || |||||||||| ||| |||| |||| ||||    
T  15625798 aacagtttagagatctgagtctagtctgtgaattgtcacctcagattgtgaagtt 15625744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 40027 - 40142
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    |||||| |||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||   |||  |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||     
T  40027 agacagcggagatggttggaattcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccaggaaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagt 40126  T
Q  120 cgttacacatgtcggc 135  Q
    | || |||||||||||    
T  40127 ccttgcacatgtcggc 40142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 32555 - 32815
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32555 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 32654  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32655 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 32754  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32755 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 32815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 55778 - 56022
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  55778 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttcaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 55877  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  55878 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 55977  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  55978 gatgctgaaaattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagc 56022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 49392 - 49652
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  49392 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcattcgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 49491  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49492 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 49591  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49592 tatgtagaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 49652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44555 - 44319
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  44555 aaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcggaagacattgcatatgtccgctatgatggtta 44456  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
      || || ||||||||||| ||||| |||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||| ||    
T  44455 gagagttcgagttactcgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgagtt 44356  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    | |||| |||||||  ||||||||  | |||||||||    
T  44355 cctgaagagtatcaaggaagcacagaaagttgatgtc 44319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 9880 - 9781
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  9880 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctagtgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 9781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16342 - 16275
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagt 112  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16342 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagt 16275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 21679835 - 21680095
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21679835 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgt 21679934  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21679935 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 21680034  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21680035 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 21680095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22463262 - 22463003
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22463262 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 22463163  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  22463162 tgcacatgtcggccttaatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtgcagttggg 22463063  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22463062 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 22463003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20822764 - 20822505
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  20822764 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 20822665  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || | | | || ||||||||||||||    
T  20822664 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagtttagagacttaagtctagtgtgtgagttatcatctcaaagtgtgcagttggg 20822565  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20822564 tatgttgaagatcaatagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 20822505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 24619352 - 24619596
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  24619352 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgt 24619451  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24619452 tacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggg 24619551  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24619552 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24619596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 24715583 - 24715827
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  24715583 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgt 24715682  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24715683 tacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggg 24715782  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24715783 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24715827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 24748611 - 24748855
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  24748611 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgt 24748710  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24748711 tacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttgtgagttggcacctcagagtgttcagttggg 24748810  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24748811 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24748855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 28893999 - 28894258
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  28893999 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28894098  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||    
T  28894099 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28894198  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     |||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28894199 tatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgt 28894258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 28915470 - 28915729
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  28915470 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28915569  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||    
T  28915570 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28915669  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     |||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28915670 tatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgt 28915729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 28922825 - 28923084
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  28922825 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28922924  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||    
T  28922925 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28923024  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     |||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28923025 tatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttgatgt 28923084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 273
Target Start/End: Original strand, 23079146 - 23079396
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||| || || || |    
T  23079146 cagaggagatggttagagctgttgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagcaggaaaacat 23079245  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||  |||||| |  |||||||    
T  23079246 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacttcagagtatatagttggg 23079345  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 273  Q
     |||||||| || || | | | ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23079346 gatgttgaagattaacagtaatttcttgaatagtatctgagaagctcaaca 23079396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20775036 - 20774811
Alignment:
Q  57 attttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttga 156  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  20775036 attttggcttgaactaccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcga 20774937  T
Q  157 gttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagt 256  Q
    ||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||    
T  20774936 gttgcttgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgggtagt 20774837  T
Q  257 atcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20774836 atcagagaagcacaacaagttgatgt 20774811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 14886048 - 14886292
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  14886048 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 14886147  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  14886148 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 14886247  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14886248 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 14886292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 22234977 - 22235236
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  22234977 cagaggagatggttggagctgttgaaggactatgaatttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 22235076  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  22235077 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtattcagttggg 22235176  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||| | || || || | ||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||| |||||    
T  22235177 gatgctaaagattaacagtgatttcttgaataatatccgagaagcgcagcaggtagatgt 22235236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 24797454 - 24797698
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |    
T  24797454 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggtagctgatgctttgagtaggaagactt 24797553  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  24797554 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 24797653  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  |||  || |||||||| |||||| |||||||    
T  24797654 aatgttgaaaattgatagggatttcttgaacagtatccgagaagc 24797698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 28930738 - 28930946
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  28930738 cagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 28930837  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||| ||||||||    
T  28930838 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtacagttggg 28930937  T
Q  223 catgttgaa 231  Q
     ||||||||    
T  28930938 tatgttgaa 28930946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 21563051 - 21563277
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  || |||||||    
T  21563051 ttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtatgctatgatgg 21563150  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||  | || || |||||||| ||||  ||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  21563151 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctgagtctcgtttgtgagttgtcgccttagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 21563250  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||    
T  21563251 gttcttgaacagtatcaaagaagcaca 21563277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 283
Target Start/End: Original strand, 21889933 - 21890076
Alignment:
Q  140 atggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaata 239  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| || || ||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  21889933 atggtaaaggagtttgagttgctagagaagtttagagacttgagtcttgtttatgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagatcaata 21890032  T
Q  240 atgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21890033 gtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 21890076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 37542438 - 37542682
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| || || |    
T  37542438 cagaggaggtggttagagttattgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgacgctttaagtaggaaaactt 37542537  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||| |||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  37542538 tgcacgtgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 37542637  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||| | | ||||| || |||||| |||||||    
T  37542638 aatgttgaaaattgatagtaacttcttaaacagtatccgagaagc 37542682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23472536 - 23472400
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23472536 ttgaaggattatgattttgggttaaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 23472437  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || || ||||| || || ||||||||||||||    
T  23472436 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagattt 23472400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25849386 - 25849142
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  25849386 cagaggagatggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactt 25849287  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| |||||||| || || ||  |||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | ||||||||    
T  25849286 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgctagaatagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggg 25849187  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| | || ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  25849186 gatgctaaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 25849142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 27667568 - 27667794
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27667568 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27667667  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  27667668 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 27667767  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    |||  |||| || |||| |||||||||    
T  27667768 atttctgaaaagcatcaaagaagcaca 27667794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16357810 - 16357710
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16357810 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16357711  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  16357710 t 16357710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27519714 - 27519614
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27519714 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27519615  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  27519614 t 27519614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34567802 - 34567702
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  34567802 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 34567703  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  34567702 t 34567702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40710088 - 40709988
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  40710088 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 40709989  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  40709988 t 40709988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22503984 - 22503746
Alignment:
Q  29 agatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacaca 128  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || || |    
T  22503984 agatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcata 22503885  T
Q  129 tgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgtt 228  Q
    |||| ||  | ||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||| || || || || ||||| |||| ||| |||||| | |||||||| ||| |    
T  22503884 tgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttggggatgct 22503785  T
Q  229 gaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| ||  ||| | | |||||||| |||||| |||||||    
T  22503784 gaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 22503746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23575036 - 23574810
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | || || ||||| || ||||||||    
T  23575036 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaggcattgcatatgtccgctatgatggt 23574937  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 244  Q
     |  || || || || || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  23574936 tagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 23574837  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcacaa 271  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  23574836 ttcctgaagagtatcaaagaagcacaa 23574810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41772147 - 41772050
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  41772147 aaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 41772050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27611662 - 27611562
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27611662 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27611563  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  27611562 t 27611562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19771265 - 19771134
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  19771265 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtca 19771166  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  19771165 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 19771134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23441518 - 23441279
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  23441518 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 23441419  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || || ||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  23441418 ttagagagttcgaattacttgaacagtttagagatttgagtttagtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaagtgggaatgctgaagattgatagtga 23441319  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    |||  |||| ||||| | ||| |||||| | |||||||||    
T  23441318 atttatgaagagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtc 23441279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Original strand, 21872128 - 21872226
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  21872128 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatg 21872226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Original strand, 21876408 - 21876506
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||||||    
T  21876408 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatg 21876506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 22331965 - 22332191
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  22331965 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 22332064  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  22332065 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 22332164  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  22332165 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 22332191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25427735 - 25427605
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  25427735 gattatgattttgagttgagctatcatccgtgtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 25427636  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || ||||| || || ||||| ||| ||||    
T  25427635 agttcgagttgcttgaacagttcagaaattt 25427605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20343590 - 20343349
Alignment:
Q  26 aggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttac 125  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |    
T  20343590 aggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagcaggaaaactttgc 20343491  T
Q  126 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcat 225  Q
    ||||||| ||  ||||| |||| |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| | |||||||| | | |||||| | |||||||| ||    
T  20343490 acatgtctgctttgatgatgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctatgaattgtcatctcagagtatacagttggggat 20343391  T
Q  226 gttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    | |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||  |||||||    
T  20343390 gctgaagattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 20343349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 14998817 - 14998917
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  14998817 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 14998916  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  14998917 t 14998917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22135976 - 22135876
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  22135976 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 22135877  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  22135876 t 22135876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 27684478 - 27684578
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  27684478 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 27684577  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  27684578 t 27684578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 29475151 - 29475251
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  29475151 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 29475250  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  29475251 t 29475251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 26737805 - 26737992
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  26737805 ttgaaagactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 26737904  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 231  Q
    | || || || |||||  | ||||||||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  26737905 taaaagagttcgagttgttggagcagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaa 26737992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21497228 - 21497150
Alignment:
Q  48 aggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 126  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  21497228 aggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttaca 21497150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Original strand, 37290574 - 37290708
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  37290574 ttgaaggattacgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 37290673  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | |  ||||| || || || || ||||||||||||    
T  37290674 tcagagaattcgaattgcttgaacagtttagagat 37290708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 17268391 - 17268545
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || ||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  17268391 cagaggagatggcttgagctgttaaaatattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacac 17268490  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| | || ||||| || || || || |||||||||||    
T  17268491 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagtttagaga 17268545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21882256 - 21882018
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||  | ||||| || ||||||||    
T  21882256 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctatgatggt 21882157  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 244  Q
     |  || |||||||| || || ||||||| |||| | ||||| |||||||| | || ||| ||||||||| |  || | ||| |||| ||  ||| ||||    
T  21882156 tagagagtttgagttgcttgaacagtttacagatatgagcctagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgtgaatgctgaagattgatagtgaa 21882057  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  21882056 tttctgaagagtatcaaagaagcacagaaagttgatgtc 21882018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 105
Target Start/End: Original strand, 20467176 - 20467237
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgc 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  20467176 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgc 20467237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 252
Target Start/End: Original strand, 21830878 - 21831047
Alignment:
Q  83 aaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaa 182  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  || |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||  | |    
T  21830878 aaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtttgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctga 21830977  T
Q  183 gccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaa 252  Q
    | || |||||||| ||||  ||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  21830978 gtctcgtttgtgagttgtcgcctaagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaa 21831047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18777103 - 18776951
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  18777103 tgaaagattatgattttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggt 18777004  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 197  Q
     |  || || |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  18777003 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaat 18776951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 144
Target Start/End: Original strand, 21338384 - 21338475
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| || |||| | | || ||||| || ||||||||    
T  21338384 tatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagcaggaagatgctgcatatgtcagctatgatggt 21338475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 100
Target Start/End: Original strand, 846 - 923
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgca 100  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  846 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgca 923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21408443 - 21408230
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  21408443 aaggattatgaattcggattgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatactttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggtta 21408344  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
    | || || ||||| || || ||||| ||||| || ||  | ||||||||| |||  || |||||| |  | ||||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  21408343 aagagttggagttgcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgcagagtctaaaattgggaatgtttaatatcaacattgaatt 21408244  T
Q  247 cttgaatagtatca 260  Q
     || ||||||||||    
T  21408243 ttttaatagtatca 21408230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 13971223 - 13971483
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13971223 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgactttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtaggaagacgt 13971322  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13971323 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 13971422  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  13971423 tatgttaaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcaaataagcgcaacaggttgatgtc 13971483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14087699 - 14087439
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  14087699 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttaaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacat 14087600  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  14087599 tacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgagaagttggg 14087500  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14087499 tatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 14087439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 10419148 - 10419408
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  10419148 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 10419247  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| || || || || || |||||||| | | | || ||||||||||||||    
T  10419248 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttggg 10419347  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  10419348 tatgttgaagatcaatagtgacttcttgaatagtatcagagaagcacaacgagttgatgtc 10419408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 12359630 - 12359889
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12359630 cagagaagatggatagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagattccttgagtagaaagacgt 12359729  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||  ||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  12359730 tgcatatgtctgctttgatggtgaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 12359829  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  12359830 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtagatgt 12359889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17187400 - 17187164
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |    
T  17187400 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttagtttgaactatcacccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcat 17187301  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || |||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| || || || |||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  17187300 tgcatatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtctggtttgtgaattaacacctcagagtgtgcagttggg 17187201  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatc 259  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||| |||||||    
T  17187200 tatgttgaaaattaacagtgatttcttgagtagtatc 17187164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14574925 - 14574689
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  14574925 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaa 14574826  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  14574825 atgaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgcgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 14574726  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  14574725 cttgagtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 14574689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17493656 - 17493396
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  17493656 cagagaagatggttaaagctgttgaaggattatgattttggtttgagttaccatccgggtaaagccaacgtggttgcagatgccttgaggaggaagacgt 17493557  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || ||||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || || | ||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  17493556 tgcatatgtctgctatgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcgtgtctgtgaattgacacctcagagtgtacatttggg 17493457  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  17493456 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 17493396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 31694289 - 31694536
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||     
T  31694289 cagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaacatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgc 31694388  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| || | |||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  31694389 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgaaccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 31694488  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  31694489 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattcgagaagcaca 31694536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31939929 - 31939682
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||     
T  31939929 cagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgctttgagtaggaaaacgc 31939830  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |  |||||||  |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  31939829 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagtttagagactcgagccttgcctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 31939730  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  31939729 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattcgagaagcaca 31939682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47124970 - 47124726
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  47124970 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 47124871  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  47124870 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 47124771  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  47124770 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 47124726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 13319605 - 13319864
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||||| |    
T  13319605 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcgaatgcgttgagcaggaagacct 13319704  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| || || || ||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||| | |||| |||    
T  13319705 tacatatgtctgcactgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttaaagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcaaagtattcagtcggg 13319804  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     |||||||| || || | ||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||    
T  13319805 gatgttgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgtgaagctcagcaggtagatgt 13319864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 16827327 - 16827566
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  16827327 ttgaaggattatgattttagtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtgtttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 16827426  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || || || |||||||| || || ||| | ||||| |||| ||| ||| |||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  16827427 taaaagagtttgagttgctagaccattttagagacttgagtcttatctgtgagttgtcacctcagggtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 16827526  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16827527 tttcttgaacagtatcagagaagcacatcaagttgatgtc 16827566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 276
Target Start/End: Original strand, 16337615 - 16337868
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  16337615 cagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccgatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 16337714  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||||||||| || ||  | || ||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  16337715 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttagaacagtttagagacttgagtctggtatgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 16337814  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggt 276  Q
     |||||||  ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  16337815 aatgttgaggattgatagtgatttcttgaacagtatcagagaagctcagcaggt 16337868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 11960272 - 11960516
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  11960272 cagaggagattgttagaactactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctagtaaggccaatgtggttgctgatgcattgaggaggaaaacat 11960371  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  11960372 tgcatatgtctgctttgatggtaaaggaatttgagttgctagagcagtttagggacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 11960471  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||  ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11960472 gatgatgaggattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 11960516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 16835613 - 16835873
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |    
T  16835613 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtagttgcggatgcgttgagcagaaagactt 16835712  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  | ||||| |  |||||||| || || || |||||||||||  | || ||||| ||||| |||  |||  ||||||| ||||||||    
T  16835713 tgcacatgtctgcattaatggtaagagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtcttgtgtgtgagttgacaccgaagagtgttcagttggg 16835812  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  16835813 tatgttgaaaattaacagtgatttcttgagtagtatccgagaagcacagcaggtggatgtc 16835873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15228654 - 15228416
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  15228654 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatag 15228555  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||| | | || |||||| | ||||| |||||||| ||||| | |||    
T  15228554 ttaaagattttgagttgcttgagcaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 15228455  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  15228454 gttcttgaatagtattaaagaagcacagaaggttgatgt 15228416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15234522 - 15234284
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  15234522 ttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatag 15234423  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||| | | || |||||| | ||||| |||||||| ||||| | |||    
T  15234422 ttaaagattttgagttgcttgagcaatttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtga 15234323  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||    
T  15234322 gttcttgaatagtattaaagaagcacagaaggttgatgt 15234284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 283
Target Start/End: Original strand, 14580053 - 14580316
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    |||||||| |||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14580053 agacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaaga 14580152  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 219  Q
      ||||||||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||| ||  | || |||||| ||| | | ||||||||  || |    
T  14580153 atttacacatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtctgtgaaatgtcatctcagagtgttaagct 14580252  T
Q  220 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     || |||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||  | |||||||||    
T  14580253 aggaatgttgaagattgataatgaatttttgaaaagtattaaggaagcacagaaagttgatgtc 14580316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 15347383 - 15347550
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| ||||||||||| |    
T  15347383 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaaattgcatatgtccgccatgatggtca 15347482  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
      || || |||||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  15347483 gagagttcgagttacttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15347550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12179364 - 12179234
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  12179364 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccagccgggcaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaaacgt 12179265  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatt 153  Q
    | || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  12179264 tgcatatgtctgctatgatggtgaaagaatt 12179234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 267
Target Start/End: Original strand, 18133453 - 18133693
Alignment:
Q  27 ggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttaca 126  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||| || ||||| ||    
T  18133453 ggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcatgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcatataccttaagtaggaaaacgttgca 18133552  T
Q  127 catgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatg 226  Q
     ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||  | |||| ||||||||| || ||||| || |||||||||  ||| || ||||| |||||||  |||    
T  18133553 tatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttagagccgtttagagacttgagcctcgtctgtgaattgacacctcatagtgttcagttggcgatg 18133652  T
Q  227 ttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     | || || || | ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  18133653 ctaaagattaacagtgatttcttgaataatatccgagaagc 18133693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 16491317 - 16491452
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  16491317 tgaaggattatgattttgggttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgaagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 16491416  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  16491417 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 16491452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 5424065 - 5424291
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  5424065 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 5424164  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| |  ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  5424165 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 5424264  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  5424265 atttctgaaaagtatcaaggaagcaca 5424291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44778273 - 44778119
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  44778273 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacac 44778174  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  44778173 tgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagaga 44778119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6601728 - 6601631
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  6601728 aaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 6601631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 267
Target Start/End: Original strand, 16328766 - 16329007
Alignment:
Q  26 aggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttac 125  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||    
T  16328766 aggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacattac 16328865  T
Q  126 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcat 225  Q
    | ||||| ||  | ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||| ||| | | |||||| | |||||||| ||    
T  16328866 atatgtctgctttaatggtaaaagaatttgagttgttggaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcatctcagagtatacagttggggat 16328965  T
Q  226 gttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
      |||| ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  16328966 aatgaagattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 16329007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 15588527 - 15588627
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  15588527 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 15588626  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  15588627 t 15588627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16636768 - 16636668
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16636768 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16636669  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  16636668 t 16636668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 20061189 - 20061289
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  20061189 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 20061288  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  20061289 t 20061289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 43164092 - 43163992
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  43164092 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 43163993  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  43163992 t 43163992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 48426442 - 48426342
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  48426442 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 48426343  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  48426342 t 48426342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 53384156 - 53384323
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  53384156 aaggattatgactttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgttattgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtca 53384255  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
      || ||||||||||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  53384256 gagagtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 53384323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17490839 - 17490693
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||     
T  17490839 gattatgattttgagttgagctatcatcctggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagt 17490740  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaa 196  Q
    | || ||||| || || ||||| |||||||| ||| | |||||||||    
T  17490739 agttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagcttagtttgtgaa 17490693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41178548 - 41178394
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  41178548 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacac 41178449  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  41178448 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 41178394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10006595 - 10006495
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10006595 ttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10006496  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  10006495 t 10006495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10907205 - 10907105
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10907205 ttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10907106  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  10907105 t 10907105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 270
Target Start/End: Original strand, 11302991 - 11303123
Alignment:
Q  138 tgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaa 237  Q
    |||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||    
T  11302991 tgatggtgaaagaatttgatctgctagagcagtttagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaa 11303090  T
Q  238 taatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     | ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11303091 cagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 11303123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13253685 - 13253585
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  13253685 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 13253586  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  13253585 t 13253585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15260625 - 15260489
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||||||    
T  15260625 ttgaaagattatgattttgagttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtccgctatgatgg 15260526  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  15260525 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagattt 15260489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 15401652 - 15401878
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15401652 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15401751  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  15401752 tcagagagttcgaatttcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 15401851  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  15401852 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 15401878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15340264 - 15340038
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15340264 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgctgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15340165  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  15340164 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 15340065  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  15340064 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 15340038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Original strand, 14125730 - 14125899
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  14125730 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 14125829  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |  || || || ||||| || | |||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  14125830 tagagagttcgaattacttgaaccgtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 14125899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 15724069 - 15724169
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15724069 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 15724168  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  15724169 t 15724169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13943050 - 13942896
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||      
T  13943050 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagacac 13942951  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| | || ||||| || || || || |||||||||||    
T  13942950 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagtttagaga 13942896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12499245 - 12499109
Alignment:
Q  42 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  12499245 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaacgtcgttgcagatggcttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgat 12499146  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    ||| |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  12499145 ggttagagagttcgatttacttgaacagtttagagat 12499109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 280
Target Start/End: Original strand, 14875635 - 14875870
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||  | ||||| ||    
T  14875635 tgaaagattatgactttgatttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccactatgatagt 14875734  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 244  Q
     |  || || ||||| || ||  ||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||| ||||    
T  14875735 tagagagttcgagttgcttgaatagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaa 14875834  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgat 280  Q
    || ||||| ||||| | ||| |||||| | ||||||    
T  14875835 tttttgaaaagtattaaagaggcacaaaaagttgat 14875870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16693159 - 16693026
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||| ||||||    
T  16693159 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgccttgatgg 16693060  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | |  || || |||||||| || ||||| |||||    
T  16693059 ttagagagttcgagttacttgaacagttcagaga 16693026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 16411418 - 16411517
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  16411418 tgaaagattacgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 16411517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 144
Target Start/End: Original strand, 16755757 - 16755820
Alignment:
Q  81 gtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||    
T  16755757 gtaaagcgaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 16755820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Original strand, 16806083 - 16806252
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  16806083 tgaaagattatgactttgctttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 16806182  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |  || || |||||||| || ||||| || ||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  16806183 tagagagttcgagttacttgaacagttcagggatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 16806252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 16380031 - 16380185
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||      
T  16380031 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagcaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacac 16380130  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| || || || |||||||||||    
T  16380131 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtttagaga 16380185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24439 - 24179
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  24439 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagacgt 24340  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24339 tacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 24240  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24239 tatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 24179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20277 - 20017
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  20277 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttacagatgctttgagcaggaagacgt 20178  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20177 tacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttgcgaattgtcaccccagagtgtgcagttggg 20078  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20077 tatgctgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacaggttgatgtc 20017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 42 - 283
Target Start/End: Original strand, 20060918 - 20061159
Alignment:
Q  42 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20060918 tattaaaggattatgattttggcttgaactaccattcgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgat 20061017  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 241  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  20061018 ggtgaaggaatttgagttgcttgagcattttagagatttgagccttgtttgtgatttgttaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagt 20061117  T
Q  242 gaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20061118 gaattcttgaatagtatcagagaagcgcaacagattgatgtc 20061159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19855717 - 19855458
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  19855717 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 19855618  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  19855617 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttactagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 19855518  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  19855517 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgt 19855458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 19662084 - 19662331
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  19662084 cagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacat 19662183  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  19662184 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacaccccagagtgtacagttggg 19662283  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19662284 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 19662331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 20855707 - 20855966
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20855707 cagaggagatggcttgagttattaaatgattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 20855806  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| | ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||| | | || ||||||||||||||    
T  20855807 tgcacatgtcggccttaatggtaaaggagttttaattgctcgaacagtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcaaagtgtgcagttggg 20855906  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20855907 tatgctgaagatcaatagtgatttcttggatagtatcagagaagcgcaacaagttgatgt 20855966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 23197193 - 23197440
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  23197193 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacgt 23197292  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  23197293 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 23197392  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  23197393 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgtgaagcaca 23197440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 20939010 - 20939269
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||    
T  20939010 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaatgt 20939109  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||  |  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  20939110 tgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttatagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacaattggg 20939209  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  20939210 gatgctgaaaattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgt 20939269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 272
Target Start/End: Original strand, 20834847 - 20835096
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  20834847 cagaggagatggttggagttgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 20834946  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||   ||| |||||||| ||||||||    
T  20834947 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattaacacctcagagtgttcagttggg 20835046  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 272  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20835047 gatgctgaagattaataatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 20835096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 24098550 - 24098794
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  24098550 cagagaagatggttagatcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 24098649  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  24098650 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 24098749  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24098750 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24098794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 31538944 - 31539188
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  31538944 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 31539043  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||| |||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  31539044 tgcacgtgtcagctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 31539143  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  31539144 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 31539188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16373921 - 16373707
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  16373921 ttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatgg 16373822  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | ||||| || ||||| || || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  16373821 ttaaggagttcgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtga 16373722  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    ||||||||| |||||    
T  16373721 attcttgaaaagtat 16373707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21952321 - 21952113
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  21952321 cagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 21952222  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| || |||||||| |||||| ||| | | |||||| | ||||||||    
T  21952221 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaactgtcatctcagagtatacagttggg 21952122  T
Q  223 catgttgaa 231  Q
     ||| ||||    
T  21952121 gatgctgaa 21952113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21750322 - 21750093
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || |    
T  21750322 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagt 21750223  T
Q  153 ttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaa 252  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| ||  | || |||||| ||| | |  |||||||| |||| || ||| |||| ||  ||||||||||  ||||    
T  21750222 tcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtatgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagttagggatgctgaagattgataatgaatttctgaa 21750123  T
Q  253 tagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  21750122 gagtattaaagaagcacaaaaagttgatgt 21750093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 151
Target Start/End: Original strand, 21744499 - 21744627
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21744499 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgagtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagtaggaagacgt 21744598  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaa 151  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||||    
T  21744599 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggaa 21744627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 431085 - 431220
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  431085 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 431184  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  431185 aaaagaattcgagttgcttgaacagttcagagattt 431220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 51332461 - 51332687
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  51332461 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgattaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 51332560  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || || || || || || |||||||||||| | ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  51332561 tcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 51332660  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  51332661 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 51332687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20295824 - 20295580
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |    
T  20295824 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaggccaatgtagttgctgatgctttgagcaggaaaactt 20295725  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||| ||| |||||||| ||  | ||  |||||||||| || ||  | || |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  20295724 tgcacatgtctgctttgatggcgaaagaatttgaattgttagaatagtttagagacttgagtttggtctgtgaattgtcacctcagagtattcagttggg 20295625  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| ||  ||| | | |||||||| |||||| |||||||    
T  20295624 gatgctgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 20295580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Original strand, 41352636 - 41352800
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |  |    
T  41352636 gattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagag 41352735  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | ||||||||||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  41352736 agtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 41352800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 16349564 - 16349664
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16349564 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16349663  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  16349664 t 16349664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 33390000 - 33390167
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  33390000 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 33390099  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
      || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  33390100 gagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 33390167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21838341 - 21838241
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  21838341 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 21838242  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  21838241 t 21838241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22110413 - 22110277
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||||    
T  22110413 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtcctctatgatgg 22110314  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || |||||||| || ||  |||||||||||||    
T  22110313 taaaagagtttgagttgcttgaatagtttagagattt 22110277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22114262 - 22114126
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||||    
T  22114262 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtcctctatgatgg 22114163  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || |||||||| || ||  |||||||||||||    
T  22114162 taaaagagtttgagttgcttgaatagtttagagattt 22114126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19107759 - 19107625
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||    
T  19107759 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgtatatgtccgctatgatgg 19107660  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  19107659 ttagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 19107625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21831694 - 21831468
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  21831694 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 21831595  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  21831594 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 21831495  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  21831494 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 21831468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Original strand, 16077630 - 16077794
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||| |  |    
T  16077630 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccttgaggaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagag 16077729  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  16077730 agtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 16077794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 19759841 - 19760067
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  19759841 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggaaaagctaatgttgttgcagatgcgttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 19759940  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    |  | ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||  | || |||||| ||| ||| ||||||||| |||| |  ||| |||| ||  ||| |||    
T  19759941 tctaagaattggagctgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttagaaatgctgaagattgatagtga 19760040  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    |||  |||||||||| | |||||||||    
T  19760041 atttatgaatagtataaaagaagcaca 19760067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21025564 - 21025394
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  21025564 ttgaaagattatgaatttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatggtgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 21025465  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  21025464 ttagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 21025394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 197
Target Start/End: Original strand, 21234675 - 21234852
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    |||||| | |||||| ||||| |  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  21234675 agacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaaga 21234774  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 197  Q
    |||| || ||||| ||  ||||||| |  || || |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  21234775 cgttgcatatgtccgctttgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaat 21234852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 282
Target Start/End: Original strand, 22361213 - 22361450
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || || ||||||||    
T  22361213 tgaaggactatgattttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatatctgctatgatggt 22361312  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 244  Q
     ||  | || ||||| || || ||||| |||||||| ||  | ||||||||| ||| | |  | |||||| || | || ||| |||| ||  ||||||||    
T  22361313 aaaatagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaaatgtcatcttaaagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaa 22361412  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
    || ||||| ||||| | ||||||| || | ||||||||    
T  22361413 tttttgaagagtattaaagaagcataaaaagttgatgt 22361450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 123
Target Start/End: Original strand, 24793585 - 24793664
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  24793585 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaaaacgtt 24793664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 120
Target Start/End: Original strand, 17043983 - 17044059
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 120  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  17043983 ttgaaggattacgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttgagcaggaagac 17044059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Original strand, 23099455 - 23099693
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23099455 tgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggt 23099554  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 244  Q
     |||||||||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||     
T  23099555 aaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttgtgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtgat 23099654  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23099655 ttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttgatgtc 23099693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 283
Target Start/End: Original strand, 27209590 - 27209847
Alignment:
Q  26 aggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttac 125  Q
    ||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  27209590 aggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagtcgcagatgcgttgagtagaaagacattgc 27209689  T
Q  126 acatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcat 225  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||| || || |||||  |||||||||| || || || || |||||||| | | | || |||||||||||||| ||    
T  27209690 acatgtccgccttgatggtaaaggaattcgaattgctcgaatagtttagagacttgagtctcgtatgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtat 27209789  T
Q  226 gttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27209790 gctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 27209847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23277804 - 23277560
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23277804 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 23277705  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || ||||||||  | ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  23277704 tgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatctgctatagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 23277605  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||  |||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23277604 gattctgaagattaacagtgacttcttgaatagtatccgagaagc 23277560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24949618 - 24949371
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  24949618 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 24949519  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||  |||||||| ||||||||    
T  24949518 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacttcagagtgttcagttggg 24949419  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     ||| |||| || |  | ||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  24949418 gatgctgaagattatcagtgatttcttagatagtatccgagaagcaca 24949371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1064779 - 1064535
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  1064779 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 1064680  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  1064679 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 1064580  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||  |||||||    
T  1064579 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 1064535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23111743 - 23111517
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23111743 ttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagccaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 23111644  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || ||| |||| || ||  ||||||||||| | || ||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  23111643 taaaagagttttagttgcttgaagagtttagagatctgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagattgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 23111544  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  23111543 attcttgaacagtattaaagaagcaca 23111517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20829287 - 20829043
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  20829287 cagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtgaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 20829188  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  20829187 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 20829088  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  20829087 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 20829043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31831686 - 31831450
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  31831686 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 31831587  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  31831586 tacacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 31831487  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatc 259  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||    
T  31831486 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatc 31831450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23294963 - 23294719
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| || |||||||    
T  23294963 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatttggtggcagatgcgttgagcaggaagacgt 23294864  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  |  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| |  |||||||    
T  23294863 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgatttgttatagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtattaagttggg 23294764  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23294763 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 23294719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 19651465 - 19651709
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||     
T  19651465 cagaggagatggttagagctgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcctaggaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaacgc 19651564  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||    |||||||| ||||| || || ||  ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||    
T  19651565 tgcatatgtctgcttcaatggtgaaagaattcgatttgctatagcagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcaattggg 19651664  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19651665 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 19651709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24711041 - 24710803
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  24711041 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 24710942  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  24710941 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 24710842  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  24710841 atttctgaaaagtatcaaggaagcacaaaaagttgatgt 24710803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16923896 - 16923796
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16923896 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16923797  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  16923796 t 16923796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16926367 - 16926267
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16926367 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16926268  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  16926267 t 16926267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16983159 - 16983059
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16983159 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16983060  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  16983059 t 16983059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17000007 - 16999907
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17000007 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 16999908  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  16999907 t 16999907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17064724 - 17064624
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17064724 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 17064625  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  17064624 t 17064624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 22324292 - 22324392
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22324292 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 22324391  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  22324392 t 22324392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 27219023 - 27218923
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27219023 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27218924  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  27218923 t 27218923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24676489 - 24676326
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  ||    
T  24676489 attatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagaga 24676390  T
Q  151 atttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     || |||||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  24676389 gttcgagttacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 24676326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12575381 - 12575227
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  12575381 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacac 12575282  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  12575281 tgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 12575227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23067391 - 23067262
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  23067391 gattatgattttgagttga-ctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 23067293  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  23067292 agttcgagttgcttgaacagttcagagattt 23067262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27372276 - 27372142
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27372276 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 27372177  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  27372176 tcagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 27372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 44385005 - 44385105
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  44385005 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 44385104  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  44385105 t 44385105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 23107167 - 23107302
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  23107167 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgcgtaaagctaatgttgttacagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 23107266  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || || || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  23107267 aaaagagttcgagttacttgaacagttcagagattt 23107302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27788768 - 27788615
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  27788768 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagtaggaagacac 27788669  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  27788668 t-catatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 27788615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Original strand, 21144478 - 21144611
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21144478 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 21144577  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  21144578 cagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 21144611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10869857 - 10869757
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  10869857 ttgaaggattatgactttggtctgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 10869758  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  10869757 t 10869757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 41607821 - 41607921
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  41607821 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 41607920  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  41607921 t 41607921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 24876186 - 24876285
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  24876186 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 24876285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24263377 - 24263279
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatg 142  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||    
T  24263377 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatg 24263279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45533349 - 45533113
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||| | ||||| || |||||||| |    
T  45533349 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattaaatatgtctgctatgatggtta 45533250  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa-t 245  Q
      || || ||||| || ||  |||| ||||| || ||  | ||||||||| |||  || ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| || ||| |    
T  45533249 gagagttggagttgcttgaatagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagatcaacaacgaatt 45533150  T
Q  246 tcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
    | ||| ||||||||| ||| || ||| |||| |||||    
T  45533149 ttttggatagtatcaaagaggctcaaaaggtggatgt 45533113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 178
Target Start/End: Original strand, 21324711 - 21324836
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |  || |    
T  21324711 tatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgttgttgtagacgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggttagagagt 21324810  T
Q  153 ttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | |||||||| || ||||||||||||    
T  21324811 tcgagttacttgaacagtttagagat 21324836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 24706916 - 24707088
Alignment:
Q  42 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||  |||| || |||||  |||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||    
T  24706916 tattgaaagattatgactttggtttgaattattatccaagtaaggctaatgtttttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgcattgat 24707015  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    ||| |  || || |||||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  24707016 ggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagcttggtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 24707088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 283
Target Start/End: Original strand, 27364713 - 27364754
Alignment:
Q  242 gaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27364713 gaattcttgaatagtatcaaagaagcgcaacaggttgatgtc 27364754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1311 - 1051
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||  | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  1311 cagaggagatgacttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtagaaagacat 1212  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  1211 tgcacatgtcggccatgatggtgaaggaattcgaattgcttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtgcagttggg 1112  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1111 tatattgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 68798 - 68540
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  68798 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 68699  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  68698 tgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaatttcttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcagagtgtacagttggg 68599  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatg 281  Q
     ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  68598 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatg 68540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 272
Target Start/End: Original strand, 3831 - 4080
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3831 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccacccgggtaaagctaatgtggttgcagatgccttgagtagcaagacgt 3930  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||    
T  3931 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagcattttagagacttgagtcttgtttgtgaattgacaccttagagtgtacagttggg 4030  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 272  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4031 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 4080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 12786 - 13039
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  12786 cagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 12885  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || |||||  |  ||||||||||| ||||||| || || || | ||||||       || ||||| ||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  12886 tgcatatgtctcctttgatggtgaagcaatttgaattgctagaactgtttag-------agtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 12978  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  12979 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatacgagaagcacaacaagtggatgtc 13039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 2208 - 2468
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |    
T  2208 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcat 2307  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || || || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  2308 tgcatatgtcggcgttgatggtgaaagaatttgagttgcttgagcagttcagagacttgagtctggtttgtgaattgacacctcagagtgtgcagttggg 2407  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  2408 tatgttgaaaattaacagtgaattcttgagtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 2468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 430 - 690
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  430 cagaggagatgcttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 529  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  530 tgcacatgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 629  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  630 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgggaagcacaacaagtggatgtc 690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13464 - 13239
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || | ||| |||||||||||    
T  13464 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtcaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcataagtctgccatgatggt 13365  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 244  Q
     ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||| | || |||||| ||| | |  |||||||| || | || ||| |||| ||  ||||||||    
T  13364 aaaggagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagcttagtgtgtgaaatgtcatctgagagtgtgaagctaggaatgctgaagattgataatgaa 13265  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    ||  |||| ||||| | |||||||||    
T  13264 tttctgaagagtattaaagaagcaca 13239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 7426 - 7291
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7426 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggt 7327  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7326 aaatgagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 7291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 20984865 - 20985125
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20984865 cagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgt 20984964  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  20984965 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctatagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttggg 20985064  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  20985065 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacagaaagttgatgtc 20985125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21841859 - 21841620
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  21841859 ttgaaggattatgatttctgtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttaaacatgtctgctatgatgg 21841760  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  21841759 taaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttaagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 21841660  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21841659 tttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 21841620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19852853 - 19852630
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  19852853 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 19852754  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||| |||    
T  19852753 taaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagtga 19852654  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  19852653 tttcttgaatagtatcagagaagc 19852630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19858889 - 19858666
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  19858889 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 19858790  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||| |||    
T  19858789 taaaggagtttgagttgcttgagcagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagtga 19858690  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  19858689 tttcttgaatagtatcagagaagc 19858666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23656366 - 23656130
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  23656366 aaggattatgattttggtttgaattactatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaa 23656267  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
    | |||||||| || || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||| | |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  23656266 aagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtatacagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 23656167  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  23656166 cttgagtagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 23656130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22372375 - 22372150
Alignment:
Q  42 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    |||||||||| ||||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  22372375 tattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgat 22372276  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 241  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||  | || |||||||||   |||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  22372275 ggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctgagtcttgtttgtttgttgtcatctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagt 22372176  T
Q  242 gaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    || ||||| || ||||||||||||||    
T  22372175 gatttcttaaacagtatcagagaagc 22372150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 20974974 - 20975228
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  20974974 cagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 20975073  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || |||||     || ||||||| |||||  | || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  20975074 tgcatatgtc-----tgctggtgaaagaattccattttctagaacagtttagagagttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 20975168  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| || || | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  20975169 gatgctgaagattaaaagtgatttcttgaatagtataagagaagcaaaacaagtggatgt 20975228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14566605 - 14566361
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  14566605 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 14566506  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  14566505 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 14566406  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  14566405 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 14566361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Original strand, 20395471 - 20395685
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |  |||||||    
T  20395471 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtcagttatgatgg 20395570  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || || ||| | ||||| |||||||||||  | ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  20395571 ttaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtga 20395670  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    ||| |||||||||||    
T  20395671 atttttgaatagtat 20395685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 31415789 - 31416036
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| |    
T  31415789 cagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccattctggtaaagccaatgtggttgctgacgcgttgagcaggaagacat 31415888  T
Q  123 tacacatgtcggcca---tgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    | || ||||| ||     ||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || || |||||  |||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  31415889 tgcatatgtctgctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagggacttgagtcttgtcagtgagttgacacctcagagtgtgcagtt 31415988  T
Q  220 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31415989 ggggatgctgaagattaatagtgaattcttgaatagtatccgagaagc 31416036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 29302744 - 29302988
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || || || || |    
T  29302744 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaggctaatgtggttgcagatgcgttaagcaggaaaacat 29302843  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||| | | ||||||    
T  29302844 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacggttggg 29302943  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| ||  ||| ||| ||||| || |||||| |||||||    
T  29302944 gatgctgaagattgatagtgatttcttaaacagtatccgagaagc 29302988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19979408 - 19979170
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||||||    
T  19979408 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtataaagacattgcatatgtccgctatgatggt 19979309  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 244  Q
     |  || |||||||| || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||||||  ||| ||||    
T  19979308 tagagagtttgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaaaattgatagtgaa 19979209  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  19979208 tttttgaagagtatcaaagaagcacagaaagttgatgtc 19979170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 267
Target Start/End: Original strand, 22376791 - 22377016
Alignment:
Q  42 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||||    
T  22376791 tattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatgat 22376890  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 241  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||| | ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| || || | ||| | || ||  ||| |    
T  22376891 ggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgctaaagattgatagt 22376990  T
Q  242 gaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22376991 gaattcttgaacagtatcaaagaagc 22377016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 267
Target Start/End: Original strand, 22382966 - 22383191
Alignment:
Q  42 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| || |||||    
T  22382966 tattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcatatgtccgctatgat 22383065  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 241  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||| | ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| || || | ||| | || ||  ||| |    
T  22383066 ggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgctaaagattgatagt 22383165  T
Q  242 gaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22383166 gaattcttgaacagtatcaaagaagc 22383191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6605121 - 6604877
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  6605121 cagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 6605022  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || || |||||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  6605021 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagttcgagttgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 6604922  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  6604921 aatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 6604877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 21324587 - 21324794
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  21324587 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgt 21324686  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||  |||| | | |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |||||||    
T  21324687 tgcatgtgtctg-cttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgtttagttggg 21324785  T
Q  223 catgttgaa 231  Q
     ||| ||||    
T  21324786 gatgctgaa 21324794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 20009260 - 20009482
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  20009260 ttgaaggactgtgattttggtttgaattatcaccccggtaaa-ctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 20009358  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || || ||||| ||||| || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||| |||    
T  20009359 taaaagagtttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattgggtatgttgaagattaatagtga 20009458  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||| | ||||| ||||||    
T  20009459 tttcttgaacaatatcatagaagc 20009482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20389541 - 20389317
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  20389541 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 20389442  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || ||| | || || || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||  || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| | |||    
T  20389441 ttaaagagttttatttgcttgaacagtttagggacttgagcctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtga 20389342  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagca 268  Q
     |||||||| | ||||| |||||||    
T  20389341 gttcttgaacaatatcaaagaagca 20389317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 150
Target Start/End: Original strand, 21921082 - 21921181
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||    
T  21921082 attatgattttgagttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacttttcacatgtctgccatgatggtaaagga 21921181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6680547 - 6680330
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||  |||||||||| |    
T  6680547 gattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaag 6680448  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 249  Q
    | || |||||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||    
T  6680447 agttcgagttgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttctt 6680348  T
Q  250 gaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  6680347 gaacagtatccgagaagc 6680330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 16270542 - 16270786
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  16270542 cagaggagatggttagagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 16270641  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||| || || ||||| |||||| ||| ||| |||||| | ||||||||    
T  16270642 tgcacatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtatacagttggg 16270741  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| ||  ||| | | |||||||| |||||| |||||||    
T  16270742 gatgctgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 16270786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Original strand, 19483409 - 19483573
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |  |    
T  19483409 gattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagag 19483508  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | ||||||||||| || |||||  ||||| | ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  19483509 agtttgagttacttgaacagttccgagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 19483573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23651477 - 23651313
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| | ||    
T  23651477 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttaggg 23651378  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | || |||||  | || |||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  23651377 agttcgagttgttggaacagtttagagatttgagcttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 23651313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21252385 - 21252250
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21252385 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21252286  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21252285 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 21252250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 31570160 - 31570314
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  31570160 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacac 31570259  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  31570260 ttcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagaga 31570314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Original strand, 17673362 - 17673496
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  17673362 ttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 17673461  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    | |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  17673462 tcagagagttcgaattacttgaacagtttagagat 17673496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 20017602 - 20017828
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  20017602 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 20017701  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  20017702 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 20017801  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  20017802 atttctgaaaagtatcaaggaagcaca 20017828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Original strand, 21165878 - 21166116
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  21165878 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 21165977  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 244  Q
     |  || || ||||| || || |||||||||||| | ||| | || ||||| | || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  21165978 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtgtgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 21166077  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  21166078 tttctgaagagtatcaaagaagcacataaagttgatgtc 21166116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23886466 - 23886252
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||||||     
T  23886466 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatcctggtaaaactaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacacatgtccgccatgatga 23886367  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || || ||| | || || || ||||||||||| ||  | || |||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| |||    
T  23886366 tcaaagagttggagctgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 23886267  T
Q  244 attcttgaatagtat 258  Q
    |||  ||||||||||    
T  23886266 atttctgaatagtat 23886252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12306221 - 12305977
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  | || || |    
T  12306221 cagaggagatggttatagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagctgtaaaacat 12306122  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || ||||| |||||  | || ||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  12306121 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 12306022  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||| ||  ||| | | |||||||| |||||| |||||||    
T  12306021 gatgttgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 12305977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19114132 - 19114032
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  19114132 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 19114033  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  19114032 t 19114032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 132
Target Start/End: Original strand, 22247772 - 22247860
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtc 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  22247772 ttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtc 22247860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 267
Target Start/End: Original strand, 803064 - 803235
Alignment:
Q  96 ttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
    |||| ||||| |||||||| || || || |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||    
T  803064 ttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtga 803163  T
Q  196 attgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  803164 attgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 803235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 21393205 - 21393340
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21393205 tgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21393304  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21393305 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 21393340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 21787699 - 21787834
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21787699 tgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21787798  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  21787799 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 21787834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22041301 - 22041131
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  22041301 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagccaatgttgttgcggatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatgg 22041202  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | |  || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  22041201 ttagagagtttgagttacttgaacagttcagtgatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 22041131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21043886 - 21043753
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21043886 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctctgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 21043787  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    ||| || || ||||| || || ||||| ||||||    
T  21043786 gaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagat 21043753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18858019 - 18857919
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  18858019 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatgg 18857920  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  18857919 t 18857919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22052334 - 22052066
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||    
T  22052334 acatgagacagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcag 22052235  T
Q  115 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |||||  | || ||||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||| ||||  || || ||  |     
T  22052234 gaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtcgcctcaaagcata 22052135  T
Q  215 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  22052134 tagttgggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 22052066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 197
Target Start/End: Original strand, 30312484 - 30312636
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  30312484 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 30312583  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 197  Q
     |  || || |||||||| || ||||| |||||||| ||  | ||||||||||    
T  30312584 tagagagttcgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaat 30312636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 27355999 - 27355924
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttg 98  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27355999 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttg 27355924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1267674 - 1267544
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | || || || || |||||| | || |    
T  1267674 gattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagtcaatgtggttgcagatgcgttgaggaggaagacactgcatatatctgctatgatgataaaag 1267575  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  1267574 aatttgatttgctagagcagtttagagattt 1267544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15534849 - 15534689
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    |||||| | |||||| ||||| |  |||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  15534849 agacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatgatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaaga 15534750  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || |||||||| ||  ||||||| |  || || |||||||| || || |||||||||||    
T  15534749 cattgcacatgtccgctttgatggttagagagttcgagttacttgaacaatttagagattt 15534689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32601586 - 32601433
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  32601586 ttgaaggattacgactttggtttgaatcatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatgg 32601487  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaat 197  Q
    | |  || || |||||||| || || || |||||||| ||  | ||||||||||    
T  32601486 ttatagagttcgagttacttgaacaattcagagatttgagtttggtttgtgaat 32601433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19869159 - 19869044
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    |||||| |||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||   |||  |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||     
T  19869159 agacagcggagatggttggagttcttaaaggactatgattttgaactgagttatcatccagggaaggccaatgtagtagctgatgccttgagtaggaagt 19869060  T
Q  120 cgttacacatgtcggc 135  Q
    | || |||||||||||    
T  19869059 ccttgcacatgtcggc 19869044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Original strand, 16407495 - 16407623
Alignment:
Q  155 gagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaata 254  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | ||| | |||||||||| || | | ||||||||| |  |||| ||| |||| || |||| ||||||  |||| |    
T  16407495 gagttaattgagcagtttagagatatgagcttggtttgtgaatggtcatctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattaatagtgaatttctgaaga 16407594  T
Q  255 gtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| | |||||||||| | |||||||||    
T  16407595 gtattaaagaagcacaaaaagttgatgtc 16407623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 27901783 - 27901525
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  27901783 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 27901684  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||||||| ||| || |||||  |||||||    
T  27901683 tgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattacttgaacagtttagagacttgagtctcgtttgtgaattgtcacctcaaagtgtaaagttggg 27901584  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatg 281  Q
     ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27901583 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtataagagaagcacaacaagttgatg 27901525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 15002239 - 15002499
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15002239 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 15002338  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  15002339 tgcacatgtcggctatgatggtaaaagagtttgagttgctatagcagtttagagactttagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 15002438  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15002439 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagatgatgtc 15002499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 15357995 - 15358242
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15357995 cagagaagatggtgagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacgt 15358094  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| |  ||||| ||||||| || || ||||| |||||||||  ||| || ||||| ||||| ||    
T  15358095 tgcatatgtctgctatgatggtaaaggaatttgatttaatatagcagcttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcatagtgtacagttagg 15358194  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15358195 gatgctgaagattaatagtgacttcttgaatagtatccgagaagcaca 15358242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 280
Target Start/End: Original strand, 15413922 - 15414158
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15413922 ttgaaagactatgattttggtttgaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatgg 15414021  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || ||||||||||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  15414022 ttaaagaatttgagttgctggagcattttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagtga 15414121  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgat 280  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||    
T  15414122 gttcttgaatagtattaaagaagcacagaaggttgat 15414158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 29452412 - 29452656
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  29452412 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 29452511  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  29452512 tgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 29452611  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  29452612 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 29452656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 3263669 - 3263913
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |    
T  3263669 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactt 3263768  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  3263769 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 3263868  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3263869 aatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 3263913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 33224320 - 33224076
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  33224320 cagagaaggtggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacat 33224221  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || |||||||| || || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  33224220 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagggacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 33224121  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||  || |||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  33224120 gatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtacccgagaagc 33224076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16149107 - 16148873
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||    
T  16149107 agaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacatt 16149008  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 223  Q
     || ||||| ||| ||||||| || ||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||     
T  16149007 gcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttgggg 16148908  T
Q  224 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||    
T  16148907 atgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 16148873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16153253 - 16153019
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||    
T  16153253 agaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatacgttgagcaggaagacatt 16153154  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 223  Q
     || ||||| ||| ||||||| || ||||| || ||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||     
T  16153153 gcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttgggg 16153054  T
Q  224 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtat 258  Q
    ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||    
T  16153053 atgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 16153019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15247297 - 15247061
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  15247297 aaggattatgactttggtttgaattaccattcgggtaaagctaatgtggttgcagatgttttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaa 15247198  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| | ||| |||  ||  |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  15247197 aagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgacacttcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgattt 15247098  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  15247097 cttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 15247061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15320512 - 15320317
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||    
T  15320512 ttgaaggattatgattttggtatgaattatcacccaggtaaagctaatgtgattgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatgg 15320413  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaata 239  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || || |||| ||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  15320412 taaaggattttgagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttatgagttgtcacctcagagtgtgtagttgggtatgttgaagatcaata 15320317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 267
Target Start/End: Original strand, 11206107 - 11206350
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  11206107 agaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaaaacttt 11206206  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 223  Q
     |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| | ||||||||     
T  11206207 gcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttgggg 11206306  T
Q  224 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||||||| ||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  11206307 atgttgaagattgatagtgatttcttgaacagtatctgagaagc 11206350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15078918 - 15078785
Alignment:
Q  137 atgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatca 236  Q
    |||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15078918 atgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatca 15078819  T
Q  237 ataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15078818 atagtgaattcttgaatagtatcagggaagcaca 15078785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8707296 - 8707088
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  8707296 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 8707197  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || |||||||| || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || || |||||| ||||||| ||| |||| ||||| | |||    
T  8707196 ttagagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcatagtgtgaagttgggtatgctgaagatcaacagtga 8707097  T
Q  244 attcttgaa 252  Q
     ||||||||    
T  8707096 gttcttgaa 8707088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 42 - 214
Target Start/End: Original strand, 16354079 - 16354251
Alignment:
Q  42 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  16354079 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgat 16354178  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    ||| |  || || ||||||||  |||||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||    
T  16354179 ggttagagagttcgagttacttaagcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtg 16354251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14695489 - 14695266
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| || ||||||     
T  14695489 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagaagttgcatatgtccgctatgatgt 14695390  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| ||  |  | ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| | || ||  ||| |||    
T  14695389 taaaagagtttgagttgcttaaaaaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtga 14695290  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  14695289 attcttgaacagtatcaaagaagc 14695266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15071737 - 15071602
Alignment:
Q  42 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    |||||||||| ||||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  15071737 tattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgat 15071638  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||    
T  15071637 ggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagaga 15071602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Original strand, 15146521 - 15146672
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  15146521 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 15146620  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  15146621 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 15146672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 282
Target Start/End: Original strand, 1648153 - 1648411
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||   ||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  1648153 agaggagatggttagagctgttgaaagactatgactttggtttgaattaccaccctaataaggctaatgttgtggcggatgcgttgagtaggaagacatt 1648252  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 223  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||| ||||||| |||||  | |||||||| |||| ||| || ||| |  | || ||     
T  1648253 gcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagcttagagacttaagtttagtttgtgagttgtcacctcaaagtattaaatttggg 1648352  T
Q  224 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
    ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  1648353 atgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcaacaggtggatgt 1648411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8387788 - 8387688
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8387788 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8387689  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  8387688 t 8387688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12477976 - 12477876
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  12477976 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 12477877  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  12477876 t 12477876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18298581 - 18298481
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  18298581 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 18298482  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  18298481 t 18298481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 19777429 - 19777529
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  19777429 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 19777528  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  19777529 t 19777529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 29038040 - 29038140
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  29038040 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 29038139  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  29038140 t 29038140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23957120 - 23956953
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |    
T  23957120 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggtca 23957021  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
      || || || || || || |||||||||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  23957020 gagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 23956953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 8052259 - 8052485
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  8052259 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatgg 8052358  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  8052359 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 8052458  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    |||  |||| |||||||  ||||||||    
T  8052459 atttctgaaaagtatcaaggaagcaca 8052485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 51605667 - 51605821
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||      
T  51605667 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgcggatgcgttgagtaggaagacac 51605766  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| |||| |||||||| ||| | || |||||||||||    
T  51605767 tccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagaga 51605821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14160867 - 14160710
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| |    
T  14160867 cagagaagatggcttgagttactgaaggattttgattttggcttgaattatcatccgggtaaagcgaatgtcgtagctgatgccttaagtagaaagacct 14160768  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| ||||| || || ||  | |||||||||||    
T  14160767 tgcatatgtccgctatgatggttaaggagtttgaattgctagaataatttagagattt 14160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20892379 - 20892171
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  20892379 cagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 20892280  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  | || ||||||||||| || || || || |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  20892279 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtctggtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 20892180  T
Q  223 catgttgaa 231  Q
     ||| ||||    
T  20892179 gatgctgaa 20892171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 267
Target Start/End: Original strand, 44660733 - 44660985
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |     
T  44660733 acatgagacagaggaggtggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgttgttgctgatgctttgagcaa 44660832  T
Q  115 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     || || || || ||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| |     
T  44660833 gaaaactttgcatatgtctgctttaatggtaaaggaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtata 44660932  T
Q  215 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||||||| |||||||||||  |||  || |||||||| |||||| |||||||    
T  44660933 cagttgggaatgttgaaaattgatagcgacttcttgaacagtatccgagaagc 44660985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27712709 - 27712578
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |    
T  27712709 aaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtca 27712610  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
      || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  27712609 gagagttcgagttacttgaacagttcagagat 27712578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12525051 - 12524918
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || ||||||||    
T  12525051 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatggt 12524952  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
     |  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  12524951 tagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 12524918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 178
Target Start/End: Original strand, 14850011 - 14850136
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| || || |    
T  14850011 tatgattttgggtttaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgctttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctgtgatggtaaaagagt 14850110  T
Q  153 ttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    ||||||| || |||||||||||||||    
T  14850111 ttgagttgcttgagcagtttagagat 14850136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 14681943 - 14681867
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 120  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14681943 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 14681867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40474415 - 40474282
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  40474415 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 40474316  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
     || || || || || || || ||||||||||||    
T  40474315 caaagagttcgaattgcttgaacagtttagagat 40474282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 14302614 - 14302830
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || |||||||    
T  14302614 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagatattgcatatgtccgctatgatgg 14302713  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  14302714 tcagagagttcgaatttcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggtatgctgaagattgatagtga 14302813  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||| |||| |||||||    
T  14302814 attcctgaaaagtatca 14302830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Original strand, 18614436 - 18614596
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    |||||| | |||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  18614436 agacagcgaagatggatagaactgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagcatgaaga 18614535  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || ||||| ||  ||||||| |  || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  18614536 cattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacaattcagagattt 18614596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 18226082 - 18226269
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  ||||||    
T  18226082 ttgaaagattatgactatggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtcagctttgatgg 18226181  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 231  Q
    | |   | ||||||||||| || | ||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  18226182 ttagaaagtttgagttacttgaacggttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaattgggaatgctgaa 18226269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11200 - 10974
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  11200 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg 11101  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||    
T  11100 taaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagattaatagtga 11001  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  11000 tttcttgaatagtatcagagaagcaca 10974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5858 - 5598
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  5858 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagaaggaagacgt 5759  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  5758 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 5659  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5658 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaaaaagttgatgtc 5598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 111 - 370
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  111 cagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaaataccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacat 210  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  211 tgcacatgtcggccttgatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttaagtctcgtgtgtgaattgtcatctcagagtgtgcagttggg 310  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  311 tatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgt 370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 324132 - 323882
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  324132 cagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgt 324033  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  | ||||||||  ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  324032 tgcacatgtctgctttaatggtgaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 323933  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 273  Q
     ||| |||| || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  323932 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaagagtatccgagaagcacaaca 323882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Original strand, 202367 - 202575
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||    
T  202367 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagcaaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatgg 202466  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || || || |||||||| || || || |||||||| ||||  || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  202467 ttaaagagtttgagttgcttgaacattttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 202566  T
Q  244 attcttgaa 252  Q
     ||||||||    
T  202567 gttcttgaa 202575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 118633 - 118477
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| |  ||||||     
T  118633 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgttatgatga 118534  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgt 200  Q
    | || || || ||| | ||||| ||||||||||| || ||  || ||||||||||||    
T  118533 tcaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacttgagttttatttgtgaattgt 118477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 1732 - 1992
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1732 cagaggagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagcaaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgt 1831  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| ||||||||  |||||||    
T  1832 tgcacatgtctactatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtaaagttggg 1931  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1932 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaacaatatcagagaagcacaacaagttgatgtc 1992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29485 - 29225
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  29485 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 29386  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||| || |  ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  29385 tgcacatgtctgctatgatggtaaagaagtttgagttgctagagcagtttagagagttgattcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 29286  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||| || |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  29285 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaataatatcagagaagcacagcaagttgatgtc 29225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30346 - 30216
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  30346 gattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgtttttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtctgctatgatggtaaagg 30247  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || |||||  | || ||||| ||||||||    
T  30246 agttcgagttggttgaacagttcagagattt 30216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 50238 - 50168
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgt 93  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  50238 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgt 50168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28645 - 28385
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||      
T  28645 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacac 28546  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || || |  ||  ||||||||||  ||||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  28545 tgcatatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 28446  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  28445 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 28385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34898 - 34638
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||      
T  34898 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacac 34799  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || || |  ||  ||||||||||  ||||||| || || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  34798 tgcatatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 34699  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  34698 gatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 34638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 159
Target Start/End: Original strand, 95 - 172
Alignment:
Q  82 taaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagtt 159  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||  || |||||||| ||||| ||||||||    
T  95 taaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacatgtttgctatgatggtaaaggagtttgagtt 172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 47912 - 48172
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  47912 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggtcgcagatgctttgagcaggaagacgt 48011  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| ||||||||  |||||||    
T  48012 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgttagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtatagttggg 48111  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||    
T  48112 tatgttgaaaatcaatagtgatttcttgaacattatcagagaagcacagcaagttgatgtc 48172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 56725 - 56984
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |  ||||||     
T  56725 cagaggagatggttagagctgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaagaagacgc 56824  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || ||||||||  |||||  ||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  56825 tgcacatgtctgctatgatggtataggaacatgatttgctagaacagtttagagagttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 56924  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  56925 aatgctgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcaacaagtggatgt 56984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27931 - 27708
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||    
T  27931 ttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagcaggaagacgtttcacatgtctgctatgatgg 27832  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||| |||| || || |||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  27831 taaaagagtttgagctacttgaacaatttagagacttcagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtga 27732  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  27731 tttcttgaacagtatcagagaagc 27708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 46277 - 46524
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  46277 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcacatgccttgagtaggaaaacgt 46376  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||| || | |||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  46377 tgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgatccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 46476  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  46477 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 46524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 41211 - 41455
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  41211 cagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaacgt 41310  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  41311 tgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttggg 41410  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  41411 aatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 41455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3314 - 3098
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||    
T  3314 attatgattgtgggttgaattattatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgcattgatggtaaaaga 3215  T
Q  151 atttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttg 250  Q
     |||||||| || || || ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | || ||  ||| |||||||||     
T  3214 gtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtgaattctta 3115  T
Q  251 aatagtatcagagaagc 267  Q
    |||||||||| ||||||    
T  3114 aatagtatcaaagaagc 3098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 270
Target Start/End: Original strand, 24755 - 25001
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24755 agagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcagaaagacgtt 24854  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 223  Q
     || ||||  ||  |||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||  |||  ||||||| ||||||||     
T  24855 gcatatgtttgctttgatggtgaaagaattcgatttgctagagcagtttagagatttgtgtcttgtctgtgaattgacacctgagagtgtacagttgggg 24954  T
Q  224 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24955 atgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 25001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13628 - 13379
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  13628 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 13529  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || | ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  |||  ||||||| ||||||||    
T  13528 tgcacatgtctgctacgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacaccttagagtgtacagttggg 13429  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 272  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13428 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 13379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5204 - 4944
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||    
T  5204 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaagaagacgt 5105  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||| |    
T  5104 tgcacatttctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctggagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtacagttgag 5005  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5004 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 4944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 48508 - 48272
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  48508 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaa 48409  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  48408 aggattttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 48309  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48308 cttgagtagtatcagagaagcacatcaggttgatgtc 48272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 89323 - 89583
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  89323 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 89422  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||||||    
T  89423 tgcatatgtctgctatgatggtaaacgaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttggg 89522  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  89523 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 89583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 90001 - 90261
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  90001 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 90100  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||||||    
T  90101 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagagtgtacagttggg 90200  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  90201 tatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 90261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41102 - 40879
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  41102 aaggattatgattttggttttgattatcatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaa 41003  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||| ||| ||    
T  41002 aagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgattt 40903  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  40902 cttgaatagtatccgagaagcaca 40879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15540 - 15290
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||    
T  15540 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatctgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagaggt 15441  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  15440 tgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggg 15341  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaaca 273  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15340 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaaca 15290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 149997 - 149749
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  149997 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagc-aatgtggttgcagatgcgttgagcaggaagacat 149899  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |  | ||||| ||  |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  149898 tgaatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 149799  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaac 272  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  149798 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaac 149749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 194582 - 194841
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||    
T  194582 cagaggagatggttggaggtgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttattgatgccttgagtaggaagacgt 194681  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| | || || |||||||| ||||||  ||| | |||||| ||||||||    
T  194682 tgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagtagtttagatacttgagtcttgtttgcgaattgacacctctgagtgtacagttggg 194781  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  194782 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtattcgagaagcacaacaagtggatgt 194841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 180
Target Start/End: Original strand, 25439 - 25568
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||    
T  25439 attatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccctaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaaga 25538  T
Q  151 atttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     |||||||| || || ||||||||||||||    
T  25539 gtttgagttgcttgaacagtttagagattt 25568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6154 - 5918
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||  |  |||||||| |    
T  6154 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtttgttatgatggtaa 6055  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| | ||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||| ||| ||    
T  6054 aggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctatgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgattt 5955  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5954 cttgaatagtatccgagaagcacaacaagttgatgtc 5918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 44211 - 43967
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |    
T  44211 cagagaagatggttagagcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctaatgcgttgagtaggaagacat 44112  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  44111 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacattttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 44012  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44011 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 43967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 50753 - 51013
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || || ||||    
T  50753 cagagaagatggcttgaactgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaaaacgt 50852  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||     
T  50853 tgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtacagttggc 50952  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  50953 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattagagaagcacatcaagttgatgtc 51013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 146
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||    
T  385 ttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatatggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 286  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | ||||| |||| ||| || ||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| |||    
T  285 taaaggagtttgtgttgcttgaatagttcagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtga 186  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  185 tttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 429 - 182
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  429 cagaggagatggttagagctgttgaaggattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggtagcagatgcgttgagcaggaagacgt 330  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||| ||    
T  329 tgcatatgtctgctatgatggttaaagaattcgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagtttgg 230  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  229 gatgttgaaaattaatagtgatttcctgaatagtatccgagaagcaca 182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1273 - 1037
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | |||||||| |    
T  1273 aaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtctactatgatggtaa 1174  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
    |||| |||||||| || ||  |||  ||||| || || ||||||||||| ||||  ||  ||||||| || ||||| |||||||| || |||| ||| ||    
T  1173 aggagtttgagtttctagaatagtaaagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcgccttagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagtgattt 1074  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1073 cttgaatagtatcagagaagcacaacaagttgatgtc 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 10935 - 11179
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10935 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 11034  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || | |||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  11035 tgcacatgtctgctacgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 11134  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  11135 aatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtattcgagaagc 11179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 14705 - 14949
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14705 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagacgt 14804  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || | |||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  14805 tgcacatgtctgctaagatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 14904  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  14905 aatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtattcgagaagc 14949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21411 - 21151
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||  ||| |||||||| || ||  || ||||  |||| |  | |||||    
T  21411 cagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatttggggaaagccaacgtggtgtcaaatgcgatgagcaagaggacgt 21312  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||  |||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  21311 tgcatatgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgctagagccatttagagaattgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 21212  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  21211 aatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 21151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 42345 - 42101
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  42345 cagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 42246  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  42245 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtatacagttggg 42146  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42145 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 42101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 250041 - 249797
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  250041 cagagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaaaacat 249942  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||| |    
T  249941 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttgcg 249842  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  249841 gatgctgaagattaataatgatttcttgaatagcatccgagaagc 249797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3016 - 2769
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||| || |||| ||    
T  3016 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagccaatatggttgcagatgcgctgagcaggaagatgt 2917  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||| |||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  2916 tgcatatgtctgctatgatggtgaaagaattcgatttgctagagtagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagttggg 2817  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2816 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 2769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 5988 - 6206
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgta--gttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  5988 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtacggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgat 6087  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 241  Q
    ||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  6088 ggtaaaggagttggagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagt 6187  T
Q  242 gaattcttgaatagtatca 260  Q
    || |||||||| |||||||    
T  6188 gatttcttgaacagtatca 6206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Original strand, 2225 - 2492
Alignment:
Q  15 acatcagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2225 acatgagacagaggagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgcgtag 2324  T
Q  115 aaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     || ||||| || |||||  | |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| ||||||||     
T  2325 gaaaacgttgcatatgtctactatgatggtaaaagaattcgatttgctagagcaatttagagacttgagtcttgtgtgtgagttgacacctcagagtgtt 2424  T
Q  215 cagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
    |||||||| ||| |||| || || | ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  2425 cagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaacagtatccgagaagcgcaacaagtagatgt 2492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8488 - 8244
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  8488 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgcagatgtcttgaataggaagacgt 8389  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || |||||  |  | |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  8388 tgcatatgtctactttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagagtgttcagttggg 8289  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  8288 gatgctgaagattaacagtgacttcttgaatagtattcgagaagc 8244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 268
Target Start/End: Original strand, 6116 - 6361
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||    
T  6116 cagagaagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaatgt 6215  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| |||||| | ||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| | |||||| ||||||||    
T  6216 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattttatttgttagagcagtttagagacttaagccttgtatgtgaattgacacctctgagtgtacagttggg 6315  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagca 268  Q
     ||| |||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  6316 gatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagca 6361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32839 - 32579
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |  |||| || || ||||    
T  32839 cagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcggatactctgagcaggaaaacgt 32740  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||||| || | || |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  32739 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagcgcggtttagagatttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtgtacagttggg 32640  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||    
T  32639 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccaagaagcgcaacaagtggatgtc 32579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 566 - 824
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  566 cagaggagatggctagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatc-gggtaaagcaaatgtggttgcagatgccataagtaggaagacgt 664  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||| ||| ||||||||    
T  665 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagactgtacagttggg 764  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     ||| |||| || |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  765 gatgatgaagattaat-gtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20822 - 20578
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| |    
T  20822 cagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacat 20723  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  20722 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttaagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 20623  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||  || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20622 gatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 20578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23642 - 23398
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| |    
T  23642 cagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgatgatgcgttgagcaggaagacat 23543  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  23542 tacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttaagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggg 23443  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||  || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23442 gatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 23398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28052 - 27793
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||  |||| |||| |||||    
T  28052 cagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgtggttgtagatgctctgagcagaa-gacgt 27954  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |  | ||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| || || |||||||| || |||| |||  ||||||| ||||||||    
T  27953 tggatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttaaagacttgagtcttgtttgcgagttgtcaccttagagtgtacagttggg 27854  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
     |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  27853 tatgttgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 27793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 51058 - 51317
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  51058 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagacct 51157  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  51158 tacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 51257  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||||||| ||| |||| ||| ||| |||||| |||| | ||||||||||| || |||||    
T  51258 gatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaacaagtggatgt 51317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 60092 - 60351
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  60092 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagacct 60191  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  60192 tacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 60291  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||||||| ||| |||| ||| ||| |||||| |||| | ||||||||||| || |||||    
T  60292 gatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaacaagtggatgt 60351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 66480 - 66739
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||| |||||| | ||| ||||| ||||  || ||||| |    
T  66480 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatgtggctgcggatgcgttgatcaggaagacct 66579  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  66580 tacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 66679  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||||||| ||| |||| ||| ||| |||||| |||| | ||||||||||| || |||||    
T  66680 gatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaacaagtggatgt 66739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 100440 - 100684
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  100440 cagaggagatggttagagctattgaaggactacaattttggtttgaattaccatcatggtaaagccaatgtggttgcagatgcattgagcaggaagacat 100539  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||  |||  ||||| | || |||||    
T  100540 tgcatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgatttgctagagcagttcagagatttgagtcttgtctgtgaattgacaccttagagtattcaattggg 100639  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  100640 gatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 100684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 181555 - 181436
Alignment:
Q  95 gttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  181555 gttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgcttgaacagttgagagatttgagcttagtttgtg 181456  T
Q  195 aattgttaccccagagtgtg 214  Q
    ||| || | | |||||||||    
T  181455 aatggtcatctcagagtgtg 181436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 2363 - 2610
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  2363 cagagaagatggctagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtgaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 2462  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| || | |||  ||||||| ||||||||    
T  2463 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttctcaccttagagtgtacagttggg 2562  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     |||||||| || |||  | | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2563 tatgttgaagattaattgtaatttcttgaatagtatccgagaagcaca 2610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Original strand, 851 - 1098
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||| || || || ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||    
T  851 cagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccattcggttaaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgt 950  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||| ||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  951 tgcacaagtctgctatgatggtaaatgactttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgaaacctcagagtgtacagttggg 1050  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1051 tatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3580 - 3346
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  3580 aaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctattatggtaa 3481  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
    |||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||| |||  |||||||  ||||||| ||| |||| || |||| ||| ||    
T  3480 aggagtttgagttgctagagcattttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctaagagtgtatagttgggtatgctgaagattaatagtgattt 3381  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatg 281  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  3380 cttgaacagtatcagagaagcacagcaagttgatg 3346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16632 - 16448
Alignment:
Q  99 cagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaatt 198  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||| || || ||||| ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  16632 cagatgccttgagtagaaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggaattggaattgctcgaacagtttagagacttgagtctcgtgtgtgaatt 16533  T
Q  199 gttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    || | | || |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16532 gtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtctcagagaagcacaacaagttgatgtc 16448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 283
Target Start/End: Original strand, 6264 - 6468
Alignment:
Q  79 gggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||     
T  6264 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagac 6363  T
Q  179 ttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttg 278  Q
    || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6364 ttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagttg 6463  T
Q  279 atgtc 283  Q
    |||||    
T  6464 atgtc 6468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 283
Target Start/End: Original strand, 10695 - 10899
Alignment:
Q  79 gggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||     
T  10695 gggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagac 10794  T
Q  179 ttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttg 278  Q
    || || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10795 ttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagttg 10894  T
Q  279 atgtc 283  Q
    |||||    
T  10895 atgtc 10899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 13177 - 13436
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||     
T  13177 cagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaaaacgc 13276  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||  ||  | |||||||| ||||| || || || || || |||||||| || |||||||| |||||||||  |||  ||||||| ||||||||    
T  13277 tgcatatgtttgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacaatttagagacttgagccttgtctgtgaattgacaccttagagtgttcagttggg 13376  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||| ||||||| || | | | ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  13377 gatgctgaaaattaaaagtaatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgt 13436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 9707 - 9945
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||  |||| || |||||||    
T  9707 ttgaaggattgtgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatttgtcagctatgatgg 9806  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || ||||||||||| || |||||||||| ||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  9807 ttaaagaatttgagttgcttgagcagtttaaagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtga 9906  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  9907 gttcttggatagtattagagaagcacagaaggttgatgt 9945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12119 - 11902
Alignment:
Q  65 ttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcg 164  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |  ||||||| || |||||||| || || |    
T  12119 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagaccttacatatgtctacgttgatggtaaaagaatttgatttgctag 12020  T
Q  165 agcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagaga 264  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  12019 aacagtttagtgacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgttgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccgaga 11920  T
Q  265 agcacaacaggttgatgt 282  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  11919 agcgcaacaagtggatgt 11902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 10335 - 10579
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||     
T  10335 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgc 10434  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |  ||||||| |||||  | || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||| ||| || |||||    
T  10435 tgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagattgttcaattggg 10534  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  10535 gatgctgaagattaatagtgatttcttaaatagtatccgagaagc 10579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 20549 - 20793
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||     
T  20549 cagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttacagatgccttgagtaggaaaacgc 20648  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |  ||||||| |||||  | || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||  ||| |||| ||| || |||||    
T  20649 tgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagattgttcaattggg 20748  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  20749 gatgctgaagattaatagtgatttcttaaatagtatccgagaagc 20793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20548 - 20289
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  20548 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacat 20449  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  20448 tgcatatgtctgcgttgatggtgaaggaattcgatttactagaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgaattgacacctcagagtattcagttggg 20349  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  20348 gatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatccgagaagcgcaacaagtggatgt 20289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Original strand, 58093 - 58146
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgca 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||    
T  58093 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgca 58146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 270
Target Start/End: Original strand, 1 - 187
Alignment:
Q  84 aagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaag 183  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||  | |     
T  1 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacgtgac 100  T
Q  184 ccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  101 tctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacaatatcagagaagcaca 187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 16876 - 17114
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || |||||||    
T  16876 ttgaaagattatgattttgagttgaattatcaaccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgg 16975  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | || |||||| ||| ||| ||||||||| |||| || ||| |||| ||  |||||||    
T  16976 tcaaggaatttgagttacttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgataatga 17075  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
    ||||||||| | ||| | |||||| ||| | ||||||||    
T  17076 attcttgaacaatattaaagaagcgcaaaaagttgatgt 17114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 260
Target Start/End: Original strand, 18114 - 18330
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  18114 ttgaaggattgtgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 18213  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| | || ||  ||| |||    
T  18214 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctaaagattgatagtga 18313  T
Q  244 attcttgaatagtatca 260  Q
    |||||||||||||||||    
T  18314 attcttgaatagtatca 18330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 4330 - 4574
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  4330 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacct 4429  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| || |||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||    
T  4430 tacatatgtctgcattgatggtaaaagaatttgatttactagaatagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagttggg 4529  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| ||| ||| |||| ||| |||||||||| |||  |||||||    
T  4530 gatgctgagaattaatagtgatttcttgaataatattcgagaagc 4574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4177 - 3932
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||| |||    
T  4177 cagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcatgaaggcgt 4078  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| || |||||||| || |||||  | || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| ||||  || ||||||||    
T  4077 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaattcaatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcaga--gtacagttggg 3980  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
     ||| |||| || |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  3979 aatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccaagaagcaca 3932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 237
Target Start/End: Original strand, 43012 - 43199
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| |  |||||||| || |    
T  43012 gattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgttatgatggttaaag 43111  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaa 237  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||| || ||  | ||||||||| | | ||| || |||||| | ||||| |||||||| |||||    
T  43112 agttggagtttcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtatcaccacaaagtgtgaaattgggaatgttgaagatcaa 43199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 755 - 516
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaaga 119  Q
    ||||||||||||||  | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  755 agacagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaaga 656  T
Q  120 cgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    | ||||| ||||| ||  ||||||| || |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||    
T  655 ccttacatatgtctgcgttgatggtaaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctcagagtatacagtt 556  T
Q  220 gggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatc 259  Q
    ||| ||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  555 ggggatgctgagaattaatagtgatttcttgaatagtatc 516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 283
Target Start/End: Original strand, 79391 - 79632
Alignment:
Q  42 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  79391 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagaaagacattgcatatgtccgccatgat 79490  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 241  Q
    ||| |  || || |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| |  | || |||||||| ||  ||| |    
T  79491 ggttagagagttcgagttacttgagcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaaactaggaatgttgaagattgatagt 79590  T
Q  242 gaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    |||||  |||| ||||| | ||| |||||| | |||||||||    
T  79591 gaatttctgaagagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtc 79632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 7023 - 7267
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  7023 cagaggagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 7122  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | ||||| |  ||||| || || || || |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  7123 tgcatatgtctgctttaatggtaagagaattggatttgctagaacagtttagagacctgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 7222  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     |||||||| || || | | | || |||||||||||| |||||||    
T  7223 gatgttgaagattaacagtaattttttgaatagtatccgagaagc 7267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Original strand, 12405 - 12613
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     
T  12405 cagaggagatggttagaactgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttgagtaggaagacgc 12504  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||    |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || || ||||| |||||||||  ||| |||||| | ||||||||    
T  12505 tgcatatgtctgcttgaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtattcagttggg 12604  T
Q  223 catgttgaa 231  Q
     ||| ||||    
T  12605 gatgctgaa 12613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Original strand, 31652 - 31788
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  31652 ttgaaagattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 31751  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || || ||||| || || ||||||||||||||    
T  31752 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagattt 31788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 109058 - 108859
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || |||||||    
T  109058 cagagaagatggcttgagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgtggttgtagatgctttgagcaggaagacgt 108959  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||  |||||||||| || || ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||||||||    
T  108958 tgcacatgtctgctatgatggtaaatgattttgagtttctagattagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacctcagagcgtacagttggg 108859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Original strand, 62930 - 63081
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  62930 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 63029  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
    | || |  || ||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  63030 ttaaagtgttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 63081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 218316 - 218539
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||||    
T  218316 ttgaaagattatgattttgggttgaactataatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgatgg 218415  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || ||||||||||||||||| ||  | || |  ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| | || ||  ||| |||    
T  218416 taaaagagtttgagttgcttgagcagtttagagatttgagtttagtctacgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtga 218515  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||    
T  218516 attcttgaacaatatcaaagaagc 218539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 282
Target Start/End: Original strand, 177161 - 177399
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  177161 ttgaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgtcgttgcagaagctttaagcaggaagacgttacatatgtctgctatgatgg 177260  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || ||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  177261 ttaaagaattagaattgctagaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagtga 177360  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgt 282  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||| || | ||||||||    
T  177361 attcttgaacagtattaaagaagcataaaaagttgatgt 177399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Original strand, 3150 - 3387
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  |||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  3150 cagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgt 3249  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  3250 tgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattggg 3349  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatca 260  Q
     |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  3350 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatca 3387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 267
Target Start/End: Original strand, 15379 - 15604
Alignment:
Q  42 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||    
T  15379 tattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccatgtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgat 15478  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataat 241  Q
    ||| || || ||||||||||| || | |||||||||||| ||  | ||||| || ||||  || ||||||||| ||||||| ||| | |  ||  ||| |    
T  15479 ggtaaaagagtttgagttacttgaacggtttagagatttgagtttagtttgcgatttgtcccctcagagtgtgaagttgggaatgctaaggattgatagt 15578  T
Q  242 gaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15579 gaattcttgaacagtatcaaagaagc 15604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 260
Target Start/End: Original strand, 30163 - 30400
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| | ||| | ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||  |||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  30163 cagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatgtagtcgcggatgctttgagcaggaagacgt 30262  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  30263 tgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcaattggg 30362  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatca 260  Q
     |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  30363 tatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatca 30400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18753 - 18517
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| |    
T  18753 aaggattatgattttggttttaattaccatccgggtaaagctaatgtcgttgtagatgctttgagcaggaagacatttcacatctctgctatgatggtaa 18654  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
    | || |||||||| || ||  | |||||||| || || ||||| ||||| |||| ||  || ||||| |||||||| ||| ||||  | |||| ||| ||    
T  18653 aagagtttgagttgctagaatattttagagacttgagtcttgtctgtgagttgtcacttcaaagtgtacagttgggtatgctgaaggttaatagtgattt 18554  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18553 cttgaatagtatcagagaagcacagcaagttgatgtc 18517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 264
Target Start/End: Original strand, 32198 - 32438
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||    
T  32198 agagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcagcaaaacatt 32297  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 223  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||||||||| || ||  | ||  ||| |||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||     
T  32298 acatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttagaatagtctagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttgggg 32397  T
Q  224 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagaga 264  Q
    ||||||   || |||| ||| |||||||| |||||| ||||    
T  32398 atgttgcggattaatagtgatttcttgaacagtatccgaga 32438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 45945 - 45701
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||      
T  45945 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgttaagcaggaagaccc 45846  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  |||||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  45845 tacatatgtctgcgttgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 45746  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     ||| |||| || || | | | ||||||||||||||| |||||||    
T  45745 aatgctgaagattaacagtaatttcttgaatagtatccgagaagc 45701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 19241 - 19340
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  19241 tgaaggactatgattttgtgttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 19340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21315 - 21138
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  21315 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaatgtggttgcggatgcgttgagcaggaagacct 21216  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgt 200  Q
    |||| ||||| ||  ||||||| |  ||||||||  | || || ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||    
T  21215 tacatatgtctgcgttgatggtaagagaatttgatcttctagaacagtttagagacttgagccttgtttctgagttgt 21138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 35540 - 35422
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  35540 agagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagatgtt 35441  T
Q  124 acacatgtcggccatgatg 142  Q
     |||||||| || ||||||    
T  35440 gcacatgtctgctatgatg 35422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 149 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28527 - 28393
Alignment:
Q  149 gaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattct 248  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||| ||||    
T  28527 gaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgatttct 28428  T
Q  249 tgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  28427 tgaatagtatccgagaagcacaacaagtggatgtc 28393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 280
Target Start/End: Original strand, 39685 - 39894
Alignment:
Q  71 tatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagt 170  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || || |    
T  39685 tatcatcaaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcatgaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaggagtttgagttgcttgaacaat 39784  T
Q  171 ttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||||  || |||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  39785 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtatgaagttgggtatgttgaagatcaacaatgagttcttgaacagtatcaaagaagcaca 39884  T
Q  271 acaggttgat 280  Q
    | | ||||||    
T  39885 aaaagttgat 39894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17061 - 16925
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  17061 ttgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatgg 16962  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || ||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  16961 taaaagagtttgaattattggaacagtttagagattt 16925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 15591 - 15835
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |    
T  15591 cagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgctgatgctttgagcaggaagactt 15690  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||  | || ||||| |||||||||| | | |||||| |  |||||||    
T  15691 tgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatatagttggg 15790  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     | |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15791 aaggttgaaaattgataatgacttcttgaatagtatccgagaagc 15835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10844 - 10621
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||   |||||  | ||||| || || ||||| || |||||||    
T  10844 ttgaaggactgtgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatattttgagcgggaagacattgcatatgtcagctatgatgg 10745  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || || |||||||| ||||  || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| | |||    
T  10744 ttaaagaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgtgtatgttgaagatcaacagtga 10645  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||    
T  10644 attcttgaacagtattaaagaagc 10621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16284 - 16148
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  16284 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatgg 16185  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | ||||| |||||| | || || ||||||||||||||    
T  16184 ttaaggagtttgagctgcttgaacagtttagagattt 16148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 180
Target Start/End: Original strand, 112396 - 112523
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||| |||||||||| || || |    
T  112396 tatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttaagtaggaagacattgcatatgtcgaccatgatggtaaaagagt 112495  T
Q  153 ttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | |||||  | || ||||||||||||||    
T  112496 tcgagttgttggaacagtttagagattt 112523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13875 - 13652
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||| || || || || || || ||||| ||||||||||    
T  13875 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgtcgcagatgccttaagcaggaaaactttgcatatgtccgccatgatgg 13776  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || || |||||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || | || ||| | || ||| ||| |||    
T  13775 taaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctaggaatgctaaagatcgatagtga 13676  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  13675 attcttgaacagtatcaaagaagc 13652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10376 - 10240
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  10376 ttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttacatatgtctgctatgatgg 10277  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | ||||| || ||||| || || || |||||||||||    
T  10276 ttaaggagttcgagttgcttgaacaatttagagattt 10240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 180
Target Start/End: Original strand, 7561 - 7688
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || || |    
T  7561 tatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagt 7660  T
Q  153 ttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7661 tcgagttgcttgaacagttcagagattt 7688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7421 - 7182
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||  | |||||||    
T  7421 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtagtaagacattgcatatgtcctctatgatgg 7322  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || |||||||| || |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| |||||| || |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  7321 ttagagagttcgagttacttgatcagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtctgaaactgggaatgctgaagattgatagtga 7222  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    ||| ||||| ||||| | ||| |||||| | |||||||||    
T  7221 atttttgaaaagtattaaagaggcacaaaaagttgatgtc 7182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Original strand, 29470 - 29621
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  29470 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatgg 29569  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
    | || || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  29570 ttaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 29621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 23084 - 23307
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| || |  ||||| |||||  | |||||||    
T  23084 ttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaattttacatatgtctcctatgatgg 23183  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || || ||| | |||||  |||||||| | || ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  23184 ttaaagagttggagctgctcgaatagtttagacacttgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttgaagattaatagtga 23283  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||| || |||||||| | ||||||    
T  23284 attttttaatagtattaaagaagc 23307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8804 - 8670
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  8804 ttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 8705  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
    |||  || || |||||||| || ||||| ||||||    
T  8704 tgagagagttcgagttacttgaacagttcagagat 8670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 102640 - 102470
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||| | ||||||||||    
T  102640 ttgaaagattatgattttggtttgaactatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgcattgagtaggaagactttgcatatgcccgccatgatgg 102541  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | || || || ||||| || || ||||||| |||||| ||| | || |||||||||| | | |||||||||    
T  102540 taaaagagttcgagttgcttgaacagtttatagatttgagcttagtctgtgaattgtcatctcagagtgtg 102470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5420 - 5215
Alignment:
Q  62 gggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttac 161  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |  || |||||||| |    
T  5420 gggttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttacatatgtccgctatgatggtaagagagtttgagttgc 5321  T
Q  162 tcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcag 261  Q
    | || |||||||| ||||| ||  | || |||||||||| ||| ||||||||| || || | ||| | || ||  ||| |||||||||||| |||||||     
T  5320 ttgaacagtttagggatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgagaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaa 5221  T
Q  262 agaagc 267  Q
    ||||||    
T  5220 agaagc 5215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5280 - 5091
Alignment:
Q  42 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||    
T  5280 tattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgat 5181  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 231  Q
    ||| ||  | |||||||| || || || ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  5180 ggtaaaaaagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaa 5091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12410 - 12221
Alignment:
Q  42 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||||    
T  12410 tattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccactatgat 12311  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaa 231  Q
    ||| ||  | |||||||| || || || ||||||||||| ||  | || || ||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||    
T  12310 ggtaaaaaagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgatgaa 12221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 267
Target Start/End: Original strand, 5241 - 5458
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    |||||||||||||| ||| | || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||   ||||||    |    
T  5241 gattatgattttggtttggattaccatcttggtaaagccaatgtagttgcggatgcgttgaggaggaagaccttacatatgtctgcgtagatggtatgag 5340  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattctt 249  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||| |||| || || | | | |||||    
T  5341 aatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgctgaagattaacagtaatttctt 5440  T
Q  250 gaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||||||||| |||||||    
T  5441 gaatagtatccgagaagc 5458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3594 - 3431
Alignment:
Q  51 attatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagga 150  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||    
T  3594 attatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttacagatgcctcgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaaga 3495  T
Q  151 atttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     || ||||| || || |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | | |||||||||    
T  3494 gttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagttgtcatctcagagtgtg 3431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 7778 - 7643
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7778 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 7679  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7678 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 7643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 7455 - 7356
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  7455 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 7356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 156
Target Start/End: Original strand, 3534 - 3620
Alignment:
Q  70 ctatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttga 156  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  3534 ctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagtttga 3620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 14111 - 14246
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  | || ||||| || ||||||||    
T  14111 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccatgcatatgtctgctatgatggt 14210  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  14211 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 14246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 172 - 37
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  172 tgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 73  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     ||||| || ||||| || ||  |||| ||||||||    
T  72 aaaggagttcgagttgcttgaatagttcagagattt 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2675 - 2540
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  2675 tgaatgattttgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggt 2576  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     ||||| || ||||| || ||  |||| ||||||||    
T  2575 aaaggagttcgagttgcttgaatagttcagagattt 2540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 25845 - 25979
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  25845 tgaaggatta-gattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggt 25943  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || || || |||||  | || ||||||||||||||    
T  25944 aaaagagttcgagttgttggaacagtttagagattt 25979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28361 - 28150
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| || || || |    
T  28361 cagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaggccaatgtggttgttgatgcattgagcaggaaaacat 28262  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||  | ||  |||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  28261 tgcatatgtctgctttaatggtgaaagaatttgaattgttagaaaagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggg 28162  T
Q  223 catgttgaaaat 234  Q
     ||| |||||||    
T  28161 gatgctgaaaat 28150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 177
Target Start/End: Original strand, 277727 - 277862
Alignment:
Q  42 tattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgat 141  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  277727 tattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgat 277826  T
Q  142 ggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    ||| |  || || |||||||| || |||||||||||    
T  277827 ggttagagagttcgagttacttgaacagtttagaga 277862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 261735 - 261491
Alignment:
Q  24 agaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgtt 123  Q
    ||||||||||| | ||| | || || |||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||  |    
T  261735 agaggagatggcttgagttgttaaaagattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagctaacgtagttgctgatgcgttgagcaggaagacact 261636  T
Q  124 acacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggc 223  Q
     || ||||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||| ||  | || || || ||||| ||||   | |||||| | |||||||||    
T  261635 gcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagggacatgagtctggtatgtgagttgtcgactcagagtatacagttgggc 261536  T
Q  224 atgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagca 268  Q
    ||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  261535 atgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagca 261491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 50838 - 50688
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||||    
T  50838 tgaaggactacgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcacatgtccgctatgatggt 50739  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
     ||||| || ||||| || || ||||| | |||||| ||| | ||||||||    
T  50738 aaaggagttcgagttgcttgaacagttcaaagatttgagcttagtttgtga 50688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20008 - 19783
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  20008 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 19909  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 244  Q
     |  || || ||||| || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||| |||| |||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  19908 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggttacctcagaatgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 19809  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||    
T  19808 tttctgaagagtatcaaagaagcaca 19783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 35432 - 35207
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  35432 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 35333  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 244  Q
     |  || || ||||| || || |||||||||||| | ||| | |||||||| | |||||| |||| |||| |  |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  35332 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggttacctcagaatgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaa 35233  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||    
T  35232 tttctgaagagtatcaaagaagcaca 35207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Original strand, 80710 - 80970
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||      
T  80710 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgctgatgcgttgagcaggaagacac 80809  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    |||| ||||| || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||| ||||  || || ||  |  |||||||    
T  80810 tacatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtagcctcaaagaataaagttggg 80909  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  80910 catgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 80970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 390 - 142
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || |    
T  390 cagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcaggaaaacat 291  T
Q  123 ----tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagt 218  Q
        || | ||||| ||  |||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||| || || ||||| |||||| ||| ||| |||||| | ||||    
T  290 tgcatatatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgctataacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagagtatacagt 191  T
Q  219 tgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||| ||| |||| ||  ||  ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  190 tggggatgctgaagatttattgtgatttcttgaacagtatccgagaagc 142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 7231 - 7366
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||  |||| || ||||||||    
T  7231 tgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttgcatttgtctgctatgatggt 7330  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
     || || || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  7331 aaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagattt 7366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26381 - 26230
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  26381 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 26282  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
    | |  || || ||||||||  | |||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  26281 ttagagagttcgagttactttatcagtttagagatatgagttttgtttgtga 26230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2315 - 2089
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||    
T  2315 ttgaaagattatgatttcgggctgaattatcatccaggtaaagctaatgttcttgcagatgctttaagtaggaaaactttacatatgtctgctatgatgg 2216  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | ||  | || ||| | | ||| |||||||  ||  | ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||| || |||| |||    
T  2215 ttaaaaagttggagctgcacgaacagtttattgacctgagttttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtcaagttgggaatgttgaagattaatagtga 2116  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  2115 atttttgaacagtattaaagaagcaca 2089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8346 - 8120
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||    
T  8346 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatgg 8247  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | |  || || || || || || |||||||||||| | ||  | ||||| |||| || ||| ||||||||| |  |||| ||| |||| ||  ||| |||    
T  8246 tcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgcgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtga 8147  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagcaca 270  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||    
T  8146 attcctgaaaagtatcaaggaagcaca 8120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 14178 - 14331
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  14178 cagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccag-taaagacaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 14276  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  14277 tgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagaga 14331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 22357 - 22510
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||    
T  22357 cagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccag-taaagacaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgt 22455  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| ||  ||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  22456 tgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagaga 22510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Original strand, 23978 - 24179
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||       ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  23978 ttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgca-------tgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatgg 24070  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || |||||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||  |||  || ||||||||| ||||| | |||||||| ||||| | |||    
T  24071 ttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagatgtagcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtga 24170  T
Q  244 attcttgaa 252  Q
     ||||||||    
T  24171 gttcttgaa 24179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Original strand, 4253 - 4491
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| ||  |||||||    
T  4253 tgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctttgatggt 4352  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaa 244  Q
     |  || || ||||| ||  | |||||||||||| | ||| | |||||||| | || ||| ||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||| ||||    
T  4353 tagagagttcgagttgcttaaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtgaa 4452  T
Q  245 ttcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    ||  | || ||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  4453 tttctaaagagtatcaaagaagcacagaaagttgatgtc 4491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8772 - 8639
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  8772 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 8673  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
     |  || || || ||||| || ||||||||||||    
T  8672 cagagagttcgaattacttgaacagtttagagat 8639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 214
Target Start/End: Original strand, 7995 - 8156
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaat 152  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||||||||| |  || |    
T  7995 tatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaacattgcatatgtcggccatgatggtaagagagt 8094  T
Q  153 ttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
    | |||||  | || |||||||||||||| ||  | || |||||||||| | | |||||||||    
T  8095 tcgagttgtttgaacagtttagagatttgagtttagtatgtgaattgtcatctcagagtgtg 8156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Original strand, 38853 - 38982
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||    
T  38853 gattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagacgctttgagtaggaagaccttggatatgtctgctatgatggtaaagg 38952  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagatt 179  Q
    | || ||||| || || ||||| |||||||    
T  38953 agttcgagttgcttgaacagttcagagatt 38982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Original strand, 966 - 1102
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  966 ttgaaagactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatcttgtagcagatgccttgaataggaagacattgcatatgtcggccatgatgg 1065  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || || || ||  |||| ||||||||||||||    
T  1066 taaaagagttcgaattgttcgaacagtttagagattt 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6641 - 6381
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||      
T  6641 cagaggagatggcttgaggttttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacac 6542  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttggg 222  Q
    | || ||||  || |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||| ||||  || |||||  | ||||||||    
T  6541 ttcatatgtatgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatgtgagttgtcgcctcagagcatacagttggg 6442  T
Q  223 catgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagcacaacaggttgatgtc 283  Q
    |||| |||| || |||| ||| ||||||  ||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  6441 catgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcacagcaagtggatgtc 6381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4519 - 4383
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  4519 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcaaacggttaaagctaatgttgttgcggataccttaagtaggaagactttacatatgtctgctatgatgg 4420  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | ||||| |||||||| || || || ||||| |||||    
T  4419 ttaaggagtttgagtttcttgaacaatttagggattt 4383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2299 - 2200
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  2299 tgaaagattatgattttgagttgagctatcatctaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggt 2200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24874 - 24723
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| ||  ||||||    
T  24874 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaagactctacatatgtccgctttgatgg 24775  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtga 195  Q
    | || || || ||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  24774 ttaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtga 24723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 9915 - 10138
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  9915 ttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtatagccaatgttgttgcagatgaattaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 10014  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || ||||| ||| | || || |||||| ||||||| ||  | || |||||| ||| |||| |||||||| |||| || ||| |||| ||  ||| |||    
T  10015 tcaaagaattggagctgcttgaacagttttgagatttgagtttagtctgtgaagtgtcaccctagagtgtgaagttaggaatgctgaagattgatagtga 10114  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    |||  |||||||||| | ||||||    
T  10115 atttctgaatagtattaaagaagc 10138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 96592 - 96438
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||      
T  96592 cagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagtcgctgatgcattgagcaggaagacac 96493  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||| | || |||||||| || || || |||||||||||    
T  96492 tgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgattttctggaacagtttagaga 96438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1824 - 1655
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  1824 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 1725  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  1724 tagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 1655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15564 - 15395
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  15564 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 15465  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtg 214  Q
     |  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  15464 tagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 15395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 267
Target Start/End: Original strand, 85421 - 85641
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||  |||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  85421 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttattgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgatggtta 85520  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaatt 246  Q
      || |||||||| || || ||||||||||| || ||  | ||||||||| |||  || ||||||||| | || || |||||||| |||||  |||||||    
T  85521 gagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgcagagtgtgaaattaggaatgttgaagatcaacgatgaatt 85620  T
Q  247 cttgaatagtatcagagaagc 267  Q
     || || | ||||| ||||||    
T  85621 ttttaacactatcaaagaagc 85641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Original strand, 6790 - 7013
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||     
T  6790 ttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcattaagtaggaagactctacatatgtccgctatgatga 6889  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatga 243  Q
    | || || || ||| | || || ||||||||||| || ||| | || || ||| ||| |||  |||||||| |||| || ||| |||| ||   || |||    
T  6890 tcaaagagttggagctgcttgaacagtttagagacttgagcttagtctgcgaagtgtcaccttagagtgtgaagttaggaatgatgaagattgttagtga 6989  T
Q  244 attcttgaatagtatcagagaagc 267  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||    
T  6990 attcttgaacagtattaaagaagc 7013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 132
Target Start/End: Original strand, 32473 - 32560
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtc 132  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  32473 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcatatgtc 32560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 178
Target Start/End: Original strand, 38720 - 38853
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || || ||||| ||  |||||||    
T  38720 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgtgtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 38819  T
Q  145 gaaggaatttgagttactcgagcagtttagagat 178  Q
     |  || || ||||| || || ||||||||||||    
T  38820 tagagagttcgagttgcttgaacagtttagagat 38853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 66836 - 66745
Alignment:
Q  20 agacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgag 111  Q
    |||||| | |||||| ||||| |  |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  66836 agacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgag 66745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 111
Target Start/End: Original strand, 1712 - 1800
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgag 111  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1712 cagaggagatggttatagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgag 1800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 120
Target Start/End: Original strand, 12900 - 12967
Alignment:
Q  53 tatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 120  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12900 tatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 12967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 28268 - 28367
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggt 144  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  28268 tgaaggattatgactttggtttcaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattccttgagttggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 28367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Original strand, 3355 - 3491
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || |||||  | |||||||    
T  3355 ttgaaagattacgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtcttctatgatgg 3454  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || || ||| | || || || ||||||||||||||    
T  3455 ttaaagagttttaattgcttgaacagtttagagattt 3491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 131477 - 131377
Alignment:
Q  80 ggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatt 179  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  131477 ggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatt 131378  T
Q  180 t 180  Q
    |    
T  131377 t 131377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 39958 - 39828
Alignment:
Q  50 gattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |  ||||| | ||||| || || ||||| || |||||||| ||||    
T  39958 gattatgattttgagttgagctatcatccggttaaagctaatgttgttgcagacactctgagtgggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagg 39859  T
Q  150 aatttgagttactcgagcagtttagagattt 180  Q
    | || ||||| || || ||||| ||||||||    
T  39858 agttcgagttgcttgaacagttcagagattt 39828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 6602 - 6492
Alignment:
Q  70 ctatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcag 169  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || |||    
T  6602 ctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacag 6503  T
Q  170 tttagagattt 180  Q
    || ||||||||    
T  6502 ttcagagattt 6492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 111
Target Start/End: Original strand, 18967 - 19033
Alignment:
Q  45 tgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgag 111  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18967 tgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgag 19033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 120
Target Start/End: Original strand, 196377 - 196453
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 120  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  196377 ttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcggacgccttgagtaggaagac 196453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 120
Target Start/End: Original strand, 23972 - 24048
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagac 120  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  23972 ttgaaagattatgactttaggttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtaggaagac 24048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 11664 - 11818
Alignment:
Q  23 cagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgt 122  Q
    |||||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||      
T  11664 cagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaacgtagttgctgatgcattgagcaggaagacac 11763  T
Q  123 tacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttactcgagcagtttagaga 177  Q
    | || ||||| || |||||||| || ||||||||  | || || |||||||||||    
T  11764 tgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatatgctggaacagtttagaga 11818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 219
Target Start/End: Original strand, 115804 - 115979
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatgg 143  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||| || ||  |||| ||||| || ||||||     
T  115804 ttgaaagattatgattttggattgaattatcatccaggtaaggctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatga 115903  T
Q  144 tgaaggaatttgagttactcgagcagtttagagatttaagccttgtttgtgaattgttaccccagagtgtgcagtt 219  Q
    | || ||  | ||| | ||||| |||||||||||  | ||  | || |||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  115904 tcaaagagctggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagtt 115979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 114
Target Start/End: Original strand, 13980 - 14050
Alignment:
Q  44 ttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtag 114  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  13980 ttgaaagattatggttttgggttgaattatcatcctagtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtag 14050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 401 - 343
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgc 105  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  401 aaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttgttgcagatgc 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 172
Target Start/End: Original strand, 16466 - 16591
Alignment:
Q  47 aaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagttgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtga 146  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| |    
T  16466 aaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtta 16565  T
Q  147 aggaatttgagttactcgagcagttt 172  Q
    | || ||||||||  | |||||||||    
T  16566 aagagtttgagttgattgagcagttt 16591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University