View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7073_low_30 (Length: 280)

Name: NF7073_low_30
Description: NF7073
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7073_low_30
NF7073_low_30
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (14-252)||(26089933-26090172)
chr6 (14-243)||(23995121-23995350)
chr6 (15-213)||(15742078-15742275)
chr6 (14-213)||(18002353-18002553)
chr6 (14-171)||(19983192-19983349)
chr6 (14-171)||(35015057-35015214)
chr6 (14-170)||(4991271-4991427)
chr6 (14-171)||(18583515-18583672)
chr6 (15-169)||(15889607-15889762)
chr6 (139-244)||(23148303-23148409)
chr6 (139-244)||(23153754-23153860)
chr6 (15-172)||(25640455-25640611)
chr6 (15-123)||(22585494-22585602)
chr6 (15-123)||(22590325-22590433)
chr6 (139-245)||(27751742-27751849)
chr6 (14-123)||(15004855-15004963)
chr6 (139-243)||(29666181-29666284)
chr6 (151-213)||(16299844-16299906)
chr6 (139-213)||(32276617-32276691)
chr6 (139-213)||(13620669-13620743)
chr6 (139-213)||(18823241-18823315)
chr6 (139-213)||(18839096-18839170)
chr6 (139-239)||(35009283-35009384)
chr6 (139-216)||(1649976-1650053)
chr6 (195-271)||(15740598-15740672)
chr6 (139-172)||(1657660-1657693)
chr6 (139-172)||(15862789-15862822)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (14-272)||(24385551-24385809)
chr8 (14-245)||(41506634-41506866)
chr8 (14-171)||(24716762-24716919)
chr8 (14-171)||(39115473-39115630)
chr8 (15-171)||(274642-274798)
chr8 (15-171)||(641051-641207)
chr8 (15-171)||(826857-827013)
chr8 (139-272)||(43373291-43373424)
chr8 (139-272)||(24928615-24928748)
chr8 (139-272)||(16193542-16193674)
chr8 (15-172)||(21259390-21259547)
chr8 (15-123)||(17502360-17502468)
chr8 (15-123)||(4234054-4234162)
chr8 (15-123)||(23218076-23218184)
chr8 (14-80)||(22321437-22321503)
chr8 (139-213)||(3431134-3431208)
chr8 (139-213)||(22886654-22886728)
chr8 (139-213)||(21494314-21494388)
chr8 (140-245)||(7000445-7000551)
chr8 (139-213)||(2545265-2545339)
chr8 (139-213)||(16038744-16038818)
chr8 (139-216)||(5238404-5238481)
chr8 (139-216)||(22907083-22907160)
chr8 (139-216)||(24661117-24661194)
chr8 (139-216)||(43685863-43685940)
chr8 (154-213)||(18612739-18612798)
chr8 (195-263)||(21197956-21198022)
chr8 (15-93)||(18118259-18118337)
chr8 (139-213)||(22147756-22147830)
chr8 (139-171)||(16404900-16404932)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (13-271)||(6343-6601)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (14-270)||(30153140-30153396)
chr3 (14-272)||(38168112-38168371)
chr3 (14-243)||(53771239-53771468)
chr3 (14-243)||(16261651-16261880)
chr3 (14-272)||(33342079-33342332)
chr3 (14-272)||(54685105-54685358)
chr3 (14-172)||(23492571-23492729)
chr3 (14-171)||(7854180-7854337)
chr3 (14-171)||(17955884-17956041)
chr3 (15-212)||(28558370-28558567)
chr3 (15-171)||(45581830-45581987)
chr3 (14-171)||(55513068-55513225)
chr3 (14-171)||(3992748-3992905)
chr3 (14-272)||(54037921-54038181)
chr3 (14-171)||(2844389-2844546)
chr3 (139-272)||(2050115-2050248)
chr3 (139-272)||(19260648-19260781)
chr3 (139-272)||(17912297-17912430)
chr3 (139-272)||(12029971-12030105)
chr3 (14-172)||(18970119-18970278)
chr3 (188-272)||(5240528-5240612)
chr3 (139-243)||(11986009-11986112)
chr3 (15-171)||(15550797-15550953)
chr3 (15-94)||(48421776-48421855)
chr3 (139-213)||(14285289-14285363)
chr3 (139-213)||(16933827-16933901)
chr3 (139-213)||(19947026-19947100)
chr3 (137-212)||(51960990-51961065)
chr3 (139-213)||(11477053-11477127)
chr3 (139-226)||(13839200-13839287)
chr3 (139-243)||(54651764-54651867)
chr3 (139-216)||(2449107-2449184)
chr3 (139-219)||(13954756-13954836)
chr3 (139-219)||(45861122-45861202)
chr3 (139-213)||(12901965-12902039)
chr3 (230-272)||(17955777-17955819)
chr3 (15-124)||(11402789-11402898)
chr3 (139-172)||(14842486-14842519)
chr3 (139-216)||(15615137-15615214)
chr3 (18-116)||(17393636-17393735)
chr3 (140-213)||(44229293-44229366)
chr3 (195-263)||(11882023-11882089)
chr3 (154-213)||(15938352-15938411)
chr3 (139-171)||(15857163-15857195)
chr3 (139-171)||(19232089-19232121)
chr3 (230-272)||(55513286-55513325)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (14-272)||(21205124-21205381)
chr5 (14-245)||(2032008-2032240)
chr5 (14-272)||(21650893-21651146)
chr5 (14-170)||(11342883-11343039)
chr5 (20-172)||(16105847-16106000)
chr5 (19-239)||(25005019-25005238)
chr5 (139-245)||(27182396-27182503)
chr5 (141-239)||(18530919-18531018)
chr5 (15-93)||(22662653-22662731)
chr5 (139-239)||(22053684-22053785)
chr5 (139-272)||(23981308-23981437)
chr5 (139-243)||(108657-108760)
chr5 (139-213)||(9730236-9730310)
chr5 (143-243)||(32951016-32951115)
chr5 (139-210)||(7529228-7529299)
chr5 (139-213)||(17909823-17909897)
chr5 (139-216)||(23507270-23507347)
chr5 (139-216)||(20623286-20623363)
chr5 (139-216)||(21233397-21233474)
chr5 (139-216)||(37053061-37053138)
chr5 (139-213)||(34939595-34939669)
chr5 (139-216)||(16536514-16536591)
chr5 (139-172)||(25900319-25900352)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (14-272)||(3049780-3050039)
chr7 (14-243)||(42056117-42056346)
chr7 (14-243)||(2190014-2190243)
chr7 (14-272)||(2029119-2029372)
chr7 (32-272)||(15516660-15516901)
chr7 (14-171)||(126613-126770)
chr7 (14-171)||(1936917-1937074)
chr7 (14-171)||(32493946-32494103)
chr7 (14-171)||(111169-111326)
chr7 (137-272)||(25124448-25124583)
chr7 (139-272)||(36052971-36053104)
chr7 (139-272)||(16212071-16212204)
chr7 (188-272)||(17817259-17817343)
chr7 (188-272)||(19049658-19049742)
chr7 (139-243)||(13321334-13321437)
chr7 (139-245)||(11580586-11580693)
chr7 (139-239)||(15709469-15709570)
chr7 (15-123)||(13352151-13352259)
chr7 (139-245)||(13036863-13036970)
chr7 (139-239)||(36024452-36024554)
chr7 (15-123)||(39291457-39291565)
chr7 (139-213)||(371417-371491)
chr7 (139-213)||(47480902-47480976)
chr7 (140-213)||(10000245-10000318)
chr7 (140-213)||(48622541-48622614)
chr7 (230-272)||(32493843-32493885)
chr7 (139-216)||(7293333-7293410)
chr7 (139-216)||(11516544-11516621)
chr7 (139-216)||(15441433-15441510)
chr7 (139-216)||(30261998-30262075)
chr7 (18-92)||(15977820-15977894)
chr7 (139-172)||(14113902-14113935)
chr7 (140-213)||(16418805-16418878)
chr7 (140-216)||(25292207-25292283)
chr7 (195-263)||(13389733-13389799)
chr7 (154-213)||(18253718-18253777)
chr7 (139-213)||(15862226-15862300)
chr7 (18-116)||(18151259-18151357)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (15-272)||(12317-12574)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (14-272)||(193296-193545)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (14-243)||(13214-13443)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (14-243)||(15272140-15272369)
chr4 (14-172)||(14951960-14952118)
chr4 (14-171)||(25119107-25119264)
chr4 (69-243)||(15135836-15136010)
chr4 (14-171)||(5682428-5682584)
chr4 (139-272)||(122194-122327)
chr4 (139-245)||(13246737-13246844)
chr4 (139-239)||(15674940-15675041)
chr4 (139-239)||(10104101-10104202)
chr4 (14-147)||(19559557-19559690)
chr4 (139-239)||(33241011-33241112)
chr4 (140-245)||(55376420-55376525)
chr4 (142-239)||(31132628-31132726)
chr4 (139-263)||(40885368-40885491)
chr4 (14-123)||(49071885-49071994)
chr4 (139-213)||(32460561-32460635)
chr4 (139-213)||(8045272-8045346)
chr4 (140-213)||(22738577-22738650)
chr4 (139-209)||(14500074-14500144)
chr4 (139-209)||(16523146-16523216)
chr4 (20-94)||(34177617-34177691)
chr4 (139-213)||(9795533-9795607)
chr4 (139-216)||(16608968-16609045)
chr4 (139-216)||(26680517-26680594)
chr4 (141-213)||(18248527-18248599)
chr4 (139-213)||(8378493-8378567)
chr4 (139-213)||(19697236-19697310)
chr4 (139-213)||(19707821-19707895)
chr4 (139-216)||(16327795-16327872)
chr4 (154-213)||(19020808-19020867)
chr4 (19-79)||(14500208-14500268)
chr4 (139-171)||(54118168-54118200)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (14-239)||(55779-56005)
scaffold0032 (68-225)||(108021-108179)
scaffold0032 (139-213)||(13225-13299)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (14-272)||(9786-10040)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (14-243)||(21273878-21274106)
chr2 (14-272)||(9652700-9652953)
chr2 (14-171)||(22274920-22275077)
chr2 (14-171)||(22284153-22284310)
chr2 (20-170)||(25213252-25213403)
chr2 (20-171)||(15633418-15633569)
chr2 (139-272)||(463043-463165)
chr2 (139-243)||(25265232-25265335)
chr2 (139-245)||(22863235-22863342)
chr2 (15-172)||(7321716-7321873)
chr2 (139-239)||(24341240-24341341)
chr2 (139-213)||(33128372-33128446)
chr2 (139-226)||(8891549-8891636)
chr2 (139-213)||(28031092-28031166)
chr2 (140-245)||(32466177-32466281)
chr2 (139-226)||(36982309-36982396)
chr2 (139-213)||(17204659-17204733)
chr2 (140-213)||(21142203-21142276)
chr2 (230-270)||(22275138-22275178)
chr2 (139-213)||(7507715-7507789)
chr2 (140-213)||(5888505-5888578)
chr2 (139-216)||(14906309-14906386)
chr2 (139-216)||(23820388-23820465)
chr2 (230-270)||(22284371-22284411)
chr2 (15-93)||(20279610-20279688)
chr2 (139-216)||(19689270-19689347)
chr2 (139-219)||(17396519-17396599)
chr2 (139-214)||(20015328-20015403)
chr2 (139-213)||(23777920-23777994)
chr2 (139-171)||(19794629-19794661)
chr2 (139-171)||(20627238-20627270)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (14-272)||(782-1035)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (16-272)||(17208-17459)
[»] scaffold0303 (2 HSPs)
scaffold0303 (14-213)||(4304-4504)
scaffold0303 (14-94)||(5-85)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (14-170)||(15861327-15861483)
chr1 (14-171)||(21860209-21860366)
chr1 (14-171)||(44034871-44035028)
chr1 (139-272)||(20913335-20913468)
chr1 (139-272)||(20931650-20931783)
chr1 (14-94)||(22367216-22367296)
chr1 (78-171)||(41218667-41218760)
chr1 (139-245)||(20893476-20893583)
chr1 (139-272)||(37844275-37844406)
chr1 (139-226)||(20445987-20446074)
chr1 (139-226)||(20531751-20531838)
chr1 (139-209)||(20254631-20254701)
chr1 (139-216)||(45051726-45051803)
chr1 (139-216)||(51452809-51452886)
chr1 (139-171)||(41394527-41394559)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (14-171)||(80062-80219)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (14-171)||(5983-6140)
scaffold0686 (25-171)||(5777-5923)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (16-171)||(162078-162233)
scaffold0016 (16-171)||(166164-166319)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (14-171)||(31180-31337)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (14-171)||(41507-41664)
scaffold0078 (139-216)||(36935-37012)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (20-170)||(130760-130911)
scaffold0028 (139-245)||(89303-89410)
scaffold0028 (139-245)||(107633-107740)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (14-171)||(30292-30449)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (139-272)||(48903-49036)
scaffold0023 (139-209)||(61084-61154)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (30-170)||(42568-42708)
scaffold0132 (139-205)||(13824-13890)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (14-171)||(352-508)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (139-272)||(1430-1563)
scaffold0266 (139-272)||(3407-3540)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (139-272)||(9183-9316)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (139-272)||(146906-147039)
scaffold0025 (197-272)||(149014-149090)
scaffold0025 (139-239)||(9160-9261)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (139-272)||(172210-172343)
scaffold0001 (139-272)||(177913-178046)
scaffold0001 (139-213)||(164829-164903)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (139-272)||(272330-272463)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (139-272)||(12418-12552)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (139-272)||(36733-36869)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (139-272)||(127994-128127)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (14-103)||(15147-15236)
scaffold0175 (188-272)||(15246-15325)
scaffold0175 (139-172)||(881-914)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (15-149)||(44036-44170)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (136-243)||(57321-57427)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (139-239)||(123018-123119)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (139-272)||(51009-51140)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (139-213)||(41965-42039)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (15-94)||(305-384)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (15-94)||(1478-1557)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (139-272)||(26244-26372)
scaffold0162 (139-243)||(12063-12166)
scaffold0162 (139-212)||(8051-8125)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (139-213)||(5434-5508)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (139-213)||(49710-49784)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (140-244)||(339-444)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (140-245)||(25532-25637)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (139-272)||(42034-42165)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (139-213)||(18026-18100)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (139-213)||(5549-5623)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (139-213)||(34266-34340)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (139-217)||(45338-45416)
scaffold0066 (139-217)||(54724-54802)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (139-213)||(95298-95372)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (139-217)||(247320-247398)
scaffold0012 (139-241)||(34007-34107)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (139-243)||(55942-56045)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (139-213)||(6068-6142)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (139-213)||(9370-9444)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (15-123)||(3785-3897)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (139-213)||(9223-9297)
scaffold0215 (139-213)||(16121-16195)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (140-213)||(12002-12075)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (139-213)||(34331-34405)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (139-216)||(22857-22934)
scaffold0141 (139-216)||(27112-27189)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (139-216)||(1451-1528)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (140-213)||(54182-54255)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (139-241)||(10188-10288)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (137-172)||(5989-6024)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (139-213)||(7053-7127)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (139-213)||(48504-48578)
scaffold0049 (230-272)||(20585-20624)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (139-216)||(5846-5923)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (140-213)||(7517-7590)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (157-213)||(3743-3799)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (15-66)||(6082-6133)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (139-213)||(3505-3578)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (139-172)||(17208-17241)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (230-272)||(19750-19789)
scaffold0122 (230-272)||(24054-24093)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 252
Target Start/End: Original strand, 26089933 - 26090172
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26089933 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 26090032  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090033 gaatcaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 26090132  T
Q  213 agctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttct 252  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090133 acctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttct 26090172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 23995121 - 23995350
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995121 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaattccaaatattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 23995220  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23995221 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctccta 23995320  T
Q  213 agctcactccaatcttgattcttcaagctct 243  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23995321 agctcac-ccaatcttgattcctcaagctct 23995350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15742275 - 15742078
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15742275 catcaaattaacataatcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcat-g 15742177  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15742176 aacaagagaaaaagaattaaccaaaggattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 15742078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18002553 - 18002353
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18002553 acatcaaatgaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatgcccataatcaattatgcata 18002454  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18002453 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggttatgattaatctaaacttagccttcactttagctccta 18002354  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  18002353 a 18002353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19983349 - 19983192
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983349 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattggattcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 19983250  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19983249 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 19983192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 35015214 - 35015057
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35015214 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 35015115  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35015114 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 35015057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 4991271 - 4991427
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991271 acatcaaat-aacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 4991369  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 170  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991370 aaatcaagagaaaaagaattaaacaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 4991427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 18583515 - 18583672
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18583515 acatcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatgatgcata 18583614  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18583615 gaacaggagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 18583672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15889762 - 15889607
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||  |||| || ||||||||||    
T  15889762 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaggttgggttcacaataatcacgtattcaaataaacacttatgcatag 15889663  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatga-taaagactaacccccttacct 169  Q
    || |||||| ||  ||||||| || ||||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  15889662 aaaaagagagaagaaattaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacct 15889607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 244
Target Start/End: Original strand, 23148303 - 23148409
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23148303 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaattcttgattcttca 23148402  T
Q  238 agctctc 244  Q
    || ||||    
T  23148403 agttctc 23148409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 244
Target Start/End: Original strand, 23153754 - 23153860
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23153754 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaattcttgattcttca 23153853  T
Q  238 agctctc 244  Q
    || ||||    
T  23153854 agttctc 23153860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 25640611 - 25640455
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  25640611 catcaaattaacatactcaaacatatc-ctacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 25640513  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    || ||||||  |  ||||| | || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  25640512 aaaaagagagtagaaattacctaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag 25640455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22585602 - 22585494
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  22585602 catcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 22585503  T
Q  115 aacaagaga 123  Q
    || ||||||    
T  22585502 aaaaagaga 22585494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22590433 - 22590325
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  22590433 catcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 22590334  T
Q  115 aacaagaga 123  Q
    || ||||||    
T  22590333 aaaaagaga 22590325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751849
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaattcttgattcttca 27751841  T
Q  238 agctctcc 245  Q
    || |||||    
T  27751842 agttctcc 27751849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15004963 - 15004855
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  |||| || |||||||||    
T  15004963 acatcaaatta-catactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatctcttattcaaataagcacttatgcata 15004865  T
Q  114 gaacaagaga 123  Q
    ||| ||||||    
T  15004864 gaaaaagaga 15004855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Original strand, 29666181 - 29666284
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29666181 atgattatgatgaagactaacccacttatgttagataatgattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaat-ttgattcttcaa 29666279  T
Q  239 gctct 243  Q
    |||||    
T  29666280 gctct 29666284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16299906 - 16299844
Alignment:
Q  151 aagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16299906 aagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 16299844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32276691 - 32276617
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  32276691 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcctaa 32276617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13620743 - 13620669
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13620743 atgattatgaagaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaactcaggcttcactttagctcctaa 13620669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18823315 - 18823241
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  18823315 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaaacttcactttagctcctaa 18823241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18839170 - 18839096
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18839170 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaagcttcactttagcttctaa 18839096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35009384 - 35009283
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| ||   |||| |||| |||||||||||||    
T  35009384 atgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgattaatccaaactttggcttcactttagctcttagattcaccccaattcttgattcttca 35009285  T
Q  238 ag 239  Q
    ||    
T  35009284 ag 35009283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1650053 - 1649976
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1650053 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 1649976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 271
Target Start/End: Original strand, 15740598 - 15740672
Alignment:
Q  195 gcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttct 271  Q
    |||||||||| |||||||||  | |||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||    
T  15740598 gcttcactttcgctcctaagtcctctccaactcttgaatcttcaagctct---tcttctctctaaccctttttcttct 15740672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657660
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 1657660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Original strand, 15862789 - 15862822
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15862789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 15862822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24385809 - 24385551
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385809 acatcaaattatcatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcataataatcacttattctcataatcaattatgcata 24385710  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24385709 gaacaagagaaaaggaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 24385610  T
Q  214 gctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24385609 gctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctccaacccttgttcttctc 24385551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41506866 - 41506634
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41506866 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacggatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 41506767  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | | || | |||||||||||||| |||||||| |||    
T  41506766 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcttaa 41506667  T
Q  214 gctcactccaa-tcttgattcttcaagctctcc 245  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  41506666 gctcaccccaattcttgattcttcaagttctcc 41506634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 24716919 - 24716762
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716919 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccatataaccacgaatttcaaagatcgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 24716820  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716819 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 24716762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 39115473 - 39115630
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39115473 acatcaaattaacatattcaaacatatctttacaacataagcacgaatgtcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 39115572  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  39115573 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacacccttacctta 39115630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Original strand, 274642 - 274798
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  274642 catcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataacttattctcataatcaattatgcatag 274741  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
     ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  274742 gacaagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 274798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 641207 - 641051
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  641207 catcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataacttattctcataatcaattatgcatag 641108  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
     ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  641107 gacaagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 641051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 827013 - 826857
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  827013 catcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataacttattctcataatcaattatgcatag 826914  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
     ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  826913 gacaagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 826857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43373424 - 43373291
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43373424 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 43373325  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  43373324 gctctccttcttctctttaacccttgttcttctc 43373291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24928748 - 24928615
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | | ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24928748 atgattatgataaagactaaccccattaccttagataaagattaatcccaacttagacttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 24928649  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24928648 gatctccctcttctctctaacccttgttcttctc 24928615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16193674 - 16193542
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16193674 atgattatgataaagactaacccc-ttaccttagataaagatgaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattctttaa 16193576  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16193575 gctctccctcttctctctaaccctagttcttctc 16193542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21259547 - 21259390
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  21259547 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 21259448  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    || ||||||  |  ||||||| || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  21259447 aaaaagagagtagaaattaactaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag 21259390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 17502360 - 17502468
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  17502360 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaaagattgggttcataataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 17502459  T
Q  115 aacaagaga 123  Q
    || ||||||    
T  17502460 aaaaagaga 17502468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 4234054 - 4234162
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  4234054 catcaaattaacatactcaaacatatcactgcaacatgagcacaaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 4234153  T
Q  115 aacaagaga 123  Q
    || ||||||    
T  4234154 aaaaagaga 4234162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 23218076 - 23218184
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  23218076 catcaaattaacatactcaaacatatcactaccacataagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatag 23218175  T
Q  115 aacaagaga 123  Q
    || ||||||    
T  23218176 aaaaagaga 23218184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 22321503 - 22321437
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatg 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321503 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacctgagcacgaatttcaaagattgggttcatg 22321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3431208 - 3431134
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3431208 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaatccaaacttgggcttcactttagctcctaa 3431134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 22886654 - 22886728
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22886654 atgattatgattaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcctaa 22886728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21494388 - 21494314
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21494388 atgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 21494314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7000551 - 7000445
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| | | || | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  7000551 tgattatgatgaaaactaacccccttactttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaattcttgattctacaa 7000452  T
Q  239 gctctcc 245  Q
    | |||||    
T  7000451 gttctcc 7000445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 2545265 - 2545339
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||  ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2545265 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaatttaagcttcactttagctcctaa 2545339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16038818 - 16038744
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  16038818 atgattatgatgaagacaaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 16038744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 5238404 - 5238481
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5238404 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 5238481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22907160 - 22907083
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22907160 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 22907083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24661194 - 24661117
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24661194 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 24661117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 43685863 - 43685940
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  43685863 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 43685940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Original strand, 18612739 - 18612798
Alignment:
Q  154 actaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  18612739 actaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaatttgggcttcactttagctcctaa 18612798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 21198022 - 21197956
Alignment:
Q  195 gcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttcaagctctccctcttctctctaaccctt 263  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  21198022 gcttcactttagctcctaggttctctccaactcttgaatcttcaagctc---ctcttctctctaaccctt 21197956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18118337 - 18118259
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatt 93  Q
    ||||||||| | |||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||    
T  18118337 catcaaatttatatacgcaaacatatctctataacacgagcacgaatttcaacgattaagttcacaataatcacttatt 18118259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 22147756 - 22147830
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  22147756 atgattatgaagaacactaaaccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcaccttagctcctaa 22147830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16404932 - 16404900
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16404932 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 16404900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6601 - 6343
Alignment:
Q  13 gacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  6601 gacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataagcacctattatcataatcaattatgcat 6502  T
Q  113 agaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  6501 agaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaggaataatcccaacttaggcttcaatttagctccta 6402  T
Q  213 agctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttct 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6401 agctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaactcttgttcttct 6343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 30153140 - 30153396
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153140 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 30153239  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | | | ||||  ||||||| |||| |||||||||||||    
T  30153240 gaacaagagaaaaagaattaattaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttagacttctctttagctcctaa 30153339  T
Q  214 gctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttc 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153340 gctcaccccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttc 30153396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 38168112 - 38168371
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38168112 acatcaaattaacatattcaaacatatttctacaacataagtacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 38168211  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  38168212 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 38168311  T
Q  214 gctcactccaat-cttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168312 gttcactccaatccttaattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 38168371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 53771239 - 53771468
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771239 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 53771338  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  53771339 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctccta 53771438  T
Q  213 agctcactccaatcttgattcttcaagctct 243  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  53771439 agctcac-ccaatcttgattcctcaagctct 53771468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 16261651 - 16261880
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16261651 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattacgcata 16261750  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  16261751 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttaggcttcactttagctccta 16261850  T
Q  213 agctcactccaatcttgattcttcaagctct 243  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16261851 agctcac-ccaatcttgattcctcaagctct 16261880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 33342079 - 33342332
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33342079 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacattagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 33342178  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | | | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33342179 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaaccctcttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 33342278  T
Q  214 gctcactccaat-cttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  33342279 gttcactccaatccttaattcttcaag------ttcttctctctaacccttgttcttctc 33342332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 54685358 - 54685105
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685358 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 54685259  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | | | | ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  54685258 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatcataaagactaacccacttaccttggatgaagattaatcccaacttagacttcaatttagctcctaa 54685159  T
Q  214 gctcactccaat-cttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
      |||||||||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  54685158 tttcactccaatccttaattcttcaag------ttcttctctctaacccttgttcttctc 54685105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Original strand, 23492571 - 23492729
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23492571 acatcaaattaacacattcaaacatatctctacaacataagcaagaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 23492670  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492671 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 23492729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 7854180 - 7854337
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7854180 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 7854279  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7854280 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 7854337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17956041 - 17955884
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17956041 acatcaaattaacatattcagacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcgattatgcata 17955942  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955941 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 17955884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 212
Target Start/End: Original strand, 28558370 - 28558567
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28558370 catcaaattaacatattcaaacatatctctatcacataagcacgaatttcaaagattaggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatgg 28558469  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  28558470 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaaccctcttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaattttgctccta 28558567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Original strand, 45581830 - 45581987
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45581830 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatag 45581929  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaa-cccccttacctta 171  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45581930 aacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaaccccccttacctta 45581987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 55513068 - 55513225
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  55513068 acatcgaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatttccataatcaattatgcata 55513167  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55513168 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 55513225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 3992748 - 3992905
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3992748 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacggatttcaaaggttgagttcatgataattacttattctcataatcaattatgcata 3992847  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3992848 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 3992905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 54038181 - 54037921
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54038181 acatcaaattaacatattcaaacatatatctacaatataagcacgaatgtcaaacattgagttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 54038082  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||   |  | | | | || | |||||||||| |||||||     
T  54038081 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctat 54037982  T
Q  214 gctcactccaa-tcttg-attcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    | |   || ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54037981 gattcttcaaacccttgaattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 54037921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 2844389 - 2844546
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2844389 acatcaaattaacatattaaaacaaaaatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcgcttattcccataatcaattatgcata 2844488  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2844489 gaataagagaaaaagaatcaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 2844546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 2050115 - 2050248
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2050115 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaaactcactccaatcttgattcttcaa 2050214  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050215 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 2050248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19260781 - 19260648
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19260781 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttagacttcaatttagctcttaatctcactccaatcttgattcttcaa 19260682  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19260681 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 19260648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912297
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccacctcaggcttcaatttagctcctaagctcactccaaccttgattcttcaa 17912331  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17912330 gctctccctcttctctttaacccttgttcttctc 17912297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12030105 - 12029971
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaat-cttgattcttca 237  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  12030105 atgattatgataatgattaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatccttagttcttca 12030006  T
Q  238 agctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12030005 agctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 12029971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Original strand, 18970119 - 18970278
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  18970119 acatcaaattaacatacttaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcataataatcacttattcaaataatcacttatgcata 18970218  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatga-taaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||| |||||||||  || |||| || || |||||| | ||  ||||||||||||||||||    
T  18970219 gaaaaagagaaaagaaactaactaagtggttatgattgaaatctaacccccttaccttag 18970278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 188 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5240612 - 5240528
Alignment:
Q  188 aacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5240612 aacttaggcttcaatttagctcgtaagctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 5240528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986009
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaat-ttgattcttcaa 11986014  T
Q  239 gctct 243  Q
     ||||    
T  11986013 actct 11986009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 171
Target Start/End: Original strand, 15550797 - 15550953
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  || | || |||||||||     
T  15550797 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaattagcacttatgcataa 15550896  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||  |||||  |  ||||||| || |||||||||| ||  |||||||||||| ||||    
T  15550897 aaagagagagtagaaattaactaagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 15550953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Original strand, 48421776 - 48421855
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 94  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  48421776 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcatgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattc 48421855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 14285289 - 14285363
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14285289 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcctaa 14285363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16933901 - 16933827
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  16933901 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 16933827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 19947026 - 19947100
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19947026 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaggcttcactttaactcctaa 19947100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 51961065 - 51960990
Alignment:
Q  137 aaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  51961065 aaatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttagacttcactttacctccta 51960990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11477127 - 11477053
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11477127 atgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaattcaaacttaggcttcactttaactcctaa 11477053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Original strand, 13839200 - 13839287
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatc 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |   ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13839200 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagagtaatccctacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatc 13839287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Original strand, 54651764 - 54651867
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| | || | ||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  54651764 atgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgattaacccaaacttttgcttcaattaagctcctaagctcaccccaat-ttgattcatcaa 54651862  T
Q  239 gctct 243  Q
    |||||    
T  54651863 gctct 54651867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2449184 - 2449107
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2449184 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 2449107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13954836 - 13954756
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcac 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13954836 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctcac 13954756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 219
Target Start/End: Original strand, 45861122 - 45861202
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcac 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45861122 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctcac 45861202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12902039 - 12901965
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  12902039 atgattatgatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttaactcctaa 12901965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17955819 - 17955777
Alignment:
Q  230 attcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955819 attcttcaaattctccctcttctctctaacccttgttcttctc 17955777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 11402789 - 11402898
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||  |||||  ||||||||||||||  |||| || || |||||||    
T  11402789 catcaaattcatatactcaaacatatcactataatatgagcacgaatttcaacaattaagttcacaataatcacttattcaaataagcacttgtgcatag 11402888  T
Q  115 aacaagagaa 124  Q
    ||| ||||||    
T  11402889 aactagagaa 11402898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14842519 - 14842486
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842519 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 14842486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 15615137 - 15615214
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15615137 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 15615214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Original strand, 17393636 - 17393735
Alignment:
Q  18 caaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctca--taatcaattatgcataga 115  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||   ||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  17393636 caaattaacatacccaaacatatcactacaactagagcacgaatttcaacaattaagttcataataatcactta-tctcaattaagcaattatgcataga 17393734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Original strand, 44229293 - 44229366
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  44229293 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggtttcactttatctcctaa 44229366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11882089 - 11882023
Alignment:
Q  195 gcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttcaagctctccctcttctctctaaccctt 263  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  11882089 gcttcactttagctcctaggatctctccaactcttgaatcttcaagctc---ctcttctctctaaccctt 11882023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15938411 - 15938352
Alignment:
Q  154 actaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  15938411 actaacccccttaccttaggctatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 15938352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15857195 - 15857163
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15857195 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 15857163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Original strand, 19232089 - 19232121
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19232089 atgattaagataaagactaacccccttacctta 19232121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 272
Target Start/End: Original strand, 55513286 - 55513325
Alignment:
Q  230 attcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  55513286 attcttcaagctc---ctcttctctctaacccttgttcttctc 55513325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 21205124 - 21205381
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205124 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 21205223  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | | | | |||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21205224 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaa-tcccttatcttagatgaagattaattccaacttaggcttcaatttagctcctaa 21205322  T
Q  214 gctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21205323 gctcactccaatcttgattcttcaagctctcccacttctctctaacccttgttcttctc 21205381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 2032008 - 2032240
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2032008 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 2032107  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | | || | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2032108 gaacaagagaaaaagaattaactaaacgattatgatgaaaactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 2032207  T
Q  214 gctcactccaa-tcttgattcttcaagctctcc 245  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  2032208 gctcaccccaattcttgattcttcaagttctcc 2032240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 21650893 - 21651146
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  21650893 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaactatgcaca 21650992  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | | | ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21650993 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaatattaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttagacttcaatttagctcctaa 21651092  T
Q  214 gctcactccaat-cttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  21651093 gctcactccaatccttaattcttcaag------ttcttctctctaacccttgttcttctc 21651146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 11342883 - 11343039
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342883 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 11342982  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11342983 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctt 11343039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 172
Target Start/End: Original strand, 16105847 - 16106000
Alignment:
Q  20 aattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-ca 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16105847 aattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatca 16105946  T
Q  119 agagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105947 agagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 16106000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Original strand, 25005019 - 25005238
Alignment:
Q  19 aaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaaca 118  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   | | || |||| |||| ||||    
T  25005019 aaattaacacactcaaacatatcacttcaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaattgagcacttattcatacaaca 25005118  T
Q  119 agagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctca 218  Q
    |  ||||||  |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  25005119 attgaaaaacta--aactaaatgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctagattca 25005216  T
Q  219 ctccaa-tcttgattcttcaag 239  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  25005217 ctccaattcttgattcttcaag 25005238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27182503 - 27182396
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27182503 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaattcttgattcttca 27182404  T
Q  238 agctctcc 245  Q
    || |||||    
T  27182403 agttctcc 27182396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18531018 - 18530919
Alignment:
Q  141 gattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttcaag 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18531018 gattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaattcttgattcttcaag 18530919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22662731 - 22662653
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatt 93  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22662731 catcaaattaacatattcaaatatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttatt 22662653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22053785 - 22053684
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| | || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22053785 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttagacttcactttagctcctaagctcacttcaattcttgattcttca 22053686  T
Q  238 ag 239  Q
    ||    
T  22053685 ag 22053684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23981437 - 23981308
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| || | | | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23981437 atgattttgatgaagactaacccccttacctaagatgaagattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaattcttgattcttca 23981338  T
Q  238 agctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    || ||| |||||    |||||||||||||||||||    
T  23981337 agatct-cctct----tctaacccttgttcttctc 23981308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 108760 - 108657
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |    
T  108760 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttacctcctaagctcac-caaatcttgattcctcga 108662  T
Q  239 gctct 243  Q
    |||||    
T  108661 gctct 108657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9730310 - 9730236
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9730310 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 9730236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 243
Target Start/End: Original strand, 32951016 - 32951115
Alignment:
Q  143 ttatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaagctc 242  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  32951016 ttatgatgaagactaacccccttaccttaaataatgattaattcaaacttagacttcaatttagctcctaagcttaccccaat-ttgattcttcaagctc 32951114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 210
Target Start/End: Original strand, 7529228 - 7529299
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcc 210  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7529228 atgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcc 7529299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 17909823 - 17909897
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17909823 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaggcttcactttaactcctaa 17909897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 23507270 - 23507347
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||   |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23507270 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttatgcttcactttaactcctaagct 23507347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 20623286 - 20623363
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20623286 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 20623363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21233474 - 21233397
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21233474 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 21233397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053138
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 37053138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 34939595 - 34939669
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| | |||  | |||||| ||||||||||||||||||    
T  34939595 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcacacttagacttcactttagctcctaa 34939669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 16536514 - 16536591
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16536514 atgattatgataaagactaacccccttatcttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 16536591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900319
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 25900319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 3049780 - 3050039
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3049780 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaatataaacacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 3049879  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| |||||||| |||    
T  3049880 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcttaa 3049979  T
Q  214 gctcactccaat-cttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3049980 gttcactccaatccttaattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 3050039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42056346 - 42056117
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056346 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 42056247  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42056246 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctccta 42056147  T
Q  213 agctcactccaatcttgattcttcaagctct 243  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  42056146 agctcac-ccaatcttgattactcaagctct 42056117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2190243 - 2190014
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2190243 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggtacatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 2190144  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  2190143 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaaccgccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttaactccta 2190044  T
Q  213 agctcactccaatcttgattcttcaagctct 243  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2190043 agctcac-ccaatcttgattcctcaagctct 2190014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Original strand, 2029119 - 2029372
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029119 acatcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 2029218  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2029219 gaacaagagaaaaaaaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttaggcttcaatttagctcctaa 2029318  T
Q  214 gctcactccaa-tcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    | ||||||||| | || ||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||    
T  2029319 gttcactccaatttttaattcttcaag------ttcttctctctaacccttgctcttctc 2029372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15516901 - 15516660
Alignment:
Q  32 caaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15516901 caaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaa 15516802  T
Q  131 ttaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||| | || |  ||||   |||||| || ||||||||  || || ||||||||||    
T  15516801 ttaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacatttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctagacttaccccaatcttga 15516702  T
Q  231 ttcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516701 ttcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 15516660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 126613 - 126770
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126613 acatcaaattaacatattcaaacatatctctgcaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 126712  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  126713 gaacaatagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 126770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1937074 - 1936917
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1937074 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 1936975  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1936974 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacctccttacctta 1936917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 32494103 - 32493946
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32494103 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataaacacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 32494004  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32494003 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 32493946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 111326 - 111169
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  111326 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaatattgggttcatgataatcacttattttcataatcaattatgcata 111227  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  111226 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 111169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 137 - 272
Target Start/End: Original strand, 25124448 - 25124583
Alignment:
Q  137 aaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttc 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25124448 aaatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttc 25124547  T
Q  237 aagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25124548 aagctctccctcttctctctaatccttgttcttctc 25124583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 36052971 - 36053104
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052971 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 36053070  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36053071 gctctccctcttctctctaaccattgttcttctc 36053104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 16212071 - 16212204
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16212071 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 16212170  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16212171 actctccctcttctctctaacccttgttcttctc 16212204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 188 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17817343 - 17817259
Alignment:
Q  188 aacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17817343 aacttaggcttcaatttagctcgtaagctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 17817259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 188 - 272
Target Start/End: Original strand, 19049658 - 19049742
Alignment:
Q  188 aacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19049658 aacttaggcttcaatttagctcgtaagctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 19049742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Original strand, 13321334 - 13321437
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaagcttaccccaat-ttgattcttcaa 13321432  T
Q  239 gctct 243  Q
    |||||    
T  13321433 gctct 13321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11580693 - 11580586
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaat-cttgattcttca 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | | | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11580693 atgattatgataaagactaatccccttaccttagattaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatccttgattcttca 11580594  T
Q  238 agctctcc 245  Q
    || |||||    
T  11580593 agttctcc 11580586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 15709469 - 15709570
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15709469 atgattatgatgaagactaatcctcttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaattcttgattcttca 15709568  T
Q  238 ag 239  Q
    ||    
T  15709569 ag 15709570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 13352151 - 13352259
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||    
T  13352151 catcaaattaacatactgaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaagggttgggttcacaataatcacttattcaaataaacacttatgcatag 13352250  T
Q  115 aacaagaga 123  Q
    || ||||||    
T  13352251 aaaaagaga 13352259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13036970 - 13036863
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaat-cttgattcttca 237  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13036970 atgattatggtgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagcttactccaatccttgattcttca 13036871  T
Q  238 agctctcc 245  Q
    || |||||    
T  13036870 agttctcc 13036863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 36024452 - 36024554
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccc-cttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttc 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||| | || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36024452 atgattatgatgaagactaaccccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcataagctcactccaattcttgattcttc 36024551  T
Q  237 aag 239  Q
    |||    
T  36024552 aag 36024554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 39291565 - 39291457
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||  ||||  | ||||||||||    
T  39291565 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttaggttcacaataatcacttattcaaataagtacttatgcatag 39291466  T
Q  115 aacaagaga 123  Q
    || ||||||    
T  39291465 aaaaagaga 39291457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 371417 - 371491
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  371417 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 371491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 47480976 - 47480902
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  47480976 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttacctcctaa 47480902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10000318 - 10000245
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10000318 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 10000245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48622614 - 48622541
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48622614 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 48622541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 32493885 - 32493843
Alignment:
Q  230 attcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32493885 attcttcaagctctcactcttctctctaacccttgttcttctc 32493843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 7293333 - 7293410
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  7293333 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 7293410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 11516544 - 11516621
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11516544 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 11516621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15441510 - 15441433
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15441510 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 15441433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30262075 - 30261998
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  30262075 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 30261998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 15977894 - 15977820
Alignment:
Q  18 caaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttat 92  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  15977894 caaattaacatactcaaacatatcactacaactagagcatgaatttcaaacatttagttcataataatcacttat 15977820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113902
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 14113902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Original strand, 16418805 - 16418878
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||| | ||| | ||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  16418805 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaactaaagcttcactttagctcctaa 16418878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25292283 - 25292207
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  25292283 tgattatgataaagactaacccccttatcttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 25292207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 263
Target Start/End: Original strand, 13389733 - 13389799
Alignment:
Q  195 gcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttcaagctctccctcttctctctaaccctt 263  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||| |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  13389733 gcttcactttagctcctaggatctctccaattcttgaatcttcaagctct---tcttctctctaaccctt 13389799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18253777 - 18253718
Alignment:
Q  154 actaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  18253777 actaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaatttgagcttcactttagctcctaa 18253718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 15862226 - 15862300
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  ||||||  ||| |||||||    
T  15862226 atgattatgataataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcaacttaactcctaa 15862300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18151357 - 18151259
Alignment:
Q  18 caaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 116  Q
    ||||||||||||   || |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||  ||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||    
T  18151357 caaattaacatacctaatcatatcactacaacatgagcacgaatttcaacggttaagttcacaataatcacttattcaaataagaatttatgcatagaa 18151259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12574 - 12317
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12574 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacaaatttcaaagattgggttcatgataataacttattcccataatcaattatgcatag 12475  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaag 214  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |  |||  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12474 aacaaaagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttagataaagattcatcccaacttagacttcaatttagctcctaag 12375  T
Q  215 ctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12374 ctcaatccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 12317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 193545 - 193296
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193545 acatcaaattaacatattcaaacatatctct---------gcacgaatttcaatgattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 193455  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  193454 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 193355  T
Q  214 gctcactccaatcttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193354 gctcactccaatcttaattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 193296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13443 - 13214
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13443 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 13344  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13343 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctccta 13244  T
Q  213 agctcactccaatcttgattcttcaagctct 243  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13243 agctcac-ccaatcttgattcctcaagctct 13214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15272369 - 15272140
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272369 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 15272270  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15272269 gaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctccta 15272170  T
Q  213 agctcactccaatcttgattcttcaagctct 243  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15272169 agctcac-ccaatcttgattcctcaagctct 15272140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Original strand, 14951960 - 14952118
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14951960 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 14952059  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952060 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 14952118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 25119264 - 25119107
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25119264 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaattttcaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 25119165  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  25119164 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaactcccttacctta 25119107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 69 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15136010 - 15135836
Alignment:
Q  69 attgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttac 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15136010 attgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttac 15135911  T
Q  168 cttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaagctct 243  Q
    ||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15135910 cttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcac-ccaatcttgattcctcaagctct 15135836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5682584 - 5682428
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682584 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 5682485  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5682484 gaacaagaggaaaa-aattaactaaatgattatgataaaaactaacccacttacctta 5682428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 122194 - 122327
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  122194 atgattatgataaagactaatccccttaccttagataaagattaatcccaacttagacttcaatttagctcttaagctcactccaatcttgattcttcaa 122293  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122294 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 122327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Original strand, 13246737 - 13246844
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13246737 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaattcttgattcttca 13246836  T
Q  238 agctctcc 245  Q
    || |||||    
T  13246837 agttctcc 13246844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15675041 - 15674940
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15675041 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaattcttgattcttca 15674942  T
Q  238 ag 239  Q
    ||    
T  15674941 ag 15674940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10104202 - 10104101
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| | || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10104202 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggctttactttagctcctaagctcactccaattcttgattcttca 10104103  T
Q  238 ag 239  Q
    ||    
T  10104102 ag 10104101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Original strand, 19559557 - 19559690
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  19559557 acatcaaattaacatgctcaaacatatcactacaacatgagcaggaatttcaaaagttgggtacataataatcacttattcaaataagcacttatgcata 19559656  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatg 147  Q
    ||| |||||| ||  ||||||| || ||||||||    
T  19559657 gaaaaagagagaagaaattaactaattgattatg 19559690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 33241011 - 33241112
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33241011 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcgctttaactcctaagctcactccaattcttgattcttca 33241110  T
Q  238 ag 239  Q
    ||    
T  33241111 ag 33241112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 55376525 - 55376420
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaag 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||    
T  55376525 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggatcaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcacccaattcttggttcttcaag 55376426  T
Q  240 ctctcc 245  Q
     |||||    
T  55376425 ttctcc 55376420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 239
Target Start/End: Original strand, 31132628 - 31132726
Alignment:
Q  142 attatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttcaag 239  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| | || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31132628 attatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggctccactttagctcctaagctcactccaattcttgattctacaag 31132726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 40885491 - 40885368
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa--tcttgattcttc 236  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||   |||||||||||    
T  40885491 atgattatgatgaattctaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctagattcactccaaatccttgattcttc 40885392  T
Q  237 aagctctccctcttctctctaaccctt 263  Q
    |||   | |||||||||||||||||||    
T  40885391 aag---ttcctcttctctctaaccctt 40885368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Original strand, 49071885 - 49071994
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||||||  |||| || |||||||||    
T  49071885 acatcaaattaacatactcaaacatatcactacaatatgagcacgaatttcaacggttgggttcacaatgatcacttattcaaataagcacttatgcata 49071984  T
Q  114 gaacaagaga 123  Q
    ||| ||||||    
T  49071985 gaaaaagaga 49071994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32460635 - 32460561
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32460635 atgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 32460561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 8045272 - 8045346
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8045272 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaacttagacttcactttagctcctaa 8045346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Original strand, 22738577 - 22738650
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22738577 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 22738650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14500144 - 14500074
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctc 209  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14500144 atgattatgatgaagcctaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaagcttcactttagctc 14500074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Original strand, 16523146 - 16523216
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctc 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||    
T  16523146 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctc 16523216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 34177691 - 34177617
Alignment:
Q  20 aattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 94  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  34177691 aattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattttcaagattggattcacaataatcacttattc 34177617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 9795533 - 9795607
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  9795533 atgattatgatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 9795607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16608968
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 16608968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 26680517 - 26680594
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  26680517 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 26680594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Original strand, 18248527 - 18248599
Alignment:
Q  141 gattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  18248527 gattatgataataactaacccccttaccttagatgatgattaatcttaacttaagcttcactttaactcctaa 18248599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 8378493 - 8378567
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||| | ||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  8378493 atgattatgataataactaatccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaagcttcactttaactcctaa 8378567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19697310 - 19697236
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| | |||  | ||||||||||||||||| |||||||    
T  19697310 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcacacttaggcttcactttacctcctaa 19697236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19707895 - 19707821
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| | |||  | ||||||||||||||||| |||||||    
T  19707895 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcacacttaggcttcactttacctcctaa 19707821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327795
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttaccttatatgaagattaggccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 16327795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Original strand, 19020808 - 19020867
Alignment:
Q  154 actaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  19020808 actaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcaccttagctcctaa 19020867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 14500268 - 14500208
Alignment:
Q  19 aaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcat 79  Q
    ||||||||||| |||||| |||| | | ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14500268 aaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcat 14500208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 54118200 - 54118168
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54118200 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 54118168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Original strand, 55779 - 56005
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55779 acatcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 55878  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  || |||||||||| ||||||||||||    
T  55879 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaatttaggcttcaatttagctcctaa 55978  T
Q  214 gctcactccaa-tcttgattcttcaag 239  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||    
T  55979 gctctctccaattcttgattcttcaag 56005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 108179 - 108021
Alignment:
Q  68 gattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaac-aagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaaccccctta 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108179 gattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatgaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaaccccctta 108080  T
Q  167 ccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaat 225  Q
    |||||| | | | | |||   ||||||||||||| || |||||||||||| || |||||    
T  108079 ccttagatgaagattaattccaacttaggcttcaattcagctcctaagcttaccccaat 108021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13299 - 13225
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  13299 atgattatgatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 13225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10040 - 9786
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaa-ttatgcat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10040 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattttcataatcaatttatgcat 9941  T
Q  113 agaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | ||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  9940 agaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctccta 9841  T
Q  213 agctcactccaat-cttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    || |||||||||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  9840 agttcactccaatccttaattcttcaag------ttcttctctctaacccttgttcttctc 9786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21274106 - 21273878
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21274106 acatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 21274007  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 212  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  21274006 gaatcaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaa-ccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcata 21273908  T
Q  213 agctcactccaatcttgattcttcaagctct 243  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21273907 agctcac-ccaatcttgattcctcaagctct 21273878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9652953 - 9652700
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9652953 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataaccacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 9652854  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | ||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  9652853 gaacaagaaaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggtttcaatttagctcctaa 9652754  T
Q  214 gctcactccaat-cttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9652753 gttcactccaatccttaattcttcaag------ttcttctctctaacccttattcttctc 9652700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 22274920 - 22275077
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274920 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 22275019  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22275020 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaggctaacccccttacctta 22275077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 22284153 - 22284310
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22284153 acattaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgagttcatgataatcacttattctcataatcaaatatgcata 22284252  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284253 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 22284310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 170
Target Start/End: Original strand, 25213252 - 25213403
Alignment:
Q  20 aattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-ca 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25213252 aattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatca 25213351  T
Q  119 agagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213352 agagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 25213403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 171
Target Start/End: Original strand, 15633418 - 15633569
Alignment:
Q  20 aattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaa 119  Q
    |||||||||| |||||| |||| | | ||||  |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15633418 aattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaagaattgggttcattataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaa 15633517  T
Q  120 gagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15633518 gagaaaaagaattaactaagtgattatgataaagactaacctccttacctta 15633569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 463043 - 463165
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||           |||||||||    
T  463043 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctca-----------attcttcaa 463131  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  463132 gctctccctctcctctctaacccttgttcttctc 463165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25265335 - 25265232
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  25265335 atgattatgatgaagactaacccccttacattagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaagcttaccccaat-ttgattcttcaa 25265237  T
Q  239 gctct 243  Q
    |||||    
T  25265236 gctct 25265232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Original strand, 22863235 - 22863342
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaat-cttgattcttca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22863235 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggctgcaatttagctcctaagctcaccccaatccttgattcttca 22863334  T
Q  238 agctctcc 245  Q
    || |||||    
T  22863335 agttctcc 22863342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 172
Target Start/End: Original strand, 7321716 - 7321873
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||  |||| ||  |||||||||    
T  7321716 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaatagtcacttattcaaataagcacgtatgcatag 7321815  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
     | ||||||  |  ||||||| || ||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  7321816 gaaaagagagtagaaattaactaagtgattataatgaattctaacccccttaccttag 7321873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24341341 - 24341240
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| | || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24341341 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcattttagctcctaagctcactccaattcttgatgcttca 24341242  T
Q  238 ag 239  Q
    ||    
T  24341241 ag 24341240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 33128372 - 33128446
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33128372 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 33128446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Original strand, 8891549 - 8891636
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8891549 atgattatgataaagactaacccctttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagttcctaagctcactccaatc 8891636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28031166 - 28031092
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  28031166 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaattcaaacttaggcttcactttaactcctaa 28031092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 245
Target Start/End: Original strand, 32466177 - 32466281
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaag 239  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||    
T  32466177 tgattatgatgaagactaacccc-ttaccttagataaggatcaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcacccaattcttggttcttcaag 32466275  T
Q  240 ctctcc 245  Q
     |||||    
T  32466276 ttctcc 32466281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36982396 - 36982309
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |   |||   ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36982396 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagactaataccaacttaggcttcaatttagctcctcagctcactccaatc 36982309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 17204659 - 17204733
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  17204659 atgattatgatgaagactaacccccttactttaggttatgattaatccaaacttagacttcactttaactcctaa 17204733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Original strand, 21142203 - 21142276
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21142203 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 21142276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 270
Target Start/End: Original strand, 22275138 - 22275178
Alignment:
Q  230 attcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275138 attcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttc 22275178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7507789 - 7507715
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  | ||||||||| |||||||    
T  7507789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagtttcactttaactcctaa 7507715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5888578 - 5888505
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5888578 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaagcttcactttagctcctaa 5888505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14906386 - 14906309
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  14906386 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 14906309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 23820388 - 23820465
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  23820388 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 23820465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 270
Target Start/End: Original strand, 22284371 - 22284411
Alignment:
Q  230 attcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttc 270  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22284371 attcttcaagctctctctcttctctctaacccttgttcttc 22284411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 93
Target Start/End: Original strand, 20279610 - 20279688
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatt 93  Q
    ||||||||| | |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||    
T  20279610 catcaaattcatatacccaaacatatctctataacatgagcacgaatttcaacgattaagttcaccataatcacttatt 20279688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19689347 - 19689270
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19689347 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 19689270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17396599 - 17396519
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcac 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17396599 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggctttaatttagctcctaagctcac 17396519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Original strand, 20015328 - 20015403
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaag 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20015328 atgatcatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaag 20015403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23777994 - 23777920
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| ||| |||||  ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  23777994 atgattatgatgataactaacccctttaccttaggttatgatcaattcaaatttgagcttcactttagctcctaa 23777920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19794661 - 19794629
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19794661 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 19794629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20627270 - 20627238
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20627270 atgattatgataaagactaaccccgttacctta 20627238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1035 - 782
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1035 acatcaaattaacatattaaaacaaacctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 936  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  935 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 836  T
Q  214 gctcactccaat-cttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  835 gttcactccaatccttaattcttcaag------ttcttctctctaacccttgttcttctc 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17459 - 17208
Alignment:
Q  16 atcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcataga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17459 atcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcactaatttcaaagattgggttcatgataatcaattattctcataatcaattatgcataga 17360  T
Q  116 acaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagc 215  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |   | | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||     
T  17359 acaagagaaaaagaattacctaaatgattatgataaagactaacccgcttaccttagatggagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagt 17260  T
Q  216 tcactccaat-cttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  17259 tcactccaatccttaattcttcaag------ttcttctctctaacccttgttcttctc 17208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4504 - 4304
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4504 acatcaaattaacatatttaaacatatctctacaacataagcactaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 4405  T
Q  114 gaa-caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 212  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  4404 gaatgaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagtctaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttttgcttcactttagctccta 4305  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  4304 a 4304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 85 - 5
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15861483 - 15861327
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15861483 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 15861384  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861383 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 15861327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 21860209 - 21860366
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21860209 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagtacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 21860308  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21860309 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 21860366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 44035028 - 44034871
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44035028 acatcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataaacaagaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 44034929  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44034928 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 44034871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 20913335 - 20913468
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913335 atgattacgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 20913434  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20913435 tttctccctcttctctctaacccttgttcttctc 20913468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 20931650 - 20931783
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20931650 atgattatgataaaggctaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctgctaagctcactccaatcttgattattcaa 20931749  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20931750 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 20931783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 22367216 - 22367296
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367216 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 22367296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 171
Target Start/End: Original strand, 41218667 - 41218760
Alignment:
Q  78 atgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  41218667 atgagaatcacttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgatcatgatgaaaactaacccccttacctta 41218760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20893583 - 20893476
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20893583 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaattcttgattcttca 20893484  T
Q  238 agctctcc 245  Q
    || |||||    
T  20893483 agttctcc 20893476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37844406 - 37844275
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaat-cttgattcttca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  37844406 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaaaattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatccttagttcttca 37844307  T
Q  238 agctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    || ||||   |||||||| ||||||| ||||||||    
T  37844306 agttctc---cttctctcaaacccttattcttctc 37844275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Original strand, 20445987 - 20446074
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatc 226  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20445987 atgattatgataaagactaactcccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaagctcactccaatc 20446074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 226
Target Start/End: Original strand, 20531751 - 20531838
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatc 226  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20531751 atgattatgataaagactaatttccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttatctcctaagctcactccaatc 20531838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Original strand, 20254631 - 20254701
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctc 209  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||    
T  20254631 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctc 20254701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 45051726 - 45051803
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  45051726 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 45051803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 51452809 - 51452886
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  51452809 atgattaagataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 51452886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Original strand, 41394527 - 41394559
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394527 atgattatgataaagactaacccccttacctta 41394559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 80062 - 80219
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80062 acatcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacaaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 80161  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80162 gaacaagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 80219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 6140 - 5983
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6140 acatcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 6041  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6040 gaacaagagaaaaagaattaactatatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 5983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5923 - 5777
Alignment:
Q  25 acatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaa 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5923 acatattcaaacacatctctacaacagaagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaa 5824  T
Q  125 aaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5823 aaagaattaactatatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 5777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 162233 - 162078
Alignment:
Q  16 atcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcataga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162233 atcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcataga 162134  T
Q  116 acaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  162133 acaagagaaaaagaattaactagatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 162078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 166319 - 166164
Alignment:
Q  16 atcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcataga 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166319 atcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcataga 166220  T
Q  116 acaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  166219 acaagagaaaaagaattaactagatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 166164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 31337 - 31180
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31337 acatcaaattaacatattcaaacacatgtctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 31238  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31237 gaacaagagaaaatgaattaactaaatgattgtgataaaaactaacccccttacctta 31180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 41507 - 41664
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41507 acatcaaattaacatattcaaacacatgtctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 41606  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41607 gaacaagagaaaatgaattaactaaatgattgtgataaaaactaacccccttacctta 41664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36935
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 36935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 170
Target Start/End: Original strand, 130760 - 130911
Alignment:
Q  20 aattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-ca 118  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  130760 aattaacgtatccaaacatatctctacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatca 130859  T
Q  119 agagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 170  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130860 agagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 130911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 89410 - 89303
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  89410 atgatcatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaagctcactccaattcttgattcttca 89311  T
Q  238 agctctcc 245  Q
    || |||||    
T  89310 agttctcc 89303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 107740 - 107633
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  107740 atgatcatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaagctcactccaattcttgattcttca 107641  T
Q  238 agctctcc 245  Q
    || |||||    
T  107640 agttctcc 107633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Original strand, 30292 - 30449
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30292 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcatgaatttcaaagatagggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcata 30391  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  30392 gaacaagagaaaaataattaactaaatgattatgatgaaaaataacccccttacctta 30449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 48903 - 49036
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48903 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggctttactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 49002  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49003 tctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 49036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 61154 - 61084
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctc 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||| ||||||||||    
T  61154 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttaactttagctc 61084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 170
Target Start/End: Original strand, 42568 - 42708
Alignment:
Q  30 ttcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaaga 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42568 ttcaaccatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaaga 42667  T
Q  130 attaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 170  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42668 attaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctt 42708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 205
Target Start/End: Original strand, 13824 - 13890
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcacttta 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  13824 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcacttta 13890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 352
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  508 acatcaaattaacatattcaaatatatctctacaacataagcacaaatttcaaatattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcata 409  T
Q  114 gaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 171  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  408 gaacaagag-aaaagaattaactagatgattatgataaagaataaccccgttacctta 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 1430 - 1563
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1430 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcacaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 1529  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1530 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 1563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3540 - 3407
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3540 atgattatgacaaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 3441  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3440 gctctccctcttctctctaacccttgtttttctc 3407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 9183 - 9316
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9183 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 9282  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9283 gctctccctattctctctaacccttgttcttctc 9316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 146906 - 147039
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146906 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 147005  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147006 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 147039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Original strand, 149014 - 149090
Alignment:
Q  197 ttcactttagctcctaagctcactccaatcttga-ttcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149014 ttcactttagctcctaagctcactccaatctttagttcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 149090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Original strand, 9160 - 9261
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9160 atgattatgatgaagactaacacacttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaattcttgattcttca 9259  T
Q  238 ag 239  Q
    ||    
T  9260 ag 9261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 172210 - 172343
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172210 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 172309  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  172310 gctctcccttttctctctaacccttgttcttctc 172343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 177913 - 178046
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177913 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 178012  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  178013 gctctcccttttctctctaacccttgttcttctc 178046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 164903 - 164829
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| | |||  ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  164903 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaatttaagcttcactttagctcctaa 164829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 272330 - 272463
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  272330 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctgagctcactccaatcttgattctttaa 272429  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  272430 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12552
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatctt-gattcttca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12418 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatagagattaatcctaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatttttgattcttca 12517  T
Q  238 agctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12518 agctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 12552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36869 - 36733
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactt---tagctcctaagctcactccaatcttgattctt 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36869 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaataaagattaatcccaacttaggcttcacttctttagctcctaagctcactccaatcttgattctt 36770  T
Q  236 caagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36769 caagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 36733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 128127 - 127994
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  128127 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcattttatctcctaatctcactccaatcttgattcttcaa 128028  T
Q  239 gctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  128027 gctctccctcttctctctaactgttgttcttctc 127994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Original strand, 15147 - 15236
Alignment:
Q  14 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15147 acatcaaattaacatattcaaacatatctctacgacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatca 15236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 272
Target Start/End: Original strand, 15246 - 15325
Alignment:
Q  188 aacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaat-cttgattcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||       |||||||||||||| |||||||||||    
T  15246 aacttaggcttcaatttagctcctaagttcactccaatccttaattcttcaag------ttcttctctctaacctttgttcttctc 15325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 881
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  914 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 44170 - 44036
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatag 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  44170 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattaggttcacaataatcacttattcaaataatcacttatgcatag 44071  T
Q  115 aacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgat 149  Q
     | |||||| ||  ||||||| || ||||||||||    
T  44070 caaaagagagaagaaattaactaagtgattatgat 44036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 57427 - 57321
Alignment:
Q  136 caaatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattctt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  57427 caaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctactaagctcac-ccaatcttgattcct 57329  T
Q  236 caagctct 243  Q
    ||||||||    
T  57328 caagctct 57321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 123119 - 123018
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttca 237  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  123119 atgattatggtgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaattcttgattcttca 123020  T
Q  238 ag 239  Q
    ||    
T  123019 ag 123018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 51140 - 51009
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaat-cttgattcttca 237  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| | | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  51140 atgattatgataaagactaatctccttacctaagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatccttagttcttca 51041  T
Q  238 agctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  51040 agttctc---cttctctctaacccttgttcttctc 51009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 41965 - 42039
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41965 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 42039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Original strand, 305 - 384
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 94  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  305 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcaagaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattc 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 1557 - 1478
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 94  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  1557 catcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcatttattc 1478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26372 - 26244
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaat-cttgattcttca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | ||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26372 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccatcttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatccttaattcttca 26273  T
Q  238 agctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    ||       ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26272 ag------ttcttctctctaaccctttttcttctc 26244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Original strand, 12063 - 12166
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||     
T  12063 atgattatgatgaagactaacccccttatcttagataatgattaatccaaactttggcttcaatttagctcctaagcttaccccaat-ttgattcttcac 12161  T
Q  239 gctct 243  Q
    |||||    
T  12162 gctct 12166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8125 - 8051
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaaccccc-ttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctccta 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  8125 atgattatgatgaagactaaccccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcattttagctccta 8051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5508 - 5434
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5508 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaatcttaggcttcactttagctcctaa 5434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 49784 - 49710
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49784 atgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 49710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 244
Target Start/End: Original strand, 339 - 444
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaa-tcttgattcttcaa 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  339 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagaccaccccaattcttgattcttcaa 438  T
Q  239 gctctc 244  Q
    | ||||    
T  439 gttctc 444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 245
Target Start/End: Original strand, 25532 - 25637
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaag 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | | || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  25532 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcacctaattcttgattcttcaag 25631  T
Q  240 ctctcc 245  Q
     |||||    
T  25632 ttctcc 25637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 272
Target Start/End: Original strand, 42034 - 42165
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaat-cttgattcttca 237  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||   | ||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||  |||||||    
T  42034 atgattatgataaagaccaacccccttaccttagataaatattaatcccaacttagacttcaatttacctcctaagctcagtccaatccttagttcttca 42133  T
Q  238 agctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    || ||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  42134 agttctc---cttctctctaacccttgttcttctc 42165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 18026 - 18100
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18026 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttaactcctaa 18100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 5549 - 5623
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5549 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttgggcttcattttagctcctaa 5623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34340 - 34266
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34340 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcattttagctcctaa 34266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 217
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45416
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctc 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatggttaatccaaacttaggcttcaattaagctcctaagctc 45416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 217
Target Start/End: Original strand, 54724 - 54802
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctc 217  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  54724 atgattatgatgaagactaaccaccttaccttagataatggttaatccaaacttaagcttcaattaagctcctaagctc 54802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 95298 - 95372
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  95298 atgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaa 95372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 247398 - 247320
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  247398 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctc 247320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 34007
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | | | || | |||||   |||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||| ||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacgccaa--ttgattcctcaa 34010  T
Q  239 gct 241  Q
    |||    
T  34009 gct 34007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 56045 - 55942
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| | |||| |||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  56045 atgattatgatgaagactaaccccctgaccgtagataatgattaatccaaacttaggctttaatttatctcctaagttcaccccaat-ttgattcttcaa 55947  T
Q  239 gctct 243  Q
    |||||    
T  55946 gctct 55942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6142 - 6068
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6142 atgattatgtttaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 6068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9444 - 9370
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9444 atgattatgaagaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 9370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 3897 - 3785
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatct----ctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |    ||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||    
T  3897 catcaaattaacatactcaaacatatatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttggtttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgc 3798  T
Q  111 atagaacaagaga 123  Q
    |||||| ||||||    
T  3797 atagaaaaagaga 3785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9297 - 9223
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9297 atgattgtgataataactaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 9223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16195 - 16121
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16195 atgattgtgataataactaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 16121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12075 - 12002
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12075 tgattatgataataactaacccccttaccttagatgatgtttaattttaacttaggcttcactttagctcctaa 12002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34405 - 34331
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||  || |||  |||||||||||||||||||    
T  34405 atgattatgataataactaaccctcttaccttaggtaatgatcaattcaagcttgagcttcactttagctcctaa 34331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 22857 - 22934
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22857 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 22934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 27112 - 27189
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27112 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 27189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1451
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1528 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 1451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Original strand, 54182 - 54255
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  54182 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactatagctcctaa 54255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10288 - 10188
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 238  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| | ||| | || |  |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||||| ||||    
T  10288 atgattatgaagaagacaaacccccttaccttagatgatgattaaccccaacttaggcttcactttagctcataagcttaccccaa--ttgattcctcaa 10191  T
Q  239 gct 241  Q
    |||    
T  10190 gct 10188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 6024 - 5989
Alignment:
Q  137 aaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6024 aaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 5989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7127 - 7053
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| | |||  ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7127 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaatttaagcttcactttagctcctaa 7053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 48504 - 48578
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  48504 atgattatgaagaagactaacccccttacattaggttatgattaattcaaatttgggcttcactttagctcctaa 48578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 272
Target Start/End: Original strand, 20585 - 20624
Alignment:
Q  230 attcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  20585 attcttcaagctc---ctcttctctctaacccttgttcttctc 20624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 216
Target Start/End: Original strand, 5846 - 5923
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagct 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5846 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagct 5923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Original strand, 7517 - 7590
Alignment:
Q  140 tgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||| | ||| | ||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  7517 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaactaaagcttcactttagctcctaa 7590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Original strand, 3743 - 3799
Alignment:
Q  157 aacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    |||||| ||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3743 aaccccattaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 3799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 66
Target Start/End: Original strand, 6082 - 6133
Alignment:
Q  15 catcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaa 66  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  6082 catcaatttaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaa 6133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 213
Target Start/End: Original strand, 3505 - 3578
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 213  Q
    ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| | ||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3505 atgattatgaggaagaataacccc-ttaccttagatgatgattaattcaaacttaggcttcactttagctcctaa 3578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17208
Alignment:
Q  139 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 17208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19789 - 19750
Alignment:
Q  230 attcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  19789 attcttcaagctc---ctcttctctctaacccttgttcttctc 19750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24093 - 24054
Alignment:
Q  230 attcttcaagctctccctcttctctctaacccttgttcttctc 272  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  24093 attcttcaagctc---ctcttctctctaacccttgttcttctc 24054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University