View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7075_low_2 (Length: 523)

Name: NF7075_low_2
Description: NF7075
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7075_low_2
NF7075_low_2
[»] chr8 (69 HSPs)
chr8 (36-329)||(43849018-43849312)
chr8 (36-298)||(8436335-8436597)
chr8 (220-410)||(28716624-28716815)
chr8 (136-404)||(24652234-24652503)
chr8 (227-410)||(28709267-28709451)
chr8 (223-404)||(22877923-22878105)
chr8 (220-405)||(45141450-45141635)
chr8 (220-407)||(40223079-40223266)
chr8 (227-404)||(17081620-17081798)
chr8 (220-408)||(6338280-6338469)
chr8 (220-404)||(31478042-31478227)
chr8 (220-384)||(31581680-31581845)
chr8 (135-404)||(11297950-11298221)
chr8 (220-401)||(17115507-17115689)
chr8 (220-385)||(44827312-44827478)
chr8 (220-384)||(8270892-8271057)
chr8 (220-384)||(25023292-25023457)
chr8 (220-384)||(36681442-36681607)
chr8 (220-404)||(38171422-38171607)
chr8 (220-404)||(42142730-42142915)
chr8 (227-405)||(37587720-37587900)
chr8 (227-404)||(32099502-32099681)
chr8 (220-401)||(32541192-32541374)
chr8 (220-404)||(37560524-37560709)
chr8 (220-384)||(39702292-39702457)
chr8 (220-401)||(36590105-36590287)
chr8 (220-404)||(10618773-10618957)
chr8 (220-404)||(16422796-16422980)
chr8 (220-384)||(39871251-39871415)
chr8 (220-370)||(27781102-27781253)
chr8 (220-404)||(23676837-23677023)
chr8 (227-361)||(31688052-31688187)
chr8 (220-370)||(39320061-39320212)
chr8 (204-329)||(41693885-41694011)
chr8 (227-404)||(1893843-1894022)
chr8 (218-327)||(44157240-44157350)
chr8 (227-327)||(36112843-36112944)
chr8 (210-306)||(2642403-2642499)
chr8 (231-404)||(16831500-16831666)
chr8 (227-329)||(41313416-41313519)
chr8 (227-329)||(43276773-43276876)
chr8 (220-306)||(11741098-11741184)
chr8 (222-404)||(7378821-7378997)
chr8 (227-407)||(34395348-34395531)
chr8 (227-388)||(9210968-9211130)
chr8 (224-312)||(39746938-39747026)
chr8 (220-306)||(3511283-3511369)
chr8 (192-282)||(39677445-39677535)
chr8 (162-313)||(13970033-13970177)
chr8 (220-313)||(35243347-35243440)
chr8 (227-329)||(3427623-3427726)
chr8 (155-298)||(29189656-29189799)
chr8 (224-312)||(40551868-40551955)
chr8 (219-298)||(38780734-38780813)
chr8 (225-298)||(2855155-2855228)
chr8 (210-291)||(9370301-9370382)
chr8 (222-290)||(44263388-44263456)
chr8 (226-327)||(1363793-1363895)
chr8 (220-306)||(22957374-22957460)
chr8 (224-302)||(26036979-26037057)
chr8 (220-281)||(40045489-40045551)
chr8 (227-282)||(42203405-42203460)
chr8 (224-282)||(13888330-13888388)
chr8 (237-298)||(26293840-26293901)
chr8 (237-298)||(26307097-26307158)
chr8 (151-229)||(18410959-18411037)
chr8 (220-281)||(10651115-10651176)
chr8 (230-282)||(44318319-44318371)
chr8 (173-243)||(5320485-5320555)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (227-515)||(17192452-17192740)
chr7 (36-298)||(791148-791414)
chr7 (220-404)||(40258824-40259009)
chr7 (135-399)||(44743689-44743955)
chr7 (177-384)||(44596597-44596805)
chr7 (220-384)||(42587386-42587551)
chr7 (220-384)||(43254090-43254255)
chr7 (220-384)||(45686919-45687084)
chr7 (177-404)||(482942-483169)
chr7 (220-401)||(36246379-36246560)
chr7 (220-384)||(10312032-10312197)
chr7 (224-384)||(21254704-21254865)
chr7 (227-404)||(21313799-21313979)
chr7 (220-404)||(40637163-40637348)
chr7 (177-404)||(36407195-36407423)
chr7 (220-404)||(48313427-48313611)
chr7 (177-404)||(43134372-43134599)
chr7 (192-404)||(47470937-47471149)
chr7 (220-386)||(9487392-9487559)
chr7 (220-374)||(33203671-33203826)
chr7 (227-388)||(42375793-42375954)
chr7 (227-388)||(47587115-47587276)
chr7 (220-383)||(21374621-21374785)
chr7 (155-329)||(27655611-27655786)
chr7 (220-409)||(45222076-45222259)
chr7 (192-329)||(1342818-1342956)
chr7 (220-370)||(27089659-27089810)
chr7 (220-370)||(27188491-27188642)
chr7 (220-370)||(31511301-31511452)
chr7 (220-329)||(33026918-33027028)
chr7 (220-404)||(40106008-40106186)
chr7 (220-404)||(21741938-21742124)
chr7 (267-404)||(32168800-32168938)
chr7 (135-404)||(49148298-49148571)
chr7 (220-370)||(35587580-35587731)
chr7 (155-360)||(17844555-17844761)
chr7 (231-381)||(48620448-48620598)
chr7 (231-404)||(36436121-36436294)
chr7 (220-329)||(34709275-34709385)
chr7 (220-329)||(48832056-48832166)
chr7 (404-516)||(17186746-17186858)
chr7 (220-329)||(12345070-12345180)
chr7 (220-329)||(48590756-48590866)
chr7 (220-404)||(46879527-46879713)
chr7 (227-329)||(19832000-19832103)
chr7 (192-295)||(36612086-36612189)
chr7 (203-298)||(40893446-40893541)
chr7 (231-361)||(38481290-38481421)
chr7 (155-312)||(23029850-23030007)
chr7 (204-360)||(9485727-9485884)
chr7 (136-328)||(38531100-38531294)
chr7 (225-329)||(11466047-11466152)
chr7 (201-298)||(19757500-19757597)
chr7 (244-403)||(21316611-21316764)
chr7 (225-329)||(46757752-46757857)
chr7 (220-312)||(28425614-28425706)
chr7 (162-288)||(24170860-24170985)
chr7 (146-251)||(33609058-33609163)
chr7 (225-298)||(35000786-35000859)
chr7 (260-312)||(24170804-24170856)
chr7 (225-298)||(27869570-27869643)
chr7 (218-298)||(22621459-22621539)
chr7 (225-312)||(22642259-22642346)
chr7 (223-298)||(21740152-21740226)
chr7 (227-281)||(39698930-39698984)
chr7 (225-279)||(45672387-45672441)
chr7 (162-250)||(30699575-30699663)
chr7 (228-290)||(39229965-39230027)
chr7 (356-404)||(48590534-48590582)
[»] chr3 (97 HSPs)
chr3 (36-361)||(193407-193726)
chr3 (36-297)||(5506704-5506961)
chr3 (223-404)||(33391870-33392052)
chr3 (192-410)||(2579899-2580118)
chr3 (220-410)||(29081281-29081472)
chr3 (220-404)||(19948318-19948503)
chr3 (220-404)||(44845591-44845776)
chr3 (220-404)||(16127139-16127324)
chr3 (220-404)||(26540927-26541112)
chr3 (220-404)||(45345008-45345192)
chr3 (220-386)||(24536554-24536721)
chr3 (220-410)||(38185732-38185922)
chr3 (220-401)||(49853043-49853225)
chr3 (220-404)||(35499569-35499753)
chr3 (177-404)||(52166047-52166275)
chr3 (210-409)||(52857858-52858058)
chr3 (220-405)||(28676890-28677076)
chr3 (220-401)||(40563363-40563545)
chr3 (220-384)||(37088271-37088436)
chr3 (220-404)||(37528723-37528908)
chr3 (135-410)||(2121789-2122065)
chr3 (220-410)||(50499724-50499914)
chr3 (204-370)||(52794896-52795063)
chr3 (224-405)||(38891990-38892171)
chr3 (227-407)||(8872837-8873018)
chr3 (220-384)||(25570366-25570531)
chr3 (227-406)||(46318766-46318947)
chr3 (220-360)||(29718201-29718341)
chr3 (177-404)||(46972000-46972228)
chr3 (227-409)||(46247971-46248153)
chr3 (220-370)||(55305109-55305260)
chr3 (220-353)||(2851835-2851969)
chr3 (227-404)||(44748793-44748970)
chr3 (227-404)||(48378193-48378371)
chr3 (227-387)||(21707135-21707296)
chr3 (162-313)||(44947143-44947294)
chr3 (210-404)||(12063718-12063913)
chr3 (155-327)||(51709055-51709229)
chr3 (409-516)||(11366724-11366831)
chr3 (227-401)||(40480028-40480203)
chr3 (224-329)||(4240320-4240426)
chr3 (220-329)||(47897606-47897716)
chr3 (220-410)||(54672180-54672370)
chr3 (222-398)||(42465029-42465206)
chr3 (409-516)||(11375432-11375539)
chr3 (409-516)||(11385270-11385377)
chr3 (404-515)||(11391316-11391427)
chr3 (227-361)||(39876624-39876759)
chr3 (220-370)||(50317029-50317180)
chr3 (220-361)||(24628199-24628341)
chr3 (227-327)||(48943033-48943134)
chr3 (150-329)||(20450500-20450680)
chr3 (220-323)||(21603846-21603950)
chr3 (224-327)||(30864470-30864574)
chr3 (224-404)||(45368577-45368758)
chr3 (220-327)||(52225329-52225437)
chr3 (224-327)||(53779075-53779179)
chr3 (227-329)||(37713972-37714075)
chr3 (227-329)||(43525785-43525888)
chr3 (135-305)||(42497061-42497231)
chr3 (227-323)||(41246297-41246394)
chr3 (226-325)||(30548790-30548890)
chr3 (220-327)||(46627497-46627605)
chr3 (227-329)||(42217705-42217808)
chr3 (266-404)||(41785776-41785915)
chr3 (227-298)||(37489931-37490002)
chr3 (218-312)||(32026407-32026501)
chr3 (220-298)||(45693386-45693464)
chr3 (224-313)||(51003306-51003395)
chr3 (218-298)||(29203025-29203105)
chr3 (231-325)||(54541946-54542041)
chr3 (222-304)||(41518429-41518511)
chr3 (267-404)||(44545198-44545335)
chr3 (231-325)||(30814261-30814356)
chr3 (222-327)||(7041105-7041211)
chr3 (231-312)||(52595345-52595426)
chr3 (225-306)||(52868184-52868265)
chr3 (260-384)||(47173555-47173680)
chr3 (337-407)||(45693524-45693594)
chr3 (225-298)||(2598669-2598742)
chr3 (225-329)||(33897898-33898003)
chr3 (267-370)||(39469914-39470018)
chr3 (224-298)||(22257727-22257801)
chr3 (224-325)||(27446473-27446575)
chr3 (309-404)||(51950323-51950418)
chr3 (225-399)||(35100160-35100328)
chr3 (267-325)||(43740325-43740384)
chr3 (288-400)||(52931200-52931314)
chr3 (156-298)||(25146387-25146529)
chr3 (155-298)||(37713074-37713218)
chr3 (201-251)||(44895985-44896035)
chr3 (227-281)||(52931152-52931206)
chr3 (337-386)||(24536807-24536856)
chr3 (193-257)||(42527967-42528031)
chr3 (201-257)||(43968271-43968327)
chr3 (227-298)||(39719427-39719498)
chr3 (229-294)||(32982921-32982986)
[»] chr2 (81 HSPs)
chr2 (36-298)||(5519876-5520138)
chr2 (142-404)||(26911476-26911739)
chr2 (220-407)||(3377354-3377541)
chr2 (220-404)||(16486847-16487031)
chr2 (220-404)||(650772-650956)
chr2 (218-385)||(8815196-8815364)
chr2 (220-406)||(8688954-8689140)
chr2 (220-401)||(4453515-4453697)
chr2 (220-404)||(2266144-2266328)
chr2 (220-404)||(9886957-9887141)
chr2 (220-407)||(13111734-13111923)
chr2 (220-384)||(36712528-36712693)
chr2 (220-384)||(41322740-41322905)
chr2 (218-401)||(38578998-38579182)
chr2 (227-381)||(4385524-4385679)
chr2 (220-409)||(37356128-37356318)
chr2 (227-404)||(5039739-5039917)
chr2 (220-404)||(21865210-21865396)
chr2 (220-401)||(28382672-28382854)
chr2 (220-404)||(2546316-2546501)
chr2 (220-404)||(36999454-36999638)
chr2 (218-360)||(7400381-7400524)
chr2 (223-403)||(6232275-6232456)
chr2 (220-404)||(8339943-8340128)
chr2 (220-404)||(40024934-40025119)
chr2 (155-361)||(38842842-38843049)
chr2 (227-404)||(6760603-6760781)
chr2 (161-298)||(25071441-25071578)
chr2 (220-361)||(39167758-39167900)
chr2 (227-388)||(43135597-43135759)
chr2 (223-361)||(10393030-10393169)
chr2 (224-374)||(15521473-15521624)
chr2 (220-329)||(24402044-24402154)
chr2 (227-404)||(41796741-41796919)
chr2 (220-370)||(43507554-43507705)
chr2 (220-404)||(10839572-10839756)
chr2 (177-403)||(38880731-38880959)
chr2 (220-329)||(17263745-17263855)
chr2 (220-329)||(29514872-29514982)
chr2 (227-361)||(40869358-40869493)
chr2 (227-388)||(4038339-4038501)
chr2 (173-298)||(4055961-4056086)
chr2 (164-311)||(15250163-15250310)
chr2 (224-386)||(13527900-13528063)
chr2 (227-329)||(43285657-43285760)
chr2 (227-361)||(31616385-31616520)
chr2 (135-318)||(2047227-2047411)
chr2 (220-325)||(8070612-8070718)
chr2 (266-404)||(18212084-18212223)
chr2 (227-327)||(42132708-42132809)
chr2 (177-406)||(44275625-44275854)
chr2 (162-313)||(2221445-2221596)
chr2 (220-386)||(10727812-10727979)
chr2 (225-298)||(16669123-16669196)
chr2 (177-298)||(23356933-23357054)
chr2 (225-298)||(24019957-24020030)
chr2 (231-306)||(7213664-7213739)
chr2 (337-406)||(6153558-6153627)
chr2 (222-302)||(598958-599038)
chr2 (220-323)||(9053122-9053226)
chr2 (231-298)||(2758902-2758969)
chr2 (156-295)||(7823475-7823614)
chr2 (225-297)||(6222636-6222708)
chr2 (227-285)||(18710254-18710312)
chr2 (227-302)||(34884877-34884952)
chr2 (309-384)||(18710174-18710249)
chr2 (225-287)||(41877821-41877883)
chr2 (227-285)||(7569850-7569908)
chr2 (166-231)||(3337198-3337263)
chr2 (225-270)||(6807492-6807537)
chr2 (227-271)||(13351603-13351647)
chr2 (222-298)||(39675090-39675166)
chr2 (196-247)||(10818420-10818471)
chr2 (220-251)||(18212224-18212255)
chr2 (227-302)||(37674486-37674561)
chr2 (220-294)||(44525925-44525998)
chr2 (273-302)||(2757282-2757311)
chr2 (198-231)||(24020017-24020050)
chr2 (340-392)||(13564523-13564575)
chr2 (155-231)||(13761887-13761963)
chr2 (201-257)||(43496286-43496342)
[»] chr4 (115 HSPs)
chr4 (37-298)||(30562669-30562922)
chr4 (36-298)||(52707812-52708072)
chr4 (220-404)||(4517187-4517372)
chr4 (220-404)||(12233963-12234148)
chr4 (220-410)||(19513878-19514068)
chr4 (220-409)||(7706330-7706520)
chr4 (220-404)||(8829811-8829996)
chr4 (220-404)||(42116859-42117044)
chr4 (220-404)||(53407153-53407337)
chr4 (177-407)||(37970255-37970485)
chr4 (220-407)||(56372396-56372583)
chr4 (220-410)||(28307212-28307403)
chr4 (231-413)||(35777393-35777576)
chr4 (220-409)||(8941863-8942052)
chr4 (220-404)||(11600646-11600831)
chr4 (220-404)||(18582808-18582992)
chr4 (220-404)||(31338496-31338683)
chr4 (177-384)||(22892511-22892719)
chr4 (177-384)||(22944175-22944383)
chr4 (177-404)||(55764523-55764750)
chr4 (220-384)||(46895266-46895431)
chr4 (220-370)||(4939382-4939532)
chr4 (227-404)||(37115286-37115463)
chr4 (220-401)||(45906105-45906287)
chr4 (227-384)||(55495883-55496041)
chr4 (220-404)||(22038353-22038538)
chr4 (220-409)||(9043606-9043796)
chr4 (220-370)||(11151935-11152086)
chr4 (220-399)||(15635910-15636090)
chr4 (220-370)||(27397762-27397913)
chr4 (204-370)||(29413528-29413695)
chr4 (220-374)||(52669987-52670142)
chr4 (192-328)||(35190584-35190721)
chr4 (231-404)||(47417482-47417656)
chr4 (227-404)||(55828967-55829145)
chr4 (220-404)||(4392722-4392906)
chr4 (218-329)||(5465404-5465516)
chr4 (220-327)||(25440480-25440588)
chr4 (224-384)||(39087558-39087719)
chr4 (207-329)||(9031978-9032101)
chr4 (220-363)||(21369884-21370028)
chr4 (155-298)||(21633747-21633890)
chr4 (220-329)||(23867865-23867975)
chr4 (227-404)||(43225680-43225858)
chr4 (220-329)||(55856523-55856633)
chr4 (222-407)||(25235105-25235291)
chr4 (192-328)||(26826560-26826697)
chr4 (162-282)||(24954159-24954279)
chr4 (227-404)||(31678939-31679110)
chr4 (220-329)||(3009749-3009859)
chr4 (220-370)||(4355588-4355739)
chr4 (218-312)||(22430691-22430785)
chr4 (216-306)||(27185624-27185714)
chr4 (220-329)||(33115013-33115123)
chr4 (224-402)||(35822299-35822478)
chr4 (155-312)||(23113407-23113564)
chr4 (227-384)||(35580948-35581106)
chr4 (220-328)||(55358334-55358443)
chr4 (227-370)||(29663926-29664070)
chr4 (230-328)||(37831961-37832060)
chr4 (220-370)||(35468012-35468163)
chr4 (227-304)||(44525701-44525778)
chr4 (177-328)||(56270044-56270196)
chr4 (220-329)||(4391704-4391814)
chr4 (223-327)||(23162641-23162747)
chr4 (224-386)||(44442063-44442225)
chr4 (284-404)||(29656598-29656719)
chr4 (220-327)||(30366142-30366250)
chr4 (220-312)||(51011061-51011153)
chr4 (227-329)||(11050355-11050458)
chr4 (142-312)||(43078113-43078284)
chr4 (225-306)||(20148803-20148884)
chr4 (225-298)||(20511479-20511552)
chr4 (260-407)||(53273078-53273226)
chr4 (225-298)||(42085723-42085796)
chr4 (222-295)||(55684768-55684841)
chr4 (232-302)||(50502306-50502376)
chr4 (192-327)||(36486353-36486489)
chr4 (225-304)||(4465472-4465551)
chr4 (227-298)||(33005111-33005182)
chr4 (227-298)||(40497399-40497470)
chr4 (338-404)||(19169165-19169231)
chr4 (227-285)||(45780760-45780818)
chr4 (192-298)||(52713564-52713670)
chr4 (225-298)||(36196944-36197017)
chr4 (225-298)||(37047099-37047172)
chr4 (225-298)||(48056607-48056680)
chr4 (309-405)||(25199382-25199478)
chr4 (191-282)||(40119906-40119997)
chr4 (220-282)||(42124675-42124737)
chr4 (225-282)||(17715650-17715707)
chr4 (260-373)||(29656729-29656843)
chr4 (220-281)||(36008014-36008075)
chr4 (274-370)||(33005178-33005275)
chr4 (340-404)||(45520071-45520135)
chr4 (227-298)||(31953225-31953296)
chr4 (218-305)||(32948177-32948264)
chr4 (135-257)||(35842519-35842642)
chr4 (203-313)||(48977863-48977974)
chr4 (155-281)||(3932180-3932306)
chr4 (225-298)||(31435076-31435149)
chr4 (225-298)||(32101736-32101809)
chr4 (309-405)||(45780823-45780919)
chr4 (227-278)||(53224317-53224368)
chr4 (223-297)||(37337710-37337784)
chr4 (367-408)||(53224210-53224251)
chr4 (210-249)||(1768544-1768583)
chr4 (337-408)||(40528363-40528433)
chr4 (220-251)||(53274813-53274844)
chr4 (267-324)||(35842638-35842696)
chr4 (225-291)||(38048878-38048944)
chr4 (227-297)||(41864083-41864153)
chr4 (225-298)||(8716919-8716992)
chr4 (224-281)||(49239219-49239276)
chr4 (220-256)||(20530799-20530835)
[»] chr1 (93 HSPs)
chr1 (220-404)||(1507723-1507909)
chr1 (192-405)||(30774055-30774264)
chr1 (220-405)||(44909810-44909995)
chr1 (220-404)||(15313214-15313398)
chr1 (220-401)||(19898888-19899070)
chr1 (220-405)||(36838675-36838861)
chr1 (216-399)||(3660920-3661104)
chr1 (225-404)||(47134516-47134695)
chr1 (225-411)||(13121569-13121755)
chr1 (227-409)||(17046694-17046877)
chr1 (220-409)||(31150405-31150594)
chr1 (220-409)||(42064297-42064486)
chr1 (220-384)||(2497912-2498077)
chr1 (220-384)||(29586148-29586313)
chr1 (220-388)||(38676475-38676644)
chr1 (224-406)||(26204243-26204425)
chr1 (135-403)||(36043194-36043465)
chr1 (220-401)||(1917999-1918180)
chr1 (220-405)||(33524497-33524683)
chr1 (177-405)||(34319358-34319587)
chr1 (220-401)||(36301085-36301265)
chr1 (227-410)||(39826564-39826748)
chr1 (220-405)||(30721603-30721790)
chr1 (227-404)||(7710941-7711119)
chr1 (227-388)||(25601972-25602134)
chr1 (220-404)||(15348794-15348979)
chr1 (224-384)||(17499869-17500030)
chr1 (220-404)||(32368319-32368504)
chr1 (162-313)||(7781086-7781237)
chr1 (220-401)||(29704064-29704246)
chr1 (220-327)||(3270705-3270813)
chr1 (155-329)||(29374375-29374550)
chr1 (156-329)||(3391165-3391339)
chr1 (220-370)||(50351036-50351187)
chr1 (220-327)||(322912-323020)
chr1 (224-404)||(26843721-26843902)
chr1 (227-329)||(38967451-38967554)
chr1 (220-371)||(49220453-49220605)
chr1 (220-328)||(37703716-37703825)
chr1 (192-304)||(41004945-41005057)
chr1 (135-328)||(37672244-37672439)
chr1 (220-327)||(22098965-22099073)
chr1 (220-327)||(50171277-50171385)
chr1 (162-298)||(52703033-52703169)
chr1 (220-328)||(46369853-46369959)
chr1 (215-328)||(5697523-5697637)
chr1 (227-406)||(18347403-18347582)
chr1 (218-312)||(34318469-34318563)
chr1 (220-321)||(43727074-43727176)
chr1 (135-327)||(49185079-49185273)
chr1 (224-409)||(51422968-51423155)
chr1 (267-404)||(2479131-2479268)
chr1 (155-312)||(49822082-49822239)
chr1 (220-357)||(40887898-40888030)
chr1 (155-282)||(16085526-16085653)
chr1 (227-361)||(49240268-49240403)
chr1 (267-384)||(33561922-33562040)
chr1 (225-329)||(34087011-34087116)
chr1 (222-326)||(42614117-42614222)
chr1 (227-327)||(50540819-50540920)
chr1 (220-327)||(39583143-39583251)
chr1 (192-298)||(8221187-8221293)
chr1 (192-294)||(33151975-33152077)
chr1 (218-298)||(13570771-13570851)
chr1 (224-304)||(36379130-36379210)
chr1 (218-324)||(9769951-9770058)
chr1 (225-327)||(25134895-25134998)
chr1 (260-327)||(28429076-28429144)
chr1 (227-326)||(30495182-30495282)
chr1 (337-404)||(7024813-7024880)
chr1 (227-285)||(7024913-7024971)
chr1 (220-298)||(46928964-46929042)
chr1 (225-306)||(44956347-44956428)
chr1 (210-302)||(28868981-28869073)
chr1 (204-312)||(46087964-46088072)
chr1 (210-281)||(9894931-9895002)
chr1 (226-285)||(40935893-40935952)
chr1 (231-329)||(44718962-44719061)
chr1 (142-279)||(6814123-6814261)
chr1 (225-298)||(46056411-46056484)
chr1 (227-279)||(9169151-9169203)
chr1 (227-295)||(40719554-40719622)
chr1 (309-409)||(9169043-9169143)
chr1 (201-298)||(912730-912827)
chr1 (220-285)||(33632328-33632393)
chr1 (225-304)||(42963899-42963978)
chr1 (225-298)||(10628814-10628887)
chr1 (204-268)||(50940120-50940184)
chr1 (220-251)||(2479270-2479301)
chr1 (220-251)||(33561889-33561920)
chr1 (142-251)||(12891648-12891758)
chr1 (193-257)||(2459557-2459621)
chr1 (347-395)||(42614247-42614295)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (220-410)||(30811144-30811335)
chr6 (220-409)||(12297326-12297516)
chr6 (204-401)||(34232894-34233092)
chr6 (216-384)||(2442411-2442580)
chr6 (220-401)||(32731728-32731910)
chr6 (177-401)||(7317563-7317788)
chr6 (220-404)||(14227531-14227715)
chr6 (227-401)||(31100017-31100192)
chr6 (224-401)||(20804960-20805137)
chr6 (173-313)||(21894310-21894450)
chr6 (220-329)||(558402-558512)
chr6 (227-361)||(33453745-33453880)
chr6 (233-406)||(31451962-31452136)
chr6 (227-403)||(3636643-3636819)
chr6 (220-402)||(5942957-5943143)
chr6 (227-370)||(10856133-10856277)
chr6 (155-312)||(12140809-12140966)
chr6 (220-328)||(12432616-12432725)
chr6 (224-370)||(34685015-34685161)
chr6 (220-323)||(2970722-2970826)
chr6 (218-329)||(28076464-28076576)
chr6 (135-328)||(33540635-33540830)
chr6 (220-329)||(5681561-5681671)
chr6 (155-328)||(34439725-34439899)
chr6 (218-404)||(3107999-3108180)
chr6 (155-312)||(5301532-5301689)
chr6 (220-404)||(29414919-29415091)
chr6 (210-361)||(6709681-6709833)
chr6 (260-405)||(1806350-1806495)
chr6 (225-311)||(6104671-6104757)
chr6 (218-325)||(31049379-31049487)
chr6 (218-328)||(11015632-11015743)
chr6 (201-404)||(34903926-34904117)
chr6 (156-298)||(15591082-15591224)
chr6 (162-298)||(20563467-20563603)
chr6 (220-371)||(29823031-29823183)
chr6 (156-329)||(7292480-7292654)
chr6 (192-282)||(11443035-11443125)
chr6 (210-311)||(9896766-9896867)
chr6 (227-298)||(23648267-23648338)
chr6 (192-298)||(32563210-32563317)
chr6 (225-295)||(5893894-5893964)
chr6 (218-270)||(19415382-19415434)
chr6 (234-298)||(26561423-26561487)
chr6 (230-327)||(1225475-1225573)
[»] chr5 (75 HSPs)
chr5 (220-410)||(36685776-36685967)
chr5 (220-401)||(8023970-8024152)
chr5 (224-404)||(12774542-12774723)
chr5 (220-404)||(14647343-14647527)
chr5 (220-384)||(30299684-30299849)
chr5 (177-404)||(1174750-1174978)
chr5 (220-387)||(6603896-6604064)
chr5 (220-407)||(32382812-32383000)
chr5 (220-405)||(2236502-2236688)
chr5 (224-404)||(12713278-12713459)
chr5 (220-404)||(19525715-19525900)
chr5 (224-404)||(30412602-30412783)
chr5 (220-384)||(31168973-31169138)
chr5 (227-402)||(3669509-3669685)
chr5 (220-404)||(13228459-13228643)
chr5 (218-401)||(24793941-24794125)
chr5 (210-411)||(30774168-30774370)
chr5 (220-404)||(5591555-5591739)
chr5 (220-404)||(39744528-39744712)
chr5 (177-404)||(10697235-10697463)
chr5 (220-410)||(35639901-35640091)
chr5 (227-404)||(4221466-4221643)
chr5 (220-361)||(26699092-26699234)
chr5 (220-361)||(26968825-26968967)
chr5 (220-404)||(1711189-1711374)
chr5 (220-384)||(39275409-39275574)
chr5 (218-405)||(19956292-19956478)
chr5 (220-387)||(32381660-32381828)
chr5 (227-394)||(6893372-6893539)
chr5 (227-370)||(39246830-39246973)
chr5 (220-384)||(3037411-3037576)
chr5 (156-384)||(3670264-3670493)
chr5 (220-409)||(5997880-5998063)
chr5 (195-329)||(11062868-11063003)
chr5 (155-329)||(19347747-19347922)
chr5 (220-329)||(9160678-9160788)
chr5 (210-403)||(35236643-35236838)
chr5 (220-328)||(27130375-27130484)
chr5 (220-328)||(35235713-35235822)
chr5 (220-361)||(43402453-43402595)
chr5 (224-384)||(11663881-11664042)
chr5 (227-407)||(13156879-13157060)
chr5 (220-363)||(2178767-2178911)
chr5 (227-374)||(2671410-2671558)
chr5 (220-407)||(15443419-15443607)
chr5 (220-329)||(5381930-5382040)
chr5 (220-329)||(22977191-22977301)
chr5 (220-404)||(12363598-12363783)
chr5 (227-384)||(29392100-29392257)
chr5 (223-328)||(4379300-4379406)
chr5 (220-325)||(15530480-15530586)
chr5 (220-328)||(7651682-7651791)
chr5 (161-298)||(16474844-16474981)
chr5 (220-328)||(36027977-36028086)
chr5 (204-327)||(5521341-5521465)
chr5 (227-384)||(9587179-9587338)
chr5 (225-329)||(648572-648677)
chr5 (155-298)||(11100690-11100826)
chr5 (225-298)||(13936265-13936338)
chr5 (215-282)||(4657582-4657649)
chr5 (223-325)||(9627143-9627246)
chr5 (218-404)||(23920424-23920610)
chr5 (309-404)||(25872284-25872379)
chr5 (220-302)||(4875713-4875795)
chr5 (216-282)||(6349429-6349495)
chr5 (225-298)||(13921798-13921871)
chr5 (225-312)||(2497622-2497709)
chr5 (224-298)||(27005844-27005918)
chr5 (218-278)||(42323591-42323651)
chr5 (224-298)||(32321652-32321726)
chr5 (218-302)||(31407991-31408074)
chr5 (224-299)||(11780117-11780192)
chr5 (155-305)||(6280376-6280526)
chr5 (227-285)||(25872221-25872279)
chr5 (376-404)||(5521278-5521306)
[»] scaffold1632 (1 HSPs)
scaffold1632 (210-404)||(22-217)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (220-404)||(22561-22746)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (220-404)||(126755-126939)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (220-404)||(12712-12897)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (220-404)||(28071-28265)
scaffold0197 (227-360)||(30179-30313)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (135-327)||(63887-64081)
scaffold0011 (362-407)||(63821-63866)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (220-353)||(431275-431409)
scaffold0002 (201-298)||(119215-119312)
[»] scaffold0246 (1 HSPs)
scaffold0246 (220-404)||(7024-7208)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (218-329)||(192054-192166)
[»] scaffold1173 (1 HSPs)
scaffold1173 (404-503)||(2064-2163)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (227-329)||(53023-53126)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (203-298)||(72743-72838)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (220-306)||(93381-93467)
scaffold0016 (225-298)||(84329-84402)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (260-404)||(27169-27315)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (227-328)||(5451-5552)
[»] scaffold0027 (2 HSPs)
scaffold0027 (220-285)||(41760-41825)
scaffold0027 (309-404)||(41830-41924)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (227-298)||(4565-4636)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (225-296)||(9305-9376)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (216-298)||(10836-10918)
[»] scaffold1360 (1 HSPs)
scaffold1360 (155-281)||(1175-1301)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (218-312)||(8956-9049)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (173-231)||(11855-11913)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 69)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 36 - 329
Target Start/End: Original strand, 43849018 - 43849312
Alignment:
Q  36 ttgtatgtatcttatactgaacaatggtttcgtggtagagattcaaccattgtaagcttaatcgtgtgtacatgtagatgtagcatcgtttttgttttgt 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43849018 ttgtatgtatcttatattgaacaatggtttcgtggtagagattcaaccattgtaagcttaatcgtgtgtacatgtagatgtagcatcgtttttgttttgt 43849117  T
Q  136 tttaaattataataaaattaattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43849118 tttaaattataataaaattaattattaagggtaaacatgggttttggttaaagtggtaagggtataaatggaataaaacatgataagctataagctataa 43849217  T
Q  236 gctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc-atggagaaaagtgttaccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || | |||| ||||||||||||||||    
T  43849218 gctcaaacgctacttgtaatagcatctgaaaaatagcttataagctcataaaataagctataagctcgttgtaaaaaattgttaccaaacagagc 43849312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 36 - 298
Target Start/End: Original strand, 8436335 - 8436597
Alignment:
Q  36 ttgtatgtatcttatactgaacaatggtttcgtggtagagattcaaccattgtaagcttaatcgtgtgtacatgtagatgtagcatcgtttttgttttgt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8436335 ttgtatgtatcttatactgaacaatggcttcgtggtagagattcaaccattgtaagcttaatcgtgtgtacatgtagatgtagcatcgtttttgttttgt 8436434  T
Q  136 tttaaattataataaaattaattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8436435 tttaaattataataaaattaattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaagggtataaatggaataaaacatgataagctataagctataa 8436534  T
Q  236 gctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    | ||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8436535 gttcaaacgatatttgtaatagcatctgaaaaataacttataagctcataaaataagctataa 8436597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 220 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28716815 - 28716624
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  28716815 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 28716716  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataata 410  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  28716715 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttgggttttcccaaacagacccttaata 28716624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 136 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 24652503 - 24652234
Alignment:
Q  136 tttaaattataataaaattaattattaagggtaaaca-tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctata 234  Q
    ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||  |||||||| | |  ||||| || || |||||| |||  ||| |||||||||||||||    
T  24652503 tttaatttataatataataaatgattaagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctata 24652404  T
Q  235 agctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaagtgttaccaaacagagcnnnnn 334  Q
    |||||||| |||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |         
T  24652403 agctcaaatgctacttgaaatagcttctaaaaaatggcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaagtgttaccaaacagaactttct 24652304  T
Q  335 nngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
      ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24652303 ttgtcaaacgagcttataagctataagataagaggtaaaagctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 24652234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 227 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28709451 - 28709267
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  28709451 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 28709352  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataata 410  Q
    ||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  28709351 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttgggttttcccaaacagacccttaata 28709267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 223 - 404
Target Start/End: Original strand, 22877923 - 22878105
Alignment:
Q  223 ctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttacca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  22877923 ctataagctataagctcaaacgctactgagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagttcatggtgaaaaagtgttacca 22878022  T
Q  322 aacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22878023 aacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaagagctataagctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 22878105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 405
Target Start/End: Original strand, 45141450 - 45141635
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  45141450 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 45141549  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccca 405  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  45141550 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaaactcttttttggat-taaccaaacagaccca 45141635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Original strand, 40223079 - 40223266
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaagtgttac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  40223079 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatag-ttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtg-aaagtgttac 40223176  T
Q  320 caaacagagc--nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccata 407  Q
    ||||||||||         ||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40223177 caaacagagctttttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttttgggtgttaccaaacagacccata 40223266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 227 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17081798 - 17081620
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  17081798 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 17081699  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  17081698 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 17081620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 6338469 - 6338280
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  6338469 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgtta 6338370  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataa 408  Q
    ||||||||||         |||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  6338369 ccaaacagagttttttttatcaaacgagcttataagctataagctagaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccataa 6338280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 31478227 - 31478042
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  31478227 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 31478128  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||||||  | |||||||||||||    
T  31478127 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctcttttggggttaaccaaacagaccc 31478042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31581845 - 31581680
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  31581845 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 31581746  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  31581745 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 31581680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 135 - 404
Target Start/End: Original strand, 11297950 - 11298221
Alignment:
Q  135 ttttaaattataataaaattaattattaagggtaaaca-tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctat 233  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||  |||||||| | |  ||||| || || |||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  11297950 ttttaatttataatataataaatgattaagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctat 11298049  T
Q  234 aagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnn 332  Q
    ||||||||||| || ||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||  | |||| |||||||||||||||        
T  11298050 aagctcaaacgttatttggaatagcttctgaaaaatatcttataagctcgtgaaataagctataagctgatgatgaaaaaatgttaccaaacagagtttt 11298149  T
Q  333 nnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
        ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11298150 ttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctataacctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 11298221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17115689 - 17115507
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  17115689 aagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 17115590  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    |||||||||||        |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  17115589 ccaaacagagctttttttttcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 17115507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 220 - 385
Target Start/End: Original strand, 44827312 - 44827478
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  44827312 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 44827411  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttg 385  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  44827412 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctcttttttg 44827478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8271057 - 8270892
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  8271057 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgtta 8270958  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  8270957 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaggtaaaaactaaaagctctttttt 8270892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25023457 - 25023292
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  25023457 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 25023358  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  25023357 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 25023292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Original strand, 36681442 - 36681607
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  36681442 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 36681541  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||    
T  36681542 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagttaaaagctctttttt 36681607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 38171422 - 38171607
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaa-aagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  38171422 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaacaacttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaacaagtgtta 38171521  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  38171522 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctcttttttggggtttcccaaacagaccc 38171607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 42142730 - 42142915
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  42142730 aagctataagctataagctcaaacactatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 42142829  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||||        ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |  | |||||||||||||    
T  42142830 ccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttgaggttaaccaaacagaccc 42142915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 227 - 405
Target Start/End: Original strand, 37587720 - 37587900
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  37587720 aagctaaaagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 37587819  T
Q  326 gagc-nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccca 405  Q
    || |         |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37587820 gaacttttttttatcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccca 37587900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 32099681 - 32099502
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  32099681 aagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaaca 32099582  T
Q  326 gag-cnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||         ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32099581 gagattttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctataagctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 32099502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 32541374 - 32541192
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  32541374 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 32541275  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||  | ||||||||||    
T  32541274 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctactttttggggttaaccaaacaga 32541192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 37560524 - 37560709
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatg-gagaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    ||||||||||    
T  37560524 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagttcatgatcaaaaagtgtta 37560623  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||| |       || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||    
T  37560624 ccaaacagaactttttttgtgaaacgagcttataagctataagttaagagctaaaagctctttttttgagtttaccaaacagaccc 37560709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39702457 - 39702292
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  39702457 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 39702358  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||  ||||||||    
T  39702357 ccaaacagagctttttatgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagttaaaagttctttttt 39702292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 36590287 - 36590105
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  36590287 aagctataagcta-aagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtaaaaaagtgtta 36590189  T
Q  319 ccaaacag-agcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    |||||||| |         |||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36590188 ccaaacagaatttttttttgtcaaacgagtttataagctataaattaagagctaaaagctcttttttgggtgttaccaaacaga 36590105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 10618957 - 10618773
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  10618957 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 10618858  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||| | |        |||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  10618857 ccaaacaaaactttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctctttttttggt-ttcccaaacagaccc 10618773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16422980 - 16422796
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||    
T  16422980 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatgatgaaaaagtgtta 16422881  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    | |||||||||        |||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16422880 ctaaacagagctttttttatcaaacgagcttataggctataagctaaaagctaaaagctcttttttgggt-taaccaaacagaccc 16422796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39871415 - 39871251
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  39871415 aagctataagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 39871316  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    ||||| |||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  39871315 ccaaatagagc-ttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 39871251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27781253 - 27781102
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  27781253 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 27781154  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  27781153 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 27781102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23677023 - 23676837
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  23677023 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagttcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 23676924  T
Q  319 ccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||| ||| |         |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  23676923 ccaaagagaacttttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 23676837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 227 - 361
Target Start/End: Original strand, 31688052 - 31688187
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  31688052 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 31688151  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataag 361  Q
    ||||       ||||||||| ||||||| |||||||    
T  31688152 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctataag 31688187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 39320061 - 39320212
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  39320061 aagctataagttataagctcgaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 39320160  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    |||||||||||       |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||    
T  39320161 ccaaacagagctttttttgtcaaacgaatttataagctataagctaaaagct 39320212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 204 - 329
Target Start/End: Original strand, 41693885 - 41694011
Alignment:
Q  204 tggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactca 303  Q
    ||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41693885 tggaagaaaacgtgagaaactataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctca 41693984  T
Q  304 tggag-aaaagtgttaccaaacagagc 329  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  41693985 tggtgaaaaaatgttaccaaacagagc 41694011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 404
Target Start/End: Original strand, 1893843 - 1894022
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  1893843 aagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 1893942  T
Q  326 gagc-nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    || |         |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  1893943 gaacttttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagaccc 1894022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 218 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44157350 - 44157240
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  44157350 ataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtat 44157251  T
Q  317 taccaaacaga 327  Q
    |||||||||||    
T  44157250 taccaaacaga 44157240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 327
Target Start/End: Original strand, 36112843 - 36112944
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  36112843 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 36112942  T
Q  326 ga 327  Q
    ||    
T  36112943 ga 36112944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 210 - 306
Target Start/End: Original strand, 2642403 - 2642499
Alignment:
Q  210 aaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg 306  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2642403 aaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgg 2642499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 231 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16831666 - 16831500
Alignment:
Q  231 tataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgttaccaaacagagc 329  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||||||||| ||||        ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |    
T  16831666 tataagctcaaacgctacttaaaatagcttatgaaaaatagcttataaactca--------gctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaactgaac 16831575  T
Q  330 nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
           ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16831574 tttttttgtcaaacgaacttataagctataagttaagagctaaaaactctttttttggtgttaccaaacagaccc 16831500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41313519 - 41313416
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  41313519 aagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 41313420  T
Q  326 gagc 329  Q
    ||||    
T  41313419 gagc 41313416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Original strand, 43276773 - 43276876
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  43276773 aagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 43276872  T
Q  326 gagc 329  Q
    ||||    
T  43276873 gagc 43276876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 306
Target Start/End: Original strand, 11741098 - 11741184
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11741098 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagattctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgg 11741184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 222 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 7378997 - 7378821
Alignment:
Q  222 gctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc-atggagaaaagtgttacc 320  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || | ||||| ||||||    
T  7378997 gctataagctataagctcaaacactacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcgttgtaaaaaagcgttacc 7378898  T
Q  321 aaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||       |||| |||||||||||| |||||       | ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7378897 aaacagagcttcttttgtcagacgaacttataagctata-------aactataagctcttttttgtgtgttaccaaacagaccc 7378821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 407
Target Start/End: Original strand, 34395348 - 34395531
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaa-atagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaac 324  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||    
T  34395348 aagctataagttcaaacgctactttgaatagcttctgaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttatcaaac 34395447  T
Q  325 agag-cnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccata 407  Q
    ||||         ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  34395448 agagtttttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttaaggtttaccaaacagacccata 34395531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 9211130 - 9210968
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaaca 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||   |||||||||| |||||     
T  9211130 aagctataagctcaaacgctacttgggatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtcaaaaagtgttatcaaacg 9211031  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggt 388  Q
    ||||       ||||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||    
T  9211030 gagctttttttgtcaaacaaacttataagctataagctaagaattaaaagctcttttttgggt 9210968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 312
Target Start/End: Original strand, 39746938 - 39747026
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  39746938 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcatctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcgtggtgaaaa 39747026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3511369 - 3511283
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  3511369 aagctataagctataagttcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctacaagctcatgg 3511283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39677535 - 39677445
Alignment:
Q  192 taaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctc 282  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||    
T  39677535 taagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctc 39677445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13970177 - 13970033
Alignment:
Q  162 aagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatc 261  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||       ||||||||||||  |||||  ||    
T  13970177 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaatatgataagctataagct-------caaacgctacttcgaatagcgtc 13970085  T
Q  262 tgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaag 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  13970084 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaag 13970033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 220 - 313
Target Start/End: Original strand, 35243347 - 35243440
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaag 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||||    
T  35243347 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaataacttataagctcgtgaaataagatataagctcgtggtgaaaag 35243440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Original strand, 3427623 - 3427726
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | |||||  ||||||||||    
T  3427623 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaggtcatggtgaaaaagcattaccaaaca 3427722  T
Q  326 gagc 329  Q
    ||||    
T  3427723 gagc 3427726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 298
Target Start/End: Original strand, 29189656 - 29189799
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| | |||||||  ||| |||||| |||| |  ||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  29189656 aattataatgggtaaaattggattttagataaaataataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataagctgtaagctcaaacgctacttggaa 29189755  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||  ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  29189756 tagcttcttaaaaataacatataagctcgtgaaataagctataa 29189799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 224 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 40551955 - 40551868
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40551955 tataaactataagctcaaacgctatctgaaatagcttctgaaaaatagct-ataagctcatgaaataagctataaactcatggtgaaaa 40551868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38780813 - 38780734
Alignment:
Q  219 taagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||    
T  38780813 taagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtaaaataagttataa 38780734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2855228 - 2855155
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2855228 ataagctataagctcaaacgctacttgaaataacttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 2855155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 291
Target Start/End: Original strand, 9370301 - 9370382
Alignment:
Q  210 aaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataa 291  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9370301 aaaagatgataagttataagctataagctcaaacgctacttgaaataacttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataa 9370382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 44263456 - 44263388
Alignment:
Q  222 gctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaata 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44263456 gctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaata 44263388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 327
Target Start/End: Original strand, 1363793 - 1363895
Alignment:
Q  226 taagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaac 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| | |||| | |||||||||    
T  1363793 taagctataagttcaaacgctacttagaatagcgtctgaataatagcttataaactcgtgaaataagttataagctcatggtaaaaaaatattaccaaac 1363892  T
Q  325 aga 327  Q
    |||    
T  1363893 aga 1363895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22957460 - 22957374
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg 306  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  22957460 aagctataaactataaactcaaacactacttagaatagcttctgaaaaataacttataagcttgtgaaataagctataagctcatgg 22957374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 302
Target Start/End: Original strand, 26036979 - 26037057
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc 302  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26036979 tataggctataaactcaaacgcaacttggaataacatctgaaaaataacttataaactcatgaaataaactataaactc 26037057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 40045551 - 40045489
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaat-agcttataagct 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  40045551 aagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaataagcttataagct 40045489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 282
Target Start/End: Original strand, 42203405 - 42203460
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42203405 aagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctc 42203460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13888388 - 13888330
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctc 282  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  13888388 tataagctataagcttaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagtttataagctc 13888330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26293901 - 26293840
Alignment:
Q  237 ctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||    
T  26293901 ctcaaacgctacttggaatagtgtctgaaaaatagcttataaatttgtgaaataagctataa 26293840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26307158 - 26307097
Alignment:
Q  237 ctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||    
T  26307158 ctcaaacgctacttggaatagtgtctgaaaaatagcttataaatttgtgaaataagctataa 26307097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18411037 - 18410959
Alignment:
Q  151 aattaattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataag 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || || |  ||||||| || ||||| ||||||    
T  18411037 aattaattataaagggtaaacatgagttttagttaaaatggtaagggtagaagtaaaataaaaaattataagttataag 18410959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 220 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10651176 - 10651115
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagct 281  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |  ||| ||||||||||||||||||    
T  10651176 aagctataagctataaactcaaacgctacttaaaattgcttctaaaaaatagcttataagct 10651115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44318371 - 44318319
Alignment:
Q  230 ctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctc 282  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  44318371 ctataagctcaaatgctacttgaaataacgtctgaaaaatagcttataagctc 44318319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 243
Target Start/End: Original strand, 5320485 - 5320555
Alignment:
Q  173 tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaac 243  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| || ||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5320485 tgggttttagttaaaataataagggtaaaaatggaattaaaagtgatatgttataagctataagctcaaac 5320555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 227 - 515
Target Start/End: Original strand, 17192452 - 17192740
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaagtgttaccaaacag 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17192452 aagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtgaaaagtgttaccaaacag 17192551  T
Q  327 agcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataatagtaatcttgaaaatac 426  Q
    |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17192552 agctttttttgtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataatagtaatcttgaaaatat 17192651  T
Q  427 tgtgatggggtcatctgataataaaatggataggtttcaaagtattgaagtggaataacttcatttgtatttgttgaccctttcttctc 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17192652 tgtgatggggtcatctgataataaaatggataggtttcaaagtattgaagtggaataacttcatttgtatttgttgaccctttcttctc 17192740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 36 - 298
Target Start/End: Original strand, 791148 - 791414
Alignment:
Q  36 ttgtatgtatcttatactgaacaatggtttcgtggtagagattcaaccattgtaagcttaatcgtgtgtacatgtagatgtagcatcgtttttgttttgt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  791148 ttgtatgtatcttatactgaacaatggtttcgtggtagacattcaaccattgtaagcttaatcgtgtgtacatgtagatgtagcatcgtttttgttttgt 791247  T
Q  136 tttaaattataataaaattaattattaagg----gtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagct 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  791248 tttaaattataataaaattaattattaagggtaagtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggttataaatggaataaaacatgataagctataagct 791347  T
Q  232 ataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  791348 ataagttcaaacgctacttgtaatagcatctgaaaaatagcttataagctcataaaataagctataa 791414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 40259009 - 40258824
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  40259009 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgtta 40258910  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||| |||       ||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40258909 ccaaacatagctttttctgtcaaacaagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 40258824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 135 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 44743955 - 44743689
Alignment:
Q  135 ttttaaattataataaaattaattattaagggtaaaca-tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctat 233  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||  |||||||| | |  ||| | || || |||||| |||  ||| ||| ||||||||||    
T  44743955 ttttaatttataatataataaatgattaagggtaaaaaatggaatttagttagaataataaaggtaaaactggaattaaaagtgagaagttataagctat 44743856  T
Q  234 aagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnn 332  Q
    || |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||       
T  44743855 aaactcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttt 44743756  T
Q  333 nnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaaca 399  Q
        ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44743755 ttttgtcaaacgagcttataaactataagctaagagctaaaagcttttttttgggtgttaccaaaca 44743689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 177 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44596805 - 44596597
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || ||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  44596805 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgaaacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttat 44596706  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||         || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44596705 aagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagaattttttttgtgaaacgagcttataaactataagctaagagctaaaag 44596606  T
Q  376 ctctttttt 384  Q
    |||||||||    
T  44596605 ctctttttt 44596597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Original strand, 42587386 - 42587551
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  42587386 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 42587485  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  42587486 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 42587551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 43254255 - 43254090
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  43254255 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 43254156  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  43254155 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 43254090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Original strand, 45686919 - 45687084
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  45686919 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 45687018  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  45687019 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 45687084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 177 - 404
Target Start/End: Original strand, 482942 - 483169
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || |||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  482942 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttat 483041  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||       || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  483042 aagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacaaagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaag 483141  T
Q  376 ctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||    
T  483142 ctcttttttaagt-ttaccaaacagaccc 483169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Original strand, 36246379 - 36246560
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  36246379 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 36246478  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  36246479 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctactttttgggt-taaccaaacaga 36246560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Original strand, 10312032 - 10312197
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  10312032 aagctataagatataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 10312131  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  10312132 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 10312197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 224 - 384
Target Start/End: Original strand, 21254704 - 21254865
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  21254704 tataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatagtgaaaaagtgttaccaa 21254803  T
Q  323 acagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21254804 acagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctctttttt 21254865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 227 - 404
Target Start/End: Original strand, 21313799 - 21313979
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  21313799 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 21313898  T
Q  326 gagc--nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||         ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21313899 gagctttttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaagagctaaaagttcttttttgggtattaccaaacagaccc 21313979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 40637163 - 40637348
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||     
T  40637163 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttg 40637262  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||||        ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |  | |||||||||||||    
T  40637263 ccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgaggttaaccaaacagaccc 40637348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 177 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 36407423 - 36407195
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || |||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  36407423 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttat 36407324  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||| |       || |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||     
T  36407323 aagctcgtgaaataagttataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtgaaacgaacttataagctataagctaagagttaaaag 36407224  T
Q  376 ctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  36407223 ctctttttttgggtttaccaaacataccc 36407195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 48313427 - 48313611
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  48313427 aagctataagctataagctcaaaagctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 48313526  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||| ||||||       ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  48313527 ccaatcagagc-ttttttgtcaaacgaacttataaactataacctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 48313611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 177 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 43134599 - 43134372
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || |||||  | |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  43134599 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttat 43134500  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||       || |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||     
T  43134499 aagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagc-ttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaag 43134401  T
Q  376 ctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  43134400 ctctttttttgggtttaccaaacagaccc 43134372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 404
Target Start/End: Original strand, 47470937 - 47471149
Alignment:
Q  192 taaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataa 291  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  47470937 taaggataaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataa 47471036  T
Q  292 gctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgt 390  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||| |       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| |    
T  47471037 gctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaacgctcttttttgggt-t 47471135  T
Q  391 taccaaacagaccc 404  Q
     |||||||||||||    
T  47471136 aaccaaacagaccc 47471149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 220 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 9487559 - 9487392
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcat-ggagaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  9487559 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatagtaaaaaagtgtta 9487460  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgg 386  Q
    ||||||||| |       |||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  9487459 ccaaacagaactttttttgtcagacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgg 9487392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 220 - 374
Target Start/End: Original strand, 33203671 - 33203826
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  33203671 aagctataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 33203770  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaa 374  Q
    |||||||||||       |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  33203771 ccaaacagagctttttttgtcaaaggaacttataaactataaactaaaagctaaaa 33203826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 388
Target Start/End: Original strand, 42375793 - 42375954
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  42375793 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 42375892  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggt 388  Q
    |||        ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  42375893 gag-tttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgggt 42375954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 388
Target Start/End: Original strand, 47587115 - 47587276
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaagtgttaccaaacag 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  47587115 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaagtgttaccaaacag 47587214  T
Q  327 agcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggt 388  Q
    ||         ||| ||||  |||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  47587215 agttttttttatcagacgagtttataagctataagctaaaagctaaaatctcttttttgggt 47587276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 220 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 21374785 - 21374621
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  21374785 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 21374686  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttt 383  Q
    |||||||||         ||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  21374685 ccaaacagaattttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttt 21374621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 155 - 329
Target Start/End: Original strand, 27655611 - 27655786
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| ||||||||| | || ||||||  ||| | |||||| || || ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27655611 aattataaagggtaaaaaaggattttagaaaaaatagtaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacgctacttggaa 27655710  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagc 329  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  27655711 tagcttctgaaaaatagcttataagctcttgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaacagagc 27655786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 220 - 409
Target Start/End: Original strand, 45222076 - 45222259
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgtta 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  45222076 aagctataagctaaaagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaggtgtta 45222175  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataat 409  Q
    ||||||||| |       ||||||||| |||||||||||||       |||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  45222176 ccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataaactata-------agctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttaat 45222259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1342956 - 1342818
Alignment:
Q  192 taaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataa 291  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1342956 taaggataaaaatggaagaaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagcttctgaaataa 1342857  T
Q  292 gctataaactc-atggagaaaagtgttaccaaacagagc 329  Q
    ||||||| |||  || | ||||| |||||||||||||||    
T  1342856 gctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaacagagc 1342818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 27089659 - 27089810
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  27089659 aagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 27089758  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  27089759 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 27089810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27188642 - 27188491
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  27188642 aagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 27188543  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  27188542 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 27188491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31511452 - 31511301
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  31511452 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 31511353  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    ||||||||||        ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  31511352 ccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 31511301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33027028 - 33026918
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  33027028 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 33026929  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  33026928 ccaaacagagc 33026918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 40106008 - 40106186
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  40106008 aagctataaactataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 40106107  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||       |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40106108 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagct-------tataagctaagagctaaaagctcttttttgggtgttaccaaacataccc 40106186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 21742124 - 21741938
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  21742124 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttttaagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaggtgtta 21742025  T
Q  319 ccaaacag-agcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||| |         ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  21742024 ccaaacagaatttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaatctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 21741938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 267 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 32168938 - 32168800
Alignment:
Q  267 aatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaa 365  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  32168938 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaa 32168839  T
Q  366 gagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32168838 gagctaaaagctcttttttgggcgttaccaaacagaccc 32168800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 49148571 - 49148298
Alignment:
Q  135 ttttaaattataataaaattaattattaagggtaaaca--tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagcta 232  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |  |||  |||||||||| |  ||||| || || |||||| |||  ||| ||||||||| |||    
T  49148571 ttttaatttataatataataaattattaagggtaaaaaaatggaatttagttaaaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataaacta 49148472  T
Q  233 taagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnn 331  Q
    |||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||      
T  49148471 taagctcaaacgctgcttggaatagcttctgaaaaatagctcataagctcgtgaaataagctataagctcatggtggaaaagtgttactaaacagagctt 49148372  T
Q  332 nnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaac-tcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
         ||||||  | ||||||| |||| || |||||||||||| | | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  49148371 tttttgtcaaaaaagcttataagctattagctaagagctaaaagcttttttttttgccgttaccaaacagaccc 49148298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 35587731 - 35587580
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  35587731 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 35587632  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
     |||||||||        ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  35587631 tcaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 35587580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 155 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17844761 - 17844555
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| |||| |||| |||| |||||| |||| |  ||||| || |||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  17844761 aattataaaggataaaaatggattttagataaaatattaagggtaaaaatggaagaaattttgagaagctataagctataagctcaaacgctacttagaa 17844662  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaa-agtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataa 353  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||       |||| |||| |||||||    
T  17844661 tagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaatagcattaccaaacagagctttttttgtcagacgagcttataa 17844562  T
Q  354 actataa 360  Q
    |||||||    
T  17844561 actataa 17844555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 231 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 48620598 - 48620448
Alignment:
Q  231 tataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaagtgttaccaaacagagcn 330  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||      
T  48620598 tatatgctcaaacgctacttgaaatagtttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataaactataaactcatgatgaaaagtgttaccaaacaaagtt 48620499  T
Q  331 nnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttt 381  Q
          ||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48620498 ttttccgtcaaacaagtttataaactataagctaagagctaaaaactcttt 48620448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 231 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 36436294 - 36436121
Alignment:
Q  231 tataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagc 329  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  36436294 tataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacatagc 36436195  T
Q  330 nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
           ||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  36436194 -ttttttgtcaaacgagcttataagatataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 36436121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34709385 - 34709275
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  34709385 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcatggtgaaaaagtgtta 34709286  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    ||| |||||||    
T  34709285 ccagacagagc 34709275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Original strand, 48832056 - 48832166
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||||    
T  48832056 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcacggtgaaaaagtgtta 48832155  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  48832156 ccaaacagagc 48832166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 404 - 516
Target Start/End: Original strand, 17186746 - 17186858
Alignment:
Q  404 cataatagtaatcttgaaaatactgtgatggggtcatctgataataaaatggataggtttcaaagtattgaagtggaataacttcatttgtatttgttga 503  Q
    |||| ||||||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17186746 catagtagtaatattgaaaatatcgtggttgggtcatctgataataaaatggataggtgtcaaagtattgaactggaataacttcatttgtatttgttga 17186845  T
Q  504 ccctttcttctca 516  Q
      | |||||||||    
T  17186846 atccttcttctca 17186858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Original strand, 12345070 - 12345180
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | | ||||||||||    
T  12345070 aagctataagctataagctcaaatgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcttcgtgaaaaagtgtta 12345169  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  12345170 ccaaacagagc 12345180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 48590866 - 48590756
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  48590866 aagctataagctataagctcaaacgctactttgaatagcttttgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 48590767  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  48590766 ccaaacagagc 48590756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 46879527 - 46879713
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc-atggagaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || | ||||| ||||    
T  46879527 aagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagctataagctcgttgtaaaaaagcgtta 46879626  T
Q  319 ccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||| |||||||        |||| |||||||||||| |||| || ||  ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  46879627 ccagacagagcttttttttgtcagacgaacttataagctatcagctataagctataagctcctttttgtgtgttaccaaacagaccc 46879713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Original strand, 19832000 - 19832103
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||    
T  19832000 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaaca 19832099  T
Q  326 gagc 329  Q
    ||||    
T  19832100 gagc 19832103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Original strand, 36612086 - 36612189
Alignment:
Q  192 taaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataa 291  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  36612086 taaggataaaaatggaagaaaatatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctaaaaaatagcttataaactcctgaaataa 36612185  T
Q  292 gcta 295  Q
    ||||    
T  36612186 gcta 36612189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 40893541 - 40893446
Alignment:
Q  203 atggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40893541 atggaagaaaaaatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgaaataggttctaaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 40893446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 231 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 38481421 - 38481290
Alignment:
Q  231 tataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagc 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38481421 tataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttatagactcgtgaaataagctataaattcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 38481322  T
Q  330 nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataag 361  Q
           ||||||||||||||||| |||||||    
T  38481321 tgtttttgtcaaacgaacttataagctataag 38481290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23030007 - 23029850
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| |||| |||| |||| |||||| |||| |  ||||| || || ||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23030007 aattataaaggataaaaatggattttagataaaatattaagggtaaaattggaagaaatattgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaa 23029908  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    |||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23029907 tagcttctgaataatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaa 23029850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 204 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9485884 - 9485727
Alignment:
Q  204 tggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactca 303  Q
    |||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| | |||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9485884 tggaattaaaaatgagaacctataagctataagctcaaatgatacttgaaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctca 9485785  T
Q  304 tggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataa 360  Q
    ||| | |||||||||| |||| ||||        ||||||||||||||||| ||||||    
T  9485784 tggtgaaaaagtgttatcaaagagagttttttttgtcaaacgaacttataagctataa 9485727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 328
Target Start/End: Original strand, 38531100 - 38531294
Alignment:
Q  136 tttaaattataataaaattaattattaagggtaaaca--tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctat 233  Q
    ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| |  |||  |||||||| | |  ||||| || || |||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  38531100 tttaatttataatataataaatgattaagggtaaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctat 38531199  T
Q  234 aagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagag 328  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38531200 aagctcaaacgctacttg-aataacttctgaaaaatagcttataagctcgtaaaataagctattagatcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 38531294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 329
Target Start/End: Original strand, 11466047 - 11466152
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||    
T  11466047 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagttcgtgaaataagctataagctcatggttaaaaagtattaccaaa 11466146  T
Q  324 cagagc 329  Q
    ||||||    
T  11466147 cagagc 11466152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 201 - 298
Target Start/End: Original strand, 19757500 - 19757597
Alignment:
Q  201 aaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19757500 aaatggaagaaaatattataagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttttgaaaaatagcttataagctcctgaattaagctataa 19757597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 244 - 403
Target Start/End: Original strand, 21316611 - 21316764
Alignment:
Q  244 gctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaa 342  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||        ||||||    
T  21316611 gctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttatgaaataagctataagctcatagtgaaaaagtgttaccaaacagagtttttttggtcaaa 21316710  T
Q  343 cgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacc 403  Q
    ||| ||||||| |||||||  |||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21316711 cgagcttataagctataagcgaagag-------ctcttttttgggtgttaccaaacagacc 21316764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 46757857 - 46757752
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc-atggagaaaagtgttaccaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || | ||||| |||||||||    
T  46757857 ataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagttataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaa 46757758  T
Q  324 cagagc 329  Q
    ||||||    
T  46757757 cagagc 46757752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 28425614 - 28425706
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28425614 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttatgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaa 28425706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24170985 - 24170860
Alignment:
Q  162 aagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatc 261  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||| ||  | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| | ||    
T  24170985 aagggtaaacttgg-ttttagataaagtaataagggtagtattggaagaaaaagtgataagctataagttataagctcaagcactacttggaataatgtc 24170887  T
Q  262 tgaaaaatagcttataagctcatgaaa 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24170886 tgaaaaatagcttataagctcatgaaa 24170860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 251
Target Start/End: Original strand, 33609058 - 33609163
Alignment:
Q  146 aataaaattaattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgc 245  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| || |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  33609058 aatataataaattataaagggtaaacatgggttttaattaaaataataagggtaaaaatgggacaaaagatgataagctataagctataagcttaaatgc 33609157  T
Q  246 tacttg 251  Q
    ||||||    
T  33609158 tacttg 33609163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 35000859 - 35000786
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  35000859 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcatctgaaaaatagtttataaacttgtgaaataagctataa 35000786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24170856 - 24170804
Alignment:
Q  260 tctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24170856 tctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggtgaaaa 24170804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Original strand, 27869570 - 27869643
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27869570 ataagctataaactcaaacgctacttggaataacgtccgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataa 27869643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 298
Target Start/End: Original strand, 22621459 - 22621539
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  22621459 ataagctataagttataagctcaaacgctgcttgaaataatgtctgaaaaataagttatgagctcctgaaataaactataa 22621539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 312
Target Start/End: Original strand, 22642259 - 22642346
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||  | | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  22642259 ataagctataagctcaaatgctacttagaatagcgtttaaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 22642346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 298
Target Start/End: Original strand, 21740152 - 21740226
Alignment:
Q  223 ctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  21740152 ctataagctataag-tcaaacgctatttcaagtagtttctgaaaaatagcttataaacttctgaaataagctataa 21740226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 39698984 - 39698930
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagct 281  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  39698984 aagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttgtaagct 39698930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45672441 - 45672387
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataag 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||    
T  45672441 ataaactataagctcaaacgctacttgaaataacgtctgaaaaatagcttataag 45672387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30699663 - 30699575
Alignment:
Q  162 aagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctactt 250  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| | |||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||    
T  30699663 aagggtaaaattgggttttacttaaaatggtgagggtataaataggataaaatatgataagctatgaattataagttcaaacgatactt 30699575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 39230027 - 39229965
Alignment:
Q  228 agctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaata 290  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  39230027 agctataagctcaaacactatttaaaatagtatctgaaaaataagttataagttcgtgaaata 39229965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 356 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 48590582 - 48590534
Alignment:
Q  356 tataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||    
T  48590582 tataagctaagagctaaaagctattttttggatgttaccaaacaaaccc 48590534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 97)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 36 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 193726 - 193407
Alignment:
Q  36 ttgtatgtatcttatactgaacaatggtttcgtggtagagattcaaccattgtaagcttaatcgtgtgtacatgtagatgtagcatcgtttttgttttgt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193726 ttgtatgtatcttatactgaacaatggtttcgtggtagagattcaaccattgtaagcttaatcgtgtgtacatgtagatgtagcatcgtttttgttttgt 193627  T
Q  136 tttaaattataataaaattaattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |    
T  193626 tttaaattataataaaattaattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaagggtataaatggaataaaacatgataagctata-------a 193534  T
Q  236 gctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc-atggagaaaagtgttaccaaacagagcnnnnn 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || | |||| ||||||||||||||||         
T  193533 gctcaaacgctacttgtaatagcatctgaaaaatagcttataagctcataaaataagctataagctcgttgtaaaaaattgttaccaaacagagctattt 193434  T
Q  335 nngtcaaacgaacttataaactataag 361  Q
      ||||||||| ||||||| |||||||    
T  193433 ttgtcaaacgagcttataagctataag 193407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 36 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5506961 - 5506704
Alignment:
Q  36 ttgtatgtatcttatactgaacaatggtttcgtggtagagattcaaccattgtaagcttaatcgtgtgtacatgtagatgtagcatcgtttttgttttgt 135  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5506961 ttgtatgtatcttata----acaatggtttcgtggtagagattcaaccattgtaagcttaatcgtgtgtacatgtagatgtatcatcgtttttgttttgt 5506866  T
Q  136 tttaaattataataaaattaattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5506865 tttaaattataataaaattaattattaagggtaaacatggattttagttaaagtggtaagggtataaatggaataaaacatgataagctataagctataa 5506766  T
Q  236 gctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctata 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5506765 gctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcataaaataagctata 5506704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 223 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 33392052 - 33391870
Alignment:
Q  223 ctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttacca 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  33392052 ctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataaactataagctcatggtgaaaaagtgttacca 33391953  T
Q  322 aacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||| |       ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391952 aacagaactttttttgtcaaacgaacttataagctctaagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 33391870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 192 - 410
Target Start/End: Original strand, 2579899 - 2580118
Alignment:
Q  192 taaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataa 291  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2579899 taaggataaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataa 2579998  T
Q  292 gctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgt 390  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||| ||  |    
T  2579999 gctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataaactaaaagctaaaagctcttttttagggtt 2580098  T
Q  391 taccaaacagacccataata 410  Q
     |||||||||||||| ||||    
T  2580099 aaccaaacagacccaaaata 2580118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 220 - 410
Target Start/End: Original strand, 29081281 - 29081472
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  29081281 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 29081380  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataata 410  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  29081381 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagagccataata 29081472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 19948318 - 19948503
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  19948318 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgtta 19948417  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  19948418 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagctagaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 19948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 44845776 - 44845591
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  44845776 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 44845677  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  44845676 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaaactcttttttgaggttaaccaaacagaccc 44845591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 16127139 - 16127324
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  16127139 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 16127238  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||||    
T  16127239 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaatcagaccc 16127324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26541112 - 26540927
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  26541112 aagctataagctgtaagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 26541013  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  26541012 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 26540927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 45345008 - 45345192
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  45345008 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 45345107  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  45345108 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaaactctttttttggt-ttcccaaacagaccc 45345192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 220 - 386
Target Start/End: Original strand, 24536554 - 24536721
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  24536554 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 24536653  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgg 386  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24536654 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctctaagctaagagctaaaagctcttttttgg 24536721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 220 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 38185922 - 38185732
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  38185922 aagctataagctataagttcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 38185823  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataata 410  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||    
T  38185822 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttaggt-taaccaaacagacccaaaata 38185732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Original strand, 49853043 - 49853225
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  49853043 aagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 49853142  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    ||||| | |||       ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  49853143 ccaaagatagccttttttgtcaaacgagcttataagctataaggtaagagttaaaagctcttttttaggtgttaccaatcaga 49853225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 35499753 - 35499569
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  35499753 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 35499654  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||||        ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||||||| || ||||||||||||    
T  35499653 ccaaacagagatttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagcttttttttgggt-ttcccaaacagaccc 35499569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 177 - 404
Target Start/End: Original strand, 52166047 - 52166275
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || |||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  52166047 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgagataaaaaatgagaagctataagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttat 52166146  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||        || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  52166147 aagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttgccaaacagagatttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaag 52166246  T
Q  376 ctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  52166247 ctctttttttgggtttaccaaacagaccc 52166275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 210 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 52858058 - 52857858
Alignment:
Q  210 aaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-ag 308  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||       
T  52858058 aaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgatacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtca 52857959  T
Q  309 aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataa 408  Q
    |||||||||||||||||||||       || |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||    
T  52857958 aaaagtgttaccaaacagagctttttttgtaaaacgagcttataagctataaactaagagctaaaagctctttttttgggtttaccaaacagacccttaa 52857859  T
Q  409 t 409  Q
    |    
T  52857858 t 52857858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 220 - 405
Target Start/End: Original strand, 28676890 - 28677076
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  28676890 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 28676989  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccca 405  Q
    |||||||||||        |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||  || ||||||| |||||    
T  28676990 ccaaacagagctttttttttcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttagggtttcccaaacataccca 28677076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Original strand, 40563363 - 40563545
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  40563363 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 40563462  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||  | ||||||||||    
T  40563463 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctactttttggggataaccaaacaga 40563545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37088436 - 37088271
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||    
T  37088436 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtatta 37088337  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  37088336 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 37088271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 37528723 - 37528908
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  37528723 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 37528822  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||| || |||||| ||  || ||||||||||||    
T  37528823 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagttaaaagctttttttttgggtttcccaaacagaccc 37528908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 135 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 2122065 - 2121789
Alignment:
Q  135 ttttaaattataataaaattaattattaagggtaaaca-tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctat 233  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||  |||||||| | |  ||||| || || |||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  2122065 ttttaatttataatataataaatgattaagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctat 2121966  T
Q  234 aagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnn 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||       
T  2121965 aagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaacagagc-tt 2121867  T
Q  333 nnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataata 410  Q
        ||||||| ||  ||||| ||||||  ||||| ||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  2121866 ttttgtcaaacaaatctataagctataacctaagatctataagctcttttttaggtattaccaaacagacccgtaata 2121789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 50499914 - 50499724
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| | ||||||||||    
T  50499914 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagcttatggtgaaaaagtgtta 50499815  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataata 410  Q
    ||||||| | |        |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  50499814 ccaaacaaaactttttttatcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaagctcttttttgggt-taaccaaacagacccttaata 50499724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 204 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 52795063 - 52794896
Alignment:
Q  204 tggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactca 303  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  52795063 tggaagaaaacgtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctca 52794964  T
Q  304 tggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  52794963 tggggaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 52794896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 224 - 405
Target Start/End: Original strand, 38891990 - 38892171
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaa 322  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||    
T  38891990 tataagctataagctcaaatgctacttggaatagtttctgaaaaatagcttataggctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaa 38892089  T
Q  323 acagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccca 405  Q
    |||||||       ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | | | ||||||||||||||    
T  38892090 acagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaagctcttttttagat-taaccaaacagaccca 38892171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 8873018 - 8872837
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  8873018 aagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaaca 8872919  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccata 407  Q
     |||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||    
T  8872918 tagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagacccata 8872837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25570531 - 25570366
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  25570531 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 25570432  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  25570431 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 25570366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 406
Target Start/End: Original strand, 46318766 - 46318947
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  46318766 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaaca 46318865  T
Q  326 gagc-nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccat 406  Q
    ||||         |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  46318866 gagcttttttttatcaaacgagcttataagctataagctaagagataaaagctcttttttgggtgttaccaaatagatccat 46318947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 220 - 360
Target Start/End: Original strand, 29718201 - 29718341
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaagtgttac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  29718201 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgatgaaaagtgttac 29718300  T
Q  320 caaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataa 360  Q
    ||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||    
T  29718301 caaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataa 29718341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 177 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 46972228 - 46972000
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || |||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  46972228 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttat 46972129  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |         || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  46972128 aagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacataaatttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaag 46972029  T
Q  376 ctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||| |   |||||||||||||||    
T  46972028 ctctttttttgagtttaccaaacagaccc 46972000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 227 - 409
Target Start/End: Original strand, 46247971 - 46248153
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  46247971 aagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 46248070  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataat 409  Q
    ||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| ||||    
T  46248071 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctcttttttgggt-ttcccaaacaaacccttaat 46248153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 55305109 - 55305260
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  55305109 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 55305208  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  55305209 ccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 55305260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 220 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 2851969 - 2851835
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  2851969 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 2851870  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataa 353  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||    
T  2851869 ccaaacagaactttttttgtcaaacgaacttataa 2851835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 404
Target Start/End: Original strand, 44748793 - 44748970
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  44748793 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 44748892  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||       ||||||| |  |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  44748893 gagctttttttgtcaaacaagtttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttggt-ttcccaaacagaccc 44748970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 48378371 - 48378193
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  48378371 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctatagactcgtggtgaaaaaatgttaccaaaca 48378272  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||         |||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48378271 gatttttttttgtcaaatgagcttataagctataagctaagaggtaaaagctcttttttgggtgttaccaaagagaccc 48378193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 21707296 - 21707135
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  21707296 aagctataagctcaaaagctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataatctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 21707197  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttggg 387  Q
    || |       || |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21707196 gaactttttttgttaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttggg 21707135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 162 - 313
Target Start/End: Original strand, 44947143 - 44947294
Alignment:
Q  162 aagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatc 261  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||  ||    
T  44947143 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacactgcttggaatagcttc 44947242  T
Q  262 tgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaag 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  44947243 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaag 44947294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 210 - 404
Target Start/End: Original strand, 12063718 - 12063913
Alignment:
Q  210 aaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-ag 308  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||       
T  12063718 aaaaaatgagaagctataagatataagctcaaacgctacttggaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagcttatggtca 12063817  T
Q  309 aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||||||||||         ||||||| |  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||    
T  12063818 aaaagtgttaccaaacagaattttttttgtcaaacaagtttataagctataaactaagagctaaaagctcttttttggagtttaccaaacagaccc 12063913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 51709229 - 51709055
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaaca-tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgta 253  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||| | |  ||||| || ||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51709229 aattattaagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaaatggaattaaaagtgagaaactataagctataagctcaaacgctacttgga 51709130  T
Q  254 atagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacaga 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  51709129 atagtttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 51709055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 409 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 11366831 - 11366724
Alignment:
Q  409 tagtaatcttgaaaatactgtgatggggtcatctgataataaaatggataggtttcaaagtattgaagtggaataacttcatttgtatttgttgaccctt 508  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  11366831 tagtaattttgaaaatattgtggtggggtcatctgataataaaatggataggttccaaagtgttgaagtggaataacttcatttgtatttgttgaatcct 11366732  T
Q  509 tcttctca 516  Q
    ||||||||    
T  11366731 tcttctca 11366724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 401
Target Start/End: Original strand, 40480028 - 40480203
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  40480028 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtaaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 40480127  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttg-ggtgttaccaaacaga 401  Q
    || |       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  40480128 gaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcatttttgaggtg-taccaaacaga 40480203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 224 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4240426 - 4240320
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  4240426 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaa 4240327  T
Q  323 acagagc 329  Q
    |||||||    
T  4240326 acagagc 4240320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Original strand, 47897606 - 47897716
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  47897606 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 47897705  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    | |||||||||    
T  47897706 ctaaacagagc 47897716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 410
Target Start/End: Original strand, 54672180 - 54672370
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  54672180 aagctataaggtataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 54672279  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataata 410  Q
     ||||||||||        |||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||     || ||||||||||||||||||    
T  54672280 tcaaacagagcttttttc-tcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctcttttttttagtttcccaaacagacccataata 54672370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 222 - 398
Target Start/End: Original strand, 42465029 - 42465206
Alignment:
Q  222 gctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttacc 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||  | |||| |||||||    
T  42465029 gctataagctataatctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataaacttgtgaaataagctataagctcatgccgaaaaaatgttacc 42465128  T
Q  321 aaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaac 398  Q
    ||||| |         ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42465129 aaacataattttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaagagctataagctcttttttgggtgttaccaaac 42465206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 11375539 - 11375432
Alignment:
Q  409 tagtaatcttgaaaatactgtgatggggtcatctgataataaaatggataggtttcaaagtattgaagtggaataacttcatttgtatttgttgaccctt 508  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |    
T  11375539 tagtaattttgaaaatattgtggtggggtcatctgataataaaatggataggttccaaagtgttgaagtggaataaattcatttgtatttgttgaatcct 11375440  T
Q  509 tcttctca 516  Q
    ||||||||    
T  11375439 tcttctca 11375432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 11385377 - 11385270
Alignment:
Q  409 tagtaatcttgaaaatactgtgatggggtcatctgataataaaatggataggtttcaaagtattgaagtggaataacttcatttgtatttgttgaccctt 508  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |    
T  11385377 tagtaattttgaaaatattgtggtggggtcatctgataataaaatggataggttccaaagtgttgaagtggaataaattcatttgtatttgttgaatcct 11385278  T
Q  509 tcttctca 516  Q
    ||||||||    
T  11385277 tcttctca 11385270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 404 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 11391427 - 11391316
Alignment:
Q  404 cataatagtaatcttgaaaatactgtgatggggtcatctgataataaaatggataggtttcaaagtattgaagtggaataacttcatttgtatttgttga 503  Q
    |||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  11391427 catagtagtaatctcaaaaatattgtgatggggtcatctgataataaaatggataggttggaaagtattgaagtggaataacttcatgtgtgattgttga 11391328  T
Q  504 ccctttcttctc 515  Q
    | ||||||||||    
T  11391327 ctctttcttctc 11391316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 39876759 - 39876624
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||||||| ||||||    
T  39876759 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgatgaaaaagtgttatcaaaca 39876660  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataag 361  Q
    ||||       ||||||||||||||||| |||||||    
T  39876659 gagcttttttagtcaaacgaacttataagctataag 39876624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 50317029 - 50317180
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||     
T  50317029 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttg 50317128  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    ||||||||| |        |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  50317129 ccaaacagaactttttttatcaaacgagcttataagctataagttaaaagct 50317180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 220 - 361
Target Start/End: Original strand, 24628199 - 24628341
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  24628199 aagctataagctataagttcaaatgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgtta 24628298  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataag 361  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| |||||||    
T  24628299 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataag 24628341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 48943134 - 48943033
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  48943134 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 48943035  T
Q  326 ga 327  Q
    ||    
T  48943034 ga 48943033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20450680 - 20450500
Alignment:
Q  150 aaattaattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctact 249  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| |  ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20450680 aaataaattataaagggtaaatataagttttaattaaaataataagggtagaaatggaataaaagatgataaactataagttataagcacaaacgctact 20450581  T
Q  250 tgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagc 329  Q
    || |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  | | | |||| ||||||||||||||||    
T  20450580 tgcaatagcgtctgaaaaataacttataagctcgtgaaataagttataaacttgttgtaaaaaactgttaccaaacagagc 20450500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21603950 - 21603846
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  21603950 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaagtagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 21603851  T
Q  319 ccaaa 323  Q
    |||||    
T  21603850 ccaaa 21603846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 224 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30864574 - 30864470
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||    
T  30864574 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctaatggtgaaaaagtgttaccaa 30864475  T
Q  323 acaga 327  Q
    |||||    
T  30864474 acaga 30864470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 224 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 45368758 - 45368577
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaac-tcatggagaaaagtgttaccaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  || | ||||| ||||||||    
T  45368758 tataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagctataagcttgttgtaaaaaagcgttaccaa 45368659  T
Q  323 acagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||       |||| |||| ||||||| |||| || ||  ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45368658 acagagctttttttgtcagacgagcttataagctatcagctataagctataagctcctttttgggtgttaccaaacagaccc 45368577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 52225437 - 52225329
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  52225437 aagctataagctataagctcaaacgctactttgaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgtta 52225338  T
Q  319 ccaaacaga 327  Q
    |||||||||    
T  52225337 ccaaacaga 52225329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 224 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 53779179 - 53779075
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaa 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  53779179 tataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaa 53779080  T
Q  323 acaga 327  Q
    |||||    
T  53779079 acaga 53779075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Original strand, 37713972 - 37714075
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  37713972 aagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 37714071  T
Q  326 gagc 329  Q
    ||||    
T  37714072 gagc 37714075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43525888 - 43525785
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||    
T  43525888 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaaca 43525789  T
Q  326 gagc 329  Q
    ||||    
T  43525788 gagc 43525785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 42497231 - 42497061
Alignment:
Q  135 ttttaaattataataaaattaattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctata 234  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||  |||||||| | |  ||||| || || |||||| |||  ||| || ||||||||||||    
T  42497231 ttttaatttataatataataaatgattaagggtaaaaaaggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaaactataagctata 42497132  T
Q  235 agctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatg 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  42497131 agctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatg 42497061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 41246394 - 41246297
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  41246394 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 41246297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 30548890 - 30548790
Alignment:
Q  226 taagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaac 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  30548890 taagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaac 30548791  T
Q  325 a 325  Q
    |    
T  30548790 a 30548790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 327
Target Start/End: Original strand, 46627497 - 46627605
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||    
T  46627497 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaattagcttataacctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtatta 46627596  T
Q  319 ccaaacaga 327  Q
    |||||||||    
T  46627597 ccaaacaga 46627605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 42217808 - 42217705
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  42217808 aagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaaca 42217709  T
Q  326 gagc 329  Q
    ||||    
T  42217708 gagc 42217705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 41785915 - 41785776
Alignment:
Q  266 aaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagtta 364  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41785915 aaatagcctataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattatcaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagtta 41785816  T
Q  365 agagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    | |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  41785815 aaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 41785776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Original strand, 37489931 - 37490002
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37489931 aagctataagctcaaacgctacttggaatagtgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 37490002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Original strand, 32026407 - 32026501
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  32026407 ataagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcatctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataaactataagctcgtggtgaaaa 32026501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 298
Target Start/End: Original strand, 45693386 - 45693464
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  45693386 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagttcgtgaaataagctataa 45693464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 224 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 51003395 - 51003306
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaag 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  51003395 tataagctataagctcaaacgctacttgaaataacgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaag 51003306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 298
Target Start/End: Original strand, 29203025 - 29203105
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29203025 ataagctataagctataagctcaaatgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataa 29203105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 325
Target Start/End: Original strand, 54541946 - 54542041
Alignment:
Q  231 tataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||    
T  54541946 tataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaaca 54542041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41518511 - 41518429
Alignment:
Q  222 gctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  41518511 gctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagtttataagctcttgaaataagctataagctcat 41518429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 267 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 44545335 - 44545198
Alignment:
Q  267 aatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaa 365  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| |       ||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  44545335 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaa 44545236  T
Q  366 gagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
     |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  44545235 aagctaaaagctctttttttggt-ttcccaaacagaccc 44545198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 325
Target Start/End: Original strand, 30814261 - 30814356
Alignment:
Q  231 tataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  30814261 tataagttcaaacgctacttggaatagtttccgaaaaatatcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 30814356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7041211 - 7041105
Alignment:
Q  222 gctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc-atggagaaaagtgttacc 320  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || | ||||| ||||||    
T  7041211 gctataaactataagcttaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagctataagctcgttgtaaaaaagcgttacc 7041112  T
Q  321 aaacaga 327  Q
    |||||||    
T  7041111 aaacaga 7041105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 312
Target Start/End: Original strand, 52595345 - 52595426
Alignment:
Q  231 tataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52595345 tataagctccaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataatcttgtgaaataagctataaactcatggtgaaaa 52595426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 306
Target Start/End: Original strand, 52868184 - 52868265
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg 306  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  52868184 ataagttataagctcaaacactacttgaaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgg 52868265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 47173680 - 47173555
Alignment:
Q  260 tctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| |||||||| |        |||||||| ||||||| ||||    
T  47173680 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagcgttatcaaacagaactttttttatcaaacgagcttataacctat 47173581  T
Q  359 aagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||    
T  47173580 aagctaagagctataagctctttttt 47173555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 407
Target Start/End: Original strand, 45693524 - 45693594
Alignment:
Q  337 gtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccata 407  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  45693524 gtcaaacgaacttataagctataagctaagaactataaactcttttttaggtgttaccaaagagacccata 45693594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2598742 - 2598669
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2598742 ataagttataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 2598669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 329
Target Start/End: Original strand, 33897898 - 33898003
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaag-tgttaccaaa 323  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||   ||||||||    
T  33897898 ataagttataagttcaaacgctatttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacattaccaaa 33897997  T
Q  324 cagagc 329  Q
    ||||||    
T  33897998 cagagc 33898003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 39470018 - 39469914
Alignment:
Q  267 aatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaa 365  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  39470018 aatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttttttggtcaaacgagcttataagctataagctaa 39469919  T
Q  366 gagct 370  Q
     ||||    
T  39469918 aagct 39469914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22257801 - 22257727
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    ||||||| ||||||||||||||||    
T  22257801 tataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcatttgaaaaataagcaataagcttatgaaataagctataa 22257727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27446575 - 27446473
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaa-ctcatggagaaaagtgttaccaa 322  Q
    |||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  27446575 tataagttataaactcagacgctatttgaaatagcttctgaaaaatagcatataaactcgtgaaataagctataaagctcatgtgaaaaagtgttaccaa 27446476  T
Q  323 aca 325  Q
    |||    
T  27446475 aca 27446473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 51950418 - 51950323
Alignment:
Q  309 aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||  |||||| ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  51950418 aaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagttataagctaagagcgataaactcttttttaggtattaccaaacagaccc 51950323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 35100328 - 35100160
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgttaccaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||        | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  35100328 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatggct--------cgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 35100237  T
Q  324 cagagcnnnnnnngt--caaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaaca 399  Q
    || | |        |  ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  35100236 caaaactttttttttatcaaacgagcttataagctataagctaagaactaaaagct-ttttttgggtgttaccaaaca 35100160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 325
Target Start/End: Original strand, 43740325 - 43740384
Alignment:
Q  267 aatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  43740325 aatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtgaaaaactgttaccaaaca 43740384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 400
Target Start/End: Original strand, 52931200 - 52931314
Alignment:
Q  288 ataagctataaactcatggagaaaa-gtgttaccaaacagagcnnnnnnn-gtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttg 385  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||         |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  52931200 ataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagtttttttttgtcaaacgagtttataaactataagttaaaagttaaaaactcttttttg 52931299  T
Q  386 ggtgttaccaaacag 400  Q
      | |||||||||||    
T  52931300 aatattaccaaacag 52931314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25146529 - 25146387
Alignment:
Q  156 attattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaat 255  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||| ||||| | |||||| || ||||||||| |||  ||| ||  |||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  25146529 attattaagggtaaaagtggattttaattaaaatagtaagggtaaaaatggaattaaaagtgaaaaattataagttataagttcaaacgttacttgaaat 25146430  T
Q  256 agtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||  || ||||||||  ||||||| |  ||||||||| |||||    
T  25146429 agcgtcagaaaaataagttataagttggtgaaataagttataa 25146387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 298
Target Start/End: Original strand, 37713074 - 37713218
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctata--agctcaaacgctacttgt 252  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||| |||| |  ||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||      
T  37713074 aattataatgggtaaa-atggattttagataaattaataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataagttatataagctcaaacgctacttag 37713172  T
Q  253 aatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||   ||| |||||||| |||||||||| | |||||| ||||||    
T  37713173 aataacttcttaaaaatagtttataagctcgtaaaataaactataa 37713218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 251
Target Start/End: Original strand, 44895985 - 44896035
Alignment:
Q  201 aaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttg 251  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44895985 aaatggaataaaatatgaaaagctacaagctataagctcaaaagctacttg 44896035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 281
Target Start/End: Original strand, 52931152 - 52931206
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagct 281  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  52931152 aagctataagcttaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataacttataagct 52931206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 337 - 386
Target Start/End: Original strand, 24536807 - 24536856
Alignment:
Q  337 gtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgg 386  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24536807 gtcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttttgg 24536856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 42527967 - 42528031
Alignment:
Q  193 aaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatag 257  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  42527967 aaggatataaatggaagaaaatgtgaaaagctatcagctataagctaaaaagctacttgaaatag 42528031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 257
Target Start/End: Original strand, 43968271 - 43968327
Alignment:
Q  201 aaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatag 257  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  43968271 aaatggaagaaaatatgaaaagctataagctacaagctcaaaagctacttgaaatag 43968327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39719498 - 39719427
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||  |||  | |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39719498 aagctataaactcaaacgctatttggaatagcttcttcataataacttataagctcgtgaaataagctataa 39719427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 32982921 - 32982986
Alignment:
Q  229 gctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagct 294  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||  || |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  32982921 gctataagctcaagcattacttgaaatagcttccgaaaaatagcttataagctcgtaaaataagct 32982986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 81)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 36 - 298
Target Start/End: Original strand, 5519876 - 5520138
Alignment:
Q  36 ttgtatgtatcttatactgaacaatggtttcgtggtagagattcaaccattgtaagcttaatcgtgtgtacatgtagatgtagcatcgtttttgttttgt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5519876 ttgtatgtatcttatactgaacaatggtttcgtgatagagattcaaccattgtaagcttaatcgtgtgtacatgtagatgtagcatcgtttttgttttgt 5519975  T
Q  136 tttaaattataataaaattaattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataa 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5519976 tttaaattataataaaattaattattaagggtaaacgtgggttttacttaaagtggtaagggtataaatggaataaaatatgataagctatatgctataa 5520075  T
Q  236 gctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5520076 gctcaaacgctatttgtaatagcatctgaaaaatagcttataaactcataaaataagctataa 5520138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 142 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26911739 - 26911476
Alignment:
Q  142 ttataataaaattaattattaagggtaaaca-tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctca 240  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||  |||||||| | |  ||||| || || |||||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||    
T  26911739 ttataatataataaatgattaagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagttataagctca 26911640  T
Q  241 aacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtc 339  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||        |||    
T  26911639 aacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaagagag-tttttttgtc 26911541  T
Q  340 aaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26911540 aaacgagcttataagctataagttaagagctaaaagctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 26911476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3377541 - 3377354
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  3377541 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 3377442  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccata 407  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3377441 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgggt-taaccaaacagacccata 3377354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16487031 - 16486847
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  16487031 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 16486932  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16486931 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgggt-taaccaaacagaccc 16486847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 650772 - 650956
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  650772 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 650871  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  650872 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaa-agctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 650956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 218 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8815364 - 8815196
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  8815364 ataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgt 8815265  T
Q  317 taccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttg 385  Q
    |||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  8815264 taccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaggctcttttttg 8815196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 220 - 406
Target Start/End: Original strand, 8688954 - 8689140
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  8688954 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 8689053  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccat 406  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  8689054 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctctttttggggt-taaccaaacagacccat 8689140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Original strand, 4453515 - 4453697
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  4453515 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 4453614  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  4453615 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 4453697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 2266144 - 2266328
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  2266144 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 2266243  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||| || ||||||||||||    
T  2266244 ccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaagtttttttttgggt-ttcccaaacagaccc 2266328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 9887141 - 9886957
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  9887141 aagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttatgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 9887042  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  9887041 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttaggt-taaccaaacagaccc 9886957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Original strand, 13111734 - 13111923
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  13111734 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 13111833  T
Q  319 cc-aaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccata 407  Q
    || |||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||||||  || |||||||||||||||    
T  13111834 ccaaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctattttttggggtttcccaaacagacccata 13111923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Original strand, 36712528 - 36712693
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  36712528 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 36712627  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  36712628 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 36712693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41322905 - 41322740
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  41322905 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 41322806  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  41322805 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagataaaagctaaaagctctttttt 41322740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 218 - 401
Target Start/End: Original strand, 38578998 - 38579182
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  38578998 ataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgt 38579097  T
Q  317 taccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    |||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||| ||  | ||||||||||    
T  38579098 taccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagttcttttttagggttaaccaaacaga 38579182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 227 - 381
Target Start/End: Original strand, 4385524 - 4385679
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4385524 aagctataagctcaaacgctacttgaaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 4385623  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttt 381  Q
    || |       ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4385624 gaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttt 4385679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 220 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 37356318 - 37356128
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  37356318 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 37356219  T
Q  319 ccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataat 409  Q
    |||||||||||        ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  || || |||||||||||| ||||    
T  37356218 ccaaacagagctttttttggtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaaactctttttttagt-ttcccaaacagacccgtaat 37356128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 227 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 5039917 - 5039739
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||    
T  5039917 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcacggtgaaaaagtgttaccaaaca 5039818  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  5039817 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtttcccaaacagaccc 5039739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 21865396 - 21865210
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  21865396 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 21865297  T
Q  319 ccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||        ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  21865296 ccaaacagagcttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 21865210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Original strand, 28382672 - 28382854
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  28382672 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 28382771  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||  | ||||||||||    
T  28382772 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctactttttggggttaaccaaacaga 28382854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 2546316 - 2546501
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||  |||||    
T  2546316 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggttaaaatttgtta 2546415  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  2546416 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtttctcaaacagaccc 2546501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 36999638 - 36999454
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  36999638 aagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 36999539  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  36999538 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctctttttttggt-ttcccaaacagaccc 36999454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 218 - 360
Target Start/End: Original strand, 7400381 - 7400524
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  7400381 ataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgt 7400480  T
Q  317 taccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataa 360  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||    
T  7400481 taccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataa 7400524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 223 - 403
Target Start/End: Original strand, 6232275 - 6232456
Alignment:
Q  223 ctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttacca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  6232275 ctataagctataagctcaaacgctacttgaaatatcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcatggtgaaaaagtgttacca 6232374  T
Q  322 aacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacc 403  Q
    ||||||         ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  6232375 aacagaatattttttgtcaaacgagcttataagttataagctaagagctaaaagctcttttttgagtgttagcaaacagacc 6232456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 8340128 - 8339943
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgtta 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||  || | |||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  8340128 aagctataagctttaagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataaattcgtaaaataaactataagctcatgatgaaaaagtgtta 8340029  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||    
T  8340028 ccaaacagaacttttttcgtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaagctcttttttaaatgttaccaaacagaccc 8339943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 40024934 - 40025119
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  40024934 aagctataagctataagctcaaaggctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 40025033  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||   || ||||||||||||    
T  40025034 ccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttatatgctataagctaaaagctaaaagctcttttttggagtttcccaaacagaccc 40025119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 155 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 38843049 - 38842842
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| |  || || || |||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  38843049 aattataaagggtaaacatgaattttaattaaaataatatgggtaaaaatgggataaaatatgagaagttataagctataagttcaaacgctacttgaaa 38842950  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataa 353  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||    
T  38842949 tagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtgaaaaagtattaccaaacagagttttttttatcaaacgaacttataa 38842850  T
Q  354 actataag 361  Q
    ||||||||    
T  38842849 actataag 38842842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 404
Target Start/End: Original strand, 6760603 - 6760781
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  6760603 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaaca 6760702  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||       || |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||    
T  6760703 gagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgagtttaccaaacagaccc 6760781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25071578 - 25071441
Alignment:
Q  161 taagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtat 260  Q
    |||||||| | |||| |||||| |||| |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  25071578 taagggtataaatggtttttagataaaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagttt 25071479  T
Q  261 ctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25071478 ctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataa 25071441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 220 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 39167900 - 39167758
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  39167900 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 39167801  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataag 361  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| |||||||    
T  39167800 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataag 39167758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 227 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 43135759 - 43135597
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||||||| ||||||    
T  43135759 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgatgaaaaagtgttatcaaaca 43135660  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggt 388  Q
    ||||        |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  43135659 gagctttttttatcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgggt 43135597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 361
Target Start/End: Original strand, 10393030 - 10393169
Alignment:
Q  223 ctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttacca 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  10393030 ctataagctataaactcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttacca 10393129  T
Q  322 aacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataag 361  Q
    ||||||||       ||||||||| ||||||| |||||||    
T  10393130 aacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataag 10393169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 224 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15521624 - 15521473
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||    
T  15521624 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagttttaccaa 15521525  T
Q  323 acagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaa 374  Q
    |||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  15521524 acagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaa 15521473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Original strand, 24402044 - 24402154
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  24402044 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 24402143  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  24402144 ccaaacagagc 24402154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 227 - 404
Target Start/End: Original strand, 41796741 - 41796919
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||    
T  41796741 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttacgaaaca 41796840  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttt-tgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||        | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  41796841 gagctttttttataaaacgagcttataaactataagctaagagctaaaagctctttttattggt-ttaccaaacagaccc 41796919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 43507554 - 43507705
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  43507554 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgtta 43507653  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  43507654 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 43507705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 10839572 - 10839756
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  10839572 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctagtgaaataagatataagctcatggtgaaaaagtgtta 10839671  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       |||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||| ||| || ||||||||||||    
T  10839672 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagtttataagctataagctaaaagctaaaagttctttttttggt-ttcccaaacagaccc 10839756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 403
Target Start/End: Original strand, 38880731 - 38880959
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || |||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  38880731 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttat 38880830  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaa 374  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| |        || |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  38880831 aaactcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagaacttttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagttaaaa 38880930  T
Q  375 actcttttttgggtgttaccaaacagacc 403  Q
     ||||||||| |   ||||||||||||||    
T  38880931 gctctttttttgaatttaccaaacagacc 38880959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Original strand, 17263745 - 17263855
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||    
T  17263745 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaacatgtta 17263844  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  17263845 ccaaacagagc 17263855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29514982 - 29514872
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  29514982 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcttggtgaaaaagtgtta 29514883  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  29514882 ccaaacagagc 29514872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 227 - 361
Target Start/End: Original strand, 40869358 - 40869493
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  40869358 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 40869457  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataag 361  Q
    || |       |||||| || |||||||||||||||    
T  40869458 gaactttttttgtcaaatgagcttataaactataag 40869493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 388
Target Start/End: Original strand, 4038339 - 4038501
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  4038339 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 4038438  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggt 388  Q
    || |        |||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  4038439 gaactttttttatcaaacgagcttgtaagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgggt 4038501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4056086 - 4055961
Alignment:
Q  173 tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagc 272  Q
    ||||||||| ||||| || ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  4056086 tgggttttaattaaaatgataaaggtaaaaatgaaataaaacatgataagctataagctataagttcaaacgctatttggaatagtgtctgaaaaatagc 4055987  T
Q  273 ttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    | |||||||| |||||||||||||||    
T  4055986 taataagctcgtgaaataagctataa 4055961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15250310 - 15250163
Alignment:
Q  164 gggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctg 263  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  15250310 gggtaaatgtgggttttaattaaaatgataagggtagaaatggaacaaaacatgacaagctataaactataagctcaaacgctacttggaatagcgtctg 15250211  T
Q  264 aaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaa 311  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  15250210 aaaaataacttataagctcgagaaataagctataagctcgtggtgaaa 15250163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 224 - 386
Target Start/End: Original strand, 13527900 - 13528063
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgttaccaa 322  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  13527900 tataagctataagttcaaacgttacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataaacttgtgaaataagttataaactcatggtgaaaaggtgttaccga 13527999  T
Q  323 acagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgg 386  Q
    |||||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  13528000 acagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagcttttttttgg 13528063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43285760 - 43285657
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  43285760 aagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 43285661  T
Q  326 gagc 329  Q
    ||||    
T  43285660 gagc 43285657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 361
Target Start/End: Original strand, 31616385 - 31616520
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  31616385 aagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 31616484  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataag 361  Q
     |||       ||||||||| ||||||| |||||||    
T  31616485 aagctttttttgtcaaacgagcttataagctataag 31616520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 318
Target Start/End: Original strand, 2047227 - 2047411
Alignment:
Q  135 ttttaaattataataaaattaattattaagggtaaaca-tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctat 233  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||| | |||  |||||||| | |  ||||| || || |||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  2047227 ttttaatttataatataataaataattaagagtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctat 2047326  T
Q  234 aagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  2047327 aagctcaaacgctacttagaataacttctgaaaaatagcttataaactcatgaaataagctataaactcatgtgaaaaagtgtta 2047411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 325
Target Start/End: Original strand, 8070612 - 8070718
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  8070612 aagctataaactataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgtta 8070711  T
Q  319 ccaaaca 325  Q
    |||||||    
T  8070712 ccaaaca 8070718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 266 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 18212223 - 18212084
Alignment:
Q  266 aaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagtta 364  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  18212223 aaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaggta 18212124  T
Q  365 agagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    | |||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||    
T  18212123 aaagctaaaagctcctttttggggttaaccaaacagaccc 18212084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 42132809 - 42132708
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  42132809 aagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgatgaaaaggtgttaccaaaca 42132710  T
Q  326 ga 327  Q
    ||    
T  42132709 ga 42132708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 177 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 44275854 - 44275625
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || |||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||| ||||    
T  44275854 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctaattggaataacttctgaaaaatagattat 44275755  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||| |         || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  44275754 aagctcgtgaaataagctataagctcgtggtcaaaaagtgttaccaaacata-atttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaag 44275656  T
Q  376 ctcttttttgggtgttaccaaacagacccat 406  Q
    |||||||||  |  |||||||||||| ||||    
T  44275655 ctctttttttaggtttaccaaacagatccat 44275625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2221596 - 2221445
Alignment:
Q  162 aagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatc 261  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| |  ||||| || ||  |||| |||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||  ||    
T  2221596 aagggtaaaaatggattttagataaaataataagggtaaaataggaagaaaaaatgataagttataagttataagttcaaacgttacttggaatagcgtc 2221497  T
Q  262 tgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaag 313  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2221496 tgaaaaatagcttagaagctcgtgaaataaactataaactcatggtgaaaag 2221445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10727979 - 10727812
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||  | ||||||||||    
T  10727979 aagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagtttttgaaaaatagcttataagttcgtgaaataagctataagcttatgatgaaaaagtgtta 10727880  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgg 386  Q
     |||||||| |        |||||||  || |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  10727879 tcaaacagaactttttttatcaaacgggctaataagctataagctaaaagttaaaaactcttttttgg 10727812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16669196 - 16669123
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16669196 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagctataa 16669123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 298
Target Start/End: Original strand, 23356933 - 23357054
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    ||||||||||| |  ||||| || |||||||| |||| || | |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||    
T  23356933 ttttagttaaaataataagggtaaaaatggaacaaaagataaaaagctaaaagctataagctcagacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcatat 23357032  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  23357033 aagctcgtgaaataagctataa 23357054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24020030 - 24019957
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24020030 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 24019957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 306
Target Start/End: Original strand, 7213664 - 7213739
Alignment:
Q  231 tataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg 306  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  7213664 tataagcacaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgg 7213739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 337 - 406
Target Start/End: Original strand, 6153558 - 6153627
Alignment:
Q  337 gtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccat 406  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6153558 gtcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttttggatgttaccaaacagacccat 6153627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 599038 - 598958
Alignment:
Q  222 gctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  599038 gctataaactataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagcttttgaaataaactataaactc 598958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 323
Target Start/End: Original strand, 9053122 - 9053226
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaa-aagtgtta 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| |  |||||| ||| ||||||||    
T  9053122 aagctgtaagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaagaatagtttataagctcgtgaaataaactattagttcatggtgaataagtgtta 9053221  T
Q  319 ccaaa 323  Q
    |||||    
T  9053222 ccaaa 9053226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2758969 - 2758902
Alignment:
Q  231 tataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2758969 tataagctcaaacgctacttggaatagcgtctaaaaaatagcttataagctcatgaaataagttataa 2758902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 295
Target Start/End: Original strand, 7823475 - 7823614
Alignment:
Q  156 attattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaat 255  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |  ||||| || || | |||| |||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  7823475 attattaagggtaaaagtggattttaattaaaataataagggtaaaactagaattaaaagtgagatgctataagctataagctcaaacgctacttgaagt 7823574  T
Q  256 agtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagcta 295  Q
    ||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7823575 agcttataaaaaatagcttataagctcgtgaaataagcta 7823614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 297
Target Start/End: Original strand, 6222636 - 6222708
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctata 297  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6222636 ataagctataagttcaaatgctgcttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 6222708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18710312 - 18710254
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18710312 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcatg 18710254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 34884952 - 34884877
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc 302  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  34884952 aagctataagctgaaacactacttggaatagagtctgaaaaataggctataagctcgtgaaataaactataaactc 34884877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18710249 - 18710174
Alignment:
Q  309 aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18710249 aaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctctttttt 18710174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41877883 - 41877821
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaa 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  41877883 ataagctataagctcaaacactacttgaaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaa 41877821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7569908 - 7569850
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatg 285  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  7569908 aagctataagctcaaacgttacttaaaataacttctgaaaaatagcttataagctcatg 7569850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3337263 - 3337198
Alignment:
Q  166 gtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagct 231  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3337263 gtaaaaatggattttagttaaagtgataagggtgaaaatgaaataaaagatgataagctataagct 3337198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 6807537 - 6807492
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaata 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  6807537 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaata 6807492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 271
Target Start/End: Original strand, 13351603 - 13351647
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatag 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  13351603 aagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaatag 13351647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39675166 - 39675090
Alignment:
Q  222 gctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||  | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  39675166 gctataagttataagctcaaacgctacttgaagcagcttttgaaaaatatcttataaactcttgaaataagttataa 39675090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10818471 - 10818420
Alignment:
Q  196 gatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgcta 247  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10818471 gataaaaatagaataaaagatgataaactataagttataagctcaaacgcta 10818420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18212255 - 18212224
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18212255 aagctataagctataagctcaaacgctacttg 18212224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 37674561 - 37674486
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||    
T  37674561 aagctataaactcaaacgctacttggaatagcgtctaaaatatagtttacaagctcgtgaaataaattataaactc 37674486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 294
Target Start/End: Original strand, 44525925 - 44525998
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagct 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||  || |||||||| |||||| |||||    
T  44525925 aagctataagctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaaacgc-tataagctaatgaaaaaagct 44525998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2757311 - 2757282
Alignment:
Q  273 ttataagctcatgaaataagctataaactc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2757311 ttataagctcatgaaataagctataaactc 2757282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24020050 - 24020017
Alignment:
Q  198 tataaatggaataaaacatgataagctataagct 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24020050 tataaatggaataaaagatgataagctataagct 24020017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 340 - 392
Target Start/End: Original strand, 13564523 - 13564575
Alignment:
Q  340 aaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgtta 392  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||    
T  13564523 aaacgagcttataagctataagttaagagttaaaagctctttcttgagtgtta 13564575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13761963 - 13761887
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagct 231  Q
    |||||| | |||||||  ||| |||||| |||| |  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13761963 aattataatgggtaaaattggtttttagataaaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagct 13761887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 201 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 43496342 - 43496286
Alignment:
Q  201 aaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatag 257  Q
    |||||||| |||| || | |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  43496342 aaatggaagaaaatataaaaagctacaagctataagctcaaaagctacttgaaatag 43496286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 115)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 37 - 298
Target Start/End: Original strand, 30562669 - 30562922
Alignment:
Q  37 tgtatgtatcttatactgaacaatggtttcgtggtagagattcaaccattgtaagcttaatcgtgtgtacatgtagatgtagcatcgtttttgttttgtt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30562669 tgtatgtatcttatactgaacaatggtttcgtggtagagattcaaccattgtaagcttaatcgtgtgtacatgtagatgtagcatcgtttttgttttgtt 30562768  T
Q  137 ttaaattataataaaattaattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataag 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  30562769 ttaaattataataaaattaattattaagggtaaacatgagttttagttaaagtggtaagggtataaatggaataaaacatg-------ataagctataag 30562861  T
Q  237 ctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||    
T  30562862 cttaaacgctacttgtaatagcatctgaaaaatagcttat-tgctcataaaataagttataa 30562922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 298
Target Start/End: Original strand, 52707812 - 52708072
Alignment:
Q  36 ttgtatgtatcttatactgaacaatggtttcgtggtagagattcaaccattgtaagcttaatcgtgtgtacatgtagatgtagcatcgtttttgttttgt 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52707812 ttgtatgtgtcttatactgaacaatggttttgtgatagagattcagccattgtaagcttaatcgtgtgtacatgcagatgtagcatcgtttttgttttgt 52707911  T
Q  136 tttaaattataataaaattaattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataa 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52707912 tttaaattataat-aaattaattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaagggtataaatggaataaaacatgataagatataagctataa 52708010  T
Q  236 gctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  52708011 gctc-aacgttacttgtaataacatctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataa 52708072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 4517187 - 4517372
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  4517187 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaggtgtta 4517286  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  4517287 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttgggattaaccaaacagaccc 4517372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 12233963 - 12234148
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  12233963 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 12234062  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  12234063 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 12234148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 220 - 410
Target Start/End: Original strand, 19513878 - 19514068
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  19513878 aagctataagctataagctaaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 19513977  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataata 410  Q
    |||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  19513978 ccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttggt-ttcccaaacagacccataata 19514068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 7706520 - 7706330
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7706520 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtgaaaaagtgtta 7706421  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataat 409  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||| ||||    
T  7706420 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttcttggttttcccaaacagacccttaat 7706330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 8829811 - 8829996
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  8829811 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 8829910  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  8829911 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctcttttttggggtttcccaaacagaccc 8829996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 42117044 - 42116859
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  42117044 aagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 42116945  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||    
T  42116944 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgaggtttcccaaacagaccc 42116859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 53407337 - 53407153
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  53407337 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 53407238  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  53407237 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttggggt-taaccaaacagaccc 53407153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 177 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 37970485 - 37970255
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || |||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  37970485 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttat 37970386  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||        || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  37970385 aagctcatgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagag-tttttttgtgaaacgaacttataagctataagctaagagctaaaag 37970287  T
Q  376 ctc-ttttttgggtgttaccaaacagacccata 407  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37970286 ctcatttttttggt-ttaccaaacagacccata 37970255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 56372583 - 56372396
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  56372583 aagctataagctataagctcaaacgctgcttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 56372484  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccata 407  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  56372483 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttggt-ttcccaaacagacccata 56372396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 220 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28307403 - 28307212
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  28307403 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 28307304  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataata 410  Q
     ||||| ||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  28307303 tcaaaccgagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagacccataata 28307212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 231 - 413
Target Start/End: Original strand, 35777393 - 35777576
Alignment:
Q  231 tataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagc 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35777393 tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 35777492  T
Q  330 nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataatagta 413  Q
           ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||    
T  35777493 tttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccatagtagta 35777576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 8942052 - 8941863
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  8942052 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtaaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 8941953  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataat 409  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| || |||||||||||| ||||    
T  8941952 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagttaaaagctctttttttggt-ttcccaaacagacccgtaat 8941863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 11600831 - 11600646
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  11600831 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 11600732  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||| |||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  11600731 ccaaacatagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 11600646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 18582992 - 18582808
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  18582992 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgtta 18582893  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  18582892 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttggt-ttcccaaacagaccc 18582808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 31338496 - 31338683
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaag---tgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||    |||    
T  31338496 aagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagcccgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaaaatgt 31338595  T
Q  317 taccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||| |||||||||       ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31338596 tactaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataagctatcagttaagagctataagctcttttttgagtgttaccaaatagaccc 31338683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 177 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22892719 - 22892511
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || |||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  22892719 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttat 22892620  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||       || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  22892619 aagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaag 22892520  T
Q  376 ctctttttt 384  Q
    |||||||||    
T  22892519 ctctttttt 22892511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 177 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22944383 - 22944175
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || |||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  22944383 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttat 22944284  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||       || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  22944283 aagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaag 22944184  T
Q  376 ctctttttt 384  Q
    |||||||||    
T  22944183 ctctttttt 22944175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 177 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 55764750 - 55764523
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || |||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  55764750 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttat 55764651  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||        | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  55764650 aagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagcttttttt-tgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaag 55764552  T
Q  376 ctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  55764551 ctctttttttgggtttaccaaacagaccc 55764523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 46895431 - 46895266
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||    
T  46895431 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtatta 46895332  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  46895331 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 46895266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 4939382 - 4939532
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaagtgttac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  4939382 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaagtgttac 4939481  T
Q  320 caaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    |||||||| |       ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  4939482 caaacagaactttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagct 4939532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 404
Target Start/End: Original strand, 37115286 - 37115463
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  37115286 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 37115385  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    || |       ||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  37115386 gaactttttttgtcaaacgagcttatatgctataagctaaaagctaaaaactctttttttggt-ttcccaaacagaccc 37115463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 45906287 - 45906105
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  45906287 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 45906188  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||| ||  ||||||||  | ||||||||||    
T  45906187 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaggtaaaagctactttttggggttaaccaaacaga 45906105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 384
Target Start/End: Original strand, 55495883 - 55496041
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  55495883 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 55495982  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    ||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  55495983 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 55496041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 22038353 - 22038538
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  22038353 aagctataagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcctataagctcgagaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 22038452  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  22038453 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttatggggttaaccaaacagaccc 22038538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 220 - 409
Target Start/End: Original strand, 9043606 - 9043796
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag--aaaagtgtt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||    
T  9043606 aagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtggaaaaagtgtt 9043705  T
Q  318 accaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataat 409  Q
    |||||||| | |       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  9043706 accaaacataactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgagt-ttcccaaacagacccataat 9043796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 11151935 - 11152086
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  11151935 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 11152034  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  11152035 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 11152086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 220 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 15636090 - 15635910
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  15636090 aagctataagctataaaatcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataaactcatagtgaaaaagtgtta 15635991  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaaca 399  Q
    ||||||| |||        |||||| |  |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15635990 ccaaacaaagctttttttatcaaacaagtttataagctataagctaagaggtaaaagctcttttttgggtgttaccaaaca 15635910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 27397762 - 27397913
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  27397762 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttatgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 27397861  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  27397862 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 27397913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 204 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29413695 - 29413528
Alignment:
Q  204 tggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactca 303  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  29413695 tggaagaaaacgtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagttca 29413596  T
Q  304 tggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  29413595 tggtgaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 29413528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 52670142 - 52669987
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  52670142 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 52670043  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaa 374  Q
    ||||||||||        ||||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  52670042 ccaaacagagttttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaagctaaaa 52669987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 328
Target Start/End: Original strand, 35190584 - 35190721
Alignment:
Q  192 taaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataa 291  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35190584 taaggataaaaatggaagaaaatatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaataa 35190683  T
Q  292 gctataaactc-atggagaaaagtgttaccaaacagag 328  Q
    |||| ||||||  || | ||||| ||||||||||||||    
T  35190684 gctacaaactcgttgtaaaaaagcgttaccaaacagag 35190721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 404
Target Start/End: Original strand, 47417482 - 47417656
Alignment:
Q  231 tataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47417482 tataagctcaaacgctgcttggaatagcttatgaaagatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 47417581  T
Q  330 nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
           ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  47417582 tttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtttcccaaacagaccc 47417656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 227 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 55829145 - 55828967
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  55829145 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaaca 55829046  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||       || |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||    
T  55829045 gagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgggtttaccgaacagaccc 55828967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 4392722 - 4392906
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  4392722 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttatgaaaa-tagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 4392820  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||        |||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||| |  | |||||||||||||    
T  4392821 ccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctcttttttgaggttaaccaaacagaccc 4392906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 218 - 329
Target Start/End: Original strand, 5465404 - 5465516
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  5465404 ataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtat 5465503  T
Q  317 taccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||||    
T  5465504 taccaaacagagc 5465516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 220 - 327
Target Start/End: Original strand, 25440480 - 25440588
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  25440480 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 25440579  T
Q  319 ccaaacaga 327  Q
    |||||||||    
T  25440580 ccaaacaga 25440588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 224 - 384
Target Start/End: Original strand, 39087558 - 39087719
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  39087558 tataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaa 39087657  T
Q  323 acagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||    
T  39087658 acagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctagaagctaaaagctctttttt 39087719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 207 - 329
Target Start/End: Original strand, 9031978 - 9032101
Alignment:
Q  207 aataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg 306  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9031978 aataaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgg 9032077  T
Q  307 ag-aaaagtgttaccaaacagagc 329  Q
     | |||||||||||||||||||||    
T  9032078 tgaaaaagtgttaccaaacagagc 9032101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 220 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21370028 - 21369884
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||    
T  21370028 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtatta 21369929  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagtt 363  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  21369928 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctaaaagtt 21369884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 155 - 298
Target Start/End: Original strand, 21633747 - 21633890
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| | |||||||  ||| |||||| |||| |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21633747 aattataatgggtaaaattggtttttagataaaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctatttggaa 21633846  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21633847 tagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 21633890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Original strand, 23867865 - 23867975
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  23867865 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 23867964  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  23867965 ccaaacagagc 23867975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 227 - 404
Target Start/End: Original strand, 43225680 - 43225858
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  43225680 aagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 43225779  T
Q  326 gagc-nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||        ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  43225780 gagcttttttttgtcaaacaaacttataagctataagctaaaaactaaaagctctttttttggt-ttcccaaacagaccc 43225858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Original strand, 55856523 - 55856633
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  55856523 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgtta 55856622  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  55856623 ccaaacagagc 55856633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 222 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25235291 - 25235105
Alignment:
Q  222 gctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc-atggagaaaagtgttacc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || | ||||| ||||||    
T  25235291 gctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagctataagctcgttgtaaaaaagcgttacc 25235192  T
Q  321 aaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccata 407  Q
    |||||||||       |||| |||||||||||| |||| || ||  | ||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25235191 aaacagagctttttttgtcagacgaacttataagctatcagctataaactataagctcctttttgtgtgttaccaaacagacccata 25235105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 192 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26826697 - 26826560
Alignment:
Q  192 taaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataa 291  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26826697 taaggataaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataa 26826598  T
Q  292 gctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagag 328  Q
    | ||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  26826597 gttataagctcatcgtgaaaaagtgttaccaaacagag 26826560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 282
Target Start/End: Original strand, 24954159 - 24954279
Alignment:
Q  162 aagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatc 261  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  24954159 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatggaacaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtc 24954258  T
Q  262 tgaaaaatagcttataagctc 282  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24954259 tgaaaaatagcttataagctc 24954279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 31679110 - 31678939
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  31679110 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 31679011  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||       ||||||||| ||||||| |||||       |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  31679010 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctata-------agctaaaaactcttttttggggttaaccaaacaaaccc 31678939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3009859 - 3009749
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| |||||    
T  3009859 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcaaggtaaaaaaatgtta 3009760  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  3009759 ccaaacagagc 3009749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Original strand, 4355588 - 4355739
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||    
T  4355588 aagctataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtatta 4355687  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    ||||||||| |       |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||    
T  4355688 ccaaacagaactttttttgtcaaacgaatttataagctataagctaaaagct 4355739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22430785 - 22430691
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  22430785 ataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcatctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 22430691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 216 - 306
Target Start/End: Original strand, 27185624 - 27185714
Alignment:
Q  216 tgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27185624 tgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgg 27185714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33115123 - 33115013
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||||    
T  33115123 aagctataagctataagctcaaacgatacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcacggtaaaaaagtgtta 33115024  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  33115023 ccaaacagagc 33115013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 224 - 402
Target Start/End: Original strand, 35822299 - 35822478
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  35822299 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataatctcgtgaaataagttgtaagctcatggtgaaaaagtgttaccaa 35822398  T
Q  323 acagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagac 402  Q
    ||||||        ||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||| |  | |||||||||||    
T  35822399 acagagttttttttgtcaaacgagcttataagttataagctaaaagctaaaagctcttttttgaggttaaccaaacagac 35822478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Original strand, 23113407 - 23113564
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |  ||||| || |||||| |||||| |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  23113407 aattataaagggtaaatatggattttaattaaaataataagggtaaaaatgggataaaatatgagaagttataagttataaactcaaacgctacttggaa 23113506  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23113507 taacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggcgaaaa 23113564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 384
Target Start/End: Original strand, 35580948 - 35581106
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  35580948 aagctataagctcaaacgctacttgaaatagcctctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataaactataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaaca 35581047  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    ||||       || |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||    
T  35581048 gagctttttttgtgaaacgaacttataagctataagctaaaagttaaaagctctttttt 35581106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 220 - 328
Target Start/End: Original strand, 55358334 - 55358443
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  55358334 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgtta 55358433  T
Q  319 ccaaacagag 328  Q
     |||||||||    
T  55358434 tcaaacagag 55358443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29664070 - 29663926
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  29664070 aagctataagctcaaacgctacctggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 29663971  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    ||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  29663970 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 29663926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37832060 - 37831961
Alignment:
Q  230 ctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagag 328  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  37832060 ctataacctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtaaaaaagtgttaccaaacagag 37831961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 35468163 - 35468012
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  35468163 aagctatatgttataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 35468064  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    |||||||||         ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  35468063 ccaaacagatttttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagct 35468012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44525778 - 44525701
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcat 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44525778 aagctataagctcaaacgctacttgaaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcat 44525701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 328
Target Start/End: Original strand, 56270044 - 56270196
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || |||||  | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||    
T  56270044 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctaaaagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttat 56270143  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagag 328  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||    
T  56270144 aagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaaatgttaccaaacagag 56270196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Original strand, 4391704 - 4391814
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc-atggagaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || | ||||| ||||    
T  4391704 aagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagctataagctcgttgtaaaaaagcgtta 4391803  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  4391804 ccaaacagagc 4391814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23162747 - 23162641
Alignment:
Q  223 ctataagctataagct-caaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttacc 320  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  23162747 ctataagctataagcttcaaaagctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggggaaaaagtgttacc 23162648  T
Q  321 aaacaga 327  Q
    |||||||    
T  23162647 aaacaga 23162641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 224 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 44442225 - 44442063
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||||| ||| |||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  44442225 tataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatag-ttttaagctcgtgagataagcaataagctcatggtgaaaaagtgttaccaa 44442127  T
Q  323 acagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgg 386  Q
    |||||         |||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  44442126 acagaattttttttgtcaaacgaacttataaattataagctaaaagttaaaagctcttttttgg 44442063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 284 - 404
Target Start/End: Original strand, 29656598 - 29656719
Alignment:
Q  284 tgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttt 382  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||       ||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  29656598 tgaaataagctataagctcgtggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttttcttgtcaaacgagcttaaaagctataaggtaagagctaaaagctctttt 29656697  T
Q  383 ttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29656698 ttgggtgttaccaaacagaccc 29656719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 327
Target Start/End: Original strand, 30366142 - 30366250
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||    
T  30366142 aagctataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagatataagctcatgatgaaaaagtgtta 30366241  T
Q  319 ccaaacaga 327  Q
    |||||||||    
T  30366242 ccaaacaga 30366250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 312
Target Start/End: Original strand, 51011061 - 51011153
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||| |||||    
T  51011061 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagcttatggtgaaaa 51011153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11050458 - 11050355
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | |||||  ||||||||||    
T  11050458 aagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagttcatggtgaaaaagcattaccaaaca 11050359  T
Q  326 gagc 329  Q
    ||||    
T  11050358 gagc 11050355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 312
Target Start/End: Original strand, 43078113 - 43078284
Alignment:
Q  142 ttataataaaattaattattaagggt-aaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctca 240  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||| |  ||||| || || |||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  43078113 ttataatataataaatgattaagggtgaaaaatggaatttagttaaactaataagggtaaaactggaattaaaaatgagaagttataagctataagctca 43078212  T
Q  241 aacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    || |||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  43078213 aatgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagttataagctcgtggcgaaaa 43078284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 306
Target Start/End: Original strand, 20148803 - 20148884
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg 306  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20148803 ataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgg 20148884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20511552 - 20511479
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20511552 ataagttataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 20511479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 53273226 - 53273078
Alignment:
Q  260 tctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||| | ||||||||||||||| ||| |       ||||||||| ||||||| ||||    
T  53273226 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaatagaactttttttgtcaaacgagcttataagctat 53273127  T
Q  359 aagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccata 407  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  53273126 aagctaaaagctaaaagctcttttttgaggttaaccaaacagacccata 53273078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Original strand, 42085723 - 42085796
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42085723 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaaaagcttataagctcgtgaaataagctataa 42085796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 55684841 - 55684768
Alignment:
Q  222 gctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagcta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55684841 gctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagcta 55684768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 232 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 50502376 - 50502306
Alignment:
Q  232 ataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc 302  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50502376 ataagctcaaacactacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactc 50502306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 327
Target Start/End: Original strand, 36486353 - 36486489
Alignment:
Q  192 taaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataa 291  Q
    |||||||| || |||||| |||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||  | |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  36486353 taaggataaaactggaattaaaagtgagaagttataagctataagttcaaacgttacttaaaatagcttatgaaaaatagtttataagctcataaaataa 36486452  T
Q  292 gctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacaga 327  Q
     ||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||    
T  36486453 actataaattcatggtgaaaaagtattaccaaacaga 36486489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 304
Target Start/End: Original strand, 4465472 - 4465551
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcat 304  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4465472 ataagctacaagctcaaacgctacttggaacagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcat 4465551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Original strand, 33005111 - 33005182
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33005111 aagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataa 33005182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Original strand, 40497399 - 40497470
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40497399 aagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataa 40497470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 404
Target Start/End: Original strand, 19169165 - 19169231
Alignment:
Q  338 tcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19169165 tcaaacgagcttataagctataagttaagagctaaaagctcttttttggatgttactaaacagaccc 19169231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 285
Target Start/End: Original strand, 45780760 - 45780818
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45780760 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatg 45780818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 52713670 - 52713564
Alignment:
Q  192 taaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataa 291  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||||| |  ||||||||    
T  52713670 taagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagttataagctataagctcaaacgctacttagaatagtgtcttaaaaataacttataagtttgtgaaataa 52713571  T
Q  292 gctataa 298  Q
    | |||||    
T  52713570 gttataa 52713564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36197017 - 36196944
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  36197017 ataagctataagctcaaacactacttagaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataa 36196944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37047172 - 37047099
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37047172 ataagctataagctcaaacgctatttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctaaaataagctataa 37047099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Original strand, 48056607 - 48056680
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||    
T  48056607 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaataacttataagttcgtgaaataaactataa 48056680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 405
Target Start/End: Original strand, 25199382 - 25199478
Alignment:
Q  309 aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccca 405  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  25199382 aaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacataccca 25199478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40119997 - 40119906
Alignment:
Q  191 gtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctc 282  Q
    |||||| || || ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  40119997 gtaagggtaaaagtggaagaaaatatgataagctataggctacaagctcaaatgctacttggaatagcgtctgaaaaatagtttataagctc 40119906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 282
Target Start/End: Original strand, 42124675 - 42124737
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  42124675 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaagatagtttataagctc 42124737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17715707 - 17715650
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctc 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17715707 ataagctataatctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctc 17715650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 373
Target Start/End: Original strand, 29656729 - 29656843
Alignment:
Q  260 tctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactat 358  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||| |       ||||||||| ||||||| ||||    
T  29656729 tctgaaaaataaattattagctcgtgaaataagctataagctcatggcgaaaaagtgttaacaaacagaactttttctgtcaaacgagcttataagctat 29656828  T
Q  359 aagttaagagctaaa 373  Q
    ||| |||||||||||    
T  29656829 aagctaagagctaaa 29656843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 281
Target Start/End: Original strand, 36008014 - 36008075
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagct 281  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  36008014 aagctataagctataaactcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaacagcttataagct 36008075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 370
Target Start/End: Original strand, 33005178 - 33005275
Alignment:
Q  274 tataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  33005178 tataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 33005275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 45520135 - 45520071
Alignment:
Q  340 aaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  45520135 aaacgagcttataagctataagctaagagctaaaaactcttttttggatgttacgaaagagaccc 45520071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31953296 - 31953225
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||    
T  31953296 aagctataagctcaaacgctacttgaaataatgtctaaaaaatagtttataaagtcgtgaaataagctataa 31953225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 305
Target Start/End: Original strand, 32948177 - 32948264
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatg 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||    
T  32948177 ataagctataaactataagctcaaacgctatttagaatagcgtctgaaaaatactttataatatcataaaataagatataaactcatg 32948264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 257
Target Start/End: Original strand, 35842519 - 35842642
Alignment:
Q  135 ttttaaattataataaaattaattattaagggtaaaca-tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctat 233  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||  |||||||| | |  ||||| || || |||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  35842519 ttttaatttataatataataaatgattaagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctat 35842618  T
Q  234 aagctcaaacgctacttgtaatag 257  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  35842619 aagctcaaacgctacttggaatag 35842642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 48977974 - 48977863
Alignment:
Q  203 atggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctg-aaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaact 301  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| || ||| |||| |||||||  ||||||| | || |||||| ||||||  |    
T  48977974 atggaataaaagatgataagttataagctataaggttaaacgctacttgaaaaagtgtctgaaaaaataagttataagttaataaaataaactataagtt 48977875  T
Q  302 catggagaaaag 313  Q
    ||||| ||||||    
T  48977874 catggtgaaaag 48977863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 281
Target Start/End: Original strand, 3932180 - 3932306
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| | |||||||  ||| |||||| |||| |  ||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  3932180 aattataatgggtaaaattggattttagataaaataataagggtaaaaatgaaagaaaatatgataagctataagctataagctcaaatgctacttgaaa 3932279  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagct 281  Q
    ||   | |||||||| ||| |||||||    
T  3932280 taacgtttgaaaaatggctcataagct 3932306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31435149 - 31435076
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31435149 ataagttataacctcaaacgctacttggaatagcgtatgaaaaataacttataaactcgtgaaataagctataa 31435076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Original strand, 32101736 - 32101809
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | |||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  32101736 ataagctataagctcaaacgctacttggaataacgtcttagaaatagtttataagctcgtgaaataagttataa 32101809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 405
Target Start/End: Original strand, 45780823 - 45780919
Alignment:
Q  309 aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccca 405  Q
    ||||||||||||||| |||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  45780823 aaaagtgttaccaaatagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttagggttaaccaaacagaccca 45780919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 53224368 - 53224317
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||    
T  53224368 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataa 53224317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 37337784 - 37337710
Alignment:
Q  223 ctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctata 297  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37337784 ctataaactataagttcaaacgctacttgaagtagcttatgaaaaatagcttataagtacctgaaataagctata 37337710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 367 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 53224251 - 53224210
Alignment:
Q  367 agctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataa 408  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53224251 agctataaactcttttttgggtgttaccaaacatacccataa 53224210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1768583 - 1768544
Alignment:
Q  210 aaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctact 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1768583 aaaagatgataagctataagctataagctcaaaccctact 1768544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 408
Target Start/End: Original strand, 40528363 - 40528433
Alignment:
Q  337 gtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataa 408  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||  |  ||| |||||||||||||||    
T  40528363 gtcaaacgaatttataagctataagttaagagctaaaagc-cttttttaaggtttatcaaacagacccataa 40528433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 53274844 - 53274813
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53274844 aagctataagctataagctcaaacgctacttg 53274813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 324
Target Start/End: Original strand, 35842638 - 35842696
Alignment:
Q  267 aatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaac 324  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  35842638 aatagcttataagctcgcgaaataatctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaac 35842696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 291
Target Start/End: Original strand, 38048878 - 38048944
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataa 291  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  38048878 ataagctataaactcaaatgctatttggaatagcgtctgaaaaatagtttataaactcgtgaaataa 38048944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 297
Target Start/End: Original strand, 41864083 - 41864153
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctata 297  Q
    ||||||||| || |||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  41864083 aagctataaacttaaacgctatttggaatagcttcttaaaaatagcttataagttcgtaaaataagctata 41864153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Original strand, 8716919 - 8716992
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||   ||||||||  |||||||||||||||    
T  8716919 ataaactataagctcaaacactacttgaaatagcctctggaaaataaactataagcttttgaaataagctataa 8716992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 281
Target Start/End: Original strand, 49239219 - 49239276
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagct 281  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  49239219 tataaactataagttcaaacgttacttataatagcgtctgaaaaatagtttataagct 49239276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 256
Target Start/End: Original strand, 20530799 - 20530835
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaata 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20530799 aagctataagctataagctcaaaagctacttggaata 20530835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 93)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 1507723 - 1507909
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  1507723 aagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactaatggtgaaaaagtgtta 1507822  T
Q  319 ccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||        ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1507823 ccaaacagagcttctttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 1507909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 30774264 - 30774055
Alignment:
Q  192 taaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataa 291  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30774264 taaggataaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataa 30774165  T
Q  292 gctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgt 390  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  30774164 gctataaacttatggtgaaaaagtgttaccaaacagagcttta----tcaaacgaacttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttgggt-t 30774070  T
Q  391 taccaaacagaccca 405  Q
     ||||||||||||||    
T  30774069 aaccaaacagaccca 30774055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 44909995 - 44909810
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  44909995 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 44909896  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccca 405  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  44909895 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctctttttggggt-taaccaaacagaccca 44909810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15313398 - 15313214
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaagtgttac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15313398 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtgaaaagtgttac 15313299  T
Q  320 caaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||  || ||||||||||||    
T  15313298 caaacagagctttttttatcaaacgaacttataagctataagttaaaagctaaaagttctttttttgggtttcccaaacagaccc 15313214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Original strand, 19898888 - 19899070
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  19898888 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 19898987  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  19898988 ccaaacagaactttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 19899070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 220 - 405
Target Start/End: Original strand, 36838675 - 36838861
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36838675 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggagaaaaagtgtta 36838774  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccca 405  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  36838775 ccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagaccca 36838861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 216 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3661104 - 3660920
Alignment:
Q  216 tgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||    
T  3661104 tgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagatataagctcatggtgaaaaagt 3661005  T
Q  315 gttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaaca 399  Q
    ||||||||||||| |       |||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3661004 gttaccaaacagaacttttgttgtcaaatgagcttataagctataagctaagaactaaaagctcttttttgggtgttaccaaaca 3660920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 225 - 404
Target Start/End: Original strand, 47134516 - 47134695
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  47134516 ataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 47134615  T
Q  324 cagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  47134616 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaggtaaaagctaaaagctcttttttgggt-taaccaaacagaccc 47134695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 225 - 411
Target Start/End: Original strand, 13121569 - 13121755
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  13121569 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 13121668  T
Q  324 cagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataatag 411  Q
    ||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||    
T  13121669 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttggggt-taaccaaacagacccttaatag 13121755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 227 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 17046877 - 17046694
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  17046877 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 17046778  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataat 409  Q
     |||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  17046777 aagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccataat 17046694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 409
Target Start/End: Original strand, 31150405 - 31150594
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  31150405 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 31150504  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataat 409  Q
    || ||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  31150505 cccaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagcttttttttgggt-ttcccaaacagacccttaat 31150594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 409
Target Start/End: Original strand, 42064297 - 42064486
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  42064297 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 42064396  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataat 409  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||  || || |||||||||||| ||||    
T  42064397 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttagt-ttcccaaacagacccttaat 42064486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2498077 - 2497912
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  2498077 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaggtgtta 2497978  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  2497977 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaagctctatttt 2497912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29586313 - 29586148
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  29586313 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgtta 29586214  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  29586213 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 29586148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 38676644 - 38676475
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  38676644 aagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagttcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 38676545  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggt 388  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  38676544 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataaactataagttaaaagctaaaagctttttttggggt 38676475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 224 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26204425 - 26204243
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  26204425 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaa 26204326  T
Q  323 acagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccat 406  Q
    |||||||        |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  26204325 acagagctttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgggt-taaccaaacaggcccat 26204243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 135 - 403
Target Start/End: Original strand, 36043194 - 36043465
Alignment:
Q  135 ttttaaattataataaaattaattattaagggtaaaca-tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctat 233  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||| | |||  |||||||| | |  ||||| || || |||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  36043194 ttttaatttataatataataaatgattacgggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagctat 36043293  T
Q  234 aagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacag-agcnn 331  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| |        
T  36043294 aagctcaaacgctacttagaatagcatctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcatggtgaaaaactgttaccaaacagaatttt 36043393  T
Q  332 nnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacc 403  Q
         ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36043394 tttttgtcaaacgaacttatatgctataagctaagagctataagctcttttttgggtgttaccaaacagacc 36043465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1918180 - 1917999
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  1918180 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 1918081  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  1918080 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctactttttgggt-taaccaaacaga 1917999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 220 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 33524683 - 33524497
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  33524683 aagctataaactataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 33524584  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccca 405  Q
    |||||||||||        |||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  33524583 ccaaacagagctttttttatcaaacaagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccca 33524497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 177 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 34319587 - 34319358
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || |||||  | |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  34319587 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttat 34319488  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaa 375  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||| |       || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  34319487 aagctcgtgaaataagctataaggtcatggtcaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaag 34319388  T
Q  376 ctcttttttgggtgttaccaaacagaccca 405  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  34319387 ctctttttttgggtttaccaaacagaccca 34319358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Original strand, 36301085 - 36301265
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  36301085 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 36301184  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
     ||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  36301185 tcaaacagagc-ttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgggt-taaccaaacaga 36301265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 227 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 39826748 - 39826564
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  39826748 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 39826649  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataata 410  Q
    ||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||  | ||||| ||||||| |||||    
T  39826648 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttatggggttaaccaatcagacccttaata 39826564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 405
Target Start/End: Original strand, 30721603 - 30721790
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||||||    
T  30721603 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagttcatggtgaaaaagtgtta 30721702  T
Q  319 ccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccca 405  Q
    |||||||||||        ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  30721703 ccaaacagagcttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagaccca 30721790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 404
Target Start/End: Original strand, 7710941 - 7711119
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  7710941 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 7711040  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||        ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  7711041 gagttttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagaccc 7711119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25602134 - 25601972
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||||    
T  25602134 aagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaggtcatggtaaaaaagtgataccaaaca 25602035  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggt 388  Q
    ||||       ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25602034 gagctttttttgtcaaacgagcttataacctataagctaagagctaaaagctcttttttgggt 25601972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15348979 - 15348794
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  15348979 aagctataaactataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataatttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 15348880  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||| ||         |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15348879 ccaaacatagttttttttatcaaacgagcttataagctataagcaaagagctaaaagctcttttttggatgttaccaaacaaaccc 15348794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 224 - 384
Target Start/End: Original strand, 17499869 - 17500030
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaa 322  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  17499869 tataagctataagcttaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaa 17499968  T
Q  323 acagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||       ||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  17499969 acagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataaactaaaagctaaaagctctttttt 17500030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 32368319 - 32368504
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  32368319 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcatataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgtta 32368418  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||| | ||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  32368419 ccaaacagagctttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaagttaaaagctcttttttagggttaaccaaacagaccc 32368504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 162 - 313
Target Start/End: Original strand, 7781086 - 7781237
Alignment:
Q  162 aagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatc 261  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||    
T  7781086 aagggtaaaagtgggttttaattaaaatgataagggtaaaaatgaaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttc 7781185  T
Q  262 tgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaag 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  7781186 tgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaag 7781237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Original strand, 29704064 - 29704246
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  29704064 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgtta 29704163  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctt-ttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    |||||||||||       ||||||| | ||||||| ||||||| ||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29704164 ccaaacagagctttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaaattaaaagctcttattttgggt-ttaccaaacaga 29704246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 220 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3270813 - 3270705
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  3270813 aagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 3270714  T
Q  319 ccaaacaga 327  Q
    |||||||||    
T  3270713 ccaaacaga 3270705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 155 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 29374550 - 29374375
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| ||||||||| | || ||||||  ||| | |||||| || || ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29374550 aattataaagggtaaaaaaggattttagaaaaaatagtaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaactctacttggaa 29374451  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagc 329  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  29374450 tagcttctgaaaaatagcttataagctcttgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaacagagc 29374375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3391339 - 3391165
Alignment:
Q  156 attattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaat 255  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||| || |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  3391339 attataaagggtaaacatggattttaattaaaataataagggtaaaaatgggataaaatatgagaagctataagctataagcttaaacgttacttggaat 3391240  T
Q  256 agtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagc 329  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  |||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  3391239 agcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataaactataagttcatggtgaaaaagtattaccaaacagagc 3391165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 50351187 - 50351036
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  50351187 aagctataagctataacctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggttaaaaagtgtta 50351088  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  50351087 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 50351036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 220 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 323020 - 322912
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  323020 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgtta 322921  T
Q  319 ccaaacaga 327  Q
    |||||||||    
T  322920 ccaaacaga 322912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 224 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 26843902 - 26843721
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgttaccaa 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||    
T  26843902 tataagctataaactcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattatcaa 26843803  T
Q  323 acagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    | |||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||| ||  || ||||||||||||    
T  26843802 atagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctatttttttggattttccaaacagaccc 26843721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Original strand, 38967451 - 38967554
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  38967451 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 38967550  T
Q  326 gagc 329  Q
    ||||    
T  38967551 gagc 38967554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 371
Target Start/End: Original strand, 49220453 - 49220605
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| || | ||||||||||    
T  49220453 aagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctgtaagctcacggtgaaaaagtgtta 49220552  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagcta 371  Q
    ||||||||||        ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||    
T  49220553 ccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagcta 49220605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 220 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37703825 - 37703716
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  37703825 aagctataagttataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 37703726  T
Q  319 ccaaacagag 328  Q
    ||||||||||    
T  37703725 ccaaacagag 37703716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 304
Target Start/End: Original strand, 41004945 - 41005057
Alignment:
Q  192 taaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataa 291  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41004945 taagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataagctataagttcaaacgctacttgaaatagcttcttaaaaataacttataagctcatgaaataa 41005044  T
Q  292 gctataaactcat 304  Q
    |||||||||||||    
T  41005045 gctataaactcat 41005057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 328
Target Start/End: Original strand, 37672244 - 37672439
Alignment:
Q  135 ttttaaattataataaaattaattattaagggtaaaca-tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctat 233  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| ||||| |||||| | |||  |||||||| | |  ||||| || || |||||| |||  ||| |||||||||| |||    
T  37672244 ttttaatttataatataataaatgattaaaggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagttat 37672343  T
Q  234 aagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagag 328  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  37672344 aagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 37672439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22099073 - 22098965
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  22099073 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgtta 22098974  T
Q  319 ccaaacaga 327  Q
    |||||||||    
T  22098973 ccaaacaga 22098965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 327
Target Start/End: Original strand, 50171277 - 50171385
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||    
T  50171277 aagctataagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaggtgtta 50171376  T
Q  319 ccaaacaga 327  Q
    |||||||||    
T  50171377 ccaaacaga 50171385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 298
Target Start/End: Original strand, 52703033 - 52703169
Alignment:
Q  162 aagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatc 261  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  52703033 aagggtaaatatgacttttagttaaaataataagggtaaaaatgaaataaaagataaaaagctaaaagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttc 52703132  T
Q  262 tgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  52703133 tgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataa 52703169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 46369959 - 46369853
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  46369959 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagctt---agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 46369863  T
Q  319 ccaaacagag 328  Q
    ||||||||||    
T  46369862 ccaaacagag 46369853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 215 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5697637 - 5697523
Alignment:
Q  215 atgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactca-tggagaaaag 313  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||     
T  5697637 atgataagttataaggtataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcattgtaaaaaac 5697538  T
Q  314 tgttaccaaacagag 328  Q
    |||||||||| ||||    
T  5697537 tgttaccaaatagag 5697523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 406
Target Start/End: Original strand, 18347403 - 18347582
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaag-tgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||   ||||||||||    
T  18347403 aagctataagctcaaacactacttggaatagtgtctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaagacattaccaaaca 18347502  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccat 406  Q
    ||||       ||||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||| || |||  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  18347503 gagc-ttttttgtcaaacaaacttataagctataagctataagctataagctcacttttgggtcttatcaaacagacccat 18347582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34318563 - 34318469
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  34318563 ataagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcatctgaaaaatagcttataagctcgtaaaataagctataagctcgtggtgaaaa 34318469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 43727176 - 43727074
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  43727176 aagctataagctataagttcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagtttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 43727077  T
Q  319 cca 321  Q
    |||    
T  43727076 cca 43727074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 327
Target Start/End: Original strand, 49185079 - 49185273
Alignment:
Q  135 ttttaaattataataaaattaattattaagggtaaaca-tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctat 233  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||  |||||||| | |  ||||| || || || ||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  49185079 ttttaatttataatataataaatgattaagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaattgaaattaaaagtgagaagctataagctat 49185178  T
Q  234 aagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacaga 327  Q
    ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||    
T  49185179 aagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagcttgtgaaataagctataagcttatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 49185273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 224 - 409
Target Start/End: Original strand, 51422968 - 51423155
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||||| | |||||||||| |||    
T  51422968 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagtttataaactcgtgaaataagctataagttcatggtgaaaaagtgttatcaa 51423067  T
Q  323 acagagc-nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataat 409  Q
    ||||| |         |||||| ||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  51423068 acagaacttttttttatcaaacaaacttataagctataagctaaaagttaaaagctcttttttgaatgttaccaaacagacccctaat 51423155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 2479268 - 2479131
Alignment:
Q  267 aatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatg-gagaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaa 365  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  2479268 aatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatgataaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaa 2479169  T
Q  366 gagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
     |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  2479168 aagctaaaagctctttttttggt-ttcccaaacagaccc 2479131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Original strand, 49822082 - 49822239
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| ||||||||| | || ||||||  ||| | |||||| || || ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49822082 aattataaagggtaaaaaaggattttagaaaaaatagtaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacgctacttgaaa 49822181  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    ||   ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  49822182 taacttctaaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaa 49822239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40888030 - 40887898
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaagtgttac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |     |||||||||||    
T  40888030 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtaaaataagctataagctga-----aaaagtgttac 40887936  T
Q  320 caaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaacta 357  Q
    |||||||| |        ||||||||||||||||||||    
T  40887935 caaacagaactttttttatcaaacgaacttataaacta 40887898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 282
Target Start/End: Original strand, 16085526 - 16085653
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    ||||||||||||||||||     ||||| |||| |  ||||| || || |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16085526 aattattaagggtaaacaaaaaatttagataaaataataagggtaaaattggaataaaaaataataagttataagctataagctcaaacgctacttgaaa 16085625  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagctc 282  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16085626 tagcatctgaaaaatagcttataagctc 16085653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 361
Target Start/End: Original strand, 49240268 - 49240403
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |||||  ||||||||||    
T  49240268 aagctataagctcaaacgctatttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagttcatagtgaaaaagcattaccaaaca 49240367  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataag 361  Q
    ||||       |||| |||||||||||| |||||||    
T  49240368 gagctttttttgtcatacgaacttataagctataag 49240403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 267 - 384
Target Start/End: Original strand, 33561922 - 33562040
Alignment:
Q  267 aatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaa 365  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  33561922 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaa 33562021  T
Q  366 gagctaaaaactctttttt 384  Q
     |||||||| |||||||||    
T  33562022 aagctaaaagctctttttt 33562040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34087116 - 34087011
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||    
T  34087116 ataagctataagctcaaacgctacctggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtgaaattagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaa 34087017  T
Q  324 cagagc 329  Q
    ||||||    
T  34087016 cagagc 34087011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 222 - 326
Target Start/End: Original strand, 42614117 - 42614222
Alignment:
Q  222 gctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttacc 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||| | |||| |||||||    
T  42614117 gctataagctataacctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctagaagctcatggtgaaaaaatgttacc 42614216  T
Q  321 aaacag 326  Q
    ||||||    
T  42614217 aaacag 42614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 50540920 - 50540819
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  | |||| | |||||| ||||||||||    
T  50540920 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagtttatggtgaaaaagtattaccaaaca 50540821  T
Q  326 ga 327  Q
    ||    
T  50540820 ga 50540819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 220 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39583251 - 39583143
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  39583251 aagctataaggtataaactcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgttaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgtta 39583152  T
Q  319 ccaaacaga 327  Q
    |||||||||    
T  39583151 ccaaacaga 39583143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 298
Target Start/End: Original strand, 8221187 - 8221293
Alignment:
Q  192 taaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataa 291  Q
    ||||| || |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8221187 taagggtaaaaatggaagaaaaagtgagaagctataagctataaattcaaacgctatttggaatagtttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataa 8221286  T
Q  292 gctataa 298  Q
    |||||||    
T  8221287 gctataa 8221293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33152077 - 33151975
Alignment:
Q  192 taaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataa 291  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33152077 taagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataagttacaagctcaaacgctacttgaaatagcttcttaaaaatagcttataagctcgtgaaataa 33151978  T
Q  292 gct 294  Q
    |||    
T  33151977 gct 33151975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 298
Target Start/End: Original strand, 13570771 - 13570851
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13570771 ataagctataagctataagttcaaacgctatttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagttcgtgaaataagctataa 13570851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 224 - 304
Target Start/End: Original strand, 36379130 - 36379210
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36379130 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaataacttataaactcatgaaataaactataaactcat 36379210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 218 - 324
Target Start/End: Original strand, 9769951 - 9770058
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgt 316  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  9769951 ataagctagaagttataagctcaaacgttatttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgt 9770050  T
Q  317 taccaaac 324  Q
    || |||||    
T  9770051 tatcaaac 9770058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25134998 - 25134895
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc-atggagaaaagtgttaccaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || | |||| ||||||||||    
T  25134998 ataagctataagctcaaacactacttaaaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgttgtaaaaaactgttaccaaa 25134899  T
Q  324 caga 327  Q
    ||||    
T  25134898 caga 25134895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28429144 - 28429076
Alignment:
Q  260 tctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacaga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28429144 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 28429076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 326
Target Start/End: Original strand, 30495182 - 30495282
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaaca 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||    
T  30495182 aagctataagctgaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataaactctagaaataagctataagctcatggtcaaaaagtattaccaaaca 30495281  T
Q  326 g 326  Q
    |    
T  30495282 g 30495282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 337 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 7024880 - 7024813
Alignment:
Q  337 gtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7024880 gtcaaacgaacttataagctatatgctaagagctaaaagctcttttttaggtgttaccaaacagaccc 7024813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7024971 - 7024913
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7024971 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatg 7024913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 298
Target Start/End: Original strand, 46928964 - 46929042
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  46928964 aagctataagctataagcacaaacgctaattagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtaaaataagctataa 46929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44956428 - 44956347
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg 306  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||    
T  44956428 ataagttataagctcaaactctacttggaatagcatctgaaaaataacttataatctcgttaaataagctataagctcatgg 44956347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 302
Target Start/End: Original strand, 28868981 - 28869073
Alignment:
Q  210 aaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc 302  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  28868981 aaaagatgagaaactataagctataagctcaaacgttacttgaaataatttcttaaaaataatttataagctcgtgaaataaactataaactc 28869073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 312
Target Start/End: Original strand, 46087964 - 46088072
Alignment:
Q  204 tggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactca 303  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||   |||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||     
T  46087964 tggaagaaaaaatgataagctataagctacaagctcaaatattacttggaataacgtctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagttataagctcg 46088063  T
Q  304 tggagaaaa 312  Q
    ||| |||||    
T  46088064 tggcgaaaa 46088072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 9895002 - 9894931
Alignment:
Q  210 aaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagct 281  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9895002 aaaaaatgacaagctataaactataagctcaaacgctactttgaatagcgtctgaaaaatagcttataagct 9894931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 40935893 - 40935952
Alignment:
Q  226 taagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  40935893 taagctataagctcaaacgctacttggaatagtttctgaaaaatagtttataaactcatg 40935952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 329
Target Start/End: Original strand, 44718962 - 44719061
Alignment:
Q  231 tataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaag-tgttaccaaacagagc 329  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| ||||||   ||||||||||||||    
T  44718962 tataagcttaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtaaaataagctataagctcgtggtgaaaagacattaccaaacagagc 44719061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6814261 - 6814123
Alignment:
Q  142 ttataataaaattaattattaagggt-aaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctca 240  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||  |||||||| | |  ||||| || || |||||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||    
T  6814261 ttataatacaataaatgattaagggttaaaaatggaatttagttagactaataagggtaaaattggaattaaaagtgaaaagctataagttataagctca 6814162  T
Q  241 aacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataag 279  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  6814161 aacgctacttgaaatagcgtctgaaaaataacttataag 6814123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Original strand, 46056411 - 46056484
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  46056411 ataagctataagcttaaatgctacttgaaatagcgtctgaaaaatatcttataagctcgtgaaataaactataa 46056484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9169203 - 9169151
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataag 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  9169203 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataag 9169151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40719622 - 40719554
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagcta 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40719622 aagctataaactcaaacgctacttgaaataacttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagcta 40719554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 9169143 - 9169043
Alignment:
Q  309 aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataa 408  Q
    |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  9169143 aaaagtgttaccaaacagagctttttttttcaaacgaacttataagctataagctaaaagttaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccctaa 9169044  T
Q  409 t 409  Q
    |    
T  9169043 t 9169043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 912827 - 912730
Alignment:
Q  201 aaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | || ||| |||||| |||  |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  912827 aaatgaaagaaaaaatgataagctataagttataagctcaaatgttatttgaaatagtgtctagaaaataggatataagctcctgaaataagttataa 912730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33632393 - 33632328
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatg 285  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33632393 aagctatcagcaataagctcaaacgctgtttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatg 33632328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42963978 - 42963899
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcat 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||| |||||    
T  42963978 ataagctgtaagctcaaacgctacttgaaatagcttctcaaaaatagcttataaactcgtaaaataaattataagctcat 42963899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Original strand, 10628814 - 10628887
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  |||||||||  | |||||| ||||||    
T  10628814 ataagttataagctcaaacgctacttgaaataatgtctgaaaaataagttataagctagtaaaataaactataa 10628887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 268
Target Start/End: Original strand, 50940120 - 50940184
Alignment:
Q  204 tggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaa 268  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||    
T  50940120 tggaagaaaacataaaaagctataagttataagctcaaaagctacttgaaatagtttctcaaaaa 50940184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2479301 - 2479270
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2479301 aagctataagctataagctcaaacgctacttg 2479270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 251
Target Start/End: Original strand, 33561889 - 33561920
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttg 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33561889 aagctataagctataagctcaaacgctacttg 33561920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12891758 - 12891648
Alignment:
Q  142 ttataataaaattaattattaagggtaaaca-tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctca 240  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| | |||  |||||||| | |  ||||  || ||||||||  |||  ||| |||||||||||||||| ||||    
T  12891758 ttataatataataaattattaagggtaaaaaatggaatttagttagactaataagcgtaaaaatggaaataaaagtgagaagctataagctataaactca 12891659  T
Q  241 aacgctacttg 251  Q
    |||||||||||    
T  12891658 aacgctacttg 12891648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 2459557 - 2459621
Alignment:
Q  193 aaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatag 257  Q
    |||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  2459557 aagggtataaatggaagaaaatgtgaaaagctatcagctataagctaaaaagctacttgaaatag 2459621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 347 - 395
Target Start/End: Original strand, 42614247 - 42614295
Alignment:
Q  347 cttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttacca 395  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  42614247 cttataaactataaactaagagctataagctcttttttaggtgttacca 42614295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 220 - 410
Target Start/End: Original strand, 30811144 - 30811335
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||    
T  30811144 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtatta 30811243  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataata 410  Q
    |||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  30811244 ccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaaactctttttttgggtttcccaaacagacccataata 30811335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 220 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12297516 - 12297326
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  12297516 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 12297417  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataat 409  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  12297416 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaggtaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccataat 12297326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 204 - 401
Target Start/End: Original strand, 34232894 - 34233092
Alignment:
Q  204 tggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactca 303  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  34232894 tggaagaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctca 34232993  T
Q  304 tggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||    
T  34232994 tggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggataaccaaacaga 34233092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 216 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2442580 - 2442411
Alignment:
Q  216 tgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  2442580 tgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagt 2442481  T
Q  315 gttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  2442480 gttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttt 2442411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 32731910 - 32731728
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  32731910 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 32731811  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  32731810 ccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacaga 32731728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 177 - 401
Target Start/End: Original strand, 7317563 - 7317788
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || |||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  7317563 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttat 7317662  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  7317663 aagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaaatgttaccaaacagagctttttctgtgaaacgaacttataagctataagttaagagctaaaag 7317762  T
Q  376 ctcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    ||||||||| |   ||||||||||||    
T  7317763 ctctttttttgagtttaccaaacaga 7317788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 14227531 - 14227715
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  14227531 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 14227630  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||| |||        |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  14227631 ccaaacaaagctttttta-tcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 14227715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 227 - 401
Target Start/End: Original strand, 31100017 - 31100192
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  31100017 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 31100116  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctt-ttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    ||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31100117 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttattttgggt-ttaccaaacaga 31100192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 224 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 20805137 - 20804960
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  20805137 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaa 20805038  T
Q  323 acagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    ||||| |       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||| || |||||||||    
T  20805037 acagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaaactaaaagctctttttttggt-ttcccaaacaga 20804960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 21894450 - 21894310
Alignment:
Q  173 tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagc 272  Q
    ||||||||| ||||| || ||||  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  21894450 tgggttttaattaaaatgataagcgtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagc 21894351  T
Q  273 ttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaag 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  21894350 ttataagctcgtgaaataagctataatctcgtggtgaaaag 21894310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 558512 - 558402
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  558512 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 558413  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  558412 ccaaacagagc 558402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 227 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33453880 - 33453745
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  33453880 aagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 33453781  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataag 361  Q
    ||||       |||||||||||||||||||||||||    
T  33453780 gagctttttttgtcaaacgaacttataaactataag 33453745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 233 - 406
Target Start/End: Original strand, 31451962 - 31452136
Alignment:
Q  233 taagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnn 331  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||      
T  31451962 taagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaacagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctt 31452061  T
Q  332 nnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccat 406  Q
         ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||  || || ||||||||||||||    
T  31452062 tttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttttgttttcccaaacagacccat 31452136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 403
Target Start/End: Original strand, 3636643 - 3636819
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||    
T  3636643 aagctataagttcaaaggctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagcttatggtgaaaaagtgttaccaaaca 3636742  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacc 403  Q
    ||         ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3636743 ga-atttttttgtcaaacaagcttataagctataagttaagagctaaaagctcttttttgaatgttaccaaacagacc 3636819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 220 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 5943143 - 5942957
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  5943143 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 5943044  T
Q  319 ccaaacagagc---nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagac 402  Q
     |||||||| |          |||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  5943043 tcaaacagaacttttttttttgtcaaacgagtttataagctataagccaagagctaaaaacccttttttgaatgttaccaaacagac 5942957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10856277 - 10856133
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  10856277 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 10856178  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    ||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  10856177 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 10856133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Original strand, 12140809 - 12140966
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| ||||||||| |||  ||||||||||| |  ||||| || ||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  12140809 aattataaagggtaaatatgaattttagttaaaataataagggtaaaaaaggaacaaaagataataagctataagctataagttcaaacgctacttgaaa 12140908  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  12140909 tagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcatggtgaaaa 12140966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 220 - 328
Target Start/End: Original strand, 12432616 - 12432725
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  12432616 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatggcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 12432715  T
Q  319 ccaaacagag 328  Q
    ||||||||||    
T  12432716 ccaaacagag 12432725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 224 - 370
Target Start/End: Original strand, 34685015 - 34685161
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaagtgttaccaaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||    
T  34685015 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgtgaaaatgtgttaccaaa 34685114  T
Q  324 cagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    ||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  34685115 cagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 34685161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 220 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2970826 - 2970722
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2970826 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagattataagctcgtgaaataagctataaactcatggtaaaaaagtgtta 2970727  T
Q  319 ccaaa 323  Q
    |||||    
T  2970726 ccaaa 2970722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 218 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28076576 - 28076464
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  28076576 ataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtat 28076477  T
Q  317 taccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||||    
T  28076476 taccaaacagagc 28076464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 328
Target Start/End: Original strand, 33540635 - 33540830
Alignment:
Q  135 ttttaaattataataaaattaattattaagggtaaaca-tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctat 233  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||   |||||||| | |  ||||| || || |||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  33540635 ttttaatttataatataataaataattaagggtaaaaaatgaaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctat 33540734  T
Q  234 aagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagag 328  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||    
T  33540735 aagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagattataagctcgtgaaataagctataagcttatggtgaaaaagtgttaccaaacagag 33540830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5681671 - 5681561
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||     
T  5681671 aagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttg 5681572  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  5681571 ccaaacagagc 5681561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34439899 - 34439725
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| |||| |||| |||| |||||| |||| |  ||||| || |||||||| |||   ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34439899 aattataaaggataaaaatggattttagataaaatattaagggtaaaaatggaagaaattttgagaagctgtaagctataagctcaaacgttacttggaa 34439800  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagag 328  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  34439799 tagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagag 34439725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 218 - 404
Target Start/End: Original strand, 3107999 - 3108180
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaa-taagctataaactcatggag-aaaagtg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  3107999 ataagctataagctataagctcaaacgctatttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaattaagttataagctcatggtgaaaaagtg 3108098  T
Q  316 ttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||| |||||       ||||||||| ||||||| |||||       ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3108099 ttaccaaatagagctttttttgtcaaacgagcttataagctata-------agctataagctcttttctgggtgttaccaaacagaccc 3108180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Original strand, 5301532 - 5301689
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| |||| |||| |||| |||||| |||| |  ||||| || |||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  5301532 aattataaaggataaaaatggattttagataaaatattaagggtaaaaatggaagaaattttgagaagctataagctataagcttaaacgctacttggaa 5301631  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5301632 tagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaa 5301689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 29414919 - 29415091
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||             |||| ||||||| ||||| ||||||    
T  29414919 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct-------------ataagctcatggtgaaaaagtgtta 29415005  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29415006 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctataaactcttttttaggtgttaccaaacagaccc 29415091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 210 - 361
Target Start/End: Original strand, 6709681 - 6709833
Alignment:
Q  210 aaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag- 308  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||| |     
T  6709681 aaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataatttcgtgaaataagctataagctcatggtga 6709780  T
Q  309 aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataag 361  Q
    |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||||    
T  6709781 aaaagtgttaccaaacagaattttttttgtcaaacgaacttataagctataag 6709833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 260 - 405
Target Start/End: Original strand, 1806350 - 1806495
Alignment:
Q  260 tctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactat 358  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||| ||||    
T  1806350 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagattttttagtcaaacgagcttataagctat 1806449  T
Q  359 aagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccca 405  Q
    ||| ||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1806450 aagctataagctaaaagctcttttttgggt-taaccaaacagaccca 1806495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 311
Target Start/End: Original strand, 6104671 - 6104757
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  6104671 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagtatctgaaaaatagcttataagctcgcgaaataagctataagctcgtggtgaaa 6104757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 218 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31049487 - 31049379
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  31049487 ataagctataagctataagctcaaacactatttggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtat 31049388  T
Q  317 taccaaaca 325  Q
    |||||||||    
T  31049387 taccaaaca 31049379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 218 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11015743 - 11015632
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | |||||| |    
T  11015743 ataagctataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctcaaaaatagcttgtaagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtat 11015644  T
Q  317 taccaaacagag 328  Q
    ||||||||||||    
T  11015643 taccaaacagag 11015632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 201 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 34904117 - 34903926
Alignment:
Q  201 aaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaac 300  Q
    |||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||             |||||||| |    
T  34904117 aaatggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata-------------agctataagc 34904031  T
Q  301 tcatggag-aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaaca 399  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||   || |||||||    
T  34904030 tcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggagtttcccaaaca 34903931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 298
Target Start/End: Original strand, 15591082 - 15591224
Alignment:
Q  156 attattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaat 255  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |  ||||| || || |||||| |||  ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  15591082 attattaagggtaaaagtggattttaattaaaataataagggtaaaattggaattaaaagtgacacgctataagttataagctcaaacgctacttgaagt 15591181  T
Q  256 agtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15591182 agcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataa 15591224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20563603 - 20563467
Alignment:
Q  162 aagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatc 261  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| |  ||||| || |||||||| |||| || | || ||| |||||||||||||| | |||||||| |||||  ||    
T  20563603 aagggtaaatatgacttttagttaaaataataagggtaaaaatggaacaaaagataaaaaactaaaagctataagctcagatgctacttgaaatagcttc 20563504  T
Q  262 tgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  20563503 tgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataa 20563467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 371
Target Start/End: Original strand, 29823031 - 29823183
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||| |||||||||||   ||||||||||| | ||||||| | |||| |||||    
T  29823031 aagctataagctataagctcaaacgctactttgaatagcttttgaaaaataacttataagctcgcaaaataagctattagctcatggtgaaaaaatgtta 29823130  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagcta 371  Q
     ||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  29823131 tcaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctatgagcta 29823183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 329
Target Start/End: Original strand, 7292480 - 7292654
Alignment:
Q  156 attattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaat 255  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |  ||||  || || |||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  7292480 attattaagggtaaaagtggattttaattaaaataataagagtaaaactggaattaaaagtgagacgctataagctataagctcaaacgttacttgaagt 7292579  T
Q  256 agtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactca-tggagaaaagtgttaccaaacagagc 329  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| || | ||||| |||| ||||||||||    
T  7292580 agcttatgaaaaatagcttataagcttctgaaataagctataagctcattgtaaaaaagcgttatcaaacagagc 7292654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11443125 - 11443035
Alignment:
Q  192 taaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctc 282  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||    
T  11443125 taaggatataaatggaagaaaagatgataagttaaaagatataagctcaaacgctacttgaaatagagtctggaaaataggttataagctc 11443035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9896867 - 9896766
Alignment:
Q  210 aaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggaga 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| ||| ||    
T  9896867 aaaaaatgataagctataagctattaactcaaacgctacttgaaataacgtctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataaactataagctcgtggtga 9896768  T
Q  310 aa 311  Q
    ||    
T  9896767 aa 9896766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23648338 - 23648267
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23648338 aagctataagctcagaagctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 23648267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 298
Target Start/End: Original strand, 32563210 - 32563317
Alignment:
Q  192 taaggatataaatggaataa-aacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaata 290  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  32563210 taagggtaaaaatggaataagaaaatgataaactataagttataatctcaaacactatttgaaatagcgtctgaaaaataaattataagcttctgaaata 32563309  T
Q  291 agctataa 298  Q
    || |||||    
T  32563310 agttataa 32563317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 295
Target Start/End: Original strand, 5893894 - 5893964
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagcta 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||  |||||||||  | ||||||||||    
T  5893894 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctggaaaataagttataagctagtaaaataagcta 5893964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19415434 - 19415382
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaata 270  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  19415434 ataagctgtaagctataaactcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaata 19415382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26561487 - 26561423
Alignment:
Q  234 aagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  26561487 aagctcaaacgctacttgaaatagcgtttgaaaaataagttataagctcctgaaataaactataa 26561423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1225573 - 1225475
Alignment:
Q  230 ctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacaga 327  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||| ||| ||  | |||||||||| ||||||||    
T  1225573 ctataagctcaaacgctacttgaaataacttctaaaaaatagcttataaacttgtgaaataaaatataagctcttgatgaaaaagtgttatcaaacaga 1225475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 75)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 220 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36685967 - 36685776
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  36685967 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 36685868  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataata 410  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  36685867 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccttaata 36685776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Original strand, 8023970 - 8024152
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  8023970 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 8024069  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    |||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||    
T  8024070 ccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggataaccaaacaga 8024152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 224 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12774723 - 12774542
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  12774723 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaa 12774624  T
Q  323 acagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  12774623 acagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtttcccaaacagaccc 12774542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 14647343 - 14647527
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  14647343 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 14647442  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  14647443 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttaggt-taaccaaacagaccc 14647527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30299849 - 30299684
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  30299849 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 30299750  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  30299749 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaaactctttttt 30299684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 177 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1174978 - 1174750
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || |||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  1174978 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttat 1174879  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| |       || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  1174878 aagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagaactttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaag 1174779  T
Q  376 ctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  1174778 ctctttttttgggtttaccaaacagaccc 1174750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 220 - 387
Target Start/End: Original strand, 6603896 - 6604064
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| |||||    
T  6603896 aagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcacggtgaaaaaatgtta 6603995  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttggg 387  Q
    |||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6603996 ccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataagctataagctaaaagctaaaaactcttttttggg 6604064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 32383000 - 32382812
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  32383000 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 32382901  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccata 407  Q
    ||||||||| |        |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  32382900 ccaaacagaactttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagacccata 32382812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 405
Target Start/End: Original strand, 2236502 - 2236688
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  2236502 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 2236601  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccca 405  Q
    ||||||||||        ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  2236602 ccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagaccca 2236688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 224 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 12713459 - 12713278
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaa 322  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  12713459 tataagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaa 12713360  T
Q  323 acagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  12713359 acagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggggtttcccaaacagaccc 12713278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19525900 - 19525715
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgtta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  19525900 aagctataagctataagctcaaacgctgcttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaggtgtta 19525801  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       |||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  19525800 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagtttataaactataaggtaaaagctaaaagctcttttttagggttaaccaaacagaccc 19525715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 224 - 404
Target Start/End: Original strand, 30412602 - 30412783
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  30412602 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtgaaaaagtgttaccaa 30412701  T
Q  323 acagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||| ||  || ||||||||||||    
T  30412702 acagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctttttttttgggtttcccaaacagaccc 30412783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Original strand, 31168973 - 31169138
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  31168973 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 31169072  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
     |||||||||        ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  31169073 tcaaacagagttttttttgtcaaacgaacttataaactataaactaaaagctaaaaactctttttt 31169138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 227 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3669685 - 3669509
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||| | |||||||||||||||||    
T  3669685 aagctataagctcaaacgctactttgaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctacaagtttatggtaaaaaagtgttaccaaaca 3669586  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagac 402  Q
    ||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3669585 gagctttttttatcaaacgaacttataaactataagctaagagctaaaagctcttttttaggtgttacaaaacagac 3669509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 13228459 - 13228643
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  13228459 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgtta 13228558  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||   || ||||||||||||    
T  13228559 ccaaacagagc-ttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggagtttcccaaacagaccc 13228643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 218 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24794125 - 24793941
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  24794125 ataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgt 24794026  T
Q  317 taccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacaga 401  Q
    |||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||  | ||||||||||    
T  24794025 taccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctactttttggggttaaccaaacaga 24793941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 210 - 411
Target Start/End: Original strand, 30774168 - 30774370
Alignment:
Q  210 aaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-ag 308  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||       
T  30774168 aaaaaatgagaagctaaaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagcttatggtca 30774267  T
Q  309 aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataa 408  Q
    |||||||||||||||||||||       || |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| |||||| |||    
T  30774268 aaaagtgttaccaaacagagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgggtttaccaaagagacccttaa 30774367  T
Q  409 tag 411  Q
    |||    
T  30774368 tag 30774370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 5591739 - 5591555
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  5591739 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagttcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 5591640  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  5591639 ccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttggt-ttcccaaacagaccc 5591555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 39744528 - 39744712
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||    
T  39744528 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgtta 39744627  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    | |||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  39744628 caaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttggt-ttcccaaacagaccc 39744712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 177 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 10697463 - 10697235
Alignment:
Q  177 ttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttat 276  Q
    |||| |||||| || ||||| || |||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  10697463 tttttgttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttat 10697364  T
Q  277 aagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||       || ||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  10697363 aagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagctttttttgtgaaatgagcttataagctataagctaagagctaaaag 10697264  T
Q  376 ctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  10697263 ctctttttttgggtttaccaaacaaaccc 10697235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 35640091 - 35639901
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  35640091 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtgaaaaagtatta 35639992  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataata 410  Q
     ||||||||||        |||||||| |||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||| |||||    
T  35639991 tcaaacagagctttttttatcaaacgagcttataaattataagttaaaaactaaaagctctttttttggt-ttcccaaactgacccttaata 35639901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 404
Target Start/End: Original strand, 4221466 - 4221643
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  4221466 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 4221565  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    || |       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||    
T  4221566 gaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttgagt-taaccaaacagaccc 4221643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 361
Target Start/End: Original strand, 26699092 - 26699234
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  26699092 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcctctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 26699191  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataag 361  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| |||||||    
T  26699192 ccaaacagagctttatttgtcaaacgagcttataacctataag 26699234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 361
Target Start/End: Original strand, 26968825 - 26968967
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  26968825 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcctctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 26968924  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataag 361  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| |||||||    
T  26968925 ccaaacagagctttatttgtcaaacgagcttataacctataag 26968967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 1711189 - 1711374
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  1711189 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgtta 1711288  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  1711289 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctataagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagaccc 1711374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39275574 - 39275409
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  39275574 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgtta 39275475  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    ||||||||| |       ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  39275474 ccaaacagaactttttttgtcaaacgagcttataagctataagttaaaagctaaaagctatttttt 39275409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 218 - 405
Target Start/End: Original strand, 19956292 - 19956478
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  19956292 ataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctg-aaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgt 19956390  T
Q  317 taccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccca 405  Q
    |||||||||||||       || |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||||||    
T  19956391 taccaaacagagctttttttgttaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttaggt-taaccaaagagaccca 19956478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 220 - 387
Target Start/End: Original strand, 32381660 - 32381828
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  32381660 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 32381759  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttggg 387  Q
    ||||||| ||        ||||||| | ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  32381760 ccaaacatagttttttttgtcaaacaagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttggg 32381828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 227 - 394
Target Start/End: Original strand, 6893372 - 6893539
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  6893372 aagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaactagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 6893471  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttacc 394  Q
    ||||       ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6893472 gagc-ttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaagagctaacagctcttttttgggtgttacc 6893539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 227 - 370
Target Start/End: Original strand, 39246830 - 39246973
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaagtgttaccaaacag 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39246830 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaagtgttaccaaacag 39246929  T
Q  327 agcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagct 370  Q
    |||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  39246930 agctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagct 39246973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Original strand, 3037411 - 3037576
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3037411 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtaaaaaagtgtta 3037510  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    ||||||| | |        |||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3037511 ccaaacatacctttttttatcaaacaagcttataagctataagttaaaagctaaaagctctttttt 3037576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 3670493 - 3670264
Alignment:
Q  156 attattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaat 255  Q
    ||||| ||||||| | |||  |||| |||||| || ||||| || |||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3670493 attataaagggtagatatgaatttttgttaaattgataagggtaaaaatgagacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaat 3670394  T
Q  256 agtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaa 354  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||||        || |||||| || ||||     
T  3670393 agcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagcgcatggtcaaaaagtgttaccaaacagagttttttttgtgaaacgagctcataag 3670294  T
Q  355 ctataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3670293 ctataagctaagagctaaaagctctttttt 3670264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 220 - 409
Target Start/End: Original strand, 5997880 - 5998063
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||||    
T  5997880 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcacggtgaaaaagtgtta 5997979  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccataat 409  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| |||||       |||||||| ||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  5997980 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctata-------agctaaaagctcatttttggggtttcccaaacagacccataat 5998063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 11062868 - 11063003
Alignment:
Q  195 ggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagct 294  Q
    ||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11062868 ggataaaaatggaagaaaaagtgagaagctataaactataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagtt 11062967  T
Q  295 ataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagc 329  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11062968 ataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagagc 11063003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 155 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19347922 - 19347747
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| ||||||||| | || ||||||  ||| | |||||| || || ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19347922 aattataaagggtaaaaaaggattttagaaaaaatagtaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacgctacttggaa 19347823  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaacagagc 329  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  19347822 tagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaacagagc 19347747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Original strand, 9160678 - 9160788
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  9160678 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 9160777  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  9160778 ccaaacagagc 9160788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 210 - 403
Target Start/End: Original strand, 35236643 - 35236838
Alignment:
Q  210 aaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-ag 308  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||       
T  35236643 aaaaaatgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtca 35236742  T
Q  309 aaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacc 403  Q
    |||||||||||||||||||||         | |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||    
T  35236743 aaaagtgttaccaaacagagcttttttttatgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttttttggtttaccaaacagacc 35236838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27130484 - 27130375
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  27130484 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 27130385  T
Q  319 ccaaacagag 328  Q
    ||||||||||    
T  27130384 ccaaacagag 27130375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 328
Target Start/End: Original strand, 35235713 - 35235822
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  35235713 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 35235812  T
Q  319 ccaaacagag 328  Q
    ||||||||||    
T  35235813 ccaaacagag 35235822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 43402595 - 43402453
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  43402595 aagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 43402496  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataag 361  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| |||||||    
T  43402495 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataag 43402453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 224 - 384
Target Start/End: Original strand, 11663881 - 11664042
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  11663881 tataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataaacttatggtcaaaaagtgttaccaa 11663980  T
Q  323 acagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    |||||||       || |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11663981 acagagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttt 11664042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 407
Target Start/End: Original strand, 13156879 - 13157060
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||||    
T  13156879 aagctataagctcaaaagctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagttaatggtgaaaaagtgttaccaaaca 13156978  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccata 407  Q
    ||||       ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  13156979 gagctttttttgtcaaacaaacttataagctataaggtaaaagctaaaagctcttttttggggtttttcaaacagacccata 13157060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 220 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2178911 - 2178767
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  2178911 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 2178812  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagtt 363  Q
    ||||||||||        ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2178811 ccaaacagagttttttttgtcaaacgagcttataaactaaaagtt 2178767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 227 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2671558 - 2671410
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  2671558 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 2671459  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaa 374  Q
    ||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  2671458 gagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaa 2671410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 220 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15443607 - 15443419
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  15443607 aagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 15443508  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccata 407  Q
    |||| || | |       ||||||||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||||| ||  || ||| |||||||||||    
T  15443507 ccaaccaaaactaaacttgtcaaacgaacttataagctataaactaaaagttaaaaactctttttttgggtttcccagacagacccata 15443419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Original strand, 5381930 - 5382040
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  5381930 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagttataagctcgtggtgaaaaagtgtta 5382029  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  5382030 ccaaacagagc 5382040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 220 - 329
Target Start/End: Original strand, 22977191 - 22977301
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa-gtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  22977191 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttatgaaaaatagtttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaggtgtta 22977290  T
Q  319 ccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||    
T  22977291 ccaaacagagc 22977301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 12363598 - 12363783
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  12363598 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgtta 12363697  T
Q  319 ccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||| |        ||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  12363698 ccaaacagaacttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagttaaaagctcttttctggat-taaccaaacagaccc 12363783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 227 - 384
Target Start/End: Original strand, 29392100 - 29392257
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  29392100 aagctataagctcaaacgctatttggaatagcttttaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 29392199  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    ||||       ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  29392200 gagc-ttttttgtcaaacgagcttataaactataagctaaaagctaaaagctctttttt 29392257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 223 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4379406 - 4379300
Alignment:
Q  223 ctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttacca 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  4379406 ctataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttacca 4379307  T
Q  322 aacagag 328  Q
    |||||||    
T  4379306 aacagag 4379300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15530586 - 15530480
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  15530586 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 15530487  T
Q  319 ccaaaca 325  Q
    |||||||    
T  15530486 ccaaaca 15530480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 220 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 7651791 - 7651682
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  7651791 aagctataagctataagctcaaacactacttgaaatagcttctgaaaaatagattataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 7651692  T
Q  319 ccaaacagag 328  Q
    ||||||||||    
T  7651691 ccaaacagag 7651682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16474981 - 16474844
Alignment:
Q  161 taagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtat 260  Q
    |||||||| | |||| |||||| |||| |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  16474981 taagggtataaatggtttttagataaaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 16474882  T
Q  261 ctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  16474881 ctaaaaaatagcttataatctcgtgaaataaactataa 16474844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 220 - 328
Target Start/End: Original strand, 36027977 - 36028086
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  36027977 aagctataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtaaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 36028076  T
Q  319 ccaaacagag 328  Q
    ||||||||||    
T  36028077 ccaaacagag 36028086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5521465 - 5521341
Alignment:
Q  204 tggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactca 303  Q
    ||||| |||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5521465 tggaagaaaagataatgagctataagctataaactcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctca 5521366  T
Q  304 tggag-aaaagtgttaccaaacaga 327  Q
    ||| | |||||||||||||||||||    
T  5521365 tggtgaaaaagtgttaccaaacaga 5521341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 384
Target Start/End: Original strand, 9587179 - 9587338
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  9587179 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaaca 9587278  T
Q  326 gagc-nnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactctttttt 384  Q
    || |        ||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||    
T  9587279 gaacttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctataagctaaaagctctttttt 9587338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 648677 - 648572
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||||||    
T  648677 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagcattaccaaa 648578  T
Q  324 cagagc 329  Q
    ||||||    
T  648577 cagagc 648572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 298
Target Start/End: Original strand, 11100690 - 11100826
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||| || | |||||| |||| |||||||       ||||||||||||||||||||||| ||    
T  11100690 aattataaagggtaaatatgggttttagttaaaataataagggtaaagatggaagaaaaaatgataa-------gctataagctcaaacgctacttggaa 11100782  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11100783 tagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 11100826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13936338 - 13936265
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13936338 ataagctataagctcaaatgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 13936265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 4657582 - 4657649
Alignment:
Q  215 atgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctc 282  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4657582 atgataagttataagctataagctcaaactctacttgaaatagtttctgaaaaatagcttataagctc 4657649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 223 - 325
Target Start/End: Original strand, 9627143 - 9627246
Alignment:
Q  223 ctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactca-tggagaaaagtgttacca 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||    
T  9627143 ctataagttataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagcttctgaaataagctataagctcattgtaaaaaagtgttatca 9627242  T
Q  322 aaca 325  Q
    ||||    
T  9627243 aaca 9627246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 218 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23920610 - 23920424
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaa-agtgt 316  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| |||| |  ||    
T  23920610 ataagctataaactctaagttcaaacactacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcctggtgaaagatagt 23920511  T
Q  317 taccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||||       |||| |||||||||||| ||||  | ||  ||||  || || |||||| |||||||||||||||||||    
T  23920510 taccaaacagagctatttttgtcatacgaacttataagctatccgctataagct-taagcttttttttaggtgttaccaaacagaccc 23920424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 404
Target Start/End: Original strand, 25872284 - 25872379
Alignment:
Q  309 aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||| || ||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25872284 aaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaatgagcttataagctataagctacgagctaaaagctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 25872379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4875795 - 4875713
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  | | ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  4875795 aagctataagctataagctcaaacgctactttgaatagcttttaaaaaatagcttataaactcctaaaataaactataaactc 4875713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6349495 - 6349429
Alignment:
Q  216 tgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctc 282  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  6349495 tgataagttataagctataagctcaaacgctacttagaatagcgtctgaaaaatagtttataagctc 6349429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13921871 - 13921798
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  13921871 ataagttataagttcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagcttttaagctcgtgaaataagttataa 13921798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2497709 - 2497622
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  |||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  2497709 ataagttataagctcaaacgctatttagaatagcttttgaaaaataacttataagctcgtgaaataagttataatctcatggtgaaaa 2497622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 27005844 - 27005918
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  | || ||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  27005844 tataagctataagctcaaacgttacttgaaatagcgtttggaaaataagttataagctcttgaaataagctataa 27005918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 278
Target Start/End: Original strand, 42323591 - 42323651
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataa 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  42323591 ataaactataagctataagctcaaacactacttagaatagcgtctgaaaaatagcttataa 42323651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 298
Target Start/End: Original strand, 32321652 - 32321726
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||  |||||||||||  || |||| || |||||||||||||||    
T  32321652 tataagctataagctcaaacgttatttgaaatagagtctgaaaaataagttgtaagttcgtgaaataagctataa 32321726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31408074 - 31407991
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactc 302  Q
    |||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  31408074 ataagctata-gttataatcttaaacgctaattggaatagcgtctgacaaatagcttataagctcgtgaaataagttattaactc 31407991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11780192 - 11780117
Alignment:
Q  224 tataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaa 299  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||   ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11780192 tataaactataagctcaaacgttacttaaaataaagtctaaaaaatagtttataagctcacgaaaaaagctataaa 11780117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 305
Target Start/End: Original strand, 6280376 - 6280526
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| |||| |||| |||| |||||| |||| |  ||||| || |||| ||| |||   ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  6280376 aattataaaggataaaaatggattttagataaaatattaaggttaaaaatagaagaaattttgagaagttataagctataagcttaaatgctacttgaaa 6280475  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatg 305  Q
    ||   | |||||||||| |||||| | | |||||||| |||||| ||||||    
T  6280476 taacttatgaaaaatagtttataaacccgtgaaataaactataagctcatg 6280526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 285
Target Start/End: Original strand, 25872221 - 25872279
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatg 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||| |||||    
T  25872221 aagctataagctcaaactctacttggaatagcttctgaaaaataaattataagttcatg 25872279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 5521306 - 5521278
Alignment:
Q  376 ctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5521306 ctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 5521278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1632 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1632
Description:

Target: scaffold1632; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 210 - 404
Target Start/End: Original strand, 22 - 217
Alignment:
Q  210 aaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-ag 308  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||       
T  22 aaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtca 121  T
Q  309 aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||||||||||||       || |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||    
T  122 aaaagtgttaccaaacagagctttttttgtgaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctctttttttgagtttaccaaacagaccc 217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22746 - 22561
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  22746 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 22647  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  22646 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctcttttttcgggttaaccaaacagaccc 22561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 126755 - 126939
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  126755 aagctataagctataagctcaagcgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 126854  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||    
T  126855 ccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttcttgggt-taaccaaacagaccc 126939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 12712 - 12897
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  12712 aagctataagctataacctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtcaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 12811  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||        |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  12812 ccaaacagagctttttttatcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttgggtttcccaaacagaccc 12897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Original strand, 28071 - 28265
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaa---------taagctataaactcatggagaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  |||||         |||||||||| ||||||| |||    
T  28071 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaaaatagcttataagctataagctcatggtgaa 28170  T
Q  311 aa-gtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    || |||||| ||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28171 aaagtgttatcaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaagagctaaaagctcttttttgagtgttaccaaacagaccc 28265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 360
Target Start/End: Original strand, 30179 - 30313
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  30179 aagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 30278  T
Q  326 gagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataa 360  Q
    |||        ||||||||| ||||||||||||||    
T  30279 gagttttttttgtcaaacgagcttataaactataa 30313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 64081 - 63887
Alignment:
Q  135 ttttaaattataataaaattaattattaagggtaaaca-tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctat 233  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||  |||||||| | |  ||||| || || |||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  64081 ttttaatttataatataataaatgattaagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctat 63982  T
Q  234 aagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacaga 327  Q
    |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  63981 aagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaga 63887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 362 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 63866 - 63821
Alignment:
Q  362 ttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagacccata 407  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  63866 ttaagagctataagctcttttttgagtgttaccaaacagacccata 63821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 431409 - 431275
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  431409 aagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 431310  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataa 353  Q
    |||||||||||       |||||||||||||||||    
T  431309 ccaaacagagctttttttgtcaaacgaacttataa 431275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 201 - 298
Target Start/End: Original strand, 119215 - 119312
Alignment:
Q  201 aaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  119215 aaatggaataaaagatgataagttataagctataagctcaaactctacttggaataggatctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 119312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 220 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 7208 - 7024
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgtta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  7208 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgtta 7109  T
Q  319 ccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    ||||||||| |       |||||||||||||| || ||||||| ||| | |||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  7108 ccaaacagaactttttttgtcaaacgaacttaaaagctataagctaaaaactaaaagctctttttgaggt-taaccaaacagaccc 7024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 192166 - 192054
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  192166 ataagctataagctataagctcaaaagctacttggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtat 192067  T
Q  317 taccaaacagagc 329  Q
    |||||||||||||    
T  192066 taccaaacagagc 192054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1173 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1173
Description:

Target: scaffold1173; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 404 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 2163 - 2064
Alignment:
Q  404 cataatagtaatcttgaaaatactgtgatggggtcatctgataataaaatggataggtttcaaagtattgaagtggaataacttcatttgtatttgttga 503  Q
    |||| ||||||| |||||||||  ||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2163 catagtagtaattttgaaaatatcgtggttgagtcatctgataataaaatggataggtgtcaaagtattgaagtggaataacttcatttgtatttgttga 2064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 329
Target Start/End: Original strand, 53023 - 53126
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  53023 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataggctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 53122  T
Q  326 gagc 329  Q
    ||||    
T  53123 gagc 53126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 298
Target Start/End: Original strand, 72743 - 72838
Alignment:
Q  203 atggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  72743 atggaagaaaaaatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgaaataggttctaaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 72838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 306
Target Start/End: Original strand, 93381 - 93467
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  93381 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttatgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgg 93467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 84402 - 84329
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  84402 ataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataa 84329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 260 - 404
Target Start/End: Original strand, 27169 - 27315
Alignment:
Q  260 tctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggag-aaaagtgttaccaaacagagc-nnnnnnngtcaaacgaacttataaacta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||        ||||||||| ||||||| |||    
T  27169 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacatagctttattttgtcaaacgagcttataagcta 27268  T
Q  358 taagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  27269 taagctaaaagctaaaagctcttttttggggttaaccaaacagaccc 27315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5552 - 5451
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatgg-agaaaagtgttaccaaaca 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  5552 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataacttataagctcgtgaaataag-tataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 5454  T
Q  326 gag 328  Q
    |||    
T  5453 gag 5451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 220 - 285
Target Start/End: Original strand, 41760 - 41825
Alignment:
Q  220 aagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41760 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatg 41825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 404
Target Start/End: Original strand, 41830 - 41924
Alignment:
Q  309 aaaagtgttaccaaacagagcnnnnnnngtcaaacgaacttataaactataagttaagagctaaaaactcttttttgggtgttaccaaacagaccc 404  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  41830 aaaagtgttaccaaacagagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctaaaagctaaaagctctttttttggt-ttcccaaacagaccc 41924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 4636 - 4565
Alignment:
Q  227 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4636 aagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataa 4565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9376 - 9305
Alignment:
Q  225 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctat 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9376 ataagctataagctcaaacactacttgaaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctat 9305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10918 - 10836
Alignment:
Q  216 tgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 298  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10918 tgataagctataaaccgtaagctcaaacgctatttggaatagcgtctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataa 10836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1360 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1360
Description:

Target: scaffold1360; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 281
Target Start/End: Original strand, 1175 - 1301
Alignment:
Q  155 aattattaagggtaaacatgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaa 254  Q
    |||||| | |||||||  ||| |||||| |||| |  ||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1175 aattataatgggtaaaattggattttagataaaataataagggtaaaaatgaaagaaaatatgataagctataagctataagctcaaatgctacttgaaa 1274  T
Q  255 tagtatctgaaaaatagcttataagct 281  Q
    ||   | |||||||| ||| |||||||    
T  1275 taacgtttgaaaaatggctcataagct 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Original strand, 8956 - 9049
Alignment:
Q  218 ataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggagaaaa 312  Q
    ||||| |||| | |||||||| ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  8956 ataagttatacgatataagcttaaatgctacttgaaa-agtgtctgaaaaatagcttataaacttgtgaaataaactataagctcgtggtgaaaa 9049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11913 - 11855
Alignment:
Q  173 tgggttttagttaaagtggtaaggatataaatggaataaaacatgataagctataagct 231  Q
    ||||||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11913 tgggttttaataaaaatgataaggataaaaatggaataaaaaatgataagttataagct 11855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University