View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7075_low_9 (Length: 320)

Name: NF7075_low_9
Description: NF7075
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7075_low_9
NF7075_low_9
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (1-306)||(22183291-22183596)
chr2 (49-289)||(36270308-36270548)
chr2 (29-306)||(18822205-18822483)
chr2 (45-289)||(21330070-21330317)
chr2 (27-289)||(18796626-18796891)
chr2 (27-289)||(18619924-18620188)
chr2 (123-280)||(20978091-20978249)
chr2 (199-289)||(36799780-36799870)
chr2 (29-256)||(18851918-18852144)
chr2 (69-279)||(19279450-19279660)
chr2 (99-286)||(6991939-6992129)
chr2 (93-197)||(36801897-36802003)
chr2 (143-198)||(24250223-24250279)
chr2 (143-198)||(30174432-30174488)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (28-306)||(12014091-12014370)
chr1 (40-289)||(27131231-27131483)
chr1 (45-289)||(18252168-18252415)
chr1 (27-209)||(3855823-3856006)
chr1 (27-306)||(12006350-12006626)
chr1 (69-289)||(18532336-18532559)
chr1 (41-306)||(23507034-23507300)
chr1 (45-209)||(21171137-21171302)
chr1 (45-289)||(27310399-27310646)
chr1 (46-209)||(16358939-16359103)
chr1 (46-209)||(36816537-36816701)
chr1 (27-289)||(27277380-27277644)
chr1 (46-209)||(22657125-22657289)
chr1 (27-198)||(9917834-9918005)
chr1 (201-286)||(9916603-9916688)
chr1 (143-209)||(19706619-19706686)
chr1 (143-209)||(43802545-43802612)
chr1 (143-198)||(9456171-9456227)
chr1 (143-198)||(20779836-20779892)
chr1 (143-198)||(22670448-22670504)
chr1 (143-198)||(42817180-42817236)
chr1 (143-198)||(47667665-47667721)
chr1 (143-209)||(28134903-28134970)
chr1 (143-198)||(20391430-20391486)
chr1 (143-209)||(22612547-22612614)
chr1 (243-289)||(22641696-22641741)
chr1 (162-209)||(51997353-51997401)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (29-289)||(24642771-24643033)
chr8 (45-289)||(21940803-21941050)
chr8 (44-289)||(6094260-6094508)
chr8 (69-286)||(14983748-14983964)
chr8 (45-289)||(22171625-22171872)
chr8 (29-271)||(38232219-38232462)
chr8 (70-282)||(2375167-2375386)
chr8 (139-289)||(15326430-15326583)
chr8 (139-289)||(15506799-15506952)
chr8 (143-209)||(8371433-8371500)
chr8 (143-209)||(12562178-12562245)
chr8 (143-209)||(21969388-21969455)
chr8 (143-209)||(25611250-25611317)
chr8 (143-198)||(22130800-22130856)
chr8 (143-198)||(27007708-27007764)
chr8 (143-198)||(27014851-27014907)
chr8 (143-198)||(27880678-27880734)
chr8 (143-198)||(28020859-28020915)
chr8 (143-209)||(24797292-24797359)
chr8 (90-183)||(29645537-29645630)
chr8 (143-198)||(21916731-21916787)
chr8 (155-209)||(26240551-26240606)
chr8 (37-158)||(32872797-32872918)
chr8 (249-289)||(28548393-28548432)
chr8 (155-198)||(45534464-45534508)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (29-289)||(188799-189062)
chr6 (45-289)||(11651861-11652108)
chr6 (69-289)||(17684291-17684514)
chr6 (45-289)||(17691262-17691509)
chr6 (69-289)||(27381074-27381297)
chr6 (69-289)||(27471457-27471680)
chr6 (49-289)||(28172698-28172939)
chr6 (45-289)||(29309028-29309275)
chr6 (45-289)||(29315988-29316235)
chr6 (45-177)||(16566257-16566389)
chr6 (45-289)||(13359095-13359338)
chr6 (71-288)||(17850321-17850538)
chr6 (90-286)||(2669476-2669673)
chr6 (140-209)||(16394349-16394419)
chr6 (155-289)||(27296877-27297014)
chr6 (143-209)||(18020021-18020088)
chr6 (153-289)||(25537013-25537152)
chr6 (88-256)||(27925935-27926103)
chr6 (143-198)||(16789126-16789182)
chr6 (143-198)||(22860079-22860135)
chr6 (29-125)||(25537148-25537244)
chr6 (243-288)||(16559295-16559339)
chr6 (70-214)||(20553488-20553631)
chr6 (143-198)||(27508538-27508594)
chr6 (143-198)||(27528124-27528180)
chr6 (243-289)||(16394267-16394312)
chr6 (155-198)||(1586299-1586343)
[»] scaffold0390 (2 HSPs)
scaffold0390 (45-289)||(6756-7003)
scaffold0390 (44-289)||(13772-14020)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (45-289)||(2143-2390)
scaffold0234 (45-289)||(11034-11281)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (45-289)||(15152581-15152828)
chr7 (45-289)||(29327922-29328169)
chr7 (45-289)||(11542802-11543049)
chr7 (45-289)||(12750964-12751211)
chr7 (29-209)||(18561129-18561310)
chr7 (29-287)||(12738658-12738919)
chr7 (45-209)||(11535966-11536131)
chr7 (69-217)||(18257738-18257887)
chr7 (46-282)||(13392289-13392528)
chr7 (27-261)||(7662517-7662751)
chr7 (154-282)||(2365169-2365298)
chr7 (108-236)||(10235363-10235492)
chr7 (29-128)||(15148264-15148363)
chr7 (143-209)||(8465054-8465121)
chr7 (143-198)||(2204607-2204663)
chr7 (143-198)||(18400159-18400215)
chr7 (143-198)||(18407143-18407199)
chr7 (143-198)||(48808687-48808743)
chr7 (27-165)||(7396309-7396450)
chr7 (143-209)||(19230943-19231010)
chr7 (143-209)||(30254193-30254260)
chr7 (27-125)||(2365015-2365112)
chr7 (88-172)||(47833899-47833983)
chr7 (155-198)||(15729818-15729862)
chr7 (162-209)||(16011515-16011563)
chr7 (155-198)||(18139529-18139573)
chr7 (143-183)||(19859177-19859217)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (29-289)||(19714320-19714583)
chr5 (27-289)||(18806858-18807121)
chr5 (45-289)||(24695288-24695535)
chr5 (29-209)||(19707122-19707303)
chr5 (133-290)||(17298722-17298880)
chr5 (70-231)||(22546898-22547060)
chr5 (29-205)||(39538710-39538887)
chr5 (103-286)||(17285575-17285759)
chr5 (45-289)||(18569683-18569932)
chr5 (27-167)||(27347425-27347565)
chr5 (145-289)||(18829385-18829530)
chr5 (182-289)||(18806498-18806605)
chr5 (182-289)||(18806678-18806785)
chr5 (143-209)||(20941082-20941149)
chr5 (143-209)||(25805565-25805632)
chr5 (143-198)||(31954-32010)
chr5 (143-198)||(23545977-23546033)
chr5 (155-209)||(22941317-22941372)
chr5 (143-198)||(12789854-12789910)
chr5 (155-198)||(24933497-24933541)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (45-289)||(19926582-19926829)
chr4 (45-289)||(55612821-55613068)
chr4 (45-209)||(4426508-4426673)
chr4 (45-289)||(8858305-8858552)
chr4 (69-289)||(18262374-18262597)
chr4 (69-289)||(18269235-18269458)
chr4 (29-289)||(28392956-28393219)
chr4 (44-289)||(10621155-10621403)
chr4 (44-289)||(10628234-10628482)
chr4 (69-289)||(868759-868982)
chr4 (45-289)||(5707458-5707705)
chr4 (45-289)||(5714086-5714333)
chr4 (69-289)||(26963802-26964025)
chr4 (69-289)||(26970625-26970848)
chr4 (40-289)||(20311425-20311675)
chr4 (56-287)||(32646627-32646859)
chr4 (27-289)||(35223680-35223945)
chr4 (45-289)||(8845341-8845588)
chr4 (27-208)||(56516176-56516358)
chr4 (39-289)||(5667949-5668200)
chr4 (27-129)||(10677540-10677640)
chr4 (27-129)||(10891180-10891280)
chr4 (91-169)||(24700213-24700291)
chr4 (143-219)||(21454033-21454110)
chr4 (143-209)||(15461552-15461619)
chr4 (143-198)||(2677068-2677124)
chr4 (143-198)||(5870473-5870529)
chr4 (162-289)||(10677404-10677534)
chr4 (162-289)||(10891044-10891174)
chr4 (143-198)||(15815076-15815132)
chr4 (143-198)||(17300150-17300206)
chr4 (143-198)||(18111234-18111290)
chr4 (143-198)||(34975606-34975662)
chr4 (244-289)||(4426438-4426482)
chr4 (143-198)||(3369214-3369270)
chr4 (70-116)||(468756-468802)
chr4 (70-124)||(39074190-39074244)
chr4 (155-198)||(4676174-4676218)
chr4 (155-198)||(20244004-20244048)
chr4 (155-198)||(26531680-26531724)
chr4 (143-183)||(33888594-33888634)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (45-289)||(16482305-16482552)
chr3 (69-289)||(6110226-6110449)
chr3 (69-289)||(10572414-10572637)
chr3 (69-289)||(15600706-15600929)
chr3 (69-289)||(15607251-15607474)
chr3 (45-289)||(17780940-17781187)
chr3 (70-289)||(10579177-10579399)
chr3 (40-289)||(13248740-13248992)
chr3 (45-289)||(18520113-18520360)
chr3 (70-289)||(13211465-13211687)
chr3 (30-209)||(13516934-13517114)
chr3 (70-289)||(17200006-17200228)
chr3 (45-289)||(18522801-18523048)
chr3 (69-289)||(32056721-32056945)
chr3 (45-289)||(15342041-15342288)
chr3 (45-289)||(15357408-15357655)
chr3 (88-289)||(8490676-8490880)
chr3 (49-209)||(1647425-1647586)
chr3 (27-289)||(29925091-29925356)
chr3 (27-289)||(29974244-29974509)
chr3 (45-289)||(17136497-17136738)
chr3 (27-289)||(16200551-16200815)
chr3 (72-272)||(24253230-24253430)
chr3 (182-281)||(9504587-9504686)
chr3 (44-183)||(9504420-9504559)
chr3 (143-209)||(14890446-14890513)
chr3 (143-209)||(15846716-15846783)
chr3 (143-209)||(21034293-21034360)
chr3 (143-198)||(20147745-20147801)
chr3 (143-209)||(21398847-21398914)
chr3 (45-134)||(19089725-19089814)
chr3 (155-198)||(55427088-55427132)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (45-287)||(7245-7490)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (69-289)||(18450-18673)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (27-209)||(5649-5832)
[»] scaffold0186 (1 HSPs)
scaffold0186 (69-289)||(25812-26035)
[»] scaffold0657 (1 HSPs)
scaffold0657 (44-289)||(1130-1378)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (139-289)||(230213-230366)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (143-209)||(8360-8427)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (143-209)||(238-305)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (143-198)||(3866-3922)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (143-198)||(119785-119841)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (143-198)||(130415-130471)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (69-210)||(90018-90161)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (155-209)||(67554-67609)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22183596 - 22183291
Alignment:
Q  1 gaagtggtttcttcggagtgttaccgattattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183596 gaagtggtttcttcggagtgttaccgattattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtg 22183497  T
Q  101 ggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatattatattggattgacccgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183496 ggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatattatattggattgacccgc 22183397  T
Q  201 catgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccaacgtgtactct 300  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183396 catgacaatgttacatataatgttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccaacgtgtactct 22183297  T
Q  301 tgatgt 306  Q
    ||||||    
T  22183296 tgatgt 22183291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 289
Target Start/End: Original strand, 36270308 - 36270548
Alignment:
Q  49 tcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaa 148  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||   || | || || ||||||||||    
T  36270308 tcaagctttagtgtgaagagggataacattaaagtataaagactattgtgtgggtagactgatgatcacatctcacgagtcatagagaaagagttatcaa 36270407  T
Q  149 gtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattct 247  Q
    || ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  36270408 gttttcacttcgatttaaatattaggagtaatatttatattggattgactcgccatgagaatgttacatagaaaattatgtaaaggtcacaagtcattct 36270507  T
Q  248 catagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  36270508 catagtgataagtggtgtatt-cacccttcgacctaaaacca 36270548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 306
Target Start/End: Original strand, 18822205 - 18822483
Alignment:
Q  29 tattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagat 128  Q
    ||||||| ||| || |||| |||||||||||| ||||   ||||| |||||||| | | ||| ||||| ||   |||| ||||||||| || |||| |||    
T  18822205 tattcttaaaacatatgtaatcaagctttagtttgaagtgggatatcattaaagcagatagattattatgtcaatagactgatgatcacatatcacggat 18822304  T
Q  129 ctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatg 227  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  18822305 cattgataaggagttatcaacttttcacatagatataaatattaatggtaatatttatattggattgatctgccatgagattgttacataaaacgttatg 18822404  T
Q  228 taaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgt 306  Q
    ||||  || || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || |||||    
T  18822405 taaagatctcaagtcattctcatatagataagtggtgtattccacccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgt 18822483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21330317 - 21330070
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| || ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  21330317 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtggactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 21330218  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  21330217 tcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 21330118  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21330117 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 21330070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 289
Target Start/End: Original strand, 18796626 - 18796891
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacag 126  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||   | ||| |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18796626 attattcttaaattatctgtagtcaagctttattgtgaagtggtatatcattaaagcattgagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacag 18796725  T
Q  127 atctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattt 223  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||  ||||||   ||  |    
T  18796726 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctctatgagaatactacatagtaaaagt 18796825  T
Q  224 tatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||| |||  |||| | |  ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18796826 tatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-ggtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 18796891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 289
Target Start/End: Original strand, 18619924 - 18620188
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacag 126  Q
    ||||||||| || ||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||| |    
T  18619924 attattcttaaagtatctgtggtcaaactttattgtgaaaagggataatattaaagcatatagactattatgtgggtaggccgatgatcacatctcacgg 18620023  T
Q  127 atctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattt 223  Q
    ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||   ||  |    
T  18620024 atcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagt 18620123  T
Q  224 tatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||| ||  |||| | |  |||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18620124 tatgaaagtgtcataagatattctcatggtgat-attggtgtatcccaccctttgacctgaaacca 18620188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 20978091 - 20978249
Alignment:
Q  123 acagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacatataat 221  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||     
T  20978091 acagatcatggataaagagttatcaagtcttcaccgagatataattattatgagtaatatttatattggattgacccgccatgagaattttatatggaaa 20978190  T
Q  222 tttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgac 280  Q
     ||||| ||| |||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20978191 attatgaaaatgtcataagttattctcgtagtgataagtggtgtattccactctttgac 20978249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 36799870 - 36799780
Alignment:
Q  199 gccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36799870 gccatgagaatgttacatagaacattttgtaaaagtcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtattctaccgtttgacctgaaacca 36799780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18852144 - 18851918
Alignment:
Q  29 tattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagat 128  Q
    ||||||| || ||| ||||||| | ||||| ||||||   ||||||||||||| | || ||||||||| || |||||| | ||||||  ||||||| |||    
T  18852144 tattcttaaagtatatgtagtccaactttattgtgaagtaggataacattaaattgtatagactattatgtcggtagactaatgatcccatctcacggat 18852045  T
Q  129 ctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatg 227  Q
    | |  |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||  | | |||||    
T  18852044 catgaataaagagttatcaagtcttcaaatatgtataaatattaagagtaatatttatattggattgactcgctataagaatattacattaagtgttatg 18851945  T
Q  228 taaaagtcacaggtcattctcatagtgat 256  Q
    |  |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  18851944 t--aagtcacaagtctttctcatactgat 18851918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 279
Target Start/End: Original strand, 19279450 - 19279660
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||| | | || || | ||||||| |||||||  ||| | |||||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  19279450 ggataactttaaagcataaagactattatgcgagttgactaatgatcacatctcacgtatcatggataaaaagttatcaagttttcagatagatatagat 19279549  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtat 267  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||   ||||| ||  |||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  19279550 atttggagtaatatttatattggattgacacgtcatgagaataccacatagaacattacttaatagtcacgagtcattctcatagtgataaatggt-tat 19279648  T
Q  268 tccaccctttga 279  Q
    ||||||| ||||    
T  19279649 tccacccattga 19279660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6992129 - 6991939
Alignment:
Q  99 tgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagt--cttcacatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattga 195  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||  |  |||| || |||||||||  |||||||||| ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||    
T  6992129 tgggtagactaatgatcatatctcacagattataaataaagatttatcaagtatcttcacataggtataaatctcaggagtaatatttatattggattga 6992030  T
Q  196 cccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaa 286  Q
     || |||| |||| | |||||| ||  ||||||||  | || |    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6992029 tcctccataagaacgctacatagaaaattatgtaagtgacataaactattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcggcctgaaa 6991939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36802003 - 36801897
Alignment:
Q  93 attacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacat-agatataaatattaagagtaata-ttatattgg 190  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  36802003 attatgtgagtagactgatgatcacacctcacaaatcattgataatgagttatcaagtcttcgcataaaatataaatattaagggtaatatttatattga 36801904  T
Q  191 attgacc 197  Q
    |||||||    
T  36801903 attgacc 36801897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24250279 - 24250223
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24250279 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 24250223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Original strand, 30174432 - 30174488
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30174432 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 30174488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12014370 - 12014091
Alignment:
Q  28 ttattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacaga 127  Q
    |||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||| | |||||  |||||||  || |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  12014370 ttattcttaaaacatccgtagttaagctttagtgtgaagagggatacgattaaagcgtaaagaccattatgtgggtagaatgatgatcacatctcacgga 12014271  T
Q  128 tctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttat 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||    
T  12014270 tcattgataaggagttatcaagtcttcacataaatataaatattaagagtaatattaatattggattgacccggcatgagaatgttacatagaacaatat 12014171  T
Q  227 gtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgt 306  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||  ||||||||| |||||    
T  12014170 gtaaaaatcacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcacccttcaacctaaaatcactgtgtactctagatgt 12014091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27131483 - 27131231
Alignment:
Q  40 tatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataagg 139  Q
    ||||||||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |    
T  27131483 tatttgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaag 27131384  T
Q  140 agttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||    
T  27131383 agttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtc 27131284  T
Q  236 acaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    | | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27131283 ataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 27131231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 18252168 - 18252415
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  18252168 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 18252267  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  18252268 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 18252367  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18252368 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 18252415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3856006 - 3855823
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacag 126  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  3856006 attattcttaaaatatttgtagtcaaactttattgtgaagtgggatattattaaagcatggagactattacgtgggtagactgatgatcacatctcacaa 3855907  T
Q  127 atctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3855906 atcatggataaagagttataaagtcttcacataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgcaatgagaat 3855823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12006626 - 12006350
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacag 126  Q
    |||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||   |||||| | ||| |||  |||| ||||||||| | || ||      
T  12006626 attattattaaaacattcgtagtcaagccttagtgtgaagagggataacattaaaacttagagattgttatgtgcatagactgatgatcacaacttacga 12006527  T
Q  127 atctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacatataatttta 225  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||||||||||||| | | |   |||    
T  12006526 atcattgataaggagttatcaagtgttcgcacagatataaatattaagagtaatatttatactgga----cccgccatgagaatgttagagagagcgtta 12006431  T
Q  226 tgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgt 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  12006430 tgtaaaagtcacaagtcattctcatactgataagtggtgttttccacccttcgacctgaaatcattgtgtactctagatgt 12006350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18532559 - 18532336
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532559 ggatatcattaaagcatagagactattatgtagatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 18532460  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtg 264  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  18532459 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 18532361  T
Q  265 tattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  18532360 tattccacccttcgacctgaaacca 18532336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 306
Target Start/End: Original strand, 23507034 - 23507300
Alignment:
Q  41 atttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataagga 140  Q
    ||||||||||| | |||||||||||   ||||| |||||||||||| ||| ||| | |||| |||| ||||||||| ||||||| |||| | ||||||||    
T  23507034 atttgtagtcatgatttagtgtgaagtgggatagcattaaagtatatagaatataaggtggatagactgatgatcacatctcacggatcatggataagga 23507133  T
Q  141 gttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacag 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||  || |||||||  || |     
T  23507134 gttatcaagttttcacatagatataaataataggagtaatatttatattggattaacccaccattagaatgctacagagaacgttgtgtaaaaagcataa 23507233  T
Q  240 gtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccaacgtgtactcttgatgt 306  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||||||||||||  |||||| || |||||    
T  23507234 gttattctcatagtgataagtggagtatgtcatccttcgacctgaaaccactgtgtaccctagatgt 23507300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21171302 - 21171137
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  21171302 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtgggtagactgatgataacatctcacagatcatggataaagagtta 21171203  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21171202 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 21171137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27310646 - 27310399
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||    
T  27310646 gtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagattatggataaagagtta 27310547  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  27310546 tcaagtcttcacataaatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 27310447  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27310446 atattcttatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 27310399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16359103 - 16358939
Alignment:
Q  46 tagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttat 145  Q
    ||||||||||||| || ||||  | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||    
T  16359103 tagtcaagctttattgagaaatggaatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagataatggataaagagttat 16359004  T
Q  146 caagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16359003 caagccttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 16358939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36816701 - 36816537
Alignment:
Q  46 tagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttat 145  Q
    ||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  36816701 tagtcaagctttattgagaagtgggataccattaaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttat 36816602  T
Q  146 caagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36816601 caagtctacacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaat 36816537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27277644 - 27277380
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacag 126  Q
    ||||||||| || |||  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |    
T  27277644 attattcttaaagtatccgtagtcaggctttattgtgaaaagggataacattaaagcatagagactattatgtgggtagaccgatgatcacatctcacgg 27277545  T
Q  127 atctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattt 223  Q
    ||| | ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||| || ||||   ||  |    
T  27277544 atcatagataaagagttatcatgttttcacataggtataaatattaggagtaatatttatactagattgacccaccataagaatattgcatagtaaaagt 27277445  T
Q  224 tatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
     ||| ||  | || | |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27277444 catgaaagtgccataagatattcttatagtgat-agtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 27277380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22657289 - 22657125
Alignment:
Q  46 tagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttat 145  Q
    ||||||||||||| | |||||   |||| |||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||| || || | ||||| |||||||    
T  22657289 tagtcaagctttattctgaaatgagatatcattaaagcatagagactatcatgtggatagactgatgatcacatctcatagctcatagataaagagttat 22657190  T
Q  146 caagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  22657189 taagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattagattgacccaccatgtgaat 22657125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9918005 - 9917834
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacag 126  Q
    ||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||| ||   ||||| |||| ||| ||||||| || || || ||||| |||||||||| |||||   |    
T  9918005 attattcttaaaatatctatagttaagctttattgttaagtgggatagcattgaagcatagagaatactatgtcggtaggttgatgatcacatctcgtgg 9917906  T
Q  127 atctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  9917905 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatatt-tgagtaatatttatattggattgaccc 9917834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 201 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9916688 - 9916603
Alignment:
Q  201 catgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaa 286  Q
    |||||||||  |||||| ||  ||||||||| |||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9916688 catgagaatactacatagaaagttatgtaaatgtcataaattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaa 9916603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19706686 - 19706619
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  19706686 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 19706619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43802612 - 43802545
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  43802612 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 43802545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Original strand, 9456171 - 9456227
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9456171 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 9456227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20779892 - 20779836
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20779892 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 20779836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22670504 - 22670448
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22670504 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 22670448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42817236 - 42817180
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  42817236 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 42817180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 47667721 - 47667665
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  47667721 tatcaagtctatacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgaccc 47667665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28134970 - 28134903
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  28134970 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccaccgtgagaat 28134903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20391486 - 20391430
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20391486 tatcaagtctatacatagatataaatgttaggagtaatatttatattggattgaccc 20391430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 22612547 - 22612614
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  22612547 tatcaagtctatacatagatataaatattgggagtaatatttttattggattgacccaccgtgagaat 22612614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22641741 - 22641696
Alignment:
Q  243 attctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22641741 attctcacagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 22641696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 209
Target Start/End: Original strand, 51997353 - 51997401
Alignment:
Q  162 tataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  51997353 tataaatattaggagtaatatttatattagattgacccaccatgagaat 51997401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 24642771 - 24643033
Alignment:
Q  29 tattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagat 128  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||| || |||    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24642771 tattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagtatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagat 24642870  T
Q  129 ctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata-taattttat 226  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||  ||||    
T  24642871 catggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaatactacatagtaaaattat 24642970  T
Q  227 gtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    | |||  |||| | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24642971 gaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa-tggtgtattccacccttcgaactgaaacca 24643033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 21940803 - 21941050
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  21940803 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 21940902  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  21940903 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 21941002  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21941003 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 21941050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 289
Target Start/End: Original strand, 6094260 - 6094508
Alignment:
Q  44 tgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtt 143  Q
    ||||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||    
T  6094260 tgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatatgggtagagtgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtt 6094359  T
Q  144 atcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacatat--aattttatgtaaaa-gtcacag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||   ||  ||||| |||  |||| |     
T  6094360 atcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactatatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa 6094459  T
Q  240 gtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  6094460 gatattctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgaccagaaacca 6094508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14983964 - 14983748
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |||| | || || | |||||||||||||||||||||| || ||    
T  14983964 ggataacattaa-gaatagggactattatgtgggtagactaatgatcatatctcacggatcatggaaaaagtgttatcaagtcttcacatagatgtagat 14983866  T
Q  169 attaagagtaatattatattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtatt 268  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14983865 attaggagtaatattatattagaatgacccgccatgagaatactacatagaaagttatgtaaatgtcataagttattctcatagtgataagtggtgtatt 14983766  T
Q  269 ccaccctttgacctgaaa 286  Q
    ||  |||| |||||||||    
T  14983765 ccgtccttcgacctgaaa 14983748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 22171625 - 22171872
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   | ||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  22171625 gtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcatagatcatggataaagagtta 22171724  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  22171725 tcaagtcttcacataaatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 22171824  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22171825 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 22171872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 38232462 - 38232219
Alignment:
Q  29 tattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatg-gataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacaga 127  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||| || ||||   |||||| ||| | ||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||| ||    
T  38232462 tattcttaaagtatttgtagtcaaactttattgt-aaagtgagatagtcttaaagcataaaaactattttgtgggtagactgataatcacatctcacgga 38232364  T
Q  128 tctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttat 226  Q
    || | ||||| |||| ||| |||||| ||||||||| | |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||  ||||    
T  38232363 tcatggataaagagtgatccagtcttgacatagatacacatattatgggtaatatttatattggattgatccgccgtgagaatgctacatagaaagttat 38232264  T
Q  227 gtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattcca 271  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  38232263 gtaaatgtcacaggttattcgcataatgataagtggtgtattcca 38232219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 2375167 - 2375386
Alignment:
Q  70 gataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgat-------gatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagat 162  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||       ||||| ||| |||  ||| | ||||| |||||||||| | |||||||| ||    
T  2375167 gataacattaaagtatatgaactattaagtgggtagattgatcactcatgatcacatcacacgtatcatggataatgagttatcaaattttcacataaat 2375266  T
Q  163 ataaatattaagagtaatat-tatattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtg 261  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||  |||||| ||  |||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||    
T  2375267 ataaatattatgagtaatatgtatattggattgaccctccattataattctacataaaaagttatgtaaaactcatagtt-attctcatagtgataagtg 2375365  T
Q  262 gtgtattccaccctttgacct 282  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  2375366 gtgtattcaaccatttgacct 2375386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 289
Target Start/End: Original strand, 15326430 - 15326583
Alignment:
Q  139 gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  ||    
T  15326430 gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgt 15326529  T
Q  235 cacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    || | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15326530 cataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 15326583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 289
Target Start/End: Original strand, 15506799 - 15506952
Alignment:
Q  139 gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  ||    
T  15506799 gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgt 15506898  T
Q  235 cacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    || | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15506899 cataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 15506952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8371500 - 8371433
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  8371500 tatcaagtctatacataggtataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 8371433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 12562178 - 12562245
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  12562178 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 12562245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 21969388 - 21969455
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  21969388 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 21969455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 25611250 - 25611317
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  25611250 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 25611317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22130856 - 22130800
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22130856 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 22130800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27007764 - 27007708
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27007764 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 27007708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27014907 - 27014851
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27014907 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 27014851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27880734 - 27880678
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27880734 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 27880678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28020915 - 28020859
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28020915 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 28020859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24797359 - 24797292
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24797359 tatcatgtcttcacgtaggtataaatattatgagtaaaatttatactggattgacccgccatgagaat 24797292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 183
Target Start/End: Original strand, 29645537 - 29645630
Alignment:
Q  90 actattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt 183  Q
    ||||||||||||||| | |||||| || ||||||  | || |  |||| || ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29645537 actattacgtgggtaaactgatgaccacatctcatggttcatgcataaagatttatcaactcttcacatatatataaacattaagagtaatatt 29645630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Original strand, 21916731 - 21916787
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21916731 tatcaagtctatgcatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 21916787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 209
Target Start/End: Original strand, 26240551 - 26240606
Alignment:
Q  155 acatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  26240551 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 26240606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 32872918 - 32872797
Alignment:
Q  37 aaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgata 136  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||| | || | || | | ||||  |||||||||||| |  |||    
T  32872918 aaatatttgtagttaagatttattgtgaagtgggataacatcaaagcatagagactattatgcggctggactcacgatcttatctcacagatcatgaata 32872819  T
Q  137 aggagttatcaagtcttcacat 158  Q
    | ||| ||||||||||| ||||    
T  32872818 aagaggtatcaagtctttacat 32872797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 289
Target Start/End: Original strand, 28548393 - 28548432
Alignment:
Q  249 atagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28548393 atagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 28548432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 45534508 - 45534464
Alignment:
Q  155 acatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  45534508 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgaccc 45534464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 189062 - 188799
Alignment:
Q  29 tattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagat 128  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| || |||    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  189062 tattcttaaagtatttgtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatat 188963  T
Q  129 ctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taatttta 225  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  |||    
T  188962 catggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtta 188863  T
Q  226 tgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    || |||  |||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  188862 tgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 188799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 11651861 - 11652108
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  11651861 gtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 11651960  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  11651961 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 11652060  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11652061 atattctcataatgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 11652108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17684514 - 17684291
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684514 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 17684415  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtg 264  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  17684414 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 17684316  T
Q  265 tattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  17684315 tattccacccttcgacctgaaacca 17684291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17691509 - 17691262
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    ||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  17691509 gtagtcaagctttagtgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagtta 17691410  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  17691409 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 17691310  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17691309 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 17691262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27381297 - 27381074
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381297 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 27381198  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtg 264  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  27381197 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 27381099  T
Q  265 tattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  27381098 tattccacccttcgacctgaaacca 27381074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27471680 - 27471457
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471680 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 27471581  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtg 264  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  27471580 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 27471482  T
Q  265 tattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  27471481 tattccacccttcgacctgaaacca 27471457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 289
Target Start/End: Original strand, 28172698 - 28172939
Alignment:
Q  49 tcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaa 148  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||| | ||| ||||| | ||||| |||  | || ||||||||| |||| ||||||| ||| |||  |||||||||    
T  28172698 tcaagttttagtgtgaagtgggataacactgaagaatagaaattattatgtgaatggactgatgatcacatcttacagatcattgttaaaaagttatcaa 28172797  T
Q  149 gtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattct 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||  |    
T  28172798 gtctttacatagatataaatattaagggtagtgtttatattggattgaccctccatgagaatgttacatataactttatgtgaaactcacacgtcatctt 28172897  T
Q  248 catagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28172898 tatagtgataagtggtgtattccacccttcgaccggaaacca 28172939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 29309028 - 29309275
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  29309028 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagtta 29309127  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  29309128 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 29309227  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29309228 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 29309275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 29315988 - 29316235
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  29315988 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacatatcatggataaagagtta 29316087  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  29316088 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 29316187  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29316188 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 29316235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16566389 - 16566257
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  16566389 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 16566290  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagt 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16566289 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagt 16566257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13359338 - 13359095
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||| || ||| | |||||  |||||    
T  13359338 gtagtcaacctttattgtgaaatgggacaacattaaagcgtagagactattatatggatagactgatgatcacatctcgcaaatcatggataaaaagtta 13359239  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtca 243  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||  |||| || |||||||| |||| | | ||||  ||||  |||||  ||  ||||||||| |||| |  | |    
T  13359238 tcaaatcttcacttagatataagtattagaagtagtatttatattgaattgtctcaccat--gaatactacattgaaaattatgtaaatgtcataaatta 13359141  T
Q  244 ttctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13359140 ttctcatagtgataagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 13359095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17850538 - 17850321
Alignment:
Q  71 ataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatat 170  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||| || ||||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  17850538 ataacattcaagtatatagactattatatgggtagactgatgatcatatcttatagatcattgacaacgagttatcgtgtattcacataggtataaatat 17850439  T
Q  171 taagagtaatat-tatattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattc 269  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| || | |||||  |||||    ||||||||||   ||| | || ||||| |||||||| |||| ||||| |    
T  17850438 tatgagtaatatatatattggattgaccctccttaagaatactacattgggttttatgtaagtatcataagttattcttatagtgat-agtgatgtatac 17850340  T
Q  270 caccctttgacctgaaacc 288  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17850339 caccctttgacctgaaacc 17850321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 286
Target Start/End: Original strand, 2669476 - 2669673
Alignment:
Q  90 actattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatatt 188  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2669476 actattatatgggtagattgatgatcacatctcatgaatcattgattaagagttatcatgtattcacatagatataaatattaggagtaatatttatatt 2669575  T
Q  189 ggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaa 286  Q
     ||||||| |  ||||| |||  |||||| ||| || | |||   ||| | || ||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  2669576 tgattgacacatcatgaaaatactacatagaatgttgtttaagtatcataagttattctcatagtgacaagttgtgtattccactatttgacctgaaa 2669673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16394419 - 16394349
Alignment:
Q  140 agttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16394419 agttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaat 16394349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 289
Target Start/End: Original strand, 27296877 - 27297014
Alignment:
Q  155 acatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcat 250  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  ||||||||    
T  27296877 acattgatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcat 27296976  T
Q  251 agtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27296977 agtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 27297014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18020088 - 18020021
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  18020088 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 18020021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25537152 - 25537013
Alignment:
Q  153 tcacatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctc 248  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  ||||||    
T  25537152 tcacatagatataaatattaggtgtcatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctc 25537053  T
Q  249 atagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25537052 atagtga-cagtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 25537013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 256
Target Start/End: Original strand, 27925935 - 27926103
Alignment:
Q  88 agactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttata 186  Q
    ||||||||| |||| || | ||||||||  ||||||| |||| | ||||| || |||| |||| ||||||||||||| || |||| || ||||| |||||    
T  27925935 agactattatgtggataaactgatgatctcatctcacggatcatggataaagatttatgaagttttcacatagatattaa-attaggaataatatttata 27926033  T
Q  187 ttggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgat 256  Q
    ||| |||||| |||||||| |||  |||| | ||  ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||    
T  27926034 ttgaattgactcgccatgataatactacacagaaaattatgtaaatgtcataggttattatcatagtgat 27926103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Original strand, 16789126 - 16789182
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16789126 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 16789182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22860135 - 22860079
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22860135 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 22860079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25537244 - 25537148
Alignment:
Q  29 tattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcaca 125  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||    
T  25537244 tattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcaca 25537148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16559339 - 16559295
Alignment:
Q  243 attctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacc 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16559339 attctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaacc 16559295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20553631 - 20553488
Alignment:
Q  70 gataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaata 169  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| | ||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||  ||||||   ||||||||||||| ||||    
T  20553631 gataaaattaaagcataaagatttttatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatcgataaagaaatatcaaacattcacatagatat-aata 20553533  T
Q  170 ttaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttac 214  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||    
T  20553532 ttaagaataatatttatatt-gattgacccatcatgagaatattac 20553488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27508594 - 27508538
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  27508594 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgaccc 27508538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27528180 - 27528124
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  27528180 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgaccc 27528124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16394312 - 16394267
Alignment:
Q  243 attctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16394312 attcttatagtgata-gtggtgtattccaccctttgacttgaaacca 16394267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1586343 - 1586299
Alignment:
Q  155 acatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  1586343 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgaccc 1586299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7003 - 6756
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  7003 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 6904  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  6903 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 6804  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6803 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 6756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14020 - 13772
Alignment:
Q  44 tgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtt 143  Q
    ||||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||    
T  14020 tgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtt 13921  T
Q  144 atcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacag 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| |     
T  13920 atcaagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataa 13821  T
Q  240 gtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13820 gatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 13772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2390 - 2143
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  2390 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 2291  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  2290 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 2191  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2190 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 2143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11281 - 11034
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  11281 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 11182  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  11181 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 11082  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11081 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 11034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 15152581 - 15152828
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  15152581 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 15152680  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  15152681 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 15152780  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15152781 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 15152828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 29327922 - 29328169
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  29327922 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 29328021  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  29328022 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 29328121  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29328122 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 29328169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11543049 - 11542802
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  11543049 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 11542950  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||| ||||| |||  |||| | |    
T  11542949 tctagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaagtgtcataag 11542850  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11542849 atattctcatagtgat-agtgatgtattccacccttcgacctgaaacca 11542802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 12750964 - 12751211
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||  |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  12750964 gtagtcaagctttattgagaagttggatatcattaaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 12751063  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  12751064 tcaattcttctcatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 12751163  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12751164 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 12751211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Original strand, 18561129 - 18561310
Alignment:
Q  29 tattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagat 128  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18561129 tattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaggtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagat 18561228  T
Q  129 ctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18561229 catggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccctctatgagaat 18561310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 287
Target Start/End: Original strand, 12738658 - 12738919
Alignment:
Q  29 tattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagat 128  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  12738658 tattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgaagatcacatctcacagat 12738757  T
Q  129 ctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taatttta 225  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  |||    
T  12738758 catggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattactcataatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtta 12738857  T
Q  226 tgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaac 287  Q
    || |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  12738858 tgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccgttcgacctgaaac 12738919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11536131 - 11535966
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  11536131 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 11536032  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11536031 tccagtcttcacaaagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 11535966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18257887 - 18257738
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    |||||||| ||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257887 ggataacaataatgcataaagactattatgtggatagattgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 18257788  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata 217  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||| || | ||||| |||||||    
T  18257787 attaggagtaatatttatattggattaacccaccgtcagaatattacata 18257738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 282
Target Start/End: Original strand, 13392289 - 13392528
Alignment:
Q  46 tagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttat 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||   | ||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||| |||||||    
T  13392289 tagtcaaactttattgtgaaaagggataacattaaaacatagagactattgtattggtagatcgatgatcacatctcacggatcatagataaagagttat 13392388  T
Q  146 caagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggt 241  Q
    |  ||||||||||||  |||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||   || |||||| |||  |||| | |     
T  13392389 cctgtcttcacataggaataaatattaggagaaatatttatactggattgacccaccatgcgaatattacatagtaaaatttatgaaaagtgtcataaga 13392488  T
Q  242 cattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacct 282  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13392489 tattctcatagtgat-agtggtgtattccaccctttgacct 13392528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7662751 - 7662517
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacag 126  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||| |  || ||||| |||| || | ||||||||| |||| ||      
T  7662751 attatttttaaaacatttgtagtcaagatttagtgtgaagtaggatagcattaaagtacattgattattatgtggatacactgatgatcatatcttacga 7662652  T
Q  127 atctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacatataatttta 225  Q
    ||| |  ||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||  |||    
T  7662651 atcatgtataaaaacttatcaagtcttcacatagatataaa-attataagtaatatttttattagattgacccgccatgagaatgctatatggaacatta 7662553  T
Q  226 tgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtg 261  Q
     |||||| | | | || |||||||||||||||||||    
T  7662552 cgtaaaaattataagttattctcatagtgataagtg 7662517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 282
Target Start/End: Original strand, 2365169 - 2365298
Alignment:
Q  154 cacatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatag 252  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |  ||||||||| |||| | || |||||||| |    
T  2365169 cacatagatatcaatattaggagtaatatttacattggattgacccaccatgaaaatgctacataggaagttatgtaaatgtcataagttattctcattg 2365268  T
Q  253 tgataagtggtgtattccaccctttgacct 282  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||    
T  2365269 tgataagtggtgtatttcaccattcgacct 2365298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 236
Target Start/End: Original strand, 10235363 - 10235492
Alignment:
Q  108 tgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgag 206  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  10235363 tgatgatcacatctcacagatcattgataaagagttatcaggtgttcccatatgtataaatattaggaataatatttatatcggattgactcaccatgag 10235462  T
Q  207 aatgttacatataattttatgtaaaagtca 236  Q
    |||  |||||| | | |||||||| |||||    
T  10235463 aattatacatagagtgttatgtaagagtca 10235492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 128
Target Start/End: Original strand, 15148264 - 15148363
Alignment:
Q  29 tattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagat 128  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15148264 tattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagat 15148363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 8465054 - 8465121
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  8465054 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 8465121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Original strand, 2204607 - 2204663
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2204607 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 2204663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Original strand, 18400159 - 18400215
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18400159 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 18400215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Original strand, 18407143 - 18407199
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18407143 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 18407199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 48808743 - 48808687
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  48808743 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 48808687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 165
Target Start/End: Original strand, 7396309 - 7396450
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgt---gggtagattgatgatcaaatctca 123  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||   ||| | ||||||| ||||||||||||| ||   ||||  | ||||||||| ||||||    
T  7396309 attattcttaaaacatatgtagtcaagccttagtgtgaaatacgatgatattaaagcatagagactattatgtgcagggtgaactgatgatcacatctca 7396408  T
Q  124 cagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatata 165  Q
    || ||| |  |||| || ||||||||| |||||||| |||||    
T  7396409 catatcatgaataaagaattatcaagtattcacataaatata 7396450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 19230943 - 19231010
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  19230943 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccgtgagaat 19231010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 30254193 - 30254260
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  30254193 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgacccaccgtgagaat 30254260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 125
Target Start/End: Original strand, 2365015 - 2365112
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcaca 125  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||| | |||||||   ||||||||||||  ||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||||||||    
T  2365015 attattcttaaaatattcgtagtcaacctt-attgtgaaatgagataacattaaaacatagagactatcatgtgggtcgactgatgatcacatctcaca 2365112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 47833983 - 47833899
Alignment:
Q  88 agactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatatta 172  Q
    |||||||||||| |||||  || |||||| ||||||| |||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  47833983 agactattacgtaggtaggctggtgatcagatctcaccgatcatgaataaagagttaccaagttttcacataggtataaatatta 47833899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Original strand, 15729818 - 15729862
Alignment:
Q  155 acatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  15729818 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgaccc 15729862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 209
Target Start/End: Original strand, 16011515 - 16011563
Alignment:
Q  162 tataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16011515 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccaccatgagaat 16011563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18139573 - 18139529
Alignment:
Q  155 acatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  18139573 acatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgaccc 18139529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 183
Target Start/End: Original strand, 19859177 - 19859217
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt 183  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19859177 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatt 19859217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19714583 - 19714320
Alignment:
Q  29 tattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagat 128  Q
    ||||||| ||||||  | |||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19714583 tattcttaaaatatccgaagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagat 19714484  T
Q  129 ctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taatttta 225  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  |||    
T  19714483 catggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtta 19714384  T
Q  226 tgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    || |||  |||| | |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19714383 tgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agttgtgtattccacccttcgacctgaaacca 19714320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18807121 - 18806858
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacag 126  Q
    ||||||||| || ||| | ||||||||| ||| ||||||    ||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| || ||| |     
T  18807121 attattcttaaagtatctatagtcaagcgttattgtgaagtaagataacaataaagcatagagactattatgcgggtagactgatgatcacatttcatat 18807022  T
Q  127 atctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaat-attatattggattgacccgccatgagaatgttacatataatttta 225  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||  ||     
T  18807021 atcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatgtttatattggattgatccaccatgagaatgatacatagaaagttt 18806922  T
Q  226 tgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||  |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  18806921 tgtaactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccacccttcaacctgaaacca 18806858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24695535 - 24695288
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||    |||| || ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  24695535 gtagtcaagctttattgagaagtgagatatcaataaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 24695436  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  24695435 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 24695336  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24695335 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 24695288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19707303 - 19707122
Alignment:
Q  29 tattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagat 128  Q
    ||||||| ||||||  | |||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19707303 tattcttaaaatatccgaagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagat 19707204  T
Q  129 ctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    | | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19707203 catggataaagagttatcaaatcttcacatagatataaatactaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 19707122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 133 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17298880 - 17298722
Alignment:
Q  133 gataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaa 231  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| || ||  |||||||||    
T  17298880 gataaagagttattaaatcttcacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacgtagaaagttatgtaaa 17298781  T
Q  232 agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaaccaa 290  Q
     |||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  17298780 tgtcataagttattctcatagtgataagtggcgtattccacccttcaacctgaaaccaa 17298722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22547060 - 22546898
Alignment:
Q  70 gataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaata 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22547060 gataacattaaaatatagagactattatgtggatagaccgatgatcacatctcacaaatcatggataaagagttatcaagttttcatatagatataaata 22546961  T
Q  170 ttaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaa 231  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||  |||||||||    
T  22546960 ttatgagtaatatttatattggattgaccagccatgagaatactacataaaaagttatgtaaa 22546898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 205
Target Start/End: Original strand, 39538710 - 39538887
Alignment:
Q  29 tattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagat 128  Q
    ||||||| ||||||   |||| |||||||| ||||||   ||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||    
T  39538710 tattcttaaaatatccatagttaagctttattgtgaagtgggatatcattaaagcatgaagactattatgtgggtagactgatggtcatatttcacagat 39538809  T
Q  129 ctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatga 205  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39538810 catggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccatga 39538887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 103 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17285759 - 17285575
Alignment:
Q  103 tagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgcc 201  Q
    |||| ||||||||| || |||||| || | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  17285759 tagactgatgatcacatatcacaggtcatggataaagagttatcaagtctttacatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgacccaca 17285660  T
Q  202 atgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaa 286  Q
    ||||||||  |||||| ||  ||||||| |  ||| | || ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  17285659 atgagaatactacatagaaagttatgtatatatcataagttattatcatagtgataagtggtatattccactcttcgacctgaaa 17285575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18569932 - 18569683
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgata--aggagt 142  Q
    |||||||||||||| || |||   | ||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||  | |||     
T  18569932 gtagtcaagctttattgagaagtggaatatcattaaagcataaagactattatgttggtagactgatgatcacatctcacatatcatggatataaagaga 18569833  T
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcaca 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| |    
T  18569832 tatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcata 18569733  T
Q  239 ggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
     |  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18569732 agatattatcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 18569683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27347565 - 27347425
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacag 126  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||   |||||||| |||||||||    
T  27347565 attattcttaaagtatatgtagtcaagctttattgtgaaaagggataacattaaagcatagagactattttgtggataggccgatgatcacatctcacag 27347466  T
Q  127 atctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaa 167  Q
    ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27347465 atcatagataaagagttatcatgtcttcacataggtataaa 27347425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18829530 - 18829385
Alignment:
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtca 243  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||||    || | || |    
T  18829530 tcaagtgttctcatatatataaatattaggaccaatatttatattggattgacccaccatgagaatgatacatagaaagttatgtaagttccataagtta 18829431  T
Q  244 ttctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  18829430 ttctcataatgataagtggtgtattccatcatttgacctaaaacca 18829385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18806605 - 18806498
Alignment:
Q  182 ttatattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacc 281  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||  || |||||  |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  18806605 ttatattggattgatccaccatgagaatgatacatagaaagttttgtaactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccacccttcaacc 18806506  T
Q  282 tgaaacca 289  Q
    ||||||||    
T  18806505 tgaaacca 18806498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18806785 - 18806678
Alignment:
Q  182 ttatattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacc 281  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||  || |||||  |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  18806785 ttatattggattgatccaccatgagaatgatacatagaaagttttgtaactgtcataagttattctcatagtgataagtgatgtattccacccttcaacc 18806686  T
Q  282 tgaaacca 289  Q
    ||||||||    
T  18806685 tgaaacca 18806678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 20941082 - 20941149
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  20941082 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 20941149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25805632 - 25805565
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  25805632 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 25805565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Original strand, 31954 - 32010
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31954 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 32010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Original strand, 23545977 - 23546033
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  23545977 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 23546033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 209
Target Start/End: Original strand, 22941317 - 22941372
Alignment:
Q  155 acatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  22941317 acatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 22941372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12789910 - 12789854
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  12789910 tatcaagtctatacatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgaccc 12789854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24933541 - 24933497
Alignment:
Q  155 acatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  24933541 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgaccc 24933497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19926829 - 19926582
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  19926829 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 19926730  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaaa-gtcacagg 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||| |||| | |    
T  19926729 tcaagtcttcaaatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaaatgtcataag 19926630  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19926629 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 19926582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 55612821 - 55613068
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  55612821 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 55612920  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  55612921 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 55613020  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55613021 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 55613068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4426673 - 4426508
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  4426673 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 4426574  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4426573 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaat 4426508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 8858305 - 8858552
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  8858305 gtagtcaagctttattgagaagtcggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 8858404  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  8858405 tcaagtcttcatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 8858504  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8858505 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 8858552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Original strand, 18262374 - 18262597
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262374 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 18262473  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtg 264  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  18262474 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 18262572  T
Q  265 tattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  18262573 tattccacccttcgacctgaaacca 18262597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Original strand, 18269235 - 18269458
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269235 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 18269334  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtg 264  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  18269335 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 18269433  T
Q  265 tattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  18269434 tattccacccttcgacctgaaacca 18269458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28393219 - 28392956
Alignment:
Q  29 tattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagat 128  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  28393219 tattcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacatat 28393120  T
Q  129 ctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taatttta 225  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  |||    
T  28393119 catggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagtta 28393020  T
Q  226 tgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    || |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28393019 tgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcaacctgaaacca 28392956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10621403 - 10621155
Alignment:
Q  44 tgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtt 143  Q
    ||||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||    
T  10621403 tgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtt 10621304  T
Q  144 atcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| |     
T  10621303 atcaagtcttcacatagatataaattttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa 10621204  T
Q  240 gtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10621203 gatattctcatagtgat-agtggtgttttccacccttcgacctgaaacca 10621155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10628482 - 10628234
Alignment:
Q  44 tgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtt 143  Q
    ||||||||||||||| || |||   |||||  ||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||    
T  10628482 tgtagtcaagctttattgagaagtgggatattattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtt 10628383  T
Q  144 atcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacag 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| |     
T  10628382 atcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataa 10628283  T
Q  240 gtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10628282 gatattctcatagtgataa-tggtgttttccacccttcgacctgaaacca 10628234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Original strand, 868759 - 868982
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  868759 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagttatcaagtcttcacatagatataaat 868858  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtg 264  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||||| |||||    
T  868859 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgataa-tggtg 868957  T
Q  265 tattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  868958 tattccacccttcgacctgaaacca 868982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 5707458 - 5707705
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||    |||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  5707458 gtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 5707557  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  5707558 tcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 5707657  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5707658 atattctcatagtgat-agtggtgtattccatccttcgacctgaaacca 5707705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 5714086 - 5714333
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||    |||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  5714086 gtagtcaagctttattgagaagtgagatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 5714185  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  5714186 tcaagtcttcacatagatataaatattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 5714285  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5714286 atattctcatagtgat-agtggtgtattccatccttcgacctgaaacca 5714333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Original strand, 26963802 - 26964025
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963802 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 26963901  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtg 264  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  26963902 attagcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 26964000  T
Q  265 tattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  26964001 tattccacccttcgacctgaaacca 26964025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Original strand, 26970625 - 26970848
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970625 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 26970724  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtg 264  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  26970725 attagcagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 26970823  T
Q  265 tattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  26970824 tattccacccttcgacctgaaacca 26970848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 289
Target Start/End: Original strand, 20311425 - 20311675
Alignment:
Q  40 tatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataagg 139  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||    |||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||  |||| | ||||| |    
T  20311425 tatttgttgtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatagagactattttgtgggtagattgatgatcacatatcatggatcatggataaag 20311524  T
Q  140 agttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaa-tattatattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcaca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | |||||||||  |||||| |   ||||||||   ||| |    
T  20311525 agttatcaagtcttcacatagatgtaaatattaggagtaatttttatattggattgacctgtcatgagaatactacatagacagttatgtaactatcata 20311624  T
Q  239 ggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  20311625 cattattctcatagtgataagtggtgtattccacccttctacttgaaacca 20311675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 32646859 - 32646627
Alignment:
Q  56 ttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttca 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||  |||||||||| ||||||| |||| ||||||| |   |||| ||||||||    
T  32646859 ttagtgtgaagatggataacattaaagaatgaagactattatgtggatatgttgatgatcacatctcacggatcattgataaaggaatatcgagtcttca 32646760  T
Q  156 catagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtg 254  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||  ||||||| |||||||| | ||||| | |||||    
T  32646759 catagatataaatattaggaataatatttacattggattgacctaccataagaatgctacataaaaggttatgtataagtcacatgacattcccgtagtg 32646660  T
Q  255 ataagtggtgtattccaccctttgacctgaaac 287  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  32646659 ataagtggtgtattttacccttcgacctgaaac 32646627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 289
Target Start/End: Original strand, 35223680 - 35223945
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacag 126  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |    
T  35223680 attattcttaaagtattcgtagtcaagctttattgtaaaaaaggataacattaaagcatatagactattatgtgggtagacggatgatcacatctcacgg 35223779  T
Q  127 atctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattt 223  Q
    ||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  || |||   ||  |    
T  35223780 atcatagataaagagttatcatgtctttacatatgtataaatattaggagtaatatttatactggattgaaccaccatgagaatactatatagtaaaagt 35223879  T
Q  224 tatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35223880 tatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtgttgtattccaccctttgacctgaaacca 35223945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 8845341 - 8845588
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  8845341 gtagtcaagctttattgagaagtcggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtaggctgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 8845440  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacatat--aattttatgtaaaa-gtcacagg 240  Q
    |||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| |      
T  8845441 tcaattctttatatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataat 8845540  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8845541 atattctcatagtgata-gtggtgtattccatccttcgacctgaaacca 8845588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 208
Target Start/End: Original strand, 56516176 - 56516358
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacag 126  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||  ||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  56516176 attattcttgaagtatctatagtcaagctttattgtgaataacgatagtattaaaacatagagactattatgtaggtagattaatgatcaaatctcacag 56516275  T
Q  127 atctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaa 208  Q
    ||  | ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  56516276 ataatggataaagagttatcaagtcttcacatacgtataaatatcatgagtaatatttatattggattgactcgctatgagaa 56516358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5668200 - 5667949
Alignment:
Q  39 atatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataag 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||  |||||||  ||||||| |||| | |||||     
T  5668200 atatttgtagtcaagctttattgtgaaaagagataacattaaatcatagagactattatgtggatagaccgatgatc--atctcacggatcatagataaa 5668103  T
Q  139 gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agt 234  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  ||    
T  5668102 gagttatcatatcttcacgtaggtataaatattaggagtaatatttatactggattgactcaccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgt 5668003  T
Q  235 cacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    || | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5668002 cataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttagacctgaaacca 5667949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 10677640 - 10677540
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatg-gataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcaca 125  Q
    ||||||||| || |||  |||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||     
T  10677640 attattcttaaagtatccgtagtcaagctttagtg---aaatgagataacattaaagtatatagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacg 10677544  T
Q  126 gatc 129  Q
    ||||    
T  10677543 gatc 10677540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 10891280 - 10891180
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatg-gataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcaca 125  Q
    ||||||||| || |||  |||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||     
T  10891280 attattcttaaagtatccgtagtcaagctttagtg---aaatgagataacattaaagtatatagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacg 10891184  T
Q  126 gatc 129  Q
    ||||    
T  10891183 gatc 10891180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 169
Target Start/End: Original strand, 24700213 - 24700291
Alignment:
Q  91 ctattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaata 169  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24700213 ctattatgtgggtagactgataatcacatcttacagatcttggataaagagatattaagtcttcacatagatataaata 24700291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21454110 - 21454033
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacatata 219  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  21454110 tatcaagttttcacatacatataaatattaggagtaatatttatattgaattgacccaccatgagaatactacatata 21454033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 15461552 - 15461619
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  15461552 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 15461619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Original strand, 2677068 - 2677124
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2677068 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 2677124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Original strand, 5870473 - 5870529
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  5870473 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 5870529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10677534 - 10677404
Alignment:
Q  162 tataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacatat--aattttatgtaaaa-gtcacaggtcattctcatagtgata 257  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||   ||| ||||| |||| |||| | |  |||||||||||||||    
T  10677534 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10677435  T
Q  258 agtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10677434 -gtggtgtatttcaccctttgacttgaaacca 10677404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10891174 - 10891044
Alignment:
Q  162 tataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacatat--aattttatgtaaaa-gtcacaggtcattctcatagtgata 257  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||   ||| ||||| |||| |||| | |  |||||||||||||||    
T  10891174 tataaatattaggagtaatatttatactggattgacccactatgagaatactacatagtaaatgttatgaaaaatgtcataagatattctcatagtgata 10891075  T
Q  258 agtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
     |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10891074 -gtggtgtatttcaccctttgacttgaaacca 10891044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Original strand, 15815076 - 15815132
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15815076 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 15815132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17300206 - 17300150
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  17300206 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 17300150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18111290 - 18111234
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18111290 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 18111234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Original strand, 34975606 - 34975662
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  34975606 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 34975662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4426482 - 4426438
Alignment:
Q  244 ttctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4426482 ttctcatagtgata-gtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 4426438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3369270 - 3369214
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  3369270 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttgtattggattgaccc 3369214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 116
Target Start/End: Original strand, 468756 - 468802
Alignment:
Q  70 gataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatca 116  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  468756 gataaaattaaagtatagagaatatcatgtgggtagattgatgatca 468802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 39074244 - 39074190
Alignment:
Q  70 gataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcac 124  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  39074244 gatatcattaaagcatggagactattacgtgggttgattgttgatcacatctcac 39074190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4676218 - 4676174
Alignment:
Q  155 acatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  4676218 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgaccc 4676174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Original strand, 20244004 - 20244048
Alignment:
Q  155 acatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  20244004 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgaccc 20244048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Original strand, 26531680 - 26531724
Alignment:
Q  155 acatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  26531680 acataaatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 26531724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 183
Target Start/End: Original strand, 33888594 - 33888634
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  33888594 tatcaagttttcacatagatataaatattatgtgtaatatt 33888634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16482552 - 16482305
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  16482552 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 16482453  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  16482452 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 16482353  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16482352 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 16482305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Original strand, 6110226 - 6110449
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110226 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 6110325  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtg 264  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  6110326 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 6110424  T
Q  265 tattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  6110425 tattccacccttcgacctgaaacca 6110449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10572637 - 10572414
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572637 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 10572538  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtg 264  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  10572537 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaactgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 10572439  T
Q  265 tattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  10572438 tattccacccttcgacctgaaacca 10572414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15600929 - 15600706
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600929 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 15600830  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtg 264  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  15600829 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 15600731  T
Q  265 tattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  15600730 tattccacccttcgacctgaaacca 15600706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15607474 - 15607251
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607474 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 15607375  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtg 264  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  15607374 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 15607276  T
Q  265 tattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  15607275 tattccacccttcgacctgaaacca 15607251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17781187 - 17780940
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  17781187 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacaaatcatagataaagagtta 17781088  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  17781087 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataag 17780988  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17780987 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 17780940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10579399 - 10579177
Alignment:
Q  70 gataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaata 169  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579399 gatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 10579300  T
Q  170 ttaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgt 265  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| ||||||||    
T  10579299 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacataataaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgt 10579201  T
Q  266 attccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  10579200 attccacccttcgacctgaaacca 10579177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 289
Target Start/End: Original strand, 13248740 - 13248992
Alignment:
Q  40 tatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataagg 139  Q
    |||| |||||||||||||  || |||   |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||| |    
T  13248740 tattcgtagtcaagctttgttgagaagtgggataacattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaag 13248839  T
Q  140 agttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||   ||  ||||| |||  |||    
T  13248840 agttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgattcgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtc 13248939  T
Q  236 acaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    | |    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13248940 ataatatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 13248992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 18520113 - 18520360
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  18520113 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 18520212  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  18520213 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatatttgattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 18520312  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18520313 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgaactgaaacca 18520360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 289
Target Start/End: Original strand, 13211465 - 13211687
Alignment:
Q  70 gataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaata 169  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211465 gatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacaactcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 13211564  T
Q  170 ttaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgt 265  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||  ||||| |||  |||| |    |||||||||||||| ||||||||    
T  13211565 ttaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatattacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataatatattctcatagtgat-agtggtgt 13211663  T
Q  266 attccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  13211664 attccacccttcgacctgaaacca 13211687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 209
Target Start/End: Original strand, 13516934 - 13517114
Alignment:
Q  30 attcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatc 129  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13516934 attcttaaagtatctgtagtcaagctttattgagaagtaggatatcattaaagcacagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatc 13517033  T
Q  130 tttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  13517034 atggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatcctccatgagaat 13517114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17200228 - 17200006
Alignment:
Q  70 gataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaata 169  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200228 gatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacagatcgtggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaata 17200129  T
Q  170 ttaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgt 265  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| ||||||||    
T  17200128 ttaggagtagtatttgtattggattgacccgctatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgt 17200030  T
Q  266 attccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  17200029 attccacccttcgacctgaaacca 17200006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 18522801 - 18523048
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  18522801 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcatttaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 18522900  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  18522901 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgaaaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 18523000  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18523001 atattctcatagtgat-agtggtgtatttcacccttcgacctgaaacca 18523048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 32056945 - 32056721
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatat-aaa 167  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32056945 ggatatcattaaagcatagagactattatgtgggtagactaatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaaa 32056846  T
Q  168 tattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggt 263  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| ||||||    
T  32056845 tattatgagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggt 32056747  T
Q  264 gtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||||  |||||||||||    
T  32056746 gtattccacccttcaacctgaaacca 32056721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15342288 - 15342041
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  15342288 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 15342189  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  15342188 tctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattggattgatccgtcatgagaatactacatagtaaaaattatgaaaagtgtcataag 15342089  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15342088 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 15342041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15357655 - 15357408
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  15357655 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 15357556  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  15357555 tctagtcttcacatagatataaaaattaggagtaatatttatattgggttgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 15357456  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15357455 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 15357408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 289
Target Start/End: Original strand, 8490676 - 8490880
Alignment:
Q  88 agactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttata 186  Q
    |||| |||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8490676 agacgattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttata 8490775  T
Q  187 ttggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8490776 ttggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctg 8490874  T
Q  284 aaacca 289  Q
    ||||||    
T  8490875 aaacca 8490880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1647586 - 1647425
Alignment:
Q  49 tcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaa 148  Q
    |||||||||| || ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  1647586 tcaagctttattgagaaaagggatataattaaagcatagagactattatgtggatagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaa 1647487  T
Q  149 gtcttcacatagatataaatattaagagtaat-attatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1647486 gtctacacatagatataaatattaggagtaatgtttatatttgattgactcgccatgagaat 1647425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 289
Target Start/End: Original strand, 29925091 - 29925356
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacag 126  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    |||| |||||||| || ||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||| ||    
T  29925091 attattcttaaaatatatgtagtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatag 29925190  T
Q  127 atctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattt 223  Q
    ||| | ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||  | ||||   ||  |    
T  29925191 atcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagt 29925290  T
Q  224 tatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29925291 tatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccatttgacctgaaacca 29925356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 289
Target Start/End: Original strand, 29974244 - 29974509
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacag 126  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    |||| |||||||| || ||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||| ||    
T  29974244 attattcttaaaatatatgtagtcaagctttattgtgaagtgagatatcattaaagcatggaggctattatgtggatagatcgatgatcacatctcatag 29974343  T
Q  127 atctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattt 223  Q
    ||| | ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||  | ||||   ||  |    
T  29974344 atcatggataaagagtcattaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccacctagagaatactgcatagtaaaagt 29974443  T
Q  224 tatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29974444 tatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattccaccatttgacctgaaacca 29974509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 17136497 - 17136738
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||||    
T  17136497 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaaacatagagactattatgtgggtagactgatgatcacatttcacagatcatggataaagagtta 17136596  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttaca---tataattttatgtaaaagtcacagg 240  Q
    ||||||||||||||||      |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||   || || ||  || ||  |||| | |    
T  17136597 tcaagtcttcacatag------atattaggagtaatatttatattggattgacccaccatgagaatactacatagtaaaagttattgaaagtgtcataag 17136690  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17136691 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacttgaaacca 17136738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 289
Target Start/End: Original strand, 16200551 - 16200815
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacag 126  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||| |||| ||||||   ||||  |||||||| ||  ||||||||  ||||  ||| ||||||||| |||| ||||    
T  16200551 attattcttaaagtattcgtagtcaagatttattgtgaagtgggatgtcattaaagcatgaagactattt-gtggagagactgatgatcatatcttacag 16200649  T
Q  127 atctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt-atattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattt 223  Q
    ||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||   ||  |    
T  16200650 atcatggataaagaattatcaagtattcatatagatacaaatattaggtgtaatattcatattggattgacccaccatgagaatactacatagtcaaaat 16200749  T
Q  224 tatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    ||||||||   ||| | |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16200750 tatgtaaagtatcataagatattctcatagtgat-agtggtgtattcaaccctttgacctgaaacca 16200815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24253430 - 24253230
Alignment:
Q  72 taacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatatt 171  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||||||  ||  | ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||| |||    
T  24253430 taacattaaagcatagagactattatgtcggtagactaatgatcatatctcacgaattatggataaagagttatcaagttttcacatacttataaacatt 24253331  T
Q  172 aagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattcc 270  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||| ||| |||| |||   ||| | || ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24253330 aagagttatatttatattggtttgaccctccatgagaataatgcatagaatgttatttaaggatcataagttattctcatagtgataa-cggtgtattcc 24253232  T
Q  271 ac 272  Q
    ||    
T  24253231 ac 24253230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 182 - 281
Target Start/End: Original strand, 9504587 - 9504686
Alignment:
Q  182 ttatattggattgacccgccatgagaatgttacatataattttatgtaaaagtcacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacc 281  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9504587 ttatattgaattgacccgccatgagaatgctacatagaacattatgtagtagtgacaagtcattctcatagtgataagtggtgtatttcaccgtttgacc 9504686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 183
Target Start/End: Original strand, 9504420 - 9504559
Alignment:
Q  44 tgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtt 143  Q
    |||||||||| || ||| |||| || |||| | |||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||  ||||||| | || | |||||||||||    
T  9504420 tgtagtcaagtttcagtatgaagattgatatctttaaaggatagaaactattatgtgggtagactgataatcttatctcacgggtcatggataaggagtt 9504519  T
Q  144 atcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaatatt 183  Q
    ||||||| || ||||| ||| |||||||||| | ||||||    
T  9504520 atcaagtattaacatacataaaaatattaagcggaatatt 9504559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 14890446 - 14890513
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  14890446 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 14890513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15846783 - 15846716
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  15846783 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 15846716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 21034293 - 21034360
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  21034293 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 21034360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20147801 - 20147745
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20147801 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 20147745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 21398847 - 21398914
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  21398847 tatcaagtctatacataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 21398914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19089814 - 19089725
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttga 134  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||| || |||||    
T  19089814 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaatcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacanatgtttga 19089725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Original strand, 55427088 - 55427132
Alignment:
Q  155 acatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  55427088 acatagatataaatattagaagtaatatttatattggattgaccc 55427132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 287
Target Start/End: Original strand, 7245 - 7490
Alignment:
Q  45 gtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtta 144  Q
    |||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  7245 gtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagtta 7344  T
Q  145 tcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacagg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |    
T  7345 tcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataag 7444  T
Q  241 tcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaac 287  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7445 atattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaac 7490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Original strand, 18450 - 18673
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18450 ggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaat 18549  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtg 264  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  18550 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 18648  T
Q  265 tattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  18649 tattccacccttcgacctgaaacca 18673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Original strand, 5649 - 5832
Alignment:
Q  27 attattcttgaaatatttgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacag 126  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5649 attattcttaaagtatatgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcataaagactattatgtgggtagactgatgatcacatctcacag 5748  T
Q  127 atctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
     || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5749 gtcatggataaagagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatccgccatgtgaat 5832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26035 - 25812
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagttatcaagtcttcacatagatataaat 168  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26035 ggatatcattaaagcatagcgactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaagagttatcaagacttcacatagatataaat 25936  T
Q  169 attaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agtcacaggtcattctcatagtgataagtggtg 264  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  |||| | |  |||||||||||||| |||||||    
T  25935 attaggagtaatatttatattggattgatccgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgtcataagatattctcatagtgat-agtggtg 25837  T
Q  265 tattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  25836 tattccacccttcgacctgaaacca 25812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 289
Target Start/End: Original strand, 1130 - 1378
Alignment:
Q  44 tgtagtcaagctttagtgtgaaaatggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataaggagtt 143  Q
    ||||||||||||||| || |||   ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||    
T  1130 tgtagtcaagctttattgagaagtgggatatcattaaagcatagagactattatgtaggtagactgatgatcacatctcacagatcatggataaaaagtt 1229  T
Q  144 atcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaaag--tcaca 238  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||||  ||| |    
T  1230 atcaagtcttgccatagatataaatattaagagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatg-aaaagtatcata 1328  T
Q  239 ggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
     |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1329 agatattctcatagtgat-agtggtgtattccacccttcgacctgaaacca 1378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 230366 - 230213
Alignment:
Q  139 gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatgttacata--taattttatgtaaa-agt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||  ||||||   ||  ||||| |||  ||    
T  230366 gagttatcaagtcttcacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgatctgccatgagaatactacatagtaaaagttatgaaaagtgt 230267  T
Q  235 cacaggtcattctcatagtgataagtggtgtattccaccctttgacctgaaacca 289  Q
    || | |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  230266 cataagatattctcatagtgat-agtggtgtattctacccttcgacctgaaacca 230213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 8360 - 8427
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  8360 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 8427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 238 - 305
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  238 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3922 - 3866
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3922 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 3866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Original strand, 119785 - 119841
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  119785 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 119841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 130471 - 130415
Alignment:
Q  143 tatcaagtcttcacatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgaccc 198  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  130471 tatcaagtctatacatagatataaatattaggagtaatatttatattggattgaccc 130415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 90161 - 90018
Alignment:
Q  69 ggataacattaaagtatagagactattacgtgggtagattgatgatcaaatctcacagatctttgataag-gagttatcaagtcttcacatagatataaa 167  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||| || || | |||| |||| |||| ||||||| |||| | | |||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  90161 ggataatattaaagcataaagactactatgtagatagactgataatcacatctcacggatcatgggtaaaagagttatcaacacttcacatagatataaa 90062  T
Q  168 tattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaatg 210  Q
    ||||| |  ||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  90061 tattacgtataacatttatattggattgacacgcgatgagaatg 90018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 67609 - 67554
Alignment:
Q  155 acatagatataaatattaagagtaata-ttatattggattgacccgccatgagaat 209  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  67609 acataggtataaatattaggagtaatatttatattggattgacccaccgtgagaat 67554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University