View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7117_high_1 (Length: 582)

Name: NF7117_high_1
Description: NF7117
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7117_high_1
NF7117_high_1
[»] chr7 (52 HSPs)
chr7 (1-564)||(44726022-44726584)
chr7 (14-564)||(21679175-21679725)
chr7 (1-546)||(38395388-38395932)
chr7 (5-557)||(24815665-24816209)
chr7 (289-557)||(20298844-20299113)
chr7 (1-557)||(7092806-7093345)
chr7 (1-545)||(28486668-28487195)
chr7 (3-412)||(9679763-9680168)
chr7 (1-412)||(43643-44033)
chr7 (1-412)||(1047783-1048173)
chr7 (1-557)||(7470663-7471201)
chr7 (1-423)||(20298383-20298785)
chr7 (1-412)||(22136208-22136597)
chr7 (1-412)||(40551235-40551624)
chr7 (234-562)||(9680180-9680508)
chr7 (1-224)||(24749690-24749912)
chr7 (235-412)||(7350147-7350324)
chr7 (1-169)||(7350370-7350535)
chr7 (234-412)||(31156779-31156958)
chr7 (3-169)||(31157003-31157167)
chr7 (289-513)||(20298747-20298972)
chr7 (39-222)||(44011476-44011659)
chr7 (405-557)||(1047542-1047695)
chr7 (234-417)||(1047587-1047771)
chr7 (236-394)||(7349974-7350133)
chr7 (411-557)||(44128-44275)
chr7 (234-417)||(31156583-31156767)
chr7 (41-222)||(26214193-26214373)
chr7 (405-557)||(7349905-7350059)
chr7 (405-557)||(31156538-31156691)
chr7 (234-417)||(44045-44230)
chr7 (234-394)||(22136609-22136770)
chr7 (234-394)||(40551636-40551797)
chr7 (1-101)||(4293803-4293902)
chr7 (290-417)||(4509627-4509753)
chr7 (290-417)||(4511469-4511595)
chr7 (405-557)||(22136685-22136839)
chr7 (405-557)||(40551712-40551866)
chr7 (437-528)||(26214495-26214586)
chr7 (41-200)||(47674742-47674900)
chr7 (405-513)||(4509627-4509734)
chr7 (405-513)||(4511469-4511576)
chr7 (450-513)||(6067801-6067863)
chr7 (291-417)||(6431085-6431209)
chr7 (451-513)||(6431147-6431209)
chr7 (450-523)||(6048268-6048340)
chr7 (41-176)||(48490810-48490945)
chr7 (137-222)||(6067995-6068080)
chr7 (55-198)||(6047969-6048110)
chr7 (319-394)||(6067823-6067900)
chr7 (38-90)||(6593245-6593297)
chr7 (38-90)||(18390883-18390935)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-562)||(34988-35547)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (1-557)||(22801402-22801957)
chr4 (1-557)||(14788063-14788618)
chr4 (1-556)||(36920165-36920718)
chr4 (1-546)||(24879660-24880203)
chr4 (4-564)||(47563906-47564466)
chr4 (3-562)||(12401381-12401940)
chr4 (1-549)||(16454453-16455000)
chr4 (1-412)||(36379374-36379783)
chr4 (1-401)||(5099967-5100363)
chr4 (113-562)||(12396439-12396888)
chr4 (1-412)||(22045210-22045598)
chr4 (5-412)||(9174965-9175353)
chr4 (1-412)||(22781231-22781621)
chr4 (1-395)||(16932659-16933032)
chr4 (1-417)||(22133071-22133466)
chr4 (309-557)||(5100454-5100701)
chr4 (5-485)||(18535544-18536023)
chr4 (235-557)||(36379797-36380119)
chr4 (39-343)||(10114028-10114328)
chr4 (3-224)||(36770601-36770822)
chr4 (1-169)||(11007286-11007452)
chr4 (310-549)||(18535386-18535619)
chr4 (236-412)||(11007062-11007239)
chr4 (289-398)||(3825222-3825331)
chr4 (405-562)||(22133021-22133179)
chr4 (297-546)||(3825167-3825420)
chr4 (405-557)||(22044969-22045122)
chr4 (234-417)||(22045014-22045198)
chr4 (5-224)||(47565760-47565978)
chr4 (287-513)||(3577620-3577850)
chr4 (3-90)||(12399578-12399665)
chr4 (234-417)||(16932444-16932628)
chr4 (405-557)||(16932399-16932552)
chr4 (291-424)||(3577613-3577748)
chr4 (234-394)||(22781057-22781219)
chr4 (234-394)||(9174792-9174953)
chr4 (234-417)||(11006865-11007050)
chr4 (287-389)||(3577453-3577557)
chr4 (463-548)||(22780997-22781084)
chr4 (464-528)||(9174753-9174818)
chr4 (236-389)||(26559263-26559415)
chr4 (310-513)||(3577718-3577925)
chr4 (287-487)||(3577451-3577654)
chr4 (287-343)||(35371380-35371436)
chr4 (41-164)||(54881989-54882111)
chr4 (40-176)||(34571229-34571361)
chr4 (470-557)||(11006820-11006909)
chr4 (41-200)||(12740336-12740495)
chr4 (41-200)||(12748542-12748701)
chr4 (235-321)||(12740219-12740306)
chr4 (235-321)||(12748425-12748512)
chr4 (290-344)||(54882237-54882290)
chr4 (38-90)||(7124112-7124164)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-557)||(51112-51667)
[»] chr1 (55 HSPs)
chr1 (5-546)||(28202002-28202542)
chr1 (1-546)||(14098565-14099110)
chr1 (1-412)||(50077570-50077979)
chr1 (253-557)||(6996871-6997172)
chr1 (1-557)||(31736157-31736696)
chr1 (1-412)||(31423812-31424219)
chr1 (1-410)||(16430041-16430448)
chr1 (1-412)||(25249428-25249837)
chr1 (1-397)||(27337639-27338014)
chr1 (252-557)||(50077235-50077540)
chr1 (1-401)||(51751432-51751811)
chr1 (9-393)||(28841760-28842123)
chr1 (1-412)||(47178757-47179147)
chr1 (1-410)||(20301526-20301914)
chr1 (234-557)||(31423478-31423800)
chr1 (289-548)||(25127283-25127544)
chr1 (1-395)||(16227563-16227936)
chr1 (234-564)||(25249086-25249416)
chr1 (8-560)||(13126036-13126580)
chr1 (183-437)||(25127081-25127335)
chr1 (5-196)||(6996682-6996872)
chr1 (234-557)||(8954014-8954335)
chr1 (309-549)||(16430537-16430775)
chr1 (444-557)||(8347873-8347986)
chr1 (234-397)||(20301928-20302092)
chr1 (391-560)||(155220-155388)
chr1 (41-417)||(13548075-13548445)
chr1 (234-395)||(51751834-51751996)
chr1 (405-557)||(20302004-20302159)
chr1 (460-545)||(27337585-27337672)
chr1 (392-557)||(28842026-28842194)
chr1 (234-394)||(16227967-16228128)
chr1 (309-389)||(47179235-47179315)
chr1 (405-557)||(16228043-16228197)
chr1 (405-557)||(47179235-47179389)
chr1 (290-417)||(31928662-31928788)
chr1 (493-557)||(51752000-51752065)
chr1 (103-199)||(31928880-31928975)
chr1 (290-417)||(19753623-19753749)
chr1 (444-512)||(10742262-10742329)
chr1 (405-513)||(13548075-13548182)
chr1 (410-506)||(41141279-41141374)
chr1 (309-344)||(155234-155269)
chr1 (43-176)||(776480-776613)
chr1 (234-340)||(28997281-28997386)
chr1 (234-340)||(29002997-29003102)
chr1 (108-200)||(19753440-19753532)
chr1 (405-513)||(19753642-19753749)
chr1 (405-513)||(31928662-31928769)
chr1 (314-382)||(41141279-41141346)
chr1 (41-172)||(50167982-50168113)
chr1 (325-394)||(10742240-10742308)
chr1 (41-222)||(28242990-28243170)
chr1 (56-121)||(31658561-31658626)
chr1 (41-121)||(28222106-28222186)
[»] chr5 (38 HSPs)
chr5 (1-546)||(20504507-20505052)
chr5 (1-546)||(659112-659658)
chr5 (1-412)||(27911526-27911935)
chr5 (1-412)||(18510189-18510599)
chr5 (65-539)||(31466558-31467031)
chr5 (1-485)||(20044066-20044548)
chr5 (1-557)||(6746466-6747005)
chr5 (143-412)||(41586783-41587051)
chr5 (1-557)||(18468117-18468656)
chr5 (289-547)||(20044448-20044706)
chr5 (1-412)||(10756289-10756678)
chr5 (1-169)||(31544128-31544295)
chr5 (234-412)||(15355347-15355525)
chr5 (234-412)||(23666649-23666827)
chr5 (1-169)||(23666442-23666608)
chr5 (1-169)||(34478137-34478303)
chr5 (235-401)||(31544341-31544507)
chr5 (1-169)||(15355566-15355733)
chr5 (234-412)||(34477913-34478092)
chr5 (406-557)||(18509949-18510101)
chr5 (405-545)||(41586557-41586698)
chr5 (405-545)||(27912022-27912165)
chr5 (234-417)||(31544530-31544714)
chr5 (234-397)||(27911947-27912110)
chr5 (443-557)||(31544644-31544759)
chr5 (234-394)||(15355173-15355335)
chr5 (234-394)||(23666839-23667001)
chr5 (236-417)||(41586590-41586770)
chr5 (234-394)||(10756690-10756852)
chr5 (234-394)||(34477740-34477901)
chr5 (405-557)||(10756767-10756921)
chr5 (234-417)||(18509994-18510177)
chr5 (443-557)||(34477671-34477787)
chr5 (405-557)||(15355104-15355258)
chr5 (405-557)||(23666916-23667070)
chr5 (42-200)||(13295047-13295204)
chr5 (1-64)||(25806524-25806587)
chr5 (41-200)||(13487430-13487588)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (3-546)||(21518998-21519541)
chr2 (1-341)||(6263002-6263339)
chr2 (1-412)||(31733658-31734064)
chr2 (257-542)||(6259413-6259698)
chr2 (1-412)||(36559639-36560028)
chr2 (1-412)||(19502830-19503220)
chr2 (1-169)||(35216687-35216854)
chr2 (234-412)||(35216464-35216642)
chr2 (64-224)||(22404969-22405129)
chr2 (285-407)||(22405135-22405257)
chr2 (234-546)||(31733336-31733646)
chr2 (443-557)||(19502589-19502704)
chr2 (234-394)||(36559466-36559627)
chr2 (237-375)||(13828967-13829105)
chr2 (234-417)||(19502634-19502818)
chr2 (337-412)||(6259733-6259808)
chr2 (234-389)||(35216296-35216452)
chr2 (405-557)||(36559397-36559551)
chr2 (385-560)||(13828878-13829052)
chr2 (405-557)||(35216222-35216376)
chr2 (1-69)||(22402402-22402470)
chr2 (41-200)||(28569073-28569234)
chr2 (41-176)||(14634627-14634762)
chr2 (450-523)||(28568842-28568914)
chr2 (289-383)||(16677131-16677224)
chr2 (404-513)||(42018293-42018401)
chr2 (405-489)||(22405149-22405233)
chr2 (309-398)||(42018313-42018400)
chr2 (444-537)||(41303707-41303802)
chr2 (289-343)||(7858371-7858425)
chr2 (50-200)||(41303933-41304082)
chr2 (309-353)||(28568918-28568961)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (1-557)||(18097461-18098017)
chr3 (1-562)||(28100632-28101193)
chr3 (1-564)||(28137863-28138426)
chr3 (1-389)||(3315755-3316141)
chr3 (1-412)||(53916450-53916859)
chr3 (1-412)||(890681-891092)
chr3 (1-557)||(43227454-43227993)
chr3 (1-412)||(43422247-43422655)
chr3 (5-557)||(42991376-42991911)
chr3 (1-547)||(4308867-4309391)
chr3 (235-562)||(890342-890668)
chr3 (1-412)||(5898786-5899178)
chr3 (1-412)||(6064287-6064678)
chr3 (1-412)||(11169475-11169865)
chr3 (234-557)||(53916124-53916438)
chr3 (146-547)||(35918535-35918939)
chr3 (269-546)||(23636400-23636675)
chr3 (188-412)||(10956843-10957066)
chr3 (234-412)||(457492-457670)
chr3 (1-169)||(457281-457447)
chr3 (1-224)||(23634836-23635059)
chr3 (405-562)||(43422005-43422161)
chr3 (405-564)||(3306326-3306486)
chr3 (234-412)||(3306251-3306429)
chr3 (4-118)||(10957090-10957204)
chr3 (234-417)||(11169877-11170061)
chr3 (405-557)||(11169953-11170106)
chr3 (234-394)||(6064114-6064275)
chr3 (443-557)||(10956602-10956717)
chr3 (235-417)||(10956647-10956830)
chr3 (5-156)||(25634907-25635058)
chr3 (468-560)||(1619244-1619337)
chr3 (443-548)||(5899303-5899409)
chr3 (234-394)||(457682-457843)
chr3 (405-557)||(7607002-7607157)
chr3 (270-397)||(7607069-7607196)
chr3 (234-417)||(43422054-43422235)
chr3 (234-412)||(5899190-5899368)
chr3 (405-548)||(6064054-6064199)
chr3 (405-557)||(457758-457912)
chr3 (290-417)||(43402814-43402940)
chr3 (108-221)||(1619491-1619603)
chr3 (41-176)||(29812275-29812409)
chr3 (460-522)||(14634796-14634858)
chr3 (444-523)||(2075654-2075734)
chr3 (309-353)||(27422343-27422386)
chr3 (405-513)||(43402814-43402921)
chr3 (235-389)||(15824279-15824432)
chr3 (309-343)||(4041708-4041742)
chr3 (405-485)||(890705-890785)
chr3 (309-353)||(1619358-1619401)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (1-542)||(15533279-15533822)
chr6 (1-412)||(3395406-3395815)
chr6 (1-412)||(33310284-33310673)
chr6 (1-412)||(26066892-26067279)
chr6 (1-224)||(3630906-3631128)
chr6 (233-401)||(3630711-3630879)
chr6 (236-412)||(30729440-30729616)
chr6 (443-564)||(3630454-3630575)
chr6 (284-417)||(26944707-26944840)
chr6 (405-562)||(3395903-3396061)
chr6 (234-417)||(3630505-3630688)
chr6 (103-200)||(26944599-26944696)
chr6 (309-560)||(28038296-28038544)
chr6 (234-394)||(33310685-33310846)
chr6 (234-412)||(3395827-3396006)
chr6 (234-394)||(26066719-26066880)
chr6 (405-546)||(30729401-30729543)
chr6 (405-557)||(33310761-33310915)
chr6 (405-557)||(26066650-26066804)
chr6 (404-549)||(26944731-26944877)
chr6 (129-224)||(28038629-28038724)
chr6 (360-489)||(11137760-11137891)
chr6 (443-560)||(30445063-30445180)
chr6 (404-528)||(24543270-24543398)
chr6 (287-353)||(11137783-11137848)
chr6 (42-200)||(16652346-16652504)
chr6 (287-353)||(11137926-11137991)
chr6 (444-513)||(17759031-17759100)
chr6 (460-513)||(11137764-11137817)
chr6 (460-489)||(11137907-11137936)
chr6 (57-222)||(30444772-30444936)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (5-528)||(15071912-15072432)
chr8 (1-412)||(41383801-41384210)
chr8 (1-395)||(27828435-27828792)
chr8 (1-169)||(18812158-18812324)
chr8 (1-169)||(43081052-43081218)
chr8 (234-401)||(43081263-43081430)
chr8 (38-344)||(31574411-31574714)
chr8 (1-329)||(21481645-21481951)
chr8 (405-557)||(18812476-18812629)
chr8 (404-536)||(17849336-17849468)
chr8 (444-557)||(21481969-21482081)
chr8 (405-557)||(27828899-27829054)
chr8 (234-397)||(27828823-27828987)
chr8 (460-542)||(41384352-41384435)
chr8 (234-417)||(18812400-18812584)
chr8 (382-449)||(14418718-14418785)
chr8 (448-556)||(31574293-31574401)
chr8 (235-410)||(41384223-41384398)
chr8 (234-380)||(43081453-43081600)
chr8 (404-522)||(40220415-40220533)
chr8 (309-389)||(17849337-17849416)
chr8 (404-523)||(42436004-42436123)
chr8 (42-200)||(34255109-34255267)
chr8 (79-200)||(41365619-41365742)
chr8 (405-528)||(43081529-43081653)
chr8 (45-200)||(17849079-17849233)
chr8 (492-560)||(18959980-18960049)
chr8 (290-389)||(42436044-42436141)
chr8 (237-294)||(14418842-14418899)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (1-557)||(69872-70412)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (1-542)||(148-672)
[»] scaffold0133 (3 HSPs)
scaffold0133 (92-389)||(3969-4269)
scaffold0133 (297-375)||(4273-4351)
scaffold0133 (437-557)||(4393-4512)
[»] scaffold0140 (4 HSPs)
scaffold0140 (1-169)||(23522-23689)
scaffold0140 (234-412)||(23730-23908)
scaffold0140 (234-394)||(23920-24082)
scaffold0140 (405-557)||(23997-24151)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (1-169)||(1019-1186)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (493-557)||(2525-2590)
scaffold0250 (234-366)||(2371-2504)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (308-371)||(81351-81413)
scaffold0014 (405-489)||(81329-81412)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 451; Significance: 0; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 564
Target Start/End: Original strand, 44726022 - 44726584
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44726022 cctgttgaggtggagtttcaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 44726121  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  44726122 gtaatggtacgactatggaggaccttgggtgttatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagatggaaggcattccggaggttgaagaatgta 44726221  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44726222 cagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggtcaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttat 44726320  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44726321 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaatgaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttaaggtg 44726420  T
Q  401 tgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44726421 tgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaagaatcttcataagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaat 44726520  T
Q  501 cttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttggc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44726521 cttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttggc 44726584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 14 - 564
Target Start/End: Original strand, 21679175 - 21679725
Alignment:
Q  14 agtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgac 113  Q
    ||||| || ||||||||||||   |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |    
T  21679175 agtttcaaggttgaagacataatgggatatacacattttctagttgaggtagagtacactcagcgtgaggtggagttgaacacaccagtaatggtacggc 21679274  T
Q  114 tatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgc 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21679275 tatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagatattccgaaggttgaagaatgtatagcacgacttgc 21679373  T
Q  214 gggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgt 313  Q
    |||||||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21679374 gggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaggaagcggaagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgt 21679472  T
Q  314 ggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||| |||| ||||||||||    ||||||||    
T  21679473 cgaactacataaaattcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcgggagacgttccgatggcagaagaggttaaggtgaatgcttgtgga 21679572  T
Q  413 actacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagct 511  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21679573 actacctaaaattcctagcgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacaatccgatggctgaaggggttagggtgtaaacttgtggagct 21679671  T
Q  512 acttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttggc 564  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  21679672 acttggtgtggtgggaagcaagggaaggagcaacatggtggttgatggtgtggc 21679725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 38395388 - 38395932
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38395388 cctgttgaggtggggtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagggtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 38395487  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  38395488 gtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagcgatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgta 38395586  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||| |||||||||||        |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||   |    
T  38395587 tagcacggcttgtgggattaccct-aaaaaaaggccaagcatgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcatgtgttgaagatg---t 38395682  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| | |||| |||||||| |||||||||    
T  38395683 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagagagaagacgttccgatggctgaagaggttaaggt 38395782  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--gggtg 496  Q
    |    ||||||| |||||||||||  ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| |||||||| || ||||  ||| |   ||||    
T  38395783 gaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaagggttatgaggtg 38395881  T
Q  497 taaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 546  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38395882 taaacttgtgaagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaa 38395932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 24816209 - 24815665
Alignment:
Q  5 ttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaa 104  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||    
T  24816209 ttgaggtggagtttcaaggtggaagacatagtgggatgtatgcatttgctagttgaagtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccgagaa 24816110  T
Q  105 tgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagc 204  Q
    || |||||||| || |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  24816109 tggtacgactacggtggacctcgggtgctatgctctagtggtgagcaagggatt-cttcatgaagaaggaaggtatttcggaggttgaagaatgtatagc 24816011  T
Q  205 acggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtg 304  Q
    |  |||||||||||||||||        |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| | ||| |||||||||| ||||| |||    
T  24816010 atagcttgcgggattaccctaaaa----ggccaaggttgattggatgaaaggagatcttcatggaagcgggagttatcccgtgttgaagacgttattgtg 24815915  T
Q  305 aatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgca 404  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| |    
T  24815914 aatacttgtagaactacctaaaattcctagtgtagttgg-gtgcaaggaccttcgagaaggcggaatacattccgatggctgaagaggttaaggtgtgta 24815816  T
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 504  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| | |||| |||||  |||| ||||||| || |||||||||| ||| |||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  24815815 cttgtggagctacctaaaattcctagcgtag-ttggatgcaagaatcttcacaa-ggcggaaggcgttcggatggttgaacaggt-aaggtgtaaacttg 24815719  T
Q  505 tggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  24815718 tggagctacttggtgtagtggaaagcaagggaaagatcagcatggtggttgatg 24815665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 289 - 557
Target Start/End: Original strand, 20298844 - 20299113
Alignment:
Q  289 tgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaa 388  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20298844 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaa 20298943  T
Q  389 ggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20298944 ggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 20299043  T
Q  489 tcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20299044 tcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtcgtgggaagcaagggaaagagcagcatggtggttgatg 20299113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 7093345 - 7092806
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  7093345 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccg 7093246  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||    
T  7093245 gtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag-------------------ttgaagaatgta 7093166  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7093165 tagcacggcttgcgggattactctaaaagga-ggccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaggaagtgggagatgtcctgcgttgaagatgttat 7093067  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| | |||| |||||||| |||||||||    
T  7093066 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaaatcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagaccgaagacgttccgatggctgaagaggttaaggt 7092967  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--gggtg 496  Q
    |    |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||||| |||| | | |||||||| ||||| ||  | ||||| ||| |   ||||    
T  7092966 gaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtag-ttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagagctgaaggggttatgaggtg 7092868  T
Q  497 taaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  7092867 taaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcaacaaggaggttgatg 7092806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 545
Target Start/End: Original strand, 28486668 - 28487195
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28486668 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 28486767  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||    
T  28486768 gtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag-------------------ttgaagaatgta 28486847  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| |    
T  28486848 tagcacggcttgcgagattactctaaaagaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgtttt 28486946  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||    
T  28486947 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctggtgtagttggaccgcaaggactcttagagaagacggaagacgttccgatggctgaagaggttaaggt 28487046  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg-tcag-ggtg 496  Q
    |    |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||||| |||| | | |||||||   |||||||||| ||||| || | || ||||    
T  28487047 gaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtag-ttggactacaaggaccttcgagaaggcggaaaatattccgatggctgaaggggtttagaggtg 28487145  T
Q  497 taaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagca 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28487146 taaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagca 28487195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 412
Target Start/End: Original strand, 9679763 - 9680168
Alignment:
Q  3 tgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggt 102  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  9679763 tgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacac--cggt 9679860  T
Q  103 aatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtaca 202  Q
    |||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |    
T  9679861 aatggtactgctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagaaagagattttttcatgaagacggaatgcatttcggaggttgaagaatgtata 9679959  T
Q  203 gcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatgg 302  Q
     |||  ||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9679960 acactacttgcaggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcatggagaccttcaaggaagcgggagatgtcatgtgttgaacatgttatgg 9680058  T
Q  303 tgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||     
T  9680059 tgaatgcttgtggaactacctaaaatttctagcgtagtctgactgcaaggaccttcgagaaggtggaagacattacgagggccgaaggggttaaggtgta 9680158  T
Q  403 cacttgtgga 412  Q
     |||||||||    
T  9680159 tacttgtgga 9680168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Original strand, 43643 - 44033
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||  ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43643 cctgttgaggttgagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgagatggagttgaacacaccg 43742  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||    
T  43743 gtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga-------------------ggttgaagaatgta 43822  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43823 tatcacggcttgcgggattaccctaaaagaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttat 43921  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43922 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtg 44021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 1048173 - 1047783
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1048173 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 1048074  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||                   ||| ||||||||    
T  1048073 gtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag-------------------ttggagaatgta 1047994  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||        | |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1047993 tagcacggcttgcgagattactctaaaagaatg-ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttat 1047895  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1047894 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtg 1047795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 7471201 - 7470663
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7471201 cctgttgtggtggagtttcaaggttgaagacaaagtgggatgtacgcatttgctagttgaggcagagtacgctcagcgtgaggtggggttgaacacaccg 7471102  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||    
T  7471101 gtaatgatacgattatggaagaccttgggtgctatgctcta-tggggagcaagggatttcttcatgaa-------------------gttgaagaatgta 7471022  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||| | || |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7471021 tagcacggcttgcgggattaccct-aaaagaagtccaagggtgattggatgcaaagtgatcttcaagggagcaggagatgtcctgtgttgaagatgttat 7470923  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||    
T  7470922 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaattcctagcatagttgaagtgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaagaggttaaggt 7470823  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--gggtg 496  Q
    |    ||||||| |||||||||||| |||   |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| |||||||| || ||||| ||  |   ||||    
T  7470822 gaatgcttgtggtactacctaaaattcctaatgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggctatgaggtg 7470724  T
Q  497 taaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  7470723 taaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcatcatggtggttgatg 7470663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 423
Target Start/End: Original strand, 20298383 - 20298785
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||| ||| ||||| || || ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20298383 cctgttgatgtggagtttcaaggtggaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 20298482  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||    
T  20298483 gtaatggtacgactatggagaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga-------------------ggttgaagaatgta 20298562  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20298563 cagcacggcttgcgggattaccctaaaagaa-ggccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttat 20298661  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||    
T  20298662 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaagaggttaaggt 20298761  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaa 423  Q
    |    ||||||| |||||||||||    
T  20298762 gaatgcttgtgggactacctaaaa 20298785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Original strand, 22136208 - 22136597
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22136208 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 22136307  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||                   ||| |||||||     
T  22136308 gtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag-------------------ttggagaatgtg 22136386  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||        | |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||| ||| |||||||| | |||    
T  22136387 tagcacggcttgcgagattactctaaaagaatg-ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgttctgcgttgaagacggtat 22136485  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  22136486 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaaggggttgaggtg 22136585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Original strand, 40551235 - 40551624
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40551235 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 40551334  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||                   ||| |||||||     
T  40551335 gtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag-------------------ttggagaatgtg 40551413  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||        | |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||| ||| |||||||| | |||    
T  40551414 tagcacggcttgcgagattactctaaaagaatg-ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgttctgcgttgaagacggtat 40551512  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  40551513 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaaggggttgaggtg 40551612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 234 - 562
Target Start/End: Original strand, 9680180 - 9680508
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  |||||  |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  9680180 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaagc-atggtatagtcttgtagaactacctgaaattccta 9680278  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagt 433  Q
    |  || ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9680279 gcataattggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttaaggtatgtacttgtagaactacctaaaattccttgagt 9680378  T
Q  434 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtggga-acaag 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||    
T  9680379 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtacgacgcaag 9680478  T
Q  533 ggaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 562  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9680479 ggaaagagcagcaaggaggttgatggtttg 9680508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 24749690 - 24749912
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24749690 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcattttctagttaaggtagagtacactcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 24749789  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  24749790 gtaatggtacgtctatggaggaccttggatgctatgctcta-tggtgagcaagagatttcttcataaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgta 24749888  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccct 224  Q
     |||| | ||||||||||||||||    
T  24749889 tagcatgacttgcgggattaccct 24749912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 235 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 7350324 - 7350147
Alignment:
Q  235 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctag 334  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||    
T  7350324 ccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacctaaaacttctag 7350225  T
Q  335 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||  |||||||||    
T  7350224 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccaagggctgaagggattgaggtgtatacttgtgga 7350147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7350535 - 7350370
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  7350535 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaac-cactg 7350437  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 169  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7350436 gtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 7350370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 234 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31156958 - 31156779
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  31156958 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacctaaaactccta 31156859  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  31156858 gtgtagttggactgcaaggactcttcgagagtgcggaagatattccgatggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 31156779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31157167 - 31157003
Alignment:
Q  3 tgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggt 102  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  31157167 tgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggacttgaacacacctgt 31157068  T
Q  103 aatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 169  Q
    |||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31157067 aatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaaggaatttcttcatgaag 31157003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 289 - 513
Target Start/End: Original strand, 20298747 - 20298972
Alignment:
Q  289 tgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctga 387  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  20298747 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctga 20298846  T
Q  388 aggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaaga 486  Q
    || ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| |||||||| || |||||     
T  20298847 agaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaagg 20298945  T
Q  487 ggtcagggtgtaaacttgtggagctac 513  Q
    ||| | |||||  ||||||||| ||||    
T  20298946 ggttaaggtgtgcacttgtggaactac 20298972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44011659 - 44011476
Alignment:
Q  39 gatgtacgcatttgctagtt--gaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctatt 136  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||  | |||| || |||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||     
T  44011659 gatgtacgtatttgctagttaagaggtaga--aagctctgcttgaggtggagtcgaacacaccggaaatggtacgactatggagaaccttgggtgctatg 44011562  T
Q  137 ctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 222  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||    
T  44011561 ctgtagttgtgagcaagggaattcttcatgaagatggaaggtattccggaggttgaagaatgtataacatggcttgtgggattacc 44011476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 1047695 - 1047542
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 503  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1047695 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaactt 1047597  T
Q  504 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1047596 gtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggaggttgatg 1047542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1047771 - 1047587
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  1047771 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 1047672  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  1047671 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 1047587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 236 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7350133 - 7349974
Alignment:
Q  236 caagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctag 334  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7350133 caagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctaaaattcctag 7350034  T
Q  335 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
     ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  7350033 cgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 7349974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 411 - 557
Target Start/End: Original strand, 44128 - 44275
Alignment:
Q  411 gaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggag 509  Q
    ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | ||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44128 gaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggtagacattccgatggctaaagaggttagggtgtaaacttgtggag 44226  T
Q  510 ctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  44227 ctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggatgttgatg 44275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 234 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 31156767 - 31156583
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| | | |||||||| | ||||||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  31156767 gccaagggtgattgggtacaagtatatcttcaaggaaagcgagagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 31156668  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  31156667 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatgactgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 31156583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Original strand, 26214193 - 26214373
Alignment:
Q  41 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctct 140  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||    ||||  | || ||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  26214193 tgtacgcatttggaagttgaggtagataaagctcagcttgaggtggagttggtgacactaggaacgatacgactatggag-accttgggtgctagactct 26214291  T
Q  141 agtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 222  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  26214292 agttgtgagcaagggaattcttcaagaagacggaagacattccgtagtttgaagaatgtatggcttggcttgtgggattacc 26214373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 7350059 - 7349905
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 502  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  7350059 cttgtagaactacctaaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 7349961  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  7349960 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 7349905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 31156691 - 31156538
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 503  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  31156691 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatgactgaagaggttagggtgtaaactt 31156593  T
Q  504 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  31156592 gtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 31156538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 417
Target Start/End: Original strand, 44045 - 44230
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtg-gaactacctaaaattcc 331  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  |||||  ||||||||| |||||||    
T  44045 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtaagaactacctgaaattcc 44144  T
Q  332 tagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    ||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  44145 tagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggtagacattccgatggctaaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 44230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Original strand, 22136609 - 22136770
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  22136609 gccaagggtgattgggtataagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 22136708  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  22136709 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 22136770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Original strand, 40551636 - 40551797
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  40551636 gccaagggtgattgggtataagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 40551735  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  40551736 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 40551797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 4293902 - 4293803
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  4293902 cctgttgagctggagtttcaaggttgaagacatagtacgat-tacgcatttgctagtttaggtagagtacgctaagcttgaggtggagttgaacacaccg 4293804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 290 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 4509753 - 4509627
Alignment:
Q  290 gaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 389  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| |  |||||    
T  4509753 gaagaggttatggtgtaggcttgtggaactatctaaaaatcctagtgtagttgga-tgcaaggaacttcaagaaggcggaaggcattccgaagtttgaag 4509655  T
Q  390 gggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
     ||| ||||||   ||||||||||||||    
T  4509654 aggtaaaggtgaaaacttgtggaactac 4509627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 290 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 4511595 - 4511469
Alignment:
Q  290 gaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 389  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| |  |||||    
T  4511595 gaagaggttatggtgtaggcttgtggaactatctaaaaatcctagtgtagttgga-tgcaaggaacttcaagaaggcggaaggcattccgaagtttgaag 4511497  T
Q  390 gggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
     ||| ||||||   ||||||||||||||    
T  4511496 aggtaaaggtgaaaacttgtggaactac 4511469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Original strand, 22136685 - 22136839
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 502  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  22136685 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 22136783  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  22136784 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 22136839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Original strand, 40551712 - 40551866
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 502  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  40551712 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 40551810  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  40551811 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 40551866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 437 - 528
Target Start/End: Original strand, 26214495 - 26214586
Alignment:
Q  437 ttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa 528  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26214495 ttggatacaaggaacttcaaaaaggcggaagtcattctgatggttgaagaggcaagggtggaagcttatggagctacttggtgtagttggaa 26214586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 47674900 - 47674742
Alignment:
Q  41 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctct 140  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| | | |||||||||| |  ||||| | |||| ||| ||||||| || ||||||||| ||| ||||    
T  47674900 tgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacacctggaatggtacaactatggtgg-ccttgagtgatatgctct 47674802  T
Q  141 agtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    ||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||| ||| | | | ||||||||||||    
T  47674801 agttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaagacattccagggtttgaagaatgta 47674742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 4509734 - 4509627
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 504  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| | |||||| |||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| |||||||    
T  4509734 cttgtggaactatctaaaaatcctagtgtagtt-ggatgcaaggaacttcaagaaggcggaaggcattccgaagtttgaagaggtaaaggtgaaaacttg 4509636  T
Q  505 tggagctac 513  Q
    |||| ||||    
T  4509635 tggaactac 4509627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 4511576 - 4511469
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 504  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| | |||||| |||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| |||||||    
T  4511576 cttgtggaactatctaaaaatcctagtgtagtt-ggatgcaaggaacttcaagaaggcggaaggcattccgaagtttgaagaggtaaaggtgaaaacttg 4511478  T
Q  505 tggagctac 513  Q
    |||| ||||    
T  4511477 tggaactac 4511469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 6067863 - 6067801
Alignment:
Q  450 tcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctac 513  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  6067863 tcttcaagaaggcggaagacattccgatggttgaagaggt-tgggtggaaacttgtggagctac 6067801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 417
Target Start/End: Original strand, 6431085 - 6431209
Alignment:
Q  291 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 390  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| | |||| ||| |||||||| ||| |||| |  |||||     
T  6431085 aagaggttatggtgtaggcttgcggaactacctaaaa-tcctagtgcagttgga-tgcaagaaacttcaagagggcggaaggcattccgaagtttgaaga 6431182  T
Q  391 ggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    ||| ||||||   ||||||||||||||    
T  6431183 ggtaaaggtgaaaacttgtggaactac 6431209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 513
Target Start/End: Original strand, 6431147 - 6431209
Alignment:
Q  451 cttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctac 513  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||    
T  6431147 cttcaagagggcggaaggcattccgaagtttgaagaggtaaaggtgaaaacttgtggaactac 6431209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 523
Target Start/End: Original strand, 6048268 - 6048340
Alignment:
Q  450 tcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagt 523  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||| | |||||||    
T  6048268 tcttcaagaaggcggaaggcattccgatggttaaagaggt-tgggtggaagcttgtggagctacattgtgtagt 6048340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Original strand, 48490810 - 48490945
Alignment:
Q  41 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctc 139  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||  |  ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| |||  ||| |||    
T  48490810 tgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtagatgacaccgggaatggtacaactatggagg-ccttgggtgtttatgctc 48490908  T
Q  140 tagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaag 176  Q
    |||| ||||||| |  | |||||||||| ||||||||    
T  48490909 tagttgtgagcatgtaaattcttcatgaggacggaag 48490945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6068080 - 6067995
Alignment:
Q  137 ctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 222  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||  ||| ||||| |||||||||| |  ||| |||||| |||||||||    
T  6068080 ctctagttgtgagcaagggaattcttcaattagacggaaggcattccggagtttgaagaatgcatggcatggcttgtgggattacc 6067995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 198
Target Start/End: Original strand, 6047969 - 6048110
Alignment:
Q  55 agttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagg 154  Q
    ||||||||||||| |   ||||| |||||||||||| |  ||| ||  |||| ||| ||||||  |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  6047969 agttgaggtagagaaatgtcagcttgaggtggagttgatgacatcgagaatggtacaactatg--ggaccttgggtgctaggctctagttgtgagcaagg 6048066  T
Q  155 gatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatg 198  Q
     | ||||||| || |||| |||  ||||||| | ||||||||||    
T  6048067 aaattcttcaagaggacgaaaggcatttcggggtttgaagaatg 6048110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 319 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6067900 - 6067823
Alignment:
Q  319 tacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagga---ccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||| |||| || ||||| ||||    
T  6067900 tacctaaaatttctagtgtagttgga-tgcaaggatggtcttcaagaaggcggaagacattccgatggttgaagaggtt 6067823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 6593297 - 6593245
Alignment:
Q  38 ggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 90  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  6593297 ggatgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtt 6593245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 18390935 - 18390883
Alignment:
Q  38 ggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 90  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  18390935 ggatgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtt 18390883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 562
Target Start/End: Original strand, 34988 - 35547
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34988 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcg 35087  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  35088 gtaatggtacgactatggaggaccttgagtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgta 35187  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||    
T  35188 cagcacggcttgcgggattaccctaaaaaag-ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaaacgggagatgtcctgtgttgaagaggttat 35286  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35287 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaatacctagcgtagttagactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttaaggtg 35386  T
Q  401 tgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  35387 tgcacttgtggaactacctaaaattcctttagtattttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcatttcgatggttgaagaggtta-ggtgtaaa 35485  T
Q  501 cttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 562  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35486 cttgtggagctacttggtgtagtaggaacaagggaaagagcagcaaggtggttgatggtttg 35547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 405; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 22801957 - 22801402
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22801957 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagaatacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 22801858  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  22801857 gtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgta 22801759  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22801758 tagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggaaaccttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttat 22801660  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22801659 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggacattcgagaaggcggaagacattccgagggcagaaggggttaaggtg 22801560  T
Q  401 tgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22801559 tgcacttgtggaactacctaaaataccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggatagggtgtaaa 22801460  T
Q  501 cttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22801459 cttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggaggttgatg 22801402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 14788618 - 14788063
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14788618 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 14788519  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  14788518 gtaatggtacggctatggaggacgttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcacgaagacggaaggcgttccggaggttgaagaatgta 14788420  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14788419 tagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttat 14788321  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14788320 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagatggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgaggtctgaaggggttaaggtg 14788221  T
Q  401 tgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14788220 tgcacttgtggaactacctaaaatgcctttagtagtttagacacaaggatctacaaaagggcggaagacattccgatggttgaagaggttagggtgtaaa 14788121  T
Q  501 cttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  14788120 cttgtgaaactacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcttggtggttgatg 14788063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 36920718 - 36920165
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||    
T  36920718 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgttcagcgtgaggtgcatttgaacacaccg 36920619  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  36920618 gtaatggtacgactatggaggaccttgggtgcaatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgta 36920520  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  ||||    
T  36920519 tagcacagcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcaggagatgtcctgtgttgaagagattat 36920421  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| |||||||    
T  36920420 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgatggttgaaggggataaggtg 36920321  T
Q  401 tgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaa 500  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36920320 tgcacttgtggaactacct-aaattccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggttagggtgtaaa 36920222  T
Q  501 cttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgat 556  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36920221 cttgtggagctacttagtatagtgagaagcaagggaaagagcagcaaggtggttgat 36920165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 24879660 - 24880203
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24879660 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttaaggtagagtacgctcagcgagaggtggagttgaacacaccg 24879759  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  24879760 gtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaatgcattccggaggttgaagaatgta 24879858  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||  |  |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24879859 tagcacggcttgcgggattaccgtaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtaatattca-ggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttat 24879956  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| |||| | ||||||||    
T  24879957 gatgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagagtagttggactgcaaggaccttcgagaaggtggaagacattctgaaggcagaagagattaaggtg 24880056  T
Q  401 tgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24880057 tgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttgaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggttagggtgtaaa 24880156  T
Q  501 cttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 546  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| |||||||||    
T  24880157 cttgtggagctacttggtgcagtggaaagcaaaggaaggagcagcaa 24880203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 564
Target Start/End: Original strand, 47563906 - 47564466
Alignment:
Q  4 gttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggta 103  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  47563906 gttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccgata 47564005  T
Q  104 atgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacag 203  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||    
T  47564006 atggtacgactatggacgaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaatggatttcttcatgaagacggaaggcattatggaggttgaagaatgtatag 47564105  T
Q  204 cacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggt 303  Q
    ||||  |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| || ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  47564106 cacgaattgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggaaattttcaaggaagcgggaaatgtattgtgttgaagaggttatggt 47564204  T
Q  304 gaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgc 403  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | || |||||||||||||||||||||     
T  47564205 gaatgcttgtgaaactacctaaaattcctagcgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaaaatattctgatggctgaaggggttaaggtgtgt 47564304  T
Q  404 acttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 503  Q
    | ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  47564305 agttgtggaacttactaaaattccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggaggaagacattccgatggttgaagaggttatggtgtaaactc 47564404  T
Q  504 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttggc 564  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47564405 gtggagctacttggtgtagtggaaagcaagggaaagagcagcaaggtggttgatggcttggc 47564466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 3 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12401940 - 12401381
Alignment:
Q  3 tgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggt 102  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  12401940 tgttgaggtggagtttcaaggttgaagacataatgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaactcaccggt 12401841  T
Q  103 aatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtaca 202  Q
    |||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  12401840 aatggtacagctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacagaaggaattccggaggttgaagaatgtata 12401742  T
Q  203 gcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatgg 302  Q
    ||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12401741 gcacgacttgcgggattaccct-aaaaaaaggccaagggtgattggatgtaaggtgatcttcaaggaagcatgagatgtcctgtggtgaagatgttatgg 12401643  T
Q  303 tgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgt 401  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| | |||| |||||||| ||||||||||     
T  12401642 tgaatgcttgtggaactgcctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttagagaagacgaaagacgttccgatggctgaagaggttaaggtga 12401543  T
Q  402 gcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaa 500  Q
       |||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||    
T  12401542 atgcttgtggaactacctaaaattcctagtttag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgatggctgacggggttagggtgtaaa 12401444  T
Q  501 cttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12401443 cttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggtgattgatggtttg 12401381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 549
Target Start/End: Original strand, 16454453 - 16455000
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16454453 cctgttgaggtggtgtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccg 16454552  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  16454553 gtaatggtacgactatggagtaccttgggtgctatacgcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgta 16454651  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16454652 tagcacggcttgcgggattaccct-aaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttat 16454750  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || | |||| |||||||| |||||||||    
T  16454751 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactctttgagaaggcggaaaacgttccgatggctgaagaggttaaggt 16454850  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgta 498  Q
    |     ||||||||||||||||||| | | | |||| ||||||  |||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||  ||||| ||| | |||| |    
T  16454851 gaatgtttgtggaactacctaaaattcttagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcagaagacattccgatgactgaag-ggttaaggtgaa 16454948  T
Q  499 aacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggt 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  16454949 aacttgtggagctacttggtgtagtagaaagcaagggaaagagcagcaaggt 16455000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Original strand, 36379374 - 36379783
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36379374 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtac-catttgctagttgaggtagagtacgctcagtttgaggtggagttaaacacaccg 36379472  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||| | ||| ||||||||||||    
T  36379473 ggaatggtacgactatggaggaccttggatgctatgctctagtggtgagcaatgaatttcttcatgaaaacggaaggcattccagagattgaagaatgta 36379572  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  36379573 tagcacggcttgcgggattaccct-aaaaaaaggccaagggtgattgaatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcttgtgttgaagatgttat 36379671  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  36379672 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattgccagcgtagttggactgcaaggaccttcgagaagacggaaatcattccgatggctaaaggggttaaggtg 36379771  T
Q  401 tgcacttgtgga 412  Q
    |  |||||||||    
T  36379772 tatacttgtgga 36379783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Original strand, 5099967 - 5100363
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  5099967 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaa--acaccg 5100064  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5100065 gtaatagtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacagaagacattccggaggttgaagaatgta 5100163  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     | ||| |||||||||||||||||         |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5100164 taacacagcttgcgggattaccctaaaaaata-gccaagagtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttat 5100262  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||  || || || ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  5100263 ggtgaatgcttgttgaactacctaaaatacctagcataattagattgcaaggaccttcgagaagacacaagatattccgagggctgaagggattaaggtg 5100362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 113 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 12396888 - 12396439
Alignment:
Q  113 ctatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttg 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12396888 ctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacagaaggaattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttg 12396790  T
Q  213 cgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttg 312  Q
    ||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12396789 cgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgtaaggtgatcttcaaggaagcatgagatgtcctgtggtgaagatgttatggtgaatgcttg 12396691  T
Q  313 tggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgg 411  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| | |||| |||||||| ||||||||||    |||||||    
T  12396690 tggaactgcctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttagagaagacgaaagacgttccgatggctgaagaggttaaggtgaatgcttgtgg 12396591  T
Q  412 aactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagc 510  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  12396590 aactacctaaaattcctagtttag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattcagatggctgacggggttagggtgtaaacttgtggagc 12396492  T
Q  511 tacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 562  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12396491 tacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggtgattgatggtttg 12396439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22045598 - 22045210
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22045598 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagatagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 22045499  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||| ||    
T  22045498 gtaatggtacggctatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag-------------------ttgaagaatata 22045419  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||          ||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||||    
T  22045418 tagcacggcttgcgagattactctaaaaatt---ccaagggtgattgaatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcggtgaagatgttat 22045322  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22045321 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtg 22045222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 9175353 - 9174965
Alignment:
Q  5 ttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaa 104  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9175353 ttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaa 9175254  T
Q  105 tgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagc 204  Q
    || |||||||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||                   ||||||||||||| |      
T  9175253 tggtacgactatgaaggaccttgggtactatgctcta-tggtgagcaagggatttattcatgaa-------------------gttgaagaatgtataca 9175174  T
Q  205 acggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaaggg--tgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatgg 302  Q
    ||||||||| |||||| |||        |||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9175173 acggcttgcaggattatcctaaaagaa-ggccaagggggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttatgg 9175075  T
Q  303 tgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtg 402  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  9175074 tgaatgcttgtgggactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaaggggttaaggtgta 9174975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22781621 - 22781231
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22781621 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactg 22781522  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||                   ||| ||||||||    
T  22781521 gtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag-------------------ttggagaatgta 22781443  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||        | |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22781442 tagcacggcttgcgagattactctaaaagaatg-ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttat 22781344  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||    
T  22781343 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagggattgaggt 22781244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16933032 - 16932659
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16933032 cctgttgaggtggagtttcaaggctgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactg 16932933  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||                   ||| |||||||     
T  16932932 gtaatggtacgactatgaaa-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag-------------------ttggagaatgtg 16932854  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||        | |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16932853 tagcacggcttgcgagattactctaaaagaatg-ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttat 16932755  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtta 395  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  16932754 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagtggtta 16932659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 22133466 - 22133071
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22133466 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 22133367  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||                   |||| |||||||||||    
T  22133366 gtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat-------------------gaggatgaagaatgta 22133287  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||    
T  22133286 tagcacggcttgcgggattatcct-aaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttat 22133188  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    |||  |  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||| ||||    
T  22133187 ggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattttgatggctgaagaggttagggtg 22133088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 309 - 557
Target Start/End: Original strand, 5100454 - 5100701
Alignment:
Q  309 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttg 408  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |  | ||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  5100454 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaagcatat-cgaaaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtttaggtgtgcacttg 5100552  T
Q  409 tggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtgga 508  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  5100553 tggaactacctaaa-tgccttgagtagtttggacacaaagatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggttagggtgtaaacttgtgaa 5100651  T
Q  509 gctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  5100652 gctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcatggtggttgatg 5100701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 18536023 - 18535544
Alignment:
Q  5 ttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaa 104  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||    |  | ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||    
T  18536023 ttgaggtggagttttaaggttgaagacatagtgcgatgtacgcattttctagttgagaggtaaaaagctcagcttgaggtggagtttaacacaccaggaa 18535924  T
Q  105 tgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagc 204  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  | |||  ||||||| ||||||||| | |    
T  18535923 tggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaatggatttcttcataaagacgaacaacattctggaggttaaagaatgtatatc 18535824  T
Q  205 acggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtg 304  Q
    ||| |||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18535823 acgacttgcgggattaccttaaaaa----gccaagggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagtgggagatgtcccgtgttgaagaggttatggtg 18535728  T
Q  305 aatgct-------tgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaag 397  Q
     || ||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| | |||| |||||||| |||||||    
T  18535727 gatacttgtggaatgtggaactacataaaattcctagtgtagttggactgcaaggctcttctagaacgcggaagacgtcccgatggctgaagaggttaag 18535628  T
Q  398 gtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaag 485  Q
     ||   | ||||| ||||||||||||| ||     |||| ||||| ||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  18535627 atggatatttgtgaaactacctaaaattcc-----tagtgtggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaag 18535544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 235 - 557
Target Start/End: Original strand, 36379797 - 36380119
Alignment:
Q  235 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctag 334  Q
    ||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||  |  ||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  36379797 ccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgttctgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaattacttgaaattcctag 36379896  T
Q  335 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagta 434  Q
    ||||||| |  | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||    
T  36379897 tgtagtttggatacaaggatcttcgagaaggcagaagacattccgatagctaaagaggttaaggtgtgtacttgtggagctacctaaaattcctagcgta 36379996  T
Q  435 gtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagg 533  Q
    ||  | |  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36379997 gtgcgaag-caagagtcttcaaaaggacggaaggcattccgatggttgaagaggttaggttgtaaacttgtggagctacttggtctagtgggaagcaagg 36380095  T
Q  534 gaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  36380096 gaaagagcagcatggtggttgatg 36380119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 343
Target Start/End: Original strand, 10114028 - 10114328
Alignment:
Q  39 gatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattct 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  10114028 gatgtacgcattttctagttgaggttgacaacgctcagcttgaggtggagttaaacacaccgggaatggtacgactatgga-gaccttgggtgttattct 10114126  T
Q  139 ctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaa 238  Q
     |||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||| ||||          ||||    
T  10114127 ttagttgtgagcaatggaattcttcatgaagacataagacattccggagtttgaagaatgtatggcatggcttgtgggattgccctaaaata----ccaa 10114222  T
Q  239 gggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgt-gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgt 337  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| || | || |||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10114223 gggtgattggatggaaggagatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagaggttatggtatatacttgtggaactacctaaaattcctagtgt 10114322  T
Q  338 agttgg 343  Q
    ||||||    
T  10114323 agttgg 10114328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Original strand, 36770601 - 36770822
Alignment:
Q  3 tgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggt 102  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||| |||| |    
T  36770601 tgttgagttggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtgcgcatttgctagttgaggtagagtaagcttagcttgaggtggagttgaacagaccgat 36770700  T
Q  103 aatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtaca 202  Q
    |||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |    
T  36770701 aatggtacggctatggagaaccttgggtgctatgctctagttgtgagcaagggaattcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtata 36770800  T
Q  203 gcacggcttgcgggattaccct 224  Q
     || |||||| |||||||||||    
T  36770801 acatggcttgtgggattaccct 36770822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11007452 - 11007286
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11007452 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 11007353  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 169  Q
    |||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11007352 gtaatggtacgactat-gaaaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 11007286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 310 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 18535619 - 18535386
Alignment:
Q  310 ttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgt 409  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | || |    
T  18535619 ttgtgaaactacctaaaattcctagtgt----ggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaaggggttaaggtgtgtattttt 18535524  T
Q  410 ggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggag 509  Q
    | | |||||||||||  || | |||| |||||  |||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18535523 gaacctacctaaaatttctagtgtag-ttggatgcaagaatcttcaaga-ggcggaaggcattccaatggctgaagaggt-aaggtgtaaacttgtggag 18535427  T
Q  510 ctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggt 549  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18535426 ctacatgatgtagtgggaagcaaggaaaagagcagcaaggt 18535386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 236 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11007239 - 11007062
Alignment:
Q  236 caagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| | |  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11007239 caagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaaccaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacctaaaactcctagt 11007140  T
Q  336 gtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | || |||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  11007139 gtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagatattctgatggctgaagtggttgaggtgtatacttgtgga 11007062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 289 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 3825331 - 3825222
Alignment:
Q  289 tgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaa 388  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3825331 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcatagtatagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctgaa 3825232  T
Q  389 ggggttaagg 398  Q
    ||| ||||||    
T  3825231 gggtttaagg 3825222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 405 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 22133179 - 22133021
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 503  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22133179 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattttgatggctgaagaggttagggtgtaaactt 22133081  T
Q  504 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22133080 gtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggtggttgatggtttg 22133021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 297 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 3825420 - 3825167
Alignment:
Q  297 ttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtta 395  Q
    |||||||||||||| || ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||    
T  3825420 ttatggtgaatgctcgtagaactatataaatctcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaagaggtta 3825321  T
Q  396 aggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--g 492  Q
    |||||    |||||||||||||||||||| | | |  ||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||| || || ||||| | | |  |    
T  3825320 aggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcatagtatag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctgaagggtttaagg 3825222  T
Q  493 ggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 546  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  3825221 ggtgtaaacttgtggagttacttggtgtagcaggaagcaagggaaagagcagcaa 3825167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 22045122 - 22044969
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 503  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22045122 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaactt 22045024  T
Q  504 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22045023 gtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcaacaaggtggttgatg 22044969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 22045198 - 22045014
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  22045198 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 22045099  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  22045098 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 22045014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 47565760 - 47565978
Alignment:
Q  5 ttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaa 104  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||   ||||||||  ||||||||||||||    || | ||| ||  ||||||| |||| ||| |||||| ||    
T  47565760 ttgaggtggagtttcaaggtggaagacataatgggatgtacatatttgctagttgagaggtagaaagcttagtttgaggtgaagttgaactcaccgggaa 47565859  T
Q  105 tgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagc 204  Q
    || || |||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||| |||    
T  47565860 tggtatgactatggagaaccttgagtgatatgctctattg-tgagcaagggaattcttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaaggatgtatagc 47565958  T
Q  205 acggcttgcgggattaccct 224  Q
    | |||||| |||||||||||    
T  47565959 atggcttgtgggattaccct 47565978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 287 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 3577850 - 3577620
Alignment:
Q  287 gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcg---agaaggcggaagacataccgaggg 383  Q
    |||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||   |||   |||||||||||| | | | || ||    
T  3577850 gttgaagaggttatggtgtagactcgtggaactacctacaatttctagtgtagttgga-tgcaaggatgatcgtcaagaaggcggaaggccttcagatgg 3577752  T
Q  384 ctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaag---gatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggt 480  Q
    || ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  ||||   ||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  3577751 cttaagaggttatggtgtagacttgtggaactacctaaaattcctagtgtag-ttggatgcaaggatgatcttcaagaagtcggaaggcattccgatggt 3577653  T
Q  481 tgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctac 513  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  3577652 tgaagaggttatggtgtagacttgtggaactac 3577620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 12399665 - 12399578
Alignment:
Q  3 tgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 90  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12399665 tgttaaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagtt 12399578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16932628 - 16932444
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||   | ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  16932628 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcatattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 16932529  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    || ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  16932528 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaagacggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 16932444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 16932552 - 16932399
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 503  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | | |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16932552 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaagacggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaactt 16932454  T
Q  504 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  16932453 gtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 16932399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 3577748 - 3577613
Alignment:
Q  291 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaag---gaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctga 387  Q
    |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||| ||||| |||||| ||| |||| || |||    
T  3577748 aagaggttatggtgtagacttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgga-tgcaaggatgatcttcaagaagtcggaaggcattccgatggttga 3577650  T
Q  388 aggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaat 424  Q
    || ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||    
T  3577649 agaggttatggtgtagacttgtggaactaccaaaaat 3577613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22781219 - 22781057
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  22781219 gccaagggtgattgagtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 22781120  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggc-ggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    || ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  22781119 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcgggaagacattccgatggctgaagaggtt 22781057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9174953 - 9174792
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||  ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  9174953 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagctggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 9174854  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    || ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  9174853 agcgtagttggactccaagcatcttcgagaaggcagaagacattccgatggctgaagaggtt 9174792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 11007050 - 11006865
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  11007050 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 11006951  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt-aaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    || ||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  11006950 agcgtagttgaactacaagcatcttcgagaaggcagaagatattccgatggctgaagaggttgaaggtgtaaacttgtggagctac 11006865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 3577557 - 3577453
Alignment:
Q  287 gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagga---ccttcgagaaggcggaagacataccgaggg 383  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  3577557 gttgaagaggttatggtgtagacttatggaactacctaaaattcctagtgtagttgga-tgcaaggattgtcttcaagaaggcggaagacattccgatgg 3577459  T
Q  384 ctgaag 389  Q
     |||||    
T  3577458 ttgaag 3577453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 463 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 22781084 - 22780997
Alignment:
Q  463 ggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaagg 548  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  22781084 ggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaacttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaagg 22780997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 464 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 9174818 - 9174753
Alignment:
Q  464 gaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa 528  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9174818 gaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaacttgtggagctacttggagtagtgggaa 9174753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 389
Target Start/End: Original strand, 26559263 - 26559415
Alignment:
Q  236 caagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgt-gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| || |||| |||||||| | | ||||| || ||| || |||||||||||||| ||||    
T  26559263 caagggtgattggatgcaaggagatcttcacggaagcgggagacgttctgtggttgaagaggatttggtgtatacttatgaaactacctaaaatt-ctag 26559361  T
Q  335 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 389  Q
    ||||| |||| |||||| | | |  |||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  26559362 tgtagctgga-tgcaagaatcattaagaaggcgaaaaacattccgagggttgaag 26559415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 3577925 - 3577718
Alignment:
Q  310 ttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaag---gaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcact 406  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||   || |||| ||||||| |||| ||| |||| || ||||| ||||| |||||  |||    
T  3577925 ttgtggaactacttaaaattcctagtgtacttgga-tgcaaggatgatcttcaagaaggcagaaggcattccgacggttgaagaggttatggtgtagact 3577827  T
Q  407 tgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaag---gatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 503  Q
     ||||||||||||| |||  || | |||| |||||  ||||   |||| |||| | |||||||||| ||| ||||| | ||||||| | |||||| ||||    
T  3577826 cgtggaactacctacaatttctagtgtag-ttggatgcaaggatgatcgtcaagaaggcggaaggccttcagatggcttaagaggttatggtgtagactt 3577728  T
Q  504 gtggagctac 513  Q
    ||||| ||||    
T  3577727 gtggaactac 3577718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 3577654 - 3577451
Alignment:
Q  287 gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcg--agaaggcggaagacataccgagggc 384  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||   ||   ||||||  |||  ||| | || ||     
T  3577654 gttgaagaggttatggtgtagacttgtggaactaccaaaaattcctagtgtatttcga-tgcaaggatggtcttaagaaggaagaatgcattctgatggt 3577556  T
Q  385 tgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggat---cttcaaaagggcggaaggcattccgatggtt 481  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||| | |||||| |||  |||||||   |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  3577555 tgaagaggttatggtgtagacttatggaactacctaaaattcctagtgtagtt-ggatgcaaggattgtcttcaagaaggcggaagacattccgatggtt 3577457  T
Q  482 gaagag 487  Q
    ||||||    
T  3577456 gaagag 3577451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35371436 - 35371380
Alignment:
Q  287 gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgg 343  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  35371436 gttgaagatgttatggtgtaaacttgtggaactacctaaaagtcctagtatagttgg 35371380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 164
Target Start/End: Original strand, 54881989 - 54882111
Alignment:
Q  41 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctct 140  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||   ||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  54881989 tgtacacatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttagtgacaccgagaatggtacgactatggagg-ccttgggtgttatgctct 54882087  T
Q  141 agtggtgagcaagggatttcttca 164  Q
    ||| ||||||| | || |||||||    
T  54882088 agttgtgagcatgtgaattcttca 54882111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34571361 - 34571229
Alignment:
Q  40 atgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctc 139  Q
    |||||||||||||  ||||||||||   || ||||| | ||||||||||||    ||||||  |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| |||    
T  34571361 atgtacgcatttggaagttgaggta---taagctcaacttgaggtggagttggtgacaccgagaatgatacaactatgaagg-ccttgggtgctatgctc 34571266  T
Q  140 tagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaag 176  Q
    |||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||    
T  34571265 tagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaag 34571229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 11006909 - 11006820
Alignment:
Q  470 attccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  11006909 attccgatggctgaagaggttgaaggtgtaaacttgtggagctacttggaatagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 11006820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12740495 - 12740336
Alignment:
Q  41 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgct-attctc 139  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||| |  | ||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||| | || |||    
T  12740495 tgtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtagagttgatgataccggaaatggtacaactatggagg-ccttgggtgtttatgctc 12740397  T
Q  140 tagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||| || |||| | || |||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  12740396 tagttgtaagcacgtgaattcttcatgaggacggaagacattccggggtttgaagaatgta 12740336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12748701 - 12748542
Alignment:
Q  41 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgct-attctc 139  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||| |  | ||||| |||| ||| |||||||||| ||||| ||| | || |||    
T  12748701 tgtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtagagttgatgataccggaaatggtacaactatggagg-ccttgggtgtttatgctc 12748603  T
Q  140 tagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||| || |||| | || |||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  12748602 tagttgtaagcacgtgaattcttcatgaggacggaagacattccggggtttgaagaatgta 12748542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12740306 - 12740219
Alignment:
Q  235 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgt-gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactac 321  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| || | || |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||    
T  12740306 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgtatacttgtggagctac 12740219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12748512 - 12748425
Alignment:
Q  235 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgt-gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactac 321  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| || | || |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||    
T  12748512 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgtatacttgtggagctac 12748425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 344
Target Start/End: Original strand, 54882237 - 54882290
Alignment:
Q  290 gaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgga 344  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54882237 gaagaagttatggtgtagtcttgtggaactacctaaaa-tcctagtgtagttgga 54882290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 90
Target Start/End: Original strand, 7124112 - 7124164
Alignment:
Q  38 ggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagtt 90  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  7124112 ggatgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtt 7124164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 557
Target Start/End: Original strand, 51112 - 51667
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51112 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 51211  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  51212 gtaatggtacggctatggaggacgttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcacgaagacggaaggcgttccggaggttgaagaatgta 51310  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51311 tagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttat 51409  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  51410 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagatggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgaggtctgaaggggttaaggtg 51509  T
Q  401 tgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaa 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51510 tgcacttgtggaactacctaaaatgcctttagtagtttagacacaaggatctacaaaagggcggaagacattccgatggttgaagaggttagggtgtaaa 51609  T
Q  501 cttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  51610 cttgtgaaactacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcttggtggttgatg 51667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 28202542 - 28202002
Alignment:
Q  5 ttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaa 104  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  28202542 ttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgttcgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacatcggtaa 28202443  T
Q  105 tgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagc 204  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| | |    
T  28202442 tggcacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggttttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatatc 28202344  T
Q  205 acggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtg 304  Q
    |||||   ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28202343 acggcgctcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaagaagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaaaatgttatggtg 28202245  T
Q  305 aatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgca 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28202244 aatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgtgggctgaaggggttaaggtgtgca 28202145  T
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28202144 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattctgatggttgaagaggttagggtgtaaccttg 28202045  T
Q  505 tggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28202044 tggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagctgcaa 28202002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 14099110 - 14098565
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14099110 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggcagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 14099011  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| || | ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  14099010 gtaatggtatgtctatggaggaccttgggtgttatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgta 14098912  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14098911 tagcatggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttat 14098813  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | |||| |||| ||  |||||||||    
T  14098812 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaaacggaagacgttccgatggctaaaaaggttaaggt 14098713  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgta 498  Q
    |     |||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  14098712 gaatgtttgtagaactacctaaaattcctagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaaggggttagggtgta 14098614  T
Q  499 aacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14098613 aacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagtgaaagagcagcaa 14098565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 50077979 - 50077570
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50077979 cctgttgaggtggagcttcaaggttgaagacataataggatgtatgcatttgctagttgaggtagagtacactcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 50077880  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  50077879 ataatggtacgactatggagaaccttggatgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattttggaggttaaagaatgta 50077781  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||| ||||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  50077780 tagcacgacttgcgggattaccct-aaaaaaaggtcaagggtgattggatgcaaggtggccttcaaggaagcgggagatgtcccgtgttgaagatgttat 50077682  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    
T  50077681 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtagttggattgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctgaaggggttaaagtg 50077582  T
Q  401 tgcacttgtgga 412  Q
    |  |||||||||    
T  50077581 tatacttgtgga 50077570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 253 - 557
Target Start/End: Original strand, 6996871 - 6997172
Alignment:
Q  253 aaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagg 352  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996871 aaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtaaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagg 6996970  T
Q  353 accttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatct 452  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996971 accttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatct 6997070  T
Q  453 tcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtag 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  6997071 tcaaaagggcggaaggcattccgatgg----agaggttagggtgtaaacttgtgaagcaacttggtatagtgggaagcaaggtaaagagcagcacggtgg 6997166  T
Q  552 ttgatg 557  Q
    ||||||    
T  6997167 ttgatg 6997172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 31736696 - 31736157
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31736696 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 31736597  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||    
T  31736596 gtaatggtacggctatggagaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat-------------------gaggttgaagaatgta 31736517  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31736516 tagcacggcttgcgggattactct-aaaagaaggccaagggtgataggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttat 31736418  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||    
T  31736417 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaagaggttaaggt 31736318  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--gggtg 496  Q
    |    ||||||| |||||||||||| |||   |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| |||||||| || ||||| ||| |   ||||    
T  31736317 gaatgcttgtgggactacctaaaattcctaacgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttatgaggtg 31736219  T
Q  497 taaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31736218 taaacttgtggagctacttggtgtaatgggaagcaagggaaagagcagcatggtggttgatg 31736157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31424219 - 31423812
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||  ||||| || |||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||     | | ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  31424219 cctgttgaggtagagtttcaaggttgaacacataatgggatgtacgcatttgctagttgagaggttggaagctcagcttgaggtggagttgaacacaccg 31424120  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  31424119 gtaatagtacgactatgggggaccttgggtgctatgctctag--gtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgta 31424022  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
      ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  31424021 ttgcacggcttgcgggattaccctaaaaaa--ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagagattat 31423924  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31423923 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaatttctagtgtagttggactgtaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttatggtg 31423824  T
Q  401 tgcacttgtgga 412  Q
    || |||||||||    
T  31423823 tgtacttgtgga 31423812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 16430041 - 16430448
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||     | | ||||||| | |||||||||| ||||||||     
T  16430041 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggtatgtacgctttt-ctagttgagaggatggaagctcagcttaaggtggagttgaacacacca 16430139  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||    
T  16430140 gtaatggtacggctatggaggaccttggatgttatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccgaaggttggagaatgta 16430239  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16430240 tagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaggttat 16430338  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||    
T  16430339 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtagttagactgcaaggaccttcgagaaggcggaacacattctgatggctgaaggggttaaggtg 16430438  T
Q  401 tgcacttgtg 410  Q
    || |||||||    
T  16430439 tgtacttgtg 16430448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 25249837 - 25249428
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    ||||||||| || ||||| || || ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||||||    
T  25249837 cctgttgagttggagttttaaggtggaagacatagtgggatgtacacatttgctaattgaggtagagtacactctacttgaggtggagttgaacacaccg 25249738  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    | |||  || ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||||||| ||||||    
T  25249737 gaaatcgtatgactatggaggaccttgggtgctatgatctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacagaaggcattctggaggttgaataatgta 25249638  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||| | ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25249637 tagcatgacttgcgggattaccctaaaaaa--ggccaagggtgattggatgcaagatgatcttcaaagaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttat 25249540  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  25249539 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtagttggactgcaacgaccttcgagaaggtgaaagacattccgagggctgaagggtttaaggtg 25249440  T
Q  401 tgcacttgtgga 412  Q
     | |||||||||    
T  25249439 cgtacttgtgga 25249428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 27338014 - 27337639
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27338014 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgcgaggtggagttgaacacaccg 27337915  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||                   ||||||||||||    
T  27337914 gtaatgtttcgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaatggatttcttcatgaag-------------------ttgaagaatgta 27337835  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27337834 tagcacggcttgcgggattaccctaaaagaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttat 27337736  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaag 397  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27337735 ggtgaatgcttgtaggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaagaggttaag 27337639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 252 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 50077540 - 50077235
Alignment:
Q  252 caaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaag 351  Q
    |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| || |||| ||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50077540 caagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtatttaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctaaaattcctagcgtagttggactacaag 50077441  T
Q  352 gaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatc 451  Q
    || |||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50077440 gatcttcgagaagacggaagacatttcgatggctaaagaggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaattccttgagtagtttggacacaaggatc 50077341  T
Q  452 ttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcagcaaggtag 551  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  50077340 ttcaaaagggcggaaggcatttcgatggttgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaataagggaaagagcagcaaggtgg 50077241  T
Q  552 ttgatg 557  Q
    ||||||    
T  50077240 ttgatg 50077235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 401
Target Start/End: Original strand, 51751432 - 51751811
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51751432 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 51751531  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||                   |||| ||||||||    
T  51751532 gtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaa-------------------gttggagaatgta 51751611  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||         ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  51751612 tagcacggcttgcgagattactctaaaagaat-gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttat 51751710  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  51751711 ggtgaatgcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaaggggttgaggtg 51751810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 393
Target Start/End: Original strand, 28841760 - 28842123
Alignment:
Q  9 ggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgat 108  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  28841760 ggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggt 28841859  T
Q  109 acgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacgg 208  Q
    ||||||||| |  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||                   |||||||||||||| ||||| |    
T  28841860 acgactatgaaaaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaaggaatttcttcatga-------------------ggttgaagaatgtaaagcacag 28841939  T
Q  209 cttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatg 308  Q
    ||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  28841940 cttgcgggattacactaaaagaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttatggtgtacg 28842038  T
Q  309 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggt 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28842039 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggt 28842123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Original strand, 47178757 - 47179147
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47178757 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 47178856  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||                   |||| ||||||||    
T  47178857 gtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaa-------------------gttggagaatgta 47178936  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| ||| || ||         ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  47178937 tagcacggcttgcgagataactctaaaagaat-gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgtgttgaagatgttat 47179035  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||    
T  47179036 ggtgaaagcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagtggttgaggtg 47179135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 20301526 - 20301914
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20301526 cctgtcgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacacca 20301625  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||                   ||||||||||||    
T  20301626 gtaatggtacggctatgaaggaccttgagtgctatgctcta-tcgtgagcaaaggatttcttcatgaag-------------------ttgaagaatgta 20301705  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||  ||  |||||||||||||    
T  20301706 tagcacggcttgcggaattaccctaaaagaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatctttaaggaagcgggagatgttttgcattgaagatgttat 20301804  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20301805 ggtgaatgcttgtgggactaactaaaattcctagcgtagttgggctgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttaaggtg 20301904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 234 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 31423800 - 31423478
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||||||||||||   ||||  || |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||  |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  31423800 gccaagggtgattgggcacaagtggatcttcaaggaagcgggagatgtcttgtgttgaagaagt-atggtatagtcttgtagaactacctaaaattccta 31423702  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagt 433  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31423701 gcgtagttggactacaaggatcttcgagaatgtggaagacattccgatggctgaagaggttaaggtgtgtacttgtggaactacctaaaattccttgagt 31423602  T
Q  434 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagg 533  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||     
T  31423601 agtttggacacaaagatcttcaaaagggcggaagacattccgatggttaaagaggttaaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtagaatcaaga 31423502  T
Q  534 gaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  31423501 gaaagagcagcatggtggttgatg 31423478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 289 - 548
Target Start/End: Original strand, 25127283 - 25127544
Alignment:
Q  289 tgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaa 388  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || | ||    
T  25127283 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaggcggaagacattccaatggttaaa 25127382  T
Q  389 ggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtag-tttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagag 487  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25127383 ggggttaaggcgtgtacttgtggaactacgcaaaattccttgagtagttttggacacaaggatcttcaaaagggcgaaaggcattccgatggttgaagag 25127482  T
Q  488 gtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaagg 548  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  25127483 gttagggtgtaaacttgtgaagctacatggtgtagtgggaagcaagggaaaaaacagcaagg 25127544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 16227563 - 16227936
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16227563 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagatatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 16227662  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||                   |||| |||||||     
T  16227663 gtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaa-------------------gttggagaatgtg 16227741  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||         ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16227742 tagcacggcttgcgagattactctaaaagaat-gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttat 16227840  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtta 395  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || | || |||||||| |||||    
T  16227841 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactacaaggactcttcgagaaggcggaagatattctgatggctgaagtggtta 16227936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 234 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 25249416 - 25249086
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||| || ||| |  |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  25249416 gccaagggtgattgggcacaagtagatcgtcaaggaagcaggagatgtcctgtgttgaagaagt-atgatatagtcttgtagaactacctgaaattccta 25249318  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagt 433  Q
    |||||||| |  | |||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25249317 gtgtagtttggatacaaggatcttcaagaagacggaagacattccgatggctgaagaggttaaggtgtgtaattgtggaactacctaaaattccttgagt 25249218  T
Q  434 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caag 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25249217 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattctgatgattgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtactgggaagcaag 25249118  T
Q  533 ggaaagagcagcaaggtagttgatggtttggc 564  Q
    | |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  25249117 gaaaagagtagcaaggtggtcgatggtttggc 25249086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 13126580 - 13126036
Alignment:
Q  8 aggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatga 107  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| |  ||||     
T  13126580 aggtggagtttcaaggtggaagacatagtgggatgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcagctagaggtggagttgaacacactgaaaatgg 13126481  T
Q  108 tacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacg 207  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||  |||  ||| || || |||||||| ||| |||| |    
T  13126480 tacgactatagaggaccttgtgt--tatgctctagttgtgagcaaggaaattcttcatgaagacaaaaggcattccgaagtttgaagaaagtatagcatg 13126383  T
Q  208 gcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtg-ttgaagatgttatggtgaa 306  Q
    ||||| |||||||| ||          |||||||||||| |||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| ||||||| ||||||||| |    
T  13126382 gcttgtgggattacgctaaaaaa----ccaagggtgattagatgcaaggagatcttcaaggaaggg-gagatgttccgtggttgaagaggttatggtgta 13126288  T
Q  307 tgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcact 406  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||  |||    
T  13126287 gacttgtggaactacctaaaattcttagtgtagttgga-tgcaaggatcttcgacaaggcggaagacattctgatggctgaagaggttaaggtgtagact 13126189  T
Q  407 tgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtg 506  Q
    || ||||||||||||||| ||| | |||| ||| |  ||||||||||||| | || |||||| | || |||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  13126188 tgcggaactacctaaaattcctagcgtag-ttgcatgcaaggatcttcaagaaggtggaaggaaatctgatggttgaagaggt-tgggtggaaacttgtg 13126091  T
Q  507 gagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtt 560  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  13126090 gagctacatggtgtaatgggaagcaagggaaagagcgtcaaggtgattgatggtt 13126036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 183 - 437
Target Start/End: Original strand, 25127081 - 25127335
Alignment:
Q  183 cggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtc 282  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||        |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25127081 cggaggttgaagaatgtatagcacggcttgtgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtaattggatggaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtc 25127179  T
Q  283 ctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgag 381  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||     
T  25127180 ctttgttgaagatgttatggtgaatgattgtggaactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcaagaaggcggaagacgttccgat 25127279  T
Q  382 ggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtt 437  Q
    |||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  25127280 ggctgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagtt 25127335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 6996682 - 6996872
Alignment:
Q  5 ttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaa 104  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6996682 ttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcggtaa 6996781  T
Q  105 tgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaa 196  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  6996782 tggtacggctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaa 6996872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 234 - 557
Target Start/End: Original strand, 8954014 - 8954335
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||| | |||||||||    
T  8954014 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgttctgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacgtgaaattccta 8954113  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagt 433  Q
     ||||||| |  | ||||||  || ||||||| |||||||||  ||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | ||    
T  8954114 ttgtagtttggatacaaggatttttgagaaggtggaagacatttcgatgactgaagaggttaaggtgtgtacttgtggagctacctaaatttcctagtgt 8954213  T
Q  434 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caag 532  Q
    || |||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8954214 ag-ttggaagcaagaatcttcaaaa-ggcggaaggcattccaatggttgaagacgt-aaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaag 8954310  T
Q  533 ggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  8954311 ggaaagagcagcaaggtggttgatg 8954335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 309 - 549
Target Start/End: Original strand, 16430537 - 16430775
Alignment:
Q  309 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttg 408  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| || |  | |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||| |||||    
T  16430537 cttgtagaactacctgaaattcctagtgtaatttggatacaaggatcttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagaggttaaggtgtgtacttg 16430636  T
Q  409 tggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtgga 508  Q
    |||| ||||||||||| ||| |  ||| | |||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||| || | || |||||||||||||    
T  16430637 tggagctacctaaaattcctagcatag-tgggaagcaagaatcttc-aaagggcggaaggaattccaatggtttaagacgt-aaggagtaaacttgtgga 16430733  T
Q  509 gctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggt 549  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16430734 gctacttggtgtagtgggaaccaagggaaagagcagcaaggt 16430775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 444 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 8347986 - 8347873
Alignment:
Q  444 caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagca 542  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8347986 caagaatcttcaaatgggcggaaggcattccgatggttgaagaggt-ttggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagca 8347888  T
Q  543 gcaaggtagttgatg 557  Q
    ||| ||| |||||||    
T  8347887 gcatggtggttgatg 8347873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 397
Target Start/End: Original strand, 20301928 - 20302092
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  20301928 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 20302027  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaag 397  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  20302028 agcgtagttggactacaaggatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttaag 20302092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 391 - 560
Target Start/End: Original strand, 155220 - 155388
Alignment:
Q  391 ggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc 490  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  |||  |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  155220 ggttaaggtgtacacttgtggaactacctaaaattcctagtgtag-ttggatgcaataatctccaagaaggcagaaggcattccgatggttgaagaggt- 155317  T
Q  491 agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagt-gggaacaagggaaagagcagcaaggtagttgatggtt 560  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  155318 tgggtggaaacttgtggagctacatggtgtagtggggagcaagggaaagggcaccgaggtggttgatggtt 155388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 13548445 - 13548075
Alignment:
Q  41 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctct 140  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| | ||||| | | |||||||||| |  ||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||    
T  13548445 tgtacgcatttggaagttaaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaactatggagg-ccttgagtgctatgttct 13548347  T
Q  141 agtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagg 240  Q
    ||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||||||||  |   |||||| | |||||||          | ||||||    
T  13548346 agttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacc-----taaaagaccaagg 13548252  T
Q  241 gtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtg-ttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtag 339  Q
    ||||| |||||||||  || |||||||| |||| |||| || |  || ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13548251 gtgatcggatgcaagatgatcttcaaggaagcgggagacgttccatggttgaagaggttatggtgtaggcttgtggaactacctaaaaatcctagtttag 13548152  T
Q  340 ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||| |  ||||  ||| ||||||   ||||||||||||||    
T  13548151 ttgga-tgcaaggaacttcaagagggcggaaggcattccgaagtttgaaaaggtaaaggtgaaaacttgtggaactac 13548075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 51751834 - 51751996
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||| ||||||||| | |||| ||| |||||||| | | | ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  51751834 gccaatggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagtgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaatttct 51751933  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtta 395  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  51751934 agcgtagttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctgaaggggtta 51751996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Original strand, 20302004 - 20302159
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagg--gtgtaaac 501  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| |||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||    
T  20302004 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaaggatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttaagaggtgtaaac 20302102  T
Q  502 ttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20302103 ttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggatgttgatg 20302159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 460 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 27337672 - 27337585
Alignment:
Q  460 ggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagg--gtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcagca 545  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337672 ggcggaagacattccgagggctgaagaggttaagaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcagca 27337585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 392 - 557
Target Start/End: Original strand, 28842026 - 28842194
Alignment:
Q  392 gttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggaca-caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc 490  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||  |||||| |||| | | |||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  28842026 gttatggtgtacgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagtt-ggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggtc 28842124  T
Q  491 agg--gtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    | |  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  28842125 atgaggtgttaacttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaatagcagcaaggaggttgatg 28842194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Original strand, 16227967 - 16228128
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcag-cgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |  || ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  16227967 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaaacgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 16228066  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  16228067 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagaaattccgatggctgaagaggtt 16228128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 309 - 389
Target Start/End: Original strand, 47179235 - 47179315
Alignment:
Q  309 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 389  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  47179235 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaag 47179315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Original strand, 16228043 - 16228197
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 502  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | ||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  16228043 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagaaattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 16228141  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  16228142 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 16228197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Original strand, 47179235 - 47179389
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 502  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  47179235 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaagttgagggtgtaaact 47179333  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  47179334 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 47179389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 31928788 - 31928662
Alignment:
Q  290 gaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 389  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||   |||||| |||  |||||  |||||    
T  31928788 gaagaggttatggtgtaggcttgtggaactacctaaaaatcctagtgtagttgga-tgcaaggaacttcaagagatcggaaggcatttcgaggtttgaag 31928690  T
Q  390 gggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
     ||| ||||||   ||||||||||||||    
T  31928689 aggtaaaggtgaaaacttgtggaactac 31928662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 557
Target Start/End: Original strand, 51752000 - 51752065
Alignment:
Q  493 ggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  51752000 ggtgtaaacttgtggagatacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggaggttgatg 51752065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31928975 - 31928880
Alignment:
Q  103 aatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgt 199  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||||| || |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  31928975 aatggtacgactatggag-accttgggtgatatgctctagttgtgagcaagagaattcttcaagaggacgaaagacatttcgggggttgaagaatgt 31928880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 417
Target Start/End: Original strand, 19753623 - 19753749
Alignment:
Q  290 gaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 389  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||||| ||| |||| |  |||||    
T  19753623 gaagaggttatggtgtaggcttgtgtaactacctaaaaatcctagtgtagttgga-tgcaagtaacttcaagagggcggaaggcattccgaagtttgaag 19753721  T
Q  390 gggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
     ||| ||||||   | ||||||||||||    
T  19753722 aggtaaaggtgaaaaattgtggaactac 19753749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 512
Target Start/End: Original strand, 10742262 - 10742329
Alignment:
Q  444 caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagcta 512  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  10742262 caaggatcttcaagaaggcgaaaggcattccgatggttgaagaggt-tgggtggaaatttgtggagcta 10742329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 13548182 - 13548075
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 504  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |  ||||| |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||| | |||| |||||||    
T  13548182 cttgtggaactacctaaaaatcctagtttagtt-ggatgcaaggaacttcaagagggcggaaggcattccgaagtttgaaaaggtaaaggtgaaaacttg 13548084  T
Q  505 tggagctac 513  Q
    |||| ||||    
T  13548083 tggaactac 13548075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 506
Target Start/End: Original strand, 41141279 - 41141374
Alignment:
Q  410 ggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtg 506  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| || || ||||||    
T  41141279 ggaactacctaaaattcctggtgtagtt-ggatgcaaggatcttcaagagggcagaaggcattccgaggtttgaagaggtaaggatggaagcttgtg 41141374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 344
Target Start/End: Original strand, 155234 - 155269
Alignment:
Q  309 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgga 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155234 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgga 155269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 176
Target Start/End: Original strand, 776480 - 776613
Alignment:
Q  43 tacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctcta 141  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  | ||||| | |||||||||||| |  ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||| |||  ||| |||||    
T  776480 tacgcatttggaagttgaggtagataaagctcaacttgaggtggagttgataacaccggaaatggtaccactatggagg-ccttgggtgtttatgctcta 776578  T
Q  142 gtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaag 176  Q
    || ||||||| | || |||||||||| ||||||||    
T  776579 gttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaag 776613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28997386 - 28997281
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |  |||||  |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  28997386 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcctatgttgaagaag-catggtatagtcttgtagaactacctaaaattccta 28997288  T
Q  334 gtgtagt 340  Q
    | |||||    
T  28997287 gcgtagt 28997281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29003102 - 29002997
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |  |||||  |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  29003102 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcctatgttgaagaag-catggtatagtcttgtagaactacctaaaattccta 29003004  T
Q  334 gtgtagt 340  Q
    | |||||    
T  29003003 gcgtagt 29002997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 108 - 200
Target Start/End: Original strand, 19753440 - 19753532
Alignment:
Q  108 tacgactatggaggaccttgagtgct-attctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  19753440 tacgactatggagg-ccttgggtgcttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcatttcggggtttgaagaatgta 19753532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 513
Target Start/End: Original strand, 19753642 - 19753749
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 504  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| | |||||| |||  |||| | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| ||| |||    
T  19753642 cttgtgtaactacctaaaaatcctagtgtagtt-ggatgcaagtaacttcaagagggcggaaggcattccgaagtttgaagaggtaaaggtgaaaaattg 19753740  T
Q  505 tggagctac 513  Q
    |||| ||||    
T  19753741 tggaactac 19753749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 31928769 - 31928662
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 504  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||| |||  |||||| |||||| ||  ||||||||||| ||| | |||||||||| | |||| |||||||    
T  31928769 cttgtggaactacctaaaaatcctagtgtagtt-ggatgcaaggaacttcaagagatcggaaggcatttcgaggtttgaagaggtaaaggtgaaaacttg 31928671  T
Q  505 tggagctac 513  Q
    |||| ||||    
T  31928670 tggaactac 31928662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 382
Target Start/End: Original strand, 41141279 - 41141346
Alignment:
Q  314 ggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagg 382  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||    
T  41141279 ggaactacctaaaattcctggtgtagttgga-tgcaaggatcttcaagagggcagaaggcattccgagg 41141346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 50168113 - 50167982
Alignment:
Q  41 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctc 139  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| |  |||| | |||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| |||    
T  50168113 tgtacacatttggaagttgaggtagagaaaactcaacttgaggtggagttgatgacaccggaaatggtacgactatggagg-ccttgggtgtttatgctc 50168015  T
Q  140 tagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacg 172  Q
    |||| ||||||| | || |||||||||| ||||    
T  50168014 tagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacg 50167982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 394
Target Start/End: Original strand, 10742240 - 10742308
Alignment:
Q  325 aaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| ||| |||| || ||||| ||||    
T  10742240 aaattcctagtgtagttgga-tgcaaggatcttcaagaaggcgaaaggcattccgatggttgaagaggtt 10742308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Original strand, 28242990 - 28243170
Alignment:
Q  41 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctct 140  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||   ||| ||| ||| ||||    
T  28242990 tgtacacatttggaagttgaggtagagaaagctcaactagaggtggagttagtgacaccgggaatggtacgactatggagg-tattgggtgttatgctct 28243088  T
Q  141 agtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 222  Q
    | | ||||||| | || |||| ||||| |||||||   ||| ||  | |||||||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  28243089 atttgtgagcatgtgaattctccatgaggacggaaagcattccgtggtttgaagaatgtttagcatggcttgtgggattacc 28243170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 121
Target Start/End: Original strand, 31658561 - 31658626
Alignment:
Q  56 gttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggagg 121  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  31658561 gttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggagg 31658626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 28222186 - 28222106
Alignment:
Q  41 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggagg 121  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |  ||||||| |||| ||  ||||||||||    
T  28222186 tgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtataactatggagg 28222106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20505052 - 20504507
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20505052 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagttagagtacactcagcgtgaggtggagtggaacacaccg 20504953  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  20504952 gtaatggtacggctatggaggaccttggatgttatgctcta-tggtgagcaagggatttgttcatgaagacggaaggcattacggaggttgaagaatgta 20504854  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||         |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20504853 tagcacggcttacgggattacccttaaaaaaatgccaagggggattggatgcaaggagacctttaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaggttat 20504754  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  20504753 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggaggaagacattctgatggctgaagaggttaaggtg 20504654  T
Q  401 tgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaa 500  Q
     | ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20504653 cgtacttgtggaacaacccaaaattccttgagtagtttagacacaagaatcttcaaatgggcggaaggcattccgatggttgaagaggttagggtgtaaa 20504554  T
Q  501 cttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 546  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||||    
T  20504553 cttgtggagctacttggcgtagtgcgaagcaagggagagagtagcaa 20504507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 546
Target Start/End: Original strand, 659112 - 659658
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    ||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  659112 cctgttgagatggagtttcaagattgaagacatagtgggatgtacgcattttctagtttaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactg 659211  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  659212 gtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctttgctcta-tgatgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcatttcggaggttgaagaatgta 659310  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  659311 tagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttat 659410  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||    
T  659411 ggtgaatgtttgtggaactacctaaaactcctagtgtagttggactacaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaagaggttaaggt 659510  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgta 498  Q
    |    |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  659511 gaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggttgaaggggttaaggtgta 659609  T
Q  499 aacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  659610 aacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaatggaaagagcagcaa 659658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Original strand, 27911526 - 27911935
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27911526 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttaaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 27911625  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  27911626 gtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgta 27911724  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27911725 tagcacggcttgcgggattaccct-aaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaactgggagatgtcctgtgttgaagatgttat 27911823  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27911824 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttagactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttaaggtg 27911923  T
Q  401 tgcacttgtgga 412  Q
    |  |||||||||    
T  27911924 tatacttgtgga 27911935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18510599 - 18510189
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18510599 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtactctcagtgtgaggtggagttgaacacaccg 18510500  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  18510499 gtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttaaagaatgta 18510401  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18510400 tagcacggcttgcgggattaccct-aaaaaaaggccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttat 18510302  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagggg-ttaaggt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  18510301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaatacctagcgtagttagactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaaggggtttaaggt 18510202  T
Q  400 gtgcacttgtgga 412  Q
    ||  |||||||||    
T  18510201 gtatacttgtgga 18510189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 65 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 31467031 - 31466558
Alignment:
Q  65 gagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttca 164  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31467031 gagtacgcttagcttgaggtggagttaaacacaccgataatggtacgactatggaggaccttggttgctatgctcta-tggtgagcaagagatttcttca 31466933  T
Q  165 tgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttc 264  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31466932 tgaagacggaagacatttcagaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccct--aaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttc 31466835  T
Q  265 aaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaa 363  Q
    |||  || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31466834 aagaaagtgggagatgtcctgtgttgaagatttcatggtgaatgcttgtggaactacataattctcctagtgtagttggactacaaggactcttcgagaa 31466735  T
Q  364 ggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggc 462  Q
    | |||||||| | |||| |||| ||| ||||||||||    |||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||  |||||| |||| | | |||    
T  31466734 gacggaagacgttccgatggctaaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctattgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggc 31466636  T
Q  463 ggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaaga 539  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31466635 ggaagacattctgatggctgaaggggttagggtgtaaatttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaaga 31466558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 485
Target Start/End: Original strand, 20044066 - 20044548
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||     | | ||||||| |||||||||||| || ||  |     
T  20044066 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagcgggatgtacacatttgctagttgagaggttggaagctcagcttgaggtggagttgaagac--ca 20044163  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20044164 gtaatgttgcgactatggaggaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaagagatttcttcatgaagacggaagacattccggaggttgaagaatgta 20044263  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20044264 tagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggtcaagggtgattggatgcaaggaaaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttat 20044362  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||| |||||| ||    
T  20044363 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaacttctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagacattttgatggctgaagaggttaaagt 20044462  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaag 485  Q
    |    |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  20044463 gaatgcttgtggaactacctaaaattcctggtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagtcattccgatggctgaag 20044548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 557
Target Start/End: Original strand, 6746466 - 6747005
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6746466 cctgttgaggtgaagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtatgctcaccgtgaggtggagttgaacacaccg 6746565  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||||    
T  6746566 gtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttca-------------------ggaggttgaagaatgta 6746645  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||| |||||||||||| |    
T  6746646 tagcacggcttgcgggattaccct-aaaagaagaccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaagaagcaggagatgtcctgcgttgaagatgttgt 6746744  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||| ||    
T  6746745 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaaatcctagcgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaagaggttaaagt 6746844  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--gggtg 496  Q
    |    |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||   ||||| |||| | | |||||||| ||||| || || ||||| ||| |   ||||    
T  6746845 gaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtag-ttggactgtaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctgaaggggttaagaggtg 6746943  T
Q  497 taaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  6746944 taaacttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcaacaaggaggttgatg 6747005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 143 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 41587051 - 41586783
Alignment:
Q  143 tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||        ||||||||||    
T  41587051 tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtacagcacggcttgtgggattactctaaaaaga-ggccaagggt 41586953  T
Q  243 gattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41586952 gattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttg 41586853  T
Q  343 gactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41586852 gactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttaaggtgtgtacttgtgga 41586783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 557
Target Start/End: Original strand, 18468117 - 18468656
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18468117 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagctgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 18468216  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||                   ||||||||||||||||    
T  18468217 gtaatggcacggctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaatggatttcttcat-------------------gaggttgaagaatgta 18468296  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||| ||||||||||        |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  18468297 tagcacggcttgcaggattaccct-aaaagaaggccaagggtgattagatgcaaggtgatcttcaaggaagcgagagatgttttgcattgaagatgttat 18468395  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | |||| |||||||| |||||| ||    
T  18468396 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagatgttccgatggctgaagaggttaaagt 18468495  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--gggtg 496  Q
    |    ||||||| |||||||||||  ||| | || | |||||| ||||||| |||  | | |||||||| |||||||| || ||||| ||| |   | ||    
T  18468496 gaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgttg-ttggactacaaggacctttgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttatgagctg 18468594  T
Q  497 taaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  18468595 taaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagtatggtggttgatg 18468656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 289 - 547
Target Start/End: Original strand, 20044448 - 20044706
Alignment:
Q  289 tgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaa 388  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  20044448 tgaagaggttaaagtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctggtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagtcattccgatggctgaa 20044547  T
Q  389 ggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 488  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  20044548 ggggttaaggtgtgtacttttggaactacctaaaaatacttgagtagtttgggcacaaggatcttcaaaagggcggaa-gcattccgttggttgaaaagg 20044646  T
Q  489 tcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaag 547  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20044647 ctagggtataaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaag 20044706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Original strand, 10756289 - 10756678
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10756289 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtatgctcagcgtgaggtggagttgaactcaccg 10756388  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||                   |||| |||||||     
T  10756389 gtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaa-------------------gttggagaatgtg 10756467  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||         ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||  || |||||||| | |||    
T  10756468 tagcacggcttgcgagattactctaaaagaat-gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgttatgcgttgaagacggtat 10756566  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||    
T  10756567 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagtggttgaggtg 10756666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 31544128 - 31544295
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31544128 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 31544227  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 169  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31544228 gtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 31544295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 234 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15355525 - 15355347
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15355525 gccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgctgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 15355426  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15355425 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 15355347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 234 - 412
Target Start/End: Original strand, 23666649 - 23666827
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23666649 gccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgctgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 23666748  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  23666749 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 23666827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 23666442 - 23666608
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23666442 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 23666541  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 169  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23666542 gtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 23666608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 34478303 - 34478137
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34478303 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 34478204  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 169  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34478203 gtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 34478137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 235 - 401
Target Start/End: Original strand, 31544341 - 31544507
Alignment:
Q  235 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctag 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31544341 ccaatggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacctaaaactcctag 31544440  T
Q  335 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||||    
T  31544441 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagtggttgaggtgt 31544507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15355733 - 15355566
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15355733 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 15355634  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaa-gggatttcttcatgaag 169  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15355633 gtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaaggggatttcttcatgaag 15355566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 234 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 34478092 - 34477913
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  34478092 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttatgcgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacctaaaactccta 34477993  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||  ||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  34477992 gtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagatattctgatagctgaagtggttgaggtgtatacttgtgga 34477913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 406 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 18510101 - 18509949
Alignment:
Q  406 ttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 504  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18510101 ttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggttaaggtgtaaacttg 18510003  T
Q  505 tggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18510002 tggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcatggtggttgatg 18509949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 405 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 41586698 - 41586557
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 503  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41586698 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcaagaaggcggaaggcattccgatggttgaagaggttagggtgtaaactt 41586600  T
Q  504 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagca 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41586599 gtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagca 41586557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 405 - 545
Target Start/End: Original strand, 27912022 - 27912165
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagg--gtgtaaact 502  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | ||||||||   ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||    
T  27912022 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtttgactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttaagaggtgtaaact 27912121  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagca 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27912122 tgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagca 27912165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 234 - 417
Target Start/End: Original strand, 31544530 - 31544714
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| |||| |||| ||||||||    
T  31544530 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaaccacctgaaattcct 31544629  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  31544630 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 31544714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 234 - 397
Target Start/End: Original strand, 27911947 - 27912110
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| || | ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  27911947 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggtagtgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattccta 27912046  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaag 397  Q
    | |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  27912047 gcgtagtttgactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttaag 27912110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 443 - 557
Target Start/End: Original strand, 31544644 - 31544759
Alignment:
Q  443 acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagc 541  Q
    ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||    
T  31544644 acaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagc 31544743  T
Q  542 agcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||| |||||||    
T  31544744 agcaaggtggttgatg 31544759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15355335 - 15355173
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatg-cttgtggaactacctaaaattcc 331  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  | | ||||| ||||||||| |||||||    
T  15355335 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtataagtcttgtagaactacctgaaattcc 15355236  T
Q  332 tagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    ||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  15355235 tagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 15355173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Original strand, 23666839 - 23667001
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatg-cttgtggaactacctaaaattcc 331  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  | | ||||| ||||||||| |||||||    
T  23666839 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtataagtcttgtagaactacctgaaattcc 23666938  T
Q  332 tagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    ||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  23666939 tagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 23667001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 41586770 - 41586590
Alignment:
Q  236 caagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagt 335  Q
    |||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||||     
T  41586770 caagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcctatgttgaagaagt-atggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagc 41586672  T
Q  336 gtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  41586671 gtagttggactacaagcatcttcaagaaggcggaaggcattccgatggttgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 41586590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Original strand, 10756690 - 10756852
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatg-cttgtggaactacctaaaattcc 331  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  | | ||||| ||||||||| |||||||    
T  10756690 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtataagtcttgtagaactacctgaaattcc 10756789  T
Q  332 tagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    ||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  10756790 tagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 10756852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 34477901 - 34477740
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| | ||||||| ||||||||    
T  34477901 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtaggactacctgaaattcct 34477802  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  34477801 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 34477740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Original strand, 10756767 - 10756921
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 502  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  10756767 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 10756865  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  10756866 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 10756921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 234 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 18510177 - 18509994
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    ||||||||||||||    |||| ||| |||||||| | || |||| ||||||||||||||| ||||||||  |   |||| ||||||||| |||||||||    
T  18510177 gccaagggtgattgagcacaagtagatcttcaaggaaacgggagaggtcctgtgttgaagaggttatggtatagtattgtagaactacctgaaattccta 18510078  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    | ||||||||||| |||| | |||| | | |||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  18510077 gcgtagttggactacaagcatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggttaaggtgtaaacttgtggagctac 18509994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 443 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 34477787 - 34477671
Alignment:
Q  443 acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagag 540  Q
    ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||    
T  34477787 acaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaacttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgag 34477688  T
Q  541 cagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||  |||||||    
T  34477687 cagcaaggaggttgatg 34477671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 15355258 - 15355104
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 502  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  15355258 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgatggtgtaaact 15355160  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  15355159 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 15355104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Original strand, 23666916 - 23667070
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 502  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  23666916 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgatggtgtaaact 23667014  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  23667015 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 23667070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Original strand, 13295047 - 13295204
Alignment:
Q  42 gtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctcta 141  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| | |  |||||   |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  13295047 gtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcagcttgaggtggagatgatgacaccaaaaatggtacgactatggag-accttgggtgctatgctcta 13295145  T
Q  142 gtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    || ||||||||||||  |||| | || |||| | || ||||||||| ||||| ||||||    
T  13295146 gttgtgagcaagggagctctttaagaggacgaacgacatttcggagtttgaaaaatgta 13295204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 25806524 - 25806587
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggta 64  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25806524 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggaagtacgcatttgctagttgaggta 25806587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 200
Target Start/End: Original strand, 13487430 - 13487588
Alignment:
Q  41 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctct 140  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| | | ||| | | |||||||||| |  ||||||  |||| ||  |||||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  13487430 tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctct 13487528  T
Q  141 agtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    ||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||||||||    
T  13487529 agttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgta 13487588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 3 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 21519541 - 21518998
Alignment:
Q  3 tgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggt 102  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21519541 tgttgaggtgaagcttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggt 21519442  T
Q  103 aatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtaca 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || |    
T  21519441 aatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatatata 21519343  T
Q  203 gcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatgg 302  Q
    |||||||||||||||||| | |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21519342 gcacggcttgcgggattatc-ttaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatgg 21519244  T
Q  303 tgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| | |||| |||| ||| ||||||||||     
T  21519243 tgaatgcttgtggaactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacagaagacgttccgatggctaaagaggttaaggtga 21519144  T
Q  402 gcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaa 500  Q
       |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | ||||||||  |||||||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  21519143 atgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaaggggttaaggtgtaaa 21519045  T
Q  501 cttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 546  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21519044 attgtgcagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaa 21518998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6263339 - 6263002
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6263339 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccg 6263240  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||    
T  6263239 gtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta--ggtgagcaagggatttcttcatgaagacagaagacattctggaggttgaagaatgta 6263142  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6263141 tagcacggcttgcgggattaccct-aaaaaaaggccaagtgtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatatcctgtgttgaagatgttat 6263043  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6263042 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaactcctagcgtagtt 6263002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 31734064 - 31733658
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  31734064 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacactcagcttgaggtggagttgaacacatcg 31733965  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31733964 gtaatggtacgactatggaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagtgatttcttcatgaagacgaaagacattccggaggttgaagaatgta 31733866  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||| |||||  |||||||||         ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31733865 tagcacgacttgctagattaccctaaaaa----gccaaaggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttaaagattttat 31733770  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||  |||||| ||    
T  31733769 ggtggatacttgtggaactacctcaaatttctagcgtagttggactgcaaggacctttgagaaggaggaagacattccgatggctaaagaagttaagatg 31733670  T
Q  401 tgcacttgtgga 412  Q
    || | |||||||    
T  31733669 tgtatttgtgga 31733658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 257 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 6259698 - 6259413
Alignment:
Q  257 agaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggacct 356  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||| ||    
T  6259698 agaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaagt-atggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagtgtagtttggatacaaggatct 6259600  T
Q  357 tcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaa 456  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6259599 tcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagaggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaattccttgagtagtttggacacaaggatcttcaa 6259500  T
Q  457 aagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagca 542  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6259499 aagggcagaaggcattccgatggttgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctacatggtatagtgggaagcaagggaaagagca 6259413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 36560028 - 36559639
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36560028 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 36559929  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||                   ||| |||||||     
T  36559928 gtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag-------------------ttggagaatgtg 36559850  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||        | |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||| ||| |||||||| | |||    
T  36559849 tagcacggcttgcgagattactctaaaagaatg-ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgttctgcgttgaagacggtat 36559751  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  36559750 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaaggggttgaggtg 36559651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 19503220 - 19502830
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19503220 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgcacgcatttgctagctgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaatacaccg 19503121  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||                   ||||||||||||    
T  19503120 gtaatggtacggctattaaggaccttgggtgctatgcgcta-tggtgaccaagggatttcttcatgaag-------------------ttgaagaatgta 19503041  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||        | |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19503040 tagcacggcttgcgagattactctaaaagaatg-ccaagggtgattggatgcaagatgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttat 19502942  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19502941 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaagaaccttcaagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtg 19502842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 35216854 - 35216687
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35216854 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 35216755  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 169  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35216754 gtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 35216687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 234 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 35216642 - 35216464
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  35216642 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaatgaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctgaaactccta 35216543  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  35216542 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 35216464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Original strand, 22404969 - 22405129
Alignment:
Q  64 agagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttc 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22404969 agagtacgctcagcttgaggtggaattgaacacaccggtaatggtatggctatggaggaccttgagtgttatgctctagtggtgagcaagggatttcttc 22405068  T
Q  164 atgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccct 224  Q
    ||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22405069 atgaagacgaaaggcattccggaggttgaagaatgtataacacggcttgcgggattaccct 22405129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 285 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 22405257 - 22405135
Alignment:
Q  285 gtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  22405257 gtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggacttcaaggatcttcgagaaggcggaagccattccgatggc 22405158  T
Q  385 tgaaggggttaaggtgtgcactt 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  22405157 tgaagaggttaaggtgtgcactt 22405135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 234 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 31733646 - 31733336
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||||||||||||   |||  ||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||||| |  |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  31733646 gccaagggtgattgggcacaaatagatcttcaaggaagcgggagatgttctgtattgaagaggttatgatatagtcttgtagaactacctgaaattccta 31733547  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagt 433  Q
    |||||||| |  | |||||  |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||| || ||||| || | | |  |    
T  31733546 gtgtagtttggatacaaggttcttcgagaaggcagaagacattccgatggctaaagaggttaaggtgtgtacttgtggagcttcctaacattcttagctt 31733447  T
Q  434 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caag 532  Q
    || | |||  |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| | |   ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  31733446 ag-tgggaagcaagaatcttcaaga-ggcggaaagcattccgatggtagaagagct-aacatgtaaacttgtggagctacatggtgtagtggaaagcaag 31733350  T
Q  533 ggaaagagcagcaa 546  Q
    ||||||||||||||    
T  31733349 ggaaagagcagcaa 31733336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 443 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 19502704 - 19502589
Alignment:
Q  443 acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagc 541  Q
    ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19502704 acaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagc 19502605  T
Q  542 agcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||  |||||||    
T  19502604 agcaaggaggttgatg 19502589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36559627 - 36559466
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  36559627 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 36559528  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  36559527 agtgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 36559466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 237 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13829105 - 13828967
Alignment:
Q  237 aagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtg-ttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagt 335  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||  ||||||| | ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||    
T  13829105 aagggtgattggatacaagaagatcttcaaggaagcaggagatgttccgtggttgaagaggttatggtgtatacttgtggaactaactaaaatttctagt 13829006  T
Q  336 gtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacat 375  Q
    ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  13829005 gtagttgga-tgcaagaatcttcaagaaggcggaagacat 13828967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 19502818 - 19502634
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| || |||||| ||| ||||    
T  19502818 gccaagggtgattgggtataagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagagctacctgaaactcct 19502719  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  19502718 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 19502634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 337 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 6259808 - 6259733
Alignment:
Q  337 tagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6259808 tagttggactgcaaggaccttcgagaaggtggaagatattccgagggctgaaggggttaaggtgcgtacttgtgga 6259733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 35216452 - 35216296
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  35216452 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 35216353  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 389  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  35216352 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaag 35216296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 36559551 - 36559397
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 502  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  36559551 cttgtagaactacctgaaattcctagtgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 36559453  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  36559452 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 36559397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 385 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 13829052 - 13828878
Alignment:
Q  385 tgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaa 484  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||  || | |||||| |||  |||| |||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13829052 tgaagaggttatggtgtatacttgtggaactaactaaaatttctagtgtagtt-ggatgcaagaatcttcaagaaggcggaagacattctgatggttgaa 13828954  T
Q  485 gaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtt 560  Q
     ||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||    
T  13828953 aaggtt-gggtggaaactcatggagctacttggtgtagttggaagcaagggaaagaacatcatggtggttgatggtt 13828878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 35216376 - 35216222
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 502  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  35216376 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagaagttgagggtgtaaact 35216278  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  35216277 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 35216222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 22402402 - 22402470
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagta 69  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22402402 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtggaatgtacgcattttctagttgaggtagagta 22402470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28569234 - 28569073
Alignment:
Q  41 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaat---gatacgactatggaggaccttgagtgctattc 137  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |  ||||| | |||   | ||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  28569234 tgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcagcttaaggtggagttgatgacacctggaatattggtacgactatggag-acctagggtgctattc 28569136  T
Q  138 tctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| || || |||||  ||| ||| | ||||||||||||    
T  28569135 tctagttgtgagcaaggtaattcttcaagaggatggaaggcattccggggtttgaagaatgta 28569073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14634762 - 14634627
Alignment:
Q  41 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctct 140  Q
    |||||||| |||  ||||| ||||||| |  |||| | |||||||||||||   ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  14634762 tgtacgcaattggaagttggggtagagaaatctcaacttgaggtggagttagtgacaccggaaatggtacgactatggagggccttgggtgttatgctct 14634663  T
Q  141 agtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaag 176  Q
    ||| ||||||| | || ||||||| || ||||||||    
T  14634662 agttgtgagcatgagaattcttcaagaggacggaag 14634627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 28568914 - 28568842
Alignment:
Q  450 tcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagt 523  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28568914 tcttcaagaaggcggaaggcattccagtggttgaagaggtt-gggtggaagcttgtggagctacttggtgtagt 28568842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 383
Target Start/End: Original strand, 16677131 - 16677224
Alignment:
Q  289 tgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgaggg 383  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  16677131 tgaaaatgttacggtgaaagcttgtgaaactacctcaaaatctgagtgtagttgga-tgcaaggatcttcaagaggacggaagacattccgaggg 16677224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 42018401 - 42018293
Alignment:
Q  404 acttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg-tcagggtgtaaact 502  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || ||    
T  42018401 acttgtggaaatacctaaaat-cctagtgtagtt-ggatgcaaggatcttcaagaggatggaagacattccgagggttgaagaggctaagggtggaacct 42018304  T
Q  503 tgtggagctac 513  Q
    |||||||||||    
T  42018303 tgtggagctac 42018293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 405 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 22405233 - 22405149
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggaca-caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggt 489  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||  ||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22405233 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagtt-ggacttcaaggatcttcgagaaggcggaagccattccgatggctgaagaggt 22405149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 42018400 - 42018313
Alignment:
Q  309 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaagg 398  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |  ||||||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  42018400 cttgtggaaatacctaaaat-cctagtgtagttgga-tgcaaggatcttcaagaggatggaagacattccgagggttgaagaggctaagg 42018313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 41303802 - 41303707
Alignment:
Q  444 caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca-gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaa 537  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||| || ||| || ||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41303802 caaggatctttaagagggcgaaaggcattctgagggtcgaggaggcaaagggtggaagcttgtggagctacttggtgtagttggaagcaagggaaa 41303707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7858425 - 7858371
Alignment:
Q  289 tgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgg 343  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  7858425 tgaagatgttatgatgaaaacttgtggaactaactaaaatgactagtgtagttgg 7858371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 41304082 - 41303933
Alignment:
Q  50 ttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgag 149  Q
    ||||||||||||||||||   ||  ||| ||||||||| || |  ||| ||| |||| ||| ||||||||| | |||| ||||||  ||||||| |||||    
T  41304082 ttgctagttgaggtagagatagcatagcttgaggtggaattgatgacatcgggaatggtacaactatggag-atcttgggtgctaggctctagttgtgag 41303984  T
Q  150 caagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    ||||||| ||||||| || |||  |||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  41303983 caagggaattcttcaagaggacaaaagaaattccggggtttgaataatgta 41303933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 28568961 - 28568918
Alignment:
Q  309 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagga 353  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28568961 cttgtagaactacgtaaaattcctagtgtagttgga-tgcaagga 28568918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 18098017 - 18097461
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  18098017 cctgttgaggtggagtttgaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttgaggtagagtacgctcagcatgaggtggaatttaacacaccg 18097918  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  18097917 gtaatggtacgactatggaggaccttgggtgccatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgta 18097819  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18097818 tagcacggcttgcgggattaccct-aaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggcgatcttcaagggagcgggagatgtcctgtgttgaagatattat 18097720  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||    
T  18097719 ggtgaatgcttgtggaactacataaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaagaggttaaggt 18097620  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgta 498  Q
    |    |||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||  |||||| |||| | | || ||||| ||||||||||| ||||| |||   ||||||    
T  18097619 gaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcctag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggtggaagacattccgatggctgaaggggtggaggtgta 18097521  T
Q  499 aacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18097520 aacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggtggttgatg 18097461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 28101193 - 28100632
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28101193 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatggtgggatgtacgcattttctagttaaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccg 28101094  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28101093 gtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgttatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcatttcggaggttgaagaatgta 28100995  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  28100994 tagcacgacttgcgggattaccct-aaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagactttcaaggaagtggaagatgtcctatgttgaagaggttat 28100896  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || | || | |||||||| |||||||||    
T  28100895 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaacacctagtgtcgttggactgtaaggactcttcgagaagacggaaaacgttccaatggctgaagaggttaaggt 28100796  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgta 498  Q
    |    |||||||||||||||||||| | | | ||||  |||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  28100795 gaatgcttgtggaactacctaaaattcatagtgtag-atggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaaggggttaaggtgta 28100697  T
Q  499 aacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28100696 aacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaaggcaaagagcagcatggtggttgatggtttg 28100632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 28138426 - 28137863
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28138426 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccg 28138327  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  28138326 gtaatggtacgactatggatgaccttgggtgctatgctcta-tggcgagcaagggatttcttcatgaagacgaaaggcattccggaggttgaagaatgta 28138228  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||| |  ||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  28138227 tagcgcaacttgcgggattaccct-aaaaaaaggccaagggtgattggaagcaaggagactttcaaggaagcggaagatgtcatgtgttgaagaggttat 28138129  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagga-ccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||    
T  28138128 ggtgaatgcttgtgaaactacctaaaacacctaatgtagttggactgcaaggattcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaagaggttaaggt 28138029  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgta 498  Q
    |    ||||||||||||||||||||  || | |||| ||||||  |||||| |||  | | || ||||| ||||||||||| ||||| | | | ||||||    
T  28138028 gaatgcttgtggaactacctaaaatttctagtgtag-ttggactgcaaggacctttgagaaggaggaagacattccgatggctgaagggattaaggtgta 28137930  T
Q  499 aacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttggc 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28137929 aacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcatggtggttgatggtttggc 28137863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 389
Target Start/End: Original strand, 3315755 - 3316141
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  3315755 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgagctggagtttaaaacaccg 3315854  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  3315855 gtaatggtatgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagacattccggaggttgaagaatata 3315953  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||| ||||||||||||||||        || |||||||||||| ||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||    
T  3315954 tagcacgacttgcgggattaccct-aaaaaaaggtcaagggtgattgaatgcaagaagaccttcaaggaagtgggagatgtcctatgttgaagatgttat 3316052  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3316053 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcttagcgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaag 3316141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 53916859 - 53916450
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  53916859 cctgttgaggtggagtttcaaggtggaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgagttagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcg 53916760  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  53916759 gtaatggtacggctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagatggaagacattccggaggttgaagaatgta 53916661  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||| |||||||||||| |||        |||||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  53916660 tagcacgacttgcgggattatcct-aaaaaaaggccaacggtgattggatgcaaggtaatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaggttat 53916562  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  53916561 ggttaatgcttgtggaactacctaaaatacctagcgtagttagactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctgaaggggttaaggtg 53916462  T
Q  401 tgcacttgtgga 412  Q
    |  |||||||||    
T  53916461 tatacttgtgga 53916450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 891092 - 890681
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||   |||||||| ||||| || ||||| |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  891092 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacataatgggatgtacacattttctcgttgatgtagagcactctcagcttgaggtggagttgaacacaccg 890993  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  890992 gtaatggtacgactatggagtaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagacattccggaggttgaagaatgta 890893  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||| |||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  890892 tagcacagcttgcgggattaccct-aaaaaaaggccaagagtgattggatgcaagaagaccttcaagaaaacgggagatatcctgtgttaaagatgttat 890794  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaa-ggggttaaggt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  890793 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtagtctgactgcaaggatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagggggttaaggt 890694  T
Q  400 gtgcacttgtgga 412  Q
    ||  |||||||||    
T  890693 gtttacttgtgga 890681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 557
Target Start/End: Original strand, 43227454 - 43227993
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  43227454 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagttggatgtatgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtagagttgaacacaccg 43227553  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||    
T  43227554 gtaatggtacgactatgaaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga-------------------ggttgaagaatgta 43227633  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43227634 tagcacggcttgcgggattaccctaaaagaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttat 43227732  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||| ||| |||||||||    
T  43227733 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctaaagaggttaaggt 43227832  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--gggtg 496  Q
    |    |||||||||||| ||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| |||||||| || ||||| |||||   ||||    
T  43227833 gaatgcttgtggaactaactaaaattcctagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggtcatgaggtg 43227931  T
Q  497 taaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43227932 taaacttgtggagatacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggtggttgatg 43227993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 43422655 - 43422247
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||      
T  43422655 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgtatttgctaattgaggtagagtacgctcaacttgaggtggagttgaacacacta 43422556  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  43422555 gtaatggtaagactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagaaagggattt-ttcattaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgta 43422458  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43422457 tagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaatg-ccaagggtgattggatgctaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttat 43422359  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  43422358 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaatttctagcgtagttggactgcaaggacattcgagaaggcggaagacattctgagagctgaaggggttaaggtg 43422259  T
Q  401 tgcacttgtgga 412  Q
    |  |||||||||    
T  43422258 tatacttgtgga 43422247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 557
Target Start/End: Original strand, 42991376 - 42991911
Alignment:
Q  5 ttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaa 104  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42991376 ttgaggtggagtttcaaggttaaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaa 42991475  T
Q  105 tgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagc 204  Q
    || ||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |                   |||||||||||||| |||    
T  42991476 tggtacaactatgaaggaccttaggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcataa-------------------ggttgaagaatgtatagc 42991555  T
Q  205 acggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtg 304  Q
    ||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  42991556 acggcttgcgggattactctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatacaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcatgcgttgaagatgttatggta 42991654  T
Q  305 aatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgc 403  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||       
T  42991655 aatgcttgtgggagtacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaagaggttaaggtgaat 42991754  T
Q  404 acttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--gggtgtaaa 500  Q
     | |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||||| |||| | | |||||||| |||| ||| || ||||| ||| |   ||||||||    
T  42991755 gcatgtggaactacctaaaattcctagtgtag-ttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacatttcgagggctgaaggggttaagaggtgtaaa 42991853  T
Q  501 cttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  42991854 cttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcatggtggttgatg 42991911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 4309391 - 4308867
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4309391 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccg 4309292  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||    
T  4309291 gtaatggtacaactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat-------------------gaggttgaagaatgta 4309212  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  4309211 tagcacggcttgcgggattactc------gaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgggagatgttctgcattgaagatgttat 4309118  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||    
T  4309117 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaagaggttaaggt 4309018  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--gggtg 496  Q
    |    ||||||| | |||||||||  ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||| || || ||||| ||| |   ||||    
T  4309017 gaatgcttgtgggattacctaaaactcctagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctgaaggggttatgaggtg 4308919  T
Q  497 taaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaag 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4308918 taaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaag 4308867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 235 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 890668 - 890342
Alignment:
Q  235 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctag 334  Q
    ||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||  |  ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  890668 ccaagggtgattggccacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcatgtgttgaagaagt-atggtatagtcttgtagaactacctgaaataactag 890570  T
Q  335 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagta 434  Q
     ||||||||| | |||| | ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  890569 cgtagttggattacaagaatctttgagaagggggaaggcattccgatggctgaagaggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaattccttgagta 890470  T
Q  435 gtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagg 533  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  890469 gtctggactcaaggatcttc-aaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagg 890371  T
Q  534 gaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 562  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  890370 gaaagagcagcaaggtggttgatggtttg 890342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Original strand, 5898786 - 5899178
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5898786 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacactcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 5898885  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||     
T  5898886 gtaatggtacgactatgaaggaccttgtgtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcat-------------------gaggttgaagaatgtt 5898965  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggaga-ccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgtta 299  Q
     ||||||||||| | ||||| |||         ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||   |||||||||| | |||||||||||    
T  5898966 tagcacggcttgtgagattatcctaaaagaat-gccaagggtgattggatgcaaggtgattcttcaaggaggcagaagatgtcctgcgctgaagatgtta 5899064  T
Q  300 tggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaa-ggggttaagg 398  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  5899065 tggtgaatgcttgtgggactacctaaaattcctagcgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaagggggttaagg 5899164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 6064678 - 6064287
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  6064678 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactg 6064579  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||                   ||||||| |||||||     
T  6064578 gtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tgatgagcaagggatttcttcat-------------------gaggttggagaatgtg 6064499  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||         ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  6064498 tagcacggcttgcgagattactctaaaagaat-gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttat 6064400  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  6064399 ggtgaaagcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagacattccgatgactgaaggggttgaggt 6064300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Original strand, 11169475 - 11169865
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11169475 cctgttgcggtggagtttcaaggttgaagacatggtgggatgtacgcattttctagttgaggtagagtacactcaacgtgaggtggagttgaacacaccg 11169574  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||    
T  11169575 gtaatggtacggctatgaaggagcttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag-------------------ttgaagaatgta 11169654  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||        | |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  11169655 tagcacggcttgcgagattactctaaaagaatg-ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttttgtgttgaagatgttat 11169753  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||    
T  11169754 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctaaaggggttgaagtg 11169853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 234 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 53916438 - 53916124
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||  |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  53916438 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcaggagatgtcctgtgttgaagaagt-atggtatagtcttgtagaactacctgaaattccta 53916340  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagt 433  Q
    | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53916339 gcgtagttggactataaggatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctga---------ggtgtgcacttgtggaactaccttaaatgccttgagt 53916249  T
Q  434 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caag 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  53916248 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcgaaaggcattccgatggttgaagaggttagggtgtaaacttgtgaagctacttggtatagtgggaagcaag 53916149  T
Q  533 ggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||    
T  53916148 ggaaagagcagcatggtggttgatg 53916124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 35918939 - 35918535
Alignment:
Q  146 tgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||        |||||||||||||    
T  35918939 tgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattactctaaaagaa-ggccaagggtgat 35918841  T
Q  246 tggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggac 345  Q
    ||||||||||| || |||||||| || | |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35918840 tggatgcaaggtgatcttcaaggaagtgggagatgtcctgcattgaagatgttatggtgaatgcgtgtgggactacctaaaacttctagtgtagttggac 35918741  T
Q  346 tgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-a 443  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | | || || ||||| ||||||||||    ||||||| |||||||||||  ||| | |||| ||||||      
T  35918740 tgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttctgatggttgaagaggttaaggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtag-ttggactg 35918642  T
Q  444 caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagag 540  Q
    ||||||  ||| | | |||||||| |||||||| || ||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  35918641 caaggactttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaatgggttaagaggtgtaaacttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagag 35918542  T
Q  541 cagcaag 547  Q
    |||||||    
T  35918541 cagcaag 35918535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 269 - 546
Target Start/End: Original strand, 23636400 - 23636675
Alignment:
Q  269 cagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcgg 368  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    | |||||| ||||||||||||||    
T  23636400 cagcgggaggtgtcctgtgttgaagaggttatggtgaatgctagtggaactacctgaaattcctagcgtagtttcgatacaaggatcttcgagaaggcgg 23636499  T
Q  369 aagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaagg 468  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||| | |||  |||| |||||||||| |||||||||    
T  23636500 aagacattccgatggctgaagaggttaaagtgtgtacttgtggagctacctaaaattcctagcgtag-tgggaagcaagaatcttcaaaa-ggcggaagg 23636597  T
Q  469 cattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 546  Q
      |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23636598 ttttccaatggttgaagaggt-aaggtgtaaacttgtggatctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaa 23636675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 188 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 10957066 - 10956843
Alignment:
Q  188 gttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtg 287  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| |    
T  10957066 gttgaagaatgtatagcacggcttacgggattactctaaaagaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcg 10956968  T
Q  288 ttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctga 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  10956967 ttgaagatgttgtggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttagactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctga 10956868  T
Q  388 aggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||    
T  10956867 aggggttgaggtgtatacttgtgga 10956843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 234 - 412
Target Start/End: Original strand, 457492 - 457670
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  457492 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagtaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacctaaaactccta 457591  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | || ||||||  |||||||||    
T  457592 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagtgtttgaggtgtatacttgtgga 457670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 457281 - 457447
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  457281 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcatttgccagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 457380  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 169  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  457381 gtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 457447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 23634836 - 23635059
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||| | ||||| || |||||||||||||   | ||||| ||||| |||||||||     | | ||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  23634836 cctgttgagggggagttttaaggttgaagacatagtgaggtgtacacattttctagttgagaggttggaagctcagcttgaggtggagttgaacacacca 23634935  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  23634936 gtaatggtacggctatggaggaccttcggtgttatgctctactggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccgaaggttgaagaatgta 23635035  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccct 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  23635036 tagcacggcttgcgggattaccct 23635059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 405 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 43422161 - 43422005
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 504  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||||||||||||||| | | |||||||| ||||| ||||| ||||||||| || ||||||| |||    
T  43422161 cttgtagaactacctgaaattcctagtgtagtt-ggacacaaggatcttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagaggttagagtgtaaatttg 43422063  T
Q  505 tggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 562  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43422062 tggaactacttggtgtagtgggaataagggaaagagcagcaaggtggttgatggtttg 43422005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 405 - 564
Target Start/End: Original strand, 3306326 - 3306486
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 503  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  3306326 cttgtagaactacctgaaattcctagagtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatgactgaagaggttagggtgtaaactt 3306424  T
Q  504 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttggc 564  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3306425 gtggagcaactaggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggtggttgatggtttggc 3306486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 234 - 412
Target Start/End: Original strand, 3306251 - 3306429
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  3306251 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattccta 3306350  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
    | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  3306351 gagtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatgactgaagaggttagggtgtaaacttgtgga 3306429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10957204 - 10957090
Alignment:
Q  4 gttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggta 103  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||    
T  10957204 gttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcattttctagttgaggtagagtacactcagcgtgaggtgaaaatgaacacaccggta 10957105  T
Q  104 atgatacgactatgg 118  Q
    ||| |||||||||||    
T  10957104 atggtacgactatgg 10957090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 234 - 417
Target Start/End: Original strand, 11169877 - 11170061
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  11169877 gccaagggtgattggctacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctggtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 11169976  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||  ||||||||| ||||    
T  11169977 agcgtagttggactacaagcatcttcatgaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgaggtgtaaacttgtggagctac 11170061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Original strand, 11169953 - 11170106
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 503  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  11169953 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcatgaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgaggtgtaaactt 11170051  T
Q  504 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11170052 gtggagctacttagagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggaggttgatg 11170106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6064275 - 6064114
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||  ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  6064275 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcaggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 6064176  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  6064175 agtgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagaggtt 6064114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 443 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 10956717 - 10956602
Alignment:
Q  443 acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagc 541  Q
    ||||| |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10956717 acaagcatcttcgagaaggcggaagacattccaatggctgaagaggctagggtgtaaacttgtggagctacatggtgtagtgggaagcaatggaaagagc 10956618  T
Q  542 agcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||  |||||||    
T  10956617 agcaaggaggttgatg 10956602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 235 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 10956830 - 10956647
Alignment:
Q  235 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| |||||| ||    
T  10956830 ccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcgta 10956731  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||| || || |||||  ||||||||| ||||    
T  10956730 gcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccaatggctgaagaggctagggtgtaaacttgtggagctac 10956647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 156
Target Start/End: Original strand, 25634907 - 25635058
Alignment:
Q  5 ttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaa 104  Q
    |||| ||| ||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    || | | ||||  |||||||||||| |||||| ||| ||    
T  25634907 ttgacgtggagtttcaaggtggaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagaggtagaaagttcagtttgaggtggagttgaacacagcggaaa 25635006  T
Q  105 tgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaaggga 156  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||    
T  25635007 tggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctagtgggaagcaaggga 25635058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 468 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 1619337 - 1619244
Alignment:
Q  468 gcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa-ggtagttgatggtt 560  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  1619337 gcattccgatggttgaagaggt-agggtgaaaacttgtggagctacatggtgtagtgggaagcaagggaaagagcaacaatggtggttgatggtt 1619244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 443 - 548
Target Start/End: Original strand, 5899303 - 5899409
Alignment:
Q  443 acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagc 541  Q
    ||||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  5899303 acaagcatcttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagttacttggagtagtgggaagcaagggaaatagc 5899402  T
Q  542 agcaagg 548  Q
    |||||||    
T  5899403 agcaagg 5899409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Original strand, 457682 - 457843
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  457682 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 457781  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  457782 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatcgctgaagaggtt 457843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 7607157 - 7607002
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagg--gtgtaaac 501  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| |||||||||||| | | |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |  || |||||    
T  7607157 cttgtagaactacctgaaattcctggcgtagtt-ggactacaaggatcttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagaggttaagaggtataaac 7607059  T
Q  502 ttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7607058 ttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggaggttgatg 7607002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 270 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 7607196 - 7607069
Alignment:
Q  270 agcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcgga 369  Q
    |||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7607196 agcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctggcgtagttggactacaaggatcttcgagaaggcgga 7607097  T
Q  370 agacataccgagggctgaaggggttaag 397  Q
    |||||| | || |||||||| |||||||    
T  7607096 agacattctgatggctgaagaggttaag 7607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 234 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 43422235 - 43422054
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||  || | ||| ||||||||||| || |||||  |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  43422235 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcaggacaagtcatgtgttgaagaagt-atggtacagtcttgtagaactacctgaaattccta 43422137  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||  ||||  | ||||||||||||    
T  43422136 gtgtagttggaca-caaggatcttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagaggttagagtgtaaatttgtggaactac 43422054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 234 - 412
Target Start/End: Original strand, 5899190 - 5899368
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| ||||| ||  |  ||||||| | ||||||  |  ||||| |||||| || |||||||||    
T  5899190 gccaagggtgattgggaacaagtagatcttcaaggaagcgggagatatctcgaattgaagagggtatggtatagtcttgtagaactatctgaaattccta 5899289  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
    |  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  5899290 gcatagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtgga 5899368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 405 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 6064199 - 6064054
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 502  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | ||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  6064199 cttgtagaactacctgaaattcctagtgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 6064101  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaagg 548  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  6064100 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaagg 6064054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Original strand, 457758 - 457912
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 502  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||| | |||||||||  || |||||||||    
T  457758 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatcgctgaagaggttgagagtgtaaact 457856  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  457857 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 457912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 290 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 43402940 - 43402814
Alignment:
Q  290 gaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 389  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||| |||   ||||  | |||    
T  43402940 gaagaggttatggtgtaggcttgtggaactacctaaaaatcctagtgtagttgga-tgcaaggaacttcaagagagcggaaggcattatgaggtttcaag 43402842  T
Q  390 gggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
     ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  43402841 aggtaaaggtgtaaacttgtggaactac 43402814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1619603 - 1619491
Alignment:
Q  108 tacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacg 207  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||   | | |||| ||||||| |||| |    
T  1619603 tacgactatggag-accttgggtgctatgctctagtggtgaccaagggaattcttcatgaagacagaaggcattctagtgtttgaggaatgtatagcatg 1619505  T
Q  208 gcttgcgggattac 221  Q
    ||||| ||||||||    
T  1619504 gcttgtgggattac 1619491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Original strand, 29812275 - 29812409
Alignment:
Q  41 tgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctct 140  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| | | |||||||||| |  ||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  29812275 tgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaactatggatg-ccttgagtgctatgctct 29812373  T
Q  141 agtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaag 176  Q
    ||| ||||||  | || ||||||||||  |||||||    
T  29812374 agttgtgagcttgtgaattcttcatgagaacggaag 29812409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 460 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 14634858 - 14634796
Alignment:
Q  460 ggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtag 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||    
T  14634858 ggcggaaggcattccgatggttgaagaggttgggtggaaaacttgtagagctacttggtgtag 14634796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 2075734 - 2075654
Alignment:
Q  444 caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca-gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagt 523  Q
    |||||||||| || ||| |||||| ||||| || |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2075734 caaggatctttaagaggacggaagacattctgaaggttgaagaggcaaagggtggaaacttgtggagctacttggtgtagt 2075654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 353
Target Start/End: Original strand, 27422343 - 27422386
Alignment:
Q  309 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagga 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27422343 cttgtggaactacctaaaattccaagtgtagttgga-tgcaagga 27422386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 43402921 - 43402814
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 504  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||| |||  |||||| |||||| || ||||||||||||  || | || ||||||| | ||||||||||||    
T  43402921 cttgtggaactacctaaaaatcctagtgtagtt-ggatgcaaggaacttcaagagagcggaaggcattatgaggtttcaagaggtaaaggtgtaaacttg 43402823  T
Q  505 tggagctac 513  Q
    |||| ||||    
T  43402822 tggaactac 43402814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 15824432 - 15824279
Alignment:
Q  235 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtg-ttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||| || | ||| ||||||| | | || ||    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  15824432 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagagggtttgatgttgacttgtgaaactacctaaaat-ccta 15824334  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 389  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||||| |||  |||||| |||||    
T  15824333 gtgtagttgga-tgcaaggatctttaagatggcggaagccatttcgagggttgaag 15824279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 343
Target Start/End: Original strand, 4041708 - 4041742
Alignment:
Q  309 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgg 343  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4041708 cttgtggaactacctaaaatgcctagtgtagttgg 4041742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 405 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 890785 - 890705
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaag 485  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||    ||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  890785 cttgtggaactacctaaaattcctagcgtagtctgactgcaaggatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaag 890705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 309 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1619401 - 1619358
Alignment:
Q  309 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagga 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1619401 cttgtcgaactacctaaaattcctagtatagttgga-tgcaagga 1619358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 15533822 - 15533279
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||| ||||  ||||| || |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15533822 cctgttaaggtagagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacattttctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccg 15533723  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||    
T  15533722 gtaatggtacgactatggaggaccttgagtgttatgctctagtggtgagcacgggatttcttcatgaagacggaaggcattccaaaggttgaagaatgta 15533623  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtga-ttggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgtta 299  Q
     |||||  ||||||||||||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  15533622 tagcacaacttgcgggattaccct-aaaaaaaggccaagggtgatttggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcttgtgttgaagatgtca 15533524  T
Q  300 tggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaagg 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||     
T  15533523 tggtgaatgcttgtggaactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagacgttccgagggctgaagaggttaagt 15533424  T
Q  399 tgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgt 497  Q
    ||    | |||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||  ||||||    
T  15533423 tgaatgcctgtggaactacctaaaattccaagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaaggggttcgggtgt 15533325  T
Q  498 aaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagca 542  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15533324 aaatttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagca 15533279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Original strand, 3395406 - 3395815
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3395406 cctgttgaggtggagtttcaaggttgtagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagctagagtaccctcagcttgaggtggagttgaacacaccg 3395505  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||    
T  3395506 gtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggttagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaattta 3395604  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     | |||| ||| | ||||||||||        || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3395605 tatcacgtctttctggattaccctaaaaaaa-ggtcaagggtgattggatgcaagaagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttat 3395703  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3395704 ggtgaatgtttgtggaactacctaaaattcctattgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttaaggtg 3395803  T
Q  401 tgcacttgtgga 412  Q
    |  |||||||||    
T  3395804 tatacttgtgga 3395815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Original strand, 33310284 - 33310673
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33310284 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 33310383  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| || |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||                   ||| |||||||     
T  33310384 gtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctaggctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag-------------------ttggagaatgtg 33310462  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||        | |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||| |||    
T  33310463 tagcacggcttgcgagattactctaaaagaatg-ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatggtat 33310561  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  33310562 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaaggggttgaggtg 33310661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 26067279 - 26066892
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26067279 cctgttgaggtgaagtttcaaggttgaagacagtg--ggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 26067182  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||                   ||| |||||||     
T  26067181 gtaatggtacgactatgaag-accttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag-------------------ttggagaatgtg 26067103  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||| |||||||||||||| ||        | ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| ||| |||||||| | |||    
T  26067102 tagcacagcttgcgggattactctaaaagaatg-ccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagacggtat 26067004  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  26067003 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaagacggaagacattccgatggctgaaggggttgaggtg 26066904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3631128 - 3630906
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| | ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  3631128 cctgttgaggtggactttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacttgaggtggagttgaacacaccg 3631029  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3631028 gtaatggtatgactttggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagacattccggaggttgaagaatgta 3630930  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccct 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  3630929 tagcacggcttgcgggattaccct 3630906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 233 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3630879 - 3630711
Alignment:
Q  233 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630879 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggatatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 3630780  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgt 401  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3630779 agcgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacatttcgagggctgaaggggttaaggtgt 3630711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 30729616 - 30729440
Alignment:
Q  236 caagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagt 335  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30729616 caagggtgattggatgcaaggtaatcttcaaggaagcgggagacgtcctgtgttaaagatgttatggtgaatgcttgtgtaactacctaaaattcctagt 30729517  T
Q  336 gtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  30729516 gtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaaggggttaaagtgtaaacttgtgga 30729440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 443 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 3630575 - 3630454
Alignment:
Q  443 acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagca 542  Q
    |||||||||||  | | |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630575 acaaggatctttgagaaggcggaagacattccgatggctaaagaggttagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagca 3630476  T
Q  543 gcaaggtagttgatggtttggc 564  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  3630475 acaagttggttgatggtttggc 3630454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 284 - 417
Target Start/End: Original strand, 26944707 - 26944840
Alignment:
Q  284 tgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgaggg 383  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||    
T  26944707 tgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacctaaaattcctagcatagttggactgcaaggaccttcgaaaaggcggaaggcatttcgatgg 26944806  T
Q  384 ctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  26944807 ctgaaggggttaatgtgtgtacttatggagctac 26944840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 405 - 562
Target Start/End: Original strand, 3395903 - 3396061
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 503  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | ||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3395903 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcagaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaactt 3396001  T
Q  504 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 562  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3396002 gtggagatacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggtggttggtggtttg 3396061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 3630688 - 3630505
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| ||||||||  || |||||||||||||| |  |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  3630688 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcacgtattgaagatgttatgttatagtcttgtagaactacctgaaattccta 3630589  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  3630588 gtgtagttgaactacaaggatctttgagaaggcggaagacattccgatggctaaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 3630505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 200
Target Start/End: Original strand, 26944599 - 26944696
Alignment:
Q  103 aatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  26944599 aatggtacgactgtggaggaccttgggggctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaatgcattccggaggttgaagaatgta 26944696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 309 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 28038544 - 28038296
Alignment:
Q  309 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttg 408  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||| ||||||||   |||| ||||| |||| ||  |||| |||||||||||  |||||    
T  28038544 cttgtggaactacctaaaattcttattgtagctaga-tgcaaggatcttcgaga---cggatgacattccgatggtcgaagaggttaaggtgtagacttg 28038449  T
Q  409 tggaactacctaaaatgcc--ttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtg 506  Q
    |||||||||||||||| ||  |||  ||| | |||  |||| |||||||| | ||| |||| |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  28038448 tggaactacctaaaattcctattgtttag-tcggatgcaagaatcttcaagaaggcagaagacattccgatggttgaaaaggt-tgggtggaaacttgtg 28038351  T
Q  507 gagctacttggtgtagtggga-acaagggaaagagcagcaaggtagttgatggtt 560  Q
     |||||| ||||||||||| |  |||||| |||||||| | ||| ||||||||||    
T  28038350 aagctacatggtgtagtggaatgcaagggtaagagcagaatggtggttgatggtt 28038296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Original strand, 33310685 - 33310846
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  33310685 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 33310784  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  33310785 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 33310846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 412
Target Start/End: Original strand, 3395827 - 3396006
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| |   || ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  3395827 gccaagggtgattgggtattagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 3395926  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
    || ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  3395927 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcagaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtgga 3396006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26066880 - 26066719
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || || |||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  26066880 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattaaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 26066781  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  26066780 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggaggaagacattccgatggctgaagaggtt 26066719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 30729543 - 30729401
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggaca-caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 503  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||    
T  30729543 cttgtgtaactacctaaaattcctagtgtagtt-ggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaaggggttaaagtgtaaactt 30729445  T
Q  504 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 546  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30729444 gtggagctatttggtgtagtaggaagcaagggaaagagcagcaa 30729401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Original strand, 33310761 - 33310915
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 502  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  33310761 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 33310859  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  33310860 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 33310915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 26066804 - 26066650
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 502  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | || ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  26066804 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggaggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 26066706  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  26066705 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 26066650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 549
Target Start/End: Original strand, 26944731 - 26944877
Alignment:
Q  404 acttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggaca-caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaact 502  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||  |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||| |  ||||  |||    
T  26944731 acttgtggaactacctaaaattcctagcatagtt-ggactgcaaggaccttcgaaaaggcggaaggcatttcgatggctgaaggggttaatgtgtgtact 26944829  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggt 549  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26944830 tatggagctacatggtgtagtgggaagcaagggaaagagcaggaaggt 26944877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28038724 - 28038629
Alignment:
Q  129 gtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccct 224  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||    
T  28038724 gtgctatggtctagtggtgaggaaggggattcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcatgacttgtgggattaccct 28038629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 489
Target Start/End: Original strand, 11137760 - 11137891
Alignment:
Q  360 agaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaagga---tcttcaa 456  Q
    |||||||||||| | | |||| || ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  ||||||   ||||||     
T  11137760 agaaggcggaaggctttccgatggttgaagtggttatggtgtagacttgtggaactacctaaaattcctagtgtag-ttggatgcaaggatggtcttcat 11137858  T
Q  457 aagggcggaaggcattccgatggttgaagaggt 489  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11137859 gaaggcggaaggcattccgatggttgaagaggt 11137891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 560
Target Start/End: Original strand, 30445063 - 30445180
Alignment:
Q  443 acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagca 542  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  || |||||||| |||| ||||||||| ||||  |  |||||||||    
T  30445063 acaaggaacttcaagaaggcggaaggcattccgatggttgaagaggcaaggattgaagcttgtggaactacatggtgtagttggaagcatcgaaagagca 30445162  T
Q  543 gcaaggtagttgatggtt 560  Q
    |||| ||  |||||||||    
T  30445163 gcaaagtgattgatggtt 30445180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 404 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 24543398 - 24543270
Alignment:
Q  404 acttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaagg---atcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcaggg--tgta 498  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||  |||||   |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||  || |    
T  24543398 acttgtcgaactacctaaaatgcctagtgtagtt-ggatgcaagggtgatcttcaatagggaggaaggcattccgagggttgaagaggcaagggtttgga 24543300  T
Q  499 aacttgtggagctacttggtgtagtgggaa 528  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24543299 agcttgtggagctacttggtgcagttggaa 24543270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 11137783 - 11137848
Alignment:
Q  287 gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagga 353  Q
    |||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11137783 gttgaagtggttatggtgtagacttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgga-tgcaagga 11137848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Original strand, 16652346 - 16652504
Alignment:
Q  42 gtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctct 140  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||| | ||| | |  |||  |||    
T  16652346 gtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggagg-ctttgggagtttatgttct 16652444  T
Q  141 agtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    ||||||||||| | || |||||||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||||||||    
T  16652445 agtggtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgta 16652504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 353
Target Start/End: Original strand, 11137926 - 11137991
Alignment:
Q  287 gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagga 353  Q
    |||||||| ||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11137926 gttgaagaggttgtggtgtagacttctggaactacctaaaattcctagtgtagttgga-tgcaagga 11137991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 444 - 513
Target Start/End: Original strand, 17759031 - 17759100
Alignment:
Q  444 caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctac 513  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||    
T  17759031 caaggaacttcaagagggcggaaggcattccgaggtttgaaaaggtaaaggtgaaaacttgtggaactac 17759100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 513
Target Start/End: Original strand, 11137764 - 11137817
Alignment:
Q  460 ggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctac 513  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  11137764 ggcggaaggctttccgatggttgaagtggttatggtgtagacttgtggaactac 11137817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 460 - 489
Target Start/End: Original strand, 11137907 - 11137936
Alignment:
Q  460 ggcggaaggcattccgatggttgaagaggt 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11137907 ggcggaaggcattccgatggttgaagaggt 11137936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 222
Target Start/End: Original strand, 30444772 - 30444936
Alignment:
Q  57 ttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaaggga 156  Q
    ||||||||||| | | ||||| |||||||||||| |  || | | || || |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  30444772 ttgaggtagagaaaggtcagcttgaggtggagttgatgacgctgatagtggtacgactatgga-gacattgggtgctagtctctagttgtgagcaagaga 30444870  T
Q  157 tttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattacc 222  Q
     ||||||| || ||| ||||  |||  || | ||||||||||||  ||| | |||| |||||||||    
T  30444871 attcttcaagaggacagaaggcattcaggggtttgaagaatgtatggcatgacttgtgggattacc 30444936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 5 - 528
Target Start/End: Original strand, 15071912 - 15072432
Alignment:
Q  5 ttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaa 104  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15071912 ttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaa 15072011  T
Q  105 tgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagc 204  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| |||    
T  15072012 tggtacgacaatggaagaccttgagtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccgg--gttgaagaatgtatagc 15072108  T
Q  205 acggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtg 304  Q
    |||||  || ||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072109 acggcaagcaggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcaggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtg 15072207  T
Q  305 aatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgc 403  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | || |||||||| ||||||||||       
T  15072208 aatgcttgtagaactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttctgatggctgaagaggttaaggtgaat 15072307  T
Q  404 acttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaact 502  Q
     |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | | ||||||  |||||||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  15072308 gcttgtggaactacctaaaattcctagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaagacggaagatattccgatggctgaaggggttagagtgtaaact 15072406  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15072407 tgtggagctacttggtgtagtgggaa 15072432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Original strand, 41383801 - 41384210
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  41383801 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtgcacatttgctagttgaggtagagtacgctcatcttgaggtggagttgaacacaccg 41383900  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  41383901 gtaatggtacggctatggaggaccttggatgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgta 41383999  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41384000 tagcacggcttgcgggattaccct-aaaaaaaggccaagggttatttgatgcaaggtgaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttat 41384098  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||    
T  41384099 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaatacctagcgtagttagacttcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgaggactgaaggggttgaggtg 41384198  T
Q  401 tgcacttgtgga 412  Q
    |  |||||||||    
T  41384199 tatacttgtgga 41384210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 27828435 - 27828792
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27828435 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagttggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 27828534  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||                   |||||||||||||    
T  27828535 gtaatggtacgactatgaagaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagtaagggatttcttcatgaa-------------------gttgaagaatgta 27828614  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||        | |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||                |||||||||||    
T  27828615 tagcacggcttgcgagattactctaaaagaatg-ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcg----------------gaagatgttat 27828697  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtta 395  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27828698 ggtaaatgcttgtgggactacctaaaattcctagtgtagttggactacaaggaccttcgagaaggcagaagacattccgagggctgaaggggtta 27828792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 18812158 - 18812324
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18812158 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 18812257  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 169  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18812258 gtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 18812324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 43081052 - 43081218
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43081052 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 43081151  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 169  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43081152 gtaatggtacgactat-gaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 43081218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 234 - 401
Target Start/End: Original strand, 43081263 - 43081430
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||    
T  43081263 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggtctacctaaaactccta 43081362  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||| |||| ||||||    
T  43081363 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattctgatggctgaagtggttgaggtgt 43081430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31574714 - 31574411
Alignment:
Q  38 ggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattc 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  31574714 ggatgtacgcatttgctagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagtttatgacatcgggaatgatacgactatgga-gaccttgggtgctatgc 31574616  T
Q  138 tctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggcca 237  Q
    ||||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||||  ||| || || |||||||||||| | || ||| || ||||||||| |        |  ||    
T  31574615 tctagttatgagaaagggaattcttcatgaagacagaaggcattccgaagtttgaagaatgtataacatggcatgtgggattacctt----taaagaaca 31574520  T
Q  238 agggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgt-gttgaaga-tgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagt 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||| |||  || ||||||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31574519 agggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcaggagacgtctcgtggttgaagagggttatggtgtatacttgcggaactacctaaaattcctagt 31574420  T
Q  336 gtagttgga 344  Q
    |||||||||    
T  31574419 gtagttgga 31574411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 21481645 - 21481951
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||     | | ||||| | ||||||||| || |||||| ||    
T  21481645 cctgttgaggtggagtttcaaggtggaagacatagtgggatttacacatttgctagttgagaggttggaagctcaacttgaggtggatttgaacacatcg 21481744  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||                  || |||||||    
T  21481745 gaaatggtacgactatggaagaccttgggagctatgctctagtggtgagcaatggatttcttcatgaagacg------------------gaggaatgta 21481826  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     | ||||||||||  |||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21481827 taacacggcttgctagattaccctaaaaa----gccaagggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaggttat 21481922  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaatt 329  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  21481923 ggtggatacttgcggaactacctaaaatt 21481951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Original strand, 18812476 - 18812629
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 503  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  18812476 cttgtagaactaccttaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcaagaaggcggaagacattccgatggctggagaggttagggtgtaaactt 18812574  T
Q  504 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18812575 gtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggaggttgatg 18812629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 404 - 536
Target Start/End: Original strand, 17849336 - 17849468
Alignment:
Q  404 acttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 503  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||    
T  17849336 acttgtggaactacctaaaattcctagtgtagtt-ggatgcaaggatcttcaagaaggcggaaggcattccgatggttgaagaggcaaggatggaaactt 17849434  T
Q  504 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaa 536  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17849435 gtggagatacttggtgtagttggaagcaagggaa 17849468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 444 - 557
Target Start/End: Original strand, 21481969 - 21482081
Alignment:
Q  444 caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagca 542  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21481969 caagaatcttcaaaagg-cggaaggcattccaatagttgaagaggtaagg-tgtaaacttgtggagctacatggtgtagtgggaagcaagggaaagagca 21482066  T
Q  543 gcaaggtagttgatg 557  Q
    ||| ||| |||||||    
T  21482067 gcatggtggttgatg 21482081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Original strand, 27828899 - 27829054
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagg--gtgtaaac 501  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| |||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||    
T  27828899 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaaggatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttaagaggtgtaaac 27828997  T
Q  502 ttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27828998 ttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggatgttgatg 27829054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 234 - 397
Target Start/End: Original strand, 27828823 - 27828987
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||  | ||| |||||||   || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  27828823 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaagttaagcgggagatgtttcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 27828922  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaag 397  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  27828923 agcgtagttggactacaaggatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttaag 27828987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 460 - 542
Target Start/End: Original strand, 41384352 - 41384435
Alignment:
Q  460 ggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagca 542  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41384352 ggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtgaagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagca 41384435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 417
Target Start/End: Original strand, 18812400 - 18812584
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || |||||||  |||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  18812400 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagagattatggtatagtcttgtagaactaccttaaattcct 18812499  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 417  Q
    || ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  18812500 agcgtagttggactacaagcatcttcaagaaggcggaagacattccgatggctggagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 18812584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 382 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14418785 - 14418718
Alignment:
Q  382 ggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaagga 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14418785 ggctgaagaggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaattccttgagtagtttagacacaagga 14418718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 448 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 31574401 - 31574293
Alignment:
Q  448 gatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 546  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  31574401 gatcttcaagaaggcggaagacatttcgaaggttgaagaggtt-gggtggaaacttgtggagctacttggtgtagttggaagcgagggaaagagcagcaa 31574303  T
Q  547 ggtagttgat 556  Q
    ||| ||||||    
T  31574302 ggtggttgat 31574293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 235 - 410
Target Start/End: Original strand, 41384223 - 41384398
Alignment:
Q  235 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctag 334  Q
    |||||| |||||||   |||| ||| |||||||| |||| || |||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  41384223 ccaaggatgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggatatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaatttctag 41384322  T
Q  335 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtg 410  Q
     ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  41384323 cgtagttggactacaaacatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtg 41384398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 234 - 380
Target Start/End: Original strand, 43081453 - 43081600
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  43081453 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 43081552  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccga 380  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43081553 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccga 43081600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 40220533 - 40220415
Alignment:
Q  404 acttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggt--cagggtgtaaac 501  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || ||| |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| || |    
T  40220533 acttgtggaactacctaaaat-cctagtgtggtt-ggatgcaagaatcttcaaaagagcggaaggcattccgagggttgaagaggtacaagggtggaagc 40220436  T
Q  502 ttgtggagctacttggtgtag 522  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40220435 ttgtggagctacttggtgtag 40220415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 309 - 389
Target Start/End: Original strand, 17849337 - 17849416
Alignment:
Q  309 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| || |||||    
T  17849337 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgga-tgcaaggatcttcaagaaggcggaaggcattccgatggttgaag 17849416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 404 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 42436123 - 42436004
Alignment:
Q  404 acttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggt--cagggtgtaaac 501  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || ||| |||  ||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||| || |    
T  42436123 acttgtggaactacctaaaat-cctagtgtggtt-ggatgcaaggatcttcaagagagcgggaggcattccgagggttgaagaggtacaagggtggaagc 42436026  T
Q  502 ttgtggagctacttggtgtagt 523  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42436025 ttgtggagctacttggtgtagt 42436004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34255267 - 34255109
Alignment:
Q  42 gtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtg-ctattctct 140  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||    
T  34255267 gtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggagg-ccttgggtgtttatgctct 34255169  T
Q  141 agtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    ||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||||||||    
T  34255168 agttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgta 34255109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 41365742 - 41365619
Alignment:
Q  79 tgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatg---aagacggaa 175  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||   |||||||||    
T  41365742 tgaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatggagg-ccttgggtgctatgctctagttgtgagcatgggaattcttcatgaagaagacggaa 41365644  T
Q  176 gaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    || ||| | ||| ||||||||||||    
T  41365643 gacattccagagtttgaagaatgta 41365619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 528
Target Start/End: Original strand, 43081529 - 43081653
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 502  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| |||||||||   |||||||||  ||||||||||||    
T  43081529 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgattactgaagaggttgagggtgtaaact 43081627  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa 528  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43081628 tgtggagctacttggagtagtgggaa 43081653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 200
Target Start/End: Original strand, 17849079 - 17849233
Alignment:
Q  45 cgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| |  |||  ||  |   || ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||     
T  17849079 cgcatttgctagttgaggtagagaaagctcaccttgaggtggagttgatgacattggacaaagtatgactatgga-gaccttgggtgctaggctctagtt 17849177  T
Q  145 gtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    || |||||| || |||||||  ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  17849178 gttagcaagagaattcttcaaaaagacggaaggcatttcggattttgaagaatgta 17849233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 492 - 560
Target Start/End: Original strand, 18959980 - 18960049
Alignment:
Q  492 gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtt 560  Q
    ||||| |||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18959980 gggtggaaacttctggagctacatgatgtagtgagaagcaagggaaagagcagaaaggtggttgatggtt 18960049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 42436141 - 42436044
Alignment:
Q  290 gaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 389  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||  |||| || ||| ||||||| |||||    
T  42436141 gaagaggttatggtggagacttgtggaactacctaaaa-tcctagtgtggttgga-tgcaaggatcttcaagagagcgggaggcattccgagggttgaag 42436044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14418899 - 14418842
Alignment:
Q  237 aagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaaga 294  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14418899 aagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgagagatgtcctgtattgaaga 14418842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 70412 - 69872
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  70412 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcatcgtgaggtggagttgaacacactg 70313  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||                   ||||||||||||||    
T  70312 gtaatggtacgactatggaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgaggaagggatttcttcatga-------------------ggttgaagaatgta 70233  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     |||||| ||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  70232 tagcacgacttgcgggattactctaaaagaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaggaagcgggagatgtcctgcattgaagatgttat 70134  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||   |||| |||||||| |||||||||    
T  70133 ggtgaatgcttgtgggactacctaaaattcctagcgtagttggactgcaagtactcttcgagaagacggaagacgctccgatggctgaagaggttaaggt 70034  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatc-ttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--gggt 495  Q
    |    |||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| | ||| | | |||||||| |||||||| || ||||| ||| |   |||    
T  70033 gaatgcttgtggagctacctaaaattcctagtgtag-ttggactgcaaggacctttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttatgaggt 69935  T
Q  496 gtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  69934 gtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagatcagcaaggtggttgatg 69872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 672 - 148
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  672 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccg 573  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttgaagaatgta 200  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||                   ||||||||||||||    
T  572 gtaatggtacaactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcttga-------------------ggttgaagaatgta 493  T
Q  201 cagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttat 300  Q
     ||||||||||||| |||||| ||        |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  492 tagcacggcttgcgagattactctaaaagaa-ggccaatggtgattggatgcaaggtggtcttcaaggaagcgggagatgttctgcattgaagatgttat 394  T
Q  301 ggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggt 399  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||    
T  393 ggtgaatgcaagtgggactacctaaaattcctagcgtagttggactgcaaggactcttcgagaagtcggaagacgttccgatggctgaagaggttaaggt 294  T
Q  400 gtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--gggtg 496  Q
    |    ||||||| |||||||||||  ||| | |||| |||||| ||||||| |||| | | |||||||| |||||||| || ||||| ||| |  |||||    
T  293 gaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtag-ttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttatggggtg 195  T
Q  497 taaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagca 542  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  194 taaacttgtgaagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagca 148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 92 - 389
Target Start/End: Original strand, 3969 - 4269
Alignment:
Q  92 aacacaccggtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagaaatttcggaggttg 191  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  || |||    
T  3969 aacacaccagaaatggtacgactatggaggaccttgggtgatatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccaaagtttg 4068  T
Q  192 aagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttga 291  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  4069 aagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaa----gccaagggtgattggatgtaaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttga 4164  T
Q  292 agatgttatggtgaatgcttg-------tggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggc 384  Q
    ||| ||||||||| || ||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  4165 agaggttatggtggatacttgtggaatatggaactacctaaaatttctagtgtagttggactgcaaggctcttcgagaaggcggaagacattccgttggc 4264  T
Q  385 tgaag 389  Q
    |||||    
T  4265 tgaag 4269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 375
Target Start/End: Original strand, 4273 - 4351
Alignment:
Q  297 ttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacat 375  Q
    |||||||| || |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4273 ttatggtggatacttgggaaactacctcaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaagtcggaaaacat 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 437 - 557
Target Start/End: Original strand, 4393 - 4512
Alignment:
Q  437 ttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caaggga 535  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  4393 ttggatacaagaatcttcaaaaaggcggaaggcattccgatggtttaagaagtta-ggtgtaaa-ttgtggagctacatggtgtactgggaagcaaggga 4490  T
Q  536 aagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||| | || ||| |||||||    
T  4491 aagagaaacatggtggttgatg 4512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 23522 - 23689
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23522 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagcacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 23621  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 169  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23622 gtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 23689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 234 - 412
Target Start/End: Original strand, 23730 - 23908
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 333  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23730 gccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgctgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 23829  T
Q  334 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 412  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  23830 gtgtagttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 23908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 234 - 394
Target Start/End: Original strand, 23920 - 24082
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatg-cttgtggaactacctaaaattcc 331  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  | | ||||| ||||||||| |||||||    
T  23920 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtataagtcttgtagaactacctgaaattcc 24019  T
Q  332 tagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 394  Q
    ||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  24020 tagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 24082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Original strand, 23997 - 24151
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 502  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  23997 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgatggtgtaaact 24095  T
Q  503 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  24096 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 24151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 1019 - 1186
Alignment:
Q  1 cctgttgaggtgaagtttgaaagttgaagacatagaaggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttaaacacaccg 100  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1019 cctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctaattgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccg 1118  T
Q  101 gtaatgatacgactatggaggaccttgagtgctattctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaag 169  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1119 gtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaag 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 493 - 557
Target Start/End: Original strand, 2525 - 2590
Alignment:
Q  493 ggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2525 ggtgtaaacttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggaggttgatg 2590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 366
Target Start/End: Original strand, 2371 - 2504
Alignment:
Q  234 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 332  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||| | ||||||||    
T  2371 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacttgaaattcct 2470  T
Q  333 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggc 366  Q
    || ||||||||||| |||| | ||| ||||||||    
T  2471 agcgtagttggactacaagcatctttgagaaggc 2504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 81413 - 81351
Alignment:
Q  308 gcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaag 371  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  81413 gcttgtggaactacctaaatatcctagtgtagttgga-tgcaaggaacttcaagagggcggaag 81351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 405 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 81412 - 81329
Alignment:
Q  405 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggt 489  Q
    ||||||||||||||||||   ||| | |||||| |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  81412 cttgtggaactacctaaatatcctagtgtagtt-ggatgcaaggaacttcaagagggcggaaggcattccgtggtttgaagaggt 81329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University