View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7118_low_9 (Length: 403)

Name: NF7118_low_9
Description: NF7118
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7118_low_9
NF7118_low_9
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (9-382)||(44726212-44726584)
chr7 (107-375)||(20298844-20299113)
chr7 (52-380)||(9680180-9680508)
chr7 (9-382)||(21679351-21679725)
chr7 (9-375)||(7092806-7093175)
chr7 (51-375)||(24815665-24815986)
chr7 (9-375)||(7470663-7471031)
chr7 (51-363)||(28486879-28487195)
chr7 (9-230)||(43813-44033)
chr7 (52-230)||(1047783-1047961)
chr7 (51-230)||(9679989-9680168)
chr7 (9-364)||(38395577-38395932)
chr7 (9-241)||(20298553-20298785)
chr7 (52-230)||(22136419-22136597)
chr7 (52-230)||(40551446-40551624)
chr7 (53-230)||(7350147-7350324)
chr7 (52-230)||(31156779-31156958)
chr7 (107-331)||(20298747-20298972)
chr7 (223-375)||(1047542-1047695)
chr7 (52-235)||(1047587-1047771)
chr7 (54-212)||(7349974-7350133)
chr7 (229-375)||(44128-44275)
chr7 (52-235)||(31156583-31156767)
chr7 (223-375)||(7349905-7350059)
chr7 (223-375)||(31156538-31156691)
chr7 (52-235)||(44045-44230)
chr7 (52-212)||(22136609-22136770)
chr7 (52-212)||(40551636-40551797)
chr7 (108-235)||(4509627-4509753)
chr7 (108-235)||(4511469-4511595)
chr7 (223-375)||(22136685-22136839)
chr7 (223-375)||(40551712-40551866)
chr7 (255-346)||(26214495-26214586)
chr7 (223-331)||(4509627-4509734)
chr7 (223-331)||(4511469-4511576)
chr7 (268-331)||(6067801-6067863)
chr7 (109-235)||(6431085-6431209)
chr7 (269-331)||(6431147-6431209)
chr7 (268-341)||(6048268-6048340)
chr7 (137-212)||(6067823-6067900)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (9-375)||(22801402-22801768)
chr4 (9-375)||(14788063-14788429)
chr4 (9-374)||(36920165-36920529)
chr4 (9-364)||(24879849-24880203)
chr4 (51-382)||(47564134-47564466)
chr4 (127-375)||(5100454-5100701)
chr4 (9-380)||(12396439-12396811)
chr4 (9-380)||(12401381-12401753)
chr4 (9-367)||(16454642-16455000)
chr4 (57-230)||(9174965-9175138)
chr4 (53-375)||(36379797-36380119)
chr4 (53-230)||(22045210-22045387)
chr4 (9-230)||(36379563-36379783)
chr4 (52-213)||(16932659-16932821)
chr4 (52-230)||(22781231-22781410)
chr4 (128-367)||(18535386-18535619)
chr4 (54-230)||(11007062-11007239)
chr4 (52-219)||(5100196-5100363)
chr4 (107-216)||(3825222-3825331)
chr4 (52-303)||(18535544-18535798)
chr4 (9-235)||(22133071-22133296)
chr4 (223-380)||(22133021-22133179)
chr4 (115-364)||(3825167-3825420)
chr4 (223-375)||(22044969-22045122)
chr4 (52-235)||(22045014-22045198)
chr4 (105-331)||(3577620-3577850)
chr4 (53-161)||(10114219-10114328)
chr4 (52-235)||(16932444-16932628)
chr4 (223-375)||(16932399-16932552)
chr4 (109-242)||(3577613-3577748)
chr4 (52-212)||(22781057-22781219)
chr4 (52-212)||(9174792-9174953)
chr4 (52-235)||(11006865-11007050)
chr4 (105-207)||(3577453-3577557)
chr4 (281-366)||(22780997-22781084)
chr4 (282-346)||(9174753-9174818)
chr4 (54-207)||(26559263-26559415)
chr4 (128-331)||(3577718-3577925)
chr4 (105-305)||(3577451-3577654)
chr4 (105-161)||(35371380-35371436)
chr4 (288-375)||(11006820-11006909)
chr4 (53-139)||(12740219-12740306)
chr4 (53-139)||(12748425-12748512)
chr4 (108-162)||(54882237-54882290)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (9-380)||(35178-35547)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (51-364)||(28202002-28202316)
chr1 (71-375)||(6996871-6997172)
chr1 (70-375)||(50077235-50077540)
chr1 (52-375)||(31423478-31423800)
chr1 (107-366)||(25127283-25127544)
chr1 (9-364)||(14098565-14098921)
chr1 (52-382)||(25249086-25249416)
chr1 (9-375)||(31736157-31736526)
chr1 (11-228)||(16430232-16430448)
chr1 (21-230)||(31423812-31424019)
chr1 (9-215)||(27337639-27337844)
chr1 (51-211)||(28841963-28842123)
chr1 (54-230)||(50077570-50077746)
chr1 (51-230)||(25249428-25249607)
chr1 (9-255)||(25127089-25127335)
chr1 (53-378)||(13126036-13126359)
chr1 (52-375)||(8954014-8954335)
chr1 (52-219)||(51751644-51751811)
chr1 (9-228)||(20301696-20301914)
chr1 (52-230)||(47178969-47179147)
chr1 (52-213)||(16227774-16227936)
chr1 (127-367)||(16430537-16430775)
chr1 (262-375)||(8347873-8347986)
chr1 (52-215)||(20301928-20302092)
chr1 (209-378)||(155220-155388)
chr1 (52-213)||(51751834-51751996)
chr1 (223-375)||(20302004-20302159)
chr1 (278-363)||(27337585-27337672)
chr1 (53-235)||(13548075-13548257)
chr1 (210-375)||(28842026-28842194)
chr1 (52-212)||(16227967-16228128)
chr1 (127-207)||(47179235-47179315)
chr1 (223-375)||(16228043-16228197)
chr1 (223-375)||(47179235-47179389)
chr1 (108-235)||(31928662-31928788)
chr1 (311-375)||(51752000-51752065)
chr1 (108-235)||(19753623-19753749)
chr1 (262-330)||(10742262-10742329)
chr1 (223-331)||(13548075-13548182)
chr1 (228-324)||(41141279-41141374)
chr1 (127-162)||(155234-155269)
chr1 (52-158)||(28997281-28997386)
chr1 (52-158)||(29002997-29003102)
chr1 (223-331)||(19753642-19753749)
chr1 (223-331)||(31928662-31928769)
chr1 (132-200)||(41141279-41141346)
chr1 (143-212)||(10742240-10742308)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (9-375)||(51301-51667)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (9-364)||(20504507-20504863)
chr5 (9-364)||(659301-659658)
chr5 (107-365)||(20044448-20044706)
chr5 (9-230)||(41586783-41587003)
chr5 (9-230)||(27911715-27911935)
chr5 (9-357)||(31466558-31466906)
chr5 (9-303)||(20044254-20044548)
chr5 (10-230)||(18510189-18510409)
chr5 (9-375)||(6746636-6747005)
chr5 (9-375)||(18468287-18468656)
chr5 (52-230)||(15355347-15355525)
chr5 (52-230)||(23666649-23666827)
chr5 (53-219)||(31544341-31544507)
chr5 (52-230)||(10756500-10756678)
chr5 (52-230)||(34477913-34478092)
chr5 (224-375)||(18509949-18510101)
chr5 (223-363)||(41586557-41586698)
chr5 (223-363)||(27912022-27912165)
chr5 (52-235)||(31544530-31544714)
chr5 (52-215)||(27911947-27912110)
chr5 (261-375)||(31544644-31544759)
chr5 (52-212)||(15355173-15355335)
chr5 (52-212)||(23666839-23667001)
chr5 (54-235)||(41586590-41586770)
chr5 (52-212)||(10756690-10756852)
chr5 (52-212)||(34477740-34477901)
chr5 (223-375)||(10756767-10756921)
chr5 (52-235)||(18509994-18510177)
chr5 (261-375)||(34477671-34477787)
chr5 (223-375)||(15355104-15355258)
chr5 (223-375)||(23666916-23667070)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (75-360)||(6259413-6259698)
chr2 (9-364)||(21518998-21519354)
chr2 (52-230)||(35216464-35216642)
chr2 (52-230)||(19502830-19503008)
chr2 (52-230)||(36559639-36559817)
chr2 (103-225)||(22405135-22405257)
chr2 (52-230)||(31733658-31733836)
chr2 (9-159)||(6263002-6263151)
chr2 (52-364)||(31733336-31733646)
chr2 (261-375)||(19502589-19502704)
chr2 (52-212)||(36559466-36559627)
chr2 (55-193)||(13828967-13829105)
chr2 (52-235)||(19502634-19502818)
chr2 (155-230)||(6259733-6259808)
chr2 (52-207)||(35216296-35216452)
chr2 (223-375)||(36559397-36559551)
chr2 (203-378)||(13828878-13829052)
chr2 (223-375)||(35216222-35216376)
chr2 (268-341)||(28568842-28568914)
chr2 (107-201)||(16677131-16677224)
chr2 (222-331)||(42018293-42018401)
chr2 (223-307)||(22405149-22405233)
chr2 (127-216)||(42018313-42018400)
chr2 (262-355)||(41303707-41303802)
chr2 (107-161)||(7858371-7858425)
chr2 (127-171)||(28568918-28568961)
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (53-380)||(890342-890668)
chr3 (9-375)||(18097461-18097828)
chr3 (52-375)||(53916124-53916438)
chr3 (9-375)||(43227624-43227993)
chr3 (51-382)||(28137863-28138196)
chr3 (9-380)||(28100632-28101004)
chr3 (9-375)||(42991542-42991911)
chr3 (9-230)||(43422247-43422467)
chr3 (51-365)||(4308867-4309185)
chr3 (87-364)||(23636400-23636675)
chr3 (9-207)||(3315944-3316141)
chr3 (51-230)||(53916450-53916629)
chr3 (52-230)||(11169687-11169865)
chr3 (51-230)||(10956843-10957022)
chr3 (51-365)||(35918535-35918853)
chr3 (9-230)||(890681-890902)
chr3 (52-230)||(6064287-6064466)
chr3 (52-230)||(457492-457670)
chr3 (52-230)||(5898998-5899178)
chr3 (223-380)||(43422005-43422161)
chr3 (223-382)||(3306326-3306486)
chr3 (52-230)||(3306251-3306429)
chr3 (52-235)||(11169877-11170061)
chr3 (223-375)||(11169953-11170106)
chr3 (52-212)||(6064114-6064275)
chr3 (261-375)||(10956602-10956717)
chr3 (53-235)||(10956647-10956830)
chr3 (286-378)||(1619244-1619337)
chr3 (261-366)||(5899303-5899409)
chr3 (52-212)||(457682-457843)
chr3 (223-375)||(7607002-7607157)
chr3 (88-215)||(7607069-7607196)
chr3 (52-235)||(43422054-43422235)
chr3 (52-230)||(5899190-5899368)
chr3 (223-366)||(6064054-6064199)
chr3 (223-375)||(457758-457912)
chr3 (108-235)||(43402814-43402940)
chr3 (278-340)||(14634796-14634858)
chr3 (262-341)||(2075654-2075734)
chr3 (127-171)||(27422343-27422386)
chr3 (223-331)||(43402814-43402921)
chr3 (53-207)||(15824279-15824432)
chr3 (127-161)||(4041708-4041742)
chr3 (223-303)||(890705-890785)
chr3 (127-171)||(1619358-1619401)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (51-346)||(15072136-15072432)
chr8 (9-230)||(41383990-41384210)
chr8 (52-219)||(43081263-43081430)
chr8 (108-213)||(27828687-27828792)
chr8 (223-375)||(18812476-18812629)
chr8 (52-147)||(21481856-21481951)
chr8 (222-354)||(17849336-17849468)
chr8 (262-375)||(21481969-21482081)
chr8 (223-375)||(27828899-27829054)
chr8 (52-215)||(27828823-27828987)
chr8 (278-360)||(41384352-41384435)
chr8 (52-235)||(18812400-18812584)
chr8 (200-267)||(14418718-14418785)
chr8 (266-374)||(31574293-31574401)
chr8 (53-228)||(41384223-41384398)
chr8 (52-198)||(43081453-43081600)
chr8 (54-162)||(31574411-31574521)
chr8 (222-340)||(40220415-40220533)
chr8 (127-207)||(17849337-17849416)
chr8 (222-341)||(42436004-42436123)
chr8 (223-346)||(43081529-43081653)
chr8 (310-378)||(18959980-18960049)
chr8 (108-207)||(42436044-42436141)
chr8 (55-112)||(14418842-14418899)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (51-360)||(15533279-15533591)
chr6 (54-230)||(3395639-3395815)
chr6 (51-219)||(3630711-3630879)
chr6 (54-230)||(30729440-30729616)
chr6 (52-230)||(33310495-33310673)
chr6 (52-230)||(26066892-26067070)
chr6 (261-382)||(3630454-3630575)
chr6 (102-235)||(26944707-26944840)
chr6 (223-380)||(3395903-3396061)
chr6 (52-235)||(3630505-3630688)
chr6 (127-378)||(28038296-28038544)
chr6 (52-212)||(33310685-33310846)
chr6 (52-230)||(3395827-3396006)
chr6 (52-212)||(26066719-26066880)
chr6 (223-364)||(30729401-30729543)
chr6 (223-375)||(33310761-33310915)
chr6 (223-375)||(26066650-26066804)
chr6 (222-367)||(26944731-26944877)
chr6 (178-307)||(11137760-11137891)
chr6 (261-378)||(30445063-30445180)
chr6 (222-346)||(24543270-24543398)
chr6 (105-171)||(11137783-11137848)
chr6 (105-171)||(11137926-11137991)
chr6 (262-331)||(17759031-17759100)
chr6 (278-331)||(11137764-11137817)
chr6 (278-307)||(11137907-11137936)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (51-375)||(69872-70201)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (51-360)||(148-461)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (52-230)||(23730-23908)
scaffold0140 (52-212)||(23920-24082)
scaffold0140 (223-375)||(23997-24151)
[»] scaffold0133 (3 HSPs)
scaffold0133 (52-207)||(4107-4269)
scaffold0133 (115-193)||(4273-4351)
scaffold0133 (255-375)||(4393-4512)
[»] scaffold0250 (2 HSPs)
scaffold0250 (311-375)||(2525-2590)
scaffold0250 (52-184)||(2371-2504)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (126-189)||(81351-81413)
scaffold0014 (223-307)||(81329-81412)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 9 - 382
Target Start/End: Original strand, 44726212 - 44726584
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44726212 gaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggtcaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttg 44726310  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44726311 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaatgaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaagg 44726410  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44726411 ggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaagaatcttcataagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc 44726510  T
Q  309 agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttggc 382  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44726511 agggtgtaatcttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttggc 44726584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 107 - 375
Target Start/End: Original strand, 20298844 - 20299113
Alignment:
Q  107 tgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaa 206  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20298844 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaa 20298943  T
Q  207 ggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20298944 ggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 20299043  T
Q  307 tcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20299044 tcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtcgtgggaagcaagggaaagagcagcatggtggttgatg 20299113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 380
Target Start/End: Original strand, 9680180 - 9680508
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  |||||  |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  9680180 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaagc-atggtatagtcttgtagaactacctgaaattccta 9680278  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagt 251  Q
    |  || ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9680279 gcataattggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttaaggtatgtacttgtagaactacctaaaattccttgagt 9680378  T
Q  252 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtggga-acaag 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||    
T  9680379 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtacgacgcaag 9680478  T
Q  351 ggaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 380  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9680479 ggaaagagcagcaaggaggttgatggtttg 9680508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 382
Target Start/End: Original strand, 21679351 - 21679725
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| ||||||||    
T  21679351 gaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaggaagcggaagatgttctgtgttg 21679449  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||| ||||    
T  21679450 aagatgttatggtgaatgcttgtcgaactacataaaattcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcgggagacgttccgatggcagaag 21679549  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  21679550 aggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacaatccgatggctgaagggg 21679648  T
Q  307 tcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttggc 382  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  21679649 ttagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtggtgggaagcaagggaaggagcaacatggtggttgatggtgtggc 21679725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7093175 - 7092806
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||    
T  7093175 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattactctaaaagga-ggccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaggaagtgggagatgtcctgcgttg 7093077  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| | |||| ||||||||    
T  7093076 aagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaaatcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagaccgaagacgttccgatggctgaag 7092977  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||||| |||| | | |||||||| ||||| ||  | ||||| ||    
T  7092976 aggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtag-ttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagagctgaagggg 7092878  T
Q  307 tca--gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  7092877 ttatgaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcaacaaggaggttgatg 7092806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 51 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24815986 - 24815665
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| | ||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24815986 ggccaaggttgattggatgaaaggagatcttcatggaagcgggagttatcccgtgttgaagacgttattgtgaatacttgtagaactacctaaaattcct 24815887  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgag 250  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |    
T  24815886 agtgtagttgg-gtgcaaggaccttcgagaaggcggaatacattccgatggctgaagaggttaaggtgtgtacttgtggagctacctaaaattcctagcg 24815788  T
Q  251 tagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caa 349  Q
    ||| |||||  |||| ||||||| || |||||||||| ||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  24815787 tag-ttggatgcaagaatcttcacaa-ggcggaaggcgttcggatggttgaacaggt-aaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtggaaagcaa 24815691  T
Q  350 gggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  24815690 gggaaagatcagcatggtggttgatg 24815665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7471031 - 7470663
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||| | || |||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  7471031 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaagaa-gtccaagggtgattggatgcaaagtgatcttcaagggagcaggagatgtcctgtgttg 7470933  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  7470932 aagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaattcctagcatagttgaagtgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaag 7470833  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     ||||||||||    ||||||| |||||||||||| |||   |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  7470832 aggttaaggtgaatgcttgtggtactacctaaaattcctaatgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaagggg 7470734  T
Q  307 tca--gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
      |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  7470733 ctatgaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcatcatggtggttgatg 7470663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 51 - 363
Target Start/End: Original strand, 28486879 - 28487195
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28486879 ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttttggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcct 28486978  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttga 249  Q
     |||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| |     
T  28486979 ggtgtagttggaccgcaaggactcttagagaagacggaagacgttccgatggctgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagc 28487078  T
Q  250 gtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg-tcag-ggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa 346  Q
    |||| |||||| ||||||| |||| | | |||||||   |||||||||| ||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487079 gtag-ttggactacaaggaccttcgagaaggcggaaaatattccgatggctgaaggggtttagaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa 28487177  T
Q  347 -caagggaaagagcagca 363  Q
     |||||||||||||||||    
T  28487178 gcaagggaaagagcagca 28487195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 43813 - 44033
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  43813 gaagaatgtatatcacggcttgcgggattaccctaaaagaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttg 43911  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43912 aagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaagg 44011  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    |||| ||||||  |||||||||    
T  44012 ggttgaggtgtatacttgtgga 44033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1047961 - 1047783
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1047961 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 1047862  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  1047861 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 1047783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 51 - 230
Target Start/End: Original strand, 9679989 - 9680168
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9679989 ggccaagggtgattggatgcatggagaccttcaaggaagcgggagatgtcatgtgttgaacatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaatttct 9680088  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  9680089 agcgtagtctgactgcaaggaccttcgagaaggtggaagacattacgagggccgaaggggttaaggtgtatacttgtgga 9680168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 364
Target Start/End: Original strand, 38395577 - 38395932
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||        |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  38395577 gaagaatgtatagcacggcttgtgggattaccctaaaaaaa-ggccaagcatgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcatgtgttg 38395675  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    |||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| | |||| ||||||||    
T  38395676 aagatgt---ggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagagagaagacgttccgatggctgaag 38395772  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     ||||||||||    ||||||| |||||||||||  ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| |||||||| || ||||  ||    
T  38395773 aggttaaggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaaggg 38395871  T
Q  307 tca--gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 364  Q
    | |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38395872 ttatgaggtgtaaacttgtgaagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaa 38395932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 20298553 - 20298785
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  20298553 gaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctaaaagaa-ggccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttg 20298651  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  20298652 aagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaag 20298751  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaa 241  Q
     ||||||||||    ||||||| |||||||||||    
T  20298752 aggttaaggtgaatgcttgtgggactacctaaaa 20298785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 22136419 - 22136597
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22136419 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgttctgcgttgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 22136518  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  22136519 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 22136597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 40551446 - 40551624
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40551446 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgttctgcgttgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 40551545  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  40551546 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 40551624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 53 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7350324 - 7350147
Alignment:
Q  53 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctag 152  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||    
T  7350324 ccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacctaaaacttctag 7350225  T
Q  153 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||  |||||||||    
T  7350224 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccaagggctgaagggattgaggtgtatacttgtgga 7350147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31156958 - 31156779
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  31156958 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacctaaaactccta 31156859  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  31156858 gtgtagttggactgcaaggactcttcgagagtgcggaagatattccgatggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 31156779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 107 - 331
Target Start/End: Original strand, 20298747 - 20298972
Alignment:
Q  107 tgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctga 205  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  20298747 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctga 20298846  T
Q  206 aggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaaga 304  Q
    || ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| |||||||| || |||||     
T  20298847 agaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaagg 20298945  T
Q  305 ggtcagggtgtaaacttgtggagctac 331  Q
    ||| | |||||  ||||||||| ||||    
T  20298946 ggttaaggtgtgcacttgtggaactac 20298972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1047695 - 1047542
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 321  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1047695 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaactt 1047597  T
Q  322 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1047596 gtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggaggttgatg 1047542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1047771 - 1047587
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  1047771 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 1047672  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  1047671 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 1047587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7350133 - 7349974
Alignment:
Q  54 caagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctag 152  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7350133 caagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctaaaattcctag 7350034  T
Q  153 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
     ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  7350033 cgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 7349974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 229 - 375
Target Start/End: Original strand, 44128 - 44275
Alignment:
Q  229 gaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggag 327  Q
    ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | ||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  44128 gaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggtagacattccgatggctaaagaggttagggtgtaaacttgtggag 44226  T
Q  328 ctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  44227 ctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggatgttgatg 44275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31156767 - 31156583
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| | | |||||||| | ||||||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  31156767 gccaagggtgattgggtacaagtatatcttcaaggaaagcgagagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 31156668  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  31156667 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatgactgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 31156583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7350059 - 7349905
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 320  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  7350059 cttgtagaactacctaaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 7349961  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  7349960 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 7349905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31156691 - 31156538
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 321  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  31156691 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatgactgaagaggttagggtgtaaactt 31156593  T
Q  322 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  31156592 gtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 31156538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 44045 - 44230
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtg-gaactacctaaaattcc 149  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  |||||  ||||||||| |||||||    
T  44045 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtaagaactacctgaaattcc 44144  T
Q  150 tagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    ||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  44145 tagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggtagacattccgatggctaaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 44230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 22136609 - 22136770
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  22136609 gccaagggtgattgggtataagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 22136708  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  22136709 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 22136770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 40551636 - 40551797
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  40551636 gccaagggtgattgggtataagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 40551735  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  40551736 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 40551797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4509753 - 4509627
Alignment:
Q  108 gaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| |  |||||    
T  4509753 gaagaggttatggtgtaggcttgtggaactatctaaaaatcctagtgtagttgga-tgcaaggaacttcaagaaggcggaaggcattccgaagtttgaag 4509655  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
     ||| ||||||   ||||||||||||||    
T  4509654 aggtaaaggtgaaaacttgtggaactac 4509627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4511595 - 4511469
Alignment:
Q  108 gaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| |  |||||    
T  4511595 gaagaggttatggtgtaggcttgtggaactatctaaaaatcctagtgtagttgga-tgcaaggaacttcaagaaggcggaaggcattccgaagtttgaag 4511497  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
     ||| ||||||   ||||||||||||||    
T  4511496 aggtaaaggtgaaaacttgtggaactac 4511469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Original strand, 22136685 - 22136839
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 320  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  22136685 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 22136783  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  22136784 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 22136839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Original strand, 40551712 - 40551866
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 320  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  40551712 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 40551810  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  40551811 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 40551866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 255 - 346
Target Start/End: Original strand, 26214495 - 26214586
Alignment:
Q  255 ttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa 346  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26214495 ttggatacaaggaacttcaaaaaggcggaagtcattctgatggttgaagaggcaagggtggaagcttatggagctacttggtgtagttggaa 26214586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4509734 - 4509627
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 322  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| | |||||| |||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| |||||||    
T  4509734 cttgtggaactatctaaaaatcctagtgtagtt-ggatgcaaggaacttcaagaaggcggaaggcattccgaagtttgaagaggtaaaggtgaaaacttg 4509636  T
Q  323 tggagctac 331  Q
    |||| ||||    
T  4509635 tggaactac 4509627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4511576 - 4511469
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 322  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| | |||||| |||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| |||||||    
T  4511576 cttgtggaactatctaaaaatcctagtgtagtt-ggatgcaaggaacttcaagaaggcggaaggcattccgaagtttgaagaggtaaaggtgaaaacttg 4511478  T
Q  323 tggagctac 331  Q
    |||| ||||    
T  4511477 tggaactac 4511469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6067863 - 6067801
Alignment:
Q  268 tcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctac 331  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  6067863 tcttcaagaaggcggaagacattccgatggttgaagaggt-tgggtggaaacttgtggagctac 6067801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 235
Target Start/End: Original strand, 6431085 - 6431209
Alignment:
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| | |||| ||| |||||||| ||| |||| |  |||||     
T  6431085 aagaggttatggtgtaggcttgcggaactacctaaaa-tcctagtgcagttgga-tgcaagaaacttcaagagggcggaaggcattccgaagtttgaaga 6431182  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    ||| ||||||   ||||||||||||||    
T  6431183 ggtaaaggtgaaaacttgtggaactac 6431209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Original strand, 6431147 - 6431209
Alignment:
Q  269 cttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctac 331  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||    
T  6431147 cttcaagagggcggaaggcattccgaagtttgaagaggtaaaggtgaaaacttgtggaactac 6431209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 268 - 341
Target Start/End: Original strand, 6048268 - 6048340
Alignment:
Q  268 tcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagt 341  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||| | |||||||    
T  6048268 tcttcaagaaggcggaaggcattccgatggttaaagaggt-tgggtggaagcttgtggagctacattgtgtagt 6048340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6067900 - 6067823
Alignment:
Q  137 tacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagga---ccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||| |||| || ||||| ||||    
T  6067900 tacctaaaatttctagtgtagttgga-tgcaaggatggtcttcaagaaggcggaagacattccgatggttgaagaggtt 6067823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22801768 - 22801402
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  22801768 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggaaaccttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttg 22801670  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22801669 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggacattcgagaaggcggaagacattccgagggcagaagg 22801570  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22801569 ggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaataccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggat 22801470  T
Q  309 agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22801469 agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggaggttgatg 22801402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14788429 - 14788063
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14788429 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttg 14788331  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14788330 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagatggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgaggtctgaagg 14788231  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  14788230 ggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgcctttagtagtttagacacaaggatctacaaaagggcggaagacattccgatggttgaagaggtt 14788131  T
Q  309 agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  14788130 agggtgtaaacttgtgaaactacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcttggtggttgatg 14788063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36920529 - 36920165
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  36920529 gaagaatgtatagcacagcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcaggagatgtcctgtgttg 36920431  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||    
T  36920430 aagagattatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgatggttgaagg 36920331  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc 308  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36920330 ggataaggtgtgcacttgtggaactacct-aaattccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtt 36920232  T
Q  309 agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36920231 agggtgtaaacttgtggagctacttagtatagtgagaagcaagggaaagagcagcaaggtggttgat 36920165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 364
Target Start/End: Original strand, 24879849 - 24880203
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||  |  |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  24879849 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccgtaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtaatattca-ggaagcgggagatgtcctgtgttg 24879946  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| ||||     
T  24879947 aagatgttatgatgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagagtagttggactgcaaggaccttcgagaaggtggaagacattctgaaggcagaaga 24880046  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24880047 gattaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttgaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtt 24880146  T
Q  309 agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| |||||||||    
T  24880147 agggtgtaaacttgtggagctacttggtgcagtggaaagcaaaggaaggagcagcaa 24880203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 51 - 382
Target Start/End: Original strand, 47564134 - 47564466
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47564134 ggccaagggtgattggatgcaaggaaattttcaaggaagcgggaaatgtattgtgttgaagaggttatggtgaatgcttgtgaaactacctaaaattcct 47564233  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgag 250  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  47564234 agcgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaaaatattctgatggctgaaggggttaaggtgtgtagttgtggaacttactaaaattccttgag 47564333  T
Q  251 tagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caa 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  47564334 tagtttggacacaaggatcttcaaaagggaggaagacattccgatggttgaagaggttatggtgtaaactcgtggagctacttggtgtagtggaaagcaa 47564433  T
Q  350 gggaaagagcagcaaggtagttgatggtttggc 382  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47564434 gggaaagagcagcaaggtggttgatggcttggc 47564466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 127 - 375
Target Start/End: Original strand, 5100454 - 5100701
Alignment:
Q  127 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttg 226  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |  | ||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  5100454 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaagcatat-cgaaaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtttaggtgtgcacttg 5100552  T
Q  227 tggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtgga 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  5100553 tggaactacctaaa-tgccttgagtagtttggacacaaagatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggttagggtgtaaacttgtgaa 5100651  T
Q  327 gctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  5100652 gctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcatggtggttgatg 5100701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12396811 - 12396439
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||  ||||||||||||| ||    
T  12396811 gaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgtaaggtgatcttcaaggaagcatgagatgtcctgtggtg 12396713  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| | |||| ||||||||    
T  12396712 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactgcctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttagagaagacgaaagacgttccgatggctgaag 12396613  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||| ||||| ||| | ||    
T  12396612 aggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtttag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattcagatggctgacgggg 12396514  T
Q  307 tcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 380  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12396513 ttagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggtgattgatggtttg 12396439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12401753 - 12401381
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||  ||||||||||||| ||    
T  12401753 gaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgtaaggtgatcttcaaggaagcatgagatgtcctgtggtg 12401655  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| | |||| ||||||||    
T  12401654 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactgcctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttagagaagacgaaagacgttccgatggctgaag 12401555  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||| ||||| ||| | ||    
T  12401554 aggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtttag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgatggctgacgggg 12401456  T
Q  307 tcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 380  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12401455 ttagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggtgattgatggtttg 12401381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 367
Target Start/End: Original strand, 16454642 - 16455000
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16454642 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttg 16454740  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || | |||| ||||||||    
T  16454741 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactctttgagaaggcggaaaacgttccgatggctgaag 16454840  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     ||||||||||     ||||||||||||||||||| | | | |||| ||||||  |||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||  ||||| ||    
T  16454841 aggttaaggtgaatgtttgtggaactacctaaaattcttagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcagaagacattccgatgactgaag-gg 16454938  T
Q  307 tcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggt 367  Q
    | | |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  16454939 ttaaggtgaaaacttgtggagctacttggtgtagtagaaagcaagggaaagagcagcaaggt 16455000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 57 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9175138 - 9174965
Alignment:
Q  57 gggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgta 156  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9175138 gggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaattcctagtgta 9175039  T
Q  157 gttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9175038 gttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaaggggttaaggtgtatacttgtgga 9174965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 53 - 375
Target Start/End: Original strand, 36379797 - 36380119
Alignment:
Q  53 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctag 152  Q
    ||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||  |  ||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  36379797 ccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgttctgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaattacttgaaattcctag 36379896  T
Q  153 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagta 252  Q
    ||||||| |  | |||||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||    
T  36379897 tgtagtttggatacaaggatcttcgagaaggcagaagacattccgatagctaaagaggttaaggtgtgtacttgtggagctacctaaaattcctagcgta 36379996  T
Q  253 gtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagg 351  Q
    ||  | |  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36379997 gtgcgaag-caagagtcttcaaaaggacggaaggcattccgatggttgaagaggttaggttgtaaacttgtggagctacttggtctagtgggaagcaagg 36380095  T
Q  352 gaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  36380096 gaaagagcagcatggtggttgatg 36380119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 53 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22045387 - 22045210
Alignment:
Q  53 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctag 152  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22045387 ccaagggtgattgaatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcggtgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctag 22045288  T
Q  153 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  22045287 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 22045210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 36379563 - 36379783
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  36379563 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattgaatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcttgtgttg 36379661  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||| |||| ||||    
T  36379662 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattgccagcgtagttggactgcaaggaccttcgagaagacggaaatcattccgatggctaaagg 36379761  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  36379762 ggttaaggtgtatacttgtgga 36379783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16932821 - 16932659
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16932821 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 16932722  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtta 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  16932721 gtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagtggtta 16932659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22781410 - 22781231
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22781410 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 22781311  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||  |||||||||    
T  22781310 gtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagggattgaggtgtatacttgtgga 22781231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18535619 - 18535386
Alignment:
Q  128 ttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgt 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | || |    
T  18535619 ttgtgaaactacctaaaattcctagtgt----ggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaaggggttaaggtgtgtattttt 18535524  T
Q  228 ggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggag 327  Q
    | | |||||||||||  || | |||| |||||  |||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18535523 gaacctacctaaaatttctagtgtag-ttggatgcaagaatcttcaaga-ggcggaaggcattccaatggctgaagaggt-aaggtgtaaacttgtggag 18535427  T
Q  328 ctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggt 367  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18535426 ctacatgatgtagtgggaagcaaggaaaagagcagcaaggt 18535386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11007239 - 11007062
Alignment:
Q  54 caagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagt 153  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| | |  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11007239 caagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaaccaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacctaaaactcctagt 11007140  T
Q  154 gtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | || |||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  11007139 gtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagatattctgatggctgaagtggttgaggtgtatacttgtgga 11007062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 219
Target Start/End: Original strand, 5100196 - 5100363
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5100196 gccaagagtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgttgaactacctaaaataccta 5100295  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgt 219  Q
    |  || || || ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  5100296 gcataattagattgcaaggaccttcgagaagacacaagatattccgagggctgaagggattaaggtgt 5100363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3825331 - 3825222
Alignment:
Q  107 tgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaa 206  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3825331 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcatagtatagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctgaa 3825232  T
Q  207 ggggttaagg 216  Q
    ||| ||||||    
T  3825231 gggtttaagg 3825222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18535798 - 18535544
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaa-------ctacctaaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||       |||| ||||    
T  18535798 gccaagggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagtgggagatgtcccgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaatgtggaactacataaa 18535699  T
Q  145 attcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgc 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| | |||| |||||||| ||||||| ||   | ||||| ||||||||||||| |    
T  18535698 attcctagtgtagttggactgcaaggctcttctagaacgcggaagacgtcccgatggctgaagaggttaagatggatatttgtgaaactacctaaaattc 18535599  T
Q  245 cttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaag 303  Q
    |     |||| ||||| ||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  18535598 c-----tagtgtggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaag 18535544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22133296 - 22133071
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||  || |||    
T  22133296 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattatcctaaaagaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtctcgtattg 22133198  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    |||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||   || ||||||||     
T  22133197 aagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattttgatggctgaaga 22133098  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  22133097 ggttagggtgtaaacttgtggagctac 22133071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 223 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 22133179 - 22133021
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 321  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22133179 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattttgatggctgaagaggttagggtgtaaactt 22133081  T
Q  322 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22133080 gtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggtggttgatggtttg 22133021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3825420 - 3825167
Alignment:
Q  115 ttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtta 213  Q
    |||||||||||||| || ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||    
T  3825420 ttatggtgaatgctcgtagaactatataaatctcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaagaggtta 3825321  T
Q  214 aggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--g 310  Q
    |||||    |||||||||||||||||||| | | |  ||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||| || || ||||| | | |  |    
T  3825320 aggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcatagtatag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctgaagggtttaagg 3825222  T
Q  311 ggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 364  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  3825221 ggtgtaaacttgtggagttacttggtgtagcaggaagcaagggaaagagcagcaa 3825167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22045122 - 22044969
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 321  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22045122 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaactt 22045024  T
Q  322 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22045023 gtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcaacaaggtggttgatg 22044969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22045198 - 22045014
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  22045198 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 22045099  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  22045098 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 22045014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3577850 - 3577620
Alignment:
Q  105 gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcg---agaaggcggaagacataccgaggg 201  Q
    |||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||   |||   |||||||||||| | | | || ||    
T  3577850 gttgaagaggttatggtgtagactcgtggaactacctacaatttctagtgtagttgga-tgcaaggatgatcgtcaagaaggcggaaggccttcagatgg 3577752  T
Q  202 ctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaag---gatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggt 298  Q
    || ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  ||||   ||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  3577751 cttaagaggttatggtgtagacttgtggaactacctaaaattcctagtgtag-ttggatgcaaggatgatcttcaagaagtcggaaggcattccgatggt 3577653  T
Q  299 tgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctac 331  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  3577652 tgaagaggttatggtgtagacttgtggaactac 3577620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 161
Target Start/End: Original strand, 10114219 - 10114328
Alignment:
Q  53 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtg-ttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||| || | ||| ||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  10114219 ccaagggtgattggatggaaggagatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagaggttatggtatatacttgtggaactacctaaaattccta 10114318  T
Q  152 gtgtagttgg 161  Q
    ||||||||||    
T  10114319 gtgtagttgg 10114328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16932628 - 16932444
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||   | ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  16932628 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcatattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 16932529  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    || ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  16932528 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaagacggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 16932444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16932552 - 16932399
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 321  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | | |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16932552 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaagacggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaactt 16932454  T
Q  322 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  16932453 gtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 16932399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3577748 - 3577613
Alignment:
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaag---gaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctga 205  Q
    |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||| ||||| |||||| ||| |||| || |||    
T  3577748 aagaggttatggtgtagacttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgga-tgcaaggatgatcttcaagaagtcggaaggcattccgatggttga 3577650  T
Q  206 aggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaat 242  Q
    || ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||    
T  3577649 agaggttatggtgtagacttgtggaactaccaaaaat 3577613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22781219 - 22781057
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  22781219 gccaagggtgattgagtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 22781120  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggc-ggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    || ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  22781119 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcgggaagacattccgatggctgaagaggtt 22781057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9174953 - 9174792
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||  ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  9174953 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagctggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 9174854  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    || ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  9174853 agcgtagttggactccaagcatcttcgagaaggcagaagacattccgatggctgaagaggtt 9174792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11007050 - 11006865
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  11007050 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 11006951  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt-aaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    || ||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  11006950 agcgtagttgaactacaagcatcttcgagaaggcagaagatattccgatggctgaagaggttgaaggtgtaaacttgtggagctac 11006865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3577557 - 3577453
Alignment:
Q  105 gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagga---ccttcgagaaggcggaagacataccgaggg 201  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  3577557 gttgaagaggttatggtgtagacttatggaactacctaaaattcctagtgtagttgga-tgcaaggattgtcttcaagaaggcggaagacattccgatgg 3577459  T
Q  202 ctgaag 207  Q
     |||||    
T  3577458 ttgaag 3577453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 281 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22781084 - 22780997
Alignment:
Q  281 ggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaagg 366  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  22781084 ggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaacttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaagg 22780997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9174818 - 9174753
Alignment:
Q  282 gaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa 346  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9174818 gaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaacttgtggagctacttggagtagtgggaa 9174753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 207
Target Start/End: Original strand, 26559263 - 26559415
Alignment:
Q  54 caagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgt-gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctag 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| || |||| |||||||| | | ||||| || ||| || |||||||||||||| ||||    
T  26559263 caagggtgattggatgcaaggagatcttcacggaagcgggagacgttctgtggttgaagaggatttggtgtatacttatgaaactacctaaaatt-ctag 26559361  T
Q  153 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||| |||| |||||| | | |  |||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  26559362 tgtagctgga-tgcaagaatcattaagaaggcgaaaaacattccgagggttgaag 26559415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3577925 - 3577718
Alignment:
Q  128 ttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaag---gaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcact 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||   || |||| ||||||| |||| ||| |||| || ||||| ||||| |||||  |||    
T  3577925 ttgtggaactacttaaaattcctagtgtacttgga-tgcaaggatgatcttcaagaaggcagaaggcattccgacggttgaagaggttatggtgtagact 3577827  T
Q  225 tgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaag---gatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 321  Q
     ||||||||||||| |||  || | |||| |||||  ||||   |||| |||| | |||||||||| ||| ||||| | ||||||| | |||||| ||||    
T  3577826 cgtggaactacctacaatttctagtgtag-ttggatgcaaggatgatcgtcaagaaggcggaaggccttcagatggcttaagaggttatggtgtagactt 3577728  T
Q  322 gtggagctac 331  Q
    ||||| ||||    
T  3577727 gtggaactac 3577718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3577654 - 3577451
Alignment:
Q  105 gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcg--agaaggcggaagacataccgagggc 202  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||   ||   ||||||  |||  ||| | || ||     
T  3577654 gttgaagaggttatggtgtagacttgtggaactaccaaaaattcctagtgtatttcga-tgcaaggatggtcttaagaaggaagaatgcattctgatggt 3577556  T
Q  203 tgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggat---cttcaaaagggcggaaggcattccgatggtt 299  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||| | |||||| |||  |||||||   |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  3577555 tgaagaggttatggtgtagacttatggaactacctaaaattcctagtgtagtt-ggatgcaaggattgtcttcaagaaggcggaagacattccgatggtt 3577457  T
Q  300 gaagag 305  Q
    ||||||    
T  3577456 gaagag 3577451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 35371436 - 35371380
Alignment:
Q  105 gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgg 161  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  35371436 gttgaagatgttatggtgtaaacttgtggaactacctaaaagtcctagtatagttgg 35371380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11006909 - 11006820
Alignment:
Q  288 attccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  11006909 attccgatggctgaagaggttgaaggtgtaaacttgtggagctacttggaatagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 11006820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12740306 - 12740219
Alignment:
Q  53 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgt-gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactac 139  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| || | || |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||    
T  12740306 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgtatacttgtggagctac 12740219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12748512 - 12748425
Alignment:
Q  53 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgt-gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactac 139  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| || | || |||||||||| | ||||| || |||||||| ||||    
T  12748512 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagatggtttggtgtatacttgtggagctac 12748425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 162
Target Start/End: Original strand, 54882237 - 54882290
Alignment:
Q  108 gaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgga 162  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54882237 gaagaagttatggtgtagtcttgtggaactacctaaaa-tcctagtgtagttgga 54882290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 380
Target Start/End: Original strand, 35178 - 35547
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  35178 gaagaatgtacagcacggcttgcgggattaccctaaaaaag-ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaaacgggagatgtcctgtgttg 35276  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35277 aagaggttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaatacctagcgtagttagactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaagg 35376  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  35377 ggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaattcctttagtattttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcatttcgatggttgaagaggtt 35476  T
Q  309 agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 380  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35477 a-ggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtaggaacaagggaaagagcagcaaggtggttgatggtttg 35547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 51 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 28202316 - 28202002
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28202316 ggccaagggtgattggatgcaagaagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaaaatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 28202217  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgag 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28202216 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgtgggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgag 28202117  T
Q  251 tagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caa 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28202116 tagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattctgatggttgaagaggttagggtgtaaccttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaa 28202017  T
Q  350 gggaaagagcagcaa 364  Q
    |||||||||| ||||    
T  28202016 gggaaagagctgcaa 28202002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 71 - 375
Target Start/End: Original strand, 6996871 - 6997172
Alignment:
Q  71 aaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagg 170  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996871 aaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtaaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagg 6996970  T
Q  171 accttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatct 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996971 accttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatct 6997070  T
Q  271 tcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtag 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  6997071 tcaaaagggcggaaggcattccgatgg----agaggttagggtgtaaacttgtgaagcaacttggtatagtgggaagcaaggtaaagagcagcacggtgg 6997166  T
Q  370 ttgatg 375  Q
    ||||||    
T  6997167 ttgatg 6997172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 70 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50077540 - 50077235
Alignment:
Q  70 caaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaag 169  Q
    |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| || |||| ||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50077540 caagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtatttaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctaaaattcctagcgtagttggactacaag 50077441  T
Q  170 gaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatc 269  Q
    || |||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50077440 gatcttcgagaagacggaagacatttcgatggctaaagaggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaattccttgagtagtttggacacaaggatc 50077341  T
Q  270 ttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcagcaaggtag 369  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  50077340 ttcaaaagggcggaaggcatttcgatggttgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaataagggaaagagcagcaaggtgg 50077241  T
Q  370 ttgatg 375  Q
    ||||||    
T  50077240 ttgatg 50077235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 52 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31423800 - 31423478
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||||||   ||||  || |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||  |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  31423800 gccaagggtgattgggcacaagtggatcttcaaggaagcgggagatgtcttgtgttgaagaagt-atggtatagtcttgtagaactacctaaaattccta 31423702  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagt 251  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31423701 gcgtagttggactacaaggatcttcgagaatgtggaagacattccgatggctgaagaggttaaggtgtgtacttgtggaactacctaaaattccttgagt 31423602  T
Q  252 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagg 351  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||     
T  31423601 agtttggacacaaagatcttcaaaagggcggaagacattccgatggttaaagaggttaaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtagaatcaaga 31423502  T
Q  352 gaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||| ||| |||||||    
T  31423501 gaaagagcagcatggtggttgatg 31423478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 107 - 366
Target Start/End: Original strand, 25127283 - 25127544
Alignment:
Q  107 tgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaa 206  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || | ||    
T  25127283 tgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaagaccttcgagaaggcggaagacattccaatggttaaa 25127382  T
Q  207 ggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtag-tttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagag 305  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25127383 ggggttaaggcgtgtacttgtggaactacgcaaaattccttgagtagttttggacacaaggatcttcaaaagggcgaaaggcattccgatggttgaagag 25127482  T
Q  306 gtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaagg 366  Q
    || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  25127483 gttagggtgtaaacttgtgaagctacatggtgtagtgggaagcaagggaaaaaacagcaagg 25127544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14098921 - 14098565
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14098921 gaagaatgtatagcatggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttg 14098823  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | |||| |||| ||     
T  14098822 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaaacggaagacgttccgatggctaaaa 14098723  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     ||||||||||     |||| |||||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  14098722 aggttaaggtgaatgtttgtagaactacctaaaattcctagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagggg 14098624  T
Q  307 tcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 364  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14098623 ttagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagtgaaagagcagcaa 14098565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 52 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 25249416 - 25249086
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||| || ||| |  |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  25249416 gccaagggtgattgggcacaagtagatcgtcaaggaagcaggagatgtcctgtgttgaagaagt-atgatatagtcttgtagaactacctgaaattccta 25249318  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagt 251  Q
    |||||||| |  | |||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25249317 gtgtagtttggatacaaggatcttcaagaagacggaagacattccgatggctgaagaggttaaggtgtgtaattgtggaactacctaaaattccttgagt 25249218  T
Q  252 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caag 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25249217 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattctgatgattgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtactgggaagcaag 25249118  T
Q  351 ggaaagagcagcaaggtagttgatggtttggc 382  Q
    | |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  25249117 gaaaagagtagcaaggtggtcgatggtttggc 25249086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31736526 - 31736157
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  31736526 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattactctaaaagaa-ggccaagggtgataggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttg 31736428  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  31736427 aagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaag 31736328  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     ||||||||||    ||||||| |||||||||||| |||   |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  31736327 aggttaaggtgaatgcttgtgggactacctaaaattcctaacgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaagggg 31736229  T
Q  307 tca--gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    | |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31736228 ttatgaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtaatgggaagcaagggaaagagcagcatggtggttgatg 31736157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 16430232 - 16430448
Alignment:
Q  11 agaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaa 110  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16430232 agaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaa 16430330  T
Q  111 gatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagggg 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||    
T  16430331 gaggttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtagttagactgcaaggaccttcgagaaggcggaacacattctgatggctgaagggg 16430430  T
Q  211 ttaaggtgtgcacttgtg 228  Q
    |||||||||| |||||||    
T  16430431 ttaaggtgtgtacttgtg 16430448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31424019 - 31423812
Alignment:
Q  21 gcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatgg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31424019 gcacggcttgcgggattaccctaaaaaa--ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagagattatgg 31423922  T
Q  121 tgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  31423921 tgaatgcttgtggaactacctaaaatttctagtgtagttggactgtaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttatggtgtg 31423822  T
Q  221 cacttgtgga 230  Q
     |||||||||    
T  31423821 tacttgtgga 31423812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27337844 - 27337639
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  27337844 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaagaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttg 27337746  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  27337745 aagatgttatggtgaatgcttgtaggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaga 27337646  T
Q  209 ggttaag 215  Q
    |||||||    
T  27337645 ggttaag 27337639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 51 - 211
Target Start/End: Original strand, 28841963 - 28842123
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28841963 ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttgaagatgttatggtgtacgcttgtggaactacctaaaattcct 28842062  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28842063 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggt 28842123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 50077746 - 50077570
Alignment:
Q  54 caagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagt 153  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50077746 caagggtgattggatgcaaggtggccttcaaggaagcgggagatgtcccgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagc 50077647  T
Q  154 gtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  50077646 gtagttggattgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctgaaggggttaaagtgtatacttgtgga 50077570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25249607 - 25249428
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25249607 ggccaagggtgattggatgcaagatgatcttcaaagaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 25249508  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  25249507 agcgtagttggactgcaacgaccttcgagaaggtgaaagacattccgagggctgaagggtttaaggtgcgtacttgtgga 25249428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 255
Target Start/End: Original strand, 25127089 - 25127335
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||        |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  25127089 gaagaatgtatagcacggcttgtgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtaattggatggaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctttgttg 25127187  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  25127188 aagatgttatggtgaatgattgtggaactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcaagaaggcggaagacgttccgatggctgaag 25127287  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtt 255  Q
     ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  25127288 aggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagtt 25127335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 53 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13126359 - 13126036
Alignment:
Q  53 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtg-ttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| || | ||||||| | ||| ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||    
T  13126359 ccaagggtgattagatgcaaggagatcttcaaggaaggg-gagatgttccgtggttgaagaggttatggtgtagacttgtggaactacctaaaattctta 13126261  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagt 251  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| | ||    
T  13126260 gtgtagttgga-tgcaaggatcttcgacaaggcggaagacattctgatggctgaagaggttaaggtgtagacttgcggaactacctaaaattcctagcgt 13126162  T
Q  252 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caag 350  Q
    || ||| |  ||||||||||||| | || |||||| | || |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  13126161 ag-ttgcatgcaaggatcttcaagaaggtggaaggaaatctgatggttgaagaggt-tgggtggaaacttgtggagctacatggtgtaatgggaagcaag 13126064  T
Q  351 ggaaagagcagcaaggtagttgatggtt 378  Q
    |||||||||  ||||||  |||||||||    
T  13126063 ggaaagagcgtcaaggtgattgatggtt 13126036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 375
Target Start/End: Original strand, 8954014 - 8954335
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||| | |||||||||    
T  8954014 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgttctgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacgtgaaattccta 8954113  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagt 251  Q
     ||||||| |  | ||||||  || ||||||| |||||||||  ||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | ||    
T  8954114 ttgtagtttggatacaaggatttttgagaaggtggaagacatttcgatgactgaagaggttaaggtgtgtacttgtggagctacctaaatttcctagtgt 8954213  T
Q  252 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caag 350  Q
    || |||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8954214 ag-ttggaagcaagaatcttcaaaa-ggcggaaggcattccaatggttgaagacgt-aaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaag 8954310  T
Q  351 ggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  8954311 ggaaagagcagcaaggtggttgatg 8954335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 219
Target Start/End: Original strand, 51751644 - 51751811
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  51751644 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtagaactacctgaaattccta 51751743  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgt 219  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  51751744 gcgtagttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaaggggttgaggtgt 51751811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 20301696 - 20301914
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||  ||  |||    
T  20301696 gaagaatgtatagcacggcttgcggaattaccctaaaagaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatctttaaggaagcgggagatgttttgcattg 20301794  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20301795 aagatgttatggtgaatgcttgtgggactaactaaaattcctagcgtagttgggctgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaagg 20301894  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtg 228  Q
    |||||||||||  |||||||    
T  20301895 ggttaaggtgtatacttgtg 20301914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 47178969 - 47179147
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  47178969 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacctaaaactccta 47179068  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  47179069 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagtggttgaggtgtatacttgtgga 47179147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 213
Target Start/End: Original strand, 16227774 - 16227936
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16227774 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 16227873  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtta 213  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || | || |||||||| |||||    
T  16227874 gtgtagttggactacaaggactcttcgagaaggcggaagatattctgatggctgaagtggtta 16227936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 127 - 367
Target Start/End: Original strand, 16430537 - 16430775
Alignment:
Q  127 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttg 226  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| || |  | |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||| |||||    
T  16430537 cttgtagaactacctgaaattcctagtgtaatttggatacaaggatcttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagaggttaaggtgtgtacttg 16430636  T
Q  227 tggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtgga 326  Q
    |||| ||||||||||| ||| |  ||| | |||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||| || | || |||||||||||||    
T  16430637 tggagctacctaaaattcctagcatag-tgggaagcaagaatcttc-aaagggcggaaggaattccaatggtttaagacgt-aaggagtaaacttgtgga 16430733  T
Q  327 gctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggt 367  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16430734 gctacttggtgtagtgggaaccaagggaaagagcagcaaggt 16430775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8347986 - 8347873
Alignment:
Q  262 caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagca 360  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8347986 caagaatcttcaaatgggcggaaggcattccgatggttgaagaggt-ttggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagca 8347888  T
Q  361 gcaaggtagttgatg 375  Q
    ||| ||| |||||||    
T  8347887 gcatggtggttgatg 8347873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 215
Target Start/End: Original strand, 20301928 - 20302092
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  20301928 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 20302027  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaag 215  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  20302028 agcgtagttggactacaaggatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttaag 20302092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 209 - 378
Target Start/End: Original strand, 155220 - 155388
Alignment:
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  |||  |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  155220 ggttaaggtgtacacttgtggaactacctaaaattcctagtgtag-ttggatgcaataatctccaagaaggcagaaggcattccgatggttgaagaggt- 155317  T
Q  309 agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagt-gggaacaagggaaagagcagcaaggtagttgatggtt 378  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  155318 tgggtggaaacttgtggagctacatggtgtagtggggagcaagggaaagggcaccgaggtggttgatggtt 155388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 213
Target Start/End: Original strand, 51751834 - 51751996
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||| ||||||||| | |||| ||| |||||||| | | | ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  51751834 gccaatggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagtgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaatttct 51751933  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtta 213  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  51751934 agcgtagttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctgaaggggtta 51751996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Original strand, 20302004 - 20302159
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagg--gtgtaaac 319  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| |||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||    
T  20302004 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaaggatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttaagaggtgtaaac 20302102  T
Q  320 ttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20302103 ttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggatgttgatg 20302159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27337672 - 27337585
Alignment:
Q  278 ggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagg--gtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcagca 363  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337672 ggcggaagacattccgagggctgaagaggttaagaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcagca 27337585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13548257 - 13548075
Alignment:
Q  53 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtg-ttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||| |||||||||  || |||||||| |||| |||| || |  || ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  13548257 ccaagggtgatcggatgcaagatgatcttcaaggaagcgggagacgttccatggttgaagaggttatggtgtaggcttgtggaactacctaaaaatccta 13548158  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    || |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||| |  ||||  ||| ||||||   ||||||||||||||    
T  13548157 gtttagttgga-tgcaaggaacttcaagagggcggaaggcattccgaagtttgaaaaggtaaaggtgaaaacttgtggaactac 13548075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 210 - 375
Target Start/End: Original strand, 28842026 - 28842194
Alignment:
Q  210 gttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggaca-caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc 308  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||  |||||| |||| | | |||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  28842026 gttatggtgtacgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagtt-ggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggtc 28842124  T
Q  309 agg--gtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    | |  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  28842125 atgaggtgttaacttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaatagcagcaaggaggttgatg 28842194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 16227967 - 16228128
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcag-cgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |  || ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  16227967 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaaacgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 16228066  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  16228067 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagaaattccgatggctgaagaggtt 16228128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 207
Target Start/End: Original strand, 47179235 - 47179315
Alignment:
Q  127 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  47179235 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaag 47179315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Original strand, 16228043 - 16228197
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 320  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | ||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  16228043 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagaaattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 16228141  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  16228142 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 16228197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Original strand, 47179235 - 47179389
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 320  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  47179235 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaagttgagggtgtaaact 47179333  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  47179334 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 47179389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31928788 - 31928662
Alignment:
Q  108 gaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||   |||||| |||  |||||  |||||    
T  31928788 gaagaggttatggtgtaggcttgtggaactacctaaaaatcctagtgtagttgga-tgcaaggaacttcaagagatcggaaggcatttcgaggtttgaag 31928690  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
     ||| ||||||   ||||||||||||||    
T  31928689 aggtaaaggtgaaaacttgtggaactac 31928662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Original strand, 51752000 - 51752065
Alignment:
Q  311 ggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  51752000 ggtgtaaacttgtggagatacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggaggttgatg 51752065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 235
Target Start/End: Original strand, 19753623 - 19753749
Alignment:
Q  108 gaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||||| ||| |||| |  |||||    
T  19753623 gaagaggttatggtgtaggcttgtgtaactacctaaaaatcctagtgtagttgga-tgcaagtaacttcaagagggcggaaggcattccgaagtttgaag 19753721  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
     ||| ||||||   | ||||||||||||    
T  19753722 aggtaaaggtgaaaaattgtggaactac 19753749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 330
Target Start/End: Original strand, 10742262 - 10742329
Alignment:
Q  262 caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagcta 330  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  10742262 caaggatcttcaagaaggcgaaaggcattccgatggttgaagaggt-tgggtggaaatttgtggagcta 10742329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13548182 - 13548075
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 322  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |  ||||| |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||| | |||| |||||||    
T  13548182 cttgtggaactacctaaaaatcctagtttagtt-ggatgcaaggaacttcaagagggcggaaggcattccgaagtttgaaaaggtaaaggtgaaaacttg 13548084  T
Q  323 tggagctac 331  Q
    |||| ||||    
T  13548083 tggaactac 13548075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 228 - 324
Target Start/End: Original strand, 41141279 - 41141374
Alignment:
Q  228 ggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtg 324  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||| || || ||||||    
T  41141279 ggaactacctaaaattcctggtgtagtt-ggatgcaaggatcttcaagagggcagaaggcattccgaggtttgaagaggtaaggatggaagcttgtg 41141374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 162
Target Start/End: Original strand, 155234 - 155269
Alignment:
Q  127 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgga 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155234 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgga 155269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 28997386 - 28997281
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |  |||||  |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  28997386 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcctatgttgaagaag-catggtatagtcttgtagaactacctaaaattccta 28997288  T
Q  152 gtgtagt 158  Q
    | |||||    
T  28997287 gcgtagt 28997281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 29003102 - 29002997
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |  |||||  |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  29003102 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcctatgttgaagaag-catggtatagtcttgtagaactacctaaaattccta 29003004  T
Q  152 gtgtagt 158  Q
    | |||||    
T  29003003 gcgtagt 29002997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 331
Target Start/End: Original strand, 19753642 - 19753749
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 322  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| | |||||| |||  |||| | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| ||| |||    
T  19753642 cttgtgtaactacctaaaaatcctagtgtagtt-ggatgcaagtaacttcaagagggcggaaggcattccgaagtttgaagaggtaaaggtgaaaaattg 19753740  T
Q  323 tggagctac 331  Q
    |||| ||||    
T  19753741 tggaactac 19753749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31928769 - 31928662
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 322  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||| |||  |||||| |||||| ||  ||||||||||| ||| | |||||||||| | |||| |||||||    
T  31928769 cttgtggaactacctaaaaatcctagtgtagtt-ggatgcaaggaacttcaagagatcggaaggcatttcgaggtttgaagaggtaaaggtgaaaacttg 31928671  T
Q  323 tggagctac 331  Q
    |||| ||||    
T  31928670 tggaactac 31928662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 200
Target Start/End: Original strand, 41141279 - 41141346
Alignment:
Q  132 ggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagg 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||    
T  41141279 ggaactacctaaaattcctggtgtagttgga-tgcaaggatcttcaagagggcagaaggcattccgagg 41141346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 212
Target Start/End: Original strand, 10742240 - 10742308
Alignment:
Q  143 aaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| ||| |||| || ||||| ||||    
T  10742240 aaattcctagtgtagttgga-tgcaaggatcttcaagaaggcgaaaggcattccgatggttgaagaggtt 10742308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 51301 - 51667
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  51301 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttg 51399  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  51400 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagatggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgaggtctgaagg 51499  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  51500 ggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgcctttagtagtttagacacaaggatctacaaaagggcggaagacattccgatggttgaagaggtt 51599  T
Q  309 agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  51600 agggtgtaaacttgtgaaactacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcttggtggttgatg 51667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20504863 - 20504507
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||         |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  20504863 gaagaatgtatagcacggcttacgggattacccttaaaaaaatgccaagggggattggatgcaaggagacctttaaggaagcgggagatgtcctgtgttg 20504764  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||     
T  20504763 aagaggttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggaggaagacattctgatggctgaaga 20504664  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc 308  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20504663 ggttaaggtgcgtacttgtggaacaacccaaaattccttgagtagtttagacacaagaatcttcaaatgggcggaaggcattccgatggttgaagaggtt 20504564  T
Q  309 agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||||    
T  20504563 agggtgtaaacttgtggagctacttggcgtagtgcgaagcaagggagagagtagcaa 20504507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 364
Target Start/End: Original strand, 659301 - 659658
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  659301 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttg 659400  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  659401 aagatgttatggtgaatgtttgtggaactacctaaaactcctagtgtagttggactacaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaag 659500  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  659501 aggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggttgaagggg 659599  T
Q  307 tcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 364  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  659600 ttaaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaatggaaagagcagcaa 659658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 107 - 365
Target Start/End: Original strand, 20044448 - 20044706
Alignment:
Q  107 tgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaa 206  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  20044448 tgaagaggttaaagtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctggtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagtcattccgatggctgaa 20044547  T
Q  207 ggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  20044548 ggggttaaggtgtgtacttttggaactacctaaaaatacttgagtagtttgggcacaaggatcttcaaaagggcggaa-gcattccgttggttgaaaagg 20044646  T
Q  307 tcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaag 365  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20044647 ctagggtataaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaag 20044706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41587003 - 41586783
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41587003 gaagaatgtacagcacggcttgtgggattactctaaaaaga-ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttg 41586905  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41586904 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaagg 41586805  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  41586804 ggttaaggtgtgtacttgtgga 41586783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 27911715 - 27911935
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  27911715 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaactgggagatgtcctgtgttg 27911813  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27911814 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttagactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaagg 27911913  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  27911914 ggttaaggtgtatacttgtgga 27911935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31466906 - 31466558
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||    
T  31466906 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaa--ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaagaaagtgggagatgtcctgtgttg 31466809  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||| |||    
T  31466808 aagatttcatggtgaatgcttgtggaactacataattctcctagtgtagttggactacaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctaaag 31466709  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     ||||||||||    |||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  31466708 aggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctattgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagggg 31466610  T
Q  307 tcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaaga 357  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31466609 ttagggtgtaaatttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaaga 31466558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Original strand, 20044254 - 20044548
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20044254 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggtcaagggtgattggatgcaaggaaaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttg 20044352  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||    
T  20044353 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaacttctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagacattttgatggctgaag 20044452  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaag 303  Q
     |||||| |||    |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  20044453 aggttaaagtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctggtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagtcattccgatggctgaag 20044548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18510409 - 18510189
Alignment:
Q  10 aagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttga 109  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  18510409 aagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggaggcaaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgcgttga 18510311  T
Q  110 agatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18510310 agatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaatacctagcgtagttagactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaaggg 18510211  T
Q  210 g-ttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    | |||||||||  |||||||||    
T  18510210 gtttaaggtgtatacttgtgga 18510189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 6746636 - 6747005
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||| ||||    
T  6746636 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaagaa-gaccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaagaagcaggagatgtcctgcgttg 6746734  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  6746735 aagatgttgtggtgaatgcttgtgggactacctaaaaatcctagcgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaag 6746834  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     |||||| |||    |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||   ||||| |||| | | |||||||| ||||| || || ||||| ||    
T  6746835 aggttaaagtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtag-ttggactgtaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctgaagggg 6746933  T
Q  307 tca--gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    | |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  6746934 ttaagaggtgtaaacttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcaacaaggaggttgatg 6747005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 18468287 - 18468656
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||        |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||  |||    
T  18468287 gaagaatgtatagcacggcttgcaggattaccctaaaagaa-ggccaagggtgattagatgcaaggtgatcttcaaggaagcgagagatgttttgcattg 18468385  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | |||| ||||||||    
T  18468386 aagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagatgttccgatggctgaag 18468485  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     |||||| |||    ||||||| |||||||||||  ||| | || | |||||| ||||||| |||  | | |||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  18468486 aggttaaagtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgttg-ttggactacaaggacctttgagaaggcggaagacattccgagggctgaagggg 18468584  T
Q  307 tca--gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    | |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  18468585 ttatgagctgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagtatggtggttgatg 18468656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15355525 - 15355347
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15355525 gccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgctgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 15355426  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  15355425 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 15355347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 23666649 - 23666827
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23666649 gccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgctgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 23666748  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  23666749 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 23666827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 219
Target Start/End: Original strand, 31544341 - 31544507
Alignment:
Q  53 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctag 152  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31544341 ccaatggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacctaaaactcctag 31544440  T
Q  153 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||||    
T  31544441 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagtggttgaggtgt 31544507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 10756500 - 10756678
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10756500 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgttatgcgttgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 10756599  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  10756600 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagtggttgaggtgtatacttgtgga 10756678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34478092 - 34477913
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  34478092 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttatgcgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacctaaaactccta 34477993  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||  ||||||| |||| ||||||  |||||||||    
T  34477992 gtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagatattctgatagctgaagtggttgaggtgtatacttgtgga 34477913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 224 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18510101 - 18509949
Alignment:
Q  224 ttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 322  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18510101 ttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggttaaggtgtaaacttg 18510003  T
Q  323 tggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18510002 tggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcatggtggttgatg 18509949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 223 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41586698 - 41586557
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 321  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41586698 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcaagaaggcggaaggcattccgatggttgaagaggttagggtgtaaactt 41586600  T
Q  322 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagca 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41586599 gtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagca 41586557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 363
Target Start/End: Original strand, 27912022 - 27912165
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagg--gtgtaaact 320  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | ||||||||   ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |  |||||||||    
T  27912022 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtttgactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttaagaggtgtaaact 27912121  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagca 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27912122 tgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagca 27912165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 31544530 - 31544714
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| |||| |||| ||||||||    
T  31544530 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaaccacctgaaattcct 31544629  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  31544630 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 31544714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 215
Target Start/End: Original strand, 27911947 - 27912110
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| || | ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  27911947 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggtagtgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattccta 27912046  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaag 215  Q
    | |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  27912047 gcgtagtttgactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttaag 27912110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 375
Target Start/End: Original strand, 31544644 - 31544759
Alignment:
Q  261 acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagc 359  Q
    ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||    
T  31544644 acaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagc 31544743  T
Q  360 agcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||| |||||||    
T  31544744 agcaaggtggttgatg 31544759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15355335 - 15355173
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatg-cttgtggaactacctaaaattcc 149  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  | | ||||| ||||||||| |||||||    
T  15355335 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtataagtcttgtagaactacctgaaattcc 15355236  T
Q  150 tagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    ||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  15355235 tagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 15355173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 23666839 - 23667001
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatg-cttgtggaactacctaaaattcc 149  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  | | ||||| ||||||||| |||||||    
T  23666839 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtataagtcttgtagaactacctgaaattcc 23666938  T
Q  150 tagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    ||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  23666939 tagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 23667001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41586770 - 41586590
Alignment:
Q  54 caagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagt 153  Q
    |||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| || |||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||||     
T  41586770 caagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcctatgttgaagaagt-atggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagc 41586672  T
Q  154 gtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  41586671 gtagttggactacaagcatcttcaagaaggcggaaggcattccgatggttgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 41586590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 10756690 - 10756852
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatg-cttgtggaactacctaaaattcc 149  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  | | ||||| ||||||||| |||||||    
T  10756690 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtataagtcttgtagaactacctgaaattcc 10756789  T
Q  150 tagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    ||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  10756790 tagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 10756852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34477901 - 34477740
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| | ||||||| ||||||||    
T  34477901 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtaggactacctgaaattcct 34477802  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  34477801 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 34477740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Original strand, 10756767 - 10756921
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 320  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  10756767 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 10756865  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  10756866 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 10756921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18510177 - 18509994
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||    |||| ||| |||||||| | || |||| ||||||||||||||| ||||||||  |   |||| ||||||||| |||||||||    
T  18510177 gccaagggtgattgagcacaagtagatcttcaaggaaacgggagaggtcctgtgttgaagaggttatggtatagtattgtagaactacctgaaattccta 18510078  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    | ||||||||||| |||| | |||| | | |||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  18510077 gcgtagttggactacaagcatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggttaaggtgtaaacttgtggagctac 18509994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 261 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34477787 - 34477671
Alignment:
Q  261 acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagag 358  Q
    ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||    
T  34477787 acaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaacttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgag 34477688  T
Q  359 cagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||  |||||||    
T  34477687 cagcaaggaggttgatg 34477671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15355258 - 15355104
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 320  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  15355258 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgatggtgtaaact 15355160  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  15355159 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 15355104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Original strand, 23666916 - 23667070
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 320  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  23666916 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgatggtgtaaact 23667014  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  23667015 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 23667070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 75 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6259698 - 6259413
Alignment:
Q  75 agaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggacct 174  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||| ||    
T  6259698 agaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaagt-atggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctagtgtagtttggatacaaggatct 6259600  T
Q  175 tcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaa 274  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6259599 tcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagaggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaattccttgagtagtttggacacaaggatcttcaa 6259500  T
Q  275 aagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagca 360  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6259499 aagggcagaaggcattccgatggttgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctacatggtatagtgggaagcaagggaaagagca 6259413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21519354 - 21518998
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21519354 gaagaatatatagcacggcttgcgggattatc-ttaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttg 21519256  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| | |||| |||| |||    
T  21519255 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacagaagacgttccgatggctaaag 21519156  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | ||||||||  |||||||||| ||||| ||    
T  21519155 aggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagggg 21519057  T
Q  307 tcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 364  Q
    | | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21519056 ttaaggtgtaaaattgtgcagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaa 21518998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35216642 - 35216464
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  35216642 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaatgaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctgaaactccta 35216543  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  35216542 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 35216464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19503008 - 19502830
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19503008 gccaagggtgattggatgcaagatgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 19502909  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  19502908 gtgtagttggactgcaagaaccttcaagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 19502830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36559817 - 36559639
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36559817 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggaagatgttctgcgttgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 36559718  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  36559717 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 36559639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22405257 - 22405135
Alignment:
Q  103 gtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggc 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  22405257 gtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggacttcaaggatcttcgagaaggcggaagccattccgatggc 22405158  T
Q  203 tgaaggggttaaggtgtgcactt 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  22405157 tgaagaggttaaggtgtgcactt 22405135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31733836 - 31733658
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||    
T  31733836 gccaaaggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttaaagattttatggtggatacttgtggaactacctcaaatttcta 31733737  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||| |||  |||||| |||| | |||||||    
T  31733736 gcgtagttggactgcaaggacctttgagaaggaggaagacattccgatggctaaagaagttaagatgtgtatttgtgga 31733658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6263151 - 6263002
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  6263151 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagtgtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatatcctgtgttg 6263053  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagtt 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6263052 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaactcctagcgtagtt 6263002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31733646 - 31733336
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||||||   |||  ||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||||| |  |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  31733646 gccaagggtgattgggcacaaatagatcttcaaggaagcgggagatgttctgtattgaagaggttatgatatagtcttgtagaactacctgaaattccta 31733547  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagt 251  Q
    |||||||| |  | |||||  |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||| || ||||| || | | |  |    
T  31733546 gtgtagtttggatacaaggttcttcgagaaggcagaagacattccgatggctaaagaggttaaggtgtgtacttgtggagcttcctaacattcttagctt 31733447  T
Q  252 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caag 350  Q
    || | |||  |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| | |   ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  31733446 ag-tgggaagcaagaatcttcaaga-ggcggaaagcattccgatggtagaagagct-aacatgtaaacttgtggagctacatggtgtagtggaaagcaag 31733350  T
Q  351 ggaaagagcagcaa 364  Q
    ||||||||||||||    
T  31733349 ggaaagagcagcaa 31733336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 261 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19502704 - 19502589
Alignment:
Q  261 acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagc 359  Q
    ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19502704 acaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagc 19502605  T
Q  360 agcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||  |||||||    
T  19502604 agcaaggaggttgatg 19502589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36559627 - 36559466
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  36559627 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 36559528  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  36559527 agtgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 36559466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13829105 - 13828967
Alignment:
Q  55 aagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtg-ttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagt 153  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||  ||||||| | ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||    
T  13829105 aagggtgattggatacaagaagatcttcaaggaagcaggagatgttccgtggttgaagaggttatggtgtatacttgtggaactaactaaaatttctagt 13829006  T
Q  154 gtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacat 193  Q
    ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  13829005 gtagttgga-tgcaagaatcttcaagaaggcggaagacat 13828967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19502818 - 19502634
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| || |||||| ||| ||||    
T  19502818 gccaagggtgattgggtataagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagagctacctgaaactcct 19502719  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  19502718 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 19502634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6259808 - 6259733
Alignment:
Q  155 tagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6259808 tagttggactgcaaggaccttcgagaaggtggaagatattccgagggctgaaggggttaaggtgcgtacttgtgga 6259733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35216452 - 35216296
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  35216452 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 35216353  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  35216352 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaag 35216296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36559551 - 36559397
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 320  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  36559551 cttgtagaactacctgaaattcctagtgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 36559453  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  36559452 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 36559397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 203 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13829052 - 13828878
Alignment:
Q  203 tgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaa 302  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||  || | |||||| |||  |||| |||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13829052 tgaagaggttatggtgtatacttgtggaactaactaaaatttctagtgtagtt-ggatgcaagaatcttcaagaaggcggaagacattctgatggttgaa 13828954  T
Q  303 gaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtt 378  Q
     ||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||    
T  13828953 aaggtt-gggtggaaactcatggagctacttggtgtagttggaagcaagggaaagaacatcatggtggttgatggtt 13828878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35216376 - 35216222
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 320  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  35216376 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagaagttgagggtgtaaact 35216278  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  35216277 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 35216222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28568914 - 28568842
Alignment:
Q  268 tcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagt 341  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28568914 tcttcaagaaggcggaaggcattccagtggttgaagaggtt-gggtggaagcttgtggagctacttggtgtagt 28568842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 201
Target Start/End: Original strand, 16677131 - 16677224
Alignment:
Q  107 tgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgaggg 201  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  16677131 tgaaaatgttacggtgaaagcttgtgaaactacctcaaaatctgagtgtagttgga-tgcaaggatcttcaagaggacggaagacattccgaggg 16677224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42018401 - 42018293
Alignment:
Q  222 acttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg-tcagggtgtaaact 320  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || ||    
T  42018401 acttgtggaaatacctaaaat-cctagtgtagtt-ggatgcaaggatcttcaagaggatggaagacattccgagggttgaagaggctaagggtggaacct 42018304  T
Q  321 tgtggagctac 331  Q
    |||||||||||    
T  42018303 tgtggagctac 42018293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22405233 - 22405149
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggaca-caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggt 307  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||  ||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22405233 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagtt-ggacttcaaggatcttcgagaaggcggaagccattccgatggctgaagaggt 22405149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42018400 - 42018313
Alignment:
Q  127 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaagg 216  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |  ||||||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  42018400 cttgtggaaatacctaaaat-cctagtgtagttgga-tgcaaggatcttcaagaggatggaagacattccgagggttgaagaggctaagg 42018313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41303802 - 41303707
Alignment:
Q  262 caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca-gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaa 355  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||| || ||| || ||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41303802 caaggatctttaagagggcgaaaggcattctgagggtcgaggaggcaaagggtggaagcttgtggagctacttggtgtagttggaagcaagggaaa 41303707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7858425 - 7858371
Alignment:
Q  107 tgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgg 161  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  7858425 tgaagatgttatgatgaaaacttgtggaactaactaaaatgactagtgtagttgg 7858371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 28568961 - 28568918
Alignment:
Q  127 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagga 171  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28568961 cttgtagaactacgtaaaattcctagtgtagttgga-tgcaagga 28568918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 53 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 890668 - 890342
Alignment:
Q  53 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctag 152  Q
    ||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||  |  ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  890668 ccaagggtgattggccacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcatgtgttgaagaagt-atggtatagtcttgtagaactacctgaaataactag 890570  T
Q  153 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagta 252  Q
     ||||||||| | |||| | ||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  890569 cgtagttggattacaagaatctttgagaagggggaaggcattccgatggctgaagaggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaattccttgagta 890470  T
Q  253 gtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagg 351  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  890469 gtctggactcaaggatcttc-aaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggttagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagg 890371  T
Q  352 gaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 380  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  890370 gaaagagcagcaaggtggttgatggtttg 890342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18097828 - 18097461
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18097828 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaagaa-ggccaagggtgattggatgcaaggcgatcttcaagggagcgggagatgtcctgtgttg 18097730  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  18097729 aagatattatggtgaatgcttgtggaactacataaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaag 18097630  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||  |||||| |||| | | || ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  18097629 aggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcctag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggtggaagacattccgatggctgaagggg 18097531  T
Q  307 tcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18097530 tggaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggtggttgatg 18097461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 52 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 53916438 - 53916124
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||| || |||||  |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  53916438 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcaggagatgtcctgtgttgaagaagt-atggtatagtcttgtagaactacctgaaattccta 53916340  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagt 251  Q
    | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53916339 gcgtagttggactataaggatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctga---------ggtgtgcacttgtggaactaccttaaatgccttgagt 53916249  T
Q  252 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caag 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  53916248 agtttggacacaaggatcttcaaaagggcgaaaggcattccgatggttgaagaggttagggtgtaaacttgtgaagctacttggtatagtgggaagcaag 53916149  T
Q  351 ggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||    
T  53916148 ggaaagagcagcatggtggttgatg 53916124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 43227624 - 43227993
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  43227624 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaagaa-ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttg 43227722  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||| |||    
T  43227723 aagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctaaag 43227822  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     ||||||||||    |||||||||||| ||||||| ||| | |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  43227823 aggttaaggtgaatgcttgtggaactaactaaaattcctagtgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaagggg 43227921  T
Q  307 tca--gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43227922 tcatgaggtgtaaacttgtggagatacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggtggttgatg 43227993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 51 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28138196 - 28137863
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  28138196 ggccaagggtgattggaagcaaggagactttcaaggaagcggaagatgtcatgtgttgaagaggttatggtgaatgcttgtgaaactacctaaaacacct 28138097  T
Q  151 agtgtagttggactgcaagga-ccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttga 249  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||  || |     
T  28138096 aatgtagttggactgcaaggattcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaatttctagt 28137997  T
Q  250 gtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-c 347  Q
    |||| ||||||  |||||| |||  | | || ||||| ||||||||||| ||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28137996 gtag-ttggactgcaaggacctttgagaaggaggaagacattccgatggctgaagggattaaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagc 28137898  T
Q  348 aagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttggc 382  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28137897 aagggaaagagcagcatggtggttgatggtttggc 28137863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 28101004 - 28100632
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||| |||||    
T  28101004 gaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatgcaaggagactttcaaggaagtggaagatgtcctatgttg 28100906  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || | || | ||||||||    
T  28100905 aagaggttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaacacctagtgtcgttggactgtaaggactcttcgagaagacggaaaacgttccaatggctgaag 28100806  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     ||||||||||    |||||||||||||||||||| | | | ||||  |||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  28100805 aggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcatagtgtag-atggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagggg 28100707  T
Q  307 tcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 380  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28100706 ttaaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaaggcaaagagcagcatggtggttgatggtttg 28100632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 42991542 - 42991911
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||||||| || ||||    
T  42991542 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattactctaaaaaaa-ggccaagggtgattggatacaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcatgcgttg 42991640  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  42991641 aagatgttatggtaaatgcttgtgggagtacctaaaactcctagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaag 42991740  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagagg 306  Q
     ||||||||||    | |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||||| |||| | | |||||||| |||| ||| || ||||| ||    
T  42991741 aggttaaggtgaatgcatgtggaactacctaaaattcctagtgtag-ttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacatttcgagggctgaagggg 42991839  T
Q  307 tca--gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  42991840 ttaagaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcatggtggttgatg 42991911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 43422467 - 43422247
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        | |||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43422467 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaatg-ccaagggtgattggatgctaggtgatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttg 43422369  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  43422368 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaatttctagcgtagttggactgcaaggacattcgagaaggcggaagacattctgagagctgaagg 43422269  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  43422268 ggttaaggtgtatacttgtgga 43422247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 51 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4309185 - 4308867
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4309185 ggccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgggagatgttctgcattgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcct 4309086  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttga 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||    ||||||| | |||||||||  ||| |     
T  4309085 agtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttccgatggctgaagaggttaaggtgaatgcttgtgggattacctaaaactcctagt 4308986  T
Q  250 gtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa 346  Q
    |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||| || || ||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308985 gtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctgaaggggttatgaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa 4308887  T
Q  347 -caagggaaagagcagcaag 365  Q
     |||||||||||||||||||    
T  4308886 gcaagggaaagagcagcaag 4308867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 364
Target Start/End: Original strand, 23636400 - 23636675
Alignment:
Q  87 cagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcgg 186  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    | |||||| ||||||||||||||    
T  23636400 cagcgggaggtgtcctgtgttgaagaggttatggtgaatgctagtggaactacctgaaattcctagcgtagtttcgatacaaggatcttcgagaaggcgg 23636499  T
Q  187 aagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaagg 286  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||| | |||  |||| |||||||||| |||||||||    
T  23636500 aagacattccgatggctgaagaggttaaagtgtgtacttgtggagctacctaaaattcctagcgtag-tgggaagcaagaatcttcaaaa-ggcggaagg 23636597  T
Q  287 cattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 364  Q
      |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23636598 ttttccaatggttgaagaggt-aaggtgtaaacttgtggatctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaa 23636675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 207
Target Start/End: Original strand, 3315944 - 3316141
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||        || |||||||||||| ||||||| |||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  3315944 gaagaatatatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaa-ggtcaagggtgattgaatgcaagaagaccttcaaggaagtgggagatgtcctatgttg 3316042  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3316043 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcttagcgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaag 3316141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 51 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 53916629 - 53916450
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  53916629 ggccaacggtgattggatgcaaggtaatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaggttatggttaatgcttgtggaactacctaaaatacct 53916530  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  53916529 agcgtagttagactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgagggctgaaggggttaaggtgtatacttgtgga 53916450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 11169687 - 11169865
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11169687 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttttgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 11169786  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | ||||  |||||||||    
T  11169787 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctaaaggggttgaagtgtatacttgtgga 11169865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10957022 - 10956843
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10957022 ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgttgaagatgttgtggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcct 10956923  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  10956922 agtgtagttagactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 10956843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 51 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 35918853 - 35918535
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||    
T  35918853 ggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagtgggagatgtcctgcattgaagatgttatggtgaatgcgtgtgggactacctaaaacttct 35918754  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttga 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | || || ||||| ||||||||||    ||||||| |||||||||||  ||| |     
T  35918753 agtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttctgatggttgaagaggttaaggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagt 35918654  T
Q  250 gtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa 346  Q
    |||| ||||||  ||||||  ||| | | |||||||| |||||||| || ||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35918653 gtag-ttggactgcaaggactttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaatgggttaagaggtgtaaacttgtggagctacttggagtagtgggaa 35918555  T
Q  347 -caagggaaagagcagcaag 365  Q
     |||||||||||||||||||    
T  35918554 gcaagggaaagagcagcaag 35918535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 890902 - 890681
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||| |||||||||     
T  890902 gaagaatgtatagcacagcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagagtgattggatgcaagaagaccttcaagaaaacgggagatatcctgtgtta 890804  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaa-g 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  890803 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagcgtagtctgactgcaaggatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagg 890704  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||  |||||||||    
T  890703 gggttaaggtgtttacttgtgga 890681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6064466 - 6064287
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  6064466 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacctaaaactccta 6064367  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  6064366 gtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagacattccgatgactgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 6064287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 457492 - 457670
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  457492 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagtaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggactacctaaaactccta 457591  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | || ||||||  |||||||||    
T  457592 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagtgtttgaggtgtatacttgtgga 457670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 5898998 - 5899178
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagac-cttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5898998 gccaagggtgattggatgcaaggtgattcttcaaggaggcagaagatgtcctgcgctgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaattcct 5899097  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaa-ggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  5899098 agcgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaagggggttaaggtgtatacttgtgga 5899178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 223 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 43422161 - 43422005
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 322  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||||||||||||||| | | |||||||| ||||| ||||| ||||||||| || ||||||| |||    
T  43422161 cttgtagaactacctgaaattcctagtgtagtt-ggacacaaggatcttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagaggttagagtgtaaatttg 43422063  T
Q  323 tggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 380  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43422062 tggaactacttggtgtagtgggaataagggaaagagcagcaaggtggttgatggtttg 43422005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 382
Target Start/End: Original strand, 3306326 - 3306486
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 321  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  3306326 cttgtagaactacctgaaattcctagagtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatgactgaagaggttagggtgtaaactt 3306424  T
Q  322 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttggc 382  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3306425 gtggagcaactaggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggtggttgatggtttggc 3306486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 3306251 - 3306429
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  3306251 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattccta 3306350  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  3306351 gagtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatgactgaagaggttagggtgtaaacttgtgga 3306429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 11169877 - 11170061
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  11169877 gccaagggtgattggctacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctggtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 11169976  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||  ||||||||| ||||    
T  11169977 agcgtagttggactacaagcatcttcatgaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgaggtgtaaacttgtggagctac 11170061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Original strand, 11169953 - 11170106
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 321  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  11169953 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcatgaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgaggtgtaaactt 11170051  T
Q  322 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11170052 gtggagctacttagagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggaggttgatg 11170106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6064275 - 6064114
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||  ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  6064275 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcaggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 6064176  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  6064175 agtgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagaggtt 6064114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10956717 - 10956602
Alignment:
Q  261 acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagc 359  Q
    ||||| |||||| | | |||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10956717 acaagcatcttcgagaaggcggaagacattccaatggctgaagaggctagggtgtaaacttgtggagctacatggtgtagtgggaagcaatggaaagagc 10956618  T
Q  360 agcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||  |||||||    
T  10956617 agcaaggaggttgatg 10956602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10956830 - 10956647
Alignment:
Q  53 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| |||||| ||    
T  10956830 ccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcgta 10956731  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    | ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||| || || |||||  ||||||||| ||||    
T  10956730 gcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccaatggctgaagaggctagggtgtaaacttgtggagctac 10956647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1619337 - 1619244
Alignment:
Q  286 gcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa-ggtagttgatggtt 378  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  1619337 gcattccgatggttgaagaggt-agggtgaaaacttgtggagctacatggtgtagtgggaagcaagggaaagagcaacaatggtggttgatggtt 1619244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 261 - 366
Target Start/End: Original strand, 5899303 - 5899409
Alignment:
Q  261 acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagc 359  Q
    ||||| |||||| | | |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  5899303 acaagcatcttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtggagttacttggagtagtgggaagcaagggaaatagc 5899402  T
Q  360 agcaagg 366  Q
    |||||||    
T  5899403 agcaagg 5899409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 457682 - 457843
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  457682 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 457781  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  457782 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatcgctgaagaggtt 457843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7607157 - 7607002
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagg--gtgtaaac 319  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| |||||||||||| | | |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |  || |||||    
T  7607157 cttgtagaactacctgaaattcctggcgtagtt-ggactacaaggatcttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagaggttaagaggtataaac 7607059  T
Q  320 ttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7607058 ttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggaggttgatg 7607002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7607196 - 7607069
Alignment:
Q  88 agcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcgga 187  Q
    |||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7607196 agcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcctggcgtagttggactacaaggatcttcgagaaggcgga 7607097  T
Q  188 agacataccgagggctgaaggggttaag 215  Q
    |||||| | || |||||||| |||||||    
T  7607096 agacattctgatggctgaagaggttaag 7607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43422235 - 43422054
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||  || | ||| ||||||||||| || |||||  |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  43422235 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcaggacaagtcatgtgttgaagaagt-atggtacagtcttgtagaactacctgaaattccta 43422137  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||  ||||  | ||||||||||||    
T  43422136 gtgtagttggaca-caaggatcttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagaggttagagtgtaaatttgtggaactac 43422054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 5899190 - 5899368
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| ||||| ||  |  ||||||| | ||||||  |  ||||| |||||| || |||||||||    
T  5899190 gccaagggtgattgggaacaagtagatcttcaaggaagcgggagatatctcgaattgaagagggtatggtatagtcttgtagaactatctgaaattccta 5899289  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    |  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  5899290 gcatagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtgga 5899368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6064199 - 6064054
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 320  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | ||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  6064199 cttgtagaactacctgaaattcctagtgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagatattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 6064101  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaagg 366  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||    
T  6064100 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaagg 6064054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Original strand, 457758 - 457912
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 320  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||| | |||||||||  || |||||||||    
T  457758 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatcgctgaagaggttgagagtgtaaact 457856  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  457857 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 457912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43402940 - 43402814
Alignment:
Q  108 gaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||  ||||||| |||   ||||  | |||    
T  43402940 gaagaggttatggtgtaggcttgtggaactacctaaaaatcctagtgtagttgga-tgcaaggaacttcaagagagcggaaggcattatgaggtttcaag 43402842  T
Q  208 gggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
     ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  43402841 aggtaaaggtgtaaacttgtggaactac 43402814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14634858 - 14634796
Alignment:
Q  278 ggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtag 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||||||||||||||    
T  14634858 ggcggaaggcattccgatggttgaagaggttgggtggaaaacttgtagagctacttggtgtag 14634796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2075734 - 2075654
Alignment:
Q  262 caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca-gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagt 341  Q
    |||||||||| || ||| |||||| ||||| || |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2075734 caaggatctttaagaggacggaagacattctgaaggttgaagaggcaaagggtggaaacttgtggagctacttggtgtagt 2075654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 171
Target Start/End: Original strand, 27422343 - 27422386
Alignment:
Q  127 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagga 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27422343 cttgtggaactacctaaaattccaagtgtagttgga-tgcaagga 27422386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43402921 - 43402814
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttg 322  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||| |||  |||||| |||||| || ||||||||||||  || | || ||||||| | ||||||||||||    
T  43402921 cttgtggaactacctaaaaatcctagtgtagtt-ggatgcaaggaacttcaagagagcggaaggcattatgaggtttcaagaggtaaaggtgtaaacttg 43402823  T
Q  323 tggagctac 331  Q
    |||| ||||    
T  43402822 tggaactac 43402814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15824432 - 15824279
Alignment:
Q  53 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtg-ttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||| || | ||| ||||||| | | || ||    |||||| ||||||||||||| ||||    
T  15824432 ccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagagggtttgatgttgacttgtgaaactacctaaaat-ccta 15824334  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||||| |||  |||||| |||||    
T  15824333 gtgtagttgga-tgcaaggatctttaagatggcggaagccatttcgagggttgaag 15824279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 161
Target Start/End: Original strand, 4041708 - 4041742
Alignment:
Q  127 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgg 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4041708 cttgtggaactacctaaaatgcctagtgtagttgg 4041742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 890785 - 890705
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaag 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||    ||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  890785 cttgtggaactacctaaaattcctagcgtagtctgactgcaaggatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaag 890705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1619401 - 1619358
Alignment:
Q  127 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagga 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1619401 cttgtcgaactacctaaaattcctagtatagttgga-tgcaagga 1619358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 51 - 346
Target Start/End: Original strand, 15072136 - 15072432
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15072136 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcaggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtagaactacctaaaactcct 15072235  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttga 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | | || |||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| |     
T  15072236 agtgtagttggactgcaaggactcttcgagaagacggaagacgttctgatggctgaagaggttaaggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagt 15072335  T
Q  250 gtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa 346  Q
    |||| ||||||  |||||| |||| | | | ||||||  |||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072336 gtag-ttggactgcaaggaccttcgagaagacggaagatattccgatggctgaaggggttagagtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa 15072432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 41383990 - 41384210
Alignment:
Q  9 gaagaatatacagcacggcttgcgggattaccctnnnnnnnnggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttg 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41383990 gaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaa-ggccaagggttatttgatgcaaggtgaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttg 41384088  T
Q  109 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaagg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  41384089 aagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaatacctagcgtagttagacttcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgaggactgaagg 41384188  T
Q  209 ggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    |||| ||||||  |||||||||    
T  41384189 ggttgaggtgtatacttgtgga 41384210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 219
Target Start/End: Original strand, 43081263 - 43081430
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||    
T  43081263 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgtgttgaagatgttatggtgaaagcttgtgggtctacctaaaactccta 43081362  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||| |||| ||||||    
T  43081363 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattctgatggctgaagtggttgaggtgt 43081430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 108 - 213
Target Start/End: Original strand, 27828687 - 27828792
Alignment:
Q  108 gaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27828687 gaagatgttatggtaaatgcttgtgggactacctaaaattcctagtgtagttggactacaaggaccttcgagaaggcagaagacattccgagggctgaag 27828786  T
Q  208 gggtta 213  Q
    ||||||    
T  27828787 gggtta 27828792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Original strand, 18812476 - 18812629
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 321  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  18812476 cttgtagaactaccttaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcaagaaggcggaagacattccgatggctggagaggttagggtgtaaactt 18812574  T
Q  322 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18812575 gtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggaggttgatg 18812629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 147
Target Start/End: Original strand, 21481856 - 21481951
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaatt 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  21481856 gccaagggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaggttatggtggatacttgcggaactacctaaaatt 21481951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 222 - 354
Target Start/End: Original strand, 17849336 - 17849468
Alignment:
Q  222 acttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||    
T  17849336 acttgtggaactacctaaaattcctagtgtagtt-ggatgcaaggatcttcaagaaggcggaaggcattccgatggttgaagaggcaaggatggaaactt 17849434  T
Q  322 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaa 354  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17849435 gtggagatacttggtgtagttggaagcaagggaa 17849468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Original strand, 21481969 - 21482081
Alignment:
Q  262 caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagca 360  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21481969 caagaatcttcaaaagg-cggaaggcattccaatagttgaagaggtaagg-tgtaaacttgtggagctacatggtgtagtgggaagcaagggaaagagca 21482066  T
Q  361 gcaaggtagttgatg 375  Q
    ||| ||| |||||||    
T  21482067 gcatggtggttgatg 21482081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Original strand, 27828899 - 27829054
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagg--gtgtaaac 319  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| |||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |  ||||||||    
T  27828899 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaaggatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttaagaggtgtaaac 27828997  T
Q  320 ttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27828998 ttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggatgttgatg 27829054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 215
Target Start/End: Original strand, 27828823 - 27828987
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||  | ||| |||||||   || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  27828823 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaagttaagcgggagatgtttcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 27828922  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaag 215  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  27828923 agcgtagttggactacaaggatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttaag 27828987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 278 - 360
Target Start/End: Original strand, 41384352 - 41384435
Alignment:
Q  278 ggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagca 360  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41384352 ggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtgaagctacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagca 41384435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 18812400 - 18812584
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || |||||||  |||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  18812400 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagagattatggtatagtcttgtagaactaccttaaattcct 18812499  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    || ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  18812500 agcgtagttggactacaagcatcttcaagaaggcggaagacattccgatggctggagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 18812584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14418785 - 14418718
Alignment:
Q  200 ggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaagga 267  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14418785 ggctgaagaggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaattccttgagtagtttagacacaagga 14418718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31574401 - 31574293
Alignment:
Q  266 gatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 364  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  31574401 gatcttcaagaaggcggaagacatttcgaaggttgaagaggtt-gggtggaaacttgtggagctacttggtgtagttggaagcgagggaaagagcagcaa 31574303  T
Q  365 ggtagttgat 374  Q
    ||| ||||||    
T  31574302 ggtggttgat 31574293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 228
Target Start/End: Original strand, 41384223 - 41384398
Alignment:
Q  53 ccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctag 152  Q
    |||||| |||||||   |||| ||| |||||||| |||| || |||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  41384223 ccaaggatgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggatatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaatttctag 41384322  T
Q  153 tgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtg 228  Q
     ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  41384323 cgtagttggactacaaacatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtg 41384398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 198
Target Start/End: Original strand, 43081453 - 43081600
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  43081453 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 43081552  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccga 198  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43081553 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccga 43081600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31574521 - 31574411
Alignment:
Q  54 caagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtg-ttgaagatg-ttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||| |||  ||| ||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  31574521 caagggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcaggagacgtctcgtggttgaagagggttatggtgtatacttgcggaactacctaaaattccta 31574422  T
Q  152 gtgtagttgga 162  Q
    |||||||||||    
T  31574421 gtgtagttgga 31574411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40220533 - 40220415
Alignment:
Q  222 acttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggt--cagggtgtaaac 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || ||| |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| || |    
T  40220533 acttgtggaactacctaaaat-cctagtgtggtt-ggatgcaagaatcttcaaaagagcggaaggcattccgagggttgaagaggtacaagggtggaagc 40220436  T
Q  320 ttgtggagctacttggtgtag 340  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40220435 ttgtggagctacttggtgtag 40220415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 207
Target Start/End: Original strand, 17849337 - 17849416
Alignment:
Q  127 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| |||| || |||||    
T  17849337 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgga-tgcaaggatcttcaagaaggcggaaggcattccgatggttgaag 17849416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42436123 - 42436004
Alignment:
Q  222 acttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggt--cagggtgtaaac 319  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | || ||| |||  ||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||| || |    
T  42436123 acttgtggaactacctaaaat-cctagtgtggtt-ggatgcaaggatcttcaagagagcgggaggcattccgagggttgaagaggtacaagggtggaagc 42436026  T
Q  320 ttgtggagctacttggtgtagt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42436025 ttgtggagctacttggtgtagt 42436004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 346
Target Start/End: Original strand, 43081529 - 43081653
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 320  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| |||||||||   |||||||||  ||||||||||||    
T  43081529 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgattactgaagaggttgagggtgtaaact 43081627  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa 346  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43081628 tgtggagctacttggagtagtgggaa 43081653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 310 - 378
Target Start/End: Original strand, 18959980 - 18960049
Alignment:
Q  310 gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtt 378  Q
    ||||| |||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18959980 gggtggaaacttctggagctacatgatgtagtgagaagcaagggaaagagcagaaaggtggttgatggtt 18960049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42436141 - 42436044
Alignment:
Q  108 gaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||| |||  |||| || ||| ||||||| |||||    
T  42436141 gaagaggttatggtggagacttgtggaactacctaaaa-tcctagtgtggttgga-tgcaaggatcttcaagagagcgggaggcattccgagggttgaag 42436044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14418899 - 14418842
Alignment:
Q  55 aagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaaga 112  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14418899 aagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgagagatgtcctgtattgaaga 14418842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 51 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15533591 - 15533279
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgatt-ggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcc 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15533591 ggccaagggtgatttggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggagatgtcttgtgttgaagatgtcatggtgaatgcttgtggaactacctaaaactcc 15533492  T
Q  150 tagtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||    | |||||||||||||||||| ||  |    
T  15533491 tagtgtagttggactgcaaggactcttcgagaaggcggaagacgttccgagggctgaagaggttaagttgaatgcctgtggaactacctaaaattccaag 15533392  T
Q  249 agtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa- 346  Q
     |||| ||||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  15533391 tgtag-ttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattctgatggctgaaggggttcgggtgtaaatttgtggagctacttggtgtagtgggaag 15533293  T
Q  347 caagggaaagagca 360  Q
    ||||||||||||||    
T  15533292 caagggaaagagca 15533279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 54 - 230
Target Start/End: Original strand, 3395639 - 3395815
Alignment:
Q  54 caagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagt 153  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  3395639 caagggtgattggatgcaagaagaccttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgtttgtggaactacctaaaattcctatt 3395738  T
Q  154 gtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3395739 gtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttaaggtgtatacttgtgga 3395815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 51 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3630879 - 3630711
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630879 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggatatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 3630780  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgt 219  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3630779 agcgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacatttcgagggctgaaggggttaaggtgt 3630711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30729616 - 30729440
Alignment:
Q  54 caagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagt 153  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30729616 caagggtgattggatgcaaggtaatcttcaaggaagcgggagacgtcctgtgttaaagatgttatggtgaatgcttgtgtaactacctaaaattcctagt 30729517  T
Q  154 gtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  30729516 gtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaaggggttaaagtgtaaacttgtgga 30729440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 33310495 - 33310673
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33310495 gccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagatggtatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 33310594  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  33310595 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagatattccgagggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 33310673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26067070 - 26066892
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26067070 gccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcaggagatgttctgcgttgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 26066971  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  26066970 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaagacggaagacattccgatggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 26066892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 261 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3630575 - 3630454
Alignment:
Q  261 acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagca 360  Q
    |||||||||||  | | |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630575 acaaggatctttgagaaggcggaagacattccgatggctaaagaggttagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagca 3630476  T
Q  361 gcaaggtagttgatggtttggc 382  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  3630475 acaagttggttgatggtttggc 3630454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 235
Target Start/End: Original strand, 26944707 - 26944840
Alignment:
Q  102 tgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgaggg 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||    
T  26944707 tgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaactacctaaaattcctagcatagttggactgcaaggaccttcgaaaaggcggaaggcatttcgatgg 26944806  T
Q  202 ctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  26944807 ctgaaggggttaatgtgtgtacttatggagctac 26944840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 223 - 380
Target Start/End: Original strand, 3395903 - 3396061
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 321  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | ||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3395903 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcagaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaactt 3396001  T
Q  322 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatggtttg 380  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3396002 gtggagatacttggtgtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggtggttggtggtttg 3396061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3630688 - 3630505
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||| |||| ||||||||  || |||||||||||||| |  |  ||||| ||||||||| |||||||||    
T  3630688 gccaagggtgattgggcacaagtagatcttcaaggaagcgggagatgtcacgtattgaagatgttatgttatagtcttgtagaactacctgaaattccta 3630589  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactac 235  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||  ||||||||| ||||    
T  3630588 gtgtagttgaactacaaggatctttgagaaggcggaagacattccgatggctaaagaggttagggtgtaaacttgtggagctac 3630505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28038544 - 28038296
Alignment:
Q  127 cttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||| ||||||||   |||| ||||| |||| ||  |||| |||||||||||  |||||    
T  28038544 cttgtggaactacctaaaattcttattgtagctaga-tgcaaggatcttcgaga---cggatgacattccgatggtcgaagaggttaaggtgtagacttg 28038449  T
Q  227 tggaactacctaaaatgcc--ttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtg 324  Q
    |||||||||||||||| ||  |||  ||| | |||  |||| |||||||| | ||| |||| |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  28038448 tggaactacctaaaattcctattgtttag-tcggatgcaagaatcttcaagaaggcagaagacattccgatggttgaaaaggt-tgggtggaaacttgtg 28038351  T
Q  325 gagctacttggtgtagtggga-acaagggaaagagcagcaaggtagttgatggtt 378  Q
     |||||| ||||||||||| |  |||||| |||||||| | ||| ||||||||||    
T  28038350 aagctacatggtgtagtggaatgcaagggtaagagcagaatggtggttgatggtt 28038296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 33310685 - 33310846
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||| ||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  33310685 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatatctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 33310784  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  33310785 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 33310846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 3395827 - 3396006
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| |   || ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  3395827 gccaagggtgattgggtattagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 3395926  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    || ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  3395927 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcagaagacattccgatggctgaagaggttagggtgtaaacttgtgga 3396006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26066880 - 26066719
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || || |||| ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  26066880 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattaaagaggttatggtatagtcttgtagaactacctgaaattcct 26066781  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  26066780 agcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggaggaagacattccgatggctgaagaggtt 26066719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 223 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30729543 - 30729401
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggaca-caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaactt 321  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||||  |||||| |||| | | |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||||    
T  30729543 cttgtgtaactacctaaaattcctagtgtagtt-ggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaaggggttaaagtgtaaactt 30729445  T
Q  322 gtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaa 364  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30729444 gtggagctatttggtgtagtaggaagcaagggaaagagcagcaa 30729401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Original strand, 33310761 - 33310915
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 320  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  33310761 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 33310859  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  33310860 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 33310915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26066804 - 26066650
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 320  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | || ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  26066804 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggaggaagacattccgatggctgaagaggttgagggtgtaaact 26066706  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  26066705 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 26066650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 222 - 367
Target Start/End: Original strand, 26944731 - 26944877
Alignment:
Q  222 acttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggaca-caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaact 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||  |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||| |  ||||  |||    
T  26944731 acttgtggaactacctaaaattcctagcatagtt-ggactgcaaggaccttcgaaaaggcggaaggcatttcgatggctgaaggggttaatgtgtgtact 26944829  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggt 367  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26944830 tatggagctacatggtgtagtgggaagcaagggaaagagcaggaaggt 26944877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 307
Target Start/End: Original strand, 11137760 - 11137891
Alignment:
Q  178 agaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaagga---tcttcaa 274  Q
    |||||||||||| | | |||| || ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  ||||||   ||||||     
T  11137760 agaaggcggaaggctttccgatggttgaagtggttatggtgtagacttgtggaactacctaaaattcctagtgtag-ttggatgcaaggatggtcttcat 11137858  T
Q  275 aagggcggaaggcattccgatggttgaagaggt 307  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11137859 gaaggcggaaggcattccgatggttgaagaggt 11137891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 378
Target Start/End: Original strand, 30445063 - 30445180
Alignment:
Q  261 acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaacaagggaaagagca 360  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  || |||||||| |||| ||||||||| ||||  |  |||||||||    
T  30445063 acaaggaacttcaagaaggcggaaggcattccgatggttgaagaggcaaggattgaagcttgtggaactacatggtgtagttggaagcatcgaaagagca 30445162  T
Q  361 gcaaggtagttgatggtt 378  Q
    |||| ||  |||||||||    
T  30445163 gcaaagtgattgatggtt 30445180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24543398 - 24543270
Alignment:
Q  222 acttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaagg---atcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcaggg--tgta 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||  |||||   |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||  || |    
T  24543398 acttgtcgaactacctaaaatgcctagtgtagtt-ggatgcaagggtgatcttcaatagggaggaaggcattccgagggttgaagaggcaagggtttgga 24543300  T
Q  317 aacttgtggagctacttggtgtagtgggaa 346  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24543299 agcttgtggagctacttggtgcagttggaa 24543270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 171
Target Start/End: Original strand, 11137783 - 11137848
Alignment:
Q  105 gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagga 171  Q
    |||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11137783 gttgaagtggttatggtgtagacttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttgga-tgcaagga 11137848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 171
Target Start/End: Original strand, 11137926 - 11137991
Alignment:
Q  105 gttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaagga 171  Q
    |||||||| ||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11137926 gttgaagaggttgtggtgtagacttctggaactacctaaaattcctagtgtagttgga-tgcaagga 11137991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 331
Target Start/End: Original strand, 17759031 - 17759100
Alignment:
Q  262 caaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctac 331  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||    
T  17759031 caaggaacttcaagagggcggaaggcattccgaggtttgaaaaggtaaaggtgaaaacttgtggaactac 17759100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 331
Target Start/End: Original strand, 11137764 - 11137817
Alignment:
Q  278 ggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctac 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  11137764 ggcggaaggctttccgatggttgaagtggttatggtgtagacttgtggaactac 11137817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 307
Target Start/End: Original strand, 11137907 - 11137936
Alignment:
Q  278 ggcggaaggcattccgatggttgaagaggt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11137907 ggcggaaggcattccgatggttgaagaggt 11137936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 51 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 70201 - 69872
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  70201 ggccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaaggaagcgggagatgtcctgcattgaagatgttatggtgaatgcttgtgggactacctaaaattcct 70102  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttga 249  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||   |||| |||||||| ||||||||||    |||||||| ||||||||||| ||| |     
T  70101 agcgtagttggactgcaagtactcttcgagaagacggaagacgctccgatggctgaagaggttaaggtgaatgcttgtggagctacctaaaattcctagt 70002  T
Q  250 gtagtttggac-acaaggatc-ttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtggga 345  Q
    |||| ||||||  |||||| | ||| | | |||||||| |||||||| || ||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70001 gtag-ttggactgcaaggacctttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttatgaggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtggga 69903  T
Q  346 a-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  69902 agcaagggaaagatcagcaaggtggttgatg 69872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 461 - 148
Alignment:
Q  51 ggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  461 ggccaatggtgattggatgcaaggtggtcttcaaggaagcgggagatgttctgcattgaagatgttatggtgaatgcaagtgggactacctaaaattcct 362  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggac-cttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtggaactacctaaaatgccttga 249  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||    ||||||| |||||||||||  ||| |     
T  361 agcgtagttggactgcaaggactcttcgagaagtcggaagacgttccgatggctgaagaggttaaggtgaatgcttgtgggactacctaaaactcctagt 262  T
Q  250 gtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtca--gggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa 346  Q
    |||| |||||| ||||||| |||| | | |||||||| |||||||| || ||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  261 gtag-ttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttatggggtgtaaacttgtgaagctacttggtgtagtgggaa 163  T
Q  347 -caagggaaagagca 360  Q
     ||||||||||||||    
T  162 gcaagggaaagagca 148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 23730 - 23908
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattccta 151  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23730 gccaagagtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttctgcgctgaagacggtatggtgaatgcttgtgggactacctaaaactccta 23829  T
Q  152 gtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggttaaggtgtgcacttgtgga 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  23830 gtgtagttggactacaaggaccttcgagaaggcggaagacattccgagggctgaaggggttgaggtgtatacttgtgga 23908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 23920 - 24082
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatg-cttgtggaactacctaaaattcc 149  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  | | ||||| ||||||||| |||||||    
T  23920 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtataagtcttgtagaactacctgaaattcc 24019  T
Q  150 tagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaaggggtt 212  Q
    ||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  24020 tagcgtagttggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggtt 24082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 375
Target Start/End: Original strand, 23997 - 24151
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggac-acaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtc-agggtgtaaact 320  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  23997 cttgtagaactacctgaaattcctagcgtagtt-ggactacaagcatcttcgagaaggcggaagacattccgatggctgaagaggttgatggtgtaaact 24095  T
Q  321 tgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||  |||||||    
T  24096 tgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggtttgagcagcaaggaggttgatg 24151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 207
Target Start/End: Original strand, 4107 - 4269
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggcagcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttg-------tggaactacctaaa 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||       ||||||||||||||    
T  4107 gccaagggtgattggatgtaaggagatcttcaaggaagcgggagatgtcctgtgttgaagaggttatggtggatacttgtggaatatggaactacctaaa 4206  T
Q  145 attcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacataccgagggctgaag 207  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  4207 atttctagtgtagttggactgcaaggctcttcgagaaggcggaagacattccgttggctgaag 4269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Original strand, 4273 - 4351
Alignment:
Q  115 ttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaagacat 193  Q
    |||||||| || |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4273 ttatggtggatacttgggaaactacctcaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaagtcggaaaacat 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 375
Target Start/End: Original strand, 4393 - 4512
Alignment:
Q  255 ttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggtcagggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caaggga 353  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  4393 ttggatacaagaatcttcaaaaaggcggaaggcattccgatggtttaagaagtta-ggtgtaaa-ttgtggagctacatggtgtactgggaagcaaggga 4490  T
Q  354 aagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||| | || ||| |||||||    
T  4491 aagagaaacatggtggttgatg 4512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Original strand, 2525 - 2590
Alignment:
Q  311 ggtgtaaacttgtggagctacttggtgtagtgggaa-caagggaaagagcagcaaggtagttgatg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2525 ggtgtaaacttgtggagctacttggagtagtgggaagcaagggaaagagcagcaaggaggttgatg 2590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 184
Target Start/End: Original strand, 2371 - 2504
Alignment:
Q  52 gccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggca-gcgagagatgtcctgtgttgaagatgttatggtgaatgcttgtggaactacctaaaattcct 150  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||| | ||||||||    
T  2371 gccaagggtgattgggtacaagtagatcttcaaggaaagcgggagatgtctcgtattgaagaggttatggtatagtcttgtagaactacttgaaattcct 2470  T
Q  151 agtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggc 184  Q
    || ||||||||||| |||| | ||| ||||||||    
T  2471 agcgtagttggactacaagcatctttgagaaggc 2504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 81413 - 81351
Alignment:
Q  126 gcttgtggaactacctaaaattcctagtgtagttggactgcaaggaccttcgagaaggcggaag 189  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  81413 gcttgtggaactacctaaatatcctagtgtagttgga-tgcaaggaacttcaagagggcggaag 81351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 81412 - 81329
Alignment:
Q  223 cttgtggaactacctaaaatgccttgagtagtttggacacaaggatcttcaaaagggcggaaggcattccgatggttgaagaggt 307  Q
    ||||||||||||||||||   ||| | |||||| |||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  81412 cttgtggaactacctaaatatcctagtgtagtt-ggatgcaaggaacttcaagagggcggaaggcattccgtggtttgaagaggt 81329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University