View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7136_low_13 (Length: 294)

Name: NF7136_low_13
Description: NF7136
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7136_low_13
NF7136_low_13
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (8-275)||(1274533-1274800)
chr7 (56-275)||(22909111-22909330)
chr7 (63-275)||(2477658-2477872)
chr7 (1-200)||(19063452-19063651)
chr7 (63-275)||(3544828-3545042)
chr7 (63-275)||(2797512-2797725)
chr7 (63-271)||(12183866-12184074)
chr7 (63-275)||(12090410-12090622)
chr7 (63-275)||(12190843-12191055)
chr7 (63-265)||(24482744-24482948)
chr7 (63-275)||(45500660-45500872)
chr7 (63-275)||(10346254-10346467)
chr7 (63-275)||(1953957-1954169)
chr7 (63-275)||(31664444-31664656)
chr7 (63-275)||(31878601-31878812)
chr7 (63-275)||(2631396-2631609)
chr7 (63-275)||(8107837-8108050)
chr7 (63-275)||(22321749-22321962)
chr7 (45-275)||(29032732-29032965)
chr7 (63-275)||(31158225-31158438)
chr7 (63-275)||(22818412-22818624)
chr7 (63-275)||(23795094-23795307)
chr7 (63-275)||(6172527-6172728)
chr7 (138-275)||(19472139-19472275)
chr7 (63-202)||(19472285-19472425)
chr7 (63-122)||(33160182-33160242)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (56-275)||(13509957-13510176)
chr8 (56-275)||(13599487-13599706)
chr8 (62-275)||(22233800-22234013)
chr8 (46-275)||(22243192-22243423)
chr8 (63-275)||(16958550-16958764)
chr8 (63-275)||(22180601-22180814)
chr8 (62-239)||(22222650-22222829)
chr8 (62-239)||(22228992-22229171)
chr8 (63-275)||(12538157-12538370)
chr8 (63-275)||(4861900-4862112)
chr8 (47-253)||(17992876-17993085)
chr8 (63-275)||(8743232-8743445)
chr8 (63-275)||(9068116-9068329)
chr8 (63-275)||(16580085-16580298)
chr8 (63-275)||(3298802-3299014)
chr8 (63-275)||(11308936-11309149)
chr8 (63-275)||(28370093-28370306)
chr8 (63-275)||(28926092-28926305)
chr8 (63-275)||(41577280-41577493)
chr8 (62-264)||(1607284-1607486)
chr8 (89-275)||(24040743-24040927)
chr8 (63-275)||(27348026-27348239)
chr8 (63-275)||(34006721-34006922)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (53-275)||(8996211-8996433)
chr1 (63-275)||(11738747-11738959)
chr1 (63-275)||(41000053-41000265)
chr1 (63-275)||(13217995-13218207)
chr1 (63-275)||(16832732-16832944)
chr1 (63-275)||(38121881-38122094)
chr1 (63-275)||(9667645-9667857)
chr1 (63-275)||(44505217-44505432)
chr1 (63-275)||(12168165-12168378)
chr1 (63-275)||(39001130-39001343)
chr1 (63-275)||(432290-432502)
chr1 (63-275)||(33492147-33492360)
chr1 (49-256)||(15161087-15161296)
chr1 (63-252)||(16129659-16129848)
chr1 (63-236)||(49249072-49249245)
chr1 (46-275)||(9268617-9268848)
chr1 (63-275)||(13830288-13830500)
chr1 (103-252)||(16130254-16130402)
chr1 (172-275)||(36083868-36083970)
chr1 (63-267)||(6244201-6244399)
chr1 (63-275)||(39454103-39454319)
chr1 (63-122)||(36080220-36080279)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (63-264)||(36557482-36557684)
chr2 (63-275)||(36667818-36668031)
chr2 (63-267)||(28457834-28458039)
chr2 (63-275)||(36040212-36040424)
chr2 (103-275)||(21160006-21160178)
chr2 (67-275)||(14700645-14700855)
chr2 (63-275)||(13230291-13230503)
chr2 (63-275)||(23924981-23925193)
chr2 (63-275)||(32522929-32523141)
chr2 (103-275)||(9787054-9787227)
chr2 (63-275)||(27257385-27257597)
chr2 (63-275)||(29223715-29223927)
chr2 (63-275)||(29337014-29337226)
chr2 (63-256)||(42702175-42702368)
chr2 (65-275)||(43991533-43991737)
chr2 (63-275)||(24663079-24663293)
chr2 (63-236)||(5784513-5784686)
chr2 (178-275)||(41977710-41977807)
chr2 (63-122)||(492739-492798)
chr2 (63-128)||(8687769-8687835)
chr2 (217-272)||(11651893-11651948)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (56-275)||(12153-12370)
scaffold0298 (56-275)||(15923-16140)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (56-275)||(12188-12405)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (47-275)||(14270654-14270885)
chr6 (56-267)||(25976943-25977153)
chr6 (63-275)||(5988951-5989164)
chr6 (62-267)||(1454795-1455000)
chr6 (62-267)||(1466487-1466692)
chr6 (63-275)||(21596477-21596693)
chr6 (63-275)||(34006502-34006715)
chr6 (63-275)||(24161205-24161417)
chr6 (24-172)||(34913410-34913558)
chr6 (63-275)||(32806712-32806924)
chr6 (63-275)||(3539047-3539260)
chr6 (63-275)||(26515377-26515590)
chr6 (63-275)||(21631180-21631395)
chr6 (63-275)||(24878865-24879078)
chr6 (63-275)||(9932754-9932967)
chr6 (62-275)||(13173773-13173978)
chr6 (62-275)||(13182306-13182511)
chr6 (63-236)||(14479560-14479733)
chr6 (103-265)||(9518403-9518565)
chr6 (103-267)||(15642457-15642621)
chr6 (73-275)||(32821812-32822012)
chr6 (63-275)||(26604339-26604552)
chr6 (177-275)||(34913803-34913901)
chr6 (182-267)||(6868010-6868095)
chr6 (63-144)||(26510392-26510474)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (56-275)||(37251854-37252072)
chr5 (63-275)||(34869695-34869908)
chr5 (63-275)||(27167047-27167259)
chr5 (63-275)||(11766755-11766967)
chr5 (50-275)||(39655986-39656214)
chr5 (63-275)||(7314965-7315178)
chr5 (63-275)||(9404424-9404637)
chr5 (63-275)||(11723225-11723438)
chr5 (63-275)||(34456297-34456510)
chr5 (63-275)||(16904558-16904771)
chr5 (63-275)||(30607025-30607238)
chr5 (63-275)||(31845980-31846192)
chr5 (63-275)||(33434603-33434815)
chr5 (63-275)||(24835735-24835948)
chr5 (63-275)||(6269890-6270102)
chr5 (63-236)||(14344469-14344642)
chr5 (53-144)||(32226823-32226914)
chr5 (217-275)||(7315358-7315417)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (63-267)||(30218348-30218553)
chr4 (63-275)||(26069725-26069940)
chr4 (46-275)||(33110651-33110884)
chr4 (63-275)||(20948745-20948959)
chr4 (83-275)||(53895400-53895590)
chr4 (65-275)||(46691986-46692196)
chr4 (63-275)||(19247777-19247989)
chr4 (63-275)||(40995496-40995711)
chr4 (63-275)||(42532836-42533049)
chr4 (63-275)||(4839085-4839298)
chr4 (63-274)||(1187965-1188176)
chr4 (63-275)||(21677616-21677829)
chr4 (63-275)||(22047681-22047894)
chr4 (63-275)||(26373579-26373791)
chr4 (63-275)||(323438-323651)
chr4 (63-275)||(55326774-55326989)
chr4 (63-275)||(52618514-52618715)
chr4 (63-275)||(5273511-5273713)
chr4 (63-264)||(6639977-6640178)
chr4 (63-218)||(44432060-44432215)
chr4 (63-275)||(35416645-35416845)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (56-265)||(14178-14386)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (46-275)||(1232440-1232676)
chr3 (63-268)||(33247988-33248194)
chr3 (63-275)||(23193923-23194135)
chr3 (63-275)||(45527647-45527859)
chr3 (63-275)||(20837094-20837306)
chr3 (45-275)||(2357141-2357374)
chr3 (63-275)||(3588400-3588613)
chr3 (63-275)||(9989396-9989608)
chr3 (63-275)||(22097667-22097879)
chr3 (63-275)||(37471636-37471848)
chr3 (63-275)||(7653171-7653384)
chr3 (63-275)||(8615503-8615716)
chr3 (63-275)||(27850500-27850711)
chr3 (63-275)||(36469385-36469596)
chr3 (63-275)||(48168143-48168355)
chr3 (63-275)||(10386019-10386232)
chr3 (67-275)||(26335121-26335320)
chr3 (89-275)||(4742951-4743135)
chr3 (63-236)||(27030672-27030845)
chr3 (63-275)||(52308034-52308247)
chr3 (63-275)||(23385396-23385609)
chr3 (63-264)||(49434097-49434297)
chr3 (63-166)||(20963711-20963815)
chr3 (244-275)||(37022870-37022901)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (63-275)||(116517-116729)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (53-260)||(948-1157)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (63-275)||(16421-16635)
[»] scaffold0147 (1 HSPs)
scaffold0147 (63-275)||(6732-6944)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (63-275)||(76401-76613)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (63-275)||(28848-29061)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (63-275)||(8742-8955)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (63-275)||(25599-25812)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (50-275)||(35231-35458)
[»] scaffold1494 (1 HSPs)
scaffold1494 (63-236)||(1564-1737)
[»] scaffold1832 (1 HSPs)
scaffold1832 (63-193)||(1-132)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (187-275)||(7191-7275)
scaffold0447 (187-275)||(11805-11889)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (187-275)||(9800-9884)
[»] scaffold0458 (1 HSPs)
scaffold0458 (63-275)||(9399-9615)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (214-275)||(12429-12491)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 275
Target Start/End: Original strand, 1274533 - 1274800
Alignment:
Q  8 tttgggcagagagcaatatcacatatttttggagaaatagagagatgacatttctagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||  |||||    
T  1274533 tttgggcagagagcaatatcacatatttttggagagatagagagatggcatttctagagaaacacaaagtaaggtgttatgagtagatttaactcaagat 1274632  T
Q  108 ttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggtt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  1274633 ttgttgagacatcatggatctcggcattgaatctttatctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttctgggtt 1274732  T
Q  208 ttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1274733 ttgaggtattcaaacaagttattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatttattc 1274800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 56 - 275
Target Start/End: Original strand, 22909111 - 22909330
Alignment:
Q  56 catttctagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22909111 catttctagagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattcaatctaagatttgttgagacatcatggatctagtcattgaatcttcatcttttcttca 22909210  T
Q  156 tcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatat 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22909211 tcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatat 22909310  T
Q  256 atggttctagctatttattc 275  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  22909311 atggttctagctatatattc 22909330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 2477658 - 2477872
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  2477658 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcatcttttcctcatccttt 2477757  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2477758 gcaaagctatcatagacatatgtagctccatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 2477857  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  2477858 ctagcttatttattc 2477872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 19063452 - 19063651
Alignment:
Q  1 atcactgtttgggcagagagcaatatcacatatttttggagaaatagagagatgacatttctagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaac 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  19063452 atcactctttgggcagagagcaatatcacatatttttggagagatagagagatggtatttctagagaaacacaaagtaaggtgttaggagtagattcaac 19063551  T
Q  101 ctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctaccctt 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19063552 ctaaaatttgttgagacatcatggatctaagcattgaatcttcatctcttcttcattctatgtaaagctatcatagacatatgtagttatatctaccctt 19063651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3545042 - 3544828
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  3545042 agagaaacaaaaagaaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatggatctaggcattaaatcttcatctcttctccatccttt 3544943  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||| ||||||||||||||    
T  3544942 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaattacttgatcttttaatatatggtt 3544843  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  3544842 ctagcttatttattc 3544828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2797725 - 2797512
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  2797725 agagaaacacaaaacaaggtagttaggagtagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 2797626  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  2797625 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaattttttgatcatttaatatatggtt 2797526  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  2797525 ctagctatttattc 2797512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 271
Target Start/End: Original strand, 12183866 - 12184074
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  12183866 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatagatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 12183965  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  12183966 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacttttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 12184064  T
Q  262 ctagctattt 271  Q
    ||||||||||    
T  12184065 ctagctattt 12184074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12090622 - 12090410
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  12090622 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtaaattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 12090523  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  12090522 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctaatcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctaatatgtaatattttgatcatttaatatatggtt 12090424  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  12090423 ctagctatttattc 12090410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 12190843 - 12191055
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  12190843 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 12190942  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  12190943 gcaaagctatcatagacatatgtatttacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 12191041  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    || | |||||||||    
T  12191042 ctggatatttattc 12191055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 63 - 265
Target Start/End: Original strand, 24482744 - 24482948
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24482744 agagaaacacaaagcaagggagttatgagtagatcaaacccaagatttgttgagacatcatggatctagacattgaatcttcatctcttcttcatccttt 24482843  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggtttt-gaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| || || ||| ||||| |||||||    
T  24482844 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtggattttagaggtattcaaacaaactattatgtaatcttttgatcttttaaaatatggt 24482943  T
Q  261 tctag 265  Q
    |||||    
T  24482944 tctag 24482948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 45500872 - 45500660
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  45500872 agagaaacacaaagcaaggtagttatgagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatagatcttgtcattgaatcttcatttcttcttcatcattt 45500773  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || | ||||||||||||||||    
T  45500772 gcaaagctatcacagacatatgtagttatatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatattttgaccatttaatatatggtt 45500674  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
     ||| |||||||||    
T  45500673 atagttatttattc 45500660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10346467 - 10346254
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  10346467 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 10346368  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  10346367 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 10346269  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  10346268 ctagcttatttattc 10346254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 1953957 - 1954169
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  1953957 agagaaacacaaagcaatgtagttaggagtagattcaagccaagatttgttaagacatcatggatcttgtcattgaatcttcaattcttcttcatccttt 1954056  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  1954057 gaaaagctatcatagacatatgtagctatatctactattgt-ggttttgaggtatttaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 1954155  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  1954156 ctagctatttattc 1954169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31664656 - 31664444
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  31664656 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttaatccttt 31664557  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
     ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  31664556 acaaagctatcataaacatatctagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcgaacaggctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 31664458  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  31664457 ctagctatttattc 31664444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 31878601 - 31878812
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||| || |||||||| |    
T  31878601 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatctttt-ttcatccttt 31878699  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  31878700 gcaaaactatcaaagacatatgtagctacatctactcttgtgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 31878798  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  31878799 ctagctatttattc 31878812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 2631396 - 2631609
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  2631396 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 2631495  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  2631496 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 2631594  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  2631595 ctagcttatttattc 2631609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8108050 - 8107837
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  8108050 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 8107951  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  8107950 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-aattttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 8107852  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  8107851 ctagcttatttattc 8107837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22321962 - 22321749
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  22321962 agagaaatacaaagcaagttagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttttcattgaatcttcatcctttcttcatccttt 22321863  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  22321862 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcctttaatatatggtt 22321764  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  22321763 ctagcttatttattc 22321749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29032965 - 29032732
Alignment:
Q  45 tagagagatgacatttcta--gagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatctt 142  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |   ||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||    
T  29032965 tagagagatggcatttctatagagaaacacaaagtaaggtgttaggagtagattctattcaagatttgttgagacatcatgagtctagacatggaatctt 29032866  T
Q  143 catctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactctt 242  Q
    ||||| |  |||||| | ||| |||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  29032865 catctttctttcatcatttgccaagcttgcatagacatatgtagctacatctaaccttgtgggttttgaggtattcaaacaagtcattatgtaaactttt 29032766  T
Q  243 catcatttaatatatggttctagc-tatttattc 275  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29032765 gatcttttaatatatggttctagcttatttattc 29032732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31158438 - 31158225
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  31158438 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcatgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 31158339  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  31158338 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaaccttttgatcttttaatatatggtt 31158240  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  31158239 ctagcttatttattc 31158225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 22818412 - 22818624
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||| ||||||||| | |    
T  22818412 agagaaatacaaggcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatgaaatcttcatcttttcttcatcattt 22818511  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || ||||||| |||||||    
T  22818512 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatccattcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgataatttaatgtatggtt 22818610  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  22818611 ctagctatttattc 22818624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 23795094 - 23795307
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  23795094 agagaaactcaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 23795193  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  23795194 gcaaagctattatagacatatgtagctccatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 23795292  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  23795293 ctagcttatttattc 23795307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 6172527 - 6172728
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||           || |    
T  6172527 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatagatcctgtcatggaatcttcatc-----------cttt 6172615  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  6172616 gcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactcttgtag-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 6172714  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  6172715 ctagctatttattc 6172728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 138 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19472275 - 19472139
Alignment:
Q  138 atcttcatctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaa 237  Q
    |||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  19472275 atcttcatcctttcttcatcctttgtaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgtag-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaat 19472177  T
Q  238 ctcttcatcatttaatatatggttctagctatttattc 275  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19472176 cttttgatcatttaatatatggttctagctatttattc 19472139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19472425 - 19472285
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | | | |||||||||||  |||| |||||| |    
T  19472425 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcttggaatcttcatcctttctgcatccttt 19472326  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgt 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19472325 gtaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt 19472285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 122
Target Start/End: Original strand, 33160182 - 33160242
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcat 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33160182 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcat 33160242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 56 - 275
Target Start/End: Original strand, 13509957 - 13510176
Alignment:
Q  56 catttctagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13509957 catttctagagaaacacaaagcaagatgttagaagtagattcaacctaagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcatcttttcttca 13510056  T
Q  156 tcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatat 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13510057 tcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatat 13510156  T
Q  256 atggttctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13510157 atggttctagctatttattc 13510176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 56 - 275
Target Start/End: Original strand, 13599487 - 13599706
Alignment:
Q  56 catttctagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13599487 catttctagagaaacacaaagcaagatgttagaagtagattcaacctaagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcatcttttcttca 13599586  T
Q  156 tcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatat 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13599587 tcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatat 13599686  T
Q  256 atggttctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13599687 atggttctagctatttattc 13599706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 62 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22234013 - 22233800
Alignment:
Q  62 tagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  22234013 tagagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattctacccaagatttgttgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 22233914  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  22233913 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaatatatgatt 22233814  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    |||||| |||||||    
T  22233813 ctagctgtttattc 22233800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 46 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22243423 - 22243192
Alignment:
Q  46 agagagatgacatttctagagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttca 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22243423 agagagatgacatttctagagaaacacaaaacaaggtagttagaagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttca 22243324  T
Q  145 tctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttca 244  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |    
T  22243323 tcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacctttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatttcttga 22243224  T
Q  245 tcatttaatatatggttctagc-tatttattc 275  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22243223 tcttttaatatatggttctagcttatttattc 22243192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 16958550 - 16958764
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  16958550 agagaaacacaaagcaaggtagttaagagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatgagtctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 16958649  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  16958650 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatttaatttcttgatcttttaatatatggtt 16958749  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  16958750 ctagcttatttattc 16958764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 22180601 - 22180814
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||| |    
T  22180601 agagaaacaaaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcctttcttcatccttt 22180700  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  22180701 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 22180800  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  22180801 ctagctatttattc 22180814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 62 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22222829 - 22222650
Alignment:
Q  62 tagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctctt--cttcatcct 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  22222829 tagagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattctacccaagatttgttgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatctcttttcttcatcct 22222730  T
Q  160 atgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaact 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22222729 ttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaact 22222650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 62 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22229171 - 22228992
Alignment:
Q  62 tagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctctt--cttcatcct 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  22229171 tagagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattctacccaagatttgttgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatctcttttcttcatcct 22229072  T
Q  160 atgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaact 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22229071 ttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaact 22228992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 12538157 - 12538370
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| || || |||||| ||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  12538157 agagaaacacaaatcaaggtagttaggattagattcaagctatgatttgttgagacatcatgaatcttgtcattgaatcttcatctcttcttcatcattt 12538256  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  12538257 gcaaagctatcttagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaaactattatgtaattttttgatcatttaatatatggtt 12538356  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  12538357 ctagctatttattc 12538370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4862112 - 4861900
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  4862112 agagaaacacaaggtaaggtagttaagagtagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 4862013  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  4862012 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 4861914  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  4861913 ctagctatttattc 4861900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 253
Target Start/End: Original strand, 17992876 - 17993085
Alignment:
Q  47 gagagatgacatttctagaga--aacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttc 143  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||  ||||||||||||  |||| | ||| ||||||||    
T  17992876 gagagatggcatttctagagagaaacacaaggcaaggtagttaagagtagattcaatccaagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttc 17992975  T
Q  144 atctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttc 243  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  17992976 atcttttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtggattttgaggtattcaaacaagccattatgtaatcttttg 17993075  T
Q  244 atcatttaat 253  Q
    ||||||||||    
T  17993076 atcatttaat 17993085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8743445 - 8743232
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  8743445 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 8743346  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  8743345 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 8743247  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  8743246 ctagcttatttattc 8743232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9068329 - 9068116
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  9068329 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 9068230  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  9068229 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 9068131  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  9068130 ctagcttatttattc 9068116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 16580085 - 16580298
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  16580085 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 16580184  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  16580185 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 16580283  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  16580284 ctagcttatttattc 16580298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 3298802 - 3299014
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||  |    
T  3298802 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatagaatcttcaccctttcttcatccatt 3298901  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  3298902 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 3299000  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||| ||||||||    
T  3299001 ctagcaatttattc 3299014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11309149 - 11308936
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| || |  ||||||||||| |    
T  11309149 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatctccaccctttcttcatccttt 11309050  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  11309049 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 11308951  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  11308950 ctagcttatttattc 11308936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 28370093 - 28370306
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  28370093 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 28370192  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  28370193 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatttactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 28370291  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  28370292 ctagcttatttattc 28370306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28926305 - 28926092
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  28926305 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 28926206  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||  ||||||||||||||    
T  28926205 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatattttaatatatggtt 28926107  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  28926106 ctagcttatttattc 28926092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41577493 - 41577280
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  41577493 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 41577394  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  41577393 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agctttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 41577295  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  41577294 ctagcttatttattc 41577280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 264
Target Start/End: Original strand, 1607284 - 1607486
Alignment:
Q  62 tagagaaacacaaagcaagg-tgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatccta 160  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||| |  ||||||||     
T  1607284 tagagaaacacaaagcaagggtgttaagagtatattcttcctaagatttgttgagacatcatgaatcttagcatggaatcttcatctttctttcatcctt 1607383  T
Q  161 tgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggt 260  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||  | ||||||||||||||    
T  1607384 tgcaaagctttcataggcatatgtagctacatctacccttgtggattttgaggtattcaaacaaactattatgtaatct-ttatttatttaatatatggt 1607482  T
Q  261 tcta 264  Q
    ||||    
T  1607483 tcta 1607486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 275
Target Start/End: Original strand, 24040743 - 24040927
Alignment:
Q  89 agtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggt 188  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24040743 agtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcatttcttcctcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagct 24040842  T
Q  189 acatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagctatttattc 275  Q
    | |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24040843 atatctactcttat-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgat-atttaatatatggttttagctatttattc 24040927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 27348026 - 27348239
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  27348026 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 27348125  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||  ||||||||||||||    
T  27348126 gcaaagttatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agtcttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatattttaatatatggtt 27348224  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  27348225 ctagcttatttattc 27348239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34006922 - 34006721
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| || | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||           || |    
T  34006922 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattaaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatc-----------cttt 34006834  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  34006833 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgtag-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 34006735  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  34006734 ctagctatttattc 34006721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 53 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8996433 - 8996211
Alignment:
Q  53 tgacatttctagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttct 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8996433 tgacatttctagagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattcaacccaagatttgttgcgacatcatggatctaggcattgaatcttcatctcttct 8996334  T
Q  153 tcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8996333 tcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgatgtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaa 8996234  T
Q  253 tatatggttctagctatttattc 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  8996233 tatatgattctagctatttattc 8996211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11738959 - 11738747
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  11738959 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtaaattcaagccaagatttgttgacacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 11738860  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  11738859 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgcaatcttttgatcatttaatatatggtt 11738761  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  11738760 ctagctatttattc 11738747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41000265 - 41000053
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  41000265 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcatttcttcctcatccttt 41000166  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  41000165 gcaaatctatcatagacatatgtagttatatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 41000067  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  41000066 ctagctatttattc 41000053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13218207 - 13217995
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggtg-ttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  13218207 agagaaacacaaagcaaggtggttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggaacttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 13218108  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| || || || |||||||||| ||||    
T  13218107 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggcattcaaacaagatattatgtaatcttttgataatttaatatacggtt 13218009  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  13218008 ctagctatttattc 13217995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16832944 - 16832732
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||   |||  ||||||||||| ||||||||||| |    
T  16832944 agagaaacacaaagtaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttatcatgaaatcttcatcttttcttcatccttt 16832845  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16832844 gcaaagctatcatagatatatgtagctatatctactcttgtgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 16832746  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  16832745 ctagctatttattc 16832732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 38122094 - 38121881
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  38122094 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 38121995  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  38121994 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 38121896  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  38121895 ctagcttatttattc 38121881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9667857 - 9667645
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  9667857 agagaaatacaaggcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 9667758  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  9667757 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatacattcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 9667659  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||| ||||||||    
T  9667658 ctagcaatttattc 9667645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44505432 - 44505217
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  44505432 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaaaatttgttgagacatcatggatcatgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 44505333  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattc-aaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatat-gg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || || ||||||||||| ||    
T  44505332 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctaaacttgtggtttttgaggtattcaaaacaagctattatgtaatcttttgattatttaatatatggg 44505233  T
Q  260 ttctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||||    
T  44505232 ttctagctatttattc 44505217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12168378 - 12168165
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  12168378 agagaaacacaaagcaaggtagttaggtgtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccatttcttcatccttt 12168279  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  12168278 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 12168180  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  12168179 ctagcttatttattc 12168165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39001343 - 39001130
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  39001343 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 39001244  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  39001243 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttaaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 39001145  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  39001144 ctagcttatttattc 39001130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 432502 - 432290
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  432502 agagaaatacaaggcaaggtagttaggagtagactcaagccaagatttgttgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 432403  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  432402 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatccattcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 432304  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||| ||||||||    
T  432303 ctagcaatttattc 432290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33492360 - 33492147
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  33492360 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 33492261  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  33492260 gcaaagctatcatagacatatgtagccacatctactcttgt-agttctgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 33492162  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  33492161 ctagcttatttattc 33492147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 256
Target Start/End: Original strand, 15161087 - 15161296
Alignment:
Q  49 gagatgacatttctagag--aaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatc 146  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||| | ||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||  ||||  || | ||||||||||     
T  15161087 gagatggcatttctagagagaaacacaaagcaagatattaggagtagattcttcccaagatttgttgagacatcatgaatcttagcttggaatcttcata 15161186  T
Q  147 tcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatc 246  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  15161187 ttttcttcatcctctgcaaagctatcatagacatatgtagttacatctactcttatgggttttaaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatt 15161286  T
Q  247 atttaatata 256  Q
     |||||||||    
T  15161287 ttttaatata 15161296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 252
Target Start/End: Original strand, 16129659 - 16129848
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  16129659 agagaaacacaaagcaagatagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcatttcttcttcatcattt 16129758  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||    
T  16129759 gcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaatctattatgtaatcttttgatcatttaa 16129848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Original strand, 49249072 - 49249245
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  49249072 agagaaacacaaagtaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 49249171  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49249172 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaa 49249245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 275
Target Start/End: Original strand, 9268617 - 9268848
Alignment:
Q  46 agagagatgacatttctagaga--aacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttc 143  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||  | | ||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||   ||||| |||  |||||||    
T  9268617 agagagatgacatttttagagacaaacataaataaggttgttaagagtagattcttcctaatatttattgagacatcatgagtctagacatgaaatcttc 9268716  T
Q  144 atctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttc 243  Q
    |||| |  || ||||| ||| || ||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  9268717 atctttcttttatcctttgccaaacttgcaaagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaccaagctattatgtaaactcttg 9268816  T
Q  244 atcatttaatatatggttctagctatttattc 275  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9268817 atcttttaatatatgtttctagctatttattc 9268848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 13830288 - 13830500
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatg 162  Q
    |||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||  ||||  ||||||||| | |  |||||||| ||    
T  13830288 agagaaacacaaggaagggtgttaggagtagattcttcctaagatttgttgagacgtcatgaatcttagcatgaaatcttcatttttctttcatcctttg 13830387  T
Q  163 caaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttc 262  Q
    ||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    ||| |||||||||||||||||||    
T  13830388 caaagttttcatagacatatgtagctacatttacccttgtgggtttttaggtattcaaacaagctattatgtatta-cttgatcatttaatatatggttc 13830486  T
Q  263 tagc-tatttattc 275  Q
    |||| |||||||||    
T  13830487 tagcttatttattc 13830500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 252
Target Start/End: Original strand, 16130254 - 16130402
Alignment:
Q  103 aagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgt 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  16130254 aagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcatttcttcttcatcatttgcaaagttatcatagacatatgtagctatatctactcttgt 16130353  T
Q  203 gggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaa 252  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  16130354 -gattttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaa 16130402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 172 - 275
Target Start/End: Original strand, 36083868 - 36083970
Alignment:
Q  172 catagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagc-tatt 270  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  36083868 catagacatatgtagttacatctacc-ttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactctt-atcttttaatatatggttctagcttatt 36083965  T
Q  271 tattc 275  Q
    |||||    
T  36083966 tattc 36083970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 267
Target Start/End: Original strand, 6244201 - 6244399
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaagg-tgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttc-atccta 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |  ||||||||| |||| |||||  || | | ||| ||||||||||| ||||||| ||| |     
T  6244201 agagaaacacaaagcaagggtgttaggagtagattcttctaaagatttgtagagatatcatgaatattgtcatggaatcttcatc-cttcttccatcttt 6244299  T
Q  161 tgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggt 260  Q
    ||||||||||  ||  | | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6244300 tgcaaagctactatgaaaacatatagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaaca-------atgtaaactcttgatcatttaatatatggt 6244392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 39454103 - 39454319
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaagg-tgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttctt-catccta 160  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||  |||| ||||  |||| ||||||| |||| |||||  ||||  | || |||||||||||| ||||| |||| |     
T  39454103 agagaaacacaaatcaagcatgttagaagtagattcttcctaggatttgtagagatatcatgaatcttagtatggaatcttcatct-ttcttccatcttt 39454201  T
Q  161 tgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccatta---tgtaaactcttcatcatttaatatat 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||   ||||| || || |||||||||| ||     
T  39454202 tgcaaagttatcatagacatatgtagctacatctacgcttgtggtttttaaggtattcaaacaagctattaatttgtaatct-ttgatcatttaatttaa 39454300  T
Q  258 ggttctagc-tatttattc 275  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  39454301 ggttctagcttatttattc 39454319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 122
Target Start/End: Original strand, 36080220 - 36080279
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | | |||| |||||||||||||||    
T  36080220 agagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattctatccaagacttgttgagacatcat 36080279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36557684 - 36557482
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  36557684 agagaaacacatagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatggatctaggcatttaatcttcatcttttcttcatccttt 36557585  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36557584 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtggattttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 36557485  T
Q  262 cta 264  Q
    |||    
T  36557484 cta 36557482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36668031 - 36667818
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| | | || | |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36668031 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagacttaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcatctcttcttcatccttt 36667932  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  36667931 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 36667832  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  36667831 ctagctatttattc 36667818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 63 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28458039 - 28457834
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28458039 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaactcaagatttgttaagacatcatggatctaggcattgaatcttcatcttttcttcatccttt 28457940  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| |||||||||| |||    
T  28457939 gcaatgctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatttcttgatcttttaatatatagtt 28457840  T
Q  262 ctagct 267  Q
    ||||||    
T  28457839 ctagct 28457834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36040424 - 36040212
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  36040424 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 36040325  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  36040324 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 36040226  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  36040225 ctagctatttattc 36040212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 103 - 275
Target Start/End: Original strand, 21160006 - 21160178
Alignment:
Q  103 aagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgt 202  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21160006 aagatttgttgagacatcatgaatctaggcatgaaatcttcatctcttcttcatcttttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgt 21160105  T
Q  203 gggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21160106 gggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaatttcttgatcattcaatatatgattctagctatttattc 21160178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Original strand, 14700645 - 14700855
Alignment:
Q  67 aaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatgcaa 165  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |   ||||||||  ||| |||||| | ||||||||||| |||||    
T  14700645 aaacacaaagcaaggtagttaagagtagattcaacccaagatttgttgagacatcttgagtctaggcaaggaaacttcatattttcttcatcctttgcaa 14700744  T
Q  166 agctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctag 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  14700745 agctatcatagacatatgtagttacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaactaactattatgtaaacttttgatcttttaatatatggttctag 14700844  T
Q  266 c-tatttattc 275  Q
    | |||||||||    
T  14700845 cttatttattc 14700855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13230503 - 13230291
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  13230503 agagaaacacaaagcaaggtagttatgagtagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 13230404  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  13230403 acaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttctgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 13230305  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  13230304 ctagctatttattc 13230291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23925193 - 23924981
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  23925193 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagcgaagatttgttgagacatcatggatcatgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 23925094  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || |||||||||||||||    
T  23925093 gcaaagctatcatagacatatgtatctacatctactcttgt-tgttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgataatttaatatatggtt 23924995  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
     |||||||||||||    
T  23924994 atagctatttattc 23924981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 32522929 - 32523141
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  32522929 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttattgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcatttcttcttcgtccttt 32523028  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  32523029 gcaaagctatcatggacatatgtagctatttctacccttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 32523127  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
     |||| ||||||||    
T  32523128 atagcgatttattc 32523141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 103 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9787227 - 9787054
Alignment:
Q  103 aagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgt 202  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  9787227 aagatttgttgagatatcatgaatctaggcatgaaatcttcatattttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatatgtaagtatatctaccattgt 9787128  T
Q  203 gggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagc-tatttattc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9787127 gggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaacttttgatcatttaatatatggttatagcttatttattc 9787054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 27257385 - 27257597
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||| | ||| |||| ||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  27257385 agagaaacacaaaacaaggtagtttggaggagatttaacccaagattcattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 27257484  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| |||||||||| |||    
T  27257485 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatagtt 27257583  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  27257584 ctagctatttattc 27257597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 29223715 - 29223927
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  29223715 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 29223814  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  29223815 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgtag--tttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 29223912  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  29223913 ctagcttatttattc 29223927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 29337014 - 29337226
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  29337014 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 29337113  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  29337114 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgtag--tttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 29337211  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  29337212 ctagcttatttattc 29337226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 42702368 - 42702175
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||| |||| |    
T  42702368 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcctccttt 42702269  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatata 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||||    
T  42702268 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaataagctattatgtaatcttttgatcatttaatata 42702175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Original strand, 43991533 - 43991737
Alignment:
Q  65 agaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatgc 163  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||      ||||||||||| |||    
T  43991533 agaaacacaaggcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatctt------ttcttcatcctttgc 43991626  T
Q  164 aaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  43991627 aaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgtgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtgct 43991725  T
Q  264 agctatttattc 275  Q
    ||||||||||||    
T  43991726 agctatttattc 43991737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24663293 - 24663079
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||  | ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| |  |||||||| |    
T  24663293 agagaaacacaaagcaaggttgttaggagtagtttcataccaagatttgttgagacatcatgaatcttagcattgaatcttcatctttctttcatccttt 24663194  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    || |||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24663193 gcgaagcttgcatagacatatgtagctacatctacgcttgtgagttttgaggtattcaaacaagctattacgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 24663094  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  24663093 ctagcttatttattc 24663079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5784686 - 5784513
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  5784686 agagaaacacaaagcaaggaagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 5784587  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5784586 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaa 5784513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 275
Target Start/End: Original strand, 41977710 - 41977807
Alignment:
Q  178 catatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagctatttattc 275  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| | || |||||||||||||    
T  41977710 catatatagctacatctaccattgtgggttttaaggtattcaaacaagccattatgtaaacttttgatattttaatatacgattttagctatttattc 41977807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 122
Target Start/End: Original strand, 492739 - 492798
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcat 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  492739 agagaaacacaaatcaaggtgttaggagtagattctacccaagatttgttgagacatcat 492798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8687835 - 8687769
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatct 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  8687835 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatct 8687769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 272
Target Start/End: Original strand, 11651893 - 11651948
Alignment:
Q  217 tcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagctattta 272  Q
    |||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11651893 tcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatctaatatatgattctagctattta 11651948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 56 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12370 - 12153
Alignment:
Q  56 catttctagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12370 catttctagagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcattgaatcttcatctcttcttca 12271  T
Q  156 tcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatat 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||    
T  12270 tcctttgcaaagctatcatagacata--tagctgcatctacccttgtgtgttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatat 12173  T
Q  256 atggttctagctatttattc 275  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  12172 atggtactagctatttattc 12153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 56 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16140 - 15923
Alignment:
Q  56 catttctagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16140 catttctagagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcattgaatcttcatctcttcttca 16041  T
Q  156 tcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatat 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||    
T  16040 tcctttgcaaagctatcatagacata--tagctgcatctacccttgtgtgttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatat 15943  T
Q  256 atggttctagctatttattc 275  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  15942 atggtactagctatttattc 15923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 56 - 275
Target Start/End: Original strand, 12188 - 12405
Alignment:
Q  56 catttctagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12188 catttctagagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattcaacccaagatttattgagacatcatgaatctaggcattgaatcttcatctcttcttca 12287  T
Q  156 tcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatat 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||    
T  12288 tcctttgcaaagctatcatagacata--tagctgcatctacccttgtgtgttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatat 12385  T
Q  256 atggttctagctatttattc 275  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  12386 atggtactagctatttattc 12405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 275
Target Start/End: Original strand, 14270654 - 14270885
Alignment:
Q  47 gagagatgacatttctagag--aaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttca 144  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14270654 gagagatgacatttctagagagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatagatctaggcagtgaatcttca 14270753  T
Q  145 tctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttca 244  Q
    ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |    
T  14270754 tcttttcttcatcttttgcaaaactatcatagacatatgtagctatatatacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagcaattatgtaatttcttga 14270853  T
Q  245 tcatttaatatatggttctagc-tatttattc 275  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14270854 ttttttaatatatggttctagcttatttattc 14270885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 267
Target Start/End: Original strand, 25976943 - 25977153
Alignment:
Q  56 catttctagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttca 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||  |||| |  || |||||||||||| |||||||    
T  25976943 catttctagagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatcttgttatggaatcttcatcttttcttca 25977042  T
Q  156 tcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatat 255  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25977043 tctt-tgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcttttaatat 25977141  T
Q  256 atggttctagct 267  Q
    ||||||||||||    
T  25977142 atggttctagct 25977153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5989164 - 5988951
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| | |    
T  5989164 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcatctttt-ttcatcattt 5989066  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  5989065 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatttacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 5988966  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  5988965 ctagcttatttattc 5988951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 62 - 267
Target Start/End: Original strand, 1454795 - 1455000
Alignment:
Q  62 tagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |    
T  1454795 tagagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattctacccaagatttgttgagacatcatgagtctaggcatggaatcttcatctttctttcatccttt 1454894  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    || |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1454895 gccaagcttgcatagacatatgtaactacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 1454994  T
Q  262 ctagct 267  Q
    ||||||    
T  1454995 ctagct 1455000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 62 - 267
Target Start/End: Original strand, 1466487 - 1466692
Alignment:
Q  62 tagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |    
T  1466487 tagagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattctacccaagatttgttgagacatcatgagtctaggcatggaatcttcatctttctttcatccttt 1466586  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    || |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1466587 gccaagcttgcatagacatatgtaactacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 1466686  T
Q  262 ctagct 267  Q
    ||||||    
T  1466687 ctagct 1466692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21596693 - 21596477
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctag----gcattgaatcttcatctcttcttcatc 157  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    |||| |||||||||||| |||||||||    
T  21596693 agagaaacacaaagcatggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatagatcttgtcatgcatggaatcttcatcttttcttcatc 21596594  T
Q  158 ctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatat 257  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21596593 ctttgcaaagctatcatagacatatgtagctacatctaaacttgtgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatat 21596495  T
Q  258 ggttctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21596494 ggttctagctatttattc 21596477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 34006502 - 34006715
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  34006502 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaaaccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 34006601  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  34006602 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 34006700  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  34006701 ctagcttatttattc 34006715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24161417 - 24161205
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||      
T  24161417 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagcaaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcattcttg 24161318  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  24161317 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatattttgatcatttaatatatggtt 24161219  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    |||| |||||||||    
T  24161218 ctagttatttattc 24161205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 172
Target Start/End: Original strand, 34913410 - 34913558
Alignment:
Q  24 tatcacatatttttggagaaatagagagatgacatttctagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcata 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  34913410 tatcacatatttttggagagatagagagatgacatttctagagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattcaacccaagatttgttgagacattatg 34913509  T
Q  124 gatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatgcaaagctatc 172  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34913510 gatttaggcattgaatcttcatctcttcatcatcctatgcaaagctatc 34913558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 32806924 - 32806712
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||| ||||||||||| |    
T  32806924 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatgaaatcttcatcttttcttcatccttt 32806825  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || |||||||||||||||    
T  32806824 gcaaagctatcatagacatatgtatctacacctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgataatttaatatatggtt 32806726  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
     |||||||||||||    
T  32806725 atagctatttattc 32806712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 3539047 - 3539260
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  3539047 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 3539146  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  3539147 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 3539245  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  3539246 ctagcttatttattc 3539260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26515590 - 26515377
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  26515590 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 26515491  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  26515490 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 26515392  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  26515391 ctagcttatttattc 26515377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 21631180 - 21631395
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctctt--cttcatcct 159  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  21631180 agagaaacataaagcaaggtagttaagagtagatttaacacaagatttgttgagacatcatggatctagacatagaatcttcatctcttttcttcatcct 21631279  T
Q  160 atgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatgg 259  Q
     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  21631280 ttgtaaagctatcatagacatatgtagttacatctactcttgtggattt-gaggtattcaaacaagctattacgtaaactcttgatcttttaatacatgg 21631378  T
Q  260 ttctagc-tatttattc 275  Q
    ||||||| |||||||||    
T  21631379 ttctagcttatttattc 21631395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 24878865 - 24879078
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  24878865 agagaaacacaaaacaaggtagttaggagtagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 24878964  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| |||||||||||| |    
T  24878965 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatatactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggct 24879063  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
     |||| |||||||||    
T  24879064 atagcttatttattc 24879078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9932967 - 9932754
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  9932967 agagaaacacaaaacaaggtagttaggagtagattcaaggcaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 9932868  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  9932867 gcaaagctatcatatacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 9932769  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  9932768 ctagcttatttattc 9932754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13173978 - 13173773
Alignment:
Q  62 tagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctctt--cttcatcct 159  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  13173978 tagaaaaacacaaagtaaggtgttaggagtagattctacccaagatttgttgagatatcatgagtc--ggcatggaatcttcatctcttttcttcatcct 13173881  T
Q  160 atgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatgg 259  Q
     |||||||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||     
T  13173880 ttgcaaagctatcatagacata--------catctacccttgtgagttttgaggtattcaaacaagccattatgtaatcttttgatcatttaatatatga 13173789  T
Q  260 ttctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||||    
T  13173788 ttctagctatttattc 13173773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 62 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13182511 - 13182306
Alignment:
Q  62 tagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctctt--cttcatcct 159  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  13182511 tagaaaaacacaaagtaaggtgttaggagtagattctacccaagatttgttgagatatcatgagtc--ggcatggaatcttcatctcttttcttcatcct 13182414  T
Q  160 atgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatgg 259  Q
     |||||||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||     
T  13182413 ttgcaaagctatcatagacata--------catctacccttgtgagttttgaggtattcaaacaagccattatgtaatcttttgatcatttaatatatga 13182322  T
Q  260 ttctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||||    
T  13182321 ttctagctatttattc 13182306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Original strand, 14479560 - 14479733
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  14479560 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 14479659  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaa 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14479660 gcaaatctatcatagacatatgtagctatatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaa 14479733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9518565 - 9518403
Alignment:
Q  103 aagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgt 202  Q
    ||||||||||||||||||||  || |  ||||  ||||||||||| |  |||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9518565 aagatttgttgagacatcatgaattttagcatgaaatcttcatctttctttcatcctttgccaagtttgcatagacatatgtagctacatctacccttgt 9518466  T
Q  203 gggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctag 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9518465 gggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctag 9518403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 267
Target Start/End: Original strand, 15642457 - 15642621
Alignment:
Q  103 aagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgt 202  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||||  ||||||||||| |  |||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15642457 aagatttgttgagacatcatgaatcttagcatgaaatcttcatctttctttcatcctttgctaagcttgcatagacatatgtagctaaatctacccttgt 15642556  T
Q  203 gggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagct 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15642557 gggttttgaggtattcaaataagctattatgtaaactcttgatcttttaatatatggttctagct 15642621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 275
Target Start/End: Original strand, 32821812 - 32822012
Alignment:
Q  73 aaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatgcaaagctatc 172  Q
    |||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  32821812 aaagcaaggtattaggaatagattcaacccaagatttgttgataaatcatggatctatgcattgaatcttcatctcttctccatccttttaaaagctatc 32821911  T
Q  173 atagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagc-tattt 271  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |  ||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  32821912 atagacaaatgtagctacatcta--cttgtgggttttgaggtattcaaataagcaattatgtaatctttagat-ttttaatatatggttctagcttattt 32822008  T
Q  272 attc 275  Q
    ||||    
T  32822009 attc 32822012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 26604339 - 26604552
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaagg-tgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttctt-catccta 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||  || ||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||| |||| |     
T  26604339 agagaaacacaaagcaagggtgttagaagtagattcttcccaagatttgttgagacatcatgaatcttagcatggaatcttcatct-ttcttccatcttt 26604437  T
Q  161 tgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggt 260  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||||| | |    
T  26604438 tgcaaagctttcatagacatatgtagctacatctatccttgtgggtattgaggtattcaaaaaagctattatgtaatct-ttgatcatttaatataagat 26604536  T
Q  261 tctagc-tatttattc 275  Q
    |||||| |||||||||    
T  26604537 tctagcttatttattc 26604552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 177 - 275
Target Start/End: Original strand, 34913803 - 34913901
Alignment:
Q  177 acatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagctatttattc 275  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34913803 acatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctatctatttattc 34913901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 182 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6868095 - 6868010
Alignment:
Q  182 tgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagct 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || || || |||||||||||||||||||||    
T  6868095 tgtagctacatctacccttgtgggttttaaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgataatttaatatatggttctagct 6868010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 26510474 - 26510392
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttca 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  26510474 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttca 26510392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 56 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37252072 - 37251854
Alignment:
Q  56 catttctagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttca 155  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||   || ||| || |||||||||||| |||||||    
T  37252072 catttttagagagacacaaaacaaggtgttaggtgtagattcaacccaagatttattgagacatcatgagtcaagg-atggaatcttcatcttttcttca 37251974  T
Q  156 tcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatat 255  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37251973 tcctttgcaaagctatcatagatatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatat 37251874  T
Q  256 atggttctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  37251873 atggttctagctatttattc 37251854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34869908 - 34869695
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  34869908 agagaaacacaaaacaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcatctcttattcattcttt 34869809  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  34869808 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatctttcgatcatttaatatatggtt 34869709  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  34869708 ctagctatttattc 34869695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27167259 - 27167047
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  27167259 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgggacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 27167160  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  27167159 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaaactattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 27167061  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  27167060 ctagctatttattc 27167047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 11766755 - 11766967
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  11766755 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 11766854  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  11766855 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 11766953  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||| ||||||||    
T  11766954 ctagcaatttattc 11766967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39656214 - 39655986
Alignment:
Q  50 agatgacatttctagaga--aacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatct 147  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||    
T  39656214 agatgacatttctagagagaaacacaacgtaaggtgttaggagtagattctacaaaagatttgttgagacatcatgaatctaggcatgaaatcttcatct 39656115  T
Q  148 cttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatca 247  Q
     |  |||||||| ||  |||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  39656114 ttctttcatcctttgtcaagcttgcaaagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagtcattatgtaaactcttgatct 39656015  T
Q  248 tttaatatatggttctagc-tatttattc 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39656014 tttaatatatggttctagcttatttattc 39655986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 7314965 - 7315178
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  7314965 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 7315064  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  7315065 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 7315163  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  7315164 ctagcttatttattc 7315178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 9404424 - 9404637
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  9404424 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 9404523  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  9404524 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 9404622  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  9404623 ctagcttatttattc 9404637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11723438 - 11723225
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  11723438 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 11723339  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  11723338 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 11723240  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  11723239 ctagcttatttattc 11723225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 34456297 - 34456510
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  34456297 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 34456396  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  34456397 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 34456495  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  34456496 ctagcttatttattc 34456510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16904771 - 16904558
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  16904771 agagaaacacaaagcaaggtagttaggggtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 16904672  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  16904671 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 16904573  T
Q  262 ctag-ctatttattc 275  Q
    |||| ||||||||||    
T  16904572 ctagcctatttattc 16904558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30607238 - 30607025
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  30607238 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaatatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 30607139  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  30607138 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 30607040  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  30607039 ctagcttatttattc 30607025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 31845980 - 31846192
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  31845980 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 31846079  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  31846080 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatttaatcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 31846178  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||| ||||||||    
T  31846179 ctagcaatttattc 31846192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 33434603 - 33434815
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  33434603 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 33434702  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  33434703 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctcctcttgt-agttttgaggtactcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 33434801  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||| ||||||||    
T  33434802 ctagcaatttattc 33434815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 24835735 - 24835948
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||   | |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  24835735 agagaaacacaaatcaaggtagttaggagtagattcaagtcaggatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 24835834  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  24835835 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 24835933  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  24835934 ctagcttatttattc 24835948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 6269890 - 6270102
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||| || || |||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||| | ||  |||||||||| | ||||||||||| |    
T  6269890 agagaaacacaaagaaatgtagttatgagtagattcaagccaagatttgttgtgacaacatggatcttgtcaaggaatcttcatattttcttcatccttt 6269989  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||||||||||||  ||    
T  6269990 gcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatattttgatcatttaatatatattt 6270088  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  6270089 ctagctatttattc 6270102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Original strand, 14344469 - 14344642
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  14344469 agagaaactcaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 14344568  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14344569 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaa 14344642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 144
Target Start/End: Original strand, 32226823 - 32226914
Alignment:
Q  53 tgacatttctagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttca 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32226823 tgacatttctagagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattcaacctaaaatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttca 32226914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Original strand, 7315358 - 7315417
Alignment:
Q  217 tcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagc-tatttattc 275  Q
    |||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7315358 tcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattc 7315417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 63 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30218553 - 30218348
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  30218553 agagaaacacaaagcaaggtagttaagagtagattcaacccaagatttgttgagacgtcatgagtctaggcatggaatcttcatcttttcttcatcctta 30218454  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30218453 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtggattttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttgatcttttaatatatggtt 30218354  T
Q  262 ctagct 267  Q
    ||||||    
T  30218353 ctagct 30218348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 26069725 - 26069940
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  26069725 agagaaacacaaagcaaggtagttagaagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcattgaatcttcaactcttcttcatccttt 26069824  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtac--atctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatgg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  26069825 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatatctacccttgtggattttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatgg 26069924  T
Q  260 ttctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||||    
T  26069925 ttctagctatttattc 26069940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 46 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33110884 - 33110651
Alignment:
Q  46 agagagatgacatttctagaga--aacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatctt 142  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||   |||||    
T  33110884 agagagatgacatttctagagagaaacacaaggcaaggtagttaagagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatgaatttaggcatgacatctt 33110785  T
Q  143 catctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactctt 242  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  33110784 catctttttttcatcctttgcaaagctatcgtagacatatgtagttatatatacccttgtgggttttgaggtattcacacaagccattatgtaaactttt 33110685  T
Q  243 catcatttaatatatggttctagc-tatttattc 275  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33110684 gatcttttaatatatggttctagcttatttattc 33110651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 20948745 - 20948959
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  20948745 agagaaacacaaagcaaggtagttaaaagtagattcaacccaagatttgtcgagacatcatgaatctaggcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 20948844  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    |  ||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  20948845 gtcaagctatcataaatatatgtagctacatctatccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttgatattttaatatatggtt 20948944  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  20948945 ctagcttatttattc 20948959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 83 - 275
Target Start/End: Original strand, 53895400 - 53895590
Alignment:
Q  83 gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatat 182  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53895400 gttaaaagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatgaatctaggcatggagtcttcatctcttcttcatcctttgcaaagctatcatagacatat 53895499  T
Q  183 gtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagc-tatttattc 275  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53895500 gtagctacatctacccttctgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactctt-at--tttaatatatggttctagcttatttattc 53895590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 46692196 - 46691986
Alignment:
Q  65 agaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatgc 163  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  46692196 agaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatgaatcttgtcattgaatcttcatttcttcctcatcctttgc 46692097  T
Q  164 aaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttct 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || |||||||||||||||||    
T  46692096 aaagctatcatagacatatgtagttatatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgataatttaatatatggttct 46691998  T
Q  264 agctatttattc 275  Q
    ||||||||||||    
T  46691997 agctatttattc 46691986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19247989 - 19247777
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||| | || |||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  19247989 agagaaacacaaagcaaggtagttgggagtagattcaaaccaatatttgttgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 19247890  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  19247889 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaaactattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 19247791  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  19247790 ctagctatttattc 19247777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 40995711 - 40995496
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40995711 agagaaacacaaatcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttatcattgaatcttcatctcttcttcatccttt 40995612  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatt---taatatatg 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||||   |||||||||    
T  40995611 gcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaaaaagctattatgtaatcttttgatcatttaataatatatg 40995513  T
Q  259 gttctagctatttattc 275  Q
    |||||||||||||||||    
T  40995512 gttctagctatttattc 40995496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42533049 - 42532836
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggtg-ttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |  |||||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | |    
T  42533049 agagaaacacaaagcaaggtggttaggagtagattcaagcctagatttgttgagacgtcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatcattt 42532950  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatat-ggt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| |||    
T  42532949 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatgggt 42532851  T
Q  261 tctagctatttattc 275  Q
    |||||||||||||||    
T  42532850 tctagctatttattc 42532836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4839298 - 4839085
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  4839298 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 4839199  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  4839198 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 4839100  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  4839099 ctagcttatttattc 4839085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 1187965 - 1188176
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||  |||| | |||  ||||||||||| ||||||||||| |    
T  1187965 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagtcaagatttgttgagacatcatgaatcttgtcatgaaatcttcatcttttcttcatccttt 1188064  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||| ||    
T  1188065 gcaaagctatcataggcatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatgatt 1188163  T
Q  262 ctagctatttatt 274  Q
    |||| ||||||||    
T  1188164 ctagttatttatt 1188176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21677829 - 21677616
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||||||||| || |||| || || |||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |    
T  21677829 agagaaacacaaagcaaagtagttaggaatagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatctaggcataaaatcttcatcttttcttcatccttt 21677730  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  21677729 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaaactattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 21677631  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  21677630 ctagcttatttattc 21677616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 22047681 - 22047894
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| | ||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  22047681 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagaagattcaagccaagatttgttgagacattatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 22047780  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  22047781 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 22047879  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  22047880 ctagcttatttattc 22047894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26373791 - 26373579
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | || ||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  26373791 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaatatttgttgagatatcatggatcttatcattgaatcttcatttcttctttatccttt 26373692  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||  | | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  26373691 gcaaagctatcatagacatatatagctatatcacctcatgtgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 26373593  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  26373592 ctagctatttattc 26373579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 323438 - 323651
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  323438 agagaaacacaaagcaagatagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 323537  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  323538 gcaaagctatcataaacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgatgtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 323636  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  323637 ctagcttatttattc 323651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 55326774 - 55326989
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagta--tattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcct 159  Q
    ||||||||||| |||||| | |||| |||||  ||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||     
T  55326774 agagaaacacatagcaagatagttaggagtagatattcaacccaagattcattgagacatcatgaatctaggcatgaaatcttcatcttttcttcatcca 55326873  T
Q  160 atgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatgg 259  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || || || ||||||||||||||||    
T  55326874 ttccaaagctatcatagacatatgtagctacatctacccttgt-ggttttgaggtattcaagcaagctattatgcaatcttttgatcatttaatatatgg 55326972  T
Q  260 ttctagc-tatttattc 275  Q
    ||||||| |||||||||    
T  55326973 ttctagcttatttattc 55326989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 52618514 - 52618715
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||           || |    
T  52618514 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatc-----------cttt 52618602  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  52618603 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactattgtgg-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 52618701  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  52618702 ctagctatttattc 52618715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5273713 - 5273511
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||           ||||||||||| |    
T  5273713 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatgga-----------ttcttcatccttt 5273625  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  5273624 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgtag-ttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 5273526  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  5273525 ctagcttatttattc 5273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 264
Target Start/End: Original strand, 6639977 - 6640178
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaagg-tgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttc-atccta 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||||| |  ||||  ||||  ||||||||||| |||||| ||| |     
T  6639977 agagaaacacaaagcaagggtgttaggagtagattcttcccaaaatttgttgagacatcttgaatcttagcatgtaatcttcatct-ttcttctatcttt 6640075  T
Q  161 tgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggt 260  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||| |||    
T  6640076 tccaaagctttcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatggaatct-ttgatcatttaatataaggt 6640174  T
Q  261 tcta 264  Q
    ||||    
T  6640175 tcta 6640178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44432215 - 44432060
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  44432215 agagaaactcaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttcttgagacatcatggatcttgccatggaatcttcaccctttcttcatccttt 44432116  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattc 218  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  44432115 acaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattc 44432060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35416845 - 35416645
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||| ||               
T  35416845 agagaaacacaaagaaagatagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatgaaatcttcatctttt----------- 35416757  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  35416756 gcacaactatcatagacatatgtagttacatctactcttgtgg-ttttgatgtattcaa-caagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 35416659  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||| ||||||||    
T  35416658 ctagcaatttattc 35416645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 265
Target Start/End: Original strand, 14178 - 14386
Alignment:
Q  56 catttctagagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttca 155  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||   | |||| || |||||||||||| || ||||    
T  14178 catttctagagagacacaaagcaaggtgttaggagtagattcaactcaagatttgttgagacatcatgagtttagggatggaatcttcatctttttttca 14277  T
Q  156 tcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatat 255  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  14278 tcctttgcaaagctatcatatacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccatta-gtaaactcttgatcttttaatat 14376  T
Q  256 atggttctag 265  Q
    ||||||||||    
T  14377 atggttctag 14386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1232676 - 1232440
Alignment:
Q  46 agagagatgacatttctagaga--aacacaaagcaa-----ggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaa 138  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     ||||||| ||||| ||||     ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||    
T  1232676 agagagatgacatttctagagagaaacacaaagcaaaataaggtgttaggagtagattcttatcaagatttgttgagacatcatgaatctaggcatgaaa 1232577  T
Q  139 tcttcatctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaac 238  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      
T  1232576 tctttatctcttcttcatcctttgcaaagctattatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaaaccattatgtaatt 1232477  T
Q  239 tcttcatcatttaatatatggttctagctatttattc 275  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1232476 tcttgatcatttaatatatggttctagctatttattc 1232440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 268
Target Start/End: Original strand, 33247988 - 33248194
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  33247988 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatgaatttaggcattgaatcttcatctctttttcatccttt 33248087  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |  ||  ||||||||||| ||    
T  33248088 gcaaagctatcatagacatatgtagctgcatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatctttcgatattttaatatatgatt 33248187  T
Q  262 ctagcta 268  Q
    |||||||    
T  33248188 ctagcta 33248194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 23193923 - 23194135
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  23193923 agagaaacacaaggcaaggtagttaagagtagattcaacccaagattcattgagacatcatgaatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 23194022  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||    
T  23194023 gcaaa-ctatcagagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattacgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 23194121  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||| ||||||||||    
T  23194122 ctatctatttattc 23194135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 45527647 - 45527859
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||||| |    
T  45527647 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcatcatccttt 45527746  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  45527747 gcaaagctatcatagacatatctagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatacatggtt 45527845  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  45527846 ctagctatttattc 45527859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 20837094 - 20837306
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  20837094 agagaaatacaaggcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 20837193  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  20837194 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatccattcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 20837292  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  20837293 ctagctatttattc 20837306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 275
Target Start/End: Original strand, 2357141 - 2357374
Alignment:
Q  45 tagagagatgacatttcta--gagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatctt 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||    
T  2357141 tagagagatgacatttctatagagaaacacaaagcaagatgttaggagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatgagtctaggcatgaaatctt 2357240  T
Q  143 catctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactctt 242  Q
    ||||| |  |||||||| ||| |||||   |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2357241 catctttctttcatcctttgccaagcttgtatagacatatgtagctacatctaacattgtgggttttgaggtattcaaacaaaccatgatgtaaactctt 2357340  T
Q  243 catcatttaatatatggttctagc-tatttattc 275  Q
     ||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2357341 gatcttctaatatatggttctagcttatttattc 2357374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 3588400 - 3588613
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  3588400 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 3588499  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  3588500 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 3588598  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  3588599 ctagcttatttattc 3588613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 9989396 - 9989608
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||| ||| |    
T  9989396 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatagaatcttcaccctttcttcaaccttt 9989495  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  9989496 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 9989594  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||| ||||||||    
T  9989595 ctagcaatttattc 9989608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 22097667 - 22097879
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  22097667 agagaaacacaaagtaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 22097766  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  22097767 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatattttgatcatttaatatatggtt 22097865  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||| ||||||||    
T  22097866 ctagccatttattc 22097879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37471848 - 37471636
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| | || ||||||||||||  ||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  37471848 agagaaacacaaagcaaagtagttaggagtagattcaagccaaaatttgttgagacgacatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 37471749  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  37471748 gcaaagctatcatagacatatgtagctatatctactcttgt-ggttttgatgtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 37471650  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  37471649 ctagctatttattc 37471636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7653384 - 7653171
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  7653384 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 7653285  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  7653284 gcaaagctatcttagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 7653186  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  7653185 ctagcttatttattc 7653171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 8615503 - 8615716
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  8615503 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttatcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 8615602  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  8615603 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 8615701  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  8615702 ctagcttatttattc 8615716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27850711 - 27850500
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||| |    
T  27850711 agagaaacacaa-gcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcatttcttcatccttt 27850613  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  27850612 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatccaatcttgt-ggttttgaggtatttaaacaagctattatgtaattttttgatcatttaatatatggtt 27850514  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  27850513 ctagctatttattc 27850500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36469596 - 36469385
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  36469596 agagaaacacaa-gcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatagaatcttcatcttttcttcatccttt 36469498  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |  ||| ||||||| ||||||    
T  36469497 gcaaagctatcatagacatatgtagctacaactactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatctttagatcttttaatacatggtt 36469399  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||| ||||||||    
T  36469398 ctagcaatttattc 36469385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 48168355 - 48168143
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||  |||||   ||| |||||| |||||   |||||||||||    
T  48168355 agagaaacacgaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcagggatcttatcatggaatctgcatcttcacttcatcctat 48168256  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| |||    
T  48168255 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatattgtt 48168157  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
     |||||||||||||    
T  48168156 ttagctatttattc 48168143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10386232 - 10386019
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  10386232 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcgagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 10386133  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||||||||||||    
T  10386132 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcctttgatcttttaatatatggtt 10386034  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  10386033 ctagcttatttattc 10386019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 275
Target Start/End: Original strand, 26335121 - 26335320
Alignment:
Q  67 aaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatgcaa 165  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||           || |||||    
T  26335121 aaacacaaagcaaggtagttaagagtagattcaacccaagatttgttgagacatcatgagtctaggcatgaaatcttcatc-----------ctttgcaa 26335209  T
Q  166 agctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctag 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||    
T  26335210 agctatcatagacatatgtagctacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttgatcttttaatatatgattttag 26335309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4743135 - 4742951
Alignment:
Q  89 agtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggt 188  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| | |||  ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4743135 agtagattcaagccaagatttgttgagagatcatggatcttgtcatgaaatcttcatcttttcttcatcgtttgcaaagctatcatagacatatgtagct 4743036  T
Q  189 acatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagctatttattc 275  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4743035 acatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatca-ttaatatatggttctagctatttattc 4742951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27030845 - 27030672
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  27030845 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 27030746  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27030745 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaa 27030672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 52308247 - 52308034
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | | || ||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  52308247 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattctagccaatatttgtttagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 52308148  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||| ||||||    
T  52308147 gcaaagctatcttagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatacatggtt 52308049  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  52308048 ctagcttatttattc 52308034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 23385396 - 23385609
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| || |  ||||||||||| |    
T  23385396 agagaaacaaaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatagaatctacaccctttcttcatccttt 23385495  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||  | || ||| ||||||||||||||    
T  23385496 gcaaagctatcatagacatatttagctacatctattcttgt-agtttttaggtattcaaacaagctattatgtaattttttgatcttttaatatatggtt 23385594  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  23385595 ctagcttatttattc 23385609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 264
Target Start/End: Original strand, 49434097 - 49434297
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctatg 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||   | |||| ||  |||||| |||| |  |||||||| ||    
T  49434097 agagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattctacccaagatttgttgagatattatgagtttaggtatgtaatctttatctttctttcatcctttg 49434196  T
Q  163 caaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttc 262  Q
    | |||||  ||||||||||||||| ||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49434197 ccaagcttgcatagacatatgtagctacatttatc-ttgtgcgttttgaggtattcaaacaagctattatgtaaactcttcatcttttaatatatagttc 49434295  T
Q  263 ta 264  Q
    ||    
T  49434296 ta 49434297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20963815 - 20963711
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | | | ||||||||||||  |||||||| | |    
T  20963815 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcgtggaatcttcatcttctcttcatcattt 20963716  T
Q  162 gcaaa 166  Q
    |||||    
T  20963715 gcaaa 20963711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 275
Target Start/End: Original strand, 37022870 - 37022901
Alignment:
Q  244 atcatttaatatatggttctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37022870 atcatttaatatatggttctagctatttattc 37022901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 116729 - 116517
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||| |    
T  116729 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcctcatcttttcttcatccttt 116630  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  116629 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-ggttttgaggtatttaaacaagctattatgtaatcttttgatcatttaatatatggtt 116531  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||| ||||    
T  116530 ctagctattaattc 116517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1157 - 948
Alignment:
Q  53 tgacatttctagaga--aacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctctt 150  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||| ||||    
T  1157 tgacatttctagagagaaacacaaagtaaggtgttaggagtagattctatccaagatttgttgagacatcatgagtctaggcatggaattttcatatctt 1058  T
Q  151 cttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcattt 250  Q
    |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  1057 cttcgtcctttgcaaagttatcacagacatatgtagctacatctacctttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatctttt 958  T
Q  251 aatatatggt 260  Q
    ||||||||||    
T  957 aatatatggt 948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16635 - 16421
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |    
T  16635 agagaaacacaaagtaaggtagttaagagtagattctacccaagatttgttgagacatcatgaatctaggcatgaaatcttcatcttttcttcatccttt 16536  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    || |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  16535 gccaagctatcttagacatatgtatctacatatacccttgtgggttttgaggtatttaaataagctattatgtaaacccttgatcttttaatatatggtt 16436  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  16435 ctagcttatttattc 16421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0147 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:

Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 6732 - 6944
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  6732 agagaaatacaaggcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcatcttttcttcatccttt 6831  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  6832 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatccattcttgt-ggttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatattttgatcatttaatatatggtt 6930  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  6931 ctagctatttattc 6944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 76613 - 76401
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  76613 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatagaatcttcaacaattcttcatccttt 76514  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || |||||||||| |||||||    
T  76513 gcaaagctatcatagacatatgtagatacatctactcttgt-gattttgaggtattcaaacaagttattatgtaatcttttgatcatttaatgtatggtt 76415  T
Q  262 ctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||    
T  76414 ctagctatttattc 76401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29061 - 28848
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  29061 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 28962  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  28961 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 28863  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  28862 ctagcttatttattc 28848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Original strand, 8742 - 8955
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  8742 agagaaacacaaggcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatagaatcttcaccctttcttcatccttt 8841  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  8842 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 8940  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  8941 ctagcttatttattc 8955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25812 - 25599
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  25812 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttgtcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 25713  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggtt 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||    
T  25712 gcaaagctatcatagatatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaatcttttgatcttttaatatatggtt 25614  T
Q  262 ctagc-tatttattc 275  Q
    ||||| |||||||||    
T  25613 ctagcttatttattc 25599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35458 - 35231
Alignment:
Q  50 agatgacatttctag-agaaacacaaagcaaggtgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctc 148  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||   ||| || ||  ||||||||| |     
T  35458 agatggcatttctaggagaaacacaaagcaaggtgttaggagtagattctacccaagatttgttgagacattatgagtctcggtatgaaatcttcatttt 35359  T
Q  149 ttcttcatcctatgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcat 248  Q
    |  |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |    
T  35358 tctttcatcctttgccaagcttgcatagacatatgtaggtacatccaccattgtgagttttgaggtattcaaacaagccattatgtaatttcttgatttt 35259  T
Q  249 ttaatatatggttctagc-tatttattc 275  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  35258 ttaatatatggttatagcttatttattc 35231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1494 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1494
Description:

Target: scaffold1494; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Original strand, 1564 - 1737
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||| |  ||||||||||| |    
T  1564 agagaaacacaaagcaaggtagttaggagtagattcaagccaagatttgttgagacatcatggatcttatcatggaatcttcaccctttcttcatccttt 1663  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1664 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatctactcttgt-agttttgaggtattcaaacaagctattatgtaa 1737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1832 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1832
Description:

Target: scaffold1832; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 132 - 1
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaaggt-gttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttcatcctat 161  Q
    ||||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  132 agagaaagacaaagcaaggtagttgggagtagattcaacacaagatttgttgagacatcatggatctaggcattgaatcttcctctcttcttcatccttt 33  T
Q  162 gcaaagctatcatagacatatgtaggtacatc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32 gcaaagctatcatagacatatgtagctacatc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 275
Target Start/End: Original strand, 7191 - 7275
Alignment:
Q  187 gtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7191 gtacatctacccttgt----tttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatctattc 7275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 275
Target Start/End: Original strand, 11805 - 11889
Alignment:
Q  187 gtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11805 gtacatctacccttgt----tttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatctattc 11889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 275
Target Start/End: Original strand, 9800 - 9884
Alignment:
Q  187 gtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagctatttattc 275  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9800 gtacatctacccttgt----tttgaggtattcaaacaagccattatgtaaactcttgatcatttaatatatggttctagctatctattc 9884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9615 - 9399
Alignment:
Q  63 agagaaacacaaagcaagg-tgttaagagtatattcaacctaagatttgttgagacatcatagatctaggcattgaatcttcatctcttcttc-atccta 160  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||  |||| ||||  |||| ||||||| |||| |||||  ||||  | || |||||||||||| |||||| ||| |     
T  9615 agagaaacacaaatcaagcatgttagaagtagattcttcctaggatttgtagagatatcatgaatcttagtatggaatcttcatct-ttcttccatcttt 9517  T
Q  161 tgcaaagctatcatagacatatgtaggtacatctacccttgtgggttttgaggtattcaaacaagccatta---tgtaaactcttcatcatttaatatat 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||   ||||| || || |||||||||| ||     
T  9516 tgcaaagttatcatagacatatgtagctacatctacgcttgtggtttttaaggtattcaaacaagctattaatttgtaatct-ttgatcatttaatttaa 9418  T
Q  258 ggttctagc-tatttattc 275  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  9417 ggttctagcttatttattc 9399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12491 - 12429
Alignment:
Q  214 tattcaaacaagccattatgtaaactcttcatcatttaatatatggttctagc-tatttattc 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12491 tattcaaacaagctattatgtaatcttttgatattttaatatatggttctagcttatttattc 12429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University