View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7136_low_17 (Length: 262)

Name: NF7136_low_17
Description: NF7136
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7136_low_17
NF7136_low_17
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (11-179)||(4478395-4478564)
chr2 (10-182)||(36642009-36642183)
chr2 (10-182)||(19424636-19424808)
chr2 (10-179)||(33660376-33660545)
chr2 (10-179)||(4166948-4167117)
chr2 (38-181)||(13711488-13711632)
chr2 (10-181)||(19313876-19314046)
chr2 (10-173)||(27349947-27350109)
chr2 (10-181)||(43770847-43771017)
chr2 (10-180)||(44285974-44286144)
chr2 (10-182)||(41463858-41464030)
chr2 (10-182)||(33550994-33551166)
chr2 (10-179)||(4264085-4264254)
chr2 (10-179)||(37905735-37905903)
chr2 (10-173)||(33709240-33709403)
chr2 (9-168)||(43648252-43648411)
chr2 (12-182)||(39167373-39167543)
chr2 (10-179)||(3176965-3177134)
chr2 (10-179)||(29242146-29242315)
chr2 (10-182)||(31570742-31570914)
chr2 (10-180)||(17071745-17071915)
chr2 (14-179)||(5881560-5881729)
chr2 (12-179)||(26357603-26357770)
chr2 (10-180)||(17054104-17054274)
chr2 (10-180)||(2325386-2325548)
chr2 (10-181)||(33902092-33902261)
chr2 (38-181)||(11366416-11366560)
chr2 (14-179)||(18494292-18494445)
chr2 (11-135)||(7006930-7007054)
chr2 (12-179)||(19289333-19289500)
chr2 (10-106)||(41960940-41961035)
chr2 (10-106)||(45327820-45327915)
chr2 (10-179)||(4763654-4763826)
chr2 (10-166)||(44913700-44913858)
chr2 (61-178)||(41051263-41051382)
chr2 (183-242)||(12530541-12530600)
chr2 (38-105)||(31861953-31862020)
chr2 (10-182)||(41465532-41465696)
chr2 (38-103)||(19501775-19501839)
chr2 (10-65)||(18258295-18258349)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (10-179)||(35844343-35844513)
chr3 (14-182)||(11466838-11467006)
chr3 (11-182)||(45174517-45174691)
chr3 (11-182)||(11357355-11357527)
chr3 (10-179)||(37203084-37203253)
chr3 (10-183)||(44186491-44186664)
chr3 (11-182)||(21193620-21193791)
chr3 (11-182)||(40936005-40936175)
chr3 (10-182)||(4015474-4015646)
chr3 (14-182)||(52040916-52041085)
chr3 (10-182)||(22450982-22451154)
chr3 (10-181)||(29099370-29099541)
chr3 (11-168)||(44891534-44891682)
chr3 (13-175)||(53229145-53229308)
chr3 (10-182)||(51212971-51213143)
chr3 (10-165)||(37157739-37157893)
chr3 (10-179)||(34132952-34133121)
chr3 (15-165)||(2007964-2008114)
chr3 (12-182)||(48354955-48355125)
chr3 (10-182)||(7327472-7327645)
chr3 (10-179)||(39282670-39282838)
chr3 (10-179)||(46297752-46297921)
chr3 (27-163)||(3655209-3655345)
chr3 (10-174)||(4761639-4761803)
chr3 (14-181)||(26941254-26941421)
chr3 (27-181)||(20373303-20373457)
chr3 (10-159)||(42506065-42506214)
chr3 (10-142)||(14586660-14586792)
chr3 (12-163)||(32373505-32373654)
chr3 (10-174)||(3362275-3362441)
chr3 (38-180)||(47481538-47481681)
chr3 (10-182)||(25579753-25579925)
chr3 (12-135)||(43348319-43348441)
chr3 (10-179)||(24488952-24489121)
chr3 (38-182)||(40552276-40552421)
chr3 (10-165)||(43975878-43976033)
chr3 (11-173)||(53176078-53176239)
chr3 (10-182)||(27480369-27480541)
chr3 (10-103)||(29163912-29164004)
chr3 (10-166)||(33378775-33378931)
chr3 (10-85)||(33698265-33698339)
chr3 (10-135)||(24708105-24708230)
chr3 (12-182)||(11835619-11835768)
chr3 (11-174)||(22446055-22446218)
chr3 (12-83)||(36012251-36012322)
chr3 (38-166)||(21009819-21009948)
chr3 (14-163)||(38591727-38591880)
chr3 (13-106)||(46994654-46994746)
chr3 (12-175)||(54828693-54828855)
chr3 (10-83)||(22622708-22622780)
chr3 (119-179)||(2613907-2613967)
chr3 (38-181)||(54505823-54505966)
chr3 (12-79)||(1089811-1089877)
chr3 (124-166)||(33698218-33698260)
chr3 (148-179)||(29163864-29163895)
chr3 (57-87)||(53811698-53811728)
chr3 (144-181)||(46994774-46994811)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (10-182)||(11727046-11727218)
chr8 (10-182)||(13307645-13307817)
chr8 (11-182)||(38644000-38644171)
chr8 (10-179)||(465867-466036)
chr8 (10-182)||(5299942-5300114)
chr8 (10-179)||(12876134-12876303)
chr8 (10-179)||(36694962-36695131)
chr8 (10-182)||(1204949-1205121)
chr8 (11-179)||(34952028-34952196)
chr8 (10-179)||(16446871-16447040)
chr8 (10-182)||(37970515-37970687)
chr8 (10-173)||(27082834-27082997)
chr8 (10-173)||(6098514-6098677)
chr8 (10-179)||(9864173-9864342)
chr8 (10-179)||(34894992-34895161)
chr8 (10-182)||(10555198-10555370)
chr8 (10-178)||(41910984-41911153)
chr8 (10-181)||(1150101-1150272)
chr8 (10-173)||(43025733-43025896)
chr8 (10-182)||(16222885-16223057)
chr8 (10-182)||(23854427-23854599)
chr8 (38-182)||(31933909-31934054)
chr8 (11-173)||(40862450-40862612)
chr8 (10-182)||(43643591-43643763)
chr8 (16-173)||(44869527-44869686)
chr8 (12-132)||(39099117-39099237)
chr8 (11-83)||(7998416-7998488)
chr8 (10-134)||(1149628-1149752)
chr8 (38-177)||(30654606-30654746)
chr8 (12-179)||(41362543-41362707)
chr8 (12-182)||(33906246-33906404)
chr8 (12-123)||(35459709-35459820)
chr8 (12-109)||(1953987-1954084)
chr8 (38-118)||(7890980-7891061)
chr8 (10-178)||(8803813-8803974)
chr8 (52-107)||(33197947-33198002)
chr8 (10-80)||(4132682-4132750)
chr8 (12-59)||(18259229-18259275)
chr8 (82-135)||(4133077-4133131)
chr8 (136-182)||(24823394-24823440)
chr8 (144-181)||(15009265-15009302)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (12-173)||(9200265-9200426)
chr5 (10-182)||(30969304-30969476)
chr5 (10-179)||(36866788-36866957)
chr5 (10-182)||(25500906-25501078)
chr5 (10-182)||(26268097-26268269)
chr5 (10-180)||(27330331-27330499)
chr5 (12-179)||(32563175-32563342)
chr5 (10-179)||(7693256-7693425)
chr5 (10-182)||(27318467-27318639)
chr5 (10-182)||(8741866-8742039)
chr5 (10-181)||(22019656-22019827)
chr5 (10-179)||(40133411-40133580)
chr5 (14-182)||(5837578-5837746)
chr5 (10-182)||(19119882-19120054)
chr5 (11-182)||(699173-699344)
chr5 (11-174)||(24886135-24886298)
chr5 (10-182)||(35933925-35934091)
chr5 (10-179)||(36860449-36860619)
chr5 (11-168)||(1429126-1429283)
chr5 (12-182)||(39572842-39573012)
chr5 (10-182)||(22980816-22980988)
chr5 (11-182)||(8466768-8466938)
chr5 (11-182)||(15724513-15724682)
chr5 (13-182)||(14409310-14409478)
chr5 (10-174)||(14919508-14919672)
chr5 (10-166)||(28416507-28416663)
chr5 (10-182)||(31786626-31786798)
chr5 (10-182)||(33908256-33908428)
chr5 (10-179)||(12910376-12910550)
chr5 (10-179)||(38528217-38528385)
chr5 (10-165)||(23116202-23116357)
chr5 (14-179)||(5112297-5112462)
chr5 (52-168)||(25668687-25668803)
chr5 (12-139)||(21088748-21088875)
chr5 (12-179)||(31705594-31705760)
chr5 (10-172)||(35511457-35511619)
chr5 (10-148)||(6824459-6824599)
chr5 (38-173)||(22255213-22255350)
chr5 (10-182)||(22974062-22974234)
chr5 (11-179)||(35826465-35826632)
chr5 (10-135)||(23954769-23954895)
chr5 (10-163)||(43308632-43308784)
chr5 (10-166)||(17158011-17158166)
chr5 (10-134)||(35504436-35504560)
chr5 (38-163)||(42342775-42342899)
chr5 (10-174)||(7208844-7209007)
chr5 (38-122)||(15992547-15992632)
chr5 (18-182)||(8436989-8437152)
chr5 (110-179)||(13956425-13956494)
chr5 (69-173)||(11898034-11898139)
chr5 (73-179)||(5829923-5830034)
chr5 (128-173)||(16004474-16004519)
chr5 (38-84)||(13956369-13956415)
chr5 (11-59)||(25669733-25669780)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (10-182)||(21991634-21991806)
chr7 (10-179)||(12165753-12165922)
chr7 (10-182)||(25691535-25691708)
chr7 (10-182)||(8861283-8861455)
chr7 (12-179)||(27421373-27421539)
chr7 (12-182)||(5657474-5657644)
chr7 (10-167)||(43686054-43686210)
chr7 (10-182)||(22687237-22687409)
chr7 (10-181)||(6546518-6546689)
chr7 (10-172)||(15612750-15612911)
chr7 (11-180)||(29173540-29173709)
chr7 (11-178)||(26980325-26980492)
chr7 (11-182)||(33688254-33688424)
chr7 (10-179)||(4582920-4583089)
chr7 (10-179)||(32432458-32432622)
chr7 (10-179)||(32821044-32821213)
chr7 (10-182)||(48928555-48928726)
chr7 (10-179)||(27283745-27283914)
chr7 (10-179)||(38258546-38258715)
chr7 (10-182)||(48928288-48928459)
chr7 (11-173)||(12390622-12390784)
chr7 (10-179)||(23111191-23111362)
chr7 (10-182)||(18797327-18797497)
chr7 (10-182)||(7334792-7334964)
chr7 (10-174)||(30055533-30055697)
chr7 (10-182)||(41765069-41765241)
chr7 (12-181)||(24211740-24211909)
chr7 (10-181)||(31579055-31579231)
chr7 (38-179)||(37109873-37110015)
chr7 (10-168)||(9355817-9355975)
chr7 (38-179)||(17842604-17842746)
chr7 (10-165)||(10481619-10481775)
chr7 (11-179)||(31520716-31520883)
chr7 (14-175)||(11071211-11071372)
chr7 (57-182)||(26524364-26524490)
chr7 (14-179)||(37347023-37347188)
chr7 (10-165)||(44413370-44413525)
chr7 (10-109)||(44598738-44598836)
chr7 (11-87)||(15672754-15672829)
chr7 (10-179)||(10359205-10359374)
chr7 (76-182)||(34362205-34362311)
chr7 (57-168)||(35353120-35353233)
chr7 (10-87)||(37704251-37704327)
chr7 (11-158)||(32593181-32593327)
chr7 (10-139)||(43925147-43925271)
chr7 (10-62)||(26588075-26588126)
chr7 (67-110)||(34362149-34362192)
chr7 (11-174)||(38053492-38053647)
chr7 (12-73)||(37703491-37703551)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (10-182)||(4318811-4318984)
chr6 (10-182)||(15491638-15491810)
chr6 (20-182)||(8513256-8513419)
chr6 (10-182)||(29182186-29182358)
chr6 (20-182)||(6088931-6089094)
chr6 (10-181)||(33892992-33893162)
chr6 (10-182)||(3879928-3880100)
chr6 (10-182)||(7235024-7235195)
chr6 (12-182)||(30353349-30353519)
chr6 (10-179)||(21017101-21017270)
chr6 (12-182)||(20768109-20768275)
chr6 (11-181)||(7055205-7055375)
chr6 (10-174)||(1945865-1946029)
chr6 (29-173)||(33618866-33619010)
chr6 (38-181)||(5627415-5627559)
chr6 (10-175)||(6091172-6091336)
chr6 (75-182)||(18498456-18498565)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (12-182)||(47279208-47279378)
chr1 (10-182)||(3309167-3309339)
chr1 (10-182)||(15752048-15752220)
chr1 (12-182)||(39393402-39393573)
chr1 (10-179)||(48620659-48620828)
chr1 (10-182)||(38823233-38823405)
chr1 (10-173)||(3534960-3535123)
chr1 (10-182)||(27532966-27533137)
chr1 (12-182)||(11742338-11742507)
chr1 (14-182)||(16415664-16415833)
chr1 (10-182)||(14758060-14758232)
chr1 (11-179)||(41926185-41926353)
chr1 (12-179)||(2959770-2959937)
chr1 (10-179)||(7079048-7079228)
chr1 (10-182)||(15168108-15168287)
chr1 (10-179)||(10181993-10182162)
chr1 (10-127)||(27227470-27227587)
chr1 (38-179)||(28564793-28564935)
chr1 (12-173)||(40884841-40885002)
chr1 (10-168)||(32216088-32216246)
chr1 (10-182)||(10922746-10922918)
chr1 (10-165)||(34012362-34012517)
chr1 (10-182)||(4330298-4330472)
chr1 (10-179)||(15382955-15383124)
chr1 (10-179)||(18422673-18422842)
chr1 (38-179)||(19899781-19899923)
chr1 (14-179)||(42721061-42721226)
chr1 (10-173)||(238498-238660)
chr1 (10-182)||(1547306-1547470)
chr1 (11-181)||(32267054-32267224)
chr1 (10-179)||(9903039-9903208)
chr1 (17-182)||(31621545-31621710)
chr1 (10-166)||(51128894-51129050)
chr1 (10-182)||(27267185-27267354)
chr1 (10-182)||(47682479-47682650)
chr1 (10-181)||(30254444-30254614)
chr1 (10-166)||(8222166-8222319)
chr1 (10-184)||(33725585-33725759)
chr1 (58-182)||(21289684-21289816)
chr1 (10-179)||(30326937-30327106)
chr1 (38-166)||(28769688-28769816)
chr1 (10-179)||(37451308-37451476)
chr1 (10-118)||(25160715-25160823)
chr1 (18-166)||(27563898-27564046)
chr1 (27-181)||(37618894-37619052)
chr1 (38-166)||(46931446-46931575)
chr1 (38-181)||(23999367-23999511)
chr1 (38-181)||(27763323-27763465)
chr1 (10-83)||(38759652-38759724)
chr1 (10-106)||(22170807-22170902)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (10-180)||(54499253-54499425)
chr4 (10-182)||(23761095-23761266)
chr4 (10-182)||(34948113-34948285)
chr4 (10-180)||(29584216-29584384)
chr4 (12-182)||(27396639-27396809)
chr4 (10-179)||(30002648-30002809)
chr4 (10-181)||(4598017-4598186)
chr4 (12-179)||(25701075-25701242)
chr4 (10-179)||(37775695-37775862)
chr4 (10-179)||(35021051-35021220)
chr4 (14-182)||(5047985-5048153)
chr4 (10-182)||(33341418-33341593)
chr4 (10-179)||(32592119-32592288)
chr4 (10-182)||(879564-879736)
chr4 (10-182)||(28003002-28003174)
chr4 (10-182)||(33816549-33816721)
chr4 (10-182)||(55241121-55241292)
chr4 (10-182)||(55477907-55478083)
chr4 (11-182)||(7703540-7703703)
chr4 (10-179)||(17167739-17167908)
chr4 (10-179)||(17173316-17173485)
chr4 (38-182)||(49375989-49376135)
chr4 (38-182)||(50764755-50764898)
chr4 (27-165)||(19089486-19089624)
chr4 (12-182)||(38011877-38012047)
chr4 (13-182)||(37287756-37287919)
chr4 (38-182)||(19440691-19440836)
chr4 (10-181)||(37663757-37663926)
chr4 (10-182)||(47253772-47253935)
chr4 (10-181)||(39397942-39398104)
chr4 (10-173)||(46888173-46888336)
chr4 (10-182)||(25184136-25184308)
chr4 (14-173)||(36493708-36493867)
chr4 (10-182)||(6864058-6864230)
chr4 (38-181)||(42199753-42199897)
chr4 (10-135)||(9139315-9139440)
chr4 (18-135)||(4934226-4934344)
chr4 (14-182)||(32579467-32579637)
chr4 (10-179)||(35025612-35025773)
chr4 (10-94)||(1815413-1815496)
chr4 (10-181)||(34361508-34361678)
chr4 (9-179)||(50697268-50697437)
chr4 (10-86)||(17272084-17272159)
chr4 (10-181)||(32912596-32912767)
chr4 (10-179)||(3042637-3042814)
chr4 (110-179)||(4205142-4205211)
chr4 (139-180)||(17272036-17272077)
chr4 (124-179)||(7152236-7152291)
chr4 (124-179)||(53124313-53124368)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (10-179)||(160-329)
scaffold0002 (10-179)||(94373-94542)
scaffold0002 (10-151)||(408419-408559)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (10-179)||(11933-12104)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (38-181)||(7911-8055)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (38-173)||(43989-44125)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (38-173)||(154662-154798)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (38-181)||(146033-146177)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (114-182)||(42371-42439)
scaffold0009 (144-182)||(100844-100882)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (12-157)||(267331-267477)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4478564 - 4478395
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  4478564 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccac 4478465  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4478464 tgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaatatcatt 4478395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36642183 - 36642009
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaa-ttagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcc 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  36642183 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc 36642084  T
Q  109 a-tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  36642083 actgtacaaacagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtattaatttcaccagaaaagtcattctc 36642009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 19424636 - 19424808
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19424636 ggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaa-ttagattaagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgcca 19424734  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     | || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19424735 ctatataaacaatggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagccattctc 19424808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 33660376 - 33660545
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  33660376 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgcca 33660474  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  33660475 ctgtacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttaactagaaaagtcatt 33660545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4167117 - 4166948
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  4167117 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgcca 4167019  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4167018 ttgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcatt 4166948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13711632 - 13711488
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13711632 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcaca 13711533  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13711532 acacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattct 13711488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19314046 - 19313876
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  19314046 ggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttcgattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactata-ggactgaacttttgatgtca 19313949  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
     |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19313948 ctgtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattct 19313876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Original strand, 27349947 - 27350109
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||    
T  27349947 ggtgttacacttaaaacaaggttggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-agggactgaacttttgatgtca 27350044  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27350045 ctgtacaaacagtgtggtgttactcacaacatttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaa 27350109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 43770847 - 43771017
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||    
T  43770847 ggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaa-ttaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgcca 43770945  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43770946 ctgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaatcattct 43771017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 44286144 - 44285974
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44286144 ggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa-ttagattaagtgtattattgttaatctgatgaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgcca 44286046  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattc 180  Q
     | ||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44286045 ctatacaaacagtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaaatcattc 44285974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 41463858 - 41464030
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||| |||||| || ||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  41463858 ggtgttacaattaaaacaaagtatgataaaa-ttatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgcca 41463956  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||    
T  41463957 ctgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgattttatagtattaacttcaccaaaaatgtcattctc 41464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 33550994 - 33551166
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| ||    
T  33550994 ggtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagaccgaacttttgatgtca 33551092  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  33551093 ttgtacaaacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcattctc 33551166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 4264085 - 4264254
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||| ||    
T  4264085 ggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtca 4264183  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4264184 ctgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcatt 4264254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37905903 - 37905735
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  37905903 ggtgttacgcttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 37905805  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||   ||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37905804 ttgtacaaacggtggggtgttactcgttacattttttatgttatagtgttaacttcacca-aaaaatcatt 37905735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Original strand, 33709240 - 33709403
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  33709240 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatgtca 33709338  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
     ||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33709339 ctgtactaacagtggagtgttactcgcaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccataaaa 33709403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Original strand, 43648252 - 43648411
Alignment:
Q  9 tggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcc 108  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| |    
T  43648252 tggtgttacacttataacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtc 43648350  T
Q  109 a-tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcacca 168  Q
    | | |||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  43648351 attatacaaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 43648411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Original strand, 39167373 - 39167543
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |    
T  39167373 tgttacacttaaaacaaggtataataaaa-ttagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcatt 39167471  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  39167472 gtacaaacagtgaggtgttactcacaatacttttgatactattctgttaacttcatcaaaaaaatcattctc 39167543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3177134 - 3176965
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  3177134 ggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 3177036  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||   |||||||||| |||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  3177035 ttgtacaaacagttgcgtgttactcaaaacatttttgatattatagtattaacttcatcagaaaagtcatt 3176965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 29242146 - 29242315
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||    
T  29242146 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatacca 29242244  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||| | | || | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  29242245 ctgtacaaacagtggggtgttacgcactatattttttatgttatagttttaacttcaccaaaaaaaccatt 29242315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 31570742 - 31570914
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  31570742 ggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttgatgtca 31570840  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     | || ||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  31570841 ctataaaaatagtggggtgttacttacaacacttttaatgttatagtgttaatttcaccagaaaagttattctc 31570914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 17071745 - 17071915
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||| ||    
T  17071745 ggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtca 17071843  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattc 180  Q
     |||||||| | |||| ||||||| || ||| || || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17071844 ttgtacaaataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattc 17071915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5881729 - 5881560
Alignment:
Q  14 ttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgt 112  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| || |||    
T  5881729 ttacacttaaaacaaggtatgataaa--ttagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcactgt 5881632  T
Q  113 acaaacagtgaggtgttactcacaacac-----ttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||     || |||||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  5881631 acaaacagtggggtgttactcacaacacttttgttttgatgttataatatcaacttcaccagaaaagtcatt 5881560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26357770 - 26357603
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| || |    
T  26357770 tgttacacttgaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactgaacttttgatgtcact 26357672  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26357671 gtacaaacagtgggatgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcatt 26357603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 17054104 - 17054274
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||   |||||||||| ||    
T  17054104 ggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtca 17054202  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattc 180  Q
    | ||||||||| |||| ||||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  17054203 ttgtacaaacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattc 17054274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 2325386 - 2325548
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||        ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2325386 ggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 2325476  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattc 180  Q
     |||||||||| || |||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  2325477 gtgtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttatattgttaacttcacgagaaaagtcattc 2325548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33902261 - 33902092
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| ||    
T  33902261 ggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaa-ttcgattaaatatagtcttgttaatctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtca 33902163  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
     | ||||||||||| ||| |||||||| ||| || | ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33902162 ttttacaaacagtggggtattactcactacattttttatgt--tagtgttaacttcaccagaaaagtcattct 33902092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 181
Target Start/End: Original strand, 11366416 - 11366560
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||      
T  11366416 aaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcatt 11366515  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  11366516 acatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattct 11366560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Original strand, 18494292 - 18494445
Alignment:
Q  14 ttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccatgta 113  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |         
T  18494292 ttacacttaatacaaggtaggataaaa-ttagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc----- 18494385  T
Q  114 caaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
          ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18494386 ------gtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 18494445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 7006930 - 7007054
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  | |||||||||||||||| |     
T  7006930 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctac 7007028  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcac 135  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||    
T  7007029 tgtacaaacagtgggatgttactcac 7007054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 19289333 - 19289500
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    ||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||| ||||||||||| || |    
T  19289333 tgttacatttataacaatgtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcatt 19289431  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    ||||||||| || |||||||||||  | | || |||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  19289432 gtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatt 19289500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 41961035 - 41960940
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatg 106  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  41961035 ggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 41960940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 45327915 - 45327820
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatg 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  45327915 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatg 45327820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4763826 - 4763654
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  | ||| ||||||||||| ||    
T  4763826 ggtgctacacttgaaacaaggtagaataaaa-ttagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtca 4763728  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatag---tgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| ||| || || || |||||   ||||||||||| ||||||| |||||    
T  4763727 ctgtacaaacagtggggtgttactcactacagttttgttgatatagtgttgttaacttcatcagaaaagtcatt 4763654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44913858 - 44913700
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactat-aaggactaaacttttgatgcc 108  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| | ||||||| ||| |    
T  44913858 ggtgttacacttaaaacaatgtatgataaaa-ttagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgtc 44913760  T
Q  109 a-tgtacaaac-agtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcac 166  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||||||||    
T  44913759 attttacaaacaagtgaggtgttactcacaacatttttgatactacagtgttaacttcac 44913700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 178
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051382
Alignment:
Q  61 gttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca--tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgtt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||| ||    
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactggtacaaatagtgaagtgttatacacaacacttttgatgctatagtatt 41051362  T
Q  159 aacttcaccagaaaaatcat 178  Q
    | ||||| ||||||| ||||    
T  41051363 agcttcatcagaaaagtcat 41051382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 242
Target Start/End: Original strand, 12530541 - 12530600
Alignment:
Q  183 ttctgagaaacctctttgatatgtttcccaaccttctatttgatgcaaaatgagagatag 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12530541 ttctgagaaacctctttgatatgtttctcaaccttctatttgatgcaaaatgagagatag 12530600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 31862020 - 31861953
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgat 105  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  31862020 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataatgactgaaattttgat 31861953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 41465696 - 41465532
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |  | |||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||         
T  41465696 ggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa-ttagattaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatagggactgaacttttga----- 41465603  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
      ||| | |  |  |||| ||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41465602 --taccagcgttagggtgctactcactacacctttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctc 41465532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 103
Target Start/End: Original strand, 19501775 - 19501839
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttg 103  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  19501775 aaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttg 19501839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 65
Target Start/End: Original strand, 18258295 - 18258349
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaa 65  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18258295 ggtgttacacttaaaaaaatgtaggat-aaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35844513 - 35844343
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  35844513 ggtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtca 35844414  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35844413 ctgtacaaacagtgaggtgttactcacaacatttttgttgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 35844343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11467006 - 11466838
Alignment:
Q  14 ttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgt 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  11467006 ttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgccactgt 11466908  T
Q  113 acaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11466907 acaaacagtggggtgttactcacaacacttgcgatgttatagtcttaacttcatcagaaaagtcattctc 11466838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 45174691 - 45174517
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |     
T  45174691 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgctac 45174592  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttact--cacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  45174591 tgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagttattctc 45174517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Original strand, 11357355 - 11357527
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |     
T  11357355 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaac 11357453  T
Q  110 tgtacaaacagt-gaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11357454 tgtacaaacagtgggggtgttactcactatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctc 11357527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37203253 - 37203084
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37203253 ggtgatacactaaaaataaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 37203155  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37203154 ctgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcatt 37203084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Original strand, 44186491 - 44186664
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  44186491 ggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtca 44186589  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctct 183  Q
     |||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44186590 ctgtataaacagcggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctct 44186664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21193791 - 21193620
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||     
T  21193791 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcac 21193693  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21193692 tctacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgattcaacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctc 21193620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 40936175 - 40936005
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  40936175 gtgttacacttaaaaaaagtt-ggataaaa-ttatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcac 40936078  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40936077 tgtataaacaatgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 40936005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4015646 - 4015474
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  4015646 ggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaa-ttagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 4015548  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4015547 ctctacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctc 4015474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 52040916 - 52041085
Alignment:
Q  14 ttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgt 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |    
T  52040916 ttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactat 52041014  T
Q  113 acaaaca-gtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||||||  || || ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  52041015 acaaacatttggggagttactcactacacttttgatgttatagtattaacttcaccagaaaagtcattctc 52041085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22451154 - 22450982
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  22451154 ggtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgcca 22451056  T
Q  110 tg-tacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
       |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22451055 ccatacaaacagtgaggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctc 22450982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29099541 - 29099370
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||| ||    
T  29099541 ggtgttacacttaaaataaggcacgataaaa-ttaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtca 29099443  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29099442 ctgtacaaacagtggggtgttactcacgacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattct 29099370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44891682 - 44891534
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||      
T  44891682 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgcc-- 44891586  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcacca 168  Q
          |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44891585 ------acagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcacca 44891534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Original strand, 53229145 - 53229308
Alignment:
Q  13 gttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| | ||    
T  53229145 gttacacttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactg 53229243  T
Q  112 tacaaacagtga-ggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaat 175  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  53229244 tacaaacattgagggtgttgctcactacacttttgatgctatagtgttaatttcaccagaaaaat 53229308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 51212971 - 51213143
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  51212971 ggtgttacacttataacaaggtaggataaaa-ttatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggactcaacttttgatgcca 51213069  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||| |||||| ||||  ||| || | |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  51213070 ttgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctc 51213143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37157893 - 37157739
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  37157893 ggtgttacacttgaaataaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcca 37157795  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttca 165  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  37157794 ctgtac-aacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaacttca 37157739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34133121 - 34132952
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||    
T  34133121 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtca 34133023  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  34133022 ttgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcatt 34132952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2008114 - 2007964
Alignment:
Q  15 tacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgta 113  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||| ||||    
T  2008114 tacacttaaaacgaggtaggataaaa-ttagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgta 2008016  T
Q  114 caaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttca 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||    
T  2008015 caaacagtggggtgttactcacaacacttttaacgctatagtgttaacttca 2007964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 48355125 - 48354955
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |    
T  48355125 tgttacatttataacaaggtaggataaaa-ttagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccatt 48355027  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    ||||||||| || |||||||||||  ||| || | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48355026 gtacaaacaatggggtgttactcattacatttttaatattatagtgttaacttcaccataaaaatcattctc 48354955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 7327472 - 7327645
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  7327472 ggtgttacactagaaagaaggtaggataaaaataa-attaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtca 7327570  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtg-ttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||    
T  7327571 ctgtacaaataatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgtttaacttcactaaaaaagtcattctc 7327645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39282838 - 39282670
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||    
T  39282838 ggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgcca 39282740  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     |||| |||||||| ||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39282739 ctgtataaacagtggggtattactcac-acagttttgatgttatagtgttaattttatcagaaaaatcatt 39282670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 46297752 - 46297921
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||    
T  46297752 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagttt-gattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttgacgcca 46297850  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46297851 ttgtacaaacagtggtgtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 46297921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 163
Target Start/End: Original strand, 3655209 - 3655345
Alignment:
Q  27 aaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgagg 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||| ||    
T  3655209 aaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtgggg 3655307  T
Q  126 tgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaactt 163  Q
    |||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||    
T  3655308 tgttactcattacattttttatgttatagtgttaactt 3655345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 4761639 - 4761803
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  4761639 ggtgttatacttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 4761737  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaa 174  Q
     |||||||||||||| ||||||||||  ||| || |||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  4761738 ttgtacaaacagtgaagtgttactcattacatttttgatattatagtattaacttcaccaaaaaaa 4761803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 26941254 - 26941421
Alignment:
Q  14 ttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgt 112  Q
    |||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||| || | |    
T  26941254 ttacgcttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattat 26941352  T
Q  113 acaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    |||||||||| |||||||||||  | | || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26941353 acaaacagtggggtgttactcattataattttgattttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattct 26941421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 20373303 - 20373457
Alignment:
Q  27 aaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgagg 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  20373303 aaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggg 20373401  T
Q  126 tgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    ||||||||   ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20373402 tgttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattct 20373457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 159
Target Start/End: Original strand, 42506065 - 42506214
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  42506065 ggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 42506163  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgtta 159  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  42506164 ttgtacaaacagtggggtattactcattacaattttgatgttatagtgtta 42506214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 142
Target Start/End: Original strand, 14586660 - 14586792
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||  ||    
T  14586660 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaag-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggacaaaacttttgatatca 14586758  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacactt 142  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14586759 ctgtataaatagtgaggtgttactcacaacactt 14586792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32373654 - 32373505
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||    |||||||||||||| |    
T  32373654 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgataccattggggtggaacttttgatgccact 32373556  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaactt 163  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32373555 gtacaaacagt--ggagttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactt 32373505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3362441 - 3362275
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaa--tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgc 107  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||| |||||||||  ||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||    
T  3362441 ggtgtttcacttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgc 3362343  T
Q  108 ca-tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaa 174  Q
    || |||||||| |||| | |||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  3362342 cactgtacaaatagtgggatgttactcactatatttctgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaaa 3362275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 47481681 - 47481538
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccatg-tacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||      
T  47481681 aaaattatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcatt 47481582  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattc 180  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  47481581 acatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaacatcattc 47481538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25579925 - 25579753
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || || |||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||    
T  25579925 ggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactgaacttttgatgtca 25579827  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||| ||| |||    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25579826 ctgtataaatagtagaatgttattcacaacacttttgatgctatagtattaacttcaccagaaaaatcattctc 25579753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 43348441 - 43348319
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |    
T  43348441 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-aaagactgaacttttgatgccact 43348344  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcac 135  Q
      |||||||||| |||||| |||||    
T  43348343 aaacaaacagtggggtgttgctcac 43348319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 24488952 - 24489121
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||    
T  24488952 ggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaa-ttagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtca 24489050  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||| |||||||||   |||||||||||||| || | ||  |||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  24489051 ttgtgcaaacagtggaatgttactcacaacatttttaatactatagtcttaacttcacaaaaaaaatcatt 24489121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Original strand, 40552276 - 40552421
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||||||      
T  40552276 aaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcatt 40552375  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  40552376 acatttttgatgttatagtgttaacttctccaaaaaagtcattctc 40552421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Original strand, 43975878 - 43976033
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||    
T  43975878 ggtgttacacttaaaacaagataagataaaa-ttagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatgtca 43975976  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttca 165  Q
    | ||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  43975977 tcgtacaaatagtggagtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttca 43976033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 53176239 - 53176078
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |     
T  53176239 gtgttatatttaaaatgaggttggataaaa-ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttat 53176141  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
    ||||||||||||| |   ||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  53176140 tgtacaaacagtg-gacattacttacaacatttttgatgttatgatgttaacttcatcagaaaa 53176078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 27480369 - 27480541
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  27480369 ggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtca 27480467  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
      ||||||||| |  | || ||||||  | |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||    
T  27480468 ccgtacaaacaattggatgctactcattatacttttgatgttatagtgttgactttaccaaaaatatcattctc 27480541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 29164004 - 29163912
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttg 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  29164004 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 33378775 - 33378931
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  33378775 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtca 33378873  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcac 166  Q
      ||||||| | || |||  ||||||| |||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  33378874 ccgtacaaatattggggtactactcactacacttttgatactatagtgttgacttcac 33378931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 33698339 - 33698265
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 85  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698339 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 135
Target Start/End: Original strand, 24708105 - 24708230
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaa--tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgc 107  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||     
T  24708105 ggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaa-ttagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgt 24708203  T
Q  108 ca-tgtacaaacagtgaggtgttactcac 135  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||    
T  24708204 cactgtac--acagtgaggtgttactcac 24708230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Original strand, 11835619 - 11835768
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccatg 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||  ||||                ||    
T  11835619 tgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatgatactatggggac----------------tg 11835702  T
Q  112 tacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11835703 tacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttg-----atagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctc 11835768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 22446055 - 22446218
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactat-aaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |||| || || |||||||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||    
T  22446055 gtgttacacttaaaacaatgtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgcca 22446153  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaa 174  Q
     |||||||| |||| |||||||||||| | | || ||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  22446154 ctgtacaaa-agtggggtgttactcactatatttttgatgatataatgttaacttcaccaaaaaaa 22446218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 36012322 - 36012251
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgata 83  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36012322 tgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgata 36012251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 166
Target Start/End: Original strand, 21009819 - 21009948
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||      
T  21009819 aaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcatt 21009918  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcac 166  Q
    ||| || |||||||||||||| || |||||    
T  21009919 acatttttgatgttatagtgtcaaattcac 21009948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 38591880 - 38591727
Alignment:
Q  14 ttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgt 112  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||| |||    
T  38591880 ttacacttgaaacaagataggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgccattgt 38591782  T
Q  113 acaa----acagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaactt 163  Q
    ||||    ||| |||| |||||||| | | | || ||||||||||||||||||||    
T  38591781 acaacaatacaatgagatgttactccctataattttgatgttatagtgttaactt 38591727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 46994654 - 46994746
Alignment:
Q  13 gttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatg 106  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  46994654 gttacacttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatg 46994746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 54828693 - 54828855
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatg-ccat 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||| | || | || |||||||| |  |    
T  54828693 tgttacacttataataaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttcatatgatgaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatgtcgtt 54828791  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaat 175  Q
    ||  |||| ||| |||||||||||  ||| || | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  54828792 gtttaaacggtggggtgttactcattaca-tttttatgttatagtgttaactttaccaaaaaaat 54828855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Original strand, 22622708 - 22622780
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgata 83  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22622708 ggtgttacacttgaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2613967 - 2613907
Alignment:
Q  119 agtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  2613967 agtgtggtgttactcacaacacttttggtgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcatt 2613907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 54505966 - 54505823
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccatg-tacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||| ||| |||||||||| ||| || || |||||||| |||  || ||| | || |||||||||||      
T  54505966 aaaattatattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatgagg-ctgaatttttgatgtcattctataaataatggggtgttactcatt 54505868  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  54505867 acatttttgatgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcattct 54505823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 1089877 - 1089811
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgat 79  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| ||||||| |||||||    
T  1089877 tgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagatttaatgtagtcctgttgatctgataaattgat 1089811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 33698260 - 33698218
Alignment:
Q  124 ggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcac 166  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33698260 ggtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcac 33698218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29163895 - 29163864
Alignment:
Q  148 gttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29163895 gttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 29163864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 87
Target Start/End: Original strand, 53811698 - 53811728
Alignment:
Q  57 tcttgttaatctgatgaattgatgatactat 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53811698 tcttgttaatctgatgaattgatgatactat 53811728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 181
Target Start/End: Original strand, 46994774 - 46994811
Alignment:
Q  144 tgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  46994774 tgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattct 46994811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11727218 - 11727046
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  11727218 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgcca 11727120  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     | |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11727119 ctatacaaatagtggggtgttacttacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctc 11727046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13307817 - 13307645
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  13307817 ggtgttacatttaaaataaagtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtca 13307719  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13307718 ctgtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 13307645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 38644171 - 38644000
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||     
T  38644171 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccac 38644073  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  38644072 tagacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttgaccaaaaaagtcattctc 38644000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 466036 - 465867
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||    
T  466036 ggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgcca 465938  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  465937 ctgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatcgtgttaacttcaccacaaaagtcatt 465867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 5299942 - 5300114
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5299942 ggtgttacacttaaaacaaggttggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgcca 5300040  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||   ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||    
T  5300041 ctgtacaaacagtagagtgctacttacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattaaaaaagtcattctc 5300114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12876303 - 12876134
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  12876303 ggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 12876205  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12876204 ttgtacaaacagttgggtgttactcacaacattttttatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcatt 12876134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 36694962 - 36695131
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  36694962 ggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtca 36695060  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  36695061 ttgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcatt 36695131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 1205121 - 1204949
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  1205121 ggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 1205023  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1205022 ttgtacaaacagtgatgtgttactcactacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctc 1204949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Original strand, 34952028 - 34952196
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||     
T  34952028 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcac 34952126  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34952127 tgtacaaacagtgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttgaccagaaaagtcatt 34952196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 16446871 - 16447040
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  16446871 ggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaa-ttaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgcca 16446969  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     | ||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  16446970 ttatacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgttaactttatcagaaaagtcatt 16447040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 37970515 - 37970687
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  37970515 ggtgttacacttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggca 37970613  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    | |||||||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37970614 ttgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctc 37970687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Original strand, 27082834 - 27082997
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||| |||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  27082834 ggtgttagacttaaaacatggtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgcca 27082932  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
     || |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27082933 ctgcacaaacagtggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaa 27082997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Original strand, 6098514 - 6098677
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  6098514 ggtgttacacttaaaacaagataggataaaa-ttagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtca 6098612  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| | | || ||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  6098613 ctgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtattaacttcaccaaaaaa 6098677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9864342 - 9864173
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||    
T  9864342 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttatattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtca 9864244  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  9864243 ttgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcatt 9864173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34895161 - 34894992
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||    
T  34895161 ggtgttacacttgaaacaaggttggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgcca 34895063  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     | |||||||||||  ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34895062 ctttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcatt 34894992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 10555198 - 10555370
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||| | |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||    
T  10555198 ggtgttgcgcttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtca 10555296  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||||||||||||  ||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10555297 ttgtacaaacagtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctc 10555370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 41910984 - 41911153
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| |    
T  41910984 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatgcta 41911082  T
Q  110 -tgtacaaacagt-gaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcat 178  Q
     |||   || ||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  41911083 ctgttataatagtgggggtgttactcacgacacttttgatgatatagtattaacttcaccaaaaaaatcat 41911153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 1150101 - 1150272
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatg-cc 108  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| |     
T  1150101 ggtgttacgcttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcg 1150199  T
Q  109 atgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  1150200 ttgtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaagtcattct 1150272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43025896 - 43025733
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||| || |||    
T  43025896 ggtgttacagttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattatatgaactgaacttttaatacca 43025798  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
     |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||| ||||    
T  43025797 ttgtacaaagagtggggtattaatcacaacacttttgatactatatcgttaacttcaccataaaa 43025733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16223057 - 16222885
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||  |||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  16223057 ggtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 16222959  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||| ||| ||   ||||||| | | || | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16222958 ttgtacaaactgtggggaactactcactatattttttatgttatagtgttaaattcaccagaaaagtcattctc 16222885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 23854427 - 23854599
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  23854427 ggtgttacacttataactaggtaagataaaa-ttagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 23854525  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     || |||||||||  |||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23854526 ttgcacaaacagttgggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctc 23854599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Original strand, 31933909 - 31934054
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||| |||| |||||||||||      
T  31933909 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaagagtggggtgttactcatt 31934008  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    | | || |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31934009 atatttttgatatcatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctc 31934054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40862612 - 40862450
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccat 110  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | |||  |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||    
T  40862612 gtgttacacttagaacaaagtaggataaaa-ttagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatgag-actgaacttttgatgccat 40862515  T
Q  111 -gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttct-gatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40862514 tgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaa 40862450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 43643591 - 43643763
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | |||||| |||| ||    
T  43643591 ggtgttacgcttataacaaggtaggataaaa-ttagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtca 43643689  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||   ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43643690 ttgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctc 43643763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 44869686 - 44869527
Alignment:
Q  16 acacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtac 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | || | ||||||||||| || ||| |    
T  44869686 acacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttgatgtcattgtgc 44869587  T
Q  115 aaacagtgaggtgttactcac--aacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
    |||||||| ||  | ||||||  || |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44869586 aaacagtg-gggatcactcacaaaatacttttaatgttatagtgttaacttcaccaaaaaa 44869527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Original strand, 39099117 - 39099237
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |    
T  39099117 tgttacacttaaaacagggtaagataaaa-ttagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgctagt 39099215  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttact 132  Q
    ||||||| |||| |||||||||    
T  39099216 gtacaaagagtggggtgttact 39099237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 7998488 - 7998416
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgata 83  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7998488 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgata 7998416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Original strand, 1149628 - 1149752
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||    
T  1149628 ggtgttacgcttataacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtca 1149726  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactca 134  Q
     ||||||||||||| | |||||||||    
T  1149727 ttgtacaaacagtgggttgttactca 1149752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 177
Target Start/End: Original strand, 30654606 - 30654746
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccatgta-caaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| | | || ||||||||||| |||  | ||||||||| |||||||||||      
T  30654606 aaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattcaacaaacagtggggtgttactcatt 30654705  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatca 177  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30654706 acattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatca 30654746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362543
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || |    
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcact 41362609  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     |||||| |||| |||||||||||| ||| || | |||   ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  41362608 atacaaatagtggggtgttactcactaca-tttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaagtcatt 41362543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33906404 - 33906246
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccatg 111  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||               
T  33906404 tgttacccttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaactt----------- 33906317  T
Q  112 tacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    || |||||||| |||| ||||||| |||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  33906316 tataaacagtggggtgctactcactacacttttaatactatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctc 33906246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 123
Target Start/End: Original strand, 35459709 - 35459820
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    ||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| || |    
T  35459709 tgttacatttataacaaagtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcatt 35459807  T
Q  111 gtacaaacagtga 123  Q
    |||||| ||||||    
T  35459808 gtacaatcagtga 35459820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 109
Target Start/End: Original strand, 1953987 - 1954084
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgat-gatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| | |||| || | |||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  1953987 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgagggctgaacttttgatgcca 1954084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 118
Target Start/End: Original strand, 7890980 - 7891061
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaac 118  Q
    |||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  7890980 aaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccattgtacaaac 7891061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 8803813 - 8803974
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||       | || ||||||||||| ||    
T  8803813 ggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaa-ttatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgata-------ggctgaacttttgatgtca 8803904  T
Q  110 tg-tacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcat 178  Q
    |  |||||| ||||  ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8803905 ttctacaaatagtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcat 8803974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 33198002 - 33197947
Alignment:
Q  52 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||||    
T  33198002 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttgatgc 33197947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Original strand, 4132682 - 4132750
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatg 80  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4132682 ggtgttacacttaaac-aaggtagaataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 18259275 - 18259229
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattct 59  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18259275 tgttacacttaaaataaggtatgat-aaaattaaattaaatgtattct 18259229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 135
Target Start/End: Original strand, 4133077 - 4133131
Alignment:
Q  82 tactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcac 135  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  4133077 tactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtcaggtattactcac 4133131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Original strand, 24823394 - 24823440
Alignment:
Q  136 aacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24823394 aacacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctc 24823440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 144 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15009302 - 15009265
Alignment:
Q  144 tgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15009302 tgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattct 15009265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9200426 - 9200265
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |    
T  9200426 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcact 9200328  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9200327 gtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 9200265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 30969304 - 30969476
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  30969304 ggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 30969402  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30969403 ttgtataaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagataaatcattctc 30969476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 36866957 - 36866788
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  36866957 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcgggactgaacttttgatgcca 36866859  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36866858 ttgtacaaacagtggggtgttactcacaatatttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 36866788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 25500906 - 25501078
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  25500906 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttaaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggca 25501004  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25501005 gtgtacaaacagtgaggtgttattcacaacacttttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattctc 25501078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26268269 - 26268097
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  26268269 ggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattt-gattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtca 26268171  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
      |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26268170 ccgtacaaacagtggggtgttactcaaaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 26268097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27330499 - 27330331
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  27330499 ggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa-ttagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgcca 27330401  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattc 180  Q
     |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27330400 ttgtacaaacagtaaggtgttact--caacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 27330331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32563342 - 32563175
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||| || |    
T  32563342 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcact 32563244  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32563243 gtacagacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaatcatt 32563175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7693425 - 7693256
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  7693425 ggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaa-ttagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgcca 7693327  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7693326 ctgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 7693256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 27318467 - 27318639
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||    
T  27318467 ggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtca 27318565  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| ||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27318566 ttgtacaaacagtggtgtgttactcactacattttttatgttttagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 27318639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 8741866 - 8742039
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  8741866 ggtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaa-ttagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgcca 8741964  T
Q  110 -tgtacaaacagt-gaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8741965 ttgtacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctc 8742039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22019827 - 22019656
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||| ||    
T  22019827 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtca 22019729  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
     | |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22019728 ctatacaaacaatggggtgttactcacaacacttttgattctatagttttaacttcaccagaaaagtcattct 22019656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40133580 - 40133411
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||    
T  40133580 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatggggactgaacttttgatgcca 40133482  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     |||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  40133481 ttgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactataatgttaacttcaccacaaaagtcatt 40133411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 5837746 - 5837578
Alignment:
Q  14 ttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgt 112  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||||||| || |||    
T  5837746 ttacacttaaaacaatgtaggattaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgt 5837648  T
Q  113 acaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5837647 acaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaccttcaccagaaaagtcattctc 5837578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19120054 - 19119882
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  19120054 ggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagagtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatgtca 19119956  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19119955 ctgtacaaacagtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccacaaaagtcattctc 19119882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 699344 - 699173
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||| ||     
T  699344 gtgttacacttaaaataaggtatgataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcac 699246  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | | || | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  699245 tgtacaaacagtggggtgttactcactagattttttatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctc 699173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24886298 - 24886135
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  24886298 gtgttacacttataataaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcat 24886200  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaa 174  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24886199 tgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaa 24886135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 35934091 - 35933925
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  |||||||||||||    
T  35934091 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttgatgcca 35933992  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
      ||     |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35933991 -cta-----agtgaggtgttactcacaacacttttgattctatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattctc 35933925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 36860619 - 36860449
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataa-ggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcc 108  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| |    
T  36860619 ggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaa-ttagattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtc 36860521  T
Q  109 at-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36860520 attgtacaaacagtggggtgttactcacaacattttttatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 36860449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 1429126 - 1429283
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||     
T  1429126 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccag 1429224  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcacca 168  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | | || ||||| |||||||||||||||||||    
T  1429225 tgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtgttaacttcacca 1429283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 39573012 - 39572842
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| || |    
T  39573012 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcact 39572914  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||| || | || ||||||| ||||||| || |||||| ||||||||    
T  39572913 gcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatattatagtattaacttaactagaaaagtcattctc 39572842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22980988 - 22980816
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  22980988 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtca 22980890  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||  ||||||||| ||| ||||||||   | || ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22980889 ttgctcaaacagtggggtattactcactgtatttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctc 22980816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8466938 - 8466768
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| |||     
T  8466938 gtgttacatttaaaacaaggtagaataaaa-ttaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgataccac 8466840  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8466839 tgtacaaagaggg-ggtgttattcacaacacttttgatgttacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctc 8466768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15724682 - 15724513
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccat 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||| |||    
T  15724682 gtgttatacttaaaataaggtagaataaaa-ttaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttt-gatgtcat 15724586  T
Q  111 -gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15724585 tgtataaacagtggggtgttactcacaaaacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctc 15724513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Original strand, 14409310 - 14409478
Alignment:
Q  13 gttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccat-g 111  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |    
T  14409310 gttacacttaaaacaaggtagaataaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag-actgaacttttgatgccaccg 14409407  T
Q  112 tacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    ||  || |||| |||| ||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14409408 tattaagagtggggtgctactcactacatttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctc 14409478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 14919508 - 14919672
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  14919508 ggtgttacacttataataaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 14919606  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaa 174  Q
     | || ||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  14919607 ttatataaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttataatgttaacttcatcaaaaaaa 14919672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 28416507 - 28416663
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    || | |||||||||| |||    
T  28416507 ggtgttacacttaaaataaggcagaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagattgaacttttgattcca 28416605  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcac 166  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28416606 ctgtacaaacagtgggatgttactcacaatacttttgatattatagtgttaacttcac 28416663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 31786626 - 31786798
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  31786626 ggtgttacacttaaaacaagataggataaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgcca 31786724  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||| ||   | ||||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31786725 ctgtacaaacagtggggcagtgctcactacatttttcatgctatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctc 31786798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33908428 - 33908256
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33908428 ggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 33908330  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
      ||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  33908329 ccgtacaaacagtggagtgctactcactacacttttgatgatatagtgttgacttcaccagaaagttcattctc 33908256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12910550 - 12910376
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  12910550 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgtca 12910452  T
Q  110 ------tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
          ||||||||||||| |||||||| ||| | | || |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  12910451 ctgtactgtacaaacagtggggtgttacgcactatatttttgatgttatagttttaacttcaccaaaaaagtcatt 12910376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 38528217 - 38528385
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||    
T  38528217 ggtgttacacttgaaacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgtca 38528314  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     |||| ||||| || |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38528315 ctgtataaacaatggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaaccatt 38528385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Original strand, 23116202 - 23116357
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||| |||    
T  23116202 ggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaacttttgattcca 23116300  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttca 165  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||    
T  23116301 ctgtacaaacagtggggtgctactcactacagttttgatgttataatgttaacttca 23116357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Original strand, 5112297 - 5112462
Alignment:
Q  14 ttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgt 112  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||    
T  5112297 ttacacttaaaacatggtatgataaaa-ttagattaagtatagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgt 5112395  T
Q  113 acaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    |||||||||| |||||||||||| | | || | |||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  5112396 acaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcatt 5112462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25668803 - 25668687
Alignment:
Q  52 tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgtt 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25668803 tgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgtt 25668704  T
Q  151 atagtgttaacttcacca 168  Q
    | ||||||||||||||||    
T  25668703 a-agtgttaacttcacca 25668687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 139
Target Start/End: Original strand, 21088748 - 21088875
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| || |    
T  21088748 tgttacacttaaaacaaggtaggataaag-ttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcatt 21088846  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaaca 139  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21088847 gtacaaacagtggggtgtcactcacaaca 21088875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 31705594 - 31705760
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| || |    
T  31705594 tgttacgcttataacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttgatgtcatt 31705691  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    |||||||| ||  ||||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31705692 gtacaaacggtagggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatt 31705760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 35511457 - 35511619
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||    
T  35511457 ggtgttacacttgaaacaaggttggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtca 35511555  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaa 172  Q
     | |||||||||||  ||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35511556 ctttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttataatgttaacttcatcagaaa 35511619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Original strand, 6824459 - 6824599
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggact--aaacttttgatgc 107  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||     
T  6824459 ggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatgatactatgaagactgaacacttttgatgt 6824557  T
Q  108 ca-tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatg 148  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  6824558 cactgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatg 6824599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22255350 - 22255213
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||      
T  22255350 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgttactcatt 22255251  T
Q  137 aca-cttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
    |||  || |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22255250 acattttttgatgttataatgttaacttcaccaaaaaa 22255213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 22974062 - 22974234
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || ||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| || | | |||||||||||  |    
T  22974062 ggtgttacgcttataacaagataggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttttgatgtta 22974160  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    | |||||||||||| | |||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22974161 ttgtacaaacagtgggatgttactcattacttttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctc 22974234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Original strand, 35826465 - 35826632
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    ||||||| ||||||| || |||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  35826465 gtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaa-ttagattaaatgtggtattgttaatct-atgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcac 35826562  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  ||| || |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||    
T  35826563 tgtacaaacaatgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagtattaacttcacaaaaaaagtcatt 35826632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 135
Target Start/End: Original strand, 23954769 - 23954895
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||    
T  23954769 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgcca 23954867  T
Q  110 --tgtacaaacagtgaggtgttactcac 135  Q
       ||| |||||||| ||||||||||||    
T  23954868 ctagtaaaaacagtggggtgttactcac 23954895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 163
Target Start/End: Original strand, 43308632 - 43308784
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||| | || | ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  43308632 ggtgttacacttataacaaggtaagataaaa-ttagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 43308730  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaactt 163  Q
     ||||| ||||||| ||||||| |||  ||| || |||||||||| |||||||||    
T  43308731 ttgtacgaacagtg-ggtgttattcattacatttttgatgttataatgttaactt 43308784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Original strand, 17158011 - 17158166
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| | ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||    
T  17158011 ggtgttacacttataataaggtaagatacaa-ttatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatgtca 17158108  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcac 166  Q
     ||||||||| |||  ||||||||||  ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  17158109 ttgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcac 17158166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 35504560 - 35504436
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||    
T  35504560 ggtgttacgcttataatatggtaggataaaa-ttatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaacttttgatgtca 35504462  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactca 134  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||    
T  35504461 tcatacaaacggtgaggtgttactca 35504436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 42342899 - 42342775
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||  |||||||| || |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  42342899 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatac--taaggggaaattttttgatgtcactgtataaacagtggggtattactcaca 42342802  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaactt 163  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||    
T  42342801 acatttttgatgttatagtattaactt 42342775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 7208844 - 7209007
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatg-cc 108  Q
    ||||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |     
T  7208844 ggtgttacgtttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtca 7208941  T
Q  109 atgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaa 174  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||    || || | |||||| | |||||||||||||| |||||    
T  7208942 atgtacaaacggtagggtgttactcgttgcattttttatgttacaatgttaacttcaccaaaaaaa 7209007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 122
Target Start/End: Original strand, 15992547 - 15992632
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtg 122  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  15992547 aaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtg 15992632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8437152 - 8436989
Alignment:
Q  18 acttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaa 116  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||   || | |||| |||||||||  |||||||||  || |||||| ||||||||||| || |||||||    
T  8437152 acttaaaacaaggcaggataaaa-ttagattaagcatagttttgtaaatctgatgg-ttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaa 8437055  T
Q  117 acagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    ||| || | |||||||||| ||||||  || | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8437054 acaatgggatgttactcactacactttggaagctatagtgttaatttcaccaaaaaaatcattctc 8436989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 179
Target Start/End: Original strand, 13956425 - 13956494
Alignment:
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  13956425 tgtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatgagaaaagtcatt 13956494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 69 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898034
Alignment:
Q  69 gatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcacc 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |||  |||||||||||   ||||| ||||| |||| | ||||||| |||    
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctataatattaactttacc 11898040  T
Q  168 agaaaa 173  Q
    ||||||    
T  11898039 agaaaa 11898034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5830034 - 5829923
Alignment:
Q  73 aattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatg----ttatagtgttaacttcacc 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||  ||| || | |||    ||||| |||||||||||||    
T  5830034 aattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcattacattttttatgttaattataatgttaacttcacc 5829935  T
Q  168 agaaaaatcatt 179  Q
    | ||||||||||    
T  5829934 aaaaaaatcatt 5829923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 173
Target Start/End: Original strand, 16004474 - 16004519
Alignment:
Q  128 ttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16004474 ttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 16004519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 84
Target Start/End: Original strand, 13956369 - 13956415
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatac 84  Q
    ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13956369 aaaattagattaagtgaagttttgttaatctgatgaattgatgatac 13956415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 25669780 - 25669733
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattct 59  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25669780 gtgttacacttaaaacaaagtaggat-aaaattagattaagtgtattct 25669733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21991806 - 21991634
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  21991806 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgaca 21991708  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21991707 ctgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttcaccataaaaatcattctc 21991634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12165922 - 12165753
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  12165922 ggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagggacttaacttttgatgcca 12165824  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12165823 ctgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttggatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 12165753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 25691535 - 25691708
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  25691535 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgcca 25691633  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggt-gttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25691634 ctgtacaaacagtgaggtaattactcacaatacttttgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattctc 25691708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8861455 - 8861283
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8861455 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgcca 8861357  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  8861356 ctgtacaaacagtggggtgttattcataacacttttgatgctatagtgttaacttcgcgagaaaagtcattctc 8861283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 27421373 - 27421539
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccat- 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| |||     
T  27421373 tgttacacttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgataaatttatgatattata-ggactgaacttttgatgtcatt 27421470  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27421471 gtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatt 27421539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Original strand, 5657474 - 5657644
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |    
T  5657474 tgttacacttaaaacaaagtaggataaaa-ttaaattaagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccact 5657572  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5657573 gtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctc 5657644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43686210 - 43686054
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43686210 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagggactgaacttttgatgcca 43686112  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcacc 167  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  43686111 ttgtacaaacagtg-ggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcacc 43686054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22687409 - 22687237
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  22687409 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatacca 22687311  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     || ||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22687310 ctgcacaaacagtggagtgttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctc 22687237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6546689 - 6546518
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||  |    
T  6546689 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggatagtaaacttttgatgtta 6546591  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
     |||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6546590 ctgtacaaatagtggggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcactagaaaaatcattct 6546518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 15612750 - 15612911
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  15612750 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgcca 15612848  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaa 172  Q
     | |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15612849 ctctacaaacactggggtgttactcataacactt-tgatgttatagtgttaacttcacaagaaa 15612911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 29173709 - 29173540
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||     
T  29173709 gtgtaacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcat 29173611  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattc 180  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29173610 tgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 29173540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26980492 - 26980325
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||     
T  26980492 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccac 26980394  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcat 178  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  26980393 tgtacaaaccgtggggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaacttcaccataaaagtcat 26980325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Original strand, 33688254 - 33688424
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||     
T  33688254 gtgttacacttaaaacaaagtatgataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgccac 33688352  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    || |||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33688353 tggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaactt-accagaaaagtcattctc 33688424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4583089 - 4582920
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  4583089 ggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaa-ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtca 4582991  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     |||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4582990 ttgtacaaatagtggggtgttactcacaacatttttgatactatagtattaacttcaccagaaaagtcatt 4582920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32432622 - 32432458
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||    
T  32432622 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa-ttatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtca 32432524  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||| || ||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32432523 ttgtacaaacaatggggtgttactcacaacatttttg-----atagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 32432458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 32821044 - 32821213
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  32821044 ggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaa-attaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgcca 32821142  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32821143 ttgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatattgttaacttcaccaaaaaaatcatt 32821213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 48928555 - 48928726
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  48928555 ggtgttacacttaaaataatgtaggataaaa-ttagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggca 48928652  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
      ||||||| |||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  48928653 ccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctc 48928726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27283914 - 27283745
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||  ||    
T  27283914 ggtgttacacttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgatttca 27283816  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27283815 ttgtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatt 27283745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38258715 - 38258546
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||    
T  38258715 ggtgttacgcttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtca 38258617  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38258616 ttgtacaaacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatt 38258546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 48928288 - 48928459
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  48928288 ggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaa-ttagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggca 48928385  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
      ||||||| |||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  48928386 ccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctc 48928459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Original strand, 12390622 - 12390784
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||| ||     
T  12390622 gtgttacacttaaaagaaggtagaataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcac 12390720  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
    || |||||||||| | |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12390721 tgcacaaacagtgggatgttactcattacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaa 12390784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23111362 - 23111191
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggata-aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcc 108  Q
    |||||||| ||||||| || ||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | |  | |||||||||||||    
T  23111362 ggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgcc 23111263  T
Q  109 at-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    || ||||||| ||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23111262 attgtacaaatagtggtgtgttactcacaatatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 23111191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18797497 - 18797327
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||    
T  18797497 ggtgttacacttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtca 18797399  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  ||| || | ||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18797398 ttgtacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgt--tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctc 18797327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 7334964 - 7334792
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||    
T  7334964 ggtgttacacttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtca 7334866  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  |||  | | |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  7334865 ttgtacaaacagtggggtgttactcattacatattttatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattctc 7334792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30055697 - 30055533
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  30055697 ggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 30055599  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaa 174  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  30055598 ttgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttcatcaaaaaaa 30055533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 41765069 - 41765241
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  41765069 ggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgcca 41765167  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
      |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||| || |||| | ||||||| ||||||||    
T  41765168 ccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtattgactttatcagaaaagtcattctc 41765241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24211909 - 24211740
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |    
T  24211909 tgttacacttagaacaaggtatgataaaa-ttatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccatt 24211811  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
     || |||||||  |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24211810 ctataaacagtagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattct 24211740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 31579055 - 31579231
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||    
T  31579055 ggtgttatacttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtca 31579153  T
Q  110 -tgta-----caaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
     ||||      |||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31579154 ttgtataaattaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaattattct 31579231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37110015 - 37109873
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||      
T  37110015 aaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcatt 37109916  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37109915 acattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatt 37109873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Original strand, 9355817 - 9355975
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||||||| ||    
T  9355817 ggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtca 9355915  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcacca 168  Q
     ||||||||||||| ||| || ||||| ||| || | ||| ||||||||||| |||||||    
T  9355916 ctgtacaaacagtggggtattgctcactacattttttatgctatagtgttaaattcacca 9355975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Original strand, 17842604 - 17842746
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||      
T  17842604 aaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcatt 17842703  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17842704 acattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatt 17842746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10481775 - 10481619
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||    
T  10481775 ggtgttacacttataacaaggtaagataaaa-ttagattaagcgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatgtca 10481677  T
Q  110 -tgtacaaacagt-gaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttca 165  Q
     |||||||||||| | |||||||||||  | | || | ||||||||||||||||||||    
T  10481676 ttgtacaaacagtgggggtgttactcattatattttttatgttatagtgttaacttca 10481619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Original strand, 31520716 - 31520883
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||     
T  31520716 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactat-gggactgaacttttgatgtcac 31520813  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||| | | || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  31520814 tgtacaaacaatggagtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagtcatt 31520883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11071372 - 11071211
Alignment:
Q  14 ttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgt 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || |||    
T  11071372 ttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgt 11071274  T
Q  113 acaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaat 175  Q
    ||||||||||  ||||||||| | | | || ||||| ||||||  |||||| |||| ||||||    
T  11071273 acaaacagtggagtgttactcgctatatttttgatgatatagtactaactttaccaaaaaaat 11071211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 182
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524490
Alignment:
Q  57 tcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagt 155  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||  |||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagt 26524463  T
Q  156 gttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26524464 gttaacatcaccagaaaagtcattctc 26524490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37347188 - 37347023
Alignment:
Q  14 ttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgt 112  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||||| | || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||    
T  37347188 ttacacttaaaacaatgtatgataaaa-ttagattaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgt 37347090  T
Q  113 acaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    ||||||| || |||||||||||  | | || ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37347089 acaaacaatggggtgttactcattatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaaatcatt 37347023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Original strand, 44413370 - 44413525
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||  ||||||||||  ||    
T  44413370 ggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggagaccgaacttttgatttca 44413468  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttca 165  Q
     |||||||||| || |||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||    
T  44413469 gtgtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttca 44413525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 44598836 - 44598738
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | || |||||||||||    
T  44598836 ggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa-ttagattaaatgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattgaatttttgatgcca 44598738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 15672754 - 15672829
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactat 87  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15672754 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactat 15672829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 10359205 - 10359374
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaa-tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcc 108  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |    
T  10359205 ggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatca-gactgaacttttgatgtc 10359302  T
Q  109 a-tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    | |||| ||| |||  | |||||||||| |||||| ||||| ||||   |||| || ||||||||| |||||    
T  10359303 actgtataaatagtaggatgttactcactacacttttgatgctataagattaattttaccagaaaagtcatt 10359374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 182
Target Start/End: Original strand, 34362205 - 34362311
Alignment:
Q  76 tgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaa 174  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||     
T  34362205 tgatgatactatgagaactgaacttt-gatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttcctagaaaag 34362303  T
Q  175 tcattctc 182  Q
    ||||||||    
T  34362304 tcattctc 34362311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35353233 - 35353120
Alignment:
Q  57 tcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggac-taaacttttgatgccat-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatag 154  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  35353233 tcttgttaatctgatgaattggtgatactatggggacagaaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtgctactcactacacttttgatgctatag 35353134  T
Q  155 tgttaacttcacca 168  Q
    |||| |||||||||    
T  35353133 tgttgacttcacca 35353120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 37704327 - 37704251
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactat 87  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37704327 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttaaattaagtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactat 37704251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Original strand, 32593181 - 32593327
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |||     
T  32593181 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatactgtga-gactgaacttttgataccac 32593278  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgtt 158  Q
      || |||||||| |||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||    
T  32593279 catataaacagtggggtgctactcactacacttttaatgctatagtgtt 32593327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 43925271 - 43925147
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| | |||||||||||||   |||| ||||||||||| ||    
T  43925271 ggtgttgcacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatgtca 43925174  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaaca 139  Q
     |||    |||||||||||||||||||||||    
T  43925173 ttgt----acagtgaggtgttactcacaaca 43925147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Original strand, 26588075 - 26588126
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgt 62  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  26588075 ggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 110
Target Start/End: Original strand, 34362149 - 34362192
Alignment:
Q  67 ctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34362149 ctgatgaattgatgatactataagaactgaacttttgatgccat 34362192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 38053647 - 38053492
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccat 110  Q
    |||||||||||| || || ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||        ||||||| ||||| || ||| ||||||||||| |||    
T  38053647 gtgttacacttataacaaagtatgataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgacactatgagaactgaacttttgatgtcat 38053557  T
Q  111 -gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaa 174  Q
     |||||||||||  ||| |||||||  ||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38053556 tgtacaaacagtagggttttactcattacattttttatgttatagtattaacttcaccaaaaaaa 38053492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Original strand, 37703491 - 37703551
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 73  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  37703491 tgttacacttaaaataagatatgataaaa-ttagattaagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 4318811 - 4318984
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  | ||||||||||| ||    
T  4318811 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtca 4318910  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4318911 ctgtacaaacagtggggtgttactcataacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctc 4318984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15491810 - 15491638
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  15491810 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgcca 15491712  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15491711 ctgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttacaatgttaacttcacgagaaaagtcattctc 15491638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8513419 - 8513256
Alignment:
Q  20 ttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaac 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  8513419 ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaac 8513320  T
Q  119 agtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8513319 agtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctc 8513256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 29182358 - 29182186
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||| ||    
T  29182358 ggtgttacacttaaaatatggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgaca 29182260  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  29182259 ctgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcatcaataaaatcattctc 29182186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6089094 - 6088931
Alignment:
Q  20 ttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaac 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  6089094 ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaac 6088995  T
Q  119 agtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6088994 agtggggcgttactcacaacacttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 6088931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 33892992 - 33893162
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||  ||    
T  33892992 ggtgttatacataaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-agggactgaacttttaatatca 33893089  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  33893090 ttgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaaattattct 33893162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 3879928 - 3880100
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||    
T  3879928 ggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaa-ttagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtca 3880026  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3880027 ttgtacaaacagtagggtgttactcacaacacttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattctc 3880100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 7235024 - 7235195
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||    
T  7235024 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatgag-actgaacttttgatggca 7235121  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
      |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  7235122 ccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccggaaaagtcattctc 7235195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Original strand, 30353349 - 30353519
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||   |||| |||| | ||||||| |    
T  30353349 tgttacacttaaaacaaggcatgataaaa-ttagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccact 30353447  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30353448 gtacaaacagtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattctc 30353519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 21017101 - 21017270
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21017101 ggtgttacacttaaaataacgtaggataaaa-ttagattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgcca 21017199  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     |||||||| | || |||||||||||||||| || | ||  || | |||||||||||||| |||| |||||    
T  21017200 ttgtacaaataatggggtgttactcacaacattttttatactacaatgttaacttcaccaaaaaagtcatt 21017270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20768275 - 20768109
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccatg 111  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||      
T  20768275 tgttacacttaaaacaaagtaggataaaa-ttagattaa--gtaatcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgccact 20768179  T
Q  112 tacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||| || | || ||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20768178 aacaaacaatg-gatgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctc 20768109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 7055205 - 7055375
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||     
T  7055205 gtgttacacttagaacaaggtatgataaaa-ttatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcat 7055303  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    | |||||| |||||||||||||| |  | | || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7055304 tctacaaatagtgaggtgttactaattatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattct 7055375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1946029 - 1945865
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  1946029 ggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaa-ttatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtca 1945931  T
Q  110 tg-tacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaa 174  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1945930 ttctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaa 1945865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 33619010 - 33618866
Alignment:
Q  29 ggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtg 127  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||| | || | ||    
T  33619010 ggtaggataaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaataatgggttg 33618912  T
Q  128 ttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
     ||||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  33618911 ctactcactacacttttgatgcgatagtgttgacttcaccagaaaa 33618866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5627559 - 5627415
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||||      
T  5627559 aaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcatt 5627460  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    | | || | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5627459 atattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattct 5627415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 175
Target Start/End: Original strand, 6091172 - 6091336
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||    
T  6091172 ggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatggca 6091270  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaat 175  Q
     |||||||||| ||  ||||||||||| ||| || | |||||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  6091271 ttgtacaaacaatggtgtgttactcactacattttttatgttaca-tgttaactttaccaaaaaaat 6091336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18498565 - 18498456
Alignment:
Q  75 ttgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgagg-tgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaa 172  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || |||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  18498565 ttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcaccaggaa 18498466  T
Q  173 aatcattctc 182  Q
    | ||||||||    
T  18498465 agtcattctc 18498456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 47279378 - 47279208
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |    
T  47279378 tgttacaattaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccact 47279280  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  47279279 gtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatagtataatgttaacttcaccaaaaaaatcattctc 47279208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3309339 - 3309167
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||| |||    
T  3309339 ggtgttacatttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgatacca 3309240  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3309239 ctgtacaaacagtg-ggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccagaaaagtcattctc 3309167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15752220 - 15752048
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15752220 ggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 15752122  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | | || | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15752121 ttgtacaaacagtgaggtgttactcactatattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctc 15752048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 39393573 - 39393402
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |    
T  39393573 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgccact 39393474  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  39393473 gtacaaacaatgaagtattactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcattagaaaagtcattctc 39393402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 48620828 - 48620659
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||    
T  48620828 ggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtca 48620730  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  48620729 ctgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatattgttaacttcacaagaaaagtcatt 48620659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 38823405 - 38823233
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| ||    
T  38823405 ggtgttacacttaaaataaagtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgaca 38823307  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38823306 ctgtacaaatagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgttaacttaaccagaaaagtcattctc 38823233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3535123 - 3534960
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| ||||||||||| ||    
T  3535123 ggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaa-ttagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaaggggactgaacttttgatgtca 3535025  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3535024 ctgcacaaacagtaaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaa 3534960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 27532966 - 27533137
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  27532966 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt--gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgcca 27533063  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||||||| |||| | |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27533064 ctgtacaaagagtgggttgttacccacaatacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctc 27533137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Original strand, 11742338 - 11742507
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| || |    
T  11742338 tgttacacttaaaacaaggtaagataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttttgatgtcact 11742435  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11742436 gtacaaacagtggggtgttacttacaacacttttgataatatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctc 11742507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16415833 - 16415664
Alignment:
Q  14 ttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgt 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |||    
T  16415833 ttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgt 16415735  T
Q  113 acaaacagtga-ggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    ||||||| | | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16415734 acaaacatttagggtgttactcactacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctc 16415664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 14758232 - 14758060
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14758232 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgcca 14758134  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
      |||||||||||   ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14758133 ccgtacaaacagttgtgtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctc 14758060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41926353 - 41926185
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  41926353 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaa-ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccac 41926255  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    ||||||||||||| | | |||||||| | | || |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  41926254 tgtacaaacagtgggatattactcactatatttttgatgttatagtattaacttcatcaaaaaaatcatt 41926185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2959937 - 2959770
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || |    
T  2959937 tgttacacttgaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcact 2959839  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    |||||||||||| | ||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2959838 gtacaaacagtgggatgttacttactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcatt 2959770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 7079048 - 7079228
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||    
T  7079048 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtca 7079146  T
Q  110 -tgtacaaacagtga-----------ggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||||           ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7079147 ttgtacaaacagtgaggtgttagtggggtgttactcacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatt 7079228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15168287 - 15168108
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcc- 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||     
T  15168287 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgcca 15168189  T
Q  109 -------atgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
           | |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15168188 ccgtacaacgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaagcattctc 15168108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 10181993 - 10182162
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  10181993 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgcca 10182091  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     |||||||||||||  ||||||| ||| | | || | |||||| ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  10182092 ctgtacaaacagtggcgtgttacgcactatattttttatgttacagttttaacttcaccaaaaaagtcatt 10182162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Original strand, 27227470 - 27227587
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  27227470 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 27227568  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtg 127  Q
     ||||||||||||||||||    
T  27227569 ctgtacaaacagtgaggtg 27227587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Original strand, 28564793 - 28564935
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||      
T  28564793 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtaaggtgttactcatt 28564892  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28564893 acatttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcatt 28564935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40885002 - 40884841
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||      
T  40885002 tgttacacttaaaacaagataggataaaact-agattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgaagatactatagggactgaacttttgatgccacc 40884904  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40884903 gtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatggtgttgacttcaccagaaaa 40884841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32216246 - 32216088
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | || | |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  32216246 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattt-gattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgcca 32216148  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcacca 168  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  32216147 ttgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcacca 32216088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 10922918 - 10922746
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||    
T  10922918 ggtgttacccttataacaaggtatgataaaa-taagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtca 10922820  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    | |||||||||||| ||| |||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10922819 ttgtacaaacagtggggtcttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctc 10922746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Original strand, 34012362 - 34012517
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||    
T  34012362 ggtgttacacttgaaacaaggttggataaaa-ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgcca 34012460  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttca 165  Q
     | |||||||||||  ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  34012461 ctttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtgttaacttca 34012517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4330472 - 4330298
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||    
T  4330472 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatccca 4330374  T
Q  110 -tgtacaaacagt-gaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtg-ttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||||||||| | | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  4330373 ctgtacaaacattgggggtgttactcactacacttttgatgctatagtgtttatcttcatcagaaaagtcattctc 4330298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15383124 - 15382955
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||    
T  15383124 ggtgttacgcttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgaca 15383026  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  ||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  15383025 ttgtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcatt 15382955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18422842 - 18422673
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  18422842 ggtgttacgcatataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtca 18422744  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||   | | || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18422743 ttgtacaaacggtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatt 18422673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 179
Target Start/End: Original strand, 19899781 - 19899923
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccatg-tacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||       
T  19899781 aaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgttactcgtt 19899880  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19899881 acatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatt 19899923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 42721226 - 42721061
Alignment:
Q  14 ttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgt 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||  | |||    
T  42721226 ttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgt 42721128  T
Q  113 acaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    |||||||||| |||||||||||| | | || | ||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  42721127 acaaacagtggggtgttactcactatattttttatgatatagggctaacttcaccaaaaaaatcatt 42721061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Original strand, 238498 - 238660
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  238498 ggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtca 238596  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  238597 ttgtacaaacagtg-gatgttactcacaacatttttaatactatagtgttaacttcaccaaaaaa 238660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 1547470 - 1547306
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||        |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  1547470 ggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaa-ttagattaagtgtatttttgttaatctgatga--------tactatgagaactgaacttttgatgcca 1547380  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     || ||||||||||  ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1547379 ctgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctc 1547306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 32267224 - 32267054
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca- 109  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||| | ||||||||||| ||     
T  32267224 gtgttacgcttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcat 32267126  T
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||    
T  32267125 tgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatattgttaacttcacaaaaaaagtcattct 32267054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 9903039 - 9903208
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||| ||    
T  9903039 ggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtca 9903137  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||| | |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  9903138 ctgtacaaacagcggggtgttactcactacagttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcatt 9903208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Original strand, 31621545 - 31621710
Alignment:
Q  17 cacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtaca 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||  |||||    
T  31621545 cacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatgccaccgtaca 31621643  T
Q  116 aacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    || || | |||| ||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  31621644 aatagcggggtgctactcaatacacctttgatgttatagtgttgacttcactagaaaagtcattctc 31621710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 51129050 - 51128894
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  51129050 ggtgttacacttataacaaggtatgataaaa-ttatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtca 51128952  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcac 166  Q
     ||||||||| |||  ||||||||||  ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  51128951 ttgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcac 51128894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 27267185 - 27267354
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||| |||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||    
T  27267185 ggtgttacactcaaaacaaggtagattaaa--ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgcca 27267282  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||| ||| || | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27267283 ctgtacaaacagtggggtgtcactcactacattttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctc 27267354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 47682479 - 47682650
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||    
T  47682479 ggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaa-ttagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgatacca 47682577  T
Q  110 -tgtacaaacagtgag-gtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||| ||||| | ||||||||||||||| || | |||   ||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  47682578 ctgtacaagcagtgggagtgttactcacaacattttttatg--ctagtgttaacttcaccaaaaaagtcactctc 47682650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30254614 - 30254444
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||    
T  30254614 ggtgttatgcttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtca 30254516  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
     |||||||||||||  || |||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||    
T  30254515 ttgtacaaacagtg-tgtattactcattacatttttgatgttatattgttaacttcaacaaaaaagtcattct 30254444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 8222319 - 8222166
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  8222319 ggtgttacgcttataacaaggtaggataaaa-tgagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgcca 8222221  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcac 166  Q
    | |||   || ||| |||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8222220 ttgta---acggtgtggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcac 8222166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Original strand, 33725585 - 33725759
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33725585 ggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 33725683  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctctt 184  Q
        | ||| |||| | || ||||||  |||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  33725684 ccaaagaaatagtgggctgctactcaatacacttttgatgatatagcgttgacttcactagaaaagtcattctctt 33725759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289684
Alignment:
Q  58 cttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacactt-------ctgatgt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||        | |||     
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttttattatttatga 21289717  T
Q  150 tatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21289716 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctc 21289684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 30326937 - 30327106
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |    
T  30326937 ggtgttacgcttataacaaggtaggataaaa-tgagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcta 30327035  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||| ||  ||| |||||||  ||| || ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||    
T  30327036 ttgtacaaacggttgggtattactcattacatttttgatgttatagtgttaaattcacaaaaaaagtcatt 30327106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 28769816 - 28769688
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||      
T  28769816 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccattgtacaaacggtg-ggtgttactcatt 28769718  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcac 166  Q
    ||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  28769717 acatttttgatgtcatagtgttaacttcac 28769688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37451476 - 37451308
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||    
T  37451476 ggtgttacacttataacaaggtcagataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtca 37451379  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||| ||  ||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  37451378 ttgtacaaacggtagggtgttacttattacatttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaagtcatt 37451308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 25160823 - 25160715
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25160823 ggtgttacacttataacaaggtaggataaaa-tgagattaagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 25160725  T
Q  110 -tgtacaaac 118  Q
     |||||||||    
T  25160724 ttgtacaaac 25160715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 27563898 - 27564046
Alignment:
Q  18 acttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaa 116  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||| ||||||||||| || | |||||    
T  27563898 acttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatgtcactatacaa 27563996  T
Q  117 acagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcac 166  Q
    ||||||  ||||||||||| | | || | | |||||||||||||||||||    
T  27563997 acagtggagtgttactcactatatttttaaagttatagtgttaacttcac 27564046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 37618894 - 37619052
Alignment:
Q  27 aaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatg--atactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtga 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| ||||||||||| || | |||||||||||     
T  37618894 aaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaaacagtgg 37618992  T
Q  124 ggtg--ttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    ||||  |||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  37618993 ggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattct 37619052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 46931575 - 46931446
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcc-atgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||  | ||||||||||| ||| |||||||      
T  46931575 aaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggtattactcatt 46931476  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcac 166  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  46931475 acatttttgatgttatagtgttaacttcac 46931446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23999511 - 23999367
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| || | |||||| |||| ||||||||||       
T  23999511 aaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcgtt 23999412  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    | | || | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23999411 atattttttatgttgtagtgttaacttcaccaaaaaaatcattct 23999367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 181
Target Start/End: Original strand, 27763323 - 27763465
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| || | |||||||  || |||||||||||      
T  27763323 aaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatgtcattctacaaactatg-ggtgttactcatt 27763421  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27763422 acatttttgatgttatagtgttaacttca-caaaaaaatcattct 27763465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 38759724 - 38759652
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgata 83  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  38759724 ggtgttacacttaaaataagatatgataaaa-ttaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgata 38759652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22170902 - 22170807
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatg 106  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| | || ||||||| |||||||||||||| |||   |||| |||||||||||    
T  22170902 ggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaa-ttagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgtagactgaacttttgatg 22170807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 54499253 - 54499425
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||    
T  54499253 ggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatagagactgaacttttgatgtca 54499352  T
Q  110 t--gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattc 180  Q
    |  |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54499353 ttagtacaaacggtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 54499425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23761266 - 23761095
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||    
T  23761266 ggtgttacacttaaaacaaggtag-ataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtca 23761169  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||    
T  23761168 ctatacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttacaagaatagtcattctc 23761095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 34948113 - 34948285
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  34948113 ggtgttgcactttaaacaagataggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgcca 34948211  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  34948212 ctttacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcgccagaaaagtcattctc 34948285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 29584216 - 29584384
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  29584216 ggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaa-ttagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgcca 29584314  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattc 180  Q
     |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29584315 ttgtacaaacagtgaggtgttact--caacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 29584384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27396809 - 27396639
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |    
T  27396809 tgttacacttaaaacaaggtagaataaaa-ttaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcatt 27396711  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27396710 gtacaaacagtagggtgttactcataacacttttaatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctc 27396639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 30002648 - 30002809
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||  | |||| ||||||||||| ||    
T  30002648 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatga--------tactaagaagactgaacttttgatgtca 30002738  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30002739 ctgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgctacagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 30002809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4598186 - 4598017
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||   ||||| ||||||||||||||    
T  4598186 ggtgttacacttaaaacaagc-aggataaaa-ttaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgcca 4598089  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4598088 ctgtacaaacagtggggtgttactcacaacactt-tgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattct 4598017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 25701075 - 25701242
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |    
T  25701075 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcact 25701173  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  25701174 gtacaaacagtagggtgttactcactacacttttgatgttataatgttaactttaccaaaaaagtcatt 25701242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37775862 - 37775695
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    ||||||||||||||    
T  37775862 ggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatac--taaggggggaacttttgatgcca 37775766  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| || | || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37775765 ctgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttaatattatagtgctaacttcaccaaaaaaatcatt 37775695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 35021051 - 35021220
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  35021051 ggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggacgaaacttttgacgcca 35021149  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     |||||||||||||  ||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  35021150 atgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcatt 35021220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 5047985 - 5048153
Alignment:
Q  14 ttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccat-gt 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||  ||| ||    
T  5047985 ttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgt 5048083  T
Q  113 acaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5048084 acaaacagtgtggtcctactcactacacttttgatgttatagagttgacttcaccagaaaaatcattctc 5048153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33341593 - 33341418
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33341593 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgcca 33341496  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacact----tctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||| |||||| ||| ||||| |    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33341495 ctgtacaaacagtggggtgttcctcgcaacaatcaattttgatgatatagtgttaatttcaccagaaaaatcattctc 33341418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32592288 - 32592119
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||    
T  32592288 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtca 32592190  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     | |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||| || |||| |||||    
T  32592189 ctatacaaacagtggagtgttactctcaacacttttgatactgtagtgttaacttcatcaaaaaagtcatt 32592119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 879564 - 879736
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  879564 ggtgttacgcttataacaaggtaggataaaa-ttagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtca 879662  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||||||||| ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  879663 ttgtacaaacaatgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgtttacttcaccaaaaaaattattctc 879736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 28003002 - 28003174
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||    
T  28003002 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtca 28003100  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||||||||||||  ||  |||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28003101 ctgtacaaacagtggagtactactgactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctc 28003174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 33816549 - 33816721
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  33816549 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatgcca 33816647  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
      ||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33816648 ccgtataaatagtgaggtgctactcactacacttttgatgctacaatgttgacttcaccagaaaaatcattctc 33816721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 55241121 - 55241292
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  55241121 ggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtattcttctta-tctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgcca 55241218  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  55241219 ctgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgataatatagtattaacttcactagaaaagtcattctc 55241292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 55477907 - 55478083
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  55477907 ggtgttacacttataacaagttaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 55478005  T
Q  110 -tgt----acaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||    ||||||||||  |||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55478006 ttgtacaaacaaacagtggagtgttactcgttacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctc 55478083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 7703703 - 7703540
Alignment:
Q  11 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccat 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||  ||||| ||||||||||| ||     
T  7703703 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatga--------tactatggggactgaacttttgatgtcac 7703613  T
Q  111 -gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7703612 cgtacaaacagtggggtgttactgacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctc 7703540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17167908 - 17167739
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||   || | ||||||||||| ||    
T  17167908 ggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaatgaacttttgatgtca 17167810  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  17167809 ttgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcatt 17167739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17173485 - 17173316
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||   || | ||||||||||| ||    
T  17173485 ggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagattgaacttttgatgtca 17173387  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  17173386 ttgtacaaacagtggggtgttactcacaacatttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcatt 17173316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 49376135 - 49375989
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||     
T  49376135 aaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactcacg 49376036  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaa-tcattctc 182  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49376035 acacttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaaagtcattctc 49375989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 50764898 - 50764755
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  50764898 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcaca 50764799  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  50764798 acacttttgatgt--tagtgttaacttcatcaaaaaagttattctc 50764755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 165
Target Start/End: Original strand, 19089486 - 19089624
Alignment:
Q  27 aaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgagg 125  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||    
T  19089486 aaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgggg 19089584  T
Q  126 tgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttca 165  Q
    |||||||||  ||| || |||| |||||||||||||||||    
T  19089585 tgttactcattacaattttgatattatagtgttaacttca 19089624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 38012047 - 38011877
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgccat- 110  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||| ||      
T  38012047 tgttacacttaaaacaaggtataataaaa-ttaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggggactgaacttttgatggcacc 38011949  T
Q  111 gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38011948 gtacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctc 38011877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 37287919 - 37287756
Alignment:
Q  13 gttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tg 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||        || ||| |||| | |||||||||||||| ||    
T  37287919 gttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatcttatga--------tattatgaggattgaacttttgatgccactg 37287828  T
Q  112 tacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaa-tcattctc 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  37287827 tacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaaagtcattctc 37287756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Original strand, 19440691 - 19440836
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| |||      
T  19440691 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatcatt 19440790  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  19440791 acatttttgatgttatagtgttaacatcaccaaaaaagtcattctc 19440836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 37663757 - 37663926
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  37663757 ggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtca 37663855  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  ||| || | ||||  |||||||||||||| || |||| |||||||    
T  37663856 ttgtacaaacagtggggtgttactcattacagttttaatgt--tagtgttaacttcatcaaaaaagtcattct 37663926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 47253935 - 47253772
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||        |||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  47253935 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttaaattaagtgtattcttgttaatctgatga--------tactatgaggactgaacttttgatgtca 47253845  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  47253844 ctgtataaacaatg-ggtgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctc 47253772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 39398104 - 39397942
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||         ||||||||||   | |||| ||||||||||| ||    
T  39398104 ggtgttacacttaaaataaggcaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaat---------tgatgatactgagaagactgaacttttgatgtca 39398015  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  39398014 ctgtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattct 39397942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Original strand, 46888173 - 46888336
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcc- 108  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | |||| |||  ||||| |||||||||||||     
T  46888173 ggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatgccg 46888271  T
Q  109 atgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  46888272 ctgtacaaatagtggggtattactcactacaattttgatgttatagtattaacttcatcagaaaa 46888336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25184308 - 25184136
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | |||||| |||| ||    
T  25184308 ggtgttacgcttataacaaggtaggataaaa-ttagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtca 25184210  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     ||||||||||||   ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  25184209 ttgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctc 25184136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 173
Target Start/End: Original strand, 36493708 - 36493867
Alignment:
Q  14 ttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgt 112  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || |||    
T  36493708 ttacacttaaaacaatgtatgataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgt 36493806  T
Q  113 acaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
    ||||||| || |||||||||||| | | || ||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  36493807 acaaacaatggggtgttactcactatatttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaa 36493867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6864230 - 6864058
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |    
T  6864230 ggtgttacgcttataacaaggtatgataaaa-ttaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgcta 6864132  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
     |||||||| |||  | ||||| |||  | | || ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  6864131 ttgtacaaaaagttggatgttattcattaaatttttgatgttatagtgataacttcaccaaaaaagtcattctc 6864058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 42199897 - 42199753
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| || | |||||| | || ||| |||||||      
T  42199897 aaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaataatggggtattactcatt 42199798  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42199797 acatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattct 42199753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9139440 - 9139315
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||| ||| ||    
T  9139440 ggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatggggattgaactttttatgtca 9139342  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcac 135  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9139341 ctgtacaaacggtggggtgttactcac 9139315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 135
Target Start/End: Original strand, 4934226 - 4934344
Alignment:
Q  18 acttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaa 116  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||    
T  4934226 acttaaaacaaggtagaataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaa 4934324  T
Q  117 acagt-gaggtgttactcac 135  Q
    ||| | | ||||||||||||    
T  4934325 acaatgggggtgttactcac 4934344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 32579637 - 32579467
Alignment:
Q  14 ttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgt 112  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |  | || ||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| ||  ||    
T  32579637 ttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatgaactgataatactatga-gactaaacttttgatggcaccgt 32579540  T
Q  113 ---acaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
       ||||||| || |||| |||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32579539 acaacaaacactggggtgctactcactgcacttttgatgttataatgttgacttcaccagaaaagtcattctc 32579467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 35025612 - 35025773
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||        |||||  |||||| ||||||||||| ||    
T  35025612 ggtgtgacacttaaaacaagataggataaaa-ttatattaaatgcagtcttgttaatctgatga--------tactacgaggactgaacttttgatgtca 35025702  T
Q  110 t-gtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
      ||| |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35025703 acgtataaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcatt 35025773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 1815496 - 1815413
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggact 94  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  1815496 ggtgttacccttaaaacaaggtaggataaaa-ttagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggact 1815413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 34361508 - 34361678
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||||| ||| ||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||| ||    
T  34361508 ggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaa-ttatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgagg-ctgaacttttaatgtca 34361605  T
Q  110 tg-tacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34361606 ttctacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattct 34361678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 50697437 - 50697268
Alignment:
Q  9 tggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcc 108  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||||||||| |    
T  50697437 tggtgttacgcttataacaaggtaggataaaa-ttatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttgatgtc 50697340  T
Q  109 a-tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    | ||||||||| ||  ||||||||||   | | || | ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  50697339 attgtacaaacggtagggtgttactcgttatattttttatgttatagtgtttacttcactaaaaaaatcatt 50697268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17272159 - 17272084
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta 86  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17272159 ggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa-ttagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatacta 17272084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Original strand, 32912596 - 32912767
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  || ||||||||||  ||    
T  32912596 ggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaa-ttatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgatatca 32912694  T
Q  110 tg-tacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    |  |||||| | |  |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  32912695 ttctacaaatactagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattct 32912767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3042814 - 3042637
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatg--------atactataaggactaaacttt 101  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||        ||||| ||| |||| || |||    
T  3042814 ggtgttacgcttataataaggtatgataaaa-ttatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatgatacattgatactctaatgactgaatttt 3042716  T
Q  102 tgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    ||||| || |||| |||| ||| ||| |||||||  ||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3042715 tgatgtcattgtataaacggtggggtattactcattacattttgtatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatt 3042637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4205211 - 4205142
Alignment:
Q  110 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4205211 tgtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcatt 4205142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17272077 - 17272036
Alignment:
Q  139 acttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattc 180  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17272077 acttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattc 17272036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 179
Target Start/End: Original strand, 7152236 - 7152291
Alignment:
Q  124 ggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  7152236 ggtgttactcactatacttttgatgttataatgttaactttaccagaaaagtcatt 7152291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 53124368 - 53124313
Alignment:
Q  124 ggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
    |||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53124368 ggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatt 53124313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 160
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  329 ggtgttacacttaaaataagataggataaaa-ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgcca 231  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||||| || | ||  || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  230 ttgtacaaacagtggagtgttactcacaacattttttatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcatt 160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 94373 - 94542
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  94373 ggtgttacacttgaaacaagctagaataaaa-ttaaattaagtgtagtcttgttaatctcatgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgcca 94471  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  94472 ctgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaacttcatcagaaaagtcatt 94542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Original strand, 408419 - 408559
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||    
T  408419 ggtgttacgcttataacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatttca 408516  T
Q  110 -tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgtta 151  Q
     | ||||||| || ||||||||||||  ||| || ||||||||    
T  408517 ttttacaaacggtaaggtgttactcattacatttttgatgtta 408559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12104 - 11933
Alignment:
Q  10 ggtgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca 109  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||    
T  12104 ggtgttacacttaaaacaagataggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatacca 12006  T
Q  110 -tg-tacaaacagt-gaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcatt 179  Q
     || |||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  12005 ctgatacaaacaatgggggtgttactcacaacacttttaatgttatggtgttaatttcaccagaaaagtcatt 11933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8055 - 7911
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||      
T  8055 aaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcatt 7956  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  7955 acaattttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattct 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 44125 - 43989
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||      
T  44125 aaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcatt 44026  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
    ||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  44025 acatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaa 43989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 173
Target Start/End: Original strand, 154662 - 154798
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||      
T  154662 aaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcatt 154761  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaa 173  Q
    ||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  154762 acatttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaa 154798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 181
Target Start/End: Original strand, 146033 - 146177
Alignment:
Q  38 aaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-tgtacaaacagtgaggtgttactcaca 136  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||| || | |||||| | || |||||||||||      
T  146033 aaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaataatggggtgttactcatt 146132  T
Q  137 acacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattct 181  Q
    ||| || | |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  146133 acattttttatgttataatgttaacttaaccaaaaaaatcattct 146177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 42439 - 42371
Alignment:
Q  114 caaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42439 caaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaattattctc 42371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 100882 - 100844
Alignment:
Q  144 tgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctc 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  100882 tgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaaatcattctc 100844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 267477 - 267331
Alignment:
Q  12 tgttacacttaaaataaggtaggataaaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactaaacttttgatgcca-t 110  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| || |    
T  267477 tgttacatttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattatagagactgaacttttgatgacact 267379  T
Q  111 gtac-aaacagtgaggtgttactcacaacacttctgatgttatagtgt 157  Q
    |||| |||||||  | |||||||||| | | || ||||| ||||||||    
T  267378 gtacaaaacagttggatgttactcactatatttttgatgctatagtgt 267331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University