View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7146_low_3 (Length: 716)

Name: NF7146_low_3
Description: NF7146
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7146_low_3
NF7146_low_3
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (14-697)||(109434-110117)
scaffold0029 (25-662)||(95636-96273)
scaffold0029 (25-697)||(112559-113231)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (14-697)||(18177700-18178383)
chr7 (16-697)||(11236844-11237525)
chr7 (16-697)||(15160688-15161369)
chr7 (14-697)||(8198586-8199269)
chr7 (14-697)||(10870953-10871636)
chr7 (14-697)||(44790980-44791663)
chr7 (16-697)||(13686021-13686703)
chr7 (16-697)||(8707563-8708244)
chr7 (16-697)||(18551389-18552070)
chr7 (16-697)||(14332355-14333036)
chr7 (14-697)||(11552731-11553414)
chr7 (14-697)||(12687459-12688142)
chr7 (16-697)||(16947-17628)
chr7 (14-697)||(14954578-14955261)
chr7 (136-696)||(23516520-23517080)
chr7 (22-697)||(15154294-15154964)
chr7 (16-476)||(9596236-9596696)
chr7 (25-662)||(15624545-15625182)
chr7 (25-697)||(12206418-12207090)
chr7 (25-697)||(15102221-15102891)
chr7 (145-697)||(15203837-15204389)
chr7 (25-506)||(11771881-11772362)
chr7 (25-697)||(14263862-14264534)
chr7 (25-697)||(19147170-19147842)
chr7 (25-697)||(20746569-20747241)
chr7 (25-686)||(21661933-21662591)
chr7 (25-697)||(11388046-11388717)
chr7 (25-365)||(14039986-14040326)
chr7 (25-365)||(14350016-14350356)
chr7 (25-697)||(16071912-16072584)
chr7 (25-697)||(16950089-16950761)
chr7 (25-697)||(6413470-6414142)
chr7 (26-697)||(18053572-18054243)
chr7 (25-697)||(14285994-14286666)
chr7 (28-697)||(8211749-8212418)
chr7 (25-697)||(13665512-13666168)
chr7 (28-697)||(11305884-11306553)
chr7 (25-697)||(13021316-13021988)
chr7 (25-693)||(1025-1693)
chr7 (26-697)||(14129832-14130503)
chr7 (28-697)||(49152260-49152929)
chr7 (26-697)||(14433650-14434321)
chr7 (28-601)||(23505491-23506064)
chr7 (181-551)||(35964646-35965016)
chr7 (25-697)||(12455662-12456333)
chr7 (82-601)||(23199418-23199937)
chr7 (370-697)||(14037765-14038092)
chr7 (370-697)||(14347795-14348122)
chr7 (28-601)||(26118226-26118799)
chr7 (26-500)||(15340587-15341061)
chr7 (14-140)||(23203242-23203368)
chr7 (14-140)||(23509369-23509495)
chr7 (137-495)||(12456940-12457298)
chr7 (37-559)||(14936443-14936965)
chr7 (28-365)||(13968289-13968626)
chr7 (37-572)||(4440011-4440546)
chr7 (37-572)||(7823983-7824518)
chr7 (37-572)||(27107426-27107961)
chr7 (37-559)||(15364036-15364558)
chr7 (433-689)||(26288063-26288318)
chr7 (282-524)||(12368473-12368715)
chr7 (37-572)||(21674185-21674720)
chr7 (250-469)||(12193742-12193961)
chr7 (79-368)||(45146842-45147131)
chr7 (578-697)||(15340455-15340574)
chr7 (37-158)||(17924148-17924269)
chr7 (44-152)||(23641951-23642059)
chr7 (283-566)||(41044-41327)
chr7 (63-185)||(15171642-15171764)
chr7 (416-557)||(13378796-13378937)
chr7 (29-108)||(40790-40869)
chr7 (61-119)||(17144936-17144994)
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (16-697)||(16350293-16350974)
chr1 (16-697)||(51333187-51333868)
chr1 (16-697)||(19106351-19107032)
chr1 (16-697)||(21830287-21830968)
chr1 (16-697)||(33390723-33391404)
chr1 (16-697)||(21836934-21837615)
chr1 (55-697)||(41354202-41354844)
chr1 (16-697)||(17044709-17045390)
chr1 (16-697)||(16078350-16079008)
chr1 (37-697)||(50619959-50620619)
chr1 (25-697)||(16369281-16369953)
chr1 (143-697)||(20136762-20137316)
chr1 (153-697)||(20249834-20250378)
chr1 (25-697)||(19760569-19761241)
chr1 (273-697)||(21747519-21747942)
chr1 (28-697)||(19854298-19854966)
chr1 (29-697)||(20939770-20940438)
chr1 (25-662)||(20835591-20836231)
chr1 (37-697)||(20856476-20857136)
chr1 (23-697)||(22432817-22433491)
chr1 (28-697)||(37677063-37677733)
chr1 (25-266)||(21749356-21749597)
chr1 (28-697)||(20294396-20295065)
chr1 (95-599)||(41307907-41308411)
chr1 (25-245)||(22361947-22362167)
chr1 (391-697)||(19664945-19665251)
chr1 (25-296)||(24099306-24099577)
chr1 (25-329)||(19662844-19663143)
chr1 (280-697)||(31550139-31550556)
chr1 (508-697)||(50612602-50612791)
chr1 (28-245)||(31539703-31539920)
chr1 (25-150)||(20139361-20139486)
chr1 (444-697)||(20244184-20244437)
chr1 (37-572)||(20831107-20831642)
chr1 (583-697)||(21163264-21163378)
chr1 (433-601)||(11382674-11382842)
chr1 (433-697)||(20075170-20075434)
chr1 (37-107)||(20250376-20250446)
chr1 (37-572)||(20914319-20914854)
chr1 (250-520)||(22135486-22135756)
chr1 (523-697)||(20395194-20395368)
chr1 (406-559)||(21202371-21202524)
chr1 (37-186)||(22135272-22135421)
chr1 (17-62)||(41353357-41353402)
chr1 (398-572)||(46518830-46519004)
chr1 (70-179)||(20184683-20184792)
[»] chr6 (83 HSPs)
chr6 (14-697)||(27187269-27187952)
chr6 (14-697)||(27261288-27261971)
chr6 (16-697)||(2874570-2875251)
chr6 (14-697)||(28262962-28263645)
chr6 (14-697)||(28341711-28342394)
chr6 (14-697)||(28292137-28292820)
chr6 (16-697)||(25112385-25113066)
chr6 (16-697)||(24312935-24313616)
chr6 (16-697)||(29591687-29592368)
chr6 (14-697)||(1542849-1543532)
chr6 (16-697)||(16626484-16627165)
chr6 (16-697)||(5838986-5839667)
chr6 (19-697)||(19864520-19865198)
chr6 (28-697)||(25609640-25610309)
chr6 (25-697)||(18407718-18408391)
chr6 (25-697)||(27331209-27331881)
chr6 (25-697)||(27391949-27392621)
chr6 (37-697)||(22078478-22079136)
chr6 (25-697)||(22762231-22762903)
chr6 (25-697)||(16927416-16928088)
chr6 (37-697)||(16963155-16963815)
chr6 (25-697)||(23078302-23078974)
chr6 (230-697)||(12497859-12498326)
chr6 (230-697)||(12510575-12511042)
chr6 (21-470)||(22433929-22434378)
chr6 (230-697)||(12505188-12505655)
chr6 (271-697)||(25765312-25765737)
chr6 (25-697)||(25768024-25768696)
chr6 (37-324)||(17032589-17032876)
chr6 (25-697)||(21471434-21472106)
chr6 (28-662)||(15459204-15459838)
chr6 (25-651)||(17415365-17415991)
chr6 (25-697)||(19879131-19879803)
chr6 (25-638)||(14381243-14381856)
chr6 (25-697)||(21563908-21564580)
chr6 (25-697)||(22796408-22797080)
chr6 (25-662)||(34645362-34645999)
chr6 (21-680)||(11280277-11280936)
chr6 (26-697)||(27560394-27561065)
chr6 (90-587)||(1640715-1641212)
chr6 (25-697)||(10468625-10469297)
chr6 (26-601)||(28282590-28283165)
chr6 (25-662)||(18794558-18795195)
chr6 (28-697)||(24364245-24364914)
chr6 (212-697)||(8766111-8766596)
chr6 (25-437)||(19453513-19453925)
chr6 (440-697)||(21833172-21833429)
chr6 (510-697)||(17032395-17032582)
chr6 (310-697)||(18197608-18197995)
chr6 (25-352)||(5296982-5297308)
chr6 (26-347)||(27559765-27560086)
chr6 (433-697)||(14131363-14131627)
chr6 (211-599)||(18800873-18801261)
chr6 (439-697)||(25750642-25750900)
chr6 (331-680)||(11287680-11288029)
chr6 (25-241)||(15896383-15896599)
chr6 (25-244)||(21569767-21569986)
chr6 (424-524)||(11291818-11291918)
chr6 (37-572)||(16382161-16382696)
chr6 (16-131)||(21836964-21837079)
chr6 (25-178)||(8762709-8762862)
chr6 (25-116)||(20637077-20637168)
chr6 (25-131)||(18197504-18197610)
chr6 (37-572)||(16098008-16098543)
chr6 (37-572)||(23996206-23996741)
chr6 (37-572)||(25742876-25743410)
chr6 (250-572)||(15078365-15078687)
chr6 (603-697)||(22433830-22433924)
chr6 (452-568)||(25750908-25751024)
chr6 (37-572)||(18837696-18838231)
chr6 (250-559)||(21412939-21413248)
chr6 (251-559)||(1648786-1649094)
chr6 (37-497)||(18571684-18572144)
chr6 (21-87)||(22442710-22442776)
chr6 (252-557)||(25655456-25655760)
chr6 (268-497)||(16233242-16233471)
chr6 (609-697)||(18787721-18787809)
chr6 (55-140)||(23027522-23027607)
chr6 (619-695)||(1640634-1640710)
chr6 (250-329)||(1652274-1652353)
chr6 (37-158)||(21927577-21927698)
chr6 (37-157)||(1648602-1648722)
chr6 (79-227)||(14625068-14625216)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (14-697)||(8386381-8387064)
chr4 (16-697)||(14303340-14304020)
chr4 (16-697)||(18297174-18297855)
chr4 (14-697)||(29038764-29039447)
chr4 (18-697)||(19778157-19778836)
chr4 (16-697)||(40473009-40473690)
chr4 (14-697)||(12476569-12477252)
chr4 (16-697)||(27711305-27711986)
chr4 (14-697)||(12523645-12524328)
chr4 (16-697)||(23955716-23956397)
chr4 (16-697)||(8052985-8053666)
chr4 (14-697)||(14680536-14681219)
chr4 (123-697)||(14266368-14266942)
chr4 (19-697)||(16251810-16252488)
chr4 (25-697)||(16354816-16355488)
chr4 (16-697)||(18226808-18227489)
chr4 (22-697)||(7090402-7091076)
chr4 (25-697)||(14850737-14851409)
chr4 (22-527)||(1639793-1640298)
chr4 (19-393)||(15147249-15147623)
chr4 (203-697)||(14159461-14159955)
chr4 (25-697)||(15002995-15003667)
chr4 (220-697)||(14652277-14652754)
chr4 (25-506)||(8706078-8706559)
chr4 (25-697)||(1648908-1649580)
chr4 (25-697)||(15245893-15246565)
chr4 (25-526)||(15414657-15415158)
chr4 (25-599)||(15358721-15359295)
chr4 (28-697)||(3264428-3265097)
chr4 (25-697)||(33222887-33223564)
chr4 (28-697)||(11206865-11207534)
chr4 (388-697)||(15149740-15150049)
chr4 (472-697)||(15364355-15364580)
chr4 (25-590)||(27900462-27901027)
chr4 (25-476)||(15077825-15078276)
chr4 (121-697)||(16145881-16146459)
chr4 (28-697)||(29453171-29453840)
chr4 (217-697)||(15070382-15070862)
chr4 (25-697)||(20890952-20891623)
chr4 (28-697)||(44661500-44662169)
chr4 (25-215)||(14691353-14691543)
chr4 (211-697)||(51605998-51606484)
chr4 (368-531)||(16676417-16676580)
chr4 (25-166)||(14159970-14160111)
chr4 (79-497)||(13247814-13248232)
chr4 (25-176)||(15319641-15319792)
chr4 (37-572)||(14997410-14997945)
chr4 (37-572)||(9290929-9291464)
chr4 (546-697)||(14927151-14927302)
chr4 (250-572)||(15293013-15293335)
chr4 (250-572)||(55375214-55375536)
chr4 (433-590)||(16752669-16752826)
chr4 (466-697)||(42702872-42703103)
chr4 (277-559)||(12132293-12132574)
chr4 (79-499)||(12342548-12342968)
chr4 (537-679)||(18164332-18164474)
chr4 (647-697)||(18607823-18607873)
chr4 (416-572)||(16445234-16445390)
chr4 (28-168)||(18549694-18549834)
chr4 (629-697)||(15415214-15415282)
chr4 (125-164)||(15423974-15424013)
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (14-697)||(15589251-15589934)
chr3 (14-697)||(20061913-20062596)
chr3 (25-697)||(53384888-53385560)
chr3 (14-697)||(10005188-10005871)
chr3 (14-697)||(16635361-16636044)
chr3 (14-697)||(43162685-43163368)
chr3 (14-697)||(10905798-10906481)
chr3 (14-697)||(48425035-48425718)
chr3 (14-697)||(16756444-16757127)
chr3 (16-697)||(15348106-15348787)
chr3 (16-697)||(15724795-15725475)
chr3 (16-697)||(13252278-13252959)
chr3 (16-697)||(15402371-15403052)
chr3 (16-697)||(26792260-26792941)
chr3 (16-697)||(16412143-16412824)
chr3 (14-697)||(6600335-6601007)
chr3 (16-697)||(5424791-5425471)
chr3 (16-697)||(15338857-15339538)
chr3 (16-697)||(12497836-12498517)
chr3 (16-697)||(14876360-14877041)
chr3 (16-697)||(16806787-16807468)
chr3 (19-697)||(16371001-16371679)
chr3 (25-697)||(17489438-17490110)
chr3 (16-697)||(16691748-16692433)
chr3 (25-697)||(16492051-16492723)
chr3 (25-697)||(9522307-9522979)
chr3 (25-697)||(15208479-15209151)
chr3 (25-697)||(15247735-15248407)
chr3 (25-697)||(15227247-15227919)
chr3 (25-662)||(13971979-13972616)
chr3 (25-697)||(13322511-13323183)
chr3 (19-326)||(11564545-11564852)
chr3 (25-697)||(15952827-15953499)
chr3 (25-697)||(14086271-14086943)
chr3 (25-305)||(14126464-14126744)
chr3 (33-542)||(15015634-15016131)
chr3 (35-697)||(18134215-18134877)
chr3 (25-697)||(12360401-12361073)
chr3 (26-697)||(8758942-8759613)
chr3 (26-697)||(41177120-41177791)
chr3 (28-697)||(13941622-13942291)
chr3 (25-697)||(11303632-11304304)
chr3 (28-662)||(10419907-10420541)
chr3 (25-662)||(12850138-12850775)
chr3 (26-601)||(44776941-44777516)
chr3 (26-601)||(16836370-16836945)
chr3 (19-264)||(15061777-15062022)
chr3 (28-697)||(10383567-10384235)
chr3 (28-697)||(47123542-47124211)
chr3 (124-697)||(11960992-11961565)
chr3 (26-601)||(16380788-16381362)
chr3 (25-697)||(16329520-16330190)
chr3 (25-362)||(17492563-17492900)
chr3 (25-335)||(14573889-14574199)
chr3 (31-368)||(4678365-4678702)
chr3 (28-368)||(28754245-28754585)
chr3 (133-404)||(13001800-13002070)
chr3 (433-695)||(14571448-14571710)
chr3 (121-362)||(26008948-26009189)
chr3 (37-572)||(8274281-8274816)
chr3 (25-179)||(16828061-16828215)
chr3 (37-572)||(16742585-16743120)
chr3 (38-572)||(15576473-15577007)
chr3 (25-245)||(16338371-16338591)
chr3 (44-559)||(18748401-18748916)
chr3 (268-524)||(17192865-17193121)
chr3 (250-572)||(13975141-13975462)
chr3 (250-422)||(14183007-14183179)
chr3 (37-356)||(6152733-6153052)
chr3 (252-499)||(6712506-6712753)
chr3 (610-697)||(31689067-31689154)
chr3 (610-697)||(31945070-31945157)
chr3 (37-207)||(13967222-13967392)
chr3 (70-164)||(17193224-17193318)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (16-697)||(22332691-22333372)
chr5 (16-697)||(27668294-27668975)
chr5 (16-697)||(14999543-15000224)
chr5 (14-697)||(34566395-34567078)
chr5 (16-697)||(27685204-27685885)
chr5 (16-695)||(37291300-37291979)
chr5 (16-697)||(19769861-19770542)
chr5 (16-697)||(40708681-40709362)
chr5 (14-697)||(16356403-16357086)
chr5 (14-697)||(27518308-27518991)
chr5 (37-697)||(29475898-29476558)
chr5 (16-697)||(22134569-22135250)
chr5 (16-697)||(41770743-41771424)
chr5 (16-697)||(27610255-27610936)
chr5 (16-697)||(22348326-22349005)
chr5 (19-697)||(23573643-23574321)
chr5 (16-697)||(18775678-18776352)
chr5 (37-696)||(23516443-23517102)
chr5 (44-697)||(20798661-20799314)
chr5 (57-697)||(23440126-23440766)
chr5 (28-697)||(25423090-25423759)
chr5 (25-655)||(21497850-21498479)
chr5 (155-697)||(21984248-21984790)
chr5 (25-697)||(20467909-20468581)
chr5 (25-697)||(26738540-26739190)
chr5 (25-697)||(23471130-23471802)
chr5 (25-522)||(21339099-21339596)
chr5 (28-697)||(24749370-24750039)
chr5 (25-697)||(22235733-22236405)
chr5 (25-697)||(21563786-21564451)
chr5 (25-697)||(21890572-21891244)
chr5 (25-697)||(23079902-23080574)
chr5 (25-697)||(22381082-22381754)
chr5 (61-697)||(22461835-22462471)
chr5 (25-662)||(28923581-28924218)
chr5 (25-662)||(20821371-20822008)
chr5 (28-697)||(22502562-22503231)
chr5 (25-662)||(28894755-28895392)
chr5 (28-697)||(14886807-14887476)
chr5 (37-662)||(20773678-20774302)
chr5 (26-601)||(17269148-17269722)
chr5 (28-697)||(25847958-25848627)
chr5 (28-697)||(20342165-20342834)
chr5 (52-697)||(37545336-37545982)
chr5 (28-697)||(24798213-24798882)
chr5 (135-697)||(21404737-21405285)
chr5 (259-697)||(24735658-24736096)
chr5 (25-467)||(21831574-21831998)
chr5 (103-334)||(919-1150)
chr5 (391-697)||(23442472-23442778)
chr5 (28-263)||(24716342-24716577)
chr5 (25-316)||(28916226-28916517)
chr5 (439-697)||(24737012-24737270)
chr5 (493-697)||(20573422-20573626)
chr5 (28-257)||(24620111-24620340)
chr5 (520-697)||(21343666-21343843)
chr5 (25-257)||(21496481-21496713)
chr5 (37-572)||(21937013-21937548)
chr5 (25-139)||(21407597-21407711)
chr5 (37-572)||(24581219-24581753)
chr5 (37-572)||(27011092-27011627)
chr5 (250-572)||(11210732-11211054)
chr5 (469-697)||(21662297-21662524)
chr5 (469-697)||(21665758-21665985)
chr5 (37-185)||(25244175-25244323)
chr5 (37-185)||(25308327-25308475)
chr5 (70-497)||(23503526-23503952)
chr5 (268-347)||(21229229-21229308)
chr5 (235-305)||(21680429-21680499)
chr5 (124-185)||(16065604-16065665)
[»] chr2 (62 HSPs)
chr2 (14-697)||(16998600-16999283)
chr2 (14-697)||(16981752-16982435)
chr2 (14-697)||(17063317-17064000)
chr2 (14-697)||(9609736-9610419)
chr2 (16-697)||(24261970-24262651)
chr2 (14-697)||(10868450-10869133)
chr2 (14-697)||(27217616-27218299)
chr2 (16-697)||(44385731-44386412)
chr2 (16-697)||(22325018-22325699)
chr2 (14-697)||(17066978-17067658)
chr2 (16-697)||(24709633-24710314)
chr2 (16-697)||(27370869-27371550)
chr2 (14-697)||(21145201-21145873)
chr2 (19-697)||(24675089-24675767)
chr2 (25-697)||(23188608-23189279)
chr2 (19-697)||(24707647-24708325)
chr2 (19-697)||(21325431-21326109)
chr2 (179-697)||(16924860-16925378)
chr2 (178-697)||(24878319-24878838)
chr2 (19-697)||(22756630-22757306)
chr2 (28-697)||(23063677-23064346)
chr2 (16-402)||(41608547-41608933)
chr2 (44-639)||(24825472-24826067)
chr2 (25-697)||(30211088-30211760)
chr2 (25-693)||(45529121-45529783)
chr2 (25-697)||(27365250-27365922)
chr2 (25-697)||(23293558-23294230)
chr2 (25-697)||(23276376-23277048)
chr2 (136-697)||(23087050-23087611)
chr2 (26-697)||(27787341-27788012)
chr2 (37-697)||(11358057-11358717)
chr2 (26-601)||(12574049-12574624)
chr2 (28-697)||(20832585-20833254)
chr2 (28-697)||(31830258-31830927)
chr2 (28-697)||(1063351-1064020)
chr2 (25-362)||(19652223-19652557)
chr2 (424-697)||(23138637-23138910)
chr2 (424-697)||(23550427-23550700)
chr2 (484-697)||(27377101-27377314)
chr2 (14-176)||(16923010-16923172)
chr2 (14-178)||(16925479-16925643)
chr2 (16-171)||(20442675-20442830)
chr2 (16-183)||(24876911-24877078)
chr2 (25-322)||(24948564-24948861)
chr2 (557-697)||(41609047-41609187)
chr2 (28-329)||(20828227-20828528)
chr2 (37-558)||(22276018-22276538)
chr2 (28-206)||(21125331-21125509)
chr2 (457-696)||(24653946-24654185)
chr2 (25-113)||(23107901-23107989)
chr2 (92-520)||(23817291-23817719)
chr2 (25-140)||(23110892-23111007)
chr2 (25-179)||(24641860-24642014)
chr2 (528-697)||(24944967-24945136)
chr2 (37-559)||(24569851-24570373)
chr2 (250-572)||(12640315-12640637)
chr2 (37-572)||(24831370-24831905)
chr2 (37-470)||(25128474-25128907)
chr2 (37-524)||(22761752-22762239)
chr2 (416-470)||(27368394-27368448)
chr2 (636-697)||(24833355-24833416)
chr2 (250-326)||(23890753-23890829)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (16-697)||(620-1301)
scaffold0044 (16-697)||(14360-15041)
[»] chr8 (69 HSPs)
chr8 (16-697)||(19112725-19113406)
chr8 (18-697)||(17674090-17674769)
chr8 (16-697)||(22120239-22120920)
chr8 (55-697)||(19484974-19485616)
chr8 (66-697)||(20017865-20018496)
chr8 (16-697)||(30313209-30313890)
chr8 (35-697)||(15533415-15534077)
chr8 (16-697)||(32600179-32600860)
chr8 (37-697)||(22133127-22133787)
chr8 (37-694)||(16408131-16408788)
chr8 (16-697)||(22046408-22047089)
chr8 (16-697)||(19978002-19978683)
chr8 (37-697)||(22164278-22164937)
chr8 (19-689)||(21166606-21167275)
chr8 (25-697)||(23650076-23650748)
chr8 (25-697)||(21921809-21922481)
chr8 (25-697)||(21250977-21251648)
chr8 (25-697)||(21788433-21789104)
chr8 (25-697)||(21393939-21394611)
chr8 (16-456)||(18856853-18857293)
chr8 (25-697)||(22987236-22987903)
chr8 (16-429)||(22040162-22040575)
chr8 (25-577)||(22377528-22378079)
chr8 (25-577)||(22383703-22384254)
chr8 (25-694)||(20396199-20396868)
chr8 (27-494)||(23949158-23949624)
chr8 (37-697)||(20388134-20388794)
chr8 (25-697)||(1266274-1266945)
chr8 (37-695)||(19851448-19852106)
chr8 (37-695)||(19857484-19858142)
chr8 (25-697)||(23654962-23655634)
chr8 (25-697)||(31416548-31417220)
chr8 (25-697)||(22061507-22062179)
chr8 (25-697)||(20009974-20010646)
chr8 (25-697)||(21840452-21841124)
chr8 (25-697)||(29303500-29304172)
chr8 (26-697)||(31570917-31571588)
chr8 (28-697)||(14565177-14565846)
chr8 (28-697)||(6679146-6679815)
chr8 (26-587)||(22051008-22051569)
chr8 (28-697)||(803750-804419)
chr8 (28-697)||(6603693-6604362)
chr8 (28-697)||(12304793-12305462)
chr8 (25-362)||(20975725-20976062)
chr8 (425-697)||(22032067-22032339)
chr8 (337-698)||(21681856-21682217)
chr8 (319-697)||(20007885-20008263)
chr8 (28-365)||(16271301-16271638)
chr8 (346-697)||(21324804-21325156)
chr8 (459-697)||(23948924-23949162)
chr8 (493-697)||(15441216-15441420)
chr8 (25-301)||(22371371-22371647)
chr8 (28-245)||(27355035-27355252)
chr8 (37-572)||(16877181-16877716)
chr8 (37-572)||(21196588-21197123)
chr8 (460-697)||(16265127-16265364)
chr8 (16-143)||(22129005-22129132)
chr8 (37-559)||(22315364-22315886)
chr8 (37-572)||(21850423-21850958)
chr8 (253-572)||(20652635-20652954)
chr8 (37-572)||(22982596-22983128)
chr8 (457-697)||(28982392-28982632)
chr8 (457-697)||(28987612-28987852)
chr8 (37-368)||(23157098-23157428)
chr8 (522-697)||(27347261-27347436)
chr8 (17-62)||(19484130-19484175)
chr8 (37-186)||(23900822-23900971)
chr8 (23-149)||(19863639-19863765)
chr8 (23-149)||(19868276-19868402)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (14-697)||(43154-43837)
scaffold0028 (16-697)||(8485-9155)
scaffold0028 (16-403)||(15241-15617)
scaffold0028 (25-662)||(50148-50785)
scaffold0028 (400-531)||(13832-13963)
scaffold0028 (44-572)||(106226-106754)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (16-697)||(6937-7620)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (16-697)||(414-1095)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (16-697)||(7377-8047)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (16-697)||(65405-66086)
scaffold0042 (37-478)||(39466-39906)
scaffold0042 (528-697)||(39926-40095)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (16-697)||(33198-33879)
scaffold0109 (16-697)||(8596-9277)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (16-697)||(4030-4711)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (19-697)||(278458-279136)
scaffold0005 (375-697)||(308659-308981)
scaffold0005 (220-697)||(164538-165015)
scaffold0005 (26-697)||(260308-260979)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (16-575)||(7519-8078)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (16-633)||(7854-8471)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (25-697)||(6372-7044)
scaffold0403 (30-335)||(3153-3458)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (19-697)||(63659-64337)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (20-697)||(6014-6691)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (25-697)||(6023-6695)
scaffold0120 (25-697)||(1158-1830)
scaffold0120 (311-572)||(22819-23080)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (16-632)||(21932-22548)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (19-697)||(451-1128)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (23-697)||(676-1350)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (25-697)||(14039-14711)
scaffold0106 (16-479)||(17660-18122)
scaffold0106 (25-697)||(31410-32082)
scaffold0106 (25-93)||(18489-18557)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (25-689)||(5229-5893)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (25-697)||(9343-10015)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (25-697)||(328-999)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (25-697)||(229043-229715)
scaffold0012 (25-697)||(219051-219723)
scaffold0012 (61-572)||(32667-33176)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (19-697)||(180217-180877)
scaffold0020 (25-303)||(101186-101464)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (25-684)||(49506-50165)
scaffold0081 (19-178)||(19121-19280)
scaffold0081 (19-119)||(34604-34704)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (25-697)||(14713-15385)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (16-446)||(12738-13168)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (25-697)||(32387-33058)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (25-697)||(25353-26025)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (25-697)||(14877-15549)
scaffold0040 (25-257)||(113121-113353)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (25-697)||(112021-112693)
scaffold0004 (25-697)||(203102-203774)
scaffold0004 (25-697)||(117568-118240)
scaffold0004 (25-697)||(322704-323376)
scaffold0004 (25-697)||(385819-386491)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (25-697)||(26167-26839)
scaffold0011 (25-697)||(195338-196008)
scaffold0011 (29-697)||(148570-149238)
scaffold0011 (528-697)||(68577-68746)
scaffold0011 (250-572)||(121809-122131)
scaffold0011 (250-470)||(180151-180371)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (25-697)||(908-1580)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (37-697)||(1005-1659)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (29-697)||(4032-4699)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (25-697)||(3140-3812)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (103-697)||(126911-127505)
scaffold0022 (25-216)||(80128-80319)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (25-697)||(116539-117211)
scaffold0037 (100-572)||(98140-98612)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (25-620)||(9047-9642)
scaffold0507 (409-572)||(351-514)
scaffold0507 (253-368)||(216-331)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (25-520)||(15832-16327)
scaffold0333 (360-697)||(15493-15829)
[»] scaffold0894 (2 HSPs)
scaffold0894 (148-697)||(1139-1688)
scaffold0894 (25-157)||(2914-3046)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (239-596)||(628-985)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (25-697)||(16050-16722)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (22-697)||(24702-25377)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (47-696)||(12633-13282)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (25-697)||(5225-5896)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (22-498)||(4085-4561)
scaffold0023 (25-313)||(130532-130820)
scaffold0023 (25-479)||(58972-59426)
scaffold0023 (19-175)||(29008-29163)
scaffold0023 (211-313)||(134626-134728)
scaffold0023 (533-683)||(4567-4717)
scaffold0023 (619-697)||(36974-37052)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (37-410)||(6336-6709)
scaffold0358 (637-697)||(6273-6333)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (224-697)||(2-475)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (25-697)||(3875-4547)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (25-383)||(10-368)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (76-697)||(10425-11045)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (28-697)||(41970-42639)
scaffold0010 (25-697)||(47033-47705)
scaffold0010 (29-281)||(2337-2589)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (25-697)||(19983-20655)
scaffold0298 (25-697)||(12995-13667)
scaffold0298 (25-697)||(16765-17437)
[»] scaffold0001 (8 HSPs)
scaffold0001 (25-697)||(90566-91238)
scaffold0001 (241-696)||(448060-448515)
scaffold0001 (25-257)||(390834-391066)
scaffold0001 (434-697)||(162113-162376)
scaffold0001 (82-335)||(114542-114795)
scaffold0001 (529-599)||(175361-175431)
scaffold0001 (25-110)||(89888-89973)
scaffold0001 (428-572)||(78666-78810)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (55-697)||(27519-28161)
scaffold0139 (29-697)||(787-1454)
scaffold0139 (55-179)||(34290-34414)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (25-410)||(1552-1937)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (25-697)||(9798-10465)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (25-697)||(13535-14207)
scaffold0034 (25-662)||(4587-5224)
scaffold0034 (25-170)||(67897-68042)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (25-697)||(6183-6856)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (25-697)||(27226-27897)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (25-697)||(47124-47796)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (25-697)||(33311-33983)
scaffold0076 (37-572)||(40383-40918)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (25-697)||(51497-52169)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (25-687)||(4760-5422)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (25-697)||(6670-7342)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (25-697)||(48841-49513)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (25-697)||(248613-249285)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (145-394)||(46531-46780)
scaffold0007 (35-697)||(86154-86810)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (25-697)||(26142-26814)
scaffold0192 (25-359)||(26862-27196)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (25-697)||(60848-61519)
scaffold0067 (25-697)||(67236-67907)
scaffold0067 (25-697)||(51814-52485)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (90-697)||(9782-10389)
scaffold0483 (25-131)||(12060-12166)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (234-697)||(16987-17450)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (25-696)||(42784-43455)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (25-697)||(28402-29075)
scaffold0064 (25-697)||(40393-41066)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (25-374)||(7963-8311)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (25-697)||(18171-18843)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (25-697)||(39739-40410)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (25-697)||(19120-19792)
scaffold0058 (433-653)||(58448-58668)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (19-317)||(197106-197404)
[»] scaffold0235 (4 HSPs)
scaffold0235 (25-697)||(21305-21977)
scaffold0235 (250-497)||(26006-26253)
scaffold0235 (79-215)||(26288-26424)
scaffold0235 (25-98)||(11091-11164)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (25-697)||(528-1200)
scaffold0104 (25-92)||(12582-12649)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (25-697)||(98-770)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (25-697)||(2751-3423)
scaffold0035 (28-149)||(12833-12954)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (38-697)||(37202-37861)
scaffold0026 (321-599)||(38103-38382)
scaffold0026 (439-599)||(27385-27545)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (25-697)||(6872-7542)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (25-697)||(48668-49339)
scaffold0053 (85-697)||(57511-58122)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (25-697)||(38-705)
scaffold0124 (25-697)||(10888-11560)
scaffold0124 (37-572)||(7456-7991)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (25-697)||(43505-44177)
scaffold0114 (25-697)||(44517-45189)
scaffold0114 (82-697)||(20122-20737)
scaffold0114 (532-697)||(36055-36220)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (25-583)||(1908-2466)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (19-257)||(4727-4965)
scaffold0761 (37-572)||(32-567)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (301-662)||(16375-16736)
scaffold0138 (25-98)||(8721-8794)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (37-662)||(18884-19509)
scaffold0090 (37-599)||(23109-23671)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (28-697)||(16350-17019)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (25-601)||(10865-11441)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (37-697)||(25511-26171)
scaffold0113 (433-697)||(16676-16940)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (25-566)||(1-541)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (25-601)||(5309-5885)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (134-697)||(13994-14557)
scaffold0203 (553-697)||(9039-9183)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (26-697)||(12420-13087)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (19-272)||(3442-3695)
scaffold0375 (366-482)||(3694-3810)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (25-305)||(18839-19119)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (25-697)||(26261-26933)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (233-697)||(5756-6219)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (25-265)||(19636-19876)
scaffold0324 (512-697)||(16957-17142)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (101-367)||(1-267)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (28-479)||(2992-3443)
scaffold0222 (610-697)||(3487-3574)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (25-482)||(5086-5543)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (337-697)||(206-566)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (25-207)||(25464-25646)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (37-542)||(880-1385)
[»] scaffold1710 (2 HSPs)
scaffold1710 (63-500)||(86-523)
scaffold1710 (427-572)||(946-1091)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (433-697)||(27967-28231)
scaffold0198 (19-98)||(24097-24176)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (439-697)||(30-288)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (25-254)||(11302-11531)
scaffold0149 (25-245)||(6871-7091)
scaffold0149 (518-697)||(13380-13559)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (25-272)||(2509-2756)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (25-361)||(5969-6307)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (38-317)||(4945-5224)
[»] scaffold0682 (2 HSPs)
scaffold0682 (416-697)||(191-472)
scaffold0682 (25-110)||(470-555)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (25-272)||(41344-41589)
scaffold0126 (610-697)||(45845-45932)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (25-176)||(1988-2139)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (37-306)||(1618-1887)
scaffold0249 (301-697)||(4912-5308)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (307-697)||(3891-4281)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (433-697)||(1211-1475)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (37-572)||(46279-46814)
scaffold0066 (25-227)||(68225-68427)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (26-179)||(844-997)
scaffold0574 (469-697)||(4217-4445)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (433-697)||(14086-14349)
scaffold0266 (37-227)||(9507-9697)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (280-697)||(38776-39193)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (37-572)||(23519-24054)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (25-243)||(4884-5102)
scaffold0165 (489-697)||(1177-1385)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (37-368)||(7497-7828)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (25-143)||(4425-4543)
scaffold0270 (25-143)||(11555-11673)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (37-572)||(14383-14918)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (37-572)||(13033-13568)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (25-265)||(32953-33193)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (37-572)||(3284-3818)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (64-179)||(17877-17992)
scaffold0244 (193-497)||(25959-26263)
[»] scaffold0808 (2 HSPs)
scaffold0808 (250-559)||(913-1222)
scaffold0808 (37-164)||(700-827)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (25-110)||(39645-39730)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (37-572)||(3521-4056)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (251-470)||(71446-71665)
scaffold0021 (37-152)||(33059-33174)
scaffold0021 (416-551)||(13397-13532)
scaffold0021 (37-131)||(24529-24623)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (538-697)||(136119-136278)
scaffold0019 (217-329)||(136278-136390)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (548-697)||(2023-2172)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (268-559)||(14661-14952)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (37-572)||(24005-24540)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (260-497)||(1293-1530)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (37-572)||(27912-28447)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (29-152)||(81470-81593)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (37-524)||(3590-4077)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (37-572)||(14782-15316)
scaffold0132 (37-497)||(43738-44198)
[»] scaffold0305 (2 HSPs)
scaffold0305 (44-186)||(11167-11309)
scaffold0305 (282-368)||(10985-11071)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (248-499)||(8748-8999)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (277-559)||(9125-9407)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (37-179)||(5693-5835)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (37-207)||(18541-18711)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (427-559)||(5879-6011)
scaffold0447 (427-559)||(10493-10625)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (37-356)||(14478-14798)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (427-559)||(8488-8620)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (37-216)||(3565-3744)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (235-305)||(33952-34022)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (250-329)||(17-96)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (25-98)||(2187-2260)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 612; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 612; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Original strand, 109434 - 110117
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  109434 acatcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagaaccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagacgc 109533  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109534 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 109633  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  109634 gttcttgagcaaagaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaacggcacctttcgagg 109733  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109734 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 109833  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  109834 tcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgta 109933  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  109934 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttg 110033  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  110034 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgtcttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 110117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 662
Target Start/End: Original strand, 95636 - 96273
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||    
T  95636 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcgagattttggagaagtttacaagatgcgttgggttcga 95735  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||    
T  95736 aattgaggttgagttcggcttatcatccgcagactgatggtcagtcggaaaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagca 95835  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
     || ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  95836 gggtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttatatggt 95935  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || ||||||||  | || ||||||||||| || ||||| || || || || || ||  | |||||  | ||||| |||||||||  | |||||     
T  95936 cggaggtgtagaactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttggggccggacttggttcatgagactacggagaaagttagggtgatca 96035  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  96036 gggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttttgagggt 96135  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| |||||     
T  96136 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcg 96235  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
    ||| || | ||||| || || |||||||||||||||||    
T  96236 tatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgca 96273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 113231 - 112559
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  113231 attgtgaagctgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagattcgaggttcacatctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggctcga 113132  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | |||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||||||| || || ||  |||| ||| |||||||  | ||||| |||| |||    
T  113131 aattgaggctgagttcggcttatcatcctcagaaagatggtcagttagagaggacgatacaatccttagaagatctgttgagggtgtgtgtacttgtgca 113032  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||||    
T  113031 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggt 112932  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    || || ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| ||||||||  | || ||  |  ||||      
T  112931 cgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgaatcgggggaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacataaaaggtaaacttgataa 112832  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  112831 gagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagt 112732  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||||||||| ||||||    
T  112731 cactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggct 112632  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  112631 tatagggtgggtttaccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcagttgcggaagtatg 112559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 596; Significance: 0; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 596; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 18178383 - 18177700
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18178383 acatcaaggagattgtgaagctacatggtgttccttcgaacattgtatcagatagagatccaagatttacttttagattttggaaaagtttgcaagaggc 18178284  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18178283 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatctgttgaggatttgt 18178184  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18178183 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagctatcattctagtattggaatggcaccttttgagg 18178084  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18178083 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 18177984  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18177983 ttagatgattcgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 18177884  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18177883 ttcttgagagtcactcctataactggtgtagaacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttg 18177784  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18177783 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 18177700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 590; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 11236844 - 11237525
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11236844 atcaaggagattgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 11236943  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11236944 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 11237043  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11237044 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttaccattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 11237143  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237144 ttatatggtcggagatgcagaaccccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 11237243  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11237244 ggatgatccaagagagaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 11237343  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  11237344 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 11237443  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11237444 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 11237525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 590; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 15160688 - 15161369
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15160688 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 15160787  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15160788 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 15160887  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15160888 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 15160987  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15160988 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 15161087  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15161088 agatgatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 15161187  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  15161188 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 15161287  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15161288 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 15161369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 8199269 - 8198586
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8199269 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 8199170  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8199169 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 8199070  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  8199069 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaag 8198970  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198969 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 8198870  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  8198869 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtg 8198770  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  8198769 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 8198670  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8198669 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 8198586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 10871636 - 10870953
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871636 acatcaaagagattgtgaagctgcatggtattccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 10871537  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871536 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 10871437  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10871436 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 10871337  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871336 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 10871237  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10871236 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtg 10871137  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  10871136 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaggttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 10871037  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10871036 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 10870953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Original strand, 44790980 - 44791663
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44790980 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 44791079  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791080 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 44791179  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  44791180 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaag 44791279  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791280 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 44791379  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  44791380 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtg 44791479  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  44791480 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaaattgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 44791579  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44791580 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 44791663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 13686703 - 13686021
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686703 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 13686604  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686603 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 13686504  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13686503 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 13686404  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686403 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgatggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 13686304  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13686303 agatgatccaagagagaatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 13686204  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||    
T  13686203 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcaaatattggaaagagttgga 13686104  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatg-ttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13686103 acggtggcttaccgagtgggtttaccgtcgcatctttcgaatttgcacaacgtttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 13686021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 8708244 - 8707563
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8708244 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 8708145  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8708144 tgggttcgaagttgagattgagtttggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 8708045  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8708044 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 8707945  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8707944 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaagttc 8707845  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8707844 agatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 8707745  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  8707744 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 8707645  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8707644 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 8707563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 18551389 - 18552070
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18551389 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 18551488  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551489 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 18551588  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18551589 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 18551688  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551689 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 18551788  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18551789 agatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 18551888  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  18551889 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 18551988  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18551989 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 18552070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 14333036 - 14332355
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14333036 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 14332937  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14332936 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttattgagaatttgtgt 14332837  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14332836 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggcc 14332737  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14332736 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaataaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttc 14332637  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14332636 agatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtt 14332537  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  14332536 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatactggaaagagttgga 14332437  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14332436 acggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 14332355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 544; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Original strand, 11552731 - 11553414
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552731 acattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttccttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 11552830  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||    
T  11552831 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagatagatggacagtcggagaggacaattcagttgctagaggatttgttgaggatccgt 11552930  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11552931 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgagg 11553030  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553031 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 11553130  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553131 taagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 11553230  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  11553231 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttg 11553330  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553331 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcacgacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 11553414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 12688142 - 12687459
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12688142 acattaaggagattgtgaagttgcatggtattccttcgagcattgtatcggatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 12688043  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12688042 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgt 12687943  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12687942 gtgcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgagg 12687843  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  12687842 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttaggaccagagattgtccaacagactactgagaaagt 12687743  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12687742 taagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 12687643  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||| |||||    
T  12687642 tttttgcgagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcagaaagagttg 12687543  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12687542 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttgcacgacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 12687459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 510; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 16947 - 17628
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16947 atcaaggagattgtgaggctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 17046  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17047 taggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 17146  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17147 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcagtttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 17246  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||     
T  17247 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttcagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgaaattgttcagcagactactgagaaagtta 17346  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17347 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 17446  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||  || ||||| || |||||||| | ||||| |||||||    
T  17447 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttgga 17546  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17547 acggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 17628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 504; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 14955261 - 14954578
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||| ||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||    
T  14955261 acattaaggagattgtgacgttgcatggtattccttcgagcattgtattggatagagatccaagatttacttctaggattttcaaaagtttgcaacaggc 14955162  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14955161 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 14955062  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  14955061 gtgcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaga 14954962  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14954961 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtccagcagactactgagaaagt 14954862  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954861 taagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 14954762  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |  |||| |||||    
T  14954761 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccaaagtttattggtccgtataagatatcagaaagagttg 14954662  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14954661 gaacggtggcttatcgagtgagtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgttttccatgtatcgcaacttcggaagtatg 14954578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 477; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 696
Target Start/End: Original strand, 23516520 - 23517080
Alignment:
Q  136 agttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaactt 235  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23516520 agttcggcgtatcatccacagaaagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagagcatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggagggactt 23516619  T
Q  236 gggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcag 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23516620 gggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcag 23516719  T
Q  336 aactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatg 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23516720 aactccgttgtgccggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacaagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatg 23516819  T
Q  436 aaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatga 535  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23516820 aaggcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatga 23516919  T
Q  536 ctggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtggg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23516920 ctggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtggg 23517019  T
Q  636 tttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23517020 tttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 23517080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 697
Target Start/End: Original strand, 15154294 - 15154964
Alignment:
Q  22 gaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggct 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |    
T  15154294 gaaattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcaaatagagatccaagattcacttctagattttggaaaagtttgcagcaggctttaggtt 15154393  T
Q  122 cgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttga 221  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  15154394 ctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcaatcgctagaggacttgttgagagtttgtgtacttga 15154493  T
Q  222 gcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatat 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||    
T  15154494 gcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattgggatggcaccttatgaagctttgtat 15154593  T
Q  322 ggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatga 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  15154594 ggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag-----gagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatga 15154688  T
Q  422 tccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgag 521  Q
    | ||||| || ||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15154689 ttcaagaaaagatgaaagtgtcaccgagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaagaaggagaccacgtatttttgag 15154788  T
Q  522 agtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtg 621  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  15154789 agtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtg 15154888  T
Q  622 gcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  15154889 gcttaccgagtgggtttaccactgcatctttcgaatttgcacgatgtatttcacgtgtcgcaacttcggaagtatg 15154964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 9596696 - 9596236
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596696 atcaaggagattgtgaggttacatggtgtcccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 9596597  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9596596 tgggttcgaaattgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 9596497  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  9596496 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagtcatcattctattattggaatggcaccttttgaggct 9596397  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  9596396 ttgtatggtcggagatgtagaacttcgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtta 9596297  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcg 476  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9596296 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 9596236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 25 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 15625182 - 15624545
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |    
T  15625182 attgtgaagctacatggtgttccgccgagcattgtgtcagatagagatccaaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggttttgggttcta 15625083  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  15625082 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggaaagaacaatccagtcgttggaggacttgttgagagtttatgtacttgagca 15624983  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||  | ||||||    
T  15624982 tggaggaacttgggatagtcatcttctgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattagaatgacaccattcgaagcactgtatggt 15624883  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||  | || |||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||| || ||||||    
T  15624882 cggaggtgtaggactccattgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtaattttgggaccagaaatcgttcatcaaactacttagaaggttaagttgatcc 15624783  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15624782 aagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttatcatgataagcttaggaaagaccttgagtttcaggaaggagaccatgtatttttgagagt 15624683  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || || | |||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||||| |  |||| | |||||||||||||     
T  15624682 cactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaaattgactccgaggtttattggttcatatcagatatcagaaagaattggaacggtggcg 15624583  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15624582 taccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 15624545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 12206418 - 12207090
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  12206418 attgtgaagctgcatggtgttccgtcgagtattgtgttggatagagatccaagatttacatcgagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgggttcaa 12206517  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||    
T  12206518 agttgaggttgagttcagcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctaagagtgtgtgtacttgagca 12206617  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| |||| |    
T  12206618 aggtggagcttgggatagtcacctgccgttgatagagttcacgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagttttgtatgat 12206717  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga-tgatc 423  Q
    ||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | || ||||| || || |||||||| ||||| || |||| ||| | ||||     
T  12206718 cggaggtgcaatactccgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccggatatagttcagcagactacaga-aaaggtcaaattgata 12206816  T
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12206817 aaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagtgtagaaaggatcttaagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagag 12206916  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 623  Q
    ||| |||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | || ||||| |  || | ||||| ||| |||||    
T  12206917 tcactcctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcaaagaagttgacgccgaagtttattggttcgtaccagatatctgagagagttgcaacagtggc 12207016  T
Q  624 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12207017 atatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 12207090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 15102221 - 15102891
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||  ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  15102221 attgtgaagctacatggtttaccatcgaatattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 15102320  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  15102321 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 15102420  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15102421 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 15102520  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  || |||||| | || ||||| ||  |  |||| || ||||| ||||||||  |||||||      
T  15102521 cggaggtgcaggactcctttgtgttggttcgagtcag--gagagagtgttgttgggaccggatttgattcatcagactacagagaaagtcaagatgataa 15102618  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  15102619 gagaaaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagt 15102718  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  15102719 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggca 15102818  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15102819 tatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15102891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 145 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15204389 - 15203837
Alignment:
Q  145 tatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtc 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15204389 tatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaggacaattcagtcgttggaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttggaatagtc 15204290  T
Q  245 atcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgtt 344  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||  | ||||||| ||| || || ||||||||    
T  15204289 atcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggaaccatttgaagcgctgtatggtcagaggtgtaggactccgtt 15204190  T
Q  345 gtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcg 444  Q
    ||| ||||| |||| |||||| || || || || ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| || || ||||| ||||||    
T  15204189 gtgttggttcgagtaaggtgatagtgtagttttgggaccagattttgttcagcaaactacagagaaggttaagttgatccatgaaaagatgaaagcgtcg 15204090  T
Q  445 cagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtag 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |  | |||||||||| |    
T  15204089 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgttttttagagtcacttttgtgactggtgttg 15203990  T
Q  545 gacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgcc 644  Q
    | || || ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||  |||||||||   |||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  15203989 gccgcgcattgaagtcaaataagttgactccgaggtttattggtctgtatcagattacagaaagaattggaacggtagagtatcgagtgggtttaccacc 15203890  T
Q  645 gcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15203889 gcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15203837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 25 - 506
Target Start/End: Original strand, 11771881 - 11772362
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |    
T  11771881 attgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaaggtttacttctagattttggaggagtttgcaagaggctttaggttcta 11771980  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |  || ||||||||  | || |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11771981 agttgaggttgagttcggcgtatcatctgcagacagatggttagtcggaaaaaacgattcagtcattggaagatttgttgagagtttgtgtacttgagca 11772080  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||     
T  11772081 aggagaaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttaaggctttgtgtgga 11772180  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
     | || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  11772181 agaaggtgcagaacttcgttgtgttgatttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccggaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattc 11772280  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggaga 506  Q
    |||| |  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11772281 aagaaatgatgaaaacgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggaga 11772362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 14263862 - 14264534
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  14263862 attgtgaagttgcatggtgttccatcgagtattgtgtcggatagaaatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaa 14263961  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||| || |||||    
T  14263962 agttaaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacaattcaatcgttagaggatttgatgagagtgtctgtactcgagca 14264061  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  14264062 aggtggagcttgggatagtcatctactgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 14264161  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || |||||  |  | ||||| || |||||  |||| ||  |||||||      
T  14264162 cggaggtgcaggactcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtagtgttgggaccgtatttggttcatcagactacgaagaatgtcaagatgataa 14264261  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||    
T  14264262 gcgaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagt 14264361  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||     
T  14264362 cactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatcagatatctgaaagggttggaacagtggca 14264461  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||||||||| || || ||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  14264462 tatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcctgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatg 14264534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 19147842 - 19147170
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||  || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  19147842 attgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatctgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcta 19147743  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    || |||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||    
T  19147742 agatgaggttgagttcaacttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttaagca 19147643  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  19147642 aggtggagcttggaatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 19147543  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||      
T  19147542 cggaggtgcaggactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgataa 19147443  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||    
T  19147442 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagt 19147343  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  19147342 cactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggca 19147243  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  ||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19147242 tacagagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19147170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 20747241 - 20746569
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||  || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  20747241 attgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatctgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcta 20747142  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    || |||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||    
T  20747141 agatgaggttgagttcaacttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttaagca 20747042  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  20747041 aggtggagcttggaatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 20746942  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||      
T  20746941 cggaggtgcaggactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataa 20746842  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||    
T  20746841 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagt 20746742  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  20746741 cactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggca 20746642  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  ||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20746641 tacagagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 20746569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 21662591 - 21661933
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||| || |    
T  21662591 attgtgaagttacatggtgttccatcgagtattgtattagatagggatccaagatttacttctagattttggaagagtttgtaggaggcgttgggttcta 21662492  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21662491 agttgagtttgagttaggcgtatcatccgcagacagatggatagacggagaggacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 21662392  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||    
T  21662391 agggggatcttgggatagtcatcttccattaatcgagttcacttacaataatagttaccattctagcattggaatggcaccgttcgaagcgttgtatggt 21662292  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||| || |||||  | |||||||| |||||||| || |||| ||| || ||| || ||||      
T  21662291 cggagatgcagaactccgttgtgttgtgatgagtccggtgagagtgtggtactgggaccagacattgttcaacagactaatgaaaatgttaagttgatta 21662192  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  21662191 gagaaaagatgaaagcgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttgagtttc---aaggagaccatgtgtttttgagagt 21662095  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    ||  ||| | || ||||| ||||| ||  | || ||||||||  | || |||| ||| ||||| || |||||||||| | ||| ||||||  |||| ||     
T  21662094 cacccctcttaccggtgttggacgggcactaaaatcaaagaaactaactccgaggtttattggcccgtatcagatttcgcaaagagttggggcggttgcg 21661995  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaact 686  Q
    |||   ||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||| || |||||||| |||||    
T  21661994 tataacgtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaact 21661933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 11388046 - 11388717
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  11388046 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggttcga 11388145  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||| |  ||||| | ||||| ||||||||    
T  11388146 aattgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatctactgagagtgtgtgtacttgagca 11388245  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||| |    
T  11388246 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaatagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatgtt 11388345  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || |||||||| ||||| || || ||| || ||||      
T  11388346 cgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttgataa 11388445  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||    
T  11388446 gagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccatgagtttcaag-aggagatcatgtgttcttgagagt 11388544  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  11388545 cactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggca 11388644  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  11388645 tatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatg 11388717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14040326 - 14039986
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | || || |    
T  14040326 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctacattttggaaaattttgcaagaggctctaggttcta 14040227  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  14040226 agttgaggttgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgttaagagtttgtgtacttgagca 14040127  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  14040126 aggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggt 14040027  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtga 365  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14040026 cagagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtga 14039986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14350356 - 14350016
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | || || |    
T  14350356 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctacattttggaaaattttgcaagaggctctaggttcta 14350257  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  14350256 agttgaggttgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgttaagagtttgtgtacttgagca 14350157  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  14350156 aggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggt 14350057  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtga 365  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14350056 cagagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtga 14350016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 16071912 - 16072584
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  16071912 attgtgaagttacatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcagttctagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaa 16072011  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  16072012 agttaaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcagagaggacgattcaatcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 16072111  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| ||   |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  16072112 aggtggagcttgggatagtcacctatggttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttgtatggt 16072211  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    |||||  ||| |||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||  | ||||  || ||||  ||||| ||  |||||||      
T  16072212 cggaggcgcataactcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtagtgttgggaccagatttggttcgtcagactatggagaaggtcaagatgataa 16072311  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||    
T  16072312 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagt 16072411  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  16072412 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggca 16072511  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |    ||||||||| || || |||||||||||||||||  || | || |||||||||||||||||||||||||    
T  16072512 tgcaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16072584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 16950089 - 16950761
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  16950089 attgtgaagctacatggagtactgtcgagtattgtgtcggatagagattcgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggatcga 16950188  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  16950189 agttgaggttgagttcggattatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 16950288  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| |||   ||| ||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  16950289 aggtggagtatggaatagtcacctaccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 16950388  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||  ||  | ||||| || ||||||||||||||  |||||||      
T  16950389 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggacaggacttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgataa 16950488  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  | |||||||||||| || || || || ||| |||||||    
T  16950489 gggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccatgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagt 16950588  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||| |||||     
T  16950589 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagaaagggttggaacagtggca 16950688  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| |||||  | || ||||||||||| |||||  |||| ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  16950689 tatagagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttttatgtgtcgcagcttcggaagtatg 16950761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 6414142 - 6413470
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||  || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  6414142 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatctgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgctttaggttcga 6414043  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  6414042 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagaaggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 6413943  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||  ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  6413942 aggtggggcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 6413843  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || || || |  ||  | ||||| || ||||||||||||||  |||||||      
T  6413842 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgaatcaggagagagtgttgtgttgggtctggatttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgataa 6413743  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||| || || || |||||| |||| ||    
T  6413742 gggaaaacatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcctttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggt 6413643  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||||||| |  |||||||||  || |  |||||||| |||||     
T  6413642 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcattggttcgaatcagatttcagagagggttggaacagtggca 6413543  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||| ||||||||    
T  6413542 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcagaagtatg 6413470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 26 - 697
Target Start/End: Original strand, 18053572 - 18054243
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  18053572 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcagatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 18053671  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  18053672 gttgagactgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 18053771  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  18053772 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 18053871  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    |  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||||||      
T  18053872 gagggtgcaggactccgttgtgttggttcgagtcaggagaaagagttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcag 18053971  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || || || || || ||| |||||||     
T  18053972 agagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagtg 18054071  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctt 625  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  || | | | ||||||||||| |    
T  18054072 actccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggcccgtatcagatttcagagagaataggaacggtggcat 18054171  T
Q  626 atcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  18054172 atagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 18054243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 14285994 - 14286666
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||| |||| || |||||||| |||||||| || |    
T  14285994 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacatctagatttcggaagagcttgcaagatgctttgggttcaa 14286093  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || ||  |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  14286094 aattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgaagaggacgatacaatctttagaggatttattgagagtgtgtgtgcttgagca 14286193  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||    
T  14286194 aggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggt 14286293  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||   || || || || || ||||| ||  | ||||| || || |||||||| ||  |||||||      
T  14286294 cggaggtgcaggactcctttgtgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataa 14286393  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    |||||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  14286394 gggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagacccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagt 14286493  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||   | |   ||||||| |||||     
T  14286494 tactccgatgacaggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatttcatataggattggaacagtggca 14286593  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14286594 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 14286666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Original strand, 8211749 - 8212418
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  8211749 gtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcagatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaagacgccttgggttcgaagt 8211848  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  8211849 tgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 8211948  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||    
T  8211949 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcgccgttcgaagccttgtatggtcgg 8212048  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||    |    
T  8212049 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtattgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataaggg 8212148  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||     
T  8212149 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 8212248  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| ||     
T  8212249 tcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatac 8212348  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  8212349 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcaacttcggaagtatg 8212418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 13666168 - 13665512
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||    
T  13666168 attgtgaagctacatggtgtatcgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagcttacaagatgcattgggttcga 13666069  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||  ||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  13666068 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcagagaggacgatccaatcattagaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagca 13665969  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  13665968 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 13665869  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    |||||  |||  ||||| || ||||||||||||||||| || ||  | || || |           ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||     
T  13665868 cggaggggcatgactcctttatgctggtttgagtcaggagagagttttgtgttgg-----------gttcatcaaactacagagaaagtcaagatgatca 13665780  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |  ||||||||||| || | ||| || || ||| |||||||    
T  13665779 gagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatcacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagaggaagatcatgtatttctgagagt 13665680  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||     || ||||||||||  ||||  |||||||| |||||     
T  13665679 tactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttca-----ccgtatcagatttcagaaagggttggaacagtggca 13665585  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  13665584 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 13665512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Original strand, 11305884 - 11306553
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  11305884 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 11305983  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  11305984 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggaaaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 11306083  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  11306084 tggagcttgggatagtcacttacctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 11306183  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||    |    
T  11306184 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttagttcatgagactactgagaaagtcaggttgataaggg 11306283  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||     
T  11306284 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 11306383  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| |||    
T  11306384 tcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatat 11306483  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  11306484 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtctctcagcttcggaagtatg 11306553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 13021988 - 13021316
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13021988 attgtgaagctgcacggtgtaccgtcgagtattgtatcagatagggatccgaggttcacctctaggttctggaaaagtttgcaagatgctttgggatcga 13021889  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  13021888 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggttagtcggagaggactatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 13021789  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||| ||| || | |||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13021788 aggtggagcttgggataatcacctactgttgatagagttcacttataacaacagctatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaggctttgtatggt 13021689  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| |||||  | || ||||||||||||||  | || ||||| |||||||| ||  | |||||  | ||||||||||| ||  |||||||      
T  13021688 cggaggtgcaggactcctctatgttggtttgagtcaggaaagagtgtggtgttaggaccggacttggttcatgagactactgagaaggtcaagatgataa 13021589  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  || |||||||| || || || || || ||| |||| ||    
T  13021588 gggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggccctagagtttcaagacggtgatcatgtttttctgagggt 13021489  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| || |||  |||||| |||||||| | ||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || |  |||||||| ||||||    
T  13021488 cactcctatgacgggcgtaaaacgtgcattgaagtcgaggaagtggactccaaagtttattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggct 13021389  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  13021388 tatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 13021316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 693
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1693
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  1025 attgtgaagctacatggagtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatacaaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggatcga 1124  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  1125 ggttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggttagtcggaaaagacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 1224  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  1225 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatggt 1324  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    | ||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||||||||| ||  |||||||      
T  1325 cagaggtgaaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactactgagaaggtcaagatgataa 1424  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| ||| |||    
T  1425 gggaaaagatgaaagcgtcacagattcgacagaagagttaccatgacaagaggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtttttgtgaaagt 1524  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | | ||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||  ||||  ||||||||  ||||     
T  1525 tacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatttaagaaagggttggaacactggca 1624  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaag 693  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||| || |||||||||    
T  1625 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtctcagcttcggaag 1693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 14130503 - 14129832
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||| | |||||    
T  14130503 ttgtgaagctacatggagttccttcaagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggatgctttgagttcgaa 14130404  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||| |||||||| | ||||| ||||| |||    
T  14130403 gttgagattgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatctgttgagagtgtgtgtgcttgaacaa 14130304  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  14130303 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtc 14130204  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||  | |||||  | |  |||||||| ||  |||||||       
T  14130203 ggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagatgactgagaaggtcaagatgataag 14130104  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
     || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || || ||||| |||||     
T  14130103 ggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttttagagtt 14130004  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctt 625  Q
    | ||| |||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |   |||||||| |||| |    
T  14130003 actccgatgacgagtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacgatggcat 14129904  T
Q  626 atcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  14129903 atagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 14129832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 49152929 - 49152260
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||    
T  49152929 gtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgctttgggttcaaagt 49152830  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  49152829 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacggatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtatgtgtgcttgagcaagg 49152730  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  49152729 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgg 49152630  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | ||||||||||||||   | ||||   ||    
T  49152629 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgataagag 49152530  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||     
T  49152529 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 49152430  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| |||    
T  49152429 tcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatat 49152330  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  49152329 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 49152260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 14434321 - 14433650
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||| | |||||    
T  14434321 ttgtgaagctacatggagttccttctagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggatgctttgagttcgaa 14434222  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||| |||||||| | ||||| ||||| |||    
T  14434221 gttgagattgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatctgttgagagtgtgtgtgcttgaacaa 14434122  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  14434121 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtc 14434022  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||  | |||||  | |  |||||||| ||  |||||||       
T  14434021 ggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagatgactgagaaggtcaagatgataag 14433922  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
     || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || || ||||| |||||     
T  14433921 ggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttttagagtt 14433822  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctt 625  Q
    | ||| |||||  ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |   |||||||| |||| |    
T  14433821 actccgatgacgagtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacgatggcat 14433722  T
Q  626 atcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  14433721 atagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 14433650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 601
Target Start/End: Original strand, 23505491 - 23506064
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||    
T  23505491 gtgaagctacatggagttccttcgtgtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagt 23505590  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || || ||||||||| | ||||||||||| || ||    
T  23505591 tgagactgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgttcttgaacaggg 23505690  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  23505691 tggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcga 23505790  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||  | || ||| | ||||| || |||||  || |||||   |    
T  23505791 aggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggtccaggagactacagaaaaagtcaagctgatcaggg 23505890  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| | ||||| |     
T  23505891 agaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgac 23505990  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 601  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23505991 tccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcagattt 23506064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 181 - 551
Target Start/End: Original strand, 35964646 - 35965016
Alignment:
Q  181 attcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagtt 280  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  35964646 attcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttctattgatcgagttcacttataataacagtt 35964745  T
Q  281 atcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttagg 380  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || || || ||  | ||    
T  35964746 accattctagtattggaatggcaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtatgagtctggcgatagtgtagtactggg 35964845  T
Q  381 accagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtaga 480  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || ||||   ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  35964846 accagacattgttcaacaaactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaggcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtagg 35964945  T
Q  481 aaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgc 551  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  35964946 aaggatcttgagtttcaagaaggggaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactagtgtatgacgtgc 35965016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 12456333 - 12455662
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| | ||| ||||| |||||||| ||||    
T  12456333 attgtgaagctacacggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagaatttacaagatgctttgggatcga 12456234  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||||| | | ||||| ||||||||    
T  12456233 agttgaggttgagctcggcttatcatccccagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggaattgttgacagtgtgtgtgcttgagca 12456134  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||||    
T  12456133 aggtggagcttgggatagtcacctaccgctgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtataggtatggtaccgttcgaagctttgtatggt 12456034  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
     |||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||  | || ||  | ||||||||||||||  || ||||      
T  12456033 aggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggtacatgagactactgagaaagtcaaggtgataa 12455934  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  12455933 gggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggccctagagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggt 12455834  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||| ||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||  || | |||| |||| ||||||    
T  12455833 cactcctttgacgggtgttggatgtgcattgaagtcgaggaagttgaatccaaagttcattggtcggtatcagatttcagagagagttagaacagtggct 12455734  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| || | ||||| || || |||||||||||  ||||  |||| || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  12455733 tatagaattggtttgccaccacatctttcgaacctgcatgatgtgtttcatgtgt-gcagcttcggaagtatg 12455662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 82 - 601
Target Start/End: Original strand, 23199418 - 23199937
Alignment:
Q  82 acttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaa 181  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  23199418 acttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagttgagactgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacga 23199517  T
Q  182 ttcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagtta 281  Q
    | || ||  | || || ||||||||| | ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  23199518 tccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgttcttgaacagggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagtta 23199617  T
Q  282 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttagga 381  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || || |||    
T  23199618 tcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttggga 23199717  T
Q  382 ccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaa 481  Q
    || ||  | || ||| | ||||| || |||||  || |||||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  23199718 ccggatttggtccaggagactacagaaaaagtcaagctgatcagggagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaa 23199817  T
Q  482 aagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtt 581  Q
    | |  ||||||||||| || || || || || ||| | ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||    
T  23199818 aggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaatt 23199917  T
Q  582 cattggtccatatcagattt 601  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  23199918 cattggtccgtatcagattt 23199937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 370 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 14038092 - 14037765
Alignment:
Q  370 gtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatg 469  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14038092 gtggttttgggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatg 14037993  T
Q  470 acaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagtt 569  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  14037992 ataagcgtaggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagtt 14037893  T
Q  570 gaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgtt 669  Q
    ||| || |  || |||||| |||||||||| | ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||     
T  14037892 gacaccaagatttattggttcatatcagatatcggaaagagtttgaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtg 14037793  T
Q  670 ttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    
T  14037792 tttcatgtatcgcaacttcggaagtatg 14037765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 370 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 14348122 - 14347795
Alignment:
Q  370 gtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatg 469  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14348122 gtggttttgggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatg 14348023  T
Q  470 acaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagtt 569  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  14348022 ataagcgtaggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagtt 14347923  T
Q  570 gaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgtt 669  Q
    ||| || |  || |||||| |||||||||| | ||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||     
T  14347922 gacaccaagatttattggttcatatcagatatcggaaagagtttgaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtg 14347823  T
Q  670 ttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    
T  14347822 tttcatgtatcgcaacttcggaagtatg 14347795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 601
Target Start/End: Original strand, 26118226 - 26118799
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||| || |||||||||||  |||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || |||||  |||| || || || ||||| |||||||    
T  26118226 gtgaaacttcatggtgttccggcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagcgtttacaggacgccttgggttcgaagt 26118325  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  26118326 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaagg 26118425  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  26118426 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 26118525  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||  |||    
T  26118526 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgat--aag 26118623  T
Q  428 agaaa--atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
    |||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| || || || || ||| |||| |||    
T  26118624 agaaaggatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggagcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 26118723  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 601  Q
    | |||| |||| ||||| || |||||| ||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  26118724 actcctttgacgggtgttggtcgtgctctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagattt 26118799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15341061 - 15340587
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  15341061 ttgtgaagctacatagagttccttctagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacatctaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttcgaa 15340962  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | |   | ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||    
T  15340961 gttgaggatgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggaaaggacgatcaaataattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaa 15340862  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  15340861 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacatttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagttttgtatggtc 15340762  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || || |||||||| ||  || ||||       
T  15340761 ggaggtgcaggactccgttatgctagtttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagctgataag 15340662  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 500  Q
     || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  15340661 ggaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcagga 15340587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 140
Target Start/End: Original strand, 23203242 - 23203368
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23203242 acatcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 23203341  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttc 140  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23203342 cttggggtcgaagttgagattgagttc 23203368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 140
Target Start/End: Original strand, 23509369 - 23509495
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509369 acatcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 23509468  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttc 140  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23509469 cttggggtcgaagttgagattgagttc 23509495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 137 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 12457298 - 12456940
Alignment:
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || ||||| |||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||    
T  12457298 gttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttattgagagtgtctgtgcttgagcaaggtggaacttg 12457199  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
     |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||     
T  12457198 agatagtcacctaccgttgattgagttcacatataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtatagg 12457099  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| || || ||||| || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | | ||   ||| || ||||    
T  12457098 actcctttatgctagtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttcataagagaaaagatga 12456999  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagttt 495  Q
    | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  12456998 aagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagttt 12456940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 14936965 - 14936443
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||    
T  14936965 catggtattccttctagtattgtatcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttaggaactaagttgagattga 14936866  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||  | |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    |||||||||||||||||  ||||||  | |||||| | |  | |||    
T  14936865 gttcttcttatcatccccagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttagaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaatgtgtcagttg 14936766  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  14936765 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 14936666  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||||||| | |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||  || || ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  14936665 acgtcgttgtgttggtttgaatcaggtgaaggtgctttgttaggaccggaagttgtgcaataaactaaggaaaaggttaagatgattcaagagaagatga 14936566  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||  ||||||||||||  || || || |||||||||||||| | || | ||||    
T  14936565 aagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcttgtgac 14936466  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagt 559  Q
    |||||| || |||||||||||||    
T  14936465 tggtgttggtcgtgctttgaagt 14936443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 365
Target Start/End: Original strand, 13968289 - 13968626
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  13968289 gtgaagcttcatggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 13968388  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  13968389 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgaacaagg 13968488  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| | |||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  13968489 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgggttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 13968588  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtga 365  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  13968589 aggtgtatgactcctttatgctggtttgagtcgggtga 13968626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 4440546 - 4440011
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||||||| ||||    
T  4440546 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgctttgggaactaagttgaggttga 4440447  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||| ||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  4440446 gttctgcttatcatccccagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatttattgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 4440347  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||  || |||||||   | |||||||| |||||  | || || |||    
T  4440346 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtaccggtatggcactgcttgaggctttgtatggaagaaggtgtaga 4440247  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    |   ||||||| ||||| || ||||||||||| |   | ||||| || ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  4440246 atgtcgttgtgttggttcgaatcaggtgaaagtgctttgttagggccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatga 4440147  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | || || ||  ||||||||||||  || || || |||||||||||||| |  ||||||||    
T  4440146 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccctatgac 4440047  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  4440046 tggtgtaggacgtgctttgaagtgtaggaagttgac 4440011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 7824518 - 7823983
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || |||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||    
T  7824518 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaaattttgggagagtttgcaagctgctttaggaactaagttgagattga 7824419  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  7824418 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagaaaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 7824319  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  7824318 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 7824219  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| |||||||| || || ||||| |   | || || || ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  7824218 acaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 7824119  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| ||||    
T  7824118 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgac 7824019  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     || || || |||||||| ||||  | |||||||||    
T  7824018 cggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgac 7823983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 27107426 - 27107961
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  27107426 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 27107525  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  27107526 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagaaaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 27107625  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  27107626 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 27107725  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| |||||||| || || ||||| |   | || || || ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  27107726 acaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 27107825  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| ||||    
T  27107826 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgac 27107925  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     || || || |||||||| ||||  | |||||||||    
T  27107926 cggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgac 27107961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 15364558 - 15364036
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||    
T  15364558 catggtattccttctagtattgtatcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttaggaactaagttgagattga 15364459  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    |||||||||||||||||  ||||||  | |||||| | |  | |||    
T  15364458 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttagaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaatgtgtcagttg 15364359  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  15364358 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 15364259  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||  ||||||| |||||||| | ||| ||||| |   | ||| |||| ||  |||| ||  ||| ||  || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  15364258 acgacgttgtgttggtttgaataaggagaaagtgatatgttaagaccggaagttgtgcaaaaaaataaggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 15364159  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||  ||||||||||||  || || || |||||||||||||| | || | ||||    
T  15364158 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcttgtgac 15364059  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagt 559  Q
     ||||| || |||||||||||||    
T  15364058 cggtgttggtcgtgctttgaagt 15364036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 433 - 689
Target Start/End: Original strand, 26288063 - 26288318
Alignment:
Q  433 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 532  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  || || |||||||| || || || || ||| |||| || | |||||    
T  26288063 atgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttaccatgacaagcggagaaaggccctaga-tttcaggagggtgatcatgtttttctgagggttactccta 26288161  T
Q  533 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 632  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||  ||||  ||| |||| ||||| ||| ||||    
T  26288162 tgacgggtgtaggacgcgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggtacgtatcagatttcagaaagggtttgaacagtggcatatagagt 26288261  T
Q  633 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcg 689  Q
     ||||| || || |||||||| || |||||  |||| || ||||||||||| |||||    
T  26288262 tggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcg 26288318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 282 - 524
Target Start/End: Original strand, 12368473 - 12368715
Alignment:
Q  282 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttagga 381  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||| || || || ||||| |   | || |||    
T  12368473 tcattctagtattggtatggctccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggttcgaatccggagaaagtgctttgtttgga 12368572  T
Q  382 ccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaa 481  Q
    || ||  |||| ||  | |||||  | || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||    
T  12368573 ccggaagttgtgcaagagactacgaaaaaggttaagatgatccaagagaaaatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaa 12368672  T
Q  482 aagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    | ||| |||| |||||||  || || |||||||||||||||||    
T  12368673 aggatattgactttcaggttggtgatcacgtgtttttgagagt 12368715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 21674185 - 21674720
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  21674185 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 21674284  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||  || |||||| | ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    |||||||||||||||||  ||||||| | |||||||  |  | ||     
T  21674285 gttatgcttatcatgcccagaccgatggccagactgagaggactattcagagtttagaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaagatgtcagtt- 21674383  T
Q  237 ggatagtcatctt--ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgca 334  Q
    |||| |  || ||  |||||||| || || || ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || |    
T  21674384 ggatcg-aatgtttaccgttgattgaatttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgta 21674482  T
Q  335 gaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaat 434  Q
      ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || |||  | ||||||| |||||||| ||    
T  21674483 agacaacgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaatataagatgattcaagagaagat 21674582  T
Q  435 gaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatg 534  Q
    ||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||| | || || ||  |||| ||||| |  || || || |||||||||||||| |  | | ||    
T  21674583 gaaagcgtctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgaatttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccttgtg 21674682  T
Q  535 actggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    | |||| | ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  21674683 attggtattggacgtgctttgaagtgtaagaaattgac 21674720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 12193961 - 12193742
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 349  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||  |||||  | ||| |||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  12193961 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattaaagtatcagtatgacaccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtagaactcctttgtgtt 12193862  T
Q  350 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 449  Q
    ||| ||||||||||||||  |   | ||||||||  || |||| ||  ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||  ||||| |||||    
T  12193861 ggtatgagtcaggtgaaaatgctttgttaggaccgaaggttgtgcaagaaactacggagaaggttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcagag 12193762  T
Q  450 tcgacaaaagagttatcatg 469  Q
    | | || |||||||||||||    
T  12193761 taggcagaagagttatcatg 12193742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 45147131 - 45146842
Alignment:
Q  79 tttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 178  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||| ||  | |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||    
T  45147131 tttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgcttttggaaccaagttgaggttgagttctgcttatcatcctcagacggatgggcagacagagagga 45147032  T
Q  179 caattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttggg-atagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataata 277  Q
    | ||||||    | |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  | ||||| | | |  | | |||||||| ||||| || ||||| || |    
T  45147031 ctattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaaggtgtcagttgggcagaat-gtttaccgttgattgagtttacttacaacaaca 45146933  T
Q  278 gttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaag 368  Q
    |||  ||||||||||| || ||| |||| || |||||| | ||||||||||| || || || || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  45146932 gtttgcattctagtatcggtatgacaccgttggaggctctgtatggtcggaggtgtaggacgccattgtgttggtttgaatcaggtgaaag 45146842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 578 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15340574 - 15340455
Alignment:
Q  578 agttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 677  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  || |   ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||    
T  15340574 agttcattggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgt 15340475  T
Q  678 gtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| || |||||||||||||    
T  15340474 gtcacagcttcggaagtatg 15340455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17924269 - 17924148
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||    |||||||| ||||    
T  17924269 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgaaaaagtttgcaagctgctttgggaaataagttgaggttga 17924170  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagac 158  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  17924169 gttcggcttatcatccccagac 17924148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23642059 - 23641951
Alignment:
Q  44 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggc 143  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| | | ||||||| | |||||||||| ||| |||||  | ||||| || |||||||| ||    
T  23642059 ttccttctagcattgtgtcagatagagatccaaagtttactccgacattttgggagagtttgcaagcggcgttggggactaagttaaggttgagttctgc 23641960  T
Q  144 atatcatcc 152  Q
     ||||||||    
T  23641959 ttatcatcc 23641951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 566
Target Start/End: Original strand, 41044 - 41327
Alignment:
Q  283 cattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggac 382  Q
    |||||||||| ||| |||||||| || ||||| || |||||| |||||||  |||| || ||||| ||||  ||||| || || |  |  || || ||||    
T  41044 cattctagtactgggatggcaccatttgaggcgttgtatggtaggagatgtcgaacacctttgtgttggtacgagtctggcgagattgcagtgttgggac 41143  T
Q  383 cagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaa 482  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||  | | ||| |  ||| ||||||| || || || | | |||| ||||| |||||||| || || |||||    
T  41144 cagagattgttcagcagacgaccgagaaggtcaaaacgattcgggaggaaatgaaagcatcacaaattagacagaagagctatcatgataaacgaagaaa 41243  T
Q  483 agatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaa 566  Q
    | |  | |||||||||||||| || || || ||||| ||||||| |||  |||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  41244 ataattggagtttcaggaaggggatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttggacgtgctttgaagtctaagaa 41327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 185
Target Start/End: Original strand, 15171642 - 15171764
Alignment:
Q  63 agatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagat 162  Q
    |||||||||||  || ||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||   | ||||||||||||||||  || ||||| || ||||  |||    
T  15171642 agatagagatctgaggtttacttctatgtttcggaaaagttttcaagcggctttggaaactaagttgagattgagttttgcttatcagcctcagatcgat 15171741  T
Q  163 ggtcagtcggagaggacaattca 185  Q
    |||||| || ||||||| |||||    
T  15171742 ggtcagacgaagaggactattca 15171764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 13378937 - 13378796
Alignment:
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||| ||||| |||| ||| | |||||  |  ||||||||||||  || || || |||||    
T  13378937 agatgatccaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagcgttattatgataagaggagaaagaaaattgagtttcaggttggtgatcatgtgtt 13378838  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaa 557  Q
    ||||||||| | |||||| ||| | || || |||||||||||    
T  13378837 tttgagagtgaatcctataacttgagttggtcgtgctttgaa 13378796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Original strand, 40790 - 40869
Alignment:
Q  29 tgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaa 108  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||||  ||||||||||    
T  40790 tgaagctgcatggtcttccttcgagtattgtttcggatagagatccaaggttcacatcaaggttttggggaagtttgcaa 40869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 119
Target Start/End: Original strand, 17144936 - 17144994
Alignment:
Q  61 tcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttggg 119  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17144936 tcagatagagatccgaggtttacttcaaagttttggaagagtatgcaagaggctttggg 17144994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 590; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 590; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 16350293 - 16350974
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16350293 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 16350392  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350393 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 16350492  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16350493 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 16350592  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350593 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttc 16350692  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16350693 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 16350792  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  16350793 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 16350892  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350893 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16350974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 51333187 - 51333868
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51333187 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 51333286  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333287 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 51333386  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51333387 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 51333486  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333487 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 51333586  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  51333587 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaataaggagaccacgtgtt 51333686  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||    
T  51333687 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcatatattggaaagagttgga 51333786  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51333787 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 51333868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 19107032 - 19106351
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19107032 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaatatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 19106933  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19106932 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 19106833  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19106832 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgagtct 19106733  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19106732 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagtta 19106633  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106632 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcggagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 19106533  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  19106532 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccatatcagatatcggaaagagttgga 19106433  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106432 acggtggcgtatcgagttggattactaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19106351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 21830968 - 21830287
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21830968 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 21830869  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21830868 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctggaggatttgttgaggatttgtgt 21830769  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21830768 tctcgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttaatcgagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 21830669  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21830668 ttatatggtcggagatgtagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttc 21830569  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21830568 agatgatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtggaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 21830469  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21830468 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttgga 21830369  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21830368 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 21830287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 33390723 - 33391404
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33390723 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 33390822  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33390823 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 33390922  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  33390923 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggcc 33391022  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391023 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 33391122  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33391123 agatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 33391222  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  33391223 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 33391322  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33391323 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 33391404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 21837615 - 21836934
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21837615 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 21837516  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837515 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 21837416  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21837415 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgacgct 21837316  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21837315 ttgtatggtcggagatgcacaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactactgagacagttc 21837216  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21837215 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgatcagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 21837116  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  21837115 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 21837016  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21837015 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcaaaagtatg 21836934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 697
Target Start/End: Original strand, 41354202 - 41354844
Alignment:
Q  55 attgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgc 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41354202 attgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtctgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccac 41354301  T
Q  155 agacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354302 agacagatggtcaatcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagtaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 41354401  T
Q  255 gatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttt 354  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41354402 gatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggttt 41354501  T
Q  355 gagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgac 454  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354502 gaatccggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaaccactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgac 41354601  T
Q  455 aaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgcttt 554  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41354602 aaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcttt 41354701  T
Q  555 gaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcg 654  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41354702 gaagtcgaagaagttgacctcgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcg 41354801  T
Q  655 aatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354802 aatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 41354844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 522; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 17044709 - 17045390
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17044709 atcaaggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagacagagatccaagatttacttctaggttttggaaaagtttgcaagaggctt 17044808  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17044809 tgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatctgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 17044908  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17044909 tcttgagcaaggatgaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 17045008  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17045009 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtta 17045108  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17045109 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtt 17045208  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  17045209 tttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 17045308  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045309 acggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 17045390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 16078350 - 16079008
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16078350 atcaaggagattgtgaggttacatggt----cttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 16078445  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16078446 tggcttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctggaggatttgttgagagtttgtgt 16078545  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16078546 tcttgagcaaggaggaacttgggataatcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttaaggct 16078645  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16078646 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtta 16078745  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||                   ||||||||||||||||||||    
T  16078746 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg-------------------caggaaggagaccacgtgtt 16078826  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  16078827 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 16078926  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16078927 atggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactacggaagtatg 16079008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 697
Target Start/End: Original strand, 50619959 - 50620619
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  50619959 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttga 50620058  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  50620059 gttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagggtttgtgtacttgagcaaggaggaaattg 50620158  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  50620159 ggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaattgcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcaga 50620258  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||| | || ||||    
T  50620259 actccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggttttaggacctgagattgttcaataaactactgagaaggttaagatgattcaacaaaagatga 50620358  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  50620359 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaggaagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgac 50620458  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |  |||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50620459 tggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaatggtggcatatcgagtgggt 50620558  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  50620559 ttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatg 50620619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 16369953 - 16369281
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  |    
T  16369953 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgagatttacttctagattttggaagggtttgcaagaggctttaggctata 16369854  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | || || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16369853 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagca 16369754  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  16369753 aggaggaacgtgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatgacactttttgaggctttgtatggt 16369654  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
     |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||  ||||||| |    
T  16369653 aggaggtgcagaacttcgttgtgttggtttgagtgaggtgagaatgtggttttaggaccagagattgttcaacaaactattgaaaaggtaaagatgattc 16369554  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||||||    
T  16369553 aagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagggttatcatgataagcgtaggaaagaccttgaattccaagaaggagatcatgtatttttgagagt 16369454  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||| |  |||| |||||||||||||||     
T  16369453 cactcctgtgacaagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtctatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcg 16369354  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || || || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16369353 taccgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16369281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 20137316 - 20136762
Alignment:
Q  143 catatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatag 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  20137316 catatcatccgtagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggagggacttgggatag 20137217  T
Q  243 tcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccg 342  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20137216 tcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtataggaatggcgccttatgaagctttgtatggtcggagatgcagaacttcg 20137117  T
Q  343 ttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgt 442  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| | ||    
T  20137116 ttgtgttggtttgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagtgt 20137017  T
Q  443 cgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgt 542  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20137016 cgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagacctcgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgt 20136917  T
Q  543 aggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccg 642  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||| | ||||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||     
T  20136916 tggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttgggacagtggcgtatcgtgttggtttacca 20136817  T
Q  643 ccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20136816 cggcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 20136762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 153 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 20250378 - 20249834
Alignment:
Q  153 gcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccg 252  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20250378 gcagacagatggtcagttggagaggacgattcagtcgttggaggatttgttgagagtttatgtacttgagcaaggtggaacttgggatagtcatcttcca 20250279  T
Q  253 ttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 352  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20250278 ttgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggt 20250179  T
Q  353 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 452  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  20250178 ttgagtcaagcgaaagagtggtcttaggaccagagatcgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcg 20250079  T
Q  453 acaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgct 552  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||     
T  20250078 acaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagcg 20249979  T
Q  553 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatcttt 652  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||| |||| |  |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  20249978 ttgaagtcaaagaagttgactccgaaatttattgttccgtataagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcaccttt 20249879  T
Q  653 cgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20249878 cgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 20249834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 19760569 - 19761241
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || || |    
T  19760569 attgtgaagctacatggtgttccatcgaacattgtatcggatagaaatccgaggtttacctctagattttagaagagtttgcaagaagctttaggttcta 19760668  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | || || ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  19760669 agttgaagttaagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttggaagacttgctgagagtttgtgtacttgagca 19760768  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  19760769 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcatgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacacctttcgaagctctgtatggt 19760868  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  19760869 cggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcagcaaactactgagaaggttaagttgatcc 19760968  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19760969 aagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagt 19761068  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || || | ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||||| || |||||||| |  |||| | |||||||||||||     
T  19761069 cactcttgtgattggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggaccgtatcagatatccgaaagaattggaacggtggcg 19761168  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || | || ||||| |||||||||||| ||||||    
T  19761169 tatcgagtgggtttaccaccgcacctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtatcgcaacttcggtagtatg 19761241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 273 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 21747942 - 21747519
Alignment:
Q  273 taatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtg 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  21747942 taataattatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatgctcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagttaggcgaaagagtg 21747843  T
Q  373 gtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgaca 472  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  21747842 gtcttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccataata 21747743  T
Q  473 agcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  21747742 agcgtag-aaagatcttgagtttctagaaggagaccacatatgtttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaa 21747644  T
Q  573 cccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttc 672  Q
     ||||  || |||||| | |||||||| | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||     
T  21747643 tccgagatttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgttt 21747544  T
Q  673 catgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21747543 catgtgtcgcaacttcggaagtatg 21747519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 19854966 - 19854298
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||    
T  19854966 gtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcaaagt 19854867  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||  ||||| | || || ||||| |||||    
T  19854866 tgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcactggaggatttactgagagtgtgcgtgcttgaacaagg 19854767  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| ||| |||||    
T  19854766 tggagcttgggatagtcacctaccgttgat-gagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcacggttcgaagctttgtatagtcgg 19854668  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||  ||    
T  19854667 aggtgcaggactcctttacgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagag 19854568  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || || ||| ||||||| |     
T  19854567 agaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttac 19854468  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    ||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||  || |  |||||||| ||||| |||    
T  19854467 tcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatat 19854368  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || ||  ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  19854367 agagttggtttgccaccaaatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 19854298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 29 - 697
Target Start/End: Original strand, 20939770 - 20940438
Alignment:
Q  29 tgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagtt 128  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||    
T  20939770 tgaagctacatggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagacgttttgggttagaagtt 20939869  T
Q  129 gagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagga 228  Q
    |||   ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||     
T  20939870 gaggccgagttcgacttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttggaggatttattgagagtgtgtgtacttgagcaaggt 20939969  T
Q  229 ggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgga 328  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  20939970 ggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattgttatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgga 20940069  T
Q  329 gatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaaga 428  Q
    | |  || ||||| || |||| |||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| |||||||  ||||||||  ||||||||  |||    
T  20940070 ggtataggactcctttatgctagtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcaaactatagagaaagtcaagatgatcagaga 20940169  T
Q  429 gaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagt 528  Q
     || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| ||||||| | |    
T  20940170 aaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttact 20940269  T
Q  529 cctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatc 628  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| ||||| |||     
T  20940270 cctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatata 20940369  T
Q  629 gagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20940370 gagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 20940438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 662
Target Start/End: Original strand, 20835591 - 20836231
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || |  ||||| || ||||| ||||    
T  20835591 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagaattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagctgacaagatgcattgggttcga 20835690  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || |  ||  | ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  20835691 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagacggtcaatcggagagaacgataccatccttggaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 20835790  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  20835791 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggctccgttcgaagctttgtatggt 20835890  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||     
T  20835891 cggaggtgtagaactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgttttgggaccagatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatca 20835990  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |  ||| ||||| |||| || || || || ||| |||||||    
T  20835991 gagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgttggaaggcccttaagttttaggagggtgatcatgtttttctgagagt 20836090  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtc---aaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtg 621  Q
     | ||||||||| |||||||||||| | || |||||    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||| |||    
T  20836091 tactcctatgacgggtgtaggacgtacatttaagtcgaagaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtg 20836190  T
Q  622 gcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
    || ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  20836191 gcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 20836231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 37 - 697
Target Start/End: Original strand, 20856476 - 20857136
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||| |||||    
T  20856476 catggtgttccgtcaagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggaagagtttacaagatgcgttgggttcgaaattgaaattga 20856575  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||  ||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||    
T  20856576 gttcggcttatcatccgcagacatatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattagaggatttactaagaatatgtgtacttgagcagggtggagcttg 20856675  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||| ||||| || || ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| ||| |||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||     
T  20856676 ggacagtcacctaccattgatagaatttacatacaacaacagttaccattcgagtgttggtatggcaccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgcagg 20856775  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || || |  ||  | |||||  ||||||| ||||||||  |||||||    ||||| ||||    
T  20856776 actcctttatgctggttcgagtcgggagaaagtgttgtgttggggctggaattggttcatgaaactacggagaaagtcaagatgattagggagaagatga 20856875  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||| ||||| || ||| |||| || | |||||||||    
T  20856876 aagtgtcgcagagtcgacaaaagagctatcacgacaagcgtaggaaggaccttgcgtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgac 20856975  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
     ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||    
T  20856976 gggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttaccagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggt 20857075  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || || || |||||||||||||||||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  20857076 ttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatg 20857136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 23 - 697
Target Start/End: Original strand, 22432817 - 22433491
Alignment:
Q  23 aaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctc 122  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||| ||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  22432817 aaattgtgaagctgcatgaagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttataggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttc 22432916  T
Q  123 gaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgag 222  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | || |||||||||||  | |||||  |||||    
T  22432917 gaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacaatccaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtggttgag 22433016  T
Q  223 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 322  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || | | |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  22433017 caaggtggagcttgggatagtcacctactgctgatagagttcacatataacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccattcgaagctttgtatg 22433116  T
Q  323 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 422  Q
    || |||| || || ||||| || ||||||||||||||||| |  || ||||| || |||||  |  | |||||  | ||||| || |||||| |||||||    
T  22433117 gttggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagcgagtgtggtgttgggaccgaatttggttcatgagactacagaaaaagttaagatgat 22433216  T
Q  423 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 522  Q
    |  ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    |||||||||||||| || || || |||||  ||||     
T  22433217 cagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagccccttgagtttcaggagggtgatcatgtgttcctgagg 22433316  T
Q  523 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 622  Q
    || | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||  || |  |||| ||| ||||    
T  22433317 gttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggttcgtatcagatttcagagagggttgcaactgtgg 22433416  T
Q  623 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||| |||| ||||| || || |||||||||||| ||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22433417 cctatagagttggtttgccaccacatctttcgaatatgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 22433491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 37677733 - 37677063
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  37677733 gtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 37677634  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | || || |||||||||||    
T  37677633 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgcgtgcttgagcaagg 37677534  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| || ||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  37677533 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 37677434  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||    |    
T  37677433 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataaggg 37677334  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttt-ttgagagtca 526  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||| ||||| ||||    
T  37677333 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttcttgagggtca 37677234  T
Q  527 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctta 626  Q
     |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| ||    
T  37677233 ctcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcata 37677134  T
Q  627 tcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  37677133 cagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtctctcagcttcggaagtatg 37677063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21749597 - 21749356
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  21749597 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 21749498  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21749497 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagca 21749398  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcac 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  21749397 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgataaagttcac 21749356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 20295065 - 20294396
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||| | || || || ||||| |||||||    
T  20295065 gtgaagcttcatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtctacaggacgccttgggttcgaagt 20294966  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||| ||    
T  20294965 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaggg 20294866  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||| ||    
T  20294865 tggagcttcggatagtcaccttccattgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggttgg 20294766  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcag-atgatccaa 426  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||| ||| |||| |||||        
T  20294765 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgag-aaggtcagaatgataagg 20294667  T
Q  427 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 526  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||| |||| ||||    
T  20294666 gaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtttttctgagggtca 20294567  T
Q  527 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctta 626  Q
     |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || | |||||| || ||||| ||    
T  20294566 ctcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtacagtggcata 20294467  T
Q  627 tcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  20294466 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 20294396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 95 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 41308411 - 41307907
Alignment:
Q  95 ggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctaga 194  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||    
T  41308411 ggaagagtttgcaagatgccttgggttctaagttgagattgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattaga 41308312  T
Q  195 ggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtatt 294  Q
    ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||||| ||||||    
T  41308311 ggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacaattagcattcgagtatt 41308212  T
Q  295 ggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttc 394  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||  ||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| || ||||  ||  | ||||    
T  41308211 ggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcatgactcctttatgttggtttgagttgggagaaagtgtggtgttgggactggatttggttc 41308112  T
Q  395 agcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtt 494  Q
    | || ||||| ||||||||  | || ||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    ||||||||    
T  41308111 atcagactacggagaaagtcaaaataataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaagccccttgagtt 41308012  T
Q  495 tcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatat 594  Q
    ||| || |||||||| |||||| |||| || | ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  41308011 tcaagagggagaccatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtatgacgtgcattgaagtctaaaaagttgactcctaagtttattggtccgtat 41307912  T
Q  595 cagat 599  Q
    |||||    
T  41307911 cagat 41307907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 22361947 - 22362167
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |    
T  22361947 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagacccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaagatcta 22362046  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | | || |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  22362047 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacatatggtcagtcggagaggacgatttagttgttggaagatttgttcagagtttgtgtacttgagca 22362146  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtca 245  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22362147 aggaggaacttgggatagtca 22362167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 391 - 697
Target Start/End: Original strand, 19664945 - 19665251
Alignment:
Q  391 gttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttg 490  Q
    ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  19664945 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaagcccttg 19665044  T
Q  491 agtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtcc 590  Q
    ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19665045 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggggtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactcctaagttcattggtcc 19665144  T
Q  591 atatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 690  Q
     ||||||||||  || |  |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  19665145 gtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtatttcatgtgtcgcaacttcgg 19665244  T
Q  691 aagtatg 697  Q
    |||||||    
T  19665245 aagtatg 19665251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 296
Target Start/End: Original strand, 24099306 - 24099577
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  24099306 attgtgaagctacacggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttgcaagatgctttgggatcga 24099405  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  24099406 ggttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 24099505  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattgg 296  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  24099506 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattgg 24099577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 329
Target Start/End: Original strand, 19662844 - 19663143
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  19662844 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctagattttggaagagtttacaagatgctttgggttcga 19662943  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||        ||||| | ||||| ||||| ||    
T  19662944 agttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattgga-----aactgagagtgtgtgtgcttgaaca 19663038  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  19663039 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtatcggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 19663138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 280 - 697
Target Start/End: Original strand, 31550139 - 31550556
Alignment:
Q  280 tatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 379  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || |    
T  31550139 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgg 31550238  T
Q  380 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtag 479  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   | ||||   ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  31550239 gaccggatttagttcatgagactacggagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaag 31550338  T
Q  480 aaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaag 579  Q
    ||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| |||| |||| |||| ||||| || || ||||||||||| |  |||||||| || |||    
T  31550339 aaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaag 31550438  T
Q  580 ttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgt 679  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| ||  |||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||| || ||||| |    
T  31550439 ttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgttt 31550538  T
Q  680 cgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | || |||||||||||||    
T  31550539 ctcagcttcggaagtatg 31550556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 508 - 697
Target Start/End: Original strand, 50612602 - 50612791
Alignment:
Q  508 cacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaa 607  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |  ||||    
T  50612602 cacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaa 50612701  T
Q  608 aagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  50612702 gagttggaatggtggcatatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatg 50612791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Original strand, 31539703 - 31539920
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||      
T  31539703 gtgaaacttcatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaaaa 31539802  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  31539803 tgaagttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtacttgagcaagg 31539902  T
Q  228 aggaacttgggatagtca 245  Q
     ||| ||||||| |||||    
T  31539903 tggagcttgggacagtca 31539920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20139486 - 20139361
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||      
T  20139486 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttacaagaagctttaggttctg 20139387  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcat 150  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  20139386 agttgaggttgagtttggcgtatcat 20139361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 444 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 20244437 - 20244184
Alignment:
Q  444 gcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgta 543  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| || | ||||||||| |||||     
T  20244437 gcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggttactcctatgacgggtgtg 20244338  T
Q  544 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgc 643  Q
    |||| ||| |||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  || |  |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || |    
T  20244337 ggacatgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccatatcagatttcagagagggttggaacagtggcctatagagttggttttccac 20244238  T
Q  644 cgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  20244237 cacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 20244184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 20831107 - 20831642
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  20831107 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 20831206  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  20831207 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 20831306  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  20831307 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 20831406  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| |||||||| || || ||||| |   | || || || ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  20831407 acaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 20831506  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| ||||    
T  20831507 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgac 20831606  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     || || || |||||||| ||||  | |||||||||    
T  20831607 cggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgac 20831642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 583 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 21163378 - 21163264
Alignment:
Q  583 attggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgc 682  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  21163378 attggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgcacgacattttccatgtgtcgc 21163279  T
Q  683 aacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||||    
T  21163278 aacttcggaagtatg 21163264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 433 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 11382842 - 11382674
Alignment:
Q  433 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 532  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || || ||| ||||||||| ||||     
T  11382842 atgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctt 11382743  T
Q  533 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 601  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  11382742 tgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagattt 11382674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 433 - 697
Target Start/End: Original strand, 20075170 - 20075434
Alignment:
Q  433 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 532  Q
    ||||| || ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| | || |||| ||||     
T  20075170 atgaaagcttcgcaaagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctaagggtcactcctt 20075269  T
Q  533 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 632  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | ||| ||||| ||||| |||  |||    
T  20075270 tgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagtgggaacagtggcatataaagt 20075369  T
Q  633 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  20075370 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 20075434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20250446 - 20250376
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250446 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagaaatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgca 20250376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 20914854 - 20914319
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  || ||| | ||||||||||  ||||||||  | || ||||||||||    
T  20914854 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttctgggagagtttgcaagctgctttgggaactaacttgagattga 20914755  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||| ||    | |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| | || |||    
T  20914754 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagactgagaggactatttagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaaggtgtaagttg 20914655  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    | |      | | || ||||| ||||| || ||||| || | || |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  20914654 gaacgaaagtttaccattgattgagtttacttacaaaaacaattttcatactagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 20914555  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| ||||||||||| || ||||| |   | |||| ||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  20914554 acaccgttgtgttggtttgagtccggagaaagtgctatgttagaaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 20914455  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| | ||  | ||||| ||| |||||||||| |  || || || || |||||||| || | |||| ||||    
T  20914454 aggcgtctcagagtagagagaagagttatcattataaatggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtgac 20914355  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     ||||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  20914354 cggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 20914319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 520
Target Start/End: Original strand, 22135486 - 22135756
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 349  Q
    |||||||| || || || ||||| || |||| | |||||||||| |  |||||||| || |||||||| |||||||| || || || || || ||||| |    
T  22135486 ccgttgattgattttacttacaacaacagtttttattctagtatcgatatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaaggtgtaggacgccattgtgtt 22135585  T
Q  350 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 449  Q
    ||||||||||||||||||| |   | |||||||||||  |||| ||  |||||||  | |||||| ||||||| || | ||| ||||| ||||| |||||    
T  22135586 ggtttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccagaagttgtgcaagaaactacgaaaaaagttaagatgattcaggggaagatgaaagcgtctcagag 22135685  T
Q  450 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 520  Q
    | | || |||||||||||||| ||| | ||||| ||  || |||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  22135686 taggcagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattaagtttcaggttggtgaccatgtgtttttga 22135756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 523 - 697
Target Start/End: Original strand, 20395194 - 20395368
Alignment:
Q  523 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 622  Q
    |||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||||  ||||    
T  20395194 gtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgaggaatttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaatagtgg 20395293  T
Q  623 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || ||| | || || |||||||||||||    
T  20395294 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatatttctcagcttcggaagtatg 20395368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 406 - 559
Target Start/End: Original strand, 21202371 - 21202524
Alignment:
Q  406 gagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggag 505  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||  | || |||||||||||||| ||| | | ||| ||| ||||||||||||  || |    
T  21202371 gagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagaaggcagaagagttatcatgataagaggacaaaggatattgagtttcaggttggtg 21202470  T
Q  506 accacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 559  Q
    | ||  ||||||||||||| | |||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  21202471 atcatatgtttttgagagtgaatcctataaccggtgttggacgtactttgaagt 21202524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Original strand, 22135272 - 22135421
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||  || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||| ||  | |||||||| ||||    
T  22135272 catggtattccttatagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctatgttttgggaaagtttgcaagctgctttaggaactaagttgaggttga 22135371  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcag 186  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  22135372 gttctgcttatcatccccagaccgatgggcagacagagaggactattcag 22135421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 41353357 - 41353402
Alignment:
Q  17 tcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatc 62  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41353357 tcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatc 41353402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 46519004 - 46518830
Alignment:
Q  398 aaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttca 497  Q
    ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| || ||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| | || || ||| ||||||||||    
T  46519004 aaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagattaagacgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttca 46518905  T
Q  498 ggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| ||||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  46518904 agttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 46518830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20184792 - 20184683
Alignment:
Q  70 gatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagt 169  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||| | |||     
T  20184792 gatccgagatttacttctatgttttgggagagtttacaagtagctttgggaaccaagttgagattgagttctgcttatcattcccagactgataggcaga 20184693  T
Q  170 cggagaggac 179  Q
    | ||||||||    
T  20184692 cagagaggac 20184683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 588; Significance: 0; HSPs: 83)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 27187952 - 27187269
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187952 acatcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 27187853  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187852 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 27187753  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27187752 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 27187653  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187652 ctctgtatggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 27187553  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27187552 tcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgaagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtg 27187453  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27187452 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccgaaattcattggtccatatcagattttggaaagagttg 27187353  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187352 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 27187269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Original strand, 27261288 - 27261971
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261288 acatcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 27261387  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261388 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 27261487  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27261488 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 27261587  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261588 ctctgtatggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 27261687  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27261688 tcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgaagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtg 27261787  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27261788 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccgaaattcattggtccatatcagattttggaaagagttg 27261887  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261888 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 27261971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 2874570 - 2875251
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874570 atcaaggagattgtgaacttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 2874669  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874670 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 2874769  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2874770 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 2874869  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874870 ttatatggtcggagatgcagaaccccgttgtgctggtttgagtcgggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 2874969  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  2874970 ggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagattttgagtttcaagaaggagaccacgagtt 2875069  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  2875070 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaataagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 2875169  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2875170 acagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 2875251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Original strand, 28262962 - 28263645
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28262962 acatcaaagagattttgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 28263061  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28263062 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacggatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttattgagaatttgt 28263161  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263162 gttcttgagcaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 28263261  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263262 ctttatatggtcggatatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 28263361  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28263362 tcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtg 28263461  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  28263462 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 28263561  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263562 ggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 28263645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Original strand, 28341711 - 28342394
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28341711 acatcaaagagattttgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 28341810  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28341811 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacggatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttattgagaatttgt 28341910  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28341911 gttcttgagcaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 28342010  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342011 ctttatatggtcggatatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 28342110  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28342111 tcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtg 28342210  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  28342211 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 28342310  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342311 ggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 28342394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Original strand, 28292137 - 28292820
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292137 acatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 28292236  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28292237 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagttggagaggacaattcagtcactagaggatttattgagaatttgt 28292336  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292337 gttcttgagcaaggaggaacttcggacagtcatcttccattgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 28292436  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292437 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 28292536  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28292537 tcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtg 28292636  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28292637 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagttaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttg 28292736  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28292737 ggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 28292820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 25113066 - 25112385
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25113066 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 25112967  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25112966 tgggttcgaagttgagattaagttcggcctatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgt 25112867  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25112866 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 25112767  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25112766 ttatatggtcggagatgcagaattccgttatgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagcgatcgttcagcaaactactgagaaagttc 25112667  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25112666 agatgattcaagagaaaattaaagcgtcgcagagtcgacaaaagacttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatt 25112567  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||    
T  25112566 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagtcgga 25112467  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25112466 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcagaagtatg 25112385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 24312935 - 24313616
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24312935 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 24313034  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24313035 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 24313134  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24313135 tcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 24313234  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24313235 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 24313334  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24313335 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcataggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 24313434  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  24313435 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 24313534  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24313535 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 24313616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 29591687 - 29592368
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29591687 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgtcccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 29591786  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29591787 tgggttcgaagttgagagtgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 29591886  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  29591887 tctcgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaagct 29591986  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29591987 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 29592086  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29592087 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 29592186  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  29592187 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 29592286  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29592287 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 29592368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Original strand, 1542849 - 1543532
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1542849 acattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 1542948  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1542949 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttgttgagaatttgt 1543048  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1543049 gttcttgagcaaggaggagcttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttacaataatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 1543148  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1543149 ctttatatggtcggagatgcataactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 1543248  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    | ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1543249 taagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcccagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgcagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgta 1543348  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  1543349 tttttgagagtcactcctatgactggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtctgtatcagatattggaaagagttg 1543448  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1543449 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 1543532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 16626484 - 16627165
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16626484 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 16626583  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16626584 tgggttcaaagatgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaaaatttgtgt 16626683  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16626684 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaagct 16626783  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16626784 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactattgagaaagttc 16626883  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16626884 agatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 16626983  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  16626984 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 16627083  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16627084 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16627165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 5838986 - 5839667
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5838986 atcaaggaaattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagttagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 5839085  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5839086 tgggttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgt 5839185  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  5839186 tcttgagcagggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtataataatagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggct 5839285  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||      
T  5839286 ttgtatggtcggagatgtagaacttcgttgtgttggtttgaatcaggagatagggtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtca 5839385  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  5839386 agatgatttaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacacgtt 5839485  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  5839486 tttgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttgacttcgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 5839585  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5839586 acagtggcgtatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttacatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 5839667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 19865198 - 19864520
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19865198 aaggagattgtgaagtttcatggtgttcctacgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 19865099  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19865098 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggataggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtact 19864999  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 318  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19864998 tgagcaaggaggaacctgggctagtcatcttccgttgattgagttcacgtataataatagttatcattttggtattggaatggcaccttttgcggcttta 19864899  T
Q  319 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||    
T  19864898 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattggtcagcagactactgagaaggttaaga 19864799  T
Q  419 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 518  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19864798 tgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgcagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttt 19864699  T
Q  519 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 618  Q
     ||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| | ||||||||    
T  19864698 tagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagatttggaacg 19864599  T
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  19864598 gtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgtatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 19864520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Original strand, 25609640 - 25610309
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  25609640 gtgaagttgcatggtgttccttcgaccattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttctaagt 25609739  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25609740 tgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaagg 25609839  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  25609840 aggaacttgggatagtcatcttccattgataaagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgatgctttgtatggtcgg 25609939  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||    
T  25609940 agatgcagaactccattgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaag 25610039  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||     
T  25610040 agaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgagagtcac 25610139  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
     ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||| ||| |||| | ||||| ||||||||||||||| |||    
T  25610140 acctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgattccgagatttattggtccgtattagatatcggaaagagttggaacggtggcgtat 25610239  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25610240 cgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcgcgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 25610309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 18407718 - 18408391
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  18407718 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaaggtttacgtctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 18407817  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18407818 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagagggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagca 18407917  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaa-taatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18407918 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaaatactagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttatatgg 18408017  T
Q  324 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 423  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  18408018 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtattaggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagataatt 18408117  T
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  18408118 caagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaatagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtatttttgagag 18408217  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 623  Q
    | | || | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  18408218 taactcgtgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggc 18408317  T
Q  624 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  18408318 gtatcgggtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcactatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 18408391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 27331209 - 27331881
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  27331209 attgtgaagttgcatggtgttctttcgagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgagttcta 27331308  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  27331309 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtctgtcagagaggacgattcagtcgctagaggacttgttgagggtttgtgtgcttgagca 27331408  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  27331409 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagtgttcatgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 27331508  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |    
T  27331509 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagggtggttttaggacccgagaatgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattc 27331608  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  27331609 aagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggggatcacgtatttttgagagt 27331708  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||     
T  27331709 cactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttattggtccatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcg 27331808  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27331809 taccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttgatgtgtcgcaacttcggaagtatg 27331881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 27391949 - 27392621
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  27391949 attgtgaagttgcatggtgttctttcgagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgagttcta 27392048  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  27392049 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtctgtcagagaggacgattcagtcgctagaggacttgttgagggtttgtgtgcttgagca 27392148  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  27392149 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagtgttcatgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 27392248  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |    
T  27392249 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagggtggttttaggacccgagaatgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattc 27392348  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  27392349 aagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggggatcacgtatttttgagagt 27392448  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||     
T  27392449 cactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttattggtccatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcg 27392548  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27392549 taccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttgatgtgtcgcaacttcggaagtatg 27392621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 697
Target Start/End: Original strand, 22078478 - 22079136
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  22078478 catggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggctctaagttgaggttga 22078577  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||  || |||||||||||||||||    
T  22078578 gttcggcgtatcatccgcagacagatggttagtcggagaggacgattcagtcgctggaagatttgttgaaagtttgtgaactcgagcaaggaggaacttg 22078677  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22078678 ggatagtcatcttccattgataaagttcacgtacaataatagttat--ttctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcaga 22078775  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| | ||| || ||||    
T  22078776 actccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaaaagtggtcttaggactagagattgttcaacaaaccactgagaaggttaagatgattccagaaaagatga 22078875  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||     
T  22078876 aagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcttaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgat 22078975  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||| |||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22078976 tggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattcgtccgtatcagatatcggaaagagttggtacggtggcgtatcgagtgggt 22079075  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  22079076 ttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtagcaacttcggaagtatg 22079136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 22762231 - 22762903
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |  |    
T  22762231 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgccagaggctttaggttata 22762330  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  22762331 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaactgatggttagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagga 22762430  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||    
T  22762431 aggaggaacttgagatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttacgagactttgtgtggt 22762530  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||||||| |    
T  22762531 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtagtcttaggaccagagattgttcaacaaattacttagaaggttaagatgattc 22762630  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||| ||||| |  ||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  22762631 aagagaagatgaaagtttcggagagtcgacaatagagttacaatgataagcgtaggacagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttgtgagagt 22762730  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||| ||||     
T  22762731 cactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgaccccgagatttattggtccgaatcagatatcggaaagagttggaacgatggcg 22762830  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22762831 tatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcactttgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22762903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 16927416 - 16928088
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |    
T  16927416 attgtgaagttgcatggtattccttcgagcattgtatcaaatagagacccgagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggtacca 16927515  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  16927516 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaggatttgttgaggatttgtgtgctagagca 16927615  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||  ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16927616 agctggaacttgggacagtcatctcccgttaatagagttcacgtataacaatagctatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggt 16927715  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||||||| |    
T  16927716 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagggaaagtaaagatgattc 16927815  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16927816 aagaaaagatgaaagcgccgcagagtcgaaaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagt 16927915  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || || | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  16927916 cactcttgtgactagtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcg 16928015  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||  | || ||||| |||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  16928016 tatcgtcttggattaccaccgcatctttcgaattcgcacgatatattacatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 697
Target Start/End: Original strand, 16963155 - 16963815
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||    
T  16963155 catggtgttccttcgagcattatatcagatagagacccgagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggtaccaagttgaggttga 16963254  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| || |||||||| | ||||||    
T  16963255 gttcagcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagagaatttgttaaggatttgtgtgctagagcaaggtgaaacttg 16963354  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||| |||||||| ||||| || |||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16963355 ggacagtcatctcccgttaatagagttcacgtctaacaatagctatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcaga 16963454  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| || ||||    
T  16963455 actccgttgtgttgatttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtaaagatgattcaagaaaagatga 16963554  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  16963555 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccaagtgtttttgagagtcactcctgtgac 16963654  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||| ||||| || ||     
T  16963655 tggtgttggacgtgctttgaagtaaaagaagttgactccgagatttattggtccatatcagatatcggaaatagttggaacgatggcgtatcgtgttgga 16963754  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  16963755 ttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtattacatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16963815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 23078974 - 23078302
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| || |  |    
T  23078974 attgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagatttttgaagagtttacaagagtctttaggttata 23078875  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | ||  | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23078874 agttgaggttgagttcggcgtatcgtccgcagagagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttggaatacttgttgagagtttgtgtacttgagca 23078775  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23078774 aggaggaacttgggatagtcatcttccatttatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggt 23078675  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  23078674 cggagatgcataactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattc 23078575  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  23078574 aagaaaagatgaaagcatcgcagactcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagagggagatcacgtatttttgagagt 23078475  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||  || ||| || | |||||||| | ||||| ||||  |||||||||     
T  23078474 cactcctgtgactggtgttgggcgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagtttaaacggtggcg 23078375  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  23078374 tatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcaagaagtattacatgtatcgcaacttcggaagtatg 23078302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 230 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 12498326 - 12497859
Alignment:
Q  230 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggag 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12498326 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggag 12498227  T
Q  330 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagag 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12498226 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttaggacccgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagag 12498127  T
Q  430 aaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtc 529  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12498126 aaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 12498027  T
Q  530 ctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcg 629  Q
     | |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12498026 ttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcg 12497927  T
Q  630 agtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497926 agtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 12497859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 230 - 697
Target Start/End: Original strand, 12510575 - 12511042
Alignment:
Q  230 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggag 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12510575 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtatggtcggag 12510674  T
Q  330 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagag 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12510675 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagaatggtcttaggacccgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagag 12510774  T
Q  430 aaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtc 529  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12510775 aaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 12510874  T
Q  530 ctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcg 629  Q
     | |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12510875 ttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcg 12510974  T
Q  630 agtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510975 agtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 12511042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 22434378 - 22433929
Alignment:
Q  21 ggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggc 120  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22434378 ggaaatagtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctggattttggaagagtttgcaagaggctttgggt 22434279  T
Q  121 tcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttg 220  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||    
T  22434278 tctaagttgagattgagttcagcgtatcatccgcagacagatgattagtcggagaggacgattaagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgtacttg 22434179  T
Q  221 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 320  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22434178 agcaaagaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacttacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttata 22434079  T
Q  321 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22434078 tggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatg 22433979  T
Q  421 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 470  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433978 attcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 22433929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 230 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 12505655 - 12505188
Alignment:
Q  230 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggag 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  12505655 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgtcaccttttgaggttttttatggtcggag 12505556  T
Q  330 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagag 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  12505555 atgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagattggtcttaggacccgagattgttcatcatactactgagaatgttaagatgattcaagag 12505456  T
Q  430 aaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtc 529  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12505455 aatatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 12505356  T
Q  530 ctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcg 629  Q
     | |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12505355 ttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcg 12505256  T
Q  630 agtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505255 agtgggattaccaccgcatctttcgatttttcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 12505188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 271 - 697
Target Start/End: Original strand, 25765312 - 25765737
Alignment:
Q  271 aataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  25765312 aataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgagtcaggtgaaaaag 25765411  T
Q  371 tggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  25765412 tggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtaaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatga 25765511  T
Q  471 caagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 570  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25765512 taagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgcttttgagagtca-cgctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttg 25765610  T
Q  571 accccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttt 670  Q
    || ||||  || |||||||  |||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |    
T  25765611 actccgagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggtgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgtgt 25765710  T
Q  671 tccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25765711 tccatgtgtcgtaactttggaagtatg 25765737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 25768696 - 25768024
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |    
T  25768696 attgtgaagttacatggagttccatcgagtattgtgtccgatagagatccgaggtttaattcaagattttggaagagtttccaagatgccttgggttcaa 25768597  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  | ||||||||| | ||| | ||||| ||||||||    
T  25768596 agttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaaaacgattcagtcattcgaggatttgctaagagtgtgtgtgcttgagca 25768497  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||    
T  25768496 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaactgttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtgtggt 25768397  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  | ||||| |||||||| ||||| ||  || ||||      
T  25768396 cggaggtgcaggactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtctttggaccggatttagttcatcaaactacggagaaggtcaagttgataa 25768297  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||    
T  25768296 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagt 25768197  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || || |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||||| || ||||| |  || | ||||||||| |||||     
T  25768196 cactcttatgacgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaaattgacttcaaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggca 25768097  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||||||||| || || |||||||| ||||||||  |||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  25768096 tacagagtgggtttgccaccacatctttccaatttgcatgatgtgtttcacgtgtcgcagcttcggaagtatg 25768024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17032876 - 17032589
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17032876 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattga 17032777  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17032776 gttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggaaaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgttcttgaacaaggaggaacttg 17032677  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17032676 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttacactaatagttatcattctagtatcagaatggcaccttttgaagctttatatggt 17032589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 21472106 - 21471434
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  21472106 attgtgaagtttcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagtttgcaagatgccttgggttcaa 21472007  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||||| ||  | ||| | ||||| ||||||||    
T  21472006 agttgagattgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtgggagagaactattcagtcattagaggactttctaagagtgtgtgtacttgagca 21471907  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||     
T  21471906 aggtggagcttgggatagtcatttaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgga 21471807  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |  || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||| ||  || | ||      
T  21471806 cggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgcagtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagttaataa 21471707  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||    
T  21471706 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagt 21471607  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||| |  || | ||||||||| |||||     
T  21471606 cactcctatgacgggggtaggacgtgcgttgaaatctaagaagttgactccgaagtttattgatccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggca 21471507  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21471506 tacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21471434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 15459838 - 15459204
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| || || || ||||| || || |    
T  15459838 gtgaagttgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggaggagtttacaggacgcgttgggttcaaaat 15459739  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||  | ||  | ||||| |||||||| ||    
T  15459738 tgaagttgagttcggcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttactaagggtatgtgtacttgagcaggg 15459639  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  15459638 tggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaataacagttatcattcaagtattggtatggcaccatttgaagctttatatggtcgg 15459539  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || |||||  | || ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||   ||||||   ||    
T  15459538 aggtgtaggactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcacgagactacggagaaagtcaggatgattagag 15459439  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| || |     
T  15459438 agaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttac 15459339  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||| |||    
T  15459338 tcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtat 15459239  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
     ||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  15459238 agagtgggattaccacctcatctttcgaatttgca 15459204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 17415991 - 17415365
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  17415991 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattttggaagagcttgcaagatgcattgggttcga 17415892  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||  | ||||||||| ||| | | ||||| ||||||||    
T  17415891 agttgaggttaagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgaagaggacgatccaatcattggaggatttgctgatagtgtgtgtacttgagca 17415792  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  17415791 aggtggagcttgggatagtcacctaccgtcgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattgatatgacaccgttcgaagctttgtatggt 17415692  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||| || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||      
T  17415691 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcagaagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataa 17415592  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||    
T  17415591 gggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttatgagagt 17415492  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  17415491 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggca 17415392  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctt 651  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||    
T  17415391 tatagagtgggtttgccaccgcatctt 17415365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 19879803 - 19879131
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19879803 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacatctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggctcga 19879704  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||  |||||||| | |||||  | ||||| ||||||||    
T  19879703 agttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggacagtcagagaggacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttgagca 19879604  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || |||||     
T  19879603 aggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatgga 19879504  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    || || ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||| | || || ||||| || ||||| |||||||| || || ||| || | ||      
T  19879503 cgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgaatcgggagaaagtgtgatgttggggccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagttaataa 19879404  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||  | ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  19879403 gagaacagatgaaagggtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagt 19879304  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||| | |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||||||||| ||||||    
T  19879303 cactcctatggcaggtgtaggccgtgcattgaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggct 19879204  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  19879203 tatagggtgggtttaccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaagtatg 19879131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 638
Target Start/End: Original strand, 14381243 - 14381856
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||  |||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  14381243 attgtgaagctacatggagtaccgtcgagtattgtgtcgaatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggttcga 14381342  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  14381343 agttgaggttgagttcagcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatcaaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttaagca 14381442  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  14381443 aggtggaacttgggacagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 14381542  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||| || ||||||||||||||| | || || || || || ||| | ||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||      
T  14381543 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcatgagagagtgtcgtgttgggatcggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataa 14381642  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  14381643 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtggacagaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggt 14381742  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||| |  |||||||| |||||     
T  14381743 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggca 14381842  T
Q  625 tatcgagtgggttt 638  Q
    ||| |||| |||||    
T  14381843 tatagagttggttt 14381856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 21563908 - 21564580
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| |  ||||||||| | || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  21563908 attgttaagcttcatggtgtacggtcgagtattgtgtaggatagagattcgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 21564007  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  21564008 agttgaggttgagttcgacttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtatgtgtacttgagca 21564107  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||  || ||||| ||||| || |||    
T  21564108 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacctacatcaatagttaccattcgagtattggtatggttccgttcgaagctttgtacggt 21564207  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| | || |||||||| || |||||||| ||||   | || ||| || ||||      
T  21564208 cggaggtgccggactcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactaaaaaaaaggttaagttgataa 21564307  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  21564308 gagaacagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagctatcatgacaaacgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagt 21564407  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  21564408 cactcctttgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcg 21564507  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  | || || |||||||| ||| | ||||||||||    
T  21564508 tatagagtgggtttgccgcctcatctttagaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattacggaagtatg 21564580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 22796408 - 22797080
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  22796408 attgtgaagttgcatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcta 22796507  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| || ||||| |||  |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  22796508 agttgaggttgagttcggcttatcattcgcaaacatatggtcagtcggagagaacgattcaatcgtcagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 22796607  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| |||  |||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||| || |||    
T  22796608 aggtggagattgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtacggt 22796707  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || || ||  |||| ||  | ||||| || ||||| ||||| ||| |||||||      
T  22796708 cggaggtgcaggactcctttatgttgatttgagtcaggagagagtgtagtgttgcgaccggatttggttcatcagactacagagaaggttaagatgataa 22796807  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||    
T  22796808 gggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtctacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagt 22796907  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||  ||||| || |  || |  |||||||| |||||     
T  22796908 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttgactcctaagtttattggtctgtatcatatatctgagagggttggaacagtggca 22797007  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22797008 tatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22797080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 662
Target Start/End: Original strand, 34645362 - 34645999
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  34645362 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagggatccaaggtttacttcaagattttggaagagtttacaagatgcgttgggatcga 34645461  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||    
T  34645462 aattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagca 34645561  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| | |||||||| ||  | |||||||| || || || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||||    
T  34645562 aggtggagcgtgggatagccacttaccgttgatagaatttacttataacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggt 34645661  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || ||||      
T  34645662 cgcagatgcaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagttgataa 34645761  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||    
T  34645762 gagaacatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggt 34645861  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||||||||| |||||     
T  34645862 cactcctatgacaggtgtgggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaactgtggcg 34645961  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
    ||| || | || ||||| || |||||||||||||||||    
T  34645962 tatagaattggattaccacctcatctttcgaatttgca 34645999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 680
Target Start/End: Original strand, 11280277 - 11280936
Alignment:
Q  21 ggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggc 120  Q
    ||||||||||||| | |||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11280277 ggaaattgtgaagttgcatggtattacatcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacatctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggc 11280376  T
Q  121 tcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttg 220  Q
    ||||| |||||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||  |||| ||| | |||||  | ||||| ||||    
T  11280377 tcgaaattgaggctgagttcggcttaccatcctcagaccgatggccagtcagagaggacaatgcaatccttagaagatcttttgagggtgtgtgtacttg 11280476  T
Q  221 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 320  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||  || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  11280477 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgacagaatttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgta 11280576  T
Q  321 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatg 420  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || |     
T  11280577 tgatcgaagatgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagtta 11280676  T
Q  421 atccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 520  Q
    ||   |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  11280677 ataagagaacatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttga 11280776  T
Q  521 gagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 620  Q
    || |||  |||||||| |||||||||| ||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||||||||| ||    
T  11280777 gaatcacacctatgacaggtgtaggacatgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagt 11280876  T
Q  621 ggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtc 680  Q
    ||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||||||    
T  11280877 ggcttatagggtgggtttaccccctcatctttcaaatttgcatgacgtgttccatgtgtc 11280936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 697
Target Start/End: Original strand, 27560394 - 27561065
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  27560394 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 27560493  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  | || || ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  27560494 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 27560593  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  27560594 ggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 27560693  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    | || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||||||      
T  27560694 gaaggtgcaggactccattgtgttggtttgaatcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttagttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcag 27560793  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| | |||||     
T  27560794 ggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtt 27560893  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctt 625  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |   ||||||||||||| |    
T  27560894 actccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcat 27560993  T
Q  626 atcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||  | ||||||||||    
T  27560994 atagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgttccacgtgtcacagttgcggaagtatg 27561065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 90 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 1641212 - 1640715
Alignment:
Q  90 attttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcg 189  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1641212 attttggaaaagtttgcaagaggcgttgggttcaaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcg 1641113  T
Q  190 ctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcta 289  Q
     ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  1641112 ttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcga 1641013  T
Q  290 gtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagat 389  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||  | || |||||||| ||    
T  1641012 gtattggtatggcaccgttcgaagctttgcatggacggaggtgcagaactccgttatgttggtttaagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatat 1640913  T
Q  390 tgttcagcaaactactgagaaagttcaga-tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatct 488  Q
     ||||| || ||||| || |||| ||| | ||||   |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1640912 agttcatcagactacaga-aaaggtcaaattgataagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggacct 1640814  T
Q  489 tgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattgg 587  Q
    ||| ||| |||||||||| || |||||| | |||||||  ||| |||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||    
T  1640813 tgaattttaggaaggagatcatgtgtttctaagagtcacccctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgaccccgaggtttattgg 1640715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 10468625 - 10469297
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  10468625 attgtgaagctgcacggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttttggaagagtttacaggatgctttgggttcga 10468724  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| || |||||    
T  10468725 aattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctcgagca 10468824  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| | | ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||    
T  10468825 aggtgaagcttgggatagtcacctaccgttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggt 10468924  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||      
T  10468925 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataa 10469024  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  10469025 gagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggt 10469124  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| |||||     
T  10469125 cactcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaactgtggca 10469224  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || |||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  10469225 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacctgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 10469297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 601
Target Start/End: Original strand, 28282590 - 28283165
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  28282590 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 28282689  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  | || || ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  28282690 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 28282789  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  28282790 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 28282889  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||  | ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||||||      
T  28282890 gaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcag 28282989  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| | |||||     
T  28282990 agagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtg 28283089  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 601  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  28283090 actccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggcccgtatcagattt 28283165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 18795195 - 18794558
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  18795195 attgtgaagatgcatggtgttccgtcgagtactgtgtcagatagagatccgaggttcacttctagattatggaagcgtttgcaagatgctttgggttcga 18795096  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | |||||  |||||| ||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || ||  |||||||| |  ||||| | ||||| ||||||||    
T  18795095 aattgaggctgagtttggcttatcatcctcatacggatggtcaatcggagaggacgatacaatctttagaggatctactgagagtgtgtgtacttgagca 18794996  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || || |||    
T  18794995 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacctacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccatttgaagccttgtacggt 18794896  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    || || |||| |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||| | || || ||||| || || || || ||||| || || ||| || ||||      
T  18794895 cgaaggtgcataactcctttgtgttggtttgagttaggagaaagtgtgatgttggggccagacatagtgcaacagactacagaaaaggttaagttgataa 18794796  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  18794795 gagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaatcgtaggaaagaccttcagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagt 18794696  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |   | |  |||||||| |||||     
T  18794695 cactcctatgacaggtgtaggccgtgccttaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctaagagggttggaacagtggca 18794596  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  18794595 tatcgagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgca 18794558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 24364914 - 24364245
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  24364914 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcgaatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 24364815  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  24364814 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcgttggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaagg 24364715  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||| | ||||| || || |||||||||    
T  24364714 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcatcgttcgaagccttgtatggtcgg 24364615  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||  |||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||   ||    
T  24364614 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgagtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagag 24364515  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||     
T  24364514 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 24364415  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| || |||||  ||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| |||    
T  24364414 tcctttgacgggtgttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatat 24364315  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  24364314 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 24364245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 212 - 697
Target Start/End: Original strand, 8766111 - 8766596
Alignment:
Q  212 gtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcga 311  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  8766111 gtgttcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcga 8766210  T
Q  312 ggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaa 411  Q
     ||||| |||||| |||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||| || || || || |  ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||    
T  8766211 agctttgtatggttggaggtgcaggactcatttatgctggtttgagtcaggagagagtgtcgtgtggggaccggatttggttcatgagactacagagaaa 8766310  T
Q  412 gttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacg 511  Q
    ||  ||||||||  ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || |    
T  8766311 gtcaagatgatcagagaaaagatgaaggcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatg 8766410  T
Q  512 tgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagt 611  Q
    ||||| |||| || | | |||||||  | ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  ||    
T  8766411 tgtttctgagggttacttctatgacaagggtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggt 8766510  T
Q  612 tggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8766511 tggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 8766596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19453925 - 19453513
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  19453925 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattatgtcggatagggatccgaggttcacctctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 19453826  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||   |||| | ||||| ||||||||    
T  19453825 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatctaatcattggaggatttacagagagtgtgtgtgcttgagca 19453726  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  19453725 aggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcgcatacaacaacaattaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 19453626  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||     
T  19453625 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagatttggttcatcagactacagagaaagttaagatgatca 19453526  T
Q  425 aagagaaaatgaa 437  Q
     |||||| |||||    
T  19453525 gagagaagatgaa 19453513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 440 - 697
Target Start/End: Original strand, 21833172 - 21833429
Alignment:
Q  440 cgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactgg 539  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21833172 cgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactgg 21833271  T
Q  540 tgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggttta 639  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| |||||||| | ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  21833272 tgttggaggtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttataggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggatta 21833371  T
Q  640 ccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833372 ccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21833429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 510 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 17032582 - 17032395
Alignment:
Q  510 cgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaa 609  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| |    
T  17032582 cgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaaga 17032483  T
Q  610 gttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032482 gttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 17032395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 310 - 697
Target Start/End: Original strand, 18197608 - 18197995
Alignment:
Q  310 gaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgaga 409  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |  ||||| |||||||||| ||||||| | || ||||||||||    
T  18197608 gaggctttgtatggtcggaggtgcagaactccgttgtgttcgtttaagtcaggtgagaatgtggttttaggaccagcgattgtttaacagactactgaga 18197707  T
Q  410 aagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagacca 509  Q
    | ||  |||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||| || ||| | ||    
T  18197708 aggtaaagatgatttaagaaaagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtcggaaagaccttaagtttcaagagggatatca 18197807  T
Q  510 cgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaa 609  Q
     || ||| ||| ||||| || | ||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||| |||| | ||||| |    
T  18197808 tgtatttctgaaagtcactcttgtgacaagtgtaggacgcgaattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtctgtataagatatcggaaaga 18197907  T
Q  610 gttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||  ||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  18197908 atttaaacagtggcgtatcgagtgggtttgccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtttcgcaacttcggaagtatg 18197995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 352
Target Start/End: Original strand, 5296982 - 5297308
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  5296982 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcga 5297081  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | ||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  5297082 aattgaggttgggttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 5297181  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| | ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  5297182 aggtggagc-tgggatagtcacctaccgttgatagaattcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 5297280  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggt 352  Q
    ||||| || || ||||| || |||||||    
T  5297281 cggaggtgtaggactcctttatgctggt 5297308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 347
Target Start/End: Original strand, 27559765 - 27560086
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  27559765 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 27559864  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  | || || ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  27559865 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 27559964  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  27559965 ggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 27560064  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtg 347  Q
    | || ||||| ||||| |||||    
T  27560065 gaaggtgcaggactccattgtg 27560086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 433 - 697
Target Start/End: Original strand, 14131363 - 14131627
Alignment:
Q  433 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 532  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||| |||||    
T  14131363 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggacctggagtttcaggaaggagatcatgtgtttctgagggtcactccta 14131462  T
Q  533 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 632  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |  || | ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  14131463 tgacaggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgacttcgaagtttattggtccgtatcagatatctgagagagttggaacagtggcatatagagt 14131562  T
Q  633 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||| || |  |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  14131563 gggtttgccacaacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcagttacggaagtatg 14131627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 211 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 18801261 - 18800873
Alignment:
Q  211 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcg 310  Q
    ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || |||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||  | ||||    
T  18801261 tgtgtactagagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgtttatagagttcatttacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcctcgttcg 18801162  T
Q  311 aggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaa 410  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| |||||    
T  18801161 aagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagttaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaa 18801062  T
Q  411 agttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccac 510  Q
    |||  |||||||   ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || || || ||     
T  18801061 agtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggggatcat 18800962  T
Q  511 gtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 599  Q
    || ||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  18800961 gtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaagacgtgaattgaagtcgaagcagttgacttcaaagttcattggtccatatcagat 18800873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 439 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 25750900 - 25750642
Alignment:
Q  439 gcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactg 538  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||| || | |||| |    
T  25750900 gcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcttgtgacgg 25750801  T
Q  539 gtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggttt 638  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |  || | ||||||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  25750800 gtgtaagacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggttt 25750701  T
Q  639 accgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     || || |||||||||||||||||  || | || ||||||||||| |||||||||||||    
T  25750700 gccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcatcttcggaagtatg 25750642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 331 - 680
Target Start/End: Original strand, 11287680 - 11288029
Alignment:
Q  331 tgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagaga 430  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || | ||   |||      
T  11287680 tgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacagaaaaggttaagttaataagagaac 11287779  T
Q  431 aaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcc 530  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||  ||    
T  11287780 atatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcacccc 11287879  T
Q  531 tatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcga 630  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||||||||| ||||||||| |     
T  11287880 tatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagg 11287979  T
Q  631 gtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtc 680  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||  | || |||||||||||    
T  11287980 gtgggtttaccccctcatctttcaaatttgcatgacgtgttccatgtgtc 11288029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15896599 - 15896383
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | || || |    
T  15896599 attgtgaagctacatggtgttccgtcgagcattgtatcagatagagatgtgaggtatacttctatattttggaagagtttgcaagaggctgtaggttcta 15896500  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || |  ||||||||| | || || ||||||||| ||||||| || |||||    
T  15896499 agttgaagttgagttcggcgtatcatccgcagacagataatcagtcggaaagaatgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtactagagca 15896400  T
Q  225 aggaggaacttgggata 241  Q
    |||||||||||||||||    
T  15896399 aggaggaacttgggata 15896383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 244
Target Start/End: Original strand, 21569767 - 21569986
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||| |  ||||||||| | || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  21569767 attgttaagcttcatggtgtacggtcgagtattgtgtaggatagagattcgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 21569866  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  21569867 agttgaggttgagttcgacttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtatgtgtacttgagca 21569966  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtc 244  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  21569967 aggtggagcttgggatagtc 21569986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 424 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 11291918 - 11291818
Alignment:
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11291918 caagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 11291819  T
Q  524 t 524  Q
    |    
T  11291818 t 11291818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 16382161 - 16382696
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  16382161 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 16382260  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  16382261 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 16382360  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  16382361 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 16382460  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  16382461 acaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 16382560  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| ||||    
T  16382561 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgac 16382660  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     || || || |||||||| ||||  | |||||||||    
T  16382661 cggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgac 16382696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Original strand, 21836964 - 21837079
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21836964 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 21837063  T
Q  116 tgggctcgaagttgag 131  Q
    | || || ||||||||    
T  21837064 taggttctaagttgag 21837079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Original strand, 8762709 - 8762862
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  8762709 attgtgaagctacatggcgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagcttgcaagatgcattgggttcga 8762808  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 178  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8762809 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagga 8762862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 116
Target Start/End: Original strand, 20637077 - 20637168
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcttt 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20637077 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcttt 20637168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 131
Target Start/End: Original strand, 18197504 - 18197610
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  18197504 attgtgaagctacatggtgttccatcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 18197603  T
Q  125 agttgag 131  Q
    |||||||    
T  18197604 agttgag 18197610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 16098543 - 16098008
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| | ||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  16098543 catggtataccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 16098444  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| |||    ||||||| ||||||    | || ||||||||||||  |||| |  | |||||||| |  | |||    
T  16098443 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagaaaaagaggactattcagagtttggaagatttgttgagagcttgtatgttggagcaaggtgttagttg 16098344  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||     | | |||||||| ||||| || ||||| || | || |||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| || ||     
T  16098343 ggatgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtatcggtatggctccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtagg 16098244  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | |||||  | || ||| |||||||||||||||| ||||    
T  16098243 acaccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgccttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacataaaaggttaagatgatccaagagaagatga 16098144  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | |||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |||||||||||||| |  ||| ||||    
T  16098143 aagcgtcttagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaacctgtgac 16098044  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     ||||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  16098043 cggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 16098008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 23996741 - 23996206
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||  || ||||||||||  |||||| || |||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  23996741 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatctgaggtttacttctaagttttgggaaggtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 23996642  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |    |||    
T  23996641 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagatggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttagagcaaggtgttggttg 23996542  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
     ||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||||||||| || ||     
T  23996541 agacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcactgtttgaggccttgtatggtcggaggtgtagg 23996442  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  23996441 acaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 23996342  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | || || ||| |||||||||| |  || || ||||||||||| || || | |||||||||    
T  23996341 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacgtgtttttaagggtgaatcctatgac 23996242  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     || || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  23996241 cggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 23996206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 25742876 - 25743410
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||  || ||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  25742876 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatctgaggtttacttctacgttttgggagagtttacaagctgctttgggaactaagttgagattga 25742975  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    | ||  | || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||  ||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  25742976 gatctacttaccatcctcagaccgatgggcagacggagaggactatctagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 25743075  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | ||||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  25743076 ggacgaatgtttaccgttaattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattggaatggctccgtttgaggctttgtatggtcggagctgtagg 25743175  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtct-taggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatg 435  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||  |||| | | ||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| |||||||| |||    
T  25743176 acaccgttgtgttggtttgagtcaggtgaa--agtgctttgtaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatg 25743273  T
Q  436 aaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatga 535  Q
    |  ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| |  | || | |||    
T  25743274 agagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcaagtgtttttgagggagaatcttgtga 25743373  T
Q  536 ctggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    | ||||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  25743374 ccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 25743410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 572
Target Start/End: Original strand, 15078365 - 15078687
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 349  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| || |  || |||||||| |    
T  15078365 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattggaatggcaccgtttgaggctttgtatgatcggaggtgtaagacaccgttgtgtt 15078464  T
Q  350 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 449  Q
    ||||||||||||| ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||    
T  15078465 ggtttgagtcaggagaaagtgccttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatccgagaaaagatgaaagcgtctcagag 15078564  T
Q  450 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 549  Q
    | |||| |||||||||||||| |||   ||||| ||| | ||||||||||  || || || || ||||||||| | | |||  |||||||||| || |||    
T  15078565 tagacataagagttatcatgataagaagagaaaggatatcgagtttcaggttggtgatcatgtatttttgagactgaatccagtgactggtgttggtcgt 15078664  T
Q  550 gctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  15078665 gctttgaagtgtaggaagttgac 15078687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 603 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 22433924 - 22433830
Alignment:
Q  603 ggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22433924 ggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22433830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 452 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 25751024 - 25750908
Alignment:
Q  452 gacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgc 551  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  25751024 gacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcctgtgacgggtgtaggacgtgc 25750925  T
Q  552 tttgaagtcaaagaagt 568  Q
     ||||| || |||||||    
T  25750924 gttgaaatctaagaagt 25750908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 18837696 - 18838231
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||| ||||    
T  18837696 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaatttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagtttga 18837795  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | || ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  18837796 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaagatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 18837895  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | || ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  18837896 ggacgaatgtttaccattgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatccgaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 18837995  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || || |   | |||| ||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||    
T  18837996 acaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctatgttagcaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagaaaagatga 18838095  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| ||||||  | | |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||| | || | |||| ||||    
T  18838096 aggcgtctcagagtacatagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgtgggtgaatcctgtgac 18838195  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     ||||| || | |||||||||||  | |||||||||    
T  18838196 cggtgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgac 18838231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 559
Target Start/End: Original strand, 21412939 - 21413248
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 349  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||| |||||||| ||| || |||||||  || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  21412939 ccgttgattgagtttacttacaataacagttttcattctaatatcggtatggcactgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 21413038  T
Q  350 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 449  Q
    ||||||| || || ||||| |   | |||||||| |   |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  21413039 ggtttgaatccggagaaagcgcattgttaggaccgggagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtctcagag 21413138  T
Q  450 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 549  Q
    | |||  |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || ||  |||| ||| |||| | |||| | |||||||| || |||    
T  21413139 tagaccgaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatatgttcttgtgagtgaatcctgtaactggtgttggtcgt 21413238  T
Q  550 gctttgaagt 559  Q
    ||||||||||    
T  21413239 gctttgaagt 21413248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 251 - 559
Target Start/End: Original strand, 1648786 - 1649094
Alignment:
Q  251 cgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctg 350  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||    
T  1648786 cgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttg 1648885  T
Q  351 gtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagt 450  Q
    ||||||||| || || |  |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || || || ||||||||||| ||||||    
T  1648886 gtttgagtccggagagaatgctttattaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagt 1648985  T
Q  451 cgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtg 550  Q
     |||| ||||| |||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| || || || ||||    
T  1648986 agacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtg 1649085  T
Q  551 ctttgaagt 559  Q
    |||||||||    
T  1649086 ctttgaagt 1649094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18572144 - 18571684
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||  || ||||| ||||||   ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  18572144 catggtattccttatagtattgtgtcagatcaggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaaccaagttgagattga 18572045  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
     ||| || || ||||| ||||| |||||  |  |||||||||| || ||     | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  18572044 tttctgcttaccatcctcagaccgatgggaaaacggagaggactatccaaagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgttagttg 18571945  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||     || | | ||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||| | || || |||||||| |||||| |||| || ||     
T  18571944 ggacgaatatttacagttaattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatgactccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtagg 18571845  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || | |||||| |||||||||||||||||||| |   | ||| |||||||  || | ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||||| ||    
T  18571844 acactgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgctttattaagaccagaagttatgcaagaaactacggaaaatgttaagatgattcaggagaaaagga 18571745  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttca 497  Q
    | ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  18571744 aagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 18571684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 22442776 - 22442710
Alignment:
Q  21 ggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttct 87  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22442776 ggaaatagtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttct 22442710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 25655760 - 25655456
Alignment:
Q  252 gttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctgg 351  Q
    |||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| | ||||  |||||| |||| ||| ||||||||||| || || |   ||||||| |||    
T  25655760 gttgatggagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcgaaatgaaaccttttgaggatttgtatggtcggaggtgtaggatgtcgttgtgttgg 25655661  T
Q  352 tttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtc 451  Q
    |||||||||| |||||| |   | |||||| ||||  |||| ||  | ||||   | |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  25655660 tttgagtcag-tgaaagtgctttgttaggatcagaagttgtgcaagagactaagaaaaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagta 25655562  T
Q  452 gacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgc 551  Q
    |||| |||||||||||| | ||| | ||||| ||  ||||||||||||  || || || |||||||||||||| | ||  || |||||||| || |||||    
T  25655561 gacagaagagttatcataataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatctgataactggtgttggtcgtgc 25655462  T
Q  552 tttgaa 557  Q
    ||||||    
T  25655461 tttgaa 25655456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16233471 - 16233242
Alignment:
Q  268 tacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaa 367  Q
    ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||||||||| || || |    
T  16233471 tacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagaga 16233372  T
Q  368 gagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatca 467  Q
    | |   | |||||||  ||  |||| ||  | ||||| || || ||| |||| || ||||| || ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||    
T  16233371 gtgctttgttaggactggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagattattcaagaaaagatgaaggcgtctcaaagtagacagaagagttatca 16233272  T
Q  468 tgacaagcgtagaaaagatcttgagtttca 497  Q
    ||| ||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  16233271 tgataagaggagaaaggatattgagtttca 16233242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 609 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 18787809 - 18787721
Alignment:
Q  609 agttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||  | ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18787809 agttggaacagtggcatatagagtgggtttgccatcacatatttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 18787721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 140
Target Start/End: Original strand, 23027522 - 23027607
Alignment:
Q  55 attgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttc 140  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  23027522 attgtgtcagatagggatccgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagatgctttgggaactaagttgaggttgagttc 23027607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 619 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 1640710 - 1640634
Alignment:
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagta 695  Q
    ||||| ||| |||||| ||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1640710 gtggcatatagagtggatttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagta 1640634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1652353 - 1652274
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggag 329  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  1652353 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggctccgtttgaggctttgtatggtcggag 1652274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21927698 - 21927577
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||  | |||||||| ||||    
T  21927698 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgcattgggaactaagttgaggttga 21927599  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagac 158  Q
    |||| || |||||||| |||||    
T  21927598 gttctgcttatcatccccagac 21927577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Original strand, 1648602 - 1648722
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  1648602 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 1648701  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcaga 157  Q
    |||| || || ||||| ||||    
T  1648702 gttctgcttaccatcctcaga 1648722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Original strand, 14625068 - 14625216
Alignment:
Q  79 tttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 178  Q
    ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||| ||    
T  14625068 tttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaaattgagattgagttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagatga 14625167  T
Q  179 caattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    | ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  14625168 ctattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaagg 14625216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 588; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 8387064 - 8386381
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8387064 acatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 8386965  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386964 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 8386865  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  8386864 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcgccgttcgaag 8386765  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386764 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 8386665  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8386664 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtg 8386565  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  8386564 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 8386465  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8386464 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 8386381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 582; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 14303340 - 14304020
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303340 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 14303439  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14303440 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcatatcatccgcagacagatggttagtcggagaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgt 14303539  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303540 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcatgctagtattggaatggcacctttcgaggct 14303639  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14303640 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttc 14303739  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14303740 ggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 14303839  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  14303840 tttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttga-cccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 14303938  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14303939 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 14304020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 18297855 - 18297174
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18297855 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagatttcggaaaagtttgcaagaggcct 18297756  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297755 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 18297656  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18297655 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 18297556  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297555 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 18297456  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18297455 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 18297356  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  18297355 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 18297256  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18297255 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 18297174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Original strand, 29038764 - 29039447
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29038764 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 29038863  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29038864 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 29038963  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  29038964 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaag 29039063  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039064 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 29039163  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29039164 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtg 29039263  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  29039264 tttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 29039363  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29039364 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 29039447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 697
Target Start/End: Original strand, 19778157 - 19778836
Alignment:
Q  18 caaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttg 117  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19778157 caaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggccttg 19778256  T
Q  118 ggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttc 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778257 ggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagttgctagaggatttgttgagaatttgtgttc 19778356  T
Q  218 ttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19778357 ttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggcttt 19778456  T
Q  318 atatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcag 417  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778457 gtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcag 19778556  T
Q  418 atgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttt 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19778557 atgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttt 19778656  T
Q  518 tgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaac 617  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  19778657 tgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaac 19778756  T
Q  618 ggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19778757 ggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 19778836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 40473690 - 40473009
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473690 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 40473591  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40473590 tgggtttgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgt 40473491  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473490 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttattattctagtattggaatggcacctttcgaggct 40473391  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40473390 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccggagattgttcagcaaactactgagaaagttc 40473291  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40473290 aaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatt 40473191  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||    
T  40473190 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtctgtatcagatattggaaagagttgga 40473091  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40473090 acgatggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 40473009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 12477252 - 12476569
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12477252 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 12477153  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12477152 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgcaagaggatttgttgagaatttgt 12477053  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12477052 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 12476953  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12476952 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgaggaagt 12476853  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12476852 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtg 12476753  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  12476752 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 12476653  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12476652 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtatcgcaacttcgaaagtatg 12476569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 27711986 - 27711305
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27711986 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 27711887  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711886 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatctgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 27711787  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27711786 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagact 27711687  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711686 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 27711587  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27711586 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 27711487  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  27711486 tttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 27711387  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27711386 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcaaaagtatg 27711305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 12524328 - 12523645
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12524328 acatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 12524229  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12524228 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgt 12524129  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12524128 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 12524029  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12524028 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggttttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 12523929  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12523928 taagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtg 12523829  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  12523828 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttg 12523729  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12523728 gaacggtggcgtatcgagttggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 12523645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 23956397 - 23955716
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23956397 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 23956298  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23956297 tgggttcgaagttgagattaagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 23956198  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23956197 tcttgaacaaggaggaacttaggaccgtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggcc 23956098  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23956097 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 23955998  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23955997 agatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 23955898  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  23955897 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 23955798  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23955797 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcataacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 23955716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 8052985 - 8053666
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8052985 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 8053084  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8053085 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 8053184  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  8053185 tcttcagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggcc 8053284  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8053285 ttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtttgaatcaggagagagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttc 8053384  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8053385 agatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaagagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtt 8053484  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||    
T  8053485 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatactggaaagagttgga 8053584  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8053585 acgatggcttaccgtgtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 8053666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 520; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 14681219 - 14680536
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681219 acattaaggagattgtgaagttgcatggtattccttcgagcattgtatcggatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 14681120  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14681119 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgt 14681020  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14681019 gtgcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcatatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgagg 14680920  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14680919 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagt 14680820  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    | ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14680819 taagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaacgagaccacgtg 14680720  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  14680719 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaataagttgaccccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttg 14680620  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680619 gaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 14680536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 123 - 697
Target Start/End: Original strand, 14266368 - 14266942
Alignment:
Q  123 gaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgag 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14266368 gaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagatagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgag 14266467  T
Q  223 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266468 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagctatcattccagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 14266567  T
Q  323 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14266568 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgat 14266667  T
Q  423 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 522  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14266668 ctgagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacatgtttttgaga 14266767  T
Q  523 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 622  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14266768 gtcacccctatgactggtgtatgacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtgg 14266867  T
Q  623 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266868 cttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 14266942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Original strand, 16251810 - 16252488
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16251810 aaggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 16251909  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||    
T  16251910 gttcgaagttgagattgagttcggcttatcattcgcagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcactagaggatttgttgtaagtttgtgttct 16252009  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||     
T  16252010 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacgtacaataatagttatcattctattattggaatgacaccttttgaggctttg 16252109  T
Q  319 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  16252110 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattcttcagcagactactgagaaggttaaga 16252209  T
Q  419 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 518  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16252210 tgattcaagagaaaataaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttt 16252309  T
Q  519 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 618  Q
    |||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||    
T  16252310 gagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacg 16252409  T
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16252410 gtggcgtatcgagtgggattaccaccacatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcagaagtatg 16252488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 16354816 - 16355488
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  16354816 attgtgaagtttcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagatatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttcta 16354915  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16354916 agttgagattgagttcggcgtatcatccgcaggcagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttaagca 16355015  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16355016 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtatttgaatggcaccttttgaggctttatatggt 16355115  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  16355116 cggagatggagaattccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattc 16355215  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16355216 aagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaataattatcatgataagcgcaggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacgtgtttttgagagt 16355315  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||||     
T  16355316 cactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagacttggaacggtggcg 16355415  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355416 tatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16355488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 18226808 - 18227489
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18226808 atcaaggagattgtgaggttacatggtgtgccttcgagcattgtatcagatcgagatccaagatttacttctagattttggaggagtttgcaagaggctt 18226907  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18226908 taggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgtagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 18227007  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18227008 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 18227107  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||     
T  18227108 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttttagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagaagactactaagaaagtta 18227207  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18227208 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaagaatcttgagtttcaggaaggagagcacgtgtt 18227307  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  18227308 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 18227407  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18227408 acagtggcgtatcgagtgggattaccaccgtatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 18227489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 7091076 - 7090402
Alignment:
Q  22 gaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggct 121  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  7091076 gaaattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaaaatttacttctagattttagaaaagtttgcaagaggctttaggtt 7090977  T
Q  122 cgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttga 221  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||  |||| |||||| |    
T  7090976 ctaagttgaggttgagttcagcatatcatccgcagacagatagtcagtcggagaggacgatttagtcgttagaagatttgttgagggtttgggttcttta 7090877  T
Q  222 gcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatat 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  7090876 gcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattagaatggaaccttatgaggctttatat 7090777  T
Q  322 ggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatga 421  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7090776 ggtcggagatgcagaactcagttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatga 7090677  T
Q  422 tccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgag 521  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7090676 ttcaagagaagatgaaagcgtcgaagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgag 7090577  T
Q  522 agtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtg 621  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| | | |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  7090576 agtcactcctgtgactggtgttggatgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgct-cgtatcagatatcggaaagagttggaacggtg 7090478  T
Q  622 gcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  7090477 gcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 7090402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 14850737 - 14851409
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  14850737 attgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 14850836  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| | || || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14850837 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaatgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagca 14850936  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  14850937 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacatacaataacaattatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatgga 14851036  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
     | || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| |    
T  14851037 agaaggtgcagaactccgttgtgttggctcgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactattgagaaggttaagatgatac 14851136  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  14851137 aagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaaaaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagt 14851236  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || || | |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||||     
T  14851237 cactcatgtgaccggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttaactccgaggtttattggtccgtatcagatataggaaagaattggaacggtggcg 14851336  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  14851337 tatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtatttcatgtgtcgcaaattcggaagtatg 14851409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 22 - 527
Target Start/End: Original strand, 1639793 - 1640298
Alignment:
Q  22 gaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggct 121  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  1639793 gaaattgtgaagttgcatggtgttccttcaagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggtt 1639892  T
Q  122 cgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttga 221  Q
    |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  1639893 cgaagttgaggtggagtttggcgtatcatccgcagacagatggttagtcggaaagaacgattcagtcgctggaggacttgttgagagtttgtgtacttga 1639992  T
Q  222 gcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatat 321  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  1639993 gcaaggagggacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacttacaataatatttatcattctagtattggaatgtcaccttttgaggctttgtat 1640092  T
Q  322 ggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatga 421  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1640093 ggtcgaagatgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagggtggttttaggacccgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatga 1640192  T
Q  422 tccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgag 521  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||    
T  1640193 ttcaagaaaagatgaaggcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcataggaaagaccttgagttccaagaaggagatcatgtatttttgag 1640292  T
Q  522 agtcag 527  Q
    | ||||    
T  1640293 actcag 1640298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 393
Target Start/End: Original strand, 15147249 - 15147623
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15147249 aaggaaattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttttagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 15147348  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15147349 gttctaagttgagattgagttcgacgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtact 15147448  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15147449 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 15147548  T
Q  319 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtt 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15147549 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtgttcttaggaccagatattgtt 15147623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 203 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 14159955 - 14159461
Alignment:
Q  203 tgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggc 302  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14159955 tgagagtttatgtacttgagcaaggtggaacttgggatagtcaccttccattaatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggc 14159856  T
Q  303 acctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaact 402  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||| || |||    
T  14159855 accttttgaggctttgtacggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagaatgtggttttgggaccggagattgttcaacagact 14159756  T
Q  403 actgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaag 502  Q
    ||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14159755 actgaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaaggag 14159656  T
Q  503 gagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatttt 602  Q
    |||| || |||||  ||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |     
T  14159655 gagatcatgtgttcctgagagttactcccatgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaggtttattggtccatatcagatatc 14159556  T
Q  603 ggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14159555 agaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcggaacttcggaagtatg 14159461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 15002995 - 15003667
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  15002995 attgtgaagttgcatggagttccgtcgagtattgtgtcggaaagagacccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaa 15003094  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||    
T  15003095 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgctaagcgtatgtgtacttgagca 15003194  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  15003195 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatggt 15003294  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||  || || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||      
T  15003295 cggaagtggaggactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatgataa 15003394  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  15003395 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaatcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagt 15003494  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| |  || | ||||||||| |||||     
T  15003495 tactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattgatccatatcagatatctgagagagttggaacagtggca 15003594  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15003595 tatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15003667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 220 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 14652754 - 14652277
Alignment:
Q  220 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 319  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |    
T  14652754 gagcaaagatgaacttgggatattcatcttccgttgatagaattcacgtacaataacagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggctctgt 14652655  T
Q  320 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 419  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  | || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  14652654 atggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtatttttgggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaagat 14652555  T
Q  420 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 519  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  14652554 gattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagatcacgtatttttg 14652455  T
Q  520 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 619  Q
    ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||||| |  |||| | |||||||||    
T  14652454 agagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacgg 14652355  T
Q  620 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  14652354 tggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgtgtttcatatgtcgcaacttcggaagtatg 14652277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 25 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 8706559 - 8706078
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |    
T  8706559 attgtgaagctgcatggtgttccgtcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgagttcta 8706460  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8706459 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagca 8706360  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  8706359 aggtgggacttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtatatgaatgacaccattcgaagctttgtatggt 8706260  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || |||||||| || ||||  || |||||| || | ||      
T  8706259 cggaggtgcagaacttcgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgtagtgttgggaccggatattgttcaccagactatagaaaaagttaagctaataa 8706160  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggaga 506  Q
     ||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  8706159 gagaaaagatgaaagcgtcgcagaatcgacacaagagttatcacgacaagcgtaggaaagaccttgaatttaaggaaggaga 8706078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 1648908 - 1649580
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  1648908 attgtgaagcttcatggtgtaccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttccagattttagaagagtttgcaggacgctttgggttcga 1649007  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  1649008 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagtgtgtgtgtgcttgagca 1649107  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  1649108 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacttacaacaacagttaccattcgagtattggtatgtcaccgttcgaagctttgtatggt 1649207  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | || || ||||| || ||||| ||  | |||||  | |||||  |||||||  |||| |||     
T  1649208 cggaggtgcagaactcctttatgctggtttgagtcatgagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactacgaagaaagtcaagataatca 1649307  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||||| || || || || ||| | |||||    
T  1649308 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttaccacgacaagcggaggaaggaccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctaagagt 1649407  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |  || |   ||||||| |||||     
T  1649408 tactcctatgacgggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacttccaagttcattggtccgtatcagatatcagagaggattggaactgtggca 1649507  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| || || || || |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || ||||||||||    
T  1649508 tatagagttgggttgccacctcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagctacggaagtatg 1649580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15246565 - 15245893
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  15246565 attgtgaagttacatggagtttcgtcgagtattgtatcggatagagattcgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 15246466  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  15246465 agttgaggttgagttcgacttatcatccccagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattagaggatttggtgagagtgtgtgtacttgagca 15246366  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| |||  |||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15246365 aggtggaggttgggatagtcaactaccgttgatagagttgacgtacaacaacagtcaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 15246266  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||||||||| || | || |||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  | ||||| || |||||  |||| ||  |||||||      
T  15246265 cggaggtgcagaactcctttattctagtttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacgaagaaggtaaagatgataa 15246166  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |   ||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||    
T  15246165 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaaacgtaggaaggcctttgagtttcaggagggagatcatgtatttctgagagt 15246066  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    || |  |||||||| |||||     
T  15246065 tacccctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagataacagagagggttggaacagtggca 15245966  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  ||||| |||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  15245965 tacagagtgcgtttgccaccacatctttcgaatttgcattatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 15245893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 526
Target Start/End: Original strand, 15414657 - 15415158
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  15414657 attgtgaagctgcatggtgttccgtcaagtattgtgtcggatagagatccaagatttacatctagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgggttcaa 15414756  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  15414757 agttgaggttgagttcagcttatcatccgcaaacagatagccagtcggagagaacgattcaatcgttagatgatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 15414856  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||    
T  15414857 aggtggagtttgggatagtcatctgccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaggctttgtatggt 15414956  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga-tgatc 423  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||| || ||||| || ||||| || |||| ||| | ||||     
T  15414957 cggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatatagttcaacagactacgga-aaaggtcaaattgata 15415055  T
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
       ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15415056 agggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaaggagaccatgtgtttttgagag 15415155  T
Q  524 tca 526  Q
    |||    
T  15415156 tca 15415158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 599
Target Start/End: Original strand, 15358721 - 15359295
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||| |||| ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  15358721 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagatttgggaagagtctgcaagatgcattgggttcga 15358820  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | | ||| ||||| ||    
T  15358821 agttgaggttgagttcgacttatcatcctcagagagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtctgtgcttgaaca 15358920  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15358921 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcatgtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 15359020  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||      
T  15359021 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtaaagatgataa 15359120  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || |||  ||||||    
T  15359121 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttttcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttccgagagt 15359220  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 599  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  15359221 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaaatcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagat 15359295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Original strand, 3264428 - 3265097
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  3264428 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagt 3264527  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  3264528 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 3264627  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  3264628 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 3264727  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||   ||    
T  3264728 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagag 3264827  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||     
T  3264828 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 3264927  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| |||    
T  3264928 tcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatat 3265027  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  3265028 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 3265097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 33223564 - 33222887
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  33223564 attgtgaagctacatggtgtcccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggatgctttgggttcga 33223465  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggaca-----attcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 219  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |     || || ||  | || |||||  ||||| | ||||| |||    
T  33223464 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggagaggacgatccaatcattggaagatttactgagagtgtgtgtactt 33223365  T
Q  220 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 319  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || |  || || |  |||||||| ||| |||| ||| | || || |    
T  33223364 gagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacataaaacaaaaaataacaatagagtattggtatgacaccattcaaagcattgt 33223265  T
Q  320 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 419  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||  | |||||  ||||||||||||||||  || |    
T  33223264 atggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagacttggttcatgaaactactgagaaagtcaagtt 33223165  T
Q  420 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 519  Q
    |||    || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||| ||    
T  33223164 gataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggaacttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctg 33223065  T
Q  520 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 619  Q
    || |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||   | | ||||||||| |    
T  33223064 agggtcactcctttgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgacaccaaagttcattggtccgtatcagatttcaaagagagttggaacag 33222965  T
Q  620 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  33222964 tggcatatagagttggtttgccaccccatctttcgaacatgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 33222887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Original strand, 11206865 - 11207534
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||  || || |||||||| || | ||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  11206865 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatctgaggttcacttctaggttcttgaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 11206964  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  11206965 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgaacaagg 11207064  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||| | |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  11207065 tggagcttgggatagtcacttgcctttggttgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 11207164  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||   ||    
T  11207165 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagag 11207264  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||||||||     
T  11207265 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcac 11207364  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| |||    
T  11207365 tcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatat 11207464  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  11207465 agagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 11207534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 388 - 697
Target Start/End: Original strand, 15149740 - 15150049
Alignment:
Q  388 attgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatc 487  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  15149740 attgttcagcagactattgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatc 15149839  T
Q  488 ttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattgg 587  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||    
T  15149840 ttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattgg 15149939  T
Q  588 tccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaactt 687  Q
    ||| |||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  15149940 tccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgacgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaactt 15150039  T
Q  688 cggaagtatg 697  Q
    ||||||||||    
T  15150040 cggaagtatg 15150049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 472 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15364580 - 15364355
Alignment:
Q  472 aagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 571  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15364580 aagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 15364481  T
Q  572 ccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgtttt 671  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15364480 ccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgtttt 15364381  T
Q  672 ccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    
T  15364380 ccatatgtcgcaacttcgaaagtatg 15364355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 27901027 - 27900462
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| || || || |||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |    
T  27901027 attgtgaagatgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcggatagagacccggggtttacttcaagattttggaagagtttacaagatgcattgggttcaa 27900928  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||    
T  27900927 aattgaggttgagttcagcttatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtgcttgagca 27900828  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27900827 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttcatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 27900728  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||| | || |||||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||||||     
T  27900727 cggaggtgcaggacttctttatgctggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatca 27900628  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  27900627 gagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggt 27900528  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtcc 590  Q
     | |||||||||  |||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27900527 tactcctatgacgagtgtagaacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtcc 27900462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 15078276 - 15077825
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  15078276 attgtgaagttgcatggggttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggtttacttcaagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcaa 15078177  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  15078176 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacaaatggtcagtcgaagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 15078077  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15078076 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 15077977  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||      
T  15077976 cagaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataa 15077877  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcg 476  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15077876 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcg 15077825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 121 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 16146459 - 16145881
Alignment:
Q  121 tcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgtt--ct 218  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||  | ||| | |||||   ||    
T  16146459 tcgaagttggggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgaagaggacgattcaatctttggaggatttactaagagtgtgtgtgtgct 16146360  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 318  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||     
T  16146359 tgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagaattcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagatttg 16146260  T
Q  319 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 418  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||  | || || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||     
T  16146259 tatggtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggacagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaagtcaagg 16146160  T
Q  419 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 518  Q
    ||||    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |  || || || ||| |    
T  16146159 tgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggaggatgatcatgtatttct 16146060  T
Q  519 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 618  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | |||||||||     
T  16146059 gagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaact 16145960  T
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  16145959 gtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttacatgtgtcgcagcttcggaagtatg 16145881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Original strand, 29453171 - 29453840
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  29453171 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagt 29453270  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  29453271 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 29453370  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  29453371 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 29453470  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||  ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||   ||    
T  29453471 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtattgggacgggatttggttcatgagactactgagaaagtaaggttgataagag 29453570  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||     
T  29453571 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 29453670  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| |||    
T  29453671 tcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatat 29453770  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  29453771 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 29453840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 217 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15070862 - 15070382
Alignment:
Q  217 cttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctt 316  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  15070862 cttgagcaaggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctt 15070763  T
Q  317 tatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttca 416  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |    
T  15070762 tgtatggtcagaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaa 15070663  T
Q  417 gatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttt 516  Q
    ||||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  15070662 gatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgttt 15070563  T
Q  517 ttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaa 616  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||  | |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| || || | ||||||||    
T  15070562 ctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgtgttgaagtttatgaagttgactacgaagtttattggtccataccagatatttgagagagttggaa 15070463  T
Q  617 cggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||||| ||  | |||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15070462 cagtggcatacagggtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15070382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 20891623 - 20890952
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | || ||||| || || || ||||| || |||| |||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  20891623 attgtgaagttgcacggtgtaccgtcaagtattgtgtcggataaagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggatgctttgggttcga 20891524  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  20891523 agttgaggttgagttcgacttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtacttgagca 20891424  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||     
T  20891423 aggtggagcttgggatagtcacctaccattgattgagttcacatataacaatagctatcattcaagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggc 20891324  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || |||||  |  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||      
T  20891323 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccgaatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataa 20891224  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  20891223 gggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggt 20891124  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||  || |  |||||||| |||||     
T  20891123 cactcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggttcgtatcagatttcagagagggttggaacagtggca 20891024  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |  ||||||| ||  | ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  20891023 tataggatgggttt-ccaacacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 20890952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Original strand, 44661500 - 44662169
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||    
T  44661500 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcaaagt 44661599  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  44661600 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcgaagaggacgattcaatcgttggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaagg 44661699  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttc-cgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcg 326  Q
     ||| ||||||| |||| ||||  | ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  44661700 tggagcttgggacagtc-tcttgtctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcg 44661798  T
Q  327 gagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaa 426  Q
    ||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||   |    
T  44661799 gaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataaga 44661898  T
Q  427 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 526  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| || |    
T  44661899 gaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccgtgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtta 44661998  T
Q  527 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctta 626  Q
     |||| |||| ||||| || |||||  ||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||| ||||| ||    
T  44661999 ctcctttgacgggtgttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcata 44662098  T
Q  627 tcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  44662099 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 44662169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14691543 - 14691353
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  14691543 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 14691444  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  14691443 agttgaggttaagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttagaggacttgttgagagtttgtgt 14691353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 211 - 697
Target Start/End: Original strand, 51605998 - 51606484
Alignment:
Q  211 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcg 310  Q
    ||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  51605998 tgtgtgcttgaacagggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcactcgagtataggaatggcaccattcg 51606097  T
Q  311 aggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaa 410  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||  | ||||| ||  | |||||| | ||||| || ||    
T  51606098 aagctttgtatggtcgaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaa 51606197  T
Q  411 agttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccac 510  Q
    |||  ||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |  ||||||||||| || || || ||     
T  51606198 agtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaaacggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcat 51606297  T
Q  511 gtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaag 610  Q
    || ||| | ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || | |     
T  51606298 gtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaa 51606397  T
Q  611 ttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||||||||||| ||| |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  51606398 tcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 51606484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 368 - 531
Target Start/End: Original strand, 16676417 - 16676580
Alignment:
Q  368 gagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatca 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16676417 gagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgatttaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatca 16676516  T
Q  468 tgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcct 531  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16676517 tgataagcgcaggaaggatcttgagtttcagcaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcct 16676580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14160111 - 14159970
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  14160111 attgtgaagttgcatggtgttccttcaaacattgtattagacagagacccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 14160012  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtc 166  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14160011 agttgaggttgagttcggcgtatcatccacagacagatggtc 14159970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13248232 - 13247814
Alignment:
Q  79 tttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 178  Q
    ||||||||||  || ||| | ||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||    
T  13248232 tttacttctaagttctgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattgagttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacggagagga 13248133  T
Q  179 caattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttggga-tagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataata 277  Q
    | ||||||    | |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  | |||||| || |  | | |||||||| ||||| || ||||| || |    
T  13248132 ctattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttagagcaaggtgtcagttgggactaatgtt-taccgttgattgagtttacttacaacaaca 13248034  T
Q  278 gttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtctt 377  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||| || || |||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |   | ||    
T  13248033 gttttcattctagtattaggatggctccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtagaacaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagtgctttgtt 13247934  T
Q  378 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgt 477  Q
    |||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| |     
T  13247933 aggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagagg 13247834  T
Q  478 agaaaagatcttgagtttca 497  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  13247833 agaaaagatattgagtttca 13247814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15319792 - 15319641
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  15319792 attgtgaagttgcatggtgtcccatcgagcattgtgtcagatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagtttacaagaggccttgggttcaa 15319693  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15319692 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagag 15319641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 14997945 - 14997410
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| | ||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||||||   | |||||||||||||    
T  14997945 catggtataccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttggcaacaaagttgagattga 14997846  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  14997845 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgttagttg 14997746  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  14997745 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtattggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 14997646  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| |||||||||||  | || || |   | ||||||||  |  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| ||||| || ||||    
T  14997645 acaccgttgtgttggtttgagtccagagagagtgctttgttaggaccgaaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaagaaaagatga 14997546  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | || | ||||    
T  14997545 aggcgtctcagagtagacagaagagtcatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcttgtgac 14997446  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     || || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  14997445 cggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 14997410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 9291464 - 9290929
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||  || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  9291464 catggtattccttatagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 9291365  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    || | || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||    | || ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  9291364 gtactgcttaccatcctcagaccgatggacagacggagaggactatttagagtttggaagatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 9291265  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | |  ||||||| ||||| || ||||| |  |||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  9291264 ggacgaatgtttatcgttgattgagtttacttacaacagcagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 9291165  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || || ||||| ||||||||||| || ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  9291164 acaccattgtgttggtttgagtccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 9291065  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || || |||||||| || | |||| ||||    
T  9291064 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcaggtatttttgagggtgaatcctgtgac 9290965  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     | ||| || | |||||||||||  | |||||||||    
T  9290964 cgatgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgac 9290929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 546 - 697
Target Start/End: Original strand, 14927151 - 14927302
Alignment:
Q  546 acgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccg 645  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| || |  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||    
T  14927151 acgtgcattgaagtcaaagaatttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtactgagtgggtttaccaccg 14927250  T
Q  646 catctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  14927251 catctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatg 14927302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 572
Target Start/End: Original strand, 15293013 - 15293335
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 349  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  15293013 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 15293112  T
Q  350 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 449  Q
    |||||||||| || ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  15293113 ggtttgagtccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacagaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 15293212  T
Q  450 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 549  Q
    | |||| |||||||||||||| ||  | || || ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| ||| ||| || || |||    
T  15293213 tagacagaagagttatcatgataaaaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaatggagtgggtcgt 15293312  T
Q  550 gctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  15293313 gctttgaagtgtaggaagttgac 15293335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 572
Target Start/End: Original strand, 55375214 - 55375536
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 349  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |||| || || || | |||||| |    
T  55375214 ccgttgattgagtttacttacaacaacagtttacattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacactgttgtgtt 55375313  T
Q  350 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 449  Q
    ||||||| ||||||||||| |   | |||||||||||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||    
T  55375314 ggtttgaatcaggtgaaagtgctttgttaggaccagaagttgtacaagaaactacggaaaaggttaagatgattcagtagaagatgaaagcgtctcagag 55375413  T
Q  450 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 549  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| | |||||||| || ||     
T  55375414 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtaactggtgttggtcga 55375513  T
Q  550 gctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  55375514 gctttgaagtgtatgaagttgac 55375536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 433 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 16752826 - 16752669
Alignment:
Q  433 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 532  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||||||||||| | ||| |    
T  16752826 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccga 16752727  T
Q  533 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtcc 590  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||||||||    
T  16752726 tgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcattggtcc 16752669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 466 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 42703103 - 42702872
Alignment:
Q  466 catgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaaga 565  Q
    |||||||| || ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| | ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |    
T  42703103 catgacaaacggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaa 42703004  T
Q  566 agttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaa 665  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || | | | ||||||||||| ||| |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |    
T  42703003 agttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatga 42702904  T
Q  666 tgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  42702903 tgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 42702872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 277 - 559
Target Start/End: Original strand, 12132293 - 12132574
Alignment:
Q  277 agttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtct 376  Q
    |||| |||||||||||| || ||| |||| || |||||||| |||| |||| |||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||  | |    
T  12132293 agttttcattctagtatcggtatgacaccgtttgaggctttgtatgatcgg-gatgtagaacgtcgttgtgttggtatgagtcaggtgaaagtgttttgt 12132391  T
Q  377 taggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcg 476  Q
    |||| |||||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | || ||||||| |||||| ||| |    
T  12132392 taggtccagaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcaaagtaggcagaagagttgtcatgataagag 12132491  T
Q  477 tagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 559  Q
     || || ||  |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | || | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12132492 gaggaaggacattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 12132574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 499
Target Start/End: Original strand, 12342548 - 12342968
Alignment:
Q  79 tttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 178  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||  | ||||| || |||||||  || |||||||| || || ||||| ||| |||||||||    
T  12342548 tttacttctaaattttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttaaggttgagttatgcttatcatccccatactgatgggcagacggagagga 12342647  T
Q  179 caattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatag 278  Q
      ||||||    | || ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | ||||| |     | | |||||||| ||||| || ||||| || |     
T  12342648 atattcagagttttgaagatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttgggttgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacaa 12342747  T
Q  279 ttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtctta 378  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||| |||| || |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |   |  ||    
T  12342748 ttttcattctagtattgggatggcaccgtttgaggctttgtatggttggaggtgtagaacgtcgttgtgttggtatgagtcaggtgaaagtgctttacta 12342847  T
Q  379 ggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgta 478  Q
    ||||| ||| |||| ||  | |||||  | || ||| ||||||| |||||||| || | |||||| |||||| | || |||||||||||||| ||| | |    
T  12342848 ggaccggaggttgtgcaagagactacataaaaggttaagatgattcaagagaatataagggcgtctcagagtaggcagaagagttatcatgataagagga 12342947  T
Q  479 gaaaagatcttgagtttcagg 499  Q
    | ||  || ||||||||||||    
T  12342948 ggaagaatattgagtttcagg 12342968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 537 - 679
Target Start/End: Original strand, 18164332 - 18164474
Alignment:
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||  ||||||||    
T  18164332 tggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagctgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggt 18164431  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgt 679  Q
    || || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||    
T  18164432 ttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgt 18164474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 647 - 697
Target Start/End: Original strand, 18607823 - 18607873
Alignment:
Q  647 atctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607823 atctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 18607873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 572
Target Start/End: Original strand, 16445234 - 16445390
Alignment:
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | || || ||| |||||||||| |  || || || |||||    
T  16445234 agatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtt 16445333  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    ||| || || | |||| ||||||| || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  16445334 ttttagggtgaatcctgtgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 16445390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 168
Target Start/End: Original strand, 18549694 - 18549834
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||||  ||||||||||   ||||||||  | ||||    
T  18549694 gtgaagttgcatggtgttccttcgagtattgtttcggatagagatccaaggttcacatcaaggttttggggaagtttgcaatgtgctttgggaactaagt 18549793  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcag 168  Q
    | | | ||||||| |||||||| || || || |||||||||    
T  18549794 taaaactgagttctgcatatcacccacaaactgatggtcag 18549834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 629 - 697
Target Start/End: Original strand, 15415214 - 15415282
Alignment:
Q  629 gagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||| || || |||| |||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15415214 gagtgggtttgccaccacatccttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15415282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 164
Target Start/End: Original strand, 15423974 - 15424013
Alignment:
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatgg 164  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15423974 agttgagattgagttcggcataccatccacagacagatgg 15424013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 588; Significance: 0; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 588; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Original strand, 15589251 - 15589934
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589251 acatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 15589350  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589351 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 15589450  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15589451 gttcttaagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 15589550  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589551 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 15589650  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15589651 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtg 15589750  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  15589751 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 15589850  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15589851 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 15589934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Original strand, 20061913 - 20062596
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20061913 acatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagaattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 20062012  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062013 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 20062112  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20062113 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 20062212  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062213 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 20062312  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20062313 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtg 20062412  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  20062413 tttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 20062512  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20062513 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 20062596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 577; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 53384888 - 53385560
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53384888 attgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcga 53384987  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53384988 agttgagattgagttcggcgtatcatccacagacggatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 53385087  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  53385088 aggatgaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctctgtatggt 53385187  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385188 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 53385287  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385288 aagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 53385387  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  53385388 cactcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaaaaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggct 53385487  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53385488 taccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 53385560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 10005871 - 10005188
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10005871 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttacaagaggc 10005772  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005771 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 10005672  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10005671 gttcttgaacaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 10005572  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005571 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 10005472  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10005471 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtg 10005372  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  10005371 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 10005272  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10005271 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 10005188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 16636044 - 16635361
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16636044 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 16635945  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635944 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 16635845  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16635844 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaag 16635745  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635744 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 16635645  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16635644 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtg 16635545  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  16635544 tttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 16635445  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16635444 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16635361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 43163368 - 43162685
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163368 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 43163269  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163268 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 43163169  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  43163168 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaag 43163069  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163068 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 43162969  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43162968 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtg 43162869  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  43162868 tttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 43162769  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43162768 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 43162685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 10906481 - 10905798
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906481 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 10906382  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906381 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 10906282  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10906281 gttcttgaacgaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 10906182  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906181 ctttgtatggttggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 10906082  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10906081 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaagaaggagaccacgtg 10905982  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  10905981 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 10905882  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10905881 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 10905798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 48425718 - 48425035
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425718 acatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 48425619  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425618 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 48425519  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  48425518 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcaagg 48425419  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425418 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggactagagattgttcagcaaactactgagaaagt 48425319  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  48425318 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtg 48425219  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  48425218 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 48425119  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48425118 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 48425035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Original strand, 16756444 - 16757127
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756444 acatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 16756543  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756544 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 16756643  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16756644 gtgcttgagcaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcatcgttcgagg 16756743  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756744 ccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcagatgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 16756843  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  16756844 tcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacatg 16756943  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16756944 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcatattttggaaagagttg 16757043  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16757044 ggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16757127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 15348106 - 15348787
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15348106 atcaaggagattatgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 15348205  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348206 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 15348305  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15348306 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggcc 15348405  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348406 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcagcaaactactgagaaagttc 15348505  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15348506 agatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 15348605  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  15348606 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 15348705  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15348706 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 15348787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 15724795 - 15725475
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| || |||| | | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15724795 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcaggcattgtgtcagatagagatccaagatttacttgtagattttggaaaagtttgcaagaggctt 15724894  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15724895 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 15724994  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15724995 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 15725094  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  15725095 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaa-ttc 15725193  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725194 ggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 15725293  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  15725294 ttttagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 15725393  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15725394 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 15725475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 13252959 - 13252278
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13252959 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 13252860  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13252859 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 13252760  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  13252759 tcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggcc 13252660  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13252659 ttgtatggtcggagatgcaggactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 13252560  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13252559 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtt 13252460  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  13252459 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 13252360  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13252359 acggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 13252278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 15402371 - 15403052
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402371 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccctcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 15402470  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15402471 tgggttcgaagctgagattgagttcggcgtatcatccatagacagctggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgt 15402570  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15402571 tctcgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttaatcgagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 15402670  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15402671 ttacatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttc 15402770  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402771 agatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagattttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 15402870  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||    
T  15402871 tttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgatgttcattggtccgtatcagatattggaaagaattgga 15402970  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15402971 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 15403052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 26792260 - 26792941
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792260 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttccagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 26792359  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792360 tgggttcaaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 26792459  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26792460 tcttaagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 26792559  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792560 ttatatggtcggagatgcagaactccattatgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 26792659  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26792660 agatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 26792759  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  26792760 tttaagagtcactcctatgactagtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 26792859  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26792860 acgatggcttaccgagtggatttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 26792941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 16412143 - 16412824
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16412143 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 16412242  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16412243 tgggttcgaagttgaggttgagttcggagtatcaaccacaaacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 16412342  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16412343 tcttcagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 16412442  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16412443 ttatatggttggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactaagaaagttc 16412542  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16412543 agatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttggcaaaagagttatcatgataagcgtaggaatgaccttgagtttcatgaaggagaccacgtatt 16412642  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  16412643 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 16412742  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16412743 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttggacaacgttttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 16412824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 6601007 - 6600335
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6601007 acatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 6600908  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||               
T  6600907 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcgctagaggatttgt----------- 6600819  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6600818 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctttcgttgatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 6600719  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600718 ctttgtatggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 6600619  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  6600618 tcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattcaaggaaggagaccacgtg 6600519  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600518 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 6600419  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6600418 ggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 6600335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 5424791 - 5425471
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5424791 atcaaggagattgtaaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 5424890  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5424891 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 5424990  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5424991 tcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 5425090  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425091 ctgtatggtcagagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 5425190  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||      
T  5425191 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtg-c 5425289  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  5425290 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 5425389  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5425390 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 5425471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15339538 - 15338857
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15339538 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccctcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 15339439  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15339438 tgggttcgtagctgagattgagttcggcgtatcatcgacagacagatggtcagtcgaagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgt 15339339  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15339338 tctcgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttaatcgagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 15339239  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15339238 ttatatggtcggagatacagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcatcaaactactgagaaggttc 15339139  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15339138 agatgatccaagagcaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaagatcttgagttttaggaaggagaccacgtgtt 15339039  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||    
T  15339038 tttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagaattgga 15338939  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15338938 acggtagcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 15338857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 12498517 - 12497836
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12498517 atcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcaaatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 12498418  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498417 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 12498318  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12498317 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 12498218  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12498217 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtta 12498118  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12498117 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 12498018  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  12498017 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 12497918  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497917 acggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 12497836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 14876360 - 14877041
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876360 atcaaggagattgtgagattgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 14876459  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14876460 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagagtttgtgt 14876559  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14876560 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatattccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 14876659  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||     
T  14876660 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagcggtcttaggacccgagattgttcagcagactaccgagaaggtta 14876759  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14876760 agatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 14876859  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  14876860 tttgagagttactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 14876959  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876960 acggtggcgtatcgagttggattaccactgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 14877041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 16806787 - 16807468
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16806787 atcaaggagatcgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctaggttttggaaaagttagcaagaggctt 16806886  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16806887 tgggttcaaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 16806986  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16806987 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggct 16807086  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16807087 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtta 16807186  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16807187 aaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagaattatcatgataagcgcagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 16807286  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  ||  | ||||| |||||||| | | ||||| |||||    
T  16807287 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactctgagatttttcggtccgtatcagatatcgaaaaaatttgga 16807386  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16807387 acggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaattatg 16807468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 16371679 - 16371001
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371679 aaggaaattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 16371580  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16371579 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcggtcggaaaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttct 16371480  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16371479 tgagcaaggaggaacttgggatattcatctttcattgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 16371380  T
Q  319 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  16371379 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaga 16371280  T
Q  419 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 518  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  16371279 tgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttcaagaagaagactacgtgttttt 16371180  T
Q  519 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 618  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |  |||| |||||| |||    
T  16371179 gagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttgggacg 16371080  T
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371079 gtggcgtattgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgtcgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16371001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 17490110 - 17489438
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  17490110 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtccgatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 17490011  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  17490010 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggatgattcagtcgttagaagatctgttgagagtttgtgtacttgagca 17489911  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  17489910 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 17489811  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  17489810 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattc 17489711  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17489710 aagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagt 17489611  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||     
T  17489610 cactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcg 17489511  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17489510 tatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 17489438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 16692433 - 16691748
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaag----ag 111  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  16692433 atcaaggagattgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagctagag 16692334  T
Q  112 gctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaattt 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16692333 gctttgggttcgaagttgagattgagttcagcttatcatccacagacggatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagttt 16692234  T
Q  212 gtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcga 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16692233 gtgttcttgagcaagggggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaacaatagttatcattctagtattggaatggcaccttttga 16692134  T
Q  312 ggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaa 411  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  16692133 ggctttgtatggtcggatatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagcagactactgaaaaa 16692034  T
Q  412 gttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacg 511  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16692033 gttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcaagaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacg 16691934  T
Q  512 tgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagt 611  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||  | ||||| || | |||||  ||    
T  16691933 tgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgggtcgtatcaaatatcggaaagggt 16691834  T
Q  612 tggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16691833 tggaacggtggcatatcgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 16691748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 16492051 - 16492723
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |    
T  16492051 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattatggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 16492150  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16492151 agttgaggttgagttcggtgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttaagggtttgtgttcttgagca 16492250  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||    
T  16492251 aggaggtacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatgacaccttgtgaggctttgtatggt 16492350  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  16492351 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgtatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattc 16492450  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16492451 aagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagt 16492550  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  16492551 cactcctgtgactggtgttggacgagctttaaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcg 16492650  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16492651 tatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaattttcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16492723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 9522979 - 9522307
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  9522979 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 9522880  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9522879 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgtttcagtcgctagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagca 9522780  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  9522779 aggagggacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatatttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 9522680  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  9522679 cggagatgcagaactccgttgtcttggtttgagtcaggtgagagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaaaatgattc 9522580  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9522579 aagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgactttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagt 9522480  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |   ||| |||||||||||||||     
T  9522479 cactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcaaaaagagttggaacggtggcg 9522380  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9522379 taccgagtgggtttaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 9522307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15209151 - 15208479
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | || || |    
T  15209151 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatatgagatttacttctagattttggaagattttgcaagaggttgtaggttcta 15209052  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  15209051 agttgaggttgagctcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtctgagagaatgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtatttgagca 15208952  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15208951 aggaggaacttgggatagtcatcttctattgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgga 15208852  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  15208851 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattc 15208752  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  15208751 aagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaaaacattgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagt 15208652  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||| |  |||| | ||||||||||||      
T  15208651 cactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtaaaagaagttgactccgaggtttattggtccgaatcagatatcagaaagaattggaacggtggag 15208552  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15208551 tatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaattttcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15208479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15248407 - 15247735
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  15248407 attgtgaagttgcatggtgttcctttgagcattgtatcagatagagatatgagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 15248308  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  15248307 agttgaggttgagctcggcgtatcatcagcagacagatggtcagttggagagaacgatttagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgtaattgagca 15248208  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  15248207 aggaggaacttgggatagtcatcttctattgatatagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatagt 15248108  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  15248107 cggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattc 15248008  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |   ||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  15248007 aagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaaaacaatgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagt 15247908  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||| |||| | ||||| | |||||||||||||     
T  15247907 cactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtgtattggtccgtattagatatcggaaagaattggaacggtggcg 15247808  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  15247807 tatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaaatatg 15247735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15227919 - 15227247
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  15227919 attgcgaagctgcatggtgttccatcgagtattgtatcggatagagatccaagatttacatctagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgggttcaa 15227820  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  15227819 agttgaggtggagttcagcttatcatccgcaaacaattggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtgtgtgtacttaagca 15227720  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  15227719 aggtggagcttgggatagtcacctgccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagatttgtatggt 15227620  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga-tgatc 423  Q
     |||| |||||||||||||| || |||||||||||  ||||| | ||  | || ||||||||  | |||||||| |||||  | |||| ||| | ||||     
T  15227619 tggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtcgagtgaaggtgtaatgttgggaccagatttagttcagcagactac-aaaaaaggtcaaattgata 15227521  T
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
      |||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15227520 agagagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagag 15227421  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 623  Q
    ||| |||| |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |  || | ||||||||| |||||    
T  15227420 tcactcctgtgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggc 15227321  T
Q  624 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15227320 atatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15227247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 25 - 662
Target Start/End: Original strand, 13971979 - 13972616
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13971979 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggctcga 13972078  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||| | |||||  | ||||| ||||||||    
T  13972079 aattgaggctgagttcggcttatcatccccagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttgagca 13972178  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||||    
T  13972179 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggt 13972278  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || | ||      
T  13972279 cgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaat-- 13972376  T
Q  425 aagagaa--aatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 522  Q
    |||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||    
T  13972377 aagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgaga 13972476  T
Q  523 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 622  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||    
T  13972477 gtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtgg 13972576  T
Q  623 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
    | ||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  13972577 cgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgca 13972616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 13322511 - 13323183
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||||    
T  13322511 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcagatagggatctgaggtttacttctagattctggaagagtttgcaagatgttttgggttcga 13322610  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
     ||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||  | ||| | ||||| ||||||||    
T  13322611 ggttaaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgattcaatccttagaggatttcctaagagtatgtgtgcttgagca 13322710  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| | | ||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||    
T  13322711 aggtgaagcttgggatagtcacctacctttgatagagtttacctacaacaacaattaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttgtacggt 13322810  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| | || |  || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||     
T  13322811 cggaggtgcagaactcctttatgctggtttgagtcaggtcagagtgctgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatca 13322910  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  13322911 tagaaaggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagatcttgggtttcaggagggagaccatgtgtttctgagagt 13323010  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |   ||||||| |||||     
T  13323011 tactcctatgacgggggtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatattggagaggattggaacagtggca 13323110  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |  | ||||| || || |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13323111 tataggattggttttccaccacatctttcgaatttgcatggtgtattccatgtgtcgcagcttcggaagtatg 13323183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Original strand, 11564545 - 11564852
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11564545 aaggagattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagattttcttctagattttggaaaagttagcaagaggctttgg 11564644  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  11564645 gttcgaagttgaaattgagttcggcgtatcatctgcagacagatggttagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgctgagagtgtgtgttct 11564744  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  11564745 tgagaaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttg 11564844  T
Q  319 tatggtcg 326  Q
    ||||||||    
T  11564845 tatggtcg 11564852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 15952827 - 15953499
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  15952827 attgtgaagttacatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcga 15952926  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||  ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  15952927 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacatatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggagttgctgagagtgtgtgtacttgagca 15953026  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15953027 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttgccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 15953126  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||      
T  15953127 cggaggtgcagaactcctttatgtttgtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataa 15953226  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || || ||| ||||| |    
T  15953227 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagatt 15953326  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  15953327 tactcctatgacgggtgtacgacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggttcgtatcagatatctgagagggttggaacagtggca 15953426  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||   ||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15953427 tacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15953499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 14086943 - 14086271
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14086943 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggctcga 14086844  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||||||| | |||||  | ||||| ||||||||    
T  14086843 aattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttgagca 14086744  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||||    
T  14086743 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggt 14086644  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || | ||      
T  14086643 cgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaat-- 14086546  T
Q  425 aagagaa--aatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 522  Q
    |||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||    
T  14086545 aagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgaga 14086446  T
Q  523 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 622  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||| || || ||||    
T  14086445 gtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtgg 14086346  T
Q  623 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  14086345 cttatagggtgggtttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgcagttgcggaagtatg 14086271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 305
Target Start/End: Original strand, 14126464 - 14126744
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  14126464 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagttttcaagaggctttgggttcta 14126563  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14126564 agttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggtgaggaggattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagca 14126663  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14126664 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacc 14126744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 33 - 542
Target Start/End: Original strand, 15015634 - 15016131
Alignment:
Q  33 gctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgaga 132  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  15015634 gctacatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagatttaggaagagtttgcaggaggcgttgggttctaagttgagt 15015733  T
Q  133 ttgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15015734 ttgagttcggcatatcatccgcag------------tcggagaggacaattcagacgttggaggacttgttgagaatttgtgtacttgagcaaggcggaa 15015821  T
Q  233 cttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatg 332  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| |||||||||    
T  15015822 cttgggatagtcatctctcattgatcgagttcacttgcaataacagttaccattctagcattggaatggcaccgttcgaagcattgtatgatcggagatg 15015921  T
Q  333 cagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaa 432  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| || ||||| |  |||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| || ||||    |||||     
T  15015922 cagaactccattgtgttggtatgaatccggtgagaatgtggtactaggaccagaaattgttcaacaaactacagagaaggttaagttgattagggagaag 15016021  T
Q  433 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 532  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  15016022 atgaaagcgtctcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctg 15016121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 35 - 697
Target Start/End: Original strand, 18134215 - 18134877
Alignment:
Q  35 tacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagatt 134  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||| |||||| ||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||    
T  18134215 tacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttatagattctggaagagtttgcaggacactttgggttcgaagttgaggtt 18134314  T
Q  135 gagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaact 234  Q
    ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||    
T  18134315 gagttcaacttatcatcctcagacagatggtcagtcggagcggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagct 18134414  T
Q  235 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgca 334  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  18134415 tgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgca 18134514  T
Q  335 gaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaat 434  Q
    | | ||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| || |||||  | ||||||  |||||| ||    
T  18134515 ggaatcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagataaagtcaaaatgatcggagagaagat 18134614  T
Q  435 gaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatg 534  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || |  || ||| ||||||| | |||||||    
T  18134615 gaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcttgtatttctgagagttactcctatg 18134714  T
Q  535 actggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgg 634  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| ||||||||| |||| |    
T  18134715 actggtgtaggacgtgccttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcttatagagttg 18134814  T
Q  635 gtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| || || |||||||| || |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18134815 gtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 18134877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 12360401 - 12361073
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||    
T  12360401 attgtgaagctacatggtgtaccgtagagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacatctagattatggaagagattacaagatgcattgggttcga 12360500  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||||| |||| | | ||||| ||||||||    
T  12360501 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggaccatacaatctttggaggatttattgaaagtgtgtgtacttgagca 12360600  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  12360601 aggtggagcttcggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 12360700  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |  || || ||||||||  | ||||| |  ||||| ||||||||  |||||||      
T  12360701 cggaggtgcaggactccattatgctggtttgagtcaggagagagtgctgtattgggaccagacttggttcatcggactacagagaaagtcaagatgataa 12360800  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| |||||||    
T  12360801 gggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagt 12360900  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | | |||||||  ||||||||||||| ||||| || | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || || |||||||| |||||     
T  12360901 tacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaaatcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaggttggaacagtggca 12361000  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  12361001 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 12361073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 26 - 697
Target Start/End: Original strand, 8758942 - 8759613
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  8758942 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 8759041  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  8759042 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 8759141  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  8759142 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 8759241  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||||||      
T  8759242 gaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcag 8759341  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| | |||||     
T  8759342 agagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtg 8759441  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctt 625  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || | | | ||||||||||| |    
T  8759442 actccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcat 8759541  T
Q  626 atcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || || ||||| ||||| ||||||||||    
T  8759542 atagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaactgcggaagtatg 8759613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 26 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 41177791 - 41177120
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  41177791 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 41177692  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  41177691 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacat 41177592  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  41177591 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 41177492  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||  | ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||||||      
T  41177491 gaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcag 41177392  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| | |||||     
T  41177391 agagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtg 41177292  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctt 625  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || | | | ||||||||||| |    
T  41177291 actccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcat 41177192  T
Q  626 atcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  41177191 atagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 41177120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 13942291 - 13941622
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||    
T  13942291 gtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagt 13942192  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| || ||    
T  13942191 tgagactgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcaatggaggacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaggg 13942092  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  13942091 tggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcacccttcgaagctttgtatggtcga 13941992  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || || || ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||||||  ||    
T  13941991 aggtgcaggactccgttgtgttggtttgaataaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcagag 13941892  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| | ||||| |     
T  13941891 agaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgac 13941792  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || | | | ||||||||||| |||    
T  13941791 tccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatat 13941692  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  13941691 agagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 13941622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 11303632 - 11304304
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||    
T  11303632 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaggacgccttgggatcga 11303731  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  11303732 agttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttaagagtgtgtgtacttgagca 11303831  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||  ||| ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  11303832 agttggagcttgggatagtcacctaccgttgatatagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtaaggcaccgttcgaagctttgtatggt 11303931  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattg-ttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 423  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  ||| |||| ||  |||| ||||| ||  |||||||     
T  11303932 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggacc-gaatttgattcatcaggctacggagaaggtaaagatgata 11304030  T
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
      ||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  || | |||||||||||| || || || || || ||| ||||||    
T  11304031 agagaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtatgaaggctcttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctgagag 11304130  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 623  Q
    |    |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||  |||||    
T  11304131 ttttccctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaatagtggc 11304230  T
Q  624 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  11304231 atatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcttgtgtcgcaacttcagaagtatg 11304304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 28 - 662
Target Start/End: Original strand, 10419907 - 10420541
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| || || || ||||| || || |    
T  10419907 gtgaagttgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggaggagtttacaggacgcgttgggttcaaaat 10420006  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||  | ||  | ||||| |||||||| ||    
T  10420007 tgaggttgagttcggcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttactaagggtatgtgtacttgagcaggg 10420106  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  10420107 tggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttatcattcaagtattggtatggcaccatttgaagctttatatggtcgg 10420206  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || |||||  | || ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||  | |||||  | || || ||||||||   ||||||   ||    
T  10420207 aggtgtaggactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagaccacggagaaagtcaggatgattagag 10420306  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || ||| |||| || |     
T  10420307 agaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgatcatgtttttctgagggttac 10420406  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||    
T  10420407 tcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagtcggaactgtggcgtat 10420506  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
     || | ||||| || || |||||||||||||||||    
T  10420507 agaattggtttgccacctcatctttcgaatttgca 10420541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 662
Target Start/End: Original strand, 12850138 - 12850775
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||| || || |||||||| || ||||||||||  || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||  || |    
T  12850138 attgtgaagttgcatggtgtcccatcaagcattgtgtcggatagagatctgaggttcacttcaaggttttggaagagtttacaagaggccttggattcaa 12850237  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  12850238 agttgaggttgagttcggcttataatccgtagacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagattgtgtgttcttgagca 12850337  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | | ||| ||||||    
T  12850338 aggtggagcttgggatagtcatctatcgttgatagagttcacgtacaacaacaattaccattcaagtattggtatggcaccgttcaaagatttgtatggt 12850437  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||||| ||||||||  | |||||  |  ||||      
T  12850438 cggaggtgcagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcaaactacataaaaagtcaaattgataa 12850537  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  ||||||||||| || | ||| || |||||| |||||||    
T  12850538 gagaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaataaaggcccttgagtttcaagaggaagatcatgtgtttctgagagt 12850637  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||||||| |||||     
T  12850638 cactcctgtgacgggtataggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagagttggaacagtggca 12850737  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
    ||  |||||||||| || || ||||||| |||||||||    
T  12850738 tacagagtgggtttgccaccacatctttggaatttgca 12850775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 44777516 - 44776941
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  44777516 ttgtgaagctacatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagagatccgaggtttacttctaggttctggaagagtttacaggatgctttgggctcgaa 44777417  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || || ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  44777416 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 44777317  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  44777316 ggtggagcttgggatagtcacctgccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagcattatatggtc 44777217  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| || || || ||||||||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||||||      
T  44777216 gaaggtgcaggactcctttgtgttggttcgagacaggagaaagtgttgtgttgggaccagatttagttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcag 44777117  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || || |  |||||||| || || || || || || ||| | ||||||    
T  44777116 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagaggaggaaggcccttgagttccaagagggtgatcatgtatttctaagagtc 44777017  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 601  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  44777016 actccgatgacaggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcattggcccgtatcagattt 44776941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 601
Target Start/End: Original strand, 16836370 - 16836945
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  16836370 ttgtgaagcttcatggagttccgtcgagtattgcatcggatagagatccgaggttcacatctagattctggaagagtttgcaggacgctttgggttcgaa 16836469  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| |  |||| ||||| |||    
T  16836470 gttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatccttggaggatttgttgagagtgcgtgtgcttgaacaa 16836569  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  16836570 ggtggagcttgggatagtcacctaccattggtagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtc 16836669  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || || || ||||||||  | |||||  | || |||||||| ||  |||||||       
T  16836670 ggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatgagacgactgagaaggtcaagatgataag 16836769  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
     || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || || |||||||||||     
T  16836770 ggaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagtt 16836869  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 601  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16836870 actccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattt 16836945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15062022 - 15061777
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15062022 aaggaaattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaatagtttgcaagaggctttgg 15061923  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15061922 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatacgcagacagatggtcagtcggaaaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttatgttct 15061823  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttc 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  15061822 tgagcaaggtggaacttgggatagtcattttccattgattgagttc 15061777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 10384235 - 10383567
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |  || ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||| || || ||||| |||||||    
T  10384235 gtgaagcttcatggtgttccgtt-agtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaatgtttgcaggacgccttgggttcgaagt 10384137  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  10384136 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 10384037  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  10384036 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 10383937  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||   ||    
T  10383936 aggtgtaggactcctttgtgctggtttgagtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttagttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagag 10383837  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||     
T  10383836 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 10383737  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| |||    
T  10383736 tcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatat 10383637  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || || |||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  10383636 agagttggtttgccaccacacctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 10383567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 47124211 - 47123542
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||    
T  47124211 gtgaaacttcatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgctttgggttcaaagt 47124112  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  47124111 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 47124012  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| || || || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  47124011 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgaatttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 47123912  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | ||||||||||||||   | ||||   ||    
T  47123911 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgataagag 47123812  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||| |||||||||     
T  47123811 aaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcac 47123712  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| |||    
T  47123711 tcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggcatat 47123612  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||| || ||||| || || ||||||| |||||    
T  47123611 agagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaggtatg 47123542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 124 - 697
Target Start/End: Original strand, 11960992 - 11961565
Alignment:
Q  124 aagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagc 223  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||  | ||||||||||| ||| | ||||| |||||||    
T  11960992 aagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattggaggatttgttaagagtgtgtgtgcttgagc 11961091  T
Q  224 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 323  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11961092 aaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgattgagttcacttataacaacagctatcattcgagtattggcatggcaccgttcgaagctttgtatgg 11961191  T
Q  324 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 423  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | || ||||| || ||  | |||||     
T  11961192 tcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatgtggttcatgagacgactgaaaaggtcaaaatgata 11961291  T
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
       || || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||| || || || || ||| |||| |    
T  11961292 agggaaaagatgaaggctttgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgaggg 11961391  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 623  Q
    ||| |||| ||||  ||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||  |||||    
T  11961392 tcactcctttgacgagtgtacgacgtgcattgaagtcgaggaaattgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaatagtggc 11961491  T
Q  624 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| |||| | ||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  11961492 ttatagagttgatttgcccccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 11961565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 601
Target Start/End: Original strand, 16380788 - 16381362
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |  || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  16380788 ttgtgaagctacatggagttccttcaagtattgtgtcggatagggatccgatgttcacctctaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttcgaa 16380887  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||  || || ||  | |||||| |||||||| | ||||| ||||| |||    
T  16380888 gttgagattgagttcggcttatcattctcagacagatggtcagtcggagaggatgatccaatcattggaggatctgttgagagtgtgtgtgcttgaacaa 16380987  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||||| ||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  16380988 ggtggagcttgggataatcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatcgcaccgttcgaagctttgtatggtc 16381087  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagag---tggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 422  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |   |||| |  ||||| ||  | |||||  | ||||| || || ||  |||||||    
T  16381088 gaaggtgcaggactccgttgtgctggtttgagtccggagagagtgttatggt-tggggaccggatttggttcatgagactacagaaaaggtcaagatgat 16381186  T
Q  423 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 522  Q
    |  |||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||| || || || || ||||| |||    
T  16381187 cagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgac---agagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcgggatggtgatcatgtatttttaaga 16381283  T
Q  523 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 601  Q
    || | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16381284 gttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattt 16381362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 16329520 - 16330190
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | |||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||    
T  16329520 attgtgaagctgcacggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcatttctaggttctggaagagtttacaagacgccttgggttcga 16329619  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||    ||||| ||| ||||    
T  16329620 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggttagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgag--ggtgtgtactttagca 16329717  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||    
T  16329718 aggtggagcttgggatagtcacctaccattgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggt 16329817  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || |||||  | || ||||||||||||||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||      
T  16329818 cggaggtgtaggactcctctatgttggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataa 16329917  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  16329918 gggaaaagatgaaagcttcacagagtcgacataagagttaccatgacaagcaaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggt 16330017  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||| ||||| |||||||| |||||||| | | ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||||| |||||     
T  16330018 cactcctttgacaggtgttggacgtgcattgaagtcgaggtagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggca 16330117  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  16330118 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 16330190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17492900 - 17492563
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | | |  |||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  17492900 attgtgaagttgcatggtgttccgttgtgtgttgtttcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttggggtcga 17492801  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  17492800 acttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 17492701  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  17492700 aggtggatcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaatagttatcattcgaatattggtatggcaccgatcgaagctttgtatggt 17492601  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcagg 362  Q
    ||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  17492600 cggaggtgcaggactcctttaagctggtttgagtcagg 17492563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14574199 - 14573889
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||   || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  14574199 attgtgaagttacatggagtttcgtcgagtattgtgtcagatagagatttcaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 14574100  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||   | ||| | ||||||||    
T  14574099 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcagagagtacgattcagtcgttagaggatttgctgatggtgtgtatacttgagca 14574000  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  14573999 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccaatcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 14573900  T
Q  325 cggagatgcag 335  Q
    ||||| |||||    
T  14573899 cggaggtgcag 14573889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 4678702 - 4678365
Alignment:
Q  31 aagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttga 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  4678702 aagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagttga 4678603  T
Q  131 gattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggagg 230  Q
    |  |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| || || ||    
T  4678602 ggctgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacagggtgg 4678503  T
Q  231 aacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggaga 330  Q
    | ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||     
T  4678502 agcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcacccttcgaagctttgtatggtcgaagg 4678403  T
Q  331 tgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaag 368  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4678402 tgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaag 4678365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28754585 - 28754245
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  28754585 gtgaagcttcatggtgttccgtctagtattgtgtcagatagagatccgaggtttacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 28754486  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  28754485 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 28754386  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  28754385 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgg 28754286  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaag 368  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  28754285 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaag 28754245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 133 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 13002070 - 13001800
Alignment:
Q  133 ttgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaa 232  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |||     
T  13002070 ttgagttcggcttatcacccgcaaacagatggtcattcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgatgagagtgtgtgtacttgagcaagg-ggag 13001972  T
Q  233 cttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatg 332  Q
    |||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  13001971 cttgggatagtcatttaccgttaatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 13001872  T
Q  333 cagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactac 404  Q
    || |||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||||| ||||||||    
T  13001871 caaaactccattatgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcaaactac 13001800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 433 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 14571710 - 14571448
Alignment:
Q  433 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 532  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| | |||||    
T  14571710 atgaaagcgtcgcagagtcgactgaagagttaccgtgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactccta 14571611  T
Q  533 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 632  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||| ||||    
T  14571610 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaatttgactcctaagtttattggtccttatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagt 14571511  T
Q  633 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagta 695  Q
    ||| || || ||  ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  14571510 gggcttgccaccatatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagta 14571448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 362
Target Start/End: Original strand, 26008948 - 26009189
Alignment:
Q  121 tcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttg 220  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||| |  ||||| | ||||| ||||    
T  26008948 tcgaaattgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatctactgagagtgtgtgtacttg 26009047  T
Q  221 agcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttata 320  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||  ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||    
T  26009048 agcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgagagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgta 26009147  T
Q  321 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcagg 362  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26009148 tggtcgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcagg 26009189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 8274281 - 8274816
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| || |||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  8274281 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaggtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 8274380  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||     | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  8274381 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcaaagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 8274480  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  8274481 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 8274580  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  8274581 acaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 8274680  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| ||||    
T  8274681 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgac 8274780  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     || || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  8274781 cggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 8274816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Original strand, 16828061 - 16828215
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||    
T  16828061 attgtgaagttgcatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagaatttgcaagatgcattgggttcga 16828160  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggac 179  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16828161 agttgaggttgagttcggcttatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggac 16828215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 16742585 - 16743120
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||    
T  16742585 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatcccaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttaggaactaagttgagattga 16742684  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||    | || ||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  | |||    
T  16742685 gttctgcttaccatcctcagaccgatggtcagacagagaggactattcagagtttggaagatttgttgagagcttgtgtgttggagcaaggtgtcagttg 16742784  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  16742785 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 16742884  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || ||||| || ||||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  16742885 acaccgttttgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 16742984  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||| ||| |  || || || ||||||||||| || | |||| ||||    
T  16742985 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtgtcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgac 16743084  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     || || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  16743085 cggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 16743120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 15577007 - 15576473
Alignment:
Q  38 atggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgag 137  Q
    ||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||    
T  15577007 atggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattgag 15576908  T
Q  138 ttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgg 237  Q
    ||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | ||||    
T  15576907 ttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttgg 15576808  T
Q  238 gatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaa 337  Q
    ||      | |  ||||||| ||||| || ||||| || ||||  ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  15576807 gacgaatgtttatcgttgattgagtttacttacaacaacagtttgcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagaa 15576708  T
Q  338 ctccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaa 437  Q
    | ||||| || ||||||||||| || || || |   | || ||||| ||  |||| |   | ||||| || || ||| ||||||| || ||||| |||||    
T  15576707 caccgttatgttggtttgagtctggagagagtgctttgtttggaccggaagttgtgcgagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaa 15576608  T
Q  438 ggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgact 537  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||| || | |||| ||||     
T  15576607 ggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgacc 15576508  T
Q  538 ggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    || || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  15576507 ggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 15576473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 16338371 - 16338591
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || || | |||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  16338371 attgtgaagctgcacggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagggatccgaggttcagttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcga 16338470  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||| ||  | ||||| ||||| ||    
T  16338471 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgtttagggtgtgtgtgcttgaaca 16338570  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtca 245  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  16338571 aggtggagcttgggatagtca 16338591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 18748916 - 18748401
Alignment:
Q  44 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggc 143  Q
    ||||||| || ||||| ||||||   ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||  | || ||||| |||||||| ||    
T  18748916 ttccttctagtattgtgtcagatcaggatccgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgctttgggaactaaattgaggttgagttctgc 18748817  T
Q  144 atatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagt 243  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | ||||||||||| |||  ||||||| | |||||||| |  | |||||         
T  18748816 ttatcatccccagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatttgttaagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttgggtcgaa 18748717  T
Q  244 catcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgt 343  Q
      | | |||||||| ||||| |  ||||| || | || |||||||||||| || |||||||| || |||| ||| ||||||||||| || || ||  |||    
T  18748716 tgtttaccgttgattgagtttagttacaacaacaattttcattctagtatcggtatggcaccgtttgagggtttgtatggtcggaggtgtaggacgtcgt 18748617  T
Q  344 tgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtc 443  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |   | |||||||| ||| |||| ||  | ||||| || |||||| ||||||| ||||| || ||||| | |||    
T  18748616 tgtgttggtttgaatcaggtgaaagtgctttgttaggaccggaggttgtgcaagagactacggaaaaagttaagatgattcaagataagatgaaagtgtc 18748517  T
Q  444 gcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgta 543  Q
     |||||| |||| |||||||||||||| ||| | || ||  |  |||||||||| |  || || || |||||||| ||||| |  ||| | ||||||||     
T  18748516 tcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaagaacattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttaagagtgaaccctgtaactggtgtt 18748417  T
Q  544 ggacgtgctttgaagt 559  Q
    ||||||||||||||||    
T  18748416 ggacgtgctttgaagt 18748401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 268 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 17193121 - 17192865
Alignment:
Q  268 tacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaa 367  Q
    ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |||||||| | ||| ||||    
T  17193121 tacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacgccgttgtgttggtttgaataaggagaaa 17193022  T
Q  368 gagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatca 467  Q
    | || || ||| |||| ||  |||| ||  | | ||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  17193021 gtgttgtgttacgaccggaagttgtgcaagagagtacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatca 17192922  T
Q  468 tgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |||||||| |||||    
T  17192921 tgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttttttagagt 17192865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 572
Target Start/End: Original strand, 13975141 - 13975462
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 349  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  13975141 ccgttgattgagtt-acttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 13975239  T
Q  350 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 449  Q
    |||||||||| || || ||     | ||||| || ||  ||||  |  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| |||||||| || |||||    
T  13975240 ggtttgagtccggagagagtcctttgttagggccggaagttgtggaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcatctcagag 13975339  T
Q  450 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 549  Q
    | |||| ||||| |||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| || || || |||    
T  13975340 tagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgt 13975439  T
Q  550 gctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    | ||||||||  | |||||||||    
T  13975440 gttttgaagtgtaggaagttgac 13975462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 422
Target Start/End: Original strand, 14183007 - 14183179
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 349  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||   ||||||| ||||| || ||||| |    
T  14183007 ccgttgattgagtttacttacaacaatagttttcatttaagtattggtatggctcctttcgatgctttgtatgagaggagatgtagaacacctttgtgtt 14183106  T
Q  350 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 422  Q
    ||| ||||||  ||||||| || || || ||| | || ||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||    
T  14183107 ggtatgagtcgagtgaaagtgttgtgttgggatcggaaattgttcagcagactattgagaaggttaagatgat 14183179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 356
Target Start/End: Original strand, 6152733 - 6153052
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||  |||||| ||||||||||||  |||||| |  | |||||||||||||    
T  6152733 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccgagatttacttataagttttgggaaagtttgcaagctgctttgagaactaagttgagattga 6152832  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || ||  |||| ||||| ||||| ||  | |||||||| ||||||    | || ||||||||||||  ||||||| | || ||||| |  | |||    
T  6152833 gttctgcttactatcctcagactgatgggcaaacagagaggactattcagagtttggaagatttgttgagagcttgtgttttggaacaaggtgttagttg 6152932  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| |||||||| || | || |||||||||||| |  ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  6152933 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacatacaacaacaattttcattctagtatcgagatggctccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 6153032  T
Q  337 actccgttgtgctggtttga 356  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  6153033 acaccgttgtgttggtttga 6153052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 499
Target Start/End: Original strand, 6712506 - 6712753
Alignment:
Q  252 gttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctgg 351  Q
    |||||| ||||| || ||||| || | || || ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||    
T  6712506 gttgattgagtttacttacaacaacaattttccttctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtagaacgccgttgtgttgg 6712605  T
Q  352 tttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtc 451  Q
    | ||||||||| ||||| |   | |||||||| ||| |||| ||  | |||||  | || ||| ||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||     
T  6712606 tatgagtcaggcgaaagtgctttgttaggaccggaggttgtacaagagactacataaaaggttaagatgattcaaaagaagatgaaagcgtctcagagta 6712705  T
Q  452 gacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 499  Q
    | || |||||||||||||| ||| | || || ||  ||||||||||||    
T  6712706 ggcagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcagg 6712753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 697
Target Start/End: Original strand, 31689067 - 31689154
Alignment:
Q  610 gttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| |||||  | || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31689067 gttggaacagtggcatatagagttggtttgacaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 31689154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 31945157 - 31945070
Alignment:
Q  610 gttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| ||||| |||  ||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  31945157 gttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 31945070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 207
Target Start/End: Original strand, 13967222 - 13967392
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||  || | || || || ||||||||||  |||||| || |||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||    
T  13967222 catggtattccttctagcattgtgtcgtatcgggaaccgaggtttacttctaagttttgggaaggtttgcaagctgcttttggaactaagttgagattga 13967321  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaga 207  Q
    |||| ||  | ||||| ||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||   || |||||||||||||||    
T  13967322 gttctgctaaccatcctcagacggatgggcagacgaagaggactattcagagtctggaggatttgttgaga 13967392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 70 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17193318 - 17193224
Alignment:
Q  70 gatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatgg 164  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||   |||||||  | |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  17193318 gatccaaggtttacttctaagtttagggaaagtttgcaagcttctttgggaactaagttgaggttgagttctgcttatcatccccagaccgatgg 17193224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 586; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 586; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 22332691 - 22333372
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332691 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 22332790  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22332791 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcatatcatccgcagaaagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttcagaatttgtgt 22332890  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22332891 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacagacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 22332990  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22332991 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtcc 22333090  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22333091 ggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 22333190  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  22333191 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 22333290  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333291 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22333372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 586; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 27668294 - 27668975
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27668294 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 27668393  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668394 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 27668493  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27668494 tcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 27668593  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668594 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 27668693  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27668694 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtt 27668793  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27668794 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttgga 27668893  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27668894 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccacgtgtcgcaacttcgaaagtatg 27668975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 14999543 - 15000224
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14999543 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggttt 14999642  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999643 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacatatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 14999742  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  14999743 tcttgagcaaggaggaatttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgagact 14999842  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999843 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 14999942  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14999943 agatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 15000042  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  15000043 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 15000142  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15000143 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 15000224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 34567078 - 34566395
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34567078 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 34566979  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566978 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 34566879  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  34566878 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaag 34566779  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566778 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 34566679  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34566678 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtg 34566579  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  34566578 tttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 34566479  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34566478 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 34566395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 574; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 27685204 - 27685885
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685204 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 27685303  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685304 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 27685403  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  27685404 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatgacacctttcgaggcc 27685503  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685504 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 27685603  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27685604 agatgatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 27685703  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  27685704 tttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 27685803  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27685804 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccacgtgtcgcaacttcgaaagtatg 27685885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 572; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 695
Target Start/End: Original strand, 37291300 - 37291979
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291300 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 37291399  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37291400 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttgttgagaatttgtgt 37291499  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291500 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 37291599  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37291600 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttc 37291699  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37291700 agatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagtgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 37291799  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  37291800 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaaaaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 37291899  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagta 695  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37291900 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtctcaacttcgaaagta 37291979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 19770542 - 19769861
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19770542 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 19770443  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770442 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 19770343  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19770342 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 19770243  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770242 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 19770143  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19770142 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 19770043  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||    
T  19770042 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagtcgga 19769943  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19769942 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 19769861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 40709362 - 40708681
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40709362 atcaaggagattgttaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 40709263  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709262 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 40709163  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40709162 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 40709063  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709062 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 40708963  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  40708962 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccgcgtgtt 40708863  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  40708862 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 40708763  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40708762 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 40708681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 16357086 - 16356403
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16357086 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagggatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 16356987  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356986 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 16356887  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16356886 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaag 16356787  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356786 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 16356687  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16356686 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtg 16356587  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  16356586 tttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 16356487  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16356486 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttctccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16356403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 27518991 - 27518308
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518991 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 27518892  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518891 cttgggttcgaagttgagattgagttcgacgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 27518792  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27518791 gttcttgagcaagggggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 27518692  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518691 ctttgtatggttggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 27518592  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27518591 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagacctcgtg 27518492  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  27518491 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 27518392  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27518391 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcacaacttcgaaagtatg 27518308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 697
Target Start/End: Original strand, 29475898 - 29476558
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  29475898 catggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcttggggttcgaagttgaggttga 29475997  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29475998 gttcagcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggattttttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 29476097  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476098 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 29476197  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29476198 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacagactactgaaaaagttcggatgatccaagagaaaatga 29476297  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29476298 aggcgtcacagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgac 29476397  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29476398 ggatgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccacgaagttcattggtccatatcaggtattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggt 29476497  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29476498 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 29476558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 22135250 - 22134569
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135250 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 22135151  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  22135150 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagatagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagagaatttgttgagaatttttgt 22135051  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22135050 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 22134951  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22134950 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctagtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttc 22134851  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22134850 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgcagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatt 22134751  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  22134750 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 22134651  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22134650 acagtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 22134569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 41771424 - 41770743
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41771424 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 41771325  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41771324 tgggttcgaagttcagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 41771225  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41771224 tcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagctcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 41771125  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41771124 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 41771025  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41771024 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtt 41770925  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  41770924 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagattttggaaagagttgga 41770825  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41770824 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 41770743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 27610936 - 27610255
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27610936 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 27610837  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610836 tgggttcgaagttgagattgagttcggtgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 27610737  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27610736 tcttgagcaaggagggacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 27610637  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610636 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 27610537  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27610536 agatgatccaagagaaaatgaaagcgccgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtt 27610437  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  27610436 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 27610337  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27610336 acggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcaacttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 27610255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 535; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 22349005 - 22348326
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22349005 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 22348906  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||||||    
T  22348905 tgggttcgaagcagagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctcaatgatttgttggggatttgtgt 22348806  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22348805 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 22348706  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22348705 ttatatggtcggaggtgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtagtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 22348606  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22348605 agatgattcaagagaaaattaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaa--atcttgagtttcgggaaggagaccacgtatt 22348508  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  22348507 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 22348408  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22348407 acggtggcctaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 22348326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 23574321 - 23573643
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23574321 aaggaaattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcatttattgatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 23574222  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  23574221 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtact 23574122  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23574121 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 23574022  T
Q  319 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  23574021 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaga 23573922  T
Q  419 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 518  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23573921 tgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttt 23573822  T
Q  519 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 618  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||    
T  23573821 gagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacg 23573722  T
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573721 gtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23573643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 18776352 - 18775678
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  18776352 atcaaggagattatgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggcct 18776253  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18776252 taggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaaactttgtgt 18776153  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18776152 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcat-------tgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattcgaatggcaccttttgaggct 18776060  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18776059 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagcagactactgagaaagtta 18775960  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18775959 agatgattcaagagagaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggagggagaccacgtctt 18775860  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  18775859 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccctgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 18775760  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775759 acggtgatgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 18775678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 23517102 - 23516443
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  23517102 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttgaaagagtttgcaagagggtttgggttctaagttgagattga 23517003  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23517002 gttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttg 23516903  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  23516902 ggataatcatcttccgttgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttggtatggtcggagatgcaga 23516803  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| || ||||| || ||||    
T  23516802 actccgttgtgctggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccaagaaggttaagatcattcaagaaaagatga 23516703  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  23516702 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgac 23516603  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||| |||| |  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||     
T  23516602 tggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtattagatatcagaaagagttggaacggtggcatatcgagttgga 23516503  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 696  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23516502 ttaccaccgcatctttcgaatttgcaagatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtat 23516443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 20799314 - 20798661
Alignment:
Q  44 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||    
T  20799314 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttttagattttggaaaagtttgcaagaggttttgggttctaagttgagattgagtttggc 20799215  T
Q  144 atatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagt 243  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20799214 ttattatccgcggacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgcgagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagt 20799115  T
Q  244 catcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgt 343  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20799114 catcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgt 20799015  T
Q  344 tgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtc 443  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20799014 tgtgttggtttgagtcaggagaaagagaggtcttaggaccaaagattgttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtc 20798915  T
Q  444 gcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgta 543  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||     
T  20798914 gcaaagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgaccggtgtt 20798815  T
Q  544 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgc 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||| || |  |||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |    
T  20798814 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcaaatatcagaaagagttggaccggtggcatatcgattgggattaccac 20798715  T
Q  644 cgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20798714 cgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaaatatg 20798661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 57 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 23440766 - 23440126
Alignment:
Q  57 tgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcag 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23440766 tgtatcagatagagatccaagatttacttctaggttttggaaaagtttgcaagaggctttgggttctaagttgagattgagttcggtgtatcatccgcag 23440667  T
Q  157 acagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttga 256  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23440666 acagatggtcagtcggagagaaaaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggtggaacttgggatagtcatcttccattga 23440567  T
Q  257 tcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 356  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440566 ttgagtttacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttcaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttga 23440467  T
Q  357 gtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaa 456  Q
    || ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23440466 gttaggagaaagagtggtcttaaaaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 23440367  T
Q  457 aagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttga 556  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  23440366 aagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttaagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttga 23440267  T
Q  557 agtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa 656  Q
    |||||| ||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  23440266 agtcaatgaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagagggattaccaccgcatctttcgaa 23440167  T
Q  657 tttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440166 tttgcaagaagtattccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23440126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 25423759 - 25423090
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  25423759 gtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaaggtttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagt 25423660  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25423659 tgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagacagagaagacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaagg 25423560  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  25423559 aggaactagggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcgg 25423460  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||    
T  25423459 agatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaag 25423360  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  25423359 agaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcac 25423260  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    || | |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  || ||||| || |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||    
T  25423259 tcttgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtgaaagaagttgactccgagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtat 25423160  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| ||||    
T  25423159 caggtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaactatg 25423090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 655
Target Start/End: Original strand, 21497850 - 21498479
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || || |    
T  21497850 attgtgaagttgcatggtgttc-ttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctggattttggaaaattttgcaagaggctttaggttcta 21497948  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  21497949 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagatagatggtcagccggagagaacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttatgtacttgagca 21498048  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  21498049 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtaaaataaaagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 21498148  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  21498149 cggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggttttaggacccgagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattc 21498248  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||  | |||||||| || ||||| || ||  ||||||||||    
T  21498249 aagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggatagacatcgagtttcaagagggagatcatgtagttttgagagt 21498348  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || || | |||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||||||      
T  21498349 cactcttgtgaccggtgttggacgtgaattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggtg 21498448  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcga 655  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21498449 taccgagtgggtttaccaccgcatctttcga 21498479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 155 - 697
Target Start/End: Original strand, 21984248 - 21984790
Alignment:
Q  155 agacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21984248 agacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctttcatt 21984347  T
Q  255 gatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttt 354  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21984348 gatagagttcacgtacaataatagtaatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgttggttt 21984447  T
Q  355 gagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgac 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21984448 gagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgac 21984547  T
Q  455 aaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgcttt 554  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||    
T  21984548 aaaaaagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagagggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgattggtgttggacgtgcttt 21984647  T
Q  555 gaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcg 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  21984648 gaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagctggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcg 21984747  T
Q  655 aatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||||| |||| || |||||||||||||||| || |||||    
T  21984748 aacttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaggtatg 21984790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 20467909 - 20468581
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  20467909 attgtgaagctacatggtgttctgtcaagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 20468008  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20468009 agttgaggttgagttcggcgtattatccgcagacagatggccagtctgaaaggatgattcagtcgttggaggacttgttgagattttgtgtacttgagca 20468108  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |  |||||    
T  20468109 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaagctctgcatggt 20468208  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  20468209 cggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccataaatcgttcagcaaactactgagaatgttaagttgatcc 20468308  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20468309 aagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgactgaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggagaccatgtatttttgagagt 20468408  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | || ||| |||||||| | |||||| || |||| | | | ||| |||||     
T  20468409 cactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgaggtttattggtccgtgtcagatattagaaagaatagaaacagtggcg 20468508  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20468509 tattgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 20468581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 26738540 - 26739190
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||                      |||||| || || |    
T  26738540 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttata----------------------ggctttaggttcta 26738617  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  26738618 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttatgtacttgagca 26738717  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||  ||  ||||||| ||||||    
T  26738718 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttattattccagtaatggaatggcacaatttaaggctttgtatggt 26738817  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  26738818 tggagatgcagaactccattgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgtacaacaaactactgagaaagttaagatgattc 26738917  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||  | |||||||| ||    
T  26738918 aagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaagaaagagatcatatatttttgagggt 26739017  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |  |||| | |||||||||||||     
T  26739018 cactcctgtgactggtgttggatgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcg 26739117  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26739118 tatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcaagatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 26739190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 23471802 - 23471130
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || |    
T  23471802 attgtgaagctacatggttttccttcaagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgaaagaggctttaggttcta 23471703  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23471702 agttgaggtttagttaggcgtatcatccgtagacagatggtcagtcggagagaatgattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 23471603  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  23471602 agggggaacttgggatagtcatctcccattaatagagttcacgtacaataacagctatcattctagtattggaatggcaccttttgatgctttgtatggt 23471503  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || || ||| | |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| |    
T  23471502 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtagttttggggccataaattgttcaacaaactattgagaaggttaagatgattc 23471403  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    || | || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  23471402 aacaaaagatgaaagcgtctcagagtcggcaaaagagtaatcatgataagcgtaggcaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagt 23471303  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   || ||| |||||||| |||||| | |  |||| | |||||||||||||     
T  23471302 cactcaagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttggaggtttattggtccgtatcaggtatcagaaagaattggaacggtggcg 23471203  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23471202 tatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23471130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 522
Target Start/End: Original strand, 21339099 - 21339596
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || |    
T  21339099 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggttttaggttcta 21339198  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21339199 agttgaggttgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgttagagaacttgttgagagtttgtgtacttgagca 21339298  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21339299 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagaattcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccattcgaggctttgtatggt 21339398  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  21339399 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattc 21339498  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 522  Q
    |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  21339499 aagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaacgagaccaagtatttttgaga 21339596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Original strand, 24749370 - 24750039
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24749370 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagattcgaggttcacttcaagattctggaagagtttgcaagatgctttgggatcgaagt 24749469  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  24749470 tgaggttgagttcgacttagcatccttagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 24749569  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  24749570 tggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgg 24749669  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || |||||||| ||||| || || ||| || ||||   ||    
T  24749670 aggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagag 24749769  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||     
T  24749770 aacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcac 24749869  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| ||||| |||    
T  24749870 tcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatat 24749969  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||||||||| || || |||||||||||||||||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  24749970 agagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatg 24750039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 22235733 - 22236405
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |    
T  22235733 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccaaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagacgctttgggttcaa 22235832  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  22235833 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggatgatacaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagca 22235932  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  22235933 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagaattcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcatcgttcgaagctttgtatggt 22236032  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||  ||||| || | ||||||||||||||| || || || || || ||||| ||| | ||||| || ||||| ||||||||  ||||| ||     
T  22236033 cggaggtgcaagactcctttattctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggagttggttcatcagactacagagaaagtcaagatggtca 22236132  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  22236133 gagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggt 22236232  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| ||| |     
T  22236233 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtgtca 22236332  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  22236333 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 22236405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 21563786 - 21564451
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  21563786 attgtgaagctgcatggtgttccatcgagcattgtgtcggatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgggttcta 21563885  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  21563886 agttgaggttgagttcagcttatcatccgcaaacatatggtcagtcggagaaagcgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 21563985  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| | | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  21563986 aggtgaagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatggt 21564085  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga-tgatc 423  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||       ||| || || || |||| ||| || ||||| || ||||| || |||| ||| | ||||     
T  21564086 cggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagt-------aagtgtagtgttgggactagatatagttcatcagactacaga-aaaggtcaaattgata 21564177  T
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
      |||||| | ||| | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  21564178 agagagaagacgaaagtgtcgcaaagtcggcagaagagttatcatgacaagcgaagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgagag 21564277  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 623  Q
    ||| || | ||||  ||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||   ||| ||||||||||||||||| |  || | |||| | || |||||    
T  21564278 tcactcatgtgacacgtgttagtcgtgctttgaagtctaagaatttgactccacggtttattggtccatatcagatatctgatagagtttggacagtggc 21564377  T
Q  624 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21564378 atatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21564451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 21890572 - 21891244
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  21890572 attgtgaagttccatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcta 21890671  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  21890672 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcagagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagaatgtgtgcacttgagca 21890771  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    | | ||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  21890772 acgtggagcttgggatactcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 21890871  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| | ||  ||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||| ||||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||      
T  21890872 cggaggtacaagactccattatgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaacagatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataa 21890971  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||    
T  21890972 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagt 21891071  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     |  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  21891072 tacacctatgactggtgtaggatgtgcgttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggca 21891171  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  || | || |||||||||||||||||||||||||    
T  21891172 tacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21891244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 23079902 - 23080574
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| | || || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| | ||    
T  23079902 attgtgaagctgcacggtgtaccgtcgagtattgtatcggatagggattcgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggatgctttgggtttga 23080001  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  23080002 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggttagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 23080101  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23080102 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttatatggt 23080201  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||  | || ||  | ||||||||||||||  |||||||      
T  23080202 cggaggtgcaggactcctctatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagacttggtgcatgagactactgagaaagtcaagatgataa 23080301  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||  |||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  23080302 gggaaaagatgaaagcgtcgcagattcgacagaagagttatcatgacaagcggagaaaggccctatagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggt 23080401  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| ||||||    
T  23080402 cactcctatgacgggtgtaagacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggct 23080501  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| |||||||| || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23080502 tatagagttggtttaccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgttgcagcttcggaagtatg 23080574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 22381754 - 22381082
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  22381754 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggatgctttgggttcga 22381655  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  22381654 agttgaggttgagttcggcttatcatccttaggcagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagca 22381555  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||||||  ||||| ||||| ||||||    
T  22381554 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgattgagttcacatataacaacagctatcactcgagtataggtatggcactattcgaagctttgtatggt 22381455  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||| ||  | |||||      
T  22381454 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaggtcaaaatgataa 22381355  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  22381354 gggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggt 22381255  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||||||||||    
T  22381254 cactccgatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacggtggct 22381155  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22381154 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 22381082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 61 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 22462471 - 22461835
Alignment:
Q  61 tcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacag 160  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22462471 tcagatagagacccaaggtttacttcaagattttggaagagtttacaagatgcgttgggttcgaaattgaaattgagttcggcttatcatccgcagacag 22462372  T
Q  161 atggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcga 260  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||  ||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| || || ||||| ||    
T  22462371 atggtcagtcggaaaggacgatccaatcattagaggatttactaagaatatgtgtacttgagcagggtggagcttgggacagtcacctaccattgataga 22462272  T
Q  261 gttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 360  Q
     || |||||||| || ||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  22462271 atttacatacaacaacagttaccattcgagtgttggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttcgagtcg 22462172  T
Q  361 ggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaaga 460  Q
    || ||||| || || || || || ||  | |||||  ||||||| ||||||||  |||||||    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22462171 ggagaaagtgttgtgttggggccggaattggttcatgaaactacagagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaga 22462072  T
Q  461 gttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtc 560  Q
    | ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| || | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  22462071 gctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtc 22461972  T
Q  561 aaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttg 660  Q
     | ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||    
T  22461971 gaggaagttgactccaaagttcattggtccttaccagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttg 22461872  T
Q  661 cacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  22461871 catgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatg 22461835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 25 - 662
Target Start/End: Original strand, 28923581 - 28924218
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||  |||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||    
T  28923581 attgtgaagttgcatgggattccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcgaggttttggagaagtttacaagatgcgttgggatcga 28923680  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||    
T  28923681 aattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagca 28923780  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
     || ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28923781 gggtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttatatggt 28923880  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||  || || |||||  | || ||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| || |||||   |||||||     
T  28923881 cggaagtgtaggactcctctatgttggttcgagtcgggagaaagtgttgttttgggaccggatttggttcatgagactacggaaaaagtcaggatgatca 28923980  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  28923981 gagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctgagagt 28924080  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| |||||     
T  28924081 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcg 28924180  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
    ||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  28924181 tatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgca 28924218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 20822008 - 20821371
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||  ||||| || || || ||||| || |    
T  20822008 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcagatagagacccgaggtttacttcaagattttggaggagtttacaggacgcgttgggttcaa 20821909  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||    
T  20821908 aattgaggttgagttcggcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagca 20821809  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
     || ||| |||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  20821808 gggtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaactcacatacaacaacagttatcattcaagtattggtatggcaccatttgaagctttatatggt 20821709  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||  || || |||||  | || ||||||||||| || ||||| || || || || || ||  | |||||  | ||||| |||||||||  |||||||     
T  20821708 cggaagtgtaggactcctctatgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttggggccggatttggttcatgagactacagagaaagttaggatgatca 20821609  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| || || || ||| |||| ||    
T  20821608 gagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaagaaagaccttgaatttcaggaaggtgatcatgtttttctgagggt 20821509  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||| |||||     
T  20821508 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagggttggaactgtggcg 20821409  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
    ||| || | ||||| || || |||||||||||||||||    
T  20821408 tatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgca 20821371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 22503231 - 22502562
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  22503231 gtgaagcttcatggtgttccatcgagcattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgcattgggttcgaagt 22503132  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  22503131 tgagattgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 22503032  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  22503031 tggagcttgggatagtcacctgccattgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggcatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 22502932  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||||||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||    |    
T  22502931 aggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccagacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataaggg 22502832  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||     
T  22502831 aaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 22502732  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||    
T  22502731 tcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcatat 22502632  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  22502631 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 22502562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 662
Target Start/End: Original strand, 28894755 - 28895392
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||  |||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||    
T  28894755 attgtgaagttgcatgggattccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcgaggttttggagaagtttacaagatgtgttgggatcga 28894854  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||| | ||||| | ||  | ||||| ||||||||    
T  28894855 aattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagtgaatttgctaagggtatgtgtacttgagca 28894954  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
     || ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28894955 gggtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttatatggt 28895054  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||  || || |||||  | || ||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| || |||||   |||||||     
T  28895055 cggaagtgtaggactcctctatgttggttcgagtcgggagaaagtgttgttttgggaccggatttggttcatgagactacggaaaaagtcaggatgatca 28895154  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||||    
T  28895155 gagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctgagagt 28895254  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||  ||||     
T  28895255 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactctggcg 28895354  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
    ||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  28895355 tatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgca 28895392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Original strand, 14886807 - 14887476
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||    
T  14886807 gtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcagatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgctttgggttcaaagt 14886906  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  14886907 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 14887006  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||    
T  14887007 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggccgg 14887106  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | ||||||||||||||   | ||||   ||    
T  14887107 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgataagag 14887206  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||     
T  14887207 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 14887306  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | | |||| || ||||| |||    
T  14887307 tcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatat 14887406  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  14887407 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 14887476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 20774302 - 20773678
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||| |||| |||||    
T  20774302 catggggttccgtcgagtatagtgtcagacagagacccaaggtttacttcgagattttggagaagtttacaagatgcgttgggttcgaaattgaaattga 20774203  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| | ||  | ||||| |||||||| || ||| ||||    
T  20774202 gttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggac-atccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagcagggtggagcttg 20774104  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  || |      
T  20774103 ggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctttatatggtcggaagtgtaag 20774004  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||| || || ||||| ||||| || ||||  || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||  |||||||   |||||| ||||    
T  20774003 actcctttatgttggttcgagtcgggagaaaatgttgttttgggaccggaattggttcatgagactacagagaaagtcaagatgattagagagaagatga 20773904  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| | ||| || ||| |||| || | |||||||||    
T  20773903 aagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtcggaaagagcttcagtttcaggaagggggccatgtttttctgagggttactcctatgac 20773804  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
     || ||||||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||| |||| ||     
T  20773803 gggcgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttgga 20773704  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
    ||||| || |||||||||||||||||    
T  20773703 ttaccacctcatctttcgaatttgca 20773678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 601
Target Start/End: Original strand, 17269148 - 17269722
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || ||| |||| |||||    
T  17269148 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctctgggttcgaa 17269247  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
     |||||| | | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || || ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  17269248 attgagactaa-ttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 17269346  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  17269347 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 17269446  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||||||      
T  17269447 gaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcag 17269546  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| | |||||     
T  17269547 agagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtt 17269646  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 601  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17269647 actccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattt 17269722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 25848627 - 25847958
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| | ||| || || || ||||| |||||||    
T  25848627 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagaatttacaggacgccttgggttcgaagt 25848528  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  | || ||||||||||| || ||| | |||||||||||    
T  25848527 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagagaacaattcaatcattggaagatttgttgaggatgtgtatgcttgagcaagg 25848428  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  25848427 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 25848328  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga-tgatccaa 426  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||| ||||| ||||   |    
T  25848327 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaag-tcagattgataaga 25848229  T
Q  427 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 526  Q
    || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||    
T  25848228 gaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttttgagagtca 25848129  T
Q  527 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctta 626  Q
     |||| |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||| ||||| ||    
T  25848128 ctcctttgacgggtgttggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcata 25848029  T
Q  627 tcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
      |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||| ||||||||    
T  25848028 cagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatg 25847958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 20342834 - 20342165
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  20342834 gtgaagcttcatggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 20342735  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||    
T  20342734 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgaacaagg 20342635  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  20342634 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 20342535  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||   ||    
T  20342534 aggtgtaggactcctttatgctagtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagag 20342435  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | || || || ||| |||||||||     
T  20342434 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagcgtgatcatgtttttctgagagtcac 20342335  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
     ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| |||    
T  20342334 ccctttgacaggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatat 20342235  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  20342234 agagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 20342165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 52 - 697
Target Start/End: Original strand, 37545336 - 37545982
Alignment:
Q  52 agcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatc 151  Q
    |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||| ||| || || || ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  37545336 agcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaattttacaggacgccttgggttcgaagttgaagttgagttcggcttatcatc 37545435  T
Q  152 cgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttcc 251  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  | ||    
T  37545436 ctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacttgcc 37545535  T
Q  252 gttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctgg 351  Q
     ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||  ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  37545536 tttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcactgttcgaagccttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctgg 37545635  T
Q  352 tttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtc 451  Q
    |||||||| |||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | ||||||||||||||   | ||||   ||| || ||||| || ||||||||||    
T  37545636 tttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtacatgagactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtc 37545735  T
Q  452 gacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttt-tgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtg 550  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || |||| |||| |||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  37545736 gacagaacagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgttttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtg 37545835  T
Q  551 ctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatct 650  Q
    |||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||    
T  37545836 ctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttctgagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatct 37545935  T
Q  651 ttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  37545936 ttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 37545982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Original strand, 24798213 - 24798882
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||      
T  24798213 gtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttggggtcgaaac 24798312  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  24798313 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggaaaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 24798412  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
    |||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  24798413 aggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 24798512  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcag-atgatccaa 426  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||  ||  | |||||  | ||||||||||||| |||| |||||        
T  24798513 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggactggatttggttcacgagactactgagaaag-tcagaatgataagg 24798611  T
Q  427 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 526  Q
    || || ||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| || || || || ||| |||||||||    
T  24798612 gaaaagatgagagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttctggagggtgatcatgtttttctgagagtca 24798711  T
Q  527 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctta 626  Q
     |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  || | |||||| || ||||| ||    
T  24798712 ctcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggcata 24798811  T
Q  627 tcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  24798812 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 24798882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 135 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 21405285 - 21404737
Alignment:
Q  135 gagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaact 234  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21405285 gagttcggcgtatcatccacagacagatggacagacggagaggacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttatgtacttgagcaaggaggaact 21405186  T
Q  235 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggc--tttatatggtcggagatg 332  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   || ||||||||||||||    
T  21405185 tgggatagtcatctttcattgatcgagttcacttataataacagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaagcgtgttgtatggtcggagatg 21405086  T
Q  333 cagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaa 432  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| |  ||| |  | |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| || ||||   ||| ||     
T  21405085 cagaacttcgttgtgttggtatgagtccggtgagattgtgatactgggaccagacattgttcaacagactactgagaaggttaagttgattagagaaaat 21404986  T
Q  433 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 532  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||                 ||||||| || |||||||| ||||||| || |     
T  21404985 atgaaggtgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa----------------caaggagatcatgtgttttttagagtcactcttg 21404902  T
Q  533 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 632  Q
    |||| ||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| |||  ||| |||||  | |||||||||| ||||| |||||| || || || ||| ||||    
T  21404901 tgaccggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgtggtttattggctcgtatcagatttcggaaagagttgggacagttgcgtatagagt 21404802  T
Q  633 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || ||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  21404801 gggtttaccaccacatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatg 21404737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 259 - 697
Target Start/End: Original strand, 24735658 - 24736096
Alignment:
Q  259 gagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagt 358  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  24735658 gagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagt 24735757  T
Q  359 caggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaa 458  Q
    | |  ||||| ||| | || |||||||| || |||||||| ||||| || || ||| || ||||   |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24735758 cggaagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaa 24735857  T
Q  459 gagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaag 558  Q
    ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||     
T  24735858 gagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaa 24735957  T
Q  559 tcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatt 658  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  24735958 tctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatt 24736057  T
Q  659 tgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  24736058 tgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatg 24736096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 467
Target Start/End: Original strand, 21831574 - 21831998
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  21831574 attgtgaagctgcaccgtgttctgtcgagcattgtgtcagatagagatcgaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgggttcta 21831673  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||                   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21831674 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacacatggtcagtcgt------------------tagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagca 21831755  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||| |||| || || ||||| ||||||    
T  21831756 aggtgggacttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttacctttctagtataggaatgacaccatttgaagctttgtatggt 21831855  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||  | || || || ||||| || |||||||| || |||||  | || ||| || | ||      
T  21831856 cggaggtgcagaactccgttatgttggtttgagtcgggtgagggtgtagtgttgggaccggatattgttcaccagactacataaaaggttaagctaataa 21831955  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatca 467  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21831956 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatca 21831998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 334
Target Start/End: Original strand, 919 - 1150
Alignment:
Q  103 ttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgt 202  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||      
T  919 ttgcaagatgctttgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatttac 1018  T
Q  203 tgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggc 302  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  1019 tgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttaggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggc 1118  T
Q  303 acctttcgaggctttatatggtcggagatgca 334  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  1119 accgttcgaagctttgtatggtcggaggtgca 1150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 391 - 697
Target Start/End: Original strand, 23442472 - 23442778
Alignment:
Q  391 gttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttg 490  Q
    ||||| || ||||| ||||||||  |||||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||||    
T  23442472 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggctcttg 23442571  T
Q  491 agtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtcc 590  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  23442572 agtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgtgttgaagtctaagatgttgactccaaagttcattggtcc 23442671  T
Q  591 atatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcgg 690  Q
     |||||| | |  || |  |||||||| ||||| ||   ||||| ||| || || |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  23442672 gtatcagttatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtggttttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 23442771  T
Q  691 aagtatg 697  Q
    |||||||    
T  23442772 aagtatg 23442778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 263
Target Start/End: Original strand, 24716342 - 24716577
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24716342 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagattcgaggttcacttcaagattctggaagagtttgcaagatgctttgggatcgaagt 24716441  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  24716442 tgaggttgagttcggcttagcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 24716541  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagtt 263  Q
     ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  24716542 tggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtt 24716577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 316
Target Start/End: Original strand, 28916226 - 28916517
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||  |||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||    
T  28916226 attgtgaagttgcatgggattccgtcgagtatagtgtcagatagagacccaaggtttacttcgaggttttggagaagtttacaagatgcgttgggatcga 28916325  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||    
T  28916326 aattgaaattgagttcagcttatcatccgcagactgatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagca 28916425  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctt 316  Q
     || ||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  28916426 gggtggagcttgggatagtcatctaccattgatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccattcgaagctt 28916517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 439 - 697
Target Start/End: Original strand, 24737012 - 24737270
Alignment:
Q  439 gcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactg 538  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  24737012 gcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgg 24737111  T
Q  539 gtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggttt 638  Q
    ||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  24737112 gtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggttt 24737211  T
Q  639 accgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     || || |||||||||||||||||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  24737212 gccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatg 24737270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 493 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 20573626 - 20573422
Alignment:
Q  493 tttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccat 592  Q
    ||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  | | ||| |||||||| |    
T  20573626 tttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactccactgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacttcaaggtttattggtccgt 20573527  T
Q  593 atcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaa 692  Q
    ||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  20573526 atcagatatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaa 20573427  T
Q  693 gtatg 697  Q
    |||||    
T  20573426 gtatg 20573422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 257
Target Start/End: Original strand, 24620111 - 24620340
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24620111 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagattcgaggttcacttcaagattctggaagagtttgcaagatgctttgggatcgaagt 24620210  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  24620211 tgaggttgagttcgacttagcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 24620310  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgat 257  Q
     ||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  24620311 tggagcttgggatagtcacctaccgttgat 24620340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 520 - 697
Target Start/End: Original strand, 21343666 - 21343843
Alignment:
Q  520 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 619  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||| |||| |  |||| |||||||||||    
T  21343666 agagtcactcctgtgactggtgttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtataagatatcagaaagagttggaacgg 21343765  T
Q  620 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  21343766 tggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatg 21343843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21496713 - 21496481
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||| || |    
T  21496713 attgtgaagttgcatggggttccatcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaaaatgccctgggttcta 21496614  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    |||| || ||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| |||||| || ||||| ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  21496613 agttaaggttgagttcggcttatcattcgcaaatagatggtcagtaggagagaacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 21496514  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgat 257  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  21496513 aggtggagcttgggatagtcatctatcgttgat 21496481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 21937013 - 21937548
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  21937013 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 21937112  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  21937113 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagaaaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 21937212  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  21937213 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 21937312  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| |||||||| || || ||||| |   | || || || ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  21937313 acaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 21937412  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |||||||| || || | |||| ||||    
T  21937413 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttaagggtgaatcctgtgac 21937512  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     || || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  21937513 cggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 21937548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 21407711 - 21407597
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  | |    
T  21407711 attgtgaagctacatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagatttcggaagagtttgcaggaggcgttgggtccta 21407612  T
Q  125 agttgagattgagtt 139  Q
    ||||||| |||||||    
T  21407611 agttgagtttgagtt 21407597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 24581753 - 24581219
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| || |||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  24581753 catggtattccttctagtattgtgtcggattgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaggtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 24581654  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |    |||    
T  24581653 gttctgcttaccatcctcagaccgatgg-cagacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaaggtgttggttg 24581555  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  24581554 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 24581455  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  |||| || || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  24581454 acaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaaccacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 24581355  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | || || ||| |||||||||| |  || || ||||||||| | || || | |||| ||||    
T  24581354 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacgtgtttgtaagggtgaatcctgtgac 24581255  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     || || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  24581254 cggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 24581219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 27011627 - 27011092
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  27011627 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagttgctttgggaactaagttgagattga 27011528  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||  || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  || |||  | |||||||| |  | |||    
T  27011527 gttttgcttaccatcctcagaccgatgggcagacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttatgtgttagagcaaggtgtcagttg 27011428  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  27011427 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatgacaccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 27011328  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| ||||||||||  || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  27011327 acaccgttgtgttggtttgagttcggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 27011228  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | || || ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | || | ||||    
T  27011227 aggcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgac 27011128  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     || || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  27011127 cggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 27011092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 572
Target Start/End: Original strand, 11210732 - 11211054
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 349  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||| |||| || || ||  ||||||| |    
T  11210732 ccgttgattgagtttacttacaacaatagttttcattctagtattggaatgacaccgtttgaggccttgtatggtaggaggtgtaggacatcgttgtgtt 11210831  T
Q  350 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 449  Q
    |||||||||| || || || ||  | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || |||||| ||||||| || ||||| ||||| || || |||||    
T  11210832 ggtttgagtccggagagagtgttttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaagttaagatgattcaggagaagatgaaagcatctcagag 11210931  T
Q  450 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 549  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | || |||||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| ||||| || |||    
T  11210932 tagacagaagagttatcatgataagaggaggaaagatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgt 11211031  T
Q  550 gctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  11211032 gctttgaagtgtaggaagttgac 11211054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 469 - 697
Target Start/End: Original strand, 21662297 - 21662524
Alignment:
Q  469 gacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagt 568  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||| | ||||||| ||||||||  ||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  21662297 gacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagt 21662396  T
Q  569 tgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgt 668  Q
    ||||  ||| ||| ||||||   |||||||| | ||||| |||||||||  || | ||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||  ||||    
T  21662397 tgacttcgaggtttattggttg-tatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgt 21662495  T
Q  669 tttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     || || ||||||||||||||||| ||||    
T  21662496 atttcaagtgtcgcaacttcggaaatatg 21662524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 469 - 697
Target Start/End: Original strand, 21665758 - 21665985
Alignment:
Q  469 gacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagt 568  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||| | ||||||| ||||||||  ||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  21665758 gacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagt 21665857  T
Q  569 tgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgt 668  Q
    ||||  ||| ||| ||||||   |||||||| | ||||| |||||||||  || | ||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||  ||||    
T  21665858 tgacttcgaggtttattggttg-tatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgt 21665956  T
Q  669 tttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     || || ||||||||||||||||| ||||    
T  21665957 atttcaagtgtcgcaacttcggaaatatg 21665985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 25244175 - 25244323
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| |||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||| | | |||||||||  |||||||||  | |||||||| ||||    
T  25244175 catggtattccatctagcattgtgtcagatagagatccgaggtttacttctaagttttaggagagtttgcaatcggctttgggaactaagttgaggttga 25244274  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattca 185  Q
     |||  | |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||    
T  25244275 attctccttatcatcctcagactgatggtcagaccgagaggactattca 25244323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 25308327 - 25308475
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| |||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||| | | |||||||||  |||||||||  | |||||||| ||||    
T  25308327 catggtattccatctagcattgtgtcagatagagatccgaggtttacttctaagttttaggagagtttgcaatcggctttgggaactaagttgaggttga 25308426  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattca 185  Q
     |||  | |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||||    
T  25308427 attctccttatcatcctcagactgatggtcagaccgagaggactattca 25308475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23503952 - 23503526
Alignment:
Q  70 gatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagt 169  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||||||   | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| | |||     
T  23503952 gatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttggaa-ctaagttgagattgagttctgcttaccatcctcagaccgataggcaga 23503854  T
Q  170 cggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacata 269  Q
    |||||||||| ||||||    | || ||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  | |||||| |    | | |||||||| ||||| ||  |    
T  23503853 cggagaggactattcagagtttggaagatttgttgagagcttgtgtgttggagcaaggtgttagttgggacaaatgtttaccgttgattgagtttactaa 23503754  T
Q  270 caataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaaga 369  Q
    ||| || | || |||||||||| | || ||||| || ||  ||||||| ||||||||||| |  || || |||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  23503753 caacaacaattttcattctagtgtcggtatggctccgtttaaggctttgtatggtcggaggtctaggacaccgttgtgttggtttgagtctggtgaaagt 23503654  T
Q  370 gtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatg 469  Q
    |   | |||||||| ||  | || ||  | ||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  23503653 gctttgttaggaccggaagtggtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatg 23503554  T
Q  470 acaagcgtagaaaagatcttgagtttca 497  Q
    | ||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  23503553 ataagaggagaaaggatattgagtttca 23503526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 268 - 347
Target Start/End: Original strand, 21229229 - 21229308
Alignment:
Q  268 tacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtg 347  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  21229229 tacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagcattgtatggtcgcagatgcaggactcctttgtg 21229308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 305
Target Start/End: Original strand, 21680429 - 21680499
Alignment:
Q  235 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacc 305  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  21680429 tgggatagtcacctaccgttgatagagtttacgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcacc 21680499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 185
Target Start/End: Original strand, 16065604 - 16065665
Alignment:
Q  124 aagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattca 185  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  16065604 aagttgagattgagttctgcttattatcctcagactgatggtcatgcggagagaacaattca 16065665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 584; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 16999283 - 16998600
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16999283 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 16999184  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16999183 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 16999084  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16999083 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 16998984  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998983 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 16998884  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16998883 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtg 16998784  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  16998783 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 16998684  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16998683 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16998600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 16982435 - 16981752
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982435 acatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 16982336  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982335 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 16982236  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16982235 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 16982136  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982135 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 16982036  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  16982035 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtg 16981936  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  16981935 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 16981836  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16981835 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 16981752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 17064000 - 17063317
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17064000 acatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 17063901  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063900 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 17063801  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17063800 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 17063701  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063700 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 17063601  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  17063600 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtg 17063501  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  17063500 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 17063401  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17063400 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 17063317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 576; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 9610419 - 9609736
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610419 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 9610320  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610319 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 9610220  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9610219 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaag 9610120  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610119 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 9610020  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9610019 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtg 9609920  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  9609919 tttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 9609820  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9609819 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 9609736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 24262651 - 24261970
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262651 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 24262552  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262551 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 24262452  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24262451 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctcccgttgatcgagtccacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 24262352  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262351 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 24262252  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24262251 agatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 24262152  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||    
T  24262151 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtctgtatcatatattggaaagagttgga 24262052  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24262051 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 24261970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 10869133 - 10868450
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10869133 acatcaaagagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 10869034  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10869033 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 10868934  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10868933 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatctcccgttgatcgagttcacttataacaatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 10868834  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868833 ctttgtacggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagggtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 10868734  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10868733 tcagatgatccaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtg 10868634  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  10868633 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 10868534  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10868533 gaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 10868450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 27218299 - 27217616
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27218299 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 27218200  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27218199 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggacagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 27218100  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27218099 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttaatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 27218000  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27217999 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagatttttcagcaaactactgagaaagt 27217900  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27217899 tcagatgatacaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtg 27217800  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  27217799 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 27217700  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27217699 gaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 27217616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 44385731 - 44386412
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44385731 atcaaggggattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 44385830  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44385831 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatgatcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 44385930  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44385931 tcttgagcaaggagggacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 44386030  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386031 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 44386130  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44386131 agatgatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtt 44386230  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  44386231 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaaattcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 44386330  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44386331 acggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 44386412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 22325018 - 22325699
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22325018 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 22325117  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325118 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 22325217  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22325218 tcttgaacaaggaggaacttgggacagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 22325317  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325318 ttgtatggtcggagatgcagaactccgtggtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttagggccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 22325417  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22325418 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtt 22325517  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  22325518 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaacaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 22325617  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22325618 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 22325699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 548; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 17067658 - 17066978
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067658 acatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 17067559  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067558 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 17067459  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17067458 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgagg 17067359  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067358 ctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 17067259  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  17067258 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtg 17067159  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  17067158 tttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 17067059  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  17067058 gaacggtggctttacgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa-ttgcac-acgtttttcatgtgtcgc-acttcgaaagtatg 17066978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 24710314 - 24709633
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24710314 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcaagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 24710215  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710214 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 24710115  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||     
T  24710114 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatgacaccgtttgaggcc 24710015  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710014 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 24709915  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24709914 agatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 24709815  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||    
T  24709814 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtattagatattggaaagagttgga 24709715  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24709714 acggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgtacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 24709633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 27371550 - 27370869
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27371550 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 27371451  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27371450 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 27371351  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27371350 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 27371251  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27371250 ttgtatggtcggagatgaagaactatgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 27371151  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27371150 agatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 27371051  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  27371050 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggatgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 27370951  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27370950 acggtggcttaccgagtggatttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 27370869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Original strand, 21145201 - 21145873
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21145201 acattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagatgc 21145300  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           ||    
T  21145301 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcagagaggacaattcagtcgctagaggattt-----------gt 21145389  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145390 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagccatcttccgttgatcgagttcacatacaacaatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 21145489  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21145490 ctttatatggtcggagatgcaaaactccgttgtgctggtttgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgtccagcaaactactgagaaagt 21145589  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145590 tcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 21145689  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||| |||||    
T  21145690 tttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaagaagttgaccccgaagtttattgatctgtatcagatattggaaagagttg 21145789  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145790 gaacgatggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21145873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 24675767 - 24675089
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24675767 aaggagattgtgaagttgcatggtgttctttcgagcattgtatcatatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 24675668  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  24675667 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggatgattcagtcgctagaggatttgctgagagtctgtgttct 24675568  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24675567 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 24675468  T
Q  319 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  24675467 tatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaga 24675368  T
Q  419 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 518  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24675367 tgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttt 24675268  T
Q  519 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 618  Q
    ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||    
T  24675267 gagagtcacccctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacg 24675168  T
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24675167 gtggcgtatcgagttggattaccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 24675089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 23189279 - 23188608
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23189279 attgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 23189180  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  23189179 agttgagattgagttcggcttatcatccgcagatagatggtcagtcggagaggacagttcagtcgctagaggatttattgagagtttgtgtttttgagca 23189080  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23189079 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaacaatagttatcattctagtttaggaatggcaccttttgaggctttgtatggt 23188980  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   ||| |    
T  23188979 cggagatgcagaactccg-tgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaggttaaatagattc 23188881  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23188880 aagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtgtcaggaaggagaccacatgtttttgagagt 23188781  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||||     
T  23188780 cactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccaagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgatggcg 23188681  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188680 tatcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23188608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Original strand, 24707647 - 24708325
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24707647 aaggaaattatgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttttagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 24707746  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  24707747 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaagatttattgagggtttgtgttct 24707846  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24707847 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 24707946  T
Q  319 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  24707947 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcagactactgagaaagttaaga 24708046  T
Q  419 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 518  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24708047 tgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaaatatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttt 24708146  T
Q  519 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 618  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||  ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||    
T  24708147 gagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcctagattttttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacg 24708246  T
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24708247 gtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 24708325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Original strand, 21325431 - 21326109
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21325431 aaggaaattgtgaagttgcatggtgttctgtcgagcattatatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttag 21325530  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21325531 gttctaagttgagattgagtccggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtgct 21325630  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21325631 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttattattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 21325730  T
Q  319 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 418  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  21325731 tctggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcgggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaaccactgagaaagttaaga 21325830  T
Q  419 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 518  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21325831 tgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttt 21325930  T
Q  519 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 618  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| |||||||| | ||||| |||||| |||    
T  21325931 gagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagatatcggaaagagttgggacg 21326030  T
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21326031 gtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 21326109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 179 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 16925378 - 16924860
Alignment:
Q  179 caattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatag 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16925378 caattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatag 16925279  T
Q  279 ttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtctta 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16925278 ttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtctta 16925179  T
Q  379 ggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgta 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16925178 ggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgta 16925079  T
Q  479 gaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaa 578  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925078 gaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaa 16924979  T
Q  579 gttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtg 678  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16924978 gttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtg 16924879  T
Q  679 tcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  16924878 tcgcaacttcgaaagtatg 16924860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 178 - 697
Target Start/End: Original strand, 24878319 - 24878838
Alignment:
Q  178 acaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataata 277  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878319 acaattcagtcgctcgaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataata 24878418  T
Q  278 gttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtctt 377  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878419 gttatcattatagtattggaatgacacctttcgaggctttatatggtcggaggtgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtctt 24878518  T
Q  378 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgt 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24878519 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 24878618  T
Q  478 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24878619 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 24878718  T
Q  578 agttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 677  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24878719 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatct 24878818  T
Q  678 gtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  24878819 gtcgcaacttcgaaagtatg 24878838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Original strand, 22756630 - 22757306
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22756630 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacctctagattttggaagagttttcaagaggctttgg 22756729  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  22756730 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatacacagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagggtttgtgtact 22756829  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 318  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22756830 tgagaaaggagggacttcggatagtcatcttccgttgatagacttcacgtacaataacagttaccgttctagtattggaatggcaccctttgaggcttta 22756929  T
Q  319 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 418  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||     
T  22756930 tatggtcggagatgtagaactccgttgtgttgg--tgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacagattactgagaaagttaagg 22757027  T
Q  419 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 518  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22757028 tgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaagaaagagaccacgtgttttt 22757127  T
Q  519 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 618  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||    
T  22757128 gagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaaatcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacg 22757227  T
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22757228 gtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22757306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 23064346 - 23063677
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  23064346 gtgaagttgcatggtgttccttcaagcattgtgtcagatagagatccaagttttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttctaagt 23064247  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23064246 tgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggatgattcagtcttttgaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaagg 23064147  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23064146 aggtacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattcaagtattggaatggcaccttatgaggctttatatggtcgg 23064047  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||    
T  23064046 agatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggtcttaggaccagagattgttgaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaag 23063947  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  23063946 agaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgttttttttagagtcac 23063847  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| | |||||| |  |||| ||||||||||||||| |||    
T  23063846 tcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtttcagatatctgaaagagttggaacggtggcgtat 23063747  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  23063746 cgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 23063677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 402
Target Start/End: Original strand, 41608547 - 41608933
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41608547 atcaaggggattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagacagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 41608646  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41608647 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 41608746  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41608747 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 41608846  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaact 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41608847 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaact 41608933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 44 - 639
Target Start/End: Original strand, 24825472 - 24826067
Alignment:
Q  44 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||    
T  24825472 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttaagttcggc 24825571  T
Q  144 atatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagt 243  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24825572 gtatcatccgcagacagatggtcaatcggaaagaacgattcagtcgctggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggtggaacttgggatagt 24825671  T
Q  244 catcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgt 343  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||| || || |||||||    
T  24825672 catctcccgttgatagagttcacgtataataatagttaacattctagtattggtatggcaccttttgaagctctgtatggtcggaggtgtaggactccgt 24825771  T
Q  344 tgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtc 443  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  24825772 tgtgttgggttgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtc 24825871  T
Q  444 gcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgta 543  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  | || ||||| ||||||| |||| ||||||||||     
T  24825872 gcagagtcgacaaaggagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttttaggaaggagataatgtatttttaagagtcactcctgtgactggtgtt 24825971  T
Q  544 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggttta 639  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||| |  |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24825972 ggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggttcgtatcagatatcagaaagaattgggacggtggcgtatcgagtgggttta 24826067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 30211088 - 30211760
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |    
T  30211088 attgtgaagctacatggtgttccatcgagtattgtatcagatagggatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaggaggcgttgggttcta 30211187  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30211188 agttgagtttgagttcggtgtatcatccgcagacagatggacagacggagaggacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 30211287  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  | || ||||||    
T  30211288 agggggaacttgggatagtcatcttccattggtcgagttcacttacaataacagttaccattctagcattggaatggcaccgttcgaaacgttgtatggt 30211387  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||   ||| || || ||  || ||||| | ||| |||| || ||||||||||| ||| || ||||      
T  30211388 cggagatgcagaactctgttgtgttggtatgagtccaatgagagtgtagtactaagaccatacattattcaacagactactgagaaggttaagttgatta 30211487  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30211488 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccgtgataagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgttttttagagt 30211587  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    ||  | | |||| ||||| ||||| ||  | || ||||||||  |||| |||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||   ||| ||     
T  30211588 cacccatgtgaccggtgttggacgggcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccgtatcagatttcggaaaaagttggggtggttgcg 30211687  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  30211688 tataaagtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatg 30211760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 25 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 45529783 - 45529121
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |    
T  45529783 attgtgaagctacatggtgttgcatcgagtattgtatcagatagggatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaggaggcgttgggttcta 45529684  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  45529683 agttgagtttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggacagacgtagaggacaattcagtcgttggaggacttgttcagagtttgtgtacttgagca 45529584  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||    
T  45529583 aggaggaacttgggataatcatcttccattgatcgagttcatttataataacagttaccattttagcattggaatggcaccgttcgaagcgttgtatggt 45529484  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||| || |||||| |||| ||| || ||||      
T  45529483 cggagatgcaaaactccattgtgttggtatgagtccggtgagagtgtggtattgggaccggacattgttcaacagactactaagaaggttaagttgatta 45529384  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||      | |||||| |||||| |||||||    
T  45529383 gagaaaagatgaaagcatcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcctaggaaggatcttgagttt------gaagaccatgtgtttatgagagt 45529290  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || || | |||||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| |||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||     
T  45529289 cactcttgtgactggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattgacccatatcagatttcggaaagagttgggacggttgcg 45529190  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaag 693  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||| ||| || |   |||| || |||||||| ||||||||||||    
T  45529189 tatagagtgggtttaccactgcatcttttgaacttacgtgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaag 45529121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 27365250 - 27365922
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27365250 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggctcga 27365349  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||| | |||||  | ||||| ||||||||    
T  27365350 aattgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttgagca 27365449  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || |||||     
T  27365450 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatgga 27365549  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || | ||      
T  27365550 cgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaataa 27365649  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||    
T  27365650 gagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggt 27365749  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||| |||||     
T  27365750 cactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcg 27365849  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| || ||||| || |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  27365850 tatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcagttgcggaagtatg 27365922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 23294230 - 23293558
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||    
T  23294230 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagcttacaagatgctttgggttcga 23294131  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||| |||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  23294130 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttggagggtttgctgagagtgtgtgtgcttgagca 23294031  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  23294030 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 23293931  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| |  || ||||| || ||  ||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||  ||||||||  ||||||||     
T  23293930 cggaggttgaggactcctttatgtcggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactatagagaaagtcaagatgatca 23293831  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| |||||||    
T  23293830 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacggaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagt 23293731  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| |||||     
T  23293730 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggca 23293631  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || |||||||| || |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23293630 tatagagttggtttgccaccacatctttctaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23293558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 23277048 - 23276376
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| | || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  23277048 attgtgaagctgcatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagtgattcgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgcattgggttcga 23276949  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||| | | | ||| ||||||||    
T  23276948 agttaaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgaaagtgtttgtacttgagca 23276849  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  23276848 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 23276749  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||   |||||||     
T  23276748 cggaggtgcaggacttctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaagtcatgatgatca 23276649  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| ||||| |    
T  23276648 gagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagatt 23276549  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||  ||||| |||||||| |||||||| |  |||| ||| || |||||||||||||| |||||||| | ||| |  |||||||| |||||     
T  23276548 tactcctatgatgggtgtgggacgtgcattgaagtcgagtaagtcgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggca 23276449  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  23276448 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 23276376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 136 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 23087611 - 23087050
Alignment:
Q  136 agttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaactt 235  Q
    ||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||| ||| |||    
T  23087611 agttcagcttatcatcggcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtactttagcaaggtggagctt 23087512  T
Q  236 gggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcag 335  Q
    |||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  23087511 gggatagtcacctatcgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgactattggtatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggtgcgg 23087412  T
Q  336 aactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatg 435  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||| |||||||  || |||| ||| || ||| |  ||||   |||||| |||    
T  23087411 aactccgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgtaatgttgggaccagatattgttcgtcagactattgaaaaggttaaattgataagagagaagatg 23087312  T
Q  436 aaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatga 535  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | |||    
T  23087311 aaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtagaaaggtccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttgtga 23087212  T
Q  536 ctggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtggg 635  Q
    | ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |  || | ||||||||| ||||| ||| ||||| |    
T  23087211 caggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaggtttattggtccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcgtatagagtgtg 23087112  T
Q  636 tttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23087111 tttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23087050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 27788012 - 27787341
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  27788012 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 27787913  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  | || || ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  27787912 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 27787813  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  27787812 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcactcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 27787713  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    | || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||  | ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  || |||||      
T  27787712 gaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaaggtgatcag 27787613  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| | |||||     
T  27787612 agagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtg 27787513  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctt 625  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || | | | ||||||||||| |    
T  27787512 actccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcat 27787413  T
Q  626 atcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  27787412 atagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 27787341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 697
Target Start/End: Original strand, 11358057 - 11358717
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||    
T  11358057 catggtgttccgtctagcattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagttgaggttga 11358156  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| || |||||||| ||| ||||    
T  11358157 gttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgctagagcaaggtggagcttg 11358256  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||     
T  11358257 ggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtagg 11358356  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||   ||| || ||||    
T  11358357 actcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatga 11358456  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| ||||||||| |||| ||||    
T  11358457 aagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgac 11358556  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
     ||||| || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| || ||||| ||| |||| |||    
T  11358557 gggtgttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaagttggtacagtggcatatagagttggt 11358656  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  11358657 ttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 11358717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 12574624 - 12574049
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  12574624 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 12574525  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || || ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  12574524 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 12574425  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  12574424 ggtggagcttgggacagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 12574325  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| || || || ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||||||      
T  12574324 gaaggtgcaggactccgttgtgttggttcgagtcaagagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcag 12574225  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || || || || || ||| | || ||     
T  12574224 agagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagggtt 12574125  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 601  Q
    |  || ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12574124 accccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattt 12574049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 20833254 - 20832585
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  20833254 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagt 20833155  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  20833154 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 20833055  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| || ||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  20833054 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 20832955  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga-tgatccaa 426  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||| ||||| ||||   |    
T  20832954 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtattgggaccggatttggttcatgagactactgagaaag-tcagattgataaga 20832856  T
Q  427 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 526  Q
    || || ||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||    
T  20832855 gaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtca 20832756  T
Q  527 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctta 626  Q
     |||| |||| ||||| || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| ||    
T  20832755 ctcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcata 20832656  T
Q  627 tcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  20832655 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 20832585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 31830927 - 31830258
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||    
T  31830927 gtgaaacttcatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgctttgggttcaaagt 31830828  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  31830827 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 31830728  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| || || || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  31830727 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgaatttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 31830628  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||  | || ||  | ||||||||||||||   | ||||   ||    
T  31830627 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggtgcatgagactactgagaaagtcaggttgataagag 31830528  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||| |||||||||     
T  31830527 aaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcac 31830428  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| |||    
T  31830427 tcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggcatat 31830328  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  31830327 agagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 31830258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 1064020 - 1063351
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| |    
T  1064020 gtgaaacttcatggtgttccgtctagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgccttgggttcgaaat 1063921  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  1063920 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcatgggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 1063821  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  1063820 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcattcaagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 1063721  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||  |||| || || || || ||||||||  | || ||  | ||||||||||||||   | ||||   ||    
T  1063720 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgtgtgagagtgttgtgttgggaccagatttggtacatgagactactgagaaagtaaggttgataagag 1063621  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||     
T  1063620 aaaagatgagagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 1063521  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | | |||| || ||||| |||    
T  1063520 tcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaattggtactgtggcatat 1063421  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| | ||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  1063420 agagttgctttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 1063351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 362
Target Start/End: Original strand, 19652223 - 19652557
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| || |||| || || ||||| ||||| || ||||  ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  19652223 attgtgaagttatatggagtaccgtcgagtattgtgtcggataaggatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgctttgggttcga 19652322  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  19652323 aattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 19652422  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||   || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  19652423 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatac---aacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 19652519  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcagg 362  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  19652520 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcagg 19652557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 424 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 23138910 - 23138637
Alignment:
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  23138910 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgagag 23138811  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 623  Q
    ||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  23138810 tcactcttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggc 23138711  T
Q  624 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23138710 atatcgagtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23138637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 424 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 23550700 - 23550427
Alignment:
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  23550700 caagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgagag 23550601  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 623  Q
    ||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  23550600 tcactcttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggc 23550501  T
Q  624 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23550500 atatcgagtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23550427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 484 - 697
Target Start/End: Original strand, 27377101 - 27377314
Alignment:
Q  484 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  27377101 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 27377200  T
Q  584 ttggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 683  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27377201 ttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgca 27377300  T
Q  684 acttcggaagtatg 697  Q
    |||||| |||||||    
T  27377301 acttcgaaagtatg 27377314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16923172 - 16923010
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16923172 acatcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 16923073  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagag 176  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16923072 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagag 16923010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16925643 - 16925479
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925643 acatcaaagagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 16925544  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 178  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16925543 cttgggttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccacaaacagatggtcagtcggagagga 16925479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 171
Target Start/End: Original strand, 20442675 - 20442830
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20442675 atcaaggagattgtgatgttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 20442774  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcg 171  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20442775 tgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcg 20442830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Original strand, 24876911 - 24877078
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24876911 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaagatttacttctacattttggaaaagtttgcaagaggctt 24877010  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaatt 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24877011 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaatt 24877078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24948861 - 24948564
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||||    
T  24948861 attgtgaagctgcatggtgtaccgtcgagtattgtatcagatagggatccgaggttcacttatagattctggaagagtttgcaagatgcattggtttcga 24948762  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||  | ||||||||   |||| | ||||| ||||||||    
T  24948761 tgttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatctaatcattggaggatttacagagagtgtgtgtgcttgagca 24948662  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 322  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  24948661 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatg 24948564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 557 - 697
Target Start/End: Original strand, 41609047 - 41609187
Alignment:
Q  557 agtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41609047 agtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttacagccgcatctttcgaa 41609146  T
Q  657 tttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  41609147 tttgcacaatgttttccacgtgtcgcaactttggaagtatg 41609187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20828528 - 20828227
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  20828528 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagt 20828429  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  20828428 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 20828329  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| || ||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  20828328 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 20828229  T
Q  328 ag 329  Q
    ||    
T  20828228 ag 20828227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 22276538 - 22276018
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||||||   | |||||||||||||    
T  22276538 catggtattccttctagtattgtgtc-gatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttggaaactaagttgagattga 22276440  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| |||||  || |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  22276439 gttctgcttaccatccccagactgatgggtagacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 22276340  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  22276339 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 22276240  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || || |   | |||||||  ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  22276239 acaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgccttgttaggactggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 22276140  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |||||||||||||| | |||| ||||    
T  22276139 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgac 22276040  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaag 558  Q
     ||||| || ||||||||||||    
T  22276039 cggtgttggtcgtgctttgaag 22276018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 21125331 - 21125509
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||    
T  21125331 gtgaagttacatggggttccatcgagtattgtgtcagatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaaagt 21125430  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgag 206  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21125431 tgaggttgagttcgacttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgttgag 21125509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 457 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 24654185 - 24653946
Alignment:
Q  457 aagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttga 556  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| || | ||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  24654185 aagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacttgcattga 24654086  T
Q  557 agtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa 656  Q
    |||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |  || |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||    
T  24654085 agtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagtgaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 24653986  T
Q  657 tttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 696  Q
     |||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24653985 cttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtat 24653946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 113
Target Start/End: Original strand, 23107901 - 23107989
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23107901 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtccgatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 23107989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 92 - 520
Target Start/End: Original strand, 23817291 - 23817719
Alignment:
Q  92 tttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgct 191  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |  |||| || ||||||    |    
T  23817291 tttgggaaagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattgagttctgcttaccatcctcagaccgatggtcagacaaagagaactattcagagttt 23817390  T
Q  192 agaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagt 291  Q
     || ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |    ||||||      | | || ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||||    
T  23817391 ggaagatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtctgttgggacgtatgtttaccattgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagt 23817490  T
Q  292 attggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattg 391  Q
    || || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |  |||| |   | |||||||| ||| |||    
T  23817491 atcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggagatgtaggacaccgttgtgttggtttgagtcaagataaagtgctttgttaggaccggaggttg 23817590  T
Q  392 ttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttga 491  Q
    | ||  | ||||| || |||||| |||||||||||||||| || || ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||  | ||||| ||| ||||    
T  23817591 tgcaagagactacggaaaaagttaagatgatccaagagaagatcaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggagaaaggatattga 23817690  T
Q  492 gtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 520  Q
    ||||||||  || || || ||||||||||    
T  23817691 gtttcaggttggtgatcatgtgtttttga 23817719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23111007 - 23110892
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  23111007 attgtgaagttgcattgtgttccgtcgagcattgtgtcggatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcattgggttcaa 23110908  T
Q  125 agttgagattgagttc 140  Q
    |||| || ||||||||    
T  23110907 agttaaggttgagttc 23110892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24642014 - 24641860
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| ||| | || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||    
T  24642014 attgtgaagttacatggtgtaccgtcgagtattatgtcggatagaggtccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgacttgggttcga 24641915  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggac 179  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24641914 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggttagtcggataggac 24641860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 528 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 24945136 - 24944967
Alignment:
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||   | |  |||||||| ||||| |||    
T  24945136 tcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcaaagagggttggaacagtggcatat 24945037  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||||    
T  24945036 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgggtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 24944967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 559
Target Start/End: Original strand, 24569851 - 24570373
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  24569851 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 24569950  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| || || ||||| ||  | || ||||| ||||||    | || |||||||||||| |||||||| | ||||||||    | ||     
T  24569951 gttctgcttaccatcctcacaccgatgggcaaacagaaaggactattcagagtttggaagatttgttgagagtttgtgttttggagcaaggtttcagttc 24570050  T
Q  237 ggat-agtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcag 335  Q
    |||  |||  | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||    
T  24570051 ggacgagtgtt-taccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttatatcgtcagaggtgtag 24570149  T
Q  336 aactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatg 435  Q
     || |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||  | |||||||| ||  ||||  |  | ||||| || || ||| ||||||  |||||||| |||    
T  24570150 gacaccgttgtgttggtttgagttaggagaaagtgttttgttaggaccggaagttgtgaaagagactacggaaaaggttaagatgaatcaagagaagatg 24570249  T
Q  436 aaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatga 535  Q
    ||  |||| |||||| || | ||||| |||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || || || |||||||| | || | | |    
T  24570250 aaaacgtctcagagtagatagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaa 24570349  T
Q  536 ctggtgtaggacgtgctttgaagt 559  Q
    ||||||| || |||||||||||||    
T  24570350 ctggtgttggtcgtgctttgaagt 24570373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 250 - 572
Target Start/End: Original strand, 12640315 - 12640637
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 349  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |    
T  12640315 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttatgtt 12640414  T
Q  350 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 449  Q
    |||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  12640415 ggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 12640514  T
Q  450 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 549  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | || || ||| ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| || | |||  |||| ||||| || |||    
T  12640515 tagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggagatcatgtgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgt 12640614  T
Q  550 gctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  12640615 gctttgaagtgtaggaagttgac 12640637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 24831370 - 24831905
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||  || ||||||||||  |||||| | ||||||||||   |||||||  | |||||||||||||    
T  24831370 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatctgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctcctttggggactaagttgagattga 24831469  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||| | ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  | |||    
T  24831470 gttctgcttaccatcctcagtccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaaggtgttagttg 24831569  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | || ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||  |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  24831570 ggacgaatgtttaccattgattgagtttacttacaacaacagttttcatgttagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 24831669  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || |  |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  24831670 acaccgttgtgttggtttgagtccggagagaatgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 24831769  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | |  || ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||||||||    
T  24831770 aggtgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagagaacgaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctatgac 24831869  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    ||| || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  24831870 tggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 24831905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 25128907 - 25128474
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||    
T  25128907 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagatgctttgggaactaagttgagattga 25128808  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || |||||||| || || ||||| |||   |||||||| ||||||    |||||||||| || |||  |||| || | |||||| | |  | |||    
T  25128807 gttctgcttatcatccccataccgatgggcagatagagaggactattcagagtttagaggatttattaagagcttgtattttggagcaaagtgtcagttg 25128708  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||       | |  ||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||| ||||| || ||| |||| || || ||||| ||||||||||| || ||     
T  25128707 ggtcgaatgtttgtcgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattcaagtatcggtatgacaccgtttgatgctttgtatggtcggaggtgtagg 25128608  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | |||||| | ||| |||| ||  | ||||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  25128607 acgccgttatgttggtttgagtcgggtgaaagtgttttgttaggatcggaggttgtccaagagactacggaaaaagttaagatgattcaagagaagatga 25128508  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 470  Q
    | || || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  25128507 aagcatctcagagtagacagaagagttatcatga 25128474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 524
Target Start/End: Original strand, 22761752 - 22762239
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||  || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  22761752 catggtattccttttagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 22761851  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||  | || ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||  ||||     | |||||||||||||||  ||||||| |  ||||||| |  | |||    
T  22761852 gttcttcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactcttcaaagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttgaagcaaggtgtcagttg 22761951  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||     
T  22761952 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaagctttgtatggtcggaggtgtagg 22762051  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | |||||  | || ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22762052 acgtcgttgtgttggtttgaatcaggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacataaaaggttaagatgatccaagagaagatga 22762151  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    | ||||| |||||| |  | |||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||  || || || ||||||||||||||    
T  22762152 aagcgtctcagagtaggaagaagagttatcatgacaagaggatgaaagatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagt 22762239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 416 - 470
Target Start/End: Original strand, 27368394 - 27368448
Alignment:
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 470  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27368394 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatga 27368448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 636 - 697
Target Start/End: Original strand, 24833355 - 24833416
Alignment:
Q  636 tttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  24833355 tttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatg 24833416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23890829 - 23890753
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcg 326  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  23890829 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcg 23890753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 570; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 1301 - 620
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1301 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 1202  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1201 tgggttcgaagttgaggttgaattcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 1102  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1101 tcttgagcaaggaggaacttaggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattaaagtattggaatggcacctttcgaggct 1002  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  1001 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactagtaagaaagttc 902  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  901 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcaccataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 802  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  801 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcaaatattggaaagagttgga 702  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  701 acggtggcttaccaagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15041 - 14360
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15041 atcaaggagattgtgaggttacatggggttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 14942  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14941 tgggtttgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 14842  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14841 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagtcatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 14742  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  14741 ttgtatggtcggagatgtagaactccgttgtgttggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtta 14642  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14641 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggataccacgtgtt 14542  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  14541 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 14442  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14441 acggtggcgtatcgggtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtcttccatgtgtcgaaacttcggaagtatg 14360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 566; Significance: 0; HSPs: 69)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 566; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 19113406 - 19112725
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19113406 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 19113307  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19113306 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 19113207  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19113206 tcttgagcagggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggct 19113107  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19113106 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattattcagcaaactactgagaaagttc 19113007  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19113006 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtt 19112907  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  19112906 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 19112807  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19112806 acagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 19112725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 697
Target Start/End: Original strand, 17674090 - 17674769
Alignment:
Q  18 caaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttg 117  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17674090 caaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggccttg 17674189  T
Q  118 ggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttc 217  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674190 ggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagttgctagaggatttgttgagaatttgtgttc 17674289  T
Q  218 ttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17674290 ttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttaccattctagtattggaatggcaccgttcgaggcttt 17674389  T
Q  318 atatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcag 417  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674390 gtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcag 17674489  T
Q  418 atgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttt 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17674490 atgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttt 17674589  T
Q  518 tgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaac 617  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  17674590 tgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaac 17674689  T
Q  618 ggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17674690 ggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 17674769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 22120239 - 22120920
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| || |||| | | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22120239 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtattccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttaattctagattttggaagagtttgcaagaggctt 22120338  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120339 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 22120438  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120439 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 22120538  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22120539 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtgaggtgaaagagtggtcttaggatcagagattgttcagcagactactgagaaagttc 22120638  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22120639 ggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatt 22120738  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22120739 tttgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacctcgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttgga 22120838  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22120839 acggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttgaacaacgttttccatgtgtcgcaactttggaagtatg 22120920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 697
Target Start/End: Original strand, 19484974 - 19485616
Alignment:
Q  55 attgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgc 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19484974 attgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtctgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccac 19485073  T
Q  155 agacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 254  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485074 agacagatggtcaatcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagtaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 19485173  T
Q  255 gatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttt 354  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19485174 gatcgagttcacttataataatagctatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggttt 19485273  T
Q  355 gagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgac 454  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485274 gaatccggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaaccactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgac 19485373  T
Q  455 aaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgcttt 554  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19485374 aaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcttt 19485473  T
Q  555 gaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcg 654  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19485474 gaagtcgaagaagttgacctcgaagttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcg 19485573  T
Q  655 aatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485574 aatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19485616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 697
Target Start/End: Original strand, 20017865 - 20018496
Alignment:
Q  66 tagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20017865 tagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggccttgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggt 20017964  T
Q  166 cagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttca 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017965 cagtcggagaggacaattcagtcgttagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttca 20018064  T
Q  266 catacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtga 365  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  20018065 cttataataatagttatcattctagtattggaatggcaccgttcgaggccttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggaga 20018164  T
Q  366 aagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttat 465  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018165 aagagtggtcttaggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttat 20018264  T
Q  466 catgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaaga 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018265 catgacaagcgtagaaaagatcttgaatttgaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaaga 20018364  T
Q  566 agttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaa 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20018365 agttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaa 20018464  T
Q  666 tgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20018465 cgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 20018496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 518; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 30313209 - 30313890
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313209 atcaaggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 30313308  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30313309 tgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggattagttgagagtttgtgt 30313408  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30313409 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaacggcaccttttgaggct 30313508  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  30313509 ttgtatggtcggagatgcagaactccattgtggtggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttagggctcgagattgttcagcagactactgagaaagtta 30313608  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313609 agatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 30313708  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  30313709 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 30313808  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313809 acggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 30313890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15534077 - 15533415
Alignment:
Q  35 tacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagatt 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15534077 tacatggtgttccttcgagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagatt 15533978  T
Q  135 gagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaact 234  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15533977 gagttcggcttatcatccacagaaagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaact 15533878  T
Q  235 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgca 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15533877 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgca 15533778  T
Q  335 gaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaat 434  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  15533777 gaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaaatgatacaagagaagat 15533678  T
Q  435 gaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatg 534  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  15533677 gaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggtgaccacatgtttttgagagtcactcctgtg 15533578  T
Q  535 actggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgg 634  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15533577 gctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgg 15533478  T
Q  635 gtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533477 gattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15533415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 32600860 - 32600179
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32600860 atcaaggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctaggttttggaaaagtttgcaagaggctt 32600761  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||    
T  32600760 tgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcgttataggatttgttgagagtttgtgt 32600661  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32600660 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 32600561  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||     
T  32600560 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttcggtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagtagactactgagaaggtta 32600461  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32600460 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcaggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 32600361  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  32600360 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 32600261  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32600260 acggtggcgtatcgagtgggattaccaccacgtctttcgaatttgcacgacgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 32600179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 697
Target Start/End: Original strand, 22133127 - 22133787
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22133127 catggtgttccttcgagcattgtatcaaatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattga 22133226  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133227 gttcagcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 22133326  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22133327 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggtgatgcaga 22133426  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22133427 actccgttgtgcgggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttaggacccgagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 22133526  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || || | ||||    
T  22133527 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggagacattgtgtttttgagagacactcatgtgac 22133626  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||     
T  22133627 tggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtcgga 22133726  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133727 ataccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22133787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 694
Target Start/End: Original strand, 16408131 - 16408788
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16408131 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagacccaagatttacttatagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttctaagttgagattga 16408230  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408231 gttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 16408330  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16408331 ggatagtcatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatggtcggagatacaga 16408430  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16408431 actccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccggagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 16408530  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| || |||||||||||||| || |||||||||| || | ||||    
T  16408531 aagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttaagttccaagaaggagaccacgtattgttgagagtcactcttgtgac 16408630  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  16408631 tggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtggga 16408730  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagt 694  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408731 ttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagt 16408788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 22047089 - 22046408
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22047089 atcaaggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcatcatatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 22046990  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22046989 taggttcgaaattgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 22046890  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22046889 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatggttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 22046790  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22046789 ttgtatggtcagagatgcagaactccgttgtgctggtttgaatcaggtgaaagagtggtcctaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtta 22046690  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22046689 agatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgataaacgcaggaaggatcttgagttttaggaaggagaccacgtgtt 22046590  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| | |||||||| | ||||| |||||||    
T  22046589 tttgagagtcactccagtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccgaggtttattggttcgtatcagatatcggaaagagttgga 22046490  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046489 acggtggcgtatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22046408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 19978683 - 19978002
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19978683 atcaatgaaattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtaacaaatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaggaggctt 19978584  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19978583 tgggttctaagttgagattgagctcgacgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagatttagtgt 19978484  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19978483 acttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacaattatcattctagtattggaatggcacctttggaggct 19978384  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  19978383 ttatatggtcgaagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtta 19978284  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19978283 agatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 19978184  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  19978183 tttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaatagttgga 19978084  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19978083 acggtggcgtaacgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19978002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 697
Target Start/End: Original strand, 22164278 - 22164937
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22164278 catggtgttccttcgagcattgtattagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggttcgaagttgagattga 22164377  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22164378 gttcagcgtgtcatccgcagacatatggtcagtcagagaggacaattcagtcgct-gaagatttgttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 22164476  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||    
T  22164477 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtacggtcggtgatgcaga 22164576  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22164577 actccgttgtgcaggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttcggacccgagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatga 22164676  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| || | ||||    
T  22164677 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggagacattgtgtttttgaaagtcactcatgtgac 22164776  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||     
T  22164777 tggtgttggacgtgccttgaagtcaaataagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgcatcgagtggga 22164876  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22164877 ttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22164937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 689
Target Start/End: Original strand, 21166606 - 21167275
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21166606 aaggagattgtaaagttgcatggtgttccttcgagcatt-tatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 21166704  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21166705 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtact 21166804  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21166805 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagtttacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 21166904  T
Q  319 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 418  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  21166905 tatggtcgaagatgcagaactcaattgtgttggtttgaatcaggtggaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaaga 21167004  T
Q  419 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 518  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21167005 tgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttt 21167104  T
Q  519 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 618  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||     
T  21167105 gagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaaca 21167204  T
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcg 689  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  21167205 gtggcgtatcgagttgggttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcg 21167275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 23650748 - 23650076
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  23650748 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagtattgtttcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 23650649  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  23650648 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcaatcggagagaacgattcagtcgctagaggacttgttgagagtttgcgtacttgagca 23650549  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||||    
T  23650548 aggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcgccttatgaagctttgtatggt 23650449  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  23650448 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattc 23650349  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23650348 aagagaagataaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgagagt 23650249  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | | ||| ||||||||||||||||    
T  23650248 cactcctgtgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggct 23650149  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||    
T  23650148 tatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcttgtgttgcaacttcggaagtatg 23650076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 21921809 - 21922481
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  21921809 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 21921908  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21921909 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgtagaggacgattcaatagctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagca 21922008  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  21922009 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctactattggaatggcaccttatgaggctttctatggt 21922108  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  21922109 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtggaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgaaaaggttaagatgattc 21922208  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  21922209 aagaaaagatgaaagtgtcgcagagtccacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagt 21922308  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || || | |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||  |  |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||     
T  21922309 cactcatgtgactggtgttggacaagctttgaagtcgaagaagttgactccgagatatattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcg 21922408  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||    
T  21922409 taccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgcacgacgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21922481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 21251648 - 21250977
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  21251648 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 21251549  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21251548 agttgaggttgagtttggcgtatcatccacagacagatagtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagca 21251449  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||   | ||||| ||||||    
T  21251448 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattgagatgacaccttattacgctttgtatggt 21251349  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||      
T  21251348 cgaagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgatta 21251249  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21251248 aagag-agatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaataaggagaccacgtgtttttgagagt 21251150  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||     
T  21251149 cactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcg 21251050  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21251049 tatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21250977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 21788433 - 21789104
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  |    
T  21788433 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttccagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggtttta 21788532  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21788533 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagca 21788632  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||    
T  21788633 aggaggaacttgggatagtcatctcccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggcttg-tatggt 21788731  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  21788732 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttaaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtttagcaaactaccgagaaggttaagatgattc 21788831  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21788832 aagagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcatgaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagt 21788931  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||| | |||||||||     
T  21788932 cactcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggcg 21789031  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  21789032 taccgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcctgtgtcgcaacttcagaagtatg 21789104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 21393939 - 21394611
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  |    
T  21393939 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttccagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggtttta 21394038  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21394039 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagca 21394138  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg- 323  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||     
T  21394139 aggaggaacttgggatagtcatctcccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggcttg-tatggg 21394237  T
Q  324 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 423  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||     
T  21394238 tcggagatgcagaactccgttgtgttggtttaaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtttagcaaactaccgagaaggttaagatgatt 21394337  T
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21394338 caagagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcatgaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagag 21394437  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 623  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||| | |||||||||    
T  21394438 tcactcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggc 21394537  T
Q  624 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  21394538 gtaccgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcctgtgtcgcaacttcagaagtatg 21394611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 18857293 - 18856853
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18857293 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcct 18857194  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18857193 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcacccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgt 18857094  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18857093 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataataggtatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 18856994  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18856993 ttatatggtcggagatgcataactctgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtcgtcttaggaccagagattgttcagcaaactactaagaaagttc 18856894  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaa 456  Q
     |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18856893 ggatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 18856853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 22987903 - 22987236
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||     ||||||||||| |||||| |||||||||| || || |    
T  22987903 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatgagatagagattcgagattta-----agattttggaagagtttgtaagaggctttaggttcta 22987809  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22987808 agttgaggttgcgttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaggacgattcagtcgttagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 22987709  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||    
T  22987708 aggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcatgtacaataacaattatcattctagtattggaatgacaccttttgaggctttgtacggt 22987609  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||| |||||| || | |||||||| ||||||| |||||||| | | ||||| |    
T  22987608 cggagatgcagaactccgttgtgttggttcgagttaggtgagagtgtggttttaggagcataaattgttcaacaaactattgagaaagataatatgattc 22987509  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  22987508 aagagaagatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgattttcaagaaggagatcatgtattttttagagt 22987409  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||  |||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |   ||| | |||||||||||||     
T  22987408 cactccagtgactgatgttggacatgcattgaagtcaaagaagttgactctgaagtttattggtccgtatcagatatcataaagaattggaacggtggcg 22987309  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  22987308 tatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagtaatacatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22987236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 16 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22040575 - 22040162
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22040575 atcaaggagattgtgaggttacatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaacatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 22040476  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22040475 taggttcgaaattgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagttggagaggacaattcaatcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 22040376  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22040375 tcttgagcaaggatgaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaatattagttatcattctagtattcgaatggcaccttttgaggct 22040276  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22040275 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgaatgaggtgaaagagtggtcctaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtta 22040176  T
Q  416 agatgatccaagag 429  Q
    ||||||| ||||||    
T  22040175 agatgattcaagag 22040162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 25 - 577
Target Start/End: Original strand, 22377528 - 22378079
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  22377528 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggcttttggttcta 22377627  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | || || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22377628 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagca 22377727  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||     
T  22377728 aggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaacaatagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggc-ttgtatgga 22377826  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
     | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  22377827 agaaggtgcagaactcctttgtgttggttcgagtcgggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttaaacaaactacggagaaggttaagatgattc 22377926  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||    
T  22377927 aagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggt 22378026  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 577  Q
    || |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22378027 cactccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 22378079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 25 - 577
Target Start/End: Original strand, 22383703 - 22384254
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  22383703 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggcttttggttcta 22383802  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | || || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22383803 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagca 22383902  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||     
T  22383903 aggaggaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaacaatagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggc-ttgtatgga 22384001  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
     | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  22384002 agaaggtgcagaactcctttgtgttggttcgagtcgggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttaaacaaactacggagaaggttaagatgattc 22384101  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||    
T  22384102 aagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggt 22384201  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 577  Q
    || |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22384202 cactccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 22384254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 25 - 694
Target Start/End: Original strand, 20396199 - 20396868
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  20396199 attgtgaagttgcatggtgtcctgccgagcattgtgtcagatagagatccaaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttcta 20396298  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    || || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20396299 agctgtggttgagttcggcgtatcatctgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 20396398  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  20396399 aggtgcgacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacaattatcattctagtattggaatggcaccattcgaagctttgtatggt 20396498  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || || || || || |||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||| || |||| |    
T  20396499 cggaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtcaggcgagagtgtagttttgggactagatatcgttcaacaaactactgagaaggttaagttgatgc 20396598  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  20396599 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagtgttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagtttcaggaaggagaccatgtattttttagagt 20396698  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||  |||| |  |  || |||||||  |||||||| |  |||| | ||| ||  |||||     
T  20396699 cactcctgtgaccggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaaactgactctaagatttattggtctgtatcagatatcagaaagaattgaaatagtggcg 20396798  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagt 694  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||  || |||||||  |||||||||||||    
T  20396799 tatcgagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgatgcatttcatgtgtaacaacttcggaagt 20396868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23949624 - 23949158
Alignment:
Q  27 tgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaag 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| || || |||    
T  23949624 tgtgaagctacatggtgttccgtcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtatgcaataggttttaggttctaag 23949525  T
Q  127 ttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaag 226  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||| | || || ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23949524 ttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagatagatggtcagtcggaaataacgattcagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagcaag 23949425  T
Q  227 gaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23949424 gaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaagctctatatggtcg 23949325  T
Q  327 gagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaa 426  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23949324 gaggtgtaggactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagaaatcgtt-agcaaactactgagaaagttaagatgatccaa 23949226  T
Q  427 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtt 494  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  23949225 gaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggaccttgagtt 23949158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 37 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 20388794 - 20388134
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  20388794 catggtgttccgtcgataattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgtaagaggcgttgggttctaagttgaggttga 20388695  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  20388694 gttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaaagattcagtcgttagaggattttttgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttg 20388595  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||    
T  20388594 ggatagtcatctaccgttgatagagttcatgtacaacaacagttaccattcgagtattggcatggcaccgttcgaagctttgtatggttggaggtgcaga 20388495  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga-tgatccaagagaaaatg 435  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||  || || || |||| ||| || ||||| || |||||  | |||| ||| | ||||   |||||| |||    
T  20388494 actccgttgtgttggtttgagtcgggttaaaatgtagtgttgggacgagatatagttcatcagactac-aaaaaaggtcaaattgataagagagaagatg 20388396  T
Q  436 aaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatga 535  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||   |||    
T  20388395 aaagcgtcgtagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgagagtcactctagtga 20388296  T
Q  536 ctggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtggg 635  Q
    | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||| |  || | |||||| || ||| | ||| |||||||    
T  20388295 caggtgttggtcgtgctttgaagtctaagaagttgaccccacggtttattggtccatattagatatctgagagagttgggacagtgacatatagagtggg 20388196  T
Q  636 tttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| || || |||||||||||| ||||  |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  20388195 tttgccaccacatctttcgaatgtgcatgatgtgtttaatgtgtcgcaatttcggaagtatg 20388134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 1266945 - 1266274
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  1266945 attgttaagctgcatggtgtaccgtcgagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattatggaagagcttgcaagatgctttgggttcaa 1266846  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||| || || ||  ||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  1266845 agttgagattgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcggtcggagaggacgatccaatctttagaggatttactgagagtgtgtgtacttgagca 1266746  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1266745 aggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 1266646  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || || |||||| ||| | |||||||      
T  1266645 cagaggtgcaggactcctttgtgctagtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgag-aaggtaagatgataa 1266547  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| |||||||    
T  1266546 gggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagt 1266447  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| |||||     
T  1266446 tactccgatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggca 1266347  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1266346 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 1266274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 37 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 19852106 - 19851448
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||| |||||| || ||||| || || ||||| ||||    
T  19852106 catggtgttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagttcgcaagatgcattgggttcaaaattgaggttga 19852007  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  19852006 gttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttg 19851907  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    | |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  19851906 gtatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtattggtatggaaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagg 19851807  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||  | |||||  |||| ||  |||||||   ||| || ||||    
T  19851806 actccattgtgttggtttgagtcgggtgaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcattagactacatagaaggtcaagatgataagagaaaatatga 19851707  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||  ||||    
T  19851706 aagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgttgac 19851607  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
     | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  || |  |||||||| ||||| ||   |||||||    
T  19851606 ggttgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggt 19851507  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagta 695  Q
    || || || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19851506 ttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagta 19851448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 37 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 19858142 - 19857484
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||| |||||| || ||||| || || ||||| ||||    
T  19858142 catggtgttccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagttcgcaagatgcattgggttcaaaattgaggttga 19858043  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  19858042 gttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttg 19857943  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    | |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  19857942 gtatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtattggtatggaaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagg 19857843  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  | |||||  | |||||  |||| ||  |||||||   ||| || ||||    
T  19857842 actccattgtgttggtttgagtcgggtgaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcattagactacatagaaggtcaagatgataagagaaaatatga 19857743  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||  ||||    
T  19857742 aagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccgttgac 19857643  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
     | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  || |  |||||||| ||||| ||   |||||||    
T  19857642 ggttgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggt 19857543  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagta 695  Q
    || || || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19857542 ttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagta 19857484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 23655634 - 23654962
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||     
T  23655634 attgtgaagttgcatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagacgccttgggttcgg 23655535  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  23655534 agttgaggttgagttcgggttatcatccgcagacagatggtcagtcagagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 23655435  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| | ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  23655434 aggtggagcctgggacagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttatcattcgagtattagtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 23655335  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||      
T  23655334 cggaggtgcagaactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgataa 23655235  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||  ||||| |||||||    
T  23655234 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagacggagatcatttgtttctgagagt 23655135  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  ||| |||| ||||      
T  23655134 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggtttgaacagtggta 23655035  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||  | ||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23655034 tatatattgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 23654962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 31416548 - 31417220
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  31416548 attgtgaagctacatggagtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggatcga 31416647  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  31416648 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 31416747  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  31416748 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattagtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 31416847  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | || || || ||||||||||||||  |||||||      
T  31416848 cggaggtgcatgactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttagtgcatcagactactgagaaagtcaagatgat-- 31416945  T
Q  425 aagagaaaa--tgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 522  Q
    ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |  |||||||||||||| || || || || ||| |||||    
T  31416946 aagggaaaaggtgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcggataaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgaga 31417045  T
Q  523 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 622  Q
    || | || |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||  ||||  |||||||| ||||    
T  31417046 gttactcttatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtattagatttcagaaagggttggaacagtgg 31417145  T
Q  623 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||| |||| | ||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  31417146 catatagagttgctttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactacggaagtatg 31417220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 22061507 - 22062179
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||| |||| || |||||||| ||||    
T  22061507 attgtgaaactacatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagggatccaaggttcacttctaggttctggaagagtctgcaggacgctttgggttcga 22061606  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || ||  | ||| ||||||||||| | ||||| |||||| |    
T  22061607 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgaagaggacgatccaatcattggagtatttgttgagagtgtgtgtgcttgagga 22061706  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  22061707 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatggt 22061806  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||||||     
T  22061807 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatca 22061906  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     | | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || |||||| |||| ||    
T  22061907 gaaaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggt 22062006  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  || |  |||||||| |||||     
T  22062007 tactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcaaatatcagagagggttggaactgtggca 22062106  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22062107 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22062179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 20009974 - 20010646
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||   || || ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || |    
T  20009974 attgtgaagttgcatggtgttccatcgagtattgtgtcggatagaaatttcaggttcacttcaaggttttggaagagtttacaagatgccttgggttcaa 20010073  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    |||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  20010074 agttaagggtgagttcggcttatcatccgcaggcagatggtcattcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 20010173  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||    
T  20010174 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcaagtattggtatggcaccgttcgaaactttgtatggt 20010273  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || ||||||||  | ||||| || ||||  ||||| || ||||||||      
T  20010274 cggaggtgtaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgttgttgggaccagatttagttcatcagactatagagaaggtccagatgataa 20010373  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||    
T  20010374 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaagaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagt 20010473  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  20010474 cactccgatgacgggtgtgggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagggttggaacagtggca 20010573  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  20010574 tacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtatttcacgtgtcgcaacttcggaagtatg 20010646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 21841124 - 21840452
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| || |    
T  21841124 attgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcagatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttaaaagatgccttgggttcta 21841025  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  21841024 agttgaggttgagttcggctcatcatctgcaaacaaatggtcagtcggagagaacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 21840925  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  21840924 aggtggagcttgggatagtcatctatcgttgatagaattcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 21840825  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||      
T  21840824 cggaggtgcaggacccctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataa 21840725  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| | |||||    
T  21840724 gagaaaagataaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcgaaggaaggcacttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctaagagt 21840625  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | |||||| || ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  21840624 tactcctataacaggtgtaggaggtgcactgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggca 21840525  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  ||||| |||| || || |||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21840524 tacagagtgagtttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgtattccacgtgtcgcaacttcggaagtatg 21840452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 29303500 - 29304172
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  29303500 attgtgaagctacatggggttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcga 29303599  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||| ||  | ||||| ||||||||    
T  29303600 ggttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggatgatttgttaagggtgtgtgtacttgagca 29303699  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||| || || |||||||| |||||||| || || || |  |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||    
T  29303700 aggtggagcttgggatagccacctaccgttgatagagttcacttataacaacaactatcattcgagtataggtatggcaccgttcgaagccttgtatggt 29303799  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcag-atgatc 423  Q
    ||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||| |||| |||||     
T  29303800 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaag-tcagaatgata 29303898  T
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
       || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| |||| |    
T  29303899 agggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgaggg 29303998  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 623  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||  || | | ||||||| |||||    
T  29303999 tcactccaatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagatcataggtccgtatcagatttcagagagaattggaacagtggc 29304098  T
Q  624 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  29304099 ttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttaggaagtatg 29304172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 697
Target Start/End: Original strand, 31570917 - 31571588
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  31570917 ttgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaa 31571016  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  | || || ||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  31571017 gttgaggctgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcattggaagacttgttgagagtgtgtgtgcttgaacag 31571116  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  31571117 ggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaatagttatcattcgagtataggaatggcaccattcgaagctttgtatggtc 31571216  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||  | ||||| ||  | |||||| | ||||| || |||||  ||||||||      
T  31571217 gaaggtgcaggactccgttgtgttggttcgagtcaggagaaagtgttgtgctgggaccggatttggttcaggagactacagaaaaagtcaagatgatcag 31571316  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| |||||||     
T  31571317 agagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagtg 31571416  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctt 625  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||  || | | | ||||||||||| |    
T  31571417 actccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaaattcattggcccgtatcagatttcagagagaataggaacggtggcat 31571516  T
Q  626 atcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||| || || || || ||||| ||||| |||||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  31571517 atagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 31571588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 14565846 - 14565177
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||    
T  14565846 gtgaagcttcatggtgttccgtctagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagt 14565747  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  14565746 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggaaaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 14565647  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  14565646 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 14565547  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||  | || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||    |    
T  14565546 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgaaagtattgtgttgggaccggatttggttcacgagactactgagaaagtcaggttgataaggg 14565447  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||| |||| ||||     
T  14565446 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 14565347  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || | |||||| || ||||| |||    
T  14565346 tcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtacagtggcatat 14565247  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| || | || ||||| || || |||||||||||||    
T  14565246 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatttgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 14565177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 6679815 - 6679146
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  6679815 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagt 6679716  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  6679715 tgaagttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 6679616  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  6679615 tggagcttgggacagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 6679516  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||   ||    
T  6679515 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagag 6679416  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||     
T  6679415 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 6679316  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | |||||| || ||||| |||    
T  6679315 tcctttgacgggtgttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatat 6679216  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  6679215 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 6679146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 22051569 - 22051008
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || ||    
T  22051569 ttgtgaagctaaatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttccaa 22051470  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||| |||||||| | ||||| ||||| |||    
T  22051469 gttgagattgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcgttggaggatctgttgagagtgtgtgtgcttgaacaa 22051370  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||||||||| || || || || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22051369 ggtggagcttgggatagtcacctaccatttatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtc 22051270  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || || || ||||||||  | ||||| || || || ||||| ||  |||||||       
T  22051269 ggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcaacagacgacagagaaggtcaagatgataag 22051170  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
     || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||| || || || || || ||||||| |||     
T  22051169 ggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttttgaaagtt 22051070  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattgg 587  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22051069 actccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaggaagttgactccgaagttcattgg 22051008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Original strand, 803750 - 804419
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  803750 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 803849  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  803850 tgaggttgagtttggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaagg 803949  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  803950 tggagcttgggatagtcacttacctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 804049  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||   | ||||    |    
T  804050 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcacgagactactaagaaagtcaggttgataaggg 804149  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||| |||| ||||     
T  804150 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 804249  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  || | | |||| || ||||| |||    
T  804250 tcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatat 804349  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  804350 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 804419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 6604362 - 6603693
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  6604362 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaaaagtttacaggacgccttgggttcgaagt 6604263  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  6604262 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 6604163  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||||||| |||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  6604162 tggagcttgggacagtcacttacctttgattgagtttacgtataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 6604063  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||   ||    
T  6604062 aggtgtaggactcctttgtgttggtttgagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataagag 6603963  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||     
T  6603962 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcac 6603863  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||  || | | |||| || ||||| |||    
T  6603862 tcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcaaatttcagagagaattggtacagtggcatat 6603763  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  6603762 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 6603693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 12305462 - 12304793
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||  || ||||| ||||| || ||  | ||||| |||||||    
T  12305462 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagcattgtgtcagatagggatccgaggttcacttctatgttctggaagagtttacaggacacattgggttcgaagt 12305363  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  12305362 tgagattgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 12305263  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| |||||||| || || || || ||||| || || ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  12305262 tggagcttgggatagtcacatgccattgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagcattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 12305163  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || || || || |||||||||||||| ||||| || |  || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||    |    
T  12305162 aggtgtaggacccctttatgctggtttgagtcgggtgagagtgctgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgataaggg 12305063  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| | || ||||     
T  12305062 aaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttcttagggtcac 12304963  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  |||| ||| ||||| |||    
T  12304962 tcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttgaaacagtggcatat 12304863  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  12304862 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 12304793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 25 - 362
Target Start/End: Original strand, 20975725 - 20976062
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  20975725 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcagatggagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcatgatgctttgggttcga 20975824  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||| ||||    
T  20975825 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtactttagca 20975924  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  20975925 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 20976024  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcagg 362  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  20976025 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcagg 20976062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 425 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 22032339 - 22032067
Alignment:
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22032339 aagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaggatcttgagttttaggatggagaccacgtgtttttgagagt 22032240  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||   |||||||| | ||||| ||||| |||| ||||     
T  22032239 cactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccgagatttattggtttgtatcagatatcggaaagagttgaaacgttggcg 22032140  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22032139 tatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttacacgatgttttccatgtttcgcaacttcggaagtatg 22032067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 337 - 698
Target Start/End: Original strand, 21681856 - 21682217
Alignment:
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||   ||| || ||||    
T  21681856 actcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatga 21681955  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||| | |||||||||    
T  21681956 aagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgac 21682055  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  21682056 gggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggt 21682155  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatga 698  Q
    || || || ||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21682156 ttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatga 21682217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 319 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 20008263 - 20007885
Alignment:
Q  319 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 418  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||    
T  20008263 tatggtcggaggtgcatgactcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaggtaaaga 20008164  T
Q  419 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 518  Q
    ||||   ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||| || || ||||| || |||||| |    
T  20008163 tgataagagaaaagatgaaagcgtcgcatagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagttccaagagggagatcatgtgtttct 20008064  T
Q  519 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 618  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |  || |  ||||||||     
T  20008063 gagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaacaaggtgactccaaagttcattggtccatatcagatatctgagagggttggaaca 20007964  T
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||| |||||||||| |  || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20007963 gtggcatatagagtgggtttgctaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 20007885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 365
Target Start/End: Original strand, 16271301 - 16271638
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || || ||||| |||||||    
T  16271301 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagcattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttatggaagagtttacaggacgccttgggttcgaagt 16271400  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  16271401 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacaattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 16271500  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| || ||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  16271501 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgaattcacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 16271600  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtga 365  Q
    || || || ||||| || |||||||||| ||| |||||    
T  16271601 aggtgtaggactcctttatgctggtttgcgtcgggtga 16271638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 346 - 697
Target Start/End: Original strand, 21324804 - 21325156
Alignment:
Q  346 tgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgc 445  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||   ||| || |||||  ||||||    
T  21324804 tgctggtttgagtcaggagatagtgtggtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaaacgtcgc 21324903  T
Q  446 agagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtagg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| || | ||||||||| ||||||||    
T  21324904 agagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtagg 21325003  T
Q  546 acgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccg 645  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |   | |  |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||     
T  21325004 acgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcatagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccacca 21325103  T
Q  646 catc-tttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| ||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21325104 catcatttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21325156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 459 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 23949162 - 23948924
Alignment:
Q  459 gagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaag 558  Q
    ||||||| |||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||     
T  23949162 gagttattatgataagcgtaggaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactggttttagacgtgctttgaaa 23949063  T
Q  559 tcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatt 658  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||||||| |||||||| |  |||| | || | |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23949062 tcaaagaagttgactccgaggtttgttggtccgtatcagatatcagaaagaattagtacggtggcgtagcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatt 23948963  T
Q  659 tgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  23948962 ttcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatg 23948924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 493 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15441420 - 15441216
Alignment:
Q  493 tttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccat 592  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |    
T  15441420 tttcaagaaggtgaccacatgtttttgagagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 15441321  T
Q  593 atcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaa 692  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15441320 atcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgtgtttgattaccacctcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgtaa 15441221  T
Q  693 gtatg 697  Q
    |||||    
T  15441220 gtatg 15441216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22371647 - 22371371
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||  |||| ||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  22371647 attgtgaagtttcatgggcttccatcgagtattgtgtcgaatagagatccgaggtttacttcaaggttttggaagagtttgcaagatgcgttgggttcaa 22371548  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  22371547 agttgaggttgggttcggcttataatccgcaaacagatggtgagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgctgagaatgtgtgtacttgagca 22371448  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatgg 301  Q
    | | ||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  22371447 acgtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagatttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgg 22371371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27355252 - 27355035
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||    
T  27355252 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagt 27355153  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  27355152 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacggatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtgcttgagcaagg 27355053  T
Q  228 aggaacttgggatagtca 245  Q
     ||| |||||||||||||    
T  27355052 tggagcttgggatagtca 27355035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 16877181 - 16877716
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| || |||||||||  ||||||||  | ||||| |||||||    
T  16877181 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaggtttgcaagctgctttgggaactaagttaagattga 16877280  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  16877281 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 16877380  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||     
T  16877381 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgcagg 16877480  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || ||||| || ||||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  16877481 acaccgttatgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 16877580  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | || || ||| ||||||||||||  ||||| || ||||| ||||| || | |||  ||||    
T  16877581 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggagatcatgtgttcttgagggtgaatccggtgac 16877680  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     ||||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  16877681 cggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 16877716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 21196588 - 21197123
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| |  |||| || ||||||||||  |||||| | || ||||||   |||||||   | |||||||||||||    
T  21196588 catggtattccttctagtattgtgtcagatcggaatccgaggtttacttctacgttttgggagagcttgcaaactgctttggaaactaagttgagattga 21196687  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||| |  ||||||| ||| ||    |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    | |||    
T  21196688 gttctgcttatcatccccagaccgatgggcagacatagaggactatttagagtttagaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtatcagttg 21196787  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  21196788 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtattggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 21196887  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| |||||||| || || ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||   | |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21196888 acaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactatgtaaaaagttaagatgattcaagagaaaatga 21196987  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | ||||| |||||| | || | |||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||| ||| || || |||||||||||||| | |||| | ||    
T  21196988 aagcgtctcagagttggcagaggagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggtaggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtaac 21197087  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    ||| || || ||| |||||||||  | |||||||||    
T  21197088 tggagttggtcgtactttgaagtgtaggaagttgac 21197123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 460 - 697
Target Start/End: Original strand, 16265127 - 16265364
Alignment:
Q  460 agttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 559  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| |||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  16265127 agttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgctttgaagt 16265226  T
Q  560 caaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaattt 659  Q
    | | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| ||    
T  16265227 cgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 16265326  T
Q  660 gcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  16265327 gcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 16265364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 143
Target Start/End: Original strand, 22129005 - 22129132
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| || |||| | | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22129005 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtattccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttaattctagattttggaagagtttgcaagaggctt 22129104  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggc 143  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||    
T  22129105 taggttcgaagttgaggttgagttcggc 22129132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 22315886 - 22315364
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||| ||| |||||| |||||||||||   ||||||||  | |||||||| ||||    
T  22315886 catggtattccttccagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttttaggttttgggaaagtttgcaaactgctttgggaactaagttgaggttga 22315787  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    || | || |||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||| ||| ||    | || |||||||| |||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  22315786 gtcctgcttatcatccccagagtgatgggcagacggagaggactatttagagtttggaagatttgttaagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 22315687  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    || |     ||| |||||||| ||||| || || || || |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| | || || |||    
T  22315686 ggttgaatgtctaccgttgattgagtttacttataacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtaga 22315587  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || || ||||| |||| |||||||||||||||        ||||||| ||  |||||||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  22315586 acgccattgtgttggtatgagtcaggtgaaagttcttgggtaggaccggaagttgttcaagaaactacagaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 22315487  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | || || ||  ||||||||||||  || || || |||||||||||||| | |||| | ||    
T  22315486 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtaac 22315387  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagt 559  Q
     |||||||| |||||||||||||    
T  22315386 cggtgtaggtcgtgctttgaagt 22315364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 21850423 - 21850958
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  21850423 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 21850522  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  21850523 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 21850622  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  21850623 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggtaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 21850722  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || || |   | ||||| || ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || || || ||||    
T  21850723 acaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttagggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggaaaagatga 21850822  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| | |  || ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| ||||    
T  21850823 aggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggatgaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgac 21850922  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     ||||| || |||| ||||||||  | |||||||||    
T  21850923 cggtgttggtcgtgatttgaagtgtaggaagttgac 21850958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 253 - 572
Target Start/End: Original strand, 20652635 - 20652954
Alignment:
Q  253 ttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 352  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||| |||| || || || |||||||| ||||    
T  20652635 ttgattgagtttacttacaacaatagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacaccgttgtgttggt 20652734  T
Q  353 ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcg 452  Q
    || |||| || ||||| |   | |||||||| ||| | || ||  | ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  20652735 ttaagtccggagaaagtgccttgttaggaccggaggtggtgcaagagactacggagaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtgg 20652834  T
Q  453 acaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgct 552  Q
    ||| |||||||||||| | ||| | ||||| ||| | |||||||| |  || || || || ||||||||||| | || | |||| ||||| || ||||||    
T  20652835 acagaagagttatcattataagaggagaaaggatatagagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgct 20652934  T
Q  553 ttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    |||||||  | |||||||||    
T  20652935 ttgaagtgtaggaagttgac 20652954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 22983128 - 22982596
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | |||| |||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  22983128 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtt-gcaagctgctttgggaactaagttgagattga 22983030  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  | |||    
T  22983029 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcaaacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtcttggagcaaggtgtcagttg 22982930  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||| |    ||| |||||||| ||||| || ||||| || | || |||||||||| | || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  22982929 ggacaaatgtctaccgttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtgtcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 22982830  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||  |  | ||  ||| ||| ||  |||| ||  | ||||  || || ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22982829 acaccgttgtgttggtttgagtcaagtgagtgctttgt--tagaaccggaagttgtgcaagagactatggaaaaggttaagatgatccaagagaagatga 22982732  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | || || |||||| |||| |||||||||||||| ||  |  |||||||| ||||||||||||  || || || | |||||| ||||| | || | |||     
T  22982731 aagcatctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggtgaaaagatattgagtttcaggttggtgatcatgcgttttttagagtgaatcatgtgat 22982632  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    |||||| || |||||||||||||   ||||||||||    
T  22982631 tggtgttggtcgtgctttgaagtgtcagaagttgac 22982596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 457 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 28982632 - 28982392
Alignment:
Q  457 aagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttga 556  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| |||| |||  |||| ||||| |||||||| ||||    
T  28982632 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgccttga 28982533  T
Q  557 agtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa 656  Q
    |||| | ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  || | | |||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||    
T  28982532 agtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 28982433  T
Q  657 tttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||||| | || || ||||| || || |||||||| ||||    
T  28982432 cttgcacgacgtgtttcatgtttctcagcttcggaaatatg 28982392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 457 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 28987852 - 28987612
Alignment:
Q  457 aagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttga 556  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| |||| |||  |||| ||||| |||||||| ||||    
T  28987852 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgccttga 28987753  T
Q  557 agtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa 656  Q
    |||| | ||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  || | | |||| || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||    
T  28987752 agtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 28987653  T
Q  657 tttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||||| | || || ||||| || || |||||||| ||||    
T  28987652 cttgcacgacgtgtttcatgtttctcagcttcggaaatatg 28987612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 368
Target Start/End: Original strand, 23157098 - 23157428
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||| | || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||| ||||||||    
T  23157098 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggattcgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgctttgggaactaagtagagattga 23157197  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||  | ||||| || ||||| ||||| | | |||||| ||  ||||||    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  23157198 gttctacttatcacccccagactgatgggccgacggagaagattattcagagtttagaggatttgttgagaacttgtgtt-tggagcaaggtgttagttg 23157296  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || ||| |||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  23157297 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatgacaccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 23157396  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaag 368  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23157397 acaccgttgtgttggtttgaatcaggtgaaag 23157428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 522 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 27347436 - 27347261
Alignment:
Q  522 agtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtg 621  Q
    ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  ||||| || |||    
T  27347436 agtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttgggacagtg 27347337  T
Q  622 gcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||  ||| |||||  | || ||||||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  27347336 gcatataaagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 27347261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 62
Target Start/End: Original strand, 19484130 - 19484175
Alignment:
Q  17 tcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatc 62  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19484130 tcaaggagattgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatc 19484175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23900971 - 23900822
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| |  ||||| |||||| | ||||  || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||  | ||||||||  |||    
T  23900971 catggtattccttctaatattgtgtcagatcgggatctgaggtttacttctatgttttgggaaagtttgcaagctgctttgggaactaagttgaggctga 23900872  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcag 186  Q
    ||||  | |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  23900871 gttctacttatcatccccagaccgatggtcagacagagaggactattcag 23900822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19863765 - 19863639
Alignment:
Q  23 aaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctc 122  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||||  ||||||||||   ||||||||  |    
T  19863765 aaatagtgaagttgcatggtgttccttcgagtattgtttcggatagagatccaaggttcacatcaaggttttggggaagtttgcaaagtgctttgggtac 19863666  T
Q  123 gaagttgagattgagttcggcatatca 149  Q
     ||||| | | ||||||| ||||||||    
T  19863665 taagttaaaactgagttctgcatatca 19863639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19868402 - 19868276
Alignment:
Q  23 aaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctc 122  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||||  ||||||||||   ||||||||  |    
T  19868402 aaatagtgaagttgcatggtgttccttcgagtattgtttcggatagagatccaaggttcacatcaaggttttggggaagtttgcaaagtgctttgggtac 19868303  T
Q  123 gaagttgagattgagttcggcatatca 149  Q
     ||||| | | ||||||| ||||||||    
T  19868302 taagttaaaactgagttctgcatatca 19868276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 556; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 556; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 43837 - 43154
Alignment:
Q  14 acatcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 113  Q
    |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43837 acattaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggc 43738  T
Q  114 tttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43737 tttgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttgttgagaatttgt 43638  T
Q  214 gttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43637 gttcttgagcaaggaggagcttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttacaataatagctatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 43538  T
Q  314 ctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 413  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43537 ctttatatgttcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagt 43438  T
Q  414 tcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtg 513  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43437 taagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaaagagttaccatgataagtgcagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgta 43338  T
Q  514 tttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttg 613  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  43337 tttttgagagtcactcctatgactggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttg 43238  T
Q  614 gaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43237 gaacggtggcatactgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 43154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 9155 - 8485
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9155 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 9056  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||           ||    
T  9055 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctggaggatttgt-----------gt 8967  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8966 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 8867  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8866 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccggagattgttcagcagactactgagaaagttc 8767  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  8766 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagttttaggaaggagaccacgtatt 8667  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  8666 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 8567  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8566 agggtggcttaccgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15617 - 15241
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 15518  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||    
T  15517 tgggatcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgt-----------gt 15429  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15428 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 15329  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaacta 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15328 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccggagattgttcagcagacta 15241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 662
Target Start/End: Original strand, 50148 - 50785
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  50148 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcaaatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttccaagatgctttgggctcga 50247  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||  || ||||| | |||||  | ||||| ||||||||    
T  50248 aattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacggatggtcagtcggagagaacgatacaatccttaaaggatctattgagggtgtgtgtacttgagca 50347  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||||    
T  50348 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggt 50447  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || | ||      
T  50448 cgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggggaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaat-- 50545  T
Q  425 aagagaa--aatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 522  Q
    |||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||    
T  50546 aagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctgtcataacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgaga 50645  T
Q  523 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 622  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||| || || ||||    
T  50646 gtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtgg 50745  T
Q  623 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
    ||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  50746 cttatagggtgggtttgccccctcatctttcgaatttgca 50785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 400 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 13963 - 13832
Alignment:
Q  400 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 499  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||    
T  13963 actactaagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagttttagg 13864  T
Q  500 aaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcct 531  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13863 aaggagaccacgtatttttgagagtcactcct 13832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 572
Target Start/End: Original strand, 106226 - 106754
Alignment:
Q  44 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggc 143  Q
    ||||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||| ||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| ||    
T  106226 ttccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtctgcaagctgctttgggaactaagttgagattgagttctgc 106325  T
Q  144 atatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagt 243  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||| || ||||||| || |||    | |||||||||||||||  ||||||  | || |||||    | ||||||        
T  106326 ttaccatccccagaccgatgggcagacgaagaggactatccagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttggaacaaggtatcagttgggacgaa 106425  T
Q  244 catcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgt 343  Q
      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||| |||| || || || ||||    
T  106426 tgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggctccgtttgaggctttgtatggttggaggtgtaggacaccgt 106525  T
Q  344 tgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtc 443  Q
    |||| |||||||| ||  | ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || |||  |||||| || ||||| ||||| || ||    
T  106526 tgtgttggtttgaatccagagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaggatgattcaggagaagatgaaagcatc 106625  T
Q  444 gcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgta 543  Q
     |||||| |||| |||| ||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| |||| |||||     
T  106626 tcagagtagacataagatttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgtt 106725  T
Q  544 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    || | |||||| ||||  | |||||||||    
T  106726 ggtcctgctttaaagtgtaggaagttgac 106754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 552; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 552; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 7620 - 6937
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7620 atcaaggagatcgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 7521  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7520 tgggttcgaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctggaggatttgttgaggatttgtgt 7421  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7420 tctcgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttaatcgagttcacatataataatagttatcattcaagtattggaatggcacctttcgaggct 7321  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7320 ttatatggtcggagatgtagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttc 7221  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgt- 514  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  7220 agatgatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtggaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 7121  T
Q  515 ttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgg 614  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7120 ttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatattggaaagagttgg 7021  T
Q  615 aacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgca-tctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7020 aacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcattctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 550; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 1095 - 414
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1095 atcaaggggattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 996  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  995 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatgatcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 896  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  895 tcttgagcaaggagggacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacttataataatagttatcattctagtattggaatgacaccgttcgaggct 796  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  795 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagcggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 696  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  695 agatgatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtt 596  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  595 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaaattcattggtccgtatcagatattggaaagagttgga 496  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  495 acagtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 524; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 8047 - 7377
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8047 atcaaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcatcgtatcagatagaggtccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 7948  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||           ||    
T  7947 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcaggcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgt-----------gt 7859  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7858 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 7759  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  7758 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttcgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccggagactgttcaacagactactgagaaagttc 7659  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7658 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatt 7559  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  7558 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggagagagttgga 7459  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7458 acggtggcttagcgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 7377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 514; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 514; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 66086 - 65405
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66086 atcaaggagatcgtgaggttacatggtgttccttcgagtattgtatcagatagggatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 65987  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  65986 tgggttcgaaattgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagttagaaaggacaattcagtcgctagaagatttgttgagagtttgtgt 65887  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  65886 tcttgagcaaggaagaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 65787  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  65786 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtta 65687  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  65686 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 65587  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |  |||| |||||||    
T  65586 tttgagagtcactcctgtgactggcgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttgga 65487  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65486 acggtggcttatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 65405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 478
Target Start/End: Original strand, 39466 - 39906
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  39466 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttcgaaaagtttgcaagaggctttgggttctaagttaagattga 39565  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39566 gttcggcgtatcatccacagacagatg-tcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttg 39664  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39665 ggatagtcatcttccgttgatagatttcacatacaataacagttatcattctagtattggaatggtaccttttgaggctttatatggtcggagatgcaga 39764  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  39765 actccgtcgtgttggtttgaatcaggtgaaaaagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatga 39864  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgta 478  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39865 aagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgta 39906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 528 - 697
Target Start/End: Original strand, 39926 - 40095
Alignment:
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  || |||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||||||||| |||    
T  39926 tcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaatttgactccgagatttattggtccgtatcggatatgggaaagagttggaacggtggcgtat 40025  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| || ||||| |||||||||||||| |||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  40026 tgagttggattaccaccgcatctttcgaacttgcatgatgtctttcatgtgtcacaacttcggaagtatg 40095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 494; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 33198 - 33879
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| |||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33198 atcaaggagattgtgagattgcatggtgttccttcgagaattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 33297  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33298 tgggttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagccggaaacgaaaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgt 33397  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  33398 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaagct 33497  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||     
T  33498 ttgtatggttggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagtta 33597  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33598 agatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 33697  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
     |||| ||||| || | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | | ||| |||||||    
T  33698 attgaaagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttgga 33797  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33798 acagtggcgtatcgagtgggattactaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 33879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 9277 - 8596
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| |||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9277 atcaaggagattgtgagattgcatggtgttccttcgagaattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 9178  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9177 tgggttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggaaacgaaaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgt 9078  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  9077 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaagct 8978  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||     
T  8977 ttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagtta 8878  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8877 agatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 8778  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
     |||| ||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| |||||||| | | ||| |||||||    
T  8777 attgaaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttgga 8678  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8677 acagtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagttttccatgtgtcgcaactttggaagtatg 8596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 490; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 697
Target Start/End: Original strand, 4030 - 4711
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| |||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4030 atcaaggagattgtgagattgcatggtgttccttcgagaattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 4129  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4130 tgggttcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggaaacgaaaattcagtcgctagaagatttgttgagaatttgtgt 4229  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  4230 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaagct 4329  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||     
T  4330 ttgtatggtcggagatgcagaactccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagtta 4429  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4430 agatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 4529  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
     |||| ||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| |||||||| | | ||| |||||||    
T  4530 attgaaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttgga 4629  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4630 acagtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagttttccatgtgtcgcaactttggaagtatg 4711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 483; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Original strand, 278458 - 279136
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  278458 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctaggttttggaagagtttgcaagaggccttcg 278557  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  278558 gttctaaattgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtact 278657  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  278658 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgattgagttcgcatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 278757  T
Q  319 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  278758 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggagaaagagtggtcctaggacaagagattgttcagcagactactgagaaagttaaga 278857  T
Q  419 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 518  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  278858 tgattcaagaaaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttt 278957  T
Q  519 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 618  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| |||||||| | ||||| ||||||||||    
T  278958 gagagtcactcctgtgactggtgtgggacaagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttataggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacg 279057  T
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  279058 gtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 279136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 375 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 308981 - 308659
Alignment:
Q  375 cttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaag 474  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  308981 cttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 308882  T
Q  475 cgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccc 574  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  308881 cgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttaaccc 308782  T
Q  575 cgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttcca 674  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  308781 caaagtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttcca 308682  T
Q  675 tgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  308681 tgtgtcgtaacttcgaaagtatg 308659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 220 - 697
Target Start/End: Original strand, 164538 - 165015
Alignment:
Q  220 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 319  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |    
T  164538 gagcaaagatgaacttgggatattcatcttccgttgatagaattcacgtacaataacagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggctctgt 164637  T
Q  320 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 419  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||  | || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  164638 atggtcgaaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtatttttgggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaagat 164737  T
Q  420 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 519  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  164738 gattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagatcacgtatttttg 164837  T
Q  520 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 619  Q
    ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||||| |  |||| | |||||||||    
T  164838 agagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacgg 164937  T
Q  620 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  164938 tggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgtgtttcatatgtcgcaacttcggaagtatg 165015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 260979 - 260308
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  260979 ttgtgaagctacatggagttccttctagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttcgaa 260880  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||    
T  260879 gttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggaaaggacgatctaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaa 260780  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| ||||||| ||||| || ||  |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  260779 ggtggagcttgggacagtcacctaccactgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtc 260680  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || || |||||||| ||  |||||||       
T  260679 ggaggtgcaggactctgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataag 260580  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
     || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || |||||||||||     
T  260579 ggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagtt 260480  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctt 625  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |   || |||||||||| |    
T  260479 actccgatgacgggtgtaggacgtgctttaaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattagaacggtggcat 260380  T
Q  626 atcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || ||||  |||| || ||  |||||||||| |||||  |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  260379 atagagtttgtttgccaccatatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 260308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 464; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8078 - 7519
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8078 atcaaggagattgtgaagttgtatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 7979  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7978 tgggttcgaagttgagattgagttcggcgtatcatccacaaacagatggtcagtcggagagaacaattcaatcgctagaggatttgttgaggatttgtgt 7879  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  7878 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggtt 7779  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  7778 ttttatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcagcaaactactgagaaagtta 7679  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7678 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaatgagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatt 7579  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgacccc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7578 tttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgacccc 7519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 8471 - 7854
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8471 atcaaggtgattgtgaggttacatggtattccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagtttttggaaaagtttgcaagaggctt 8372  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8371 tgggttcgatgttgagattgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgt 8272  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8271 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 8172  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  8171 ttgtatggtcggtgatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaagtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaggtta 8072  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8071 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 7972  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| | |  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  7971 tttgagagtcacttcggtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 7872  T
Q  616 acggtggcttatcgagtg 633  Q
    |||||||| |||||||||    
T  7871 acggtggcgtatcgagtg 7854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 449; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 7044 - 6372
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  7044 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 6945  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6944 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagca 6845  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  6844 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 6745  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  6744 cggagatgcagaactctgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactacagagaaggttaagatgattc 6645  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6644 aagagtagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataaacgtagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagt 6545  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| ||||||| |||||| | |||||      
T  6544 cactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatattggaaagagttgggatggtggta 6445  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||    
T  6444 tatcgagtgggattaacaccgcatctttcgaatttgcacgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 6372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3458 - 3153
Alignment:
Q  30 gaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttg 129  Q
    |||| ||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  3458 gaagttacatggtgttccgtcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcgaagttg 3359  T
Q  130 agattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggag 229  Q
    || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |    
T  3358 aggttgagttcgtcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtg 3259  T
Q  230 gaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggag 329  Q
    || ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  3258 gagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaagaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggag 3159  T
Q  330 atgcag 335  Q
     |||||    
T  3158 gtgcag 3153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 443; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Original strand, 63659 - 64337
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  63659 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattatatcagaaaaagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctctgg 63758  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  63759 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtact 63858  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  63859 tgagcaaagaggaacttgggataatcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacaattaacattctagtattggaatggcaccttttgaggcttta 63958  T
Q  319 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  63959 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagttaggagaaagagtggtcttaggaccagatattgttcagcagactactgagaaaattaaga 64058  T
Q  419 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 518  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  64059 tgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgttttt 64158  T
Q  519 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 618  Q
    |||||||| |||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||    
T  64159 gagagtcactcctgtggctggagttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactgtgagattcattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacg 64258  T
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  64259 gtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 64337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 434; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 6691 - 6014
Alignment:
Q  20 aggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttggg 119  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6691 aggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagaatttggaagagtttgcaagaggctttggg 6592  T
Q  120 ctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttctt 219  Q
     || |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6591 ttctaagttgagattgtgttcggcgtatcatccgtagacagatggttagtcggagaggacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttatgttctt 6492  T
Q  220 gagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttat 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6491 gatcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgattgagttcacatacaataacatttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgt 6392  T
Q  320 atggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 419  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6391 atggtcggagatgcagaactctgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgtgcagcaaactactgagaaagttaagat 6292  T
Q  420 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 519  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  6291 gattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcataataagcgcaggcaggatcttgagtttcaagagggagaccacgtgttttta 6192  T
Q  520 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacgg 619  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||    
T  6191 agagtcactcctgtgactggtgtttgacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatattagaaagagttggaatgg 6092  T
Q  620 tggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6091 tggcgtatcgagttggattaccaccgcagctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 6014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 433; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6023
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |    
T  6695 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaaggtttacttctagattttggaaaagtttgcatgaggctttaggttcta 6596  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6595 agttgaggttgagttcagcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcactagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 6496  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6495 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttacgaggctttgtatggt 6396  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  6395 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtctggtgaaagagtggtcttaggaccaaagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattc 6296  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  6295 aagagaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagt 6196  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    ||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || |||||||| | ||||| |||||| ||||||||     
T  6195 cacacctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccaagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggcg 6096  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  6095 tatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcttgtgtcgcaacttcggaagtatg 6023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 1158 - 1830
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || || || || || ||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  1158 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtatcgtgtcggacagggatccgaggttcacttctagattttggaagagcttgcaagatgctttgggttcga 1257  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  1258 agttgtggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatacaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagca 1357  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1358 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggaatggcaccgttcgaagctttgtatggt 1457  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||  ||||||||  |||||||      
T  1458 cggaggtgcaagactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtattgggaccggatttggttcatcagactagagagaaagtcaagatgataa 1557  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||  | ||| || || |||  ||||||    
T  1558 gggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtaggaaggcccttgagtttcaggtggaagatcatgtatttcggagagt 1657  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |  ||||  |||||||| |||||     
T  1658 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattagtccgtatcagatatcagaaagggttggaacagtggca 1757  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1758 tatagagttggtttcccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 1830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 23080 - 22819
Alignment:
Q  311 aggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaa 410  Q
    ||||||| |||||| |||| ||  | || |||||||| |||||||||||||||||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || ||    
T  23080 aggctttgtatggtaggaggtgttggacaccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaa 22981  T
Q  411 agttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccac 510  Q
     ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || ||     
T  22980 ggttaagatgattcaggagaagatgaaggagtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcat 22881  T
Q  511 gtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    |||||||||||||| | || | |||| ||||| ||  ||||||||||||  | |||||||||    
T  22880 gtgtttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggttgtgctttgaagtgtaggaagttgac 22819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 429; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 22548 - 21932
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22548 atcaaggagattgtgaggttacatggtgtttcttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 22449  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    | || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22448 taggttcgaagttgaaattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagtggacaattcagtcgctagaggatttgttgcgagtttgtgt 22349  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22348 ccttgagcaaggaggaacttgggataatcatcttccgttgatcgagttcacatacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggct 22249  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  22248 ttgtatggtcggagatgcagatctccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactattgagaaagtta 22149  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    | ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22148 aaatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgcaggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtt 22049  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  22048 tttgagagtcactcctgcgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttgga 21949  T
Q  616 acggtggcttatcgagt 632  Q
    |||||||| ||||||||    
T  21948 acggtggcgtatcgagt 21932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 423; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Original strand, 451 - 1128
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  451 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgaaagaggctttgg 550  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  551 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatcagcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagttgctagaggatttgttgagtgtttgtgtact 650  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  651 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccatggatagagttcacgtacaataacaattatcattccagtattggaatggcaccttttgaggcttta 750  T
Q  319 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  751 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtcatcttaggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaagttaaga 850  T
Q  419 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 518  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  851 tgattcaagagaagatggaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgaaaagcgtagaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgt-ttttt 949  T
Q  519 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 618  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |  ||||||| ||||| |    
T  950 gagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatataagaaaaagatggaaag 1049  T
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||  |||||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1050 gtggaatatcgagttggattaccacagcaactttcgaaattgcatgatgtattacatgtgtcgcaacttcggaagtatg 1128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 1350 - 676
Alignment:
Q  23 aaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctc 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  1350 aaattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaggaggctttaggttc 1251  T
Q  123 gaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgag 222  Q
     |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||    
T  1250 taagttgagattgagtttggcgtatcatcctcagacatatggtcagtccgaaaggacgattcagtcgctagaggacttgttgagggtttgcgtacttgag 1151  T
Q  223 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 322  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1150 caagaaggaacttgggatagtcatcttctattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatg 1051  T
Q  323 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgat 422  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1050 ttcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgatagtgtggttttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgat 951  T
Q  423 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 522  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  950 tcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcatagaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgaga 851  T
Q  523 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 622  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | |||||  ||||||| |||||    
T  850 gtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagggttggaatggtgg 751  T
Q  623 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  750 cgtatcgtgttggcttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 405; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 14711 - 14039
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |    
T  14711 attgtgaagttgcatggtgttcattcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttagattcta 14612  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| |    
T  14611 agttgaggttgagttcggcgtatcagccgcaaacagatgctcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagta 14512  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  14511 aggaggaacttgggaaagtcatcttccattgatatagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 14412  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |    
T  14411 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccatagattgttcagcaaactaccaagaaggttaagatgattc 14312  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  14311 aagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggagagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgatagt 14212  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||  ||| |||| | ||||| |||||||||||||||     
T  14211 cactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagtagttgactccgagatttattggtctgtatgagatatcggaaagagttggaacggtggcg 14112  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  14111 tatcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgaactatgtgtttcatgtgtcgcaacttccgaagtatg 14039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 18122 - 17660
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18122 atcaaggagattgtgaggttacacggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctt 18023  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18022 tgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcactagaggatttgttgagagtttgtgt 17923  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17922 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccactgatcgagttcacataaaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 17823  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  17822 ttgtatggtcagagatgtagaacttcgttgtgttgg-ttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactaagaaagtta 17724  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtag 479  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  17723 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagtgttataatgataagcgtag 17660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 32082 - 31410
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  32082 attgtgaagttgcatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 31983  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  31982 agttggggttgagttcagcttatcatccgcaaacagattgtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 31883  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    | | ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  31882 aagtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattgatatggcaccgttcgaagctttgtatggt 31783  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || || || ||| | ||  | ||||| ||||||||  |||||||  ||||||||     
T  31782 cggaggtgcatgactcctttatgctggtttgagttaggagaaagcgttgtgttgggatcggatttggttcatcaaactacatagaaagtcaagatgatca 31683  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||| | || |||||| |||||||    
T  31682 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggatatcatgtgtttctgagagt 31583  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |   ||||||| |||||     
T  31582 tacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgataggtttggaacagtggca 31483  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  31482 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttttttgtgtcgcaacttcggaagtatg 31410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 93
Target Start/End: Original strand, 18489 - 18557
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattt 93  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18489 attgtgaagttgcatggtgttccttcaagcattgtatcatatagagatccaagatttacttctagattt 18557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 5893 - 5229
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  5893 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 5794  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||    
T  5793 agttgaggttgagttcggcgtatcatctgtagacagattgttagtcggagaggacgattcagtcgctagaagacttgttgagagtttgcgtacttgagca 5694  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  5693 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattccagtatcggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 5594  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  5593 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgattcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgaaaaggttaagatgattc 5494  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||    
T  5493 aagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatggtaaacgcaggaaagatcttgagtttaaagaaggagaccacatatttttgagagt 5394  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||  || |||||||  |||||||| |  |||| |||||||||||||||     
T  5393 cactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaggaagtcgactccgagatttattggtctgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcg 5294  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcg 689  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  5293 tatcgagtgggattaccactgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcg 5229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 10015 - 9343
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |    
T  10015 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttacgttcta 9916  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||    
T  9915 agttgaggttgagttcagcgtatcatccgcaaacagatgatcagtcggagaggacgattcagtcgctagaagacttgttgagagcttgtgtacttgagca 9816  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    |||||||||| ||| || |||||| || |||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  9815 aggaggaactagggttaatcatctaccattgataaagttcacgtacaatgatagttatcattctagtattggaagggcaccttacgaggctttgtatggt 9716  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| | ||| ||||||| |    
T  9715 cggagatgcagaactctgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggttttaggaccagagattgtttaacaaactaccgagtaggttaagatgattc 9616  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  9615 aagagaagatgaaggcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtattgttgagagt 9516  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || |  || |||||||  |||||||| | ||||| |||||||||||||||     
T  9515 cactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaaggtgactcctagatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcg 9416  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  9415 taccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcactatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 9343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 328 - 999
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  328 attgtgaagttgcatggtattccttcgagcattgtgtgtgatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 427  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    || |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  428 agctgaggttgagttcggtgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggatgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagca 527  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    || ||||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||    
T  528 agaaggaacttgagataatcatctcccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatgacaccttatgaggctttgtatggt 627  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  628 cggagatgcaaaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaagttaagatgattc 727  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  728 aagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttaagtttcaagaaggagaccacgtg-ttttgagagt 826  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    |  || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | | ||| |||||||||||||||     
T  827 ccctcgtgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcg 926  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||  |||||||||||||||||    
T  927 tatcgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcaggatgtgtttcatgtggagcaacttcggaagtatg 999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 229715 - 229043
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |    
T  229715 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttatagagtttggaaaagtttgcaagaggatttaggttcta 229616  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    |||| || ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  229615 agttaaggttgagttcggcgtatcattcgcagacaaatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 229516  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||    
T  229515 aggaggaacttgggatattcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggttttgtatggt 229416  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  229415 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgtggttttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattc 229316  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  229315 aagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataaacgtagaaaagaccttgaatttcaagaaggagatcatgtatttttgagagt 229216  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||     
T  229215 cactcctattactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttgttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcg 229116  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || ||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||| || | || |||||||||||||||||||||||||    
T  229115 taccgaatagggttaccaccgcatctttcgaatatgcacgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 229043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 219051 - 219723
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  219051 attgtgaagtgacatggtgttccttcgagcattgtatcaaatagagatccaaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 219150  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  219151 agttgaggttgagttcggggtatcatccgcagacagatggtcagtcgaagagaacgattcattcgttagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 219250  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  ||||     
T  219251 aggaggaacttgggataatcatcttccgtttatagaattcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggttttgaatgga 219350  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
     | || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  219351 agaaggtgcagaactccgttgtgttggttcaagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattc 219450  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||    
T  219451 aagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaagaagatcacgtatttttgagagt 219550  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |  |||| | |||||||||||||     
T  219551 cactcctgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcg 219650  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  219651 tatcaagtgggattaacaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatg 219723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 572
Target Start/End: Original strand, 32667 - 33176
Alignment:
Q  61 tcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacag 160  Q
    |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  32667 tcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaacaaagttgagattgagttctgcttaccatcctcagaccg 32766  T
Q  161 atggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcga 260  Q
    |||| ||| | |||||||| |||||     | || ||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  |  |||||      | | |||||| | ||    
T  32767 atgggcagacagagaggactattcaaagtttggaagatttgttgagatcttgtgtgttggagcaaggtgttaggtgggacgaatgtttaccgttggttga 32866  T
Q  261 gttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtca 360  Q
    ||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| ||  ||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||     
T  32867 gtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccatttaaggctttgtatggtaggaggtgtagaacaccgttgtgttggtttgagtcc 32966  T
Q  361 ggtgaaagagtggtct--taggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaa 458  Q
    ||    |||||| | |  |||| |||||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || || || ||||||||||| |||||| |||| ||    
T  32967 gg----agagtgctttgttaggcccagaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaa 33062  T
Q  459 gagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaag 558  Q
    |||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || |  ||| |||| ||||| || ||||||||||||    
T  33063 gagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaaacctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaag 33162  T
Q  559 tcaaagaagttgac 572  Q
    |  |||||||||||    
T  33163 tgtaagaagttgac 33176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 180877 - 180217
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  180877 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcggatagagatccaagatttacttctagattttggaacagtttgcaagaggctttgg 180778  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||                  |||||||||||||||||| |||| || ||    
T  180777 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatcagcagacagatggtcagtcg------------------ctagaggatttgttgagagtttgggtact 180696  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  180695 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccttttgaggcttta 180596  T
Q  319 tatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  180595 tatggtcggagatgcagaactccattgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggaccagatattgttcagcagactattgagaaagttaaga 180496  T
Q  419 tgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttt 518  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  180495 tgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtgttttt 180396  T
Q  519 gagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacg 618  Q
    |||||| | |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||| |||||||| |  |||| |||| ||||     
T  180395 gagagttactccggtgactggtgttggacctgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagatatcagaaagagttagaaca 180296  T
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  180295 gtggcgtatcgagttggcttaccaccgcatctttcgaattttcatgatgtctttcaagtgtcgcaacttcggaagtatg 180217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 303
Target Start/End: Original strand, 101186 - 101464
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  101186 attgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgctttgggttcga 101285  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||  || || ||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  101286 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagatagatggtcagtcagagaggatgatccaatcattagaggatttgttgagagtgtgtgtacttgagca 101385  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggca 303  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  101386 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggca 101464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 50165 - 49506
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  50165 attgtgaagttgcatggtgttcctttgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 50066  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  50065 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgtaagaagatttgttaagagtttgtgtacttgagca 49966  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    |||||||||||  |||||| ||| ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  49965 aggaggaactttcgatagttatcctccattgatagtgttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 49866  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  49865 cagagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggttaaagggttgttttaggactcgagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattc 49766  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || | ||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||    
T  49765 aagaaaagaggaaagcgtcgcagagttggcaaaagatttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacatattttttagagt 49666  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| || |||||||| | ||||| |||||||||||||||     
T  49665 cactcctgtgattgttgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcg 49566  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaa 684  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  49565 taccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaa 49506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19280 - 19121
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19280 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 19181  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 178  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19180 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 19121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 34704 - 34604
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34704 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 34605  T
Q  119 g 119  Q
    |    
T  34604 g 34604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 14713 - 15385
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |    
T  14713 attgtgaagctacatggtgttccgtcaaacattttatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggatttaggttcta 14812  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14813 agttgaggttgagttcggcgtatcacccgcggacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgccgggggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 14912  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||    
T  14913 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaagctctgtatggt 15012  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| || ||||||    
T  15013 cggaggtgcagaacttcgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcaacaaactactgagaaggttaagttgatcc 15112  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||||||    
T  15113 aagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggagatcatgtatctttgagagt 15212  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || || | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  | ||| |||||||  |||||||| |  |||| | |||||||||||||     
T  15213 cactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctaaggttaattggtctgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcg 15312  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15313 tatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 15385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 13168 - 12738
Alignment:
Q  16 atcaaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 115  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13168 atcaaggagattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctt 13069  T
Q  116 tgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||||    
T  13068 tgggttcgaagttgagattgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaatttagtcactagaggatttgctgagagtgtgtgt 12969  T
Q  216 tcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12968 tcttgagcaaggaggaacttgggatagacatcttccgttgattgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggct 12869  T
Q  316 ttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttc 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12868 ttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagttaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtta 12769  T
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgca 446  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12768 agatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgca 12738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 32387 - 33058
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |    
T  32387 attgtgaagttgcatggtgttctttcgagaat-gtatcaaatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaagctttaggttcta 32485  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32486 agttgaggttgagtttggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacgatccagtcgttagaagacttgttgagagtttgtgtacttgagca 32585  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |    
T  32586 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcatcttttgaggctttgtatgat 32685  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| |    
T  32686 cggagatgaagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgggagtgtggttttagggccagaaattgttcaacaaactactaagaaggttaagatgattc 32785  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| || ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  32786 aagaaaagatgaaagcatcgtagggtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgagttttaagaaggagatcacgtatttttgagagt 32885  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || || | |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||  || |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||     
T  32886 cactcttgtgactggtgttggacttgcattgaagttaaagaagttgacttcgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcg 32985  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  32986 taccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 33058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 25353 - 26025
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  25353 attgtgaagctacatggtgttccgtcgagcattgtgtcagatagagttccatggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 25452  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  25453 agttgaggttgagttcggcgtatcatccggagacagatggtcagtctgaaagaacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtactttagca 25552  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  25553 aggtggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccattcgaagctttgtatggt 25652  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    | ||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| || | ||||    
T  25653 cagaagtgtagaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcagcaaactactgagaaggttaagttaatcc 25752  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||    
T  25753 aagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaggactttgagtttcaggaaggaaaccatgtattttttagagt 25852  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||  | || | || ||| |||||||| |||||||| |  |||| | ||||||| |||||     
T  25853 cactcctatgactggggttggacgtgcattgaagtcaaggaaactaactcggatgtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaaccgtggcg 25952  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  25953 tatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatg 26025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15549 - 14877
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  15549 attgtaaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 15450  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  |||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  15449 agttgaggttgagttcgacatatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttgaaggacttgttgagaggttgtgtacttgagca 15350  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  15349 aggaggaacttgggataatcatcttccattgatagagttcacgtacaataacagttatcattccagtattggaatggcaccatttgaggctttgtatggt 15250  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
     |||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  15249 aggaagtgcagaactccattgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattc 15150  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||    
T  15149 aagaaaagatgaaagcgtctcagagtcgacatatgagttatcatgataagcttaggaaagaccttgagtttcatgaaggagatcatgtatttttgatagt 15050  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || |  |||| | |||||||||||||     
T  15049 cactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaataagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaatatcagaaagaattggaacggtggcg 14950  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14949 taccgagtgggcttaccaccgcatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 14877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 257
Target Start/End: Original strand, 113121 - 113353
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  113121 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttaattctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 113220  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||    
T  113221 agttgaggttgagttcggcgtgtcatccgcagacagatggtcagtcagagagaacgattcggtctctagaagatttgttgagagtttgcgtacttgagca 113320  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  113321 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgat 113353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 112693 - 112021
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  112693 attgtgaagctacatggtgttccgccaagcattgtatcagatagagatctgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 112594  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  112593 agttgaagttgagttcggcgtatcatccgtagacagatggtcagtcgaaaaggacgattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 112494  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||| | ||||||    
T  112493 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacatgcaataacagttatcattctagtattgaaatgacaccatttgaagctctgtatggt 112394  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||    
T  112393 cggaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagtcaggagagagtgtagttttgggaccagatatcgttcaacaaactattgagaaggttaagttgatcc 112294  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  112293 aagaaaagatgatagcatcacagagtcgacaaaagagatatcatgataagcgtaagaaggaccttgagtttcaggaaggagaccatgtatttttgagagt 112194  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||| |  |||| | |||||||||||||     
T  112193 cactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactcccaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcg 112094  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  112093 tatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 112021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 203102 - 203774
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  203102 attgtgaagctacatggtgttccgtcgagcattgtgtcaaatagagatccaagatttacttgtagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgggttcta 203201  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  203202 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattctgccattagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagca 203301  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  203302 aggtgggacttgggatagtcatctaccgctgatagagttcacgtacaacaaaagttaccattctagtataggaatggcaccattcaaagctttgtatggt 203401  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| || || || || |||||  | |||||||| || |||||  | || ||| || | ||      
T  203402 cggaggtgcagaactctgttatgttggtttgagtcgggtgagagtgtagtgttgggaccgaatattgttcaccagactacataaaaggttaagctaataa 203501  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||    
T  203502 gagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagatttatcacgataagcgcaggaaagaccttgaatttcaagaaggagaccatgtgtttctaagagt 203601  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || || | |||| ||||  || |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |   ||| ||||||||| |||||     
T  203602 cactcttgtgacaggtgctggccgtgctttgaagccaaagaagttgacgccgaggtttattggtccgtatcagatatctaaaagagttggaacagtggca 203701  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  203702 tatagagtgggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 203774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 118240 - 117568
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  118240 attgtgaagctacatggtgtaccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcta 118141  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  118140 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 118041  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  118040 aggtggagcttggtatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 117941  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || |  ||||| || || |||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||     
T  117940 cggaggtgtaagactcctttatgttggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcatactacggagaaagtcaagatgatca 117841  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  117840 gagagaagatgaaagcgtcacaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggt 117741  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | |||||||||  |||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||| |  |||||||| |||||     
T  117740 tactcctatgacgagtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggca 117641  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  117640 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 117568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 323376 - 322704
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  323376 attgtgaagttgcatggtgtaccgtcgagtattttgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagacgccttgggttcga 323277  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  323276 agttgaggctgagtttggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagca 323177  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |    
T  323176 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattccagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatgat 323077  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || || || || ||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||     
T  323076 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgaatcaggagagagtgttgtgttgggtccggatttggttcatcagactacggagaaagtcaagatgatca 322977  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| |||||||    
T  322976 gagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagt 322877  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |  || |  ||||||||  ||||     
T  322876 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccatatcagatatcagagagggttggaacaatggca 322777  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  322776 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 322704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 386491 - 385819
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  386491 attgtgaagttgcatggggttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagtttgcaagatgccttgggttcta 386392  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  386391 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagataacgattcagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 386292  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||  ||| | ||||| ||||||    
T  386291 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcactgttctaagctttgtatggt 386192  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | |||||  | ||||| ||||| ||| |||||||      
T  386191 cggaggtgcaggactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcattagactacggagaaggttaagatgataa 386092  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||    ||||||||||| || ||||| ||  | ||| |||||||    
T  386091 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtccacagaagagttaccatgacaagcgaagaaagacccttgagtttcaagagggagatcatctatttctgagagt 385992  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||| ||| ||||||||  |||| |||||||  ||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  || | ||||||||| |||||     
T  385991 cactcctacgacgggtgtaggttgtgcgttgaagtataagaagttgactccgaagtttataggttcataccagatatctgagagagttggaacagtggca 385892  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  385891 tacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 385819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 26167 - 26839
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  26167 attgtgaagctgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 26266  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||   | || || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26267 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaaaaacgattcagttattggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagca 26366  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||     
T  26367 aggaggaacttgggatagtcatgttctgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagcattggaatgacaccttttgaggctttgtatgga 26466  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
     | || ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  26467 agaaggtgcagaactccgttgtgttggttcgagttaggtgagagtgtggttttaggacaataaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattc 26566  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26567 aagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaggaaggagatcacgtatttttgagagt 26666  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | |||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||| |  ||||   ||| |||||||||     
T  26667 tactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtgaaagaagttgactccgaggtttattggcccgtatcagatatcagaaaggattgaaacggtggcg 26766  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26767 tatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttccatgatgtgtttgatgtgtcgcaacttcggaagtatg 26839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 195338 - 196008
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||    
T  195338 attgtgaagctgcatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaacatgcattgggttcga 195437  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||  |  |||||||  ||||| | ||||| | ||||||    
T  195438 agttgaggttgagttcggcttaccatcctcagacagatggtc-gtcggagaggacgatacaatctttgaaggatttactgagagtgtgtgtacctgagca 195536  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  195537 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccatccgagtattggtatggcaccgttcgaagctttatatggt 195636  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||     
T  195637 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatca 195736  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  195737 tagagaagatgaaagcgtcgtagagacgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgt-tttctgagggt 195835  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || || |||||||| |||||     
T  195836 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagaaggttggaacagtggca 195935  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  195936 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 196008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 29 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 149238 - 148570
Alignment:
Q  29 tgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagtt 128  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||    
T  149238 tgaagctacatggtgtaccgtcgagtattatgtcggatagggatccgaggttcacttctagattttggaagagtctgcaagatgcattgggttcgaagtt 149139  T
Q  129 gagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagga 228  Q
    |   ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||| |||||     
T  149138 ggagttgagttcggcttatcatcctcagaaagatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgaacaaggt 149039  T
Q  229 ggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgga 328  Q
    |||  |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||  |||| ||||||||||    
T  149038 ggaggttgggatagtcacctaccattgatagagttcacatacaacagcagttaccattcgagtattggtatggctccgttcgaacctttgtatggtcgga 148939  T
Q  329 gatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaaga 428  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||  ||||||||   ||||||    ||    
T  148938 ggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactatagagaaagtcaggatgataaggga 148839  T
Q  429 gaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagt 528  Q
     || ||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| |  ||| ||||  | || || || || || ||| ||||||| | |    
T  148838 aaagatgaaagcgtcgcagagtcgacggaagagttaccatgacaaccgtagaaaggcccttaagttctaagagggtgatcatgtatttctgagagttact 148739  T
Q  529 cctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatc 628  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||      
T  148738 cctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatgagagagggttggaacagtggcataca 148639  T
Q  629 gagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  148638 gagtaggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 148570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 528 - 697
Target Start/End: Original strand, 68577 - 68746
Alignment:
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||     
T  68577 tcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatac 68676  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  68677 agagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 68746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 250 - 572
Target Start/End: Original strand, 121809 - 122131
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 349  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || | || |||||||||||| ||| |||| || || |||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |    
T  121809 ccgttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtatcggattggctccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtagaacaccgttgtgtt 121908  T
Q  350 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 449  Q
    ||||||| || || ||||| ||  | |||||| | ||  |||| ||  ||| ||| || || ||| | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  121909 ggtttgaatccggggaaagtgttttgttaggaacggaagttgtgcaagaaattacggaaaaggttaacatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagag 122008  T
Q  450 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 549  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || || |||||||| || | |||| |||| ||||| || |||    
T  122009 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgt 122108  T
Q  550 gctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    ||||||||||  | |||||||||    
T  122109 gctttgaagtgtaggaagttgac 122131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 180371 - 180151
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 349  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |||| || || || || ||||| |    
T  180371 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaggacaccattgtgtt 180272  T
Q  350 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 449  Q
    |||||||||| || ||||| ||  | ||||||||  |  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| |||||| |||| |||||    
T  180271 ggtttgagtccggagaaagtgttttgttaggaccgcaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaagtcgtctcagag 180172  T
Q  450 tcgacaaaagagttatcatga 470  Q
    | |||| ||||||||||||||    
T  180171 tagacagaagagttatcatga 180151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 1580 - 908
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  1580 attgtgaagctacaaggtgttccatcgaacattgtgtcagatagagatccaaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttcta 1481  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||  |    
T  1480 agttgaagttgagttcggtgtatcatccgcagacagatggttagtcgaaaagaacaattcagtcgttggaggatttgttgagagtttgtgtacttgaata 1381  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1380 aggtggaacttgagatagtcatcttccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattttagtattggaatggcaccattcgaagctttgtatggt 1281  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
     |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| || ||||||||||||||||||||  || ||  |||||    
T  1280 tggaggtgcagaactctgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccagatatcgttcagcaaactactgagaagattaagtggatcc 1181  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || || || |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  1180 aagaaaagattaaagcgtcgcagatttgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggagaccatgtattttttagagt 1081  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| | ||||||| |||||     
T  1080 cactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaaatgaaagaaattgaatccgaggtttattggtccatatcagatatcagaaagaattggaacagtggca 981  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  980 tatcgattgggtttaccaccgcatctttcgaatatgcatgatgtgtttcacgtgtcgcaactttggaagtatg 908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 1659 - 1005
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || |    
T  1659 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatcttagttttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttta 1560  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  1559 gttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaacgatttagtcgttagaagatttgttaagagtttgtgtacttgagaaaggaggaatttg 1460  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1459 ggatagtcatcttccattgatagagttcacgtactataacatttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcaga 1360  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||     || |||||||||||||| ||| ||| |||  |||| ||| |||    
T  1359 actccgttgtgttggtttgagtcaggtgagaatgtggttttaggaccagaga-----caacaaactactgagaaggttaagacgat-taagaaaaagtga 1266  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||| || || || ||||||||||  ||| ||||    
T  1265 aatcgtcgcagagtcggcaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagttcaaagaaggagatcatgtattcttgagagtcacccctgtgac 1166  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||| ||| | ||||| |||||||||| |||| || |||||||||    
T  1165 tggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcggatatcggaaagagttggaacgttggcgtaccgagtgggt 1066  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||| |||||||    
T  1065 ttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtctttcatgtaacgcaacttcgaaagtatg 1005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 4699 - 4032
Alignment:
Q  29 tgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagtt 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||    
T  4699 tgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttataagtt 4600  T
Q  129 gagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagga 228  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||| || |||||| ||||| | ||||||||||||    
T  4599 gaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcggtcggagaggacgattcagtcgttgaaggacttcttgagagtttgtttacttgagcaagga 4500  T
Q  229 ggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgga 328  Q
    | ||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  | |    
T  4499 gaaacttgggatagtcatcttccattaatagagttcacgtacaataacaattatcattctagtattggaatggcaccgtttgaggctttgtatggaagaa 4400  T
Q  329 gatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaaga 428  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| || || || ||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4399 g-tgcagaacttcgttgtgttggttcgaatcaggtgagagtgtagttttaggaccagaaatcgttcaataaactactgagaaggttaagatgatccaaga 4301  T
Q  429 gaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagt 528  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| || || ||||||||||||| |    
T  4300 aaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttactatgataagcgtaggaaagaccttgagttttaagaaggagatcatgtatttttgagagtcact 4201  T
Q  529 cctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatc 628  Q
    ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||||| ||||    
T  4200 cctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccatatcagatatcagaaaggattggaacggtggcgtatc 4101  T
Q  629 gagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||  || | || |||||||||||||||||||||||||    
T  4100 aagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgatttgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 4032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 3812 - 3140
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  3812 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 3713  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||| |  | || ||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  3712 agttgaggttgagttcggcgtatcatctgcagacaaatggtcagtcggaaagaacgatttagtcgttgaaagacttgttgagagtttctgtacttgagca 3613  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  3612 aggagaaacttgggatagtcatcttccgttaatagagttcatgtacaataacagttaccattctagtattggaatggcaccattcgaggctttgtatggc 3513  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| || ||    || || ||||| || || || |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3512 cggagatgcagaactccattgtgttagtttgagtcaagtgagagtgtaaatttggggccagaaatcgtgcaacaaactactgagaaggttaagatgatcc 3413  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  3412 aagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttaagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagt 3313  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| | |||||||| || |||| | |||||||||||||     
T  3312 cactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggttcgtatcagatatttgaaagaattggaacggtggcg 3213  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3212 tatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 3140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 103 - 697
Target Start/End: Original strand, 126911 - 127505
Alignment:
Q  103 ttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgt 202  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| || |||| ||||    
T  126911 ttgcaagaggctttatgttctaagttgaggttgagttcaacgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttataggacttgt 127010  T
Q  203 tgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggc 302  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  127011 tgagagtttgtgtacttgagcaaggagggacttgggatagtcatcgtccattgatagagttcgcgtacaataacagttatcattctagtattggaatggc 127110  T
Q  303 acctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaact 402  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  127111 accttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttaagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaact 127210  T
Q  403 actgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaag 502  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  127211 actgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttccagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagttccaagaag 127310  T
Q  503 gagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatttt 602  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||||||| |     
T  127311 gagatcacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgatccgtatcagatatc 127410  T
Q  603 ggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  127411 agaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttacatgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatg 127505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Original strand, 80128 - 80319
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |    
T  80128 attgtgaagttgcatggtgttccttagagcattgtatcagatagagatccaagatttacttaaagattttggaagagtttgaaagaggctttgggttcta 80227  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgtt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  80228 agttgagattgagttcggcgtatcatccgcggacagatggtcattcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtt 80319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 116539 - 117211
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  116539 attgtgaagctacatggtgtttcgtcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 116638  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || || |||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||| || |||||    
T  116639 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcgaaaagaacgattccgtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtactagagca 116738  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || || | | | ||||||    
T  116739 aggaggaacttgggttagtcatcttccgttgatagagttgacgtacaataacagttatcattctagtattggaatgacaccatttgaagttctgtatggt 116838  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || |||| |||||| ||||| ||||||||||| || || || || |||||| | || |||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  116839 cggaggtgtaggactctgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtagttttgggaccataaatcgttcagcaaactactgagaaggttaagttgatcc 116938  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| || || |||||||||||    
T  116939 aagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttgagtttcaagaaagagaacaagtatttttgagagt 117038  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || || | ||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || |  |||| | ||| |||||||||     
T  117039 cactcatgtgaatagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaatatcagaaagaattgtaacggtggcg 117138  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  117139 tatcgagtgggtttaccaccgtatatttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatg 117211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 98612 - 98140
Alignment:
Q  100 agtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatt 199  Q
    ||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||    
T  98612 agtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattgagttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatt 98513  T
Q  200 tgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaat 299  Q
    ||||||||  ||||||| | |||||||| |  | ||||||      | | |||||||| ||||| || | ||| || |||| |||| ||||||| || ||    
T  98512 tgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttgggacgaatgtttaccgttgattgagtttactttcaacaacagttttcatgctagtatcggtat 98413  T
Q  300 ggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaa 399  Q
    || ||| || |||| ||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| || || || ||  | |||||||||||  |||| ||  ||    
T  98412 ggtaccgtttgaggttttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgttttgttaggaccagaagttgtgcaagaa 98313  T
Q  400 actactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 499  Q
    ||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | || || ||| |||||||||| |    
T  98312 actacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagtaaggatattgagtttcaag 98213  T
Q  500 aaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
      || || ||||||||||| || || | ||||||||| || || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  98212 ttggtgatcacgtgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 98140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 312; Significance: 1e-175; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 25 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 9642 - 9047
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  9642 attgtgaagctacatggtgttcattcgagcattgtatcagatagagatccaaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 9543  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| ||| | || || ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  9542 agtttaggttaagttcggcatatcatccgcagacagattgtcagtcggaaagaacgattcaatcgttggaagacttgttgagggtttgtgtacttgagca 9443  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9442 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacatacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgaggctttgtatggt 9343  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
     | || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||| |||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  9342 agaaggtgcaggactccgttgtgttggtttgattcaggtgagagtctggttttagcaccagaaattgttcaacaaactgctgagaaggttaagataatcc 9243  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||    
T  9242 aagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggggatcatgtatttttgagagt 9143  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggt 620  Q
    || |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||| |  |||| | ||||||||||    
T  9142 cactcctgtgaccggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtctgtatcagatatcagaaagaattggaacggt 9047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 409 - 572
Target Start/End: Original strand, 351 - 514
Alignment:
Q  409 aaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagacc 508  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||| || || |||||| | || |||||||||||||| ||| | || || ||| ||||||||||||  || || |    
T  351 aaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggtgatc 450  T
Q  509 acgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    | ||||| |||||||| | |||| | ||| |||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  451 atgtgttcttgagagtgaatcctgtaactagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 368
Target Start/End: Original strand, 216 - 331
Alignment:
Q  253 ttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggt 352  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| | |||||| || || || || | ||| || ||||    
T  216 ttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccatttgaggctttgtgtggtcgaaggtgtaggacgcggttatgttggt 315  T
Q  353 ttgagtcaggtgaaag 368  Q
    |||| |||||||||||    
T  316 ttgattcaggtgaaag 331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 25 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16327 - 15832
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  16327 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagaattgcatcatatagagatccaagatatacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 16228  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16227 agttgaggttgagttcggcgtatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacaattcagtcgctagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 16128  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | ||||    
T  16127 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagtgttcacgtacaataatatttatcattctagtattggaatggcatcttatgaggctttttttggt 16028  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |    
T  16027 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagttaggtgaaagggtggttttaggacacgagattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattc 15928  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttga 520  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15927 aagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaatacctcgagtttcaagaaggagaccacgtatttttga 15832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 360 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 15829 - 15493
Alignment:
Q  360 aggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaag 459  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15829 aggtgaaagggtggttttaggactcgagattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaag 15730  T
Q  460 agttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 559  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15729 agttaccatgataagcgtaggaaatacctcgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgacagtcattcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 15630  T
Q  560 caaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaattt 659  Q
    ||||||||||||| || |  || |||||| | |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||||||    
T  15629 caaagaagttgactcctagatttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcatatcgagtaggtttaccaccacat-tttcgaattt 15531  T
Q  660 gcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  15530 gcacgatgtgtttcatgggtcgcaacttcggaagtatg 15493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 148 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 1688 - 1139
Alignment:
Q  148 catccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatc 247  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1688 catcagcagacagatggtcagttggagaggacgatgcactcgttggaagatttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcatc 1589  T
Q  248 ttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtg 347  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1588 ttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattgaaatggcaccttatgaggctttgtatggtcggagatgtagaactccgttgtg 1489  T
Q  348 ctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcag 447  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  1488 ttggtttgagtcgggtgaaagagtggtcttaggactagagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagataagatgaaagcgtcgcag 1389  T
Q  448 agtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggac 547  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||  |||    
T  1388 agtcgacaaaaaagttaccatgataagtgtaggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtattttttagagtcactcctgtgactggtgttcgac 1289  T
Q  548 gtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgca 647  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  1288 gtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattgttccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtggatttaccaccgca 1189  T
Q  648 tctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  1188 tctttcgaatttgcacgatgtgttttatgtgttgcaacttcggaagtatg 1139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3046 - 2914
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  3046 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 2947  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcaga 157  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2946 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaga 2914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 239 - 596
Target Start/End: Original strand, 628 - 985
Alignment:
Q  239 atagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaac 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  628 atagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcgttctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaac 727  T
Q  339 tccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaag 438  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  728 tccattgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaa 827  T
Q  439 gcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactg 538  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  828 gcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttaaggaaggagaccacgtattttttagagtcactcctatgactg 927  T
Q  539 gtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatca 596  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  928 gtgtaggacgtgcactgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatca 985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 16050 - 16722
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || || |    
T  16050 attgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaataggctttaggttcta 16149  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  16150 agttgaggttaagttcggcgtatcatccgcagacaaatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgcgtacttgagca 16249  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||     
T  16250 aggagggacttgggatagtcatcttccattaatagaattcacgtacaataatagttatcattctagtattgcaatgacaccatttgaggctttgtatgga 16349  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
      ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  16350 acgaggtgcaaaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtggttttaagaacagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattc 16449  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    |||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||   ||||| |||||||| || || ||||| || ||    
T  16450 aagaaaagatgaaagcgtcgcagactcgacaaaagagttatcatgataagcgtagggaggatcttatatttcaagaaggagatcatgtattttttagggt 16549  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||  ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||| ||| |||| |  |||| | |||||| ||||||     
T  16550 cactccagtgattggtgttggacgtgcattgaagtcgaagaagttgacaccgagatttattggtccgtataagatatcagaaagaattggaatggtggcg 16649  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||  || |||||||| |||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16650 tatcatgtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgtacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 22 - 697
Target Start/End: Original strand, 24702 - 25377
Alignment:
Q  22 gaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggct 121  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  24702 gaaattgtgtagttgcatggtgttccgtcgagcattgtgtcagattgagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcgttgggat 24801  T
Q  122 cgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttga 221  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  24802 ctaagttgaggttgagttcggcttatcatccgtaaacagatggtcagtcggagagaatgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgtacttaa 24901  T
Q  222 gcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatat 321  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |||||  ||    
T  24902 gcaaggtgggacttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttatcattctagtatttggatgacaccattcgaagctttgcat 25001  T
Q  322 ggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatga 421  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || |||||||| || ||||| || || ||| || | |    
T  25002 ggtcggaggtgcagaactccgttctgttggtttgagtcgggtgaaagtgtagtgttgggaccggatattgttcaccagactacagaaaaggttaagctaa 25101  T
Q  422 tccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgag 521  Q
    |   |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| | ||    
T  25102 taagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagacttatcacgacaaacgtaggaaagatcttgaatttcaagcaggagaccatgtgtttctaag 25201  T
Q  522 agtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtg 621  Q
    ||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| | || ||| |||||  | |||||||| | ||||| ||||||||| |||    
T  25202 agtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgctttgaaatcgaagaagttgacgctgaggtttattggctcgtatcagatatcggaaagagttggaacagtg 25301  T
Q  622 gcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25302 gcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 25377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 282; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 47 - 696
Target Start/End: Original strand, 12633 - 13282
Alignment:
Q  47 cttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcata 146  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||  || ||||| || ||    
T  12633 cttcgagcatcgtatcagatagagatctgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttctaagttgatgttcagttcagcgta 12732  T
Q  147 tcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcat 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || || || |||||| | || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12733 tcatccgcagatagatggtcagtcggaaagaacgatacagtcgttggaagacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaacttgggatagtcat 12832  T
Q  247 cttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgt 346  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  12833 ctcccgttgatagagttcacatataataacagttaccattctagtattggaatggcaccattcgaagctctgtatggtcggaggtgtaggactccattgt 12932  T
Q  347 gctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgca 446  Q
    | ||||| ||||||||| | || |  || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  12933 gttggttcgagtcaggttagagtgcagttttgggaccagaaattcttcagcaaactactgagaaagtttagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgca 13032  T
Q  447 gagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtagga 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  13033 gagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttgaatttcaagaaggagaccatgtgttattgagagtcactcctgtgactggtgttgga 13132  T
Q  547 cgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgc 646  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||  |||  || ||| || | |||||||| |  |||| | | |||| ||| || ||| ||||||||||||| || |    
T  13133 cgtgcattgaagtctaagaaattgacttcgagatttattagttcgtatcagatatcagaaagaatgggaatggtagcgtatggagtgggtttaccaccac 13232  T
Q  647 atctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 696  Q
    | |||| |||||| ||  |||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  13233 aacttttgaatttacatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtat 13282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 5225 - 5896
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |    
T  5225 attgtgaagctacatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagggtttgcaggaggcgttgggttcta 5324  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    || |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  5325 agctgagtttgagttcgacgtatcatccgcagaccgatggacagacagagaggacaattcattcgttcgaggatttgttgagagtttgtgtactcgagca 5424  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| || || | ||||    
T  5425 aggaggaacttgggatagtaatcttccattgattgagttcacgtataataacagttaccattctagcattggaatgacaccgttcgaagcgttgtttggt 5524  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |  |||||  ||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||| || ||||      
T  5525 cggagatgcagaactccgttgtgttggtatgagtccggtgagaatgtggtactaggacctgaaattgttcaacaaacaacagagaaggttaagttgatta 5624  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  5625 gagagaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgca-aaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtatttttgagagt 5723  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||| ||||| ||||| ||  | ||||| |||||  || | |||| ||| | |||| | ||||| ||||   ||| |||||| || || ||     
T  5724 cactcctgtgaccggtgttggacgagcactaaagtcgaagaaactgtctccgaggtttaatggttcgtatcatatttcataaagagttgggacagttgcg 5823  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  5824 tatagagtgagtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacatcggaagtatg 5896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 22 - 498
Target Start/End: Original strand, 4085 - 4561
Alignment:
Q  22 gaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggct 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  4085 gaaattgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttatagattttggaagagtttgcaagaggctttaggtt 4184  T
Q  122 cgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttga 221  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| |    
T  4185 ctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcacacagatggtcagttggagagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtttacttca 4284  T
Q  222 gcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatat 321  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  4285 gcaaggagtaacttgggctagtcatcatccattgatatagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggctttgtat 4384  T
Q  322 ggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatga 421  Q
    ||| |||  || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  || ||||||    
T  4385 ggttggatttgtagaactcctttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccagaaattgttcaacaaactactgacaagcttaagatga 4484  T
Q  422 tccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcag 498  Q
    | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  4485 ttcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagatctcgagtttcag 4561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 130820 - 130532
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  130820 attgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 130721  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  130720 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgctgagggtatgtgttcttgagca 130621  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgagg 313  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  130620 aggatgaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttgagg 130532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 59426 - 58972
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||| || ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| || |    
T  59426 attgtaaaactatatggtgttccgtcaagtattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttgggagagtttgcaggaggcgttgggttcta 59327  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  59326 agttgagtttgagttcggcgtatcatccgcagacagatgggcagacagagaggacaattcagtcgttggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 59227  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||    
T  59226 aggaggaacttgggatagtcatctctcattgatcgagttcatgtacaataacagttaccattctagcattgggatggcaccattcgaagcattgtatggt 59127  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||| | |  |||||  ||||||| || |||||  |  |||||||  |||| ||| || ||||      
T  59126 cggagatgcagaactccattgtgttggtatgaatccggtaagaatgtggtactaggaccggaaattgtcgaaaaaactacacagaaggttaagttgattt 59027  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtag 479  Q
      ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||    
T  59026 gggagaagatgaaagcgtcgtagagtagacaaaagcgttatcatgatcagcgtag 58972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Original strand, 29008 - 29163
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29008 aaggagattgtgaagttgcatggtgttcctttgagcattgtatcagatagagatccaagattt-cttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 29106  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggaga 175  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29107 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaga 29163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 211 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 134728 - 134626
Alignment:
Q  211 tgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcg 310  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  134728 tgtgttcttgagcaaggatgaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatggcaccttttg 134629  T
Q  311 agg 313  Q
    |||    
T  134628 agg 134626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 533 - 683
Target Start/End: Original strand, 4567 - 4717
Alignment:
Q  533 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 632  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||  || |||||||| |||||| | | ||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  4567 tgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagtttactccgagatttattggtccgtatcaggtatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagt 4666  T
Q  633 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 683  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||  |||| || ||| |||||||    
T  4667 gggtttaccatcgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatctgtcgca 4717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 619 - 697
Target Start/End: Original strand, 36974 - 37052
Alignment:
Q  619 gtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| |||| ||| || ||||| |||| |||| ||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  36974 gtggcgtatctagttggattaccaccgcctcttacgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 37052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 37 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 6709 - 6336
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||    
T  6709 catggtgttccttcgaccattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttagattctaagttgaggttga 6610  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6609 gttcggcatatcatccgcaaatagatagtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 6510  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6509 ggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatggcaccctatgaggctttgtatggtcggagatgcaga 6410  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaa 410  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6409 actccattgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaactactgagaa 6336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 637 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 6333 - 6273
Alignment:
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  6333 ttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatg 6273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 224 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 475 - 2
Alignment:
Q  224 aaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatgg 323  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  475 aaggtggaacttgtgatagccatcttccgttgatagagttcacatacaataacaattataattctagtattggaatggcaccttttgaggctttatatgg 376  T
Q  324 tcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 423  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||      
T  375 ttggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggagaaagagtggtcttaggactagatattgttcagcagactattgagaaagttaagatgagt 276  T
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||  | || |||||||||||||    
T  275 caagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgtagaaaggatcttgagtttcaagagggttatcatgtgtttttgagag 176  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 623  Q
    ||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||  |||||    
T  175 tcaatccggtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaaaaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatagtggc 76  T
Q  624 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  75 atatcgagttggtttaccaccgcatctttcaaattttcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 4547 - 3875
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  4547 attgtgaagttgcatggtgttccatcgagtattgtgtcggaaagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaa 4448  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||    
T  4447 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagagagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgttgatagtgtgtgtacttgagca 4348  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||    
T  4347 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccatttgagtattggtatggcaccgttcgaagcttcgtatggt 4248  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||      
T  4247 cggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataa 4148  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||| |||    
T  4147 gagaaaagatgaaagcgtcggagaatcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagtccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgatagt 4048  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || |  |||||||| ||||||    
T  4047 cactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagtgttggaacagtggct 3948  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3947 tacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 3875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 25 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 368 - 10
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || || |    
T  368 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagagcctttaggttcta 269  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  268 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtctcttgaagatttgttgagagtttgtgtacttgagca 169  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||    
T  168 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattctagtattggaatgacaccttatgaggctttgtatggt 69  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacc 383  Q
    ||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68 cggagatgcagaacttcattatgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacc 10  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 76 - 697
Target Start/End: Original strand, 10425 - 11045
Alignment:
Q  76 agatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggaga 175  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10425 agatttacatctagattttcgaaaagtttgcaagaggcgttgggttcaaagttgagattgagttcagcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggaga 10524  T
Q  176 ggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataa 275  Q
    | || ||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||  |  ||||||| | ||| || ||||| ||    
T  10525 gaacgatttagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttggaatagtcacttgtcgttgatagtgtttacgtacaacaa 10624  T
Q  276 tagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtc 375  Q
     ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||  |     
T  10625 cagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtgtggtcggaggtgcagaactccgttacgttggtttgagtcgggtgaaagtgtaatg 10724  T
Q  376 ttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagc 475  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |  ||  ||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10725 ttgggaccagatatagttcaacagactacagagaaggc-caattgataagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagt 10823  T
Q  476 gtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgacccc 575  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  10824 gtagaaaggatcttgagttacaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgacaggtataggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacacc 10923  T
Q  576 gaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccat 675  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  10924 gaggtttattggtccatatcagatatctgagaaagttggaacagtggcatatagagtggatttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcat 11023  T
Q  676 gtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11024 gtgtcgcaacttcggaagtatg 11045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Original strand, 41970 - 42639
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41970 gtgaaacttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggttcgaagt 42069  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  42070 tgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaagg 42169  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  42170 tggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgg 42269  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || || || ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  |  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||  ||    
T  42270 aggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccgtatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagag 42369  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    | || ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| || |     
T  42370 aaaagatggaagcgtcgcagagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttac 42469  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttat 627  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||| ||||| |||    
T  42470 tcctatgacgggtgtaggaagtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatat 42569  T
Q  628 cgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||| ||||| || || ||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42570 agagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcttgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 42639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 47033 - 47705
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  47033 attgtgaagctgcatggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagggatccaaggttcacttctaggttctggaagagtttgcaagacgctttgggttcga 47132  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  47133 agttgaggctgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagca 47232  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||  |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  47233 aggtggagcttaagatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 47332  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || |||||  |  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||     
T  47333 cggaggtgaaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccgtatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatca 47432  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  47433 gagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggt 47532  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||  ||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||| |||||     
T  47533 tactcctatgacgggtgtaggaaatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggca 47632  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47633 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcttgatgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 47705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 2589 - 2337
Alignment:
Q  29 tgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |  |||||    
T  2589 tgaagctacatggtgttccttcgagcaatgtatcagatagagatccgaggtttacctctagattttggaagagtgtgcaagaggctttaggttgtaagtt 2490  T
Q  129 gagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagga 228  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2489 gaggttgagttcggcgtatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgttagaggatttgttgagagtttgtgtacttgagcaagga 2390  T
Q  229 ggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagtta 281  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2389 ggaacttggggtagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagtta 2337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 20655 - 19983
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  20655 attgtgaagttgcatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagcgatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 20556  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20555 agttgaggttgagttcggtttatcatccgcagacagatgtttagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtttgtgttcttgagca 20456  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  20455 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaaaagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatggt 20356  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||  | ||||| || ||||  |||||| |  |||||||      
T  20355 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtcttgggaccggatttggttcatcagactatagagaaactcaagatgataa 20256  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || ||| |||||||    
T  20255 gggaaaagatgaaagcgtcccagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagt 20156  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |  || || |||||||| |||||     
T  20155 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcgttgaagtcgaagaagtttactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagaaggttggaacagtggca 20056  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||    || || |||||||||||||||||||||||||    
T  20055 tacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatggcgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 12995 - 13667
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | ||||| ||||||||| || || ||||| || ||||  ||||    
T  12995 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcatttctaaattttggaagagcttacaagatgcattggattcga 13094  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  13095 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagca 13194  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  13195 aggtggagcttaggatagtcacctaccgtagatagagttcacatacaacaacagttactattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 13294  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattg-ttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 423  Q
    ||||| || || ||||  || |||||||||||||||   || || || || || ||||| || |||| |||| || ||||| ||||||||  ||||||||    
T  13295 cggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccgga-attgattcatcagactacagagaaagtcaagatgatc 13393  T
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
      |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| | ||||    
T  13394 agagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctaagag 13493  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 623  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||| |  |||||||| |||||    
T  13494 ttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggc 13593  T
Q  624 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13594 atatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 13667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 16765 - 17437
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | ||||| ||||||||| || || ||||| || ||||  ||||    
T  16765 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcatttctaaattttggaagagcttacaagatgcattggattcga 16864  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  16865 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagcggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagca 16964  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  16965 aggtggagcttaggatagtcacctaccgtagatagagttcacatacaacaacagttactattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 17064  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattg-ttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 423  Q
    ||||| || || ||||  || |||||||||||||||   || || || || || ||||| || |||| |||| || ||||| ||||||||  ||||||||    
T  17065 cggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccgga-attgattcatcagactacagagaaagtcaagatgatc 17163  T
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
      |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| | || |    
T  17164 agagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttcttaggg 17263  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 623  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||| |  |||||||| |||||    
T  17264 ttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggc 17363  T
Q  624 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17364 atatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 17437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 8)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 90566 - 91238
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||   ||    
T  90566 attgtgaagttgcatggggttccgtcgagtattgtatcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatggcttgggtgtga 90665  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  90666 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgttcttgagca 90765  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  90766 aggtggagcttgggatagtcatctaccgctgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 90865  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |  || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||      
T  90866 cggaggtgcagaactcctttatgttggtttgagtcaggagaaagtgtagcgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatgataa 90965  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||    
T  90966 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagt 91065  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | ||||| ||| |||||||| |||| |  || |  |||||||| |||||     
T  91066 tactcctacgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgacttcaaagtttattagtccatattagatatctgagagggttggaacagtggca 91165  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||| ||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  91166 tacagagtaggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactgcggaagtatg 91238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 241 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 448515 - 448060
Alignment:
Q  241 agtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactc 340  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  | || ||||||||||    
T  448515 agtcacctcccgttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcaccatttgaggctttgtatggaagaaggtgcagaactc 448416  T
Q  341 cgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggc 440  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |     
T  448415 cgttgtgttggttcgagtcaggtgagagtgtggttttttgaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagt 448316  T
Q  441 gtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggt 540  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| | |||  |    
T  448315 gtcgcagagtcgacagaagagctatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcacgtattttttagagtcactcctgtaactatt 448216  T
Q  541 gtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttac 640  Q
    || ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || | ||||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  448215 gttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcaaatatcggaaagaattggaacggtggcgcatcaagtgggtttac 448116  T
Q  641 cgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 696  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  448115 caccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtat 448060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 257
Target Start/End: Original strand, 390834 - 391066
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  390834 attgtgaagttgcatggtgttccatcgagcattgtatcagataaagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 390933  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  390934 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggaaagaacgattcagtcgttagaggacttgttgagagtttgtgtacttgagca 391033  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  391034 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgat 391066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 434 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 162376 - 162113
Alignment:
Q  434 tgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctat 533  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  162376 tgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcgtaaaaaagatcttgtgtttcaagaagtagaccacgtatttttgagagtcactcctat 162277  T
Q  534 gactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtg 633  Q
    ||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||| ||||  || ||||| || |||||||| |  |||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  162276 gactggtgttggacgagcgtcgaagtcaaagaacttgactccgagatttattggcccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtg 162177  T
Q  634 ggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||| ||||||||    
T  162176 ggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttcgcaacttcagaagtatg 162113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 114795 - 114542
Alignment:
Q  82 acttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaa 181  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  114795 acttctagattttggaagagcttgcaagatgcattgggttcgaagttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagtggacga 114696  T
Q  182 ttcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagtta 281  Q
    | || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| | |||    
T  114695 tccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaataacactta 114596  T
Q  282 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcag 335  Q
     || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  114595 ccactcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcag 114542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 529 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 175431 - 175361
Alignment:
Q  529 cctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 599  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  175431 cctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgatcccgaagtttattggtccgtatcagat 175361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 110
Target Start/End: Original strand, 89888 - 89973
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaaga 110  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  89888 attgtgaagttgcatggggttccgtcgagtattgtatcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaaga 89973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 428 - 572
Target Start/End: Original strand, 78666 - 78810
Alignment:
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcag 527  Q
    |||| |||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |||||||||||||| |     
T  78666 agaagatgaaggcatctcagattagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaa 78765  T
Q  528 tcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    || | |||| || || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  78766 tcatgtgacaggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 78810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 55 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 28161 - 27519
Alignment:
Q  55 attgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgc 154  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  28161 attgtgtcagatagagatccgaggttcacttatagattttggaagagtttgcaagacgccttgggatcgaagttgaggctgagttcggcttatcatccgc 28062  T
Q  155 agacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  28061 agacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgaacaaggtggagcttgggatagtcacctaccgtt 27962  T
Q  255 gatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttt 354  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  27961 gatagaattcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagttttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttt 27862  T
Q  355 gagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgac 454  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||||||    ||||| || ||||| ||||||||  |||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  27861 gagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccagattcggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgac 27762  T
Q  455 aaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgcttt 554  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |     
T  27761 agaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcatc 27662  T
Q  555 gaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcg 654  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |  || |  |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||| |    
T  27661 gaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtataagatatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttttg 27562  T
Q  655 aatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  27561 aatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatg 27519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 697
Target Start/End: Original strand, 787 - 1454
Alignment:
Q  29 tgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagtt 128  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  787 tgaagttacatggtgtttcatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagtttgcaagatgccttgggttcaaagtt 886  T
Q  129 gagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagga 228  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||| || ||||||||     
T  887 gaggttgagttcggcttatcgtccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatctgctgagagtgtgtgtactcgagcaaggt 986  T
Q  229 ggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgga 328  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  987 ggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcatgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggaaccgttcgaagctttgtatggtcgga 1086  T
Q  329 gatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaaga 428  Q
    | ||||| |||||  | || |||||||||||| | ||||  ||||| || ||||||||  | ||||| || |||||  |||||||  |||||||   |||    
T  1087 ggtgcaggactcctctatgttggtttgagtcaagagaaaatgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacgaagaaagtcaagatgataagaga 1186  T
Q  429 gaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagt 528  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||| ||| |    
T  1187 aaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagaatcatt 1286  T
Q  529 cctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatc 628  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||      
T  1287 cctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtt-attggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcataaa 1385  T
Q  629 gagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||| |||||    || ||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1386 aagtaggtttgaaaccacatctttcgaatttgaatgatgtatttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 1454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34414 - 34290
Alignment:
Q  55 attgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgc 154  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  34414 attgtgtcagatagagatccgaggttcacttatagattttggaagagtttgcaagacgccttgggatcgaagttgaggctgagttcggcttatcatccgc 34315  T
Q  155 agacagatggtcagtcggagaggac 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  34314 agacagatggtcagtcggagaggac 34290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 25 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1937 - 1552
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |    
T  1937 attgtgaagttgcatggtgttccttcaaacattgtatcagatatagatccaagatttacttctagattttgtaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 1838  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||  ||||| |   | || ||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  1837 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagatagatggtctgtcgttgaggatgattcatttttttgatgattttttgagagtttgtgtacttgagca 1738  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1737 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtacaataatagttatcattccagtgttggaatggcaccttatgaggctttatatggt 1638  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1637 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcaacaaaccactgagaa 1552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 10465 - 9798
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |    
T  10465 attgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagatccaaggttcacttcaagattttggaagagttttcaagatgccttgggttcta 10366  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||| ||    
T  10365 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttgctgagagtgtgtctacttgaaca 10266  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  10265 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 10166  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||||| | || ||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||      
T  10165 cggaggtgcagaactcctttatgttggtttgagacgggagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaggtcaagatgataa 10066  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |     | ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||    
T  10065 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagga-----cgtgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagt 9971  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  9970 tactcctatggcgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccttatcagatatctgagagggttggaacagtggca 9871  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||||||||| || || ||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9870 tacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 9798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 13535 - 14207
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||  |||  || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  13535 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggataggaatcagaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaa 13634  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  13635 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatccaatcgttggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 13734  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    | | ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| || || ||||||    
T  13735 aagtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattagtatggcaccgttcgaagccttgtatggt 13834  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||||||||||||  |||||||      
T  13835 cggagatgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgataa 13934  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || |||||||| |||||    
T  13935 gggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagt 14034  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |  ||||   ||||||| |||||     
T  14035 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaaattgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagaaaggattggaacagtggca 14134  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| || || || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14135 tatagagttgggttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 14207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 662
Target Start/End: Original strand, 4587 - 5224
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||| | || ||||| ||||| || || |||| |||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  4587 attgtaaagctacatggtgtaccgtcgagtattatgtcggatagggatccgaggttcacttttagattctggaagagcttgcaagatgcattgggttcga 4686  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| |||||| |    
T  4687 agttgaggttgagttcggcttatcgtcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagaa 4786  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||    
T  4787 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccatttgagtattggtatggcaccgttcgaatctttgtatggt 4886  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| | || || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||||||     
T  4887 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaagagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcattagactacagagaaagtcaagatgatca 4986  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |  || || || ||| |||||||    
T  4987 gagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaggaggatgatcatgtatttctgagagt 5086  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  5087 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggca 5186  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||    
T  5187 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 5224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 68042 - 67897
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| || || || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |    
T  68042 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcggatagagacccgaggtttacttcaagattttggaagagtttacaagatgcattgggttcaa 67943  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtc 170  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  67942 aattgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtc 67897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 6856 - 6183
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||| | || ||||| || || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| ||||    
T  6856 attgtgaagttgcatggtatcccctcgagtatagtgtccgatagagacccaaggttcacttctagattttggaagagttcacaagatgcgttgggttcga 6757  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  6756 aattgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaatccaatctttagaggatttgctgaggatatgtgtacttgagca 6657  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
     ||||||  |||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  6656 gggaggagtttgggatagtcacctaccattgatagaattcacatacaacaatagttaccattcaagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 6557  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||  || ||||| || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||||  ||||||||     
T  6556 cggaggtgcaggactcctttatgcttgtttgagttgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaagatgatca 6457  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttt-ttgagag 523  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||  |||| |    
T  6456 tagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttcctgaggg 6357  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 623  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  6356 ttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagatttggaactgtggc 6257  T
Q  624 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||| || | ||||| ||  | | |||||||||||||||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  6256 atatagatttggtttgccatctcttctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatg 6183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 27897 - 27226
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  27897 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 27798  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  27797 agttgaggttgagttcggcttatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggactatacaatcattggaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 27698  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27697 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 27598  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||  || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||      
T  27597 cggaggtgcaggactcctttatgctggttcgagtcaggagaaaatgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacggagaaagtcaagatgataa 27498  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||| || |||||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||  ||||| ||||| || ||| | || || ||| |||||||    
T  27497 gagaaaagatgaaagcgccgtagagtcgacagaagagttaccatgacgagcgtag-gaaggccttgaatttcaagagggatatcatgtatttctgagagt 27399  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  27398 tactcctatgtcgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaaccgtggca 27299  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  ||||||| || || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  27298 tacagagtgggattgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaaatatg 27226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 47796 - 47124
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  47796 attgtgaagttgcatggagttccatcgagtattgtgtcggatagagacccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaa 47697  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  47696 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacaaatggtcagtcagagagaacgattcaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 47597  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  47596 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatggt 47497  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||      
T  47496 cggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatgataa 47397  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||| ||    
T  47396 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgaaaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagggt 47297  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  47296 tactcctataacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggca 47197  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  47196 tacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 47124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 33311 - 33983
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33311 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtatcagatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggctcga 33410  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||  |||||||| | |||||  | ||||| ||||||||    
T  33411 aattgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagagaacgatacaatccttagaggatctattgagggtgtgtgtacttgagca 33510  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||||    
T  33511 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagccttgtatggt 33610  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| || || ||| || | ||      
T  33611 cgaaggtgcagaactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcaacaaactacggaaaaggttaagttaat-- 33708  T
Q  425 aagagaa--aatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 522  Q
    |||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||    
T  33709 aagagaacggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgaga 33808  T
Q  523 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 622  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  || | ||| || || ||||    
T  33809 gtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtgg 33908  T
Q  623 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| | |||||||| || || |||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  33909 cttatagggtgggtttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgcagttgcggaagtatg 33983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 40918 - 40383
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  40918 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 40819  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  40818 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagaaaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 40719  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  40718 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 40619  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| |||||||| || || ||||| |   | || || || ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  40618 acaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagtgctttgtttgggccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 40519  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| ||||    
T  40518 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgac 40419  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     || || || |||||||| ||||  | |||||||||    
T  40418 cggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgac 40383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 51497 - 52169
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||  || || |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  51497 attgtgaagttacatggtgttccatcgagtattgtgtcggatagagatctgaggttcacttttagattttggaagagtttgcaagatgcattgggttcaa 51596  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  51597 agttaaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggttagtcggagagaacaattcaatcagtagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 51696  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
     || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| ||    
T  51697 gggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaccgttcgaagctttgtatagt 51796  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||  | ||||| |||||||| ||||| ||  |||||||      
T  51797 cggaggtgcatgactcctttgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccggatttggttcatcaaactacggagaaggtcaagatgataa 51896  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||    
T  51897 gagaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagt 51996  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||     
T  51997 cactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttagtggtccatatcagatatctgaaagggttggaacagtggca 52096  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  52097 tacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatg 52169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 25 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 5422 - 4760
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  5422 attgtgaagttgcatggtgtaccatcgagtattgtgtcggatagagattcgaggttcacttctagattttggaagagcttgcaagatgcattgggttcga 5323  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||   |||| | ||||| ||||||||    
T  5322 agttgaggttgagttcaacttatcatctgcagacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcgttagaggattttccgagagtgtgtgtacttgagca 5223  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  5222 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 5123  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    | ||| ||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | ||||| || ||||||||||||||  |||||||      
T  5122 cagaggtgcagaactcctttataatggtttgagtcaggagaaagtgtggtgttgggaccagatttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgataa 5023  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || || ||| |||||||    
T  5022 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagt 4923  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||| |  || |  |||||||| |||||     
T  4922 tactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaaattgactccaaagttcattggtccgtataagatatctgagagggttggaacagtggca 4823  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaactt 687  Q
    ||  |||||||||| || || |||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  4822 tacagagtgggtttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactt 4760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 6670 - 7342
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||  || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  6670 attgtgaagttacatggggttccatcgaacattgtgtcggatagagatctgaggttcacttcaaggttttggaagagtttacaagaggccttgggttcaa 6769  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  6770 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacaaatggtcagtcggagagaacgattcagccgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 6869  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || | ||| ||||| |||||||| |||  ||| ||||| || || ||||||    
T  6870 aggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacgtataacaacaattaccattcgagtattggtatgataccgttcgaagcattgtatggt 6969  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||    ||||| ||||| || ||||||||  | ||||| |||||||| || || ||  || ||||      
T  6970 cggaggtgcagaactcaattgtgttggtttgagtcgacagaaagtgtggtgttgggaccagatttagttcatcaaactacagaaaaggtcaagttgataa 7069  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| || ||||| || |||||| |||| ||    
T  7070 gagaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaagcccttgagtgtcaagagggagatcatgtgtttctgagggt 7169  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  || | ||||||||| ||||||    
T  7170 tactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagttcattggtccataccagatatctgagagagttggaacagtggct 7269  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  7270 tacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 7342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 48841 - 49513
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  |||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  48841 attgtaaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggataggaatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcga 48940  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  48941 agttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttagaggatttattgagagtgtgtgtgcttgagca 49040  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  49041 aggtggagcttgggatagtcacctgccattgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 49140  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||  | |||||  | ||||| || |||||  ||||||||     
T  49141 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccagatttggttcatgagactacagaaaaagtcaagatgatca 49240  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || |||||| |||| ||    
T  49241 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtgtttctgagggt 49340  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  |||||||| |||||     
T  49341 cattcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaactgtggcc 49440  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  49441 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttacatgtatcgcagcttcggaagtatg 49513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 249285 - 248613
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  249285 attgtgaagctacatggagtaccgtcgagtattgtgtcagatagggatccgaggtttacctctaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttcga 249186  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  249185 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtctgagaggacgatccaatcgttggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 249086  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  249085 aggtggagcttgggatagtcacctaccgctgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 248986  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
     |||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||  |  | |||||  | |||||| |||||||  |||||||      
T  248985 aggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccgaacttggttcatgagactactaagaaagtcaagatgataa 248886  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    || ||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  248885 gggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggt 248786  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||  ||||||    
T  248785 cactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaagttggaaaagtggct 248686  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  248685 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 248613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 145 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 46780 - 46531
Alignment:
Q  145 tatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtc 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46780 tatcatccacagacagatggtcagttggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaggatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtc 46681  T
Q  245 atcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgtt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46680 atcttccgttgatcgagttcacttacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtaggagatgcagaactccgtt 46581  T
Q  345 gtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46580 gtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttc 46531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 35 - 697
Target Start/End: Original strand, 86154 - 86810
Alignment:
Q  35 tacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagatt 134  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |  |||||||        
T  86154 tacatggtgttccgtcgagtattgtatcaaatagagacccaagatttacttctagatttttgaagagtttgcaggaggcgttgggttataagttgacg-- 86251  T
Q  135 gagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaact 234  Q
    ||| |     |||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  86252 gaggtg----tatcatccacagacgggtggacaggcggagaggacaattcaatcattggaggacttgttgagagtttgtgtacttgagcaaggaggaact 86347  T
Q  235 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgca 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  86348 tgggatagtcatcttccattgatcgagttcacttataataacagttaccattctagcattgcaatggtaccgttcgaagcgttgtatggtcggagatgca 86447  T
Q  335 gaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaat 434  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| ||||| |  |||||  | |||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||| || ||||   ||| || ||    
T  86448 gaactctgttgtgttggtatgagtccggtgagactgtggtactgggaccagacatttttcaacagactactgagaaggttaagttgataagagaaaagat 86547  T
Q  435 gaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatg 534  Q
    | | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| || | ||    
T  86548 ggaagcgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataatcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggataccatgtgttttttagagtcactcttgtg 86647  T
Q  535 actggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgg 634  Q
    || ||||| ||||||||  | || ||||||||  ||||  ||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||| ||||||  |||| || ||| ||||||    
T  86648 accggtgttggacgtgcactaaaatcaaagaaactgacttcgaggtttattggcccgtatcaaatttcggaaagagttgggtcggttgcgtatagagtgg 86747  T
Q  635 gtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  | ||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  86748 gtttaccaccgcaactttcgaacctacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatg 86810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 26814 - 26142
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || |    
T  26814 attgtgaagttgcatggtgtaccatcgagtattgtgtcggatagagatccaaggttcacttcaaggttttggaagagcttacaagatgccttgggttcaa 26715  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  26714 agttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacgatttagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 26615  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||   |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  26614 aggtggagctttttatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattctagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 26515  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||  ||||| |||||  |||||||||| || ||||  || || || ||| | ||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||      
T  26514 cggaggtgcaagactcctttgtgtcggtttgagtcgggagaaaatgtagtgttgggagcggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgataa 26415  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  26414 gagaaaagatcaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccattacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagt 26315  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |  || | ||||||||| |||||     
T  26314 cactcctatgacgggtgtaggccgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggca 26215  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||||||||| || || ||||||| |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26214 tacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 26142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27196 - 26862
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || |    
T  27196 attgtgaagttgcatggtgtaccatcgagtattgtgtcggatagagatccaaggttcacttcaaggttttggaagagcttacaagatgccttgggttcaa 27097  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  27096 agttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagagaacgatttagtcgttagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 26997  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  26996 aggtggagcttcagatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcaagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 26897  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 359  Q
    ||||| ||||  ||||| |||||  ||||||||||    
T  26896 cggaggtgcaagactcctttgtgtcggtttgagtc 26862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 60848 - 61519
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  60848 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagtttacaggacgctttgggttcga 60947  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||||  |||||| | ||||| ||||||||    
T  60948 agttgaggttgagttcggcttatcatccttagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatta-ttgagagtgtgtgtgcttgagca 61046  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  61047 aggtggagcttgggatagtcacctacctttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 61146  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||| ||||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||||||     
T  61147 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatca 61246  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  61247 gagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctgagggt 61346  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |   |||  |||||||| |||||     
T  61347 tactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatatctaaaagggttggaacagtggca 61446  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  61447 tatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 61519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 67236 - 67907
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  67236 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagtttacaggacgctttgggttcga 67335  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||||  |||||| | ||||| ||||||||    
T  67336 agttgaggttgagttcggcttatcatccttagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatta-ttgagagtgtgtgtgcttgagca 67434  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  67435 aggtggagcttgggatagtcacctacctttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 67534  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||| ||||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||||||     
T  67535 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatca 67634  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  67635 gagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctgagggt 67734  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |   |||  |||||||| |||||     
T  67735 tactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatatctaaaagggttggaacagtggca 67834  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  67835 tatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 67907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 51814 - 52485
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  51814 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctagattctggaagagtttacaggacgctttgggttcga 51913  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||||  |||||| | ||||| ||||||||    
T  51914 agttgaggttgagttcggcttatcatccttagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatta-ttgagagtgtgtgtgcttgagca 52012  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  52013 aggtggagcttgggatagtcacctacctttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 52112  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||| ||||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||||||     
T  52113 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagggtggtgttgggatcagatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatca 52212  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  52213 gagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctgagggt 52312  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |   |||  |||||||| |||||     
T  52313 tactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcagatatctaaaagggttggaacagtggca 52412  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||||||||| || || ||||||||||| |||||  | || || ||||||||||| |||||||||||||    
T  52413 tatagagtgggtttgccacctcatctttcgaaattgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 52485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 90 - 697
Target Start/End: Original strand, 9782 - 10389
Alignment:
Q  90 attttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcg 189  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || || || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||     
T  9782 attttggaagagtttacaagatgcattgggttcaaaattaaggttgagttcggcttatcatccgcagacatatggtcagtcggagaggacaatccaatct 9881  T
Q  190 ctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattcta 289  Q
     ||||||||||| | ||  | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  9882 ttagaggatttgctaagggtatgtgtacttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcga 9981  T
Q  290 gtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagat 389  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||| || ||||| || || || ||||| ||  |    
T  9982 gtattggtatggcaccattcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttatgctggtttgggtcgggagaaagtgttgtgttgggaccggattt 10081  T
Q  390 tgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatctt 489  Q
     |||||  | ||||| ||||||||  ||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10082 ggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagacctt 10181  T
Q  490 gagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtc 589  Q
    ||||||||||| || || || || ||| |||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  10182 gagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtc 10281  T
Q  590 catatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcg 689  Q
    ||||||||| ||  |||| ||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  | || || |||||||||||| | ||    
T  10282 catatcagagttcagaaagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattgcg 10381  T
Q  690 gaagtatg 697  Q
    ||||||||    
T  10382 gaagtatg 10389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12166 - 12060
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  12166 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccgaggtttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 12067  T
Q  125 agttgag 131  Q
    |||||||    
T  12066 agttgag 12060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 234 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 16987
Alignment:
Q  234 ttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgc 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||     
T  17450 ttgggatagtcatcttccgttgatagaattcacgtacaataacagttatcattctagcattggaatggcaccttttgaggctctgtatggtcggaggtgt 17351  T
Q  334 agaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaa 433  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  || || || |||||||| ||  |||| |||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| || |    
T  17350 agaactccgttgtgttggttcgagtcaggtgagattgtagttttgggaccagaaatcattcaacaaactactgtgaaggttaagatgattcaagaaaaga 17251  T
Q  434 tgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctat 533  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| || | |    
T  17250 tgaaagtgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgt 17151  T
Q  534 gactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtg 633  Q
    || | |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |  |||| | ||||||||||||| |||| ||||    
T  17150 gatttgtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcaagtg 17051  T
Q  634 ggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17050 ggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 43455 - 42784
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  43455 attgtgaagctacacggtgtaccgtcgagtattgtatcagatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttgcaagatgctttgggatcga 43356  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    || |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  43355 agctgaatttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 43256  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||    
T  43255 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagcgttgtatggt 43156  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || |||||  | ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||  | |||||  | |||||| |||||||  |||||||      
T  43155 cggaggtgtaggactcctctatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggacttggttcatgagactactaagaaagtcaagatgataa 43056  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    || ||||||||||| || || || || ||| | || ||    
T  43055 gggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttcaggagggtgatcatgtttttcttagggt 42956  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || || |||||||| ||||||    
T  42955 cactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagaaggttggaacagtggct 42856  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtat 696  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  42855 tatagagttggtttgccaccacatcttttgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtat 42784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 28402 - 29075
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || |    
T  28402 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagcattgtgtcggatagagatccaagatttacttctagattttgaaaaactttgcaagaggcgttgggttcta 28501  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  28502 agttggggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagttggagagaacgatccagtcattagaggatttgctgagagtatgtgtacttgagca 28601  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| | | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  28602 aggtgaagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 28701  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga-tgat- 422  Q
    ||||| |||||||||| ||| |  | ||||||||  ||||| || |  || || |||||| | || ||||| || ||||  || |||| ||| | ||||     
T  28702 cggaggtgcagaactctgttatctttgtttgagttgggtgacagtgcagtgttgggaccatatatagttcatcagactataga-aaaggtcaaattgata 28800  T
Q  423 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 522  Q
      | ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28801 agaggagaagatgaaagcatcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgaga 28900  T
Q  523 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 622  Q
    |||| || | |||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| |  || | |||||| || ||||    
T  28901 gtcactcatgtgacaggtgtctgtcgtgctttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtgg 29000  T
Q  623 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||| |||||||||  ||  | ||||| |||||||||||  ||||  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  29001 catatagagtgggttacccatcacatctctcgaatttgcatgatgtgcttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 29075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 40393 - 41066
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || |    
T  40393 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagcattgtgtcggatagagatccaagatttacttctagattttgaaaaactttgcaagaggcgttgggttcta 40492  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  40493 agttggggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagttggagagaacgatccagtcattagaggatttgctgagagtatgtgtacttgagca 40592  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| | | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  40593 aggtgaagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 40692  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga-tgat- 422  Q
    ||||| |||||||||| ||| |  | ||||||||  ||||| || |  || || |||||| | || ||||| || ||||  || |||| ||| | ||||     
T  40693 cggaggtgcagaactctgttatctttgtttgagttgggtgacagtgcagtgttgggaccatatatagttcatcagactataga-aaaggtcaaattgata 40791  T
Q  423 ccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 522  Q
      | ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40792 agaggagaagatgaaagcatcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgaga 40891  T
Q  523 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtgg 622  Q
    |||| || | |||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| |  || | |||||| || ||||    
T  40892 gtcactcatgtgacaggtgtctgtcgtgctttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtgg 40991  T
Q  623 cttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||| |||||||||  ||  | ||||| |||||||||||  ||||  | |||||||||||||||| ||||||||    
T  40992 catatagagtgggttacccatcacatctctcgaatttgcatgatgtgcttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 41066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8311
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |    
T  7963 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtt-gcaagaggctttaggttcta 8061  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  8062 agttgaggttgagttcggcgtatcatccaaagaaaaatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttagaagatttgttgagggtatgtgttcttgagca 8161  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  8162 aggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataacagttatcattctagtattggaatggcaccttatgaggctttgtatggt 8261  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8262 cggagatgcagaactccgttgtgttggtttgaatcaggtgaaagagtggt 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 18171 - 18843
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  18171 attgtgaagtttcatggagttccgtcgagtattgtgtcgtatagagatccaaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcaa 18270  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||  ||||||||||| | | | | ||||| | ||||||    
T  18271 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcgaagaggacgatccaatcattagaggatttgctaaaagtgtgtgtacatgagca 18370  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  18371 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 18470  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| |||| |||||| || || || ||||||||||| ||||| || |  || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||      
T  18471 cggaggtgcaaaactcctttatgttgatttgagtcaggagaaagtgtagagttgggaccagatttagttcatcagactacggagaaagtcaagatgataa 18570  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||    
T  18571 gagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagt 18670  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||   |||||||| |  || |  ||| |||| |||||     
T  18671 tactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggtttgtatcagatatcagagagggttagaacagtggca 18770  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||||||||| || || ||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18771 tacagagtgggttttccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 18843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 40410 - 39739
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  40410 attgtgaagttacatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 40311  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  40310 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaagagatggtcagtcggagaggacgattcagtcattggaggatttgttgagagtgtgtgtacttgagca 40211  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| ||   || || ||| | ||||||    
T  40210 aggtggagcttgggatagtcatctacctttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatgacaatgtttgaagctctgtatggt 40111  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||  | ||||| || ||||  ||||||||  |||| ||      
T  40110 cggaggtgcag-actcctttatgttggtttgagtcgggagaaagtgtggtattgggaccggatttggttcatcagactaacgagaaagtcaagattataa 40012  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||    
T  40011 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttactatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaggagggagatcatgtatttctgagagt 39912  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |  || |  |||||||| |||||     
T  39911 tactcctatgacgggtgtaggacgcgcactcaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatccgatatctgagagggttggaacagtggca 39812  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||||||||| || || ||||| |||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  39811 tacagagtgggtttgccaccacatctctcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatg 39739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 19792 - 19120
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  19792 attgtgaagctacatggagttccgtcgagtattgtgtctgatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttcga 19693  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  19692 agttgaggttgagttcggcttatgatcctcagacagatggtcagtcggagacgacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 19593  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  19592 aggtggagcttgggatagtcacctactgttgatagagttcacatacaacaacagttatcattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 19493  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||  | || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||||||     
T  19492 cggaggtgcaggactcctttattctggtttgagtcaggatagagtgttgtattgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatca 19393  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  19392 gggaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggaccttgagtttcaggatggtgatcatgtatttctgagggt 19293  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| || || ||||||||| | |||||||| | ||| |  |||||||| |||||     
T  19292 tactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggttcgtatcagatatcggagagggttggaacagtggca 19193  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19192 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgttgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 433 - 653
Target Start/End: Original strand, 58448 - 58668
Alignment:
Q  433 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 532  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || |     
T  58448 atgaaagcgtcgcatagtagacaaaagagttatcatgataagcataggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagccactcatg 58547  T
Q  533 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 632  Q
    |||| ||||| |||| |||  |||| ||||||||  |||| |||| ||| ||||| || ||||||||||  |||| | |||| ||||| || ||| ||||    
T  58548 tgaccggtgttggacatgcactgaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccgtatcagatttcagaaagaattgggacggttgcgtatagagt 58647  T
Q  633 gggtttaccgccgcatctttc 653  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  58648 gggtttaccaccgcatctttc 58668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 317
Target Start/End: Original strand, 197106 - 197404
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  197106 aaggagattgtgaagttgtatggcgttccttcgagcattgtatcaaatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttag 197205  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  197206 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcggtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgctgagagtttgtgtact 197305  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  197306 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatagagttcacatacaataacaattatcattctagtattggaatggcaccttttgaggcttt 197404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 4)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 21305 - 21977
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| |  || || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  21305 attgtgaagctacatggtgtgctgtcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagcttgcaagatgcattgggttcga 21404  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| || || ||  | ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  21405 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagacggtcagtcggagacgacgatacaatctttggaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 21504  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  21505 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 21604  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |   | || || || ||||| ||  | ||||| || ||||||||||||||  |||||||      
T  21605 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagtgggtgttgtgttgggaccggacttggttcatcagactactgagaaagtcaagatgataa 21704  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || ||  |||| || ||| |||| ||    
T  21705 gggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtaaccatgtatttctgagggt 21804  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |  |||||||| |||||     
T  21805 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgattccgaagttcattggtccgtataagatatcggagagggttggaacagtggca 21904  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21905 tatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 26253 - 26006
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 349  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| |    
T  26253 ccgttgatcgaatttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtgtt 26154  T
Q  350 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 449  Q
    ||||||| || || ||||| |   | || ||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| || ||    
T  26153 ggtttgaatccggagaaagtgctttgtttggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcatag 26054  T
Q  450 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttca 497  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  26053 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 26006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26424 - 26288
Alignment:
Q  79 tttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagga 178  Q
    ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||    
T  26424 tttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaacttgagattgagttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagagga 26325  T
Q  179 caattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgt 215  Q
    | ||||||    | |||||||||||||||  ||||||    
T  26324 ctattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgt 26288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 98
Target Start/End: Original strand, 11091 - 11164
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |  || || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  11091 attgtgaagctacatggtgtgctgtcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaa 11164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 1200 - 528
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||  || || |||||||||||  |||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  1200 attgtgaagctacatggggtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatctgaggttcacttctagattcaggaagagcttgcaagatgcattgggttcga 1101  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  1100 agttgaggttgagttcggcttatcatccttagacagatggtcagtcggagaggacgatacaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagca 1001  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  1000 aggtggagcttgcgatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggctcctttcgaagctttgtatggt 901  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| | || |||||||| || |||||||| ||||| || || ||| || ||||      
T  900 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcgggagaaagtgtgatgttgggaccagacatagttcagcagactacagaaaaggttaagttgataa 801  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     | |  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  800 gaaaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagctatcgtgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagt 701  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| ||||||||  |||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||  || |  |||||||| ||||||    
T  700 tactcctatgacaggtgtaggcagtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttatcggtccgtatcaaatttcagagagggttggaacagtggct 601  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||  |||||||    
T  600 tacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcggaacttccaaagtatg 528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 12649 - 12582
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagatt 92  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    
T  12649 attgtgaagctacatggggtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagatt 12582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 770 - 98
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||||| |||||    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |    
T  770 attgtgaagttgcatggtgtaccatcgagtattgtggtggatagagatccgaggttcacttctagattttggaagagcttgcaagatgccttgggttcaa 671  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || || ||  | ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||    
T  670 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagacggagaggatgatccaatctttggaggatttgttaagagtgtgtgtgcttgagca 571  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| || |||    
T  570 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattcgtatggcaccgttcgaagctttgtacggt 471  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||  |||||||      
T  470 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgataa 371  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||| || ||||| || || ||| |||||||    
T  370 gggaaaagatgaaagcatcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaagggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagt 271  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  270 tactcctatgacgggtgtatgacgtgctttgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggca 171  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||  | || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  170 tacagagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaaatatg 98  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 3423 - 2751
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||  || || ||||||||||||||||| ||| ||||| | || ||||| ||||    
T  3423 attgtgaagttgcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagtgatctgaggttcacttctagattttggaagagtctgcaaaatgcattgggttcga 3324  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||| ||    
T  3323 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcgaagaggacaatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgaaca 3224  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  3223 aggtggtgcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcaaagctttgtatggt 3124  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || || || ||||||||  |||||||      
T  3123 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacaacagagaaagtcaagatgataa 3024  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| | ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||| | || || ||| |||||||    
T  3023 gggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagggttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggatatcatgtatttatgagagt 2924  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| |||||     
T  2923 tactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctgagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggca 2824  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2823 tacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 2751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 149
Target Start/End: Original strand, 12833 - 12954
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||||  ||||||||||   ||||||||  | ||||    
T  12833 gtgaagttgcatggtgttccttcgtgtattgtttcggatagagatccaaggttcacatcaaggttttggggaagtttgcaaagtgctttgggtactaagt 12932  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatca 149  Q
    | | | ||||||| ||||||||    
T  12933 taaaactgagttctgcatatca 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 38 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 37861 - 37202
Alignment:
Q  38 atggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgag 137  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| || ||    
T  37861 atggggttccatcgagcattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaaggttttggaagagcttacaagatgccttgggttcaaagttgaggttcag 37762  T
Q  138 ttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgg 237  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||     
T  37761 ttcagcctatcatccgcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcactagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttga 37662  T
Q  238 gatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaa 337  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  37661 gatagtcatctaccgttgatggagttcacgtacaacaacaattaccattcgagtattggtatcgcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagga 37562  T
Q  338 ctccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaa 437  Q
    | || ||||| |||||||||||||| ||||  || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||| |||||||   ||| || |||||    
T  37561 cccctttgtgttggtttgagtcaggagaaactgttgtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaagttaagatgataagagaaaagatgaa 37462  T
Q  438 ggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgact 537  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |   |||||||||| |   |||| || |||||| | |||||||  ||||||||     
T  37461 agcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggccattgagtttcaagggagagatcatgtgtttcttagagtcacccctatgaca 37362  T
Q  538 ggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtt 637  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |  ||||  |||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  37361 ggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtctatatcagatatctgaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtt 37262  T
Q  638 taccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | || || |||||||| ||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  37261 tgccacctcatctttcaaatttgcatgatgtgttacatgtctcgcaacttcggaagtatg 37202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 321 - 599
Target Start/End: Original strand, 38103 - 38382
Alignment:
Q  321 tggtcggagatgcagaactccgttgtgctggttt-gagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagat 419  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| ||  |   ||| || ||||| ||||||||  ||||    
T  38103 tggtcggaggtgcaggactcctttatgctggttttgagtcaggagaaagtgttgtgttgggaccggatttgaatcatcagactacggagaaagtcaagat 38202  T
Q  420 gatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttg 519  Q
    |||   ||| || ||| | ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || || ||| ||    
T  38203 gattagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccaagacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctg 38302  T
Q  520 agagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 599  Q
    ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  || || |||||||| ||||||||    
T  38303 agagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatcagat 38382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 439 - 599
Target Start/End: Original strand, 27385 - 27545
Alignment:
Q  439 gcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactg 538  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || || ||| ||||||| | ||||||||| |    
T  27385 gcgtcgcagagtcgacagaagagttaccacgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgg 27484  T
Q  539 gtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 599  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  || || |||||||| ||||||||    
T  27485 gtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatcagat 27545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 6872 - 7542
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  6872 attgtgaagctacatggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctgaaagagtttgcaagacgctttgggttcga 6971  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    |||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  6972 agttgaggctgcgttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagtggacgatacaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtacttgagca 7071  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  7072 aggtggagcttgggatagtcatctaacgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcaagtattggtatggcgccgttcgaagctttatatggt 7171  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||  | || || || ||||| ||  | ||||| ||  |||| ||||||||  ||||||||     
T  7172 cggaggtgcaggactcctttatgctggtttgtgtcaggagagggtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagtctacagagaaagtcaagatgatca 7271  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  7272 gagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttaagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggt 7371  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | | ||||||  |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||   | || |||||||| |||||     
T  7372 tacttctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagattt--cagaaggttggaacagtggca 7469  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||| ||||||| |||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  7470 tatagagttggtttgccaccacatatttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatg 7542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 48668 - 49339
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||    
T  48668 attgtgaagttacatggggttccgtcgagtattgtgtcggataaagatccgaggttcacttcaagatgttggaagagtttgcaagatgccttgggttcga 48767  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||  || ||| | ||||| ||||||||    
T  48768 agttaaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggaaaggacgattcaatcattagaggattgctt-agagtgtgtgtacttgagca 48866  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  48867 aggtggagcttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgtacgaagctttgtatggt 48966  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||  ||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||      
T  48967 cggaggtgcagaactcctttatgttggttcgagtcacgtgaaagtgtggtattgggactggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgataa 49066  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||| | || |||||| |||||||    
T  49067 gagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggaaatcatgtgtttctgagagt 49166  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     |  |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |  || |  |||||||| | |||     
T  49167 aacacctatgacaggtgtaggaagtgcgttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagcggca 49266  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||   ||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  49267 tacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaattttcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 49339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 85 - 697
Target Start/End: Original strand, 57511 - 58122
Alignment:
Q  85 tctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattc 184  Q
    ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  57511 tctaggttctggaagagtttgcagaacgctttgggttcgaagttgaggttgagttcgacttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaagacgatcc 57610  T
Q  185 agtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatca 284  Q
    | ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||| | ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    
T  57611 aatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacgaggtggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacctacaacaacagttacca 57710  T
Q  285 ttctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggacca 384  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || || || |||||     
T  57711 ttcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccg 57810  T
Q  385 gagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaag 484  Q
    ||  | ||||| || || |||||||  ||  |||||||    || || ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  57811 gatttggttcatcagacgactgagagggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaa-agttaccatgataagcggagaaagg 57909  T
Q  485 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcat 584  Q
      |||||||||||| | || || || || ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||    
T  57910 cccttgagtttcagaagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcat 58009  T
Q  585 tggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaa 684  Q
    |||||  ||||||||||  || |   ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||     
T  58010 tggtctgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcag 58109  T
Q  685 cttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||    
T  58110 cttcggaagtatg 58122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Original strand, 38 - 705
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  38 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacctctagattttggaagagtttacaagatgctttgggttcga 137  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||   |     |||| | ||||| ||||| ||    
T  138 agttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaaact-----gagagtgtgtgtgcttgaaca 232  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  233 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtatcggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 332  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattg-ttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 423  Q
    ||||| || || ||||  || |||||||||||||||   || || || || || ||||| || |||| |||| || ||||| ||||||||  ||||||||    
T  333 cggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccgga-attgattcatcagactacagagaaagtcaagatgatc 431  T
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
      |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| | || |    
T  432 agagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttcttaggg 531  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 623  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| |||||    
T  532 ttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggc 631  T
Q  624 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||    || || |||||||||||||||||||||||||    
T  632 atatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatggcgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 11560 - 10888
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || | ||||| ||||||||| || || ||||| || ||||  ||||    
T  11560 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcatttctaaattttggaagagcttacaagatgcattggattcga 11461  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  11460 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagcggacgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagca 11361  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  11360 aggtggagcttaggatagtcacctaccgtagatagagttcacatacaacaacagttactattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 11261  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattg-ttcagcaaactactgagaaagttcagatgatc 423  Q
    ||||| || || ||||  || |||||||||||||||   || || || || || ||||| || |||| |||| || ||||| ||||||||  ||||||||    
T  11260 cggaggtgtaggactcatttatgctggtttgagtcaatagagagtgttgtgttgggaccgga-attgattcatcagactacagagaaagtcaagatgatc 11162  T
Q  424 caagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
      |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||| || || || || ||| | || |    
T  11161 agagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttcttaggg 11062  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggc 623  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||| |  |||||||| |||||    
T  11061 ttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggc 10962  T
Q  624 ttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||| |||| ||||| || || ||||||| ||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  10961 atatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 10888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 7456 - 7991
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| ||||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  7456 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgagatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 7555  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  7556 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 7655  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||     | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  7656 ggatgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 7755  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || |  |   | |||||||||||  |||| ||  ||||| | || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  7756 acaccgttgtgttggtttgagtccggagagaatgctttgttaggaccagaagttgtgcaagaaactgcggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 7855  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||| | || || ||| |||||||||| |  || || || |||||||||||||| | |||| ||||    
T  7856 aggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgac 7955  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     || || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  7956 cggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 7991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 44177 - 43505
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  44177 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttggggtcga 44078  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||   | || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  44077 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagatacatggtcagtcggagaggatggtccaatcattggaggatttgttgagagtatgtgtgcttgagca 43978  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || | | |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  43977 aggtggagcttgggatagtcacctactgctgatagagttcgcatacaataacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 43878  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||| || ||||||| ||||||||| || || ||||| || ||| | ||  | |||||  | ||||| || |||||| ||||||||     
T  43877 cggaggtgtaggactcctttatgctggtatgagtcaggagagagtgtggtgttgggaacggatttggttcatgagactacagaaaaagttaagatgatca 43778  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| |||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || |||||| |||| ||    
T  43777 gagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggt 43678  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| || ||||||||||| ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  |||||||| |||||     
T  43677 tactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaactgtggcc 43578  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  43577 tatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 43505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 45189 - 44517
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  45189 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttggggtcga 45090  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||   | || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  45089 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagatacatggtcagtcggagaggatggtccaatcattggaggatttgttgagagtatgtgtgcttgagca 44990  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || | | |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  44989 aggtggagcttgggatagtcacctactgctgatagagttcgcatacaataacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 44890  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||| || ||||||| ||||||||| || || ||||| || ||| | ||  | |||||  | ||||| || |||||| ||||||||     
T  44889 cggaggtgtaggactcctttatgctggtatgagtcaggagagagtgtggtgttgggaacggatttggttcatgagactacagaaaaagttaagatgatca 44790  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| |||||| |||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || |||||| |||| ||    
T  44789 gagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggt 44690  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
     | ||||||||| || ||||||||||| ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  |||||||| |||||     
T  44689 tactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaactgtggcc 44590  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  44589 tatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 44517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 82 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 20737 - 20122
Alignment:
Q  82 acttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaa 181  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||  | |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  20737 acttctagtttctggaagagtttacagaacgctttgggtttgaagttgaggttgagttcggcttatcattgtcagacaggtggtcaatcggagaggacga 20638  T
Q  182 ttcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagtta 281  Q
    | || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20637 tccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccactgatagagttcacatacaataacagtta 20538  T
Q  282 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttagga 381  Q
     ||||| ||||| || ||| ||   ||||| ||||| ||| ||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||    
T  20537 ccattcgagtataggtatgacattgttcgaagctttgtatagtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgtggtgttggga 20438  T
Q  382 ccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaa 481  Q
    || ||  | |||||  | |||||  | |||||  |||||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  20437 ccggatttggttcatgagactacgaaaaaagtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaa 20338  T
Q  482 aagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtt 581  Q
    | |  |||||||||||||| || || || |||||| |||| || | || |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  20337 aggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcttatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagtt 20238  T
Q  582 cattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcg 681  Q
    ||| ||||| ||||||||||  || |  |||||||  ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||    
T  20237 catcggtccgtatcagatttcagagagtgttggaattgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcg 20138  T
Q  682 caacttcggaagtatg 697  Q
    || |||| ||||||||    
T  20137 cagcttcagaagtatg 20122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 532 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 36220 - 36055
Alignment:
Q  532 atgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgag 631  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  |||||||  ||||| ||| |||    
T  36220 atgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagtgttggaattgtggcctatagag 36121  T
Q  632 tgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  36120 ttggtttgccaccacatctttcgaacttgcaagatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 36055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 2466 - 1908
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||| || |||||| |||| || || |||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  2466 attgtgaagttacatggacttccatcgagtattgtgtcggatagacatccgaggttcacttcacgattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcta 2367  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  2366 agttgaggttgagttcggcatatcatccgtagacagatggtcagtcggagaggacgatttaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 2267  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| | | ||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  2266 aggtgtagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaactacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 2167  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  |  |||  || ||||| ||||  ||  |||||||      
T  2166 cggaggtgcaggactcctttatgttggttcgagtcaggagaaagtgtggtgttgggaccagatttgattcttcagactacggagagggtcaagatgat-- 2069  T
Q  425 aagagaaaa--tgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgaga 522  Q
    |||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||    
T  2068 aagagaaaaggtgaaagcgacgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcataggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgaga 1969  T
Q  523 gtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 583  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  1968 gtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttca 1908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 257
Target Start/End: Original strand, 4727 - 4965
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4727 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgg 4826  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4827 gttctaagttgggattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgttct 4926  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4927 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgat 4965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 32 - 567
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  32 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgagatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 131  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  132 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagaacttgtgttttggagcaaggtgttagttg 231  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | || ||||| ||||| || ||||| || | || ||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  232 ggacgaatgtttaccattgattgagtttacttacaacaacaattttcattcttgtatcggaatggcaccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 331  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||| |   | |||||||| ||  ||||  |  | ||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  332 acaccgttgtgttggtttgagtccggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgaaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 431  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || |  || ||||||||||| || | |||| ||||    
T  432 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgctcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgac 531  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     ||||| || ||||||||| |||  | |||||||||    
T  532 cggtgttggccgtgctttggagtgtaggaagttgac 567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 301 - 662
Target Start/End: Original strand, 16375 - 16736
Alignment:
Q  301 gcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaa 400  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||| ||||    
T  16375 gcaccttttgaggctttgtatggtcggagatgcagaactccgttgtgttggtttgagtcaggtgagagtgtggttttaggaccaaaaattgttcaacaaa 16474  T
Q  401 ctactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 500  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  16475 ctactgagaaggttaagatgattcaataaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaaga 16574  T
Q  501 aggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatt 600  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| | || ||| | |||||| ||||||||     
T  16575 gggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcacattgaagtcaaagaagttgactcagaggtttactggtccgtatcagata 16674  T
Q  601 ttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
    | | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16675 tcgaaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgca 16736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 98
Target Start/End: Original strand, 8721 - 8794
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 98  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8721 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtattagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 8794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 37 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 19509 - 18884
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    || ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  |||    
T  19509 catggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgcagttcacttctagattctagaagagtttgcaagatgctctgggttcgaaattgaggctga 19410  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || || || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  19409 gttcggcttatcatcctcagacagatgatcagtcgaagaggacgatacaatctctagaggatttactgagaatgtgtgtacttgagcaaggtggagcttg 19310  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||||||| || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||||    
T  19309 ggatagtcacctaccgttggaagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggtcgaagatgcaga 19210  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | || || ||| | || ||||| || ||||| || ||  || || ||||  ||||  | ||||    
T  19209 actcctttgtgttggttcgagtcgggagaaagtgtgatgttggggccatacatagttcaacagactacagaaaagattaagttgataaaagaacagatga 19110  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  19109 aagcgtcgcagagtcaacagaagagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttgagtttcaagagggagaccatgtgttcttgagagtcactcctatgac 19010  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
     |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  || | |||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  19009 aggtgtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttgggacagtggcgtatagagtgggt 18910  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgca 662  Q
    || || || |||||||||||||||||    
T  18909 ttgccacctcatctttcgaatttgca 18884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 23671 - 23109
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    || ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  |||    
T  23671 catggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgcagttcacttctagattctagaagagtttgcaagatgctctgggttcgaaattgaggctga 23572  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || || || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  23571 gttcggcttatcatcctcagacagatgatcagtcgaagaggacgatacaatctctagaggatttactgagaatgtgtgtacttgagcaaggtggagcttg 23472  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||||||| || ||||||   ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||||    
T  23471 ggatagtcacctaccgttggaagagtttacttacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcaccgtttgaagcattgtatggtcgaagatgcaga 23372  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||| | || || ||| | || ||||| || ||||| || ||  || || ||||  ||||  | ||||    
T  23371 actcctttgtgttggttcgagtcgggagaaagtgtgatgttggggccatacatagttcaacagactacagaaaagattaagttgataaaagaacagatga 23272  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  23271 aagcgtcgcagagtcaacagaagagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttgagtttcaagagggagaccatgtgttcttgagagtcactcctatgac 23172  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagat 599  Q
     |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  23171 aggtgtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagat 23109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 697
Target Start/End: Original strand, 16350 - 17019
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||    
T  16350 gtgaagcttcatggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcgaagt 16449  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||    
T  16450 tgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacaagg 16549  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||    
T  16550 tggagcttgggatagtcacttgcctttgattgagtttacttataacaacagctatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcgg 16649  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcaga-tgatccaa 426  Q
    || || || ||||| || ||||||||| |||| ||||| || || || || ||||| ||  | |||||  | ||||||||||||| ||||| ||||   |    
T  16650 aggtgtaggactcctttatgctggtttaagtcgggtgagagtgttgtgttgggaccggacttggttcatgagactactgagaaag-tcagattgataaga 16748  T
Q  427 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 526  Q
    || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||||    
T  16749 gaaaagatgaaagcttcgcagagccgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtca 16848  T
Q  527 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctta 626  Q
     |||| |||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||  || | ||||||||| ||||| ||    
T  16849 ctcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtattagatttcagagagagttggaacagtggcata 16948  T
Q  627 tcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  16949 tagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 17019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 11441 - 10865
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||| || || ||||| || || ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  11441 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatggagatccgaggttcacttcgaggttctggaagagtttgcaggacgctttgggttcga 11342  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  11341 agttgaggttcagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 11242  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || | | |||| |||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  11241 aggtggagcttgggatagtcacctactgctgatagagttcacatacaacaacatttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggt 11142  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||| || ||||| ||  | |||||  | ||||| ||||||||  ||||||||     
T  11141 cggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagttaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactacagagaaagtcaagatgatca 11042  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || |||||| | || ||    
T  11041 gagaaaagatgaatgcgtcttagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtgtttcttagggt 10942  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 601  Q
     | | |||||||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  10941 tacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagattt 10865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 697
Target Start/End: Original strand, 25511 - 26171
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  25511 catggtgttccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattatggaagagattgcaagatgctttgggatcgaagttgaggttga 25610  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  || || ||  | ||||||||  ||||| | || || | ||||||||| ||| ||||    
T  25611 gttcggcttatcatcctcagacagatggtcggtcagagaggatgatccaatcattggaggatttactgagagtgtgggtacatgagcaaggtggagcttg 25710  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||      
T  25711 ggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaag 25810  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    | ||| || ||||||||||||| ||| || || || ||  | ||||| ||  | || || || ||||| ||||| ||  |||||||    || || ||||    
T  25811 aatcctttatgctggtttgagttaggagagagtgttgtgctgggaccggatttggtccatcagactacggagaaggtaaagatgataagggaaaagatga 25910  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| || || || || || ||| ||||||| | |||||||||    
T  25911 aagcgtctcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtatttctgagagttactcctatgac 26010  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
     ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |   |||  |||||||| ||||| ||  ||||||||    
T  26011 gggtgtaggatgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcaaaaagggttggaacagtggcatacagagtgggt 26110  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || || || |||||||| || |||||  |||| || |||| ||||||||||||||| ||||    
T  26111 ttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgcgtcgcaacttcggaaatatg 26171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 433 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 16940 - 16676
Alignment:
Q  433 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 532  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| |||| |||| ||||     
T  16940 atgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctt 16841  T
Q  533 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 632  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||  ||||| ||| | ||    
T  16840 tgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaatagtggcatatagtgt 16741  T
Q  633 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||||| || || ||||||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  16740 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 16676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 182; Significance: 5e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 541 - 1
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | |||| ||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  541 attgtgaagttgcatgatgtaccatcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgccttgggttcaa 442  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||    
T  441 agttgaggttgagttcggcttatcatccacaaacagatggtcagtcggagagaacgattcagtcgctagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgacca 342  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  |||| | | ||||| ||||| ||||||    
T  341 aggtggagcttgggatagtcatctaccgatgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattgttatgg-aacgttcgaagctttgtatggt 243  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||  | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||      
T  242 cggaggtgcaggactccattatgttggtttgagtcaggagaaagtgtagtgttgggaccggatttggttcatcagactacggagaaggtcaagatgataa 143  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
     ||| || ||||| |||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||    
T  142 gagaaaagatgaaagcgtcatagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagt 43  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaa 566  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  42 cactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 5885 - 5309
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| || | ||| || ||||  || |||||||| ||||    
T  5885 attgtgaagctacatggagttccttctagtattgtgtcggatagggatccaaggttcacctctaggttcttgaagagcttgctggacgctttgggttcga 5786  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  5785 agttgaggttgagttcggcttatcatcgtcagaaagatggttagtcggaaaggacgatccaatcgttagaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 5686  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    |   ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  5685 acttggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtaatggtatggcaccgttcaaagctttgtatggt 5586  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||||| || || |||||||| ||  |||||||      
T  5585 cggaagtgcaggactccgttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatgat-a 5487  T
Q  425 aagagaaa-atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 523  Q
    | || ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||||| || || || || ||||||||||    
T  5486 aggaaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagag 5387  T
Q  524 tcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattt 601  Q
    | | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5386 ttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattt 5309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 134 - 697
Target Start/End: Original strand, 13994 - 14557
Alignment:
Q  134 tgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaac 233  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || || ||  | ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |    
T  13994 tgagttcagcttatcatccgtagacagatggtcagtcgaagagaacgatccaatctttggaggatttactgagaatgtgtgtgcttgagcaaggtggagc 14093  T
Q  234 ttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgc 333  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  14094 ttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgc 14193  T
Q  334 agaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaa 433  Q
    || ||||| || | ||||||||||||||| || || || || || ||||| ||  | ||| | || ||||  |||| |||  |||||||| |||| || |    
T  14194 aggactcctttatcctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaccggatttggtttatcagactatagagatagtcaagatgatcaaagaaaaga 14293  T
Q  434 tgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctat 533  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||| |||| || || || || ||| |||| || | ||||||    
T  14294 tgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagttttaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctat 14393  T
Q  534 gactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtg 633  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| ||||| |||  |||     
T  14394 gacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatataaagtt 14493  T
Q  634 ggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  14494 ggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcaggtgtcgcaacttcggaagtatg 14557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 553 - 697
Target Start/End: Original strand, 9039 - 9183
Alignment:
Q  553 ttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatcttt 652  Q
    |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || |  |||||||| ||||| |||  ||| ||||| || || |||||||    
T  9039 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatcttt 9138  T
Q  653 cgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||| |||||  |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  9139 cgaacttgcatgatgtgtttcaggtgtcgcaacttcggaagtatg 9183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 175; Significance: 8e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 697
Target Start/End: Original strand, 12420 - 13087
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  12420 ttgtgaagctacatggagttccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacatctagattttggaagagtttgcaggacgctttgggttcgaa 12519  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaa 225  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||     
T  12520 gttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggaaaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgaacat 12619  T
Q  226 ggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtc 325  Q
    || ||| |||| | ||     || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  12620 ggtggagcttgtgctac----ctaccattgatagagttcacctacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtc 12715  T
Q  326 ggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcca 425  Q
    |||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||  | ||||| || || |||||||| ||  |||||||       
T  12716 ggaggtgcaggactcttttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtattaggaccagatttggttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataag 12815  T
Q  426 agagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtc 525  Q
     || || ||||| |||||| |||||||| | || ||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| || || || || |||||||||||     
T  12816 ggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagtt 12915  T
Q  526 agtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggctt 625  Q
    | ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||  || |   ||||||||||||| |    
T  12916 actccgatgacgggtgtagaacgtgctttgaaatcaaggaagttaactccgaagttcattggtccgtattagatttcagagaggattggaacggtggcat 13015  T
Q  626 atcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |  |||| || || || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  13016 acagagttggcttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 13087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 272
Target Start/End: Original strand, 3442 - 3695
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgg 118  Q
    ||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3442 aaggagattgtgaggttgcatggtgttccttcgagcattgtatcaaatagagatccaagatttacataaagattttggaaaagtttacaagaggctttgg 3541  T
Q  119 gctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttct 218  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3542 gttctaagttgagattgagttcggcgtatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgagagtttgtgtact 3641  T
Q  219 tgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaa 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  3642 tgagcaaggaggaacttcggatagtcatcttccgttcatagagttcacgtacaa 3695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 366 - 482
Target Start/End: Original strand, 3694 - 3810
Alignment:
Q  366 aagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttat 465  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3694 aagagtggtcttaggaccagagatagttcagcaaactaacgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttat 3793  T
Q  466 catgacaagcgtagaaa 482  Q
    ||||| |||||||||||    
T  3794 catgataagcgtagaaa 3810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 305
Target Start/End: Original strand, 18839 - 19119
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | || |    
T  18839 attgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctgaggtttacttctagattttggaagagtttgaaagaggctttaagttcta 18938  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | ||||| || |||||| ||||||| ||||||||    
T  18939 agttgaggttgcgttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaatgattcagtcgttggaggacttattgagagtttgtgtacttgagca 19038  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacc 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19039 aggaggaacttaggatagtcatcttcctttgatagagttcacgtacaataacagttatcattctagtattggaatggcacc 19119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 25 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 26933 - 26261
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| || |||||  | || || ||||| || ||||| ||||  || || |||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  26933 attgtgaagctgcacggtgtatcgtcaagtattgtgtcggatagggatctgaggttcacttctaggttctggaagagtttacaggacgctttgggttcga 26834  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  26833 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcaaacagatggtcagtcggagaggacgattcaatcattggaagatttgttgagggtgtgtgtacttgagca 26734  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || || ||||| || |||||||| |||| ||| ||||| || || ||||||    
T  26733 aggtggagcttgggatagtcacctgccattgattgagttcacttataacaacagctatcactcgagtattgggatggtaccgttcgaagccttgtatggt 26634  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||| || || |||||||||||||||||||  || || || ||||||||  | |||||  | |||||||||||||||  | ||||      
T  26633 cggaggtgtaggactcctttatgttggtttgagtcaggtgaaaatgttgtgttgggaccagatttggttcatgagactactgagaaagttaggttgataa 26534  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
      || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| || || || || ||| |||| ||    
T  26533 gggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagtgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggt 26434  T
Q  525 cagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggct 624  Q
    || |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  || |  || ||||| ||||||    
T  26433 cactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggtgggaacagtggct 26334  T
Q  625 tatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| |||  ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  26333 tatagagctggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 26261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 233 - 697
Target Start/End: Original strand, 5756 - 6219
Alignment:
Q  233 cttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatg 332  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  5756 cttgggatagtcatctaccgttgatagagttcacgtacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtg 5855  T
Q  333 cagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaa 432  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||  | ||||  |||||||| || || ||  || ||||   ||| ||     
T  5856 cagaactccattgtgttggtttgagtcgggagaaagtgtagtgttgggaccagatttagttcgtcaaactacagaaaaggtcaagttgataagagaaaag 5955  T
Q  433 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 532  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||  || |||||| |||| || | |||||    
T  5956 atgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagctcatgtgtttctgagggttactccta 6055  T
Q  533 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 632  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  6056 tgacgggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagagttggaactgtggcatatagagt 6155  T
Q  633 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6156 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcttgatgtttt-catgtgtcgcaacttcggaagtatg 6219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 265
Target Start/End: Original strand, 19636 - 19876
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || || |    
T  19636 attgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattatggaaaagtttgaaagaggctttaggttcta 19735  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19736 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggtcagtcggtgaagacaattcagtcgttagaggatttgttgagggtttgtgttcttgagca 19835  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttca 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  19836 aggaggaacttgggatagtcatctcccattgatagagttca 19876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 512 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 17142 - 16957
Alignment:
Q  512 tgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagt 611  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||| || | |||||||| | ||||| |||    
T  17142 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagt 17043  T
Q  612 tggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |  ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17042 tttaacggtggcgtattgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 16957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 101 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 267 - 1
Alignment:
Q  101 gtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggattt 200  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||  |||||||  | || |||||    
T  267 gtttgcaagaggctttaggttctaagttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggttagtcggatagtacgtttcagtcttttgatgattt 168  T
Q  201 gttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatg 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167 gttgagagtttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccattgatagagttcacgtataataatagttatcattctagtattggaatg 68  T
Q  301 gcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaa 367  Q
     ||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  67 acaccttatgaggctttgtatggtcggagatgcaaaactccgttgtgttggtttgaatcaggtgaaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 160; Significance: 7e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 479
Target Start/End: Original strand, 2992 - 3443
Alignment:
Q  28 gtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagt 127  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| || || |||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||    
T  2992 gtgaagctacatggtgtaccgtcaagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttatagattctggaagagtttgcatgacgctttgggttcgaagt 3091  T
Q  128 tgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || || || ||  | |||||||||||| || | ||||| |||||||||||    
T  3092 tgaggctgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagggcacgatccaatctttggaggatttgttgcgagtgtgtgtgcttgagcaagg 3191  T
Q  228 aggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcgg 327  Q
     ||| ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  3192 tggagcttgggatagtcacctaccattgatagagttcacatagaacaacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcgg 3291  T
Q  328 agatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaag 427  Q
    || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || || ||| | ||  | ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||  ||    
T  3292 aggtgcaggactcctttatgctggtttgagtcaggagagagtgttgtgttgggaacggatttggttcatcagactacagagaaagttaagatgatcagag 3391  T
Q  428 agaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtag 479  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  3392 agaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcgtgataaacgtag 3443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 697
Target Start/End: Original strand, 3487 - 3574
Alignment:
Q  610 gttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  3487 gttggaacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcatgatgtgtatcatgtgtcgctacttcggaagtatg 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 150; Significance: 6e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 482
Target Start/End: Original strand, 5086 - 5543
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||| |||   || || |||||||| || ||||| |||||||| || | |||||| ||||    
T  5086 attgtgaagctacatggagttctttcgagtattgtgtcggatagggatttgaggttcacttctaggttctggaagagtttgcaggatgttttgggttcga 5185  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  5186 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgcttgagca 5285  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggt 324  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||  |||||    
T  5286 aggtggagcttgggatagtcacctaccaatgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtataggtatggcaccgttcgaagctttggatggt 5385  T
Q  325 cggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatcc 424  Q
    ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||  | |||||  | ||||  ||||||||  ||||||||     
T  5386 cggaggtgtaggactcctttctgatggtttgagtcaggagagagtgtggtgttgggaccggatttggttcatgagactatagagaaagtcaagatgatca 5485  T
Q  425 aagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaa 482  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  5486 gagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaa 5543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 337 - 697
Target Start/End: Original strand, 206 - 566
Alignment:
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||| || |  || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||    
T  206 actctgttgtgttggttcgaatcaggtgagagtgcagttttgggaccagaaattgtacagcaaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatga 305  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | |||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | ||    
T  306 aagcgtcgcagagtcgacaaaacaactaccatgataagcgtaggaaagacattgagtttcaagaaggggaccatgtgtttttgagagtcaatcctgtaac 405  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggt 636  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||| |  ||||   |||||| |||||| ||||||||||||    
T  406 cggtgttggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgagatttattggtccgtatcagatatcagaaaggattggaatggtggcgtatcgagtgggt 505  T
Q  637 ttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  506 ttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 147; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25646 - 25464
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  25646 attgtgaagtttcatggtgttccttcgagcattgtatcagatagatatccaagatttacttctagattttggaagagtttgcaagaggctttgggttcta 25547  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaga 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25546 agttgagattgagttcggcgtatcatccgcaggcagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgctagaggatttgttgaga 25464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 542
Target Start/End: Original strand, 880 - 1385
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||| |||||    
T  880 catggggttccgtcgagtatagtgtcaaatagagacccaaagtttacttgaagattttggaagagtttacaagatgcgttgggttcgaaattgaaattga 979  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||  ||||||||||  | ||| | ||||| |||||||| || ||| ||||    
T  980 gttcggcttatcatccgcagacagatggtcattcggaaaggacgatccaatctttagaggatttactaagagtatgtgtacttgagcagggtggagcttg 1079  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  1080 ggacagtcacctaccattgatagaatttacatacaataacagttaccattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcagg 1179  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    ||||| || |||||||| ||| | || ||||| || || || || || ||  | |||||  | ||||| ||||||||  |||||||    ||||| ||||    
T  1180 actcctttatgctggttcgagacgggagaaagtgttgtgttggggccggatttggttcatgagactacggagaaagtcaagatgattagggagaagatga 1279  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| || | |||||||||    
T  1280 aagcgtcgcagagttgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgac 1379  T
Q  537 tggtgt 542  Q
     |||||    
T  1380 gggtgt 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 63 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 523 - 86
Alignment:
Q  63 agatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagat 162  Q
    |||||| ||||| || || |||| |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  523 agatagggatccgaggttcacttatagattctggaagagtttgcaagacgccttaggatcgaagttgaggctgagttcggcttatcatccgcacacagat 424  T
Q  163 ggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagt 262  Q
    |||||   ||||||||| || || ||  ||||||||||  | ||| | ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  423 ggtcaaatggagaggacgatacaatctttagaggatttagtaagagtgtgtgtgcttgagcaatgtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagt 324  T
Q  263 tcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcagg 362  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||||||    
T  323 tcacatacaacaaccgttaccattcgagtatttgtatggcaccgttcgaagctttatatggtcggaggtgcaggaatcctttatgctggtttgagtcagg 224  T
Q  363 tgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagt 462  Q
     || || || || || ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||  |||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  223 agagagtgttgtgttgggaccagatttggttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcatcgtagagtcgacagaagagt 124  T
Q  463 tatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 500  Q
    || |||||||||||||| || |  ||||||||| ||||    
T  123 taccatgacaagcgtaggaaggcccttgagttttagga 86  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 427 - 572
Target Start/End: Original strand, 946 - 1091
Alignment:
Q  427 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 526  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || |    
T  946 gagaagatgaaggcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 1045  T
Q  527 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     |||| |||| ||||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  1046 atcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 433 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 28231 - 27967
Alignment:
Q  433 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 532  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| | |||      
T  28231 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgaatttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactccgg 28132  T
Q  533 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 632  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || |  || |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  28131 tgactggtgttggacgtgctgtgaagtcaaagaagttgaatcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagt 28032  T
Q  633 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28031 tggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 27967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 24176 - 24097
Alignment:
Q  19 aaggaaattgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 98  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24176 aaggagattgtgaagttgcatggtgttccttcgagcattggatcggatagagatccaagattaacttctagattttggaa 24097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 439 - 697
Target Start/End: Original strand, 30 - 288
Alignment:
Q  439 gcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactg 538  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||| || | ||||||    
T  30 gcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtgactg 129  T
Q  539 gtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggttt 638  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  130 gtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagtgttggaacggtggcgtatcgagtgagttt 229  T
Q  639 accgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  230 accaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatg 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 254
Target Start/End: Original strand, 11302 - 11531
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  11302 attgtgaagttacatggagttccatcgagtattgtgtcagatagagatctgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgctttgggttcga 11401  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  11402 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagagtgtgtgtacttgagca 11501  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgtt 254  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||    
T  11502 aggtggagcttgggatagtcacctaccgtt 11531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 245
Target Start/End: Original strand, 6871 - 7091
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  6871 attgtgaagttacatggagttccatcgagtattgtgtcagatagagatctgaggttcacttctagattttggaagagtttgcaagatgctttgggttcga 6970  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  6971 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgttgagagtgtgtgtacttgagca 7070  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtca 245  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  7071 aggtggagcttgggatagtca 7091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 518 - 697
Target Start/End: Original strand, 13380 - 13559
Alignment:
Q  518 tgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaac 617  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||   |||||||| |  || |  ||||||||    
T  13380 tgagagttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttaattggtaagtatcagatatctgagagggttggaac 13479  T
Q  618 ggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||| | ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13480 agtgacatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 13559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 272
Target Start/End: Original strand, 2509 - 2756
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||    
T  2509 attgtgaagttacatggtgtaccgtcgagtattgtatcggatagagatccaaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagattccttgggttcga 2608  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  2609 agttgaggttgagttcggcttatcatccacagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattagaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 2708  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaa 272  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  2709 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacgtacaa 2756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 361
Target Start/End: Original strand, 5969 - 6307
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||  || || |||||||| || ||||  ||||| || || |||||||| ||||    
T  5969 attgtgaagctacatggagttccttcgagtattgtgtcggatagggatctgaggttcacttctaggttctggatgagtttacaggacgctttgggttcga 6068  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaga--atttgtgttcttgag 222  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||||||||||||   | ||||| ||||||    
T  6069 agttgaggttgagttcggcttatcatcctcagatagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaggatttgttgagagtgtgtgtgtgcttgag 6168  T
Q  223 caaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatg 322  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || | | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||| ||||    
T  6169 caaggtggagcttgggatagtcacctactgctgatagagttcacatacaataacagttaccattcgagtataggtatggcatcgttcgaagctttgtatg 6268  T
Q  323 gtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcag 361  Q
    ||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||    
T  6269 gtcggaggtgtaggactcctttatgctggtttgagtcag 6307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 317
Target Start/End: Original strand, 4945 - 5224
Alignment:
Q  38 atggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgag 137  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  4945 atggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagagatccgaggttcacttctagattctggaagagtttgcaagatgctttgggttcgaagttgaggttaag 5044  T
Q  138 ttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgg 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||  ||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||    
T  5045 ttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtctgagatgacgattcaatctttagagtatttactgagagtgtgtgttcttgagcaagttggagcttgg 5144  T
Q  238 gatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggcttt 317  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||    
T  5145 gatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttaccattcgagtattggtatggcatcgttcgaagcttt 5224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 118; Significance: 8e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 416 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 472 - 191
Alignment:
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  472 agatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgaccatgtttt 373  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgga 615  Q
    | |||| || | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  372 tctgagggttactcctatgacgggtataggacgtgcgttgaagttgaagaacttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagaaagagttgga 273  T
Q  616 acggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || ||||| ||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||  | || || |||||||||||| | ||||||||||    
T  272 actgtggcatatagagttggtttgcctcctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatg 191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 555 - 470
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaaga 110  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| || || || |||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  555 attgtgaagatgcatggtgttccgtcgagtatagtgtcggatagagacccgaggtttacttcaagattttgaaagagtttacaaga 470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41589 - 41344
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  ||||||||||  | || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  41589 attgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcgaatagagatccggggttcacttctagattctggaagagtttgcaagacgctttgggttcga 41490  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | ||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  41489 agttgaggttg--ttcggcttatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatctttggaggatttactgagagtgtgtgtgcttgagca 41392  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaa 272  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  41391 aggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaa 41344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 45932 - 45845
Alignment:
Q  610 gttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || |||| ||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  45932 gttggaacagtggcatatagagttggttttccaccacatcattcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 45845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2139 - 1988
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  2139 attgtgaagttgcatcgtgttccgtcgagcattgtatcagatagagacccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttaggttcta 2040  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagag 176  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2039 agttgaggttgagttcggcgtatcatccgcagacagatggttagtcggagag 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Original strand, 1618 - 1887
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || ||| | || |||||||  ||||    
T  1618 catggagttccatcgagtattgtgtcagatagagatccgaggttcacttcgaggttttggaagagtttgcaagatgcattgagttcaaagttgaagttga 1717  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  || ||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  1718 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagagaacgatttaaccgttagaggatttgctaagagtgtgtgtacttgagcaaggtggagcttg 1817  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacct 306  Q
    ||||||||| ||  |||||||  ||||||| ||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  1818 ggatagtcacctgtcgttgataaagttcacgtacaacaacaattaccattcgagtattggtatggcacct 1887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 301 - 697
Target Start/End: Original strand, 4912 - 5308
Alignment:
Q  301 gcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaa 400  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||||| ||||| || | |||| |  | ||||| || |    
T  4912 gcaccgttcgaagctttgtatggtcggaggtgcaggactcctttgtgttggtttgagtggggagaaagtgtggtgttggaaccatatttagttcatcaga 5011  T
Q  401 ctactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcagga 500  Q
    | || ||||| ||  |||||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  5012 ccacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaaga 5111  T
Q  501 aggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagatt 600  Q
     ||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||     
T  5112 gggagatcatgtgtttctgagaatcactcctatgacgggtgtaggttgtgtgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggttcgtatcagata 5211  T
Q  601 ttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |   | |  ||||||||  |||| ||   ||||||||| || || ||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5212 tctaagagggttggaacactggcatacatagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 5308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 307 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 4281 - 3891
Alignment:
Q  307 ttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactg 406  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||  | |  |||||||||||| | ||||| || || || ||||| ||  | ||| | || ||||| |    
T  4281 ttcgaagctttgtatggtcgaaggtgcaggactcctatatattggtttgagtcaagagaaagtgtagtgttgggaccggatttagtttatcagactacgg 4182  T
Q  407 agaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggaga 506  Q
    |||||||  |||||||   ||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || |||||    
T  4181 agaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagatggaga 4082  T
Q  507 ccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaa 606  Q
     || |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |  ||     
T  4081 tcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtctgtatcagatatctgag 3982  T
Q  607 aaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |  |||||||| ||||| ||   ||| | ||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3981 agggttggaacagtggcatacatagttgttttgcctccacatctttcgaatttgcattatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 3891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 433 - 697
Target Start/End: Original strand, 1211 - 1475
Alignment:
Q  433 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 532  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||| | |||||    
T  1211 atgaaagcgtctcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactccta 1310  T
Q  533 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 632  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  || |  |||||||| ||||| ||   | |    
T  1311 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcataaaaaat 1410  T
Q  633 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     ||||| || || ||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1411 aggtttgccaccacatctttcgaaattgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 1475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 46814 - 46279
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || |||| |||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  46814 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttatttctaatttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 46715  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| || || ||||||||  | |||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  46714 gttctgcttaccatcctcataccgatggtcatacagagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 46615  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||     | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  46614 ggatgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 46515  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  46514 acaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 46415  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || | |||| | ||    
T  46414 aggcgtctcagagtagacaaaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtaaatcctgtaac 46315  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     ||||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  46314 cggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 46279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Original strand, 68225 - 68427
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||  || || ||||| || |||||||| ||||||||||||   ||||| || |    
T  68225 attgtgaagttgcatggggttccatcgagtattgtgtcggatagagatctgaggttcacttcaaggttttggaagagtttgcaagagaacttgggttcaa 68324  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  68325 agttgagattgacttcggcttatcacccacaaatagatggtcagtcggagaggacgattcagtcgttaaaggatttgctgagagtgtgtgtacttgagca 68424  T
Q  225 agg 227  Q
    |||    
T  68425 agg 68427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Original strand, 844 - 997
Alignment:
Q  26 ttgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaa 125  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  844 ttgtgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacttcaagattttggaagagtttgcaagatgctttgggctcgaa 943  T
Q  126 gttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggac 179  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  944 gttgaggttgagttcggcttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggac 997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 469 - 697
Target Start/End: Original strand, 4217 - 4445
Alignment:
Q  469 gacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagt 568  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||||| || || || || |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  4217 gacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagt 4316  T
Q  569 tgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgt 668  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||||||||   | |  |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||  ||||    
T  4317 tgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcaaagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 4416  T
Q  669 tttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
     || |||||||||||||||||||||||||    
T  4417 gtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 4445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 433 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 14349 - 14086
Alignment:
Q  433 atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtccta 532  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| |||||    
T  14349 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcatagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactccta 14250  T
Q  533 tgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagt 632  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| | ||  |||| |  | ||| |||||||| ||||| ||   |||    
T  14249 tgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtcgaagaagttgactccgaagtttatcggttcgtactagatatctg-aaaggttggaacagtggcatacaaagt 14151  T
Q  633 gggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  14150 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatg 14086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 227
Target Start/End: Original strand, 9507 - 9697
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||||||   | |||||||||||||    
T  9507 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttggaaacaaagttgagattga 9606  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaagg 227  Q
    |||| || || || || ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  9607 gttctgcttaccaaccacagaccgatgggcagacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaagg 9697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 280 - 697
Target Start/End: Original strand, 38776 - 39193
Alignment:
Q  280 tatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttag 379  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || |    
T  38776 tatcactcgagtattggtatggcaccgttcgaagccttgtatggtcggaggtgtaagactcctttatgctggtttgagtcaggtgagagcgttgtgttgg 38875  T
Q  380 gaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaa-atgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgta 478  Q
    |||| ||  | |||||  | ||||||||||||||   | ||||  | || ||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  38876 gaccggatttggttcatgagactactgagaaagtcaggttgata-aggaaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgaa 38974  T
Q  479 gaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaa 578  Q
    |||| |||||||| |||||||| || || || || ||| ||||||||| |||| |||| ||||| || ||||| |||||||| | ||||||||| || ||    
T  38975 gaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgccttgaagtcgaggaagttgactcctaa 39074  T
Q  579 gttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtg 678  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||| | ||||| ||| |||| ||||| || || ||||||| ||| |||||| | || || |||||     
T  39075 gttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggagcagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcacgaagtgtttcatgtt 39174  T
Q  679 tcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    || || |||||||||||||    
T  39175 tctcagcttcggaagtatg 39193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 24054 - 23519
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  24054 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 23955  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    | ||| |||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  23954 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacggagaggactattcagagtttggagtatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgttagttg 23855  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || | || |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  23854 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacatttttcatgctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 23755  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || ||||| || ||||||||||| || || || |   | |||||||| ||| |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  23754 acaccgttatgttggtttgagtctggagagagtgctttgttaggaccggaggttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 23655  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |   | || |||||||||||||| || | || | ||||    
T  23654 aagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttagtgatcacgtgtttttgagggtgaatcatgtgac 23555  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     || || || |||||||||||||  | |||||||||    
T  23554 cggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 23519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5102 - 4884
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||| | || |||||||| || |||||||| |||||||||||  | | ||| || |    
T  5102 attgtgaagttgcatggggttccatcgagcatcgtgtcggatagagattcgaggtttacttcaaggttttggaagagtttgcaagattcctcgggttcta 5003  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||    
T  5002 agttgaggttgagttcggcttatcatccgcaaacagatggtcagtcggagagaacgattcaatcgttagaggatttactgagagtgtgtgtacttgagca 4903  T
Q  225 aggaggaacttgggatagt 243  Q
    ||| ||| ||||| |||||    
T  4902 aggtggagcttggaatagt 4884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 489 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1177
Alignment:
Q  489 tgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggt 588  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1385 tgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggt 1286  T
Q  589 ccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttc 688  Q
    |  |||||||| |   | |  |||||||| ||||| ||  |||||||||| || || |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||    
T  1285 ctgtatcagatatcttagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttc 1186  T
Q  689 ggaagtatg 697  Q
    |||||||||    
T  1185 ggaagtatg 1177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7828 - 7497
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || |||   ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | || ||||||||||    
T  7828 catggtattccttctagtattgtgtcggatccggatccgaggtttacttctatgttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaatttgagattga 7729  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    | || ||||||||||||  ||||||  | ||||||||    | |||    
T  7728 gttctgcttatcatccccagacagatgggcagaccgagaggactattcagagtttggaagatttgttgagagcttgtgtcttggagcaaggtatcagttg 7629  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || | || |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7628 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacaattttcattctagtattggaatggcaccgtttgagactttgtatggtcggagatgcaga 7529  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaag 368  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7528 actccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaag 7497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 4543 - 4425
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  4543 attgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctgaggtttacttctatattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 4444  T
Q  125 agttgagattgagttcggc 143  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  4443 agttgaggttgagttcggc 4425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11673 - 11555
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  11673 attgtgaagttacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatctgaggtttacttctatattttggaagagtttgcaagaggctttaggttcta 11574  T
Q  125 agttgagattgagttcggc 143  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  11573 agttgaggttgagttcggc 11555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 14383 - 14918
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  || ||| | ||||||||||  |||||||   | ||||||||| |||    
T  14383 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgtgatccgaggtttacttctaagttctgggagagtttgcaagctgctttggaaactaagttgagactga 14482  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || | | | ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  | |||    
T  14483 gttctgcttaccgttctcagaccgatgggcagacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaaggtgtcagttg 14582  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||     | | ||| |||| ||||| || ||||| || |||| |||||||| ||| |||||||| || || |||||||| |||||| |||| || |||    
T  14583 ggatgaatgtttaccgatgattgagtttacttacaacaacagttttcattctactatcggaatggctccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtaga 14682  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| |||||||| || || ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  14683 acaccgttgtgttggtttgaatccggagaaagcgctttgttaggaccggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatga 14782  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||| |||||||  || || || ||||||||||| || | || | ||||    
T  14783 aggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgaatttcaggttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgac 14882  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
      |||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  14883 cagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 14918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 13568 - 13033
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | ||||| |||||||    
T  13568 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgagatttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttcagattga 13469  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| || || ||||| ||  |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  | |||    
T  13468 gttctgcttaccatcctcataccgatgggcaaacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaaggtgttatttg 13369  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||       | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||| ||| || ||     
T  13368 ggtcgaatgtttaccgttgattgagtttacctacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcagaggtgtagg 13269  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || || ||||| |||||||| || || || ||||   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| | |||||||||||||| ||||    
T  13268 acaccattgtgttggtttgaatccggagagagagccttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaaaatgatccaagagaagatga 13169  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||| |||||||| |  ||| ||||    
T  13168 aagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttgttgagagtgaaccctgtgac 13069  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     ||||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  13068 cggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 13033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 265
Target Start/End: Original strand, 32953 - 33193
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcga 124  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||   || ||||| ||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| || | |||||| ||||    
T  32953 attgtgaagctgcacggtgtaccgtcgagtatttcgtcggatagggatccgaggttcacctctaggttctggaagagtttgcaggatgatttgggttcga 33052  T
Q  125 agttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagca 224  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  33053 agttgaggttgagttcgacttatcatcctcagacagatggtcagtcggagaggacgatccaatcattggaagatttgttgagggtatgtgtgcttgagca 33152  T
Q  225 aggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttca 265  Q
    ||| ||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  33153 aggtggagcttgggataatcacctaccgttgatagagttca 33193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 3818 - 3284
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| | |||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||  ||||    
T  3818 catggtattccttctagtattgtgtaagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgacgttga 3719  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || |||||||| ||||| ||||| ||  | |||||||| |||| |    |||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  3718 gttctgcttatcatcc-cagaccgatgggcaaacagagaggactattccgagtttagaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 3620  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||| |    | | || ||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |      
T  3619 ggacaaatgtttacctttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcgaagatgtaag 3520  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| | |||||| ||||| ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||  || || ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  3519 acaccgttgtgttagtttgaatcaggagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactatggaaaaggttaagatgattcaagagaagatga 3420  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||  | ||||||||||  || || || |||||||||||||| | |||| ||||    
T  3419 aagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacatcgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtgac 3320  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     ||| | || |||||||||||||  | |||||||||    
T  3319 cggtattggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 3284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17992 - 17877
Alignment:
Q  64 gatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggcatatcatccgcagacagatg 163  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17992 gatagagatccgagattcacttctagattttggaagagtttgcaagatgcattgagttcaaagttaaggttgagttcggcttatcatccgcagacagatg 17893  T
Q  164 gtcagtcggagaggac 179  Q
    ||||||||||||||||    
T  17892 gtcagtcggagaggac 17877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 497
Target Start/End: Original strand, 25959 - 26263
Alignment:
Q  193 gaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagta 292  Q
    |||||||||||||||  ||||||  | |||||||| |  | |||||||||   | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||    
T  25959 gaggatttgttgagagcttgtgtgttggagcaaggtgtcagttgggatagatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagta 26058  T
Q  293 ttggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgt 392  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||||||| ||| || || || |||||||| |||||| | || ||||||||     | ||||||| |||  ||||    
T  26059 tcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtccgaggtgtaggacaccgttgtgttggttttaatccggtgaaagttctttgttaggactagaagttgt 26158  T
Q  393 tcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgag 492  Q
     ||  ||||||| || || ||| ||||||| || || || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||    
T  26159 gcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgag 26258  T
Q  493 tttca 497  Q
    |||||    
T  26259 tttca 26263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 250 - 559
Target Start/End: Original strand, 913 - 1222
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgct 349  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| | |||||  |||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||  |||| |    
T  913 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatacaagtatcagaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccaatgtgtt 1012  T
Q  350 ggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagag 449  Q
    ||||||||| ||||||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  1013 ggtttgagttaggtgaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatggtccaagagaagatgaaagcgtctcagag 1112  T
Q  450 tcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgt 549  Q
    | |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| ||  || || || || ||||| ||||| | |||| |||||||||| || |||    
T  1113 tagacagaagagttatcatgataagaggagaaaagatattgagtttctggttggcgatcatgtattttttagagtgaatcctgtgactggtgttggtcgt 1212  T
Q  550 gctttgaagt 559  Q
    ||||||||||    
T  1213 gctttgaagt 1222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 164
Target Start/End: Original strand, 700 - 827
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| || |||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  700 catggtatttcttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 799  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatgg 164  Q
    |||| || || ||||| ||||| |||||    
T  800 gttctgcttaccatcctcagaccgatgg 827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 110
Target Start/End: Original strand, 39645 - 39730
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaaga 110  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39645 attgtgaagttgcatggtgttccatcgagcattgtgtcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaaga 39730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 3521 - 4056
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| || |||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  3521 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgaggtttacttctaaattttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 3620  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  3621 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagaaaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtcagttg 3720  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  3721 ggacgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcatgctagtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 3820  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || || ||||| |||||||| ||  | || || |   | ||||| |  ||  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  3821 acaccattgtgttggtttgaatccagagagagtgctttgttaggcctggaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 3920  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |||||||| ||||| | |||| ||||    
T  3921 aagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttgatgatcatgtgtttttaagagtgaatcctgtgac 4020  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     ||||| || |||||||| ||||  | |||||||||    
T  4021 cggtgttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgac 4056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 251 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 71665 - 71446
Alignment:
Q  251 cgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctg 350  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || | |||||| ||    
T  71665 cgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatggcaccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacactgttgtgttg 71566  T
Q  351 gtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagt 450  Q
    |||||| || || ||||| || || |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  71565 gtttgaatctggagaaagtgttgtgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagt 71466  T
Q  451 cgacaaaagagttatcatga 470  Q
     |||| ||||||||||||||    
T  71465 agacagaagagttatcatga 71446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 152
Target Start/End: Original strand, 33059 - 33174
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||  | |||||||| ||||    
T  33059 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgctttgggaactaagttgaggttga 33158  T
Q  137 gttcggcatatcatcc 152  Q
    |||| || ||||||||    
T  33159 gttctgcttatcatcc 33174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 416 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 13532 - 13397
Alignment:
Q  416 agatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtt 515  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || | ||||| |||||||| ||  | ||||| ||| ||||||||||||  || || ||||| ||    
T  13532 agatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagctatcatgataaaaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcacgtatt 13433  T
Q  516 tttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgc 551  Q
     |||||||| | |||| | |||||||| || |||||    
T  13432 cttgagagttaatcctgtaactggtgttggtcgtgc 13397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24623 - 24529
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgag 131  Q
    |||||| |||| || || ||||| |||||| || | |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  24623 catggtattccatctagtattgtgtcagatcgacacccaagatttacttctatattttgggagagtttgcaagttgctttgggcactaagttgag 24529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 538 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 136278 - 136119
Alignment:
Q  538 ggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtt 637  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  136278 ggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtt 136179  T
Q  638 taccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    | || || ||||||||||| |||||  |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  136178 ttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcgcaacttcggaagtatg 136119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 136390 - 136278
Alignment:
Q  217 cttgagcaaggaggaacttgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctt 316  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  136390 cttgagcaaggtggagcttgggatagtcacctaccgttgatagagttcacatacaacaacagttacaattcgagtattggtatggcaccgttcgaagctt 136291  T
Q  317 tatatggtcggag 329  Q
    | |||||||||||    
T  136290 tgtatggtcggag 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 548 - 697
Target Start/End: Original strand, 2023 - 2172
Alignment:
Q  548 gtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccatatcagattttggaaaaagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgca 647  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||| |  |||||||| ||||| ||  ||||||||||  | || ||    
T  2023 gtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatacagagtgggttttacaccaca 2122  T
Q  648 tctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatg 697  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2123 tctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 2172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 268 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 14952 - 14661
Alignment:
Q  268 tacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaa 367  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||| || |||||||| || |||||||| ||||||| ||| || || |   ||||||| | |||||||||||||||||    
T  14952 tacaacaacagttttcattcttgtatcggtatggcaccgtttgaggctttgtatggtccgaggtgtaggatgtcgttgtgtttgtttgagtcaggtgaaa 14853  T
Q  368 gagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatca 467  Q
    | ||  | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || ||| || |||||||  ||||||| ||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  14852 gtgttttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaatttaagatgattgaagagaagatgaaagagtctcagagtagacagaagagttatca 14753  T
Q  468 tgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 559  Q
    ||| ||| | || || ||  ||||||||||||  || || || |||||||||||||| | || | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14752 tgataagaggaggaaggacattgagtttcaggttggggatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 14661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 24540 - 24005
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | |||||||| || ||||||   |||||| | ||||||||||  ||||||||    || ||||||||||    
T  24540 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccaaggttcacttctcagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaattaatttgagattga 24441  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || |||    | || ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |  | |||    
T  24440 gttctgcttaccatcctcagactgatgggcagacggagaggactatccagagtttggaagatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgttagttg 24341  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||     | | || ||| | ||||| || ||||| |||| || |||||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||| ||| || ||     
T  24340 ggatgaatgtttacctttggtagagtttacttacaacaataattttcattctagtatcggaatgacaccgtttgaggctttgtatggtcagaggtgtagg 24241  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| | ||| |||||| |||| || |   | |||||||||||  |||| ||  | ||||  || || ||| ||||||| || ||||| || |    
T  24240 acaccgttgtgttagttcgagtcaagtgagagtgctttgttaggaccagaagttgtccaagagactatggaaaaggttaagatgattcaggagaagatta 24141  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    | || || || ||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || |||||||| ||||| | |||  ||||    
T  24140 aagcatctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttttttagagttaatccggtgac 24041  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    |||||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  24040 tggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 24005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 497
Target Start/End: Original strand, 1293 - 1530
Alignment:
Q  260 agttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtc 359  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| | ||| || || || |||||||| | |||||||||    
T  1293 agttcacttacaacaacagttttcattctagtatcggaatgacaccgtttgaggctttgtatggactgaggtgtaggacaccgttgtgttagtttgagtc 1392  T
Q  360 aggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaag 459  Q
    ||||||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || | |||    
T  1393 aggtgaaagtgccttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaag 1492  T
Q  460 agttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttca 497  Q
    ||||||||||| |||   ||||| ||| ||||||||||    
T  1493 agttatcatgataagaagagaaaggatattgagtttca 1530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Original strand, 27912 - 28447
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| |  ||||||||||  || ||| | ||||| ||||  ||||||||  | |||||||| ||||    
T  27912 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccgatgtttacttctaagttctgggagagtttacaagctgctttgggaactaagttgaggttga 28011  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||    | |||||||||||||||  ||||||| | | |||||| |  | |||    
T  28012 gttctgcttaccatccccagaccgatgggcagacggagaggactattcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggtgcaaggtgttagttg 28111  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | | |||||| ||||| || ||||| || | || |||| ||||||| || ||| |||| || |||||||| |||||| | || || ||     
T  28112 ggacgaatgtttactgttgattgagtttacttacaacaacaattttcatgctagtatcggtatgacaccgtttgaggctttgtatggtagaaggtgtagg 28211  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| |   | ||||||||  |  |||| ||  ||||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  28212 acaccattgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgctttgttaggaccgaaagttgtgcaagaaactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatga 28311  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    |||| || || ||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| || | ||| || || ||||||||||| || | || | ||||    
T  28312 aggcatctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagttacaagtaggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgac 28411  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
     ||||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  28412 cggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 28447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 152
Target Start/End: Original strand, 81470 - 81593
Alignment:
Q  29 tgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagtt 128  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  81470 tgaagctacatggtgtaccgtcgagtattgtgtcggatagggatccgaggttcacatctagattttggaagagcttgcaggacgctttgggttcgaagtt 81569  T
Q  129 gagattgagttcggcatatcatcc 152  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  81570 gaggttgagttcggcttatcatcc 81593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 524
Target Start/End: Original strand, 3590 - 4077
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |  ||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||   |||| ||  | |||||||||||||    
T  3590 catggtattccttctagtattgtgttggatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctactttcggaactaagttgagattga 3689  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| ||||||||||| ||| |  | ||||| | ||||    | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||| | || |||    
T  3690 gttctgcttaccatcctcagacagatgggcagacaaaaaggactaatcagagtttggaggatttgttgagagcttgtgttttggagcaaggtgtaagttg 3789  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | || ||||| ||||| || ||||| || |||| | |||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||     
T  3790 ggacgaatgtttaccattgattgagtttacttacaacaacagtttttattctagtatcggcatggctccgtttgaggctttgtatggtcggaggtgtagg 3889  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || || |   | ||| |||| ||  |||| ||  | |||||  | || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  3890 acaccgttgtgttggtttgagtccggagagagtgctttgttaagaccggaagttgtgcaagagactacgaaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 3989  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagt 524  Q
    ||||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||  || || || ||||||||||||||    
T  3990 aggcgtctcaaagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagt 4077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 15316 - 14782
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| || |||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  || |||||  | |||||||| ||||    
T  15316 catggtatttcttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgccttgggaactaagttgaggttga 15217  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || ||||| |||||  |||| ||| |||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||   ||| |  | |||||||| |  | |||    
T  15216 gttctgcttaccatcctcagaccaatgggcagacggagaggactattcagagtttagaagatttgttgagagcgtgtctgttggagcaaggtgtcagttg 15117  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    ||||     | | |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |  || ||||| || |||| ||| |||||| |||| || ||     
T  15116 ggatgaatgtttaccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcgatatagcaccgtttgaggttttgtatggtaggaggtgtagg 15017  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || |||||||| ||||||||||| || || || |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| |||||||  | ||||| ||||    
T  15016 acaccgttgtg-tggtttgagtccggagagagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatttaggagaagatga 14918  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgac 536  Q
    ||| ||| |||||| |||| || ||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |||||||| || || | |||| ||||    
T  14917 aggtgtctcagagtagacagaaaagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgac 14818  T
Q  537 tggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 572  Q
    |||||| || |||||||||||||  | |||||||||    
T  14817 tggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgac 14782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 44198 - 43738
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || |||   ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  44198 catggtattccttctagtattgtgtcggatctggatccgaggtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 44099  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaacttg 236  Q
    |||| || || |||||  | || ||||| |||  ||||||||| ||||||    |||| ||||||||||||  ||||||| | |||||  | |  | |||    
T  44098 gttctgcttaccatccttataccgatgggcagatggagaggactattcagagtttagaagatttgttgagagcttgtgttttggagcagtgtgttagttg 43999  T
Q  237 ggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcaga 336  Q
    |||      | | || ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  | |||||||| || |||||||| |||||| |||| || |      
T  43998 ggacgaatgtttaccattgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcagtatggcaccgtttgaggctttgtatggtaggaggtgtatg 43899  T
Q  337 actccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatga 436  Q
    || ||| |||| ||||||||||| || ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  43898 acaccgctgtgttggtttgagtccggagaaagtgctttattaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatga 43799  T
Q  437 aggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttca 497  Q
    | ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  43798 aagcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 43738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11309 - 11167
Alignment:
Q  44 ttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattgagttcggc 143  Q
    ||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| |||  ||||||||  | |||||||| |||||||| ||    
T  11309 ttccttctagtattatgtcagatcgagatccaagatttacttctaagttttgggagagtttgtaagctgctttgggaactaagttgaggttgagttctgc 11210  T
Q  144 atatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcag 186  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||    
T  11209 ttatcatccccagaccgatgggcagatggagaggaccattcag 11167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11071 - 10985
Alignment:
Q  282 tcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaag 368  Q
    |||||||||||| || ||| |||| || ||| |||| |||||| |||| || ||||| | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  11071 tcattctagtatcgggatgacaccgtttgagactttgtatggtaggaggtgtagaacgctgttgtgttggtatgagtcaggtgaaag 10985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 499
Target Start/End: Original strand, 8748 - 8999
Alignment:
Q  248 ttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtg 347  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| || |||| |||| ||| ||| |||||| |||  || |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||    
T  8748 ttccgttgattgagtttacttacaaaaacagttttcatactaatatcggaatgacacagtttgaggctttgtatggtcggaggtgtaggacaccgttgtg 8847  T
Q  348 ctggtttgagtcaggtgaaagagtggtcttaggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcag 447  Q
     |||||||| || |  ||||| |   | |||||||| ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||    
T  8848 ttggtttgaatccgaagaaagtgctttgttaggaccggaagttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcag 8947  T
Q  448 agtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcagg 499  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||| | || || ||  ||||||||||||    
T  8948 agtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacattgagtttcagg 8999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 277 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 9407 - 9125
Alignment:
Q  277 agttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcagaactccgttgtgctggtttgagtcaggtgaaagagtggtct 376  Q
    |||| |||||||||||| |  ||| |||| || |||||||| |||||||| ||||| ||    |||||||| |||||||||||||||||||| |   | |    
T  9407 agttttcattctagtatcgcgatgacaccgtttgaggctttgtatggtcgaagatgtaggttaccgttgtgttggtttgagtcaggtgaaagtgctttgt 9308  T
Q  377 taggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcg 476  Q
    ||||||  ||  |||| ||  | ||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| || | ||||| |||||||| |||      
T  9307 taggacaggaagttgtgcaagagactacagaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagctatcatgataagat 9208  T
Q  477 tagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcagtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 559  Q
     ||||| ||| ||||||||||||  || || || || || |||||||| | || | | |||||||| || |||||||||||||    
T  9207 gagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaactggtgttggtcgtgctttgaagt 9125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5835 - 5693
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||| | ||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||    
T  5835 catggtattccttctagtattgtgtcagatcgggatccgaggtttacttctatgttttgggagagtttgcaagctgctttgggaactaagttgagattga 5736  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggac 179  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  5735 gttctgcttaccatcctcagactgatgggcagacggataggac 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18711 - 18541
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| ||||||| || ||||| || ||| | |||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||    
T  18711 catggtattccttctagtattgtgtcggatcgggatccaacgtttacttctaagttttgggagagtttgcaagctgctttcggaactaagttgagattga 18612  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgaga 207  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||    
T  18611 gttctgcttaccatcctcagaccgatgggcagacagagaggactattcagaggttagaagatttgttgaga 18541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 427 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 6011 - 5879
Alignment:
Q  427 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 526  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||| ||| |  || || || ||||||||||| || |    
T  6011 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 5912  T
Q  527 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 559  Q
     ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  5911 atcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 5879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 427 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 10625 - 10493
Alignment:
Q  427 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 526  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || ||||||||||| || |    
T  10625 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 10526  T
Q  527 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 559  Q
     |||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  10525 atcctttgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 10493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14798 - 14478
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggcttt-gggctcgaagttgagattg 135  Q
    |||||| ||||||| || ||||| | |||| | ||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||| |||  | |||||||| |||    
T  14798 catggtattccttctagtattgtgttagatcgggattcaaggtttacttctaagttttgggaaagtttgcaagctgcttttgggaactaagttgaggttg 14699  T
Q  136 agttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgttcttgagcaaggaggaactt 235  Q
    ||||| || ||||||||  |||||||||| |||   |||||| | ||||||    | ||||||||||| |||  ||||||| | |||||||  |  | ||    
T  14698 agttctgcttatcatcccaagacagatgggcagatcgagagggctattcagagtttggaggatttgttaagagcttgtgttttggagcaagctgtcagtt 14599  T
Q  236 gggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggagatgcag 335  Q
    ||||   |  | | | |||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||||||||| || ||    
T  14598 gggacgattgtttactgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcgccatttgaggctttgtatggtcggaggtgtag 14499  T
Q  336 aactccgttgtgctggtttga 356  Q
     || |||||||| ||||||||    
T  14498 gacaccgttgtgttggtttga 14478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 427 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 8620 - 8488
Alignment:
Q  427 gagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtca 526  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||| ||| |  || || || ||||||||||| || |    
T  8620 gagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtga 8521  T
Q  527 gtcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagt 559  Q
     ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  8520 atcctatgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 8488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Original strand, 3565 - 3744
Alignment:
Q  37 catggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaaaagtttgcaagaggctttgggctcgaagttgagattga 136  Q
    |||||| |||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||  |  |||||| | ||||||||||  ||||||||  | ||||||||  |||    
T  3565 catggtattccatctagcattgtgtcagatagagatccgaggtttactttaaagttttgggagagtttgcaagcagctttgggaactaagttgaggctga 3664  T
Q  137 gttcggcatatcatccgcagacagatggtcagtcggagaggacaattcagtcgctagaggatttgttgagaatttgtgtt 216  Q
    |||  || |||||||| ||||| ||||||||  |  ||||||||||| | ||  | || ||||||||||||  |||||||    
T  3665 gttttgcttatcatcctcagactgatggtcaaaccaagaggacaattaaatctttggaagatttgttgagagcttgtgtt 3744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 34022 - 33952
Alignment:
Q  235 tgggatagtcatcttccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacc 305  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  34022 tgggatagtcacctaccgttgatagagtttacgtacaacaatagttaccattcgagtattggtatggcacc 33952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 96 - 17
Alignment:
Q  250 ccgttgatcgagttcacatacaataatagttatcattctagtattggaatggcacctttcgaggctttatatggtcggag 329  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  96 ccgttgattgagtttacttacaacaacagttttcattctagtatcggtatggcaccgtttgaggccttgtatggtcggag 17  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 2260 - 2187
Alignment:
Q  25 attgtgaagctacatggtgttccttcgagcattgtatcagatagagatccaagatttacttctagattttggaa 98  Q
    ||||||||| | ||||| || || ||||| ||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  2260 attgtgaagttgcatggagtcccgtcgagtattgtttcaaatagagatccgaggttcacttctagattttggaa 2187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University