View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7163_low_7 (Length: 355)

Name: NF7163_low_7
Description: NF7163
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7163_low_7
NF7163_low_7
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (3-355)||(45429189-45429539)
chr2 (3-355)||(39948199-39948549)
chr2 (3-355)||(28469239-28469589)
chr2 (14-355)||(45136430-45136767)
chr2 (7-227)||(22686981-22687201)
chr2 (3-188)||(32955648-32955833)
chr2 (165-355)||(17421286-17421477)
chr2 (213-355)||(10828127-10828268)
chr2 (211-355)||(29400722-29400864)
chr2 (241-355)||(15831969-15832083)
chr2 (241-355)||(3939847-3939961)
chr2 (241-355)||(30496054-30496168)
chr2 (241-355)||(43538845-43538959)
chr2 (241-355)||(43979371-43979485)
chr2 (241-355)||(5352806-5352920)
chr2 (213-355)||(36655515-36655648)
chr2 (134-198)||(17421155-17421219)
chr2 (266-354)||(25515009-25515097)
chr2 (180-221)||(25515143-25515184)
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (3-355)||(42165761-42166112)
chr3 (3-355)||(3976305-3976655)
chr3 (3-355)||(50963552-50963906)
chr3 (3-333)||(4007469-4007797)
chr3 (3-355)||(47073331-47073681)
chr3 (14-355)||(49268393-49268732)
chr3 (45-355)||(597541-597849)
chr3 (14-355)||(50216061-50216403)
chr3 (14-354)||(20917142-20917479)
chr3 (14-354)||(20926104-20926441)
chr3 (14-350)||(30255132-30255466)
chr3 (16-350)||(42756762-42757095)
chr3 (21-354)||(49195591-49195922)
chr3 (14-306)||(48889343-48889633)
chr3 (17-354)||(48563539-48563878)
chr3 (14-354)||(44230322-44230649)
chr3 (14-153)||(42805586-42805725)
chr3 (213-355)||(36128406-36128546)
chr3 (213-355)||(2274048-2274188)
chr3 (213-355)||(16611891-16612031)
chr3 (213-355)||(22047222-22047362)
chr3 (239-355)||(52390513-52390629)
chr3 (213-354)||(20351413-20351552)
chr3 (213-355)||(41613142-41613282)
chr3 (213-355)||(17567220-17567361)
chr3 (96-212)||(54682060-54682171)
chr3 (242-355)||(29009712-29009825)
chr3 (241-355)||(42903297-42903411)
chr3 (241-355)||(49143570-49143684)
chr3 (241-355)||(34046227-34046341)
chr3 (241-355)||(46701133-46701247)
chr3 (241-355)||(50479914-50480028)
chr3 (241-355)||(54386975-54387089)
chr3 (241-355)||(46389802-46389916)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (3-355)||(31782851-31783202)
chr1 (3-353)||(52802730-52803080)
chr1 (21-355)||(47502901-47503233)
chr1 (14-354)||(51321322-51321652)
chr1 (14-354)||(45825486-45825824)
chr1 (45-355)||(2424333-2424641)
chr1 (14-350)||(19524322-19524650)
chr1 (21-354)||(23275248-23275579)
chr1 (14-355)||(19525165-19525498)
chr1 (14-355)||(19525826-19526159)
chr1 (14-355)||(19526300-19526633)
chr1 (14-350)||(35258019-35258337)
chr1 (45-355)||(22524871-22525167)
chr1 (21-194)||(49857281-49857454)
chr1 (165-355)||(30890775-30890963)
chr1 (14-148)||(11196290-11196424)
chr1 (213-355)||(97046-97186)
chr1 (14-132)||(19526702-19526820)
chr1 (14-132)||(19524906-19525024)
chr1 (14-132)||(19525567-19525685)
chr1 (241-355)||(19156851-19156965)
chr1 (14-132)||(19524719-19524837)
chr1 (14-132)||(19526889-19527007)
chr1 (213-355)||(50343116-50343256)
chr1 (167-354)||(49857094-49857278)
chr1 (241-355)||(13639128-13639243)
chr1 (241-355)||(3731488-3731602)
chr1 (241-355)||(26876494-26876608)
chr1 (241-336)||(2366064-2366159)
chr1 (267-354)||(38126630-38126717)
chr1 (239-354)||(47656678-47656793)
chr1 (300-355)||(21141748-21141803)
chr1 (168-198)||(30890676-30890706)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (3-355)||(37021202-37021552)
chr4 (3-355)||(21022013-21022363)
chr4 (3-355)||(40357405-40357755)
chr4 (21-355)||(50275332-50275664)
chr4 (14-354)||(50902088-50902415)
chr4 (14-350)||(55406917-55407251)
chr4 (14-294)||(48255758-48256035)
chr4 (14-354)||(51683811-51684149)
chr4 (134-355)||(1088848-1089069)
chr4 (14-194)||(68129-68306)
chr4 (165-355)||(30725916-30726105)
chr4 (175-355)||(1308278-1308456)
chr4 (213-355)||(3184802-3184942)
chr4 (213-354)||(50194264-50194403)
chr4 (213-355)||(44679182-44679322)
chr4 (241-355)||(41798102-41798216)
chr4 (241-353)||(9892387-9892499)
chr4 (241-355)||(6180897-6181011)
chr4 (241-355)||(31422540-31422654)
chr4 (213-319)||(3185018-3185122)
chr4 (241-355)||(49165885-49165999)
chr4 (167-327)||(11049726-11049892)
chr4 (241-355)||(49091272-49091386)
chr4 (193-355)||(46436990-46437147)
chr4 (167-298)||(14316131-14316252)
chr4 (239-354)||(30704833-30704948)
chr4 (54-144)||(21537868-21537958)
chr4 (167-354)||(10752565-10752759)
chr4 (167-354)||(10966334-10966528)
chr4 (266-354)||(11083137-11083225)
chr4 (266-354)||(41932781-41932869)
chr4 (213-315)||(50022741-50022841)
chr4 (134-198)||(30726162-30726226)
chr4 (80-179)||(11049916-11050012)
chr4 (43-124)||(46436761-46436842)
chr4 (146-195)||(10752761-10752810)
chr4 (146-195)||(10966530-10966579)
chr4 (168-198)||(1308542-1308572)
chr4 (266-328)||(21537621-21537683)
chr4 (165-203)||(21537762-21537799)
chr4 (169-221)||(41932915-41932967)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (3-355)||(43212104-43212454)
chr8 (3-355)||(39252601-39252948)
chr8 (3-355)||(15035852-15036202)
chr8 (14-355)||(39846122-39846463)
chr8 (21-351)||(41249236-41249564)
chr8 (3-348)||(45064829-45065174)
chr8 (15-355)||(39938343-39938680)
chr8 (14-354)||(34822141-34822480)
chr8 (14-355)||(43188658-43188996)
chr8 (14-354)||(40076382-40076723)
chr8 (88-355)||(39602271-39602536)
chr8 (21-350)||(5303369-5303696)
chr8 (165-355)||(42484707-42484894)
chr8 (158-355)||(488826-489024)
chr8 (213-355)||(34369662-34369802)
chr8 (213-355)||(34370990-34371130)
chr8 (213-354)||(20858071-20858210)
chr8 (241-355)||(1053376-1053490)
chr8 (241-355)||(23021428-23021542)
chr8 (241-355)||(26660298-26660412)
chr8 (241-355)||(24645-24759)
chr8 (47-179)||(2984721-2984850)
chr8 (167-298)||(2984874-2985011)
chr8 (239-354)||(35552475-35552590)
chr8 (193-355)||(37327612-37327771)
chr8 (266-354)||(5677896-5677984)
chr8 (266-354)||(45128576-45128664)
chr8 (43-124)||(37327300-37327381)
chr8 (180-221)||(45128489-45128530)
chr8 (168-198)||(489057-489087)
chr8 (170-198)||(42484957-42484985)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (3-355)||(17835675-17836025)
chr7 (18-354)||(37340917-37341252)
chr7 (14-355)||(27452743-27453083)
chr7 (14-354)||(9493930-9494260)
chr7 (14-355)||(34738975-34739312)
chr7 (56-355)||(10517546-10517843)
chr7 (14-336)||(36978207-36978526)
chr7 (16-304)||(47672271-47672547)
chr7 (165-355)||(15073392-15073582)
chr7 (165-355)||(42507201-42507391)
chr7 (14-153)||(47776943-47777082)
chr7 (123-354)||(39461169-39461405)
chr7 (14-138)||(14689405-14689529)
chr7 (213-354)||(16677837-16677976)
chr7 (213-354)||(17652073-17652212)
chr7 (213-354)||(19798081-19798220)
chr7 (213-355)||(46739637-46739777)
chr7 (213-355)||(5540699-5540838)
chr7 (241-355)||(17462412-17462526)
chr7 (241-355)||(17590688-17590802)
chr7 (201-351)||(47777047-47777195)
chr7 (241-355)||(9370497-9370611)
chr7 (241-355)||(41881342-41881456)
chr7 (241-355)||(48404209-48404323)
chr7 (241-355)||(35609533-35609647)
chr7 (239-353)||(14689283-14689397)
chr7 (43-124)||(556121-556202)
chr7 (134-198)||(42507448-42507512)
chr7 (134-198)||(15073649-15073713)
chr7 (21-77)||(39461126-39461182)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (3-350)||(14751-15096)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (3-355)||(8579630-8579980)
chr5 (14-350)||(13926-14259)
chr5 (14-354)||(8701349-8701688)
chr5 (14-354)||(42941612-42941951)
chr5 (3-355)||(28877241-28877591)
chr5 (3-355)||(7757923-7758254)
chr5 (14-354)||(42537758-42538096)
chr5 (14-354)||(38968707-38969046)
chr5 (14-354)||(17658931-17659269)
chr5 (165-355)||(28240947-28241138)
chr5 (169-355)||(27672776-27672958)
chr5 (213-355)||(5197748-5197888)
chr5 (213-355)||(30705911-30706051)
chr5 (241-355)||(19040224-19040338)
chr5 (193-355)||(40624051-40624211)
chr5 (43-124)||(40624389-40624470)
chr5 (281-354)||(19228072-19228145)
chr5 (168-198)||(28241227-28241257)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (16-354)||(6319689-6320025)
chr6 (3-225)||(31769304-31769526)
chr6 (14-194)||(24088066-24088246)
chr6 (167-354)||(24087878-24088063)
chr6 (241-355)||(27617567-27617681)
chr6 (241-355)||(6202000-6202114)
chr6 (241-355)||(11688967-11689081)
chr6 (241-355)||(22302032-22302146)
chr6 (241-355)||(30828759-30828873)
chr6 (242-354)||(24722705-24722817)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (21-354)||(10881-11209)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (3-116)||(7946-8059)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (165-276)||(1-107)
scaffold0293 (134-198)||(164-228)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (267-354)||(18081-18168)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Original strand, 45429189 - 45429539
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45429189 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 45429288  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45429289 ttatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 45429388  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45429389 aggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcga 45429486  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45429487 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 45429539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Original strand, 39948199 - 39948549
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39948199 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggatataaattttattgtaatgatga 39948298  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39948299 ttatattgaatgattttaggttatggaaatgatggtcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 39948398  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39948399 aggttatggaaatgatgttaatttttttattt--tttgtgtagatatggccgatcaggatcccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcga 39948496  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39948497 tgactcaaagccaccggagggaaaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 39948549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Original strand, 28469239 - 28469589
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28469239 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 28469338  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28469339 ttatattaaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtagttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 28469438  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  28469439 aggttatggaaatgatgtttattttat--tttattttttgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagataattggtggtaggcgtgcga 28469536  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28469537 tgacccagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 28469589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 45136767 - 45136430
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45136767 tgtatataaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 45136668  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45136667 gattttagg-tatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgag-ttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaa 45136570  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45136569 atgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgttcaatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagc 45136472  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  45136471 caccggagggagagacaaagcgaccacatcccaaagaggggt 45136430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 7 - 227
Target Start/End: Original strand, 22686981 - 22687201
Alignment:
Q  7 atttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattat 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686981 atttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttgattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatagacataaattttattgtaatgatgattat 22687080  T
Q  107 attgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22687081 attgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggt 22687180  T
Q  207 tatggaaatgatgttaatttt 227  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22687181 tatggaaatgatgttaatttt 22687201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32955833 - 32955648
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32955833 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 32955734  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtt 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32955733 ttatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtt 32955648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 17421286 - 17421477
Alignment:
Q  165 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttg--tgtgtgtagatatggccgatcaggac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||   | | | ||||||||||||||||||||    
T  17421286 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatataaatttt-ttatttttattttttatagatatggccgatcaggac 17421384  T
Q  263 ctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17421385 cccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagggcggccacatcccaaagaggggt 17421477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 10828268 - 10828127
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  10828268 aatgatgttaattttattatttttt-tgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgattcaaag 10828170  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10828169 ccaccggagggagaggcagagcggtcacatcccaaagaggggt 10828127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 211 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 29400864 - 29400722
Alignment:
Q  211 gaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcag 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29400864 gaaatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatagccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcag 29400767  T
Q  311 agccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  29400766 agccaccggagggagaggcaaagcagccacatcccaaagaggggt 29400722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 15831969 - 15832083
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  15831969 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtggccac 15832068  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  15832069 atcccaaagaggggt 15832083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3939961 - 3939847
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  3939961 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcaaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 3939862  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  3939861 atcccaaagaggggt 3939847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30496168 - 30496054
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  30496168 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 30496069  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  30496068 atcccaaagaggggt 30496054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43538959 - 43538845
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||    
T  43538959 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcatggagagacagagtgcccac 43538860  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  43538859 atcccaaagaggggt 43538845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 43979371 - 43979485
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  43979371 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgctatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 43979470  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  43979471 atcccaaagaggggt 43979485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 5352806 - 5352920
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||    
T  5352806 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcccac 5352905  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  5352906 atcccaaagaggggt 5352920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 36655648 - 36655515
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||     
T  36655648 aatgatgttaattttataattttttttgt--agatatggccgatcaggatctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgaattaga- 36655552  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
          |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36655551 ------gagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggt 36655515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 198
Target Start/End: Original strand, 17421155 - 17421219
Alignment:
Q  134 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17421155 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 17421219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 25515097 - 25515009
Alignment:
Q  266 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  25515097 attgatccatctaagataattggtggtaggcgtgcgatgacacaaagccaccggaatgagaggcaagacgggcacatcccaaagagggg 25515009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25515184 - 25515143
Alignment:
Q  180 gtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtt 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25515184 gtttaggtttaatgtttttgattaggttatggaaatgatgtt 25515143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Original strand, 42165761 - 42166112
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42165761 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 42165860  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42165861 ttatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 42165960  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42165961 aggttatggaaatgatgttaattttattatttt-tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtacga 42166059  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42166060 tgactcagagccaccagagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 42166112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Original strand, 3976305 - 3976655
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3976305 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatggtggacataaattttattgtaatgatga 3976404  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3976405 ttatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 3976504  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3976505 aggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcga 3976602  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3976603 tgactcagagccaccggagggagaggcagagtggccacatcccaaagaggggt 3976655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Original strand, 50963552 - 50963906
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattat----tgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50963552 aatgatttagttgtatagaaatgattgagtgtacgttaattatatattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatagacataaattttattgtaatg 50963651  T
Q  99 atgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50963652 atgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 50963751  T
Q  199 gattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50963752 gattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggtcgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgt 50963849  T
Q  299 tcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50963850 gcgatgactcagagctaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 50963906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4007797 - 4007469
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4007797 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 4007698  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4007697 ttatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 4007598  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4007597 aggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgtatagatatggccgatcaggactccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtacga 4007500  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagag 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4007499 tgactcagagccaccggatggagaggcagag 4007469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 47073681 - 47073331
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  47073681 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatagacataaattctattgtaatgatga 47073582  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47073581 ttatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttggtttaggtttaatgtgtttgatt 47073482  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  47073481 aggttatggaaatgatgttagttttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaagaccccattgatccatctaagatgattggtagtaggtgtgcga 47073384  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47073383 tgactcagagtcaccggagggagaggcagagcagccacatcccaaagaggggt 47073331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 49268732 - 49268393
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  49268732 tgtatagaaatgattatgtgtatgttaattattggatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattaaattgtaatgatgattatattgaat 49268633  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49268632 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaa 49268533  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49268532 atgatgttaattttattattttgt--gtgtagatatggccgatcaggactccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagc 49268435  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  49268434 caccggagggagaggcaaagcggtcacatcccaaacaggggt 49268393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 45 - 355
Target Start/End: Original strand, 597541 - 597849
Alignment:
Q  45 ttgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  597541 ttgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggatataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgt 597640  T
Q  145 tgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgta 244  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  597641 tatacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgctaattttattattt--tttgtgta 597738  T
Q  245 gatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcc 344  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  597739 gatatggccgaccaggaccccattgatccatctaaaatgatttgtggtaggcgagcgatgacctagagccaccggagggagaggcagagcgcccacatcc 597838  T
Q  345 caaagaggggt 355  Q
    |||||||||||    
T  597839 caaagaggggt 597849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 50216403 - 50216061
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  50216403 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaaatgatgaataatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgta-tgttgattatattgaat 50216305  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  50216304 gatttaaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttagtgagtttgattatgtttatgtttagtttagatttaatgtgtttgattatgttatggaa 50216205  T
Q  214 atgatgttaa--ttttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcaga 311  Q
    ||||||||||  |||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  50216204 atgatgttaattttttttttttttttttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaa 50216105  T
Q  312 gccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50216104 gtcatcggagggacaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 50216061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20917479 - 20917142
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20917479 tgtacagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgcaatgatgattatattgaat 20917380  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20917379 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgatcatgcttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatta-gttatggaa 20917281  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||  || |||| | |||||||||||| | ||| || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20917280 atgatgttaattt--tttttttttttgtgtagatatgtctgataagaacccggttgatccatctaagatgattgctggtaggcgtgcgatgactcagagc 20917183  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20917182 caccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagagggg 20917142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20926441 - 20926104
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20926441 tgtacagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgcaatgatgattatattgaat 20926342  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20926341 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgatcatgcttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatta-gttatggaa 20926243  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||  || |||| | |||||||||||| | ||| || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20926242 atgatgttaattt--tttttttttttgtgtagatatgtctgataagaacccggttgatccatctaagatgattgctggtaggcgtgcgatgactcagagc 20926145  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20926144 caccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagagggg 20926104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30255466 - 30255132
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30255466 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatatcgaat 30255367  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30255366 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgttaaatgatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 30255267  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||| | ||||  | |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  30255266 atgatgttaattttttaattt--tttgtgcagatatgaccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggtgtgcgatgacccaaagc 30255169  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaaga 350  Q
    ||  ||| ||||||||| || || |||||||||||||    
T  30255168 cattggaaggagaggcaaagtgggcacatcccaaaga 30255132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 350
Target Start/End: Original strand, 42756762 - 42757095
Alignment:
Q  16 tatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatga 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42756762 tatagaaatgattaagcgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatga 42756861  T
Q  116 ttttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaat 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42756862 ttttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagttaaaaaatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaat 42756961  T
Q  216 gatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagcca 315  Q
    |||||||||||| || | || | |||||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42756962 gatgttaatttt-ttttattttttgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagcca 42757060  T
Q  316 ccggagggagaggcagagcggccacatcccaaaga 350  Q
    ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  42757061 ccggaaggagagacaaagcgggcacatcccaaaga 42757095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 49195922 - 49195591
Alignment:
Q  21 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49195922 aaatgattaagtgtatgtaaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 49195823  T
Q  121 ggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49195822 ggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaacgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 49195723  T
Q  221 taa-ttttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccgg 319  Q
    ||| |||||  | |||   |||||||||||| | |||||| | |   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49195722 taatttttaaaaattt---tgtgtagatatgtctgatcagaatccggttgatccatctaagatgattgctggtaggcgtgcgatgactcagagccaccgg 49195626  T
Q  320 agggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    | ||||||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  49195625 aaggagagcgaaagcgggcacatcccaaagagggg 49195591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Original strand, 48889343 - 48889633
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48889343 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgcagtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 48889442  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48889443 tattttaggttatggaaatgatgttcattgctttacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttaatttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 48889542  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgac 306  Q
    |||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48889543 atgatgttaattttttaattt--tttgtgtagatatggccgatcaggatcccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgac 48889633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 354
Target Start/End: Original strand, 48563539 - 48563878
Alignment:
Q  17 atagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48563539 atagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttatgttattatgaaaatgatgggcataaattttattgtaatgatgattatattgaatgat 48563638  T
Q  117 tttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatg 216  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48563639 tttaagttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatg 48563738  T
Q  217 atgttaa--ttttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagcc 314  Q
    |||||||  ||||| | |||| | |||||||||||    |||||| ||     | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||    
T  48563739 atgttaattttttaattttttttttgtgtagatatttatgatcagaactcgggtaatccatctaagatgattggtggtaggcatgcgataactcaaagcc 48563838  T
Q  315 accggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  48563839 accggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaatagggg 48563878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Original strand, 44230322 - 44230649
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44230322 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattacggaaattatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 44230421  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44230422 gattttaggttatggaaatgatgttcaatgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttat-----------gtttaatgtgtttgattaggttatggaa 44230510  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    ||||||||| |||||  |       |||||||||||| | |||||| |||   ||||||||||||| ||||||| |||| ||||  | ||||||||||||    
T  44230511 atgatgttagtttta--aaaaaaattgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaaaatgattgctggtcggcgagcaatgactcagagc 44230608  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44230609 aaccggagggagaggcaaagcgggcacatcccaaagagggg 44230649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 42805725 - 42805586
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42805725 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttatgatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 42805626  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtactttt 153  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  42805625 gattttaggttatgaaaatgatgttcattgttgtactttt 42805586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Original strand, 36128406 - 36128546
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  36128406 aatgatgttaattttattattttttgtg--tagatatggctgattaggacctcattgattcatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcggag 36128503  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36128504 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 36128546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2274188 - 2274048
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  2274188 aatgatattaattttattattttttgtgt--agatatggccgatcaggaccccattgattcatctaagatgattgggggtaggcgtgcgataactcagag 2274091  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2274090 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 2274048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Original strand, 16611891 - 16612031
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16611891 aatgatgttaattttattattttttgtg--tagatatggccgatcaagaccccattgatccatctaagatgattagtggtaggcgtgcgatgactcagag 16611988  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16611989 ccaccagaggcagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 16612031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22047362 - 22047222
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22047362 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgatcaagaccccattgatccatctaagatgattagtggtaggcgtgcgatgactcagag 22047265  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047264 ccaccagaggcagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 22047222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 239 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 52390629 - 52390513
Alignment:
Q  239 tgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcc 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52390629 tgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggtgtgcgatgactcagagccaccggagggagaagcagagcggcc 52390530  T
Q  339 acatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||||    
T  52390529 acatcccaaagaggggt 52390513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 20351413 - 20351552
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20351413 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatggccgataaggaccccgttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 20351510  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20351511 ccacctgagggagaggcaaagcggccacatcccaaagagggg 20351552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Original strand, 41613142 - 41613282
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41613142 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatggccaatcaggaccccattgatccacccaagatgattggtggtaggcctgcgatgactcagag 41613239  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41613240 ccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggt 41613282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17567361 - 17567220
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtgg-taggcgttcgatgactcaga 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  17567361 aatgatgttaattttataattttttgtgt--agatatggccgatcagaaccccattgatccatctaagatgattggggggtaggcgtgcgatgactcaga 17567264  T
Q  312 gccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17567263 gccaccggagggagagtcaaagcggccacatcccaaagaggggt 17567220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Original strand, 54682060 - 54682171
Alignment:
Q  96 atgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54682060 atgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtac-----atgagtttgattatgtttatgtttagtttaagtttaatgtg 54682154  T
Q  196 tttgattaggttatgga 212  Q
    |||||||||||||||||    
T  54682155 tttgattaggttatgga 54682171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 355
Target Start/End: Original strand, 29009712 - 29009825
Alignment:
Q  242 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29009712 gtagatatggccgatcaggaccccattgatcaatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagcggccaca 29009811  T
Q  342 tcccaaagaggggt 355  Q
    ||||||||||||||    
T  29009812 tcccaaagaggggt 29009825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42903411 - 42903297
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  42903411 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 42903312  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  42903311 atcccaaagaggggt 42903297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 49143684 - 49143570
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  49143684 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 49143585  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  49143584 atcccaaagaggggt 49143570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 34046227 - 34046341
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  34046227 tgtagatatggccgatcaggaccccattaatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 34046326  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  34046327 atcccaaagaggggt 34046341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 46701247 - 46701133
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||    
T  46701247 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcccac 46701148  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  46701147 atcccaaagaggggt 46701133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 50480028 - 50479914
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  50480028 tgtagatatgaccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 50479929  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  50479928 atcccaaagaggggt 50479914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 54386975 - 54387089
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||    
T  54386975 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcggggagagacagagtgcccac 54387074  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  54387075 atcccaaagaggggt 54387089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 46389802 - 46389916
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||    
T  46389802 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcatgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcccac 46389901  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  46389902 atcccaaagaggggt 46389916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31783202 - 31782851
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31783202 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 31783103  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31783102 ttatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttagttttaatgtgtttgatt 31783003  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31783002 aggttatggaaatgatgttaattttattatttt-tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcga 31782904  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31782903 tgactcagagccaccagagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 31782851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 3 - 353
Target Start/End: Original strand, 52802730 - 52803080
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52802730 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtgtgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgattgacataaattttattgtaatgatga 52802829  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  52802830 ttatattgaatgattttatgttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagcgtaggtttaatgtgtttgatt 52802929  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52802930 aggttatggaaatgatgttaattttattattttttgtgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcga 52803029  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggg 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52803030 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggg 52803080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 21 - 355
Target Start/End: Original strand, 47502901 - 47503233
Alignment:
Q  21 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47502901 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaagttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 47503000  T
Q  121 ggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 220  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47503001 tgttatggaaatgatattcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttaatttaggtttaatatgtttgattaggttatggaaatgatgt 47503100  T
Q  221 taattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccgga 320  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47503101 taattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggattccattgatcgatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccgga 47503198  T
Q  321 gggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  47503199 gggagagacaaagcggccacatctcaaagaggggt 47503233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Original strand, 51321322 - 51321652
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51321322 tgtataaaaatgattaagcgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 51321421  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51321422 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaa 51321521  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||          | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  51321522 atgatgttaattt----------tttgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagc 51321611  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  51321612 caccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagagggg 51321652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Original strand, 45825486 - 45825824
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825486 tgtataaaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 45825585  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825586 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 45825685  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||  |||  || | |||||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45825686 atgatgttaattt--ttaaattttttgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagc 45825783  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||| |||||| || || || |||||||||||||||||    
T  45825784 caccggaaggagagacaaagtgggcacatcccaaagagggg 45825824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 45 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2424641 - 2424333
Alignment:
Q  45 ttgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2424641 ttgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggatataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgt 2424542  T
Q  145 tgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  2424541 tgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgctaattttattattt--tttgtgta 2424444  T
Q  245 gatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcc 344  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2424443 gatatggccgaccatgaccccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgagcgatgacccagagccaccggagggagaggtagagcgcccacatcc 2424344  T
Q  345 caaagaggggt 355  Q
    |||||||||||    
T  2424343 caaagaggggt 2424333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19524650 - 19524322
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19524650 tgtatataaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttatgttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaat 19524551  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19524550 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagttttattatgttta------gtttaggtttaatgtgttttattaggttatggaa 19524457  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  19524456 atgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgatcaggaccccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagc 19524359  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaaga 350  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19524358 caccggagagagaggcagagcggccacatcccaaaga 19524322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 23275579 - 23275248
Alignment:
Q  21 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23275579 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 23275480  T
Q  121 ggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 220  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23275479 agttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 23275380  T
Q  221 taattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccgga 320  Q
    ||| ||| | ||||  | |||||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |    
T  23275379 taaatttttaattt--tttgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagccatcgaa 23275282  T
Q  321 gggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23275281 aggagaggcaaagcgggcacatcccaaagagggg 23275248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19525498 - 19525165
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19525498 tgtatataaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaat 19525399  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19525398 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttta------ttatgtttagtttaggtttaatgtgttttattaggttatggaa 19525305  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  19525304 atgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaatccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagc 19525207  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19525206 caccggagagagaggcagagcggccacatcccaaagaagggt 19525165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19526159 - 19525826
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19526159 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttatgttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaat 19526060  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19526059 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttta------ttatgtttagtttaggtttaatgtgttttattaggttatggaa 19525966  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  19525965 atgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaatccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagc 19525868  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19525867 caccggagagagaggcagagcggccacatcccaaagaagggt 19525826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19526633 - 19526300
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19526633 tgtatataaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaat 19526534  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19526533 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttta------ttatgtttagtttaggtttaatgtgttttattaggttatggaa 19526440  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  19526439 atgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaatccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagc 19526342  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19526341 caccggagagagaggcagagcggccacatcccaaagaagggt 19526300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35258337 - 35258019
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35258337 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggtt-----ggaaatgatggacataaaatttattgtaatgatgattatattgaat 35258243  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35258242 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 35258143  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    || ||||||||||          | ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  35258142 ataatgttaattt----------tttgtgtagatatg---gatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggtgtgcgatgacccaaagc 35258056  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaaga 350  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35258055 caccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaaga 35258019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 355
Target Start/End: Original strand, 22524871 - 22525167
Alignment:
Q  45 ttgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgt 144  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22524871 ttgaataatgtttaggttattatggaaatggtggatataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttat-gaaatgatgttcattgt 22524969  T
Q  145 tgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgta 244  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||    
T  22524970 tgtacttttaaggagtttgattatgtttat-----------gtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgctaattttattattt--tttctgta 22525056  T
Q  245 gatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcc 344  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22525057 gatatggccgaccaggatcccattaatccatctagaatgattggtggtaggcgagcgatgaccaagagccaccgaagggagaggcagagcgtccacatcc 22525156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 49857454 - 49857281
Alignment:
Q  21 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49857454 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttatgatggaaatggtggacataaattttattgcaatgatgattatattgaatgatttta 49857355  T
Q  121 ggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgt 194  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49857354 ggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgt 49857281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Original strand, 30890775 - 30890963
Alignment:
Q  165 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | |||  |||||||||||||||||||      
T  30890775 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttttttttttttttgt--agatatggccgatcaggactc 30890872  T
Q  265 cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30890873 cattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcaaggagagacagagcggccacatcccaaagaggggt 30890963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Original strand, 11196290 - 11196424
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11196290 tgtatagaaatgtttaagtgtatattaattattgaatgatgtttaggttattatggaactaatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 11196389  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgta 148  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11196390 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgta 11196424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 97186 - 97046
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  97186 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggctgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggtgtgcgatgactcagag 97089  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  97088 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 97046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19526820 - 19526702
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19526820 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaat 19526721  T
Q  114 gattttaggttatggaaat 132  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19526720 gattttaggttatggaaat 19526702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19525024 - 19524906
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19525024 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttatgttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaat 19524925  T
Q  114 gattttaggttatggaaat 132  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19524924 gattttaggttatggaaat 19524906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19525685 - 19525567
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19525685 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttatgttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaat 19525586  T
Q  114 gattttaggttatggaaat 132  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19525585 gattttaggttatggaaat 19525567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 19156851 - 19156965
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19156851 tgtagatatggccgatcatgaccccattgatccatcaaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 19156950  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  19156951 atcccaaagaggggt 19156965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19524837 - 19524719
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19524837 tgtatataaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttatgttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaat 19524738  T
Q  114 gattttaggttatggaaat 132  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19524737 gattttaggttatggaaat 19524719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19527007 - 19526889
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19527007 tgtatagaaatgattaagtgtatgtaaaataatgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaat 19526908  T
Q  114 gattttaggttatggaaat 132  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  19526907 gattttaagttatggaaat 19526889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 50343256 - 50343116
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  50343256 aatgatgttaattttataattttttctgt--agatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggtctgcgatgactcagag 50343159  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50343158 ccaccggagggagcggcaaagcggccacatcccaaagaggggt 50343116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 167 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 49857278 - 49857094
Alignment:
Q  167 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctca 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  49857278 atgtttatgtttagtctaggtttaatgtgttttattaggttatggaaatgatgtttattttttttattttt-tgtgtagatatggccgatcaagacccca 49857180  T
Q  267 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| || ||||| |||| |  |||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  49857179 ttgatccatctaagatgattggtgataggcgtgtgatgacccaaagccatcggaag--gaggcaaagcgggcacatcctaaagagggg 49857094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13639243 - 13639128
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccgga-gggagaggcagagcggcca 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  13639243 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcaggggagagacagagcggcca 13639144  T
Q  340 catcccaaagaggggt 355  Q
    ||||||||||||||||    
T  13639143 catcccaaagaggggt 13639128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3731602 - 3731488
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||    
T  3731602 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcccac 3731503  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  3731502 atcccaaagaggggt 3731488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 26876494 - 26876608
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||    
T  26876494 tgtagatatggccgatcaggaccccatttatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaacgcagggagagacagagtgcccac 26876593  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  26876594 atcccaaagaggggt 26876608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 241 - 336
Target Start/End: Original strand, 2366064 - 2366159
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcgg 336  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2366064 tgtagatattgccgatcaggaccccattgatccatctcagatgattggtggtaggcgtgccatgactcatagccaccgtagggagaggcagagcgg 2366159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 267 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38126717 - 38126630
Alignment:
Q  267 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  38126717 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagtgggcacatcccaaagagggg 38126630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 239 - 354
Target Start/End: Original strand, 47656678 - 47656793
Alignment:
Q  239 tgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcc 338  Q
    |||||||||||| | |||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || || |    
T  47656678 tgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccagctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagtgggc 47656777  T
Q  339 acatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||||||||||||    
T  47656778 acatcccaaagagggg 47656793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 300 - 355
Target Start/End: Original strand, 21141748 - 21141803
Alignment:
Q  300 cgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21141748 cgatgacttagagccaccggagggagaggcaaagtggccacatcccaaagaggggt 21141803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 198
Target Start/End: Original strand, 30890676 - 30890706
Alignment:
Q  168 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30890676 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 30890706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37021552 - 37021202
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37021552 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattataatgatga 37021453  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37021452 ttatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 37021353  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37021352 aggttatggaaatgatgtttattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcga 37021255  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37021254 tgactcagagccatcggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 37021202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21022363 - 21022013
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022363 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 21022264  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022263 ttatattaaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 21022164  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21022163 aggttattgaaatgatgttaattttattattt--tttttgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcga 21022066  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022065 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 21022013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40357755 - 40357405
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40357755 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 40357656  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40357655 ttatattaaatgattttaggttatcgaaatgatgttcgttgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 40357556  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40357555 aggttattgaaatgatgttaattttattattt--tttttgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcga 40357458  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40357457 tggctcagggccactgcagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 40357405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 21 - 355
Target Start/End: Original strand, 50275332 - 50275664
Alignment:
Q  21 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 120  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  50275332 aaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattaaatgatttta 50275431  T
Q  121 ggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50275432 ggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgttcatgtttagtttaggtttaacgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 50275531  T
Q  221 taattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccgga 320  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||  |||    
T  50275532 taattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaaaatgattggtggttggcgtgcgatgacccaaagccattgga 50275629  T
Q  321 gggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50275630 gggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 50275664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Original strand, 50902088 - 50902415
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50902088 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 50902187  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50902188 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattat-----------gtttaggtttaatgtgtttgattaggttatagaa 50902276  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    ||||||||||| |||||||||  | | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  50902277 atgatgttaatcttattattt--tttttgtagatatgaccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaagcgtgcgatgactcagagc 50902374  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  50902375 caccagagggagaggcaaagcagccacatcccaaagagggg 50902415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 55407251 - 55406917
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55407251 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattgtggaaattattgacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 55407152  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55407151 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 55407052  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||| | | ||| || ||||||||||| | |||||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  55407051 atgatgttaatttt-taaatttttg-gtgtagatatgtctgatcagaacccatttgatccatctaagatgattgctggtaggtgtgcgatgactcagagc 55406954  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaaga 350  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  55406953 caccggaaggagaggcaaatcgggcacatcccaaaga 55406917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48256035 - 48255758
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256035 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 48255936  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48255935 gattttaggttatggaaatgatgttcgttgttgtacttttaacgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 48255836  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtag 294  Q
    |||||||||||||| | ||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48255835 atgatgttaattttttaattt--tttgtgtatatatggccgatcaggacc-cattgatccatctaagatgattggtggtag 48255758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Original strand, 51683811 - 51684149
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51683811 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 51683910  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51683911 gattttaagttatggaaatgatgttcattgttgtacttttagtgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtatttgattaggttatggaa 51684010  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||| ||| | ||||  | | |||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  51684011 atgatgttaaatttttaattt--tttatgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagc 51684108  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
     |||| | ||||||||| || || | |||||||||||||||    
T  51684109 taccgaaaggagaggcaaagtgggcgcatcccaaagagggg 51684149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 134 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1089069 - 1088848
Alignment:
Q  134 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattatt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  1089069 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaatttttttttt 1088970  T
Q  234 ttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagag 333  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1088969 ttttttttgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagag 1088870  T
Q  334 cggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  1088869 cagccacatcccaaagaggggt 1088848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 68129 - 68306
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  68129 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttatgatggaaatgatggacacaaattttattgtaataatgattatattgaat 68228  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgt 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  68229 gattttaggttatggaaatgatgttca---ttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaagtttaatgt 68306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30726105 - 30725916
Alignment:
Q  165 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||||||     
T  30726105 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaatttttttttttttttt-tgtagatatggccgatcaggaccc 30726007  T
Q  265 cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726006 cattgatccatcgaagataattggtggtaggcgcgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 30725916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 175 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1308456 - 1308278
Alignment:
Q  175 gtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatcca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1308456 gtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttattattttttttgt--agatatggtcgatcaggaccccattgatcca 1308359  T
Q  275 tctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1308358 tcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagcggccacatcccaaagaggggt 1308278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Original strand, 3184802 - 3184942
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3184802 aatgatgttaattttattattttttgtg--tagatatggccaatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtatgcgtgcgatgactcagag 3184899  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3184900 ccaccggagggagagacagagcggccacatcccaaagaggggt 3184942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 50194264 - 50194403
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  50194264 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatgaccgatcaggatcccattgatccatctaagatgattggtggtaggtgtacgatgactcagag 50194361  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50194362 ccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagagggg 50194403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 44679322 - 44679182
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  44679322 aatgatgttaattttattattttttatgt--agatattgccgatcaggatcccattgatccatctaagatgattggtagtaggcatgcgatgactcagag 44679225  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44679224 ccaccggagggagaggcagagtggccacatcccaaagaagggt 44679182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 41798216 - 41798102
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41798216 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagggcggccac 41798117  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  41798116 atcccaaagaggggt 41798102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 241 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 9892499 - 9892387
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9892499 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgtcatgactcagagccaccgcagggagaggcagagcggccac 9892400  T
Q  341 atcccaaagaggg 353  Q
    |||||||||||||    
T  9892399 atcccaaagaggg 9892387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6181011 - 6180897
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  6181011 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 6180912  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  6180911 atcccaaagaggggt 6180897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 31422540 - 31422654
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  31422540 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagtcaccgcagggagagacagagtgcccac 31422639  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  31422640 atcccaaagaggggt 31422654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3185122 - 3185018
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3185122 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccaatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtatgcgtgcgatgactcagag 3185025  T
Q  313 ccaccgg 319  Q
    |||||||    
T  3185024 ccaccgg 3185018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 49165885 - 49165999
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  49165885 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccttcgaagatgattggtggtaggcgtgccataactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 49165984  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  49165985 atcccaaagaggggt 49165999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11049892 - 11049726
Alignment:
Q  167 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggac---- 262  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||   |||||||||||| | |||||||||        
T  11049892 atgtttatgttcagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtgaattttttaatttt---tgtgtagatatgtctgatcaggaccagg 11049796  T
Q  263 -----ctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagag 327  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| | ||||||    
T  11049795 ggcaacccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgctatgacacaaagccaccgaaaggagag 11049726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 49091272 - 49091386
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||  | ||||    
T  49091272 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcaaggagagacagattgcccac 49091371  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  49091372 atcccaaagaggggt 49091386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 355
Target Start/End: Original strand, 46436990 - 46437147
Alignment:
Q  193 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||  || ||||||||||||   || ||||     ||||||| |||||||||||||||||||    
T  46436990 gtgtttgattcggttatggaaatgatgtaaattttttaatt--gtttgtgtagatatgtttgagcaggcg---attgatctatctaagatgattggtggt 46437084  T
Q  293 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  46437085 aggcgtgcgatgactcagagctaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggt 46437147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 298
Target Start/End: Original strand, 14316131 - 14316252
Alignment:
Q  167 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctca 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||| | ||||||||||  |    
T  14316131 atgtttatgtttagtctaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattt----------tttgtgtagatatgtctgatcaggaccgga 14316220  T
Q  267 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgt 298  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14316221 ttgatctatctgagatgattggtggtaggcgt 14316252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 239 - 354
Target Start/End: Original strand, 30704833 - 30704948
Alignment:
Q  239 tgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcc 338  Q
    |||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||| | ||||||||| ||||| |    
T  30704833 tgtgtagatatgtctgatcagaacccaattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgttgactcaaaaccaccgaaaggagaggcaaagcgggc 30704932  T
Q  339 acatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||||||||||||    
T  30704933 acatcccaaagagggg 30704948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21537958 - 21537868
Alignment:
Q  54 gtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgt 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21537958 gtttaggttatgatggaaatgatgcacacaaattatattgaaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgtttattgt 21537868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 10752759 - 10752565
Alignment:
Q  167 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggac---- 262  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||  | |||||||||||| | ||||| |||        
T  10752759 atgtttatgtttaatctaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattttttaaatt--tttgtgtagatatgtctgatcaagaccaag 10752662  T
Q  263 -----ctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
         |  | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| || ||||| | || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10752661 ggccaccgactgatccatctaagatgatcggtggtaggtgtgcgatgacacaaagccatcagaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagagggg 10752565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 10966528 - 10966334
Alignment:
Q  167 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggac---- 262  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||  | |||||||||||| | ||||| |||        
T  10966528 atgtttatgtttaatctaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattttttaaatt--tttgtgtagatatgtctgatcaagaccaag 10966431  T
Q  263 -----ctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
         |  | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| || ||||| | || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10966430 ggccaccgactgatccatctaagatgatcggtggtaggtgtgcgatgacacaaagccatcagaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagagggg 10966334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 11083225 - 11083137
Alignment:
Q  266 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11083225 attgatccatctaagatgattggtggtaggagtgcgatgacacaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagagggg 11083137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 266 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 41932869 - 41932781
Alignment:
Q  266 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  41932869 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgacacaaagccaccggaaggagaggcaaggcgggcacatcccaaagagggg 41932781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 50022841 - 50022741
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  50022841 aatgatgttaattttataattttttgtgt--agatatgaccgatcaggaccccattgatccatttaagatgattggtggtaggcgtgcaatgactcaaag 50022744  T
Q  313 cca 315  Q
    |||    
T  50022743 cca 50022741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30726226 - 30726162
Alignment:
Q  134 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726226 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 30726162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11050012 - 11049916
Alignment:
Q  80 cataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgttta 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11050012 cataaattatattgtaatgatgatgatatggactagttttaggttatggaaatgatgttca---ttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgttta 11049916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 124
Target Start/End: Original strand, 46436761 - 46436842
Alignment:
Q  43 tattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggtt 124  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46436761 tattgaatgatgtttatgttatgatggaaattatacacagaaattatattgaaatgatgattatattgaatggttttaggtt 46436842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10752810 - 10752761
Alignment:
Q  146 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtg 195  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10752810 gtacttataatttgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtg 10752761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10966579 - 10966530
Alignment:
Q  146 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtg 195  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966579 gtacttataatttgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtg 10966530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1308572 - 1308542
Alignment:
Q  168 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1308572 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 1308542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21537683 - 21537621
Alignment:
Q  266 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagagg 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || || |||| || |||||||    
T  21537683 attgatccatctaagataattggtggtaggcgtgctatgacacaaagtcaccagaaggagagg 21537621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21537799 - 21537762
Alignment:
Q  165 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatta 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21537799 ttatgttta-gtttagtttaggtttaatgtgtttgatta 21537762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 169 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41932967 - 41932915
Alignment:
Q  169 gtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtt 221  Q
    |||||||||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41932967 gtttatgttatgtttaggtataacgttttttattaggttatggaaatgatgtt 41932915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Original strand, 43212104 - 43212454
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43212104 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaagttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 43212203  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43212204 ttatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtgcttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 43212303  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  43212304 aggttatgaagatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggtgtgcga 43212401  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43212402 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 43212454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Original strand, 39252601 - 39252948
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39252601 aatgatttagttgtatagaaatgatcaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 39252700  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39252701 ttatatt-aatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 39252799  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  39252800 aggttatggaaatgatgttaattttattattt----tgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtagacgtgcaa 39252895  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39252896 tgactcagagccaccagagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 39252948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15036202 - 15035852
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15036202 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatcgaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 15036103  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15036102 ttatattaaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatcagtttgattttgtttatgtttagtttaggttgaatgtgtttgatt 15036003  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15036002 aggttatgaaaatgatattaattttatt-ttttgt-tttgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcga 15035905  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15035904 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 15035852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 39846463 - 39846122
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846463 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacatacattttattgtaatgatgattatattgaat 39846364  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39846363 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatttgtttgattaggttatggaa 39846264  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39846263 atgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcaatgactcagagc 39846166  T
Q  314 caccggagg--gagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    || ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39846165 catcggaggaagagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggt 39846122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 21 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41249564 - 41249236
Alignment:
Q  21 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41249564 aaatgattaagtgtatgttaattaatgagtgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 41249465  T
Q  121 ggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 220  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41249464 ggttatggaaatgatgttcattgctgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttaattaggttatggaaatgatgt 41249365  T
Q  221 taattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccgga 320  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  41249364 taattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagccaccgga 41249267  T
Q  321 gggagaggcagagcggccacatcccaaagag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41249266 gggagaggcagagcggccacatcccaaagag 41249236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 3 - 348
Target Start/End: Original strand, 45064829 - 45065174
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45064829 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatagacataaattttattgtaatgatga 45064928  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttat-----gtttagtttaggtttaatgtgtt 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     |||||||||||||||||||||||    
T  45064929 ttatattaaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttagtttaggtttaatgtgtt 45065028  T
Q  198 tgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcg 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||     |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45065029 tgattaggttatagaaatgatgttaatttttttttttt-----tgtagatatggctgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcg 45065123  T
Q  298 ttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaa 348  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45065124 tgcgatgactcagagtcaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaa 45065174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 39938680 - 39938343
Alignment:
Q  15 gtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatg 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39938680 gtatagaaatgattaagtgtgtgttaattaatgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggaaataaattttattgtaatgttgattatattgaatg 39938581  T
Q  115 attttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaa 214  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39938580 aatttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgcttatgtttatgtttagtttatgtttaatgtgtttgattaggttatgaaaa 39938481  T
Q  215 tgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagcc 314  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  39938480 tgatgttaattttattattt--tttgtgtagata-ggccgatcaggatcccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgtgatgactcagagtc 39938384  T
Q  315 accggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39938383 accggagggagaggtagagcggccacgtcccaaagaggggt 39938343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 34822480 - 34822141
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34822480 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 34822381  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34822380 gattttaggttatgaaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatttgtttgattaggttatggaa 34822281  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||    
T  34822280 atgatgttaatttt-taattttgtttttgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgatatgtggtaggcgtgcgatgactcaaagc 34822182  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34822181 caccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagagggg 34822141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 43188658 - 43188996
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43188658 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatgaacataaattttattgtaatgatgattattttgaat 43188757  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43188758 gattttaggttatgaaaatgatgttcattgttgtactttcaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaa 43188857  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    || ||||||||||| | ||||  | |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  43188858 ataatgttaattttttaattt--tttgtgaagatatggccgatcaggactccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcaatgactcagagc 43188955  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43188956 ca-gggatggagaggcaaagcggccacatcccaaagaagggt 43188996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40076723 - 40076382
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40076723 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaagttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 40076624  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40076623 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 40076524  T
Q  214 atgatgttaa-ttttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    |||||||||| |||| || |||| | |||||||||||| | |||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  40076523 atgatgttaatttttttttttttttttgtgtagatatgtctgatcagaatctggttgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgtgatgactcaaag 40076424  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    |||||| | ||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  40076423 ccaccgaaaggagaggcaaagcaggcacattccaaatagggg 40076382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 88 - 355
Target Start/End: Original strand, 39602271 - 39602536
Alignment:
Q  88 ttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39602271 ttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggt 39602370  T
Q  188 ttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattg 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39602371 ttaatgtgtttgattaggttatcgaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtaggtatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattg 39602468  T
Q  288 gtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39602469 gtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 39602536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5303696 - 5303369
Alignment:
Q  21 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5303696 aaatgattaagtgtatgttaattattgaaagatgtttaggttattatggaaatgatggacataaatgttattgtaatgatgattaaattgaatgatttta 5303597  T
Q  121 ggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 220  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5303596 agttacggaaatgatgttcattgttgtacttttaatatgtttgattatgtttatgtttagttttggtttaatgtgtttgattagcttatggaaatgatgt 5303497  T
Q  221 taattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccgga 320  Q
    ||| ||| | ||||  | |||||||||||| | |||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5303496 taaatttttaattt--tttgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatctatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagccaccgga 5303399  T
Q  321 gggagaggcagagcggccacatcccaaaga 350  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5303398 aggagaggcaaagcgggcacatcccaaaga 5303369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42484894 - 42484707
Alignment:
Q  165 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| |   |||||||||||||||||||||||     
T  42484894 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattatgttattgaaatgatgttaatttttttttttttt---tgtagatatggccgatcaggaccc 42484798  T
Q  265 cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42484797 cattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagaacggccacatcccaaagaggggt 42484707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 158 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 489024 - 488826
Alignment:
Q  158 agtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttg--tgtgtgtagatatggccga 255  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||   | | |||||||||||||||    
T  489024 agtttaattaggtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatattaatttt-ttatttttattttttgtagatatggccga 488926  T
Q  256 tcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  488925 tcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccacatcccaaagaggggt 488826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 34369802 - 34369662
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34369802 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgattaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 34369705  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34369704 tcaccggagggagaggcagagcgaccacatcccaaagaggggt 34369662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 34371130 - 34370990
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34371130 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgattaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 34371033  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34371032 tcaccggagggagaggcagagcgaccacatcccaaagaggggt 34370990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 20858071 - 20858210
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20858071 aatgatgttaattttataaatttttgtg--tagatatggccgatcagaaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 20858168  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20858169 ccaccggagggagaggcaaagcggtcacatcccaaagagggg 20858210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 1053376 - 1053490
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  1053376 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 1053475  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  1053476 atcccaaagaggggt 1053490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23021542 - 23021428
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  23021542 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 23021443  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  23021442 atcccaaagaggggt 23021428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 26660298 - 26660412
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  26660298 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 26660397  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  26660398 atcccaaagaggggt 26660412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24759 - 24645
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||    
T  24759 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcccac 24660  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  24659 atcccaaagaggggt 24645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 179
Target Start/End: Original strand, 2984721 - 2984850
Alignment:
Q  47 gaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttg 146  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||       
T  2984721 gaatgatgtttaggttatgatggaaatgatgcacacaaattatattgaaatgatgattatatggaatggttttaggttatggaaatgatgttcattgg-- 2984818  T
Q  147 tacttttaatgagtttgattatgtttatgttta 179  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2984819 -aattttaatgtgtttgattatgtttatgttta 2984850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 298
Target Start/End: Original strand, 2984874 - 2985011
Alignment:
Q  167 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggac---- 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||||||||||| | |||||||||        
T  2984874 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttt-taattt--tttgtgtagatatgtctgatcaggaccagg 2984970  T
Q  263 -----ctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgt 298  Q
         || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2984971 ggcagctgattgatccatctaagatgattggtggtaggcgt 2985011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 239 - 354
Target Start/End: Original strand, 35552475 - 35552590
Alignment:
Q  239 tgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcc 338  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |    
T  35552475 tgtgtagatatgtctgatcagaacctggttgatccatctaagatgattggtggtagacgtgcgatgactcaaagccaccggaagaagaggcaaagcgggc 35552574  T
Q  339 acatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||||||||||||    
T  35552575 acatcccaaagagggg 35552590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 193 - 355
Target Start/End: Original strand, 37327612 - 37327771
Alignment:
Q  193 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  || | |||||||||||| | || || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  37327612 gtgtttgattaggttatggaaatgatgtaaattttttaa--ttatttgtgtagatatgtctgagcatgacccgattgatccatctaagatgattggtgat 37327709  T
Q  293 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  37327710 aggcgtgcgatgactcagagtcatcggaaagagaggcaaag-gggcacatcccaaagaggggt 37327771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 266 - 354
Target Start/End: Original strand, 5677896 - 5677984
Alignment:
Q  266 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  5677896 attgatccatctaagatgattggtggtaggtgtgcgatgacacaaagccaccggaaggagaggtaaagcgggaacatcccaaagagggg 5677984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 266 - 354
Target Start/End: Original strand, 45128576 - 45128664
Alignment:
Q  266 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  45128576 attgatccatctaagatgattggtgataggcgtgagatgacacaaagccaccggaaggagaggcaaggcgggcacatcccaaagagggg 45128664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 124
Target Start/End: Original strand, 37327300 - 37327381
Alignment:
Q  43 tattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggtt 124  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37327300 tattcaataatgtttatgttatgatggaaatgatgcacataaattatattgaaatgatgattatattgaatggttttaggtt 37327381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 221
Target Start/End: Original strand, 45128489 - 45128530
Alignment:
Q  180 gtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtt 221  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45128489 gtttatgtttaatgtttttgattaggttatggaaatgatgtt 45128530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 489087 - 489057
Alignment:
Q  168 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  489087 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 489057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42484985 - 42484957
Alignment:
Q  170 tttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42484985 tttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 42484957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Original strand, 17835675 - 17836025
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835675 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttatttattgaataatatttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 17835774  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835775 ttatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 17835874  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17835875 aggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggtcgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcga 17835972  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17835973 tgactcagagccaccggaggaagaggcagagcgaccacatcgcaaagaggggt 17836025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 354
Target Start/End: Original strand, 37340917 - 37341252
Alignment:
Q  18 tagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37340917 tagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatt 37341016  T
Q  118 ttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37341017 ttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatga 37341116  T
Q  218 tgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccacc 317  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  37341117 tgttaatttt-ttaatttttttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaagcgtgcgatgactcaaagccacc 37341215  T
Q  318 ggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37341216 ggaagcagaggcaaagcgggcacatcccaaagagggg 37341252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27453083 - 27452743
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27453083 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatgaacataaattttattttaatgatgattatattgaat 27452984  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27452983 gatttttggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaagtttaatgtgtttgattaggttttggaa 27452884  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  27452883 atgatgttaattttattatttt-tttgtatagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtgttaggcgtgtaatgactcagagc 27452785  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27452784 caccagagggagaggcaaagcggccacatcccaaaaaggggt 27452743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9494260 - 9493930
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494260 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 9494161  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9494160 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttagatttaatgtgtttgattaggttatggaa 9494061  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||          | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  9494060 atgatgttaattt----------tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagc 9493971  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9493970 caccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagagggg 9493930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 34738975 - 34739312
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34738975 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatattgattatattgaat 34739074  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34739075 gatt--aggttatggaaatgatgttcatcgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 34739172  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  34739173 atgatgttaattttattattt--tttgtgtaaatatggccgatcaggaccccgttgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagc 34739270  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34739271 caccagagggagaggcagagcggccacattccaaagaggggt 34739312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 56 - 355
Target Start/End: Original strand, 10517546 - 10517843
Alignment:
Q  56 ttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaa 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10517546 ttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgaaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgaggttcattgttgtacttttaa 10517645  T
Q  156 tgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccga 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  10517646 tgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccga 10517743  T
Q  256 tcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517744 tcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactgagagccaccatagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 10517843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 336
Target Start/End: Original strand, 36978207 - 36978526
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36978207 tgtatagaaatgattaagtgtatattaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataatttttattgtaatgatgattatgttgaat 36978306  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36978307 gattttaggttatgaaaatgatgttcattgttgtac-tttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgcaa 36978405  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||   ||||||||  |||||| || |||    
T  36978406 atgatgttaattttttaattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatctatccaagatgattgacagtaggcgtgtgatgacccaaagc 36978503  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcgg 336  Q
    |||||||  |||||||| |||||    
T  36978504 caccggaatgagaggcaaagcgg 36978526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 47672547 - 47672271
Alignment:
Q  16 tatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47672547 tatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgttt----------ggaaatgatgaacataaattttattgtaatgatgattatatttaatga 47672458  T
Q  116 ttttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaat 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47672457 ttttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaat 47672358  T
Q  216 gatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatg 304  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47672357 gatgttaattttataattt--tttgtgtagatatggccgatcaataccccattgatccatctaagatgattggttgtaggcgtgcgatg 47672271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15073582 - 15073392
Alignment:
Q  165 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||||||     
T  15073582 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttttttttttttttttgtagatatggccgatcaggaccc 15073483  T
Q  265 cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073482 cattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 15073392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 42507391 - 42507201
Alignment:
Q  165 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| |||||||||||     
T  42507391 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttttttttttttttttgtagatatggtcgatcaggaccc 42507292  T
Q  265 cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42507291 cattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgcgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 42507201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Original strand, 47776943 - 47777082
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47776943 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 47777042  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtactttt 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47777043 gattttaggttatggaaatgatgtttattgttgtactttt 47777082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 123 - 354
Target Start/End: Original strand, 39461169 - 39461405
Alignment:
Q  123 ttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtta 222  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39461169 ttatggaaatgatgttcattgtcgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaacgtgtttgattaggttatggaaatgatgtta 39461268  T
Q  223 attt-----tattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccacc 317  Q
    ||||     ||  ||      |||||||||||| | |||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39461269 atttaaaaataaaataaaaattgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattgctggtaggcgagcgatgactcagagccacc 39461368  T
Q  318 ggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  39461369 ggagggagaggcaaagcgggcacatcccaaaaagggg 39461405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14689529 - 14689405
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14689529 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaatgttattgtaatgatgattatattgatt 14689430  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgtt 138  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||    
T  14689429 gatttgaggttatggaaatgatgtt 14689405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 16677837 - 16677976
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16677837 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatggccgatcaggaccccattgatgcatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 16677934  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16677935 ccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagagggg 16677976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 17652073 - 17652212
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17652073 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatggccgatcaggaccccattgatgcatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 17652170  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17652171 ccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagagggg 17652212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 213 - 354
Target Start/End: Original strand, 19798081 - 19798220
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19798081 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatggccgatcaggaccccatcgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 19798178  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19798179 ccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagagggg 19798220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 46739777 - 46739637
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  46739777 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgatcaggactccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgaatcagag 46739680  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  46739679 ccaccggagggagagacagagcggccacatcccaaagcggggt 46739637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5540838 - 5540699
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5540838 aatgatgttaattttataattttttctgt--agatatggccgatcaggccc-cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 5540742  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  5540741 ccaccggagggagaggaaaagtggccacatcccaaagaggggt 5540699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17462526 - 17462412
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17462526 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtggccac 17462427  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    || ||||||||||||    
T  17462426 attccaaagaggggt 17462412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 17590688 - 17590802
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17590688 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtggccac 17590787  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    || ||||||||||||    
T  17590788 attccaaagaggggt 17590802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 201 - 351
Target Start/End: Original strand, 47777047 - 47777195
Alignment:
Q  201 ttaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  || ||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  47777047 ttaggttatggaaatgatgtttattgttgtactt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccctattgatccatctaagatgattggtggtaggcatgc 47777144  T
Q  301 gatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagag 351  Q
     |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47777145 aatgactcaaagctaccggagcgagaggcaaagcggccacatcccaaagag 47777195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9370611 - 9370497
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  9370611 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 9370512  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  9370511 atcccaaagaggggt 9370497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 41881342 - 41881456
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  41881342 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 41881441  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  41881442 atcccaaagaggggt 41881456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 48404209 - 48404323
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  48404209 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 48404308  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  48404309 atcccaaagaggggt 48404323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 35609647 - 35609533
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | | ||    
T  35609647 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcctac 35609548  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  35609547 atcccaaagaggggt 35609533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 239 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14689397 - 14689283
Alignment:
Q  239 tgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcc 338  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||| || ||||||||| ||||| |    
T  14689397 tgtgaagatatggccgatcatgaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgtgatgacccaaaaccaccagaaggagaggcaaagcgggc 14689298  T
Q  339 acatcccaaagaggg 353  Q
    |||||| ||| ||||    
T  14689297 acatccaaaaaaggg 14689283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 556202 - 556121
Alignment:
Q  43 tattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggtt 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  556202 tattgaatgatgtttaggttatgatggaaatgttgcacacaaattatattgaaatgatgattatattgaatgattttaggtt 556121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42507512 - 42507448
Alignment:
Q  134 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42507512 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 42507448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15073713 - 15073649
Alignment:
Q  134 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15073713 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggttgaatgtgttt 15073649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Original strand, 39461126 - 39461182
Alignment:
Q  21 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatg 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39461126 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatatttaggttattatggaaatgatg 39461182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 3 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15096 - 14751
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15096 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 14997  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996 ttatattgaatgattttaggttatggaaatggtgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 14897  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  14896 aggttatgaaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggtcgatcaagaccccattgatccatctaagatgattggtgatagacgtgcga 14799  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaaga 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14798 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcgcccacatcccaaaga 14751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 290; Significance: 1e-163; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 8579980 - 8579630
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8579980 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatagacataaattttattgtaatgatga 8579881  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8579880 ttatattaaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 8579781  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8579780 aggttatggaaatgatgtttatttttttattt--tttttgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcga 8579683  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8579682 tgactcagagccaccgaagggagaggcagagcggccacatcccagagaggggt 8579630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 14 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14259 - 13926
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14259 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatcgaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattaaat 14160  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14159 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagttcgattttgtttatgtttagtttaggtttaatgcgtttgattaggttatggaa 14060  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||| || ||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14059 atgatgttaatttttttttttt---tttgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgacacagagc 13963  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaaga 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13962 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaaga 13926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8701688 - 8701349
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8701688 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaataatgattatattgaat 8701589  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8701588 gattttaggttatggaaatgatattcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaa 8701489  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||    
T  8701488 atgatgttaatttt-ttaatttttttgtgtagatatgaccgatcaggaccccattgatcaatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgacctaaagc 8701390  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  8701389 caccggaaggagaggcaaagcgggcacatccaaaagagggg 8701349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 42941951 - 42941612
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42941951 tgtatagaaatgattaattgtatgttaattattgaaggatgtttagattattgtggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 42941852  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42941851 gattttaggttatggaaatgatgttcatcgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttttattaggttatggaa 42941752  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||| ||| ||| | ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||    
T  42941751 atgatgttaatttttttaattt-tttgtatacatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgtgatgacccaaagc 42941653  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42941652 caccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagagggg 42941612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Original strand, 28877241 - 28877591
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28877241 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 28877340  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28877341 ttatattgaatgatttcaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttaatttaggtttaatgtgtttgatt 28877440  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    || |||||||||||||||||| ||| | ||||  | | |||||||||| | ||||||  ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  28877441 agattatggaaatgatgttaaatttttaattt--tttatgtagatatgtctgatcagatcccggttgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgcca 28877538  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28877539 tgattcagagccaccgcagggagaggcagagtggccacatcccaaaaaggggt 28877591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Original strand, 7757923 - 7758254
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7757923 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttagattattatggaaatgatggatataaattttattgtaatgatga 7758022  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||    
T  7758023 ttatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcgttgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagt-------------------tt 7758103  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7758104 aggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggactccattgatcgatctaagatgattggtggtaggcgtgcga 7758201  T
Q  303 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7758202 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcgacatcccaaagaggggt 7758254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Original strand, 42537758 - 42538096
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  42537758 tgtatataaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaatcttattgtaatgatgaatatattgaat 42537857  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42537858 gattttaagttatgaaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 42537957  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    ||||||||||| || | ||||  | |||||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  42537958 atgatgttaatcttttaattt--tttgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcatgcgatgactcaaagc 42538055  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  42538056 caccggaaggagagacaaagcgggcacatcccaaagagggg 42538096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Original strand, 38968707 - 38969046
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  38968707 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgaggtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgaagattatattcaat 38968806  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38968807 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgattgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaagttatggaa 38968906  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||    
T  38968907 atgatgttaaattttttaattt-tttgtttagatatggccgatcaggaccccattgatccatttaagatgattggtggtaggcgtgcgaagacccaaagc 38969005  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    |||| ||  |||||||  || || |||||||||||||||||    
T  38969006 caccagaaagagaggctaagtgggcacatcccaaagagggg 38969046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 354
Target Start/End: Original strand, 17658931 - 17659269
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17658931 tgtataaaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatatttagattattatggaaatgatggacataaatgttattgtaatgatgattatattgaat 17659030  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 213  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17659031 gattttagattatgaaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttagttttaatgtgtttgactaggttatggaa 17659130  T
Q  214 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 313  Q
    |||||||||||||| | ||||  | ||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||    
T  17659131 atgatgttaattttttaattt--tttgtgttgatatggccgatcaggacactattgattcatctaagatgattggtggtaggcgtgggatgacacaaagc 17659228  T
Q  314 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  17659229 caccggaaggagaggcaaagcgggtacatcccaaagagggg 17659269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 165 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28241138 - 28240947
Alignment:
Q  165 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttg--tgtgtgtagatatggccgatcaggac 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||   | | ||||||||||||||||||||||    
T  28241138 ttatgtttatgtttagtttaggtttaaagtgtttgattaggttattgaaatgatattaatttt-ttatttttattttttgtagatatggccgatcaggac 28241040  T
Q  263 ctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28241039 cccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtggccacatcccaaagaggggt 28240947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 169 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27672958 - 27672776
Alignment:
Q  169 gtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcatt 268  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| | ||  | | |||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27672958 gtttaggttttgtttaggtttagtgtttttgataaagtggttg-aatgatattaattttattatttt---tttgtagatatggccgatcaggaccccatt 27672863  T
Q  269 gatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27672862 gatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 27672776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Original strand, 5197748 - 5197888
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5197748 aatgatgttaattttataattttttttgt--agatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 5197845  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5197846 ccatcggagggagaggcaaagcggccacatcccaaataggggt 5197888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Original strand, 30705911 - 30706051
Alignment:
Q  213 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 312  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30705911 aatgatattaattttattattttttttgt--agatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 30706008  T
Q  313 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30706009 ccaccgcaggaagaggcagagcagccacttcccaaagaggggt 30706051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19040338 - 19040224
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19040338 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagggcggccac 19040239  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  19040238 atcccaaagaggggt 19040224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 193 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40624211 - 40624051
Alignment:
Q  193 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  || |||||||||||| | || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40624211 gtgtttgattaggttatggaaatgatgtaaattttttaatt--gtttgtgtagatatgtctgagcaggacccgattgatccatttaagatgattggtggt 40624114  T
Q  293 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 355  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  40624113 aggcgtgcgatgacttagagccatcgaaaggagaggcaaagggggcacatcccaaagaggggt 40624051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 40624470 - 40624389
Alignment:
Q  43 tattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggtt 124  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40624470 tattgaatgatgtttaggttatgatagaaatgatgcacataaattatattgaaatgatgattatattgaatggttttaggtt 40624389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19228145 - 19228072
Alignment:
Q  281 atgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19228145 atgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagagggg 19228072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28241257 - 28241227
Alignment:
Q  168 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241257 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 28241227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 6320025 - 6319689
Alignment:
Q  16 tatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatga 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6320025 tatagaaataattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatga 6319926  T
Q  116 ttttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaat 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6319925 ttttaggttatggaaatgatattcattgttgtacttttaatgtgtttgattatattaatgtttagtttaggtttaacttgtttgattaggttatggaaat 6319826  T
Q  216 gatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagcca 315  Q
    ||||||||||||   ||||| |||||  |||| || | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6319825 gatgttaatttttaaattttttgtgt--agatgtgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagcca 6319728  T
Q  316 ccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
     |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6319727 tcggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagagggg 6319689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 31769304 - 31769526
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  31769304 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatatttatgttattatggaaatgatggaaataaattttattataatgatga 31769403  T
Q  103 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31769404 ttatattgaatgattttaggttatgaaaatgatgttcattgttgtaattttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 31769503  T
Q  203 aggttatggaaatgatgttaatt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31769504 aggttatggaaatgatgttaatt 31769526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24088246 - 24088066
Alignment:
Q  14 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24088246 tgtatagaaatgattcagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttatgatggaaatgattgacacaaattttatagtaatgatgattatattgaat 24088147  T
Q  114 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgt 194  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24088146 gattttaggttatgaaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgt 24088066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 167 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24088063 - 24087878
Alignment:
Q  167 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctca 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||    
T  24088063 atgtttatgtttagtctaggtttaaagtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttttaattttttgtgt--agatacggccgatcaggacccca 24087966  T
Q  267 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| | | | |||||||||||| ||||    
T  24087965 ttgatctatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagccaccggaaggagaggcaaaacaggcacatcccaaagcgggg 24087878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 27617567 - 27617681
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27617567 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgtagggagaggcagggcggccac 27617666  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  27617667 atcccaaagaggggt 27617681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 6202000 - 6202114
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  6202000 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 6202099  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  6202100 atcccaaagaggggt 6202114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 11688967 - 11689081
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  11688967 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 11689066  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  11689067 atcccaaagaggggt 11689081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 22302032 - 22302146
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  22302032 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 22302131  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  22302132 atcccaaagaggggt 22302146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30828873 - 30828759
Alignment:
Q  241 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  30828873 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 30828774  T
Q  341 atcccaaagaggggt 355  Q
    |||||||||||||||    
T  30828773 atcccaaagaggggt 30828759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Original strand, 24722705 - 24722817
Alignment:
Q  242 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 341  Q
    ||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||| ||||    
T  24722705 gtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaacccaccagaaggagaggcaaagcgggcaca 24722804  T
Q  342 tcccaaagagggg 354  Q
    | |||||||||||    
T  24722805 ttccaaagagggg 24722817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 354
Target Start/End: Original strand, 10881 - 11209
Alignment:
Q  21 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10881 aaataattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttagattat---------gatggacacaaactatattgtaatgatgattatactgaatggtttta 10971  T
Q  121 ggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgttta------tgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaa 214  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  10972 ggttatggaaatgatgttca---ttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttctgtttagtttaggtttaatgtttttgattaggttatgaaaa 11068  T
Q  215 tgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgat-caggacctc--attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcaga 311  Q
    ||| ||||| ||| | | ||  | |||||||||||| | |||  ||| || |   |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| || |    
T  11069 tgaggttaagtttttaaatt--tttgtgtagatatgtctgatgaagggccaccggttgatccatctaagatgattggtggtcggtgtgtgatgacacaaa 11166  T
Q  312 gccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11167 gccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagagggg 11209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 116
Target Start/End: Original strand, 7946 - 8059
Alignment:
Q  3 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7946 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatcgaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 8045  T
Q  103 ttatattgaatgat 116  Q
    ||||||| ||||||    
T  8046 ttatattaaatgat 8059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 165 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 107 - 1
Alignment:
Q  165 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||     
T  107 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttattttttt-----tgtagatatggccgatcaggaccc 13  T
Q  265 cattgatccatc 276  Q
    ||||||||||||    
T  12 cattgatccatc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 228 - 164
Alignment:
Q  134 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  228 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttatgtttaatgtgttt 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 267 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18168 - 18081
Alignment:
Q  267 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggg 354  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  18168 ttgatacatctaagatgattgttggtaggcgtgcaatgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagcgagcacatcctaaagagggg 18081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University