View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7168_high_4 (Length: 219)

Name: NF7168_high_4
Description: NF7168
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7168_high_4
NF7168_high_4
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (2-207)||(9358677-9358882)
chr8 (2-207)||(19692150-19692355)
chr8 (2-207)||(19913121-19913326)
chr8 (2-204)||(28357911-28358113)
chr8 (2-207)||(27604864-27605069)
chr8 (2-207)||(29833377-29833582)
chr8 (2-207)||(33246422-33246627)
chr8 (2-204)||(33262789-33262991)
chr8 (2-207)||(14561676-14561881)
chr8 (2-207)||(15771626-15771831)
chr8 (2-207)||(18713536-18713741)
chr8 (2-207)||(18794756-18794961)
chr8 (2-207)||(21344130-21344335)
chr8 (2-207)||(44565036-44565241)
chr8 (1-207)||(16287005-16287211)
chr8 (1-207)||(19657299-19657505)
chr8 (2-207)||(2133219-2133424)
chr8 (2-207)||(19204321-19204526)
chr8 (2-207)||(19678499-19678704)
chr8 (1-207)||(22136962-22137168)
chr8 (2-204)||(31358583-31358785)
chr8 (2-207)||(31485830-31486035)
chr8 (2-204)||(12088682-12088884)
chr8 (15-210)||(22076897-22077092)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (2-207)||(2158624-2158829)
chr7 (2-207)||(2777304-2777509)
chr7 (2-207)||(5162433-5162638)
chr7 (2-207)||(10912752-10912957)
chr7 (2-207)||(26680989-26681194)
chr7 (2-204)||(26270969-26271171)
chr7 (2-204)||(26315731-26315933)
chr7 (2-204)||(45391273-45391475)
chr7 (2-207)||(3449356-3449561)
chr7 (2-207)||(4203439-4203644)
chr7 (2-207)||(26439307-26439512)
chr7 (2-207)||(26516842-26517047)
chr7 (2-207)||(26665797-26666002)
chr7 (2-207)||(31127957-31128162)
chr7 (2-207)||(45735357-45735562)
chr7 (2-204)||(11420662-11420864)
chr7 (2-207)||(4141129-4141334)
chr7 (2-207)||(5132046-5132251)
chr7 (2-207)||(16747400-16747605)
chr7 (2-207)||(26511579-26511784)
chr7 (2-207)||(31086505-31086710)
chr7 (2-204)||(2106046-2106248)
chr7 (2-204)||(31560273-31560475)
chr7 (2-207)||(16514313-16514518)
chr7 (2-207)||(39209022-39209227)
chr7 (2-207)||(5143223-5143428)
chr7 (2-207)||(11444937-11445142)
chr7 (2-207)||(24588417-24588622)
chr7 (2-207)||(26533756-26533961)
chr7 (1-207)||(16045365-16045571)
chr7 (1-207)||(16445888-16446094)
chr7 (1-207)||(10845670-10845876)
chr7 (1-207)||(10841876-10842082)
chr7 (132-207)||(22146238-22146308)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (2-207)||(13294892-13295097)
chr6 (2-207)||(26922427-26922632)
chr6 (2-204)||(29553610-29553812)
chr6 (2-207)||(15408474-15408679)
chr6 (2-207)||(15420261-15420466)
chr6 (2-207)||(24867766-24867971)
chr6 (2-207)||(27061556-27061761)
chr6 (2-204)||(13520135-13520337)
chr6 (2-204)||(29505469-29505671)
chr6 (2-207)||(4720076-4720281)
chr6 (2-207)||(8901644-8901849)
chr6 (2-207)||(16753871-16754076)
chr6 (2-207)||(22930825-22931030)
chr6 (2-207)||(23853270-23853475)
chr6 (2-207)||(26789866-26790071)
chr6 (2-207)||(27358051-27358256)
chr6 (2-207)||(33372372-33372577)
chr6 (2-204)||(29577067-29577269)
chr6 (2-207)||(14141335-14141540)
chr6 (2-207)||(16678190-16678395)
chr6 (2-207)||(24301698-24301903)
chr6 (2-207)||(27023187-27023392)
chr6 (2-204)||(4761816-4762018)
chr6 (2-204)||(4776933-4777135)
chr6 (2-204)||(27011784-27011986)
chr6 (2-204)||(27489186-27489388)
chr6 (2-204)||(34460447-34460649)
chr6 (2-207)||(26112353-26112558)
chr6 (1-204)||(26774567-26774770)
chr6 (2-204)||(3700136-3700338)
chr6 (2-204)||(4541715-4541917)
chr6 (2-204)||(27198238-27198440)
chr6 (2-204)||(27250795-27250997)
chr6 (2-207)||(4529335-4529540)
chr6 (2-204)||(28164544-28164746)
chr6 (2-204)||(28211507-28211709)
chr6 (2-207)||(16939968-16940173)
chr6 (2-204)||(30553957-30554159)
chr6 (1-207)||(27286304-27286510)
chr6 (1-207)||(27625651-27625857)
chr6 (1-204)||(17088383-17088586)
chr6 (1-207)||(20172597-20172803)
chr6 (1-207)||(22163188-22163394)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (2-207)||(24587434-24587639)
chr5 (2-207)||(33781545-33781750)
chr5 (2-207)||(34620578-34620783)
chr5 (2-207)||(2515122-2515327)
chr5 (2-207)||(3793601-3793806)
chr5 (2-207)||(6878365-6878570)
chr5 (2-207)||(9546604-9546809)
chr5 (2-207)||(11553415-11553620)
chr5 (2-207)||(13438578-13438783)
chr5 (2-207)||(18496620-18496825)
chr5 (2-207)||(23630030-23630235)
chr5 (2-207)||(24973966-24974171)
chr5 (2-207)||(30156091-30156296)
chr5 (2-207)||(30172529-30172734)
chr5 (2-207)||(40469445-40469650)
chr5 (2-204)||(12136238-12136440)
chr5 (2-204)||(13320725-13320927)
chr5 (2-204)||(26484457-26484659)
chr5 (2-204)||(33879191-33879393)
chr5 (2-207)||(15754747-15754952)
chr5 (2-207)||(30938695-30938900)
chr5 (2-204)||(8661370-8661572)
chr5 (2-204)||(31435527-31435729)
chr5 (2-204)||(37667381-37667583)
chr5 (2-207)||(18124311-18124516)
chr5 (2-207)||(18371429-18371634)
chr5 (2-207)||(30033488-30033693)
chr5 (2-207)||(32592169-32592374)
chr5 (2-207)||(33296588-33296793)
chr5 (2-207)||(37759043-37759248)
chr5 (2-207)||(37766886-37767091)
chr5 (2-207)||(43082315-43082520)
chr5 (1-207)||(9321536-9321742)
chr5 (2-204)||(13182688-13182890)
chr5 (2-204)||(31822302-31822504)
chr5 (2-207)||(37354538-37354743)
chr5 (2-204)||(24728032-24728234)
chr5 (2-204)||(28955680-28955882)
chr5 (2-204)||(41678768-41678970)
chr5 (2-207)||(5641848-5642053)
chr5 (2-207)||(15654653-15654858)
chr5 (2-207)||(22995012-22995217)
chr5 (1-207)||(23895935-23896141)
chr5 (2-207)||(28653302-28653508)
chr5 (2-204)||(33520443-33520645)
chr5 (2-207)||(11327697-11327902)
chr5 (1-207)||(22892523-22892729)
chr5 (2-207)||(25204338-25204543)
chr5 (2-207)||(25268493-25268698)
chr5 (1-207)||(29887091-29887297)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (2-207)||(33669798-33670003)
chr4 (2-207)||(18313176-18313381)
chr4 (2-207)||(30757826-30758031)
chr4 (2-207)||(34184958-34185163)
chr4 (2-210)||(24588359-24588567)
chr4 (2-207)||(14102609-14102814)
chr4 (2-207)||(17017112-17017317)
chr4 (2-207)||(24116728-24116933)
chr4 (2-207)||(18796612-18796817)
chr4 (2-204)||(5009944-5010146)
chr4 (2-204)||(6573927-6574129)
chr4 (2-207)||(5698601-5698806)
chr4 (2-207)||(14669082-14669287)
chr4 (2-207)||(14755490-14755695)
chr4 (3-207)||(36340516-36340720)
chr4 (2-204)||(54837460-54837662)
chr4 (2-207)||(20334419-20334624)
chr4 (2-207)||(39854703-39854908)
chr4 (2-210)||(40101635-40101843)
chr4 (2-204)||(21973770-21973972)
chr4 (2-204)||(27159315-27159517)
chr4 (2-204)||(31122510-31122712)
chr4 (2-207)||(1904320-1904525)
chr4 (1-207)||(15231886-15232092)
chr4 (1-207)||(15278624-15278830)
chr4 (88-210)||(15384432-15384554)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (2-207)||(6205918-6206123)
chr3 (2-207)||(51786037-51786242)
chr3 (2-210)||(15737135-15737343)
chr3 (2-207)||(4687669-4687874)
chr3 (2-207)||(8285511-8285716)
chr3 (2-207)||(18055276-18055481)
chr3 (2-207)||(32443165-32443370)
chr3 (2-204)||(7077223-7077425)
chr3 (1-207)||(20070054-20070260)
chr3 (2-204)||(28111995-28112197)
chr3 (2-207)||(4342717-4342922)
chr3 (2-207)||(4627799-4628004)
chr3 (2-207)||(8000574-8000779)
chr3 (2-207)||(10647087-10647292)
chr3 (2-207)||(15888746-15888951)
chr3 (2-207)||(31032277-31032482)
chr3 (2-207)||(32294642-32294847)
chr3 (2-207)||(35884780-35884985)
chr3 (2-207)||(48469941-48470146)
chr3 (2-204)||(5017731-5017933)
chr3 (2-204)||(5605355-5605557)
chr3 (2-204)||(17972902-17973104)
chr3 (2-204)||(28343194-28343396)
chr3 (2-204)||(29661011-29661213)
chr3 (2-207)||(4792676-4792881)
chr3 (2-207)||(11106400-11106605)
chr3 (2-207)||(18334644-18334849)
chr3 (2-207)||(22383619-22383824)
chr3 (2-207)||(28025295-28025500)
chr3 (1-207)||(5471002-5471208)
chr3 (1-207)||(47027467-47027673)
chr3 (2-207)||(8215749-8215954)
chr3 (2-207)||(8299985-8300190)
chr3 (2-207)||(17980990-17981195)
chr3 (2-207)||(18229210-18229415)
chr3 (2-207)||(22866889-22867094)
chr3 (2-207)||(22881948-22882153)
chr3 (2-207)||(24332177-24332382)
chr3 (2-207)||(29144797-29145002)
chr3 (2-204)||(5592398-5592600)
chr3 (2-204)||(6538783-6538985)
chr3 (2-204)||(10400161-10400363)
chr3 (2-204)||(18246758-18246960)
chr3 (2-204)||(31960496-31960698)
chr3 (2-207)||(18273093-18273298)
chr3 (2-207)||(18288394-18288599)
chr3 (2-207)||(18303695-18303900)
chr3 (2-204)||(21678720-21678922)
chr3 (2-207)||(4725645-4725849)
chr3 (8-207)||(4420929-4421128)
chr3 (1-204)||(20572883-20573086)
chr3 (2-204)||(5715090-5715292)
chr3 (2-204)||(5726000-5726202)
chr3 (2-204)||(5766166-5766368)
chr3 (1-207)||(19698504-19698710)
chr3 (1-207)||(5654099-5654305)
chr3 (1-204)||(16620530-16620733)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (2-207)||(27807755-27807960)
chr2 (2-207)||(28886331-28886536)
chr2 (2-207)||(34158896-34159101)
chr2 (2-204)||(31889478-31889680)
chr2 (2-207)||(27430428-27430633)
chr2 (2-207)||(32053855-32054060)
chr2 (2-207)||(37381729-37381934)
chr2 (2-207)||(37681882-37682087)
chr2 (2-207)||(37697147-37697352)
chr2 (2-207)||(37929421-37929626)
chr2 (1-207)||(9345972-9346178)
chr2 (2-204)||(34865739-34865941)
chr2 (2-207)||(12659588-12659793)
chr2 (2-207)||(20841965-20842170)
chr2 (2-207)||(27780286-27780491)
chr2 (2-207)||(27820043-27820248)
chr2 (2-207)||(39047806-39048011)
chr2 (2-204)||(3786548-3786750)
chr2 (2-207)||(11631171-11631376)
chr2 (2-207)||(16165532-16165737)
chr2 (2-207)||(23124556-23124761)
chr2 (2-207)||(34270907-34271112)
chr2 (2-207)||(34295206-34295411)
chr2 (2-207)||(19412488-19412693)
chr2 (2-207)||(22924135-22924340)
chr2 (2-207)||(31880338-31880543)
chr2 (2-207)||(37947849-37948054)
chr2 (2-204)||(21673162-21673364)
chr2 (2-204)||(27120579-27120781)
chr2 (2-204)||(39894124-39894326)
chr2 (2-204)||(40237563-40237765)
chr2 (2-207)||(12590860-12591065)
chr2 (2-207)||(12712588-12712793)
chr2 (2-207)||(13932534-13932739)
chr2 (2-204)||(16825325-16825527)
chr2 (2-204)||(16895953-16896155)
chr2 (1-207)||(256639-256845)
chr2 (1-207)||(21699157-21699363)
chr2 (1-207)||(19452409-19452615)
chr2 (1-204)||(27395617-27395820)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (2-207)||(10089-10294)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (2-207)||(21893746-21893951)
chr1 (2-207)||(28589040-28589245)
chr1 (2-207)||(51642273-51642478)
chr1 (2-207)||(10949132-10949337)
chr1 (2-204)||(10966723-10966925)
chr1 (2-204)||(3645196-3645400)
chr1 (8-207)||(41789314-41789513)
chr1 (1-207)||(16204031-16204237)
chr1 (2-204)||(28153794-28153996)
chr1 (1-207)||(20465031-20465237)
chr1 (1-204)||(20336413-20336616)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (2-207)||(8013-8218)
scaffold0143 (1-207)||(31346-31552)
scaffold0143 (1-207)||(20123-20329)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (2-204)||(13627-13829)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (2-204)||(10015-10217)
scaffold0159 (2-204)||(12171-12373)
scaffold0159 (2-204)||(5177-5379)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (2-207)||(4120-4325)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (2-207)||(16634-16840)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (2-207)||(10926-11131)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (2-207)||(22189-22394)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (2-204)||(10078-10280)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (2-204)||(12005-12207)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (17-204)||(10101-10288)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (17-210)||(2332-2525)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (2-207)||(42689-42902)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (1-147)||(1844-1990)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (15-210)||(23166-23361)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9358882 - 9358677
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9358882 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 9358783  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9358782 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 9358683  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  9358682 catatt 9358677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19692355 - 19692150
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19692355 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 19692256  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19692255 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 19692156  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  19692155 catatt 19692150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 19913121 - 19913326
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19913121 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 19913220  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913221 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 19913320  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  19913321 catatt 19913326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 28357911 - 28358113
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28357911 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 28358010  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358011 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 28358110  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  28358111 cat 28358113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 27604864 - 27605069
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27604864 atatggtacagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtttcccattcacccttta 27604963  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604964 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 27605063  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  27605064 catatt 27605069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29833582 - 29833377
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29833582 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 29833483  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29833482 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 29833383  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  29833382 catatt 29833377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33246627 - 33246422
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33246627 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 33246528  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33246527 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 33246428  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  33246427 catatt 33246422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33262991 - 33262789
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33262991 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 33262892  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33262891 tctgattgatgacgagcgcagagtctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 33262792  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  33262791 cat 33262789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14561881 - 14561676
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  14561881 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcatccttta 14561782  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14561781 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 14561682  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  14561681 catatt 14561676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15771831 - 15771626
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15771831 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcacccttta 15771732  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15771731 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 15771632  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  15771631 catatt 15771626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18713741 - 18713536
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18713741 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 18713642  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18713641 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatgcatgcttcatattcagc 18713542  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  18713541 catatt 18713536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18794961 - 18794756
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18794961 atatggtgcagctcaacctttataaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcacccttta 18794862  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794861 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 18794762  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  18794761 catatt 18794756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 21344130 - 21344335
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21344130 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcacccttta 21344229  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21344230 tctgattgatcacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 21344329  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  21344330 catatt 21344335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44565241 - 44565036
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44565241 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 44565142  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44565141 tctgattgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 44565042  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  44565041 catatt 44565036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16287211 - 16287005
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16287211 gatatggtgcagctcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcacccttt 16287112  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16287111 atctggttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 16287012  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  16287011 ccatatt 16287005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 19657299 - 19657505
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19657299 gatatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcacctttt 19657398  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19657399 atctggttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcaatcccaaagatacatgcttcgtactcag 19657498  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  19657499 ccatatt 19657505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 2133219 - 2133424
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2133219 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 2133318  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2133319 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcaaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcggc 2133418  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  2133419 catatt 2133424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 19204321 - 19204526
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19204321 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 19204420  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19204421 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatggcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 19204520  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  19204521 catatt 19204526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19678704 - 19678499
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19678704 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 19678605  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19678604 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 19678505  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  19678504 catatt 19678499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22137168 - 22136962
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22137168 gatatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcacccttt 22137069  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22137068 atttggttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcctcatactcgg 22136969  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  22136968 ccatatt 22136962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31358785 - 31358583
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31358785 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 31358686  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31358685 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtccattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 31358586  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  31358585 cat 31358583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 31485830 - 31486035
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31485830 atatggtgcagctcaacctttgtgaaatacgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcacccttta 31485929  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31485930 tctgattaatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 31486029  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  31486030 catatt 31486035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 12088682 - 12088884
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12088682 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcccccttta 12088781  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12088782 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 12088881  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  12088882 cat 12088884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 22076897 - 22077092
Alignment:
Q  15 caacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccttttatctgattgatgac 114  Q
    |||||||||| ||||||| || || ||| ||| ||| |||||| ||||||| || |||  |||| ||||||  ||||||||| |||||||| || || ||    
T  22076897 caacctttgtgaaatatgacaacagacggctcacataatcacggtaaggaaccagcttgtcatgatgggtcatccattcaccctttatctggttaataac 22076996  T
Q  115 gagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatattatt 210  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22076997 aagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgctcccacaatccccaagatacatgcttcgtactcagccatgttatt 22077092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2158829 - 2158624
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2158829 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 2158730  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2158729 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 2158630  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  2158629 catatt 2158624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2777509 - 2777304
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2777509 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 2777410  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2777409 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 2777310  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  2777309 catatt 2777304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5162638 - 5162433
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5162638 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcacccttta 5162539  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5162538 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 5162439  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  5162438 catatt 5162433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 10912752 - 10912957
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10912752 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaagcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 10912851  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10912852 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 10912951  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  10912952 catatt 10912957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 26680989 - 26681194
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26680989 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 26681088  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681089 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 26681188  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  26681189 catatt 26681194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 26270969 - 26271171
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26270969 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcacccttta 26271068  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26271069 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 26271168  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  26271169 cat 26271171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 26315731 - 26315933
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26315731 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccactcacccttta 26315830  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26315831 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 26315930  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  26315931 cat 26315933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 45391475 - 45391273
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45391475 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 45391376  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45391375 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 45391276  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  45391275 cat 45391273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3449561 - 3449356
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3449561 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcacccttta 3449462  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3449461 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagc 3449362  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  3449361 catatt 3449356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4203644 - 4203439
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4203644 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 4203545  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4203544 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 4203445  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  4203444 catatt 4203439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26439512 - 26439307
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  26439512 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccactctcccttta 26439413  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26439412 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 26439313  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  26439312 catatt 26439307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26517047 - 26516842
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26517047 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacatctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 26516948  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26516947 tctgtttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 26516848  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  26516847 catatt 26516842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 26665797 - 26666002
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26665797 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 26665896  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26665897 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 26665996  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  26665997 catatt 26666002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31128162 - 31127957
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31128162 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 31128063  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31128062 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 31127963  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  31127962 catatt 31127957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 45735562 - 45735357
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45735562 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcatgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 45735463  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45735462 tctgattgatgacgagcgcagaatcttcatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 45735363  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  45735362 catatt 45735357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 11420662 - 11420864
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11420662 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 11420761  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11420762 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcaaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 11420861  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  11420862 cat 11420864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 4141129 - 4141334
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4141129 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataagggatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 4141228  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4141229 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatgcatgcttcatactcagc 4141328  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  4141329 catatt 4141334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5132251 - 5132046
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5132251 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcgcgataaggaatcaacttagcatggtgagtctcccattcacctttta 5132152  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5132151 tctgattgatgacgagcgcaaaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 5132052  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  5132051 catatt 5132046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 16747400 - 16747605
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16747400 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataagggatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 16747499  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16747500 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatattcagc 16747599  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  16747600 catatt 16747605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 26511579 - 26511784
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26511579 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcatgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 26511678  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26511679 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagc 26511778  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  26511779 catatt 26511784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 31086505 - 31086710
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31086505 atatggtgtagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 31086604  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31086605 tctgattgatgacgagcgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacaggcttcatactcagc 31086704  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  31086705 catatt 31086710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 2106046 - 2106248
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2106046 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctagcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 2106145  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2106146 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtattcagc 2106245  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  2106246 cat 2106248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 31560273 - 31560475
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31560273 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 31560372  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31560373 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 31560472  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  31560473 cat 31560475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 16514313 - 16514518
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16514313 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 16514412  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16514413 tctggttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcttcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 16514512  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  16514513 catatt 16514518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 39209022 - 39209227
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39209022 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcatgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 39209121  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  39209122 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtacttagc 39209221  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  39209222 catatt 39209227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 5143223 - 5143428
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  5143223 atatggtgcagctcaacttttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattctcccttta 5143322  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5143323 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 5143422  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  5143423 catatt 5143428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11445142 - 11444937
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11445142 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtcttgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 11445043  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11445042 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcaatcccaaagatacatgcttcatactcagc 11444943  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  11444942 catatt 11444937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 24588417 - 24588622
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  24588417 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattcacccttta 24588516  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24588517 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 24588616  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  24588617 catatt 24588622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 26533756 - 26533961
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  26533756 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattcacccttta 26533855  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26533856 tctgattgatgacgagcgcgaaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 26533955  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  26533956 catatt 26533961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16045571 - 16045365
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  16045571 gatatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgagtctcccattcacccttt 16045472  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16045471 atctggttgatgacaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 16045372  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  16045371 ccatatt 16045365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 16445888 - 16446094
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  16445888 gatatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgagtctcccattcacccttt 16445987  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16445988 atctggttgatgacaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcag 16446087  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  16446088 ccatatt 16446094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10845876 - 10845670
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10845876 gatatggtgcaattcgacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcacccttt 10845777  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  10845776 atctggttgatgacaagtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcatcgatcccaaagatacacgcttcgtattcgg 10845677  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  10845676 ccatatt 10845670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 10841876 - 10842082
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  10841876 gatatggtgcaattcgacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatctcggtaaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcgcccttt 10841975  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  10841976 atctggttgatgacaagtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacacgcttcgtattcgg 10842075  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  10842076 ccatatt 10842082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22146308 - 22146238
Alignment:
Q  132 agatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatatt 207  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22146308 agatgtcgaggtgtt-gat-ctcatgtcaat-gct-cctcgatcccaaagatacatgc-tcatactcagccatatt 22146238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 13294892 - 13295097
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13294892 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 13294991  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13294992 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 13295091  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  13295092 catatt 13295097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26922632 - 26922427
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26922632 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 26922533  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26922532 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 26922433  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  26922432 catatt 26922427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29553812 - 29553610
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29553812 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 29553713  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29553712 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 29553613  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  29553612 cat 29553610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 15408474 - 15408679
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15408474 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcacccttta 15408573  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15408574 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 15408673  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  15408674 catatt 15408679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 15420261 - 15420466
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15420261 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcacccttta 15420360  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15420361 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 15420460  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  15420461 catatt 15420466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24867971 - 24867766
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24867971 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgagtctcccattcacccttta 24867872  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24867871 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 24867772  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  24867771 catatt 24867766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27061761 - 27061556
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27061761 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 27061662  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27061661 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 27061562  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  27061561 catatt 27061556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 13520135 - 13520337
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13520135 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 13520234  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13520235 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 13520334  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  13520335 cat 13520337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29505671 - 29505469
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29505671 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccactcacccttta 29505572  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29505571 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 29505472  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  29505471 cat 29505469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 4720076 - 4720281
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4720076 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 4720175  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4720176 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 4720275  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  4720276 catatt 4720281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 8901644 - 8901849
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8901644 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 8901743  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8901744 tctgattaatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatgcatgcttcatactcagc 8901843  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  8901844 catatt 8901849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16754076 - 16753871
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16754076 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 16753977  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16753976 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtagaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 16753877  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  16753876 catatt 16753871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 22930825 - 22931030
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22930825 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgagtctcccattcacccttta 22930924  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22930925 tctgattgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 22931024  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  22931025 catatt 22931030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 23853270 - 23853475
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23853270 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgagtctcccattcacccttta 23853369  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23853370 tctgattgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 23853469  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  23853470 catatt 23853475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26790071 - 26789866
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26790071 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 26789972  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789971 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 26789872  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  26789871 catatt 26789866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 27358051 - 27358256
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27358051 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcatgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 27358150  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27358151 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 27358250  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  27358251 catatt 27358256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 33372372 - 33372577
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33372372 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 33372471  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33372472 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 33372571  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  33372572 catatt 33372577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29577269 - 29577067
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29577269 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataagggatcaacttagcatggtgggtctcccactcacccttta 29577170  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29577169 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 29577070  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  29577069 cat 29577067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 14141335 - 14141540
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  14141335 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcaccctttc 14141434  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14141435 tctaattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 14141534  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  14141535 catatt 14141540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16678395 - 16678190
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16678395 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgcctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 16678296  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16678295 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 16678196  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  16678195 catatt 16678190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 24301698 - 24301903
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24301698 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 24301797  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24301798 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatggcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 24301897  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  24301898 catatt 24301903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27023392 - 27023187
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27023392 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgttagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcacccttta 27023293  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27023292 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 27023193  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  27023192 catatt 27023187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4762018 - 4761816
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4762018 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 4761919  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4761918 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 4761819  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  4761818 cat 4761816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4777135 - 4776933
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4777135 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 4777036  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4777035 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 4776936  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  4776935 cat 4776933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27011986 - 27011784
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011986 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 27011887  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27011886 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 27011787  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  27011786 cat 27011784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27489388 - 27489186
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27489388 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 27489289  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27489288 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 27489189  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  27489188 cat 27489186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 34460447 - 34460649
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  34460447 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattcacccttta 34460546  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34460547 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcctcatactcagc 34460646  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  34460647 cat 34460649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 26112353 - 26112558
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26112353 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 26112452  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26112453 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 26112552  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  26112553 catatt 26112558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 26774567 - 26774770
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  26774567 gatatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcacccttt 26774666  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26774667 atctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaaaatacatgcttcatactcag 26774766  T
Q  201 ccat 204  Q
    ||||    
T  26774767 ccat 26774770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3700338 - 3700136
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3700338 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 3700239  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3700238 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 3700139  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  3700138 cat 3700136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 4541715 - 4541917
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4541715 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 4541814  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4541815 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 4541914  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  4541915 cat 4541917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27198440 - 27198238
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27198440 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 27198341  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27198340 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 27198241  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  27198240 cat 27198238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 27250795 - 27250997
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27250795 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 27250894  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27250895 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 27250994  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  27250995 cat 27250997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4529540 - 4529335
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4529540 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 4529441  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4529440 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgctccctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 4529341  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  4529340 catatt 4529335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28164746 - 28164544
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28164746 atatggtgcaactcaaccttcgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 28164647  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164646 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 28164547  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  28164546 cat 28164544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28211709 - 28211507
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  28211709 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcccccttta 28211610  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28211609 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 28211510  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  28211509 cat 28211507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 16939968 - 16940173
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16939968 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcacccttta 16940067  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16940068 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagc 16940167  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  16940168 catatt 16940173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 30553957 - 30554159
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  30553957 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcacccttta 30554056  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30554057 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagc 30554156  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  30554157 cat 30554159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 27286304 - 27286510
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  27286304 gatatggtgtaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtcttgcgtaatcacggtaaggaattagcttggcatggtgggtctcccattctcccttt 27286403  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27286404 atctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcag 27286503  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  27286504 ccatatt 27286510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 27625651 - 27625857
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||| |||    
T  27625651 gatatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacggtaaggaatcaacttgtcatgatgggtcacccattcacccttt 27625750  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  27625751 atctggttgatgacaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcgtattcag 27625850  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  27625851 ccatatt 27625857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 17088383 - 17088586
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||| | | |||||||| || ||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  17088383 gatatggtgcaactctacctttgttaattatgtcatcatacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcagcttggcatggtgggtttcccattcacccttt 17088482  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17088483 atctggttgatgacaagtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatattcag 17088582  T
Q  201 ccat 204  Q
    ||||    
T  17088583 ccat 17088586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20172803 - 20172597
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||| || |||| ||| ||||| |||| |||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  20172803 gatatggtgcaactcgaccttcgtaaagtaagtcaacaatcgtcttgcataatcacggtatgggatcaacttggcatgatgagtctcccattcacccttt 20172704  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |    
T  20172703 atctggttgatgacaagtgctgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcaagttaattgcttcctcaattccaaagatacatgcttcgtattcgg 20172604  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  20172603 ccatatt 20172597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 22163188 - 22163394
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||| || |||| ||| ||||| |||| |||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||    
T  22163188 gatatggtgcaactcgaccttcgtaaagtaagtcaacaatcgtcttgcataatcacggtatgggatcaacttggcatgatgagtctcccattcacccttt 22163287  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |    
T  22163288 atctggttgatgacaagtgctgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcaagttaattgcttcctcaattccaaagatacatgcttcgtattcgg 22163387  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  22163388 ccatatt 22163394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24587639 - 24587434
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24587639 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 24587540  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24587539 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 24587440  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  24587439 catatt 24587434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33781750 - 33781545
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33781750 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 33781651  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33781650 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 33781551  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  33781550 catatt 33781545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34620783 - 34620578
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34620783 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 34620684  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34620683 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 34620584  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  34620583 catatt 34620578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2515327 - 2515122
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2515327 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 2515228  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2515227 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 2515128  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  2515127 catatt 2515122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3793806 - 3793601
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3793806 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatacgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 3793707  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3793706 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 3793607  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  3793606 catatt 3793601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6878570 - 6878365
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6878570 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataagggatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 6878471  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878470 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 6878371  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  6878370 catatt 6878365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 9546604 - 9546809
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9546604 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 9546703  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9546704 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagacgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 9546803  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  9546804 catatt 9546809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11553620 - 11553415
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11553620 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcacccttta 11553521  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553520 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 11553421  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  11553420 catatt 11553415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 13438578 - 13438783
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13438578 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 13438677  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13438678 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 13438777  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  13438778 catatt 13438783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 18496620 - 18496825
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18496620 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattctcccttta 18496719  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18496720 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 18496819  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  18496820 catatt 18496825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23630235 - 23630030
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23630235 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtttcccattcacccttta 23630136  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23630135 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 23630036  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  23630035 catatt 23630030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24974171 - 24973966
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24974171 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 24974072  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24974071 tctgattgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 24973972  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  24973971 catatt 24973966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30156296 - 30156091
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30156296 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 30156197  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30156196 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 30156097  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  30156096 catatt 30156091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30172734 - 30172529
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30172734 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 30172635  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30172634 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 30172535  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  30172534 catatt 30172529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 40469445 - 40469650
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40469445 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 40469544  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40469545 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 40469644  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  40469645 catatt 40469650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12136440 - 12136238
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12136440 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccactcacccttta 12136341  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12136340 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 12136241  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  12136240 cat 12136238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 13320725 - 13320927
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13320725 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 13320824  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13320825 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 13320924  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  13320925 cat 13320927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26484659 - 26484457
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26484659 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcacccttta 26484560  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484559 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 26484460  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  26484459 cat 26484457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33879393 - 33879191
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33879393 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 33879294  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33879293 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 33879194  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  33879193 cat 33879191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 15754747 - 15754952
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15754747 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 15754846  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15754847 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactccgc 15754946  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  15754947 catatt 15754952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30938900 - 30938695
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30938900 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatgaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 30938801  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30938800 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 30938701  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  30938700 catatt 30938695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 8661370 - 8661572
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8661370 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 8661469  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8661470 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 8661569  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  8661570 cat 8661572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31435729 - 31435527
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435729 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 31435630  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31435629 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 31435530  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  31435529 cat 31435527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 37667381 - 37667583
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37667381 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 37667480  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37667481 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 37667580  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  37667581 cat 37667583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 18124311 - 18124516
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18124311 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcaccattta 18124410  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18124411 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 18124510  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  18124511 catatt 18124516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 18371429 - 18371634
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18371429 atatggtgcagctcaacctttgtgaaatacgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 18371528  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18371529 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 18371628  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  18371629 catatt 18371634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30033693 - 30033488
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30033693 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 30033594  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30033593 tctgattgatgatgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactccgc 30033494  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  30033493 catatt 30033488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 32592169 - 32592374
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32592169 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatacgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgagtctcccattcacccttta 32592268  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592269 tctgattgatgacgagcgcaaaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 32592368  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  32592369 catatt 32592374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33296793 - 33296588
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33296793 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaaccaacttggcatggtgggtctcccattcacccttta 33296694  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33296693 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 33296594  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  33296593 catatt 33296588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37759248 - 37759043
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37759248 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 37759149  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759148 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 37759049  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  37759048 catatt 37759043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 37766886 - 37767091
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37766886 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgcgtctcccattcacccttta 37766985  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37766986 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 37767085  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  37767086 catatt 37767091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43082520 - 43082315
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43082520 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatacgccagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 43082421  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43082420 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 43082321  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  43082320 catatt 43082315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9321742 - 9321536
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  9321742 gatatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcacccttt 9321643  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9321642 atctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcag 9321543  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  9321542 ccatatt 9321536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 13182688 - 13182890
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13182688 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 13182787  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13182788 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaaaatacatgcttcatactcagc 13182887  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  13182888 cat 13182890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 31822302 - 31822504
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31822302 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 31822401  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31822402 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 31822501  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  31822502 cat 31822504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 37354538 - 37354743
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37354538 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcatgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 37354637  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37354638 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 37354737  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  37354738 catatt 37354743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24728234 - 24728032
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  24728234 atatggtgcagctcaacttttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattctcccttta 24728135  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24728134 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 24728035  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  24728034 cat 24728032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 28955680 - 28955882
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  28955680 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccactctcccttta 28955779  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28955780 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 28955879  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  28955880 cat 28955882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41678970 - 41678768
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41678970 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 41678871  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41678870 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 41678771  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  41678770 cat 41678768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5642053 - 5641848
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  5642053 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattcacccttta 5641954  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5641953 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 5641854  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  5641853 catatt 5641848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 15654653 - 15654858
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||    
T  15654653 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatacgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtttcccactctcccttta 15654752  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15654753 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 15654852  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  15654853 catatt 15654858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 22995012 - 22995217
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22995012 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcacccttta 22995111  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22995112 tctgattgatgacaagtgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagc 22995211  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  22995212 catatt 22995217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23896141 - 23895935
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23896141 gatatggtgcaactcaacctttgtaaaatacgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcagcttggcatggtgggtctcccattcacccttt 23896042  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23896041 atctggttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 23895942  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  23895941 ccatatt 23895935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28653508 - 28653302
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  28653508 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatacgtcagcaaacgcctcgcataatcacaataaggaatcaacttagcatgatgtgtctcccattctcccttta 28653409  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgat-cccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28653408 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatccccaaagatacatgcttcatactcag 28653309  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  28653308 ccatatt 28653302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33520645 - 33520443
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  33520645 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcacccttta 33520546  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33520545 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagc 33520446  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  33520445 cat 33520443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11327902 - 11327697
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11327902 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtcttgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcccccttta 11327803  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11327802 tctgattaatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtattcagc 11327703  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  11327702 catatt 11327697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22892729 - 22892523
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||    
T  22892729 gatatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgagtctcccattcgcccttt 22892630  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22892629 atctggttgatgacaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgtttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 22892530  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  22892529 ccatatt 22892523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25204543 - 25204338
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25204543 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcagcttggtatggtgggtctcccattcacccttta 25204444  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25204443 tctggttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcggc 25204344  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  25204343 catatt 25204338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25268698 - 25268493
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25268698 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcagcttggtatggtgggtctcccattcacccttta 25268599  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25268598 tctggttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcggc 25268499  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  25268498 catatt 25268493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 29887091 - 29887297
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29887091 gatatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtcttgcgtaatcacggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcacccttt 29887190  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29887191 atctgattgatgacgagtaccgaatctccataaatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatcgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 29887290  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  29887291 ccatatt 29887297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 33669798 - 33670003
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33669798 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 33669897  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33669898 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 33669997  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  33669998 catatt 33670003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 18313176 - 18313381
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18313176 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 18313275  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18313276 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 18313375  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  18313376 catatt 18313381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30758031 - 30757826
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30758031 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 30757932  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30757931 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 30757832  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  30757831 catatt 30757826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 34184958 - 34185163
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34184958 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcacccttta 34185057  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185058 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 34185157  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  34185158 catatt 34185163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 24588359 - 24588567
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24588359 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgagtctcccattcacccttta 24588458  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24588459 tctggttgatgacgagcgcagaatctccgtagatatcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 24588558  T
Q  202 catattatt 210  Q
    |||||||||    
T  24588559 catattatt 24588567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14102814 - 14102609
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14102814 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 14102715  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14102714 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatggcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatattcagc 14102615  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  14102614 catatt 14102609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17017317 - 17017112
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17017317 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcacccttta 17017218  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17017217 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 17017118  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  17017117 catatt 17017112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24116933 - 24116728
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24116933 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 24116834  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24116833 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcggc 24116734  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  24116733 catatt 24116728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 18796612 - 18796817
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18796612 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 18796711  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796712 tctgattaatgacgagagcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 18796811  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  18796812 catatt 18796817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5010146 - 5009944
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5010146 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccactcacccttta 5010047  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5010046 tctgattgatgacgagcgcagaatctccaaaaatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 5009947  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  5009946 cat 5009944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6574129 - 6573927
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6574129 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcacccttta 6574030  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6574029 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 6573930  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  6573929 cat 6573927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5698806 - 5698601
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5698806 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 5698707  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  5698706 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcggc 5698607  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  5698606 catatt 5698601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14669287 - 14669082
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  14669287 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctctcaatcacccttta 14669188  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14669187 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgttgaggtttttgattctcatgtcaattgcttcctcaatcccaaagatacatgcttcatactcagc 14669088  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  14669087 catatt 14669082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 14755490 - 14755695
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  14755490 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattctcccttta 14755589  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14755590 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 14755689  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  14755690 catatt 14755695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Original strand, 36340516 - 36340720
Alignment:
Q  3 tatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccttttat 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36340516 tatggtgcagctcaacctttgtaaaatacgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttat 36340615  T
Q  103 ctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagcc 202  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36340616 ctgattgatgatgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatggcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagcc 36340715  T
Q  203 atatt 207  Q
    |||||    
T  36340716 atatt 36340720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 54837662 - 54837460
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54837662 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgcctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgggtctcccattcacccttta 54837563  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54837562 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 54837463  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  54837462 cat 54837460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 20334419 - 20334624
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20334419 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcacccttta 20334518  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334519 tctgattgatgacgagcgccgaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 20334618  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  20334619 catatt 20334624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39854908 - 39854703
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  39854908 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattcacccttta 39854809  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854808 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 39854709  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  39854708 catatt 39854703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 40101635 - 40101843
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  40101635 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattcacccttta 40101734  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40101735 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 40101834  T
Q  202 catattatt 210  Q
    ||| |||||    
T  40101835 catgttatt 40101843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21973972 - 21973770
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21973972 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcacccttta 21973873  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21973872 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagc 21973773  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  21973772 cat 21973770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 27159315 - 27159517
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27159315 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatgatgggtctcccattcacccttta 27159414  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27159415 tctgattgatgacgagcgccgaatctccatagatatcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcggc 27159514  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  27159515 cat 27159517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 31122510 - 31122712
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31122510 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcacccttta 31122609  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31122610 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagc 31122709  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  31122710 cat 31122712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1904525 - 1904320
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1904525 atatggtgtaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcacccttta 1904426  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1904425 tctggttgatgacaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatatcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 1904326  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  1904325 catatt 1904320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15232092 - 15231886
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  15232092 gatatggtgcaactcaaccttcgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgagtctcccattcacccttt 15231993  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  15231992 atctggttgatgacaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacacgcttcgtattcgg 15231893  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  15231892 ccatatt 15231886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 15278624 - 15278830
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15278624 gatatggtgcaattcgacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcgcctttt 15278723  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  15278724 atctggttgatgacaagtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacacgcttcgtattcgg 15278823  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  15278824 ccatatt 15278830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 210
Target Start/End: Original strand, 15384432 - 15384554
Alignment:
Q  88 ccattcaccttttatctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacat 187  Q
    ||||||||| |||||||| || || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15384432 ccattcaccctttatctggttaataacaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatccccaagatacat 15384531  T
Q  188 gcttcatactcagccatattatt 210  Q
    ||||| ||||||||||| |||||    
T  15384532 gcttcgtactcagccatgttatt 15384554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6206123 - 6205918
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6206123 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 6206024  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6206023 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 6205924  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  6205923 catatt 6205918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 51786242 - 51786037
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51786242 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 51786143  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51786142 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 51786043  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  51786042 catatt 51786037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 15737135 - 15737343
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15737135 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 15737234  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15737235 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttccttgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 15737334  T
Q  202 catattatt 210  Q
    |||||||||    
T  15737335 catattatt 15737343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4687874 - 4687669
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4687874 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtttcccattcacccttta 4687775  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4687774 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 4687675  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  4687674 catatt 4687669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 8285511 - 8285716
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8285511 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacatctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 8285610  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8285611 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 8285710  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  8285711 catatt 8285716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18055481 - 18055276
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18055481 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 18055382  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18055381 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 18055282  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  18055281 catatt 18055276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32443370 - 32443165
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32443370 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 32443271  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32443270 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 32443171  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  32443170 catatt 32443165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7077425 - 7077223
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7077425 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 7077326  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7077325 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgacgtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 7077226  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  7077225 cat 7077223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20070260 - 20070054
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20070260 gatatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttt 20070161  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20070160 atctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatagcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 20070061  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  20070060 ccatatt 20070054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 28111995 - 28112197
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28111995 atatggtgtagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 28112094  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28112095 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 28112194  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  28112195 cat 28112197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 4342717 - 4342922
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4342717 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcaggagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 4342816  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4342817 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 4342916  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  4342917 catatt 4342922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4628004 - 4627799
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4628004 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 4627905  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4627904 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattgtcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 4627805  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  4627804 catatt 4627799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8000779 - 8000574
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8000779 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 8000680  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8000679 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 8000580  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  8000579 catatt 8000574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10647292 - 10647087
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10647292 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 10647193  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10647192 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 10647093  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  10647092 catatt 10647087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 15888746 - 15888951
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15888746 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 15888845  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15888846 tctgattgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 15888945  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  15888946 catatt 15888951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 31032277 - 31032482
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31032277 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 31032376  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31032377 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 31032476  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  31032477 catatt 31032482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32294847 - 32294642
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32294847 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccactcacccttta 32294748  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32294747 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagc 32294648  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  32294647 catatt 32294642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35884985 - 35884780
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35884985 atatggtgcagcttaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 35884886  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884885 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 35884786  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  35884785 catatt 35884780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 48470146 - 48469941
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48470146 atatggtgcagctcaacctttgtgaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 48470047  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48470046 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 48469947  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  48469946 catatt 48469941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5017933 - 5017731
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5017933 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 5017834  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5017833 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 5017734  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  5017733 cat 5017731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 5605355 - 5605557
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5605355 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 5605454  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5605455 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 5605554  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  5605555 cat 5605557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 17972902 - 17973104
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  17972902 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatagtgggtctcccactcacccttta 17973001  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17973002 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 17973101  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  17973102 cat 17973104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28343396 - 28343194
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28343396 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 28343297  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28343296 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 28343197  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  28343196 cat 28343194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 29661011 - 29661213
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29661011 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 29661110  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29661111 tctgattgatgacgagagcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatctcaaagatacatgcttcatactcagc 29661210  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  29661211 cat 29661213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 4792676 - 4792881
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  4792676 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcgtgatgggtctcccattcacccttta 4792775  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4792776 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 4792875  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  4792876 catatt 4792881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 11106400 - 11106605
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11106400 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgggtctcccattcacccttta 11106499  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11106500 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 11106599  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  11106600 catatt 11106605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18334849 - 18334644
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18334849 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 18334750  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334749 tctggttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 18334650  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  18334649 catatt 18334644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 22383619 - 22383824
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22383619 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 22383718  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22383719 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 22383818  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  22383819 catatt 22383824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28025500 - 28025295
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28025500 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 28025401  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28025400 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 28025301  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  28025300 catatt 28025295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5471208 - 5471002
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5471208 gatatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcgcctttt 5471109  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5471108 atctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcag 5471009  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  5471008 ccatatt 5471002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 47027673 - 47027467
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  47027673 gatatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcatgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcacccttt 47027574  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47027573 atctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 47027474  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  47027473 ccatatt 47027467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8215954 - 8215749
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8215954 atatggtgcagctcaacttttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 8215855  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8215854 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 8215755  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  8215754 catatt 8215749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8300190 - 8299985
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8300190 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 8300091  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8300090 tctgattgatgacgagcgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatagcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 8299991  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  8299990 catatt 8299985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 17980990 - 17981195
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17980990 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcacccttta 17981089  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17981090 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 17981189  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  17981190 catatt 17981195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18229415 - 18229210
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18229415 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcacccttta 18229316  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18229315 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 18229216  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  18229215 catatt 18229210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 22866889 - 22867094
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22866889 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatacgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 22866988  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22866989 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatggcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 22867088  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  22867089 catatt 22867094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 22881948 - 22882153
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22881948 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatacgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 22882047  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22882048 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatggcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 22882147  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  22882148 catatt 22882153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24332382 - 24332177
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24332382 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 24332283  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24332282 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgttgaggtgtttgattctcatgtcaatggcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 24332183  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  24332182 catatt 24332177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 29144797 - 29145002
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29144797 atatagtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcacccttta 29144896  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29144897 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 29144996  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  29144997 catatt 29145002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 5592398 - 5592600
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5592398 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgggtctcccattcacccttta 5592497  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5592498 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 5592597  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  5592598 cat 5592600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 6538783 - 6538985
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6538783 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 6538882  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6538883 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 6538982  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  6538983 cat 6538985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10400363 - 10400161
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10400363 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 10400264  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10400263 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 10400164  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  10400163 cat 10400161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18246960 - 18246758
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18246960 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 18246861  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18246860 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaagtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 18246761  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  18246760 cat 18246758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 31960496 - 31960698
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31960496 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 31960595  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31960596 tctgattgatgacgagcgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 31960695  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  31960696 cat 31960698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 18273093 - 18273298
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  18273093 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattctcccttta 18273192  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18273193 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 18273292  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  18273293 catatt 18273298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 18288394 - 18288599
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  18288394 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattctcccttta 18288493  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18288494 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 18288593  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  18288594 catatt 18288599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 18303695 - 18303900
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  18303695 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattctcccttta 18303794  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18303795 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 18303894  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  18303895 catatt 18303900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21678922 - 21678720
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  21678922 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattctcccttta 21678823  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21678822 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcgtactcagc 21678723  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  21678722 cat 21678720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4725849 - 4725645
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4725849 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcgcgata-ggaatcaacttagcatggtgagtctcccattcacctttta 4725751  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4725750 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatgctcagc 4725651  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  4725650 catatt 4725645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4421128 - 4420929
Alignment:
Q  8 tgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccttttatctgat 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  4421128 tgcagctcaaccttcgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattctccctttatctgat 4421029  T
Q  108 tgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatatt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4421028 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatatt 4420929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 20572883 - 20573086
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  20572883 gatatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcacccttt 20572982  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20572983 atctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcttcgatcccgaagatgcatgcttcatactcag 20573082  T
Q  201 ccat 204  Q
    ||||    
T  20573083 ccat 20573086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5715292 - 5715090
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5715292 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcacccttta 5715193  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5715192 tctgattgatgacgagcgccgaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 5715093  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  5715092 cat 5715090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5726202 - 5726000
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5726202 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcacccttta 5726103  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5726102 tctgattgatgacgagcgccgaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 5726003  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  5726002 cat 5726000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 5766166 - 5766368
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5766166 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcacccttta 5766265  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5766266 tctgattgatgacgagcgccgaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 5766365  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  5766366 cat 5766368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19698710 - 19698504
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  19698710 gatatggtgcgactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattctcccttt 19698611  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698610 atctggttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcacatcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 19698511  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  19698510 ccatatt 19698504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5654305 - 5654099
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  5654305 gatatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcgtaatcacggtaagggatcagcttggcatggtcggtctcccattcacccttt 5654206  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5654205 atctggttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttccttgatcccaaagatacatgcttcatactcag 5654106  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  5654105 ccatatt 5654099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 16620530 - 16620733
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16620530 gatatggtgcaattcgacctttgtaaaatatgttagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcagcttggcatggtgggtctcccattcacccttt 16620629  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16620630 atctggttgatgacaagtgccgaatctccgtagatgttgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtattcag 16620729  T
Q  201 ccat 204  Q
    ||||    
T  16620730 ccat 16620733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27807960 - 27807755
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27807960 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 27807861  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27807860 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 27807761  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  27807760 catatt 27807755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28886536 - 28886331
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28886536 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 28886437  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28886436 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 28886337  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  28886336 catatt 28886331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34159101 - 34158896
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34159101 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 34159002  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159001 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 34158902  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  34158901 catatt 34158896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 31889478 - 31889680
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31889478 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 31889577  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31889578 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 31889677  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  31889678 cat 31889680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 27430428 - 27430633
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27430428 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 27430527  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27430528 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 27430627  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  27430628 catatt 27430633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32054060 - 32053855
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32054060 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 32053961  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32053960 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 32053861  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  32053860 catatt 32053855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37381934 - 37381729
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37381934 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 37381835  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37381834 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatgcatgcttcatactcagc 37381735  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  37381734 catatt 37381729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 37681882 - 37682087
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37681882 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 37681981  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37681982 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 37682081  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  37682082 catatt 37682087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 37697147 - 37697352
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37697147 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 37697246  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37697247 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 37697346  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  37697347 catatt 37697352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37929626 - 37929421
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37929626 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 37929527  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37929526 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 37929427  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  37929426 catatt 37929421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 9345972 - 9346178
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9345972 gatatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttt 9346071  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346072 atctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 9346171  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  9346172 ccatatt 9346178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34865941 - 34865739
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  34865941 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccactcacccttta 34865842  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34865841 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 34865742  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  34865741 cat 34865739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12659793 - 12659588
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12659793 atatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataatgaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 12659694  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12659693 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 12659594  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  12659593 catatt 12659588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20842170 - 20841965
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20842170 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 20842071  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842070 tctggttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 20841971  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  20841970 catatt 20841965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27780491 - 27780286
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27780491 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcacccttta 27780392  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27780391 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcctaaagatacatgcttcatactcagc 27780292  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  27780291 catatt 27780286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27820248 - 27820043
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27820248 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcacccttta 27820149  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27820148 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcctaaagatacatgcttcatactcagc 27820049  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  27820048 catatt 27820043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 39047806 - 39048011
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39047806 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattcacccttta 39047905  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39047906 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 39048005  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  39048006 catatt 39048011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3786750 - 3786548
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3786750 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 3786651  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3786650 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggcgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 3786551  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  3786550 cat 3786548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 11631171 - 11631376
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11631171 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 11631270  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11631271 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatatcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcggc 11631370  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  11631371 catatt 11631376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16165737 - 16165532
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16165737 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaattaatttagcatggtgggtctcccattcacccttta 16165638  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16165637 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 16165538  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  16165537 catatt 16165532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 23124556 - 23124761
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23124556 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgttagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 23124655  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23124656 tctaattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcggc 23124755  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  23124756 catatt 23124761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 34270907 - 34271112
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34270907 atatggcgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtttcccattcacccttta 34271006  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34271007 tctgattgatgatgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 34271106  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  34271107 catatt 34271112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34295411 - 34295206
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34295411 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 34295312  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34295311 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaaatgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 34295212  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  34295211 catatt 34295206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 19412488 - 19412693
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19412488 atatggtgcagctcatcctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 19412587  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19412588 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatggcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatattcagc 19412687  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  19412688 catatt 19412693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 22924135 - 22924340
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  22924135 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattctcccttta 22924234  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22924235 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 22924334  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  22924335 catatt 22924340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31880543 - 31880338
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31880543 atatggtgcagctcaacctttgtgaaatacgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcacccttta 31880444  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31880443 tctgattaatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 31880344  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  31880343 catatt 31880338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 37947849 - 37948054
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37947849 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcacccttta 37947948  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37947949 tctgattgatgacgagagcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcttcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 37948048  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  37948049 catatt 37948054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 21673162 - 21673364
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21673162 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaaggcgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 21673261  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21673262 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 21673361  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  21673362 cat 21673364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27120781 - 27120579
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  27120781 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttca 27120682  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27120681 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatatcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcggc 27120582  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  27120581 cat 27120579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39894326 - 39894124
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39894326 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcaaaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 39894227  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39894226 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 39894127  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  39894126 cat 39894124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40237765 - 40237563
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  40237765 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaattaacttagcatggtgggtctcccattctcccttca 40237666  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40237665 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 40237566  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  40237565 cat 40237563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12591065 - 12590860
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  12591065 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcacgataaggaatcagtttagcatgatgtgtctcccattcacccttta 12590966  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12590965 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 12590866  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  12590865 catatt 12590860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 12712588 - 12712793
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  12712588 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattcacccttta 12712687  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12712688 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagc 12712787  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  12712788 catatt 12712793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 13932534 - 13932739
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13932534 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcacccttta 13932633  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13932634 tctgattaatgacgagcgcagaatctccatagatgccgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 13932733  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  13932734 catatt 13932739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 16825325 - 16825527
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16825325 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcacccttta 16825424  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16825425 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagc 16825524  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  16825525 cat 16825527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16896155 - 16895953
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16896155 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcacccttta 16896056  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16896055 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagc 16895956  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  16895955 cat 16895953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 256639 - 256845
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  256639 gatatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattctcccttt 256738  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  256739 atctgattgatgacgagcgcataatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatgcatgcctcatactcag 256838  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  256839 ccatatt 256845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 21699157 - 21699363
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  21699157 gatatggtgcaattcgacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcgtggtgggtctcccattcacccttt 21699256  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21699257 atctggttgatgaaaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 21699356  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  21699357 ccatatt 21699363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 19452409 - 19452615
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19452409 gatatggtgcaattcgacctttgtaaaatatgccaacaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcacccttt 19452508  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  19452509 atctggttgatgacaagtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgatcctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacacgcttcatattcgg 19452608  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  19452609 ccatatt 19452615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27395820 - 27395617
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| || |||  |||| |||||| |||||||||| |||    
T  27395820 gatatggtgcaactcaacctttgtgaaatatgacaacagacgtctcgcataatcacggtaaggaaccagcttgccatgatgggtcacccattcacccttt 27395721  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||  || || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27395720 atctagttaataacaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtattcag 27395621  T
Q  201 ccat 204  Q
    ||||    
T  27395620 ccat 27395617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10294 - 10089
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10294 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 10195  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10194 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 10095  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  10094 catatt 10089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 21893746 - 21893951
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21893746 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 21893845  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893846 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 21893945  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  21893946 catatt 21893951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28589245 - 28589040
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28589245 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 28589146  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28589145 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgaccccaaagatacatgcttcatactcagc 28589046  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  28589045 catatt 28589040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 51642478 - 51642273
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51642478 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 51642379  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51642378 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 51642279  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  51642278 catatt 51642273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10949337 - 10949132
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10949337 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcacccttta 10949238  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10949237 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 10949138  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  10949137 catatt 10949132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10966925 - 10966723
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10966925 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgggtctcccattcacccttta 10966826  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10966825 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 10966726  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  10966725 cat 10966723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3645400 - 3645196
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaata-tgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctccca-ttcaccttt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  3645400 atatggtgcagctcaacctttgtaaaataatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccacttcaccctt 3645301  T
Q  100 tatctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3645300 tatctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactca 3645201  T
Q  200 gccat 204  Q
    |||||    
T  3645200 gccat 3645196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 207
Target Start/End: Original strand, 41789314 - 41789513
Alignment:
Q  8 tgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccttttatctgat 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  41789314 tgcagctcaaccttcgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattctccctttatctgat 41789413  T
Q  108 tgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatatt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41789414 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatatt 41789513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 16204031 - 16204237
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16204031 gatatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcacccttt 16204130  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16204131 atctggttgatgacgagtgcaaaatctccatagatgttgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcag 16204230  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  16204231 ccatatt 16204237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28153996 - 28153794
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  28153996 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcccccttta 28153897  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28153896 tctgattaatgacgagcgcagaatctccacagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtattcagc 28153797  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  28153796 cat 28153794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20465237 - 20465031
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| |||  |||| ||||||||||||||||| |||    
T  20465237 gatatggtgcaattcgacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggagtcagcttgtcatgatgggtctcccattcacccttt 20465138  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20465137 atctggttgatgacaagtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcgg 20465038  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  20465037 ccatatt 20465031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 20336413 - 20336616
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||     
T  20336413 gatatggtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcaacaaatgcctcgcgtaatcacggtaaggaatcagcttggcatggtggatctcccattcacccttg 20336512  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20336513 atctggttgataacaagtgcagaatctccttagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcgg 20336612  T
Q  201 ccat 204  Q
    ||||    
T  20336613 ccat 20336616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8218 - 8013
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8218 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 8119  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8118 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 8019  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  8018 catatt 8013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31552 - 31346
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31552 gatatggtgcagctcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgtctcgcataatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcacccttt 31453  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31452 atctggttgatgacgagtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatacttcatactcag 31353  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  31352 ccatatt 31346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20329 - 20123
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  20329 gatatggtgcaattcgacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatctcggtaaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcgcccttt 20230  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  20229 atctggttgatgacaagtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacacgcttcgtattcgg 20130  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  20129 ccatatt 20123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13829 - 13627
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13829 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 13730  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13729 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 13630  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  13629 cat 13627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 10015 - 10217
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10015 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 10114  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10115 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 10214  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  10215 cat 10217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 12171 - 12373
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12171 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 12270  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12271 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 12370  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  12371 cat 12373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 5177 - 5379
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5177 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttta 5276  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5277 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 5376  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  5377 cat 5379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4325 - 4120
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4325 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgaaaaggaatcaacttagcatggtgggtcttccattcacccttta 4226  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4225 tctgattgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 4126  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  4125 catatt 4120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 171; Significance: 5e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16840 - 16634
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataa-ggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16840 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattcacccttt 16741  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16740 atctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcag 16641  T
Q  201 ccatatt 207  Q
    |||||||    
T  16640 ccatatt 16634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 10926 - 11131
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10926 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 11025  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  11026 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcggc 11125  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  11126 catatt 11131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 22189 - 22394
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  22189 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattcacccttta 22288  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22289 tctgattgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 22388  T
Q  202 catatt 207  Q
    ||||||    
T  22389 catatt 22394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10280 - 10078
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10280 atatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcacccttta 10181  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10180 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 10081  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  10080 cat 10078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12207 - 12005
Alignment:
Q  2 atatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12207 atatgatgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcccccttta 12108  T
Q  102 tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12107 tctgattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagc 12008  T
Q  202 cat 204  Q
    |||    
T  12007 cat 12005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10288 - 10101
Alignment:
Q  17 acctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccttttatctgattgatgacga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  10288 acctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgggtctcccatccaccctttatctggttgatgacga 10189  T
Q  117 gcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccat 204  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10188 gtgcagaatctccatagatatcgaggtgtttgatcctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccat 10101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2525 - 2332
Alignment:
Q  17 acctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccttttatctgattgatgacga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  2525 acctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctctcgtaatcacggtaaggaatcagcttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctggttgatgacaa 2426  T
Q  117 gcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatattatt 210  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  2425 gtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtattcggccatattatt 2332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 42689 - 42902
Alignment:
Q  2 atatggtgcagccc-aacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtct-cgcatgat-cacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctccca-ttcacct 97  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  42689 atatggtgcagctctaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctacgcataatacacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccacttcaccc 42788  T
Q  98 ttta-tctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtg-tttga-ttctcatgtcaattgcttcctcg-atcccaaagatacatgcttca 193  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42789 tttactctgattgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgttttgatttctcatgtcaattgcttcctcgaatcccaaagatacatgcttca 42888  T
Q  194 tactcagccatatt 207  Q
    ||||||||||||||    
T  42889 tactcagccatatt 42902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1990 - 1844
Alignment:
Q  1 gatatggtgcagcccaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacctttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  1990 gatatggtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaagttggcatggtgggtctcccattcacctttt 1891  T
Q  101 atctgattgatgacgagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgttt 147  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1890 atctggttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgttt 1844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23361 - 23166
Alignment:
Q  15 caacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcatgatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccttttatctgattgatgac 114  Q
    |||||||||| ||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| || |||  |||| ||||||  ||||||||| |||||||| || || ||    
T  23361 caacctttgtgaaatatgacaacagacgtctcgcataatcacggtaaggaaccagcttgtcatgatgggtcatccattcaccctttatctggttaataac 23262  T
Q  115 gagcgcagaatctccgtagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatattatt 210  Q
     ||  |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23261 aagtacagaatctccatagatgtcgaggtgtgtgatcctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgttatt 23166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University