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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7169_high_3 (Length: 605)

Name: NF7169_high_3
Description: NF7169
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7169_high_3
NF7169_high_3
[»] chr8 (6 HSPs)
chr8 (1-602)||(42732085-42732682)
chr8 (192-602)||(44886306-44886704)
chr8 (192-602)||(31745476-31745887)
chr8 (203-423)||(19190944-19191174)
chr8 (117-159)||(19190856-19190898)
chr8 (47-99)||(19190723-19190773)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (24-602)||(33416288-33416855)
[»] chr3 (5 HSPs)
chr3 (12-602)||(14043098-14043692)
chr3 (192-447)||(2062669-2062923)
chr3 (200-423)||(60792-61025)
chr3 (469-602)||(2062953-2063086)
chr3 (24-56)||(61203-61235)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (24-397)||(15696134-15696506)
chr1 (507-602)||(15696569-15696664)
chr1 (287-344)||(40607688-40607745)
chr1 (381-423)||(36776015-36776057)
[»] scaffold0283 (1 HSPs)
scaffold0283 (192-602)||(697-1095)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (24-426)||(15872114-15872526)
chr6 (508-602)||(15871956-15872050)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (95-397)||(53536263-53536564)
chr4 (507-602)||(53536138-53536233)
chr4 (24-70)||(53536569-53536615)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (233-397)||(45791653-45791815)
chr7 (507-602)||(45791481-45791576)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (514-554)||(14925-14965)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 602
Target Start/End: Original strand, 42732085 - 42732682
Alignment:
Q  1 ctattataaacaaatgccttattttaattgtttcaccatgccataaaaatgtacacaaatattatgcaagacaatccttatttatttatttctttaattg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42732085 ctattataaacaaatgctttattttaattgtttcaccatgccataaaaatgtacacaaatattatgcaagacaatccttatttatttatttctttaattg 42732184  T
Q  101 ttgtttgtagatttgggtgatcttgcaagtgaataatgtccatatagaacggcaatttga---nnnnnnnngttttgatttacatnnnnnnnnntgtgat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||||||         ||||||    
T  42732185 ttgtttgtagatttgggtgatcttgtaagtgaataatgtccatatagaacggcaatttgatttttgtttttgtttcgatttacataaaaaaatatgtgat 42732284  T
Q  198 agcacgtttatattttcaatttagcataactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaattgnnnnnnnggttacatcatcacctt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||    
T  42732285 agcacgtttatattttcaatttagcataactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaatt-tttttttggttacatcgtcacctt 42732383  T
Q  298 ttattatttaaaccaattataatatcacatgtgtcatctttatataatacaaatatcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttatttgctata 397  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42732384 ttattatttaaacc-attataatatcacatgtgtcacctttatataatacaaatgtcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttatttgttata 42732482  T
Q  398 caacattaattgctttcaaggaaatttacatgtagttactgatataagaatgtgnnnnnnnnnnnnnnnnngtggtgatataag-aaaggtttaattgcg 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42732483 caacattaattgctttcaaggaaatttacatgtagttactgatataagaatgtg-------tttcttttttgtggtgatataagaaaaggtttaattgcg 42732575  T
Q  497 c-ttnnnnnnncattgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagttaatggttaagtttcacacacacgtatgc 595  Q
    | |        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42732576 cataaaaaaaacattgataagcaaaacatttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagtcaatggttaagtttcacacacacgtatgc 42732675  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 192 - 602
Target Start/End: Original strand, 44886306 - 44886704
Alignment:
Q  192 tgtgatagcacgtttatattttcaatttagcataactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaattgnnnnnnnggttacatcat 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |    
T  44886306 tgtgatagcacgtttatattttcaatttagcataactattctttcattcctcaataattttacatactatgttaaccaattattttt---gttacatcgt 44886402  T
Q  292 caccttttattatttaaaccaattataatatcacatgtgtcatctttatataatacaaatatcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttattt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44886403 caccttttattatttaaaccaattataatatcacatgtgtcatctttatataatacaaatgtcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttattt 44886502  T
Q  392 gctatacaacattaattgctttcaaggaaatttacatgtagttactgatataagaatgtgnnnnnnnnnnnnnnnnngtggtgatataag-aaaggttta 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||                 ||||||||||||| |||||||||    
T  44886503 gctatacaacattaattgctttcaaggtaatttacatgtagttaccgatataagaaagtg---------ttttttttgtggtgatataagaaaaggttta 44886593  T
Q  491 attgcgcttnnnnnnncattgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagttaatggttaagtttcacacacacg 590  Q
    ||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44886594 attgcgcat-aaaaaacattgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagtcgatggttaagtttcacacacacg 44886692  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 192 - 602
Target Start/End: Original strand, 31745476 - 31745887
Alignment:
Q  192 tgtgatagcacgtttatattttcaatttagcataactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaattgnnnnnnnggttacatcat 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||| |    
T  31745476 tgtgatagcacgtttatattttcaatttagcataactattctttcattccttgataattttacatactatgttaaccaattttttttttg-ttacatcgt 31745574  T
Q  292 caccttttattatttaaaccaattataatatcacatgtgtcatctttatataatacaaatatcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttattt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31745575 caccttttattatttaaaccaattataatatcacatgtgtcatctttatataatacaaatgtcttctttaaaatttaaagtacacctaacatttttattt 31745674  T
Q  392 gctatacaacattaattgctttcaaggaaatttacatgtagttactgatataagaa--tgtgnnnnnnnnnnnnnnnnngtggtgatataag-aaaggtt 488  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||                  ||||||||||||| |||||||    
T  31745675 gctatacaacattaattgcttttaaggaaatttacatgtagttactgatataagaaagtgtttttttttttgtttttttgtggtgatataagaaaaggtt 31745774  T
Q  489 taattgcgcttnnnnnnncattgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagttaatggttaagtttcacacaca 588  Q
    ||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31745775 taattgcgcat-aaaaaacattgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagtcgatggttaagtttcacacaca 31745873  T
Q  589 cgtatgcataaaac 602  Q
    ||||||||||||||    
T  31745874 cgtatgcataaaac 31745887  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 203 - 423
Target Start/End: Original strand, 19190944 - 19191174
Alignment:
Q  203 gtttatattttcaatttagcataactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaattgnnnnnnnggttacatcatcaccttttatt 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||          ||||||  ||||||||||||    
T  19190944 gtttatattttcaatttagtataactattctttcttttctcaataattttacaaattatattaaccaatttgatttta--ttacattgtcaccttttatt 19191041  T
Q  303 atttaaaccaattataatatcacatgtgtc------------atctttatataatacaaatatcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttatt 390  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||            ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19191042 atttaaaccaattataatatcatatgtgtcgtctctatctttatctttatataatacaaatgtcttctttaaaatttaaagtacacatagcatgtttatt 19191141  T
Q  391 tgctatacaacattaattgctttcaaggaaatt 423  Q
    | ||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19191142 tactaaacaacgttaattgctttaaaggaaatt 19191174  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 159
Target Start/End: Original strand, 19190856 - 19190898
Alignment:
Q  117 gtgatcttgcaagtgaataatgtccatatagaacggcaatttg 159  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19190856 gtgatgttgcaagtgaataatgtccatatagaacggcaatttg 19190898  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 99
Target Start/End: Original strand, 19190723 - 19190773
Alignment:
Q  47 aaatgtacacaaatattatgcaagacaatccttatttatttatttctttaatt 99  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19190723 aaatgtacaca--tattaagcaagacaatccttatttatttatttctttaatt 19190773  T

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Target: chr2 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 602
Target Start/End: Original strand, 33416288 - 33416855
Alignment:
Q  24 ttaattgtttcaccatgccataaaaatgtacacaaatattatgcaagacaatccttatttatttatttctttaattgttgtttgtagatttgggtgatct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33416288 ttaattgtttcaccatgccataaaaatgtacacaaatattatgcaaggcaatccttatttatttatttctttaattgttgtttgtagatttaggtgatct 33416387  T
Q  124 tgcaagtgaataatgtccatatagaacggcaatttgannnnnnnn--gttttgatttacatnnnnnnnnntgtgatagcacgtttatattttcaatttag 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33416388 tggaagtgaataatgtccatatagaacggcaatttgattttttttttgtttcgatttacataaaaaaatatgtgatagcacgtttatattttcaatttag 33416487  T
Q  222 cataactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaattgnnnnnnnggttacatcatcaccttttattatttaaaccaattataata 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33416488 cataactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaatt--ttttttggttacatcgtcaccttttattatttaaaccaattataata 33416585  T
Q  322 tcacatgtgtcatctttatataatacaaatatcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttatttgctatacaacattaattgctttcaaggaaa 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33416586 tcacatgtgtcatctttatataatacaaatgtctt---taaaatttaaagtacacctaacatgtttatttgctatacaacattaattgctttcaaggaaa 33416682  T
Q  422 tttacatgtagttactgatataagaatgtgnnnnnnnnnnnnnnnnngtggtgatataag-aaaggtttaattgcgcttnnnnnnncattgataagcaaa 520  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||                 ||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||    
T  33416683 tttacatgtagttact-atataagaaagtg-------ttttttttttgtggtgatataagaaaaggtttaattgcgc-acaaaaaacattgataagcaaa 33416773  T
Q  521 acgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagttaatggttaagtttcacacacacgtatgcataaaac 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33416774 acgtttttgtttatatattaagaaatgttaaattaggcagaaaagtcaatggttaagtttcacacacacgtatgcataaaac 33416855  T

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Target: chr3 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 14043692 - 14043098
Alignment:
Q  12 aaatgccttattttaattgtttcaccatgccataaaaatgtacacaaatattatgcaagacaatccttatttatttatttctttaattgttgtttgtaga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14043692 aaatgccttattttaattgtttcaccatgccataaaaatgtacacaaatattatgcaaggcaatccttatttatttatttctttaattgttgtttgtaga 14043593  T
Q  112 tttgggtgatcttgcaagtgaataatgtccatatagaacggcaatttgannnnnnnngttttgatttacatnnnnnnnnntgtgatagcacgtttatatt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||| |||||||||         |||||||| |||||||||||    
T  14043592 tttgggtgatcttgcaagtgaataatgtccatatagaacgacaatttgattttttttgtttcgatttacataaaaaaatatgtgatagtacgtttatatt 14043493  T
Q  212 ttcaatttagcataactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaattgnnnnnnnggttacatcatcaccttttattatttaaacc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14043492 ttcaatttagcataactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaatttttttttttgttacatcgtcaccttttattatttaaacc 14043393  T
Q  312 aattataatatcacatgtgtcatctttatataatacaaatatcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttatttgctatacaacattaattgct 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14043392 aattacaatatcacatgtgtcatctttatataatacaaatgtcttatttaaaatttaaagtacatctaacatgtttatttgctatacaacattaattgtt 14043293  T
Q  412 ttcaaggaaatttacatg----tagttactgatataagaatgtgnnnnnnnnnnnnnnnnngtggtgatataag-aaaggtttaattgcgcttnnnnnnn 506  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||| |||                 ||||||||||||| |||||||||||||||| |           
T  14043292 ttcaaggaaatttacatgtagttagttactaatataagaaagtgtttttttttttttttttgtggtgatataagaaaaggtttaattgcgcat-aaaaaa 14043194  T
Q  507 cattgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagttaatggttaagtttcacacacacgtatgcataaaac 602  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14043193 cattggtaagcaaaacgcttttgtttatatattaaaaaatgtttaattaggcagaaaagtcaatgattaagtttcgcacacatgtatgcataaaac 14043098  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 192 - 447
Target Start/End: Original strand, 2062669 - 2062923
Alignment:
Q  192 tgtgatagcacgtttatattttcaatttagcataactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaattgnnnnnnnggttacatcat 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||| |||||    
T  2062669 tgtgatagcacgtttatattttcaatttagcataactattctttcattcctcaataattttacatactatgttaaccaattttttttttg-ttagatcat 2062767  T
Q  292 caccttttattatttaaaccaattataatatcacatgtgtcatctttatataatacaaatatcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttattt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2062768 caccttttattatttaaaccaattataatatcacatgtgtcatctttatataatacaaatgtcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttattt 2062867  T
Q  392 gctatacaacattaattgctttcaaggaaatttacatgtagttactgatataagaa 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  2062868 gctatacaacattaattgctttcaagaaaatttacatgtagataatgatataagaa 2062923  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 200 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 61025 - 60792
Alignment:
Q  200 cacgtttatattttcaatttagcataactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaattgnnnnnnnggttacatcatcacctttt 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||          ||||||   ||||||||    
T  61025 cacgtttatattttcaatttagtataactattctttcttttctcaataattttacaaattatattaaccaatttgatttta--ttacattgccacctttt 60928  T
Q  300 attatttaaaccaattataatatcacatgtgtc------------atctttatataatacaaatatcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgttt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  60927 attatttaaaccaattataatatcacatgtgtcgtctctatctttatctttatataatacaaatgtcttctttaaaatttaaagtacacataacatgttt 60828  T
Q  388 atttgctatacaacattaattgctttcaaggaaatt 423  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  60827 atttactaaacaacgttaattgcttttaaggaaatt 60792  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 469 - 602
Target Start/End: Original strand, 2062953 - 2063086
Alignment:
Q  469 gtggtgatataagaaa-ggtttaattgcgcttnnnnnnncattgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagtt 567  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  2062953 gtggtgatataagaaaaggtttaattgcgcataaaaaa-cattgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatatttaattaggcagaaaagtc 2063051  T
Q  568 aatggttaagtttcacacacacgtatgcataaaac 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2063052 aatggttaagtttcacacacacgtatgcataaaac 2063086  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 61235 - 61203
Alignment:
Q  24 ttaattgtttcaccatgccataaaaatgtacac 56  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  61235 ttaattgtttcaccatgtcataaaaatgtacac 61203  T

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Target: chr1 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 24 - 397
Target Start/End: Original strand, 15696134 - 15696506
Alignment:
Q  24 ttaattgtttcaccatgccataaaaatgtacacaaatattatgcaagacaatccttatttatttatttctttaattgttgtttgtagatttgggtgatct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15696134 ttaattgtttcaccatgccataaaaatgtacacaaatattatgcaaggcaatccttatttatttatttctttaattgttgtttgtagatttgggtgatcg 15696233  T
Q  124 tgcaagtgaataatgtccatatagaacggcaatttgannnnnnnngttttgatttacatnnnnnnnnntgtgatagcacgtttatattttcaatttagca 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15696234 tgcaagtgaataatgtccatatagaacggcaatttgattttttttgtttcgatttacataaaaaaatatgtgatagcacgtttatattttcaatttagca 15696333  T
Q  224 taactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaattgnnnnnnnggttacatcatcaccttttattatttaaaccaattataatatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15696334 taactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaatt-tttttttggttacatcgtcaccttttattatttaaaccaattataatatc 15696432  T
Q  324 acatgtgtcatctttatataatacaaatatcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttatttgctata 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15696433 acatgtgtcatctttatataataaaaatatcctctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttatttgctata 15696506  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 507 - 602
Target Start/End: Original strand, 15696569 - 15696664
Alignment:
Q  507 cattgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagttaatggttaagtttcacacacacgtatgcataaaac 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15696569 cattgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagtcaatggttaagtttcacacacacgtatgcataaaac 15696664  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 287 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40607745 - 40607688
Alignment:
Q  287 atcatcaccttttattatttaaaccaattataatatcacatgtgtcatctttatataa 344  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  40607745 atcatcatctcttattatttaaagcaattataatgtaacatgtgtcatttttatataa 40607688  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 381 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 36776057 - 36776015
Alignment:
Q  381 catgtttatttgctatacaacattaattgctttcaaggaaatt 423  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  36776057 catgtttatttactaaacaacgttaattgctttcaaggaaatt 36776015  T

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Target: scaffold0283 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0283
Description:

Target: scaffold0283; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 192 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 1095 - 697
Alignment:
Q  192 tgtgatagcacgtttatattttcaatttagcataactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaattgnnnnnnnggttacatcat 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |    
T  1095 tgtgatagcacgtttatattttcaatttagcataactattctttcattcctcaataattttacatactatgttaaccaattattttt---gttacatcgt 999  T
Q  292 caccttttattatttaaaccaattataatatcacatgtgtcatctttatataatacaaatatcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttattt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  998 caccttttattatttaaaccaattataatatcacatgtgtcatctttatataatacaaatgtcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttattt 899  T
Q  392 gctatacaacattaattgctttcaaggaaatttacatgtagttactgatataagaatgtgnnnnnnnnnnnnnnnnngtggtgatataag-aaaggttta 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||                 ||||||||||||| |||||||||    
T  898 gctatacaacattaattgctttcaaggtaatttacatgtagttaccgatataagaaagtg---------ttttttttgtggtgatataagaaaaggttta 808  T
Q  491 attgcgcttnnnnnnncattgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagttaatggttaagtttcacacacacg 590  Q
    ||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  807 attgcgcat-aaaaaacattgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagtcaatggttaagtttcacacacacg 709  T

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Target: chr6 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 24 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15872526 - 15872114
Alignment:
Q  24 ttaattgtttcaccatgccataaaaatgtacacaaatattatgcaagacaatccttatttatttatttctttaattgttgtttgtagatttgggtgatct 123  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15872526 ttaattgtttcaccatgccatataaatgtacacagatgttatgcaaggcaatccttatttatttactactttaattgttatttgtagatttgggtgatct 15872427  T
Q  124 tgcaagtgaataatgtccatatagaacggcaatttga----nnnnnnnngttttgatttacat--nnnnnnnnntgtgatagcacgtttatattttcaat 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||| |||||||||           ||||||||||||||||||||||||||    
T  15872426 tgcaagtgaataatgtccatatagaacggcaatttgatttttttgttttgtttcgatttacataaaaaaatatatgtgatagcacgtttatattttcaat 15872327  T
Q  218 ttagcataactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaattgnnnnnnnggttacatcatcaccttttattatttaaaccaattat 317  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15872326 ttagcataactattctttcactcctcaataattttacatactatgttaagcaatt--ttttttggttacatcgtcaccttttattatttaaaccaattat 15872229  T
Q  318 aatatcacatgtgtc------atctttatataatacaaatatcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttatttgctatacaacattaattgct 411  Q
    |||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15872228 aatatcacatgtgtcatctttatctttatataatacaaatgtcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttatttgctatacaacattaattgct 15872129  T
Q  412 ttcaaggaaatttac 426  Q
    |||||| ||||||||    
T  15872128 ttcaagaaaatttac 15872114  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 508 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 15872050 - 15871956
Alignment:
Q  508 attgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagttaatggttaagtttcacacacacgtatgcataaaac 602  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15872050 attgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagtcaatggttaagtttcatacacacatatgcataaaac 15871956  T

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Target: chr4 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 95 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 53536564 - 53536263
Alignment:
Q  95 taattgttgtttgtagatttgggtgatcttgcaagtgaataatgtccatatagaacggcaatttgannnnnnnngttttgatttacatnnnnnnnnn-tg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||          ||    
T  53536564 taattgttgtttgtagatttgggtgatcttgcaagtgaataatgtccatatagaacggcaatttgattttttttgtttggatttacataaaaaaaatatg 53536465  T
Q  194 tgatagcacgtttatattttcaatttagcataactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaattgnnnnnnnggttacatcatca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||    
T  53536464 tgatagcacgtttatattttcaatttagcataactattctttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaatttttttta--gttacatcgtca 53536367  T
Q  294 ccttttattatttaaaccaattataatatcacatgtgtcatctttatataatacaaatatcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttatttgc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53536366 ccttttattatttaaaccaattataatatcacatgtgtcatctttatataataaaaatgtcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttatttgc 53536267  T
Q  394 tata 397  Q
    ||||    
T  53536266 tata 53536263  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 507 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 53536233 - 53536138
Alignment:
Q  507 cattgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagttaatggttaagtttcacacacacgtatgcataaaac 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53536233 cattgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattagacagaaaagtcaacggttaagtttcacacacacgtatgcataaaac 53536138  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 53536615 - 53536569
Alignment:
Q  24 ttaattgtttcaccatgccataaaaatgtacacaaatattatgcaag 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53536615 ttaattgtttcaccatgccataaaaatgtacacaaatattatgcaag 53536569  T

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Target: chr7 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 45791815 - 45791653
Alignment:
Q  233 tttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaattgnnnnnnnggttacatcatcaccttttattatttaaaccaattataatatcacatgtgtc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45791815 tttcgttcctcaataattttacatactatgttaaccaatt--ttttttggttacatcgtcaccttttattatttaaaccaattataatatcacatgtgtc 45791718  T
Q  333 atctttatataatacaaatatcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttatttgctata 397  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45791717 atctttatataataaaaatgtcttctttaaaatttaaagtacacctaacatgtttatttgctata 45791653  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 507 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 45791576 - 45791481
Alignment:
Q  507 cattgataagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagttaatggttaagtttcacacacacgtatgcataaaac 602  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45791576 cattgataagcaaaacatttttgtttatatattaagaaatgtttaattaggcagaaaagtcaatggttaagtttcacacacacgtatgcataaaac 45791481  T

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Target: scaffold0216 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 514 - 554
Target Start/End: Original strand, 14925 - 14965
Alignment:
Q  514 aagcaaaacgtttttgtttatatattaagaaatgtttaatt 554  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14925 aagcaaaacatttttgtttatatattagaaaatgtttaatt 14965  T

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