View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7170_low_7 (Length: 316)

Name: NF7170_low_7
Description: NF7170
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7170_low_7
NF7170_low_7
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (9-301)||(20351213-20351505)
chr1 (9-301)||(3991362-3991654)
chr1 (9-301)||(38774126-38774418)
chr1 (9-301)||(44467339-44467631)
chr1 (9-301)||(3946473-3946765)
chr1 (9-297)||(29354704-29354992)
chr1 (9-297)||(13631173-13631461)
chr1 (9-297)||(5079692-5079980)
chr1 (10-297)||(12648595-12648882)
chr1 (10-297)||(50115782-50116069)
chr1 (10-291)||(37016669-37016950)
chr1 (9-294)||(51664012-51664297)
chr1 (9-297)||(13175535-13175823)
chr1 (9-297)||(38690958-38691246)
chr1 (9-294)||(36074820-36075106)
chr1 (9-297)||(19497483-19497771)
chr1 (25-203)||(46974934-46975112)
chr1 (211-297)||(46976765-46976851)
chr1 (10-96)||(41455595-41455681)
chr1 (151-297)||(32105687-32105833)
chr1 (151-215)||(27283960-27284024)
chr1 (40-90)||(32105897-32105947)
chr1 (151-209)||(36359603-36359661)
chr1 (239-297)||(25232218-25232273)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (9-301)||(2638-2930)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (9-301)||(34566-34858)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (9-301)||(8421868-8422160)
chr8 (9-301)||(32430877-32431169)
chr8 (9-301)||(7341836-7342128)
chr8 (9-301)||(32376920-32377212)
chr8 (9-301)||(30303622-30303914)
chr8 (10-294)||(43371522-43371806)
chr8 (10-297)||(2145018-2145305)
chr8 (10-297)||(35964765-35965051)
chr8 (61-297)||(43683256-43683492)
chr8 (29-297)||(7169661-7169922)
chr8 (89-297)||(22581991-22582199)
chr8 (87-297)||(22585851-22586062)
chr8 (151-203)||(17317379-17317431)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (9-301)||(30788296-30788588)
chr7 (9-301)||(43622147-43622439)
chr7 (9-301)||(45765136-45765428)
chr7 (9-297)||(18107145-18107433)
chr7 (9-299)||(616763-617053)
chr7 (9-297)||(15067646-15067934)
chr7 (9-297)||(42501164-42501452)
chr7 (27-297)||(47062656-47062926)
chr7 (9-297)||(10707697-10707986)
chr7 (9-267)||(12116418-12116676)
chr7 (10-297)||(8401259-8401546)
chr7 (9-225)||(43826697-43826913)
chr7 (157-297)||(3762832-3762971)
chr7 (263-297)||(12113572-12113606)
chr7 (151-212)||(25569735-25569796)
chr7 (151-212)||(46792245-46792306)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (9-301)||(19071669-19071961)
chr4 (9-297)||(3405547-3405835)
chr4 (10-297)||(4977977-4978264)
chr4 (25-293)||(4769904-4770172)
chr4 (25-297)||(4977524-4977796)
chr4 (9-297)||(38462856-38463144)
chr4 (122-297)||(51643023-51643198)
chr4 (130-294)||(17238850-17239014)
chr4 (193-297)||(9891813-9891917)
chr4 (9-132)||(11503260-11503383)
chr4 (215-297)||(11503387-11503470)
chr4 (151-215)||(13896850-13896914)
chr4 (152-297)||(6183584-6183728)
chr4 (152-209)||(20970619-20970675)
chr4 (163-215)||(17497455-17497507)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (9-301)||(211453-211745)
chr2 (9-301)||(5348924-5349216)
chr2 (9-301)||(10622466-10622758)
chr2 (9-301)||(41561769-41562061)
chr2 (9-301)||(38947520-38947812)
chr2 (9-297)||(7264737-7265025)
chr2 (9-297)||(39795727-39796015)
chr2 (10-297)||(24751417-24751704)
chr2 (10-297)||(27274376-27274663)
chr2 (10-297)||(9655910-9656197)
chr2 (10-297)||(28347416-28347703)
chr2 (24-297)||(24604108-24604380)
chr2 (24-297)||(24940669-24940941)
chr2 (9-297)||(12906511-12906799)
chr2 (25-297)||(45477128-45477400)
chr2 (10-297)||(11691849-11692136)
chr2 (25-294)||(43948305-43948573)
chr2 (9-294)||(41006998-41007283)
chr2 (9-297)||(34919801-34920089)
chr2 (10-253)||(1097889-1098132)
chr2 (9-297)||(437066-437362)
chr2 (130-297)||(3797817-3797984)
chr2 (9-297)||(17996206-17996479)
chr2 (9-134)||(3801745-3801870)
chr2 (151-297)||(25618105-25618251)
chr2 (148-215)||(28422550-28422617)
chr2 (151-297)||(24683970-24684115)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (9-301)||(1610763-1611055)
chr6 (10-297)||(28358076-28358363)
chr6 (25-297)||(31148092-31148364)
chr6 (9-297)||(18607750-18608031)
chr6 (9-297)||(21357369-21357657)
chr6 (9-297)||(23961351-23961639)
chr6 (9-297)||(254427-254715)
chr6 (151-215)||(26684103-26684167)
chr6 (238-297)||(34110720-34110779)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (9-301)||(3950500-3950792)
chr3 (9-301)||(30945654-30945946)
chr3 (9-297)||(8158999-8159287)
chr3 (9-301)||(6742644-6742936)
chr3 (9-297)||(13745737-13746025)
chr3 (10-297)||(36815532-36815819)
chr3 (9-297)||(16446377-16446665)
chr3 (10-297)||(14400315-14400602)
chr3 (10-297)||(48248885-48249172)
chr3 (10-297)||(46991264-46991552)
chr3 (10-297)||(21954258-21954545)
chr3 (16-297)||(29949745-29950026)
chr3 (16-297)||(29998899-29999180)
chr3 (27-297)||(6503974-6504244)
chr3 (25-297)||(77039-77311)
chr3 (16-116)||(7839356-7839456)
chr3 (148-212)||(4511042-4511106)
chr3 (151-207)||(40467293-40467349)
chr3 (151-214)||(8118509-8118572)
chr3 (149-196)||(24148288-24148335)
chr3 (151-212)||(2284136-2284197)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (9-293)||(28884458-28884742)
chr5 (16-301)||(37818889-37819174)
chr5 (9-297)||(38858206-38858494)
chr5 (10-297)||(27865861-27866148)
chr5 (9-297)||(11031468-11031756)
chr5 (16-294)||(13566126-13566404)
chr5 (9-297)||(7019982-7020270)
chr5 (10-297)||(25895113-25895400)
chr5 (10-305)||(1037109-1037404)
chr5 (25-297)||(7799034-7799306)
chr5 (16-297)||(4198922-4199203)
chr5 (10-221)||(34079538-34079749)
chr5 (9-258)||(18536395-18536643)
chr5 (49-295)||(20288065-20288311)
chr5 (148-213)||(25054192-25054257)
chr5 (151-212)||(27012749-27012810)
chr5 (151-212)||(11820136-11820197)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (9-297)||(15373-15661)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (149-214)||(2101-2166)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (157-215)||(1168-1226)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 20351213 - 20351505
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351213 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 20351312  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20351313 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtattgcatcttggttgcaggacca 20351412  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351413 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 20351505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 3991362 - 3991654
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3991362 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 3991461  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3991462 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 3991561  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3991562 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 3991654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 38774418 - 38774126
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774418 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 38774319  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774318 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 38774219  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774218 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 38774126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 44467339 - 44467631
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467339 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 44467438  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467439 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 44467538  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467539 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 44467631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3946765 - 3946473
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3946765 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 3946666  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3946665 tcaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatagacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 3946566  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3946565 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgagagaaaatacatcaca 3946473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29354992 - 29354704
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29354992 gaagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 29354893  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29354892 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 29354793  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29354792 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 29354704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 13631173 - 13631461
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13631173 gaagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatattcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 13631272  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13631273 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 13631372  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13631373 caaacagagtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgctgggagaaaatacat 13631461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 5079692 - 5079980
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079692 gaagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 5079791  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5079792 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgaaggcatggacagaccatgtgttgcatctaggttgcaggacca 5079891  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079892 caaacaaggtcgaatcggctcatgctttgttgaagaaataattggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 5079980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12648882 - 12648595
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12648882 aagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 12648783  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12648782 caatttttgaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattatgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 12648683  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12648682 gaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 12648595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 50116069 - 50115782
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  50116069 aagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttctaagattcatttagtgatttcc 50115970  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50115969 caatttttttatattatgtcatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacataccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 50115870  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     ||||||||||| | | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50115869 taacagggtcgatttgtctcatgcttttttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 50115782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 291
Target Start/End: Original strand, 37016669 - 37016950
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |    
T  37016669 aagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcagcagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgcagtaattttc 37016768  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    |||||||   | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016769 caattttcaaaaattatgtcatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgttagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 37016868  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaa 291  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37016869 caacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgagtgatttgggtacttgttgggagaaa 37016950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 294
Target Start/End: Original strand, 51664012 - 51664297
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51664012 gaagaagataatgatggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttc 51664111  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||| ||||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51664112 ccacttttcaaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgaaggcatggacaaaccatatgttgcatcttggttgcaggacca 51664211  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 294  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51664212 ctaacagggtcgaatcggctcatgctttattggataaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 51664297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 13175535 - 13175823
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13175535 gaagaagataatgagggcatggaaaactatggttgaatcgtccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttc 13175634  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||| ||||   | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13175635 ccacttttccaaaattatgcaatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaagacca 13175734  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
      ||||||||||||   || ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13175735 tcaacagggtcgaactagctcatgctttagtgaagaaatatttggacaatggtgtgagtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 13175823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38691246 - 38690958
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  38691246 gaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaagagttatttgcaaatgcattagtggagttccaagattcatttagtgatttc 38691147  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||| ||||   | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691146 ccacttttcaaaaattatgtcatgaccaccttgaatgaagtgaaggaaaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 38691047  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    | ||||| || |||| ||| |||| | | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691046 ccaacagagtagaataggctcatgttctatggaagaaatattttgacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 38690958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36075106 - 36074820
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  36075106 gaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaattgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtggtaatttc 36075007  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||| ||||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  36075006 ccacttttccaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgcgttgcatctatgttgcaggacca 36074907  T
Q  209 caaacaggg-tcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 294  Q
    | ||||||| |  ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36074906 ccaacagggataaaatcggctcatgctttagtgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 36074820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19497771 - 19497483
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||  ||||| |||  |||||||||||| | || |||| | ||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  19497771 gaagaagataatgagggcatgaaaagttatggttgaatcgcacactcaagagttatatggaaatgcattagtggagttcctagatgcatgtagtgatttc 19497672  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||| ||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19497671 ccacttttcctaaattatgccatgaccaccttgaaagaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttggtggcagaacca 19497572  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    | |||||||| |||| ||| ||||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19497571 ccaacagggtagaataggctcatgctttagtaaagaaatttttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 19497483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Original strand, 46974934 - 46975112
Alignment:
Q  25 gcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagatt 124  Q
    |||||||||  |||||||||| | |||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | |||    
T  46974934 gcatggaaagttatggttgaaacgcccactcaagagttatttgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcccacttttcaaaaatt 46975033  T
Q  125 atgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcag 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46975034 atgccatgaccaccttgaatgaagtgaagaagaaaatagtgagggcatggatagaccatgtgttgcatcttggttgcag 46975112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 211 - 297
Target Start/End: Original strand, 46976765 - 46976851
Alignment:
Q  211 aacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46976765 aacaaggtagaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 46976851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 96
Target Start/End: Original strand, 41455595 - 41455681
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattca 96  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455595 aagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattca 41455681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32105833 - 32105687
Alignment:
Q  151 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatact 250  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || |||  ||| |||||| |  | |||||||| |    
T  32105833 aaggacgaaatagtgagggcatggacatatcatgtcttgcatcttggatacagaaccaccaacagagttgaaggggctcatgctataataaagaaatatt 32105734  T
Q  251 tggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     |  ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  32105733 cgagcaataatgtgggtgatttgggtacttgctgagagaaaatacat 32105687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Original strand, 27283960 - 27284024
Alignment:
Q  151 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacag 215  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  27283960 aaggacaaattagtgagggcatggacggaccttgtgttacatcttgggtgcaggaccacgaacag 27284024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 32105947 - 32105897
Alignment:
Q  40 gttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaa 90  Q
    |||||||| ||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32105947 gttgaatcacccacacaagaattatatgcaattgcattagtggagttcaaa 32105897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36359661 - 36359603
Alignment:
Q  151 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  36359661 aaggacaaactagtgagggcatggacggaccttgtgttacatcttgggtgtaggaccac 36359603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 297
Target Start/End: Original strand, 25232218 - 25232273
Alignment:
Q  239 tgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  25232218 tgaagaaatatttgagcaatagtgtggatgatttgggtac---ttgggagaaaatacat 25232273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 2638 - 2930
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2638 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 2737  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2738 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 2837  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2838 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 2930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 34566 - 34858
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 34665  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34666 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 34765  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34766 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 34858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8422160 - 8421868
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422160 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 8422061  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422060 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 8421961  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8421960 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 8421868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 32431169 - 32430877
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431169 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 32431070  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431069 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 32430970  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32430969 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 32430877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 7341836 - 7342128
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341836 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 7341935  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341936 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 7342035  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7342036 caaacaaggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 7342128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 32377212 - 32376920
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377212 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 32377113  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377112 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 32377013  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377012 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 32376920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30303914 - 30303622
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30303914 gaagaagataatgaacgcatggaaagttatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgtattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 30303815  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30303814 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 30303715  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30303714 aaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 30303622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 294
Target Start/End: Original strand, 43371522 - 43371806
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43371522 aagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcc 43371621  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    || ||||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43371622 cacttttcaaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggaaaaaattgtgagggcatggagagaccatgtgatgcatcttggttgcaggaccac 43371721  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 294  Q
     || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43371722 caatagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttggaagaaaata 43371806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2145305 - 2145018
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||  |||| | || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2145305 aagaagataatgagggaatggaaagctatggttgaattgcccacttaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcc 2145206  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    || ||||   | |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145205 cacttttcaaaaattatgtcatgaccaccttgaatgcagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 2145106  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2145105 caacatggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttaggtacttgttgggagaaaatacat 2145018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35965051 - 35964765
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  35965051 aagaagataatgagggcatgaaaagctatggttgaatcgtccactcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgattttc 35964952  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    |||||||   | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  35964951 caattttcaaaaattatgtcatgatcaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttgatttcaggaccac 35964852  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     |||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35964851 gaaca-ggtcgaatcagctcatgctttattgaagaaatactttgacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 35964765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 61 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 43683492 - 43683256
Alignment:
Q  61 ttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43683492 ttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcccacttttcaaaaattaagtcatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaa 43683393  T
Q  161 ttgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatag 260  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43683392 tagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcatgacaaccaacagggtcgaatctgcttatgctttattgaagaaatatttggacaatag 43683293  T
Q  261 tgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43683292 tgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 43683256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 297
Target Start/End: Original strand, 7169661 - 7169922
Alignment:
Q  29 ggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgc 128  Q
    ||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  || |||||||    
T  7169661 ggaaagctatggttgaatcgcacactcaataattatatgcaaatgcattagtggagttccaagatacatgtaatgatttcccaattttcttaaattatgc 7169760  T
Q  129 catgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcc 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||      ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||     
T  7169761 catgaccaccttggaagaagtgaaggagaaaatagtgagggcat------acc-tgggttgcatcttggttgcagaaccaccaacagggtagaatcggct 7169853  T
Q  229 catgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7169854 catgctttagtaaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 7169922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 89 - 297
Target Start/End: Original strand, 22581991 - 22582199
Alignment:
Q  89 aagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgtt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22581991 aagattcatgtagtgatttcccaattttcctaaattatgccatgactaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacataccatgtgtt 22582090  T
Q  189 gcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggag 288  Q
    |||||||| |||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22582091 gcatcttgtttgcagaatcaccaacagggtagaatcggctcatgctttagtaaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggag 22582190  T
Q  289 aaaatacat 297  Q
    |||||||||    
T  22582191 aaaatacat 22582199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 87 - 297
Target Start/End: Original strand, 22585851 - 22586062
Alignment:
Q  87 caaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtg 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22585851 caaagattcatgtagtgatttcccaattttcctaaattatgccatgactaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacataccatgtg 22585950  T
Q  187 ttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtac-ttgttgg 285  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22585951 ttgcatcttggttgcagaatcaccaacagggtagaatcggctcatgctttagtaaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtactttgttgg 22586050  T
Q  286 gagaaaatacat 297  Q
    ||||||||||||    
T  22586051 gagaaaatacat 22586062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 203
Target Start/End: Original strand, 17317379 - 17317431
Alignment:
Q  151 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcag 203  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  17317379 aaggaaaaaatagtgagggcatggacataccgtgtgttgcatcttgggtgcag 17317431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 30788296 - 30788588
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788296 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 30788395  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788396 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 30788495  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788496 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 30788588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 43622439 - 43622147
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622439 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 43622340  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622339 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 43622240  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622239 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 43622147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 45765136 - 45765428
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45765136 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 45765235  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45765236 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 45765335  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45765336 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 45765428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 18107145 - 18107433
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18107145 gaagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 18107244  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18107245 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 18107344  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18107345 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 18107433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 9 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 617053 - 616763
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617053 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatcgcccacttaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 616954  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  616953 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 616854  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatca 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  616853 caaatagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatca 616763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 15067646 - 15067934
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067646 gaagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 15067745  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067746 ccaatttttttagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 15067845  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067846 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtggatgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 15067934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 42501164 - 42501452
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42501164 gaagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 42501263  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42501264 ccaatttttgtagattataccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcatgacca 42501363  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42501364 caaacatggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 42501452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 297
Target Start/End: Original strand, 47062656 - 47062926
Alignment:
Q  27 atggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattat 126  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||    
T  47062656 atggaaagctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccacttttcaataattat 47062755  T
Q  127 gccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcgg 226  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47062756 gtcatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatcgg 47062855  T
Q  227 cccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47062856 ctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtaggtgatttgggtacttgttggaagaaaatacat 47062926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10707986 - 10707697
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10707986 gaagaagataatgaaggcatggaatgctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttc 10707887  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||| ||||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  10707886 ccacttttccaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgcgttgcatctatgttgcaggacca 10707787  T
Q  209 caaacaggg-tcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    | ||||||| |  ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10707786 ccaacagggataaaatcggctcatgctttagtgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 10707697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12116676 - 12116418
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||| |||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12116676 gaagaagataatgagggcatagaaagctatggttgaatcgcccactcaagagttatttgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtggtgatttc 12116577  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||| ||||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12116576 ccacttttcaaacattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgctgcatcttggttgcaggacca 12116477  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggt 267  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12116476 ctaacagggtagaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggt 12116418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Original strand, 8401259 - 8401546
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |    
T  8401259 aagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagatttttgtagtgattttc 8401358  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    || ||||  || | |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8401359 cacttttcctaaagtatgtcatgaccaccttgaatgaaatgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcagaaccac 8401458  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     |||| ||| ||||| || ||||||||  | | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8401459 caacatggtagaatcagctcatgctttagtaatgaaatatttggacaatagtgtgggtgatttggatacttgttgggagaaaatacat 8401546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43826913 - 43826697
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  43826913 gaagaagataatgaatgcatggaaagttatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagatgtttgtagtgatttc 43826814  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||  ||||  || | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |    
T  43826813 ccgcttttcctaaagtatgccatgaccgccttgaatgaagtgaaggagaaaatagcgagggcatggacagaccatgcgttgcatcttggttgtagaacta 43826714  T
Q  209 caaacagggtcgaatcg 225  Q
    | |||||||| ||||||    
T  43826713 ccaacagggtagaatcg 43826697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 297
Target Start/End: Original strand, 3762832 - 3762971
Alignment:
Q  157 aaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggaca 256  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || | |  ||| |||| |  |||||||||||| |||  ||    
T  3762832 aaaatagtgggggcatggtcagaccatgtcttgcatcttggctgcagaaccaccaacacagttgtaggggctcatggtaggttgaagaaatatttgagca 3762931  T
Q  257 atagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  3762932 ctagtgtggatgactt-ggtacttgttgggataaaatacat 3762971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12113606 - 12113572
Alignment:
Q  263 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12113606 tgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 12113572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25569796 - 25569735
Alignment:
Q  151 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaa 212  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| | |||||||| || |||||||||||    
T  25569796 aaggacaaactagtgagggcatggacggaccttgtgctacatcttgggtgtaggaccacaaa 25569735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 212
Target Start/End: Original strand, 46792245 - 46792306
Alignment:
Q  151 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaa 212  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| | |||||||| || |||||||||||    
T  46792245 aaggacaaactagtgagggcatggacggaccttgtgctacatcttgggtgtaggaccacaaa 46792306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19071961 - 19071669
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19071961 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 19071862  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19071861 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 19071762  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19071761 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 19071669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 3405547 - 3405835
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405547 gaagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcgacagttatatccaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 3405646  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405647 ccaatttttgtagattatgtcatgactaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 3405746  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405747 caaatagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 3405835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4978264 - 4977977
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4978264 aagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagtttcaagattcatgtagtgatttcc 4978165  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    || ||||   | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4978164 cacttttcaaaaattatgacatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattttgagggcatggacagaccatgtgatgcatcttggttgcaggaccac 4978065  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4978064 cagcagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaagtatttggtcaatagtgtgagtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 4977977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 293
Target Start/End: Original strand, 4769904 - 4770172
Alignment:
Q  25 gcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagatt 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||   | |||    
T  4769904 gcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaagatttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattaatgtagtgatttcccacttttccaaaatt 4770003  T
Q  125 atgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatc 224  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4770004 atgtcatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacaaggtcgaatc 4770103  T
Q  225 ggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaat 293  Q
    ||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4770104 ggctcatgctttagtgaagaaatatttggacaacagtgtgggtgatttggatacttgttgggagaaaat 4770172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 4977524 - 4977796
Alignment:
Q  25 gcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagatt 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||   | |||    
T  4977524 gcatggaaagctatggttgaatcggccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaatattcatgtagtgatttctcacttttaaaaaatt 4977623  T
Q  125 atgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatc 224  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4977624 atgtcatgaccaccttgaatgaagtgaatgacaaaattgtgagggcatggacagactgtgtgatgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatc 4977723  T
Q  225 ggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4977724 ggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtatgggtgatttgtgtacttgttgggagaaaatacat 4977796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38463144 - 38462856
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||  ||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38463144 gaagaagataatgagggcatgaaaagctatggtcgaattgcccactcaagagttatatgcaaatgcatcagtggagttccaaaattcatgtagtgatttc 38463045  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
     || ||||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38463044 tcacttttcaaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 38462945  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
      |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38462944 gcaacatggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtactttttgggagaaaatacat 38462856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 122 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 51643198 - 51643023
Alignment:
Q  122 attatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcga 221  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  51643198 attatgccatgaccaccttaaatgaaatgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagagtaga 51643099  T
Q  222 atcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51643098 atcgactcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtaggtgatttgtgtacttgttgggagaaaatacat 51643023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17239014 - 17238850
Alignment:
Q  130 atgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggccc 229  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |    
T  17239014 atgaccaccttgaaagaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacagggtagaatcggctc 17238915  T
Q  230 atgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 294  Q
    |||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17238914 atgctttagtaaagaaatatttggacaatagcgtgggtgttttgggtacttgttgggagaaaata 17238850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 193 - 297
Target Start/End: Original strand, 9891813 - 9891917
Alignment:
Q  193 cttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891813 cttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaa 9891912  T
Q  293 tacat 297  Q
    |||||    
T  9891913 tacat 9891917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 132
Target Start/End: Original strand, 11503260 - 11503383
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11503260 gaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgaaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagcgatttc 11503359  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatg 132  Q
    ||| ||||   | |||||||||||    
T  11503360 ccacttttcaaaaattatgccatg 11503383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 297
Target Start/End: Original strand, 11503387 - 11503470
Alignment:
Q  215 gggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttg-ttgggagaaaatacat 297  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11503387 gggtcgaatcagctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgtttgggagaaaatacat 11503470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13896914 - 13896850
Alignment:
Q  151 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacag 215  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  13896914 aaggaaaaaattgtgaaggcatggacataccgtgtgttgcatcttggctgcagaaccaccaacag 13896850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 297
Target Start/End: Original strand, 6183584 - 6183728
Alignment:
Q  152 aggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatactt 251  Q
    |||| ||||| |||| |||||| ||| ||  ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||  ||| |||| | |  |||||||||| ||    
T  6183584 aggagaaaatagtgacggcatgaacaaactgtgtcttgcatcttggttacagaaccactaacagagttgaaa-ggctcatggtatagtgaagaaatattt 6183682  T
Q  252 ggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |  ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6183683 gagcaatagtgctggtgatttggatgcttgttgggagaaaatacat 6183728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20970675 - 20970619
Alignment:
Q  152 aggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20970675 aggacaaaatagtgagg-catggacataccttgtgttgcatcttgggtgcaggaccac 20970619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 215
Target Start/End: Original strand, 17497455 - 17497507
Alignment:
Q  163 gtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacag 215  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  17497455 gtgagggcatggacataccttgtgttacatcttgggtgcaggaccacgaacag 17497507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 211745 - 211453
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211745 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 211646  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211645 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 211546  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211545 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 211453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 5348924 - 5349216
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348924 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 5349023  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5349024 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 5349123  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5349124 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 5349216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10622758 - 10622466
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622758 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 10622659  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622658 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 10622559  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622558 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 10622466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 41561769 - 41562061
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561769 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 41561868  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561869 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 41561968  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561969 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 41562061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 38947520 - 38947812
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947520 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatcgcccaatcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 38947619  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947620 ccaatttttgtagattatgccatgaacaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacaaaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 38947719  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947720 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 38947812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 7264737 - 7265025
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264737 gaagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 7264836  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264837 tcaatttttgtagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 7264936  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264937 caaacaaggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 7265025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 39795727 - 39796015
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795727 gaagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaatagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 39795826  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39795827 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagagcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtaggacca 39795926  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795927 caaacagagtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 39796015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Original strand, 24751417 - 24751704
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24751417 aagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 24751516  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24751517 caatttttgaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 24751616  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24751617 gaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 24751704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27274663 - 27274376
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274663 aagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 27274564  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274563 caatttttgaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 27274464  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274463 gaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 27274376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Original strand, 9655910 - 9656197
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9655910 aagaagataatgacggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcc 9656009  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    || ||||   | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9656010 cacttttcaaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaagacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtaggaccac 9656109  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9656110 caacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgagtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 9656197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28347703 - 28347416
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28347703 aagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgaattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcc 28347604  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    || ||||   | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28347603 cacttttcaaaaattatgtcatgaccaccttgaatgaattgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtcttgcatcttggttgcaggaccac 28347504  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28347503 caatagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 28347416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24604380 - 24604108
Alignment:
Q  24 cgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagat 123  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||   | ||    
T  24604380 cgcatgcaaagctatgattgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagttatttcccacttttcaaa-at 24604282  T
Q  124 tatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaat 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24604281 tatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgatgcatcttggttgcaggactaccaacagggtcgaat 24604182  T
Q  224 cggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24604181 cggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 24604108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 24 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24940941 - 24940669
Alignment:
Q  24 cgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagat 123  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||   | ||    
T  24940941 cgcatgcaaagctatgattgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagttatttcccacttttcaaa-at 24940843  T
Q  124 tatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaat 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24940842 tatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgatgcatcttggttgcaggactaccaacagggtcgaat 24940743  T
Q  224 cggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24940742 cggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 24940669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12906799 - 12906511
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12906799 gaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcctactcaagagttatatgcaaatgcattggtggagttccaagattcatgtagtgatttc 12906700  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||| ||||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12906699 ccacttttccaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacatatcatgtgttgcatcttggttgcaggacca 12906600  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    | |||||||| |||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12906599 ccaacagggttgaatcggctcatgttttagtgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 12906511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 45477128 - 45477400
Alignment:
Q  25 gcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagatt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   | |||    
T  45477128 gcatggaaaactatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttctcacttttccaaaatt 45477227  T
Q  125 atgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatc 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45477228 atgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagcgagggcatggatagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatc 45477327  T
Q  225 ggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45477328 ggctcatgctttagtgaataaatatttggaaaatagtgtgggtgatttgggtacttgtttggagaaaatacat 45477400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11692136 - 11691849
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||  |||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||   |||||||||||||    
T  11692136 aagaagataatgagagcatggaaagttatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagctccaagatgtttgtagtgatttcc 11692037  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    || ||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692036 cacttttcctaaagtatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagttagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 11691937  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11691936 caacagggtagaatcggctcatgctttagtgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 11691849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43948573 - 43948305
Alignment:
Q  25 gcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagatt 124  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||   | |||    
T  43948573 gcatggaaagttatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatatagtgattctccacttttcaaa-att 43948475  T
Q  125 atgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatc 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43948474 atgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatc 43948375  T
Q  225 ggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 294  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43948374 ggctcatgctttattgaagaaatatttgggcaatagtgtgggtgatttgggtacttgttaggagaaaata 43948305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41007283 - 41006998
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||    
T  41007283 gaagaagataatgaggacatgaaaaactatggttgaatcgcccactcaagagttatatgtaaatgcattagtggagttccaagattcatgatgtgttttc 41007184  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||| ||||   | |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41007183 ccacttttcaaaaattatgccataatcaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggatca 41007084  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 294  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007083 ccaacagggttgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 41006998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34920089 - 34919801
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  34920089 gaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaaaagttatatgcaaatgtattagtggagttccaagattcatgcagtgatttt 34919990  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||| ||||   | |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34919989 ccacttttccaaaattatgtcatgaccatattgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagagcatggacagaccatgcgttgcatcttggttgcaggacca 34919890  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34919889 ccaacagggtagaatcggctcatgctttagtgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 34919801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1098132 - 1097889
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1098132 aagaagataatgagggcatggaaaactatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattaatggagttccaagattcatgtagtgatttcc 1098033  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    |||||||   | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098032 caattttcaaaaattatgtcatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattggtagggcatggatagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 1097933  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttgg 253  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  1097932 caacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttgg 1097889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 437066 - 437362
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgc--------aaatgcattagtggagttcaaagattcatgta 100  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  437066 gaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaataatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgta 437165  T
Q  101 gtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttg 200  Q
    ||||||||||| ||||   | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  437166 gtgatttcccacttttcaaaaattatgtcatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacatatcatgtgttgcatcttggttg 437265  T
Q  201 caggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||  | |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  437266 caggaccaccaacatggttgaatcttctcatgttttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 437362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 130 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3797984 - 3797817
Alignment:
Q  130 atgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggccc 229  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  3797984 atgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatctaggttgcaggaccacaaacagagtcgaatcggctc 3797885  T
Q  230 atgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3797884 atgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 3797817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17996479 - 17996206
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||| || | ||||||||||||| |||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||   ||||||||||||    
T  17996479 gaagaagataacgagcacatggaaaactattgttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattattggagttccaagatgtttgtagtgatttc 17996380  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  17996379 ccaattttcctaacctatgccatgaccaccttggatgaagtgaagg---------------catggacagaccatgtgttgcatcttgattgcagaacga 17996295  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    | ||| |||| |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17996294 ccaaccgggtagaatcggctcatgctttagtaaagaaatatttggacaataatgtgggtgatttgggtactttttgggagaaaatacat 17996206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 3801870 - 3801745
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3801870 gaagaagataatgaaggcatggaaatctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 3801771  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgac 134  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3801770 ccaatttttgtagattatgtcatgac 3801745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 151 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25618251 - 25618105
Alignment:
Q  151 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatact 250  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||  | |||| ||| |    
T  25618251 aaggataaaatagtgagggcatggaaagaccatgtgttgcatcttggctgcataaccaccaacagagttgaatcagctcatactttagtaaagatatatt 25618152  T
Q  251 tggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25618151 tgagtaatagtgtgggtgatctgggtacttgttgggagaaaatacat 25618105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28422617 - 28422550
Alignment:
Q  148 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacag 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  28422617 gtgaaggacaaaatagtgagggcatggatagaccttgtgttacatcttgggtgtaggaccacaaacag 28422550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 297
Target Start/End: Original strand, 24683970 - 24684115
Alignment:
Q  151 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatact 250  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||  ||| |||| |   ||||||||||| |    
T  24683970 aaggaaaaaatagtgagggcatggacacaccgtgtcttgcatcttagttgcagaaccacaaacaaagttgaaggggctcatggtaaattgaagaaatatt 24684069  T
Q  251 tggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||  ||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||| |||||||||    
T  24684070 tgagcaatagtgtggatgatttaagta-ttgttaggataaaatacat 24684115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1611055 - 1610763
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611055 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 1610956  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1610955 ccaatttttgtagattatgtcatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 1610856  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1610855 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 1610763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Original strand, 28358076 - 28358363
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358076 aagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgtccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 28358175  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358176 caatttttgtagattatgtcatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 28358275  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358276 aaacagggtcgaatcgactcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 28358363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Original strand, 31148092 - 31148364
Alignment:
Q  25 gcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagatt 124  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   | | |    
T  31148092 gcatggaaagctatagttgaatcgcccactcgacagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgattttccaattttcaaaaaat 31148191  T
Q  125 atgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatc 224  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31148192 atgtcatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaagagggtcgaatc 31148291  T
Q  225 ggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     || || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31148292 agctcacgatttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 31148364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 18607750 - 18608031
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18607750 gaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcacccaatcaagagttatatggaaatgcattagtggagttagaagattcatgtagtgatttc 18607849  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||| ||||   | |||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607850 ccacttttcaaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaagga-------gtgagggcatgaacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 18607942  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607943 ccaactgggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 18608031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21357657 - 21357369
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| | || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21357657 gaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcacactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagatgcatgtagtgatttc 21357558  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||| ||||  || |||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21357557 ccacttttcctaaattatgccatgaccaccttgaaagaagtgaaagagaaaatagtgagggcatggacataccatgtgttgcatcttggctgcagaacca 21357458  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21357457 ccaacagggtagaatcggctcatgctttaggaaagaaatatttggacaataatgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 21357369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23961639 - 23961351
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| | || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23961639 gaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcacactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagatgcatgtagtgatttc 23961540  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||| ||||  || |||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23961539 ccacttttcctaaattatgccatgaccaccttgaaagaagtgaaagagaaaatagtgagggcatggacataccatgtgttgcatcttggctgcagaacca 23961440  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23961439 ccaacagggtagaatcggctcatgctttaggaaagaaatatttggacaataatgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 23961351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 254715 - 254427
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||  |||||| ||  ||| |||||||| |||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||||| || ||   |||  ||||||     
T  254715 gaagaagataatgagagcatgggaagttattgttgaatcacccattcaaaaattaaatgaaagtgcattagtggagttccaaaatgtttgtcatgatttt 254616  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||  ||| ||   || |||||| ||||||||||||  || ||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  254615 ccaaagtttataacctaggccatggccaccttggatgttgttaaggagaaaataatgagagcatggacagactatgtgttgcatcttggatgcagaacca 254516  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    | |||| ||| |||| ||| |||||| |  | || ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254515 ccaacaaggtagaattggctcatgctatagtaaataaatatttgagcaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 254427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26684167 - 26684103
Alignment:
Q  151 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacag 215  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  26684167 aaggacaaaataatgagggcatggacagaccttgtgttacatcttgggtgcaggaccacgaacag 26684103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34110779 - 34110720
Alignment:
Q  238 ttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34110779 ttgaagaaatatttgagcaatagtgtggatgatttggatacttgttgggagaaaatacat 34110720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 3950500 - 3950792
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950500 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 3950599  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950600 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 3950699  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950700 caaacaaggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 3950792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30945946 - 30945654
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945946 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 30945847  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945846 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 30945747  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945746 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatactttgacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 30945654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8159287 - 8158999
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159287 gaagaagataatgaacgcatggaaagctatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 8159188  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159187 tcaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 8159088  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159087 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 8158999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 301
Target Start/End: Original strand, 6742644 - 6742936
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742644 gaagaagataatgaacgcatggaaaattatggttgaatctcctaatcaataattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 6742743  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742744 ccaatttttgtagattatgccatgaccatcttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 6742843  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742844 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 6742936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13746025 - 13745737
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746025 gaagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 13745926  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13745925 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 13745826  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13745825 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 13745737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36815819 - 36815532
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36815819 aagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 36815720  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36815719 caatttttgtagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 36815620  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36815619 aaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 36815532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 16446377 - 16446665
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446377 gaagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatattcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 16446476  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446477 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 16446576  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16446577 caaacagagtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgctgggagaaaatacat 16446665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Original strand, 14400315 - 14400602
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14400315 aagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcacccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 14400414  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14400415 caatttttgaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattatgagggcatagaaagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 14400514  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14400515 gaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 14400602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 48249172 - 48248885
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48249172 aagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcacccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcc 48249073  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    |||||||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249072 caattttcaaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacataccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 48248973  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48248972 gaacaaggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttggatacttgttgggagaaaatacat 48248885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 46991552 - 46991264
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46991552 aagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattaatggagttccaagattcatgtagtgatttcc 46991453  T
Q  110 caatttttgtaga-ttatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    |||||||   | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991452 caattttaaaaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaattgtgagggcatggacaggccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 46991353  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991352 cgaacagggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 46991264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21954545 - 21954258
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21954545 aagaacataatgagagcatggaaagctattgttgaatcgcccactcaacatttatatgcaattgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcc 21954446  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    |||||||   | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21954445 caattttcaaaaattataccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgaaggaccac 21954346  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21954345 aaacagagtcgaatcggcacatgctttattgaagaaataattggacaataatgtgagtaatttgggtacttgttgggagaaaatacat 21954258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 297
Target Start/End: Original strand, 29949745 - 29950026
Alignment:
Q  16 ataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaattt 115  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29949745 ataatgagggcatggaaatctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttctaagattcatgtagtgatttcccacttt 29949844  T
Q  116 ttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacag 215  Q
    |   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  29949845 tcaaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtagggccaccaacag 29949944  T
Q  216 ggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29949945 ggttgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggcacttgttgggagaaaatacat 29950026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 297
Target Start/End: Original strand, 29998899 - 29999180
Alignment:
Q  16 ataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaattt 115  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29998899 ataatgagggcatggaaatctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttctaagattcatgtagtgatttcccacttt 29998998  T
Q  116 ttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacag 215  Q
    |   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  29998999 tcaaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtagggccaccaacag 29999098  T
Q  216 ggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29999099 ggttgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggcacttgttgggagaaaatacat 29999180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 27 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6504244 - 6503974
Alignment:
Q  27 atggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattat 126  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||    
T  6504244 atggaaatctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcctaattttaaaaaattat 6504145  T
Q  127 gccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcgg 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| ||    
T  6504144 gccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatagacataccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaacaacaggttcaaattgg 6504045  T
Q  227 cccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504044 ctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagagtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 6503974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 77311 - 77039
Alignment:
Q  25 gcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagatt 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  |||  || | |    
T  77311 gcatggaaagctatggttgaatctcccactcaagagttatatgtaaatgcattagtggagttccaagatgcttgtagtgatttcccacctttcctaaagt 77212  T
Q  125 atgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatc 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  77211 atgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacataccgtgtgttgcatcttggttgcagaaccaccaacagggtagaatc 77112  T
Q  225 ggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77111 ggctcatgctttagtaaagaaatatttggacaatagtgcgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 77039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 116
Target Start/End: Original strand, 7839356 - 7839456
Alignment:
Q  16 ataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaattt 115  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7839356 ataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcccagtcaagagttttatgcaaatgcattagtggagttccaagattcatgtagtgatttcccacttt 7839455  T
Q  116 t 116  Q
    |    
T  7839456 t 7839456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 4511042 - 4511106
Alignment:
Q  148 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4511042 gtgaaggacaaaatagtgagagcatggacagactttctgttacatcttgggtgcaggaccacaaa 4511106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40467349 - 40467293
Alignment:
Q  151 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacc 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||    
T  40467349 aaggacaaaatagtgagggcatggacggaccttgtgttacatcttgggtgtaggacc 40467293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 214
Target Start/End: Original strand, 8118509 - 8118572
Alignment:
Q  151 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaaca 214  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8118509 aaggaaaaaatagtgagggcatgggcataccttgtattgcatcttggatgcaggaccaccaaca 8118572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 196
Target Start/End: Original strand, 24148288 - 24148335
Alignment:
Q  149 tgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttg 196  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24148288 tgaaggaaaaaattgtgagagcatggacataccatgtgatgcatcttg 24148335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2284197 - 2284136
Alignment:
Q  151 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaa 212  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| | |||||||| || |||||||||||    
T  2284197 aaggacaaactagtgagggcatggacggaccttgtgctacatcttgggtgtaggaccacaaa 2284136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28884742 - 28884458
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28884742 gaagaagataatgaaggcatggaaaactatggttgaatcgcccactcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtattgatttc 28884643  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884642 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 28884543  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaat 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884542 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaat 28884458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 37819174 - 37818889
Alignment:
Q  16 ataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaattt 115  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819174 ataatgaagacatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaattt 37819075  T
Q  116 ttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacag 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819074 ttgtagattatgccatgaacaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacag 37818975  T
Q  216 ggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37818974 ggtcgaatcggctcatgctttgttgaagaaatacttggaaaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcaca 37818889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38858494 - 38858206
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858494 gaagaagataatgaaggcatgaaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 38858395  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38858394 ccaatttttgtagattatgtcatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtaggacca 38858295  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858294 caaacagagtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 38858206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27866148 - 27865861
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866148 aagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 27866049  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27866048 caatttttgtagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttagttgcaggaccac 27865949  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27865948 aaacagggtcaaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 27865861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11031756 - 11031468
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11031756 gaagaagataatgaagacatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 11031657  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11031656 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggaaaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgtaggacca 11031557  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11031556 caaacagagtcaaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 11031468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13566404 - 13566126
Alignment:
Q  16 ataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaattt 115  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13566404 ataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgaaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccatttt 13566305  T
Q  116 ttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacag 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566304 ttgtagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacag 13566205  T
Q  216 ggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 294  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566204 ggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaata 13566126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7020270 - 7019982
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020270 gaagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacggttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 7020171  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020170 ccaatttcggtagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 7020071  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020070 caaacagggtcgaatcggctcatgcattattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 7019982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 10 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25895400 - 25895113
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895400 aagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcggccactcaacatttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 25895301  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895300 caatttttgaaaattatgccatgactaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 25895201  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
     |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25895200 gaacatggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtagttgttgggagaaaatacat 25895113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 305
Target Start/End: Original strand, 1037109 - 1037404
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1037109 aagaagataatgtaggcatgaaaagctatggttgaatcacccactcaaaagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcctgtagtgatttcc 1037208  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    |||||||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1037209 caattttcaaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggatagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 1037308  T
Q  210 aaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatcacaggtt 305  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1037309 gaacagggtcgaatcggctcatactttattgaagacatacttggataatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacatgacaggtt 1037404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7799306 - 7799034
Alignment:
Q  25 gcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagatt 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||   | |||    
T  7799306 gcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaagagttatatgcaaatgcattagtggagttccaagattcaagtagtgatttctcacttttcaaaaatt 7799207  T
Q  125 atgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatc 224  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7799206 atgcaatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgatgcatcttggttgcaggaccaccaacagggtcgaatc 7799107  T
Q  225 ggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799106 ggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatattgtgggtaatttgggtacttgttgggagaaaatacat 7799034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4199203 - 4198922
Alignment:
Q  16 ataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaattt 115  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||   ||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  4199203 ataatgagagcatggaaagctatggttgaattgtccattcaagagttatatgcaaatacattagtggagttccaagattcatgtagtgatttctcacttt 4199104  T
Q  116 ttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacag 215  Q
    |   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4199103 taaaaaattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccaccaacag 4199004  T
Q  216 ggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4199003 ggtcgaatcggctcatgctttattgaagaaatatttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgagagaaaatacat 4198922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 34079538 - 34079749
Alignment:
Q  10 aagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcc 109  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34079538 aagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgattttc 34079637  T
Q  110 caatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079638 caatttttgtagattatgccatgaccaccttgaatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccac 34079737  T
Q  210 aaacagggtcga 221  Q
    ||||||||||||    
T  34079738 aaacagggtcga 34079749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18536643 - 18536395
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18536643 gaagaagataatgagggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaagagttatttgcaaatgtattagtggagttccaagattcatgtagtgatttc 18536544  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    ||| |||    | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18536543 ccactttccaaaaattatgccatgaccacattgaatgaagtgaaggagaaaatagtgagggcatgaacagaccatatgttgcatcttggttgcaggacca 18536444  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaat 258  Q
    | |||  ||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18536443 c-aacgaggtagaaacggctcatgctttattgaagaaatatttggacaat 18536395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 295
Target Start/End: Original strand, 20288065 - 20288311
Alignment:
Q  49 cccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttcccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaag 148  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||| |||||| ||||||||  ||   ||||||||| | ||||||||||  |    
T  20288065 cccactcaagaattatattcaaatgcattagtggagttcaaaaatgtttgtaatgattttccaattttcctaacctatgccatgtctaccttggatgttg 20288164  T
Q  149 tgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaata 248  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||| |||  | || |||||    
T  20288165 ttaaggagaaaatagtgagggcatggataaaccatgtgttatatcttggttgcagaaccaccaatagggtagaatcggctcatgatttagtaaataaata 20288264  T
Q  249 cttgga-caatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatac 295  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20288265 -ttggagcaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatac 20288311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 213
Target Start/End: Original strand, 25054192 - 25054257
Alignment:
Q  148 gtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaac 213  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25054192 gtgaatgacaaaatagtgagagcatggacagagcttgtgttacatcttgggtgcaggaccacaaac 25054257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27012810 - 27012749
Alignment:
Q  151 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaa 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  27012810 aaggacaaaatagtgagggcatggacggacctagtgttacatcttgggtgtaggaccacaaa 27012749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 212
Target Start/End: Original strand, 11820136 - 11820197
Alignment:
Q  151 aaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaa 212  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  11820136 aaggacaaactagtgagggcatggacggaccttgtgttacatcttgggtgtagtaccacaaa 11820197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15661 - 15373
Alignment:
Q  9 gaagaatataatgaacgcatggaaaactatggttgaatctcccaatcaacaattatatgcaaatgcattagtggagttcaaagattcatgtagtgatttc 108  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15661 gaagaagataatgaaggcatggaaagctatggttgaatcgcccactcaacagttatatgcaaatgcattactggagttcaaagattcatgtagtgatttc 15562  T
Q  109 ccaatttttgtagattatgccatgaccaccttggatgaagtgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggacca 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15561 ccaatttttgtagattgtgccatgaccaccttgaatgaagtgaaagacaaaattgtgagggaatggacagaccatgtgttgcatctaggttgcaggacca 15462  T
Q  209 caaacagggtcgaatcggcccatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461 caaacagggtcgaatcggctcatgctttgttgaagaaatacttggacaatagtgtgggtgatttgggtacttgttgggagaaaatacat 15373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2166 - 2101
Alignment:
Q  149 tgaaggacaaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaaca 214  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  2166 tgaaggacaaaatagtgagggtatggacagaccttgtgttacatcttgggtgcaggaccacgaaca 2101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1226 - 1168
Alignment:
Q  157 aaaattgtgagggcatggacagaccatgtgttgcatcttggttgcaggaccacaaacag 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||    
T  1226 aaaatagtgagggcatggacagaccatgtcttgcatcttggctgccgaaccaccaacag 1168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University