View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7208_high_7 (Length: 341)

Name: NF7208_high_7
Description: NF7208
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7208_high_7
NF7208_high_7
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (1-327)||(10916672-10916998)
chr7 (1-327)||(11424580-11424906)
chr7 (1-326)||(16503185-16503510)
chr7 (2-327)||(2154587-2154912)
chr7 (1-326)||(16518221-16518546)
chr7 (1-327)||(5147144-5147470)
chr7 (1-329)||(5128005-5128333)
chr7 (1-327)||(4144927-4145253)
chr7 (1-327)||(26319673-26319999)
chr7 (1-327)||(9618664-9618990)
chr7 (1-327)||(26274898-26275224)
chr7 (1-327)||(26669718-26670044)
chr7 (1-327)||(45387356-45387682)
chr7 (1-327)||(16736264-16736590)
chr7 (1-327)||(16751318-16751644)
chr7 (1-327)||(17523545-17523871)
chr7 (1-327)||(17529344-17529670)
chr7 (3-327)||(26435272-26435596)
chr7 (3-327)||(26537674-26537998)
chr7 (3-327)||(31564194-31564518)
chr7 (6-327)||(24592345-24592666)
chr7 (39-327)||(11441623-11441911)
chr7 (3-327)||(3445321-3445645)
chr7 (3-327)||(31124935-31125259)
chr7 (25-327)||(26484731-26485033)
chr7 (25-313)||(2108823-2109111)
chr7 (1-325)||(16041336-16041660)
chr7 (57-327)||(2775428-2775698)
chr7 (57-319)||(16449810-16450072)
chr7 (25-327)||(39210827-39211129)
chr7 (120-327)||(4200679-4200886)
chr7 (1-292)||(18540812-18541103)
chr7 (21-313)||(31088282-31088574)
chr7 (39-277)||(5159570-5159808)
chr7 (21-313)||(45733493-45733785)
chr7 (118-327)||(26682804-26683013)
chr7 (3-98)||(26485756-26485851)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (1-327)||(24863726-24864052)
chr6 (1-324)||(16749863-16750186)
chr6 (1-327)||(15424178-15424504)
chr6 (1-327)||(24304479-24304805)
chr6 (1-327)||(26989010-26989336)
chr6 (1-327)||(13298812-13299138)
chr6 (1-321)||(27000082-27000402)
chr6 (1-327)||(22934741-22935067)
chr6 (1-327)||(23857186-23857512)
chr6 (1-327)||(26918389-26918715)
chr6 (1-327)||(27272441-27272767)
chr6 (3-327)||(4757775-4758099)
chr6 (39-327)||(29549522-29549810)
chr6 (3-327)||(34463207-34463531)
chr6 (3-328)||(27359852-27360177)
chr6 (3-328)||(27450195-27450520)
chr6 (3-327)||(3696092-3696416)
chr6 (3-327)||(4545636-4545960)
chr6 (3-327)||(4773017-4773341)
chr6 (6-327)||(16943888-16944209)
chr6 (39-327)||(27044434-27044723)
chr6 (3-327)||(4723995-4724319)
chr6 (39-327)||(16674186-16674474)
chr6 (3-327)||(29573024-29573348)
chr6 (6-328)||(26777475-26777797)
chr6 (6-327)||(29501429-29501750)
chr6 (3-327)||(4525297-4525621)
chr6 (3-327)||(26116271-26116595)
chr6 (3-327)||(27007738-27008062)
chr6 (3-327)||(28207465-28207789)
chr6 (1-327)||(30557877-30558203)
chr6 (3-327)||(27485140-27485464)
chr6 (3-327)||(17025288-17025612)
chr6 (9-322)||(20160718-20161031)
chr6 (9-322)||(22171800-22172113)
chr6 (21-327)||(27290231-27290537)
chr6 (25-327)||(14143146-14143448)
chr6 (25-327)||(26787977-26788279)
chr6 (25-327)||(27196350-27196652)
chr6 (25-327)||(27252588-27252890)
chr6 (69-327)||(22456795-22457053)
chr6 (21-322)||(13521939-13522240)
chr6 (21-313)||(33374131-33374423)
chr6 (21-313)||(8892186-8892477)
chr6 (21-313)||(8903421-8903712)
chr6 (21-313)||(28162686-28162978)
chr6 (69-221)||(22477240-22477392)
chr6 (1-297)||(27629591-27629887)
chr6 (201-327)||(17092301-17092427)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-327)||(28882222-28882548)
chr2 (1-327)||(12655550-12655876)
chr2 (1-327)||(23128473-23128799)
chr2 (1-327)||(20837926-20838252)
chr2 (1-327)||(27434351-27434677)
chr2 (1-327)||(11635093-11635419)
chr2 (1-327)||(11641282-11641608)
chr2 (1-327)||(21677089-21677415)
chr2 (1-327)||(34861688-34862014)
chr2 (1-327)||(37685816-37686142)
chr2 (1-327)||(37701081-37701407)
chr2 (1-327)||(32049806-32050132)
chr2 (1-295)||(34286362-34286656)
chr2 (1-295)||(34291422-34291716)
chr2 (1-327)||(37925501-37925827)
chr2 (1-242)||(34279457-34279698)
chr2 (1-327)||(31876289-31876615)
chr2 (3-327)||(260660-260984)
chr2 (39-327)||(37375207-37375495)
chr2 (1-327)||(13936451-13936777)
chr2 (1-327)||(22925935-22926261)
chr2 (3-327)||(19416406-19416730)
chr2 (1-327)||(16829245-16829571)
chr2 (1-327)||(16891910-16892236)
chr2 (3-327)||(39890084-39890408)
chr2 (3-327)||(12716509-12716833)
chr2 (3-327)||(27777232-27777556)
chr2 (3-327)||(27816990-27817314)
chr2 (3-327)||(40233521-40233845)
chr2 (3-327)||(39051729-39052053)
chr2 (3-324)||(27803717-27804038)
chr2 (3-327)||(12586820-12587144)
chr2 (3-313)||(9349903-9350213)
chr2 (21-313)||(31891249-31891541)
chr2 (1-325)||(21703073-21703397)
chr2 (1-318)||(27118696-27119013)
chr2 (59-322)||(19456333-19456596)
chr2 (21-327)||(34303210-34303516)
chr2 (21-313)||(3784682-3784974)
chr2 (21-313)||(16163627-16163919)
chr2 (21-313)||(34157039-34157330)
chr2 (59-295)||(27393035-27393271)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-327)||(9548358-9548684)
chr5 (1-327)||(11549375-11549701)
chr5 (1-327)||(23717803-23718129)
chr5 (1-327)||(30934654-30934980)
chr5 (1-327)||(15658575-15658901)
chr5 (1-327)||(24687972-24688298)
chr5 (1-327)||(33777508-33777834)
chr5 (1-327)||(22998929-22999255)
chr5 (1-327)||(23752265-23752591)
chr5 (1-327)||(24970039-24970365)
chr5 (1-327)||(30152039-30152365)
chr5 (1-327)||(9317472-9317798)
chr5 (1-327)||(12132176-12132502)
chr5 (1-327)||(8665290-8665616)
chr5 (1-327)||(15758672-15758998)
chr5 (1-327)||(2511072-2511398)
chr5 (1-327)||(26480413-26480739)
chr5 (3-319)||(18500553-18500869)
chr5 (1-327)||(5637931-5638257)
chr5 (1-327)||(6874326-6874652)
chr5 (1-327)||(30168490-30168816)
chr5 (3-327)||(28649258-28649582)
chr5 (3-327)||(34616541-34616865)
chr5 (3-327)||(43078275-43078599)
chr5 (1-292)||(41674730-41675021)
chr5 (1-327)||(18375227-18375553)
chr5 (3-327)||(31431463-31431787)
chr5 (3-327)||(31826222-31826546)
chr5 (6-327)||(29966881-29967202)
chr5 (6-327)||(30029441-30029762)
chr5 (3-327)||(37671298-37671622)
chr5 (3-327)||(37755003-37755327)
chr5 (3-327)||(37770802-37771126)
chr5 (3-328)||(32599286-32599611)
chr5 (3-327)||(3789564-3789888)
chr5 (3-328)||(28959600-28959925)
chr5 (1-327)||(33516377-33516703)
chr5 (3-327)||(37358458-37358782)
chr5 (3-327)||(24681463-24681787)
chr5 (3-327)||(24723990-24724314)
chr5 (3-327)||(40473364-40473688)
chr5 (3-327)||(13324644-13324968)
chr5 (27-327)||(23892253-23892553)
chr5 (57-327)||(29888897-29889167)
chr5 (1-325)||(22888491-22888815)
chr5 (57-325)||(25199106-25199374)
chr5 (21-313)||(11325835-11326127)
chr5 (21-322)||(33877288-33877589)
chr5 (39-276)||(33292584-33292821)
chr5 (21-313)||(13184477-13184769)
chr5 (21-313)||(13440323-13440615)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-327)||(14665045-14665371)
chr4 (1-327)||(24592232-24592558)
chr4 (1-327)||(17014027-17014353)
chr4 (1-327)||(14763222-14763548)
chr4 (1-327)||(27163235-27163561)
chr4 (1-327)||(5005900-5006226)
chr4 (1-327)||(6569880-6570206)
chr4 (1-327)||(40105556-40105882)
chr4 (3-327)||(18800531-18800855)
chr4 (39-327)||(36344433-36344721)
chr4 (39-327)||(54833452-54833740)
chr4 (1-327)||(14098568-14098894)
chr4 (3-327)||(30753783-30754107)
chr4 (1-327)||(31126436-31126762)
chr4 (3-327)||(33673716-33674040)
chr4 (3-327)||(39850667-39850991)
chr4 (1-327)||(21969728-21970054)
chr4 (57-322)||(15284851-15285116)
chr4 (57-325)||(1900340-1900608)
chr4 (57-325)||(15227953-15228221)
chr4 (39-292)||(24112727-24112980)
chr4 (39-292)||(34188913-34189166)
chr4 (21-313)||(24460537-24460829)
chr4 (59-292)||(14235478-14235711)
chr4 (59-295)||(15391288-15391524)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (1-327)||(4796612-4796938)
chr3 (1-327)||(15741053-15741379)
chr3 (1-327)||(29148714-29149040)
chr3 (1-327)||(8301226-8301552)
chr3 (1-327)||(18330642-18330968)
chr3 (1-327)||(6192289-6192615)
chr3 (1-327)||(15892665-15892991)
chr3 (1-327)||(35880739-35881065)
chr3 (1-327)||(8295945-8296271)
chr3 (3-327)||(22387537-22387861)
chr3 (1-327)||(4721604-4721930)
chr3 (1-327)||(18277011-18277337)
chr3 (1-327)||(18292312-18292638)
chr3 (1-327)||(18307613-18307939)
chr3 (1-327)||(4416892-4417218)
chr3 (1-327)||(28115913-28116239)
chr3 (1-327)||(7073185-7073511)
chr3 (1-327)||(18051235-18051561)
chr3 (1-327)||(31964432-31964758)
chr3 (1-327)||(50134030-50134356)
chr3 (1-327)||(47023426-47023752)
chr3 (1-327)||(5609281-5609607)
chr3 (1-327)||(7996535-7996861)
chr3 (1-327)||(10396106-10396432)
chr3 (1-327)||(10643043-10643369)
chr3 (1-327)||(28339275-28339601)
chr3 (3-327)||(4346646-4346970)
chr3 (3-327)||(8211713-8212037)
chr3 (3-327)||(48465902-48466226)
chr3 (1-313)||(5713200-5713512)
chr3 (1-313)||(5724110-5724422)
chr3 (1-313)||(5757055-5757367)
chr3 (1-313)||(5767946-5768258)
chr3 (3-327)||(21674668-21674992)
chr3 (3-327)||(22870815-22871139)
chr3 (3-327)||(22885874-22886198)
chr3 (3-327)||(28021250-28021574)
chr3 (21-327)||(5466978-5467284)
chr3 (39-327)||(36997036-36997324)
chr3 (6-327)||(5596316-5596637)
chr3 (3-327)||(6542421-6542745)
chr3 (3-327)||(11110308-11110632)
chr3 (3-327)||(18242714-18243038)
chr3 (1-327)||(18225164-18225490)
chr3 (6-327)||(24328137-24328458)
chr3 (39-327)||(5013723-5014011)
chr3 (39-327)||(51782034-51782322)
chr3 (39-327)||(51797123-51797412)
chr3 (3-327)||(20576806-20577130)
chr3 (1-327)||(17984915-17985241)
chr3 (3-327)||(29664929-29665253)
chr3 (25-327)||(31034076-31034378)
chr3 (25-327)||(32292749-32293051)
chr3 (57-325)||(18530417-18530685)
chr3 (57-322)||(16626470-16626735)
chr3 (3-292)||(32439129-32439418)
chr3 (21-318)||(5652380-5652677)
chr3 (21-313)||(17993757-17994049)
chr3 (39-292)||(20066054-20066307)
chr3 (21-292)||(4625937-4626208)
chr3 (39-205)||(4893221-4893387)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-326)||(27304-27629)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-327)||(2137136-2137462)
chr8 (1-327)||(16277566-16277892)
chr8 (1-327)||(19688110-19688436)
chr8 (1-327)||(14557636-14557962)
chr8 (1-327)||(27608782-27609108)
chr8 (1-327)||(16283461-16283787)
chr8 (1-327)||(19674453-19674779)
chr8 (1-327)||(28361832-28362158)
chr8 (1-327)||(31489627-31489953)
chr8 (1-327)||(19208237-19208563)
chr8 (1-327)||(31354536-31354862)
chr8 (3-327)||(12092601-12092925)
chr8 (39-327)||(19286512-19286800)
chr8 (6-327)||(33258740-33259061)
chr8 (39-327)||(29829372-29829660)
chr8 (3-327)||(3329384-3329708)
chr8 (3-327)||(18710600-18710924)
chr8 (153-327)||(189258-189432)
chr8 (21-327)||(9354654-9354961)
chr8 (21-318)||(19658926-19659222)
chr8 (69-292)||(33244745-33244968)
chr8 (25-285)||(44563137-44563396)
chr8 (59-295)||(22080787-22081023)
chr8 (3-61)||(19518280-19518338)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-327)||(46903-47229)
scaffold0089 (1-327)||(29775-30101)
scaffold0089 (1-327)||(39987-40313)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-327)||(47-374)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (1-327)||(7157-7483)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-327)||(10962681-10963007)
chr1 (1-327)||(28584992-28585318)
chr1 (1-327)||(41793226-41793552)
chr1 (1-327)||(51638229-51638555)
chr1 (57-325)||(16207951-16208219)
chr1 (25-292)||(28151897-28152164)
chr1 (69-327)||(20340253-20340511)
chr1 (9-274)||(20461100-20461365)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-327)||(8984-9310)
scaffold0159 (1-327)||(20027-20353)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-327)||(14848-15174)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (21-327)||(30484-30790)
scaffold0124 (12-325)||(20411-20723)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (3-327)||(9580-9904)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (3-319)||(6024-6344)
scaffold0415 (59-325)||(1838-2103)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-327)||(26119-26446)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (3-327)||(7963-8287)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (5-291)||(46756-47057)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (69-327)||(2576-2834)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (57-268)||(5-216)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (1-297)||(101-397)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (135-295)||(568-728)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (69-295)||(21641-21867)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10916998 - 10916672
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10916998 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 10916899  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  10916898 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 10916799  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10916798 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 10916699  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10916698 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 10916672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11424906 - 11424580
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11424906 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgcacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 11424807  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  11424806 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 11424707  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  11424706 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 11424607  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||    
T  11424606 gtgaggaaactcctagacttgatgtcc 11424580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16503510 - 16503185
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16503510 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 16503411  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  16503410 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaag 16503311  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16503310 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 16503211  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtc 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  16503210 gtgaggaagctcctagacttgatgtc 16503185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Original strand, 2154587 - 2154912
Alignment:
Q  2 tactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccg 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2154587 tactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccg 2154686  T
Q  102 ttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  2154687 ttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaaga 2154786  T
Q  202 agctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2154787 agctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatg 2154886  T
Q  302 tgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2154887 tgaggaagctcctagacttgatgtcc 2154912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16518546 - 16518221
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16518546 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 16518447  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  16518446 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaag 16518347  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16518346 aagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 16518247  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtc 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  16518246 gtgaggaagctcctagacttgatgtc 16518221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5147470 - 5147144
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5147470 ctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 5147371  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  5147370 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 5147271  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  5147270 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 5147171  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||    
T  5147170 gcgaggaagctcctagacttgatgtcc 5147144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 5128005 - 5128333
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5128005 ctacttttcctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggtaagcccccacctaatcc 5128104  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||     
T  5128105 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaag 5128204  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  5128205 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 5128304  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtccat 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5128305 gtgaggaagctcctagacttgatgtccat 5128333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4145253 - 4144927
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4145253 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 4145154  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  4145153 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 4145054  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  4145053 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 4144954  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  4144953 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 4144927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26319999 - 26319673
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26319999 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 26319900  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  26319899 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 26319800  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |    
T  26319799 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgt 26319700  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  26319699 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26319673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 9618664 - 9618990
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9618664 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 9618763  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  9618764 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 9618863  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  9618864 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 9618963  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  9618964 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 9618990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26275224 - 26274898
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26275224 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 26275125  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||     
T  26275124 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaag 26275025  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |    
T  26275024 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgt 26274925  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  26274924 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26274898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26670044 - 26669718
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26670044 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 26669945  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  26669944 gttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 26669845  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  26669844 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 26669745  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  26669744 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26669718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 45387356 - 45387682
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45387356 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 45387455  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  45387456 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 45387555  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  45387556 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 45387655  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||    
T  45387656 gtgaagaagctccgaggcttgatgtcc 45387682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16736590 - 16736264
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16736590 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcc 16736491  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  16736490 gttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 16736391  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||  |    
T  16736390 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgt 16736291  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16736290 gtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 16736264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16751644 - 16751318
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16751644 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcc 16751545  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  16751544 gttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 16751445  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||  |    
T  16751444 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgt 16751345  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16751344 gtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 16751318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 17523545 - 17523871
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17523545 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcc 17523644  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  17523645 gttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 17523744  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||  |    
T  17523745 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgt 17523844  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17523845 gtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 17523871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17529670 - 17529344
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17529670 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcc 17529571  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  17529570 gttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 17529471  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||  |    
T  17529470 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgt 17529371  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17529370 gtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 17529344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 26435272 - 26435596
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26435272 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 26435371  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  26435372 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 26435471  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  26435472 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 26435571  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  26435572 gaggaagctcctagacttgatgtcc 26435596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26537998 - 26537674
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26537998 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtgcgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 26537899  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  26537898 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 26537799  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  26537798 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 26537699  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  26537698 gaggaagctcctagacttgatgtcc 26537674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31564518 - 31564194
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564518 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 31564419  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  31564418 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31564319  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  31564318 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 31564219  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  31564218 gaggaagctcctagacttgatgtcc 31564194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24592666 - 24592345
Alignment:
Q  6 ttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 105  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592666 ttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 24592567  T
Q  106 ctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24592566 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagct 24592467  T
Q  206 cattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgag 305  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  24592466 catcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgag 24592367  T
Q  306 gcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  24592366 gaagctcctagacttgatgtcc 24592345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 39 - 327
Target Start/End: Original strand, 11441623 - 11441911
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  11441623 cttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgact 11441722  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 238  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11441723 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataa 11441822  T
Q  239 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11441823 tgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 11441911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 3445321 - 3445645
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3445321 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 3445420  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  3445421 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 3445520  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  3445521 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgt 3445620  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  3445621 gaggaaactcctagacttgatgtcc 3445645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 31124935 - 31125259
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31124935 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 31125034  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  31125035 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31125134  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  31125135 actcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 31125234  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  31125235 gaggaagctcctagacttgatgtcc 31125259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 327
Target Start/End: Original strand, 26484731 - 26485033
Alignment:
Q  25 tatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccga 124  Q
    |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  26484731 tatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctga 26484830  T
Q  125 tctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctg 224  Q
     |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||    
T  26484831 cctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttg 26484930  T
Q  225 acttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatg 324  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |    
T  26484931 acttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacg 26485030  T
Q  325 tcc 327  Q
    |||    
T  26485031 tcc 26485033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2109111 - 2108823
Alignment:
Q  25 tatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccga 124  Q
    |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  2109111 tatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctga 2109012  T
Q  125 tctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctg 224  Q
     |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||    
T  2109011 cctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttg 2108912  T
Q  225 acttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 313  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||    
T  2108911 acttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 2108823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 16041336 - 16041660
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| ||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  16041336 ctaccttccctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatcc 16041435  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||| |||||| | || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16041436 gttgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaaa 16041535  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || | ||    
T  16041536 aagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 16041635  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgt 325  Q
      |||| |||||| ||||| |||||    
T  16041636 acgaggaagctcccagactcgatgt 16041660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 327
Target Start/End: Original strand, 2775428 - 2775698
Alignment:
Q  57 agagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgg 156  Q
    |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  2775428 agagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgg 2775527  T
Q  157 gtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcga 256  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  2775528 gtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcga 2775627  T
Q  257 taatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
     || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  2775628 caaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 2775698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16450072 - 16449810
Alignment:
Q  57 agagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgg 156  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||  | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||    
T  16450072 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 16449973  T
Q  157 gtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcga 256  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16449972 gtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcga 16449873  T
Q  257 taatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagact 319  Q
     ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| |||||| |||||    
T  16449872 caatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 16449810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39211129 - 39210827
Alignment:
Q  25 tatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccga 124  Q
    |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  39211129 tatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcttccacctgatccgttacctcccaggttccggtctga 39211030  T
Q  125 tctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctg 224  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||    
T  39211029 cctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttg 39210930  T
Q  225 acttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatg 324  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |    
T  39210929 acttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacg 39210830  T
Q  325 tcc 327  Q
    |||    
T  39210829 tcc 39210827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 327
Target Start/End: Original strand, 4200679 - 4200886
Alignment:
Q  120 tccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaa 219  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  4200679 tccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 4200778  T
Q  220 agctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagact 319  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||    
T  4200779 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 4200878  T
Q  320 tgatgtcc 327  Q
    ||| ||||    
T  4200879 tgacgtcc 4200886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 18540812 - 18541103
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| |||| |||||  ||| |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| ||||| || ||    
T  18540812 ctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccaccggaccc 18540911  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
     || |||||||||||| | || ||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||     
T  18540912 tttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaag 18541011  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 292  Q
    ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  18541012 aagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 18541103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31088574 - 31088282
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  31088574 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 31088475  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  31088474 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaa 31088375  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 313  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| ||||||    
T  31088374 attgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 31088282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 277
Target Start/End: Original strand, 5159570 - 5159808
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||| | || ||||| || ||||| |    
T  5159570 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgact 5159669  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 238  Q
    | |||||||||||  | || ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||    
T  5159670 tccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaa 5159769  T
Q  239 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgc 277  Q
    ||| || ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  5159770 tgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgc 5159808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Original strand, 45733493 - 45733785
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  45733493 atgttatatgctgaattactcttaactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 45733592  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  45733593 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaa 45733692  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 313  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| ||||||    
T  45733693 attgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 45733785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26683013 - 26682804
Alignment:
Q  118 ggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaagg 217  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||  | ||||| ||||| || |||||    
T  26683013 ggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaagg 26682914  T
Q  218 aaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctaga 317  Q
    |||  |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||    
T  26682913 aaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccgga 26682814  T
Q  318 cttgatgtcc 327  Q
    ||||| ||||    
T  26682813 cttgacgtcc 26682804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26485851 - 26485756
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgat 98  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26485851 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgat 26485756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 24863726 - 24864052
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24863726 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 24863825  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24863826 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 24863925  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24863926 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 24864025  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24864026 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24864052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 16749863 - 16750186
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16749863 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcc 16749962  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  16749963 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 16750062  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  16750063 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 16750162  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatg 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  16750163 gtgaggaagctcctagacttgatg 16750186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15424504 - 15424178
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15424504 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcc 15424405  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15424404 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaa 15424305  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15424304 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcaaagtat 15424205  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15424204 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15424178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24304805 - 24304479
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24304805 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 24304706  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  24304705 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagtatatcgtgaag 24304606  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24304605 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 24304506  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24304505 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24304479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 26989010 - 26989336
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  26989010 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 26989109  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  26989110 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtaaag 26989209  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26989210 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 26989309  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26989310 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26989336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13299138 - 13298812
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13299138 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 13299039  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||||||     
T  13299038 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagtatatcgtgaag 13298939  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13298938 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 13298839  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13298838 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 13298812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 27000082 - 27000402
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27000082 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 27000181  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27000182 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaa 27000281  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27000282 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 27000381  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttg 321  Q
    |||||| |||||||| |||||    
T  27000382 gtgaggaagctcctacacttg 27000402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22935067 - 22934741
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22935067 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 22934968  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22934967 gttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 22934868  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22934867 aagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 22934768  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22934767 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 22934741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23857512 - 23857186
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  23857512 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 23857413  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23857412 gttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 23857313  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23857312 aagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 23857213  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23857212 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23857186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 26918389 - 26918715
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  26918389 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 26918488  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26918489 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaa 26918588  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26918589 aagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 26918688  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26918689 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26918715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27272767 - 27272441
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27272767 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactctactccagagagggcattgtacaaccagacagggtaagcccccacctgatcc 27272668  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27272667 gtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaa 27272568  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  27272567 aagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtat 27272468  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27272467 gtgaggtagctcctagacttgatgtcc 27272441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 4757775 - 4758099
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757775 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 4757874  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  4757875 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4757974  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  4757975 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4758074  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  4758075 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4758099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 39 - 327
Target Start/End: Original strand, 29549522 - 29549810
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29549522 cttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 29549621  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 238  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29549622 ttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 29549721  T
Q  239 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  29549722 tgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctggacttgatgtcc 29549810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34463531 - 34463207
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  34463531 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacaaggaaagcccccacctgatccgt 34463432  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  34463431 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 34463332  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  34463331 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 34463232  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  34463231 gaggaagctcctagacttgatgtcc 34463207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27360177 - 27359852
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27360177 acttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 27360078  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27360077 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27359978  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  27359977 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 27359878  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcca 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  27359877 gaggaagctcctagacttgatgtcca 27359852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27450520 - 27450195
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450520 acttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 27450421  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27450420 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27450321  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  27450320 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 27450221  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcca 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  27450220 gaggaagctcctagacttgatgtcca 27450195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 3696092 - 3696416
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3696092 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 3696191  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  3696192 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 3696291  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||    
T  3696292 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgt 3696391  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    || | ||||||||||||||||||||    
T  3696392 gatgaagctcctagacttgatgtcc 3696416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4545960 - 4545636
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545960 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 4545861  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  4545860 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4545761  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  4545760 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4545661  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  4545660 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4545636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 4773017 - 4773341
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773017 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 4773116  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  4773117 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4773216  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  4773217 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4773316  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  4773317 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4773341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16944209 - 16943888
Alignment:
Q  6 ttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 105  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16944209 ttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 16944110  T
Q  106 ctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16944109 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagct 16944010  T
Q  206 cattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgag 305  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||     
T  16944009 catcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaa 16943910  T
Q  306 gcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    | |||||| |||||||||||||    
T  16943909 gaagctccgagacttgatgtcc 16943888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 39 - 327
Target Start/End: Original strand, 27044434 - 27044723
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27044434 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 27044533  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggt-gctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaata 237  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27044534 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaata 27044633  T
Q  238 atgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27044634 atgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27044723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4724319 - 4723995
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  4724319 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 4724220  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  4724219 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4724120  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  4724119 actcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4724020  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  4724019 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4723995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 39 - 327
Target Start/End: Original strand, 16674186 - 16674474
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16674186 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 16674285  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 238  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16674286 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataa 16674385  T
Q  239 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16674386 tgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 16674474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 29573024 - 29573348
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29573024 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgt 29573123  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  29573124 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 29573223  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  29573224 gctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 29573323  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    || | |||||| |||||||||||||    
T  29573324 gaagaagctccgagacttgatgtcc 29573348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26777797 - 26777475
Alignment:
Q  6 ttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 105  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26777797 ttccctcctataccgatgttgtatgccgaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 26777698  T
Q  106 ctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  26777697 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaact 26777598  T
Q  206 cattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgag 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  26777597 cattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgag 26777498  T
Q  306 gcagctcctagacttgatgtcca 328  Q
    | |  ||||||||||||||||||    
T  26777497 gaaaatcctagacttgatgtcca 26777475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 327
Target Start/End: Original strand, 29501429 - 29501750
Alignment:
Q  6 ttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 105  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29501429 ttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 29501528  T
Q  106 ctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  29501529 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaact 29501628  T
Q  206 cattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgag 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  29501629 cattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgag 29501728  T
Q  306 gcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  29501729 gaagctcctagacttgatgtcc 29501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 4525297 - 4525621
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4525297 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgcacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 4525396  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  4525397 tgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 4525496  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  4525497 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4525596  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  4525597 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4525621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26116595 - 26116271
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26116595 acttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccgactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 26116496  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  26116495 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 26116396  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  26116395 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 26116296  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  26116295 gaggaagctcctagacttgatgtcc 26116271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 27007738 - 27008062
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27007738 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 27007837  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27007838 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27007937  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  27007938 gctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 27008037  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
     ||| ||||||||||||||||||||    
T  27008038 aaggaagctcctagacttgatgtcc 27008062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 28207465 - 28207789
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  28207465 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 28207564  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  28207565 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 28207664  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  28207665 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 28207764  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  28207765 gaggaagctcctagacttgatgtcc 28207789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30558203 - 30557877
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30558203 ctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatcc 30558104  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  30558103 gttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 30558004  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |    
T  30558003 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgt 30557904  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  30557903 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 30557877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 27485140 - 27485464
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27485140 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 27485239  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27485240 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27485339  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  27485340 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 27485439  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27485440 gaggaagctcctaggcttgatgtcc 27485464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 17025288 - 17025612
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  17025288 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 17025387  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  17025388 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 17025487  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  17025488 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 17025587  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  17025588 gaggaagctcctagacttgatgtcc 17025612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Original strand, 20160718 - 20161031
Alignment:
Q  9 cctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctc 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  20160718 cctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctc 20160817  T
Q  109 caaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcat 208  Q
    | |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20160818 ccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcat 20160917  T
Q  209 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 308  Q
     || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||| | ||| || ||||||||||  ||||||| |    
T  20160918 agaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaa 20161017  T
Q  309 gctcctagacttga 322  Q
    ||||||||||||||    
T  20161018 gctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22172113 - 22171800
Alignment:
Q  9 cctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctc 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  22172113 cctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctc 22172014  T
Q  109 caaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcat 208  Q
    | |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22172013 ccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcat 22171914  T
Q  209 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggca 308  Q
     || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||  |||||||| | ||| || ||||||||||  ||||||| |    
T  22171913 agaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaa 22171814  T
Q  309 gctcctagacttga 322  Q
    ||||||||||||||    
T  22171813 gctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27290537 - 27290231
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||| | |    
T  27290537 atgttatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaagttccgtt 27290438  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27290437 ctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa 27290338  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagactt 320  Q
    | | ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||| || | || ||||| |||||||||||||    
T  27290337 gttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatgattgaggtatatgaggaagctcctagactt 27290238  T
Q  321 gatgtcc 327  Q
    |||||||    
T  27290237 gatgtcc 27290231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14143448 - 14143146
Alignment:
Q  25 tatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccga 124  Q
    |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| ||  |||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  14143448 tatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctga 14143349  T
Q  125 tctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctg 224  Q
     |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||    
T  14143348 cctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttg 14143249  T
Q  225 acttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatg 324  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |    
T  14143248 acttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacg 14143149  T
Q  325 tcc 327  Q
    |||    
T  14143148 tcc 14143146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 327
Target Start/End: Original strand, 26787977 - 26788279
Alignment:
Q  25 tatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccga 124  Q
    |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| ||  |||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  26787977 tatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctga 26788076  T
Q  125 tctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctg 224  Q
     |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||    
T  26788077 cctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttg 26788176  T
Q  225 acttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatg 324  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |    
T  26788177 acttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacg 26788276  T
Q  325 tcc 327  Q
    |||    
T  26788277 tcc 26788279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 327
Target Start/End: Original strand, 27196350 - 27196652
Alignment:
Q  25 tatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccga 124  Q
    |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| ||  |||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  27196350 tatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctga 27196449  T
Q  125 tctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctg 224  Q
     |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||    
T  27196450 cctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttg 27196549  T
Q  225 acttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatg 324  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |    
T  27196550 acttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacg 27196649  T
Q  325 tcc 327  Q
    |||    
T  27196650 tcc 27196652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27252890 - 27252588
Alignment:
Q  25 tatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccga 124  Q
    |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| ||  |||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  27252890 tatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctga 27252791  T
Q  125 tctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctg 224  Q
     |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||    
T  27252790 cctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttg 27252691  T
Q  225 acttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatg 324  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |    
T  27252690 acttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacg 27252591  T
Q  325 tcc 327  Q
    |||    
T  27252590 tcc 27252588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22457053 - 22456795
Alignment:
Q  69 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcg 168  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  22457053 acaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcg 22456954  T
Q  169 aggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttcc 268  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  22456953 aaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 22456854  T
Q  269 aaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
     ||||| || ||||| ||  |||| || | || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  22456853 gaatcacgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 22456795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13522240 - 13521939
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  13522240 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 13522141  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  13522140 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaa 13522041  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagactt 320  Q
    | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  |||||    
T  13522040 gttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggactt 13521941  T
Q  321 ga 322  Q
    ||    
T  13521940 ga 13521939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33374423 - 33374131
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  33374423 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 33374324  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  33374323 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaa 33374224  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 313  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||    
T  33374223 attgacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 33374131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8892477 - 8892186
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  8892477 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 8892378  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  8892377 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaa 8892279  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 313  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||    
T  8892278 attgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 8892186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8903712 - 8903421
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  8903712 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 8903613  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  8903612 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaa 8903514  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 313  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||    
T  8903513 attgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 8903421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Original strand, 28162686 - 28162978
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| |||||| | |||||| | |||| | |    
T  28162686 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacttgatccatcgcctcccaagttccgtt 28162785  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||  || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  28162786 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaa 28162885  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 313  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| ||||||    
T  28162886 attgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 28162978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22477392 - 22477240
Alignment:
Q  69 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcg 168  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  22477392 acaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcg 22477293  T
Q  169 aggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaag 221  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||    
T  22477292 aaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaag 22477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27629887 - 27629591
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| ||||| || | |||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| || || |||||    
T  27629887 ctacttttcctccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaggcctccgccagatcc 27629788  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
     || || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||| || ||  |     
T  27629787 attaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccag 27629688  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaag 297  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||| || |||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  27629687 aggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatgctgcagtaaacatgattgaag 27629591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17092427 - 17092301
Alignment:
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||  || | ||    
T  17092427 aagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgaggtat 17092328  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| |||| | | |||||||||||    
T  17092327 gtgaggaagctaccaaacttgatgtcc 17092301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 28882222 - 28882548
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28882222 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 28882321  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28882322 gttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 28882421  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28882422 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 28882521  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28882522 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28882548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 12655550 - 12655876
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12655550 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 12655649  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  12655650 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaag 12655749  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  12655750 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtat 12655849  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12655850 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12655876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23128799 - 23128473
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  23128799 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 23128700  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23128699 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 23128600  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23128599 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 23128500  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23128499 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23128473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 20837926 - 20838252
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  20837926 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatct 20838025  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20838026 gttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 20838125  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  20838126 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatttgatcgaagtat 20838225  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20838226 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 20838252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27434677 - 27434351
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27434677 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccggctttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 27434578  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27434577 gttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 27434478  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27434477 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 27434378  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27434377 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27434351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11635419 - 11635093
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11635419 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcc 11635320  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  11635319 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaag 11635220  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  11635219 aagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 11635120  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||    
T  11635119 gcgaggaagctcctagacttgatgtcc 11635093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11641608 - 11641282
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11641608 ctactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcc 11641509  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  11641508 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaag 11641409  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  11641408 aagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 11641309  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||    
T  11641308 gcgaggaagctcctagacttgatgtcc 11641282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21677415 - 21677089
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21677415 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatcc 21677316  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  21677315 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 21677216  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  21677215 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 21677116  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| || |||||||||||||||||    
T  21677115 gtgaggaagttcctagacttgatgtcc 21677089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 34861688 - 34862014
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34861688 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 34861787  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  34861788 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 34861887  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  34861888 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 34861987  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| ||||| |||||||    
T  34861988 gtgaagaagctccgagactagatgtcc 34862014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 37686142 - 37685816
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37686142 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 37686043  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  37686042 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 37685943  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  37685942 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 37685843  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  37685842 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 37685816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 37701407 - 37701081
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37701407 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 37701308  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  37701307 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 37701208  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  37701207 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 37701108  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  37701107 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 37701081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 32049806 - 32050132
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  32049806 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaaacccccaccggaccc 32049905  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  32049906 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 32050005  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |    
T  32050006 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgt 32050105  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| || |||||||||||||||||    
T  32050106 gtgaggaagttcctagacttgatgtcc 32050132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 34286362 - 34286656
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34286362 ctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 34286461  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  34286462 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 34286561  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcga 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  34286562 aagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgatcga 34286656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 34291422 - 34291716
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34291422 ctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 34291521  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  34291522 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 34291621  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcga 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  34291622 aagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgatcga 34291716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 37925501 - 37925827
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  37925501 ctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacccgaccc 37925600  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  37925601 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 37925700  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  37925701 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 37925800  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  37925801 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 37925827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 34279457 - 34279698
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279457 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 34279556  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  34279557 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 34279656  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279657 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtc 34279698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 31876289 - 31876615
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| || || ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31876289 ctacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 31876388  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  31876389 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 31876488  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  31876489 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 31876588  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  31876589 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 31876615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 260984 - 260660
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  260984 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgt 260885  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  260884 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 260785  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||     
T  260784 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgc 260685  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  260684 gaggaagttcctagacttgatgtcc 260660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 39 - 327
Target Start/End: Original strand, 37375207 - 37375495
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37375207 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 37375306  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 238  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37375307 ttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataa 37375406  T
Q  239 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  37375407 tgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtggggaagctcctagacttgatgtcc 37375495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13936777 - 13936451
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||    
T  13936777 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccc 13936678  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
     || |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  13936677 tttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaag 13936578  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  13936577 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 13936478  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13936477 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 13936451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22926261 - 22925935
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22926261 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatcc 22926162  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  22926161 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 22926062  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || | ||    
T  22926061 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 22925962  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
     ||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  22925961 atgaggaagctcccggacttgacgtcc 22925935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19416730 - 19416406
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19416730 actttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 19416631  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||    
T  19416630 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaa 19416531  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  19416530 actcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 19416431  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    || | |||||| |||||||||||||    
T  19416430 gaagaagctccgagacttgatgtcc 19416406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16829571 - 16829245
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16829571 ctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatcc 16829472  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  16829471 gttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 16829372  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |    
T  16829371 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgt 16829272  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  16829271 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16829245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 16891910 - 16892236
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16891910 ctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatcc 16892009  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  16892010 gttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 16892109  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |    
T  16892110 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgt 16892209  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  16892210 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16892236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 39890084 - 39890408
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39890084 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 39890183  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||    
T  39890184 tgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatatcgtgaagaa 39890283  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  39890284 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 39890383  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  39890384 gaggaagctcctagacttgatgtcc 39890408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12716833 - 12716509
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  12716833 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 12716734  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  12716733 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 12716634  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12716633 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 12716534  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  12716533 gaggaagctcctagacttgatgtcc 12716509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 27777232 - 27777556
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  27777232 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 27777331  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27777332 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27777431  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  27777432 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 27777531  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  27777532 gaggaagctcctagacttgatgtcc 27777556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 27816990 - 27817314
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  27816990 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 27817089  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27817090 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27817189  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  27817190 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 27817289  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  27817290 gaggaagctcctagacttgatgtcc 27817314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 40233521 - 40233845
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40233521 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 40233620  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  40233621 tgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 40233720  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  40233721 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgt 40233820  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  40233821 gaggaagctcctagacttgatgtcc 40233845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 39052053 - 39051729
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  39052053 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 39051954  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  39051953 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 39051854  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  39051853 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 39051754  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  39051753 gaggaagctcctagacttgatgtcc 39051729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Original strand, 27803717 - 27804038
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  27803717 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 27803816  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27803817 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 27803916  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  27803917 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 27804016  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatg 324  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  27804017 gaggaagctcctagacttgatg 27804038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 12586820 - 12587144
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  12586820 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagtcgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 12586919  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  12586920 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 12587019  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  12587020 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 12587119  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  12587120 gaggaagctcctagacttgatgtcc 12587144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9350213 - 9349903
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||| ||||| || || |    
T  9350213 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcaaggcaagcctccaccggaccctt 9350114  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  9350113 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 9350014  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || |    
T  9350013 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatat 9349914  T
Q  303 gaggcagctcc 313  Q
    |||| ||||||    
T  9349913 gaggaagctcc 9349903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31891541 - 31891249
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891541 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 31891442  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  31891441 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaa 31891342  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 313  Q
      |||| ||| ||||||| ||||| || ||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| ||||||    
T  31891341 attgacctttaagaataacgtccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 31891249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21703397 - 21703073
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||||||| || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  21703397 ctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacaggacaagcctccacctgatcc 21703298  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| |||||     
T  21703297 gttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaag 21703198  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | ||    
T  21703197 aagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 21703098  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgt 325  Q
     ||||| |||||| ||||| |||||    
T  21703097 atgaggaagctcccagactcgatgt 21703073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Original strand, 27118696 - 27119013
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  27118696 ctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatcc 27118795  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    || |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || |||    
T  27118796 gtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaa 27118895  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    || ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | |||||| ||||| || | ||    
T  27118896 aaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatgattgaggtat 27118995  T
Q  301 gtgaggcagctcctagac 318  Q
     ||||| |||||| ||||    
T  27118996 atgaggaagctcccagac 27119013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19456596 - 19456333
Alignment:
Q  59 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 158  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  19456596 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 19456497  T
Q  159 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgata 258  Q
    |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  19456496 catgatgttgaagaatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgaca 19456397  T
Q  259 atccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttga 322  Q
    |||| ||||| ||||| || | ||| || ||||| || | |||||||| |||||| ||||||||    
T  19456396 atcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttga 19456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34303516 - 34303210
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| | |||| | |    
T  34303516 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttccgtt 34303417  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  34303416 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaa 34303317  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagactt 320  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||| || | || ||||| |||||| ||||||    
T  34303316 attgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 34303217  T
Q  321 gatgtcc 327  Q
    |||||||    
T  34303216 gatgtcc 34303210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Original strand, 3784682 - 3784974
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  3784682 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 3784781  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  3784782 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaa 3784881  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 313  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| ||||||    
T  3784882 attgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 3784974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Original strand, 16163627 - 16163919
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  16163627 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 16163726  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||| ||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  16163727 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaa 16163826  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 313  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| ||||||    
T  16163827 attgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 16163919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Original strand, 34157039 - 34157330
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  34157039 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 34157138  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  34157139 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaa 34157237  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 313  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| ||||||    
T  34157238 attgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 34157330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 295
Target Start/End: Original strand, 27393035 - 27393271
Alignment:
Q  59 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 158  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||   || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||     
T  27393035 agggcactgcacaaccaggcagggcaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggc 27393134  T
Q  159 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgata 258  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  27393135 catgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgaca 27393234  T
Q  259 atccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcga 295  Q
    |||| ||||| ||||| || | ||| || ||||||||    
T  27393235 atcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgatcga 27393271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9548684 - 9548358
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9548684 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 9548585  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  9548584 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 9548485  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  9548484 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 9548385  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9548384 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 9548358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 11549375 - 11549701
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11549375 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 11549474  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  11549475 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 11549574  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11549575 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 11549674  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||    
T  11549675 gcgaggaagctcctagacttgatgtcc 11549701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23718129 - 23717803
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  23718129 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 23718030  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23718029 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 23717930  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23717929 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 23717830  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23717829 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23717803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 30934654 - 30934980
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30934654 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 30934753  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  30934754 gttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 30934853  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  30934854 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtatatatgatcgaagtat 30934953  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30934954 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30934980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15658901 - 15658575
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15658901 ctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 15658802  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  15658801 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 15658702  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  15658701 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgt 15658602  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15658601 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15658575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24688298 - 24687972
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24688298 ctactttccctccgataccgatattgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 24688199  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24688198 gttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaa 24688099  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24688098 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 24687999  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24687998 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24687972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 33777508 - 33777834
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33777508 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 33777607  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33777608 gttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaa 33777707  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  33777708 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtat 33777807  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33777808 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 33777834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22999255 - 22998929
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22999255 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 22999156  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22999155 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 22999056  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22999055 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 22998956  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22998955 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 22998929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23752591 - 23752265
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  23752591 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 23752492  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23752491 gttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 23752392  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  23752391 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 23752292  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23752291 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23752265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 24970039 - 24970365
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24970039 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 24970138  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24970139 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 24970238  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |     
T  24970239 aagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgatcaaagtac 24970338  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24970339 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24970365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 30152039 - 30152365
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30152039 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 30152138  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  30152139 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 30152238  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  30152239 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 30152338  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30152339 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30152365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 9317472 - 9317798
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9317472 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 9317571  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  9317572 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 9317671  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  9317672 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 9317771  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  9317772 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 9317798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 12132176 - 12132502
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12132176 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 12132275  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  12132276 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 12132375  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  12132376 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 12132475  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  12132476 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 12132502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8665616 - 8665290
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  8665616 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatcc 8665517  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  8665516 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 8665417  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  8665416 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 8665317  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| || |||||||||||||||||    
T  8665316 gtgaggaagttcctagacttgatgtcc 8665290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15758998 - 15758672
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15758998 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatcc 15758899  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  15758898 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 15758799  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  15758798 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 15758699  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15758698 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15758672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 2511072 - 2511398
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2511072 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatcc 2511171  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  2511172 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 2511271  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  2511272 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 2511371  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2511372 gtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 2511398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 26480413 - 26480739
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26480413 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcc 26480512  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  26480513 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 26480612  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  26480613 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 26480712  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  26480713 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26480739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18500869 - 18500553
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18500869 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 18500770  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  18500769 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18500670  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  18500669 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 18500570  T
Q  303 gaggcagctcctagact 319  Q
    |||| ||||||||||||    
T  18500569 gaggaagctcctagact 18500553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 5637931 - 5638257
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637931 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 5638030  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  5638031 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 5638130  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |    
T  5638131 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgt 5638230  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  5638231 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 5638257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 6874326 - 6874652
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6874326 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagctgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatcc 6874425  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  6874426 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 6874525  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  6874526 aagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 6874625  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6874626 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 6874652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 30168490 - 30168816
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30168490 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatcc 30168589  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  30168590 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 30168689  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  30168690 aagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatgtcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 30168789  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||    
T  30168790 gtgaagaaactcctagacttgatgtcc 30168816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 28649258 - 28649582
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28649258 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 28649357  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  28649358 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 28649457  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  28649458 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 28649557  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  28649558 gaggaagctcctagacttgatgtcc 28649582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 34616541 - 34616865
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34616541 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 34616640  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  34616641 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 34616740  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  34616741 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 34616840  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  34616841 gaggaagttcctagacttgatgtcc 34616865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 43078275 - 43078599
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43078275 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 43078374  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  43078375 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 43078474  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  43078475 gctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 43078574  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  43078575 gaggaagctcctagacttgatgtcc 43078599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 41674730 - 41675021
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41674730 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 41674829  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||     
T  41674830 gttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaag 41674929  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 292  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  41674930 aagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 41675021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18375553 - 18375227
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18375553 ctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 18375454  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  18375453 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 18375354  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||  |    
T  18375353 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgt 18375254  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18375253 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18375227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 31431463 - 31431787
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31431463 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 31431562  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  31431563 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31431662  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  31431663 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 31431762  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  31431763 gaggaagctcctagacttgatgtcc 31431787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31826546 - 31826222
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31826546 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 31826447  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  31826446 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 31826347  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31826346 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 31826247  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  31826246 gaggaaactcctagacttgatgtcc 31826222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29967202 - 29966881
Alignment:
Q  6 ttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 105  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29967202 ttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 29967103  T
Q  106 ctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29967102 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagct 29967003  T
Q  206 cattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgag 305  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||     
T  29967002 catcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaa 29966903  T
Q  306 gcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    | |||||| |||||||||||||    
T  29966902 gaagctccgagacttgatgtcc 29966881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 327
Target Start/End: Original strand, 30029441 - 30029762
Alignment:
Q  6 ttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 105  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30029441 ttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 30029540  T
Q  106 ctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  30029541 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagct 30029640  T
Q  206 cattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgag 305  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||     
T  30029641 catcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaa 30029740  T
Q  306 gcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    | |||||| |||||||||||||    
T  30029741 gaagctccgagacttgatgtcc 30029762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 37671622 - 37671298
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37671622 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 37671523  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  37671522 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 37671423  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  37671422 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 37671323  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  37671322 gaggaagctcctagacttgatgtcc 37671298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 37755003 - 37755327
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  37755003 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 37755102  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  37755103 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 37755202  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  37755203 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 37755302  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  37755303 gaggaagctcctagacttgatgtcc 37755327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 37771126 - 37770802
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37771126 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 37771027  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||    
T  37771026 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcatgaagaa 37770927  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  37770926 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 37770827  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| |||| |||||||||||||||    
T  37770826 gaggaagcttctagacttgatgtcc 37770802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 32599611 - 32599286
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599611 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 32599512  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  32599511 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 32599412  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  32599411 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 32599312  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcca 328  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||    
T  32599311 gaggaagcccctagacttgatgtcca 32599286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 3789564 - 3789888
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789564 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 3789663  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  3789664 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 3789763  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  3789764 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 3789863  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  3789864 gaggaagctcctagacttgatgtcc 3789888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28959925 - 28959600
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28959925 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 28959826  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  28959825 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 28959726  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  28959725 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgt 28959626  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcca 328  Q
    ||||   |||||||||||||||||||    
T  28959625 gaggagactcctagacttgatgtcca 28959600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 33516377 - 33516703
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33516377 ctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatcc 33516476  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  33516477 gttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 33516576  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |    
T  33516577 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgt 33516676  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  33516677 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 33516703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 37358782 - 37358458
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37358782 acttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 37358683  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  37358682 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 37358583  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  37358582 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 37358483  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  37358482 gaggaagctcctagacttgatgtcc 37358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 24681463 - 24681787
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  24681463 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 24681562  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  24681563 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 24681662  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24681663 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 24681762  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  24681763 gaggaagctcctagacttgatgtcc 24681787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 24723990 - 24724314
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  24723990 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 24724089  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  24724090 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 24724189  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24724190 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 24724289  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  24724290 gaggaagctcctagacttgatgtcc 24724314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 40473688 - 40473364
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  40473688 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 40473589  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  40473588 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 40473489  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  40473488 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 40473389  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  40473388 gaggaagctcctagacttgatgtcc 40473364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13324968 - 13324644
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  13324968 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 13324869  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | |||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  13324868 tacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 13324769  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  13324768 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 13324669  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  13324668 gaggaagctcctagacttgatgtcc 13324644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 327
Target Start/End: Original strand, 23892253 - 23892553
Alignment:
Q  27 tatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatc 126  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  23892253 tatgccgagttgcttccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacc 23892352  T
Q  127 tcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgac 226  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  23892353 tcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaac 23892452  T
Q  227 ttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtc 326  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||  |||| || | || ||||| |||||| ||||||||||||    
T  23892453 ttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtc 23892552  T
Q  327 c 327  Q
    |    
T  23892553 c 23892553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 57 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29889167 - 29888897
Alignment:
Q  57 agagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgg 156  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||| |||||||| || ||||    
T  29889167 agagggcactgcaccaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgg 29889068  T
Q  157 gtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcga 256  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29889067 gtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcga 29888968  T
Q  257 taatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
     ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |  | ||||| |||||| |||||||||||||    
T  29888967 caatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtgtatgaggaagctcccagacttgatgtcc 29888897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 22888491 - 22888815
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||||||| || || || ||| || | |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22888491 ctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctatttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatcc 22888590  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||     
T  22888591 gttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaag 22888690  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | ||    
T  22888691 aagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 22888790  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgt 325  Q
     ||||| |||||||||||| |||||    
T  22888791 atgaggaagctcctagactcgatgt 22888815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 325
Target Start/End: Original strand, 25199106 - 25199374
Alignment:
Q  57 agagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgg 156  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||    
T  25199106 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 25199205  T
Q  157 gtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcga 256  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25199206 gtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcga 25199305  T
Q  257 taatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgt 325  Q
     ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||  ||| || |||||||||||    
T  25199306 caatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttgatgt 25199374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Original strand, 11325835 - 11326127
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  11325835 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 11325934  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  11325935 cggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaa 11326034  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 313  Q
    | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |  |||||||| ||||| || | || ||||| ||||||    
T  11326035 gttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 11326127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 322
Target Start/End: Original strand, 33877288 - 33877589
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  33877288 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 33877387  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| | ||||||||    
T  33877388 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaa 33877487  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagactt 320  Q
    | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  |||||    
T  33877488 gttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggactt 33877587  T
Q  321 ga 322  Q
    ||    
T  33877588 ga 33877589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 276
Target Start/End: Original strand, 33292584 - 33292821
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||| | || ||||| || ||||| |    
T  33292584 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgact 33292683  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 238  Q
    | |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||    
T  33292684 tccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaa 33292783  T
Q  239 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatg 276  Q
    ||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33292784 tgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatg 33292821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13184769 - 13184477
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  13184769 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 13184670  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  13184669 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaa 13184570  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 313  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| ||||||    
T  13184569 attgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 13184477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13440615 - 13440323
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    |||||||||||| |||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  13440615 atgttatatgctaaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 13440516  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  13440515 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaa 13440416  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 313  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||  ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| ||||||    
T  13440415 attgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 13440323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 14665045 - 14665371
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14665045 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 14665144  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14665145 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 14665244  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14665245 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 14665344  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14665345 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14665371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24592558 - 24592232
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24592558 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 24592459  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  24592458 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaag 24592359  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24592358 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 24592259  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24592258 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24592232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 17014027 - 17014353
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  17014027 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccaaagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 17014126  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  17014127 gttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaag 17014226  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17014227 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 17014326  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17014327 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 17014353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14763548 - 14763222
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14763548 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcc 14763449  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  14763448 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 14763349  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  14763348 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 14763249  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14763248 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14763222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27163561 - 27163235
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27163561 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 27163462  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||     
T  27163461 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaag 27163362  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  27163361 aaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 27163262  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27163261 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27163235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 5005900 - 5006226
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5005900 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaaggcaagcccccacctgatcc 5005999  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  5006000 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 5006099  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  5006100 aagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 5006199  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5006200 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 5006226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 6569880 - 6570206
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6569880 ctactttccctccgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 6569979  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  6569980 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 6570079  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  6570080 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 6570179  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6570180 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 6570206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 40105882 - 40105556
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  40105882 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgaacttcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatcc 40105783  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  40105782 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 40105683  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  40105682 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 40105583  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  40105582 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 40105556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18800855 - 18800531
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18800855 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 18800756  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  18800755 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18800656  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  18800655 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 18800556  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  18800555 gaggaagctcctagacttgatgtcc 18800531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 39 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 36344721 - 36344433
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36344721 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 36344622  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 238  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36344621 ttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataa 36344522  T
Q  239 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36344521 tgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 36344433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 39 - 327
Target Start/End: Original strand, 54833452 - 54833740
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54833452 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 54833551  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 238  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54833552 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataa 54833651  T
Q  239 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54833652 tgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 54833740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 14098568 - 14098894
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14098568 ctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatcc 14098667  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  14098668 gttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 14098767  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  14098768 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 14098867  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  14098868 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 14098894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 30753783 - 30754107
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30753783 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 30753882  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  30753883 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 30753982  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  30753983 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 30754082  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  30754083 gaggaagctcctagacttgatgtcc 30754107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31126762 - 31126436
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31126762 ctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgaccc 31126663  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  31126662 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 31126563  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |    
T  31126562 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgt 31126463  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  31126462 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 31126436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 33674040 - 33673716
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||    
T  33674040 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccgt 33673941  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  33673940 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 33673841  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  33673840 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 33673741  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  33673740 gaggaagttcctagacttgatgtcc 33673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 39850667 - 39850991
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  39850667 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 39850766  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  39850767 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 39850866  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  39850867 gctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 39850966  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  39850967 gaggaagctcctagacttgatgtcc 39850991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 21969728 - 21970054
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||    
T  21969728 ctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacgactaggcaaggcaagcctccaccggaccc 21969827  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
     || |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  21969828 tttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 21969927  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||   |    
T  21969928 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaaatgt 21970027  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| || |||||||||||||||||    
T  21970028 gtgaggaagttcctagacttgatgtcc 21970054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 57 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15285116 - 15284851
Alignment:
Q  57 agagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgg 156  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||    
T  15285116 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 15285017  T
Q  157 gtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcga 256  Q
    |||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15285016 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcga 15284917  T
Q  257 taatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttga 322  Q
     ||||| ||||| ||||| |  ||||| || ||||| || | |||||||| |||||| ||||||||    
T  15284916 caatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttga 15284851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 325
Target Start/End: Original strand, 1900340 - 1900608
Alignment:
Q  57 agagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgg 156  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||  | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||    
T  1900340 agagggcactgcacaaccagacatggtaagcctccacctgatccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 1900439  T
Q  157 gtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcga 256  Q
    |||||||||| || || |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  1900440 gtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatgtcccttatgtccttga 1900539  T
Q  257 taatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgt 325  Q
     ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| ||||| |||||    
T  1900540 caatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgt 1900608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 325
Target Start/End: Original strand, 15227953 - 15228221
Alignment:
Q  57 agagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgg 156  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||    
T  15227953 agagggcactgtacaaccagacagggtaagcctccacctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 15228052  T
Q  157 gtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcga 256  Q
    |||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  15228053 gtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctcga 15228152  T
Q  257 taatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgt 325  Q
     ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |  | || ||||  |||||| |||||||||||    
T  15228153 caatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattggggtatatgagatagctcccagacttgatgt 15228221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Original strand, 24112727 - 24112980
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||| | || ||||| || ||||| |    
T  24112727 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgact 24112826  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 238  Q
    | |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||    
T  24112827 tccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaa 24112926  T
Q  239 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 292  Q
    ||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  24112927 tgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 24112980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34189166 - 34188913
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||| | || ||||| || ||||| |    
T  34189166 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgact 34189067  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 238  Q
    | |||||||| ||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||    
T  34189066 tccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaa 34188967  T
Q  239 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 292  Q
    ||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  34188966 tgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34188913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24460829 - 24460537
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  24460829 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 24460730  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  24460729 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaa 24460630  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 313  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||    
T  24460629 attgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 24460537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 14235711 - 14235478
Alignment:
Q  59 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 158  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| | || |||||||| ||||||   | ||| |||||||||||||| |||||||| || |||||     
T  14235711 agggcactgtacaaccagacagggcaagcctccacctaaccctttgcctcccaggttccatttcgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggc 14235612  T
Q  159 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgata 258  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||| ||| || || |||||||| || || |||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  14235611 catgatgttgagggatgttacgctttgaagttcattgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcacgtcctcgaca 14235512  T
Q  259 atccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 292  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  14235511 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 14235478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15391524 - 15391288
Alignment:
Q  59 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 158  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||     
T  15391524 agggcactgcacaaccaggcaggggaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggc 15391425  T
Q  159 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgata 258  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||  | |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  15391424 catgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgaca 15391325  T
Q  259 atccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcga 295  Q
    |||| ||||  ||||| || ||||| || ||||||||    
T  15391324 atcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgatcga 15391288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4796938 - 4796612
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4796938 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 4796839  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4796838 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaa 4796739  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  4796738 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 4796639  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4796638 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4796612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15741379 - 15741053
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  15741379 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgattc 15741280  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  15741279 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaag 15741180  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15741179 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 15741080  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15741079 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15741053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29149040 - 29148714
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29149040 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcc 29148941  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  29148940 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 29148841  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29148840 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 29148741  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29148740 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29148714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8301552 - 8301226
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8301552 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 8301453  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  8301452 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 8301353  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8301352 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgt 8301253  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8301252 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8301226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 18330642 - 18330968
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18330642 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 18330741  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  18330742 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaag 18330841  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  18330842 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 18330941  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18330942 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18330968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 6192289 - 6192615
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  6192289 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatct 6192388  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  6192389 gctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 6192488  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6192489 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 6192588  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6192589 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 6192615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15892991 - 15892665
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15892991 ctactttccctccgataccaatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 15892892  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15892891 tttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 15892792  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15892791 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 15892692  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15892691 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15892665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 35880739 - 35881065
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  35880739 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccaaacagggcaagcccccacctgatcc 35880838  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35880839 gctgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaa 35880938  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  35880939 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 35881038  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||    
T  35881039 gtgaggaaactcctagacttgatgtcc 35881065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 8295945 - 8296271
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||     
T  8295945 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccacagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccctacctgatct 8296044  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  8296045 gttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 8296144  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8296145 aagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 8296244  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8296245 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8296271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22387861 - 22387537
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22387861 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgt 22387762  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  22387761 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaa 22387662  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22387661 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 22387562  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  22387561 gaggaagctcctagacttgatgtcc 22387537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 4721604 - 4721930
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4721604 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 4721703  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  4721704 gctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagtatatcgtgaaa 4721803  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  4721804 aatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtat 4721903  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||    
T  4721904 gtgaggaagctcctagactcgatgtcc 4721930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18277337 - 18277011
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  18277337 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatca 18277238  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  18277237 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 18277138  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  18277137 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 18277038  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18277037 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18277011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18292638 - 18292312
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  18292638 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatca 18292539  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  18292538 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 18292439  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  18292438 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 18292339  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18292338 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18292312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18307939 - 18307613
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  18307939 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatca 18307840  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  18307839 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 18307740  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  18307739 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 18307640  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18307639 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18307613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 4416892 - 4417218
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4416892 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaaacccccacctgatcc 4416991  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||     
T  4416992 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaag 4417091  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  4417092 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 4417191  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4417192 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4417218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28116239 - 28115913
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28116239 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacttgatcc 28116140  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  28116139 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 28116040  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  28116039 aagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 28115940  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||    
T  28115939 gcgaggaagctcctagacttgatgtcc 28115913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 7073185 - 7073511
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7073185 ctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacaaggtaagcccccgcctgatcc 7073284  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  7073285 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 7073384  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
T  7073385 aagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgt 7073484  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7073485 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 7073511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 18051235 - 18051561
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  18051235 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 18051334  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  18051335 gctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 18051434  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||    
T  18051435 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtat 18051534  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18051535 gtgagaaagctcctagacttgatgtcc 18051561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31964758 - 31964432
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31964758 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatcc 31964659  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  31964658 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 31964559  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  31964558 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 31964459  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31964458 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31964432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 50134356 - 50134030
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  50134356 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatcc 50134257  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  50134256 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 50134157  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  50134156 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 50134057  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  50134056 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 50134030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 47023426 - 47023752
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47023426 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 47023525  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  47023526 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 47023625  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||  |    
T  47023626 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgt 47023725  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  47023726 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 47023752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5609607 - 5609281
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5609607 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatcc 5609508  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  5609507 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 5609408  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  5609407 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 5609308  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5609307 gtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 5609281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 7996535 - 7996861
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7996535 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 7996634  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||     
T  7996635 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaag 7996734  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  7996735 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 7996834  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||    
T  7996835 gtgaagaagctccgaggcttgatgtcc 7996861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 10396106 - 10396432
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10396106 ctactttccctccgatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 10396205  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  10396206 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 10396305  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  10396306 aagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 10396405  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10396406 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 10396432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 10643043 - 10643369
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10643043 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 10643142  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||     
T  10643143 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaag 10643242  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  10643243 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 10643342  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||    
T  10643343 gtgaagaagctccgaggcttgatgtcc 10643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 28339275 - 28339601
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28339275 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatcc 28339374  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  28339375 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 28339474  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  28339475 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 28339574  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  28339575 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28339601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4346970 - 4346646
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4346970 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 4346871  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  4346870 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4346771  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  4346770 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4346671  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  4346670 gaggaagctcctagacttgatgtcc 4346646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 8211713 - 8212037
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8211713 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgt 8211812  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  8211813 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 8211912  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  8211913 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 8212012  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  8212013 gaggaagctcctagacttgatgtcc 8212037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 48465902 - 48466226
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48465902 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccaaagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 48466001  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  48466002 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 48466101  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  48466102 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 48466201  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  48466202 gaggaagctcctagacttgatgtcc 48466226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 5713200 - 5713512
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713200 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 5713299  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  5713300 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 5713399  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | ||    
T  5713400 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 5713499  T
Q  301 gtgaggcagctcc 313  Q
     ||||| ||||||    
T  5713500 atgaggaagctcc 5713512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 5724110 - 5724422
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724110 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 5724209  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  5724210 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 5724309  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | ||    
T  5724310 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 5724409  T
Q  301 gtgaggcagctcc 313  Q
     ||||| ||||||    
T  5724410 atgaggaagctcc 5724422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5757367 - 5757055
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757367 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 5757268  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  5757267 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 5757168  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | ||    
T  5757167 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 5757068  T
Q  301 gtgaggcagctcc 313  Q
     ||||| ||||||    
T  5757067 atgaggaagctcc 5757055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5768258 - 5767946
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768258 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 5768159  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  5768158 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 5768059  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | ||    
T  5768058 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtat 5767959  T
Q  301 gtgaggcagctcc 313  Q
     ||||| ||||||    
T  5767958 atgaggaagctcc 5767946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 21674668 - 21674992
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21674668 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 21674767  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  21674768 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 21674867  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  21674868 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 21674967  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  21674968 gaggaagctcctagacttgatgtcc 21674992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22871139 - 22870815
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22871139 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgt 22871040  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  22871039 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 22870940  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  22870939 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 22870840  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  22870839 gaggaagttcctagacttgatgtcc 22870815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22886198 - 22885874
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22886198 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgt 22886099  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  22886098 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 22885999  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  22885998 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 22885899  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  22885898 gaggaagttcctagacttgatgtcc 22885874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 28021250 - 28021574
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  28021250 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactatactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccat 28021349  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  28021350 tacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 28021449  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28021450 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgt 28021549  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  28021550 gaggaagctcctagacttgatgtcc 28021574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 327
Target Start/End: Original strand, 5466978 - 5467284
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5466978 atgttgtatgcagaactccttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 5467077  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5467078 ctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaa 5467177  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagactt 320  Q
     ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  5467178 actgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactt 5467277  T
Q  321 gatgtcc 327  Q
    |||||||    
T  5467278 gatgtcc 5467284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 39 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 36997324 - 36997036
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  36997324 cttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgact 36997225  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 238  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36997224 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataa 36997125  T
Q  239 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36997124 tgtcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 36997036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5596637 - 5596316
Alignment:
Q  6 ttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 105  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5596637 ttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 5596538  T
Q  106 ctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  5596537 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaact 5596438  T
Q  206 cattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgag 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  5596437 cattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgag 5596338  T
Q  306 gcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  5596337 gaagctcctagacttgatgtcc 5596316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6542745 - 6542421
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6542745 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 6542646  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  6542645 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 6542546  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  6542545 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 6542446  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
     ||| ||||||||||||||||||||    
T  6542445 aaggaagctcctagacttgatgtcc 6542421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11110632 - 11110308
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11110632 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctgatccgt 11110533  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  11110532 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 11110433  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||    
T  11110432 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgt 11110333  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  11110332 gaggaagctccaagacttgatgtcc 11110308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 18242714 - 18243038
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18242714 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgt 18242813  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  18242814 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18242913  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  18242914 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 18243013  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  18243014 gaggaagctcctagacttgatgtcc 18243038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 18225164 - 18225490
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225164 ctaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 18225263  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  18225264 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 18225363  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||  |    
T  18225364 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgt 18225463  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||    
T  18225464 gtgaagaagctcctaggcttgatgtcc 18225490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 327
Target Start/End: Original strand, 24328137 - 24328458
Alignment:
Q  6 ttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 105  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24328137 ttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 24328236  T
Q  106 ctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  24328237 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagct 24328336  T
Q  206 cattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgag 305  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||     
T  24328337 catcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaa 24328436  T
Q  306 gcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    | |||||| |||||||||||||    
T  24328437 gaagctccgagacttgatgtcc 24328458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 39 - 327
Target Start/End: Original strand, 5013723 - 5014011
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  5013723 cttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgact 5013822  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 238  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5013823 ttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataa 5013922  T
Q  239 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    ||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  5013923 tgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 5014011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 39 - 327
Target Start/End: Original strand, 51782034 - 51782322
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  51782034 cttctaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgact 51782133  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 238  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51782134 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataa 51782233  T
Q  239 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51782234 tgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 51782322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 39 - 327
Target Start/End: Original strand, 51797123 - 51797412
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctc-caaggttcaggtccgatctcaaatgtgat 137  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  51797123 cttctaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgtgac 51797222  T
Q  138 tttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaata 237  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51797223 tttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaata 51797322  T
Q  238 atgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51797323 atgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 51797412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20577130 - 20576806
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  20577130 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 20577031  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  20577030 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 20576931  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  20576930 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 20576831  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  20576830 gaggaagctcctagacttgatgtcc 20576806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17985241 - 17984915
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17985241 ctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatcc 17985142  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||     
T  17985141 gttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaag 17985042  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  17985041 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 17984942  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||    
T  17984941 gtgaagaagctcctagacttgatgtcc 17984915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29665253 - 29664929
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  29665253 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 29665154  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  29665153 tacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 29665054  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||    
T  29665053 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 29664954  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  29664953 gaggaagctcctagacttgatgtcc 29664929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31034378 - 31034076
Alignment:
Q  25 tatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccga 124  Q
    |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  31034378 tatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccggtctga 31034279  T
Q  125 tctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctg 224  Q
     |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||    
T  31034278 cctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttg 31034179  T
Q  225 acttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatg 324  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |    
T  31034178 acttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacg 31034079  T
Q  325 tcc 327  Q
    |||    
T  31034078 tcc 31034076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 327
Target Start/End: Original strand, 32292749 - 32293051
Alignment:
Q  25 tatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccga 124  Q
    |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  32292749 tatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagtctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctga 32292848  T
Q  125 tctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctg 224  Q
     |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||    
T  32292849 cctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttg 32292948  T
Q  225 acttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatg 324  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| ||||||  ||||||| |    
T  32292949 acttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacg 32293048  T
Q  325 tcc 327  Q
    |||    
T  32293049 tcc 32293051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 57 - 325
Target Start/End: Original strand, 18530417 - 18530685
Alignment:
Q  57 agagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgg 156  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||    
T  18530417 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 18530516  T
Q  157 gtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcga 256  Q
    |||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  18530517 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcga 18530616  T
Q  257 taatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgt 325  Q
     ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| |||||| |||||| ||||    
T  18530617 caatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgagggagctcccagacttaatgt 18530685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16626735 - 16626470
Alignment:
Q  57 agagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgg 156  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||    
T  16626735 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 16626636  T
Q  157 gtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcga 256  Q
    |||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  16626635 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttga 16626536  T
Q  257 taatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttga 322  Q
     ||||| ||||| |||||  | ||||| || ||||| || | || ||||| |||||| ||||||||    
T  16626535 caatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 16626470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 292
Target Start/End: Original strand, 32439129 - 32439418
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  32439129 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctt 32439228  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    | |||||||||||| | || ||||| || ||||| || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||    
T  32439229 tacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaa 32439328  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 292  Q
    ||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  32439329 gcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 32439418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 318
Target Start/End: Original strand, 5652380 - 5652677
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| ||||||  | |||||| || ||||| |||||||| |||||  ||||||| |||| |||||| | |||| | |    
T  5652380 atgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagccttcacctgacccgtcgcctcccaagttccgtt 5652479  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  5652480 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaa 5652579  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagac 318  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || | |||||||| |||||| ||||    
T  5652580 attgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagac 5652677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17994049 - 17993757
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  17994049 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 17993950  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || |||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  17993949 cggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaa 17993850  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcc 313  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| ||||||    
T  17993849 attgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 17993757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 292
Target Start/End: Original strand, 20066054 - 20066307
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||| |  || || |||||||||||| | || ||||| || ||||| |    
T  20066054 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgggccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgact 20066153  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 238  Q
    | |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||| ||    
T  20066154 tccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaa 20066253  T
Q  239 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 292  Q
    | | || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||    
T  20066254 tatgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgat 20066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 292
Target Start/End: Original strand, 4625937 - 4626208
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  4625937 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 4626036  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  4626037 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaa 4626136  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 292  Q
      |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  4626137 attgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgat 4626208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 205
Target Start/End: Original strand, 4893221 - 4893387
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||| || || ||||| || || || ||||||||||||   || ||||| || ||||| |    
T  4893221 cttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaaacctccaccggaccctttacctccaaggttccactctgatcttaagtgtgact 4893320  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 205  Q
    | |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||    
T  4893321 tccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagct 4893387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Original strand, 27304 - 27629
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27304 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 27403  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27404 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 27503  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27504 aagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 27603  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtc 326  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  27604 gtgaggaagctcctagacttgatgtc 27629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2137462 - 2137136
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2137462 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 2137363  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2137362 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaa 2137263  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2137262 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagcat 2137163  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  2137162 gtgagaaagctcctagacttgatgtcc 2137136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 16277566 - 16277892
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16277566 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 16277665  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  16277666 gttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaag 16277765  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16277766 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtat 16277865  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16277866 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 16277892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 19688110 - 19688436
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19688110 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 19688209  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19688210 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaa 19688309  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19688310 aagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 19688409  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||    
T  19688410 gcgaggaagctcctagacttgatgtcc 19688436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 14557636 - 14557962
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||    
T  14557636 ctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagccctcgcctgatcc 14557735  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  14557736 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 14557835  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14557836 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatgtgatcgaagtat 14557935  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14557936 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14557962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27609108 - 27608782
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27609108 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 27609009  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  27609008 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaag 27608909  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27608908 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtat 27608809  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27608808 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27608782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 16283461 - 16283787
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16283461 ctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccttagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 16283560  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  16283561 gttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 16283660  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||    
T  16283661 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtat 16283760  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||    
T  16283761 gtgaggaagctcctagacttgttgtcc 16283787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 19674453 - 19674779
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19674453 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaaacccccacctgatcc 19674552  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||     
T  19674553 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgtgaag 19674652  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  19674653 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 19674752  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19674753 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 19674779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28362158 - 28361832
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28362158 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 28362059  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  28362058 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 28361959  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  28361958 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 28361859  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  28361858 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28361832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31489953 - 31489627
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31489953 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatcc 31489854  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  31489853 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 31489754  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  31489753 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 31489654  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  31489653 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 31489627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19208563 - 19208237
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19208563 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcc 19208464  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  19208463 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 19208364  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  19208363 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 19208264  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  19208263 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 19208237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 31354536 - 31354862
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31354536 ctactttccctccgataccgatgttatatgccgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatcc 31354635  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  31354636 tttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 31354735  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  31354736 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 31354835  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||    
T  31354836 gtgaggaagctcccagacttgatgtcc 31354862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12092925 - 12092601
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12092925 acttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 12092826  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  12092825 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 12092726  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  12092725 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 12092626  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  12092625 gaggaagctcctagacttgatgtcc 12092601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 39 - 327
Target Start/End: Original strand, 19286512 - 19286800
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19286512 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatt 19286611  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 238  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19286612 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataa 19286711  T
Q  239 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19286712 tgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 19286800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 327
Target Start/End: Original strand, 33258740 - 33259061
Alignment:
Q  6 ttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 105  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33258740 ttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 33258839  T
Q  106 ctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33258840 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagct 33258939  T
Q  206 cattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgag 305  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||     
T  33258940 catcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaa 33259039  T
Q  306 gcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    | |||||| |||||||||||||    
T  33259040 gaagctccgagacttgatgtcc 33259061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 39 - 327
Target Start/End: Original strand, 29829372 - 29829660
Alignment:
Q  39 cttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||    
T  29829372 cttccaactttactccagagagggcattgtaccaccagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgatt 29829471  T
Q  139 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataa 238  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29829472 ttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataa 29829571  T
Q  239 tgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29829572 tgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29829660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3329708 - 3329384
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3329708 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgt 3329609  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  3329608 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 3329509  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||    
T  3329508 gctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgt 3329409  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  3329408 gaggaagctcctagacttgatgtcc 3329384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 18710600 - 18710924
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  18710600 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccctcacctgatccgc 18710699  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  18710700 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 18710799  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || | || |    
T  18710800 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatat 18710899  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||  ||||||| ||||    
T  18710900 gaggaagctcccggacttgacgtcc 18710924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 153 - 327
Target Start/End: Original strand, 189258 - 189432
Alignment:
Q  153 ctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  189258 ctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcc 189357  T
Q  253 tcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  189358 tcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 189432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 327
Target Start/End: Original strand, 9354654 - 9354961
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| ||||||  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |    
T  9354654 atgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgtt 9354753  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaag-ctcattgatcaaggaa 219  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||| || |||| |||||| || |||||  ||||| || |||||||    
T  9354754 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaaactcatagaccaaggaa 9354853  T
Q  220 agctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagact 319  Q
    |  |||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  9354854 aattgacctttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagact 9354953  T
Q  320 tgatgtcc 327  Q
    ||||||||    
T  9354954 tgatgtcc 9354961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19659222 - 19658926
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  | |||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| | |||| | |    
T  19659222 atgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccacctgacccgtcgcctcccaagttccgtt 19659123  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  19659122 cggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaa 19659024  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagac 318  Q
      |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||| |||||| ||||    
T  19659023 attgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 19658926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 292
Target Start/End: Original strand, 33244745 - 33244968
Alignment:
Q  69 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcg 168  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| | |||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  33244745 acaaccagacagggcaagcctccacctgacccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcg 33244844  T
Q  169 aggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttcc 268  Q
    | || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33244845 aaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttcc 33244944  T
Q  269 aaatcatgccgctgtaaatatgat 292  Q
     || || || |||||||| |||||    
T  33244945 gaaccacgctgctgtaaacatgat 33244968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 44563137 - 44563396
Alignment:
Q  25 tatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccga 124  Q
    |||||||||| ||||| || ||| |||| |  | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| | |||| | || ||    
T  44563137 tatatgctgagttgctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcgga 44563236  T
Q  125 tctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctg 224  Q
     ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||| || ||||||||| ||    
T  44563237 cctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaagttg 44563335  T
Q  225 acttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaa 285  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  44563336 acttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaa 44563396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22081023 - 22080787
Alignment:
Q  59 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 158  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||||| |||||||| || |||||     
T  22081023 agggcactgcacaaccaggcagggaaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggc 22080924  T
Q  159 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgata 258  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |    
T  22080923 catgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgaca 22080824  T
Q  259 atccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcga 295  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  22080823 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcga 22080787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 19518338 - 19518280
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagg 61  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19518338 acttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagg 19518280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 47229 - 46903
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  47229 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 47130  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  47129 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaag 47030  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47029 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 46930  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  46929 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 46903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 29775 - 30101
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  29775 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 29874  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  29875 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 29974  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  29975 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaaatatgatcgaagtat 30074  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30075 gtgaggaagctcttagacttgatgtcc 30101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 40313 - 39987
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  40313 ctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcc 40214  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  40213 gttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 40114  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40113 gagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 40014  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40013 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 374 - 47
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaa-ttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatc 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  374 ctactttccctccgataccgatgttatatgctttagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccaccggatc 275  T
Q  100 cgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaa 199  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  274 cgttgcctcccaagttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaa 175  T
Q  200 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaa 299  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  174 gaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagta 75  T
Q  300 tgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  74 tgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 47  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7483 - 7157
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7483 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 7384  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  7383 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 7284  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |    
T  7283 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgt 7184  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  7183 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 7157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 10962681 - 10963007
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10962681 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttgctccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 10962780  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  10962781 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 10962880  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  10962881 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgt 10962980  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  10962981 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 10963007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 28584992 - 28585318
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28584992 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 28585091  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  28585092 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 28585191  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  28585192 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 28585291  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||    
T  28585292 gtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28585318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 41793552 - 41793226
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  41793552 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatcc 41793453  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  41793452 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 41793353  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  41793352 aagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 41793253  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  41793252 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 41793226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 51638229 - 51638555
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  51638229 ctactttcccttcgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgaccc 51638328  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||     
T  51638329 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaag 51638428  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  51638429 aagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 51638528  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  51638529 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 51638555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16208219 - 16207951
Alignment:
Q  57 agagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgg 156  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||    
T  16208219 agagggcactgcacaaccagacagggaaaacctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 16208120  T
Q  157 gtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcga 256  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16208119 gtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcga 16208020  T
Q  257 taatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgt 325  Q
     ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||||  |||||| |||||||||||    
T  16208019 caatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttgatgt 16207951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Original strand, 28151897 - 28152164
Alignment:
Q  25 tatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccga 124  Q
    |||||||||| ||||| || ||| |||| |  |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||| || |||| ||    
T  28151897 tatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccacctgatctgttacctcccaggctccggtctga 28151996  T
Q  125 tctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctg 224  Q
     |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||    
T  28151997 cctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttg 28152096  T
Q  225 acttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 292  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  28152097 acttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgat 28152164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20340511 - 20340253
Alignment:
Q  69 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcg 168  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  20340511 acaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcg 20340412  T
Q  169 aggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttcc 268  Q
    | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  20340411 aaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 20340312  T
Q  269 aaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
     ||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  20340311 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtcc 20340253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 20461100 - 20461365
Alignment:
Q  9 cctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctc 108  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20461100 cctccgatactaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctc 20461199  T
Q  109 caaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcat 208  Q
    | |||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  20461200 ccaggttccgttctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcat 20461299  T
Q  209 tgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatca 274  Q
     || ||||||||  |||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20461300 agaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatca 20461365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9310 - 8984
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9310 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatcc 9211  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  9210 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 9111  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  9110 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 9011  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9010 gtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 8984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 20027 - 20353
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20027 ctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatcc 20126  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  20127 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 20226  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  20227 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 20326  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20327 gtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 20353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15174 - 14848
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15174 ctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 15075  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  15074 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 14975  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaat 300  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |    
T  14974 aagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatgtgatcgaagtgt 14875  T
Q  301 gtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14874 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 327
Target Start/End: Original strand, 30484 - 30790
Alignment:
Q  21 atgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 120  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30484 atgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggt 30583  T
Q  121 ccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa 220  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30584 ctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaa 30683  T
Q  221 gctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagactt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30684 gctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactt 30783  T
Q  321 gatgtcc 327  Q
    |||||||    
T  30784 gatgtcc 30790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 325
Target Start/End: Original strand, 20411 - 20723
Alignment:
Q  12 ccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaa 111  Q
    |||||||  ||||| |||||||| || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  20411 ccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccca 20510  T
Q  112 ggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattga 211  Q
    ||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20511 ggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattga 20610  T
Q  212 tcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagct 311  Q
    |||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||| | ||||    
T  20611 tcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagct 20709  T
Q  312 cctagacttgatgt 325  Q
    || ||||| |||||    
T  20710 cccagactcgatgt 20723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 9580 - 9904
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9580 acttttcctcctatacctatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagcccccacctgatccgt 9679  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  9680 tgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 9779  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  9780 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 9879  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  9880 gaggaagctcctagacttgatgtcc 9904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 6024 - 6344
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgtt-atatgctgaattgcttccaacttt-actccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6024 acttttcctcctataccgatgtttatatgctgagttgcttccaacttttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatcc 6123  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttt-catcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgcttt-gaagtacatcgtga 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  6124 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtga 6223  T
Q  199 aaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaaga 298  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  6224 agaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagt 6323  T
Q  299 atgtgaggcagctcctagact 319  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  6324 gtgtgaggaagctcctagact 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1838
Alignment:
Q  59 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggt 158  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  2103 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 2004  T
Q  159 catgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgata 258  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  2003 catgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgaca 1905  T
Q  259 atccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgt 325  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || | || ||| | |||||| ||||| |||||    
T  1904 atcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgt 1838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26446 - 26119
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26446 ctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 26347  T
Q  101 gttgcctccaa-ggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaa 199  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26346 gttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaa 26247  T
Q  200 aaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaa 299  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||       
T  26246 gaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatg 26147  T
Q  300 tgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  26146 tgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8287
Alignment:
Q  3 actttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 102  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  7963 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 8062  T
Q  103 tgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  8063 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 8162  T
Q  203 gctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgt 302  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  8163 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 8262  T
Q  303 gaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  8263 gaggaagctcctagacttgatgtcc 8287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 47057 - 46756
Alignment:
Q  5 tttccctccgatact-gatgttatatgctgaattgcttccaac---tttactccaaagaggg-cattgtacaac-tagacagggtaa--gcccccacctg 96  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  |   ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  47057 tttccctccgatacccgatgttgtatgctgagttgcttccccccgatttactccatagagggacattgtacaacctagacagggcaaacgcccccacctg 46958  T
Q  97 atccgttgcctccaaggttca-ggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtc--atg-atgtcgaggggtgc-tatgctttgaagtac 191  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  46957 atccgttgcctccaaggttcaaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcgaatggatgtcgaggggtgcgtatgctttgaagtat 46858  T
Q  192 atcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaa-gctgactttt-gagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatat 289  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  46857 atcgtgaagaagctcattgatcaaggaaaagcggactttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatat 46758  T
Q  290 ga 291  Q
    ||    
T  46757 ga 46756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2834 - 2576
Alignment:
Q  69 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcg 168  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  2834 acaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcg 2735  T
Q  169 aggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttcc 268  Q
    | || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  2734 aaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 2635  T
Q  269 aaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagaatgtgaggcagctcctagacttgatgtcc 327  Q
     ||||| || ||||| || ||||| || | || ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  2634 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtcc 2576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 216 - 5
Alignment:
Q  57 agagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgg 156  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | |||||| | || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||    
T  216 agagggcactgctcaaccagacatggcaagcctccacctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 117  T
Q  157 gtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcga 256  Q
    |||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  116 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcga 17  T
Q  257 taatccacttcc 268  Q
     ||||| |||||    
T  16 caatcctcttcc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 101 - 397
Alignment:
Q  1 ctactttccctccgatactgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatcc 100  Q
    ||||||| ||||| || | |||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||    
T  101 ctacttttcctccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtacgactaggcagggtaagcctccgccagatcc 200  T
Q  101 gttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaa 200  Q
     || || ||||||||  |  | |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||| || ||  |     
T  201 attaccaccaaggtttcgtactgatctcaagtgtgactttcatcagggggccttgggtcacgacgttgagaggtgttatgctttaaagtatattgtccag 300  T
Q  201 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaag 297  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |   || |||||||| ||||| || |||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||    
T  301 aggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatgctgcagtaaacatgattgaag 397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 568
Alignment:
Q  135 gattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgaga 234  Q
    ||||| |||||||  || ||||| |||||||| || || || || |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  235 ataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcga 295  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  628 ataatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcga 568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 295
Target Start/End: Original strand, 21641 - 21867
Alignment:
Q  69 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcg 168  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||| | | ||||||||| |||||| | || || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| || ||||| |    
T  21641 acaaccaggcagggcaagcctccacctaacctgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttg 21740  T
Q  169 aggggtgctatgctttgaagtacatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgataatccacttcc 268  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||    
T  21741 aaggatgttacgctttgaagtagattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttcc 21840  T
Q  269 aaatcatgccgctgtaaatatgatcga 295  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||    
T  21841 gaatcacgctgctgtgaacatgatcga 21867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University