View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7223_low_28 (Length: 207)

Name: NF7223_low_28
Description: NF7223
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7223_low_28
NF7223_low_28
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (10-194)||(4203832-4204016)
chr7 (10-194)||(2105674-2105858)
chr7 (10-194)||(10912380-10912564)
chr7 (10-194)||(26511207-26511391)
chr7 (10-194)||(39208650-39208834)
chr7 (10-194)||(2777697-2777881)
chr7 (10-194)||(5132439-5132623)
chr7 (10-194)||(5162826-5163010)
chr7 (10-194)||(11420290-11420474)
chr7 (10-194)||(26533384-26533568)
chr7 (10-194)||(31128350-31128534)
chr7 (10-194)||(2159017-2159201)
chr7 (10-194)||(4140757-4140941)
chr7 (10-194)||(24588045-24588229)
chr7 (10-194)||(26315359-26315543)
chr7 (10-194)||(26517235-26517419)
chr7 (10-194)||(45735750-45735934)
chr7 (10-194)||(3449749-3449933)
chr7 (10-194)||(26270597-26270781)
chr7 (10-194)||(26665425-26665609)
chr7 (10-194)||(26680617-26680801)
chr7 (12-194)||(31086133-31086315)
chr7 (10-194)||(5142851-5143035)
chr7 (10-194)||(31559901-31560085)
chr7 (10-194)||(16513941-16514125)
chr7 (10-194)||(45391663-45391847)
chr7 (10-194)||(16747028-16747212)
chr7 (10-194)||(26439700-26439884)
chr7 (10-194)||(11445330-11445514)
chr7 (10-191)||(16445520-16445701)
chr7 (10-194)||(16045758-16045942)
chr7 (10-194)||(10846063-10846247)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (10-194)||(20334047-20334231)
chr4 (10-194)||(5010334-5010518)
chr4 (10-194)||(6574317-6574501)
chr4 (10-194)||(17017505-17017689)
chr4 (10-194)||(24587987-24588171)
chr4 (10-194)||(34184586-34184770)
chr4 (10-194)||(54837850-54838034)
chr4 (10-194)||(14669472-14669656)
chr4 (10-194)||(14755118-14755302)
chr4 (10-194)||(36340143-36340327)
chr4 (10-194)||(39855096-39855280)
chr4 (10-194)||(21974160-21974344)
chr4 (10-194)||(31122138-31122322)
chr4 (10-194)||(33669426-33669610)
chr4 (10-194)||(40101263-40101447)
chr4 (10-194)||(14103002-14103186)
chr4 (10-194)||(18312804-18312988)
chr4 (10-194)||(30758219-30758403)
chr4 (10-194)||(5698994-5699178)
chr4 (10-194)||(27158943-27159127)
chr4 (10-194)||(15232275-15232459)
chr4 (10-194)||(18796240-18796424)
chr4 (10-194)||(24117121-24117305)
chr4 (10-194)||(15278253-15278437)
chr4 (10-194)||(1904713-1904897)
chr4 (10-191)||(15381862-15382043)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (10-194)||(32443558-32443742)
chr3 (10-194)||(29660639-29660823)
chr3 (10-194)||(35885173-35885357)
chr3 (10-194)||(4792304-4792488)
chr3 (10-194)||(5715480-5715664)
chr3 (10-194)||(5726390-5726574)
chr3 (10-194)||(5765794-5765978)
chr3 (10-194)||(20572512-20572696)
chr3 (10-194)||(21679110-21679294)
chr3 (10-194)||(28343584-28343768)
chr3 (10-194)||(32295035-32295219)
chr3 (10-194)||(4421322-4421506)
chr3 (10-194)||(4726037-4726221)
chr3 (10-194)||(6206311-6206495)
chr3 (10-194)||(18288022-18288206)
chr3 (10-194)||(18303323-18303507)
chr3 (10-194)||(20070447-20070631)
chr3 (10-194)||(28111623-28111807)
chr3 (10-194)||(48470334-48470518)
chr3 (10-194)||(5018121-5018305)
chr3 (10-194)||(6538411-6538595)
chr3 (10-194)||(15736763-15736947)
chr3 (10-194)||(17972530-17972714)
chr3 (10-194)||(18055669-18055853)
chr3 (10-194)||(18335037-18335221)
chr3 (10-194)||(29144425-29144609)
chr3 (10-194)||(51786430-51786614)
chr3 (10-194)||(5604983-5605167)
chr3 (10-194)||(7077613-7077797)
chr3 (10-194)||(8285139-8285323)
chr3 (10-194)||(11106028-11106212)
chr3 (10-194)||(22383247-22383431)
chr3 (10-194)||(31960124-31960308)
chr3 (10-194)||(47027860-47028044)
chr3 (10-194)||(4688062-4688246)
chr3 (10-194)||(5471395-5471579)
chr3 (10-194)||(5592026-5592210)
chr3 (10-194)||(8000967-8001151)
chr3 (10-194)||(10400551-10400735)
chr3 (10-194)||(10647480-10647664)
chr3 (10-194)||(15888374-15888558)
chr3 (10-194)||(17980618-17980802)
chr3 (10-194)||(18229603-18229787)
chr3 (10-194)||(18247148-18247332)
chr3 (10-194)||(28025688-28025872)
chr3 (10-194)||(4342345-4342529)
chr3 (10-194)||(4628192-4628376)
chr3 (10-194)||(24332570-24332754)
chr3 (10-194)||(22866517-22866701)
chr3 (10-194)||(22881576-22881760)
chr3 (10-194)||(31031905-31032089)
chr3 (10-194)||(16620159-16620343)
chr3 (19-194)||(19698906-19699081)
chr3 (93-194)||(5656624-5656725)
chr3 (10-89)||(8216142-8216221)
chr3 (10-89)||(5654492-5654571)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (10-194)||(27808148-27808332)
chr2 (10-194)||(12591253-12591437)
chr2 (10-194)||(19412116-19412300)
chr2 (10-194)||(23124184-23124368)
chr2 (10-194)||(27120969-27121153)
chr2 (10-194)||(16165925-16166109)
chr2 (10-194)||(27780679-27780863)
chr2 (10-194)||(27820436-27820620)
chr2 (10-194)||(28886724-28886908)
chr2 (10-194)||(34295599-34295783)
chr2 (10-194)||(37681510-37681694)
chr2 (10-194)||(37696775-37696959)
chr2 (10-191)||(11630802-11630983)
chr2 (10-194)||(37382122-37382306)
chr2 (10-194)||(37947477-37947661)
chr2 (10-192)||(13932164-13932346)
chr2 (10-194)||(16824953-16825137)
chr2 (10-194)||(16896343-16896527)
chr2 (10-194)||(27430056-27430240)
chr2 (10-194)||(40237953-40238137)
chr2 (10-194)||(256268-256452)
chr2 (10-198)||(9345597-9345785)
chr2 (10-194)||(22923763-22923947)
chr2 (10-194)||(31880731-31880915)
chr2 (10-194)||(31889106-31889290)
chr2 (10-194)||(34159289-34159473)
chr2 (10-194)||(34270535-34270719)
chr2 (10-194)||(3786938-3787122)
chr2 (10-194)||(21672790-21672974)
chr2 (10-194)||(32054248-32054432)
chr2 (10-194)||(37929814-37929998)
chr2 (10-194)||(39894514-39894698)
chr2 (10-194)||(12659981-12660165)
chr2 (10-194)||(12712216-12712400)
chr2 (10-194)||(39047434-39047618)
chr2 (10-194)||(20842358-20842542)
chr2 (10-194)||(34866129-34866313)
chr2 (10-194)||(19452038-19452222)
chr2 (10-194)||(21698786-21698970)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (10-191)||(9321929-9322110)
chr5 (10-194)||(30939088-30939272)
chr5 (10-194)||(8660998-8661182)
chr5 (10-194)||(9546232-9546416)
chr5 (10-194)||(13182316-13182500)
chr5 (10-194)||(22994640-22994824)
chr5 (10-194)||(24728422-24728606)
chr5 (10-194)||(26484847-26485031)
chr5 (10-194)||(33781938-33782122)
chr5 (10-194)||(6878758-6878942)
chr5 (10-194)||(11553808-11553992)
chr5 (10-194)||(12136628-12136812)
chr5 (10-194)||(18123939-18124123)
chr5 (10-194)||(23630423-23630606)
chr5 (10-194)||(33296981-33297165)
chr5 (10-194)||(11328090-11328274)
chr5 (22-194)||(15654281-15654453)
chr5 (10-194)||(24974359-24974543)
chr5 (10-194)||(28955308-28955492)
chr5 (10-194)||(30172922-30173106)
chr5 (10-194)||(33520833-33521017)
chr5 (10-194)||(41679158-41679342)
chr5 (10-194)||(43082708-43082892)
chr5 (10-194)||(2515515-2515699)
chr5 (10-194)||(3793994-3794178)
chr5 (10-194)||(13438206-13438390)
chr5 (10-194)||(15754375-15754559)
chr5 (10-194)||(18371057-18371241)
chr5 (10-194)||(18496248-18496432)
chr5 (10-194)||(28653696-28653880)
chr5 (10-198)||(40469069-40469257)
chr5 (10-194)||(5642241-5642425)
chr5 (10-194)||(24587827-24588011)
chr5 (10-194)||(30156484-30156668)
chr5 (10-194)||(31821930-31822114)
chr5 (10-194)||(33879581-33879765)
chr5 (10-194)||(37667009-37667193)
chr5 (10-194)||(37759436-37759620)
chr5 (10-194)||(37766514-37766698)
chr5 (10-194)||(30033881-30034065)
chr5 (10-194)||(32591797-32591981)
chr5 (10-194)||(37354166-37354350)
chr5 (10-194)||(13320353-13320537)
chr5 (10-194)||(34620971-34621155)
chr5 (10-194)||(25204731-25204915)
chr5 (10-194)||(25268886-25269070)
chr5 (10-194)||(31435917-31436101)
chr5 (13-191)||(29886723-29886901)
chr5 (10-194)||(23896328-23896512)
chr5 (10-191)||(22892916-22893097)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (10-194)||(14017-14201)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (10-194)||(17028-17212)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (10-194)||(8406-8590)
scaffold0143 (10-194)||(31739-31923)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (10-194)||(2132847-2133031)
chr8 (10-194)||(18795149-18795333)
chr8 (10-194)||(27604492-27604676)
chr8 (10-194)||(33246815-33246999)
chr8 (10-194)||(33263179-33263363)
chr8 (13-194)||(19912749-19912930)
chr8 (10-194)||(19692543-19692727)
chr8 (10-194)||(21343758-21343942)
chr8 (10-192)||(22137355-22137537)
chr8 (10-194)||(9359070-9359254)
chr8 (10-194)||(15772019-15772203)
chr8 (10-194)||(28357539-28357723)
chr8 (10-194)||(29833770-29833954)
chr8 (10-194)||(31485458-31485642)
chr8 (10-194)||(12088310-12088494)
chr8 (10-194)||(14562069-14562253)
chr8 (10-194)||(16287398-16287581)
chr8 (10-194)||(18713929-18714113)
chr8 (10-194)||(31358973-31359157)
chr8 (10-194)||(19203949-19204133)
chr8 (10-194)||(19656928-19657112)
chr8 (10-194)||(44565429-44565613)
chr8 (10-194)||(19678892-19679076)
chr8 (10-191)||(22076515-22076696)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (10-194)||(16754264-16754448)
chr6 (10-194)||(27023580-27023764)
chr6 (10-194)||(14140963-14141147)
chr6 (10-194)||(26922820-26923004)
chr6 (10-194)||(27357679-27357863)
chr6 (10-194)||(29554000-29554184)
chr6 (10-194)||(8901272-8901456)
chr6 (10-194)||(22930453-22930637)
chr6 (10-194)||(23852898-23853082)
chr6 (10-194)||(26774196-26774380)
chr6 (10-194)||(27183372-27183556)
chr6 (10-194)||(27265683-27265867)
chr6 (10-194)||(28164934-28165118)
chr6 (10-194)||(29577457-29577641)
chr6 (10-194)||(24301326-24301510)
chr6 (10-194)||(30553585-30553769)
chr6 (10-194)||(33372000-33372184)
chr6 (10-194)||(3700526-3700710)
chr6 (10-194)||(4541343-4541527)
chr6 (10-194)||(4719704-4719888)
chr6 (10-194)||(4762206-4762390)
chr6 (10-194)||(4777323-4777507)
chr6 (10-194)||(27061949-27062133)
chr6 (10-194)||(4529728-4529912)
chr6 (10-194)||(13519763-13519947)
chr6 (10-194)||(16678583-16678767)
chr6 (10-194)||(16939596-16939780)
chr6 (10-194)||(24868159-24868343)
chr6 (10-194)||(26111981-26112165)
chr6 (10-194)||(27489576-27489760)
chr6 (10-194)||(27625280-27625464)
chr6 (10-194)||(13294520-13294704)
chr6 (10-194)||(15408102-15408286)
chr6 (10-194)||(15419889-15420073)
chr6 (10-194)||(27198628-27198812)
chr6 (10-194)||(28211897-28212081)
chr6 (10-194)||(34460075-34460259)
chr6 (10-194)||(29505859-29506043)
chr6 (10-192)||(26790259-26790441)
chr6 (10-194)||(27250422-27250607)
chr6 (10-194)||(27012174-27012358)
chr6 (10-194)||(20172990-20173174)
chr6 (10-194)||(22162817-22163001)
chr6 (13-194)||(27285933-27286114)
chr6 (10-191)||(17088015-17088196)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (10-194)||(3645590-3645774)
chr1 (10-194)||(21893374-21893558)
chr1 (10-194)||(28154184-28154368)
chr1 (10-194)||(10949525-10949709)
chr1 (10-194)||(10967113-10967297)
chr1 (10-194)||(28589528-28589712)
chr1 (10-194)||(41788936-41789120)
chr1 (10-194)||(51642666-51642850)
chr1 (10-194)||(16203660-16203844)
chr1 (10-194)||(20465424-20465608)
chr1 (13-191)||(20336045-20336223)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (10-194)||(10482-10666)
[»] scaffold0159 (4 HSPs)
scaffold0159 (10-194)||(11799-11983)
scaffold0159 (10-194)||(4805-4989)
scaffold0159 (40-194)||(24049-24203)
scaffold0159 (10-128)||(9709-9827)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (10-194)||(21817-22001)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (10-194)||(10554-10738)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (10-194)||(4513-4697)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (10-194)||(10468-10653)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (10-194)||(104-288)
scaffold0322 (12-191)||(10493-10672)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (10-194)||(12395-12579)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (10-194)||(42305-42492)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (10-191)||(23562-23743)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (148-194)||(11216-11262)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 4203832 - 4204016
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4203832 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 4203931  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4203932 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 4204016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2105858 - 2105674
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2105858 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 2105759  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2105758 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 2105674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10912564 - 10912380
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10912564 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 10912465  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10912464 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttgatgcatgatgt 10912380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26511391 - 26511207
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26511391 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 26511292  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26511291 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 26511207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 39208834 - 39208650
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39208834 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 39208735  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39208734 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 39208650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 2777697 - 2777881
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2777697 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 2777796  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2777797 gagatattctctacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 2777881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 5132439 - 5132623
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  5132439 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcttgttagatg 5132538  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5132539 gagatattatgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 5132623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 5162826 - 5163010
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  5162826 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattgaccagtagattcctgttagatg 5162925  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5162926 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 5163010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11420474 - 11420290
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11420474 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 11420375  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11420374 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 11420290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26533568 - 26533384
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26533568 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 26533469  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26533468 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 26533384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 31128350 - 31128534
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31128350 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 31128449  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31128450 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 31128534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 2159017 - 2159201
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2159017 gacatcaaatagttcttgctgagccgtgagtatccaccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 2159116  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2159117 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 2159201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4140941 - 4140757
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4140941 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 4140842  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4140841 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 4140757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24588229 - 24588045
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24588229 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 24588130  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24588129 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 24588045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26315543 - 26315359
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26315543 gacattaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagatttctgttagatg 26315444  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26315443 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtgttgttaagatgtgttgatgagcatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 26315359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 26517235 - 26517419
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26517235 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 26517334  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26517335 gagaaattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 26517419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 45735750 - 45735934
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45735750 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 45735849  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45735850 gagatattctgtacaagagaaactatgacatagtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 45735934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 3449749 - 3449933
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3449749 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 3449848  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3449849 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggaacagttaatgcatgatgt 3449933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26270781 - 26270597
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26270781 gacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagatttctgttagatg 26270682  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26270681 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 26270597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26665609 - 26665425
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  26665609 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 26665510  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26665509 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 26665425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26680801 - 26680617
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  26680801 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 26680702  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26680701 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 26680617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31086315 - 31086133
Alignment:
Q  12 catcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatgga 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||     
T  31086315 catcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtaggttccggttagatggg 31086216  T
Q  112 gatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31086215 gatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 31086133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5143035 - 5142851
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5143035 gacatcaaacagttcttgctgagtcgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaggataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 5142936  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5142935 gagatatcctgtacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 5142851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31560085 - 31559901
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  31560085 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 31559986  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  31559985 gagatattttgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 31559901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16514125 - 16513941
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16514125 gacatcaaacagttcttgctgagccgtaagtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 16514026  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16514025 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttgatgcatgatgt 16513941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 45391663 - 45391847
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  45391663 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 45391762  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45391763 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 45391847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16747212 - 16747028
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |    
T  16747212 gacatcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagacg 16747113  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16747112 gagatattctgtataagaggaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 16747028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 26439700 - 26439884
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  26439700 gacatcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgaggagattggccggtagattcctgttagatg 26439799  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26439800 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaatatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 26439884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 11445330 - 11445514
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  11445330 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 11445429  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11445430 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 11445514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16445701 - 16445520
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16445701 gacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccactgggtgcttccaacagagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 16445602  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatga 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445601 gagatattatgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttggtgaacacgaagcggagcagttaatgcatga 16445520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 16045758 - 16045942
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||| |    
T  16045758 gacatcgagcagttcttgctaagccgtaagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaaaaccctgagaagattggccagtaaattcctgctagagg 16045857  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16045858 gagatattctgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 16045942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 10846063 - 10846247
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  10846063 gacaccaaacagttcttgctaagccgtgagtatccacagggtgcttccaacaaagacaagaagactctaagaagattggctagtaggttcttattagatg 10846162  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    | || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10846163 gggacattttgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtattgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 10846247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20334231 - 20334047
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20334231 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 20334132  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20334131 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 20334047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 5010334 - 5010518
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  5010334 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagactctgagaagattggccagcagattcctgatagatg 5010433  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5010434 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 5010518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 6574317 - 6574501
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6574317 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 6574416  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6574417 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 6574501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 17017505 - 17017689
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17017505 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 17017604  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17017605 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagtagttaatgcatgatgt 17017689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24588171 - 24587987
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24588171 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaaggccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 24588072  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24588071 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 24587987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34184770 - 34184586
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34184770 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 34184671  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34184670 gagatattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacgtgaagcggagcagttaatgcatgatgt 34184586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 54837850 - 54838034
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  54837850 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 54837949  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  54837950 gagatattttgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagaacagttaatgcatgatgt 54838034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 14669472 - 14669656
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14669472 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 14669571  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14669572 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttgatgcatgatgt 14669656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14755302 - 14755118
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14755302 gacatcaagcagttcttgctgagccatgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 14755203  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14755202 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 14755118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36340327 - 36340143
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36340327 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 36340228  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36340227 gagatatcctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 36340143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 39855096 - 39855280
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39855096 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgcctggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 39855195  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39855196 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtgttgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 39855280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 21974160 - 21974344
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  21974160 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 21974259  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21974260 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 21974344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31122322 - 31122138
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  31122322 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 31122223  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31122222 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 31122138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33669610 - 33669426
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33669610 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 33669511  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33669510 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 33669426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40101447 - 40101263
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40101447 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 40101348  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40101347 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 40101263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 14103002 - 14103186
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  14103002 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 14103101  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14103102 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 14103186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18312988 - 18312804
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  18312988 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 18312889  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18312888 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 18312804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 30758219 - 30758403
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  30758219 gacatcaaacagttcttactaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattccggttagatg 30758318  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30758319 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 30758403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 5698994 - 5699178
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  5698994 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 5699093  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5699094 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 5699178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27159127 - 27158943
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27159127 gacatcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 27159028  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27159027 gagatatcctgtacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 27158943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 15232275 - 15232459
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15232275 gacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 15232374  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15232375 gagatattttgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 15232459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18796424 - 18796240
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18796424 gacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 18796325  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18796324 gagatattctgtacaaaaggaactacgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 18796240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 24117121 - 24117305
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24117121 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaggactttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 24117220  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24117221 gggatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 24117305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15278437 - 15278253
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  15278437 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttcttattagatg 15278338  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    | || ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15278337 gggacattttgtacaagagaaactacaacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 15278253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 1904713 - 1904897
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| |||||| |||| | || ||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  1904713 gacatcaagcagttcctgctaagccatgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttcttattagatg 1904812  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    | || ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1904813 gggacattttgtacaagagaaactacaacatggtattgttaagatgtgttgatgagcacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 1904897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15382043 - 15381862
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||| | | |||||| ||||| || |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  15382043 gacatcaagcagttcttgataagccgtgagtatccaccaggtgcttccaacaaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttctttttagatg 15381944  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatga 191  Q
    | || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  15381943 gggacattttgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgagcatgaggcagagcaattaatgcatga 15381862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 32443558 - 32443742
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32443558 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 32443657  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32443658 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 32443742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29660823 - 29660639
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29660823 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 29660724  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29660723 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 29660639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 35885173 - 35885357
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35885173 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 35885272  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35885273 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 35885357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4792488 - 4792304
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4792488 gacatcaagcagttcttgcggagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 4792389  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4792388 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 4792304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 5715480 - 5715664
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5715480 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 5715579  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5715580 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaggcagagcagttaatgcatgatgt 5715664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 5726390 - 5726574
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5726390 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 5726489  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5726490 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaggcagagcagttaatgcatgatgt 5726574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5765978 - 5765794
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5765978 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 5765879  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5765878 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaggcagagcagttaatgcatgatgt 5765794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20572696 - 20572512
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  20572696 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 20572597  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20572596 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggaacagttaatgcatgatgt 20572512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 21679110 - 21679294
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21679110 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 21679209  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21679210 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 21679294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 28343584 - 28343768
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  28343584 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 28343683  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28343684 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 28343768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 32295035 - 32295219
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32295035 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgcctggtgcttccaaacaagataagaagaccctaagaagattggccagtagattcctgttagatg 32295134  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32295135 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 32295219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 4421322 - 4421506
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4421322 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 4421421  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4421422 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 4421506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 4726037 - 4726221
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4726037 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgctgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 4726136  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4726137 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 4726221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 6206311 - 6206495
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6206311 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 6206410  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6206411 gagatattttgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagtagttaatgcatgatgt 6206495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18288206 - 18288022
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18288206 gacatcaagcagttcttgctgagccatgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 18288107  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18288106 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 18288022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18303507 - 18303323
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18303507 gacatcaagcagttcttgctgagccatgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 18303408  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18303407 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 18303323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 20070447 - 20070631
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20070447 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 20070546  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20070547 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtgttgttaagatgtgtcgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 20070631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 28111807 - 28111623
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28111807 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccggttgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagattcctgttagatg 28111708  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28111707 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtgttgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 28111623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 48470334 - 48470518
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  48470334 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtacttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 48470433  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48470434 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 48470518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 5018121 - 5018305
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  5018121 gacatcaaacagttcttgctgagccatgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 5018220  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5018221 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 5018305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6538595 - 6538411
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6538595 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 6538496  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6538495 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 6538411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15736947 - 15736763
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15736947 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgctgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 15736848  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15736847 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 15736763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17972714 - 17972530
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17972714 gacattaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccccgagaagattggccagcagatttctgttagatg 17972615  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17972614 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtgttgttaagatgtgttgatgagcatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 17972530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 18055669 - 18055853
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18055669 gacatcaaacagttcttgctgagtcgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 18055768  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18055769 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 18055853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 18335037 - 18335221
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18335037 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgcctggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 18335136  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18335137 gggatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 18335221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29144609 - 29144425
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  29144609 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgaggagattggccagtagattcctgttagatg 29144510  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29144509 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcaattaatgcatgatgt 29144425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 51786430 - 51786614
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51786430 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 51786529  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  51786530 gagagattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 51786614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5605167 - 5604983
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  5605167 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 5605068  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5605067 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 5604983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 7077613 - 7077797
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7077613 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggctagtagatttctgttagatg 7077712  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7077713 gggatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 7077797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8285323 - 8285139
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8285323 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 8285224  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8285223 gagatattctgtacaagagaaattatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttgatgcatgatgt 8285139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11106212 - 11106028
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11106212 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgctgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 11106113  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11106112 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 11106028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22383431 - 22383247
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22383431 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 22383332  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  22383331 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagaacagttaatgcatgatgt 22383247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31960308 - 31960124
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  31960308 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 31960209  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31960208 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 31960124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 47027860 - 47028044
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  47027860 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 47027959  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  47027960 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggaacagttagtgcatgatgt 47028044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 4688062 - 4688246
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  4688062 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattgaccagtagattcctgttagacg 4688161  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4688162 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 4688246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 5471395 - 5471579
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  5471395 gacatcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 5471494  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  5471495 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttgatgcatgatgt 5471579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5592210 - 5592026
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  5592210 gacatcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 5592111  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5592110 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtgttgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 5592026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 8000967 - 8001151
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8000967 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 8001066  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8001067 gagatattctgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 8001151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 10400551 - 10400735
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10400551 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 10400650  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10400651 gagatatcctgtacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 10400735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 10647480 - 10647664
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10647480 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 10647579  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10647580 gagatattctgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 10647664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15888558 - 15888374
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  15888558 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagcagattggccagtagattcctgttagatg 15888459  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  15888458 gagatattctgtacaagagaaactatgacatagtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgtatgatgt 15888374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17980802 - 17980618
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  17980802 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 17980703  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17980702 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgataaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 17980618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 18229603 - 18229787
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  18229603 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 18229702  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18229703 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgataaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 18229787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 18247148 - 18247332
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  18247148 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 18247247  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18247248 gagatattttgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 18247332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 28025688 - 28025872
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  28025688 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 28025787  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28025788 gggatattctgtacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 28025872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4342529 - 4342345
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  4342529 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 4342430  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4342429 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 4342345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 4628192 - 4628376
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  4628192 gacatcaaacagttcttgctgagtcgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaggataggaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 4628291  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4628292 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcaattaatgcatgatgt 4628376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 24332570 - 24332754
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  24332570 gacatcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 24332669  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24332670 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 24332754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22866701 - 22866517
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||     
T  22866701 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagata 22866602  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22866601 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 22866517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22881760 - 22881576
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||     
T  22881760 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagata 22881661  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22881660 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 22881576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31032089 - 31031905
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | | || | ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31032089 gacatcaagcagttcttgctaagctgtaagtatccaccgggagcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 31031990  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31031989 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 31031905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16620343 - 16620159
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||| ||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||    
T  16620343 gacaccaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggctggtaggttcttgttagatg 16620244  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    | || ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16620243 gggacattttgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 16620159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 19698906 - 19699081
Alignment:
Q  19 cagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatggagatatta 118  Q
    ||||||||||| | ||  || ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || | |||| || |||||||||| |||     
T  19698906 cagttcttgctaagccacgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtaaattcttgctagatggagacattt 19699005  T
Q  119 tgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19699006 tgtacaagagaaactacaacatggtattgttaagatgtgttgatgaacgcgaagcagagcagttaatgcatgatgt 19699081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 194
Target Start/End: Original strand, 5656624 - 5656725
Alignment:
Q  93 cagattcctgttagatggagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgat 192  Q
    ||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5656624 cagattcttgctagatggaaacattttgtacaagagaaactacgacatgatattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgat 5656723  T
Q  193 gt 194  Q
    ||    
T  5656724 gt 5656725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 8216142 - 8216221
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggc 89  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8216142 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggc 8216221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 5654492 - 5654571
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggc 89  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5654492 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggc 5654571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 27808148 - 27808332
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27808148 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 27808247  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27808248 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 27808332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 12591253 - 12591437
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12591253 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 12591352  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12591353 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 12591437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19412300 - 19412116
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19412300 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 19412201  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19412200 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 19412116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23124368 - 23124184
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23124368 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaaaaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 23124269  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23124268 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 23124184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 27120969 - 27121153
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27120969 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 27121068  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27121069 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 27121153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 16165925 - 16166109
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16165925 gacatcaaacagttcttgctgaactgtgagtatccgccaagtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 16166024  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16166025 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 16166109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 27780679 - 27780863
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27780679 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 27780778  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27780779 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 27780863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 27820436 - 27820620
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27820436 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 27820535  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27820536 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 27820620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 28886724 - 28886908
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28886724 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 28886823  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28886824 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtatggttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 28886908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 34295599 - 34295783
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  34295599 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagagtcctgttagatg 34295698  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34295699 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 34295783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37681694 - 37681510
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37681694 gacatcaaacagttcttgctgagtcgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 37681595  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37681594 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 37681510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37696959 - 37696775
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37696959 gacatcaaacagttcttgctgagtcgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 37696860  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37696859 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 37696775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11630983 - 11630802
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11630983 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 11630884  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatga 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11630883 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatga 11630802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 37382122 - 37382306
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37382122 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtacttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 37382221  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37382222 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 37382306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37947661 - 37947477
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  37947661 gacatcaaacagtttttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 37947562  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  37947561 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggaacagttaatgcatgatgt 37947477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13932346 - 13932164
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13932346 gacatcaaacagttcttgctgagtcgtgagtatccgccgggtgcttccaagcaagacaagaagaccttgagaagattggccagcagattcctgttagatg 13932247  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgat 192  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13932246 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgat 13932164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16825137 - 16824953
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  16825137 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 16825038  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16825037 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 16824953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 16896343 - 16896527
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  16896343 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 16896442  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16896443 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 16896527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27430240 - 27430056
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27430240 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaacaaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 27430141  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27430140 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 27430056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 40237953 - 40238137
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  40237953 gacatcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 40238052  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40238053 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 40238137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 256452 - 256268
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  256452 gacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 256353  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  256352 gagatattttgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 256268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9345785 - 9345597
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9345785 gacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 9345686  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgtccat 198  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9345685 gagatattctgtacaaaaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtccat 9345597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22923947 - 22923763
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  22923947 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 22923848  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22923847 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 22923763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 31880731 - 31880915
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31880731 gacatcaaacagttcttgctaaaccgtgagtatccgacaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 31880830  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31880831 gaaatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 31880915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31889290 - 31889106
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  31889290 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgcctggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattagccagtagattcctgttagatg 31889191  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31889190 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttaatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 31889106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 34159289 - 34159473
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34159289 gacatcaaacagttcttgctgagccatgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 34159388  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34159389 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 34159473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34270719 - 34270535
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  34270719 gacatcaaacagttcttactgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 34270620  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  34270619 gagatattctgtacaagagacactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagttgagcagttaatgcatgatgt 34270535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 3786938 - 3787122
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3786938 gacatcaaacagttcttactaagncgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 3787037  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3787038 gagatattctgtacaagagaaactacgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 3787122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21672974 - 21672790
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  21672974 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgaatatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 21672875  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21672874 gaggtattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 21672790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 32054248 - 32054432
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  32054248 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 32054347  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32054348 gaaatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 32054432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 37929814 - 37929998
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  37929814 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 37929913  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37929914 gaaatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 37929998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 39894514 - 39894698
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39894514 gacatcaagtagttcttgctgagccgtgaatatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 39894613  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39894614 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 39894698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 12659981 - 12660165
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  12659981 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgaggagattggccagtagattcctgttagatg 12660080  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12660081 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttgatgcatgatgt 12660165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12712400 - 12712216
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  12712400 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 12712301  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12712300 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 12712216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 39047618 - 39047434
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  39047618 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaaaaccttgagaaggttggccagtagattcctgttagatg 39047519  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39047518 gagatatcctgtacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 39047434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 20842358 - 20842542
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20842358 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgtcgggtgctttcaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 20842457  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20842458 gagatattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgctgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 20842542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 34866129 - 34866313
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  34866129 gacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 34866228  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34866229 gagatattctatacaaaaggaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaatatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 34866313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19452222 - 19452038
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  19452222 gacatcaagcagttcttgctaagccgtgggtatccgtcgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggctagtaggttcttattagatg 19452123  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    | || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19452122 gggacattttgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 19452038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21698970 - 21698786
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||    
T  21698970 gacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccggatgcttccaacaaagacaagaagaccctgaggagattggccagtagatttctgttagatg 21698871  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21698870 gagacattttgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 21698786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Original strand, 9321929 - 9322110
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9321929 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 9322028  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatga 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9322029 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatga 9322110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 30939088 - 30939272
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30939088 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 30939187  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30939188 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 30939272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8661182 - 8660998
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8661182 gacatcaaacagttcttgctgagtcgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 8661083  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8661082 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 8660998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9546416 - 9546232
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9546416 gacatcaaacagttcttgctgagccgggagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 9546317  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9546316 gagatattttgtacaagagaaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 9546232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13182500 - 13182316
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13182500 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 13182401  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13182400 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 13182316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22994824 - 22994640
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22994824 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 22994725  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22994724 gagatattctgtacaaaagaaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 22994640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 24728422 - 24728606
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24728422 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgcctggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 24728521  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24728522 gagatattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 24728606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 26484847 - 26485031
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26484847 gacattaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagatttctgttagatg 26484946  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26484947 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 26485031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 33781938 - 33782122
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33781938 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 33782037  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33782038 gggatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 33782122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 6878758 - 6878942
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6878758 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 6878857  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6878858 gagagattttgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 6878942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 11553808 - 11553992
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11553808 gacatcaagcagttcttgcggagccgtgagtatccgctgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 11553907  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11553908 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 11553992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 12136628 - 12136812
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12136628 gacattaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagatttctgttagatg 12136727  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12136728 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtgttgttaagatgtgttgatgagcatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 12136812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18124123 - 18123939
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18124123 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgacaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 18124024  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18124023 aagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 18123939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 23630423 - 23630606
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23630423 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 23630522  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23630523 gagatattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaaca-gaagcagagcagttaatgcatgatgt 23630606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 33296981 - 33297165
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33296981 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 33297080  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33297081 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 33297165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 11328090 - 11328274
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11328090 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 11328189  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11328190 gagagattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 11328274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15654453 - 15654281
Alignment:
Q  22 ttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatggagatattatgt 121  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  15654453 ttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgt 15654354  T
Q  122 acaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15654353 acaagagaaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 15654281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 24974359 - 24974543
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  24974359 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatg 24974458  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24974459 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 24974543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 28955492 - 28955308
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28955492 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaagcaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 28955393  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28955392 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 28955308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 30172922 - 30173106
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30172922 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 30173021  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30173022 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 30173106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 33520833 - 33521017
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  33520833 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 33520932  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33520933 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 33521017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 41679158 - 41679342
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41679158 gacattaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 41679257  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41679258 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 41679342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 43082708 - 43082892
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43082708 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgcctggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 43082807  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43082808 gagatattctgtacaagagaaactgtgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 43082892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 2515515 - 2515699
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  2515515 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagatttctgttagatg 2515614  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2515615 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtgttgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 2515699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 3793994 - 3794178
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3793994 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaagcaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 3794093  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3794094 gagatattctgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 3794178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13438390 - 13438206
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13438390 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaagcaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 13438291  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13438290 gagatgttctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 13438206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15754559 - 15754375
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  15754559 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagacg 15754460  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15754459 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 15754375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18371241 - 18371057
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18371241 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 18371142  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18371141 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 18371057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18496432 - 18496248
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18496432 gacatcaaacagttcttgctgagccgggagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 18496333  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18496332 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 18496248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 28653696 - 28653880
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  28653696 gacatcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 28653795  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28653796 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagctgagcagttaatgcatgatgt 28653880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40469257 - 40469069
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40469257 gacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 40469158  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgtccat 198  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40469157 gagatattctgtacaaaaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtccat 40469069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 5642241 - 5642425
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  5642241 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcctccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 5642340  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5642341 gagatattctatacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaatatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 5642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 24587827 - 24588011
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  24587827 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaagtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattccttttagatg 24587926  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24587927 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttgatgcatgatgt 24588011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 30156484 - 30156668
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  30156484 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 30156583  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30156584 gaaatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 30156668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31822114 - 31821930
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  31822114 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtacttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 31822015  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31822014 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 31821930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 33879581 - 33879765
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  33879581 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggtcagtagattcctgttagatg 33879680  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33879681 gagagattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 33879765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37667193 - 37667009
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37667193 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 37667094  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37667093 gagatatcctgtacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 37667009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 37759436 - 37759620
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37759436 gacatcaaacagttcttcctgagccgtgagtatccgccgggtgcttacaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 37759535  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37759536 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 37759620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37766698 - 37766514
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37766698 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccggatgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 37766599  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37766598 gaaatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 37766514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 30033881 - 30034065
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  30033881 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 30033980  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30033981 gaaatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 30034065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 32591981 - 32591797
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32591981 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaaaaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 32591882  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32591881 gagatatcctgtacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 32591797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37354350 - 37354166
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  37354350 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaaaattggccggtagattcctgttagatg 37354251  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37354250 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 37354166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13320537 - 13320353
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  13320537 gacatcaagcagttcttgttgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 13320438  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13320437 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 13320353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 34620971 - 34621155
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  34620971 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 34621070  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34621071 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 34621155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 25204731 - 25204915
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||| | ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  25204731 gacatcaagcagttcttgctaagtcgtaagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggctagtaaattcctgctagatg 25204830  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25204831 gagatattctgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 25204915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 25268886 - 25269070
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||| | ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  25268886 gacatcaagcagttcttgctaagtcgtaagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggctagtaaattcctgctagatg 25268985  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25268986 gagatattctgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 25269070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 31435917 - 31436101
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  31435917 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 31436016  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31436017 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtactgttgaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 31436101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29886901 - 29886723
Alignment:
Q  13 atcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatggag 112  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||    
T  29886901 atcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgtcaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctaagaagattggccagtagattccttttggatggag 29886802  T
Q  113 atattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatga 191  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29886801 atattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggaacagttaatgcatga 29886723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 23896328 - 23896512
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || | |||| || ||||||    
T  23896328 gacatcaaacagttcttgctaagtcgtgagtatccgccggatgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtaaattcttgctagatg 23896427  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    || | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23896428 gaaacattttgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacgcgaagcagagcagttaatgcatgatgt 23896512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Original strand, 22892916 - 22893097
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||||||    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  22892916 gacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccaggtgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagctg 22893015  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatga 191  Q
    ||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22893016 gagatgttctgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagtagttaatgcatga 22893097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 14017 - 14201
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14017 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgcctggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagcagattcctgttagatg 14116  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14117 gagatattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 14201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 17028 - 17212
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17028 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 17127  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17128 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 17212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 8406 - 8590
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  8406 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatg 8505  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8506 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 8590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 31739 - 31923
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31739 gacataaaacagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 31838  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31839 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 31923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2133031 - 2132847
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2133031 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 2132932  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2132931 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 2132847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 18795149 - 18795333
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18795149 gacatcaagcagttcttgcggagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 18795248  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18795249 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 18795333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27604676 - 27604492
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27604676 gacatcaaacatttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 27604577  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27604576 gagatattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 27604492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 33246815 - 33246999
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33246815 gacatcaaacagttcttactgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 33246914  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33246915 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 33246999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 33263179 - 33263363
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33263179 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 33263278  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33263279 gagatgttctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 33263363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19912930 - 19912749
Alignment:
Q  13 atcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatggag 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19912930 atcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggag 19912831  T
Q  113 atattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19912830 atattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 19912749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 19692543 - 19692727
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19692543 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 19692642  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19692643 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 19692727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21343942 - 21343758
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21343942 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 21343843  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21343842 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtatttttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 21343758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 192
Target Start/End: Original strand, 22137355 - 22137537
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22137355 gacatcaaacagttcttgctaagccgagagtatccgccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 22137454  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgat 192  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137455 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgat 22137537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 9359070 - 9359254
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  9359070 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgtttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtaaattcctgttagatg 9359169  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9359170 gagatattctgtacaaaagaaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 9359254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 15772019 - 15772203
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  15772019 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccaatagattcctgctagatg 15772118  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15772119 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagtagttaatgcatgatgt 15772203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 28357723 - 28357539
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  28357723 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggcagattcctgttagatg 28357624  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28357623 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 28357539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 29833770 - 29833954
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  29833770 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 29833869  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29833870 gagatattttgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 29833954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31485642 - 31485458
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  31485642 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 31485543  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31485542 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 31485458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12088494 - 12088310
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  12088494 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 12088395  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  12088394 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcagagcagttaatgcatgatgt 12088310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 14562069 - 14562253
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  14562069 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcctccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatg 14562168  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  14562169 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcctgatgt 14562253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 16287398 - 16287581
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16287398 gacataaaacagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaa-caagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 16287496  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16287497 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 16287581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 18713929 - 18714113
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  18713929 gacatcaaatagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcatgttagatg 18714028  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18714029 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 18714113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 31358973 - 31359157
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  31358973 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaaaaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 31359072  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31359073 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 31359157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19204133 - 19203949
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  19204133 gacatcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgaggagattggccggtagattcctgttagatg 19204034  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19204033 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 19203949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19657112 - 19656928
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19657112 gacatcaaacaattcttgctgagccgtgagtatctgccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctaagaagattggccagtagattcctgttagatg 19657013  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19657012 gagatattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcgaagcagttaatgcatgatgt 19656928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 44565429 - 44565613
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  44565429 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaatattggccagtagattcctgttagatg 44565528  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44565529 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 44565613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 19678892 - 19679076
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  19678892 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 19678991  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19678992 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 19679076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22076696 - 22076515
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  22076696 gacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttcttgttagatg 22076597  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatga 191  Q
    | || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  22076596 gggacattttgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgagcatgaggcagagcaattaatgcatga 22076515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 16754264 - 16754448
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16754264 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 16754363  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16754364 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 16754448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 27023580 - 27023764
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27023580 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatcagccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 27023679  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27023680 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 27023764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14141147 - 14140963
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14141147 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 14141048  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14141047 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 14140963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 26922820 - 26923004
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26922820 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 26922919  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26922920 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 26923004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27357863 - 27357679
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27357863 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 27357764  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27357763 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 27357679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 29554000 - 29554184
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29554000 gacatcaagcagttcttgctgagccgcgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 29554099  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29554100 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 29554184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8901456 - 8901272
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8901456 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgaatatccgtcgggtgcttccaagcaggataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 8901357  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8901356 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 8901272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22930637 - 22930453
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22930637 gacatcgaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 22930538  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22930537 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 22930453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23853082 - 23852898
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23853082 gacatcgaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 23852983  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23852982 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 23852898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26774380 - 26774196
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26774380 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaagcaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 26774281  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26774280 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 26774196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 27183372 - 27183556
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27183372 gacatcaaacagttcttgttgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 27183471  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27183472 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 27183556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27265867 - 27265683
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27265867 gacatcaaacagttcttgttgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 27265768  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27265767 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 27265683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 28164934 - 28165118
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28164934 gacatcaaacagttcttgttgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 28165033  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28165034 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 28165118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 29577457 - 29577641
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29577457 gacattaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagatttctgttagatg 29577556  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29577557 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtgttgttaagatgtgttgatgagcatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 29577641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24301510 - 24301326
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  24301510 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatg 24301411  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24301410 gagatattttgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 24301326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30553769 - 30553585
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  30553769 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 30553670  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30553669 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 30553585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33372184 - 33372000
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33372184 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 33372085  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33372084 gagatattctatacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 33372000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 3700526 - 3700710
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  3700526 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagactctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 3700625  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3700626 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgtcgatgaacatgaagcggaacagttaatgcatgatgt 3700710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4541527 - 4541343
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4541527 gacatcaaacggttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 4541428  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  4541427 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcagagcagttaatgcatgatgt 4541343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4719888 - 4719704
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4719888 gacatcaaacggttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 4719789  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4719788 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 4719704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 4762206 - 4762390
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4762206 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 4762305  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4762306 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtatggttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 4762390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 4777323 - 4777507
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  4777323 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 4777422  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4777423 gagatattttgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 4777507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 27061949 - 27062133
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  27061949 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttaaatg 27062048  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27062049 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 27062133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 4529728 - 4529912
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||    
T  4529728 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcttgttagatg 4529827  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4529828 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 4529912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13519947 - 13519763
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13519947 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggtcagtagattcctgttagatg 13519848  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13519847 gagagattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 13519763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 16678583 - 16678767
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16678583 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 16678682  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||  | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16678683 gagatatcctatacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 16678767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16939780 - 16939596
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16939780 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 16939681  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16939680 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcacgatgt 16939596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 24868159 - 24868343
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24868159 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 24868258  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24868259 gagatattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttgatgcatgatgt 24868343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26112165 - 26111981
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  26112165 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 26112066  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26112065 gagatattttgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 26111981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 27489576 - 27489760
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  27489576 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagactttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 27489675  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27489676 gagatattttgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 27489760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27625464 - 27625280
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  27625464 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttggatg 27625365  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27625364 gagatattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 27625280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13294704 - 13294520
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13294704 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtattcgccaagtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 13294605  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13294604 gagatattctgtacaaaagaaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 13294520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15408286 - 15408102
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  15408286 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaatcaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatg 15408187  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15408186 gagatattctgtacaaaagaaactatgacatggtattattaaggtgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 15408102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15420073 - 15419889
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  15420073 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaatcaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatg 15419974  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15419973 gagatattctgtacaaaagaaactatgacatggtattattaaggtgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 15419889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 27198628 - 27198812
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  27198628 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 27198727  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27198728 gagatattttgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 27198812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 28211897 - 28212081
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  28211897 gacatcaaacagttcttgccgagccgtgagtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 28211996  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  28211997 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcagagcagttaatgcatgatgt 28212081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34460259 - 34460075
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  34460259 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttaaatg 34460160  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34460159 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 34460075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 29505859 - 29506043
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29505859 gacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctaagaagattggccagtagattcctgttagatg 29505958  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29505959 gagatattctttacaagaggaactatgacatggtgttgataagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 29506043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 192
Target Start/End: Original strand, 26790259 - 26790441
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  26790259 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 26790358  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgat 192  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26790359 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtactgttgaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgat 26790441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27250607 - 27250422
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  27250607 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 27250508  T
Q  110 gagatattatgtacaaga-gaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27250507 gagatattttgtacaagagggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 27250422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 27012174 - 27012358
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  27012174 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 27012273  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27012274 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtactgttgaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 27012358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 20172990 - 20173174
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||| | ||| ||||| | ||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  20172990 gacatcaagcagttcttgcagaatcatgagtatccacggggtgcttccaacagagacaagaagaccttgagaagattagccggtagattcctgttagatg 20173089  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20173090 gagatattctatacaagaggaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacgcgaagcagagcagttaatgcatgatgt 20173174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22163001 - 22162817
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| |||||||||| ||| | ||| ||||| | ||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  22163001 gacatcaagcagttcttgcagaatcatgagtatccacggggtgcttccaacagagacaagaagaccttgagaagattagccggtagattcctgttagatg 22162902  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22162901 gagatattctatacaagaggaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacgcgaagcagagcagttaatgcatgatgt 22162817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27286114 - 27285933
Alignment:
Q  13 atcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatggag 112  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| | || || || |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||| |    
T  27286114 atcaagcagttcttgctaagccgtaagtacccaccaggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtaaattccttttagatgggg 27286015  T
Q  113 atattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27286014 atattctgtacaaaagaaactacgacatggtattgttgagatgtgttgatgaacatgaagcagagaagttaatgcatgatgt 27285933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17088196 - 17088015
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||  || | ||| |||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  17088196 gacatcaagcagttcttgcaaaatcatgagtatccatcgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtaggttcttgttagatg 17088097  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatga 191  Q
    | |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || || |||||||||||    
T  17088096 gggatattctgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaaaatgtgttgatgagcacgaggcagaacaattaatgcatga 17088015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 3645590 - 3645774
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3645590 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 3645689  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3645690 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 3645774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21893558 - 21893374
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  21893558 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 21893459  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21893458 gagatattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 21893374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 28154184 - 28154368
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28154184 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 28154283  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28154284 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgt 28154368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 10949525 - 10949709
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10949525 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 10949624  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10949625 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 10949709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 10967113 - 10967297
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10967113 gacatcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 10967212  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10967213 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 10967297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 28589528 - 28589712
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28589528 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 28589627  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28589628 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgt 28589712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41789120 - 41788936
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  41789120 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 41789021  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41789020 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgacgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 41788936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 51642666 - 51642850
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51642666 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 51642765  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  51642766 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcaggatgt 51642850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16203844 - 16203660
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16203844 gacatcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatg 16203745  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16203744 gagatattctgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacgcgaagcagagcagttaatgcatgatgt 16203660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 20465424 - 20465608
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||    || ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20465424 gacatcaagcagttcttgctaagtcgtgagtatccaccgggtgcttccaacagggacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 20465523  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20465524 gagacattttgtacaaaagaaactacgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 20465608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20336223 - 20336045
Alignment:
Q  13 atcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatggag 112  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20336223 atcaagcagttcttgctaagccgtaagtatccaccgggtgcttccaacagagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggag 20336124  T
Q  113 atattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatga 191  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  20336123 atattctgtacaaaagaaactacgacatggtattgctaagatgtgttgatgaaaatgaagcagagcagttaatgcatga 20336045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 10482 - 10666
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10482 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatg 10581  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10582 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 10666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11983 - 11799
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  11983 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 11884  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11883 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 11799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4989 - 4805
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  4989 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtacttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 4890  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4889 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 4805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 194
Target Start/End: Original strand, 24049 - 24203
Alignment:
Q  40 tatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatggagatattatgtacaagagaaactatgaca 139  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24049 tatccgccaggtacttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatgaca 24148  T
Q  140 tggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24149 tggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 24203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9827 - 9709
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  9827 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 9728  T
Q  110 gagatattatgtacaagag 128  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  9727 gagatattctgtacaagag 9709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22001 - 21817
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||    
T  22001 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattgaccggtagattcctgttagatg 21902  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21901 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 21817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10738 - 10554
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  10738 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 10639  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10638 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 10554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 4513 - 4697
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  4513 gacatcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatg 4612  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  4613 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacataaagcggagcagttgatgcatgatgt 4697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 10468 - 10653
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  10468 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatg 10567  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtatt-gttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10568 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattatttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 10653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 133; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 104 - 288
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  104 gacatcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 203  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  204 gagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgt 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 191
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10672
Alignment:
Q  12 catcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatgga 111  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  10493 catcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaactaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttcttgttagatgga 10592  T
Q  112 gatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatga 191  Q
    |||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10593 gatattctgtataaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatga 10672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 133; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 12395 - 12579
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  12395 gacatcaaacagttcttgccgagccgtgagtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatg 12494  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  12495 gagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcagagcagttaatgcatgatgt 12579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42492 - 42305
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagtt-cttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  42492 gacatcaaacagtttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagat 42393  T
Q  109 ggagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattg-ttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaa-tgcatgatgt 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  42392 ggagatattctgtacaagagaaactatgacatggtattgtttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaattgcatgatgt 42305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 191
Target Start/End: Original strand, 23562 - 23743
Alignment:
Q  10 gacatcaaacagttcttgctgaaccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggctagcagattcctgttagatg 109  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  23562 gacatcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttcttgttagatg 23661  T
Q  110 gagatattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatga 191  Q
    | || ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  23662 gggacattttgtacaaaagaaactacaacatggtattgttaagatgtgttgatgagcatgaggcagagcaattaatgcatga 23743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11262 - 11216
Alignment:
Q  148 ttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgt 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11262 ttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgt 11216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University