View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7226_low_21 (Length: 246)

Name: NF7226_low_21
Description: NF7226
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7226_low_21
NF7226_low_21
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (1-237)||(25137420-25137656)
chr2 (18-228)||(24173789-24174001)
chr2 (1-237)||(18992618-18992851)
chr2 (1-179)||(23013585-23013763)
chr2 (1-237)||(27619242-27619475)
chr2 (5-192)||(22289896-22290083)
chr2 (1-228)||(113183-113407)
chr2 (1-228)||(22048986-22049210)
chr2 (1-228)||(24799655-24799879)
chr2 (1-228)||(27623269-27623493)
chr2 (1-228)||(16771323-16771547)
chr2 (172-237)||(23015014-23015079)
chr2 (96-228)||(24369637-24369769)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (1-226)||(14069875-14070100)
chr3 (5-237)||(13200986-13201218)
chr3 (1-237)||(13510670-13510903)
chr3 (5-228)||(14455320-14455541)
chr3 (1-228)||(15633229-15633453)
chr3 (1-228)||(15640750-15640974)
chr3 (1-228)||(12191144-12191368)
chr3 (1-237)||(13140486-13140719)
chr3 (1-228)||(10142734-10142958)
chr3 (1-228)||(12197788-12198012)
chr3 (1-194)||(13191742-13191935)
chr3 (1-228)||(11878659-11878883)
chr3 (1-228)||(10164497-10164721)
chr3 (130-228)||(11867280-11867375)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (1-237)||(2652558-2652794)
chr6 (1-228)||(22597430-22597657)
chr6 (1-228)||(25776502-25776729)
chr6 (5-237)||(11206839-11207071)
chr6 (1-228)||(19562075-19562303)
chr6 (30-237)||(11215670-11215877)
chr6 (1-161)||(23613177-23613337)
chr6 (5-228)||(18007527-18007750)
chr6 (1-228)||(20165874-20166098)
chr6 (1-228)||(24859561-24859785)
chr6 (1-228)||(22771454-22771678)
chr6 (6-184)||(23522134-23522312)
chr6 (1-237)||(8728307-8728540)
chr6 (1-228)||(23345404-23345631)
chr6 (52-227)||(25951012-25951187)
chr6 (52-161)||(18846219-18846328)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (2-228)||(12737332-12737558)
chr7 (1-237)||(11966390-11966627)
chr7 (5-237)||(16527687-16527919)
chr7 (11-237)||(13653690-13653913)
chr7 (1-228)||(16469824-16470048)
chr7 (5-228)||(13373089-13373312)
chr7 (105-237)||(16765325-16765457)
chr7 (51-228)||(12387606-12387782)
chr7 (8-228)||(18275707-18275924)
chr7 (1-228)||(13669512-13669736)
chr7 (1-228)||(18597639-18597863)
chr7 (52-171)||(543330-543449)
chr7 (52-161)||(14228158-14228267)
chr7 (52-161)||(16329089-16329198)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (12-237)||(22286692-22286917)
chr8 (1-228)||(22827588-22827815)
chr8 (5-237)||(18400970-18401202)
chr8 (1-224)||(25468977-25469200)
chr8 (1-228)||(21823049-21823273)
chr8 (16-228)||(22359097-22359309)
chr8 (1-221)||(22037842-22038059)
chr8 (1-228)||(22094917-22095141)
chr8 (1-228)||(21951744-21951968)
chr8 (1-228)||(8310144-8310368)
chr8 (1-228)||(8327167-8327391)
chr8 (52-161)||(19291722-19291831)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-237)||(54882-55118)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (14-228)||(8647397-8647611)
chr1 (1-228)||(8951749-8951976)
chr1 (5-228)||(22467298-22467521)
chr1 (5-237)||(52952115-52952347)
chr1 (105-237)||(19786464-19786596)
chr1 (1-237)||(20233195-20233428)
chr1 (1-228)||(21803019-21803243)
chr1 (1-228)||(22843398-22843622)
chr1 (1-65)||(19786597-19786661)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-237)||(25516-25752)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-199)||(44338-44536)
[»] scaffold1058 (1 HSPs)
scaffold1058 (1-226)||(1261-1485)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (5-237)||(22321763-22321995)
chr5 (1-226)||(21383949-21384174)
chr5 (5-237)||(25120502-25120734)
chr5 (5-237)||(25179593-25179825)
chr5 (1-237)||(30767437-30767670)
chr5 (5-228)||(21274922-21275145)
chr5 (29-228)||(21276469-21276668)
chr5 (1-237)||(20442510-20442743)
chr5 (1-228)||(20617837-20618061)
chr5 (1-228)||(24967516-24967740)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (5-237)||(1928-2159)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (5-225)||(963-1183)
[»] scaffold0346 (2 HSPs)
scaffold0346 (5-237)||(633-865)
scaffold0346 (5-103)||(18070-18168)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (5-237)||(45413-45645)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (5-237)||(5832-6064)
chr4 (1-228)||(15264409-15264633)
chr4 (1-228)||(15250008-15250232)
chr4 (1-228)||(22106636-22106861)
chr4 (1-228)||(1461-1685)
chr4 (120-228)||(15857903-15858011)
chr4 (92-228)||(15303758-15303891)
chr4 (115-228)||(11920629-11920742)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (5-228)||(116632-116855)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (5-237)||(187894-188126)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (5-225)||(5774-5994)
[»] scaffold0759 (1 HSPs)
scaffold0759 (5-237)||(538-770)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (5-228)||(367677-367900)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (36-237)||(17032-17233)
[»] scaffold1589 (1 HSPs)
scaffold1589 (5-226)||(887-1109)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-237)||(26176-26409)
[»] scaffold0164 (1 HSPs)
scaffold0164 (1-228)||(35149-35373)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (1-228)||(6974-7198)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (5-228)||(23265-23488)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (130-237)||(6384-6491)
[»] scaffold1092 (1 HSPs)
scaffold1092 (1-101)||(9-108)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-103)||(75-177)
scaffold0556 (139-237)||(176-271)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-228)||(523784-524011)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (163-237)||(119215-119286)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (52-161)||(53962-54071)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25137656 - 25137420
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25137656 ctctaagaaagaggcaggtatgtatgaagtctctgactatgatcaccttgctggtaaggttgatgcactaacccaaaaatttgaaaaactaaatgttagt 25137557  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25137556 gctatcacacctactcctgcatctcctccttgtgacatttgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattg 25137457  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25137456 agaaaatgaactacgctcaatacaaccaaggaacgag 25137420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24174001 - 24173789
Alignment:
Q  18 gtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgc--aataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatcacatctact 115  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24174001 gtatgtacgaagtctctaactatgatcatcttgctgctaaggttgatgcgcactaacccaaaaatttgaaaaactaaatgttagtgctgtcacacctact 24173902  T
Q  116 cctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaactacg 215  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| |    
T  24173901 cttgcatctcttccttgtgaaatttgtggtatatttggtcatattggtgttgatttccagttaggtagtgctactaatggtgttgagcaaatgaactatg 24173802  T
Q  216 ctcaatacaacca 228  Q
    |||||||||||||    
T  24173801 ctcaatacaacca 24173789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18992851 - 18992618
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||| |    
T  18992851 ctctaaaaaagaggcaggtatgtacgaagtctttgattatgatcaccttgctgctaaggtggatgcactaaaccgaaaatttgaaaaacttaatgttaat 18992752  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    | | ||||  |||||||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  18992751 gttgtcacccctactcctacatctcct---tgtgaaatttgtggtatatttggtcatattggtgttgattgttagttaggtagtgctactaatagtattg 18992655  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  18992654 agctaatgaactatgctcaatacaaccaaggaacgag 18992618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 23013585 - 23013763
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23013585 ctctagaaaagagtcaggtatgtacgaagtctctgactatgatcaccttgctgctaaggtggatgcactaacccaaaaatttgaaaaacttaatgttagt 23013684  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttag 179  Q
    ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23013685 gctgtcacacctactcctatatctcctccttgtgaaatctgtagtatatttggtcatattggtgttgattgtcagttag 23013763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 27619242 - 27619475
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  27619242 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacccaaaaatttgaaaaacttaatgttaat 27619341  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| || || || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  27619342 gctgtcgcaccttcttctgcatcccctccttgtgaaatctgtggtatatccggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 27619438  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  27619439 agcaactgaattacgctcaatataaccaaggaacgag 27619475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 192
Target Start/End: Original strand, 22289896 - 22290083
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||  | ||||||| ||||     
T  22289896 aaaaaggaggcaggtatgtacgaagtctctaactatgatcacctagctgctaaggttgatgctttaactcaaaaatttgataagtttaatgttaatgctg 22289995  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaa 192  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22289996 tcgcaccttctcctacatctcctccttgtgaaatctgtggtataattggtcatattggtgttgattgtcagttaggtaatgctgctaa 22290083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 113183 - 113407
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  113183 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacccaaaaatttgaaaaacttaatgttaat 113282  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||| || || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||     
T  113283 gctgtcacaccttcttctgcaccccctccttgtgaagtctgtggtatatccggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgttgccaa---tattg 113379  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  113380 agcaactgaattacgctcaatacaacca 113407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22049210 - 22048986
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  22049210 ctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 22049111  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| || || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    |||     
T  22049110 gctgtcccaccttcttctgcatcccctccttgtgaaatctgtggtataactggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---cattg 22049014  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22049013 agcaactgaattacgctcaatacaacca 22048986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24799879 - 24799655
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  24799879 ctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 24799780  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| || || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    |||     
T  24799779 gctgtcccaccttcttctgcatcccctccttgtgaaatctgtggtataactggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---cattg 24799683  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24799682 agcaactgaattacgctcaatacaacca 24799655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27623269 - 27623493
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  27623269 ctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 27623368  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| || || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    |||     
T  27623369 gctgtcccaccttcttctgcatcccctccttgtgaaatctgtggtataactggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---cattg 27623465  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27623466 agcaactgaattacgctcaatacaacca 27623493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16771323 - 16771547
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||| | | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  16771323 ctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctatgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 16771422  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    |||  |  | || | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  16771423 gctgcccaaccttcccctgcatcccctacttgtgaagtctgtggtataactggtcatacaggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 16771519  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16771520 agcaactgaattacgctcaatacaacca 16771547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 237
Target Start/End: Original strand, 23015014 - 23015079
Alignment:
Q  172 tcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23015014 tcagttaggtagtgctactaatagtattgagcaaatgaactatgctcaatacaaccaatgaacgag 23015079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24369769 - 24369637
Alignment:
Q  96 ttagtgctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatag 195  Q
    |||||| | ||||| || ||||||  || |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||| || ||  |||||||||||| | | ||    
T  24369769 ttagtgttgtcacacctgctcctgtttcacctccttgtgaagtctatggtatatttgatcatattggcgttgaatgccaactaggtagtgctgttgaaag 24369670  T
Q  196 tattaagcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    | || |||||||||| || ||| ||||||||||    
T  24369669 tgttgagcaaatgaattatgcttaatacaacca 24369637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14070100 - 14069875
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  14070100 ctctaaaaaagaggaaggtatgtacgaagtctctgactatgatcaccttgctgctaaggttgacgcattaacccaaagatttgaaaaacttaatgttagt 14070001  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14070000 gctgtcacacctactcctacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattg 14069901  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaac 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  14069900 agcaaatgaactacgctcaatacaac 14069875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13201218 - 13200986
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  13201218 aaaaaggaggcaggtatgtacgaattctccgattatgatcacctcgctgctaaggttgatgccttaactcaaaaatttgaaaaacttaatgttaatgctg 13201119  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  13201118 tcacaccttcacctacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattggtgttgattgacagttagatagtgctactaatagtattgagca 13201019  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    |||||| || || |||||||||||  |||||||    
T  13201018 aatgaattatgcacaatacaaccaaggaacgag 13200986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13510903 - 13510670
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  13510903 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacccaaaaatttgaaaaacttaatgttaat 13510804  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||||||||| || || ||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  13510803 gctatcacaccttcttctgcaccccctccttgtgaaatctgtggtatatccggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 13510707  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  13510706 agcaactgaattacgctcaatataaccaaggaacgag 13510670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14455541 - 14455320
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| |||  ||||||| |||||||  |||     
T  14455541 aaaaaggaggcagatatgtacgaggtctctgattatgatcaccttgctgctaaggttgatgccttaactcaaatttt--aaaaacttaatgttaaagctg 14455444  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||| | || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  14455443 tcataccttctactacatctcctccttgtgaaatttgtggtgtatttggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaatggtattgaaca 14455344  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14455343 aatgaactacgctcaatacaacca 14455320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15633453 - 15633229
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| |    
T  15633453 ctctaagaaagaggcaggtatatatgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggatgaggcattaacccaaaagattgaaaaacttaatgttaat 15633354  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| | ||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  15633353 gctgttacaccttcttctgcatcccctccttgtgaaatctgtggtatatccggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 15633257  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  15633256 agcaactgaattacgctcaatataacca 15633229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15640750 - 15640974
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  15640750 ctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 15640849  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| || || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    |||     
T  15640850 gctgtcccaccttcttctgcatcccctccttgtgaaatctgtggtataactggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---cattg 15640946  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15640947 agcaactgaattacgctcaatacaacca 15640974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12191368 - 12191144
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  12191368 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 12191269  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    |||  | || || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  12191268 gctgccccaccttctcctgcatcccctacttgtgaagtctgtggtataactggtcatactggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 12191172  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||    
T  12191171 agcaactaaattacgctcaatacaacca 12191144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13140719 - 13140486
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| |    
T  13140719 ctctaagaaagaggcaggtatatatgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacccaaaagattgaaaaacttaatgttaat 13140620  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    | | | ||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  13140619 gatgttacaccttcctctgcatcccctccttgtgaaatctgtggtatatccagtcacataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 13140523  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  13140522 agcaactgaattacgctcaatataaccaaggaacgag 13140486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 10142734 - 10142958
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  10142734 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 10142833  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    |||  | || || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  10142834 gctgccccacctcctcctgcatcccctacttgtgaagtctgtggtataactggtcatacaggtgtcgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 10142930  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||    
T  10142931 agcaattaaattacgctcaatacaacca 10142958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12198012 - 12197788
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  12198012 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 12197913  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    |||  | ||  | |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  12197912 gctgccccacattctcctgcatcccctacttgtgaagtctgtggtataactggtcatacaggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 12197816  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||    
T  12197815 agcaactaaattacgctcaatacaacca 12197788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13191935 - 13191742
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  13191935 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 13191836  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaata 194  Q
    ||| || || || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13191835 gctgtcccaccttctcctgcatcccctacttgtgaagtctgtggtataactggtcatacaggtgttgattgtcagttaagtagtgctgccaata 13191742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11878883 - 11878659
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  11878883 ctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 11878784  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    |||  |  | || | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  11878783 gctgcccaaccttcccctgcatcccctacttgtgaagtctgtggtataactggtcatacaggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 11878687  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11878686 agcaactgaattacgctcaatacaacca 11878659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10164721 - 10164497
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||| ||||| ||| |||| |||||  | |||||||| ||||||| |    
T  10164721 ctctaagaaagaggcagatatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaagttgaggcattaacacaaaaaatagaaaaacttaatgttaat 10164622  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
     ||  | || || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  10164621 actgcctcaccttctcctgcatcccctacttgtgaagtctgtggtataactggtcatacaggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 10164525  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||    
T  10164524 agcaactaaattacgctcaatacaacca 10164497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11867375 - 11867280
Alignment:
Q  130 ttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||| | || |||||||||||||||||    
T  11867375 ttgtgaagtctgtggtataactggtcatacaggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattgagcaactaaattacgctcaatacaacca 11867280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 2652558 - 2652794
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2652558 ctctaaaaaagaggcaggtatgtatgaagtctctgattatgatcaccttgctactaaggtggatgcactaacccaaaaatttgaaaaacttaatgttagt 2652657  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    | | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  2652658 gttgtcacacctactcctacatctcctccttgtgaaatatgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtaagttaggtagtgctactaatagtattg 2652757  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  2652758 agcaaatgaactatgctcaatacaaccaaggaacgag 2652794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22597657 - 22597430
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  22597657 ctctaaaaaagaggcagatatgtacgaagtctctaactatgatcatcttgctgctaaggttgctgcactaacttaaaaatttgaaaaactaaatgttagt 22597558  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    | | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||     
T  22597557 gttgtcacacctactcctgcatcttctccttgtgaaatttgtggtatatttggtcatattggtgttgattgccagttaggtagtgctactaatggtgttg 22597458  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||    
T  22597457 agaaaatgaactatgctcaatacaacca 22597430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 25776502 - 25776729
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| |  |||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  25776502 ctcttaaaaagaggcaggtatgtacgaagtctctgcctatgatcaccattctgctaaggttgatgtattaacccaaagatttaaaaaacttaatgttagt 25776601  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||     
T  25776602 gctgtcacacctactcctacatctcctccttgtgaaatttgtggtatatttggttatattgatgttgattttaagttaggtagtgctgctaatggtattg 25776701  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25776702 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 25776729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 11206839 - 11207071
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  11206839 aaaaaggaggcaggtatttacgaggtctctgattatgatcaccttgttgctaaggtcgttgcattaactcaaaaatttgaaaaactcaatgttaatgctg 11206938  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11206939 tcacaccttctccgacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatatggtcatactggtgttgattgtcaattaggtagtgctactaatagtattgagca 11207038  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    | ||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  11207039 attgaactatgctcaatacaaccaaggaacgag 11207071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19562303 - 19562075
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaat-tttgaaaaactaaatgttag 99  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||| | ||||||||    
T  19562303 ctctaaaaaagagccagttatgtacgaagtctctgattatgatcaccttgctgctaaggtggatgcactaaccaaaaaaatttgaaaaatttaatgttag 19562204  T
Q  100 tgctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatt 199  Q
    ||   ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19562203 tgtagtcacacctactcctacatctcctcattgtgaaatctgtggtatattcggtcatattggtgttgattgtcagttaggtagtgttactaatagtatt 19562104  T
Q  200 aagcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19562103 gagcaaatcaactatgctcaatacaacca 19562075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 237
Target Start/End: Original strand, 11215670 - 11215877
Alignment:
Q  30 tctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatcacatctactcctgcatctcctcc 129  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||    
T  11215670 tctctgattatgatcaccttgctgctaaggtcgatgcattaactcaaaaatttgaaaaactcaatgttaatgctgtcacaccttctccgacatctcctcc 11215769  T
Q  130 ttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaactacgctcaatacaaccag 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  11215770 ttgtgaaatctgtggtatatatggtcatactggtgttgattgtcaattaggtagtgctactaatagtattgagcaattgaactatgctcaatacaaccaa 11215869  T
Q  230 tgaacgag 237  Q
     |||||||    
T  11215870 ggaacgag 11215877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23613337 - 23613177
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  | |||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  23613337 ctctaaaaaggaggcaggtatttacgaggtctctgattaagatcaccttgctgctaaggtcgatgcattaactcaaaaatttgaaaaacttaatgttaat 23613238  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattg 161  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23613237 gctatcacaccttctcctacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattg 23613177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 18007527 - 18007750
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |  ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||     
T  18007527 aaaaaggaggcaggtatttacgagatctctgattatgatcaccttgctgctaattttgatgccttaactcaaaaatttaaaaaacttaatcttaatgctg 18007626  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || || || |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | | ||    
T  18007627 tcacaccttctactacatcccctccttgtgaaatctgtggtgtttttggtcatataggtgttgattgtcagctaggtagtgctgccaatggtaatgaaca 18007726  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18007727 aatgaactacgctcaatacaacca 18007750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20165874 - 20166098
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  20165874 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 20165973  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    |||  | || || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  20165974 gctgccccaccttctcctgcatcccctacttgtgaagtctgtggtataactggtcatacaggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 20166070  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||    
T  20166071 agcaactaaattacgctcaatacaacca 20166098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24859785 - 24859561
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  24859785 ctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 24859686  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| || || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| ||    |||     
T  24859685 gctgtcccaccttcttctgcatcccctccttgtgaaatctgtggtataactggtcatataggtgttgattgccagttaggcagtgctgccaa---cattg 24859589  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24859588 agcaactgaattacgctcaatacaacca 24859561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22771678 - 22771454
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  22771678 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 22771579  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    |||  | || || |||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  22771578 gctgcctcaccttctcccgcatcccctacttgtgaagtctgtggtataactggtcatacaggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 22771482  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||    
T  22771481 agcaactaaattacgctcaatacaacca 22771454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23522312 - 23522134
Alignment:
Q  6 aaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctat 105  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||    |||||| |||| ||||||||||||   | | |||||||| ||||||||| | ||||||||| || |    
T  23522312 aaaaagaggcaggtatgtacgaagtctctacccttgatcatcttgctgctaaggttgacttactcacccaaaagtttgaaaaaatgaatgttagttctgt 23522213  T
Q  106 cacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagt 184  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  23522212 cacacctactcctgtatctcctccttgtgaaatttgtggtgtgtttggccatattggtgttgatttccagctaggtagt 23522134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8728540 - 8728307
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||| ||||||| |    
T  8728540 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcgttaacccaaaaattcgaaaaacttaatgttaat 8728441  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||| |  || || |||| ||||  | |||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||| ||   ||||     
T  8728440 gctgtcacaccatcttctacatcccctcggtttgaaatatgtggtatatccggtcatatcggtgttgattgccaactaggtagtgctgccaa---tattg 8728344  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    ||||| | || ||||||||||| |||||  |||||||    
T  8728343 agcaactcaattacgctcaatataaccaaggaacgag 8728307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23345631 - 23345404
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || | |||     |||||| || | |||||||||||| ||| | || |  || ||||| ||| | |||||||||    
T  23345631 ctctaaaaaagaggcaggtatgtacgaaatttcttcccttgatcatctagatgctaaggttgacgcactcacacttaaatttgacaaaatgaatgttagt 23345532  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||| || ||||||  || |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||  |||||||| ||  |||||||||||  | |  || ||     
T  23345531 gctgtcacacctgctcctgtctcacctccttgtgaagtctgtggtgtatttgctcatactggcgttgattgacaactaggtagtgctattgaaggtgttg 23345432  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  23345431 agctaatgaattatgctcaatacaacca 23345404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 227
Target Start/End: Original strand, 25951012 - 25951187
Alignment:
Q  52 tgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatattt 151  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| | |||  ||||| | ||||| || | |||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  25951012 tgctaaggttgacgcactaacacaaaaatttgataaaatgaatactagtgatgtcacacctgcccctgtatcacctccttgtgaaatttgtggtgtattt 25951111  T
Q  152 ggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaactacgctcaatacaacc 227  Q
    || |||||||   ||||||| ||  ||||||||| |||| | |||||| ||||| |||| ||  ||||||| ||||    
T  25951112 ggccatattggcattgattgccaactaggtagtgttgctgaaagtattgagcaattgaattattctcaatataacc 25951187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 161
Target Start/End: Original strand, 18846219 - 18846328
Alignment:
Q  52 tgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatattt 151  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| | | | |||  ||||||| ||||| || | |||| ||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  18846219 tgctaaggttgacgcactaacacaaaaatttgatacaatgaatactagtgctgtcacacctgcccctgtatcacctccttgtgaagtttgtggtgtattt 18846318  T
Q  152 ggtcatattg 161  Q
    || |||||||    
T  18846319 ggccatattg 18846328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Original strand, 12737332 - 12737558
Alignment:
Q  2 tctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||    
T  12737332 tctaaaaaagaggcaggtatgtacgaagtctctgattatgatcacattgctgctaaggtggatgcactaaccgaaaaatttgaaaaacataatgttagtg 12737431  T
Q  102 ctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaa 201  Q
    || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  12737432 ctgtctcacctactcctacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatatttgtgttgattttcaattaggtagtgctgctaatagtattga 12737531  T
Q  202 gcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12737532 gcaaatgaactacgctcaatacaacca 12737558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11966627 - 11966390
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaa-ctaaatgttag 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||| || |||||||     
T  11966627 ctctaaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctctaattatgatcaccttgttgccaaggttgatgccttaactcaaaaatttgaaaaaacttaatgttaa 11966528  T
Q  100 tgctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatt 199  Q
    || | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  11966527 tgatgtcacaccttctcctacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagttaagtagtactactaataatatt 11966428  T
Q  200 aagcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  11966427 gagcaattgaactatgctcaatacaaccaaggaacgag 11966390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 16527687 - 16527919
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  16527687 aaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctccaattatgatcacctcgctgctaaggttgatgccttaactcaaaaatttgaaaaacttaatgttaatgctg 16527786  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  16527787 tcacaccttttcctacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagttaggtagtgctactaacagtattgagca 16527886  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    | | ||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  16527887 attaaactatgcttaatacaaccaaggaacgag 16527919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Original strand, 13653690 - 13653913
Alignment:
Q  11 gaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatcacat 110  Q
    ||||||||||| ||  | |||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||     
T  13653690 gaggcaggtatttacgaggtctttgattatgatcaccttgctgctaaggtcgatgcattaactcaaaaatttgaaaaactcaatgttaatgctgtcacac 13653789  T
Q  111 ctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaa 210  Q
    || ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  13653790 cttctcctacatctcc---ttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagttaggtagtgctactaatagtattgagcaattgaa 13653886  T
Q  211 ctacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
     || ||||||||||||||  |||||||    
T  13653887 ttatgctcaatacaaccaaggaacgag 13653913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16470048 - 16469824
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  16470048 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaagcattaacccaaaaatttgaaaaacttaatgttaat 16469949  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||| || || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  16469948 gctgtcacaccttcttctgcatcccctccttgtgaaatatgtggtatatccggtcatatcggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 16469852  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16469851 agcaactgaactacgctcaatataacca 16469824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13373312 - 13373089
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||  |  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |     
T  13373312 aaaaaggaggcaggtatttacgagatctctgattatgaccaccttgctgctaaggttgatgccttaactcaaaaatttgaaaaacttaatgttaatgttg 13373213  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || || || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||| | ||| ||||| | ||    
T  13373212 tcacaccttctactacatctcctccttgtgaaatctatggtatttttggtcatataggtgttgattgtcagctaggcagtgcttccaatggtattgaaca 13373113  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13373112 aatgaactacgctcaatacaacca 13373089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16765457 - 16765325
Alignment:
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16765457 tcacaccttctcctacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagctaggtagtgctgctaacagtattgagca 16765358  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    | | ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  16765357 attaaactatgctcaatacaaccaaggaacgag 16765325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12387782 - 12387606
Alignment:
Q  51 ttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatt 150  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||    
T  12387782 ttgctaaggttgatgccttaactcaaaaatttaaaaaacttaatgttaatgctgtcacaccttctactgcatctccttcttgt-aaatttgtggtgtttt 12387684  T
Q  151 tggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12387683 tggtcatataggtgttgattgttagttaggtagtgctgccaatggtattgaacaaatgaactacgctcaatacaacca 12387606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 18275707 - 18275924
Alignment:
Q  8 aaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatca 107  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||  ||| ||     
T  18275707 aaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacccaaaaaattgaaaaacttaatgttaaagctgtcc 18275806  T
Q  108 catctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaat 207  Q
    || || || ||||||| |||||||||||| | |||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||| |    
T  18275807 caccttcttctgcatcccctccttgtgaagtttgtggtataaccggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgcgaa---tattgagcaact 18275903  T
Q  208 gaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  18275904 gaattatgctcaatacaacca 18275924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 13669512 - 13669736
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  13669512 ctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 13669611  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    |||  |  | || | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  13669612 gctgcccaaccttcccctgcatcccctacttgtgaagtctgtggtataactggtcatacaggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 13669708  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13669709 agcaactgaattacgctcaatacaacca 13669736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18597863 - 18597639
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  18597863 ctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 18597764  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    |||  | || || |||||||||| ||| | |||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  18597763 gctgccccaccttctcctgcatcccctacatgtgaagtctgtggtataactggtcatacaggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 18597667  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||    
T  18597666 agcaactaaattacgctcaatacaacca 18597639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 543449 - 543330
Alignment:
Q  52 tgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatattt 151  Q
    |||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| | | | |||  ||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  543449 tgctaaggttgacgcactaagacaaaaatttgatacaatgaatactagtgctgtcacacctgctcctgtatcacctccttgtgaagtttgtggtgtattt 543350  T
Q  152 ggtcatattgatgttgattg 171  Q
    || ||||||||  |||||||    
T  543349 ggccatattgacattgattg 543330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14228267 - 14228158
Alignment:
Q  52 tgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatattt 151  Q
    |||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| | | | |||  ||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  14228267 tgctaaggttgacgcactaagacaaaaatttgatacaatgaatactagtgctgtcacacctgctcctgtatcacctccttgtgaagtttgtggtgtattt 14228168  T
Q  152 ggtcatattg 161  Q
    || |||||||    
T  14228167 ggccatattg 14228158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16329198 - 16329089
Alignment:
Q  52 tgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatattt 151  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| | | | |||  ||||| | ||||| || |||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  16329198 tgctaaggttgacgcactaacacaaaaatttgatacaatgaatactagtgttgtcacacctgctcctgtatcacctccttgtgaagtttgtggtgtattt 16329099  T
Q  152 ggtcatattg 161  Q
    || |||||||    
T  16329098 ggccatattg 16329089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 237
Target Start/End: Original strand, 22286692 - 22286917
Alignment:
Q  12 aggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatcacatc 111  Q
    |||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22286692 aggcaggtatgtacgaagtctctgactatgatcaccttgctgctaaggttgatgcactaacccaaaaatttgaaaaactaaatgttagtgctatcgcacc 22286791  T
Q  112 tactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaac 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22286792 tactcctgcatctcctctttgtgaaatctgtggtatatttgggcatattggtgttgattgtcatttaggtagcgctactaatagtattgagcaaatgaac 22286891  T
Q  212 tacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    |||||| || |||||||  |||||||    
T  22286892 tacgctaaaaacaaccaaggaacgag 22286917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22827588 - 22827815
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  |||  |||||| |||||||||    
T  22827588 ctctaaaaaagaggcagatatgtacgaagtctctgactatgatcaccttgctactaaggttgatgcattaacccaaagattttcaaaacttaatgttagt 22827687  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22827688 gctgtcacacctactcctacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatgttagtgttgattgtcaattaggtagtgctgctaatagtattg 22827787  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22827788 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 22827815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 18400970 - 18401202
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| |||| |||||| ||  |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  18400970 aaaaaggaggtaggtatatacgaagtctctgattacgatcaccttgctgctaaagttgatgctttaacccaaaaatttgaaaaacttaatgttaatgctg 18401069  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||| | || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18401070 tcataccttctcctacatctcctccttgcgaaatctgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagttaggtagtgctactaatagtattgagca 18401169  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    | ||||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  18401170 attgaactatgctcaatataaccaaggaacgag 18401202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 25468977 - 25469200
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  25468977 ctctaaaaaggaggaaggtatgtatgaggtctctgattatgatcaccttgctgctaaggttgatgccttaactcaaaaatttgaaaaacttaatgttaat 25469076  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    | | ||| | || || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||     
T  25469077 gttgtcataccttctactacatctcctccttgtgaaatttgtggtgtatttggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgttgccaataatattg 25469176  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaataca 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  25469177 agcaattgaactacgctcaataca 25469200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21823049 - 21823273
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  21823049 ctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctgaatataatcaccttgctgctaaggttgaggcattaacccaaaaatttgaaaaacttaatgttaat 21823148  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  21823149 gctgtcacaacttcttctgcatcccctccttgtgaaatctgtggtatatccggtcatatcggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 21823245  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  21823246 agcaactgaattacgctcaatataacca 21823273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 22359097 - 22359309
Alignment:
Q  16 aggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatcacatctact 115  Q
    |||||||||  | |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||    
T  22359097 aggtatgtacgaggtctctgattacgatcaccttgctgctaaggttgatgccttaactcaaaaatttgaaaaactcaatgttaatgctgtcacaccttct 22359196  T
Q  116 cctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaactacg 215  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| | |||||||||||||    
T  22359197 actacatctcctccttgtgaaatctgtggtgtttttggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctatcaacggtattgaacaaatgaactacg 22359296  T
Q  216 ctcaatacaacca 228  Q
    |||||||||||||    
T  22359297 ctcaatacaacca 22359309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22038059 - 22037842
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  22038059 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacccaaaaatttgaaaaacttaatgttaat 22037960  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  22037959 gctgtcacaccttcttctgcatcccctccttgtgaaatctgtggtatatccggtcatatcggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 22037863  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaat 221  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  22037862 agcaactgaattacgctcaat 22037842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22094917 - 22095141
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||| |    
T  22094917 ctctaagaaagaggcaggtatatacaaagtctctgaatataatcaccttgctgctaaggttgaggcattaacccaaaaatttgaaaaacttaacgttaat 22095016  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    | | ||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||   ||||     
T  22095017 gttgtcacaccttcttctgcatcccctccttgtgaagtctgtggtatatccggtcatataggtgttgattgtcagttaagtagtgctgccaa---tattg 22095113  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22095114 agcaactgaattacgctcaatacaacca 22095141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21951744 - 21951968
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  21951744 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacccaaaaatttgaaaaacttaatgttaat 21951843  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    | | || || || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |        
T  21951844 gttgtcgcaccttcttctgcatcccctccttgtgaaatctgtggtatatccggtcatatcggtgttgattgtcaaataggtagtgctgccaatactg--- 21951940  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  21951941 agcaactgaattacgctcaatataacca 21951968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 8310144 - 8310368
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  8310144 ctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 8310243  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| || || || || ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||    |||     
T  8310244 gctgtcccaccttcttctgcatcccgtccttgtgaaatctgtggtataactggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgttgcaaa---cattg 8310340  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  8310341 agcaactgaattacgctcaatacaacca 8310368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8327391 - 8327167
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  8327391 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 8327292  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    |||  | || || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  8327291 gctgccccaccttctcctgcatcccctacttgtgaagtctgtggtataactggtcatacaggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 8327195  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||    
T  8327194 agcaactaaattacgctcaatacaacca 8327167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19291831 - 19291722
Alignment:
Q  52 tgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatattt 151  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| | | | |||  ||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  19291831 tgctaaggttgacgcactaacacaaaaatttgatacaatgaatactagtgctgtcacacctgctcctgtatcacctccttgtgaagtttgtggtgtattt 19291732  T
Q  152 ggtcatattg 161  Q
    || |||||||    
T  19291731 ggccatattg 19291722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 55118 - 54882
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  55118 ctctagaaaagaggcaggtatgtacgaggtctcttattatgatcaccttgctgctaaggtcgatgcactaacccaaaaatttgaaaaacataatgttagt 55019  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  55018 gctgtcacacctactcctacatctcctccttgtaaaatttgtggtatatttggtcatataggtgttgattgccagttaggtagtgctgctaatagtattg 54919  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  54918 agcaaatgaactatgctcaatacaaccaaggaacgag 54882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Original strand, 8647397 - 8647611
Alignment:
Q  14 gcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatcacatcta 113  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||    
T  8647397 gcaggtatgtacgaagtctctgattatgatcaccttgctgctaaggtggatgcactcacccaaaaatttaaaaaatttaatgttagtgctgtcacaccta 8647496  T
Q  114 ctcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaacta 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8647497 ctcctacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattagtgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattgagcaaatcaacta 8647596  T
Q  214 cgctcaatacaacca 228  Q
    |||| ||||||||||    
T  8647597 cgcttaatacaacca 8647611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8951976 - 8951749
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8951976 ctctaaaaaggaggcaggtatgtacgaagtctctgactatgaccaccttgctgccaaggttgatgcattaacccaaaaatttgaaaaacttaatgttagt 8951877  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    | | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8951876 gttgtcacacctactcctacatttcctccttgtgaaatttgtggtatatttggttatataggtgttgattgtcagttacgtagtgctgctaatagtattg 8951777  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||    
T  8951776 agcaaatgaattatgcttaatacaacca 8951749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22467521 - 22467298
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||      
T  22467521 aaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctctgattatgatcaccttgctgctaaggttgatgccttaactcaaaaatttgaaaaacttaattttaatgcag 22467422  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22467421 tcacaccttctcccacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcggttaggtagtgctactaatagtattgagca 22467322  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    | ||||||| ||||||||||||||    
T  22467321 attgaactatgctcaatacaacca 22467298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 52952347 - 52952115
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| |||| |||||||||  | |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  52952347 aaaaaggaggtaggtatgtacgaggtctctgattatgatcaccttactgctaaggttgatgccttaactcaaaaatttgaaaaacttaatgttaatgctg 52952248  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  52952247 tcacaccttctcctacatctcctccaagtgaaatctatggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagttaggtagtgctactaatagtattgagca 52952148  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    | | ||||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  52952147 attaaactatgctaaatacaaccaaggaacgag 52952115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19786596 - 19786464
Alignment:
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19786596 tcacacctactcccgcatctcctccttgtgaaatatgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtccgttaggtagtgctgctaatagtattgagca 19786497  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  19786496 aatgaactactctcaatacaaccaaggaacgag 19786464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 20233195 - 20233428
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  20233195 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacccaaaaatttgaaaaacttaatgttaat 20233294  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  20233295 gctgtcacacctccttctgcatcccctccttgtgaaatctgtggtatatccgatcatatcggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 20233391  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    ||||| | || ||||||||||| |||||  |||||||    
T  20233392 agcaactaaattacgctcaatataaccaaggaacgag 20233428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21803243 - 21803019
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||  |  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  21803243 ctctaagaaagaggtaggtatacacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 21803144  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| || || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    |||     
T  21803143 gctgtcccaccttcttctgcatcccctccttgtgaaatctgtggtataactggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---cattg 21803047  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21803046 agcaactgaattacgctcaatacaacca 21803019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22843398 - 22843622
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  22843398 ctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 22843497  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    |||  |  | || | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  22843498 gctgcccaaccttcccctgcatcccctacttgtgaagtctgtggtataactggtcatacaggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 22843594  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22843595 agcaactgaattacgctcaatacaacca 22843622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 19786661 - 19786597
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatg 65  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||||| | ||||||||||||    
T  19786661 ctctaaaaaagaggcagctatgtacgaagtctctgactatgataaccttgcttctaaggttgatg 19786597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 25516 - 25752
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  || |  ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||    
T  25516 ctctaaaaaagaggcaggtatgtacgaagtctcttattttgatcaccttgctgctaaggtgaatacgctaaccgaaaaatttgaaaaacttaatgttggt 25615  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  25616 gctattacacctactcttacatctcctccttgtgaaatatgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatggtgttg 25715  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25716 agcaaatgaactacgctcaatacaaccaaggaacgag 25752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 44536 - 44338
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44536 ctctaaaaaagaggcaggtatgtacgaagtctctaactatgatcaacttgctgctaaggttgatgcactaacccaaaaatttgaaaaactaaatgttagt 44437  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatt 199  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44436 gctgtcacacctactcctacatctcctccctgtgaaatctgtggtatatttagtcatattggtgctgattatcagttaggtagtgctgttaatagtatt 44338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1058 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold1058
Description:

Target: scaffold1058; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1261
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1485 ctctaaaaaagaggcaggtatgtacgaagtctctaactatgatcatcttgctgctaaggttgatgcactaacccaaaattt-gaaaaactaaatgttagt 1387  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    | | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| || ||     
T  1386 gttgtcacacctactcctgcatcccctccttgtgaaatttatggtatatttggtcatattggtgttgattcccagctaggtagtgctgctaatggtgttg 1287  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaac 226  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  1286 agcaaatgaattatgctcaatacaac 1261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22321995 - 22321763
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  22321995 aaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctctgattatgatcaccttgcttctaaggttgatgccttaactcaaaaatttgaaaaacttaatgttaatgctg 22321896  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22321895 tcacaccttctcctacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatatcggtgttgattgtcagttaggtagtgctactaatagtattgagca 22321796  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    | ||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  22321795 attgaactatgctcaatacaaccaaggaacgag 22321763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 21383949 - 21384174
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21383949 ctctaaaaaagagggaggtatgtacgaagtctctaaccatgatcatcttgctgctaaagttgatgcactaacccaaaaatttgaaaaactaaatgttagt 21384048  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||     
T  21384049 gctgtcactcctactcctgcatatcctccttgtgaaatttgtggtaattttggtcatattggtgtagattgccagctaggtagtgctgctaatggtgttc 21384148  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaac 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21384149 agcaaatgaactatgctcaatacaac 21384174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25120734 - 25120502
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||       
T  25120734 aaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctccgattatgatcacctcgctgctaaggttgatgccttaactgaaaaatttgaaaaacttaatgttaatgtag 25120635  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  25120634 tcacaccttctcctacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagttaggtagtgctactaacagtattgagca 25120535  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    | | ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  25120534 attaaactatgctcaatacaaccaaggaacgag 25120502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25179825 - 25179593
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||       
T  25179825 aaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctccgattatgatcacctcgctgctaaggttgatgccttaactgaaaaatttgaaaaacttaatgttaatgtag 25179726  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  25179725 tcacaccttctcctacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagttaggtagtgctactaacagtattgagca 25179626  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    | | ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  25179625 attaaactatgctcaatacaaccaaggaacgag 25179593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30767670 - 30767437
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  30767670 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacccaaaaatttgaaaaacttaatgttaat 30767571  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  30767570 gctgtcacaccttcttctgcatcccctccttgtgaaatctgtggtatatccggtcatatcggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 30767474  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  30767473 agcaactgaattacgctcaatataaccaaggaacgag 30767437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21275145 - 21274922
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | |||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| || |     
T  21275145 aaaaaggaggcaggtatttacgaggtctctaattgtgaccaccttactgctaaggttgatgccttaactcaaaaatttgaaaaacttaatgttaatgttg 21275046  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||| | || || || ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  21275045 tcataccttctactacatctcctccttgtgaaatttgtggtgtttttggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaatggtattgaaca 21274946  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  21274945 aatgaactacactcaatacaacca 21274922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21276668 - 21276469
Alignment:
Q  29 gtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatcacatctactcctgcatctcctc 128  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||||| || | ||| | || || || |||||||||    
T  21276668 gtctctgattatgatcaccttgctgctaagtttgatgccttaactcaaaaatttaaaaaacttaatgttaatgttgtcataccttctactacatctcctc 21276569  T
Q  129 cttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  21276568 cttgtgaaatttgtggtgtttttggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaatggtattgaacaaatgaactacactcaatacaacca 21276469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20442743 - 20442510
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  20442743 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattgacccaaaaatttgaaaaacttaatgttaat 20442644  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    | | ||||| || || || |||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||     
T  20442643 gttgtcacaccttcttctacatcccttccttgtgaaatctgtggtatatccggtcatatcggtgttgattgtcagttaggtagtgctgtcaa---tattg 20442547  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  20442546 agcaactgaattacgctcaatataaccaaggaacgag 20442510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20617837 - 20618061
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  20617837 ctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 20617936  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    |||  |  | || | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  20617937 gctgcccaaccttcccctgcatcccctacttgtgaagtctgtggtataactggtcatacaggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 20618033  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20618034 agcaactgaattacgctcaatacaacca 20618061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24967740 - 24967516
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  24967740 ctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 24967641  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    |||  |  | || | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  24967640 gctgcccaaccttcccctgcatcccctacttgtgaagtctgtggtataactggtcatacaggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 24967544  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  24967543 agcaactgaattacgctcaatacaacca 24967516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 1928 - 2159
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||     
T  1928 aaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctctg-ttatgatcaccttgctgctaaggttgatgccttaactcaaaaatttgaaaaactaaatgttaatactg 2026  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2027 tcacaccttctcctacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcattttggtgttgattgtcaattaggtagtgctactaatagtattgagca 2126  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    | ||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  2127 attgaactatgctcaatacaaccaaagaacgag 2159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1183 - 963
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  1183 aaaaaggaggcaggtatttacgaggtctctgattatgatcaccttgctgctaaggtcgatgcattaactcaaaaatttgaaaaactcaatgttaatgctg 1084  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  1083 tcacaccttctcctacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagttaggtagtgctactaatagtattgatca 984  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaa 225  Q
    | |||| || |||||||||||    
T  983 attgaattatgctcaatacaa 963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 865 - 633
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  865 aaaaaggaggcaggtatgtatgaggtctctgattatgatcaccttgctgctaaggttgatgccttgactcaaaaatttgaaaaacttaatgttaatgctg 766  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||    
T  765 tcacaccttctcctacatatcctccttgtgaaatttgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagttatgtattgctactaatagtattgagca 666  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    | ||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  665 attgaactatgctcaatacaaccaaggaacgag 633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 18168 - 18070
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgct 103  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  18168 aaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctccaactatgatcaccttgctgccaaggttgatgcattaactcaaaaatttgaaaaacttaatgttaatgct 18070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45645 - 45413
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  45645 aaaaaggaggcaggtatttacgaggtctctgattatgatcaccttgctgctaaggtcgatgcattaactcaaaaatttgaaaaactcaatgttaatgctg 45546  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  45545 tcacaccttctcctacttctcctccttgtgaaatctgtggtatatttgatcatattggtgttgattgtcagttaggtagtgctactaatattattgagca 45446  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    | |||| || |||||||| |||||  |||||||    
T  45445 attgaattatgctcaatataaccaaggaacgag 45413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6064 - 5832
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  6064 aaaaaggaggcaggtatttacgaggtctctgattatgatcaccttgctgctaaggtcgatgcattaactcaaaaatttgaaaaactcaatgttaatgctg 5965  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  5964 tcacaccttctcctacttctcctccttgtgaaatctgtggtatatttgatcatattggtgttgattgtcagttaggtagtgctactaatattattgagca 5865  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    | |||| || |||||||| |||||  |||||||    
T  5864 attgaattatgctcaatataaccaaggaacgag 5832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15264633 - 15264409
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  15264633 ctctaaaaaagaggcaggtatacacgaagtctctgaatataatcaccttgctgctaagattgaggcattaacccaaaaatttgaaaaacttaatgttaat 15264534  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||| || || ||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  15264533 gctgtcacaccttcttctgcaccccctccttgtgaaatctgtggtatatccggtcatatcggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 15264437  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  15264436 agcaactgaattacgctcaatataacca 15264409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15250008 - 15250232
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||| |||||||  |  |||||||| |  || ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  15250008 ctctaagaaagagacaggtatacacgaagtctctgaagataatcaccttgctgctaaggttgaggcattaacccaaaaatttgaaaaacttaatgttaat 15250107  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    |||     
T  15250108 gctgtcacaccttcttctacatcccctccttgtgaaatctgtggtatatccggtcatatcggtgttgattgtcagttaggtagtgctgctaa---cattg 15250204  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  15250205 agcaactgaattacgctcaatataacca 15250232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22106636 - 22106861
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacc-caaaattttgaaaaactaaatgttag 99  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||||  |||||  |||||||||| |||||||     
T  22106636 ctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacaacaaaaaattgaaaaacttaatgttaa 22106735  T
Q  100 tgctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatt 199  Q
    |||| || || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    |||    
T  22106736 tgctgtcccaccttcttctgcatcccctccttgtgaaatctgtggtataactggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---catt 22106832  T
Q  200 aagcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22106833 gagcaactgaattacgctcaatacaacca 22106861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1685 - 1461
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  1685 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 1586  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    |||  |  | || | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  1585 gctgcccaaccttcccctgcatcccctacttgtgaagtctgtggtataactggtcatacaggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 1489  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1488 agcaactgaattacgctcaatacaacca 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 228
Target Start/End: Original strand, 15857903 - 15858011
Alignment:
Q  120 catctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaactacgctca 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  15857903 catctcctccttgtgaaatttgtggtgtttctggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaatggtattgaacaaatgaactacgctca 15858002  T
Q  220 atacaacca 228  Q
    |||||||||    
T  15858003 atacaacca 15858011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 228
Target Start/End: Original strand, 15303758 - 15303891
Alignment:
Q  92 aatgttagtgctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgcta 191  Q
    ||||||| || | ||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |    
T  15303758 aatgttaatgttgtcacaccttcttctgcatcccctccttgtgaaatctgtggtatatccggtcatatcggtgttgattgtcagttgggtagtgccgcca 15303857  T
Q  192 atagtattaagcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    |   |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  15303858 a---tattgagcaactgaattacgctcaatataacca 15303891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11920742 - 11920629
Alignment:
Q  115 tcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaactac 214  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||  | |  || || ||||||||||||||    
T  11920742 tcctgtatcacctcattgtgaaatttgtggtgtatttggccatattggtgttgattgccagctaggtagtgctattgaaggtgttgagcaaatgaactac 11920643  T
Q  215 gctcaatacaacca 228  Q
    ||||||||||||||    
T  11920642 gctcaatacaacca 11920629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 116632 - 116855
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  116632 aaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctctgattatgatcaccttgcttctaaggttgatgccttaactcaaaaatttgaaaaacttaatgttaatgctg 116731  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  116732 tcacaccttctactacatctcatccttgtgaaatctgtggtatttttggtcatataggtgttgattgtcagctaggtagtgctgccaatggtattgaaca 116831  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  116832 aatgaactacgctcaatacaacca 116855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 187894 - 188126
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||     
T  187894 aaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctctgactatgatcacctcgctgctaaggttgatgccttaactcaaaaattagaaaaacttaatgttaatgctg 187993  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| | || ||||||||||| ||||    
T  187994 tcacaccttctcctacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagataagtaatactactaatagtattgagca 188093  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    | ||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  188094 attgaactatgctcaatacaaccaaggaacgag 188126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 5774 - 5994
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |  |||     
T  5774 aaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctccgattatgatcacctcgctgctaaggttgatgccataactcaaaaatttgaaaaacttaaagtaaaagctg 5873  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  5874 tcacaccttctcctacatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagttaggtagtgctactaacagtatttagca 5973  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaa 225  Q
    | | || || |||||||||||    
T  5974 attaaattatgctcaatacaa 5994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0759 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0759
Description:

Target: scaffold0759; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 770 - 538
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||| ||||||| || |     
T  770 aaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctccgattatgatcacctcgctgctaaggttgatgccttaactaaaaaatttgaaaaacttaatgttaatgttg 671  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  670 tcacaccttctgctacatctcttccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagttaggtagtgctactaacagtattgagca 571  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    | | || || ||||||||||||||  |||||||    
T  570 attaaattatgctcaatacaaccaaggaacgag 538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 367900 - 367677
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||  |||| ||| ||||||| ||||||| ||||     
T  367900 aaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctctgattttgatcaccttgctgctaaggttgatgccttaactaaaaaatttaaaaaactcaatgttaatgctg 367801  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  367800 tcacaccttctactacatctcctccttgtgaaatctgtggtatttttggtcaaataggtgttgattgtcagctaggtagtgctgccaatggtattgaaca 367701  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  367700 aatgaactacactcaatacaacca 367677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 237
Target Start/End: Original strand, 17032 - 17233
Alignment:
Q  36 attatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatcacatctactcctgcatctcctccttgtga 135  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| || || || |||||||| |||||||    
T  17032 attatgatcaccttgctgctaaggttgatgccttaactcaaaaatttgaaaaacttaatgttaatgctgtcacaccttctactacatctccttcttgtga 17131  T
Q  136 aatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacg 235  Q
    ||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||||||  |||||    
T  17132 aatttgtggtgtttttggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaatggtattgaacaaatgaactatgttcaatacaaccaaggaacg 17231  T
Q  236 ag 237  Q
    ||    
T  17232 ag 17233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1589 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1589
Description:

Target: scaffold1589; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1109 - 887
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| | ||     
T  1109 aaaaaggaggcaggtatgtacgaggtctctgattatgatcaccttgctcctaaggttgatgccttaactcaaaaatttgaaaaacttaattttaatactg 1010  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgtt-gattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagc 203  Q
    ||||| || || || |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |    
T  1009 tcacaccttctactacatctccttcttgtgaaatttgtggtgtttttggtcatataggtgttagattgtcagttaggtagtgctgccaatggtattgaac 910  T
Q  204 aaatgaactacgctcaatacaac 226  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  909 aaatgaactacgcccaatacaac 887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 26176 - 26409
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||||||| || ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  26176 ctctaagaaagaggcaggcatatacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattgacccaaaaatttgaaaaacttaatgttaat 26275  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||| || || || |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  26276 gctgtcacaccttcttctacatcccctccttgtgaaatctgtggtatatccggtcatatcggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 26372  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    ||||| |||| || |||||||| |||||  |||||||    
T  26373 agcaattgaattaggctcaatataaccaaggaacgag 26409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0164 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0164
Description:

Target: scaffold0164; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 35149 - 35373
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  35149 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgaatatcaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacccaaaaatttgaaaaacttaatgttaat 35248  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    | | || || || || ||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   | |  |||     
T  35249 gttgtcccaccttcttctgcatcccctccttgtgaagtctgtggtataaccggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctg---aaaaaattg 35345  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35346 agcaactgaattacgctcaatacaacca 35373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 6974 - 7198
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  6974 ctctaagaaagaggcaggtatacacgaagtctctgaatataaccaccttgctgctaaggttgaggcattaacacaaaaaattgaaaaacttaatgttaat 7073  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| || || || || ||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||     
T  7074 gctgtcccaccttcttctgcatcccctccttgtgaagtctgtggtataaccggtcatataggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattg 7170  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  7171 agcaactgaattacgctcaatacaacca 7198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 23265 - 23488
Alignment:
Q  5 aaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgcta 104  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||    |||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||     
T  23265 aaaaaagaggcaggtatgtacgaagtctctacccttgatcatcttgctgctaaggttgacgcactcacccaaaagtttgaaaaaatgaatgttaatgctg 23364  T
Q  105 tcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagca 204  Q
    ||||| | |||| || |||  ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||  | |  || || ||||    
T  23365 tcacaccaactcttgtatcatctccttgtgaaatttgtggtgtatttggacatattggtgttgattgccagctaggtagtgctatttaaggtgttgagca 23464  T
Q  205 aatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  23465 aatgaattacgctcaatacaacca 23488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6491 - 6384
Alignment:
Q  130 ttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaactacgctcaatacaaccag 229  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  6491 ttgtgaaatatgtggtatatttggtcatattggtgttgattgtcagttaggtaatgctactaatagtattgagcaattgaactatgctcaatacaaccaa 6392  T
Q  230 tgaacgag 237  Q
     |||||||    
T  6391 ggaacgag 6384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1092 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1092
Description:

Target: scaffold1092; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 108 - 9
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  108 ctctaaaaaagaggcaggtatgtacgaagtctctaactatgatcatcttgctgctaaggttgatgcactaacccaaaa-tttgaaaaactaaatgttagt 10  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 75 - 177
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||||| |    
T  75 ctctaagaaagaggcaggtatatacgaagtctctgattataaccaccttgctgctaaggttgaagcattaacataaaaatttgaaaaacttaatgttaat 174  T
Q  101 gct 103  Q
    |||    
T  175 gct 177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 176 - 271
Alignment:
Q  139 ctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    |||| ||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||| | || ||||||||||| |||||  |||||||    
T  176 ctgtagtatatccggtcatatcggtgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattgagcaactaaattacgctcaatataaccaaggaacgag 271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 523784 - 524011
Alignment:
Q  1 ctctaaaaaagaggcaggtatgtaataagtctctaattatgatcaccttgttgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || ||||||    | |||| |||| |||||| |||||  || | || ||||| ||||| ||| | ||||||||     
T  523784 ctctaacaaagaggcaggtatgtacgaattctctacccttaatcatcttgctgctaaagttgacacactcacacaaaaatttgataaaatgaatgttagc 523883  T
Q  101 gctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatatttggtcatattgatgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtatta 200  Q
    ||| ||||   | | |||| ||| |||||||||||||| |||||| | || || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||  | |  || ||     
T  523884 gctgtcactattgcccctgtatcacctccttgtgaaatttgtggtgttttcggccatattggtgttgattgccagctaggtagtgctattgaaggtgttg 523983  T
Q  201 agcaaatgaactacgctcaatacaacca 228  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  523984 agcaaatgaattacgctctatacaacca 524011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 237
Target Start/End: Original strand, 119215 - 119286
Alignment:
Q  163 tgttgattgtcagttaggtagtgctgctaatagtattaagcaaatgaactacgctcaatacaaccagtgaacgag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||    
T  119215 tgttgattgtcagttaggtagtgctgccaa---tattgagcaactgaattacgctcaatataaccaaggaacgag 119286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 54071 - 53962
Alignment:
Q  52 tgctaaggttgatgcaataacccaaaattttgaaaaactaaatgttagtgctatcacatctactcctgcatctcctccttgtgaaatctgtggtatattt 151  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| | | | |||  ||||| | ||||| || |||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  54071 tgctaaggttgacgcactaacacaaaaatttgatacaatgaatactagtgttgtcacacctgctcctgtatcacctccttgtgaagtttgtggtgtattt 53972  T
Q  152 ggtcatattg 161  Q
    || |||||||    
T  53971 ggccatattg 53962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University