View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF7227_low_4 (Length: 317)
Name: NF7227_low_4
Description: NF7227
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF7227_low_4 |
 |  |
|
| [»] scaffold0264 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0378 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0393 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold2089 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0037 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0019 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0099 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0063 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0376 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0139 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0112 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1948 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0061 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0031 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0466 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0611 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0086 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0059 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0111 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0454 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0136 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0783 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1400 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0034 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21969358 - 21969079
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21969358 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
21969259 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21969258 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
21969159 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21969158 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
21969079 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 27007794 - 27008072
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27007794 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
27007893 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27007894 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
27007993 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27007994 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
27008072 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 27014937 - 27015215
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27014937 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
27015036 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27015037 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
27015136 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27015137 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
27015215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28498518 - 28498240
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28498518 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
28498419 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28498418 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
28498319 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28498318 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
28498240 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12562148 - 12561869
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12562148 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
12562049 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12562048 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
12561949 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12561948 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacgccaacag |
12561869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Original strand, 22130886 - 22131165
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22130886 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggataaatttaagaatagcgttctataaga |
22130985 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22130986 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
22131085 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22131086 |
tatattattcaataataaaagtcacgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
22131165 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 45534550 - 45534828
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
45534550 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacagatacatttaagaatagcattctataaga |
45534649 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45534650 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
45534749 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45534750 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
45534828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26240509 - 26240231
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26240509 |
catcagtcttcatacataatagtctcgacgctttattattatcttttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctttaaga |
26240410 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26240409 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
26240310 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26240309 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
26240231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 27880764 - 27881043
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttt-attcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataag |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27880764 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagcgttctataag |
27880863 |
T |
 |
| Q |
111 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27880864 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatatcattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcc |
27880963 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27880964 |
atatattatccaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
27881043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 28020945 - 28021224
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttt-attcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataag |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28020945 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagcgttctataag |
28021044 |
T |
 |
| Q |
111 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28021045 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatatcattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcc |
28021144 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28021145 |
atatattatccaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
28021224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25611220 - 25610938
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacattt-aagaatagcgttctataag |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25611220 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacattttaagaatagcgttctctaag |
25611121 |
T |
 |
| Q |
111 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25611120 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaggagtgcc |
25611021 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacagat |
293 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25611020 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttatcataaactatttgcccctagggcttacacaaacagat |
25610938 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 8371530 - 8371808
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | ||||| |
|
|
| T |
8371530 |
catcagtctacatacataatagtctcgatgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacagacacatttaagaatagtgttatttaaga |
8371629 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
8371630 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaattatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
8371729 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8371730 |
tacattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
8371808 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 22659771 - 22660049
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
22659771 |
catcagtctacatacataatagtcttgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagtgttctttatga |
22659870 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22659871 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacaaactatctattctaaggactttattaacattatataaatataataaagagtgtca |
22659970 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
22659971 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggccttttggacttacaccaaca |
22660049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 290
Target Start/End: Original strand, 2963217 - 2963489
Alignment:
| Q |
16 |
agtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||| |
|
|
| T |
2963217 |
agtctacatacataatagtctctacgctttattattatcct--aattatattaaag-tttgac-acgaatacatttaagaatagtgttctttatgataat |
2963312 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttatt-aacatta-tctaaatataataaagagtgccata |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
2963313 |
gtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaaacattactataaatataataaaaagtgtcata |
2963412 |
T |
 |
| Q |
214 |
tattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2963413 |
tattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcatctagggcttacaccaaca |
2963489 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21916701 - 21916524
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21916701 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
21916602 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattat |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21916601 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaattatctattctaaggactttattaacattat |
21916524 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 59 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 36970253 - 36970022
Alignment:
| Q |
59 |
attcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaa |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
36970253 |
attcatattaaagctt-gactacggatacatttaagaacaacgttctttatgataatgtaatctcatgattaagtcacacataatatattattacatgaa |
36970155 |
T |
 |
| Q |
159 |
ctatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaac |
257 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36970154 |
ctatctattctagggactttattaacattactataaatataataaagagtatcatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataaatttaac |
36970055 |
T |
 |
| Q |
258 |
ataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36970054 |
ataaactattggcct-tagggcttacaccaacag |
36970022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6430952 - 6430692
Alignment:
| Q |
27 |
ataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatg |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6430952 |
ataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gactacgaatacatttaagaatagtgttatttatgataatgtaatctcat- |
6430856 |
T |
 |
| Q |
127 |
attaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaat- |
224 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6430855 |
--taagtcacacttaatatattattacacgaactatctattataaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtcatatattatttaata |
6430758 |
T |
 |
| Q |
225 |
aataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6430757 |
aataaaagttatgatacataagataaatttaacgtaaactattggtctctagagcttacaccaaca |
6430692 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18835374 - 18835119
Alignment:
| Q |
13 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagat |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| | || | | |
|
|
| T |
18835374 |
atcagtctacatacataatagtctcgatgctttattattatt-tcaatccatattaaagctg-gactacagatatatttaagaataacgttttttatgtt |
18835277 |
T |
 |
| Q |
113 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattat-ctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | || || |
|
|
| T |
18835276 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatactactgc---aactatctattctaagaactttattaacattataacaaatataacaaaaattgtca |
18835180 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcct |
272 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18835179 |
tatattatttaataacaaaagtcatgataaataaaataagtttaacataaactattcgcct |
18835119 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 20539674 - 20539953
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttt--attcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataa |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
20539674 |
catcagtctacatacataatcgtctatgcgctttattattattatcccaatttacattaaagcttt-actacaaatgtatttaagaataacgttctttat |
20539772 |
T |
 |
| Q |
110 |
gataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaat-ataataaagagtg |
208 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |
|
|
| T |
20539773 |
gttaatgtaatcacatgattaagtcacacttaatattccatta-atgaactatctattctatggactttattaatcttacaacaattataataaagaatg |
20539871 |
T |
 |
| Q |
209 |
ccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
20539872 |
tcatatattatttaataataaaagtcatgatacataacacaagtttaacataaactattggtctcaatggcttacaccaaca |
20539953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 206 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21914394 - 21914310
Alignment:
| Q |
206 |
gtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21914394 |
gtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
21914310 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 210 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21862227 - 21862147
Alignment:
| Q |
210 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21862227 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
21862147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 290
Target Start/End: Original strand, 8782188 - 8782365
Alignment:
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaat-ataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || | |
|
|
| T |
8782188 |
taatgtaatcccatgattaagtcacatttaatattccatcacattaactatctattttaaggactttattaatcttacaacaattataataaagaatgac |
8782287 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || |||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8782288 |
atattttattaaa-aataaa-gtaatgatacataatataagtttaacataaactattgacctatagggcttacaccaaca |
8782365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12642277 - 12642210
Alignment:
| Q |
223 |
ataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12642277 |
ataataaaagtcatgatacacaacgtaagtttaacataaactataggcttctagggcttacaccaaca |
12642210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30174402 - 30174123
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30174402 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
30174303 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30174302 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
30174203 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30174202 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
30174123 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 24250309 - 24250587
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24250309 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
24250408 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24250409 |
taatgtaatctcatgattaagtcgcacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
24250508 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24250509 |
tattttattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
24250587 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 292
Target Start/End: Original strand, 24229492 - 24229772
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
24229492 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggacacatttaagaataatgttctttatga |
24229591 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24229592 |
taaagtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaaggactttattaacattatttaaatataataaagagtgtca |
24229691 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacaga |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24229692 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaaccattggcctctagggcttacaccaacaga |
24229772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19616460 - 19616186
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
19616460 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctt-attattatccca-attcatattaaagctt-gactacaaatacatttaagaatagtgttctttatgt |
19616364 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataat-aaagagtgc |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |
|
|
| T |
19616363 |
taatgtaatcttatgattaagtcacacttaatatatcattacacgaactatctattctaggaactttattaacattacaacaaatattataaaagagtgt |
19616264 |
T |
 |
| Q |
210 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |
|
|
| T |
19616263 |
catatattatttaataataaaaatcatgatacataatataagtttaacataaactattgaccgctagaacttacacca |
19616186 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 284
Target Start/End: Original strand, 24763834 - 24764105
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| |||| | || | |
|
|
| T |
24763834 |
catcagtctacataaataatagtctcgatgctttattattatc-tcaattcatattaaagctt-gagtacagatgcatttaagaatatcgttttttatgt |
24763931 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatct-aaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |
|
|
| T |
24763932 |
taatataatctcatgattaagtcacgcttaatatactattacatgaactatctattcttgggactttattaacattataacaaatataataaagatttcc |
24764031 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttaca |
284 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24764032 |
atgtattatttaataataaaagtcattatacataacataagtttaacataaactattggcctccagggcttaca |
24764105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 281
Target Start/End: Original strand, 15342280 - 15342548
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
15342280 |
catcaatctacatacataatagtctccacgctttattattatccca-atttatattaaatctt-gactacatatacattaaagaatagtgttctttatgg |
15342377 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaa-cattatctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| || |||||||| || || | |
|
|
| T |
15342378 |
taatgtaatctcatgattaaatcacacttaatattccattacacgaaccatctattttagggactttattaatcatacaagaattataataacgaatgtc |
15342477 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggctt |
281 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15342478 |
atatattatttaacaataaaagtcatgatacataatataagtttaacataaactattggcctctaaggctt |
15342548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21626647 - 21626429
Alignment:
| Q |
73 |
tttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaag |
172 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||||| | | |
|
|
| T |
21626647 |
tttgacttcggatacttttaagaatattgttctttatgttaatgtaatgtcatgattaagtcttacttaatgttccatcacatgaactatctattcgagg |
21626548 |
T |
 |
| Q |
173 |
gactttattaacattatct-aaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
271 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
21626547 |
gactttattaatcttataacaaatataataaagaatgccttattttattcaataataaatgtcatgatgcatatcataagtttaacataaactattgaca |
21626448 |
T |
 |
| Q |
272 |
tctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21626447 |
tctaggacttacaccaaca |
21626429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 149 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29800317 - 29800175
Alignment:
| Q |
149 |
attacacgaactatctattctaaggactttattaacattatc-taaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataaga |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
29800317 |
attacacgaactatctattctagggactttattaatcttacaataattataataaagaatgacatatattattcaataataaaagtcatgatacgtagta |
29800218 |
T |
 |
| Q |
248 |
taggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29800217 |
taagtttaacataaaatattgtcctctagggcttacaccaaca |
29800175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Original strand, 28719170 - 28719304
Alignment:
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataat-aaagagtgc |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| || |
|
|
| T |
28719170 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatgttccatcacatgaactatatattctaaggactttattaattttacaataagtataataaaagaatgt |
28719269 |
T |
 |
| Q |
210 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacata |
244 |
Q |
| |
|
| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28719270 |
cttattttgtttaataataaaagtcatgatacata |
28719304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 290
Target Start/End: Original strand, 18852167 - 18852337
Alignment:
| Q |
122 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
220 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
18852167 |
tcatgattaagtcacacttaacgtttcattactcgaactatctattatatggactttattaatcttacaaaaaatataataaagaatgcctcgtattatt |
18852266 |
T |
 |
| Q |
221 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacat-aaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||| | ||| |||||| | || |||||||||||||| |
|
|
| T |
18852267 |
tattaataaaagtcatgatagaaaacataagtttaacttaaaattattggtttttatggcttacaccaaca |
18852337 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 54
Target Start/End: Original strand, 28719053 - 28719100
Alignment:
| Q |
7 |
atggacatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatc |
54 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28719053 |
atggtcatcagtctacatacataatagtctctacgttttattattatc |
28719100 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 29800492 - 29800449
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcc |
55 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29800492 |
catcagtctacatacataatagtctttccgctttattattatcc |
29800449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0264 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0264
Description:
Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 3952 - 4230
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3952 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
4051 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4052 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
4151 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4152 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
4230 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0264; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 56 - 290
Target Start/End: Original strand, 10851 - 11085
Alignment:
| Q |
56 |
tttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacac |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10851 |
tttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacac |
10950 |
T |
 |
| Q |
156 |
gaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggttta |
255 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10951 |
aaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggttta |
11050 |
T |
 |
| Q |
256 |
acataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11051 |
acataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
11085 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 130501 - 130779
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
130501 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
130600 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
130601 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
130700 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
130701 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
130779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 71 - 253
Target Start/End: Original strand, 138471 - 138653
Alignment:
| Q |
71 |
gctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattcta |
170 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
138471 |
gctttgactacggatacatttaagaatagtgttctttaagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacaaactatctattcta |
138570 |
T |
 |
| Q |
171 |
aggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtt |
253 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
138571 |
aggactttattaacattatataaatataataaagagtgacatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtt |
138653 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 255 - 291
Target Start/End: Original strand, 141112 - 141148
Alignment:
| Q |
255 |
aacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
141112 |
aacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
141148 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18400129 - 18399851
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18400129 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
18400030 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18400029 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
18399930 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18399929 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
18399851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18407113 - 18406835
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18407113 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
18407014 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18407013 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
18406914 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18406913 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
18406835 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 48808773 - 48809051
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48808773 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
48808872 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48808873 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
48808972 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48808973 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
48809051 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15729776 - 15729498
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15729776 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagtgttctataaga |
15729677 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15729676 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
15729577 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15729576 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
15729498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19859147 - 19858869
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19859147 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttgttattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
19859048 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19859047 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattaaacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
19858948 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19858947 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
19858869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 30254163 - 30253885
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30254163 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgatctataaga |
30254064 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
30254063 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatattataaagagtgcca |
30253964 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30253963 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
30253885 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2204577 - 2204298
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttt-attcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataag |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2204577 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagcgttctataag |
2204478 |
T |
 |
| Q |
111 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
2204477 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtc |
2204378 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2204377 |
atatattatccaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
2204298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8465024 - 8464746
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8465024 |
catcagtctacatacataatagtctcgtcgctttattattatcctttattcatattaaagcttcgactacggatacatttaagaatagcgttctttaaga |
8464925 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8464924 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
8464825 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8464824 |
tatattattcaataataaaagtcatgattcataagataggtttaacataaactattggcctctaggacttacaccaaca |
8464746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 18139615 - 18139895
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat--ttaagaatagcgttctataa |
109 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18139615 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatatatatttaagaataacgttctataa |
18139714 |
T |
 |
| Q |
110 |
gataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgc |
209 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18139715 |
gataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgt |
18139814 |
T |
 |
| Q |
210 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18139815 |
catatattattcaataataaaggtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
18139895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19230913 - 19230634
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
19230913 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaatgttttgactacggatacatttaagaatagcgttctttatga |
19230814 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
19230813 |
taatgtaatctcatgattaagttacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtc |
19230714 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19230713 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacattaactattggcctctagggcgtacaccaaca |
19230634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 10669179 - 10669456
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
10669179 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcatttattaatat-aaagatt-gactacggatacatttaagaataacgttctttatga |
10669276 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
10669277 |
taatgtaatctgatgattaagtcacacttattatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtc |
10669376 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10669377 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
10669456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 47167136 - 47167413
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
47167136 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gactacaaatacatttaagaataacgttctttatga |
47167233 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
47167234 |
taatgtaatctcatgataaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtc |
47167333 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47167334 |
acatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
47167413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 18259402 - 18259678
Alignment:
| Q |
13 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagat |
112 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| |
|
|
| T |
18259402 |
atcagtcaacatacataatactctcgacgatttattattatccta-attcatattaaagctt-gactatggatacatttaagaataatgttctttatgat |
18259499 |
T |
 |
| Q |
113 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18259500 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgcca |
18259599 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18259600 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaattattggcctctagggcttacaccaaca |
18259678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34128598 - 34128322
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || || |
|
|
| T |
34128598 |
catcagtctacatacataataatctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagctta-actacggatacatttaaaaataatgttctttatga |
34128502 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
34128501 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaagaactttattaacattactataaatataataaagagtgtc |
34128402 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34128401 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaattattggcctctagggcttacaccaaca |
34128322 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 264
Target Start/End: Original strand, 41681250 - 41681502
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
41681250 |
catcagtctacatacataatagtctcaaagctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacagatacatttaagaataacattctataaga |
41681349 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
41681350 |
taaagtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacataaactatctattccaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtta |
41681449 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaact |
264 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
41681450 |
tatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaatataaact |
41681502 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28130586 - 28130309
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
28130586 |
catcagtctacatgcataatagtctcgacgctttattattatcctt-attcatattaaagctt-gactacagatacatttaagaatagcgttttttatga |
28130489 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
28130488 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattataaggacttcattaacattattataaatataataaagagtgtc |
28130389 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28130388 |
acatactattcaataataaaagttatgatacataagataagttcaacataaactattggcatatagggcttacaccaaca |
28130309 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 19393705 - 19393963
Alignment:
| Q |
16 |
agtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || | |||| |
|
|
| T |
19393705 |
agtctacatacataatagtctcgacgctttataattatccca-actcatattaaagctt-gactacagatacatttaagaatagcattctttatgttaat |
19393802 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19393803 |
gtaatctcatgattaagtcacacttaatatatcattacatgaactatctattatagagactttattaacattactacagatataataaagagtatcatat |
19393902 |
T |
 |
| Q |
215 |
attattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctcta |
275 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19393903 |
attatttaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctcta |
19393963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14586191 - 14585913
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14586191 |
catcagtctgcatacataaaagtctcgacgctttattattattcca-attcatattaaag-tttgactaaggatacatttaataatagcgttcattaaga |
14586094 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
14586093 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatataccattatacgaactatctattttagggactttattaacattacaacaaatataataaagagtgac |
14585994 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaa------taataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacac |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | || ||||||||| |
|
|
| T |
14585993 |
atatattatttaataatagtaataaaagtcatgatacataacataaatttaacttaaactattggcatttacggcttacac |
14585913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16000007 - 15999791
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16000007 |
catcagtctgcatacataaaagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaag-tttgactaaggatacatttaataatagcgttctttaagg |
15999910 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
15999909 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatataccattatacgaactatctattttaggtacttaattaacattacaacaaatataataaagagtgac |
15999810 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataa |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15999809 |
atatattatttaataataa |
15999791 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2936056 - 2935846
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
2936056 |
catcagtctacataaataacagtctcgatgctttattattatcgca-attcatattaaagctt-gactacggatacatttaagaataacgttctttatgt |
2935959 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
2935958 |
taatgtaatctcatgattaagt--cacttaatatataattacatgaactatttattctagggactttattaacattacaacaaatataatgaagagtgac |
2935861 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaata |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
2935860 |
atatattatttaata |
2935846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Original strand, 42150363 - 42150626
Alignment:
| Q |
20 |
tacatacataat--agtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgt |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||| |
|
|
| T |
42150363 |
tacatacataatttagtctcgacgctttattattatccca-attcatattaaagctt-gactacggatacattta-gaataacgttctttatgttaatgt |
42150459 |
T |
 |
| Q |
118 |
aatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaa--ggactttattaacatta-----tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
42150460 |
aatctcatgattaagtcacac-------------aca-gaactatctattctataggggctttattaacattactacctacaaatataacaaagagtgtc |
42150545 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacat-aagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42150546 |
atatattattcaataataaaagtcacgatacataaagataagtttaacataaactattggcctctagggcttataccaaca |
42150626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22994176 - 22994055
Alignment:
| Q |
170 |
aaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
268 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22994176 |
aaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtcatatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattg |
22994077 |
T |
 |
| Q |
269 |
gcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22994076 |
gtctctagggcttacaccaaca |
22994055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3587934 - 3587657
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| | || | |
|
|
| T |
3587934 |
catcggtctatatacataatagtctctacgctttattattatccca-atttatattaaagctt-gactatagattcatttaagaataacgttttttatgt |
3587837 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||| | | |
|
|
| T |
3587836 |
taaagtaatctcatgattaagtcacagttaatatttcatcacataaactacctattctatggactttattaatcttacaacaattataataaagaattgc |
3587737 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3587736 |
atatgttatttaataataaaagtcatgatacatagcataagtttcacataaactattgacatttagggcttacaccaaca |
3587657 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22968975 - 22968697
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||| || |
|
|
| T |
22968975 |
catcggtctacataaataatagtcttgacactttatcattatccta-atttatattaaagatt-gactacggatacatttaagaattgcattctttacat |
22968878 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
22968877 |
taatgtaatctcatgattaattaacacttaatattccatcacacgaactatctattctctggactttatttatcttacaacaaatataataaa-aatgcc |
22968779 |
T |
 |
| Q |
211 |
--atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22968778 |
atatatattattcaataataaaagtcatgatacgtagcaaaagtttaagataaactattgacctatagagcttacaccaaca |
22968697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 183
Target Start/End: Original strand, 24443604 - 24443772
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
24443604 |
catcagtctacatacataatagtctttacactttgttatcatccc--atttatattaaagcttgg-ctacggatacatttaagaatatcgttctttatgt |
24443700 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaa |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
24443701 |
taatgtaatctcgtgattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattatagggactttattaa |
24443772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 15170307 - 15170581
Alignment:
| Q |
13 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcc---tttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataa |
109 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| | || |
|
|
| T |
15170307 |
atcagtctacatatataatagtctctacgctttattattatcccaatttat--atattaaagctt-gactacaaatatatttaagaataacgttttttat |
15170403 |
T |
 |
| Q |
110 |
gataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtg |
208 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||| || ||||||||||| || |
|
|
| T |
15170404 |
gttaatgtaatctcatgattaagtcccacttaatattccattacatgaac-atctattttatggactttattaattttacaacaattataataaagaatg |
15170502 |
T |
 |
| Q |
209 |
ccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
287 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
15170503 |
tcgtatattatttaatattaaaactcacgatacatagaataaatttaacataaactattagccttcaaggcttacacca |
15170581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 48813825 - 48813749
Alignment:
| Q |
214 |
tattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48813825 |
tattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
48813749 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 290
Target Start/End: Original strand, 24443932 - 24444074
Alignment:
| Q |
149 |
attacacgaactatctattctaaggactttattaacattatct-aaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataaga |
247 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |
|
|
| T |
24443932 |
attacacgaactatctattctatgaattttattaatcttataacaaatataataaagaatgcaatatattattcaataataaaaatcatgatagataaca |
24444031 |
T |
 |
| Q |
248 |
taggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
24444032 |
taagtttaacataagctattgacctctaagacttacaccaaca |
24444074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 31190722 - 31191000
Alignment:
| Q |
14 |
tcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagata |
113 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||| | || | || |
|
|
| T |
31190722 |
tcagcctacatacgtaatagtctcggtgctttattattatccca-atttatactaaagctt-gactaaggatatatttaataataatgttatttatgtta |
31190819 |
T |
 |
| Q |
114 |
atgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccat |
212 |
Q |
| |
|
|||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31190820 |
atgtaagcaaacgattaagtcacacttaatataccattacatgaactatcta-tctggggactttattaacattacaacaaatataataaaaagtgccat |
31190918 |
T |
 |
| Q |
213 |
atattattcaataataaaagtcatgata----cataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||| || | | || |||| | |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31190919 |
atattatttaacatagtatgttatgaaaatgtcatagcataagtttaacataaattattggcctctaaggcttacaccaaca |
31191000 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Original strand, 25846379 - 25846443
Alignment:
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctcta |
275 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
25846379 |
atattttatttaataataaaagtcatgatacatagcataaatttaacataaaatattgacctcta |
25846443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 55
Target Start/End: Original strand, 25845753 - 25845796
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcc |
55 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25845753 |
catcagtctacatgcataatagtctctacgatttattattatcc |
25845796 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 55
Target Start/End: Original strand, 25846172 - 25846215
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcc |
55 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25846172 |
catcagtctacatgcataatagtctctacgatttattattatcc |
25846215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 288
Target Start/End: Original strand, 5983259 - 5983324
Alignment:
| Q |
224 |
taataaaagtcatgatacataagataggtttaacat-aaactattggcctctagggcttacaccaa |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
5983259 |
taataaaagtcatgatacatatcataagtttaacataaaattaatggcatccagggcttacaccaa |
5983324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16789096 - 16788818
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16789096 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
16788997 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16788996 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
16788897 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16788896 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
16788818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Original strand, 22860165 - 22860444
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22860165 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagcgttctataaga |
22860264 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22860265 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
22860364 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22860365 |
tatattatccaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
22860444 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 1586385 - 1586663
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1586385 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagtgttctataaga |
1586484 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1586485 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
1586584 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1586585 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
1586663 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 13995220 - 13995498
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13995220 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcattctataaga |
13995319 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13995320 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
13995419 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13995420 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttataccaaca |
13995498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 18020118 - 18020396
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
18020118 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctttaaaa |
18020217 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18020218 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctgaatataataaagagtgcca |
18020317 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18020318 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
18020396 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 27508624 - 27508903
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27508624 |
catcagtctacatacataacagtctcgacgctttattattatcctttatacatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataata |
27508723 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
27508724 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
27508823 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattatt-caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27508824 |
tatattattacaataataaaagtcatgatacataaaataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
27508903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 27528210 - 27528489
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27528210 |
catcagtctacatacataacagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataata |
27528309 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
27528310 |
taatgtaatttcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
27528409 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattatt-caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27528410 |
tatattattacaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctttagggcttacaccaaca |
27528489 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14074505 - 14074226
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| || || |
|
|
| T |
14074505 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatactttattcatattaaagctttgactacatatacatttaagactagtgttctttatga |
14074406 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14074405 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
14074306 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14074305 |
tatattattcaataataatagtcatgatacataagatatttttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
14074226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8612940 - 8612664
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
8612940 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagtgttctttatga |
8612844 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8612843 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactatgaatataataaagagtgtc |
8612744 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8612743 |
atatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
8612664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 88 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13947704 - 13947501
Alignment:
| Q |
88 |
atttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatt |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13947704 |
atttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatt |
13947605 |
T |
 |
| Q |
188 |
atctaaatataataaagagtgccatatattatt-caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13947604 |
atctaaatataataaagagtgccatatattattacaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
13947505 |
T |
 |
| Q |
287 |
aaca |
290 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
13947504 |
aaca |
13947501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 5758758 - 5759034
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || || |
|
|
| T |
5758758 |
catcagtctacatacataatattctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagcttt-actacggatacatttaataatattgttctttatga |
5758854 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
5758855 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaagaactttattaacattactataaatataataaagagtatc |
5758954 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5758955 |
atatattattcaataataaaagtcatcatacataagataagtttaacataaattattggcctctagggcttacaccaaca |
5759034 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 290
Target Start/End: Original strand, 17120741 - 17121002
Alignment:
| Q |
27 |
ataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatg |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17120741 |
ataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gacaatggatacatttaagaataacgttctttatgataatataatctcatg |
17120838 |
T |
 |
| Q |
127 |
attaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaata |
225 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17120839 |
actaagtcacacttaatatattattatacgaactatctattctagggattttattaacattattataaatataataaagagt--catatattattcaata |
17120936 |
T |
 |
| Q |
226 |
ataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctcta-gggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17120937 |
ataaaagtcatgatacataagatgagtttaacataaactattgacctctaggggcttacaccaaca |
17121002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 20736605 - 20736882
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
20736605 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcccag-ttcttattaaagctt-gactacagatacatttaagaataatgttctttatgt |
20736702 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20736703 |
taatgtaatctcatgattaagtcaaacttaatataccattacacgaactatctattctaggaactttattaacattacaacaaatataataaagagtggc |
20736802 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20736803 |
atatattatttaataataaaagtcatgatacataacataagattaacataacctattggcctctagggcatacaccaaca |
20736882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19218454 - 19218176
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||| || || |
|
|
| T |
19218454 |
catcagtctacatacataatagtctctacactttattattatccccttt--atattaaagctt-gactactgatgc-tttaagaatagcattctttatga |
19218359 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatct-aaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19218358 |
taatgtaatcacatgattaagtcacacttaatattctattacacgaactatctattctagagactttattaatcttacaacaaatataataaagaatgcc |
19218259 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacagat |
293 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19218258 |
atatattatttaataataaaagtcatgatacatagcataaatttaacataaactattggactataggggttacaccaacagat |
19218176 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 142 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14997007 - 14996859
Alignment:
| Q |
142 |
atatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatac |
241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
14997007 |
atatattattacacgaactatctattctaaggactttattaaaattatataaatataataaagagtgtcatatattattcaataattaaagtcataatac |
14996908 |
T |
 |
| Q |
242 |
ataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14996907 |
ataagataagtttaacataaaatattggcctctagatcttacaccaaca |
14996859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 22560461 - 22560740
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatag--cgttctataa |
109 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||| | |
|
|
| T |
22560461 |
catcggtctacatgcataatagtctctgcgctttattattatccca-atttatattaaagctt-gactatggatacatttaaggataaaacattcttaat |
22560558 |
T |
 |
| Q |
110 |
gataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatc-taaatataataaagagtg |
208 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22560559 |
gttaatgtcatctcatgattgagtcacacttaatatcccattacacgaactatctattctaaggaccttattaatattgcaataaatataataaaaagtg |
22560658 |
T |
 |
| Q |
209 |
ccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22560659 |
tcatatattatttaataatagaagtcatgatacactgcataattttaacataaactatcggcttctagggcttacaccaaca |
22560740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4073595 - 4073320
Alignment:
| Q |
18 |
tctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgt |
117 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |
|
|
| T |
4073595 |
tctacaaacataatagtctctacgttttattattatcctg-atttatattaaag-tttgactacggatacttttaagaataatgttctttccattaatgt |
4073498 |
T |
 |
| Q |
118 |
aatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttatta-----acattatctaaatataataaagagtgccat |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4073497 |
aatctcatgattaagtcacacttaatgttccattatatgaactatcaattctatggactttattaatcttacaacaaacaaatgtaataaagaatgccat |
4073398 |
T |
 |
| Q |
213 |
atattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
4073397 |
attttatttaatgataaaaatcatgatacataacataagtttaacataaattattggcatctaagacttacaccaaca |
4073320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21994613 - 21994406
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
21994613 |
catcagtctacatatataatagtctttgcgctttattattattcca-atttatattaaagctc-gactatggatacatttaagaatagtgttctttatat |
21994516 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||||| | |
|
|
| T |
21994515 |
taatgtaatctcatgattaagtcacaattaatataccattacacgaactatctattattgggactttattaatattacaacaagtataataaagagtatc |
21994416 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattatt |
220 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
21994415 |
atatattatt |
21994406 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 289
Target Start/End: Original strand, 10359410 - 10359588
Alignment:
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaat-ataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||| || ||||||||||| |||| ||| || ||||| | || | |
|
|
| T |
10359410 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatattccatcacatcaactatatattatagagactttattaatcttataacaattatgataaataatgtc |
10359509 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaac |
289 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10359510 |
atattttatttaatattaaaaatcataatacatacgataagtttaacataaactattgacctctaaaacttacaccaac |
10359588 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21993786 - 21993711
Alignment:
| Q |
214 |
tattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21993786 |
tattatttaataataaaagtcatgatacatatcataggtttaacataaattattgg-ctatagggcttacaccaaca |
21993711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 11248569 - 11248530
Alignment:
| Q |
252 |
tttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11248569 |
tttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
11248530 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 288
Target Start/End: Original strand, 23846851 - 23846923
Alignment:
| Q |
216 |
ttattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaa |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
23846851 |
ttatttaatattaaaagtcatgatacatatgacaagtttaatataaactattgacctctatagcttataccaa |
23846923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 54
Target Start/End: Original strand, 10359326 - 10359368
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatc |
54 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10359326 |
catcactctacatatataatagtctctacgctttattattatc |
10359368 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Original strand, 23846668 - 23846755
Alignment:
| Q |
16 |
agtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttct |
105 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23846668 |
agtctacatacataatagtctctgtactatattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacagatacttttaagaatagtgttct |
23846755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2677038 - 2676760
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2677038 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
2676939 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2676938 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
2676839 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2676838 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
2676760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15461522 - 15461244
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15461522 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
15461423 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15461422 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
15461323 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15461322 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
15461244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15815046 - 15814768
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15815046 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
15814947 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15814946 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
15814847 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15814846 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctaggacttacaccaaca |
15814768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 18111320 - 18111598
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18111320 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
18111419 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18111420 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
18111519 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18111520 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggttcaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
18111598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20243962 - 20243684
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20243962 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
20243863 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20243862 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
20243763 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20243762 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
20243684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26531638 - 26531360
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26531638 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
26531539 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26531538 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
26531439 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26531438 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaatataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
26531360 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 3369300 - 3369578
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3369300 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcttttattcatattaaagctttgactacggatatatttaagaatagcgttctataaga |
3369399 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3369400 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
3369499 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3369500 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
3369578 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18163187 - 18162909
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18163187 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
18163088 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18163087 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatgtaataaagagtgcca |
18162988 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18162987 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
18162909 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Original strand, 17300236 - 17300515
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17300236 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactatggatacatttaagaatagcgttctataaga |
17300335 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17300336 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattatttcacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
17300435 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17300436 |
tatattattcaataataaaagtcaagatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
17300515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 4676260 - 4676538
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4676260 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
4676359 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
4676360 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatattataaagagtgtca |
4676459 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4676460 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
4676538 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5870443 - 5870159
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5870443 |
catcagtctacatacataatagtcttgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacagatacatttaagaatagcgttctataaga |
5870344 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataa------taaaga |
205 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5870343 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaaaataaaga |
5870244 |
T |
 |
| Q |
206 |
gtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5870243 |
gtgtcatatattattcaataataaaggtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
5870159 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34975576 - 34975298
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
34975576 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaaactttgactacaaatacatttaagaatagcgttctttatga |
34975477 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
34975476 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaaccatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
34975377 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34975376 |
tatattaatcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
34975298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 56 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38816694 - 38816458
Alignment:
| Q |
56 |
tttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacac |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38816694 |
tttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacac |
38816595 |
T |
 |
| Q |
156 |
gaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggttta |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38816594 |
gaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattatccaataataaaagtcatgatacataagataggttta |
38816495 |
T |
 |
| Q |
256 |
acataaactattggcctctagggcttacaccaacaga |
292 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38816494 |
acataaactattggcctctagggcttacaccaacaga |
38816458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1941749 - 1941472
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
1941749 |
catcagtctatatacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gactacgaatacatttaagaataacgttctttatga |
1941652 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1941651 |
tactgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtc |
1941552 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1941551 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataaaataagtttaacataaactattgacctctagggcttacaccaaca |
1941472 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 83 - 290
Target Start/End: Original strand, 11484265 - 11484472
Alignment:
| Q |
83 |
gatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttatta |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11484265 |
gatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaaggactttatta |
11484364 |
T |
 |
| Q |
183 |
acattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggctta |
282 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11484365 |
acattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggctta |
11484464 |
T |
 |
| Q |
283 |
caccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
11484465 |
caccaaca |
11484472 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9487575 - 9487301
Alignment:
| Q |
13 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagat |
112 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
9487575 |
atcagtcaacatacataatagtctcaacgctttattattatccta-attcatattaaatctt-gactacggatacatttaagaataacgttctttatgat |
9487478 |
T |
 |
| Q |
113 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
9487477 |
aaagtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaagggctttattaacattactataaatataataaagagtgtca |
9487378 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaa |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9487377 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaattattggcccctagggcttacaccaa |
9487301 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11421041 - 11420768
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
11421041 |
catcagtctacatacataatagtctcgaagctttattattatccta-attcatattaaag-tttgactacggatacatttaagaatagcgttctttatgt |
11420944 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11420943 |
taatgtaatctaatgattaaatcacacttaatatatcattgcacgaactatctattttagggactttattaacattacaaaaaatataataaagagtgcc |
11420844 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
286 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11420843 |
atatattatttaataataaaagtcatgatacataacataagtttaacataaaccattggcctctagggcttccacc |
11420768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Original strand, 30040751 - 30041029
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
30040751 |
catcagtctatatacataatagtctcgatgctttattattatccca-attcatattaacgctt-gactatagatacatttaagaatagtgttctttatgt |
30040848 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
30040849 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatactattacacgaactatctattctaggaactttattaacattacaacaaatataataaagagtatc |
30040948 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30040949 |
atatattaattgataataaaagtcatgatacataacataagtttaacataaattattggcctctagggcttacaccaacag |
30041029 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4546104 - 4545948
Alignment:
| Q |
13 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagat |
112 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
4546104 |
atcagtcaacatacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctta-actacggatacatttaagaataacgttctttatgat |
4546007 |
T |
 |
| Q |
113 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaa |
171 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4546006 |
aaagtattctcatgactaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaa |
4545948 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19365544 - 19365389
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
19365544 |
catcagtctacgtatataatagtctcaacactttattattacccca-atttatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagcgttctttacgt |
19365447 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattct |
169 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19365446 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattct |
19365389 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4545950 - 4545860
Alignment:
| Q |
200 |
taaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4545950 |
taaagagtgtcatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
4545860 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9537926 - 9537705
Alignment:
| Q |
74 |
ttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaagg |
173 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| | || |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
9537926 |
ttgactacatatacatttaagaatagcgttctttatgttaatgtaaactctttatagagtcacacttgatattccattgcacgaactatctattctaggg |
9537827 |
T |
 |
| Q |
174 |
-actttattaacattatctaaat-ataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
271 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||| |||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9537826 |
gactttattaatcttacaacaattataataaaaa-tgacatatattatttaataataaa-gtcatgatacataacataaatttaacataaactattggcc |
9537729 |
T |
 |
| Q |
272 |
tctagggcttacaccaacagattg |
295 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9537728 |
tctggggcttacaccaacaaattg |
9537705 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19362435 - 19362229
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| || | |
|
|
| T |
19362435 |
catcaatctacatacataatagtctcggcactgtattattat-------ttatattaaagctt-gactactgatacatttaagaaaagcgttccttacgt |
19362344 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||| || | |
|
|
| T |
19362343 |
taatgtaatctcatgattaactcacacttaatattacattacatgaactatctattctaggaactttattgatcttacaacaaatataataaagaatgtc |
19362244 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaata |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
19362243 |
atatattatttaata |
19362229 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 270
Target Start/End: Original strand, 5528762 - 5529013
Alignment:
| Q |
18 |
tctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgt |
117 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | || || ||||||||| ||||| | | || |||||||||| ||||| | | |||||| |
|
|
| T |
5528762 |
tctacaaacataatagtctatacgctttattattatcatgatttaat-ttaaagctt-gactatgaacacttttaagaatatagttctttgtgttaatgt |
5528859 |
T |
 |
| Q |
118 |
aatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaat-ataataaagagtgccatatat |
216 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
5528860 |
aatctcgtgattaagtcgcactgaatattccatcacatgcactatctattctagggattttattaatcttacaacaattataataaaaaatgtcatatta |
5528959 |
T |
 |
| Q |
217 |
tattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggc |
270 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5528960 |
tatttaataataaatgtcatgatacataacataagtttaacataaactattggc |
5529013 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 290
Target Start/End: Original strand, 39422426 - 39422694
Alignment:
| Q |
22 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatc |
121 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||| || |||| | |||||||||| |
|
|
| T |
39422426 |
cataaataatagtctatacgctttattacta-ccttaattcatattaaag-tttgtctacaaatacttttaagaataatgtcttatatgttaatgtaatc |
39422523 |
T |
 |
| Q |
122 |
tcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattatt |
220 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||| || |||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||||| |
|
|
| T |
39422524 |
tcacgattaagtctcgtttaattttccattacatgaactatttattttagggacattattaatcttacaacaaatataataaatagtgcgtcattttatt |
39422623 |
T |
 |
| Q |
221 |
caataataaaagtcatgatacataagataggtttaacat-aaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
39422624 |
taataataacaatcatgatatgtaacataagtttaacataaaactattgacctctacgacttacaccaaca |
39422694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 32636509 - 32636465
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcct |
56 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32636509 |
catcagtctacatacataatagtctccacgctttattattatcct |
32636465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 290
Target Start/End: Original strand, 23056437 - 23056615
Alignment:
| Q |
113 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattat-ctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
23056437 |
aatgtaatcttacgattaagtctcacttaatgtctcattacttgaactatatattctagggactttattaattttatagaaaatataacaaagaatgcct |
23056536 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacat-aaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||| ||| | || |||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23056537 |
tattttaattaacaataaaagtcatgataca-atcatcagtttaacataaaactattcacctatagcgcttacaccaaca |
23056615 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19361661 - 19361597
Alignment:
| Q |
226 |
ataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19361661 |
ataaaattcatgatacatagcataagtttaacataaacaattggcctatagggcttaaaccaaca |
19361597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 56516255 - 56515990
Alignment:
| Q |
18 |
tctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgt |
117 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| | | |||| || |||| || ||||| | |||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||||| | ||||| |
|
|
| T |
56516255 |
tctacctacataatagtctctatgttttaatactatcgtt-attcacaataaagctt-gactatagatac-ttcaagaataatgttctatatgttaatga |
56516159 |
T |
 |
| Q |
118 |
aatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaa-cattatctaaatataataaagagtgccatatat |
216 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||| ||||| | | ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||| | | || |
|
|
| T |
56516158 |
agtctcacaattaagtcacaattaatgtttcattactctaaccatctattctaaggactttattaatcttaaaacaaatataataaagaaagtc--tcat |
56516061 |
T |
 |
| Q |
217 |
tattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacat-aaactattggcctctagggcttacacc |
286 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||| || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
56516060 |
tatttaataataaaagtaatgatacaaaatataactttaacttaaaactattgacctctagggctgacacc |
56515990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21798054 - 21797922
Alignment:
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | ||||||||| | |||||| | ||||||| ||| |||| |||| || | |||||||||| |||| ||| |||||||||| || |
|
|
| T |
21798054 |
taatataatcttacgattaagtctcccttaatgttttattactcgatctatatattttaggaactttattaatcttatagaaa-ataataaagaacacct |
21797956 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataa |
245 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21797955 |
catattatttaataataaaagttatgatacataa |
21797922 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21034263 - 21033985
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21034263 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
21034164 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21034163 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
21034064 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21034063 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
21033985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12299936 - 12299658
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12299936 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcatttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
12299837 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12299836 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagcgcca |
12299737 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
12299736 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctaggacttacatcaaca |
12299658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 15846813 - 15847091
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15846813 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctttaaga |
15846912 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15846913 |
aaatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggaatttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
15847012 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15847013 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagcgcttacaccaaca |
15847091 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14890416 - 14890138
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14890416 |
catcagtctacatacataatagtctcaacactttattattatcctttattcatattaaagctttgaatacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
14890317 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
14890316 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatataaatataataaagagtgtca |
14890217 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14890216 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
14890138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 55427046 - 55426768
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55427046 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
55426947 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
55426946 |
taatgtaatctcatgattaagtcatacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
55426847 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55426846 |
tatattattcaataataaaagtcataatacataagatagatttaacataaactattggtctctagggcttacaccaaca |
55426768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 20147831 - 20148110
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttt-attcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataag |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20147831 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagtgttctataag |
20147930 |
T |
 |
| Q |
111 |
ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20147931 |
ataatgtaatctcatgattaagttacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcc |
20148030 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20148031 |
atatattatccaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
20148110 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21398813 - 21398539
Alignment:
| Q |
16 |
agtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21398813 |
agtctacatacataatagtctcgacactttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctttaagataat |
21398714 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatata |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21398713 |
gtaatctcatgattaagtcacaattaatatataattacatgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtcatata |
21398614 |
T |
 |
| Q |
216 |
ttattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21398613 |
ttattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
21398539 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 25979006 - 25979282
Alignment:
| Q |
13 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagat |
112 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
25979006 |
atcagtcaacatacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagcgttctttatgat |
25979103 |
T |
 |
| Q |
113 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
25979104 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtca |
25979203 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25979204 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctaggacttacaccaaca |
25979282 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 44 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28088211 - 28087967
Alignment:
| Q |
44 |
ttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaat |
143 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28088211 |
ttattattatcatttattcatattaaagctttgactacggatctatttaagaatagtgttctttatgataatgtaatctcatgattaagtcacacttaat |
28088112 |
T |
 |
| Q |
144 |
atattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacat |
243 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28088111 |
atattattacacgaactatctattctaagaactttattaatattatctaaatataataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgatacat |
28088012 |
T |
 |
| Q |
244 |
aagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaa |
288 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28088011 |
aagataagtttaacataaactattggcctttagggattacaccaa |
28087967 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11787611 - 11787382
Alignment:
| Q |
13 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagat |
112 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
11787611 |
atcagtcaacatacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gactacagatacatttaagaataacgttctttatgat |
11787514 |
T |
 |
| Q |
113 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
11787513 |
aatgtaatctcatgattaagtcacatttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtca |
11787414 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacat |
243 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11787413 |
tatattattcaataagaaaagtcatgatacat |
11787382 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14147046 - 14146769
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || | | | |
|
|
| T |
14147046 |
catcagtctacatatataatagtctctgtgctttattattatccca-atttatgttaaagctt-gactacagatacatttagaaatagctttgttaatgt |
14146949 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatct-aaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14146948 |
taatgtagtttcatgattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctatggaccgtattaatcttataacaaatataataaagagtgcc |
14146849 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14146848 |
atatattatttaataataaaagtcatgatacataacataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
14146769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15526777 - 15526503
Alignment:
| Q |
13 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagat |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| || | | |
|
|
| T |
15526777 |
atcagtctacaaacataatagtctctacgctttattattatc--tcatttatattaaagctt-gactacatatgcatttaagaatagtgttctttatgtt |
15526681 |
T |
 |
| Q |
113 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatct-aaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||| || || |
|
|
| T |
15526680 |
aatgtaatctcatgattaagtcacccttaatattccattacacgaactatatattctaggga-tttattaatcttataacaaatataataaagaatgtca |
15526582 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15526581 |
tatattatttaataataaaagtcatgatacgtagcttaagtttaacataaattaatggcctatagggcttacaccaaca |
15526503 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14226090 - 14225954
Alignment:
| Q |
156 |
gaactatctattctaaggactttattaacattatc-taaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggttt |
254 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||||||||| | || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
14226090 |
gaactatctattttagggactttattaatcttacagttaatataataaaaaacgcgttatcttatttaataataaaagtcatgatacataacataaattt |
14225991 |
T |
 |
| Q |
255 |
aacat-aaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14225990 |
aacataaaaatattggtctctagagcttacaccaaca |
14225954 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9456141 - 9455863
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9456141 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
9456042 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9456041 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
9455942 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9455941 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
9455863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 42817266 - 42817544
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42817266 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
42817365 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42817366 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
42817465 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42817466 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
42817544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Original strand, 47667751 - 47668030
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47667751 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
47667850 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47667851 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
47667950 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47667951 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
47668030 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Original strand, 20391516 - 20391795
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20391516 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
20391615 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20391616 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
20391715 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20391716 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttctcataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
20391795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 22670534 - 22670812
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22670534 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggattcatttaagaatagcgttctataaga |
22670633 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22670634 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
22670733 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22670734 |
tatattatccaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
22670812 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Original strand, 20779922 - 20780201
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20779922 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
20780021 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20780022 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
20780121 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20780122 |
tatattatacaataataaaagtcatgatacataagataaatataacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
20780201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 19706716 - 19706994
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19706716 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctttaaga |
19706815 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
19706816 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatatcattacacgaactatctattctaaggactttattaacattgtttaaatataataaagagtgaca |
19706915 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19706916 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
19706994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 28135000 - 28135278
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28135000 |
catcagtctacatacataattgtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacagatacatttaataatagcgttcttaaaga |
28135099 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28135100 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
28135199 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28135200 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
28135278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Original strand, 43802642 - 43802921
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43802642 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacgaatacatttaagaatagcgttctttaaga |
43802741 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
43802742 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatataattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
43802841 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43802842 |
tatattattcaatattaaaagtcatgatacataagatatgtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
43802921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22612517 - 22612234
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacg----gatacatttaagaatagcgttctat |
107 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22612517 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacgaatatatatatttaagaatagcgttctat |
22612418 |
T |
 |
| Q |
108 |
aagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagt |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22612417 |
aagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactttctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagt |
22612318 |
T |
 |
| Q |
208 |
gccatatatta-ttcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22612317 |
gccatatattatttcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
22612234 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 35930607 - 35930329
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
35930607 |
catcagtctatatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagttttgactacggatacatttaagaatagcgttctttatga |
35930508 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
35930507 |
taatgtaatctcatgattaagtcgcacttaatatattattacacaaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
35930408 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35930407 |
tatattattcaataataaaagtcattatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
35930329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 88 - 290
Target Start/End: Original strand, 22234827 - 22235029
Alignment:
| Q |
88 |
atttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatt |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22234827 |
atttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatt |
22234926 |
T |
 |
| Q |
188 |
atctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22234927 |
atctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
22235026 |
T |
 |
| Q |
288 |
aca |
290 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
22235027 |
aca |
22235029 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8727692 - 8727412
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttt--attcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataa |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
8727692 |
catcagtctacatagataatagtctcgacgctttattattattatctcaattcatattaaag-tttgactacagatagatttcagaataacgttctttat |
8727594 |
T |
 |
| Q |
110 |
gataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattat-ctaaatataataaagagtg |
208 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |
|
|
| T |
8727593 |
gttaaagtaatcttatgatttagtcacacttaatataaaattacacgaa-aatttattctagggactttattaacattataacaagtatgataaagagtg |
8727495 |
T |
 |
| Q |
209 |
ccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtt-taacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||| || |||||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8727494 |
ccatatattatttaatagtaaatgttatgatatgtaatataagttataacataaaccattggcctctagggcttacaccaaca |
8727412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 633959 - 633814
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || || |
|
|
| T |
633959 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttgttattatcctt-attcatattaaagctt-gactacggatacatttaaaaataatgttctttatga |
633862 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaac |
159 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
633861 |
taatttaatctcatgattaagttacacttaatatattattacacgaac |
633814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 290
Target Start/End: Original strand, 26923675 - 26923900
Alignment:
| Q |
62 |
catattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaacta |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | || | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26923675 |
catattaaagctt-gactacggatacatttaagaataacattatttatgttaatgtaatctaatgattaagtcacactcaatatacaattacacgaacta |
26923773 |
T |
 |
| Q |
162 |
tctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacata |
260 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26923774 |
tctattctagaaactttattaacatcactacaaatataataaagagtgtcatatattatttaataataaaag---tgatacataagataagtttaacata |
26923870 |
T |
 |
| Q |
261 |
aactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
| ||| ||| || | || |||||||||||| |
|
|
| T |
26923871 |
acctaatggactttgggacttacaccaaca |
26923900 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 21881653 - 21881931
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||| || |
|
|
| T |
21881653 |
catcggtctacataaataatagtcttgacactttatcattatccta-atttatattaaagatt-gactacggatacatttaagaattgcattctttacat |
21881750 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
21881751 |
taatgtaatctcatgattaattaacacttaatattccatcacacgaactatctattctctggactttatttatcttacaacaaatataataaa-aatgcc |
21881849 |
T |
 |
| Q |
211 |
--atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21881850 |
atatatattattcaataataaaagtcatgatacgtagcaaaagtttaagataaactattgacctatagagcttacaccaaca |
21881931 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29096739 - 29096580
Alignment:
| Q |
21 |
acatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaat |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| | | ||||||||| |
|
|
| T |
29096739 |
acatacataatagtctctacgctttattattatc-tcgatatatat-aaagctt-gactacatatacttttaagaataaagttctttttgttaatgtaat |
29096643 |
T |
 |
| Q |
121 |
ctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaa |
183 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29096642 |
cttacgattaagtcacacttaatattccatcacatgaactatctattctagggactttattaa |
29096580 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14482337 - 14482299
Alignment:
| Q |
252 |
tttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14482337 |
tttaacataaactattggcctctagggcttacactaaca |
14482299 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16435877 - 16435837
Alignment:
| Q |
13 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattat |
53 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16435877 |
atcagtctacatacatattagtctctacgctttattattat |
16435837 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16435728 - 16435649
Alignment:
| Q |
160 |
tatctattctaaggactttattaacattatctaaa-tataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatga |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16435728 |
tatctattctaagaactttattaatcttatataaaatataataaagaatgtctcattttatttaataataaaagtcatga |
16435649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 119755 - 119477
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
119755 |
catcagtctacgtacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
119656 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
119655 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
119556 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
119555 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
119477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 24933583 - 24933861
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24933583 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
24933682 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24933683 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
24933782 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24933783 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
24933861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31924 - 31646
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31924 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
31825 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31824 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
31725 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31724 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataaaataggtttaacataaactattggcctctaaggcttacaccaaca |
31646 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23545947 - 23545669
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23545947 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
23545848 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23545847 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
23545748 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23545747 |
tatattaatcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggctcacaccaaca |
23545669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Original strand, 12789940 - 12790219
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12789940 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
12790039 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12790040 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaaaattatctaaatataataaagagtgcca |
12790139 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12790140 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctttagggcttacaccaacag |
12790219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 291
Target Start/End: Original strand, 25805662 - 25805941
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25805662 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagcttcgactacggatatatttaagaatagcgttctttaaga |
25805761 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25805762 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
25805861 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25805862 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
25805941 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22941275 - 22940997
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |
|
|
| T |
22941275 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcaaattaaagctttgactacggatacatttaagaataacattctttaaga |
22941176 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22941175 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgtca |
22941076 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22941075 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
22940997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31096841 - 31096563
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
31096841 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaataacgttctttaaga |
31096742 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31096741 |
taatgtaatcccatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
31096642 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31096641 |
tatattattcaataataagagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
31096563 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20941052 - 20940774
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
20941052 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaataacgttctttaaga |
20940953 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20940952 |
taatgtaatctcatgattaagtcacagttaatatattattacacgaactatctattctaaggacattattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
20940853 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
20940852 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctttagggcttacacaaaca |
20940774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Original strand, 12765271 - 12765544
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
12765271 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagtgttctttatga |
12765367 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
12765368 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattttaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtc |
12765467 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12765468 |
atatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
12765544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 7865711 - 7865987
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
7865711 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagtgttctttatga |
7865807 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
7865808 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactatgaatataataaagagtgtc |
7865907 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7865908 |
atatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttaaaccaaca |
7865987 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Original strand, 12704155 - 12704428
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
12704155 |
catcagtctacatacatagtagtctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagtgttctttatga |
12704251 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
12704252 |
taatgtaatctcatgattaagtcacaattaatatattattacacgaactatctattttaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtc |
12704351 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12704352 |
atatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
12704428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Original strand, 9812014 - 9812287
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |
|
|
| T |
9812014 |
catcagtctacatacatagtagtctcgacgctttattattatcct--aattatattaaagctt-gactacggatacatttaataatagtgttctttatga |
9812110 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
9812111 |
taatgtaatctcatgattaagtcacaattaatatattattacacgaactatctattttaaggactttattagcattactataaatataataaagagtgtc |
9812210 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
287 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9812211 |
atatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacacca |
9812287 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26245127 - 26244850
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | |||| || || |
|
|
| T |
26245127 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctt-attcatattaaagctt-gattacagatacatttaagaataacattctttatga |
26245030 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
26245029 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattcgagggactttattaacattactataaatataaaaaagagtatc |
26244930 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
26244929 |
atatattattcaataataaaagtcatgatatataagataagtttaacataaactattggcctccagagcttacaccaaca |
26244850 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5097676 - 5097414
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
5097676 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaaactt-gactacaaatacatttaagaataacgttctttatgt |
5097579 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
5097578 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatatcattacatgaactatctattccagggactttattaacattactataaatataataaaaattgcc |
5097479 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctag |
276 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
5097478 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaa-tattagcctctag |
5097414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 39535489 - 39535211
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
39535489 |
catcagtctacatacataatagtcttgacgctttattattatccca-attcatattaaag-tttgagtacggatacatttaagaatatcgttctttaagg |
39535392 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattat-ctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
39535391 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatataccattatatgaactatctattccagggactttattaacattataacaaatataataaagagtgtc |
39535292 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaat-aataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| || |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39535291 |
atatattatttaataaaaaaaattcatgatacataacgtaaatttaacataaactattgacctctagggcatacaccaaca |
39535211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 20100520 - 20100793
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||| | || | |
|
|
| T |
20100520 |
catcagtctacatacataatagtcgtgacgctttattattatccca-atttatattaaag-tttaactacgaatacatttaagaataacgttatttacgt |
20100617 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| || | |
|
|
| T |
20100618 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatattccattatatgaactatctattctatggactttattaatcttacaacaaatataataaagaatgtc |
20100717 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaa |
288 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20100718 |
--atattattgaataataaaagtcatgatacataacataagtctgacataaactattggcctctagggcttacaccaa |
20100793 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 290
Target Start/End: Original strand, 26129974 - 26130249
Alignment:
| Q |
16 |
agtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| |
|
|
| T |
26129974 |
agtctacatacataatattctctgcgctttattattatccca-atttatattaaagctt-gactacggatacatttaagaagagcgttcttaatgttaaa |
26130071 |
T |
 |
| Q |
116 |
gtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatat--aataaagagtgccat |
212 |
Q |
| |
|
||||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
26130072 |
gtaatattaggattaagtcacactaaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaacaagtattaaataaagagtgtcat |
26130171 |
T |
 |
| Q |
213 |
atattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26130172 |
atattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttatcataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
26130249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 31652208 - 31652338
Alignment:
| Q |
157 |
aactatctattctaaggactttattaacattatct-aaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggttta |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| |
|
|
| T |
31652208 |
aactatctattctagggactttattaatcttacaacaaatataataaagaatgctttattttatttaataataaaagtcatgatacaaagcgtaagttta |
31652307 |
T |
 |
| Q |
256 |
acataaactattggcctctagggcttacacca |
287 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
31652308 |
acataaa-tattggcctttaaggcttacacca |
31652338 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 55
Target Start/End: Original strand, 31267939 - 31267982
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcc |
55 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31267939 |
catccgtctacatacataatagtctccacgctttattgttatcc |
31267982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0378 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:
Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8330 - 8052
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8330 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactatggatacatttaagaatagcgttctataaga |
8231 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8230 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatataaatataataaagagtgcca |
8131 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8130 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
8052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0393 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:
Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Original strand, 15100 - 15376
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15100 |
catcagtctacatacataatagtctcgatgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctttaaga |
15199 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15200 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
15299 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaa |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15300 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaa |
15376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold2089 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold2089
Description:
Target: scaffold2089; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 22 - 290
Target Start/End: Original strand, 1 - 273
Alignment:
| Q |
22 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat----ttaagaatagcgttctataagataatgt |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatatatatatttaagaatagcgttctataagataatgt |
100 |
T |
 |
| Q |
118 |
aatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatatt |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
101 |
aatctcatgattaagtcgcacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatatt |
200 |
T |
 |
| Q |
218 |
attcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
201 |
attcaataataaaggtcatgatacataagataggtttaacaaaaactattggcctctagggcttacaccaaca |
273 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 56 - 290
Target Start/End: Original strand, 40015 - 40249
Alignment:
| Q |
56 |
tttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacac |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40015 |
tttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaataacgttctttaagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacac |
40114 |
T |
 |
| Q |
156 |
gaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggttta |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40115 |
gaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggttta |
40214 |
T |
 |
| Q |
256 |
acataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40215 |
acataaactattgacctctagggcttacaccaaca |
40249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0019 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:
Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 61 - 292
Target Start/End: Original strand, 19160 - 19391
Alignment:
| Q |
61 |
tcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaact |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19160 |
tcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaact |
19259 |
T |
 |
| Q |
161 |
atctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacata |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
19260 |
atctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagatattttttttata |
19359 |
T |
 |
| Q |
261 |
aactattggcctctagggcttacaccaacaga |
292 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19360 |
aactattggcctctagggcttacaccaacaga |
19391 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 67651 - 67928
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || || |
|
|
| T |
67651 |
catcagtctatatacataatagtctcgacgctttattattatccta-attcatattaaagctt-gactacgaatacatttaagaataacgttctttatga |
67748 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
67749 |
tactgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtc |
67848 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67849 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataaaataagtttaacataaactattgacctctagggcttacaccaaca |
67928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0099 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:
Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9135 - 8847
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcg-acgctttatt-attatccttt-attcatattaaa-gcttt-gactacggatacattt-aagaatagcgtt-c |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
9135 |
catcagtctacatacataatagtctcgtacgctttatttattatccttttattcatattaaaagcttttgactacggatacattttaagaatagcgttac |
9036 |
T |
 |
| Q |
105 |
tataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaagg-actttattaacattatctaaatataataaa |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9035 |
tataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggtactttattaacattatctaaatataataaa |
8936 |
T |
 |
| Q |
204 |
gagtgccatatattattc-aataataaaagt-catgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8935 |
gagtgccatatattattctaataataaaagtacatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
8847 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0063 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:
Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Original strand, 45226 - 45502
Alignment:
| Q |
13 |
atcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagat |
112 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
45226 |
atcagtcaacatacataatagtctcgacgctttattattatccta-attaatattaaagctt-gactacggatacatttaagaatagcgttctttatgat |
45323 |
T |
 |
| Q |
113 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
45324 |
aatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacaagaactatctattgtaaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtca |
45423 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
45424 |
tatattattcaataataaaagtcatgatgcataagataagtttaacagaaactattggccttttgggcttacaccaaca |
45502 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0376 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:
Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 11807 - 12083
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
11807 |
catcaatctacatacataatagtttcgacgctttattattatcct--aattatattaaagatt-gactacagatacatttaagaatagtgttctttatga |
11903 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || | |
|
|
| T |
11904 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactataaatacaataaagaatgtc |
12003 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12004 |
atatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
12083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0139 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:
Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 107 - 290
Target Start/End: Original strand, 18786 - 18969
Alignment:
| Q |
107 |
taagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagag |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18786 |
taagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagag |
18885 |
T |
 |
| Q |
207 |
tgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18886 |
tgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
18969 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0112 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:
Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 208 - 1
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
208 |
catcagtcgacatacataatagtctcgacgctttattattatccattattcatattaaagctttgactacagatacatttaagaacagcgttctataaga |
109 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
108 |
taatgtaatctcattattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgcca |
9 |
T |
 |
| Q |
212 |
tatattat |
219 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
8 |
tatattat |
1 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1948 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold1948
Description:
Target: scaffold1948; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 82 - 290
Target Start/End: Original strand, 961 - 1169
Alignment:
| Q |
82 |
ggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttatt |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
961 |
ggatacatttaagaataacgttctttaagataatgtaatcacatgattaagtcacacttaatatattattaaaaaaactatctattataaggactttatt |
1060 |
T |
 |
| Q |
182 |
aacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggctt |
281 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1061 |
aacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggctt |
1160 |
T |
 |
| Q |
282 |
acaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
1161 |
acaccaaca |
1169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0061 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:
Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 101 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 76496 - 76307
Alignment:
| Q |
101 |
gttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataat |
200 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
76496 |
gttctttatgataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataat |
76397 |
T |
 |
| Q |
201 |
aaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
76396 |
aaagagtgtcatattttattcaatattaaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
76307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Original strand, 40265 - 40542
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
40265 |
catcagtctacatacataatagtctcggcgctttattattatc-tcaatttatattaaagctt-gactatggatacatttaagaatagcgttctttacgt |
40362 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
40363 |
taatgtattctcatgattaagtcacacttaatataccattacatgaattatctattccagagactttattaatattacaaaaaatataataaagagtgtc |
40462 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40463 |
atatattatttaataataaaagtcatgctacatagcataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
40542 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0466 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:
Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 275
Target Start/End: Original strand, 13226 - 13489
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || | |
|
|
| T |
13226 |
catcggtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccca-attaatattaaagctt-gactatggatacatttaagaatactgttttttatgt |
13323 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattatt-acacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgc |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
13324 |
taatgtaatctcatgattaaatcacacttaatatatcatttacatgaactatctattctagggactttattagcattactacaaatataattaagagagc |
13423 |
T |
 |
| Q |
210 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctcta |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13424 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacataagataaatttaacataaactattggcctcta |
13489 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0611 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:
Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 134 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9672 - 9516
Alignment:
| Q |
134 |
cacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagt |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9672 |
cacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatctaaatattataaagagtgccacatattattccataataaaagt |
9573 |
T |
 |
| Q |
234 |
catgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9572 |
catgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
9516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0086 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:
Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 53790 - 53521
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
53790 |
catcaatctacatacataatagtcttgacactttattattatccta-attcatattaaagctt-gaatacggatacatttaagaatagtgttctttatgt |
53693 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
53692 |
taatgtaatctcat--------cacacttaatatatcattacatgaactatttactctagggactttattaacattactatgaatcgaataaagagtgtc |
53601 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53600 |
atatattattcaataataaaagtcatgatatataagataagtttaacataaactattgacctctagggcttacaccaaca |
53521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0059 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:
Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 157 - 290
Target Start/End: Original strand, 33927 - 34060
Alignment:
| Q |
157 |
aactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33927 |
aactatctattctaaggactttattaacattatctaaatataataaagagtgccacatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaa |
34026 |
T |
 |
| Q |
257 |
cataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34027 |
cataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
34060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0111 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:
Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 78 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26567 - 26413
Alignment:
| Q |
78 |
ctacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactt |
177 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26567 |
ctactgatacatttaagaataacgttctttattataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatacgattacacgaactatctattctagggactt |
26468 |
T |
 |
| Q |
178 |
tattaacattatcta--aatataataaagagtgccatatattattcaataataaaa |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26467 |
tattaacatta-caacgaatataataaagagtgccatatattatttaataataaaa |
26413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0454 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:
Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13861 - 13740
Alignment:
| Q |
170 |
aaggactttattaacatta-tctaaatataataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattg |
268 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13861 |
aaggactttattaacattactataaatataataaagagtgtcatatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattg |
13762 |
T |
 |
| Q |
269 |
gcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13761 |
gtctctagggcttacaccaaca |
13740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0136 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:
Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8756 - 8479
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
8756 |
catcaatctacatacatattagtctctacgctttattactatc-tcaatttatattaaaactt-gactacaaatacttttaagaatagtgttctttatgt |
8659 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatct-aaatataataaagagtgcc |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||| | || |
|
|
| T |
8658 |
taatgtaatctcatgattaagtctcacataatgt-ccattacttgaactatatattctaaggactttattaatattatatcaaatttcataaagaatacc |
8560 |
T |
 |
| Q |
211 |
atatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacat-aaactattggcctctagggcttacaccaaca |
290 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8559 |
tcattttatttaataataaaaatcacgatacataaaataattttaacataaaactattaacctctaggatttacaccaaca |
8479 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0783 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0783
Description:
Target: scaffold0783; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6284 - 6222
Alignment:
| Q |
233 |
tcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacagattg |
295 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6284 |
tcatgatacataagataggtttaacataaactattggcttctagggcttacaccaacacattg |
6222 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1400 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1400
Description:
Target: scaffold1400; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 241 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1875 - 1825
Alignment:
| Q |
241 |
cataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1875 |
cataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacag |
1825 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 145
Target Start/End: Original strand, 83292 - 83423
Alignment:
| Q |
12 |
catcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataaga |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| | | |
|
|
| T |
83292 |
catcagtctacatacataatagtctatacactttattattat-ctcaatttatattaaa-tttcgactacggatacttttaagaatagtattctttgtgt |
83389 |
T |
 |
| Q |
112 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatat |
145 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
83390 |
gaatttaatctcacaattaagtctcacttaatat |
83423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University