View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7229_high_33 (Length: 243)

Name: NF7229_high_33
Description: NF7229
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7229_high_33
NF7229_high_33
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (15-243)||(18712313-18712540)
chr6 (37-243)||(26168184-26168387)
chr6 (15-243)||(16321102-16321329)
chr6 (15-243)||(16333250-16333477)
chr6 (15-195)||(26161699-26161877)
chr6 (37-243)||(24505442-24505645)
chr6 (37-202)||(791301-791464)
chr6 (37-243)||(26021146-26021349)
chr6 (37-243)||(1596271-1596474)
chr6 (37-207)||(17823929-17824095)
chr6 (37-163)||(30658255-30658377)
chr6 (56-207)||(16923424-16923573)
chr6 (176-243)||(30658164-30658231)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (15-243)||(42090753-42090980)
chr5 (15-243)||(20764151-20764375)
chr5 (37-243)||(21681458-21681661)
chr5 (37-243)||(18210049-18210252)
chr5 (37-243)||(18219387-18219590)
chr5 (40-243)||(34130727-34130927)
chr5 (37-243)||(27274419-27274621)
chr5 (37-243)||(31916627-31916830)
chr5 (37-243)||(37299052-37299255)
chr5 (37-243)||(19888592-19888794)
chr5 (37-243)||(37817415-37817618)
chr5 (37-212)||(30944054-30944226)
chr5 (37-212)||(30953476-30953648)
chr5 (37-243)||(37548843-37549045)
chr5 (37-243)||(37651641-37651843)
chr5 (37-243)||(4038217-4038420)
chr5 (37-243)||(22173488-22173690)
chr5 (37-214)||(13571947-13572120)
chr5 (56-243)||(205713-205898)
chr5 (37-162)||(20896769-20896891)
chr5 (54-162)||(20904849-20904955)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (37-243)||(18576-18780)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (15-243)||(12570378-12570606)
chr2 (37-232)||(22687719-22687912)
chr2 (37-243)||(45190652-45190855)
chr2 (37-243)||(574075-574278)
chr2 (54-243)||(37863059-37863245)
chr2 (37-243)||(16934328-16934531)
chr2 (37-243)||(17004988-17005191)
chr2 (37-202)||(3606001-3606161)
chr2 (37-89)||(24942742-24942794)
[»] scaffold0014 (3 HSPs)
scaffold0014 (30-243)||(114550-114760)
scaffold0014 (16-243)||(146486-146712)
scaffold0014 (15-232)||(153575-153778)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (15-243)||(20531360-20531586)
chr8 (37-243)||(13674069-13674272)
chr8 (37-243)||(31999282-31999484)
chr8 (37-243)||(33774172-33774375)
chr8 (37-243)||(14881729-14881931)
chr8 (37-243)||(14894079-14894281)
chr8 (37-243)||(23015043-23015245)
chr8 (15-191)||(5759198-5759367)
chr8 (37-243)||(11430699-11430900)
[»] chr7 (6 HSPs)
chr7 (37-243)||(27988330-27988533)
chr7 (37-243)||(45553012-45553214)
chr7 (37-243)||(19585591-19585793)
chr7 (37-243)||(24540864-24541067)
chr7 (56-243)||(10415538-10415723)
chr7 (55-162)||(12769954-12770058)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (37-243)||(13477-13680)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (37-243)||(111818-112021)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (37-243)||(16629348-16629551)
chr4 (37-243)||(7846792-7846997)
chr4 (15-243)||(16211210-16211437)
chr4 (37-212)||(17828568-17828740)
chr4 (37-212)||(17837959-17838131)
chr4 (37-207)||(44888572-44888738)
chr4 (37-202)||(53946367-53946528)
chr4 (56-214)||(2829395-2829551)
chr4 (56-243)||(16396756-16396941)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (37-243)||(893-1096)
[»] chr3 (10 HSPs)
chr3 (37-243)||(19828275-19828478)
chr3 (37-243)||(20745108-20745310)
chr3 (37-243)||(4783012-4783215)
chr3 (37-243)||(2489603-2489806)
chr3 (37-243)||(13120002-13120205)
chr3 (37-243)||(13112890-13113093)
chr3 (117-243)||(20292928-20293054)
chr3 (37-164)||(18560802-18560926)
chr3 (37-202)||(51978838-51979000)
chr3 (37-154)||(12376368-12376482)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (37-243)||(20318085-20318288)
chr1 (37-243)||(20308685-20308887)
chr1 (37-243)||(26193481-26193684)
chr1 (37-243)||(27065904-27066107)
chr1 (37-224)||(20328428-20328612)
chr1 (37-214)||(22960708-22960882)
chr1 (37-243)||(37011820-37012022)
chr1 (37-202)||(25823532-25823693)
chr1 (30-191)||(18097025-18097183)
chr1 (37-202)||(49333163-49333324)
chr1 (37-143)||(20314369-20314472)
chr1 (37-162)||(21821555-21821677)
chr1 (79-243)||(25039455-25039617)
chr1 (37-162)||(21782530-21782654)
[»] scaffold1705 (1 HSPs)
scaffold1705 (37-243)||(688-891)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (37-175)||(23924-24059)
scaffold0058 (179-243)||(29335-29399)
[»] scaffold0706 (3 HSPs)
scaffold0706 (111-243)||(2010-2142)
scaffold0706 (37-89)||(4104-4156)
scaffold0706 (37-89)||(4317-4369)
[»] scaffold1468 (1 HSPs)
scaffold1468 (37-202)||(1144-1305)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (37-169)||(59849-59978)
scaffold0018 (37-169)||(54469-54598)
scaffold0018 (37-169)||(58421-58550)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (37-162)||(11132-11254)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (55-162)||(15238-15342)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18712540 - 18712313
Alignment:
Q  15 tcagttttgttttac-attagagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatg 113  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  18712540 tcagttgtgttttactattaaagttgattacattaaaagtcaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattctgaaggtcagaat--g 18712443  T
Q  114 ttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctg 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  18712442 ttcatttctgcacatgctttcaaccatgaacagtgtagttggtggaaagatgtaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtcctctt 18712343  T
Q  214 atttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18712342 atttgaatcaagcaaatctccttgaagcat 18712313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 26168184 - 26168387
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  26168184 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 26168280  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  26168281 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatgaaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtatcctatgatttgaatcaagcaaatctcctt 26168380  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  26168381 gaagcat 26168387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 16321102 - 16321329
Alignment:
Q  15 tcagttttgttttac-attagagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatg 113  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||  |    
T  16321102 tcagttgtgttttactatcagtgttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaattgaacattctgaagatcagaat--g 16321199  T
Q  114 ttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctg 213  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  16321200 ttcacttctgcacatgcttccagccatgaacagtacagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtatcctttg 16321299  T
Q  214 atttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16321300 atttgaatcaagcaaatctccttgaagcat 16321329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 16333250 - 16333477
Alignment:
Q  15 tcagttttgttttac-attagagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatg 113  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||  |    
T  16333250 tcagttgtgttttactatcagtgttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaattgaacattctgaagatcagaat--g 16333347  T
Q  114 ttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctg 213  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  16333348 ttcacttctgcacatgcttccagccatgaacagtacagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtatcctttg 16333447  T
Q  214 atttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16333448 atttgaatcaagcaaatctccttgaagcat 16333477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Original strand, 26161699 - 26161877
Alignment:
Q  15 tcagttttgttttac-attagagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatg 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  |    
T  26161699 tcagttgtgttttactattagagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--g 26161795  T
Q  114 ttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatca 195  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26161796 ttcacttctgcacatgcttccagccatgaacagtgtagttggtggaaagatgaaaaagctagcaaaaggagatcttgcatca 26161877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24505645 - 24505442
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||| | || |||||||| |||||     
T  24505645 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gtttacttctgcacatgtttccat 24505549  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  24505548 ccatgaacagtgtagttggtagaaagatggaaaagctagcaaaaggatatcttgcatcagagataacgtgtactctgatatgaatcaagcaaatctcctt 24505449  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  24505448 gaagcat 24505442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 791464 - 791301
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||| |  ||||||||||||||     
T  791464 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctgaagatcagaat--gttcactcctgcacatgcttccag 791367  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataa 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  791366 ccatgaacagtgtagttggtggaaagaagaaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataa 791301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26021349 - 26021146
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  26021349 ttgattacattaaaagttaagtcttatcaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctg-agatcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 26021253  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagat-gaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctact 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||    
T  26021252 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaaagctag-caaatgagatcttgcatcagagataatgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcct 26021154  T
Q  236 tgaagcat 243  Q
    ||||||||    
T  26021153 tgaagcat 26021146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 1596271 - 1596474
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  1596271 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 1596367  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||    ||||||| |||||| |||    
T  1596368 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcattggagataacatgtactctgaacaaaatcaagcaaatctcctt 1596467  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  1596468 gaagcat 1596474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 207
Target Start/End: Original strand, 17823929 - 17824095
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  17823929 ttgattacatcaaaagt--agtcttacatatcatcctaaagtaagagcaaatgaaacattctgatggtcagaat--gttcacttttgcacatgcttccag 17824024  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgt 207  Q
    | ||||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17824025 ctatgaatagtgtagttggtagaaagaagaaaaagatagcaaagggagatcttgcatcagagataacgtgt 17824095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 30658377 - 30658255
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  30658377 ttgattacatcaaaagt--agtcttacaaatcatcctaaagtaagagcaaatgaaacattctgatggtcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 30658282  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaaga 163  Q
    | | ||||| |||||||||| ||||||    
T  30658281 ctacgaacagtgtagttggtagaaaga 30658255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 207
Target Start/End: Original strand, 16923424 - 16923573
Alignment:
Q  56 agtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttgg 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||  |||||||| | |||||||||||  ||| | ||||| ||||||||     
T  16923424 agtcttacaaatcatcttaaagtaagagcaaatgaaacattcttatggtcaga--atgttcatctctgcacatgcttttaactacgaacagtgtagttga 16923521  T
Q  156 tggaaagatgaaaaagc-tagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgt 207  Q
    | ||||  | |  ||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16923522 t-gaaaatttagcaagcaaagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgt 16923573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 30658231 - 30658164
Alignment:
Q  176 aaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||||| || |||||||    
T  30658231 aaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgaacaaaatcaagcaaatctcctagaagcat 30658164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42090980 - 42090753
Alignment:
Q  15 tcagttttgttttac-attagagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatg 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |    
T  42090980 tcagttgtgttttactattagagttgattacattaaaagttaagtcttaaaaatcaaactaaagtaagaacaaaagaaacattccgaaggtcagaat--g 42090883  T
Q  114 ttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctg 213  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42090882 ttcatttctgcacatgcttctaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtcctctg 42090783  T
Q  214 atttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  42090782 atttgaatcaagcaaatctcattgaagcat 42090753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 20764151 - 20764375
Alignment:
Q  15 tcagttttgttttac-attagagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatg 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||    
T  20764151 tcagttgtgttttactattagagttaattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaaagaaacattttgaaggtc--aaaatg 20764248  T
Q  114 ttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctg 213  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20764249 ttcatttctgcatatgcttccagccatgaac---gtagttggtggaaagatgaaaaagctagcaaaatgaaatcttgcatcagagataacgtgtcctttg 20764345  T
Q  214 atttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20764346 gtttgaatcaagcaaatctacttgaagcat 20764375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 21681458 - 21681661
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  21681458 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 21681554  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  21681555 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 21681654  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  21681655 gaagcat 21681661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18210252 - 18210049
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  18210252 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 18210156  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  18210155 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 18210056  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  18210055 gaagcat 18210049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18219590 - 18219387
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  18219590 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 18219494  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  18219493 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 18219394  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  18219393 gaagcat 18219387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34130927 - 34130727
Alignment:
Q  40 attacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaacca 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || |||||||||||||| |||    
T  34130927 attacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaagaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccagcca 34130831  T
Q  140 tgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctacttgaa 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  34130830 tgaacagtgtagttggtggaaagatgaaaaagctagcaaaaggagatattgcatcagagataacgtgtactctgatatgaatcaagcaaatctccttgaa 34130731  T
Q  240 gcat 243  Q
    ||||    
T  34130730 gcat 34130727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27274621 - 27274419
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  27274621 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctg-agatcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 27274525  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  27274524 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatggaaaagctag-caaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 27274426  T
Q  237 gaagcat 243  Q
     ||||||    
T  27274425 aaagcat 27274419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 31916627 - 31916830
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  31916627 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttatgcacatgcttccag 31916723  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||||| |||    
T  31916724 ccatgaacagtgtagttagtggaaagatggaaacgctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactttgatatgaatcaagcaaatctcctt 31916823  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  31916824 gaagcat 31916830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37299255 - 37299052
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  37299255 ttgattacattaaaagttaagtcttataaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 37299159  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  37299158 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaaactagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 37299059  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  37299058 gaagcat 37299052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19888794 - 19888592
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  19888794 ttgattacattaaaagttaagtcttacagatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctg-agatcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 19888698  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  19888697 ccataaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctag-caaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgatatgaatcaagcaaatctcctt 19888599  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  19888598 gaagcat 19888592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 37817415 - 37817618
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  37817415 ttgattacattaaaagttaagtctttcaaatcaacctaaagaaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 37817511  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  37817512 ccatgaacagtgtagttggtgaaaagatcaaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 37817611  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  37817612 gaagcat 37817618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30944226 - 30944054
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  30944226 ttgattacattaaaagttaagtcttataaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 30944130  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctct 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30944129 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactct 30944054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30953648 - 30953476
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  30953648 ttgattacattaaaagttaagtcttataaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 30953552  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctct 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30953551 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactct 30953476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37549045 - 37548843
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  37549045 ttgattacattaaaagttaagtcttataaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctg-agatcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 37548949  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  37548948 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaa-gagatcttgcatcaaagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 37548850  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  37548849 gaagcat 37548843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37651843 - 37651641
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  37651843 ttgattacattaaaagttaagtcttataaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctg-agatcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 37651747  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  37651746 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaa-gagatcttgcatcaaagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 37651648  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  37651647 gaagcat 37651641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4038420 - 4038217
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  |||||  | ||||||||||| ||     
T  4038420 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacgtctgcacatgctttcag 4038324  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||||| |||    
T  4038323 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagttagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgaacaaaatcaagcaaatctcctt 4038224  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  4038223 gaagcat 4038217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22173690 - 22173488
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  22173690 ttgattacattaaaagttaagtcttataaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctg-agatcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 22173594  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| |  |||||| |||    
T  22173593 ccatgaacagtgtagttggtggaaaggtggaaaagctag-caaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatccaacaaatctcctt 22173495  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  22173494 gaagcat 22173488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13572120 - 13571947
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  13572120 ttgattacattaaaagttaagtctttcaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctg-agatcaga--atgttcatttctgcacatgcttccag 13572024  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctga 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13572023 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctag-caaaggaaatcttgcatcagagataacgtgtactctga 13571947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 205898 - 205713
Alignment:
Q  56 agtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttgg 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| | |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  205898 agtcttacaaatcatcctaaagtaagagcaaatgaaacattctgatggtcaga--atgttcatctctgcacatgcttctaactatgaacagtgtagttgg 205801  T
Q  156 tggaaagatgaaaaagc-tagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    || |||| | |  ||||  || ||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||    ||||||| |||||| || |||||||    
T  205800 tgaaaag-ttagcaagcaaagcaaaaggagatcttccattagagataacgtgtactctgaacaaaatcaagcaaatctcctagaagcat 205713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 162
Target Start/End: Original strand, 20896769 - 20896891
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||  |||||||| | |||||| ||||| ||    
T  20896769 ttgattacatcaaaagt-aagtcttacaaatcattctaaagtaagaaaaaaaggaacattctgaaggtcaga--atgttcatctctgcacaagcttctaa 20896865  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaag 162  Q
    | |||| || ||||||||||| ||||    
T  20896866 ctatgagcagtgtagttggtgaaaag 20896891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20904955 - 20904849
Alignment:
Q  54 taagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagtt 153  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||  | | || | |||||||||||| ||| |||| || |||||||    
T  20904955 taagtcttacaaatcattctaaagtaagaaaaaaaggaacattatgaaggtcagaat--ggttatctctgcacatgcttctaactatgagcagtgtagtt 20904858  T
Q  154 ggtggaaag 162  Q
    |||| ||||    
T  20904857 ggtgaaaag 20904849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 18576 - 18780
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||  ||||| || |||||||||||| |     
T  18576 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacagatggaacattctgaagatcagaat--gttcacttctgcacatgcttctag 18673  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  18674 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatgaaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttaaatcaagcaaatctcctt 18773  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  18774 gaagcat 18780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 12570378 - 12570606
Alignment:
Q  15 tcagttttgttttac-attagagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatg 113  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||  |    
T  12570378 tcagttgtgttttactattagagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacttaaagtaagaagaa-tgaaacattctgaaggtcagaat--g 12570474  T
Q  114 ttcatttttgcacatgcttccaaccat--gaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctc 211  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  12570475 ttcatttctgcacatgcttccagctatatgaacagtgtagttggtggaaagatgaaaaagctagcaaaagaagatcttgcatcagagataacgtgtactc 12570574  T
Q  212 tgatttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12570575 tgatttgaatcaagcaaatctccttgaagcat 12570606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22687912 - 22687719
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  22687912 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaataaacctaaagtaagaacaaatggaacattttgaagatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 22687815  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatct 232  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22687814 caatgaacagtgtagttggtggaaagatgaaaaagctagcaaaaggagatcttgcataagaggtaacgtgtcctctgatatgaatcaagaaaatct 22687719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 45190652 - 45190855
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  45190652 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 45190748  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  45190749 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 45190848  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  45190849 gaagcat 45190855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 574075 - 574278
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  574075 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 574171  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||||| |||    
T  574172 ccatgaacagtgtggttggtggaaagatggaaaagttagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgaacaaaatcaagcaaatctcctt 574271  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  574272 gaagcat 574278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37863245 - 37863059
Alignment:
Q  54 taagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagtt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  37863245 taagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccagccatgaacagtgtagtt 37863149  T
Q  154 ggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37863148 ggtggaaagatgaaaaagctagcaaaatgaaatcttgcataagagataacgtgtactctgatatgaatcaagcaaatctccttgaagcat 37863059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16934531 - 16934328
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||  ||||| || || |||||||||||     
T  16934531 ttgattacattaaaagttaagtcttacagatcaacctaaagtaagaacaaattgaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgtacatgcttccag 16934435  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||    ||||||| |||||| |||    
T  16934434 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacatttactctgaacaaaatcaagcaaatctcctt 16934335  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  16934334 gaagcat 16934328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17005191 - 17004988
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||  ||||| || || |||||||||||     
T  17005191 ttgattacattaaaagttaagtcttacagatcaacctaaagtaagaacaaattgaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgtacatgcttccag 17005095  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||    ||||||| |||||| |||    
T  17005094 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacatttactctgaacaaaatcaagcaaatctcctt 17004995  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  17004994 gaagcat 17004988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 3606161 - 3606001
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||  || ||||||||||||||     
T  3606161 ttgattacatcaaaagt--agtcttacaaatcatcctaaagtaagagcaaatgaaacattctgatggtcaga--atgttctcttctgcacatgcttccag 3606066  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataa 202  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3606065 ctatgaacagtgtagttggtagaaaga-aaaaaaggtagcaaaaggagaacttgcatcagagataa 3606001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 89
Target Start/End: Original strand, 24942742 - 24942794
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatg 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24942742 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatg 24942794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 114760 - 114550
Alignment:
Q  30 attagagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  114760 attagagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattct-aagatcagaat--gttcacttctgcacatg 114664  T
Q  130 cttccaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaa 229  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  114663 cttccagtcatgaacagtgtagttggtggaaagatgaaaaagctagcaaaaggagatattgcattagagataacgtgtcctctgatttgaatcaaacaaa 114564  T
Q  230 tctacttgaagcat 243  Q
    ||| ||||||||||    
T  114563 tctccttgaagcat 114550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 243
Target Start/End: Original strand, 146486 - 146712
Alignment:
Q  16 cagttttgttttac-attagagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgt 114  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||  ||    
T  146486 cagttgtgttttactattaggtttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaagtggaacattctgaagatcagaat--gt 146583  T
Q  115 tcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctga 214  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |    
T  146584 tcacttctgcacatgcttccagccatgaacagtgtagttggtggaaagatgaaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacttgttctctta 146683  T
Q  215 tttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    ||| ||| ||| |||||| ||||||||||    
T  146684 ttttaattaagcaaatctccttgaagcat 146712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 153778 - 153575
Alignment:
Q  15 tcagttttgttttac-attagagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatg 113  Q
    |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||  |||    
T  153778 tcagttgtgttttactattaggtttgattacattaaaagttaagtcttacaaatgaacctaaagtaataacaaatggaacattctg-aggttaga--atg 153682  T
Q  114 ttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctg 213  Q
    |||| || |||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||            ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||     
T  153681 ttcacttctgcacatgcttccagcgatgaatagtgtagttggtggaaagatg------------aaaggagatattgcatcagagataacatgtcctcta 153594  T
Q  214 atttgaatcaagaaaatct 232  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  153593 atttgaatcaaggaaatct 153575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20531586 - 20531360
Alignment:
Q  15 tcagttttgttttac-attagagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatg 113  Q
    |||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||  |    
T  20531586 tcagttgtgttttactattaggtttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtacgaacaaatggaacattctga-gatcagaat--g 20531490  T
Q  114 ttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctg 213  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  20531489 ttcacttctgcacatgcttccagccatgaacagtgtagttggtggaaagatgaaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtcctcta 20531390  T
Q  214 atttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  20531389 atttgaataaagcaaatctccttgaagcat 20531360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 13674069 - 13674272
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  13674069 ttgattacattaaaagttaagtcttataaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 13674165  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  13674166 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 13674265  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  13674266 gaagcat 13674272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31999484 - 31999282
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  31999484 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctg-agatcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 31999388  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  31999387 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatcgaaaagctag-caaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 31999289  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  31999288 gaagcat 31999282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33774375 - 33774172
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  33774375 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 33774279  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||| |||    
T  33774278 ccatgaacagtgtaattagtggaaagatggaaaagctagcagaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactcttatatgaatcaagcaaatctcctt 33774179  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  33774178 gaagcat 33774172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14881931 - 14881729
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  14881931 ttgattacattaaaagttaagtcttataaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctg-agatcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 14881835  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| || |||||| |||    
T  14881834 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctag-caaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatccagcaaatctcctt 14881736  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  14881735 gaagcat 14881729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14894281 - 14894079
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  14894281 ttgattacattaaaagttaagtcttataaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctg-agatcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 14894185  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| || |||||| |||    
T  14894184 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctag-caaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatccagcaaatctcctt 14894086  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  14894085 gaagcat 14894079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23015245 - 23015043
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||     
T  23015245 ttgattacatcaaaagt--agtcttacaaatcatcctaaagtaagagcaaatgaaacattctgatggtcagaat--gttcacttttgcacatgcttccag 23015150  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    | ||||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||||| |||||| |||    
T  23015149 ctatgaatagtgtagttggtagaaagaagaaaaagatagcaaagggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgaataaaatcaagcaaatctcctt 23015050  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  23015049 gaagcat 23015043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 5759198 - 5759367
Alignment:
Q  15 tcagttttgttttac-attagagttgatt-acattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatat 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||    
T  5759198 tcagttgtgttttactattagagttgatttacatcaaaagttaagtcttgcaaattaacctaaagtaagaacaaatggaacattctgaaggtcaga--at 5759295  T
Q  113 gttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgc 191  Q
    |||||||| |||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5759296 gttcatttctgcacatgcttcc-------aacagtgtagttggtggaaagatgaaaaagctagcaaaaggagatcttgc 5759367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11430900 - 11430699
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || | || |||||||||  ||||| |  ||||||||||||||     
T  11430900 ttgattacatcaaaagt--agtcttacaaatcatcctaaagtaagatcaaatgaaaaatct-gatggtcagaat--gttcactcctgcacatgcttccag 11430806  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||    |||| ||||||||| ||     
T  11430805 ctatgaacagtgtagttggtagaaagaagaaaaaggtagcaaaaggagatcttgcataagagataacttgtactctgaacaaaatctagaaaatctccta 11430706  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  11430705 gaagcat 11430699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 27988330 - 27988533
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  27988330 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattct-aagatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 27988426  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  27988427 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgatatgaatcaagcaaatctcctt 27988526  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  27988527 gaagcat 27988533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 45553012 - 45553214
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  45553012 ttgattacattaaaagttaagtcttataaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctg-agatcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 45553108  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  45553109 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctag-caaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgatatgaatcaagcaaatctcctt 45553207  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  45553208 gaagcat 45553214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 19585591 - 19585793
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  19585591 ttgattacattaaaagttaagtcataaaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctg-agattaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 19585687  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  19585688 ccatg-atagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtactctgatgtgaatcaagcaaatctcctt 19585786  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  19585787 gaagcat 19585793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24541067 - 24540864
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  24541067 ttgattacattaaaagttaagtcttataaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattatga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 24540971  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| ||||||  ||    
T  24540970 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagttagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgaacaaaatcaagcaaatctcttt 24540871  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  24540870 gaagcat 24540864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 56 - 243
Target Start/End: Original strand, 10415538 - 10415723
Alignment:
Q  56 agtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttgg 155  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||    
T  10415538 agtcttacaaatcatcctaaaggaagagcaaatgaaacattctgatggtcagaat--gttcacttctgcacatgcttccagctatgaacagtgtagtagg 10415635  T
Q  156 tggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |  ||||||| |||||| || |||||||    
T  10415636 tagaaagaagaaaaaggtagcaaaaggagatcttgcatcagagataacatgtactctgaataaaatcaagcaaatctcctagaagcat 10415723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 162
Target Start/End: Original strand, 12769954 - 12770058
Alignment:
Q  55 aagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttg 154  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| | | |||||||||  |||||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  12769954 aagtcttacaaatcatcttaa-gtaagaacaaatggaacattctaatggtcagaat--gttcatctctgcacatgcttcatactatgaacaatgtagttg 12770050  T
Q  155 gtggaaag 162  Q
    | ||||||    
T  12770051 gaggaaag 12770058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13680 - 13477
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  13680 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 13584  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  13583 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 13484  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  13483 gaagcat 13477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 112021 - 111818
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  112021 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 111925  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  111924 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 111825  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  111824 gaagcat 111818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 16629348 - 16629551
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  16629348 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 16629444  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  16629445 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 16629544  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  16629545 gaagcat 16629551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7846997 - 7846792
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagtt-aagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttcca 135  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  7846997 ttgattacattaaaaatttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctgaagatcagaat--gttcacttctgcacatgcttcca 7846900  T
Q  136 accatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctact 235  Q
     ||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | |||| ||    
T  7846899 gccatgaacagtatagttggtggaaagttggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgatatgaatcaagcatatctcct 7846800  T
Q  236 tgaagcat 243  Q
    ||||||||    
T  7846799 tgaagcat 7846792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16211437 - 16211210
Alignment:
Q  15 tcagttttgttttac-attagagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatg 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||  |    
T  16211437 tcagttgtgttttactattagagttgattacatcaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatagaacattctgatggtcagaat--g 16211340  T
Q  114 ttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctg 213  Q
    |||| |  |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  16211339 ttcactcctgcacatgcttccagctatgaacagtgtagttggtggaaagatgaaaaaggtagcaaaaggagatcttgcatcagagataacttgtactctg 16211240  T
Q  214 atttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    |    ||||||| |||||| || |||||||    
T  16211239 aacaaaatcaagcaaatctcctagaagcat 16211210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17828740 - 17828568
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  17828740 ttgattacattaaaagttaagtcttataaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 17828644  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctct 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17828643 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactct 17828568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17838131 - 17837959
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  17838131 ttgattacattaaaagttaagtcttataaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 17838035  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctct 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17838034 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactct 17837959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 207
Target Start/End: Original strand, 44888572 - 44888738
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  44888572 ttgattacatcaaaagtc--gtcttacaaatcatcataaagtaagagcaaatgaaacattctgatggtcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 44888667  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgt 207  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44888668 ctatgaacagtgtagttggtagaaagaagaaaaaggtagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgt 44888738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 53946528 - 53946367
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||  ||||| |  |||||||||||| ||    
T  53946528 ttgattacatcaaaagt--agtcctacaaatcatcctaaagtaagatcaaatgaaacattctgatgatcagaat--gttcactcctgcacatgcttctaa 53946433  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataa 202  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  53946432 ctatgaacagtgtagttggtagaaagaagaaaaagttagcaaaaggagatcttgcatcagatataa 53946367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 214
Target Start/End: Original strand, 2829395 - 2829551
Alignment:
Q  56 agtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttgg 155  Q
    |||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  2829395 agtcttacaaatcatcttaaagtaaaagcaaatgaaacattttgatggtcaga--attttcatctttgcacatgcttttaactatgaacaatgtagttgg 2829492  T
Q  156 tggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctga 214  Q
    || |||| |   |||   || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2829493 tgaaaagttagcaaacaaagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctga 2829551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 243
Target Start/End: Original strand, 16396756 - 16396941
Alignment:
Q  56 agtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttgg 155  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| | | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  16396756 agtcttacaaatcatcctaaagtaagagcaaatgaaacattctgatggtcaga--atgttcatctctacacatgcttctaactatgaatagtgtagttgg 16396853  T
Q  156 tggaaagatgaaaaagc-tagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    || |||| | |  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    |||||||||||| | || |||||||    
T  16396854 tgaaaag-ttagcaagcaaagcaaaaggagatcttgcatcagagataacttgtactctgaacaaaatcaagaaaatttcctagaagcat 16396941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1096 - 893
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  1096 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaatattct-aagatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 1000  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||| | |    
T  999 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataaagtgtactctgatatgaatcaagcaaatctccat 900  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  899 gaagcat 893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19828478 - 19828275
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  19828478 ttgattacattaaaagttaagtctttcaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 19828382  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  19828381 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatcaaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 19828282  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  19828281 gaagcat 19828275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20745310 - 20745108
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  20745310 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctg-agatcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 20745214  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  20745213 ccatgaacagtatagttggtggaaagatggaaaagctag-caaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 20745115  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  20745114 gaagcat 20745108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4783215 - 4783012
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  4783215 ttgattacattaaaagttaagtcttataaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattatg-agatcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 4783119  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagat-gaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctact 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||| |||||| ||    
T  4783118 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaaagctag-caaaggagatcttgcatcagagataacctgtactctgagatgaatcaagcaaatctcct 4783020  T
Q  236 tgaagcat 243  Q
    ||||||||    
T  4783019 tgaagcat 4783012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2489806 - 2489603
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || |||||||||||| |     
T  2489806 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttctag 2489710  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    ||||||| |||||| |||    
T  2489709 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaaactagcaaaaggagatcttgcatcagagataacatgtactctgaacaaaatcaagcaaatctcctt 2489610  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  2489609 gaagcat 2489603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13120205 - 13120002
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  13120205 ttgattacattaaaagttaagtcttacagatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 13120109  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    ||||||| |||||| |||    
T  13120108 ccatgaacggtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacatgtactctgaacaaaatcaagcaaatctcctt 13120009  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  13120008 gaagcat 13120002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13113093 - 13112890
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  13113093 ttgattacattagaagttaagtcttatagatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 13112997  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    ||||||| |||||| |||    
T  13112996 ccatgaacaatgtagttggtgggaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacatgtactctgaacaaaatcaagcaaatcttctt 13112897  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  13112896 gaagcat 13112890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 117 - 243
Target Start/End: Original strand, 20292928 - 20293054
Alignment:
Q  117 atttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatt 216  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  20292928 atttctgcacatgcttccagccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagcaaaaggggatcttgcatcagagataacgtgtcctctaatt 20293027  T
Q  217 tgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20293028 tgaatcaagcaaatctccttgaagcat 20293054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 164
Target Start/End: Original strand, 18560802 - 18560926
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  18560802 ttgattacattaaaagttaagtctttcaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctg-agatcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 18560898  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagat 164  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18560899 ccatgaacagtgtagttggtggaaagat 18560926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 51979000 - 51978838
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgctt-cca 135  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| |  |||||||| || |||    
T  51979000 ttgattacatcaaaagt--agtcttgcaaatcatcctaaagtaagagcaaatgaaacattctgatggtcagaatat--tcactcatgcacatgttttcca 51978905  T
Q  136 accatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataa 202  Q
     | ||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51978904 gctatgaacagtgtagttggtagaaagaagaaaaatgtagcaaaaggagatcttgcatcagagataa 51978838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 154
Target Start/End: Original strand, 12376368 - 12376482
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||    
T  12376368 ttgattacatcaaaagt-aagtcttacaaatcatcctaaagtaagaacaaaaggaacattctgaaggtcaga--atgttcatctttgcacatgcttttaa 12376464  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttg 154  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  12376465 ctatgaacagtgtagttg 12376482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20318288 - 20318085
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  20318288 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattct-aagatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 20318192  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  20318191 ccatgaacagtgtagttggtggaaaaatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 20318092  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  20318091 gaagcat 20318085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 20308685 - 20308887
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  20308685 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctgaa-atcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 20308781  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  20308782 ccatgaacagtgtagttggtgaaaagatggaaaagctag-caaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgatatgaatcaagcaaatctcttt 20308880  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  20308881 gaagcat 20308887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26193684 - 26193481
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||  ||||| || |||||||| |||||     
T  26193684 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctgaaa-tcagaat--gttcacttctgcacatgtttccag 26193588  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||||| |||    
T  26193587 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgaacaaaatcaagcaaatctcctt 26193488  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  26193487 gaagcat 26193481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 27065904 - 27066107
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  27065904 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctg-atatcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 27066000  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  27066001 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctagcaaaaggagatcttgcgtcagagataacgtgtactctgagatgaatcaagcaaatctcctt 27066100  T
Q  237 gaagcat 243  Q
     ||||||    
T  27066101 taagcat 27066107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20328612 - 20328428
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  20328612 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 20328516  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaa 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  20328515 ccatgaacagtgtagttggtggaaaaatggaaaagctagcaaaaggagatcatgcatcagagataacgtgtactctgagatgaatcaa 20328428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 214
Target Start/End: Original strand, 22960708 - 22960882
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||  ||| || | ||||||||||||||     
T  22960708 ttgattacattaaaagt-aagtcttacaaatcatcctaaagtaagaacaaaaggaacattctgatggtcagaat--gttaatctctgcacatgcttccag 22960804  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctga 214  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22960805 ctatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaaggtagaaaaaggagatcttgcatcagagataacttgtcctctga 22960882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 37011820 - 37012022
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||     
T  37011820 ttgattacatcaaaagt--agtcttacaaatcatcctaaagtaagagcaaatgaaacattctgatggtcagaat--gttcacttctgcacatgcttccag 37011915  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||||| ||     
T  37011916 ctatgaacagtgtagttggtagaaagaagaaaaaggtagcaaaaggagatattgcatcagagataacgtgtactctgaacaaaatcaagcaaatctccta 37012015  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  37012016 gaagcat 37012022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25823693 - 25823532
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||| ||||||||||     
T  25823693 ttgattacatcaaaagt--agtcttacaaatcatcctaaagtaagagcaaatgaaacattctgatggtcagaat--gttcatctatgcgcatgcttccag 25823598  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataa 202  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25823597 ctatgaacagtgtagttggtggaaagatgaaaaaggtagcaaaaggagatcatgcatcagagataa 25823532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18097183 - 18097025
Alignment:
Q  30 attagagttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatg 129  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| | | |||||||||  |||||| ||||||||||    
T  18097183 attagaattgactacatcaaaagt-aagtcttacaaatcatcctaaagtaagaacaaaaggaacattctaatggtcagaat--gttcatctttgcacatg 18097087  T
Q  130 cttccaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgc 191  Q
    |||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18097086 cttccagctatgaatagtgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaagagatcttgc 18097025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 49333163 - 49333324
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| |  ||||||| ||||||     
T  49333163 ttgattacatcaaaagt--agtcttacaaatcattctaaagtaagatcaaatgaaacattctgatggtcagaat--gttcactcctgcacatccttccag 49333258  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataa 202  Q
    | |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  49333259 ctatgaacaatgtagttgatagaaagaagaaaaaggtagcaaaaggagatcttacatcagagataa 49333324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Original strand, 20314369 - 20314472
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  20314369 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaacgtaagaacaaatggaacattctg-agatcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 20314465  T
Q  137 ccatgaa 143  Q
    |||||||    
T  20314466 ccatgaa 20314472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21821677 - 21821555
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||  |||||||| | |||||||||||| ||    
T  21821677 ttgattacaacaaaagt-aagtcttacaaatcatcctaaagtaagaaaaaaaggaacattctgaaggttaga--atgttcatctctgcacatgcttctaa 21821581  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaag 162  Q
    | |||| || ||||||||||| ||||    
T  21821580 ctatgagcactgtagttggtgaaaag 21821555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25039617 - 25039455
Alignment:
Q  79 aagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctaga-a 177  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| |||| | |  |||| | | |    
T  25039617 aagaacaaatggaacattctgaatgtcagaat--gttcactcttgcacatgcttccagctacgaacagtgtagttggtgaaaag-ttagcaagcaaaaca 25039521  T
Q  178 aaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    ||||||| |||||| || |||||||    
T  25039520 aaaggagatcttgcatcagagataacttgtactctgaacaaaatcaagcaaatctcctagaagcat 25039455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 162
Target Start/End: Original strand, 21782530 - 21782654
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatga--aacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttcc 134  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||  |  |||||| |||||||||||||  |||||| | |||| | |||||     
T  21782530 ttgattacatcaaaagt-aagtctcacaaatcattctaaagtaagaaaaaaaaaggaacattctgaaggtcagaat--gttcatctctgcataagcttct 21782626  T
Q  135 aaccatgaacaatgtagttggtggaaag 162  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  21782627 aactatgagcaatgtagttggtgaaaag 21782654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1705 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1705
Description:

Target: scaffold1705; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Original strand, 688 - 891
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||  ||||| || | ||||||||||||     
T  688 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaggaacaaatggaacattctga-gatcagaat--gttcacttctacacatgcttccag 784  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctactt 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    ||||||| |||||| |||    
T  785 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagatagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgaacaaaatcaagcaaatctcctt 884  T
Q  237 gaagcat 243  Q
    |||||||    
T  885 gaagcat 891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24059 - 23924
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  24059 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatggaacattctg-agatcaga--atgttcacttctgcacatgcttccag 23963  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctag 175  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23962 ccatgaacagtgtagttggtggaaagatggaaaagctag 23924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29399 - 29335
Alignment:
Q  179 aaggagatcttgcatcagagataatgtgtcctctgatttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29399 aaggagatcttgcatcagagataacgtgtactctgatatgaatcaagaaaatctccttgaagcat 29335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2142 - 2010
Alignment:
Q  111 atgttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataatgtgtcct 210  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  2142 atgttcacttctgcacatgcttccagccatgaacagtgtagttggtggaaagatttaaaatctagcaaaaggagatcttgcatcagagataacgtgtact 2043  T
Q  211 ctgatttgaatcaagaaaatctacttgaagcat 243  Q
    ||||| |||||| || |||||| ||||||||||    
T  2042 ctgatatgaatctagcaaatctccttgaagcat 2010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 4156 - 4104
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatg 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatg 4104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 4369 - 4317
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatg 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4369 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatg 4317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1468 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1468
Description:

Target: scaffold1468; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 1144 - 1305
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| |  ||||||| ||||||     
T  1144 ttgattacatcaaaagt--agtcttacaaatcattctaaagtaagatcaaatgaaacattctgatggtcagaat--gttcactcctgcacatccttccag 1239  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaaagctagaaaaaggagatcttgcatcagagataa 202  Q
    | |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1240 ctatgaacaatgtagttgatagaaagaagaaaaaggtagcaaaaggagatcttacatcagagataa 1305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Original strand, 59849 - 59978
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||  ||||| || |  ||||||||||| ||    
T  59849 ttgattacatcaaaagt-aagtcttacaaatcatcctaaagtaagaacaaaatgaacattctgaaggtcaga--atgttgatctccgcacatgcttctaa 59945  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaa 169  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  59946 ctatcaacaatgtagttggtggaaagataaaaa 59978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Original strand, 54469 - 54598
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| | |||||||||  ||||| || |  ||||||||||| ||    
T  54469 ttgattacatcaaaagt-aagtcttacaaatcatcctaaagtaagaacaaaatgaacattctaaaggtcaga--atgttgatctccgcacatgcttctaa 54565  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaa 169  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54566 ctatcaacaatgtagttggtggaaagataaaaa 54598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Original strand, 58421 - 58550
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| | |||||||||  ||||| || |  ||||||||||| ||    
T  58421 ttgattacatcaaaagt-aagtcttacaaatcatcctaaagtaagaacaaaatgaacattctaaaggtcaga--atgttgatctccgcacatgcttctaa 58517  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaagatgaaaa 169  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  58518 ctatcaacaatgtagttggtggaaagataaaaa 58550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 162
Target Start/End: Original strand, 11132 - 11254
Alignment:
Q  37 ttgattacattaaaagttaagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaa 136  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| |||  |||||||| | |||||||||||| ||    
T  11132 ttgattacaacaaaagt-aagtcttacaaatcatcctaaagtaagaaaaaaaggaacattctgaaggttaga--atgttcatctctgcacatgcttctaa 11228  T
Q  137 ccatgaacaatgtagttggtggaaag 162  Q
    | |||| || ||||||||||| ||||    
T  11229 ctatgagcactgtagttggtgaaaag 11254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 162
Target Start/End: Original strand, 15238 - 15342
Alignment:
Q  55 aagtcttacaaatcaacctaaagtaagaacaaatgaaacattttgaaggtcagaatatgttcatttttgcacatgcttccaaccatgaacaatgtagttg 154  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||  || || |||| ||||||||    
T  15238 aagtcttacaaatcattctaa-gtaagaacaaatggaacattctgatggtcagaat--gttcatctttgcacatgcttcatactataaacagtgtagttg 15334  T
Q  155 gtggaaag 162  Q
    ||||||||    
T  15335 gtggaaag 15342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University