View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7233_low_5 (Length: 465)

Name: NF7233_low_5
Description: NF7233
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7233_low_5
NF7233_low_5
[»] scaffold0402 (1 HSPs)
scaffold0402 (17-454)||(6231-6668)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (19-454)||(22289384-22289822)
chr8 (15-454)||(22830245-22830684)
chr8 (15-454)||(21942886-21943325)
chr8 (15-442)||(22368303-22368730)
chr8 (15-442)||(11348389-11348816)
chr8 (19-438)||(21100285-21100703)
chr8 (21-437)||(21825734-21826150)
chr8 (13-442)||(22034962-22035391)
chr8 (185-438)||(19765980-19766236)
chr8 (288-438)||(29333200-29333350)
chr8 (81-442)||(22101057-22101418)
chr8 (243-376)||(21267909-21268042)
chr8 (81-442)||(21380514-21380875)
chr8 (198-442)||(21954617-21954861)
chr8 (313-442)||(17132452-17132581)
chr8 (382-442)||(8313190-8313250)
chr8 (382-442)||(8324283-8324343)
chr8 (18-442)||(16420032-16420456)
chr8 (384-442)||(22097947-22098005)
chr8 (81-168)||(8324557-8324644)
chr8 (21-144)||(25735370-25735493)
chr8 (114-160)||(20000746-20000792)
chr8 (81-166)||(17132220-17132305)
chr8 (15-64)||(20040886-20040935)
chr8 (17-66)||(45562294-45562343)
chr8 (92-144)||(20040806-20040858)
chr8 (16-64)||(21855589-21855637)
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (15-454)||(17386111-17386539)
chr3 (18-438)||(4369020-4369440)
chr3 (18-438)||(20157901-20158321)
chr3 (18-438)||(16654035-16654456)
chr3 (18-438)||(22165779-22166199)
chr3 (27-428)||(10604018-10604419)
chr3 (19-427)||(12423834-12424241)
chr3 (114-438)||(14447010-14447334)
chr3 (18-382)||(18979465-18979829)
chr3 (102-442)||(13693309-13693649)
chr3 (22-437)||(12161540-12161955)
chr3 (221-454)||(3278019-3278252)
chr3 (21-437)||(3340668-3341084)
chr3 (17-229)||(3273077-3273289)
chr3 (21-437)||(13505991-13506406)
chr3 (21-438)||(15643401-15643818)
chr3 (21-438)||(10161663-10162080)
chr3 (21-214)||(11876010-11876203)
chr3 (81-442)||(13137601-13137962)
chr3 (282-442)||(13196861-13197021)
chr3 (198-442)||(15630388-15630632)
chr3 (250-437)||(15945139-15945326)
chr3 (273-442)||(7598969-7599138)
chr3 (273-442)||(12188507-12188676)
chr3 (273-442)||(12194921-12195090)
chr3 (273-442)||(13188849-13189018)
chr3 (373-442)||(10145724-10145793)
chr3 (382-442)||(16374911-16374971)
chr3 (81-168)||(13197135-13197222)
chr3 (15-168)||(12188781-12188934)
chr3 (15-168)||(12195195-12195348)
chr3 (81-168)||(13189123-13189210)
chr3 (81-168)||(15630662-15630749)
chr3 (15-64)||(13090624-13090673)
[»] scaffold0059 (2 HSPs)
scaffold0059 (21-454)||(10510-10929)
scaffold0059 (21-454)||(18511-18930)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (21-454)||(234469-234888)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (15-451)||(8651368-8651804)
chr1 (17-448)||(8948879-8949313)
chr1 (18-438)||(3988427-3988848)
chr1 (15-442)||(19877118-19877545)
chr1 (15-437)||(19783349-19783771)
chr1 (46-427)||(20072391-20072772)
chr1 (18-188)||(22139001-22139171)
chr1 (21-438)||(21800149-21800566)
chr1 (19-440)||(16383739-16384169)
chr1 (348-437)||(20392141-20392230)
chr1 (373-442)||(20236194-20236263)
chr1 (17-64)||(22626844-22626891)
chr1 (94-160)||(21786165-21786231)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (17-442)||(20106621-20107046)
chr7 (15-442)||(15921433-15921859)
chr7 (15-442)||(823973-824400)
chr7 (15-442)||(15064107-15064534)
chr7 (18-438)||(16150978-16151398)
chr7 (15-437)||(16530358-16530783)
chr7 (15-437)||(16634879-16635304)
chr7 (15-437)||(16761252-16761671)
chr7 (243-454)||(48803279-48803490)
chr7 (21-438)||(18594744-18595161)
chr7 (21-438)||(18616523-18616940)
chr7 (21-438)||(13672179-13672596)
chr7 (19-442)||(13656292-13656715)
chr7 (198-442)||(16467047-16467291)
chr7 (77-130)||(12768768-12768821)
chr7 (81-442)||(18286046-18286407)
chr7 (81-442)||(8716285-8716646)
chr7 (18-87)||(15460464-15460533)
chr7 (15-80)||(12760867-12760932)
chr7 (15-160)||(13740767-13740912)
chr7 (382-442)||(14549818-14549878)
chr7 (23-160)||(4311083-4311220)
chr7 (15-160)||(8783811-8783956)
chr7 (18-66)||(11956667-11956715)
chr7 (90-160)||(12565423-12565493)
chr7 (18-176)||(48803557-48803714)
chr7 (15-144)||(23513416-23513545)
chr7 (84-160)||(14223348-14223424)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (15-454)||(18446550-18446990)
chr6 (15-437)||(21561926-21562348)
chr6 (21-438)||(20017715-20018132)
chr6 (21-438)||(22167030-22167447)
chr6 (15-152)||(11218204-11218341)
chr6 (21-428)||(20168555-20168962)
chr6 (273-442)||(18010461-18010630)
chr6 (69-438)||(22768605-22768974)
chr6 (18-442)||(8725433-8725857)
chr6 (15-104)||(22581109-22581198)
chr6 (15-104)||(22583899-22583988)
chr6 (15-104)||(22588730-22588819)
chr6 (382-442)||(24856676-24856736)
chr6 (18-104)||(29684883-29684969)
chr6 (18-163)||(18010225-18010370)
chr6 (91-159)||(19587281-19587349)
chr6 (15-55)||(19589371-19589411)
chr6 (15-64)||(17817865-17817914)
chr6 (15-64)||(18852368-18852417)
chr6 (16-64)||(18189384-18189432)
chr6 (15-66)||(23519566-23519617)
chr6 (92-144)||(18852446-18852498)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (18-438)||(11800-12220)
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (18-438)||(3352938-3353358)
chr4 (18-423)||(15863851-15864256)
chr4 (21-437)||(15261535-15261951)
chr4 (15-325)||(16680711-16681021)
chr4 (21-438)||(13821231-13821648)
chr4 (198-442)||(15252883-15253127)
chr4 (17-160)||(11918419-11918562)
chr4 (15-160)||(45240580-45240725)
chr4 (382-442)||(22109682-22109742)
chr4 (81-168)||(15252766-15252853)
chr4 (21-166)||(12513575-12513720)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (18-438)||(21202-21622)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (16-442)||(7938-8363)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (17-454)||(43788-44216)
scaffold0037 (17-454)||(51177-51605)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (15-442)||(131973-132400)
scaffold0026 (15-144)||(16717-16846)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (21-438)||(20597315-20597732)
chr5 (21-438)||(20603612-20604029)
chr5 (18-438)||(26845986-26846406)
chr5 (21-438)||(20609931-20610348)
chr5 (18-438)||(18071230-18071650)
chr5 (18-454)||(22946777-22947213)
chr5 (25-438)||(20792258-20792671)
chr5 (19-438)||(23520623-23521042)
chr5 (15-437)||(25117622-25118044)
chr5 (15-437)||(25176713-25177135)
chr5 (21-438)||(20439639-20440056)
chr5 (15-325)||(30764692-30765002)
chr5 (21-438)||(24954652-24955069)
chr5 (18-442)||(21386656-21387077)
chr5 (81-442)||(22318916-22319276)
chr5 (243-442)||(23746634-23746833)
chr5 (198-442)||(25008215-25008459)
chr5 (81-442)||(15733955-15734316)
chr5 (382-442)||(20620885-20620945)
chr5 (90-160)||(18487790-18487860)
chr5 (19-144)||(20446581-20446706)
chr5 (15-64)||(21282726-21282775)
chr5 (15-64)||(24218183-24218232)
chr5 (388-420)||(30764599-30764631)
chr5 (81-168)||(23746472-23746559)
chr5 (81-168)||(25008489-25008576)
chr5 (15-64)||(24938889-24938938)
chr5 (84-144)||(24218252-24218312)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (18-438)||(22468-22888)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (18-438)||(23677-24097)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (15-442)||(5035-5462)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (21-438)||(24821559-24821966)
chr2 (238-454)||(25372396-25372612)
chr2 (21-437)||(115854-116270)
chr2 (21-437)||(23160851-23161267)
chr2 (21-437)||(23572108-23572524)
chr2 (21-437)||(27629829-27630245)
chr2 (21-268)||(22870088-22870335)
chr2 (21-438)||(16773979-16774396)
chr2 (22-454)||(24169702-24170134)
chr2 (21-438)||(24796770-24797187)
chr2 (245-442)||(25369017-25369214)
chr2 (18-176)||(25369250-25369408)
chr2 (365-442)||(17867491-17867568)
chr2 (81-442)||(22046092-22046453)
chr2 (81-442)||(25355933-25356294)
chr2 (198-442)||(13046-13290)
chr2 (21-167)||(20306429-20306575)
chr2 (382-442)||(27626316-27626376)
chr2 (92-144)||(24500756-24500808)
chr2 (81-168)||(13308-13395)
chr2 (18-66)||(25372784-25372832)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (18-438)||(121709-122119)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (15-437)||(3517-3939)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (21-438)||(19725-20128)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (21-438)||(19423-19840)
scaffold0004 (123-442)||(253240-253573)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (15-286)||(20234-20505)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (21-356)||(1513-1848)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (18-438)||(465-906)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (15-435)||(25859-26275)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (21-437)||(28831-29247)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (21-437)||(23892-24308)
[»] scaffold1400 (1 HSPs)
scaffold1400 (21-310)||(49-338)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (18-452)||(32975-33409)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (190-438)||(8457-8705)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (264-442)||(1870-2046)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (18-454)||(10887-11323)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (18-454)||(115001-115441)
scaffold0020 (18-454)||(119305-119745)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (18-442)||(39166-39590)
[»] scaffold1879 (1 HSPs)
scaffold1879 (18-454)||(336-773)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (243-454)||(10000-10211)
scaffold0216 (17-168)||(9782-9932)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (81-408)||(4619-4947)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (18-442)||(12396-12820)
[»] scaffold1620 (1 HSPs)
scaffold1620 (198-440)||(423-665)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (312-454)||(54893-55035)
scaffold0091 (19-163)||(54596-54740)
[»] scaffold1756 (1 HSPs)
scaffold1756 (15-118)||(1000-1103)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (19-406)||(41388-41775)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (15-94)||(7835-7914)
scaffold0326 (15-94)||(15737-15816)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (374-456)||(21620-21702)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (373-442)||(4819-4888)
[»] scaffold1571 (1 HSPs)
scaffold1571 (382-442)||(1344-1404)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (81-355)||(32347-32621)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (132-183)||(37500-37551)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (90-160)||(18249-18319)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (272-355)||(50288-50371)
scaffold0080 (81-168)||(50475-50562)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (21-100)||(195735-195814)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (84-145)||(11632-11693)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (15-64)||(12130-12179)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (15-64)||(13260-13309)
scaffold0012 (15-64)||(9151-9200)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (90-160)||(1029-1099)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (15-64)||(14888-14937)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (21-166)||(7187-7332)
[»] scaffold0242 (2 HSPs)
scaffold0242 (18-66)||(15824-15872)
scaffold0242 (18-66)||(24659-24707)


Alignment Details
Target: scaffold0402 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0402
Description:

Target: scaffold0402; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 454
Target Start/End: Original strand, 6231 - 6668
Alignment:
Q  17 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6231 tgtgcttaggtaccttcaaagagtgatggcttgcaccatttggggtaggactgaattgtggaacactaggacagatgagctttttatgttatgggctatg 6330  T
Q  117 cttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggca 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6331 cttaataaccaccccgttaacatttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtctgatggtaaaggagagatagtagtgggtggca 6430  T
Q  217 tcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctat 316  Q
    |||| || |||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  6431 tcatcacctatatagctagccaattgggagtgggtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttaattctat 6530  T
Q  317 gaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtg 416  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6531 gaacttcattaagcatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtggctatattaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtg 6630  T
Q  417 gaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  6631 gaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggt 6668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 19 - 454
Target Start/End: Original strand, 22289384 - 22289822
Alignment:
Q  19 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 118  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22289384 tgcttaggtaccttcaaagagtgatggcttgcaccatttggggtaggactgaattggggaacactaggacatatgagcttttcttgttgtgggctatgct 22289483  T
Q  119 taataacca---ccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 215  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22289484 taataaccaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataagtctgatggtaagggagagatagtagtgggtggt 22289583  T
Q  216 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 315  Q
    ||||| || |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22289584 atcatcacctatatagctaggcaattgagagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctcta 22289683  T
Q  316 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 415  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22289684 tgaacttcattaatcatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctatctcatctcggactaacaccgaggt 22289783  T
Q  416 ggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  22289784 ggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggt 22289822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 454
Target Start/End: Original strand, 22830245 - 22830684
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  22830245 cctgtccttaggtaccttcaaagagttatggctgacaccatttggggtaggactgaattggggaacactaggacagatgagcttttcatgctgtgggcta 22830344  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22830345 tgcttaataaccaccctgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtctgatggtaagggagagatagtagtgggtgg 22830444  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||| ||||||||| | | | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22830445 tatcatcacatatatagcaaggcaattgagagtgagtgagaaccaagggataaacaagattgagggaaacaataagcttaacatagagacccttatctct 22830544  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22830545 atgaacttcattaagcatcgtccacccatgacatatacactcaaactcaatgtgcatattttaattatacttcctaacccatctcggactaataccgagg 22830644  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  22830645 tggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggt 22830684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 21943325 - 21942886
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  21943325 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcacaatttggggtaggattgaattggggaacactagaactgatgaactcttcatgttgtgggcta 21943226  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || || | |||||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||    
T  21943225 tgtttaacaaccaccccgttaacactttcttttccttgcttgattaccttccccatctcggtaataggtctaatggtaggggagagatagtggtaggtgg 21943126  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||| ||||| |||  || | |||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  21943125 tatcatcacatacatagttaggcaattgggagtgggtgaagaccaatggattaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaggcccttatctct 21943026  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
    ||||||||||| || | ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21943025 atgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 21942926  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  21942925 tggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggttcgcaggt 21942886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 442
Target Start/End: Original strand, 22368303 - 22368730
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22368303 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcacaatttggggtaggattgaattggggaacactagaactgatgaactcttcatgttgtgggcta 22368402  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||| | |||||| ||||||| |||| || |||||    
T  22368403 cgcttaacaaccaccccgttaacacttgcttttccttgcttgattacctttcccatctcggtaataggtctaatggtaggggagagttagtggtaggtgg 22368502  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||| ||||| |||  || | ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22368503 tatcatcacatacatagttaggcaattgagagtgggtgaagaccaagggattaacaagattgagggaaaaaataggcttaacatagaggcccttatctct 22368602  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
    |||||||| || || | |   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22368603 atgaactttataaaaccttgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 22368702  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||    
T  22368703 tggaagaaaatttgttgtatgttggtga 22368730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 11348816 - 11348389
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  11348816 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcacaatttggggtaggattgaattggggaacactagaactgatgaactcttcatgttgtgggcta 11348717  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || |  ||||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||    
T  11348716 tgcttaacaaccaccccgttaacacttacttttccatgcttgattacctttcccatctcagtaataggtctaatggtaggggagagatagtggtaggtgg 11348617  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||| ||| | |||  || | |||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11348616 tatcatcacagacatagttaggcaattgggagtgggtgaagaccaatggattaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaggcccttatctct 11348517  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
     |||| ||||| || | ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348516 ttgaaattcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 11348417  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||    
T  11348416 tggaagaaaatttgttgtatgttggtga 11348389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21100703 - 21100285
Alignment:
Q  19 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 118  Q
    ||||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||     
T  21100703 tgcttaggtaccttcaacgagtgatggcttgcactatttggggaagaactgaattgggaaacactaggacggatgaactttttatgctgtgggctatgcc 21100604  T
Q  119 taataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatc 218  Q
    ||| ||||  ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    | ||||||| |||||||| || || ||||||    
T  21100603 taacaaccgtcccgtaaa-acttgcttttatttgcttgattacctttcccatgtaggtactaggtccactagtaagggggagatagtggtaggaggcatc 21100505  T
Q  219 ataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatga 318  Q
    || || || ||| ||| | |||| || || |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  21100504 atcacttacatagctaggcaatttggggttggtgaggaccaaggaattaaaaggattgagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatga 21100405  T
Q  319 acttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 418  Q
    ||||||| || | || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21100404 acttcatcaaacctcgtccacccatgtcctatacactcaagctcaatgtgcctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 21100305  T
Q  419 agaaaatttgctatatgttg 438  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  21100304 agaaaatttgttgtatgttg 21100285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 437
Target Start/End: Original strand, 21825734 - 21826150
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  21825734 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggagtgaattagggaacactaggagtgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 21825833  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| || ||||| ||||| |||||    
T  21825834 acaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatcgtagttggtggtatcat 21825933  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||| |   || || ||| |||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  21825934 aacatacatagctaggcggttcggcgtgagtgaagatcaagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaat 21826033  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| ||    |     ||| |    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21826034 ttcataaaaacccgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 21826133  T
Q  421 aaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||| | ||||||    
T  21826134 aaaatttgttgtatgtt 21826150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22035391 - 22034962
Alignment:
Q  13 aacctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggc 112  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |  | ||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||    
T  22035391 aacctgtacataggtaccttcaaagggttatggcttgcactattaggggaaggactgaactacgaaacactaggaacgatgaactcttcatgttatgggc 22035292  T
Q  113 tatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggt 212  Q
    ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || | |||||||   || ||| |||||| || ||||| |||    
T  22035291 tatgctacacaaccaacccgttaacacttgcttttacttgcttgactacctttcccttataagaaataggtccaatagtaggggagaaatcgtagttggt 22035192  T
Q  213 ggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatct 312  Q
    || | ||||||||| ||| ||| ||| || || ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||| |      
T  22035191 ggtaccataacatacatagctaggaagttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagaaacccttgttg 22035092  T
Q  313 ctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccga 412  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  | ||     | ||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22035091 ctatgaatttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcagctttgcatacctcttttgtttctacttcctaacccatctcgtactaaccccga 22034992  T
Q  413 ggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  22034991 ggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 22034962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 185 - 438
Target Start/End: Original strand, 19765980 - 19766236
Alignment:
Q  185 tgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg---a 281  Q
    |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |     |    
T  19765980 tgatagtaggggagagatagttgtgggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaaaattgagaagaaa 19766079  T
Q  282 aacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatta 381  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  19766080 aaaaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagcctcgtccacccatgtcctacacactcaaactaaatgtgcctattttgattt 19766179  T
Q  382 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19766180 tactttctaacccatctcagactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 19766236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 288 - 438
Target Start/End: Original strand, 29333200 - 29333350
Alignment:
Q  288 aggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttc 387  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  29333200 aggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccatccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatacttt 29333299  T
Q  388 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29333300 ctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 29333350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22101418 - 22101057
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 180  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||   |||||  |     
T  22101418 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgcttctacctacttgattacctttcctccataggtgctc 22101319  T
Q  181 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 280  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  22101318 gacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggg 22101219  T
Q  281 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 380  Q
     |||||||||||||  || || |||||| |  ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||| ||    
T  22101218 caacaataggcttaatattgaaacccttgttactatgaatttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttgttt 22101119  T
Q  381 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  22101118 atacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 22101057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 376
Target Start/End: Original strand, 21267909 - 21268042
Alignment:
Q  243 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21267909 ggagtgggtgaggacaaagggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaacccttatttctatgaatttcattaagcatcatccaccca 21268008  T
Q  343 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgtttt 376  Q
    |||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  21268009 tgacttatgcacttaaactcaacgtgcctctttt 21268042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 21380514 - 21380875
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 180  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||   ||||   ||    
T  21380514 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcctccataggagcta 21380613  T
Q  181 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 280  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||| | ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  21380614 gacttgataatagagctgagatagtagtcggtagtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggg 21380713  T
Q  281 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 380  Q
     |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  ||    
T  21380714 caacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttattt 21380813  T
Q  381 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  21380814 ctacttcctaacccttctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 21380875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 442
Target Start/End: Original strand, 21954617 - 21954861
Alignment:
Q  198 gagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatca 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  |  |||||||    |||| ||| |||||||||||||  |    
T  21954617 gagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagataggataaatccaattgagggcaacaataggcttaata 21954716  T
Q  298 tagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatc 397  Q
    | || || ||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||| || ||| ||||  ||||     | ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  21954717 ttgaaactctttttgctatgaacttcattaagattcacccacccattacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttgtttctacttcctaacccatc 21954816  T
Q  398 tcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  21954817 tcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 21954861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 442
Target Start/End: Original strand, 17132452 - 17132581
Alignment:
Q  313 ctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccga 412  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17132452 ctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatctcggactaaccccga 17132551  T
Q  413 ggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  17132552 ggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 17132581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 382 - 442
Target Start/End: Original strand, 8313190 - 8313250
Alignment:
Q  382 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  8313190 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 8313250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 382 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8324343 - 8324283
Alignment:
Q  382 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  8324343 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 8324283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16420456 - 16420032
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    |||||||| |||||  |||| || ||| |||| ||||||| |||||| || ||| | || |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  16420456 gtgcttagatacctctaaagagtcatggcttgtaccatttagggtagaatagaagtaggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgc 16420357  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    ||  |||| |||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||||||   |||||  |||   ||||  ||  |   ||||||||||| |||| ||    
T  16420356 ttggtaacaaccccgttcatacttgcttctacctacttgattacctttcctccataggtgctagacctgataatagagctaagatagtagtcagtggtat 16420257  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| || |  ||  ||| ||| || |||||| |||| | | |||| |||||    |||| ||| ||||||||| |||  || || |||||  | ||||||    
T  16420256 catcaccttcatcgctaggaagtttggagtgagtgaagccgaaggaataaattcaattgagggcaacaataggtttaatattgaaaccctggtatctatg 16420157  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16420156 aatttcattaagcttcatccatccatgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttatttctgcttcctaacccatcttggactaacaccgaggtgg 16420057  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    | |  |||||| | |||||||||||    
T  16420056 aggcgaatttgttgtatgttggtga 16420032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 384 - 442
Target Start/End: Original strand, 22097947 - 22098005
Alignment:
Q  384 cttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | |||||||||||    
T  22097947 cttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggagaatttgttgtatgttggtga 22098005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8324644 - 8324557
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 168  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||    
T  8324644 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttaataacaaccccgttaatacttgtttctacctacttgactacctttcct 8324557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Original strand, 25735370 - 25735493
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | || |||||  ||| | || |  |  ||||| | |||||| | ||||||||||| |||||||     
T  25735370 cttaggtactttcaaagggttatggcttgcaccatataggataggaaagaagtaggaatgatgaggactgttgagctgtatatgttgtgggttatgcttt 25735469  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgct 144  Q
    |||||||||| ||||||| |||||    
T  25735470 ataaccaccctgttaacatttgct 25735493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 160
Target Start/End: Original strand, 20000746 - 20000792
Alignment:
Q  114 atgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 160  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20000746 atgctttataaccaccacgttaacatttgctattacttgcttgatta 20000792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 166
Target Start/End: Original strand, 17132220 - 17132305
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttc 166  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  17132220 actaggactgatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttc 17132305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 20040935 - 20040886
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 64  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  20040935 cctgtgcttaggtaccttcacacggttattgcttgcaccatatggggtag 20040886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 45562343 - 45562294
Alignment:
Q  17 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtagga 66  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  45562343 tgtgtttaggtaccttcaaagggttatggtttgcaccatatagggtagga 45562294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20040858 - 20040806
Alignment:
Q  92 tgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgct 144  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  20040858 tgagctatttttgttgtgggctatgctttataaccaccatgttaacatttgct 20040806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 21855637 - 21855589
Alignment:
Q  16 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 64  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  21855637 ctgtgcttaggtaccttcacacggttattgcttgcaccatatggggtag 21855589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 454
Target Start/End: Original strand, 17386111 - 17386539
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||    
T  17386111 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatttgaggtaggactgaattggggaacactaggacatacgagctcttcatgttatgggcta 17386210  T
Q  115 tgcttaataaccacccc-gttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtg 213  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||            ||||||    
T  17386211 tgcttaacaaccacccctgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaaaaggtctgatggtaagg------------tcggtg 17386298  T
Q  214 gcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctc 313  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17386299 gcatcataacatatatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctc 17386398  T
Q  314 tatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgag 413  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17386399 tatgaacttcattaagcatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgag 17386498  T
Q  414 gtggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17386499 gtggaagaaaaattaatatatgttggtgaaggttcacaggt 17386539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 4369020 - 4369440
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  4369020 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 4369119  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  4369120 ttaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtcgataataggtttgatagtaggggagagatagttgtgggtggtat 4369219  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  4369220 catcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaacattgagggaatcaataggctttacatagagacccttatctttatg 4369319  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4369320 aacttcattaagccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcttattttaattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 4369419  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  4369420 aagaaaatttgttgtatgttg 4369440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20158321 - 20157901
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  20158321 gtgcatagttaccttcaaagggctatggcttgcactatttggggtatgactgaattggggaacactagggccgatgaactcttcatgttgtgggccatgc 20158222  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  20158221 ttaacaaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattaccttttccatgtcggtaataggtcagatggtaggggagagatagttgtgggtggtat 20158122  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20158121 catcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatg 20158022  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    ||||| ||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20158021 aactttattaagcactgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttatttgtacttcctaacccatcttggactaacaccgaggtga 20157922  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  20157921 aagaaaatttgttgtatgttg 20157901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 16654035 - 16654456
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  16654035 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggatcgaattgtgtaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 16654134  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  16654135 ttaacaaccacccggttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtcggtaataggtttgatagtaggggagagatagttgtgggtggtat 16654234  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16654235 catcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattactaaatttgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatg 16654334  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactc-aaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtg 416  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16654335 aacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtg 16654434  T
Q  417 gaagaaaatttgctatatgttg 438  Q
     ||||||||||| | |||||||    
T  16654435 taagaaaatttgttgtatgttg 16654456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22166199 - 22165779
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  22166199 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattgaggaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 22166100  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  22166099 ttaacaaccacctcgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgacggtaataggtttgatagtacgggagagatagttgtgggtggtat 22166000  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |  || |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22165999 catcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaatggattaccaaaattgaggaaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatg 22165900  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165899 aacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattataccttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 22165800  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  22165799 aagaaaatttgttgtatgttg 22165779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 27 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10604419 - 10604018
Alignment:
Q  27 taccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataacc 126  Q
    ||||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||    
T  10604419 taccttcaaaaagtaatgactggcactatttggggtaggaccgaagtggggaacactaggaaggatgaactcttcatgtcgtgggccatgcttaacaacc 10604320  T
Q  127 accccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacata 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  10604319 accccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgatggtaataggtttgatagtaggggagagatagttgtgggtggtatcatcacata 10604220  T
Q  227 tataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcatt 326  Q
     ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10604219 catagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattacaaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcatt 10604120  T
Q  327 aagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatt 426  Q
    ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10604119 aagccccatccacccatgtcctacacactcaaactcattgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatt 10604020  T
Q  427 tg 428  Q
    ||    
T  10604019 tg 10604018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12424241 - 12423834
Alignment:
Q  19 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 118  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  12424241 tgcttaggtgccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattgtggaacactaggatggatgaactcttcatgtcgtgggccatgct 12424142  T
Q  119 taataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatc 218  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||  || ||||| |||    
T  12424141 taacgaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttaattacctttcccatgtcggtaataggtctgatagta-gggagagataggtgtgggtggtatc 12424043  T
Q  219 ataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatga 318  Q
    || ||||| |||  || | |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12424042 atcacatacatagataggcaattgggagtgggtgaggaccacgggattaacaacattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatga 12423943  T
Q  319 acttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 418  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12423942 acttcattaagccccgtccacccatgtcctacacattcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacacatctcggactaacaccgaggtgga 12423843  T
Q  419 agaaaattt 427  Q
    |||||||||    
T  12423842 agaaaattt 12423834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 114 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14447334 - 14447010
Alignment:
Q  114 atgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtg 213  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||  |||||||||||| || ||||    
T  14447334 atgctcaacaaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcccatgtaggtaataggtctgacagttggggagagatagttgtgggtg 14447235  T
Q  214 gcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctc 313  Q
    | || || ||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14447234 gtattatcacatacatagctaggcaattgggggtgggtgaggaccaagggataaacaaaattgagggtaacaatagacttaacatagagacccttatctc 14447135  T
Q  314 tatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgag 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14447134 tatgaacttcattaagcatcatccacccatgtcctacacactcaaactcgatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgag 14447035  T
Q  414 gtggaagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||||||||||||| | |||||||    
T  14447034 gtggaagaaaatttgttgtatgttg 14447010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 18979829 - 18979465
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  18979829 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgtcttgggccatgc 18979730  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  18979729 ttaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtctgtaataggtttgatagtatgggagagatagttgtgggtggtat 18979630  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| ||||| ||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18979629 catcacatacatagctaggcaattgcgagttggtgaggaccaagggattaacaaaattgagggaaacaatagggttaacatagagacccttatctttatg 18979530  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattat 382  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18979529 aacttcattaagccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattat 18979465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 102 - 442
Target Start/End: Original strand, 13693309 - 13693649
Alignment:
Q  102 atgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagaga 201  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13693309 atgttgtgggccatgctaaacaaccaccccgttaatacttgcttttacatgcttgactacctttcccatgtaggtaataggtctgatggtaggggagaga 13693408  T
Q  202 tagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcataga 301  Q
    |||| || ||||| ||||||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||||||||| ||||||    
T  13693409 tagttgtaggtggtatcataatatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggatcaacaagattgaggggaataataggcttaacataga 13693508  T
Q  302 gacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcgg 401  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13693509 gatccttgtctctatgaacttcattaaacctcgaccacccatgacttatacactcaagctcaacgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcag 13693608  T
Q  402 actaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  13693609 actaacaccgaggtggatgaaaatttgttgtatgttggtga 13693649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12161955 - 12161540
Alignment:
Q  22 ttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||  |    
T  12161955 ttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactattttgggaaggagtgaattagggaacactaggagcgatgaactcttcatgttatgggctatgctgca 12161856  T
Q  122 taaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcata 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  12161855 caaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatggtaagggagaaatagtagttggtggtatcatc 12161756  T
Q  222 acatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaact 321  Q
    ||||| ||| ||  |  | | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |    
T  12161755 acatacatagctgggctactaggagtgagtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggttaaacatagagacccttatctctatgaatt 12161656  T
Q  322 tcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaaga 421  Q
    |||| || | ||  |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12161655 tcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgatcttactgccttacccatctcggactaacaccgaggtggaaga 12161556  T
Q  422 aaatttgctatatgtt 437  Q
    ||||||| | ||||||    
T  12161555 aaatttgttgtatgtt 12161540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 221 - 454
Target Start/End: Original strand, 3278019 - 3278252
Alignment:
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||||  ||| | |||||||||||| || ||||||||     
T  3278019 aacatatatagctaggcaattgggagtgggtgagaaccaagggataaacatgatcgagggaaacaatttgctaaacatagagaccctcatttctatgaat 3278118  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3278119 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctcttttatttatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 3278218  T
Q  421 aaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  3278219 aaaatttgatgtatgttggtgatggttcacaggt 3278252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3341084 - 3340668
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  3341084 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggagtgaattagggaacactaggagtgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 3340985  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  3340984 acaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 3340885  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||| |   || || ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  3340884 aacatacatagctaggcggttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaat 3340785  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| || | ||     ||| |    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3340784 ttcataaaacctcgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 3340685  T
Q  421 aaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||| | ||||||    
T  3340684 aaaatttgttgtatgtt 3340668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 3273077 - 3273289
Alignment:
Q  17 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatg 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  3273077 tgtgcttaggtatcttcaaagggttatggcttgcaccatctggggtaggactgagttaggaaacactaggacatatgagcttttcatgttgtgggctatg 3273176  T
Q  117 cttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggca 216  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  3273177 cttaataaccatcatgtgaacacttgcttctactatcttgattatcttgcctatgtaggtaataggtctgacagtaagggagagatagtagtaggtggta 3273276  T
Q  217 tcataacatatat 229  Q
    |||| ||||||||    
T  3273277 tcatcacatatat 3273289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 13506406 - 13505991
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || | ||||   || | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  13506406 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactattaggagaaggacaaaactagggaacactaggaacgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 13506307  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||  |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  13506306 acaacaaccc-gttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtcggggagaaatagtagttggtggtatcat 13506208  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||| |   || || |||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  13506207 aacatacatagctaggcggttaggcgtgattgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagaaacccttatctctatgaat 13506108  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| || |  |     ||| |    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13506107 ttcataaaaccccgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 13506008  T
Q  421 aaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||| | ||||||    
T  13506007 aaaatttgttgtatgtt 13505991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Original strand, 15643401 - 15643818
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||  |||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  15643401 cttaggtaccttcaaagggttatagcttgtaccattaggggacggaaagaattagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 15643500  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15643501 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 15643600  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  15643601 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 15643700  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15643701 ttcatcaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 15643800  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
     ||||||| | |||||||    
T  15643801 caaatttgttgtatgttg 15643818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10162080 - 10161663
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||  |||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| |      
T  10162080 cttaggtaccttcaaagggttatagcttgtaccattaggggacggaaagaattagggaacactaggaatgatgaactcttcatgatttgggctatgttgc 10161981  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  10161980 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 10161881  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  10161880 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatagagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 10161781  T
Q  321 ttcattaagcatc-atccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaa 419  Q
    ||||| ||   || |  | || |||  |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10161780 ttcataaaaactcgagtcccctatg-tctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgcactaacaccgaggtggaa 10161682  T
Q  420 gaaaatttgctatatgttg 438  Q
    | ||||||| | |||||||    
T  10161681 gcaaatttgttgtatgttg 10161663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11876203 - 11876010
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| | |    
T  11876203 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgtaccattaggggacggaaagaattagggaacactaggaatgatgaactcttcatgatttgggctatgttga 11876104  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| |||||    
T  11876103 aaaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtgg 11876010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13137962 - 13137601
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 180  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||   ||||   ||    
T  13137962 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcctccataggagcta 13137863  T
Q  181 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 280  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  || |||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  13137862 gacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcactaggaaatttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggg 13137763  T
Q  281 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 380  Q
     |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  ||    
T  13137762 caacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttattt 13137663  T
Q  381 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  13137662 ctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 13137601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 282 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13197021 - 13196861
Alignment:
Q  282 aacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatta 381  Q
    |||||||||||||  || || |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||| ||     
T  13197021 aacaataggcttaatattgaaacccttgtatctatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttgtttc 13196922  T
Q  382 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  13196921 tgcttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaggcaaatttgttgtatgttggtga 13196861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15630632 - 15630388
Alignment:
Q  198 gagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatca 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | |||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |    
T  15630632 gagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaacacaattgagggcaacaataggcttaata 15630533  T
Q  298 tagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatc 397  Q
    | || |||||| |  | |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || ||||||||||||||||    
T  15630532 ttgaaacccttgttgcgatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatc 15630433  T
Q  398 tcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  15630432 tcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 15630388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 437
Target Start/End: Original strand, 15945139 - 15945326
Alignment:
Q  250 gtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgaccta 349  Q
    |||| ||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||   ||     ||| |    ||    
T  15945139 gtgaagaccaagggctatacaagattgagggaaacaataggctgaacatagaaacccttatctctatgaatttcattaaaactcgaatcccctttgttta 15945238  T
Q  350 tacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 437  Q
    ||| ||||| || ||||| ||| |||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15945239 tacgctcaagcttaatgtacctattttgatattattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 15945326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 442
Target Start/End: Original strand, 7598969 - 7599138
Alignment:
Q  273 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 372  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||| || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||      
T  7598969 attgagggcaacaatagacttaacattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcataccac 7599068  T
Q  373 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  7599069 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 7599138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12188676 - 12188507
Alignment:
Q  273 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 372  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||| || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||   | | ||      
T  12188676 attgagggcaacaatagacttaacattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgtataccac 12188577  T
Q  373 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  12188576 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgtagtatgttggtga 12188507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12195090 - 12194921
Alignment:
Q  273 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 372  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||| || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||   | | ||      
T  12195090 attgagggcaacaatagacttaacattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgtataccac 12194991  T
Q  373 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  12194990 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgtagtatgttggtga 12194921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13189018 - 13188849
Alignment:
Q  273 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 372  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||| || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||      
T  13189018 attgagggcaacaatagacttaacattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcataccac 13188919  T
Q  373 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  13188918 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 13188849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 373 - 442
Target Start/End: Original strand, 10145724 - 10145793
Alignment:
Q  373 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  10145724 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 10145793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16374971 - 16374911
Alignment:
Q  382 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  16374971 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttcttgtatgttggtga 16374911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13197222 - 13197135
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 168  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||| |||| | |||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  13197222 actaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgcttagtaacaacctcgttcatacttgcttctacctacttgattacctttcct 13197135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12188934 - 12188781
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||| |||| || ||||||||||| |  ||| | || |  |||||||| ||||| || |||||| | ||||| |    
T  12188934 cctgtgcttagatacctccagagagtcatggcttgtacaatttggggtagaaaagaagtaggaacaactaggacggatgaactttttatgctttgggcaa 12188835  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 168  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||    
T  12188834 tgcttaataacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgactacctttcct 12188781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12195348 - 12195195
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    ||||||||||| ||||| || || || ||| |||| || ||||||||||| |  ||| | || |  |||||||| ||||| || |||||| | ||||| |    
T  12195348 cctgtgcttagatacctccagagagtcatggcttgtacaatttggggtagaaaagaagtaggaacaactaggacggatgaactttttatgctttgggcaa 12195249  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 168  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||    
T  12195248 tgcttaataacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgactacctttcct 12195195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13189210 - 13189123
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 168  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||    
T  13189210 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttaataacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgactacctttcct 13189123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15630749 - 15630662
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 168  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  15630749 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttatacctacttgattacctttcct 15630662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 13090673 - 13090624
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 64  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  13090673 cctgtgcttaggtaccttcacacggttattgcttgcaccatatggggtag 13090624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 454
Target Start/End: Original strand, 10510 - 10929
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||     
T  10510 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatttggggtaggactgaattggggaacactaggacatatgagcttttcatgttgtgggctatgcttt 10609  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10610 ataaccaccccgttaacacttgctt--------------acctttcctatgtaggtaataggtctgatggtaagggagagatagtagtcggtggtatcat 10695  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
     ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10696 cacatatatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaac 10795  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10796 ttcattaaacatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaacgaggtggaag 10895  T
Q  421 aaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  10896 aaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggt 10929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 454
Target Start/End: Original strand, 18511 - 18930
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||     
T  18511 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatttggggtaggactgaattggggaacactaggacatatgagcttttcatgttgtgggctatgcttt 18610  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18611 ataaccaccccgttaacacttgctt--------------acctttcctatgtaggtaataggtctgatggtaagggagagatagtagtcggtggtatcat 18696  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
     ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18697 cacatatatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaac 18796  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18797 ttcattaaacatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaacgaggtggaag 18896  T
Q  421 aaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  18897 aaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggt 18930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 21 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 234888 - 234469
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||     
T  234888 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatttggggtaggactgaattggggaacactaggacatatgagcttttcatgttgtgggctatgcttt 234789  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  234788 ataaccaccccgttaacacttgctt--------------acctttcctatgtaggtaataggtctgatggtaagggagagatagtagtcggtggtatcat 234703  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
     ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  234702 cacatatatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaac 234603  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  234602 ttcattaaacatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaacgaggtggaag 234503  T
Q  421 aaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  234502 aaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggt 234469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 451
Target Start/End: Original strand, 8651368 - 8651804
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  8651368 cctgtgcttaggtaccttaaaagggttatggcttgcaccatttggggtagtactgaattggggaacactaggacaaatgacctcttaatgttgtgggcta 8651467  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8651468 tgcttaacaaccaccccgttaacacttacttttccatgcttgattacctttcccatgtaggtaataggtctgatggtaagggagatatagtagtaggtgg 8651567  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8651568 tatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctct 8651667  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8651668 atgaacttcattaaacctcgtccccccatggcctatacactcaaattcaatgtgcctattttaattatacttcctaacctatctcggactaacactgagg 8651767  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcaca 451  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  8651768 tggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcaca 8651804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8949313 - 8948879
Alignment:
Q  17 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8949313 tgtgcttaggtaccttcaaaggtttatggcttgcaacatttggggaaggactgaattggggaacactaggacagatgaactctttatgttgtgggctatg 8949214  T
Q  117 cttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggca 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||| |    
T  8949213 cttaacaaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcccatgtaggtaatagttctgatggtaagggagagatagtgataggtggta 8949114  T
Q  217 tcataacatatataactat--gaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaa-aagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctc 313  Q
    |||| ||||| ||| ||||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  8949113 tcatcacatacatagctataggcaattgggagtggatgaagaccaagggataaaacaagattgagggaaacaataagcttaacatagagaccctcatctc 8949014  T
Q  314 tatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgag 413  Q
    ||||||||||||||| | || ||| | |||| | |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8949013 tatgaacttcattaaacctcgtccccacatggcatatacatttaaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgag 8948914  T
Q  414 gtggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttc 448  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  8948913 gttgaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttc 8948879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 3988427 - 3988848
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  3988427 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 3988526  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaa-cacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggca 216  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| |    
T  3988527 ttaacaaccaccccattaaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtcggtaataggtttgatagtaggggagagatagttgtgggtggta 3988626  T
Q  217 tcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctat 316  Q
    |||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  3988627 tcatcacatacctagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaagcaataggcttaacatagagacccttatctttat 3988726  T
Q  317 gaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtg 416  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3988727 gaacttcattaagccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgtctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccaaggtg 3988826  T
Q  417 gaagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||||||| || | |||||||    
T  3988827 gaagaaaatatgttgtatgttg 3988848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19877545 - 19877118
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19877545 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatatggggtaggactgagttgggaaacactaggacatatgagctttttatgttgtgggcta 19877446  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    ||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19877445 tgcttcataaccatcctgtgaacacttgcttttacttgcttgattatcttgcccatgttggtaatagggatgattgtaagggagagatagtagtgggtgg 19877346  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||| || |||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||| ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || |||    
T  19877345 tatcatcacctataaagctaggaaattgggagtggatgagaaccaagggataaaccggattgagggcaacaatatgcttaacataccgaccctcatttct 19877246  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
    |||||||||||| | | ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19877245 atgaacttcattcaacctcatccacctatgaaatatacactcaaactcaatgtgcctcttttatttctactttctaacctatctcggactaacaccgagg 19877146  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  19877145 tggaagaaaacttgttgtatgttggtga 19877118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 437
Target Start/End: Original strand, 19783349 - 19783771
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||  | |||||||    
T  19783349 cctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggactgaattagggaacactaggagtgatgaactcttcatactatgggcta 19783448  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19783449 tgttgcacaaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtctgatggtaagggagaaatagtagttggtgg 19783548  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||| | ||| ||| ||  | || | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  19783549 tatcatcatatacatagctgggcaactaggagtgagtgaggaccaaggtataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctct 19783648  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
    ||||||||||| || | ||  |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19783649 atgaacttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttactttctaacctatctctgactaacaccgagg 19783748  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  19783749 tggaagaaaatttgttgtatgtt 19783771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 46 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20072772 - 20072391
Alignment:
Q  46 cttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgctt 145  Q
    ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  20072772 cttgcactatttgaggtagaaccgaattgggaaacactaggacggatgaaccttttatgttgtgggctatgcttaacaaccatcccgtaaatacttgctt 20072673  T
Q  146 ttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattggga 245  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    |||||||||||||||||  || || |||||||| || || ||| ||| | |||| ||     
T  20072672 ttatttgcttgattacctttcccatgtaggtactaggtcaactggtaagggagagatagaggtaggaggcatcatcacttacatagctaggcaatttggg 20072573  T
Q  246 gtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatga 345  Q
    || |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| || | || ||||||||||     
T  20072572 gttggtgaggaccaaggaattaaaaggattgagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatgaacttcatcaaacctcgtccacccatgt 20072473  T
Q  346 cctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaattt 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072472 cctatacactcaagctcaatgtgcctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaattt 20072391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Original strand, 22139001 - 22139171
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  22139001 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgtcatgggccatgc 22139100  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgat 188  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  22139101 ttaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtcggtaataggtctgat 22139171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21800566 - 21800149
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||  |||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| |      
T  21800566 cttaggtaccttcaaagggttatagcttgtaccattaggggacggaaagaattagggaacactaggaatgatgaactcttcatgatttgggctatgttgc 21800467  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  21800466 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 21800367  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  21800366 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 21800267  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21800266 ttcatcaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 21800167  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
     ||||||| | |||||||    
T  21800166 caaatttgttgtatgttg 21800149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16384169 - 16383739
Alignment:
Q  19 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 118  Q
    |||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||  || || ||    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16384169 tgcttaggtatcttgtaagggttatggcttgcaccatctggggtaggaaagagttaggaccaactaggacagatgagctctttatgctttgggctatgct 16384070  T
Q  119 taataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatc 218  Q
    |||| | || || || ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||| ||||| |||| |||| | ||||| |||||||| || ||||| |||    
T  16384069 taatgatcatcctgtgaacactttcttttacatgcttgattatctttcttctgttggtaagaggtctgatagaaagggtgagatagtggtaggtggtatc 16383970  T
Q  219 ataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatga 318  Q
    || || | |||  ||| ||| || || |||||||||||  |   ||||||  | |||| ||| ||||||||||||   ||||| ||||| ||| ||||||    
T  16383969 atcacttttattgctaggaagtttggtgtgggtgaggaaaacatgataaatcaaattgagggcaacaataggcttgatatagacaccctcatcactatga 16383870  T
Q  319 acttcattaagcatcatccacc------catgacctatacactcaaactcaatgtgcctg---ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacac 409  Q
     ||| ||||||| |||| | ||       |||||||||   || || |||||| ||||||    |||| |||| |||| ||||||| |||| ||| ||||    
T  16383869 cctttattaagcctcattcgccttataatatgacctatgagcttaagctcaatttgcctggatgtttgtttattcttcataacccacctcgaactgacac 16383770  T
Q  410 cgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 440  Q
    || |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16383769 cggggtggaagaaaatttgctttattttggt 16383739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 348 - 437
Target Start/End: Original strand, 20392141 - 20392230
Alignment:
Q  348 tatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 437  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20392141 tatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 20392230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 442
Target Start/End: Original strand, 20236194 - 20236263
Alignment:
Q  373 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  20236194 ttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccaaggtggagaaaaatttgttgtatgttggtga 20236263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22626891 - 22626844
Alignment:
Q  17 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 64  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22626891 tgtgcttaggtaccttgaaagagttttgacttgcaccatatggggtag 22626844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21786231 - 21786165
Alignment:
Q  94 agctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 160  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  21786231 agctgtttatgttgtgggctatgctttataaccatcttattaacatttgctattatttgcttgatta 21786165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 17 - 442
Target Start/End: Original strand, 20106621 - 20107046
Alignment:
Q  17 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatg 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  20106621 tgtgcttaggtaccttcagagggttatggcttgcaccattttgggtaggactgaattgaggaacactaggacagatgaaatcttcatgtcgtgggctatg 20106720  T
Q  117 cttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggca 216  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |    
T  20106721 cttaacaaccaccccattaacacttgcttttacttgcttgattacctttcccatgtaggtaataggtctgatggtaagggagagatggtggtaggtggta 20106820  T
Q  217 tcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctat 316  Q
    |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  20106821 tcatcacatacatagctaggaaattgggagtgggtgaagaccaggggataaacaagattgaggaaaacaataggcttaacatagagactctcatctctat 20106920  T
Q  317 gaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtg 416  Q
    |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20106921 gaacttcattaaacctcgtccccccatgacctatacacttaaactcaatgtgcccgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtg 20107020  T
Q  417 gaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||| | |||||||||||    
T  20107021 gaagaaaatttgttgtatgttggtga 20107046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15921859 - 15921433
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15921859 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcacaatttggggtaggattgaattggggaacactagaactgatgaactcttcatgttgtgggcta 15921760  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| || | |||||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||    
T  15921759 tgcttaacaaccaccccgttaacacttacttttccatgcttgattacctttcccatctcggtaataggtctaatggtaggggagagatagtggtaggtgg 15921660  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||| ||||| |||  || | |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15921659 tatcatcacatacatagttaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggat-aacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctct 15921561  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
     |||||||||| || | ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15921560 ttgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 15921461  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||    
T  15921460 tggaagaaaatttgttgtatgttggtga 15921433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 442
Target Start/End: Original strand, 823973 - 824400
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  823973 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcacaatttggggtaggattgaattggggaacactataactgatgaactcttcatgttatgggcta 824072  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||    
T  824073 cgcttaacaaccaccccattaacacttacttttccttgcttgattacctttcccatctcggtaataggtctaatggtaggggagagatagtggtaggtgg 824172  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||| ||||| |||  || | |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  824173 tatcatcacatacatagttaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggattaacaagattgaggaaaacaataggcttaacatagaggcccttatcttt 824272  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
    ||||||||||| || | ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  824273 atgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 824372  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||    
T  824373 tggaagaaaatttgttttatattggtga 824400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 442
Target Start/End: Original strand, 15064107 - 15064534
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15064107 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcacaatttggggtaggattgaattggggaacactagaactgatgaactcttcatgttgtgggcta 15064206  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || | |||||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||    
T  15064207 tgcttaacaaccaccccgttaacacttacttttccatgcttgattacttttcccatctcggtaataggtctaatggtaggggagagatagtggtaggtgg 15064306  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||| | ||| |||  || | |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15064307 tatcatcatatacatagttaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggattaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaggcccttatctct 15064406  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
     |||||||||| || | ||  ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15064407 ttgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaacccaacgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgagg 15064506  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||    
T  15064507 tggaagaaaatttgttgtatgttggtga 15064534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16151398 - 16150978
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  16151398 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 16151299  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||| ||| || ||||||||| || ||||| ||    
T  16151298 ttaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccgtgacggtaataggtttgatagtagggaagagatagttgtgggtggtat 16151199  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    |||  |||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16151198 catcgcatacatagctaggcaattgagagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatg 16151099  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16151098 aacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactccatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 16150999  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  16150998 aagaaaatttgttgtatgttg 16150978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 437
Target Start/End: Original strand, 16530358 - 16530783
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaa---cactaggacagatgagctctttatgttgtggg 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||   ||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||    
T  16530358 cctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggagtgaattagggaattacactaggagcgatgaactcttcatgctttggg 16530457  T
Q  112 ctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcgg 211  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||    
T  16530458 ctatgctgcacaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttgg 16530557  T
Q  212 tggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatc 311  Q
    ||| ||||||||||| |||  || | || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  16530558 tggtatcataacatacatagttaggcaactaggagtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatc 16530657  T
Q  312 tctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccg 411  Q
    |||||||| ||||| || | ||  |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16530658 tctatgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgatattactgcctaacccatctcagactaacaccg 16530757  T
Q  412 aggtggaagaaaatttgctatatgtt 437  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||    
T  16530758 aggtggaagaaaatttgttgtatgtt 16530783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16635304 - 16634879
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaa---cactaggacagatgagctctttatgttgtggg 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||   ||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||    
T  16635304 cctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggagtgaattagggaattacactaggagcgatgaactcttcatgctttggg 16635205  T
Q  112 ctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcgg 211  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||    
T  16635204 ctatgctgcacaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttgg 16635105  T
Q  212 tggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatc 311  Q
    ||| ||||||||||| |||  || | || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  16635104 tggtatcataacatacatagttaggcaactaggagtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatc 16635005  T
Q  312 tctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccg 411  Q
    |||||||| ||||| || | ||  |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16635004 tctatgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgatattactgcctaacccatctcagactaacaccg 16634905  T
Q  412 aggtggaagaaaatttgctatatgtt 437  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||    
T  16634904 aggtggaagaaaatttgttgtatgtt 16634879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16761671 - 16761252
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  16761671 cctgtacttaggtaccttcaaatggttatggcttgcac---ttggggaaggagtgaattagggaacactaggagcgatgaactcttcatgttttgggcta 16761575  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||  |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| |||||    
T  16761574 tgctgcacaaccaccccgttaacacttgtttttacttacttgactacctttcccatatagtaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtgg 16761475  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||||||||| ||| ||| | || | |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||    
T  16761474 tatcataacatacatagctaggcaactaggagtgagtgaagaccaagagataaacaagattaagggaaacaataggctaaacataaacacccttatctct 16761375  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
    ||||| ||||| || | ||  |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16761374 atgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttactgcctaacccatctcggactaacaccgagg 16761275  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  16761274 tggaagaaaatttgttgtatgtt 16761252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 48803490 - 48803279
Alignment:
Q  243 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 342  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  48803490 ggagtgggtgaggacgaggggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaaccctcatttctatgaatttcattaagcatcgtccaccca 48803391  T
Q  343 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  48803390 tgacttatgcacttaaactcaatgtgcctcttttgtttctacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttggtga 48803291  T
Q  443 aggttcacaggt 454  Q
     |||||||||||    
T  48803290 tggttcacaggt 48803279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18595161 - 18594744
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  18595161 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 18595062  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18595061 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtcagatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 18594962  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  18594961 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 18594862  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18594861 ttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 18594762  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
     ||||||| | |||||||    
T  18594761 caaatttgttgtatgttg 18594744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Original strand, 18616523 - 18616940
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  18616523 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 18616622  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  18616623 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtcagatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 18616722  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  18616723 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 18616822  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18616823 ttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 18616922  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
     ||||||| | |||||||    
T  18616923 caaatttgttgtatgttg 18616940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Original strand, 13672179 - 13672596
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| |      
T  13672179 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgttgc 13672278  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  13672279 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 13672378  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  13672379 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 13672478  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13672479 ttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 13672578  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
     ||||||| | |||||||    
T  13672579 caaatttgttgtatgttg 13672596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Original strand, 13656292 - 13656715
Alignment:
Q  19 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 118  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||| |  ||  | || |  |||||||| ||||| |||||| || | ||||| |||||    
T  13656292 tgcttagatacctccaaagagtcatggcttgtaccatttggggtagaaaagaggtaggaacaactaggacggatgaactctttctgctttgggcaatgct 13656391  T
Q  119 taataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatc 218  Q
    || |||| |||||| | | |||||||| ||| | ||||||||||||||||   |||||  |||   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| |||    
T  13656392 tagtaacaaccccgctcatacttgcttctacctacttgattacctttcctccataggttctagacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatc 13656491  T
Q  219 ataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatga 318  Q
    || || |  ||  ||| ||| || |||||| |||| | | |||| |||||    |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| | |||||||    
T  13656492 atcaccttcatcgctaggaagtttggagtgagtgaagccgaaggaataaatccaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgtatctatga 13656591  T
Q  319 acttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 418  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656592 atttcattaagcttcatccacccatgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttgtttctgcttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 13656691  T
Q  419 agaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
     |  |||||| | |||||||||||    
T  13656692 ggcgaatttgttgtatgttggtga 13656715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 198 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16467291 - 16467047
Alignment:
Q  198 gagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatca 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |  || |||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||  |    
T  16467291 gagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcactaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggcaacaataggcttaata 16467192  T
Q  298 tagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatc 397  Q
    | || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||| || |||||| |||||||||    
T  16467191 ttgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttgtttctacttcgtaacccatc 16467092  T
Q  398 tcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16467091 tcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 16467047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 130
Target Start/End: Original strand, 12768768 - 12768821
Alignment:
Q  77 gaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12768768 gaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccc 12768821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 18286046 - 18286407
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 180  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||   ||||   ||    
T  18286046 actaggacggatgaactttttatggtttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcctccataggagcta 18286145  T
Q  181 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 280  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  18286146 gacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggg 18286245  T
Q  281 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 380  Q
     |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| | ||  ||||     | ||| ||||  ||    
T  18286246 caacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcccttcaacttcgcatacctcttttattt 18286345  T
Q  381 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  18286346 ctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 18286407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 8716285 - 8716646
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 180  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||   ||||   ||    
T  8716285 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcctccataggagcta 8716384  T
Q  181 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 280  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  8716385 gacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggg 8716484  T
Q  281 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 380  Q
     |||||||| ||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||  ||||  ||    
T  8716485 caacaatagacttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcataccacttttattt 8716584  T
Q  381 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  8716585 ctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 8716646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 87
Target Start/End: Original strand, 15460464 - 15460533
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactagga 87  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15460464 gtgcttaggtatcttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactagga 15460533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Original strand, 12760867 - 12760932
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaac 80  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||    
T  12760867 cctgtgcttaagtaccttcaaagggttatgacttgcactatttagagtaggactgaattggggaac 12760932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Original strand, 13740767 - 13740912
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||  | || |  |  ||||| | || ||| |||||| |||||||||    
T  13740767 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatatggggtagaaaagaggtaggaatgatgaggactgttgtgctatttatgatgtgggcta 13740866  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 160  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  13740867 tgctttataaccaccatgttaacatttgctattatttgctttatta 13740912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 382 - 442
Target Start/End: Original strand, 14549818 - 14549878
Alignment:
Q  382 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  14549818 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 14549878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 160
Target Start/End: Original strand, 4311083 - 4311220
Alignment:
Q  23 taggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaat 122  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||  ||  | || |  |  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4311083 taggtaccttcaaagagttatcgcttgcaccatatggggtaggaaagatgtaggaatgatgaggaccaatgagctgtttatgttgtgggctatgctttat 4311182  T
Q  123 aaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 160  Q
    |||||||  ||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  4311183 aaccaccatgttaacatttgttattatttgcttgatta 4311220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8783956 - 8783811
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||  ||  | || |  |  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  8783956 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatataaggtaggaaagaggtaggaataatgaggactgatgagctgtttatcttgtgggcta 8783857  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 160  Q
       || |||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  8783856 caatttataaccaccatgttaacatttgctattatttgcttgatta 8783811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 11956715 - 11956667
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtagga 66  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11956715 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtagga 11956667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Original strand, 12565423 - 12565493
Alignment:
Q  90 gatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 160  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  12565423 gatgagctgtttatgttgtgggctatgctttataaccatcctattaaaatttgctattatttgcttgatta 12565493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 48803714 - 48803557
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||  ||  | || |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  48803714 gtgcttaggtaccttcaaagagtcatg-cttgtaccatttggggtaggaaagaggtaggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgc 48803616  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggt 176  Q
    ||| |||  ||| ||| || ||||| || ||| | |||||||||||| ||| | |||||    
T  48803615 ttagtaataacctcgtgaatacttgtttctacctacttgattaccttgcctctataggt 48803557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 144
Target Start/End: Original strand, 23513416 - 23513545
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| |||||||| |  ||  | || |  |  ||||  | |||||| ||| ||||||||||||    
T  23513416 cctgtgcttaggtaccttcacatggttattgcttgcaccatatggggtagaaaagaggtaggaatgatgaggaatgttgagctatttttgttgtgggcta 23513515  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgct 144  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  23513516 tgctttataaccaccatgttaacatttgct 23513545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14223424 - 14223348
Alignment:
Q  84 aggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 160  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  14223424 aggactgatgagctatttatgttatgagacatgctttataaccaccatgttaacatttgctattatttgcttgatta 14223348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 15 - 454
Target Start/End: Original strand, 18446550 - 18446990
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaa-gggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggct 113  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||    
T  18446550 cctgtgcttaagtaccttcaaaagggttatggcttgcataatttggggtaggattgaattggggaacactagaactgatgaactcttcacgttgtgggct 18446649  T
Q  114 atgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtg 213  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||    
T  18446650 atgcttaacaaccaccccattaacacttgcttttccttgcttgattacctttcccaggtaggtaataggtctgatggtaggggagagatagtggtaggtg 18446749  T
Q  214 gcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctc 313  Q
    | ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18446750 gtatcatcacataaatagctaggaaattgggagtgggtgaagaccaagggatcaacaagattgaggtaaacaataggcttaacatagagacccttatctc 18446849  T
Q  314 tatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgag 413  Q
    |||||||||||| || | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18446850 tatgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacactcaaactcaatgtgcctgttttcattatacttcctaacccatctcgaactaacaccgag 18446949  T
Q  414 gtggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  18446950 gtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcgcaggt 18446990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21562348 - 21561926
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  21562348 cctgtacttaggtacctttaaagggttatggcttgcactatttgcggaaggactgaattagggaacactaggagcgatgaactcttcatgttatgggcta 21562249  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    || |  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21562248 tgttgtacaaccaccccgttaacacttgcttttactttcttgactacctttcccatataggaaataggtctgatggtaagggagaaatagtagttggtgg 21562149  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||| ||||| ||| ||  | || | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||  ||||||| |||    
T  21562148 tatcatcacatacatagctgggcaactaggagtgagtgaggaccaaggaataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacgcccttatttct 21562049  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
    ||||||||||| || | |   |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21562048 atgaacttcataaaaccttgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttacttcctaacccatttcggactaacaccgagg 21561949  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  21561948 tggaagaaaatttgttgtatgtt 21561926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20018132 - 20017715
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  20018132 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 20018033  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  20018032 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 20017933  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  20017932 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 20017833  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20017832 ttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 20017733  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
     ||||||| | |||||||    
T  20017732 caaatttgttgtatgttg 20017715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22167447 - 22167030
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  22167447 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 22167348  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  22167347 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 22167248  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  22167247 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 22167148  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22167147 ttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 22167048  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
     ||||||| | |||||||    
T  22167047 caaatttgttgtatgttg 22167030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 11218204 - 11218341
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  11218204 cctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggattgaattagggaacactaggagcgatgaactcttcatgttatgggcta 11218303  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttg 152  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11218304 tgctgcataaccaccccgttaacacttgcttttacttg 11218341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 428
Target Start/End: Original strand, 20168555 - 20168962
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||  |||  ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| |      
T  20168555 cttaggtaccttcagagggttatagcttgtaccattaggggacggaaagaattagggaacactaggaatgatgaactcttcatgatttgggctatgttgt 20168654  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
      ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  20168655 gcaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 20168754  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
     ||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| || || | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  20168755 cacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaaaatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 20168854  T
Q  321 ttcattaagcatc-atccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaa 419  Q
    ||||| ||   || |  | || |||  |||| ||||| |||| ||||||||  | |||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20168855 ttcataaaaactcgagtcccctatg-tctatgcactccaactaaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccacctcgaactaacaccgaggtggaa 20168953  T
Q  420 gaaaatttg 428  Q
    | |||||||    
T  20168954 gcaaatttg 20168962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 273 - 442
Target Start/End: Original strand, 18010461 - 18010630
Alignment:
Q  273 attgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctg 372  Q
    |||| ||||||||| | ||| | ||| || ||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| | |||     
T  18010461 attgagggaaacaacatgctaaacattgaaaccctcatttctatgaatttcatcaaacttcatccacccatgacttatgcactccaacttaatataccta 18010560  T
Q  373 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18010561 ttttctttctacttcctaacccatctcggactaacaccaaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtga 18010630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22768974 - 22768605
Alignment:
Q  69 gaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 168  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||||||| |  | |||||  || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  22768974 gaattggggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgttgcacaaccaaaccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttccc 22768875  T
Q  169 atgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaa 268  Q
     | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| || || || |||||||| ||| ||  |  ||| || |||  ||| |||| |||||||||    
T  22768874 ttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagtggggggtattataacatacatagctgggcgattcggtgtgaatgaagacctagggataaa 22768775  T
Q  269 aaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtg 368  Q
     ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || ||||||||||| ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||| ||||||    
T  22768774 caagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaatttcataaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactgaatgtg 22768675  T
Q  369 cctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||  | || ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  22768674 cccatcttaattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttg 22768605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8725857 - 8725433
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||| |  ||  | || |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  8725857 gtgcttagatacctccaaagagtcatggcttgtaccatttggggtagaaaagaggtaggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgc 8725758  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    ||| |||| | ||  || | |||||||| ||| | ||||||||||||||||   |||||  |||   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||    
T  8725757 ttagtaacaatcctttttatacttgcttctacctacttgattacctttcctccataggtgctagacctgataatatagctgagatagtagtcggtggtat 8725658  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| || |  || |||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||||    |||| ||| ||||||||| |||  || || |||||| |  |||||    
T  8725657 cattaccttcatcactaggaagtttggagtgggtgaggaagaagggataaatccaattgagggcaacaataggtttaatattgaaacccttgttgctatg 8725558  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    || |||||||||  ||  || |||||||| ||| ||||  || |   | | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8725557 aatttcattaagattctccctcccatgacttatgcacttcaatttcgtttacctcttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtgg 8725458  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    | ||||||||| | |||||||||||    
T  8725457 aggaaaatttgttgtatgttggtga 8725433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22581198 - 22581109
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatg 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22581198 cctgtgcttaggtacctttaaagggttatggtttgcaccatctggggttggactgagttagggaacactgggacagatgagctttttatg 22581109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22583988 - 22583899
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatg 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22583988 cctgtgcttaggtacctttaaagggttatggtttgcaccatctggggttggactgagttagggaacactgggacagatgagctttttatg 22583899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22588819 - 22588730
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatg 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22588819 cctgtgcttaggtacctttaaagggttatggtttgcaccatctggggttggactgagttagggaacactgggacagatgagctttttatg 22588730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 382 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24856736 - 24856676
Alignment:
Q  382 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  24856736 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 24856676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 104
Target Start/End: Original strand, 29684883 - 29684969
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| | |||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  29684883 gtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggtaggaaggaaataggggcaactaggactgatgagctatttatg 29684969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 163
Target Start/End: Original strand, 18010225 - 18010370
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||  | || |  ||||| || ||||| || |||||| | ||||| ||||    
T  18010225 gtgcttaggtacctacaaagggtcatggcttgtaccatttggggtaggaaagacgtaggaacaactagaacggatgaactttttatgctttgggcgatgc 18010324  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacct 163  Q
    ||| |||| ||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  18010325 ttagtaacaaccccgtgaatacttgtttctacttacttgattacct 18010370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19587349 - 19587281
Alignment:
Q  91 atgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatt 159  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  19587349 atgagctgtttatgttgtgggctatgctttataaccaccatgttaaaatttgctattatttgcttgatt 19587281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 19589411 - 19589371
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccat 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19589411 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccat 19589371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 17817865 - 17817914
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 64  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17817865 cctgtgcttaggtaccttcacacggttatggcttgcaccatatggggtag 17817914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 18852368 - 18852417
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 64  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18852368 cctgtgcttaggtaccttcacatggttatggcttgcaccatatggggtag 18852417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18189432 - 18189384
Alignment:
Q  16 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||    
T  18189432 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcataatatggggtag 18189384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 23519617 - 23519566
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtagga 66  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  23519617 cctgtgcttagctaccttcagagggttatggtttgcaccatatggggtagga 23519566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 144
Target Start/End: Original strand, 18852446 - 18852498
Alignment:
Q  92 tgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgct 144  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  18852446 tgagctgtttatgttgtgggttatgctttataaccaccatgttaacatttgct 18852498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 11800 - 12220
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  11800 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 11899  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  11900 ttaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgacggtaataggtttgatagtaggggagagatagttgtgggtggtat 11999  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12000 catcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatg 12099  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12100 aacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 12199  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  12200 aagaaaatttgttgtatgttg 12220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 3352938 - 3353358
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||    
T  3352938 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatggcttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgttgtgggtcatgc 3353037  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  3353038 ttaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttgcttacctttcccatgtcggtaataggtcggatggtaggggagagatagttgtgggtggtat 3353137  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3353138 catcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatg 3353237  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3353238 aacttcattaagccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattgtacttcctaacccatctcgaactaacaccgaggtgg 3353337  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  3353338 aagaaaatttgttgtatgttg 3353358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 423
Target Start/End: Original strand, 15863851 - 15864256
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||    
T  15863851 gtgcttaggtaccttcaacgggttatggcttgcactatttgggggagaattgaattaggaaacactaggacggatgaactattcatgttgtgggccatgc 15863950  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  15863951 ttaacaaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcccatgtaggtaatatgtctgatggtaaggaagagatagttgtgggtggtat 15864050  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| || || ||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15864051 catcacgtacatatctaggcaattgggagtgggtgaggactaagggataaacaaaattgagggtaacaataggcttaacatagagacccttatttctatg 15864150  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15864151 aacttcattaagcatcatacacccatttcctacacactcaaactcaatgtgcctgttttaattgtacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 15864250  T
Q  418 aagaaa 423  Q
    ||||||    
T  15864251 aagaaa 15864256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15261951 - 15261535
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  15261951 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggagtggattagggaacactaggagtgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 15261852  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| || ||||| ||||| |||||    
T  15261851 acaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttaacaacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatcgtagttggtggtatcat 15261752  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||| |   || || ||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||     
T  15261751 aacatacatagctaggcggttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagatcgagggtaacaataggctgaacatagaaaccgttatctctatgaat 15261652  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| ||   ||     ||| |    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15261651 ttcataaaaactcgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 15261552  T
Q  421 aaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||| | ||||||    
T  15261551 aaaatttgttgtatgtt 15261535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Original strand, 16680711 - 16681021
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  |||||  |||| ||| | |||||||    
T  16680711 cctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttttactatttggggaaggagtgaattagggaacactaggagtgatgaaatcttcatgctttgggcta 16680810  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    ||||  | || | ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||| |||||||   || ||| |||||| |||||||| |||||    
T  16680811 tgctgcacaagccccccgttaacacttgtttttacttgcttggctacctttcccatataggaaataggtccaatagtaggggagaaatagtagttggtgg 16680910  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||||||||| ||| ||| | || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  16680911 tatcataacatacatagctaggcaactaggagtgagtgaagaccaagggataaagaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctct 16681010  T
Q  315 atgaacttcat 325  Q
    ||||| |||||    
T  16681011 atgaatttcat 16681021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Original strand, 13821231 - 13821648
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  13821231 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 13821330  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  13821331 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 13821430  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  13821431 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 13821530  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13821531 ttcatcaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 13821630  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
     ||||||| | |||||||    
T  13821631 caaatttgttgtatgttg 13821648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 442
Target Start/End: Original strand, 15252883 - 15253127
Alignment:
Q  198 gagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatca 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |  ||| ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||  |    
T  15252883 gagatagtagtcggtggtatcattaccttcatagctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggtaacaataggcttaata 15252982  T
Q  298 tagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatc 397  Q
    | || || ||| |  | ||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||| || |||||||||| |||||    
T  15252983 ttgaaactcttgttgccatgaatttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttgtttctacttcctaatccatc 15253082  T
Q  398 tcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  15253083 tcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 15253127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11918562 - 11918419
Alignment:
Q  17 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  ||| ||||||  |  ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  11918562 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatatagggtaggaaagaagtggggatgatgaggactgatgaactgtttatgttatgggcaatg 11918463  T
Q  117 cttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 160  Q
    ||  | |||| ||| || ||||||||||  || |||||||||||    
T  11918462 ctctacaaccgccctgtgaacacttgctactatttgcttgatta 11918419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 45240725 - 45240580
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||| |  ||  | || |  |  ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  45240725 cctgtgcttaggtaccttcacacggttatggcttgcaccatatggggtagaaaagaggtaggaatgatgaggactgttgagctgtttatgttgtgggcta 45240626  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 160  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  45240625 tgctttataaccaccatgttaacatttgctattatttgctttatta 45240580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 382 - 442
Target Start/End: Original strand, 22109682 - 22109742
Alignment:
Q  382 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  22109682 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 22109742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Original strand, 15252766 - 15252853
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 168  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  15252766 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcct 15252853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Original strand, 12513575 - 12513720
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    ||||| ||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||   || ||||    |||||  | |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12513575 cttagatacattcaaagttttatggcatgcaccatttggggtaggacgaaagtgggaccgactagagcggatgagttgtttatgttgtgggctatgctta 12513674  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttc 166  Q
    | || | | | || ||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  12513675 acaatctctctgtgaacacctgtttttacttgcttaattatctttc 12513720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 21202 - 21622
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||  ||||| ||||    
T  21202 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggaaggataaactcttcatgtcatgggccatgc 21301  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  21302 ttaacaacaaccccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtcggtaataggtctgatagtaggggagagatagttgtgggtggtat 21401  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21402 catcacatacatagctaggaaattgggagtgggtaaggaccaagggattaacaacattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatg 21501  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21502 aacttcattaagccccatccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacactgaggtgg 21601  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  21602 aagaaaatttgttgtatgttg 21622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8363 - 7938
Alignment:
Q  16 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||    
T  8363 ctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatctagggtaggatcgaattggggaacactaggacaaatgaactcttcatgttgtgggccat 8264  T
Q  116 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 215  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| || |||||     
T  8263 gctaaacaaccaccccgttaatacttgcttttacatgcttgactacctttcccatgtaggtagtaggtctgatggtaggggagagatagttgtaggtggt 8164  T
Q  216 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 315  Q
    ||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| || |||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  8163 atcataacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggatcaacaagattaaggggaataataggcttaacatagagatccttgtctcta 8064  T
Q  316 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 415  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8063 tgaacttcattaaacctcgaccacccatggcttatacactcaaa-tcaacgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagct 7965  T
Q  416 ggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||    
T  7964 ggaagaaaatttgttgtatgttggtga 7938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 454
Target Start/End: Original strand, 43788 - 44216
Alignment:
Q  17 tgtgcttaggtaccttcaaa-gggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  43788 tgtgcttaggtaccttcaaaagggttatggcttgcataatttggggtaggattgaattggggagcactagaactgatgaactcttcatgctgtgggctat 43887  T
Q  116 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 215  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||     
T  43888 gcttaacaaccaccccgtcaacactt----------gcttgattacctttcctatgtaggtaataggtctgatggtaggggagagatagtggtaggtggt 43977  T
Q  216 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 315  Q
    ||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43978 atcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctcta 44077  T
Q  316 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 415  Q
    |||||||||| || | ||  ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44078 tgaacttcataaaacctcgaccacccatggcatatacactaaaaatcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 44177  T
Q  416 ggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  44178 ggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcgcaggt 44216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 454
Target Start/End: Original strand, 51177 - 51605
Alignment:
Q  17 tgtgcttaggtaccttcaaa-gggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctat 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  51177 tgtgcttaggtaccttcaaaagggttatggcttgcataatttggggtaggattgaattggggagcactagaactgatgaactcttcatgctgtgggctat 51276  T
Q  116 gcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggc 215  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||     
T  51277 gcttaacaaccaccccgtcaacactt----------gcttgattacctttcctatgtaggtaataggtctgatggtaggggagagatagtggtaggtggt 51366  T
Q  216 atcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctcta 315  Q
    ||||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51367 atcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctcta 51466  T
Q  316 tgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 415  Q
    |||||||||| || | ||  ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51467 tgaacttcataaaacctcgaccacccatggcatatacactaaaaatcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggt 51566  T
Q  416 ggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||    
T  51567 ggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcgcaggt 51605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 442
Target Start/End: Original strand, 131973 - 132400
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  131973 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcacaatttggggtaggattgaattggggaacactagaactgatgaactcttcatgttgtgggcta 132072  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||    
T  132073 tgcttaacaaccaccccgttaacacatgcttttccttgcttgattacctttcccatctcggtaataggtctaatggtaggggagagatagtggtaggtgg 132172  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||| || || |||  || | ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  132173 tatcatcacgtacatagttaggcaattgagagtgggtgaagaccaagggattaacaagattgagggtaacaataggcttaacatagaggcccttttctct 132272  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
     |||||||||| || | ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132273 ttgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 132372  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||    
T  132373 tggaagaaaatttgttgtatgttggtga 132400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 144
Target Start/End: Original strand, 16717 - 16846
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||  |  | |  |  ||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  16717 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatatggggtagcaaagaggtatgaatgataaggactgttgagccgtttatgttgtgggcta 16816  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgct 144  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  16817 tgctttataaccaccatgttaacatttgct 16846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20597732 - 20597315
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  20597732 cttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattgaggaacactaggatggatgaactcttcatgtcgtgggccatgctta 20597633  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  20597632 acaaccacctcgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgacggtaataggtttgatagtacgggagagatagttgtgggtggtatcat 20597533  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
     ||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20597532 cacatacatagctaggcaattgagagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaac 20597433  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20597432 ttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 20597333  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
    |||||||| | |||||||    
T  20597332 aaaatttgttgtatgttg 20597315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20604029 - 20603612
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  20604029 cttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattgaggaacactaggatggatgaactcttcatgtcgtgggccatgctta 20603930  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  20603929 acaaccacctcgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgacggtaataggtttgatagtacgggagagatagttgtgggtggtatcat 20603830  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
     ||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20603829 cacatacatagctaggcaattgagagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaac 20603730  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20603729 ttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 20603630  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
    |||||||| | |||||||    
T  20603629 aaaatttgttgtatgttg 20603612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 26845986 - 26846406
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  26845986 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtatgaccgaattggggaatactagaacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 26846085  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  26846086 taaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtcagtaataggtctgatagtaggggagagatagttgtgggtggtat 26846185  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26846186 catcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaacattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatg 26846285  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26846286 aacttcattaagccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatcttggaataacaccgaggtgg 26846385  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  26846386 aagaaaatttgttgtatgttg 26846406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20610348 - 20609931
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  20610348 cttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattgaggaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgctta 20610249  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  20610248 acaaccacctcgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgacggtaataggtttgatagtacgggagagatagttgtgggtggtatcat 20610149  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
     ||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20610148 cacatacatagctaggcaattgagagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaac 20610049  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20610048 ttcattaagccctatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatatgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 20609949  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
    |||||||| | |||||||    
T  20609948 aaaatttgttgtatgttg 20609931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 18071230 - 18071650
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  18071230 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattgaggaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 18071329  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  18071330 ttaacaaccacctcgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgacgataataggtttgatagtacgggagagatagttgtgggtggtat 18071429  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| ||||| ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||    
T  18071430 catcacatacatacctaggcaattaggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaccaataggcttaacataaagacccttctctttatg 18071529  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18071530 aacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 18071629  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  18071630 aagaaaatttgttgtatgttg 18071650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 454
Target Start/End: Original strand, 22946777 - 22947213
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  22946777 gtgcataggtaccttaaaagggttatggcttgcaccatctggggtaggactgagttagggaagactaggacagatgagttttttatattgtgggctatgc 22946876  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  22946877 ttaataaccaccctgtgaacacttgctattacttgcttgattatatcgcctatgtatgtaataggtctgacggtaagggagagatagtaatgggtggtat 22946976  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| || |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22946977 catcacctatatagctaggaagttgggagtgggtgaggaccaagggataaatcagattgagggcaacaataggcttaacatagagacccttatttctatg 22947076  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    |||||||| |||| |||||| ||  || | |||  |||||| |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22947077 aacttcatcaagcctcatccgcctgtggcatatgaactcaagctcaatgtgcctcttttatttatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 22947176  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  22947177 aagaaaatttgttgtatgttggtgatggtccacaggt 22947213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 25 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20792671 - 20792258
Alignment:
Q  25 ggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataa 124  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  20792671 ggtaccttcaaaaggtaatgactagcactatttggggtaggaccgaagaggggaacactaggaaggatgaactcttcatgtcgtgggccatgcttaacaa 20792572  T
Q  125 ccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataaca 224  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||   | ||||| ||||| |||    
T  20792571 ccaccccgttaacacatgtttttatttgcttgattacctttcccatgatggtaataggtttgatagtaggggagagatagctatgggtggtatcatcaca 20792472  T
Q  225 tatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttca 324  Q
    || ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20792471 tacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggagtacaaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatgaacttca 20792372  T
Q  325 ttaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaa 424  Q
    ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20792371 ttaagccccatccacccatgtcctacacactcaaactcattgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaa 20792272  T
Q  425 tttgctatatgttg 438  Q
    |||| | |||||||    
T  20792271 tttgttgtatgttg 20792258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23521042 - 23520623
Alignment:
Q  19 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 118  Q
    |||||||| |||||||| | || | | ||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| |  || ||| ||| |||||||||    
T  23521042 tgcttaggcaccttcaacgagtgacggcttgcactatttggggtagaaccgaattgggaaacactaggacggatgaacctttcatgctgtaggctatgct 23520943  T
Q  119 taataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatc 218  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    |||||||||||||||||  || || ||||||    
T  23520942 taacaaccatcccgtaaatacttgcttttatttgcttgattacctttcccatgtaggtactaggtcaactggtaagggagagataggggtaggaggcatc 23520843  T
Q  219 ataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatga 318  Q
    || || || ||| ||| | |||| || || |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  23520842 atcacttacatagctaggcaatttggggttggtgaggaccaaggaattaaaaggattgagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatga 23520743  T
Q  319 acttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 418  Q
    ||||||| || | || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23520742 acttcatcaaacctcgtccacccatgtcctatacactcaagctcaatgtgcctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 23520643  T
Q  419 agaaaatttgctatatgttg 438  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  23520642 agaaaatttgttgtatgttg 23520623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25118044 - 25117622
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||    
T  25118044 cctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgtactatttggggaaggagtgaattagggaacactaggagtgatgaactcttcatgctttgggcta 25117945  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    ||||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| |||||    
T  25117944 tgctgcacaaccaccccgtcaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtgg 25117845  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||||||||| ||| ||| |||| | |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  25117844 tatcataacatacatagctaggaaactaggagtgagtgaagaccaagagataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctct 25117745  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
    ||||| ||||| || | ||     ||| |    ||||||||||||||||| |||||   ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25117744 atgaatttcataaaacctcgaatcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccactttgatattactgcctaacccatctcggactaacaccgagg 25117645  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  25117644 tggaagaaaatttgttgtatgtt 25117622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25177135 - 25176713
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||    
T  25177135 cctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgtactatttggggaaggagtgaattagggaacactaggagtgatgaactcttcatgctttgggcta 25177036  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    ||||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| |||||    
T  25177035 tgctgcacaaccaccccgtcaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtgg 25176936  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||||||||| ||| ||| |||| | |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  25176935 tatcataacatacatagctaggaaactaggagtgagtgaagaccaagagataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctct 25176836  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
    ||||| ||||| || | ||     ||| |    ||||||||||||||||| |||||   ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176835 atgaatttcataaaacctcgaatcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccactttgatattactgcctaacccatctcggactaacaccgagg 25176736  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  25176735 tggaagaaaatttgttgtatgtt 25176713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20440056 - 20439639
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  20440056 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgtactatttggggaaggagtgaattagggaacagtaggagcgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 20439957  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  ||| ||   ||||| |||||||| | ||| |||||    
T  20439956 acaaccaccccgtttacacttgtttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatagtcgaggagaaatagtagttgatggtatcat 20439857  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||| | || | || ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||     
T  20439856 aacatacatagctaggcaactaggcgtgagtgatgaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctctatgaat 20439757  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| || | ||     ||| |    ||||  ||||| || ||||||||   ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20439756 ttcataaaacctcgaatcccctttgtttatatgctcaagcttaatgtgcccactttgatattattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 20439657  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
    |||||||| | |||||||    
T  20439656 aaaatttgttgtatgttg 20439639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 30765002 - 30764692
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| | |||||||||||||  || || ||||| ||||| |||||||    
T  30765002 cctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactattaggggaaggactgaactagggaacactaggaacgacgaactcttcatgttatgggcta 30764903  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| |||||| || ||||| |||||    
T  30764902 tgctgcacaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatagtaggggagaaatcgtagttggtgg 30764803  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||||||||| ||| ||| | || | |||||  |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||    
T  30764802 tatcataacatacatagctaggcaactaggagttagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatagct 30764703  T
Q  315 atgaacttcat 325  Q
    ||||| |||||    
T  30764702 atgaatttcat 30764692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24955069 - 24954652
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  24955069 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 24954970  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  24954969 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 24954870  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  24954869 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 24954770  T
Q  321 ttcat-taagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaa 419  Q
    |||||  || | | |  | ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24954769 ttcatcaaaacttgagtc-ccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaa 24954671  T
Q  420 gaaaatttgctatatgttg 438  Q
    | ||||||| | |||||||    
T  24954670 gcaaatttgttgtatgttg 24954652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 442
Target Start/End: Original strand, 21386656 - 21387077
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||  ||  | || |  |||||||| ||||||||||| ||  | ||||| ||||    
T  21386656 gtgcttaggtaacttcaaagggttatggattgtaccatttgaggtaggaaagaggtaggaacaactaggacggatgagctcttaattctttgggcaatgc 21386755  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    ||| |||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | |||||  ||||   ||   ||  |  |||||||| || ||||| ||    
T  21386756 ttagtaacaaccccattaatacttgtttttacttgcttgattatcttgcctctataggtgctaggcccgacaatagagctgagatagtggtaggtggtat 21386855  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| || |  |   ||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| |||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||    
T  21386856 cattaccttaagtgctaggaagtttggagtgggtgaggacaaagggataaatccaattgagggcaacaatagacttaacattgaaaccctcatttctatg 21386955  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| | |||  ||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  21386956 aacttcattaagcatcgtccgcctatggcatatgaactcaaactcaatgtgcctattttatttctacttcctaacc---cttggactaacaccgaggtgg 21387052  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    ||| ||||||  | |||||||||||    
T  21387053 aagcaaattttttgtatgttggtga 21387077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22319276 - 22318916
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 180  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||  ||    
T  22319276 actaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgcttagtaacaaccccgttcatacttgcttttacctacttgattacctttcctccataggtgcta 22319177  T
Q  181 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 280  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||| ||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  22319176 gacctgataatagagctgagatagtagttggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagaggggataaatccaattgaggg 22319077  T
Q  281 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 380  Q
     |||||||||||||  || || |||||| |  ||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||||  ||||   | | ||| ||||| ||    
T  22319076 caacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaatttcattaagattcacccacc-atgacctatgcacttcaacttcgtatacctcttttgttt 22318978  T
Q  381 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  22318977 ctatttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaggcaaatttgttgtatgttggtga 22318916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 442
Target Start/End: Original strand, 23746634 - 23746833
Alignment:
Q  243 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 342  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  23746634 ggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgttactatgaacttcattaagattcacccaccca 23746733  T
Q  343 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  23746734 tgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 23746833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25008459 - 25008215
Alignment:
Q  198 gagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatca 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| ||  |||||||||||||  |    
T  25008459 gagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggacaacaataggcttaata 25008360  T
Q  298 tagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatc 397  Q
    | || |||||| |  | |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || ||||||||||||||||    
T  25008359 ttgaaacccttgttgcgatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatc 25008260  T
Q  398 tcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  25008259 tcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 25008215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 15733955 - 15734316
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 180  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||   ||||   ||    
T  15733955 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcctccataggagcta 15734054  T
Q  181 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 280  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || |||| |||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  15734055 gacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagcgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggg 15734154  T
Q  281 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 380  Q
     |||||||| ||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||  ||||  ||    
T  15734155 caacaatagacttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcataccacttttattt 15734254  T
Q  381 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  15734255 ctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 15734316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 442
Target Start/End: Original strand, 20620885 - 20620945
Alignment:
Q  382 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  20620885 tacttcctaacccatctcggactaaccccaaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 20620945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18487860 - 18487790
Alignment:
Q  90 gatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 160  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  18487860 gatgagctgtttatgttgtgggctatgctttataaccatcctattaacatttgctattatttgcttgatta 18487790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20446706 - 20446581
Alignment:
Q  19 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 118  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||| |  ||  | || |  |  ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  20446706 tgcttaggtaccttcacatggttatggcttgcaccatatggggtagaaaagaggtaggaatgatgaggactgttgagctgtttatgttgtaggctatgct 20446607  T
Q  119 taataaccaccccgttaacacttgct 144  Q
    | |||||||||  ||||||| |||||    
T  20446606 ttataaccaccatgttaacatttgct 20446581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 21282775 - 21282726
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 64  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21282775 cctgtgcttaggtaccttcacacggttatggcttgcaccatatggggtag 21282726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 24218183 - 24218232
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 64  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  24218183 cctgtgcttaggtaccttcacacggttatggcttgcaccatatggggtag 24218232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 30764631 - 30764599
Alignment:
Q  388 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30764631 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 30764599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Original strand, 23746472 - 23746559
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 168  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  23746472 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcct 23746559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25008576 - 25008489
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 168  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  25008576 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcct 25008489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Original strand, 24938889 - 24938938
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 64  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  24938889 cctgtgcttaggtaccttcacacggttattgcttgcaccatatggggtag 24938938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 144
Target Start/End: Original strand, 24218252 - 24218312
Alignment:
Q  84 aggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgct 144  Q
    ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  24218252 aggactgttgagctgtttatattgtgggctatgctttataaccaccatgttaacatttgct 24218312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22888 - 22468
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || || |||| |||||| ||||    
T  22888 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaacttttcatgtcgtgggccatgc 22789  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| ||    
T  22788 ttaacaaccaccctgttaacacatgcttttacttgcttgattacttttcccatgtcggtaataggtctgatagtaggggagagatagttgtgggtggtat 22689  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| ||||| ||| |||   | ||||||| |||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  22688 catcacatacatagctagacacttgggagagggtgaggaccaagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagacctttatctttatg 22589  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    |||||||||||||  | | | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22588 aacttcattaagccccgttcgcccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 22489  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  22488 aagaaaatttgttgtatgttg 22468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 23677 - 24097
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  23677 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggcaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgtcgtgggccatgc 23776  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | |  ||||||||||  || ||||| ||    
T  23777 ttaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttacttgattacctttcccatgtcggtaataggtttgatagaagaggagagatagatgtgggtggtat 23876  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23877 catcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaattaataggcttaacatagagacccttatctttatg 23976  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23977 aacttcattaggccccgtccacccatgtcttacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 24076  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  24077 aagaaaatttgttgtatgttg 24097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 5462 - 5035
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  5462 cctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggtaggaccgaattggggaacactaggaccgacgaactcttcatgttgtgggcta 5363  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5362 tgctgcacaaccaccccgttaacacttgcttttacttacttgactacctttccaatataggtaataggtctgatggtaagggagaaatagtagttggtgg 5263  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||    
T  5262 tatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgagtgaagaccaatggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaaactcttgtctct 5163  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
    ||||||||||| || | ||  | |||| |    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5162 atgaacttcatcaaacctcgactaccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcctattttaattttacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 5063  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  5062 tggaagagaatttgttgtatgttggtga 5035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24821966 - 24821559
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||  | || ||||||||||| || |       
T  24821966 cttaggtaccttcaaagggtaatagcttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggatggatgaagttttcatgttgtgggccatac--- 24821870  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  24821869 --aaccaccccgttaacacatgcttttacttgtttgattacctttcctatgtcagtaataggtctgatggtaggggagagatagttgtgggtggtatcat 24821772  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
     ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  24821771 cacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaa-----agacccttatctctatgaac 24821677  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24821676 ttcattaagcctcgtccacccatgttctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattgtacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 24821577  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
    |||||||| | |||||||    
T  24821576 aaaatttgttgtatgttg 24821559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 238 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 25372612 - 25372396
Alignment:
Q  238 aattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatcc 337  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25372612 aattgagagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggtttaacatatagacccttatctctatgaacttcattaagcatcgtcc 25372513  T
Q  338 acccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25372512 acccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgatatatgtt 25372413  T
Q  438 ggtgaaggttcacaggt 454  Q
    |||||||||||||||||    
T  25372412 ggtgaaggttcacaggt 25372396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 437
Target Start/End: Original strand, 115854 - 116270
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  115854 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggtaggagtgaattagggaacactaggagtgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 115953  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  | |||| |||||||  ||| ||| ||| || || ||||| ||||| |||||    
T  115954 acaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctctcccttataggaaataggtccgatagtaggggcgaaatcgtagttggtggtatcat 116053  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||| |   || || ||| |||| || ||||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  116054 aacatacatagctaggcggttaggcgtgagtgaagatcaagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaat 116153  T
Q  321 ttcat--taagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 418  Q
    |||||   || ||  |||  ||| |    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  116154 ttcataaaaaccagaatc--ccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaactcatctcggactaacaccgaggtgga 116251  T
Q  419 agaaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  116252 agaaaatttgttgtatgtt 116270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23161267 - 23160851
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| ||||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  23161267 cttaggtaccttcaaagggtaatggcttgcactattaggggaaggacagaactagggaacactaggaacgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 23161168  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  23161167 acaaccaacccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 23161068  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||      || || ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  23161067 aacatacatagctggacggttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagatacccttatctctatgaat 23160968  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| || |  |     ||| |    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23160967 ttcataaaaccccgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 23160868  T
Q  421 aaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||| | ||||||    
T  23160867 aaaatttgttgtatgtt 23160851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23572524 - 23572108
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| ||||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  23572524 cttaggtaccttcaaagggtaatggcttgcactattaggggaaggacagaactagggaacactaggaacgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 23572425  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  23572424 acaaccaacccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 23572325  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||      || || ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  23572324 aacatacatagctggacggttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagatacccttatctctatgaat 23572225  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| || |  |     ||| |    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572224 ttcataaaaccccgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 23572125  T
Q  421 aaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||| | ||||||    
T  23572124 aaaatttgttgtatgtt 23572108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 437
Target Start/End: Original strand, 27629829 - 27630245
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| ||||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  27629829 cttaggtaccttcaaagggtaatggcttgcactattaggggaaggacagaactagggaacactaggaacgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 27629928  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||| | |||||||| ||||| |||||    
T  27629929 acaaccaacccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggaaaaatagtagttggtggtatcat 27630028  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| |||     || || ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  27630029 aacatacatagctagacggttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagaaacccttatctctatgaat 27630128  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| || |  |     ||| |    ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27630129 ttcataaaaccccgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 27630228  T
Q  421 aaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||| | ||||||    
T  27630229 aaaatttgttgtatgtt 27630245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 268
Target Start/End: Original strand, 22870088 - 22870335
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||      
T  22870088 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggagtgaattagggaacactaggagcgatgaactctttatgctatgggctatgctgc 22870187  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || |||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  22870188 acaaccacccccttaacacttgcttttacttacttaactacctttcccatataggaaataggtccgatggtaagggagaaatagtagttggtggtatcat 22870287  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaa 268  Q
     ||||| ||| ||  | || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  22870288 cacatacatagctgggcaactaggagtgagtgaggaccaagggataaa 22870335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Original strand, 16773979 - 16774396
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  16773979 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 16774078  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16774079 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 16774178  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  16774179 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 16774278  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| ||   ||     ||  |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16774279 ttcatcaaaactcgagtcccttttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 16774378  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
     ||||||| | |||||||    
T  16774379 caaatttgttgtatgttg 16774396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 454
Target Start/End: Original strand, 24169702 - 24170134
Alignment:
Q  22 ttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattgg--ggaaca-ctaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 118  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||   ||| ||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  24169702 ttaggtacctacaaagggtcatggcttgtaccatttggggtagga---aataggtaggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgct 24169798  T
Q  119 taataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatc 218  Q
    || |||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||||||  ||| | ||||   ||||  ||||  ||  |  ||||||||||| ||||| |||    
T  24169799 tagtaacaaccccgtgaatacttgtttctacttgcttgattacctcgcctttataggagctaggcctgataatagagctgagatagtagtaggtggtatc 24169898  T
Q  219 ataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatga 318  Q
    || || |  ||  ||| ||| || ||||||||||| ||| | |||||||     |||| ||||| ||||||||| | ||| || ||||| || |||||||    
T  24169899 attaccttcattgctaggaagtttggagtgggtgaagacgaggggataactccaattgagggaatcaataggctaaacattgaaaccctcatttctatga 24169998  T
Q  319 acttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 418  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| || || ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24169999 atttcattaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaacgtacctattttgtttctacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 24170098  T
Q  419 agaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    || ||||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  24170099 agcaaattttttgtatgttggtgatggttcacaggt 24170134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24797187 - 24796770
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  24797187 cttaggtaccttcaacgggttatggcttgcaccattaggggacggaaagaactagggaacactaggaatgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 24797088  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||   || ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  24797087 acaaccaacccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccaatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 24796988  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||  |  ||| || ||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| || | |||||| || || |||||||||||     
T  24796987 aacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctcatctctatgaat 24796888  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| ||   ||     ||| |   |||||||||| |||||||||||||  | |||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24796887 ttcatcaaaactcgagtcccctttgtctatacactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaag 24796788  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
     ||||||| | |||||||    
T  24796787 caaatttgttgtatgttg 24796770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25369214 - 25369017
Alignment:
Q  245 agtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatg 344  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25369214 agtgggtgaggacgaagggataaattcaattgagggcaacaataggcttaacatagggaccctcatttccatgaacttcattaagcgtcatccgcccatg 25369115  T
Q  345 acctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
     | ||| ||||||| |||||||||  | | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  25369114 gcttatgcactcaagctcaatgtgattctattatttatgcttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagacaatttgttgtatgttggtga 25369017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25369408 - 25369250
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||  ||  | || |  |||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  25369408 gtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgtaccatttgagataggaaagaggtaggaacaactaggatggatgagctctttatgctttgggcaatgc 25369309  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggt 176  Q
    ||| |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25369308 ttagtaacaaccccgtgaatacttgtttttacttgcttgattaccttacctctgtaggt 25369250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 365 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17867568 - 17867491
Alignment:
Q  365 tgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17867568 tgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtga 17867491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22046453 - 22046092
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 180  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||   ||||   ||    
T  22046453 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcctccataggagcta 22046354  T
Q  181 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 280  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  22046353 gacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggg 22046254  T
Q  281 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 380  Q
     |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  ||    
T  22046253 caacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttattt 22046154  T
Q  381 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  22046153 ctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 22046092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 81 - 442
Target Start/End: Original strand, 25355933 - 25356294
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 180  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||   ||||   ||    
T  25355933 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcctccataggagcta 25356032  T
Q  181 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 280  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||    
T  25356033 gacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgaggg 25356132  T
Q  281 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgatt 380  Q
     |||||||||||||  || || |||||| |  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  ||    
T  25356133 caacaataggcttaatattgaaacccttgttgctatgaacttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttattt 25356232  T
Q  381 atacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  25356233 ctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 25356294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13290 - 13046
Alignment:
Q  198 gagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatca 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||  | ||||||||    |||| |||||||||||||||||  |    
T  13290 gagatagtagtcggtggtatcattaccttcatcgctaggaagtttggagtgggtgaggaagatgggataaatccaattgagggaaacaataggcttaata 13191  T
Q  298 tagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatc 397  Q
    | || |||||| |  ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||  ||||     | ||| ||||  || ||||||||||||||||    
T  13190 ttgaaacccttgttgctatgaatttcattaagattcacccacccatgacttatgcacttcaacttcgcatacctcttttatttctacttcctaacccatc 13091  T
Q  398 tcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  13090 tcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 13046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20306575 - 20306429
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |  | | ||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||| ||||||      
T  20306575 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactattagaagaaagacagaactagggaacactaggaacgatgaactcttcatgctctgggatatgctgc 20306476  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcc 167  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  20306475 acaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacatttcc 20306429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 382 - 442
Target Start/End: Original strand, 27626316 - 27626376
Alignment:
Q  382 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  27626316 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 27626376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 144
Target Start/End: Original strand, 24500756 - 24500808
Alignment:
Q  92 tgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgct 144  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  24500756 tgagctgtttatgttgtgggctatgctttataaccaccctattaacatttgct 24500808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13395 - 13308
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 168  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  13395 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgtttctacctacttgattacctttcct 13308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 25372832 - 25372784
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtagga 66  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  25372832 gtgcttaggtaccttcaaagagtcatggcttgtaccatttagggtagga 25372784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 121709 - 122119
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  121709 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggacggatgaactcttcatgttgtgggccatgc 121808  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||          |||||||||| | |||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||| || ||||| ||    
T  121809 ttaacaaccaccgcgttaacacatgctt----------gattaccttttccatgtcggtaataggtttgatagtaggggagcgatagttgtgggtggtat 121898  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
     || ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| || |  || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  121899 aatcacatacatagctcggcaattgggagtgggtgaggaccaaggaattaccaaaattaagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctttatg 121998  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121999 aacctcattaagcctcgtccacccatgtcttacacactcaaactcaatgtgcctatattgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 122098  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  122099 aagaaaatttgttgtatgttg 122119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3939 - 3517
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||  | |||||||    
T  3939 cctgtacttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggactgaattagggaacactaggagtgatgaactcttcatactatgggcta 3840  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3839 tgttgcacaaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtctgatggtaagggagaaatagtagttggtgg 3740  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||| ||||| ||| ||  | || | |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  3739 tatcatcacatacatagctgggcaactaggagtgagtgaggaccaaggaataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatctct 3640  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
    ||||||||||| || | ||  |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3639 atgaacttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 3540  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  3539 tggaagaaaatttgttgtatgtt 3517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20128 - 19725
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||  | || ||||||||| | || |       
T  20128 cttaggtaccttcaaagggtaatagcttgcactatttggggtaggaccgaattggggaacactaggatggatgaagttttcatgttgtggtccatac--- 20032  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| |||||    
T  20031 --aaccaccccgttaacacatgcttttacttgtttgattacctttcctatgtctgtaataggtctgatggtaggggagagatagttgtgggtggtatcat 19934  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
     ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||| ||         ||||||||||||||    
T  19933 cacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaaca---------ttatctctatgaac 19843  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19842 ttcattaagcctcgtccacccatgttctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattgtactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 19743  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
    |||||||| | |||||||    
T  19742 aaaatttgttgtatgttg 19725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19840 - 19423
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||  | |||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||      
T  19840 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggactgatatagggaacactaggagcgatgaactcttcatgttgtgggctatgctgc 19741  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  19740 acaaccaccccgttaacactcgcttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtctgatggtaagggagaaatagtagttggtggtatcat 19641  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
     ||||| ||| ||  | |||| |||||  || |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||     
T  19640 cacatacatagctgggtaattaggagttagttaggaccaagggataaacaagattgagggtaacaataggctaaacatagatacccttatctctatgaat 19541  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| || | ||  |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19540 ttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 19441  T
Q  421 aaaatttgctatatgttg 438  Q
    |||||||| | |||||||    
T  19440 aaaatttgttgtatgttg 19423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 123 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 253573 - 253240
Alignment:
Q  123 aaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |    
T  253573 aaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgactatctttcccatataggtaataggtctgatggtaagggggaaatagtagtccgtggtatcatca 253474  T
Q  223 catatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagac------cct--------t 308  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||      |||        |    
T  253473 catacatagctaggaaattgggagtgggtgaggacctagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacaaggtgcctgtggaaact 253374  T
Q  309 atctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaaca 408  Q
     |||||||||||||||| || | ||  || ||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253373 gtctctatgaacttcataaaacctcgaccccccttggattatacactcaaactcaacgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaaca 253274  T
Q  409 ccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  253273 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtga 253240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20505 - 20234
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20505 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatttggggtaggactgaattggaaaacactaggacagatgaactcttcatgttgtgggcta 20406  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20405 tgcttaacaaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattatctttcccatgtaggtaataggtctgatggtaagggagagatagtagtaggtgg 20306  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaa 286  Q
     ||||| ||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||    
T  20305 tatcatcacatacatagctagtcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaaaatcgagggaaacaa 20234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 356
Target Start/End: Original strand, 1513 - 1848
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| || | |||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  1513 cttagatacctccaacgggttatggcttgcactatttggggaagaactgaattaggaaacactaggacggatgaactgttcatgttgtgggccatgctta 1612  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  1613 acaaccaccccgttaatacttgcttttacttgcttgattacctttcccttgtaggtaataggtctgacggtaagggagagatagttgtgggtggtatcat 1712  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
     ||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1713 cacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaaaattgagggtaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaac 1812  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactc 356  Q
    |||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||    
T  1813 ttcattaatcatcatacacccacgtcctacacactc 1848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 438
Target Start/End: Original strand, 465 - 906
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||| ||||    
T  465 gtgcttaggtaccttcaaagggtaatgacttgcactatttggggtaggaccgaattgtggaacactaggacggatgaactcttcatatcgtgggccatgc 564  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | | |||||||||||  || ||||| ||    
T  565 ttaacaaccaccccgttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtcggtaataggtttgatagcaggggagagatagctgtgggtggtat 664  T
Q  218 ---------------------cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatc 296  Q
                         ||| ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || ||  ||||||| || |    
T  665 gagatagctgtgggtgggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaacattgaggaaattaataggcataac 764  T
Q  297 atagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccat 396  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  765 atagagacacttatctttatgaacttcattaggccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccat 864  T
Q  397 ctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  865 ctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26275 - 25859
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| |||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  26275 cctgtacttaggtaccttcaaagggttatggtttgcactatttggggaaggactgaactagggaacactaggagcgatgaactcttcatgttatgggcta 26176  T
Q  115 tgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtgg 214  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  26175 tgctgcacaaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatggtaggggagaaatagtagttggtgg 26076  T
Q  215 catcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctct 314  Q
     ||||| ||||| ||| ||  | |||| |||    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  26075 tatcatcacatacatagctgggcaattagga----gtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagaaacccttatctct 25980  T
Q  315 atgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgagg 414  Q
    ||||||||||| || | ||  |  ||| |    ||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25979 atgaacttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgatcttactgcctaacccatctcggactaacaccgagg 25880  T
Q  415 tggaagaaaatttgctatatg 435  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  25879 tggaagaaaatttgctgtatg 25859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 437
Target Start/End: Original strand, 28831 - 29247
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||  ||||| || || ||| | |||||||||||      
T  28831 cttaggtaccttcaacgggttatggcttgtactatttggggaaggagcgaattagggaacactaggagtgatgaactattcatgctttgggctatgctgc 28930  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28931 acaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccatataggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 29030  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||| |||| | || ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||     
T  29031 aacatacatagctaggaaactaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagaaacccttatctctatgaat 29130  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||||| || | ||     ||| |    ||||| ||||| |||||||||||   ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29131 ttcataaaacctcgaatcccctttgtttatacgctcaagctcaatgtgccaactttgatattattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 29230  T
Q  421 aaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||| | ||||||    
T  29231 aaaatttgttgtatgtt 29247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 437
Target Start/End: Original strand, 23892 - 24308
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||      
T  23892 cttaggtaccttcaaacggttatggcttgcaccattaggggacggacagaactagggaacactaggaacgatgaactcttcatgctttgggctatgctgc 23991  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| |||||||| ||||| |||||    
T  23992 acaaccaccccattaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttctaggaaataggtccgatagtaggggagaaatagtagttggtggtatcat 24091  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaac 320  Q
    |||||| ||| ||| |   || || ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  24092 aacatacatagctaggcggttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaacccttatctctatgaat 24191  T
Q  321 ttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 420  Q
    ||| | || | ||     ||| |    ||||||||||| || ||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24192 ttcctaaaacctcgaatcccctttgtttatacactcaagcttaatgtgcctattttgatattattacctaacccatctcggactaacaccgaggtggaag 24291  T
Q  421 aaaatttgctatatgtt 437  Q
    |||||||| | ||||||    
T  24292 aaaatttgttgtatgtt 24308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1400 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1400
Description:

Target: scaffold1400; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 338 - 49
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| | |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||      
T  338 cttaggtaccttcaaagggttatggcttgcactattaggggaaggactgaactagggaacactaggaacgatgaactcttcatgttatgggctatgctgc 239  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcat 220  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||  ||| ||| |||||| || ||||| ||||| |||||    
T  238 acaaccaccccgttaacacttgtttttacttgcttgactacctttcccttataggaaataggtccgatagtaggggagaaattgtagttggtggtatcat 139  T
Q  221 aacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttat 310  Q
    |||||| |||  || | || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  138 aacatacatagttaggcaactaggagtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttat 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 33409 - 32975
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||| |||  ||  | || |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  33409 gtgcttaggtaccttcaaagagtcatggcttgtaccatttggggtgggaaagaggtaggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgc 33310  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    ||| |||| |||| || || ||||| || ||||||||||||| |||| ||| | |||||  ||||  |||   ||  |   ||||| |  | ||||| ||    
T  33309 ttagtaacaaccctgtgaatacttgtttctacttgcttgattgccttgcctctataggtgctaggcctgacaatagagctaagatattgataggtggtat 33210  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||    
T  33209 cattaccttcattgctaggaagtttggagtgggtgaggacgaatggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaaccctcatttctatg 33110  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33109 aacttcattaagcatcgtccacccatgacttatgcactcaaactcaatatgcctcttttgtttctacttcctaacccatctcgcactaacaccgaggtgg 33010  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacag 452  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  33009 aagcaaatttgttgtatgttggtgatggttcacag 32975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 190 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8705 - 8457
Alignment:
Q  190 gtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaatag 289  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| || || ||| ||| | |||| || || ||| |||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||    
T  8705 gtaagggagagatagtggtaggaggcatcatcacttacatagctaggcaatttggggttggtaaggaccaaggaattaaaaggatttagggaaacaatag 8606  T
Q  290 gcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcct 389  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| || | || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | |||  |||||||    
T  8605 gcttaacatagatacccttgtctctatgaacttcatcaaacctcgtccacccatgtcctatacactcaagctcaatgtgcctattctaattgcacttcct 8506  T
Q  390 aacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8505 aacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 8457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 264 - 442
Target Start/End: Original strand, 1870 - 2046
Alignment:
Q  264 ataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactca 363  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| || | ||  || |||||| | ||||||||||||||||    
T  1870 ataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttgtct--atgaacttcataaaacctcgaccccccatggcttatacactcaaactca 1967  T
Q  364 atgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1968 atgtgactgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtga 2046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 454
Target Start/End: Original strand, 10887 - 11323
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||  ||| | || |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  10887 gtgcttaggtaccttcaaagagtcatggcttgtaccatttggggtaggaaagaaatcggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgc 10986  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    ||| |||| ||||||| || ||||| || || || |||||||||||| ||| | |||||  ||||  |||   ||  |  ||||||||  | ||||| ||    
T  10987 ttagtaacaaccccgtgaatacttgtttctatttacttgattaccttgcctctataggtgctaggcctgacaatagagctgagatagtgataggtggtat 11086  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| || |  ||   ||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||| || || || || ||||||    
T  11087 cattaccttcattgttagtaaatttggagtgggtgaggacgaggggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaacactcatttctatg 11186  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    || |||||||||| || |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11187 aatttcattaagcttcgtccacccatgacttatgcacttaaactaaatgtgccccttttgtttctactttctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 11286  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    |||  |||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  11287 aagcgaatttgttgtatgttggtgatggatcacaggt 11323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 454
Target Start/End: Original strand, 115001 - 115441
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |  ||  | || |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  115001 gtgcttagataccttcaaagagtcatggcttgtaccatttggggtagaaaagaggtaggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggctatgc 115100  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    ||| |||| |||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||||||   ||||| || ||  ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||    
T  115101 ttagtaacaaccccgttcatacttgcttctacctacttgattacctttcctccataggtgatgggcctgataatagagctgagatagtagtcggtggtat 115200  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaata----ggcttatcatagagacccttatctc 313  Q
    ||| || |  ||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| |||||||    |||||| ||| || |||||  | ||    
T  115201 cattaccttcatagctaggaagtttggagtgggtgaggacgaagggataaatccaattgagggcaacaatatataggcttaacattgaaaccctcttttc 115300  T
Q  314 tatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgag 413  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||   | | ||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  115301 tatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcacttaaacttcgtatacctcttttgtttctgcttcctaacccatctcggattaacaccgag 115400  T
Q  414 gtggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    ||||| | ||||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  115401 gtggaggcaaatttgttgtatgttggtgatggatcacaggt 115441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 454
Target Start/End: Original strand, 119305 - 119745
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |  ||  | || |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  119305 gtgcttagataccttcaaagagtcatggcttgtaccatttggggtagaaaagaggtaggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggctatgc 119404  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    ||| |||| |||||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||||||   ||||| || ||  ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||    
T  119405 ttagtaacaaccccgttcatacttgcttctacctacttgattacctttcctccataggtgatgggcctgataatagagctgagatagtagtcggtggtat 119504  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaata----ggcttatcatagagacccttatctc 313  Q
    ||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| |||||||    |||||| ||| || |||||  | ||    
T  119505 cattaccttcattgctaggaagtttggagtgggtgaggacgaagggataaatccaattgagggcaacaatatataggcttaacattgaaaccctcttttc 119604  T
Q  314 tatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgag 413  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||   | | ||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  119605 tatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcacttaaacttcgtatacctcttttgtttctgcttcctaacccatctcggattaacaccgag 119704  T
Q  414 gtggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    ||||| | ||||||| | ||||||||||| || ||||||||    
T  119705 gtggaggcaaatttgttgtatgttggtgatggatcacaggt 119745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 39590 - 39166
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||  ||  | || |  |||| ||| ||||| || |||||| | ||||| ||||    
T  39590 gtgcttaggtacctacaaaggatcatggcttgtaccatttggggtaggaaagaggtaggaacaactaagacggatgaactttttatgctttgggcaatgc 39491  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    ||| | || ||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||  ||| | ||||   ||||  ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||    
T  39490 ttagtgacaaccccgtgaatacttgtttctacttacttgattacctcgcctctataggagctaggcctgataatagagctgagatagtagtcggtggtat 39391  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| || |  ||| ||| ||| || ||| ||||||| ||  |||||||||     |||| |||||||||||| || | ||| || ||||| || ||||||    
T  39390 cattaccttcatagctaggaagtttggaatgggtgaagaagaagggataactccaattgagggaaacaatagactaaacattgaaaccctcatttctatg 39291  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| || || ||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39290 aatttcattaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaacgtacctcttttgtttctacttcctaacccatcttggactaacaccgaggtgg 39191  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||    
T  39190 aagcaaatttgttgtatgttggtga 39166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1879 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1879
Description:

Target: scaffold1879; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 773 - 336
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttgggg-taggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatg 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||  ||  | || |  ||||| || ||||| || |||||| | ||||| |||    
T  773 gtgcttaggtacctacaaagggtcatggcttgtaccatttgggggtaggaaagaggtaggaacaactagaacggatgaactttttatgctttgggcgatg 674  T
Q  117 cttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggca 216  Q
    |||| |||| ||||||  || ||||| || ||||| |||||||||||| ||| | |||| | ||||  ||||  ||  |  | ||||||||| ||||| |    
T  673 cttagtaacaaccccgcgaatacttgtttctacttacttgattaccttgcctctataggaactaggcctgatattagagctgggatagtagtaggtggta 574  T
Q  217 tcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctat 316  Q
    |||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||| ||  | |||||||     |||| ||||||||| | ||| | ||| || ||||| || |||||    
T  573 tcattaccttcatttctaggaagtttggagtgggtgaagaagaggggataactccaattgagggaaacaacatgctaaacattgaaaccctcatttctat 474  T
Q  317 gaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtg 416  Q
    ||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  473 gaatttcatcaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaatatacctattttgtttctacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtg 374  T
Q  417 gaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  373 gaagaaaatttgttgtatgttggtgatggtccacaggt 336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 243 - 454
Target Start/End: Original strand, 10000 - 10211
Alignment:
Q  243 ggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccaccca 342  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    |||| ||| ||||||||||||| ||| || ||| |  | |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10000 ggagtgggtgaggacgaacggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaaccttcctttctatgaatttcattaagcttcatccaccca 10099  T
Q  343 tgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||| |||  | | ||||||||| | ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  10100 tgacatatgaaattaaactcaatatacctcttttgtttctacttcctgacccatctcggactaacactgaggtggaagcaaatttgttgtatgttggtga 10199  T
Q  443 aggttcacaggt 454  Q
     || ||||||||    
T  10200 tggatcacaggt 10211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 168
Target Start/End: Original strand, 9782 - 9932
Alignment:
Q  17 tgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatg 116  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||  | || |  |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||    
T  9782 tgtgcttaagtaccttcaaagggctatgacttgtaccatttggggtagaaaagaggtaggaacaactaggacggatgaactctttatgctttgggcaatg 9881  T
Q  117 cttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 168  Q
    |||  |||| ||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||    
T  9882 ctt-gtaacaaccccgtgaatacctgtttatacttacttgattacctttcct 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 4947 - 4619
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 180  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||  ||    
T  4947 actaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgcttagtaacaaccccgttcatacttgcttctacctacttgattacctttcttccataggtgtta 4848  T
Q  181 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 280  Q
    ||  ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    |||| |||    
T  4847 ggcctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcattaccttcattgctaggaagtttggagtgggtgaggacgaagggataaatccaattgaggg 4748  T
Q  281 aaacaataggcttatc-atagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgat 379  Q
     |||||||||||||   || || |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||| |    
T  4747 caacaataggcttaaatattgaaacccttgtttctatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttgtt 4648  T
Q  380 tatacttcctaacccatctcggactaaca 408  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  4647 tctgcttcctaacccatctcggactaaca 4619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 442
Target Start/End: Original strand, 12396 - 12820
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgc 117  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||| |  ||  | || |  |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||      
T  12396 gtgcttagatacctccaaagagtcatggcttgtaccatttggggtagaaaagaggtaggaacaactaggacagatgaactctttatgctttgggcaattg 12495  T
Q  118 ttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcat 217  Q
    ||| |||| | |||||||| ||||||||  || | ||||||||||||||||   |||||  |||   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||    
T  12496 ttagtaacaatcccgttaatacttgcttccacctacttgattacctttcctccataggtgctagacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtat 12595  T
Q  218 cataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatg 317  Q
    ||| || |  || |||| ||| || ||||||||||||||  |||| ||||||   |||| ||| |||||||||||||  || || || ||| |  |||||    
T  12596 cattaccttcatcactaggaagtttggagtgggtgaggaagaaggaataaaaccaattgagggcaacaataggcttaatattgaaacacttgttgctatg 12695  T
Q  318 aacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgg 417  Q
    || |||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||  ||||   | | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12696 aatttcattaagattcacccgcccatgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtgg 12795  T
Q  418 aagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    | ||||||| | | |||||||||||    
T  12796 aggaaaattagttgtatgttggtga 12820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1620 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1620
Description:

Target: scaffold1620; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 665 - 423
Alignment:
Q  198 gagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatca 297  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    |||| ||| ||||||| ||| | ||    
T  665 gagatagtagtaggtggtatcattaccttcattgctaggaagtttggagtgggtgaagacaaagggataaatccaattgaggggaacaatatgctaaaca 566  T
Q  298 tagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatc 397  Q
    | || ||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||  ||| | ||||| || ||||||||||||||||    
T  565 ttgaaaccctcatttctatgaatttcataaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaacatgcttcttttgtttctacttcctaacccatc 466  T
Q  398 tcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggt 440  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  465 tcggactaacacggaggtggaagcaaatttgttgtatgttggt 423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 312 - 454
Target Start/End: Original strand, 54893 - 55035
Alignment:
Q  312 tctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccg 411  Q
    |||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54893 tctatgaatttcataaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaatatacctattttgtttctacttcctaacccatctcggattaacaccg 54992  T
Q  412 aggtggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggt 454  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||||||    
T  54993 aggtggaagcaaatttgttgtatgttggtgatggtccacaggt 55035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Original strand, 54596 - 54740
Alignment:
Q  19 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 118  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||| | || |  ||||| || ||||| || |||||| | ||||| |||||    
T  54596 tgcttaggtacctacaaagggtcatggcttgtaccatttggggtaggaaagaagtaggaacaactagaacggatgaactttttatgctttgggcgatgct 54695  T
Q  119 taataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacct 163  Q
    || |||| ||||||| || ||||| || ||| | |||||||||||    
T  54696 tagtaacaaccccgtgaatacttgtttctacatacttgattacct 54740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1756 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1756
Description:

Target: scaffold1756; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 1000 - 1103
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggcta 114  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  1000 cctgtacttagataccttcaaagggttatggcttgcactatttggggaaggagtgaattagggaacactaggagcgatgaactcttcatgttatgggcta 1099  T
Q  115 tgct 118  Q
    ||||    
T  1100 tgct 1103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 406
Target Start/End: Original strand, 41388 - 41775
Alignment:
Q  19 tgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgct 118  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||| | || |  ||||| |||||||| || |||||| | ||||| |||||    
T  41388 tgcttaggtacctacaaagggtcatggcttgtaccatttggggtaggaaagaagtaggaacaactagaacagatgaactttttatgctttgggcgatgct 41487  T
Q  119 taataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatc 218  Q
    || |||| ||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||  ||| | |||| | |||   ||||  ||  |  ||||||||||| ||||| |||    
T  41488 tagtaacaaccccgtgaatacttgtttctacttacttgattacctcgcctctataggaactagacctgatattagagttgagatagtagtaggtggtatc 41587  T
Q  219 ataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatga 318  Q
    || || |  ||  ||| ||| || |||||| |||| ||  | |||||||     |||| ||||||||| | ||| | ||| || ||||| || |||||||    
T  41588 attaccttcattgctaggaagtttggagtgagtgaagaggaggggataactccaattgagggaaacaacatgctcaacattgaaaccctcatttctatga 41687  T
Q  319 acttcattaagcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaa 406  Q
    | ||||| || | ||||||||||||||| |||  |||| |||| ||| | ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41688 atttcatcaaacttcatccacccatgacttatgaactccaacttaatatacctattttgtttctacttcctaacccatctcggactaa 41775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Original strand, 7835 - 7914
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatga 94  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  7835 cctgtgattaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatctagggtaggaccgaattgaggaacactaggacagatga 7914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Original strand, 15737 - 15816
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatga 94  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  15737 cctgtgattaggtaccttcaaagggttatggcttgcaccatctagggtaggaccgaattgaggaacactaggacagatga 15816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 456
Target Start/End: Original strand, 21620 - 21702
Alignment:
Q  374 tttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtgaaggttcacaggttc 456  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | |||||||||    
T  21620 tttgattatctttcctaacccatctcggaataacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatgttccacaggttc 21702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 373 - 442
Target Start/End: Original strand, 4819 - 4888
Alignment:
Q  373 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  4819 ttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1571 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1571
Description:

Target: scaffold1571; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 382 - 442
Target Start/End: Original strand, 1344 - 1404
Alignment:
Q  382 tacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgctatatgttggtga 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  1344 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtga 1404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32621 - 32347
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaata 180  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| |||   |||||  ||    
T  32621 actaggacggatgaactctttatgctttgggcaatgcttagtaacaaccccgttaatacttgcttctacctacttgattaccttacctccataggtggta 32522  T
Q  181 ggtatgatggtaagggagagatagtagtcggtggcatcataacatatataactatgaaattgggagtgggtgaggaccaagggataaaaaagattggggg 280  Q
    |   ||||  ||  |  ||||||||||||||||| ||||| || |  ||  ||| ||| || | |||| |||| | | |||| |||||    |||| |||    
T  32521 gacctgataatagagctgagatagtagtcggtggtatcatcaccttcatcgctaggaagtttgtagtgagtgaagccaaaggaataaatccaattgaggg 32422  T
Q  281 aaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacact 355  Q
     |||||||||||||  || || |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  32421 caacaataggcttaatattgaaacccttgtatctatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcact 32347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 183
Target Start/End: Original strand, 37500 - 37551
Alignment:
Q  132 gttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcctatgtaggtaataggt 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37500 gttaacacatgcttttacttgcttgattacctttcccatgtcggtaataggt 37551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Original strand, 18249 - 18319
Alignment:
Q  90 gatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 160  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  18249 gatgagctgtttatgttgtgggctatgctttataaccatcctattaacatttgctattatttgcttgatta 18319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 50371 - 50288
Alignment:
Q  272 gattgggggaaacaataggcttatcatagagacccttatctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgacctatacact 355  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  || || |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  50371 gattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgtttctatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcact 50288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 50562 - 50475
Alignment:
Q  81 actaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttcct 168  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  50562 actaggacggatgaactttttatgctttgggcaatgcttagtaacaatcccgttaatacttgcttctacctacttgattacctttcct 50475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 195814 - 195735
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| | |||||||||||||  ||||| |||||    
T  195814 cttaggtaccttcagagggttatggcttgcactattaggggaaggactgaactagggaacactaggaacgatgaactctt 195735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11693 - 11632
Alignment:
Q  84 aggacagatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgctt 145  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  11693 aggactgatgaactgttaatgttgtgggctatgctttataaccaccctgttaacatttgctt 11632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 12179 - 12130
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 64  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12179 cctgtgcttaggtaccttcacacggttatggcttgcaccatatggggtag 12130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 13309 - 13260
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 64  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13309 cctgtgcttaggtaccttcacacggttatggcttgcaccatatggggtag 13260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 9200 - 9151
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 64  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  9200 cctgtgcttaggtaccttcacacggttattgcttgcaccatatggggtag 9151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Original strand, 1029 - 1099
Alignment:
Q  90 gatgagctctttatgttgtgggctatgcttaataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgatta 160  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||  |||||| || || ||| |||||||||||    
T  1029 gatgagctgtttatgttatgggctatgctttataaccatcctattaacattttctattatttgcttgatta 1099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 14937 - 14888
Alignment:
Q  15 cctgtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtag 64  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  14937 cctgtgcttaggtaccttcacacggttattgcttgcaccatatggggtag 14888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7332 - 7187
Alignment:
Q  21 cttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtaggattgaattggggaacactaggacagatgagctctttatgttgtgggctatgctta 120  Q
    ||||| ||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||||   || ||||    |||||  | |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7332 cttagatacattcaaagttttatggcatgcaccatttggggtaggacgaaagtgggaccgactagagcggatgagttgtttatgttgtgggctatgctta 7233  T
Q  121 ataaccaccccgttaacacttgcttttacttgcttgattacctttc 166  Q
    | || | | | || ||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  7232 acaatctctctgtgaacacctgtttttacttgcttaattatctttc 7187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 15872 - 15824
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtagga 66  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  15872 gtgcttaggtacctacaacgggtcatggcttgtaccatttggggtagga 15824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 24707 - 24659
Alignment:
Q  18 gtgcttaggtaccttcaaagggttatgacttgcaccatttggggtagga 66  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  24707 gtgcttaggtacctacaacgggtcatggcttgtaccatttggggtagga 24659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University