View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7241_low_4 (Length: 589)

Name: NF7241_low_4
Description: NF7241
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7241_low_4
NF7241_low_4
[»] chr3 (116 HSPs)
chr3 (4-576)||(54634835-54635428)
chr3 (166-576)||(6716392-6716805)
chr3 (166-576)||(45282875-45283291)
chr3 (166-560)||(3617342-3617739)
chr3 (166-576)||(25637321-25637736)
chr3 (166-545)||(4600638-4601019)
chr3 (166-563)||(800983-801379)
chr3 (166-557)||(4598405-4598798)
chr3 (166-557)||(10211288-10211681)
chr3 (166-557)||(10209068-10209461)
chr3 (166-557)||(10056112-10056505)
chr3 (166-557)||(10058334-10058727)
chr3 (166-557)||(10060556-10060949)
chr3 (166-557)||(10062778-10063171)
chr3 (166-557)||(10065000-10065393)
chr3 (237-563)||(7779880-7780208)
chr3 (166-559)||(23200020-23200420)
chr3 (166-557)||(23197823-23198221)
chr3 (166-558)||(5258028-5258427)
chr3 (166-556)||(9636010-9636410)
chr3 (166-365)||(10067222-10067419)
chr3 (166-559)||(5260206-5260606)
chr3 (166-556)||(45095050-45095445)
chr3 (166-556)||(19683774-19684172)
chr3 (166-308)||(6718576-6718718)
chr3 (166-552)||(37408344-37408737)
chr3 (166-556)||(7762151-7762548)
chr3 (166-556)||(7764353-7764747)
chr3 (166-556)||(9581168-9581565)
chr3 (3-140)||(2671189-2671328)
chr3 (166-556)||(5236343-5236739)
chr3 (166-444)||(39153358-39153644)
chr3 (274-444)||(34491212-34491383)
chr3 (3-91)||(8477790-8477878)
chr3 (274-447)||(49199462-49199638)
chr3 (274-440)||(4569952-4570120)
chr3 (274-444)||(29196383-29196555)
chr3 (166-444)||(40734383-40734669)
chr3 (166-444)||(760732-761018)
chr3 (274-444)||(44700476-44700646)
chr3 (166-444)||(32744433-32744709)
chr3 (274-447)||(43401794-43401970)
chr3 (166-552)||(40735268-40735660)
chr3 (166-444)||(29682244-29682530)
chr3 (207-444)||(44331470-44331716)
chr3 (166-433)||(22835010-22835285)
chr3 (278-447)||(30236129-30236299)
chr3 (405-557)||(10067439-10067592)
chr3 (166-554)||(51398699-51399094)
chr3 (274-447)||(43403737-43403913)
chr3 (274-440)||(6095600-6095767)
chr3 (8-141)||(10208908-10209042)
chr3 (3-96)||(8738647-8738740)
chr3 (3-96)||(9090885-9090978)
chr3 (276-444)||(31314447-31314616)
chr3 (274-440)||(41819523-41819691)
chr3 (4-91)||(4598894-4598981)
chr3 (4-91)||(4601115-4601202)
chr3 (8-91)||(10058157-10058240)
chr3 (8-91)||(10060379-10060462)
chr3 (8-91)||(10062601-10062684)
chr3 (8-91)||(10064823-10064906)
chr3 (4-91)||(25637138-25637225)
chr3 (166-556)||(29810753-29811150)
chr3 (274-440)||(54593704-54593871)
chr3 (3-91)||(7167670-7167758)
chr3 (8-91)||(10055935-10056018)
chr3 (8-91)||(10067045-10067128)
chr3 (8-91)||(45282695-45282778)
chr3 (166-444)||(16498915-16499200)
chr3 (3-69)||(40372380-40372446)
chr3 (274-440)||(46860474-46860642)
chr3 (4-81)||(6716210-6716287)
chr3 (4-81)||(6718394-6718471)
chr3 (3-91)||(27352205-27352293)
chr3 (8-91)||(10211108-10211191)
chr3 (274-433)||(53921511-53921671)
chr3 (274-444)||(29813063-29813234)
chr3 (276-433)||(32891105-32891264)
chr3 (8-91)||(3617163-3617246)
chr3 (332-447)||(40913352-40913467)
chr3 (293-431)||(46173377-46173515)
chr3 (257-444)||(9666463-9666659)
chr3 (3-91)||(28503443-28503530)
chr3 (274-444)||(23391906-23392077)
chr3 (277-442)||(47304254-47304420)
chr3 (274-402)||(51352150-51352278)
chr3 (3-91)||(28501276-28501363)
chr3 (334-440)||(55301972-55302079)
chr3 (241-346)||(5433971-5434086)
chr3 (3-65)||(32475885-32475947)
chr3 (3-65)||(32480743-32480805)
chr3 (3-64)||(2672543-2672604)
chr3 (3-64)||(8512642-8512703)
chr3 (3-64)||(8517522-8517583)
chr3 (3-64)||(18656843-18656904)
chr3 (3-64)||(22172786-22172847)
chr3 (274-403)||(36018852-36018982)
chr3 (3-64)||(2676699-2676760)
chr3 (3-64)||(24968519-24968580)
chr3 (102-141)||(45282809-45282848)
chr3 (279-391)||(4055813-4055926)
chr3 (8-73)||(7782538-7782603)
chr3 (3-71)||(1306411-1306479)
chr3 (219-444)||(23410326-23410561)
chr3 (286-345)||(28253363-28253423)
chr3 (4-63)||(800811-800870)
chr3 (332-391)||(4075520-4075581)
chr3 (514-556)||(9634707-9634750)
chr3 (374-432)||(27305719-27305777)
chr3 (166-216)||(7782375-7782424)
chr3 (9-71)||(23198337-23198399)
chr3 (9-71)||(23200536-23200598)
chr3 (294-347)||(25517069-25517121)
chr3 (373-440)||(2075076-2075143)
chr3 (294-346)||(4386875-4386926)
[»] chr6 (79 HSPs)
chr6 (7-576)||(27647596-27648157)
chr6 (166-576)||(16554762-16555173)
chr6 (166-576)||(16631318-16631729)
chr6 (173-576)||(16653012-16653416)
chr6 (166-576)||(16578382-16578793)
chr6 (166-576)||(16616587-16616998)
chr6 (166-560)||(25421198-25421595)
chr6 (166-560)||(6027141-6027535)
chr6 (166-539)||(411994-412369)
chr6 (166-557)||(34166973-34167366)
chr6 (166-563)||(3072636-3073036)
chr6 (166-560)||(33341982-33342380)
chr6 (166-557)||(34164751-34165144)
chr6 (166-563)||(6097326-6097717)
chr6 (245-557)||(13153886-13154201)
chr6 (166-563)||(2171406-2171814)
chr6 (166-556)||(31404561-31404957)
chr6 (166-534)||(5406109-5406481)
chr6 (166-534)||(5410434-5410806)
chr6 (166-556)||(5413281-5413675)
chr6 (166-556)||(16452214-16452612)
chr6 (166-558)||(30834418-30834819)
chr6 (166-539)||(33160254-33160636)
chr6 (166-556)||(9182917-9183314)
chr6 (274-440)||(21588931-21589098)
chr6 (274-440)||(21593664-21593831)
chr6 (345-556)||(5408956-5409164)
chr6 (274-447)||(3808701-3808877)
chr6 (277-440)||(17758026-17758191)
chr6 (274-440)||(2972940-2973107)
chr6 (166-444)||(16568928-16569193)
chr6 (274-440)||(17762990-17763158)
chr6 (186-440)||(28137409-28137671)
chr6 (3-119)||(5266432-5266548)
chr6 (3-91)||(5674354-5674442)
chr6 (276-440)||(26830124-26830289)
chr6 (166-444)||(26954283-26954568)
chr6 (4-91)||(33342475-33342562)
chr6 (8-91)||(34166796-34166879)
chr6 (274-440)||(22424826-22424995)
chr6 (8-98)||(25420926-25421016)
chr6 (8-98)||(25421020-25421110)
chr6 (277-440)||(5043630-5043795)
chr6 (4-91)||(6136335-6136422)
chr6 (8-91)||(13150979-13151062)
chr6 (8-91)||(16554583-16554666)
chr6 (8-91)||(16578889-16578972)
chr6 (8-91)||(16616408-16616491)
chr6 (8-91)||(16631139-16631222)
chr6 (8-91)||(34164574-34164657)
chr6 (8-91)||(6026963-6027046)
chr6 (8-91)||(16652826-16652909)
chr6 (308-447)||(603082-603222)
chr6 (274-444)||(33211182-33211353)
chr6 (274-391)||(3038953-3039071)
chr6 (274-391)||(4045423-4045542)
chr6 (4-73)||(411811-411881)
chr6 (166-341)||(16567091-16567265)
chr6 (3-64)||(28155195-28155256)
chr6 (328-440)||(26800642-26800755)
chr6 (6-73)||(3073148-3073215)
chr6 (3-74)||(22010313-22010383)
chr6 (3-141)||(2171838-2171979)
chr6 (3-73)||(16839137-16839206)
chr6 (3-64)||(5343879-5343940)
chr6 (3-64)||(6005821-6005882)
chr6 (8-141)||(6097741-6097877)
chr6 (3-64)||(6438898-6438959)
chr6 (3-64)||(33330057-33330118)
chr6 (3-64)||(33335554-33335615)
chr6 (3-71)||(22709452-22709520)
chr6 (3-74)||(11857373-11857443)
chr6 (3-74)||(14737190-14737260)
chr6 (3-74)||(14742050-14742120)
chr6 (2-46)||(30125141-30125185)
chr6 (526-576)||(6136165-6136216)
chr6 (102-141)||(16554697-16554736)
chr6 (102-141)||(16631253-16631292)
chr6 (102-141)||(16652940-16652979)
[»] chr5 (93 HSPs)
chr5 (166-576)||(29720256-29720667)
chr5 (166-576)||(29722416-29722827)
chr5 (166-576)||(29751024-29751436)
chr5 (166-563)||(22536169-22536563)
chr5 (166-576)||(10593151-10593564)
chr5 (166-560)||(25078013-25078410)
chr5 (166-560)||(25135982-25136379)
chr5 (166-563)||(9789101-9789500)
chr5 (166-576)||(40379985-40380397)
chr5 (166-576)||(40382196-40382608)
chr5 (166-563)||(18441521-18441924)
chr5 (166-559)||(16409367-16409764)
chr5 (166-557)||(16544302-16544697)
chr5 (166-557)||(16546524-16546919)
chr5 (166-563)||(26177775-26178175)
chr5 (166-563)||(26170666-26171055)
chr5 (166-558)||(30182474-30182872)
chr5 (166-556)||(25412647-25413042)
chr5 (166-558)||(13342946-13343344)
chr5 (166-558)||(36073927-36074327)
chr5 (204-539)||(13239674-13240016)
chr5 (166-539)||(32636709-32637088)
chr5 (293-444)||(37439161-37439313)
chr5 (274-440)||(213465-213633)
chr5 (166-444)||(13488088-13488374)
chr5 (4-141)||(22536590-22536727)
chr5 (166-556)||(30682809-30683203)
chr5 (274-440)||(40147261-40147428)
chr5 (274-442)||(28278316-28278485)
chr5 (8-91)||(29751532-29751615)
chr5 (166-444)||(42428427-42428713)
chr5 (166-440)||(31182858-31183138)
chr5 (166-403)||(39468587-39468832)
chr5 (166-444)||(28750652-28750938)
chr5 (274-440)||(5058047-5058212)
chr5 (204-444)||(8565943-8566192)
chr5 (166-461)||(33831565-33831866)
chr5 (167-444)||(533655-533940)
chr5 (3-91)||(24136271-24136359)
chr5 (4-91)||(25077831-25077918)
chr5 (4-91)||(25135800-25135887)
chr5 (166-440)||(16451966-16452247)
chr5 (8-91)||(16544123-16544206)
chr5 (8-91)||(16546345-16546428)
chr5 (8-91)||(40379807-40379890)
chr5 (8-91)||(40382018-40382101)
chr5 (274-438)||(27637615-27637781)
chr5 (166-444)||(537910-538196)
chr5 (166-444)||(42426232-42426518)
chr5 (3-91)||(27445355-27445442)
chr5 (3-91)||(27450198-27450285)
chr5 (3-91)||(43592661-43592748)
chr5 (3-91)||(43599106-43599193)
chr5 (3-91)||(43604598-43604685)
chr5 (3-91)||(43610090-43610177)
chr5 (274-391)||(13695740-13695859)
chr5 (170-440)||(3075659-3075937)
chr5 (8-91)||(10592972-10593055)
chr5 (278-444)||(38747009-38747176)
chr5 (27-91)||(35388084-35388150)
chr5 (4-73)||(29720091-29720161)
chr5 (2-64)||(30631763-30631825)
chr5 (288-440)||(16640941-16641091)
chr5 (3-96)||(31180633-31180725)
chr5 (3-91)||(1456762-1456849)
chr5 (277-391)||(9049392-9049506)
chr5 (274-440)||(27015531-27015690)
chr5 (3-62)||(37561071-37561130)
chr5 (280-442)||(316769-316933)
chr5 (3-64)||(2785777-2785838)
chr5 (3-64)||(15045095-15045156)
chr5 (364-444)||(19806454-19806534)
chr5 (4-73)||(26177592-26177661)
chr5 (3-64)||(28807200-28807261)
chr5 (3-64)||(33768586-33768647)
chr5 (3-64)||(33791718-33791779)
chr5 (3-62)||(37556249-37556308)
chr5 (3-57)||(29402674-29402728)
chr5 (328-442)||(33906028-33906144)
chr5 (4-63)||(9789624-9789683)
chr5 (4-63)||(18442048-18442107)
chr5 (27-73)||(26170506-26170552)
chr5 (166-403)||(42309973-42310218)
chr5 (9-73)||(16407772-16407836)
chr5 (9-73)||(16409208-16409272)
chr5 (3-71)||(38219837-38219905)
chr5 (328-390)||(10054867-10054929)
chr5 (166-370)||(5887487-5887699)
chr5 (4-57)||(29722278-29722332)
chr5 (359-440)||(42926977-42927058)
chr5 (3-64)||(31396614-31396675)
chr5 (3-64)||(31401471-31401532)
chr5 (376-435)||(4160702-4160762)
[»] chr1 (91 HSPs)
chr1 (166-572)||(40282269-40282676)
chr1 (166-576)||(20622102-20622514)
chr1 (166-563)||(21053850-21054248)
chr1 (166-563)||(9987094-9987492)
chr1 (166-576)||(9036310-9036721)
chr1 (166-576)||(44203526-44203938)
chr1 (166-559)||(51765280-51765684)
chr1 (166-556)||(8550670-8551070)
chr1 (273-558)||(13316236-13316521)
chr1 (166-556)||(20762557-20762950)
chr1 (166-534)||(3189216-3189590)
chr1 (166-534)||(3198033-3198407)
chr1 (166-534)||(3206872-3207246)
chr1 (166-556)||(3156751-3157147)
chr1 (166-556)||(31659123-31659520)
chr1 (166-444)||(28220223-28220509)
chr1 (274-440)||(37168297-37168465)
chr1 (166-444)||(834164-834450)
chr1 (274-440)||(13547090-13547257)
chr1 (166-552)||(44455045-44455438)
chr1 (166-444)||(4552634-4552920)
chr1 (274-447)||(42297968-42298143)
chr1 (274-556)||(49918350-49918632)
chr1 (274-440)||(13549001-13549168)
chr1 (274-444)||(28265551-28265722)
chr1 (274-440)||(29136247-29136415)
chr1 (274-440)||(47255340-47255508)
chr1 (4-89)||(20622610-20622695)
chr1 (166-444)||(28223418-28223704)
chr1 (274-440)||(7482231-7482399)
chr1 (274-440)||(11348698-11348865)
chr1 (274-440)||(31925708-31925875)
chr1 (166-556)||(37503443-37503837)
chr1 (166-444)||(3847118-3847404)
chr1 (274-444)||(37033068-37033241)
chr1 (204-556)||(37559751-37560115)
chr1 (274-442)||(19754494-19754664)
chr1 (274-420)||(23555286-23555433)
chr1 (3-91)||(24786949-24787037)
chr1 (3-91)||(24793771-24793859)
chr1 (274-440)||(47115171-47115340)
chr1 (166-444)||(196904-197191)
chr1 (274-444)||(45644351-45644523)
chr1 (274-444)||(50169207-50169378)
chr1 (166-444)||(13659333-13659619)
chr1 (8-91)||(44203347-44203430)
chr1 (274-440)||(193611-193778)
chr1 (166-403)||(1833407-1833652)
chr1 (274-436)||(34603576-34603740)
chr1 (274-444)||(50167172-50167343)
chr1 (225-444)||(46064861-46065089)
chr1 (8-63)||(9036132-9036187)
chr1 (166-444)||(13137973-13138257)
chr1 (274-444)||(19752685-19752857)
chr1 (274-385)||(41360914-41361026)
chr1 (166-420)||(15820192-15820455)
chr1 (8-73)||(24202360-24202425)
chr1 (3-64)||(25439523-25439584)
chr1 (3-64)||(39445897-39445958)
chr1 (3-64)||(41398656-41398717)
chr1 (4-71)||(21053665-21053733)
chr1 (279-405)||(22079322-22079449)
chr1 (2-73)||(9986909-9986980)
chr1 (359-440)||(28242391-28242472)
chr1 (274-444)||(30476443-30476614)
chr1 (8-73)||(40282088-40282154)
chr1 (9-139)||(51765121-51765254)
chr1 (3-64)||(1054638-1054699)
chr1 (3-64)||(25444716-25444777)
chr1 (3-64)||(44023501-44023562)
chr1 (295-440)||(927977-928123)
chr1 (166-444)||(10925108-10925397)
chr1 (277-444)||(40122193-40122363)
chr1 (166-250)||(13316518-13316601)
chr1 (3-64)||(41391001-41391062)
chr1 (3-64)||(43988073-43988134)
chr1 (328-414)||(6808507-6808595)
chr1 (288-417)||(3460710-3460841)
chr1 (328-402)||(16455676-16455750)
chr1 (274-347)||(37879005-37879079)
chr1 (277-346)||(8871143-8871213)
chr1 (359-440)||(37876767-37876848)
chr1 (279-378)||(12318585-12318685)
chr1 (296-360)||(48382441-48382505)
chr1 (3-71)||(19361037-19361105)
chr1 (292-355)||(32736952-32737015)
chr1 (292-355)||(35109493-35109556)
chr1 (328-402)||(5459961-5460035)
chr1 (359-420)||(36683766-36683828)
chr1 (288-404)||(37282728-37282846)
chr1 (517-556)||(10925464-10925504)
[»] chr8 (84 HSPs)
chr8 (166-576)||(3439396-3439805)
chr8 (166-576)||(25689847-25690259)
chr8 (166-557)||(15290417-15290810)
chr8 (166-557)||(15470786-15471179)
chr8 (166-557)||(42575207-42575599)
chr8 (166-548)||(2627627-2628012)
chr8 (166-558)||(31218142-31218541)
chr8 (166-556)||(34254217-34254611)
chr8 (166-556)||(17982538-17982935)
chr8 (166-556)||(34256393-34256787)
chr8 (166-558)||(19945243-19945643)
chr8 (166-556)||(44303739-44304137)
chr8 (166-556)||(42498079-42498477)
chr8 (166-556)||(1746105-1746501)
chr8 (166-444)||(43036308-43036594)
chr8 (166-534)||(12702542-12702921)
chr8 (166-552)||(15212671-15213064)
chr8 (166-556)||(33352035-33352432)
chr8 (167-556)||(27811164-27811560)
chr8 (274-440)||(4283524-4283691)
chr8 (274-440)||(42434992-42435159)
chr8 (172-552)||(4731549-4731936)
chr8 (3-91)||(36979802-36979890)
chr8 (276-444)||(40321082-40321251)
chr8 (166-444)||(6598857-6599143)
chr8 (166-444)||(6674310-6674596)
chr8 (8-141)||(15290273-15290407)
chr8 (8-141)||(15470642-15470776)
chr8 (274-440)||(18655400-18655567)
chr8 (166-444)||(3303667-3303953)
chr8 (1-89)||(3439209-3439297)
chr8 (3-91)||(4759658-4759746)
chr8 (3-91)||(30656070-30656158)
chr8 (4-91)||(25689666-25689753)
chr8 (166-556)||(30143227-30143622)
chr8 (274-444)||(40221745-40221916)
chr8 (274-434)||(18141821-18141981)
chr8 (3-133)||(33037411-33037543)
chr8 (274-403)||(30291606-30291737)
chr8 (274-434)||(1292471-1292631)
chr8 (8-91)||(42575696-42575779)
chr8 (278-444)||(41366612-41366778)
chr8 (274-391)||(9765745-9765863)
chr8 (3-91)||(18852751-18852839)
chr8 (169-444)||(5689159-5689442)
chr8 (277-414)||(40328782-40328922)
chr8 (3-73)||(1261539-1261609)
chr8 (277-403)||(44353796-44353923)
chr8 (3-91)||(18870145-18870233)
chr8 (276-447)||(10930193-10930365)
chr8 (278-440)||(11383989-11384152)
chr8 (166-444)||(1345368-1345654)
chr8 (186-440)||(4162405-4162663)
chr8 (274-440)||(8965692-8965859)
chr8 (349-444)||(4743211-4743306)
chr8 (274-385)||(19491755-19491867)
chr8 (3-64)||(10683863-10683924)
chr8 (328-435)||(18106087-18106191)
chr8 (3-74)||(25327788-25327858)
chr8 (3-72)||(7289552-7289620)
chr8 (328-435)||(10015136-10015241)
chr8 (3-64)||(35745793-35745854)
chr8 (333-440)||(3073875-3073981)
chr8 (3-91)||(6311724-6311811)
chr8 (3-91)||(10688723-10688810)
chr8 (166-345)||(10929686-10929871)
chr8 (274-433)||(3772192-3772352)
chr8 (359-429)||(8153844-8153914)
chr8 (3-64)||(39784449-39784510)
chr8 (3-71)||(26288324-26288392)
chr8 (3-71)||(26301581-26301649)
chr8 (3-71)||(26313575-26313643)
chr8 (359-440)||(4733792-4733873)
chr8 (2-63)||(2627442-2627503)
chr8 (279-346)||(1822297-1822365)
chr8 (279-346)||(1856742-1856810)
chr8 (186-360)||(41364927-41365110)
chr8 (102-141)||(3439330-3439369)
chr8 (298-416)||(11712024-11712145)
chr8 (298-346)||(6813771-6813818)
chr8 (328-403)||(7597669-7597745)
chr8 (359-391)||(10929874-10929906)
chr8 (279-350)||(29796413-29796485)
chr8 (497-533)||(32902096-32902132)
[»] chr2 (59 HSPs)
chr2 (166-576)||(6266583-6266993)
chr2 (166-560)||(12647265-12647660)
chr2 (254-560)||(13655908-13656220)
chr2 (166-559)||(32289457-32289853)
chr2 (166-559)||(4484211-4484614)
chr2 (166-564)||(30833230-30833638)
chr2 (166-558)||(4503017-4503415)
chr2 (166-556)||(45099640-45100036)
chr2 (166-556)||(36205551-36205946)
chr2 (166-552)||(5723146-5723537)
chr2 (166-556)||(36987961-36988358)
chr2 (166-444)||(2334414-2334700)
chr2 (274-556)||(6594890-6595175)
chr2 (204-539)||(29867791-29868133)
chr2 (167-556)||(38312126-38312522)
chr2 (204-444)||(34139767-34140017)
chr2 (274-440)||(45726929-45727096)
chr2 (166-444)||(723741-724027)
chr2 (166-444)||(14633822-14634109)
chr2 (166-420)||(42362237-42362500)
chr2 (166-444)||(11151588-11151874)
chr2 (166-444)||(11690386-11690672)
chr2 (3-91)||(9295986-9296074)
chr2 (3-91)||(11098511-11098599)
chr2 (3-91)||(14291913-14292001)
chr2 (204-556)||(17057255-17057615)
chr2 (204-556)||(17085238-17085598)
chr2 (274-440)||(35446885-35447052)
chr2 (274-444)||(36318006-36318177)
chr2 (274-444)||(36773562-36773733)
chr2 (274-440)||(26353184-26353351)
chr2 (274-438)||(1631735-1631900)
chr2 (279-440)||(33648176-33648340)
chr2 (4-91)||(12647755-12647842)
chr2 (274-442)||(24398055-24398228)
chr2 (274-435)||(42288117-42288278)
chr2 (274-444)||(33162447-33162618)
chr2 (274-405)||(13121769-13121899)
chr2 (366-444)||(17450671-17450748)
chr2 (328-440)||(17490149-17490261)
chr2 (274-391)||(7815323-7815441)
chr2 (274-444)||(11067305-11067476)
chr2 (3-71)||(25410073-25410141)
chr2 (3-64)||(19344824-19344885)
chr2 (328-440)||(7451173-7451284)
chr2 (367-444)||(39284930-39285007)
chr2 (3-64)||(19349682-19349743)
chr2 (3-71)||(3492184-3492252)
chr2 (9-73)||(32289279-32289343)
chr2 (3-59)||(39811601-39811657)
chr2 (166-308)||(39284770-39284920)
chr2 (9-73)||(4484728-4484792)
chr2 (278-403)||(14202450-14202569)
chr2 (3-71)||(30833046-30833114)
chr2 (8-64)||(32247188-32247244)
chr2 (373-417)||(42412118-42412162)
chr2 (283-441)||(24197906-24198065)
chr2 (332-429)||(28671989-28672088)
chr2 (292-344)||(28770730-28770781)
[»] chr7 (99 HSPs)
chr7 (166-576)||(20343789-20344201)
chr7 (166-560)||(18392075-18392470)
chr7 (166-560)||(18388639-18389034)
chr7 (8-560)||(32060201-32060759)
chr7 (166-506)||(24789733-24790075)
chr7 (166-576)||(6594420-6594832)
chr7 (166-576)||(6592202-6592614)
chr7 (166-571)||(43504025-43504431)
chr7 (166-559)||(39731261-39731656)
chr7 (170-552)||(35853804-35854194)
chr7 (166-344)||(1562103-1562278)
chr7 (166-557)||(25766842-25767237)
chr7 (166-559)||(48408687-48409092)
chr7 (166-556)||(29990940-29991335)
chr7 (351-560)||(1560544-1560757)
chr7 (166-556)||(23554925-23555323)
chr7 (166-555)||(4178660-4179054)
chr7 (204-556)||(25615785-25616137)
chr7 (274-444)||(34310712-34310884)
chr7 (166-444)||(14069830-14070116)
chr7 (166-444)||(14379858-14380144)
chr7 (186-539)||(19502083-19502443)
chr7 (4-141)||(20343625-20343762)
chr7 (166-444)||(30024729-30025015)
chr7 (3-91)||(2058393-2058481)
chr7 (274-552)||(27347817-27348095)
chr7 (274-440)||(22269973-22270140)
chr7 (274-444)||(41317431-41317602)
chr7 (3-91)||(24789551-24789639)
chr7 (204-432)||(47673953-47674189)
chr7 (166-556)||(18126529-18126928)
chr7 (274-440)||(8359316-8359485)
chr7 (166-444)||(41649008-41649292)
chr7 (274-436)||(6431971-6432134)
chr7 (166-556)||(43864129-43864526)
chr7 (166-444)||(38671219-38671505)
chr7 (166-556)||(26417201-26417598)
chr7 (274-438)||(29608737-29608902)
chr7 (166-554)||(48489316-48489711)
chr7 (172-420)||(48491470-48491727)
chr7 (3-133)||(20357152-20357284)
chr7 (166-403)||(4586046-4586291)
chr7 (204-444)||(31732966-31733215)
chr7 (274-440)||(3258995-3259162)
chr7 (274-440)||(4508707-4508874)
chr7 (274-444)||(8153342-8153513)
chr7 (328-440)||(32358055-32358167)
chr7 (166-444)||(47676133-47676419)
chr7 (274-440)||(48599335-48599502)
chr7 (166-444)||(1113542-1113828)
chr7 (274-440)||(4253529-4253697)
chr7 (3-133)||(21640167-21640299)
chr7 (8-91)||(6592709-6592792)
chr7 (8-91)||(6594925-6595008)
chr7 (8-91)||(18389132-18389215)
chr7 (8-91)||(18392568-18392651)
chr7 (292-447)||(2390301-2390456)
chr7 (2-91)||(1562375-1562464)
chr7 (274-435)||(2360978-2361140)
chr7 (166-440)||(31105394-31105676)
chr7 (3-91)||(1533028-1533116)
chr7 (274-444)||(36146405-36146576)
chr7 (501-576)||(24790230-24790303)
chr7 (277-444)||(495980-496148)
chr7 (293-433)||(23565069-23565210)
chr7 (166-276)||(24514934-24515043)
chr7 (274-430)||(23343975-23344130)
chr7 (299-443)||(2759195-2759339)
chr7 (274-440)||(4510549-4510716)
chr7 (274-440)||(4512391-4512558)
chr7 (3-73)||(21646448-21646518)
chr7 (279-435)||(22328395-22328556)
chr7 (3-64)||(21811863-21811924)
chr7 (3-64)||(24023943-24024004)
chr7 (274-440)||(36574517-36574683)
chr7 (3-74)||(12397311-12397381)
chr7 (3-74)||(12406663-12406733)
chr7 (328-447)||(6359946-6360065)
chr7 (3-64)||(24260945-24261006)
chr7 (3-64)||(24265801-24265862)
chr7 (274-345)||(24525992-24526065)
chr7 (4-73)||(43504526-43504595)
chr7 (339-440)||(18396384-18396486)
chr7 (359-444)||(24525499-24525584)
chr7 (274-444)||(12097864-12098027)
chr7 (359-433)||(31518988-31519063)
chr7 (3-59)||(4873541-4873597)
chr7 (9-73)||(39731064-39731128)
chr7 (3-64)||(16880475-16880536)
chr7 (3-64)||(16885330-16885391)
chr7 (7-71)||(18409206-18409270)
chr7 (3-71)||(18414082-18414150)
chr7 (367-442)||(30814530-30814605)
chr7 (3-59)||(31109195-31109251)
chr7 (274-383)||(31518795-31518905)
chr7 (94-141)||(2058322-2058371)
chr7 (293-346)||(28617182-28617234)
chr7 (397-441)||(28485811-28485854)
chr7 (7-71)||(48408527-48408591)
[»] chr4 (94 HSPs)
chr4 (166-576)||(8395498-8395910)
chr4 (168-560)||(8393291-8393684)
chr4 (166-560)||(7124794-7125191)
chr4 (166-560)||(7122575-7122972)
chr4 (166-571)||(31495177-31495593)
chr4 (166-545)||(5138183-5138565)
chr4 (166-545)||(5135957-5136340)
chr4 (166-559)||(13992174-13992569)
chr4 (166-556)||(56178522-56178919)
chr4 (166-534)||(29999719-30000088)
chr4 (166-556)||(48142927-48143330)
chr4 (166-556)||(52095248-52095645)
chr4 (166-556)||(5369968-5370369)
chr4 (166-556)||(9927345-9927740)
chr4 (278-447)||(2209717-2209889)
chr4 (166-552)||(34570304-34570697)
chr4 (166-444)||(12739547-12739833)
chr4 (274-437)||(41964415-41964580)
chr4 (3-140)||(29760995-29761134)
chr4 (166-442)||(37740511-37740794)
chr4 (166-444)||(5429564-5429850)
chr4 (169-444)||(47038408-47038689)
chr4 (274-444)||(36463386-36463557)
chr4 (274-440)||(40632445-40632612)
chr4 (166-444)||(5871705-5871991)
chr4 (166-444)||(26175633-26175919)
chr4 (274-447)||(26364236-26364410)
chr4 (276-444)||(46147388-46147557)
chr4 (274-440)||(46703500-46703669)
chr4 (166-556)||(52082549-52082940)
chr4 (274-440)||(12073392-12073560)
chr4 (276-447)||(12119540-12119714)
chr4 (293-444)||(12743922-12744073)
chr4 (293-444)||(12745311-12745462)
chr4 (274-440)||(41639426-41639593)
chr4 (274-440)||(37229722-37229890)
chr4 (274-444)||(48893635-48893810)
chr4 (274-447)||(54883020-54883194)
chr4 (274-442)||(36994524-36994693)
chr4 (277-440)||(379383-379548)
chr4 (292-440)||(6655975-6656123)
chr4 (4-91)||(7122392-7122479)
chr4 (166-403)||(12747794-12748039)
chr4 (170-442)||(54199906-54200185)
chr4 (274-440)||(8648139-8648306)
chr4 (274-420)||(8665408-8665556)
chr4 (274-444)||(45687179-45687351)
chr4 (274-440)||(6542180-6542349)
chr4 (257-444)||(52467351-52467546)
chr4 (281-440)||(5207843-5208003)
chr4 (3-69)||(24742387-24742453)
chr4 (274-444)||(27416962-27417133)
chr4 (328-440)||(50673848-50673960)
chr4 (278-447)||(50262694-50262865)
chr4 (274-403)||(4587958-4588089)
chr4 (8-91)||(5135779-5135862)
chr4 (8-91)||(5138005-5138088)
chr4 (4-63)||(7124614-7124673)
chr4 (293-401)||(12744087-12744195)
chr4 (274-401)||(12745476-12745604)
chr4 (274-432)||(35662441-35662600)
chr4 (3-91)||(56141636-56141723)
chr4 (8-82)||(8393111-8393185)
chr4 (274-440)||(31474150-31474318)
chr4 (289-435)||(26699447-26699596)
chr4 (3-91)||(51520839-51520926)
chr4 (8-82)||(8395320-8395394)
chr4 (359-539)||(29254580-29254758)
chr4 (274-391)||(24969112-24969230)
chr4 (219-440)||(51337000-51337231)
chr4 (1-64)||(3814421-3814484)
chr4 (3-74)||(9224023-9224093)
chr4 (3-74)||(9228810-9228880)
chr4 (3-74)||(18712379-18712449)
chr4 (3-64)||(5733061-5733122)
chr4 (2-71)||(13992686-13992755)
chr4 (3-64)||(18856124-18856185)
chr4 (3-64)||(45347441-45347502)
chr4 (3-64)||(45356922-45356983)
chr4 (257-444)||(3913424-3913618)
chr4 (348-444)||(13009441-13009536)
chr4 (4-63)||(31495717-31495776)
chr4 (237-276)||(35369614-35369653)
chr4 (328-416)||(33989899-33989989)
chr4 (278-346)||(48142473-48142542)
chr4 (166-276)||(13009604-13009714)
chr4 (3-71)||(28468102-28468170)
chr4 (274-362)||(41639263-41639353)
chr4 (288-346)||(1983252-1983309)
chr4 (279-360)||(44967910-44967992)
chr4 (292-343)||(5349929-5349980)
chr4 (328-414)||(33089933-33090021)
chr4 (166-230)||(52093885-52093947)
chr4 (274-360)||(55085445-55085532)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (166-576)||(2466-2878)
scaffold0565 (4-91)||(2973-3060)
[»] scaffold0674 (2 HSPs)
scaffold0674 (166-560)||(3605-4000)
scaffold0674 (4-91)||(4098-4185)
[»] scaffold0137 (2 HSPs)
scaffold0137 (166-576)||(6167-6581)
scaffold0137 (8-91)||(5989-6072)
[»] scaffold0491 (4 HSPs)
scaffold0491 (166-559)||(11042-11445)
scaffold0491 (166-559)||(8616-9019)
scaffold0491 (1-139)||(9045-9186)
scaffold0491 (1-82)||(11550-11631)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (166-552)||(434418-434812)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (166-558)||(802-1200)
[»] scaffold0286 (3 HSPs)
scaffold0286 (232-563)||(11508-11855)
scaffold0286 (3-141)||(22064-22205)
scaffold0286 (166-224)||(22229-22286)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (219-552)||(114539-114881)
scaffold0016 (292-355)||(102450-102513)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (408-560)||(1-154)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (274-556)||(20301-20583)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (274-440)||(18004-18171)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (274-440)||(7327-7494)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (166-444)||(149094-149380)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (298-440)||(10515-10656)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (3-139)||(17556-17695)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (3-74)||(34678-34748)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (3-64)||(760-821)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (3-64)||(3461-3522)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (3-64)||(13908-13969)
scaffold0197 (3-65)||(18788-18850)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (3-64)||(176574-176635)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (3-74)||(8098-8168)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (3-73)||(1863-1932)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (3-73)||(148568-148637)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (278-386)||(80338-80447)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (328-403)||(27480-27556)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 116)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 576
Target Start/End: Original strand, 54634835 - 54635428
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatc----------------- 86  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||                     
T  54634835 tgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcttttcttgggtggtacgcaaatcatgacacgattgggaaa 54634934  T
Q  87 ---gtgacgtgattgcttcagagggaggctagtataaagtgttcttgtgcagatttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgggaaatcaaaggga 183  Q
       |||||  ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||                        ||||||||||||||||||    
T  54634935 atcgtgacacgattgcaacagaggaaggctagtataaagtgttcttgtgcagatttgaagagggagttggaagagagagagacttgggaaatcaaaggga 54635034  T
Q  184 gaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagat 283  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54635035 gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 54635134  T
Q  284 tgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtgga 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635135 tgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtgga 54635234  T
Q  384 ttggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttat 482  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635235 ttggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttat 54635334  T
Q  483 cttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635335 cttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 54635428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 6716392 - 6716805
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6716392 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 6716491  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716492 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 6716591  T
Q  366 gaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttct 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716592 gaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttct 6716691  T
Q  465 tcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtttt-gttgattattgcttgcacaca 562  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6716692 tcttccctccccttttatcttgtgattgtatttttgagtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttggttgattattgcttgcacaca 6716791  T
Q  563 cactttgtttggtg 576  Q
    ||||||||||||||    
T  6716792 cactttgtttggtg 6716805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 45282875 - 45283291
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  45282875 cttggggaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgcaaagagagaatcat 45282974  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc---ttttg 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  45282975 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccctttttttg 45283074  T
Q  363 taagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgtt 460  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45283075 taagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatctc-ttggtgcttttgtt 45283173  T
Q  461 ttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgca 558  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283174 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcactagtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgca 45283273  T
Q  559 cacacactttgtttggtg 576  Q
    || |||||||||||||||    
T  45283274 caaacactttgtttggtg 45283291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 166 - 560
Target Start/End: Original strand, 3617342 - 3617739
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3617342 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 3617440  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3617441 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa 3617540  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  3617541 agaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttt 3617639  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 560  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3617640 tcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 3617739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 25637321 - 25637736
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  25637321 cttgggaaatcaaaggg-gtatctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcat 25637417  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25637418 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa 25637517  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgtttt 462  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25637518 agaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgcttttgtttt 25637617  T
Q  463 cttcttccctctcct--tttatcttgtgattg--tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgca 558  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  25637618 cttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcctgcttgca 25637717  T
Q  559 c-acacactttgtttggtg 576  Q
    | | |||||||||| ||||    
T  25637718 caatacactttgttaggtg 25637736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 166 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 4601019 - 4600638
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4601019 cttgggaaatcaaaggga-aagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 4600923  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  4600922 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtattccttttgta 4600823  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  4600822 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgtt 4600724  T
Q  461 ttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 545  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4600723 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgatt-tgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttg 4600638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 166 - 563
Target Start/End: Original strand, 800983 - 801379
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  800983 cttgggaaatcaaaggaagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatca 801081  T
Q  265 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatccctttt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  801082 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctctttt 801180  T
Q  362 gtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgtt 460  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  801181 gtaagaactcattgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgtt 801279  T
Q  461 ttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttct-cacttgtttcctagattagatctaggtg--gtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  801280 ttcttcttccctctccttttatc------ttgtgtattgtgtttttccacttgtttcctagattagatctaggtgctgttttttgttgattattgcttgc 801373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 4598798 - 4598405
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  4598798 cttgggaaatcaaaggga-aagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgtagagag--aatcat 4598702  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  4598701 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta 4598602  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  4598601 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgtt 4598503  T
Q  461 ttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  4598502 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttattgtttcttgcttgc 4598405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Original strand, 10211288 - 10211681
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10211288 cttgggaaatcaaaggga-aagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 10211384  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  10211385 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta 10211484  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  10211485 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgtt 10211583  T
Q  461 ttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10211584 ttcatcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 10211681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Original strand, 10209068 - 10209461
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10209068 cttgggaaatcaaaggga-aagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 10209164  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||     
T  10209165 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtagtccttttgta 10209264  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  10209265 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgtt 10209363  T
Q  461 ttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10209364 ttcatcttccctctccttgtttatcttgtgattgt-tgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 10209461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Original strand, 10056112 - 10056505
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10056112 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 10056208  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  10056209 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta 10056308  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  10056309 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgtt 10056407  T
Q  461 ttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||   |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  10056408 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgc 10056505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Original strand, 10058334 - 10058727
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10058334 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 10058430  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  10058431 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta 10058530  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  10058531 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgtt 10058629  T
Q  461 ttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||   |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  10058630 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgc 10058727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Original strand, 10060556 - 10060949
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10060556 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 10060652  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  10060653 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta 10060752  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  10060753 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgtt 10060851  T
Q  461 ttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||   |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  10060852 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgc 10060949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Original strand, 10062778 - 10063171
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10062778 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 10062874  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  10062875 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta 10062974  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  10062975 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgtt 10063073  T
Q  461 ttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||   |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  10063074 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgc 10063171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Original strand, 10065000 - 10065393
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10065000 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 10065096  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  10065097 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta 10065196  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  10065197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgtt 10065295  T
Q  461 ttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||   |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  10065296 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgc 10065393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 237 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 7780208 - 7779880
Alignment:
Q  237 tgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaat 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  7780208 tgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttcgtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaat 7780110  T
Q  336 ttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 434  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  7780109 ttcttgtaaccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagtggg 7780010  T
Q  435 tgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtg-tttctcacttgtttcctagattagatctaggt 533  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7780009 tgaacaatctc-ttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgtattgtgttttttcacttgtttcctagattagatctaggt 7779911  T
Q  534 ggtg-ttttgttgattattgcttgcacacac 563  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7779910 gctgtttttgttgattattgcttgcacacac 7779880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 166 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 23200420 - 23200020
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  23200420 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 23200322  T
Q  265 ttgagtgtcttg------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 355  Q
    ||||||||||||      |||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23200321 ttgagtgtcttgttcttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 23200223  T
Q  356 ccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 454  Q
      |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||      
T  23200222 t-ttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtc 23200126  T
Q  455 tttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctca-cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgc 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  23200125 tttgttttcttcttccctctccttttatcttatgcttgtggtttgtgtttttcattttgtttcctagattagatctaggtgttttattgttgattattgc 23200026  T
Q  554 ttgcac 559  Q
    ||||||    
T  23200025 ttgcac 23200020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 23198221 - 23197823
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  23198221 cttggaaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 23198123  T
Q  265 ttgagtgtcttg------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 355  Q
    ||||||||||||      |||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23198122 ttgagtgtcttgttcttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttttttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 23198024  T
Q  356 ccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 454  Q
      |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||      
T  23198023 t-ttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtc 23197927  T
Q  455 tttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctca-cttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgc 553  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||    
T  23197926 tttgttttcctcttctctctccttttatcttgtgcttgtggtttgtgtttttcattttgtttcctagattagatctatgtgttttattgttgattattgc 23197827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 166 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 5258427 - 5258028
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  5258427 cttgagaaatcaaagggagaaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 5258330  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgta 353  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5258329 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgta 5258231  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  5258230 tctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaa--tctttggtg 5258134  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
      |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5258133 tgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggtttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattat 5258036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 9636410 - 9636010
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  9636410 cttgggaaatcaaaggaagaaactttagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 9636312  T
Q  265 ttgagtgtcttggt-------gagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-ttttgta 353  Q
    ||||||||||||||       ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  9636311 ttgagtgtcttggtcattggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccttttgta 9636213  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9636212 tct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctctt-ggtg 9636115  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
      |||||||   ||| | ||| |||||||||||||| |||||  || || || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9636114 tgtttgtttctctctgctctc-ccttttatcttgtgcttgtgatttatgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattat 9636016  T
Q  551 tgcttg 556  Q
    ||||||    
T  9636015 tgcttg 9636010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 166 - 365
Target Start/End: Original strand, 10067222 - 10067419
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10067222 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 10067318  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10067319 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta 10067418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 166 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 5260606 - 5260206
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  5260606 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 5260509  T
Q  265 ttgagtgtcttggt-------gagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgta 353  Q
    ||||||||||||||       |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5260508 ttgagtgtcttggtcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgta 5260410  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  5260409 tctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccaaagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaa--tctttggtg 5260313  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
      |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  ||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5260312 tgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggtttgtgcttttcactttgattcctaaattagatctaggtgttgttattgttgattat 5260215  T
Q  551 tgcttgcac 559  Q
    |||||||||    
T  5260214 tgcttgcac 5260206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 45095050 - 45095445
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  45095050 cttgggaaatcaaaagaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 45095147  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 355  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  45095148 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 45095246  T
Q  356 ccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 454  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |      
T  45095247 tcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggcgta 45095343  T
Q  455 tttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 552  Q
    |||||||   |||   ||||||||||||||| || |||||  ||||||||  | | ||| ||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  45095344 tttgttt--ctctattctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgttttactctttgattcatagattagatctatgtgctgttattgttgattattg 45095441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 19684172 - 19683774
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  19684172 cttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 19684075  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgta 353  Q
    ||||| |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19684074 attgaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgta 19683976  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19683975 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtg 19683879  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcacttgt-ttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19683878 tgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcacttttattcctagattagatctaggtgctgttattgttgatta 19683781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 166 - 308
Target Start/End: Original strand, 6718576 - 6718718
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6718576 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 6718675  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718676 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt 6718718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 166 - 552
Target Start/End: Original strand, 37408344 - 37408737
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||   ||| |||||| |    
T  37408344 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttagtgagtgaaaatta 37408441  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtat 354  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37408442 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat 37408540  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  37408541 ctcttt-gtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaa--tctttggtgt 37408637  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-tattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
     |||||||   ||||  ||||||||||||||| || ||||| | | ||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  37408638 gtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtgatttagtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattat 37408735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 7762151 - 7762548
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| || |  |||||||||  ||| ||||||||    
T  7762151 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaatattgtgaacaccttggtgagtgaaaatca 7762248  T
Q  265 ttgagtgtctt-------ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtat 354  Q
    |||||||||||       |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7762249 ttgagtgtcttattcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtat 7762347  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||     
T  7762348 ctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctatgatgt 7762444  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
     |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7762445 gtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctaaattagatctaggtgttgttattgttgattat 7762542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 7764353 - 7764747
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||| | |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  7764353 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagagttgagggt-ctttgattagatt-tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 7764450  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatc 355  Q
    ||||||||||||       ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7764451 ttgagtgtcttgttcattggtgaga--gggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaactcttttgtatc 7764547  T
Q  356 ccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 454  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||      
T  7764548 tcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatttagaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtg 7764644  T
Q  455 tttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattatt 551  Q
    |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7764645 tttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgtttgtggttttgtgcttttcactttgattccaagattagatctaggtgctgttattgttgattatt 7764742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 9581168 - 9581565
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  9581168 cttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 9581265  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtat 354  Q
    |||||||||||||       ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  9581266 attgagtgtcttgttcatttgtgggattcggaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgtat 9581364  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||     
T  9581365 cccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttgatgt 9581461  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
     |||||||   ||||  |||||| ||||| ||||| |||| || ||||| || |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9581462 gtttgtttctctctt--ctctccctttattttgtgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcatagattagatctaggtgctgttattgttgattat 9581559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Original strand, 2671189 - 2671328
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgattgcttc 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  2671189 ttgggaaatcgtgacacgatttagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacacgatttcttc 2671288  T
Q  103 agagggaggctagtataaa--gtgttcttgtgcagatttg 140  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  2671289 agaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagatttg 2671328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 5236739 - 5236343
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||| ||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  5236739 cttgggaaatcgaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 5236642  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  5236641 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 5236543  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    || |||| |||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||     
T  5236542 tctcttt-gtaagaactcattgataatggattcgagagatcaatctttccccagattaggtcaa-tttggaccaaactgggtcaacaa--tctttggtgt 5236447  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta-ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
     ||||  ||| |||   ||||||||||||||| || ||||| | ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||    
T  5236446 gtttg--ttcctctcttctctccttttatcttttgcttgtggatttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggagctcttattgttgattat 5236349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 39153644 - 39153358
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||  |||||||    
T  39153644 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgaatgaaaatc 39153547  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||    
T  39153546 attgagtgtcttgttcatgtgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgta 39153448  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  39153447 tcccttta-taagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 39153358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Original strand, 34491212 - 34491383
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  34491212 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 34491309  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34491310 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatct 34491383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 8477878 - 8477790
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477878 ttgggaaatcgtgacacgattgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 8477790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 274 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 49199638 - 49199462
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  49199638 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 49199541  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 447  Q
    || |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49199540 tcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagactaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 49199462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 4569952 - 4570120
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  4569952 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 4570049  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4570050 cattgatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttggaccgaactgggtcaaca 4570120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 29196555 - 29196383
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  29196555 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 29196457  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29196456 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29196383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Original strand, 40734383 - 40734669
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggaga-aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaat 262  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| ||||||    
T  40734383 cttggaaaatcaaagg-agataactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 40734479  T
Q  263 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgt 352  Q
    ||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | |||||    
T  40734480 cattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgt 40734578  T
Q  353 atcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40734579 atcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40734669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Original strand, 760732 - 761018
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||   |||||||||| | ||| |||||||    
T  760732 cttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattataaacaccttggatgagtgaaaatc 760829  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  760830 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tctgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 760928  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  760929 tcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaaatgggttaacaatct 761018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 44700646 - 44700476
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  44700646 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 44700549  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  44700548 ctttgatagtggattggagagatcaatctctccccacattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 44700476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 32744709 - 32744433
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||| |||  ||| ||||||||    
T  32744709 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatca 32744612  T
Q  265 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatccctttt 361  Q
    |||||| | ||| ||||||||  |||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||     
T  32744611 ttgagtattttg-tgagattgaaaaaatgggtagaaattag--tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcacttt- 32744516  T
Q  362 gtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| | || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32744515 gtaagaactctttgatagtggattgaagagataaatctatcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 32744433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 274 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 43401970 - 43401794
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||   |||| |||| |||| ||||||||    
T  43401970 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctcttt-gtaagaac 43401873  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 447  Q
    || ||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43401872 tcattgatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 43401794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 552
Target Start/End: Original strand, 40735268 - 40735660
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtaga-gagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||| | | | |||||||    
T  40735268 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggaaaagtgaaaatc 40735365  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  ||||||    
T  40735366 attgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccagtttgta 40735464  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||    
T  40735465 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcagcaa--tctttggtg 40735560  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta-ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || ||||| | ||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40735561 tatttg--ttcctctcttctctcc-tttatcttttgcttgtggatttgtgcttttcactttggttcctatattagatctaggtgctgttattgttgatta 40735657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Original strand, 29682244 - 29682530
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||    || | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  29682244 cttgggaaatcaaaggagttaaatttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 29682341  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||| |||  ||||||    
T  29682342 attgagtgtcttgtttatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgta 29682440  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29682441 tcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29682530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 207 - 444
Target Start/End: Original strand, 44331470 - 44331716
Alignment:
Q  207 ttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggta 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||       |||||||| |||||| |||||    
T  44331470 ttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattaggaaaatgggta 44331568  T
Q  297 gaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtac 394  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |    
T  44331569 gaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctcttt-gtaagaacttattgatagtggattggagagatc 44331666  T
Q  395 aatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44331667 aatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 44331716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22835285 - 22835010
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||| ||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| | || |||||||   ||| |||||||    
T  22835285 cttggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgtgttgggaaacattgtaatcaccttgggtgagtgaaaatc 22835188  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  22835187 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 22835089  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcc-tcagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 433  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22835088 tcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 22835010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 278 - 447
Target Start/End: Original strand, 30236129 - 30236299
Alignment:
Q  278 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 374  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||    
T  30236129 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 30236226  T
Q  375 gatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 447  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  30236227 gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatttctt 30236299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 405 - 557
Target Start/End: Original strand, 10067439 - 10067592
Alignment:
Q  405 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtg 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||   |  | ||    
T  10067439 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctttg 10067537  T
Q  502 tttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  10067538 tttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgc 10067592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 554
Target Start/End: Original strand, 51398699 - 51399094
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| || || ||||||||||||| | ||||||||||  ||| || | |||||||||| | ||| |||||||    
T  51398699 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagagt-ctttgattagagttt-tcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggatgagtgaaaatc 51398796  T
Q  264 attgagtgtcttggt-------gagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgta 353  Q
    ||||||||||||| |       |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||    
T  51398797 attgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgta 51398895  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||    
T  51398896 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatttatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaa--tctttggtg 51398991  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| || ||||  || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51398992 tgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtacttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgatta 51399089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 274 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 43403913 - 43403737
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||||   | || |||| |||| ||||||||    
T  43403913 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggctt-gttctttgtgagcttgttgaagctcatttcttgtaactcatgttttatctcttt-gtaagaac 43403816  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 447  Q
    || |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43403815 tcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 43403737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6095767 - 6095600
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  6095767 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 6095670  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6095669 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgtgtgaaca 6095600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 141
Target Start/End: Original strand, 10208908 - 10209042
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgattgcttcagagg 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||  |||||   ||||||    
T  10208908 aaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaaatatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattggaacagagg 10209007  T
Q  108 gaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttga 141  Q
     || |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10209008 aagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttga 10209042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Original strand, 8738647 - 8738740
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgat 96  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||    
T  8738647 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggaacggacgcaaatcgtgacatgat 8738740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Original strand, 9090885 - 9090978
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgat 96  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||    
T  9090885 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggaacggacgcaaatcgtgacatgat 9090978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 276 - 444
Target Start/End: Original strand, 31314447 - 31314616
Alignment:
Q  276 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 372  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  31314447 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatct-ttttgtaagaactct 31314544  T
Q  373 ttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| || || | ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  31314545 ttgatagtggattggagagatcaatatctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct 31314616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41819691 - 41819523
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  41819691 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 41819594  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    || || |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  41819593 tcatt-atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtgaaca 41819523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4598981 - 4598894
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  4598981 tgggaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 4598894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4601202 - 4601115
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  4601202 tgggaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 4601115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 10058157 - 10058240
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  10058157 aaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgtacgcaaatcgtgac 10058240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 10060379 - 10060462
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  10060379 aaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgtacgcaaatcgtgac 10060462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 10062601 - 10062684
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  10062601 aaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgtacgcaaatcgtgac 10062684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 10064823 - 10064906
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  10064823 aaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgtacgcaaatcgtgac 10064906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Original strand, 25637138 - 25637225
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  25637138 tgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 25637225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 29810753 - 29811150
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | || | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  29810753 cttgggaaatcaaaggaggtaattttagggttgagggt-ctttgattagagt-tcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 29810850  T
Q  264 attgagtgtctt-------ggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    ||||| ||||||       ||||||||| ||||||   ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  29810851 attgaatgtcttattcattggtgagattaggaaaatatgtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 29810949  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| ||  |||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  29810950 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttaaaccgaattgggtcaacaa--tctttggtg 29811045  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| || ||| | || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29811046 tgtttg--ttcatctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgatta 29811143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 54593704 - 54593871
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  54593704 ttggtgagattgggaaaatgtgcagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54593801  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  54593802 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatgtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 54593871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 7167758 - 7167670
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  7167758 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtcataccttgggtcagacgcaaatcgtgac 7167670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 10055935 - 10056018
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  10055935 aaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 10056018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 10067045 - 10067128
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  10067045 aaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 10067128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 45282695 - 45282778
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  45282695 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcagatcgtgac 45282778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Original strand, 16498915 - 16499200
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtag-agagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | ||||   ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||||  | || |||||||    
T  16498915 cttgggaaatcaaaggaggtaacttgtgggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatc 16499012  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  |||| | |||||  ||||||||||||||| |||  ||| ||    
T  16499013 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttt--ttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttata 16499110  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16499111 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 16499200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Original strand, 40372380 - 40372446
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcatacct 69  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372380 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcatacct 40372446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 46860474 - 46860642
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  46860474 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaataact 46860571  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||   |||||||||| ||| ||||||    
T  46860572 cattgatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaattggatgaaca 46860642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Original strand, 6716210 - 6716287
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgc 81  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||    
T  6716210 tgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgc 6716287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Original strand, 6718394 - 6718471
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgc 81  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||    
T  6718394 tgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgc 6718471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 27352205 - 27352293
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  27352205 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaattatcactgataaggactggtcataccttgggacggacgcaaatcgtgac 27352293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 10211108 - 10211191
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  10211108 aaatcatgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 10211191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 53921671 - 53921511
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  53921671 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttgtttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcatttgtatca-ttttgtaagaact 53921574  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 433  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  53921573 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagttt-gaccgaactgg 53921511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Original strand, 29813063 - 29813234
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||    
T  29813063 ttggtgagattggaaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctcttt-gtaagaact 29813160  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | || ||||||||||||||||  |||||||| || |||| | ||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  29813161 catttatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcatg-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29813234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 276 - 433
Target Start/End: Original strand, 32891105 - 32891264
Alignment:
Q  276 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactct 372  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||     
T  32891105 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcg 32891203  T
Q  373 ttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 433  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| || | |||||||||| | ||||||||||||||    
T  32891204 ttgatagtggattggagagataaatctctcccccggagtaggtcatg-ttggaccgaactgg 32891264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 3617163 - 3617246
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  3617163 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataacggctggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 3617246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 332 - 447
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913467
Alignment:
Q  332 taatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaa 429  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaa 40913449  T
Q  430 ctgggtgaacaatctctt 447  Q
    |||||| |||||||||||    
T  40913450 ctgggtcaacaatctctt 40913467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 293 - 431
Target Start/End: Original strand, 46173377 - 46173515
Alignment:
Q  293 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 390  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  46173377 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaattcattgatagtggattggaga 46173474  T
Q  391 gtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaact 431  Q
    |  |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  46173475 gatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 46173515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 257 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9666659 - 9666463
Alignment:
Q  257 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-c 346  Q
    ||||||||||||||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||| |    
T  9666659 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaatgggtagaaattagattttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactc 9666560  T
Q  347 ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
     ||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9666559 atttata-cctctttgtaagaattctttgatagtggattggagagattgatctctcccccagattaggtaaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 9666463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 28503443 - 28503530
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||    
T  28503443 ttgggaaatcgtgacacaattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggacttgtca-accttgggtcagacgcaaatcgtgac 28503530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23392077 - 23391906
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||    
T  23392077 ttggtgagtttgggaaaatgagtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaagataatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gcaagaact 23391980  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23391979 ctttgatagtggattgtagagataaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 23391906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 442
Target Start/End: Original strand, 47304254 - 47304420
Alignment:
Q  277 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttt-tgtatcccttttgtaagaactctt 373  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  ||| |||| ||||||||||  | |||||| |||  |||||||||| |    
T  47304254 gtgagattgagaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagttaatatcttgtaacccatctgtatctcttc-gtaagaactcat 47304351  T
Q  374 tgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 442  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47304352 tgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaat 47304420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 51352278 - 51352150
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactct 372  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| | || | ||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||||| |||||     
T  51352278 ttggtgagattaggaaaatgatagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaaccatttgtatttc-tttgtaataactca 51352180  T
Q  373 ttgatagtggattggagagtacaatctctc 402  Q
    |||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  51352179 ttgagagtggatttgagagatcaatctctc 51352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 28501276 - 28501363
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||| ||||    
T  28501276 ttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggacttgtca-accttgggtcagacgcaaatcatgac 28501363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 55302079 - 55301972
Alignment:
Q  334 atttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaact 431  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||    
T  55302079 atttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaattcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaact 55301981  T
Q  432 gggtgaaca 440  Q
     ||||||||    
T  55301980 tggtgaaca 55301972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5434086 - 5433971
Alignment:
Q  241 aaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaag 330  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||    
T  5434086 aaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaag 5433987  T
Q  331 ctaatttcttgtaacc 346  Q
    ||||||||||||||||    
T  5433986 ctaatttcttgtaacc 5433971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 32475947 - 32475885
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcat 65  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32475947 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtcat 32475885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 32480805 - 32480743
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcat 65  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32480805 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtcat 32480743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 2672543 - 2672604
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2672543 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 2672604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 8512703 - 8512642
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8512703 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 8512642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 8517583 - 8517522
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8517583 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 8517522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18656904 - 18656843
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18656904 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtca 18656843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 22172786 - 22172847
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  22172786 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaaggatctctgataaggactggtca 22172847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 403
Target Start/End: Original strand, 36018852 - 36018982
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| ||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||    
T  36018852 ttggtgaaattgggaaaatgggttgaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaagaac 36018949  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 403  Q
    || || ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36018950 tcatt-atagtggattggagaggtcaatctctcc 36018982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 2676699 - 2676760
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  2676699 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagaatctctgataaggactggtca 2676760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 24968580 - 24968519
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  24968580 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtttctctgataaggactggtca 24968519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 141
Target Start/End: Original strand, 45282809 - 45282848
Alignment:
Q  102 cagagggaggctagtataaagtgttcttgtgcagatttga 141  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282809 cagaggaaggctagtataaagtgttcttgtgcagatttga 45282848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4055926 - 4055813
Alignment:
Q  279 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgt-caagctaatttcttgtaac--cttttgtatcccttttgtaag-aactcttt 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | | ||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||| ||||| ||    
T  4055926 gagattgggaaatgggtagaaattagg--ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctc-tttgtaagaaactcatt 4055830  T
Q  375 gatagtggattggagag 391  Q
    |||||||||||| ||||    
T  4055829 gatagtggattgaagag 4055813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 7782603 - 7782538
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  7782603 aaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtgccttggg 7782538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 1306479 - 1306411
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||    
T  1306479 ttgggaaatcgtgacacgattctcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttg 1306411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23410561 - 23410326
Alignment:
Q  219 tctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtt 308  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||       |||| ||| |||||| |||||||||||| | ||    
T  23410561 tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgaaatttggaaaatgggtagaaattatg-tt 23410463  T
Q  309 tgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctc 405  Q
    | ||| |||||| |||||  ||||||||||| | |||||  |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||| || |    
T  23410462 tattctttgtgagcttgtttaagctaatttcgtataacccatttgtatcacttt-gtaagaactcttagataatggattggagagataaatctctccccc 23410364  T
Q  406 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | | ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||    
T  23410363 aaattaggtcaag-ttggaacgaattgggtcaacaatct 23410326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28253423 - 28253363
Alignment:
Q  286 ggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac 345  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||    
T  28253423 ggaaaatggtagaaattagggttcgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaac 28253363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 800811 - 800870
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 63  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  800811 tgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggaatggtc 800870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4075581 - 4075520
Alignment:
Q  332 taatttcttgtaacct--tttgtatcccttttgtaagaa-ctctttgatagtggattggagag 391  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4075581 taatttcttgtaacctcttttgtatcacttt-gtaagaaactctttgatagtggattggagag 4075520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 514 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 9634750 - 9634707
Alignment:
Q  514 ttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 556  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9634750 ttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 9634707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305719
Alignment:
Q  374 tgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactg 432  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaa-tttggaccgaactg 27305719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7782424 - 7782375
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagag 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  7782424 cttgggaaatcaaagggagtaactctaggttttagag-tctttgattagag 7782375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23198399 - 23198337
Alignment:
Q  9 aatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  23198399 aatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggactggtcgtaccttg 23198337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23200598 - 23200536
Alignment:
Q  9 aatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  23200598 aatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggactggtcgtaccttg 23200536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25517121 - 25517069
Alignment:
Q  294 gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct 347  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||    
T  25517121 gtagaaattagggtttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttataacct 25517069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 373 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2075143 - 2075076
Alignment:
Q  373 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  2075143 ttgatagtggatttgagagatcaatctctccccgagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggtaaaca 2075076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 294 - 346
Target Start/End: Original strand, 4386875 - 4386926
Alignment:
Q  294 gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  4386875 gtagaaattaggttttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttgtaacc 4386926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 79)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 576
Target Start/End: Original strand, 27647596 - 27648157
Alignment:
Q  7 gaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgattgcttcagag 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||   ||||    
T  27647596 gaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgatattgactggtcgtttcttgggtggtacgcagatcgtgacacgattgcaatagag 27647695  T
Q  107 ggaggctagtataaagtgttcttgtgcagatttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttct 206  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647696 gaagactagtataaagtgttcttgtgcagatttgaagagagagttggaagagagagagacttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttct 27647795  T
Q  207 ttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647796 ttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccatgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg 27647893  T
Q  307 tttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-c 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27647894 tttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctcc 27647993  T
Q  406 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttc 505  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||    
T  27647994 agagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatc------ttgtgtattgagtttc 27648086  T
Q  506 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27648087 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgttcggtg 27648157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 16554762 - 16555173
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16554762 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 16554860  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554861 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 16554960  T
Q  366 gaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttc 463  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16554961 gaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttc 16555060  T
Q  464 ttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacac 561  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||    
T  16555061 ttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttg--cac 16555158  T
Q  562 acactttgtttggtg 576  Q
    |||||||||||||||    
T  16555159 acactttgtttggtg 16555173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 16631318 - 16631729
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16631318 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 16631416  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631417 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 16631516  T
Q  366 gaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttc 463  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16631517 gaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttc 16631616  T
Q  464 ttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacac 561  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||    
T  16631617 ttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttg--cac 16631714  T
Q  562 acactttgtttggtg 576  Q
    |||||||||||||||    
T  16631715 acactttgtttggtg 16631729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 173 - 576
Target Start/End: Original strand, 16653012 - 16653416
Alignment:
Q  173 aatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgt 272  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16653012 aatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgt 16653110  T
Q  273 cttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc- 371  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16653111 cttggtgagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactca 16653210  T
Q  372 tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttcc 470  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16653211 tttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttcttcttcc 16653310  T
Q  471 ctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacacttt 568  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||    
T  16653311 ctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttg--cacacacttt 16653408  T
Q  569 gtttggtg 576  Q
    ||||||||    
T  16653409 gtttggtg 16653416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 16578793 - 16578382
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  16578793 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcat 16578695  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578694 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 16578595  T
Q  366 gaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttc 463  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16578594 gaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttc 16578495  T
Q  464 ttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacac 561  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||    
T  16578494 ttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttg--cac 16578397  T
Q  562 acactttgtttggtg 576  Q
    |||||||||||||||    
T  16578396 acactttgtttggtg 16578382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 16616587 - 16616998
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  16616587 cttggggaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcat 16616685  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616686 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 16616785  T
Q  366 gaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttc 463  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16616786 gaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttttc 16616885  T
Q  464 ttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacac 561  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||    
T  16616886 ttcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttg--cac 16616983  T
Q  562 acactttgtttggtg 576  Q
    |||||||||||||||    
T  16616984 acactttgtttggtg 16616998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 166 - 560
Target Start/End: Original strand, 25421198 - 25421595
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25421198 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 25421296  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25421297 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa 25421396  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  25421397 agaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttt 25421495  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 560  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25421496 tcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 25421595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 166 - 560
Target Start/End: Original strand, 6027141 - 6027535
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6027141 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcat 6027237  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  6027238 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa 6027337  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  6027338 agaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttt 6027436  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 560  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6027437 tcttcttccctc-cattttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 6027535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 166 - 539
Target Start/End: Original strand, 411994 - 412369
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  411994 cttgagaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcat 412092  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttg 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  412093 tgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttg 412191  T
Q  363 taagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttt 461  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  412192 taagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgttt 412291  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  412292 tcttcttccctctccttttatcttgtgcttgtgtattgtgtttttcacttgttacctagattagatctaggtgctgtt 412369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Original strand, 34166973 - 34167366
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34166973 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 34167069  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  34167070 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta 34167169  T
Q  364 aagaac-tctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  34167170 aagaacttatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgtt 34167268  T
Q  461 ttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34167269 ttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagatttgatctaggtggtgttttgttgttttttgcttgc 34167366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 166 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 3073036 - 3072636
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3073036 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatca 3072938  T
Q  265 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatccctttt 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  3072937 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaatggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctctttt 3072839  T
Q  362 gtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgtt 460  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  3072838 gtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgtt 3072740  T
Q  461 ttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggt-gttttgttgattattgcttgcac 559  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  3072739 ttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcacttgtttcctagattagatctatgtgctatttttgttgattattgcttgcac 3072640  T
Q  560 acac 563  Q
    ||||    
T  3072639 acac 3072636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 166 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 33342380 - 33341982
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  33342380 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 33342284  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||     
T  33342283 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtactccttttgta 33342184  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  33342183 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgtt 33342085  T
Q  461 ttcttcttccctctcct---tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| ||   |  | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  33342084 ttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 33341985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Original strand, 34164751 - 34165144
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34164751 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 34164847  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  34164848 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta 34164947  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  34164948 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgtt 34165046  T
Q  461 ttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||   |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  34165047 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtg-tttgttgtttcttgcttgc 34165144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 166 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 6097717 - 6097326
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  6097717 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctctttggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatca 6097618  T
Q  265 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt 363  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||           |||||||    
T  6097617 ttgagtgttttggtgagattggaaaaatggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaact----------cttttgt 6097529  T
Q  364 aagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgtttt 462  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6097528 aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgtttt 6097429  T
Q  463 cttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttct-cacttgtttcctagattagatctaggtggtg-ttttgttgattattgcttgcaca 560  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  6097428 cctcttccctctccttgtatcttgtgattgtgtattgtgtttttccacttgttacctagattagatcaaggtgctgtttttgttgattatagcttgcaca 6097329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 245 - 557
Target Start/End: Original strand, 13153886 - 13154201
Alignment:
Q  245 accttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgta 343  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13153886 accttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgta 13153983  T
Q  344 accttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13153984 acctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgacca 13154083  T
Q  441 atctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgt 538  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13154084 atctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgt 13154182  T
Q  539 tttgttgattattgcttgc 557  Q
     |||||| || ||||||||    
T  13154183 attgttgtttcttgcttgc 13154201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 166 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 2171814 - 2171406
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  2171814 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 2171716  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccttttgtatc 355  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2171715 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttgtatc 2171617  T
Q  356 ccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 454  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  2171616 tcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgta 2171519  T
Q  455 tttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtg---tttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
    |||||||   ||||| ||| |||||||||||||| |||||| || ||   ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2171518 tttgtttatctcttctctc-ccttttatcttgtgcttgtgttttatgttttttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgatta 2171420  T
Q  550 ttgcttgcacacac 563  Q
    ||||||||||||||    
T  2171419 ttgcttgcacacac 2171406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 31404957 - 31404561
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  31404957 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggtcttttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 31404859  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 355  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31404858 ttgagtgtcttgttcatcagtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 31404760  T
Q  356 ccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 454  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||      
T  31404759 tcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggccaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtg 31404663  T
Q  455 tttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtg-tttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 552  Q
    |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||    ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31404662 tttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgctttcctctttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 31404565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 166 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 5406481 - 5406109
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  5406481 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 5406384  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 355  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5406383 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 5406285  T
Q  356 ccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 454  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||      
T  5406284 tcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtg 5406188  T
Q  455 tttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtg 534  Q
    |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  5406187 tttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgtttgtggtttgtgcttttctctttgattcctagattagatctaggtg 5406109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 166 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 5410806 - 5410434
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  5410806 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 5410709  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 355  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5410708 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 5410610  T
Q  356 ccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 454  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||      
T  5410609 tcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtg 5410513  T
Q  455 tttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtg 534  Q
    |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  5410512 tttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgtttgtggtttgtgcttttctctttgattcctagattagatctaggtg 5410434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 5413675 - 5413281
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| | |||||| |||  ||| ||||||||    
T  5413675 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctctcgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatca 5413578  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 355  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5413577 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 5413479  T
Q  356 ccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 454  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||      
T  5413478 tcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaa--tctttggtgtg 5413383  T
Q  455 tttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 552  Q
    |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5413382 tttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgcttttctctttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattg 5413285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 16452612 - 16452214
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  16452612 cttgggaaatcaaagtaagcaactttagagtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 16452515  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaaccttttg-ta 353  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||    
T  16452514 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttcata 16452416  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16452415 tctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtg 16452319  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttat-cttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      |||||||   ||||  ||||||||||||  || || |||||  ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16452318 tgtttgtttctctctt--ctctccttttatatttttgcttgtggtttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgatgttattgttgatta 16452221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 166 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 30834819 - 30834418
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| |  ||| ||||||||    
T  30834819 cttgagaaatcaaaggaagcaactttagggtttatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacacctcggtgagtgaaaatca 30834722  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgta 353  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  30834721 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgta 30834623  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  30834622 tctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatct--ttggtg 30834526  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttct--cactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatt 548  Q
      |||||||   |||||  ||||||||||| || || |||||  |||||||| |  ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  30834525 tgtttgtttatctcttc--tctccttttatattttgcttgtggtttgtgtttttttcactttgattcatagattagatctaggtgctgttattgttgatt 30834428  T
Q  549 attgcttgca 558  Q
    ||||||||||    
T  30834427 attgcttgca 30834418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33160636 - 33160254
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaa-tc 263  Q
    |||||| |||||||||  | |||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||| ||    
T  33160636 cttggggaatcaaaggaggtaactttagggttgagagt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaaatc 33160539  T
Q  264 attgagtgtctt-------ggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgt 352  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33160538 attgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgt 33160440  T
Q  353 atcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggt 451  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  33160439 atctcttt-gtaagaactcattgatggtggattggagagatcaatctctcctccagagtatttcaagtttggaccaaactgggtgaacaatct--ttggt 33160343  T
Q  452 gcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-tattgtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt 539  Q
    |  |||||||   ||||| ||| | ||||||||| || ||||| | ||||| || |||||| | || |||||||||||||||||| ||||    
T  33160342 gtgtttgtttctctcttctctc-ctttttatcttttgtttgtggttttgtgcttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 33160254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 9183314 - 9182917
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  9183314 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcctgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 9183217  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  9183216 attgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 9183118  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  9183117 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtg 9183022  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      ||||  | | |||   |||||| |||||||| || |||| || ||||  || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9183021 tgtttg--tccctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtacttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgatta 9182924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 21588931 - 21589098
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  21588931 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 21589028  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21589029 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 21589098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 21593664 - 21593831
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  21593664 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 21593761  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21593762 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 21593831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 345 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 5409164 - 5408956
Alignment:
Q  345 ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 443  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  5409164 ccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaa-- 5409069  T
Q  444 tctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-tt 541  Q
    |||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  5409068 tctttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgcttttctctttgattcctagattagatctaggtgttgttatt 5408971  T
Q  542 gttgattattgcttg 556  Q
    |||||||||||||||    
T  5408970 gttgattattgcttg 5408956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 274 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 3808877 - 3808701
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  3808877 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 3808780  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 447  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3808779 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcatgattggaccgaactaggtgaacaatctctt 3808701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 277 - 440
Target Start/End: Original strand, 17758026 - 17758191
Alignment:
Q  277 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |    
T  17758026 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcat 17758123  T
Q  374 tgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17758124 tgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtgaaca 17758191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2973107 - 2972940
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  2973107 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 2973010  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  2973009 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaag-ttcgaccgaactaggtgaaca 2972940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Original strand, 16568928 - 16569193
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg--tagagagaaaat 262  Q
    |||||||||||||||| |  || | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||  || || ||||||    
T  16568928 cttgggaaatcaaaggaattaaatttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggta-agtgaaaat 16569024  T
Q  263 cattgagtgtcttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttt 360  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||            ||    
T  16569025 cattgagtgtcttg---agattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacc------------tt 16569109  T
Q  361 tgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16569110 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 16569193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 17762990 - 17763158
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||    
T  17762990 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatct-ttttggaagaact 17763087  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17763088 cattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactaggtgaaca 17763158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 28137671 - 28137409
Alignment:
Q  186 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg------- 276  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||           
T  28137671 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 28137574  T
Q  277 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 373  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||| |    
T  28137573 gtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttcttt-gtaagaactcat 28137476  T
Q  374 tgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  28137475 tgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgtgtgaaca 28137409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 5266548 - 5266432
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgattgcttc 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||  |||||||||    
T  5266548 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatccttgataaggactggtcataccttgaaacggacgcaaatcgtgacacgattgcttc 5266449  T
Q  103 agagggaggctagtata 119  Q
    ||||| || ||||||||    
T  5266448 agaggaagactagtata 5266432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 5674354 - 5674442
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5674354 ttgggaaatcgtgacacgattttgaaacttgctcgttaagtatccgtgataaggactggtcataccttgggacgtacgcaaatcgtgac 5674442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 276 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 26830289 - 26830124
Alignment:
Q  276 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactct 372  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||     
T  26830289 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctcttt-gtaagaactca 26830192  T
Q  373 ttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26830191 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagttt-gactgaactgggtgaaca 26830124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26954568 - 26954283
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacctt-gtagagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| || || ||||||||||||| | |||| |||||  |||||| | ||||||||| |  ||| |||||||    
T  26954568 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagagt-ctttgattagagt-tatcttaggttgggaaacattgtaaacacctttggggagtgaaaatc 26954471  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtat 354  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | | |||||    
T  26954470 attgagtgtcttgttcatatgtgagattgggaaattggtataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgtat 26954372  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  26954371 ctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 26954283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 33342562 - 33342475
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  33342562 tgggaaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 33342475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 34166796 - 34166879
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  34166796 aaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacgtacgcaaatcgtgac 34166879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22424995 - 22424826
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc---ttttgtatcccttttgtaagaa 368  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  22424995 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctcttt-gtaagaa 22424898  T
Q  369 ctctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    ||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  22424897 ctcatt-atagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcattgttggaccgtactgggtgaaca 22424826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 98
Target Start/End: Original strand, 25420926 - 25421016
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgattg 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||||| ||||||    
T  25420926 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacatgattg 25421016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 98
Target Start/End: Original strand, 25421020 - 25421110
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgattg 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||||| ||||||    
T  25421020 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacatgattg 25421110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 277 - 440
Target Start/End: Original strand, 5043630 - 5043795
Alignment:
Q  277 gtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 373  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |    
T  5043630 gtgagattgagaaaatgagtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcat 5043727  T
Q  374 tgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  5043728 tgatagtagattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 5043795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 6136422 - 6136335
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | | ||||||||||||    
T  6136422 tgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggaagcaaatcgtgac 6136335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 13150979 - 13151062
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  13150979 aaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 13151062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 16554583 - 16554666
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  16554583 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcagatcgtgac 16554666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16578972 - 16578889
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  16578972 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcagatcgtgac 16578889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 16616408 - 16616491
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  16616408 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcagatcgtgac 16616491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 16631139 - 16631222
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  16631139 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcagatcgtgac 16631222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 34164574 - 34164657
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  34164574 aaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 34164657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 6026963 - 6027046
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  6026963 aaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaccggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 6027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 16652826 - 16652909
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  16652826 aaatcgtgacacaatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcagatcgtgac 16652909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 308 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 603222 - 603082
Alignment:
Q  308 ttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc 405  Q
    |||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| |    
T  603222 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattggagaaatcaatctctcccc 603124  T
Q  406 -agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 447  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  603123 aagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctctt 603082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33211353 - 33211182
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |||||| |||| | ||| |||||||||||| | | |||||||| |||| |||||||||    
T  33211353 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgatgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctcttt-gtaagaact 33211256  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | || ||| ||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33211255 catttataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33211182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 274 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3039071 - 3038953
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  3039071 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagctttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 3038974  T
Q  371 ctttgatagtggattggagag 391  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  3038973 ctttaatagtggattggagag 3038953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 391
Target Start/End: Original strand, 4045423 - 4045542
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 371  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||| | |||| |||| ||||   || |||||    
T  4045423 ttggagagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttatatctctttgtaaataactc 4045522  T
Q  372 tttgatagtggattggagag 391  Q
     |||||||||||||||||||    
T  4045523 attgatagtggattggagag 4045542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Original strand, 411811 - 411881
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgag-aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  411811 tgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttggg 411881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 341
Target Start/End: Original strand, 16567091 - 16567265
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  16567091 cttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 16567188  T
Q  264 attgagtgtcttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttg 341  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||    
T  16567189 attgagtgtct---tgagattgggaaaatggttagaaattaggttttgttttttgtgagcttgtttaagctaatttcttg 16567265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 28155195 - 28155256
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28155195 ttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 28155256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 328 - 440
Target Start/End: Original strand, 26800642 - 26800755
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttgga 424  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||    
T  26800642 aagctaatttcttgtaactaattttgtatctcttt-gtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttgga 26800739  T
Q  425 ccgaactgggtgaaca 440  Q
    ||||||||| ||||||    
T  26800740 ccgaactggatgaaca 26800755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 3073215 - 3073148
Alignment:
Q  6 ggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3073215 ggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttggg 3073148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 22010313 - 22010383
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggt 74  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22010313 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggt 22010383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2171979 - 2171838
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacg--caaatcgtgacgtgattgct 100  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||| |  |||||  | |||||||||  ||||       
T  2171979 ttgggaaatcgtgacacgattgtaaaacttgctcgttaagtttccaagataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcgtgacacgatttta 2171880  T
Q  101 tcagagggaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttga 141  Q
    |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2171879 tcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttga 2171838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 16839206 - 16839137
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  16839206 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca-accttggg 16839137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 5343940 - 5343879
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5343940 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 5343879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 6005882 - 6005821
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6005882 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 6005821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 6097877 - 6097741
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgca--aatcgtgacgtgattgcttcaga 105  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||  |||||||||  ||||   ||||     
T  6097877 aaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtacctggggacgtacgcaccaatcgtgacacgattttatcagg 6097778  T
Q  106 gggaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttga 141  Q
    || || |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6097777 ggaagactagtatttaagtgttcttgtgcagatttga 6097741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 6438959 - 6438898
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6438959 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctagttaagtatcactgataaggactggtca 6438898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 33330057 - 33330118
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33330057 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 33330118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 33335554 - 33335615
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33335554 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 33335615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 22709520 - 22709452
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22709520 ttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttg 22709452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11857443 - 11857373
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggt 74  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  11857443 ttgggaaatcgtgacacgatttagaaacttgctcgttaagtaacactgataaggacttgtca-accttgggt 11857373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 14737190 - 14737260
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggt 74  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  14737190 ttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtca-accttgggt 14737260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 14742050 - 14742120
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggt 74  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  14742050 ttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtca-accttgggt 14742120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Original strand, 30125141 - 30125185
Alignment:
Q  2 tttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatc 46  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30125141 tttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatc 30125185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 6136216 - 6136165
Alignment:
Q  526 atctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-acacactttgtttggtg 576  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||    
T  6136216 atctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcacaatacactttgtttggtg 6136165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 141
Target Start/End: Original strand, 16554697 - 16554736
Alignment:
Q  102 cagagggaggctagtataaagtgttcttgtgcagatttga 141  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16554697 cagaggaaggctagtataaattgttcttgtgcagatttga 16554736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 141
Target Start/End: Original strand, 16631253 - 16631292
Alignment:
Q  102 cagagggaggctagtataaagtgttcttgtgcagatttga 141  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16631253 cagaggaaggctagtataaattgttcttgtgcagatttga 16631292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 141
Target Start/End: Original strand, 16652940 - 16652979
Alignment:
Q  102 cagagggaggctagtataaagtgttcttgtgcagatttga 141  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16652940 cagaggaaggctagtataaattgttcttgtgcagatttga 16652979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 93)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 29720256 - 29720667
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720256 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 29720355  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720356 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 29720455  T
Q  365 agaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttc 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  29720456 agaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttc 29720554  T
Q  464 ttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacac 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29720555 ttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgtacacac 29720654  T
Q  564 actttgtttggtg 576  Q
    |||||||||||||    
T  29720655 actttgtttggtg 29720667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 29722416 - 29722827
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722416 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 29722515  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722516 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 29722615  T
Q  365 agaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttc 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  29722616 agaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttc 29722714  T
Q  464 ttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacac 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29722715 ttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgtacacac 29722814  T
Q  564 actttgtttggtg 576  Q
    |||||||||||||    
T  29722815 actttgtttggtg 29722827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 29751436 - 29751024
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751436 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 29751337  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751336 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 29751237  T
Q  365 agaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg-cttttgtttt 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  29751236 agaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtcttttgtttt 29751138  T
Q  463 cttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacaca 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751137 cttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtactgtgtttctcacttgttttctagattatatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacaca 29751038  T
Q  563 cactttgtttggtg 576  Q
    ||| ||||||||||    
T  29751037 cacattgtttggtg 29751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 22536563 - 22536169
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||    
T  22536563 cttgggaaatcaaagggagaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgcagagagaa--tcat 22536466  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536465 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 22536366  T
Q  366 gaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttct 464  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22536365 gaactctttgatagtggattggggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgcttttgttttct 22536267  T
Q  465 tcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacac 563  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22536266 tcttccctccccttttatcttgtgattgtgttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggt-gttttttgttgattgttgcttgcatacac 22536169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 10593151 - 10593564
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10593151 cttgggaaatcaaagggggaa-ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 10593249  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593250 tgagtgtcttggtgagattgggagaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 10593349  T
Q  366 gaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttc 463  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  10593350 gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtatttgttttc 10593448  T
Q  464 ttcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac-a 560  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  10593449 tacttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaa 10593548  T
Q  561 cacactttgtttggtg 576  Q
     |||||||||||||||    
T  10593549 tacactttgtttggtg 10593564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 166 - 560
Target Start/End: Original strand, 25078013 - 25078410
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25078013 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 25078111  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25078112 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa 25078211  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  25078212 agaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttt 25078310  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 560  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25078311 tcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 25078410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 166 - 560
Target Start/End: Original strand, 25135982 - 25136379
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25135982 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 25136080  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25136081 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa 25136180  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  25136181 agaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttt 25136279  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 560  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25136280 tcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 25136379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 166 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 9789500 - 9789101
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  9789500 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatca 9789402  T
Q  265 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttg 362  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9789401 ttgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttg 9789303  T
Q  363 taagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttt 461  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9789302 taagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttt 9789203  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacac 561  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9789202 tcctcttccctctccgtttatcttgtgcttgtgtattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgctgttttgttgatttttgcttgcacac 9789103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 40379985 - 40380397
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  40379985 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcat 40380081  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  40380082 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa 40380181  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  40380182 agaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttt 40380280  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac- 559  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  40380281 tcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 40380380  T
Q  560 acacactttgtttggtg 576  Q
    | | |||||||||||||    
T  40380381 ataaactttgtttggtg 40380397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 40382196 - 40382608
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  40382196 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcat 40382292  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  40382293 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaagttagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa 40382392  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  40382393 agaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttt 40382491  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac- 559  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  40382492 tcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 40382591  T
Q  560 acacactttgtttggtg 576  Q
    | | |||||||||||||    
T  40382592 ataaactttgtttggtg 40382608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 166 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 18441924 - 18441521
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  18441924 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatca 18441826  T
Q  265 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttg 362  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18441825 ttgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttg 18441727  T
Q  363 taagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttt 461  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18441726 taagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttt 18441627  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtg----tttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18441626 tcctcttccctctccgtttatcttgtgcttgtgtattgtgtttttttttcacttctttcctagattagatctaggtgctgttttgttgattattgcttgc 18441527  T
Q  558 acacac 563  Q
    ||||||    
T  18441526 acacac 18441521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 166 - 559
Target Start/End: Original strand, 16409367 - 16409764
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  16409367 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatca 16409465  T
Q  265 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttg 362  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16409466 ttgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttg 16409564  T
Q  363 taagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttt 461  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16409565 taagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttt 16409664  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcac 559  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16409665 tcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 16409764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Original strand, 16544302 - 16544697
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16544302 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 16544398  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||     
T  16544399 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttctcataacctcttgtatcccttttgta 16544498  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  16544499 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgtt 16544597  T
Q  461 ttcttcttccctctcct---tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| ||   |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16544598 ttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 16544697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Original strand, 16546524 - 16546919
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16546524 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 16546620  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16546621 tgagtgtcttggtgagattaggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgta 16546720  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  16546721 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgtt 16546819  T
Q  461 ttcttcttccctctcct---tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| ||   |  | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16546820 ttcttcttccctctcctttgtttatcttgtgtttagttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatttaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 16546919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 166 - 563
Target Start/End: Original strand, 26177775 - 26178175
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  26177775 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatca 26177873  T
Q  265 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttg 362  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26177874 ttgagtgtcttggtgagattgg-aaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttg 26177971  T
Q  363 taagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttt 461  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26177972 taagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttt 26178071  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcac 559  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||    
T  26178072 tcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttatcattgattattgcttgcac 26178171  T
Q  560 acac 563  Q
    ||||    
T  26178172 acac 26178175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 166 - 563
Target Start/End: Original strand, 26170666 - 26171055
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  26170666 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattacagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatca 26170764  T
Q  265 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt 363  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||           |||||||    
T  26170765 ttgagtgtcttggtgagattgg-aaaagggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaact----------cttttgt 26170852  T
Q  364 aagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgtttt 462  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26170853 aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgtttt 26170952  T
Q  463 cttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctca-cttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcaca 560  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||||    
T  26170953 cctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcattttgattcctagattagatctaggtgttgttatcatcgattattgcttgcaca 26171052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 166 - 558
Target Start/End: Original strand, 30182474 - 30182872
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  30182474 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggattagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgcaaacaccttggtgagtgaaaatca 30182571  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtat 354  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  30182572 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctat 30182670  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||     
T  30182671 ctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactggatgaacaa--tctttggtgt 30182767  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattatt 551  Q
     |||||||   ||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30182768 gtttgtttctctctt--ctctccttttatcttgtgcttgtgttttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattatt 30182865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 25412647 - 25413042
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  25412647 cttgggaaatcaaaggaggcaacattagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 25412744  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatc 355  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25412745 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 25412843  T
Q  356 ccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 454  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||      
T  25412844 tcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaa--tctttggtgtg 25412940  T
Q  455 tttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 552  Q
    |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || || | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  25412941 tttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgcttttctctttgattcctagattagatataggtgctgttattgttgattattg 25413038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 166 - 558
Target Start/End: Original strand, 13342946 - 13343344
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  13342946 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctctgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 13343043  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgta 353  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13343044 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgta 13343142  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  13343143 tctctttg--aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcatgtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttgatg 13343238  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
      |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13343239 tgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggtttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattat 13343336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 166 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 36074327 - 36073927
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  36074327 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 36074230  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa----gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttg 351  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36074229 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttg 36074131  T
Q  352 tatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgg 450  Q
    |||| ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  36074130 tatctctttg--aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaa--tctttgg 36074035  T
Q  451 tgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatt 548  Q
    ||  |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36074034 tgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatgttttgcttgtgatttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgatt 36073937  T
Q  549 attgcttgca 558  Q
    ||||||||||    
T  36073936 attgcttgca 36073927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 204 - 539
Target Start/End: Original strand, 13239674 - 13240016
Alignment:
Q  204 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-gg 294  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||  ||    
T  13239674 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaatgg 13239772  T
Q  295 tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagt 392  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13239773 tagaaattagggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagaga 13239870  T
Q  393 acaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgatt 491  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || ||    
T  13239871 tcaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaa--tttttggtgtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgctt 13239966  T
Q  492 gt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 539  Q
    || || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  13239967 gtggttttgtgtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 13240016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 166 - 539
Target Start/End: Original strand, 32636709 - 32637088
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    |||| |||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  32636709 cttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtagtgaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 32636806  T
Q  264 attgagtgtctt-------ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  32636807 attgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgta 32636905  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  32636906 tctcttt-gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtg 32637001  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-tattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 539  Q
      |||||||   ||||||  |||| ||||||||||| ||||| | ||| |||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  32637002 tgtttgtttctctcttcc--ctccctttatcttgtgcttgtgattttgagtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 32637088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 293 - 444
Target Start/End: Original strand, 37439161 - 37439313
Alignment:
Q  293 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 390  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37439161 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaga 37439258  T
Q  391 gtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37439259 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 37439313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 213465 - 213633
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  213465 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 213562  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213563 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 213633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Original strand, 13488088 - 13488374
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||| ||||||     
T  13488088 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatt 13488185  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  13488186 attgagtgtcttgttcattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 13488284  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  13488285 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatct 13488374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22536727 - 22536590
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgattgcttca 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| || ||||||||  |||| |  ||    
T  22536727 tgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacacagatcgtgacacgatttcaaca 22536628  T
Q  104 gagggaggctagtataaagtgttcttgtgcagatttga 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536627 gaggaaggctagtataaagtgttcttgtgcagatttga 22536590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 30683203 - 30682809
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||| |||  | || | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  30683203 cttgggaaatcagaggaggtaattttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgcgaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 30683106  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtat 354  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30683105 ttgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt----ctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtat 30683010  T
Q  355 cccttttgtaagaa--ctctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggt 451  Q
      |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||||    
T  30683009 ttcttt-gtaagaatactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact-ggtcaacaa--tctttggt 30682915  T
Q  452 gcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta-ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatt 548  Q
    |  ||||  ||| |||   ||||||||||||||| || ||||| | ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  30682914 gtgtttg--ttcctctcttctctccttttatcttttgcttgtgaatttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgatt 30682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 40147261 - 40147428
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  40147261 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 40147358  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40147359 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 40147428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 274 - 442
Target Start/End: Original strand, 28278316 - 28278485
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  28278316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 28278413  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 442  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28278414 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaat 28278485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 29751615 - 29751532
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751615 aaatcgtgacacgattgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 29751532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 42428713 - 42428427
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggaga-aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaat 262  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||||||||   ||| ||||||    
T  42428713 cttgggaaatcaaagg-agataactttagggttgaaggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 42428617  T
Q  263 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgt 352  Q
    ||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  42428616 cattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgt 42428518  T
Q  353 atcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  42428517 atctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 42428427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 440
Target Start/End: Original strand, 31182858 - 31183138
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacctt-gtagagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| |  ||| |||||||    
T  31182858 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtgaaaatc 31182955  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatc 355  Q
    |||||||||||||       |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| ||||||  ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31182956 attgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagtttgtttaagttaatttcttgtaaccatttgtatc 31183054  T
Q  356 ccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | |||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31183055 cc-tttgtaagaactcattgatactggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaaca 31183138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 39468832 - 39468587
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  39468832 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttcattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatc 39468735  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  39468734 attgagtgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 39468636  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 403  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  39468635 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcc 39468587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28750938 - 28750652
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  28750938 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgaaaacaccttgggtgagtgaaaatc 28750841  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||  ||| ||||||| |||||||  ||||||    
T  28750840 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccatttgta 28750742  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||    
T  28750741 tct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaattgggtcaataatct 28750652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 5058047 - 5058212
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||  |||||| ||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||    
T  5058047 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttc--tgtgagcttgttgaagctattttcttgtatcccatttgtatctcttt-gtaagaact 5058142  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5058143 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 5058212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8566192 - 8565943
Alignment:
Q  204 tctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gg 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||| ||    
T  8566192 tctttgattagagt-tctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgg 8566094  T
Q  294 gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 391  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8566093 gtagaacttagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctct-gtaagaactcattgatagtggattggagag 8565996  T
Q  392 tacaatctctc-ctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
      ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  8565995 atcaatctctcacccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 8565943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 461
Target Start/End: Original strand, 33831565 - 33831866
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||    || | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  33831565 cttgggaaatcaaaggagttaattttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 33831662  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    ||||||||||||        |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  33831663 attgagtgtcttattcatttgtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 33831761  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||    
T  33831762 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaa--tctttggtg 33831857  T
Q  453 cttttgttt 461  Q
     ||||||||    
T  33831858 tttttgttt 33831866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 444
Target Start/End: Original strand, 533655 - 533940
Alignment:
Q  167 ttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||  | |||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| ||||||||    
T  533655 ttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgggggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatca 533752  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtat 354  Q
    ||| ||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||    
T  533753 ttgcgtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggt-ctttgtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtat 533851  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  533852 ctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 533940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 24136359 - 24136271
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24136359 ttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggacgtacgcaaatcgtgac 24136271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Original strand, 25077831 - 25077918
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  25077831 tgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 25077918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Original strand, 25135800 - 25135887
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  25135800 tgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 25135887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 440
Target Start/End: Original strand, 16451966 - 16452247
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   || || |||||    
T  16451966 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggat-ctttgattagagt-tctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttggtaagtgacaatca 16452063  T
Q  265 ttgagtgtcttggt-------gagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtat 354  Q
    |||||||||||| |       |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  16452064 ttgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttctgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 16452162  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16452163 ctcttt-gtaagaactcattcatagtggattggagagataaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 16452247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 16544123 - 16544206
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  16544123 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 16544206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 16546345 - 16546428
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  16546345 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 16546428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 40379807 - 40379890
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  40379807 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 40379890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 40382018 - 40382101
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  40382018 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 40382101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27637781 - 27637615
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  27637781 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 27637684  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 438  Q
    || || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  27637683 tcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaa 27637615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Original strand, 537910 - 538196
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||| ||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  537910 cttggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttggcttgggaaacatcgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 538007  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||| ||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  538008 attgcgtgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gctctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 538106  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  538107 tctcttt-gtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 538196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 42426518 - 42426232
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| | |||  |||||| | ||||||||||   ||| ||||||     
T  42426518 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttagattgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatt 42426421  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  42426420 attgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgta 42426322  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || | || ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  42426321 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccctgattaggtcaag-ttggactgaactaggtcaacaatct 42426232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 27445442 - 27445355
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  27445442 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcagacgcaaatcgtgac 27445355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 27450285 - 27450198
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  27450285 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcagacgcaaatcgtgac 27450198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 43592748 - 43592661
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  43592748 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcagacgcaaatcgtgac 43592661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 43599193 - 43599106
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  43599193 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcagacgcaaatcgtgac 43599106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 43604685 - 43604598
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  43604685 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcagacgcaaatcgtgac 43604598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 43610177 - 43610090
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  43610177 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcagacgcaaatcgtgac 43610090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13695859 - 13695740
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 371  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||    
T  13695859 ttggagagattgggaaaagggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactc 13695760  T
Q  372 tttgatagtggattggagag 391  Q
     || |||||||||| |||||    
T  13695759 attaatagtggattagagag 13695740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3075937 - 3075659
Alignment:
Q  170 ggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattg 267  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  3075937 ggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacacctttgatgagtgaaaatcattg 3075840  T
Q  268 agtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatccc 357  Q
    ||||||| |       ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||  ||||||||      
T  3075839 agtgtctcgttcatttgtgagattgagaaaataggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgctgaatctaatttcttgtaacccatttgtatct- 3075742  T
Q  358 ttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  3075741 ttttgtaagaattcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccaaattgggtgaaca 3075659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 10592972 - 10593055
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||| ||||||||    
T  10592972 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccgtgataaggactggtcgtttcttcggtggtacgcagatcgtgac 10593055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 444
Target Start/End: Original strand, 38747009 - 38747176
Alignment:
Q  278 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 374  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| | || ||||| ||    
T  38747009 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttggaaa-aactcatt 38747106  T
Q  375 gatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  38747107 gatagaggattggagagatcaatctctccctcagatcaggtcaag-ttggaccaaactgggtcaataatct 38747176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 35388150 - 35388084
Alignment:
Q  27 aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacg--caaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  35388150 aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggacgtacgttcaaatcgtgac 35388084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Original strand, 29720091 - 29720161
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgag-aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29720091 tgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttggg 29720161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 30631825 - 30631763
Alignment:
Q  2 tttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30631825 tttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatctctgataaggactggtca 30631763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16641091 - 16640941
Alignment:
Q  288 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggatt 385  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||    
T  16641091 aaaatggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttgttgaagctgatttctgataactcttttgtatctcttt-gtaagaact---tgatagtggatt 16640996  T
Q  386 ggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| ||||    
T  16640995 ggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-tagggccgaactgggtaaaca 16640941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 31180725 - 31180633
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgat 96  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  31180725 ttgggaaatcgtgacacgattcagagactttctcgttaagtatcactgataaggactggtca-accttgggtcagacgcaaatcgtgacatgat 31180633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 1456762 - 1456849
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||   | ||||||||||||    
T  1456762 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgcttgttaagtatccctgataaggacttgtc-taccttgggtcagatgcaaatcgtgac 1456849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 9049506 - 9049392
Alignment:
Q  277 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcttt 374  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  9049506 gtgagtttgggaaaatgatagaaattagtgtttgttt-ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctcttt-gtaagaactcatt 9049409  T
Q  375 gatagtggattggagag 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  9049408 gacagtggattggagag 9049392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 27015531 - 27015690
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactc 371  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||       | || |||||||| |||| ||||||||||    
T  27015531 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaat-------acccatttgtatctcttt-gtaagaactc 27015621  T
Q  372 tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
     |||||||||||||| | ||  ||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27015622 attgatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 27015690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 62
Target Start/End: Original strand, 37561071 - 37561130
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggt 62  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  37561071 ttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggt 37561130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 442
Target Start/End: Original strand, 316769 - 316933
Alignment:
Q  280 agattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgat 377  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| |||||    
T  316769 agattgagaaaaaggtagaaattagg-tttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgat 316867  T
Q  378 agtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 442  Q
    | ||||| |||| |  |||||||||| | |||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||    
T  316868 aatggatcggagggatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaacttggtaaacaat 316933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 2785838 - 2785777
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2785838 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 2785777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15045156 - 15045095
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15045156 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatcactgataaggactggtca 15045095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 444
Target Start/End: Original strand, 19806454 - 19806534
Alignment:
Q  364 aagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19806454 aagaactccttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 19806534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Original strand, 26177592 - 26177661
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26177592 tgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttggg 26177661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 28807200 - 28807261
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28807200 ttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgttggttaagtatctctgataaggactggtca 28807261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 33768647 - 33768586
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33768647 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 33768586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 33791779 - 33791718
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33791779 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 33791718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 62
Target Start/End: Original strand, 37556249 - 37556308
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggt 62  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  37556249 ttgggaaattgtgacacgatctagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggt 37556308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Original strand, 29402674 - 29402728
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataagga 57  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29402674 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataagga 29402728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 33906144 - 33906028
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggac 425  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||| | | ||||||||||||  ||||||    
T  33906144 aagctaacttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtagattggaaagatcaatctcttccctagagtaggtcaatgttggac 33906045  T
Q  426 cgaactgggtgaacaat 442  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  33906044 cgagctgggtaaacaat 33906028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 9789683 - 9789624
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 63  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9789683 tgggaaatcgtgacacgatttgaaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtc 9789624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 18442107 - 18442048
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 63  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18442107 tgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtc 18442048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 73
Target Start/End: Original strand, 26170506 - 26170552
Alignment:
Q  27 aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26170506 aaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttggg 26170552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 42310218 - 42309973
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttg--tagagagaaaat 262  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||| | |||||  |||  || || ||||||    
T  42310218 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggtttatggt-ctttgattagggt-tctctttggttggaaaacattgtaaacattttgggta-agtgaaaat 42310122  T
Q  263 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgt 352  Q
    ||||||||||||||       ||||||||| ||||  |||||||||| | | |||| || |||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  42310121 cattgagtgtcttgctcattggtgagattgagaaattgggtagaaatcaag-tttgatctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgt 42310023  T
Q  353 atcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 403  Q
    ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| | |||  ||||||||||    
T  42310022 atctcttt-gtaagaacttattgatagtggattagcgagatcaatctctcc 42309973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 73
Target Start/End: Original strand, 16407772 - 16407836
Alignment:
Q  9 aatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  16407772 aatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggaccggtcgtaccttggg 16407836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 73
Target Start/End: Original strand, 16409208 - 16409272
Alignment:
Q  9 aatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  16409208 aatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtacattggg 16409272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 38219905 - 38219837
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    ||||||||| ||||||||||    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  38219905 ttgggaaattgtgacacgattttcaaacttgcttgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttg 38219837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10054929 - 10054867
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactctttgatagtggattggaga 390  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  10054929 aagctaatttcttataaccttttgtatctc-tttgtaatgaactcattgatagtgtattggaga 10054867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 5887699 - 5887487
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacacctt-gtagagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||| |  ||| |||||||    
T  5887699 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tatttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 5887602  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgta 353  Q
    ||||| |||||||       ||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||| |||||| |||| | |||||||||||||| || || ||||||    
T  5887601 attgaatgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaatta-gatttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgcaacccatttgta 5887503  T
Q  354 tcccttttgtaagaact 370  Q
    || | ||||||||||||    
T  5887502 tcac-tttgtaagaact 5887487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 29722278 - 29722332
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgag-aaacttgctcgttaagtatccttgataagga 57  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29722278 tgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataagga 29722332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 359 - 440
Target Start/End: Original strand, 42926977 - 42927058
Alignment:
Q  359 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctc-ctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42926977 tttgtaagaactcattgacagtggattgaagaaataaatctctctctcatagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 42927058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 31396614 - 31396675
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31396614 ttgggaaatcgtgacacgattcagacacttgttggttaagtttctctgataaggactggtca 31396675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 31401471 - 31401532
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31401471 ttgggaaatcgtgacatgattcagaaacttgctgcttaagtttctctgataaggactggtca 31401532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 376 - 435
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160762
Alignment:
Q  376 atagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 435  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggt 4160762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 91)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 572
Target Start/End: Original strand, 40282269 - 40282676
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282269 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 40282368  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282369 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 40282468  T
Q  365 agaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttc 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  40282469 agaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttc 40282567  T
Q  464 ttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacac 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282568 ttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacac 40282667  T
Q  564 actttgttt 572  Q
    |||||||||    
T  40282668 actttgttt 40282676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 20622514 - 20622102
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20622514 cttgggaaatcaaatggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagggaaaatcat 20622415  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatccc--ttttg 362  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20622414 tgactgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttttg 20622316  T
Q  363 taagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttt 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  20622315 taagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttt 20622217  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacac 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622216 tcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacac 20622117  T
Q  562 acactttgtttggtg 576  Q
    |||||||||||||||    
T  20622116 acactttgtttggtg 20622102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 563
Target Start/End: Original strand, 21053850 - 21054248
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21053850 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagaaaaaatcat 21053949  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21053950 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagtgtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaaccttttgtatcccttttgta 21054049  T
Q  365 agaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttc 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  21054050 agaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctc-ttggtgtatttgttttc 21054148  T
Q  464 ttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacac 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054149 ttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacac 21054248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 563
Target Start/End: Original strand, 9987094 - 9987492
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987094 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 9987193  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  9987194 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaaccttttgtatcccttttgca 9987292  T
Q  365 agaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg-cttttgtttt 462  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  9987293 agaactcattgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtcttttgtttt 9987391  T
Q  463 cttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacaca 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987392 cttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtatagtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacaca 9987491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 9036310 - 9036721
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9036310 cttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 9036408  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036409 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 9036508  T
Q  366 gaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttct 464  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  9036509 gaactctttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtatttgttttct 9036607  T
Q  465 tcttccctctcct--tttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacaca 562  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  9036608 tcttccctctccttgtttatcttgtgattgtgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttgttgcttgcacaaa 9036707  T
Q  563 cactttgtttggtg 576  Q
    ||||||||||||||    
T  9036708 cactttgtttggtg 9036721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 44203526 - 44203938
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  44203526 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcat 44203622  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  44203623 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa 44203722  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  44203723 agaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttt 44203821  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac- 559  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  44203822 tcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 44203921  T
Q  560 acacactttgtttggtg 576  Q
    | | |||||||||||||    
T  44203922 ataaactttgtttggtg 44203938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 166 - 559
Target Start/End: Original strand, 51765280 - 51765684
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||||||||||  ||| | |||||||    
T  51765280 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcat 51765378  T
Q  266 tgagtgtcttg------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc--ttttgtat 354  Q
    |||||||||||      ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  51765379 tgagtgtcttgttcttggtttgattgggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtat 51765478  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  51765479 ctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggacaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgt 51765576  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattatt 551  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  51765577 ctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattatt 51765676  T
Q  552 gcttgcac 559  Q
    ||||||||    
T  51765677 gcttgcac 51765684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 8551070 - 8550670
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||| |||   ||| |||||||    
T  8551070 cttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttaagaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatc 8550973  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||    
T  8550972 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgta 8550874  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8550873 tcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtg 8550777  T
Q  453 cttttgttttct-tcttccctctccttttatcttgtgattgtg-tattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatt 548  Q
      |||||||||| |||| | ||||  ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8550776 tgtttgttttctctctt-cttctctctttatcttgtgcttgtgattttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgatt 8550678  T
Q  549 attgcttg 556  Q
    ||||||||    
T  8550677 attgcttg 8550670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 273 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 13316521 - 13316236
Alignment:
Q  273 cttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  13316521 cttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg-aagaac 13316424  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttctt 468  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||   ||||    
T  13316423 tcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttagtgagtttgtttctctctt 13316326  T
Q  469 ccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgca 558  Q
      |||||||||||| || || |||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13316325 --ctctccttttatattttgcttgtggtttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgca 13316236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 20762557 - 20762950
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  20762557 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 20762654  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgta 353  Q
    |||||| |||||       ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20762655 ttgagtatcttgttcattggtgagattgagaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgta 20762753  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||  |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||    
T  20762754 tctcttc-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctacagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaa--tctttggtg 20762850  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
      |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||| || ||||    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20762851 tgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcac----ttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattat 20762944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 534
Target Start/End: Original strand, 3189216 - 3189590
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  3189216 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 3189313  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtat 354  Q
     |||||||||||       |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3189314 ctgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtat 3189412  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  3189413 ct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgt 3189509  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtg 534  Q
     |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  3189510 gtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattactagattagatctaggtg 3189590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 534
Target Start/End: Original strand, 3198033 - 3198407
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  3198033 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 3198130  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtat 354  Q
     |||||||||||       |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3198131 ctgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtat 3198229  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  3198230 ct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgt 3198326  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtg 534  Q
     |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  3198327 gtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattactagattagatctaggtg 3198407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 534
Target Start/End: Original strand, 3206872 - 3207246
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  3206872 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 3206969  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtat 354  Q
     |||||||||||       |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3206970 ctgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtat 3207068  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  3207069 ct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgt 3207165  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtg 534  Q
     |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  3207166 gtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattactagattagatctaggtg 3207246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 3156751 - 3157147
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||| ||  ||| ||||||||    
T  3156751 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccctggtgagtgaaaatca 3156848  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtat 354  Q
    ||||||||||||       ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  3156849 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 3156947  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||     
T  3156948 ctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgt 3157043  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
     ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3157044 gtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattat 3157141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 31659123 - 31659520
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  31659123 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 31659220  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       |||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  31659221 attgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggct-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 31659319  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  31659320 tctcttt-gtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtg 31659415  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      | | | ||| ||||  ||||||||||||||| || || | || ||||| || | || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  31659416 --tgtttattcctcttttctctccttttatcttttgcttatggttttgtgctttttactttgattcctagattagatcaaggtgttgttattgttgatta 31659513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28220509 - 28220223
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaa-catgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  28220509 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaagcattgaaaacaccttgggtgagtgaaaatc 28220412  T
Q  264 attgagtgtctt-------ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    ||||||||||||       ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  28220411 attgagtgtcttattcattggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 28220313  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28220312 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28220223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 37168297 - 37168465
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  37168297 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 37168394  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37168395 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 37168465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 834450 - 834164
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   | | |||||||    
T  834450 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgcgtgaaaatc 834353  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  834352 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 834254  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  834253 tcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 834164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13547257 - 13547090
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  13547257 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13547160  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13547159 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 13547090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 552
Target Start/End: Original strand, 44455045 - 44455438
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||| ||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| ||||| |    
T  44455045 cttggtaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagttt-tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaacc 44455142  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||| | ||||||    
T  44455143 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgta 44455241  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  44455242 tct-ttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacga--tctttggtg 44455337  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      ||||  ||| |||   |||| | |||||||| || || | || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44455338 tgtttg--ttcctctcttctcttcctttatcttttgcttttggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgatta 44455435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4552920 - 4552634
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    |||||||||| |||||  | |||| ||||||| ||||| |||| ||| |||  ||||||||||||| |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  4552920 cttgggaaattaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttaatt-gaggttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgggtgagggaaaatc 4552823  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  4552822 attgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgtcctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgta 4552724  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4552723 tcccttt-gtaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 4552634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 274 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 42298143 - 42297968
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  42298143 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 42298046  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 447  Q
    | |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42298045 cattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 42297968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 274 - 556
Target Start/End: Original strand, 49918350 - 49918632
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  49918350 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 49918447  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 469  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||      
T  49918448 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctct 49918542  T
Q  470 cctctccttttatcttgtgattgtgta-ttgtgtttctca-cttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 556  Q
     ||||||||||||||| || ||||| | ||||| || |||  ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  49918543 tctctccttttatcttttgcttgtggatttgtgcttttcattttgattcctagattagatataggtgctgttattgttgattattgcttg 49918632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13549168 - 13549001
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagc-taatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || | ||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  13549168 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 13549071  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13549070 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 13549001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28265722 - 28265551
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  28265722 ttggcgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 28265625  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28265624 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28265551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 29136247 - 29136415
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||||  |||||||  |||| |||||||||    
T  29136247 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccatttgtatttcttt-gtaagaact 29136344  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29136345 cattgatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaaca 29136415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 47255508 - 47255340
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  47255508 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 47255411  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  47255410 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 47255340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 20622695 - 20622610
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtg 89  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20622695 tgggaaatcgtgacacgattgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggtggtacgcaaatcgtg 20622610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28223704 - 28223418
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | | ||||||||   ||| |||||||    
T  28223704 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgaagacaccttgggtgagtgaaaatc 28223607  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || || |||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  28223606 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 28223508  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28223507 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28223418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 7482399 - 7482231
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  7482399 ttggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 7482302  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcc-tcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    || ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7482301 tcattgatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaaca 7482231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 11348698 - 11348865
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||    
T  11348698 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttc-taagaact 11348795  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11348796 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaaca 11348865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31925875 - 31925708
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  31925875 ttggtgagagtggaaaaatgggtagaaattagggat-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 31925778  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31925777 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaaca 31925708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 37503837 - 37503443
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  |  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||| || | ||||||||||   ||| |||||||    
T  37503837 cttgggaaatcaaaggaggtgactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctattgggttggaaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 37503740  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtat 354  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||    
T  37503739 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacctt--gtat 37503643  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||| ||||| |||||| ||| |||||  |||||||||     
T  37503642 ctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggatcgaactaggtcaacaa--tctttggtgt 37503547  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtg-ttttgttgattat 550  Q
     ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||  || ||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  37503546 gtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgcggttttgtgcttttcactttaattcctagattagatctaggtgttgatattgttgattat 37503449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3847404 - 3847118
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  3847404 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggtcgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 3847307  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  ||||||| || ||||||||  ||||||    
T  3847306 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgtttaagctaaatttttgtaacccatttgta 3847208  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctc-tcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  3847207 tcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatccatctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct 3847118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 37033241 - 37033068
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| |  ||||| ||| |||| ||||||||    
T  37033241 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctcttt-gtaagaac 37033144  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||||||||||||||||||   ||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37033143 tcattgatagtggattggagagattaatctcttctccatagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatct 37033068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 37560115 - 37559751
Alignment:
Q  204 tctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacacctt-gtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gg 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||| |||||| ||    
T  37560115 tctttgattagagt-tctcttgggtttgaaaacattgtaaacacattaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattaggaaaatgg 37560017  T
Q  294 gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc--aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 390  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37560016 gtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtgaattggaga 37559919  T
Q  391 gtacaatctctcctc--agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtg 488  Q
    |  |||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||  ||||||    ||||| ||| || |||||||| ||    
T  37559918 gatcaatctctccccctagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaa--tctttggtgtgtttgttcctctcttctctc-ccctttatcttttg 37559823  T
Q  489 attgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctaga-ttagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 556  Q
     |||| || ||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  37559822 cttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagatttagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 37559751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 442
Target Start/End: Original strand, 19754494 - 19754664
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  19754494 ttggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctcttt-gtaagaac 19754591  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 442  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  19754592 tcattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaagtgggtcaacaat 19754664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 23555433 - 23555286
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  23555433 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctcttt-gtaagaact 23555336  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtt 420  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  23555335 cattgatagtggattggagagttcaatctctccccatagtaggtcaagtt 23555286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 24786949 - 24787037
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||    
T  24786949 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcaaaccttgggtcagacgcaaatcgtgac 24787037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 24793771 - 24793859
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||    
T  24793771 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcaaaccttgggtcagacgcaaatcgtgac 24793859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 47115171 - 47115340
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||    
T  47115171 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaaaaac 47115268  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
     | |||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  47115269 ccattgatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 47115340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 197191 - 196904
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||| ||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  197191 cttggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 197094  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||| | ||||||    
T  197093 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagttaatttcttgtaactcatttgta 196995  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct--cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  196994 tcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatttatctctccccccagattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 196904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 45644523 - 45644351
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  45644523 ttggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 45644425  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||||||||||||||||||  |||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  45644424 cattgatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 45644351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 50169378 - 50169207
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||    
T  50169378 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagtact 50169281  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||||||||||||| ||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  50169280 cattgatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 50169207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13659619 - 13659333
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtag-agagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | ||||   ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||||  | || |||||||    
T  13659619 cttgggaaatcaaaggaggtaacttgtgggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatc 13659522  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||| | |||||  ||||||||||||||| |||  ||| ||    
T  13659521 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggtt-gttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttata 13659423  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13659422 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 13659333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 44203347 - 44203430
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  44203347 aaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 44203430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 193611 - 193778
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || | | |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  193611 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttattagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaataact 193708  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  193709 cattgatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 193778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 403
Target Start/End: Original strand, 1833407 - 1833652
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggaga-aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaat 262  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||  |||||| | ||||||||||   ||| ||||||    
T  1833407 cttgggaaatcaaagg-agataactttaaggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 1833503  T
Q  263 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaa-cttgtcaagctaatttcttgtaac-cttttgt 352  Q
    ||||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||  | ||||||| |||||||||| | |||||    
T  1833504 cattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatctattgaagctaaattcttgtaactcatttgt 1833602  T
Q  353 atcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 403  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1833603 atctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 1833652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 436
Target Start/End: Original strand, 34603576 - 34603740
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||    
T  34603576 ttggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatctcttt-gtaagaac 34603673  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 436  Q
    || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34603674 tcattgatggtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtg 34603740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 50167343 - 50167172
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  50167343 ttggtgagattgggaaaattagtagaaattagggtt-gttatttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 50167246  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  50167245 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagctcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 50167172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 225 - 444
Target Start/End: Original strand, 46064861 - 46065089
Alignment:
Q  225 gggttgaaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcat 315  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| |    
T  46064861 gggtggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatggataaaaattagg-tttgttctt 46064959  T
Q  316 tgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtag 412  Q
    ||||| || ||  |||||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||    
T  46064960 tgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaactcatgtgtatctcttt-gtaagaactcattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtag 46065058  T
Q  413 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  46065059 gtcaag-ttggatcgaactgggtaaacaatct 46065089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 63
Target Start/End: Original strand, 9036132 - 9036187
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 63  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036132 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 9036187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13138257 - 13137973
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  13138257 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagggt-tctcttggggtgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 13138160  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtat 354  Q
    |||||||||||||       |||||||||  ||| || |||||||||||  | |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| ||    
T  13138159 attgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaatggatagaaattagg--tcgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcat 13138062  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||| |||||||| | |||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  13138061 ctcttt-gtaagaacacattgatagtggattgaagagagcaatctctcccctagagtaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaatct 13137973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Original strand, 19752685 - 19752857
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    |||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  19752685 ttggtgagattgagtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctcttt-gtaagaac 19752782  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctc-ctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || ||||||| |||||||||||  ||||||||| | || | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  19752783 tcattgatagaggattggagagatcaatctctctcccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 19752857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 385
Target Start/End: Original strand, 41360914 - 41361026
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  41360914 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 41361011  T
Q  371 ctttgatagtggatt 385  Q
    | |||||||||||||    
T  41361012 cgttgatagtggatt 41361026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 420
Target Start/End: Original strand, 15820192 - 15820455
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    |||||||||||||| |  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  15820192 cttgggaaatcaaaagaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 15820289  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgta 353  Q
    |||||||||||||       |||| ||||| || | ||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||    
T  15820290 attgagtgtcttgttctttggtgatattggaaagatgggtaaaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgta 15820388  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtt 420  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||||||| | ||||||||||||||||    
T  15820389 tctctttt-taagaactcattgatagtgcattgaagagataaatctctcatccagagtaggtcaagtt 15820455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 73
Target Start/End: Original strand, 24202360 - 24202425
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24202360 aaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcatatcttggg 24202425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 25439523 - 25439584
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25439523 ttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 25439584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 39445958 - 39445897
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39445958 ttgggaaatcatgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtca 39445897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 41398717 - 41398656
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  41398717 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatcattgataaggactggtca 41398656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 71
Target Start/End: Original strand, 21053665 - 21053733
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgag-aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21053665 tgggaaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttg 21053733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 405
Target Start/End: Original strand, 22079322 - 22079449
Alignment:
Q  279 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttga 376  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||| ||||    
T  22079322 gagattggaaaaatggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactcattga 22079420  T
Q  377 tagtggattggagagtacaatctctcctc 405  Q
    || ||||||||||||  |||| |||||||    
T  22079421 tattggattggagagatcaatttctcctc 22079449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 73
Target Start/End: Original strand, 9986909 - 9986980
Alignment:
Q  2 tttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9986909 tttgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccataataaggactggtcataccttggg 9986980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 440
Target Start/End: Original strand, 28242391 - 28242472
Alignment:
Q  359 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  28242391 tttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 28242472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30476614 - 30476443
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| || |||||||||  ||| |||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  30476614 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttatgaacttgttgaagataatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 30476517  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||||| ||||||||| ||  |||||||| || || |  |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  30476516 cattgatactggattggacagatcaatctctaccccatatgaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 30476443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 73
Target Start/End: Original strand, 40282088 - 40282154
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgag-aaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40282088 aaatcgtgacacgattgtgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttggg 40282154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 139
Target Start/End: Original strand, 51765121 - 51765254
Alignment:
Q  9 aatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacg--caaatcgtgacgtgattgcttcagag 106  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||  | |||||||||  ||||   |||| |    
T  51765121 aatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcataccttgtgacgtacgtaccaatcgtgacacgattttatcagtg 51765220  T
Q  107 ggaggctagta-taaagtgttcttgtgcagattt 139  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  51765221 gaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 51765254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 1054638 - 1054699
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1054638 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctagttaagtatcactgataaggactggtca 1054699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 25444716 - 25444777
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25444716 ttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgttggttaagtatctctgataaggactggtca 25444777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 44023501 - 44023562
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44023501 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtca 44023562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 928123 - 927977
Alignment:
Q  295 tagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagt 392  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||| || |||||||||| |||||     
T  928123 tagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttggatctc-tttgtaaaaactcattaatagtggattagagaga 928025  T
Q  393 acaatctc-tcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
     ||| ||| ||| ||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  928024 ccaacctcttccccaaggtaggtcaag-ttagaccgaactgggtaaaca 927977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Original strand, 10925108 - 10925397
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||| ||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  10925108 cttggaaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattatagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 10925205  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgta 353  Q
    |||||||||||||       |||||||||  |||| || ||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||||||    
T  10925206 attgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatggatagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgta 10925304  T
Q  354 tcccttttgt---aagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || | |||||   ||||| || ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||| ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  10925305 tctc-tttgtaagaagaattcattgatagtggattggagaaatcaatctctcccctagattaggtaaag-ttggatcgaactgggtcaacaatct 10925397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 277 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 40122363 - 40122193
Alignment:
Q  277 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 373  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||||    
T  40122363 gtgagattggaaaaatgggtcgaaattaga-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttataactcatttgtatcacttt-gtaagaactctt 40122266  T
Q  374 tg--atagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||  |||||||||| |||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  40122265 tgatatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 40122193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13316601 - 13316518
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttg 250  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  13316601 cttgggaaatcaaaggtagcaactttagggtttaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 13316518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 41391062 - 41391001
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  41391062 ttgggaaatcgtgacatgattcagaaacttgctcattaagtatcactgataaggactggtca 41391001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 43988073 - 43988134
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43988073 ttggtaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 43988134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 414
Target Start/End: Original strand, 6808507 - 6808595
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctc-tcctcagagtaggt 414  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||   |||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  6808507 aagctaacttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctcttcctcagagtaggt 6808595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 417
Target Start/End: Original strand, 3460710 - 3460841
Alignment:
Q  288 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggatt 385  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||  ||||   ||||||   |||||||| ||||    
T  3460710 aaaagggtagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttgtatatctttgtaaagaacatattgatagtcgatt 3460809  T
Q  386 ggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaa 417  Q
    ||||||  |||| ||| |  ||||||||||||    
T  3460810 ggagagatcaatatcttcctagagtaggtcaa 3460841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 402
Target Start/End: Original strand, 16455676 - 16455750
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctc 402  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16455676 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctctgt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 16455750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 37879079 - 37879005
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 347  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  37879079 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacct 37879005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8871213 - 8871143
Alignment:
Q  277 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 346  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | | | |||||||||||||||||||    
T  8871213 gtgagatttggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagttcgttgaagctaatttcttgtaacc 8871143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 37876848 - 37876767
Alignment:
Q  359 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  37876848 tttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaag-ttgaaccgaactgggtgaaca 37876767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 279 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12318685 - 12318585
Alignment:
Q  279 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttga 376  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||| ||||    
T  12318685 gagatttggaaatgggtagaaattagg-tttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatgtcttctttaagaactcattga 12318587  T
Q  377 ta 378  Q
    ||    
T  12318586 ta 12318585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 360
Target Start/End: Original strand, 48382441 - 48382505
Alignment:
Q  296 agaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttt 360  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  48382441 agaaattagggtttgatctttgtgaacttgt-aagttaatttcttgtaacctatttgtatcacttt 48382505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Original strand, 19361037 - 19361105
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||    
T  19361037 ttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttg 19361105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 355
Target Start/End: Original strand, 32736952 - 32737015
Alignment:
Q  292 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatc 355  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32736952 gggtagaaattagggtttgttctttatgaactt-ttaagctaattttttgtaacctctttgtatc 32737015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 355
Target Start/End: Original strand, 35109493 - 35109556
Alignment:
Q  292 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatc 355  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35109493 gggtagaaattaaggtttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttgtaacctatttgtatc 35109556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 402
Target Start/End: Original strand, 5459961 - 5460035
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctc 402  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||   |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  5459961 aagctaatttcttgtaacattttatatttctttgtaaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctc 5460035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 359 - 420
Target Start/End: Original strand, 36683766 - 36683828
Alignment:
Q  359 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtt 420  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||| || ||||||||||||||||    
T  36683766 tttgtaagaactcattgatagtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaagtt 36683828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 37282846 - 37282728
Alignment:
Q  288 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggatt 385  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||   |||||||| ||  |||||||||    
T  37282846 aaaatggtataaattagggtttgttccttgtgagcttgttgaagctaatttatggtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattagtagtggatt 37282747  T
Q  386 ggagagtacaatctctcct 404  Q
    ||||||   ||||||||||    
T  37282746 ggagagataaatctctcct 37282728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 517 - 556
Target Start/End: Original strand, 10925464 - 10925504
Alignment:
Q  517 ctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 556  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10925464 ctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 10925504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 84)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 3439396 - 3439805
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3439396 cttgagaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagaaaatcat 3439495  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439496 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 3439595  T
Q  366 gaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttct 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439596 gaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctctttggtgcttttgttttct 3439695  T
Q  465 tcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacaca 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  3439696 tcttccctctccttttatcttgtgattgtgttttgagtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattgttgcttg--cacaca 3439793  T
Q  565 ctttgtttggtg 576  Q
    ||||||||||||    
T  3439794 ctttgtttggtg 3439805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 25689847 - 25690259
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25689847 cttgggaaatcaaagggagaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 25689946  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689947 tgagtgtcttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 25690046  T
Q  366 gaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttc 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25690047 gaactctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtttgttgttttc 25690146  T
Q  464 ttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacac 563  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25690147 ttcttccctccccttttatcttgtgagtgtgttttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattcttgcttgcacacac 25690246  T
Q  564 actttgtttggtg 576  Q
    |||||||||||||    
T  25690247 actttgtttggtg 25690259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Original strand, 15290417 - 15290810
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15290417 cttgggaaatcaaaggga-aagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 15290513  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  15290514 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta 15290613  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||    
T  15290614 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctcttt-gtgtttattgtt 15290712  T
Q  461 ttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  15290713 ttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgc 15290810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Original strand, 15470786 - 15471179
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15470786 cttgggaaatcaaaggga-aagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 15470882  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  15470883 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta 15470982  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||    
T  15470983 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctcttt-gtgtttattgtt 15471081  T
Q  461 ttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  15471082 ttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattcgatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgc 15471179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 42575599 - 42575207
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  42575599 cttgggaaatcaaaggga-aagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagag--aatcat 42575503  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  42575502 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggattgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta 42575403  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  42575402 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgtt 42575304  T
Q  461 ttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgc 557  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||  |  | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42575303 ttcttcttccctctccttgtatcttgtgtttggttgctttgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgc 42575207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 166 - 548
Target Start/End: Original strand, 2627627 - 2628012
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2627627 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatca 2627725  T
Q  265 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatccctttt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||||||| ||| |    
T  2627726 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgt 2627824  T
Q  362 gtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgtt 460  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||    
T  2627825 gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatctc-ttggtgtctttgtt 2627923  T
Q  461 ttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatt 548  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2627924 ttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcacttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgatt 2628012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 166 - 558
Target Start/End: Original strand, 31218142 - 31218541
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  31218142 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 31218239  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgta 353  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  31218240 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgta 31218338  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31218339 tctctttgg-aagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtg 31218435  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
      |||||||   ||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31218436 tgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttgtgcttatgttttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattat 31218533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 34254611 - 34254217
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||  ||| |||||||||    
T  34254611 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggagacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcat 34254514  T
Q  266 tgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcc 356  Q
    |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||     
T  34254513 tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatct 34254415  T
Q  357 cttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt 455  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |    
T  34254414 cttt-gtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgt 34254318  T
Q  456 ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgc 553  Q
    ||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34254317 ttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgcttttctctttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgc 34254220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 17982538 - 17982935
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  17982538 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 17982635  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgta 353  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  17982636 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgta 17982734  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17982735 tctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtg 17982831  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
      |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  17982832 tgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggtttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattat 17982929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 34256787 - 34256393
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||  | | |||||||||    
T  34256787 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tatcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgtgtgaaaatcat 34256690  T
Q  266 tgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcc 356  Q
    |||||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||     
T  34256689 tgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatct 34256591  T
Q  357 cttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt 455  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |    
T  34256590 cttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtgt 34256494  T
Q  456 ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgc 553  Q
    ||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || || | ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34256493 ttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgcttttctctttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgc 34256396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 166 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 19945643 - 19945243
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  19945643 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagagt-ctttgattagagt-tctcttgggtcgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 19945546  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc--ttttgt 352  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  19945545 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgt 19945447  T
Q  353 atcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggt 451  Q
    ||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19945446 atctctttgg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcgagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaa--tctttggt 19945350  T
Q  452 gcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
    |  |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19945349 gtgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggtttgtgcttttcacttcgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgatta 19945252  T
Q  550 ttgcttgca 558  Q
    |||||||||    
T  19945251 ttgcttgca 19945243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 44303739 - 44304137
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  44303739 cttgagaaatcaaaggaaacaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 44303836  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa---gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgt 352  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44303837 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgt 44303935  T
Q  353 atcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggt 451  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||    
T  44303936 atctctttt-taagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactaggtgaacaa--tctttggt 44304032  T
Q  452 gcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
    |  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44304033 gtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgcttttcactttgatttctagattagatctaggtgttgttattgttgatta 44304130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 42498079 - 42498477
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||| | | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  42498079 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacgttgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 42498176  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgta 353  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  42498177 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgta 42498275  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    |  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42498276 tttcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtg 42498372  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      ||||||| | ||||  ||||||||||||||| || |||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  42498373 tgtttgtttccctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttaatta 42498470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 1746501 - 1746105
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  1746501 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggtcctt-gattagagt-tctctttggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 1746404  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgta 353  Q
    ||||||||||||       |||||||||  ||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1746403 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgta 1746305  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  1746304 tctctttg--aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tcgttggtg 1746209  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
      |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  ||| | || | || ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  1746208 tgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggtttgcgcttttgactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattat 1746111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Original strand, 43036308 - 43036594
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  43036308 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 43036405  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  | ||||||    
T  43036406 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgta 43036504  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43036505 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 43036594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 166 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 12702921 - 12702542
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | || | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  12702921 cttgggaaatcaaaggaggtaaatttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 12702824  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa------gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttt 349  Q
    || |||||||||       |||||||||||||||      ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  12702823 ttaagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttt 12702725  T
Q  350 tgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt 448  Q
    ||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  12702724 tgtgtctcttt-gtaagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tcttt 12702629  T
Q  449 ggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcactt--gtttcctagattagatctaggtg 534  Q
    |||   |||||||   ||||  |||||| ||||||||||| |||| || |||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  12702628 ggtatgtttgtttctctctt--ctctccctttatcttgtgcttgtggttttgtgtttttcactttgattttctagattagatctaggtg 12702542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 166 - 552
Target Start/End: Original strand, 15212671 - 15213064
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    |||||||||||||| |  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  15212671 cttgggaaatcaaatgaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 15212768  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    ||||| |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  15212769 attgaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 15212867  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  15212868 tctcttt-gtaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtg 15212963  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| |  ||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  15212964 tgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggctttgtgcttttcactttgattcctagattagatcaaggtgctgttattgttgatta 15213061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 33352035 - 33352432
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    |||||||||||||||   | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||  |||||||    
T  33352035 cttgggaaatcaaagaaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgattgaaaatc 33352132  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||||||    
T  33352133 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgta 33352231  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||    
T  33352232 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttgatg 33352327  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta-ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      ||||  ||| |||    |||||||||||||| || ||||| | |||||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  33352328 tgtttg--ttcctctcttatctccttttatcttttgcttgtggatttgtgtttttcactttgatttctagattagatttaggtgttgttattgttgatta 33352425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 556
Target Start/End: Original strand, 27811164 - 27811560
Alignment:
Q  167 ttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||  | || | ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||   ||| ||||||||    
T  27811164 ttgggaaatcaaaggaggtaaatttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttaggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatca 27811261  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtat 354  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  27811262 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 27811360  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | |||| |||||||| | |||||||||||||| ||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||     
T  27811361 ctcttt-gtaagaacccattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgt 27811456  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-tattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
     ||| ||  | ||||  ||||   |||||||| || ||||| | ||||| || |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27811457 gttttttcccctctt--ctcttgctttatcttttgcttgtgattttgtgcttttcactttgattcctaaattagatctaggtgttgttattgttgattat 27811554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 4283524 - 4283691
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  4283524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4283621  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4283622 cattgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 4283691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 42435159 - 42434992
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  42435159 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 42435062  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42435061 cattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 42434992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 172 - 552
Target Start/End: Original strand, 4731549 - 4731936
Alignment:
Q  172 aaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgag 269  Q
    ||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||||||||    
T  4731549 aaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgag 4731646  T
Q  270 tgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatccctt 359  Q
    |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  4731647 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gctctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctt 4731745  T
Q  360 ttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttg 458  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || |||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||  |||||||||  ||||    
T  4731746 t-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattcggtcaag-ttggaccgaattgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg 4731841  T
Q  459 ttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 552  Q
      ||| |||   |||||| |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4731842 --ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 4731936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 36979890 - 36979802
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36979890 ttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatctctgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 36979802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 276 - 444
Target Start/End: Original strand, 40321082 - 40321251
Alignment:
Q  276 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctttt-gtatcccttttgtaagaactct 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||    
T  40321082 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctcttt-gtaaaaactct 40321179  T
Q  373 ttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40321180 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40321251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Original strand, 6598857 - 6599143
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggaga-aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaat 262  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| ||||||    
T  6598857 cttgggaaatcaaagg-agataactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 6598953  T
Q  263 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgt 352  Q
    |||| |||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  6598954 cattaagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 6599052  T
Q  353 atcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6599053 atac-ttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6599143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Original strand, 6674310 - 6674596
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggaga-aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaat 262  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| ||||||    
T  6674310 cttgggaaatcaaagg-agataactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaat 6674406  T
Q  263 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgt 352  Q
    |||| |||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  6674407 cattaagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgt 6674505  T
Q  353 atcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6674506 atac-ttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6674596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 141
Target Start/End: Original strand, 15290273 - 15290407
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgattgcttcagagg 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  | ||||||||||||||  |||||   ||||||    
T  15290273 aaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtagttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattggaacagagg 15290372  T
Q  108 gaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttga 141  Q
     || |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15290373 aagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttga 15290407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 141
Target Start/End: Original strand, 15470642 - 15470776
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgattgcttcagagg 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  | ||||||||||||||  |||||   ||||||    
T  15470642 aaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtagttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattggaacagagg 15470741  T
Q  108 gaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttga 141  Q
     || |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15470742 aagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttga 15470776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 18655400 - 18655567
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  18655400 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 18655497  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | ||||||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18655498 cattgatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 18655567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3303953 - 3303667
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| || |||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  3303953 cttgggaaatcaaaggaggtaactttacggttgagggt-ctttgattagggt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatc 3303856  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgta 353  Q
    ||||||| |||||       ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| | ||||||    
T  3303855 attgagtatcttgtttattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgta 3303757  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3303756 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct 3303667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 3439209 - 3439297
Alignment:
Q  1 atttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtg 89  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||    
T  3439209 atttgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcatatcgtg 3439297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 4759658 - 4759746
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  4759658 ttgggaaatcgtgacacgatttagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggaacggacgcaaatcgtgac 4759746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 30656158 - 30656070
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||    
T  30656158 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcaaaccttgggtcagacgcaaatcgtgac 30656070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Original strand, 25689666 - 25689753
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||    
T  25689666 tgggaaatcgtcacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttggtttgtacacaaatcgtgac 25689753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 30143227 - 30143622
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||| |||   ||| |||||||    
T  30143227 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatc 30143324  T
Q  264 attgagtgtc-----ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatc 355  Q
    |||| || |      ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30143325 attgtgtcttgttcattggccagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatc 30143423  T
Q  356 ccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 454  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||  |||||||| ||| || |||||| || |||||  |||||||||      
T  30143424 tcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagataaggtcaag-ttgaactgaactgagtcaacaa--tctttggtgtg 30143519  T
Q  455 tttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattatt 551  Q
    ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| || ||| | || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30143520 tttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattatt 30143617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Original strand, 40221745 - 40221916
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  40221745 ttggtgagattggtaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 40221842  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  40221843 cgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatct 40221916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 434
Target Start/End: Original strand, 18141821 - 18141981
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  18141821 ttggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg--ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaagaact 18141917  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactggg 434  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  18141918 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccaaactggg 18141981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Original strand, 33037411 - 33037543
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgattgcttc 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||  |||||||||    
T  33037411 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatcactgataaggactggtcatgccttggaacggacgcaaatcgtgacacgattgcttc 33037510  T
Q  103 agagggaggctagtataaa--gtgttcttgtgc 133  Q
    ||| |||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  33037511 agaaggagactagtatatattgtgttcttgtgc 33037543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 403
Target Start/End: Original strand, 30291606 - 30291737
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| |    
T  30291606 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcacttt-gtaagaatt 30291704  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 403  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30291705 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcc 30291737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 1292631 - 1292471
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  1292631 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 1292534  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 434  Q
    | ||||||||||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1292533 cattgatagtggatttgagaaataaatctctccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactggg 1292471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 42575779 - 42575696
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  42575779 aaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtctttccttgggacggacgcaaatcgtgac 42575696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 41366778 - 41366612
Alignment:
Q  278 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 374  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |||| | |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  41366778 tgagattgagaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtaagcttgtttaagctaatttcttttaacctatttgtatcccttt-gtaagaactcatt 41366681  T
Q  375 gatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  41366680 tatagtggattggagagatcaatctctccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggacaacaatct 41366612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 391
Target Start/End: Original strand, 9765745 - 9765863
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  9765745 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 9765842  T
Q  371 ctttgatagtggattggagag 391  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  9765843 cattgatagtggattggagag 9765863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 18852751 - 18852839
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||    
T  18852751 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtcataccttgggtcagacgcagatcgtgac 18852839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 444
Target Start/End: Original strand, 5689159 - 5689442
Alignment:
Q  169 gggaaatcaaagggaga-aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||| | |||||| | ||||||||||   ||| |||||||||    
T  5689159 gggaaatcaaagg-agataactttagggttgagggt-ctttgattagggt-tctcttgagtttggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcat 5689255  T
Q  266 tgagtgtcttggt-------gagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatc 355  Q
    ||||||||||| |       |||||||| |||| |||||||||||| |||  || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  5689256 tgagtgtcttgttcattaatgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtg-gtgctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatc 5689354  T
Q  356 ccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5689355 tcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 5689442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 277 - 414
Target Start/End: Original strand, 40328782 - 40328922
Alignment:
Q  277 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactct 372  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||     
T  40328782 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaagaactca 40328879  T
Q  373 ttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggt 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  40328880 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 40328922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 73
Target Start/End: Original strand, 1261539 - 1261609
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1261539 ttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 1261609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 277 - 403
Target Start/End: Original strand, 44353796 - 44353923
Alignment:
Q  277 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |    
T  44353796 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctcttt-gtaagaactcat 44353893  T
Q  374 tgatagtggattggagagtacaatctctcc 403  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  44353894 tgatagtggattgaaaagatcaatctctcc 44353923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 18870145 - 18870233
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||    
T  18870145 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactaataaggactggtcataccttgggtcagacgcagatcgtgac 18870233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 276 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 10930365 - 10930193
Alignment:
Q  276 ggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactct 372  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| | || |||||| || ||  |||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||| |     
T  10930365 ggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gctctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaacccatttatatctcttt-gtaagaacaca 10930268  T
Q  373 ttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 447  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10930267 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttctt 10930193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Original strand, 11383989 - 11384152
Alignment:
Q  278 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcttt 374  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||| | ||    
T  11383989 tgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaacccatt 11384086  T
Q  375 gatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    |||| |||||||||||   | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11384087 gatactggattggagacatcgatctctcctccagagtaggttaagtt-ggaccgaactgggtgaaca 11384152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 1345654 - 1345368
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||| ||||||||||  | |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||  ||| || | ||||||||||   ||| |||||||    
T  1345654 cttggaaaatcaaaggatgtaactttagggttgagggtt-tttgattagagt-tctcttgagttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 1345557  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttt-tgta 353  Q
    ||||| |||||||       ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||  | ||||    
T  1345556 attgaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatatgta 1345458  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||    
T  1345457 tctcttt-gaaagaactcattgatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttagaccgaactaggtcaacaatct 1345368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 440
Target Start/End: Original strand, 4162405 - 4162663
Alignment:
Q  186 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg------- 276  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||           
T  4162405 aactttagggttgagggt-ctttgattagggt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgagcgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatta 4162502  T
Q  277 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcttt 374  Q
    ||||||  || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||| ||    
T  4162503 gtgaga--ggaaaatgggtagaagttagg-tttgttctttgagaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaactcatt 4162598  T
Q  375 gatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  4162599 gatag-ggattggagatatcaatctctccccaagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggtaaaca 4162663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8965859 - 8965692
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  ||| | ||| ||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||||    
T  8965859 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttctttatgagtttgttgaagttaatttcttataacccttttatatctc-tttgtaagaactc 8965761  T
Q  372 tttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
     ||||||||| || ||||||   ||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8965760 attgatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 8965692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 349 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4743306 - 4743211
Alignment:
Q  349 ttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4743306 ttgtaacccatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 4743211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 19491867 - 19491755
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  19491867 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 19491770  T
Q  371 ctttgatagtggatt 385  Q
    | |||||||||||||    
T  19491769 cgttgatagtggatt 19491755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 10683863 - 10683924
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10683863 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatctctgataaggactggtca 10683924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 328 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 18106191 - 18106087
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggacc 426  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  18106191 aagctaatttcttgtaactcatttgtatc--ttttgtaagaactcattgatagtgt-ttggagagatcaatctctccccagaataggtcaag-ttggacc 18106096  T
Q  427 gaactgggt 435  Q
    |||||||||    
T  18106095 gaactgggt 18106087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 25327788 - 25327858
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggt 74  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  25327788 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtca-accttgggt 25327858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 72
Target Start/End: Original strand, 7289552 - 7289620
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgg 72  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  7289552 ttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggacttgtc-taccttgg 7289620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 435
Target Start/End: Original strand, 10015136 - 10015241
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggacc 426  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||  | |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||  || ||||||||||| |||||||    
T  10015136 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttt--aggaactcattgatagtggattggagagataaatctctctccatagtaggtcaag-ttggacc 10015232  T
Q  427 gaactgggt 435  Q
    |||||||||    
T  10015233 gaactgggt 10015241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 35745854 - 35745793
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35745854 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctatgataaggactggtca 35745793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3073981 - 3073875
Alignment:
Q  333 aatttcttgtaacctttt-gtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaact 431  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||    
T  3073981 aatttcttgtaacatttttgtatctcttt-gtaagaactcattgataatggcttggagagatcaatctctccccatagtaggtcaag-ttgggccgaact 3073884  T
Q  432 gggtgaaca 440  Q
    |||| ||||    
T  3073883 gggtaaaca 3073875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 6311811 - 6311724
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||||||   | ||||||||||||    
T  6311811 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactaataaggacttgtca-accttgggtcagatgcaaatcgtgac 6311724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 10688723 - 10688810
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |||||||||   | ||||||||||||    
T  10688723 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactaataaggacttgtca-accttgggtcagatgcaaatcgtgac 10688810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 345
Target Start/End: Original strand, 10929686 - 10929871
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtag-agagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||| |  || ||||||||    
T  10929686 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggtt--ggggtctttgattagagt-tctcttgggttgggaacattgtaaacaccttggattagtgaaaatca 10929782  T
Q  265 ttgagtgtc-------ttggtgagat-tgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac 345  Q
    |||||||||       |||||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  10929783 ttgagtgtcttgttctttggtgagatatggaaaatgggtagaaatta-tgtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac 10929871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 433
Target Start/End: Original strand, 3772192 - 3772352
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||| | |||||||  |||| ||||||| |    
T  3772192 ttggtgagattgagaaaattgatagaaattagg-tttgttctttgtgagcttatttaagctaatttcttgtaactcatttgtatatcttt-gtaagaatt 3772289  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctc-ctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 433  Q
      |||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3772290 tattgatagtggattggagagatcaatctatctctcagagtaggtcaag-ttggaccaaactgg 3772352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 429
Target Start/End: Original strand, 8153844 - 8153914
Alignment:
Q  359 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctc-tcctcagagtaggtcaagtttggaccgaa 429  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8153844 tttgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttcctcagagtaggtcaag-ttggaccgaa 8153914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 39784449 - 39784510
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39784449 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgttggttaagtatcactgataaggactggtca 39784510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 26288392 - 26288324
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26288392 ttgggaaatcgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttg 26288324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 26301649 - 26301581
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26301649 ttgggaaatcgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttg 26301581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 26313643 - 26313575
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26313643 ttgggaaatcgtgacacaattttcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttg 26313575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 440
Target Start/End: Original strand, 4733792 - 4733873
Alignment:
Q  359 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||  | |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4733792 tttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 63
Target Start/End: Original strand, 2627442 - 2627503
Alignment:
Q  2 tttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 63  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  2627442 tttgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggattggtc 2627503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 346
Target Start/End: Original strand, 1822297 - 1822365
Alignment:
Q  279 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 346  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  1822297 gagattgcaaaaaggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 1822365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 346
Target Start/End: Original strand, 1856742 - 1856810
Alignment:
Q  279 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 346  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  1856742 gagattgcaaaaaggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 1856810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41365110 - 41364927
Alignment:
Q  186 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttggt----- 278  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |         
T  41365110 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcaaga 41365013  T
Q  279 --gagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttt 360  Q
      |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41365012 ctgagattgggaaaattggtagaaattagg-tttgttctttgtgagtttgtttaagctaatttcttgtaacacatttgtatcccttt 41364927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 141
Target Start/End: Original strand, 3439330 - 3439369
Alignment:
Q  102 cagagggaggctagtataaagtgttcttgtgcagatttga 141  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439330 cagaggaagactagtataaagtgttcttgtgcagatttga 3439369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 11712145 - 11712024
Alignment:
Q  298 aaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaca 395  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||  |||||||||||||| |||| |||| |||| ||||   || ||||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  11712145 aaattaggttttgttccttgagagcttgttgaagctaatttcttgaaacccttttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattgaagagatca 11712046  T
Q  396 atctct-cctcagagtaggtca 416  Q
    |||||| ||||| |||||||||    
T  11712045 atctctccctcaaagtaggtca 11712024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 298 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6813818 - 6813771
Alignment:
Q  298 aaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc 346  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6813818 aaattaggttttgttctttgtgagcttg-caagctaatttcttgtaacc 6813771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 403
Target Start/End: Original strand, 7597669 - 7597745
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 403  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||   |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7597669 aagctaatttcttataatccttttgtatctctttgtaaagaatgcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 7597745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 359 - 391
Target Start/End: Original strand, 10929874 - 10929906
Alignment:
Q  359 tttgtaagaactctttgatagtggattggagag 391  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10929874 tttgtaagaactcattgatagtggattggagag 10929906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 279 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 29796485 - 29796413
Alignment:
Q  279 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctttt 350  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| | | ||||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  29796485 gagattgggaaaagagtagaaatcaaggtttgttcttggagaacttgttgaagctgatttcttgtaacatttt 29796413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 497 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 32902132 - 32902096
Alignment:
Q  497 ttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggt 533  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32902132 ttgtgtttttcacttggttcctagattagatctaggt 32902096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 6266583 - 6266993
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266583 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 6266682  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266683 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 6266782  T
Q  365 agaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg-cttttgtttt 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  6266783 agaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtcttttgtttt 6266881  T
Q  463 cttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacaca 562  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||    
T  6266882 cttcttccctctccgtttatcttgtgcttgtgtattgtgtttttcacttctttcctagattagatctaggtgttgttttgttgatttttgctt--acaca 6266979  T
Q  563 cactttgtttggtg 576  Q
    ||||||||||||||    
T  6266980 cactttgtttggtg 6266993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 166 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 12647660 - 12647265
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12647660 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcat 12647564  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12647563 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa 12647464  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  12647463 agaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttt 12647365  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 560  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12647364 tcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 12647265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 254 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 13656220 - 13655908
Alignment:
Q  254 agagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgta 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13656220 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgta 13656121  T
Q  354 tcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggt 451  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13656120 tcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggt 13656021  T
Q  452 gctt-ttgttttcttcttccctctcct--tttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgat 547  Q
    | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13656020 gtttgttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtt 13655921  T
Q  548 tattgcttgcaca 560  Q
    | |||||||||||    
T  13655920 tcttgcttgcaca 13655908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 166 - 559
Target Start/End: Original strand, 32289457 - 32289853
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  32289457 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggtttggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatca 32289555  T
Q  265 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttg 362  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32289556 ttgagtgtcttggtgagattgg-aaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttg 32289653  T
Q  363 taagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttt 461  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  32289654 taagaactcattgatagtaaattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtccttgttt 32289753  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcac 559  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32289754 tcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 32289853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 166 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 4484614 - 4484211
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| | ||||||    
T  4484614 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatca 4484516  T
Q  265 ttgagtgtcttg------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtat 354  Q
    ||||||||||||      |||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4484515 ttgagtgtcttgttcttggtgaaattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat 4484417  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||     
T  4484416 ctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacagaactgggtgaacaa--tctttggtgt 4484319  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattatt 551  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4484318 ctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgcttgtggtttttgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattatt 4484219  T
Q  552 gcttgcac 559  Q
    ||||||||    
T  4484218 gcttgcac 4484211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 166 - 564
Target Start/End: Original strand, 30833230 - 30833638
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||  |||||| | |||||| |||  ||| | ||||||    
T  30833230 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggtt-tttgattagagcttatcttgggttgggaaacattgtaaacactttggtgagtgtaaatca 30833328  T
Q  265 ttgagtgtcttg------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtat 354  Q
    ||||||||||||      ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  30833329 ttgagtgtcttgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtat 30833427  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||     
T  30833428 ctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaa--tctttggtgt 30833525  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattatt 551  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30833526 ctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattatt 30833625  T
Q  552 gcttgcacacaca 564  Q
    |||||||| ||||    
T  30833626 gcttgcactcaca 30833638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 166 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 4503415 - 4503017
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  4503415 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagg-ttctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 4503318  T
Q  265 ttgagtgtcttggt-------gagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgta 353  Q
    |||||||||||| |       |||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4503317 ttgagtgtcttgttcattggagagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgta 4503219  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4503218 tctctttg--aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtg 4503123  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
      |||||||   ||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4503122 tgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttgtgcttgtgttttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattat 4503025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 45099640 - 45100036
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  45099640 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 45099737  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgta 353  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  45099738 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgta 45099836  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || ||||   |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  45099837 tctctttg--aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtg 45099932  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
      |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  45099933 tgtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtgatttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattat 45100030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 36205946 - 36205551
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  36205946 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatca 36205849  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtat 354  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36205848 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtat 36205750  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | ||||   |||||||| |||| || |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  36205749 ctctttg--aagaactcattgacagcggattggagagttcaatctatcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct--ttggtgt 36205654  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattatt 551  Q
     |||||||   |||||  ||||||||||| || || |||||  || || || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  36205653 gtttgtttctctcttc--tctccttttatattttgcttgtggtttctgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattatt 36205556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 166 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 5723537 - 5723146
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  5723537 cttgggaaatcaaaggaggcaactttagggtttggggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 5723440  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctttt-gtatc 355  Q
    ||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5723439 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaagggtagaaattaggctt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatc 5723341  T
Q  356 ccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgct 454  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||      
T  5723340 tcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtg 5723244  T
Q  455 tttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctc-acttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 552  Q
    |||||||   |||   ||||||||||||||| || |||||  ||||| || ||   ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5723243 tttgttt--ctctattctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgcttttctttttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattg 5723146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 36988358 - 36987961
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  36988358 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatagtaaacaccttggtgagtgaaaatca 36988261  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-cttttgtat 354  Q
    ||||||||||||       ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  36988260 ttgagtgtcttgttcattggtgggattggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctatgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaactcttttgtat 36988162  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  36988161 ctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgt 36988065  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
     |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| |  ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  36988064 gtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggctttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattat 36987967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 2334700 - 2334414
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  2334700 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggta-tttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 2334603  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtat 354  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2334602 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaataagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaactcttttgtat 2334504  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2334503 ctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggggaacaatct 2334414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 274 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 6595175 - 6594890
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||    
T  6595175 ttggtgagattaggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctcttt-gtaagaac 6595078  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttctt 468  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||   ||||    
T  6595077 tcgttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt 6594980  T
Q  469 ccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 556  Q
    | ||| ||||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  6594979 ctctc-ccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgatttctagattagatctaggtgctgttattgttgattattacttg 6594890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 204 - 539
Target Start/End: Original strand, 29867791 - 29868133
Alignment:
Q  204 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gg 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| ||    
T  29867791 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgg 29867889  T
Q  294 gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 391  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29867890 gtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactctttgatagtggattggagag 29867987  T
Q  392 tacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgat 490  Q
      |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| || ||  |||||| ||  |||||||   ||||  |||||| ||||||||||| |    
T  29867988 atcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataa--tctttgatgtgtttgtttctctctt--ctctccgtttatcttgtgct 29868082  T
Q  491 tgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 539  Q
    ||| || ||| |||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  29868083 tgtggttttgagtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 29868133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 167 - 556
Target Start/End: Original strand, 38312126 - 38312522
Alignment:
Q  167 ttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | | |||||||||  ||| ||||||||    
T  38312126 ttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagg-ttctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtatacaccttgtgtgagtgaaaatca 38312223  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtat 354  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||    
T  38312224 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtat 38312322  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||     
T  38312323 ctcttt-gtaagatctcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttgatgt 38312418  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
     ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  38312419 gtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattgt 38312516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 204 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34140017 - 34139767
Alignment:
Q  204 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gg 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||| ||    
T  34140017 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgg 34139919  T
Q  294 gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttt-tgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 391  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34139918 gtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaagaactcattgatagtggattggagag 34139820  T
Q  392 tacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
      |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  34139819 atcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 34139767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 45726929 - 45727096
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  45726929 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 45727026  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45727027 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 45727096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 724027 - 723741
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  724027 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 723930  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       |||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  723929 attgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaactgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 723831  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  723830 tcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 723741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14634109 - 14633822
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  14634109 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagagttgagggtt-tttgattagagt-tcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 14634012  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  14634011 attgagtgtcttgttcatttgtgagattggtaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 14633913  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  14633912 tcccttttgtaagaactcatagatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct 14633822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 420
Target Start/End: Original strand, 42362237 - 42362500
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  42362237 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 42362334  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  42362335 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 42362433  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtt 420  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || |||| |||||||||||    
T  42362434 tcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagattaggtcaagtt 42362500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11151874 - 11151588
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  11151874 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 11151777  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    ||||||| |||||       |||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  11151776 attgagtctcttgttcattggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 11151678  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11151677 tcacttt-gtaagaactcttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 11151588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Original strand, 11690386 - 11690672
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  11690386 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattatagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 11690483  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  11690484 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgta 11690582  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||| || || | || |||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  11690583 tcccttt-gtaagaaatcgttgatagtggattggagagatcaacctctcccccatattacgtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 11690672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 9295986 - 9296074
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9295986 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatccttgataaggactggtcataccttgggtcggacgcaaatcgtgac 9296074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 11098511 - 11098599
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11098511 ttgggaaatcgtgacacgatttagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtcaaaccttgggttgtacgcaaatcgtgac 11098599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 14292001 - 14291913
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14292001 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtaccactgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 14291913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 17057615 - 17057255
Alignment:
Q  204 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gg 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||| |||| ||    
T  17057615 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgg 17057517  T
Q  294 gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 391  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  | |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17057516 gtagaaattagggtt-gttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagag 17057419  T
Q  392 tacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgat 490  Q
      |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |    
T  17057418 atcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctcgtctctccctttatcttttgct 17057324  T
Q  491 tgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 556  Q
    ||| || ||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17057323 tgtggttttgtgcttttcactttaattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 17057255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 17085598 - 17085238
Alignment:
Q  204 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gg 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||| |||| ||    
T  17085598 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgg 17085500  T
Q  294 gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 391  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  | |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17085499 gtagaaattagggtt-gttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagag 17085402  T
Q  392 tacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgat 490  Q
      |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |    
T  17085401 atcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctcgtctctccctttatcttttgct 17085307  T
Q  491 tgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 556  Q
    ||| || ||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17085306 tgtggttttgtgcttttcactttaattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 17085238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 35447052 - 35446885
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  35447052 ttggtgagattggtaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 35446955  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35446954 cattgatagtggattggagagatcactctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 35446885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 36318177 - 36318006
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  36318177 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36318080  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36318079 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36318006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Original strand, 36773562 - 36773733
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  36773562 ttggtgagattgggaaaatgggaataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 36773659  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36773660 ctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36773733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 26353184 - 26353351
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactc 371  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  26353184 ttggtgagattgaaaaaagtgtagaaattaaggtttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtat-ctttttgtaagtactc 26353282  T
Q  372 tttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
     |||||||||||||||||||  || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  26353283 attgatagtggattggagagatcactctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaaccgggtaaaca 26353351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1631900 - 1631735
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  1631900 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 1631803  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 438  Q
    | ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1631802 cattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaa 1631735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 279 - 440
Target Start/End: Original strand, 33648176 - 33648340
Alignment:
Q  279 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttga 376  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||   |||||||| ||||    
T  33648176 gagattgagaaaatggtaaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattga 33648275  T
Q  377 tagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  33648276 tagcggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtaaaca 33648340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 12647842 - 12647755
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  12647842 tgggaaatcgtgacacgatccataaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 12647755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 442
Target Start/End: Original strand, 24398055 - 24398228
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaa--aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||    
T  24398055 ttggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaac 24398154  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 442  Q
    || |||||| ||||||||||||  |||||||| || || |||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  24398155 tcattgataatggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaactggctgaacaat 24398228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 42288278 - 42288117
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||  |||| |||||| ||    
T  42288278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatttcttt-gtaagagct 42288181  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 435  Q
    | |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  42288180 cattgataatggattggagagatcaatctctccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 42288117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33162618 - 33162447
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| || | |||||||||    
T  33162618 ttggtgaaattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctct-gtaagaact 33162521  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | ||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  33162520 cattgatagtggattagagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 33162447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 274 - 405
Target Start/End: Original strand, 13121769 - 13121899
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactct 372  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||     
T  13121769 ttggtgagactgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacc-tttgtatctc-tttgtagaaactca 13121866  T
Q  373 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctc 405  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  13121867 ttgatagtggattgaagaaatcaatctctcctc 13121899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 366 - 444
Target Start/End: Original strand, 17450671 - 17450748
Alignment:
Q  366 gaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17450671 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccacagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaacaatct 17450748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 328 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17490261 - 17490149
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggac 425  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  17490261 aagctaatttcttgtaactcttttgtaactcttt-gtaagaactcattgatagtggattgtagagatcaatctctcccctagagtaggtcaa-tttggac 17490164  T
Q  426 cgaactgggtgaaca 440  Q
    |||||||||| ||||    
T  17490163 cgaactgggtaaaca 17490149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7815441 - 7815323
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactc 371  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||   | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  7815441 ttggtgagattgagaaaaaggttgaaattagggtttgttctttagaagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactc 7815343  T
Q  372 tttgatagtggattggagag 391  Q
     || ||||||||||||||||    
T  7815342 atttatagtggattggagag 7815323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Original strand, 11067305 - 11067476
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  11067305 ttggtgaaattggaaaaatgggtagaaattagtgtt-gtactttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 11067402  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | || ||| ||||||| ||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  11067403 catttataatggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactcggtcaacaatct 11067476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 25410141 - 25410073
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25410141 ttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaatggtcgtaccttg 25410073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 19344885 - 19344824
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19344885 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 19344824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 328 - 440
Target Start/End: Original strand, 7451173 - 7451284
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggac 425  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||     
T  7451173 aagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaag-ttgga- 7451269  T
Q  426 cgaactgggtgaaca 440  Q
    |||||||||||||||    
T  7451270 cgaactgggtgaaca 7451284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 367 - 444
Target Start/End: Original strand, 39284930 - 39285007
Alignment:
Q  367 aactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  39284930 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 39285007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 19349743 - 19349682
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19349743 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgttggttaagtatctctgataaggactggtca 19349682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 3492252 - 3492184
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||    
T  3492252 ttgggaaatcgtgacacgattctgaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttg 3492184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 73
Target Start/End: Original strand, 32289279 - 32289343
Alignment:
Q  9 aatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32289279 aatcgtgacacgatttgaaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttggg 32289343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 59
Target Start/End: Original strand, 39811601 - 39811657
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggact 59  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  39811601 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggact 39811657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 308
Target Start/End: Original strand, 39284770 - 39284920
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacacctt-gtagagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||| |  ||| |||||||    
T  39284770 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 39284867  T
Q  264 attgagtgtc-------ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtt 308  Q
    ||||||| ||       ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39284868 attgagtatcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt 39284920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 4484792 - 4484728
Alignment:
Q  9 aatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  4484792 aatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttctatgataaggactggtcgtaccttggg 4484728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14202569 - 14202450
Alignment:
Q  278 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttg 375  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||       ||||  ||||||||||||| |||    
T  14202569 tgagattgggaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaac-----tcatcc--tttgtaagaactcattg 14202478  T
Q  376 atagtggattggagagtacaatctctcc 403  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  14202477 atagtagattggagagatcaatctctcc 14202450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Original strand, 30833046 - 30833114
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||    
T  30833046 ttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttccaggataaggacaggtcgtaccttg 30833114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 32247244 - 32247188
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  32247244 aaatcgtggcacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaagactggtca 32247188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 417
Target Start/End: Original strand, 42412118 - 42412162
Alignment:
Q  373 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaa 417  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  42412118 ttgatagtggattggagagatcaatctctccccagagtaggtcaa 42412162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 441
Target Start/End: Original strand, 24197906 - 24198065
Alignment:
Q  283 ttgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgt--caagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaag-aactctttgatag 379  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||| | | ||||||||   | |||||||||||||||||  ||||||| | |||| ||| ||||||||||||     
T  24197906 ttgggaaaagggtagaaattaaagttttttcttggagaacttgttgaaggctaatttcttgtaacc-cttgtatctc-tttgcaagaaactctttgataa 24198003  T
Q  380 tggattggagagtacaatctctcctcaga-gtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 441  Q
    ||||||||||||  | |||| ||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  24198004 tggattggagagatctatct-tctccagacgtaggtcacgtttgggccgaactgggtaaacaa 24198065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 429
Target Start/End: Original strand, 28671989 - 28672088
Alignment:
Q  332 taatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaa 429  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  28671989 taatttcttgttaccgttttgtatctctttacaaagaactcactgacagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaa 28672088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 344
Target Start/End: Original strand, 28770730 - 28770781
Alignment:
Q  292 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 344  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28770730 gggtagaaattagagtttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttgtaa 28770781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 99)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 20343789 - 20344201
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20343789 cttggggaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 20343888  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343889 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 20343988  T
Q  366 gaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttc 463  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343989 gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttc 20344087  T
Q  464 ttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctagg---tggtgttttgttgattattgcttgcaca 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||| |||||||  ||    
T  20344088 ttcttccctctccttttatcttgtgattgtgttttgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtgctggttttttgtcgattgttgcttg--ca 20344185  T
Q  561 cacactttgtttggtg 576  Q
    ||||||||||||||||    
T  20344186 cacactttgtttggtg 20344201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 166 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 18392470 - 18392075
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  18392470 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcat 18392374  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18392373 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa 18392274  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  18392273 agaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttt 18392175  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 560  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18392174 tcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 18392075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 166 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 18389034 - 18388639
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  18389034 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcat 18388938  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18388937 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa 18388838  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  18388837 agaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttt 18388739  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 560  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18388738 tcttcttccctctctttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 18388639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 32060759 - 32060201
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgattgcttcagagg 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||  |||||   ||||||    
T  32060759 aaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgacacgattggaacagagg 32060660  T
Q  108 gaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttct 206  Q
     || |||||| | ||||||||||||||||||||||                        |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  32060659 aagactagtacttaagtgttcttgtgcagatttgaagggaagaggttggaagagagagacttgggaaatcaaagggt-aagctctagggtttagggttct 32060561  T
Q  207 ttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32060560 ttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattaggg 32060461  T
Q  307 tttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccc--ttttgt-aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctc 402  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060460 tttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctc 32060361  T
Q  403 ct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattg 499  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||  |||    
T  32060360 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttg 32060262  T
Q  500 tgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 560  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32060261 tgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 32060201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 166 - 506
Target Start/End: Original strand, 24789733 - 24790075
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789733 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 24789832  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgta 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24789833 tgagtgtcttggtaagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacattttgtatcccttttgta 24789932  T
Q  365 agaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg-cttttgtttt 462  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||    
T  24789933 aaaactctttgatagtggattggagagtactatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgttttt 24790031  T
Q  463 cttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttct 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24790032 cttcttccctctccttttatcttgtgattgtgcattgtgtttct 24790075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 6594832 - 6594420
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6594832 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcat 6594736  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  6594735 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa 6594636  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  6594635 agaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttt 6594537  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac- 559  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  6594536 tcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 6594437  T
Q  560 acacactttgtttggtg 576  Q
    | | |||||||||||||    
T  6594436 ataaactttgtttggtg 6594420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 6592614 - 6592202
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6592614 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcat 6592518  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  6592517 tgagtgtcttggtgagattgggaaatgggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa 6592418  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  6592417 agaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttt 6592319  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac- 559  Q
    ||||||||||||    ||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  6592318 tcttcttccctccttgtttttcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 6592219  T
Q  560 acacactttgtttggtg 576  Q
    | | |||||||||||||    
T  6592218 ataaactttgtttggtg 6592202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 166 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 43504431 - 43504025
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43504431 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttggcttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatca 43504333  T
Q  265 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatccctttt 361  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  43504332 tcgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctctttt 43504234  T
Q  362 gtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgtt 460  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  43504233 gtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgtt 43504135  T
Q  461 ttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac 559  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||| ||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  43504134 ttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttgattcctagattagatctagctg--tttttgttgattattgcttgcac 43504037  T
Q  560 acacactttgtt 571  Q
    ||||||||||||    
T  43504036 acacactttgtt 43504025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 166 - 559
Target Start/End: Original strand, 39731261 - 39731656
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  39731261 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 39731359  T
Q  265 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttg 362  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39731360 ttgagtgtcttggtgagattggaaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttg 39731458  T
Q  363 taagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttt 461  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  39731459 taagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgtctttgttt 39731556  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcac 559  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39731557 tcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcac 39731656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 170 - 552
Target Start/End: Original strand, 35853804 - 35854194
Alignment:
Q  170 ggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattga 268  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  35853804 ggaaatcaaaggtagcaactttagggtttagggt-ctttgatttgagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattga 35853901  T
Q  269 gtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatccct 358  Q
    ||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  35853902 gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctct 35854000  T
Q  359 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctttt 457  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  35854001 tt-gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtgttt 35854098  T
Q  458 gttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 552  Q
    ||||   ||||| ||| |||||||||||||| |||||| || || || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  35854099 gtttctctcttctctc-ccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttgcttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 35854194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 166 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1562278 - 1562103
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1562278 cttggggaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcat 1562182  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562181 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 1562103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 166 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 25767237 - 25766842
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   | | |||||| | ||||||||||  ||| |||||||||    
T  25767237 cttgagaaatcaaagggagcaactctagggtttaggg-tctttgattagagtttctctt---tgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcat 25767142  T
Q  266 tgagtgtcttg----gtgagattgg-gaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatccc 357  Q
    |||||||||||     |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  25767141 tgagtgtcttgttcattgagattggaaaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctc 25767043  T
Q  358 ttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttt 456  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  25767042 ttttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtgtt 25766945  T
Q  457 tgttttcttcttccctctccttttatc-ttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgc 553  Q
    |||||   | ||| ||| ||||||||| || || |||||  |||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25766944 tgtttctctattctctc-ccttttatctttttgcttgtgatttgtgtttttcactttgatacctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgc 25766846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 166 - 559
Target Start/End: Original strand, 48408687 - 48409092
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  48408687 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 48408785  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc--ttttgta 353  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  48408786 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaatgtt-gttctttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgta 48408884  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48408885 tctcttttgaaataactcattgatagtggattggagagtttaatctctcctccagagtatgtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatttc-ttggtg 48408983  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatc-ttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      |||||||   ||||| ||| ||||||||| || || |||||  ||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48408984 tgtttgtttctctcttctctc-ccttttatctttttgcttgtgatttgtgcttttcactttgatacctagattagatctaggtgctgttattgttgatta 48409082  T
Q  550 ttgcttgcac 559  Q
    ||||||||||    
T  48409083 ttgcttgcac 48409092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 29990940 - 29991335
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggaga-aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatc 263  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||||||    
T  29990940 cttgggaaatcaaagg-agacaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatc 29991036  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtat 354  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29991037 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaggatagaaattagggtt-gttatttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat 29991135  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | ||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  29991136 ctctttc-taataactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgt 29991232  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattatt 551  Q
     |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||| || || | ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29991233 gtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtttgtgcttttctctttgattcctatattagatctaggtgttgttattgttgattatt 29991330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 351 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 1560757 - 1560544
Alignment:
Q  351 gtatcccttttgtaagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  1560757 gtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtaaccaatctctt- 1560659  T
Q  449 ggtgcttttgttttcttcttccctctcctt--ttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 545  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560658 ggtgtatttgttttcttcttccctctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 1560559  T
Q  546 attattgcttgcaca 560  Q
     || |||||||||||    
T  1560558 tttcttgcttgcaca 1560544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 23554925 - 23555323
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | ||||  |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  23554925 cttgggaaatcaaaggaggtaacttcagggttgaaggt-ctttgattagagt-tctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 23555022  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgta 353  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23555023 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgta 23555121  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
     | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  23555122 cctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttgatg 23555218  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23555219 tgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggtattgtgttttttactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgatta 23555316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 166 - 555
Target Start/End: Original strand, 4178660 - 4179054
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  4178660 cttgagaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 4178757  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtat 354  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4178758 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtat 4178856  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | ||||   |||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||||||     
T  4178857 ctctttg--aagaactcattgatagtggattgaacagttcaatctctcctccagagcaggtcaagtttgaaccaaactaggtgaacaa--tctttggtgt 4178952  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattatt 551  Q
     |||||||   ||||  |||||||||||| || || |||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4178953 gtttgtttctctctt--ctctccttttatattttgcttgtggtttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattatt 4179050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 204 - 556
Target Start/End: Original strand, 25615785 - 25616137
Alignment:
Q  204 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaa-gggtagaaa 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||    
T  25615785 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagagaaaatcattgagtgtcttg---agattgggaaaatgggtagaaa 25615880  T
Q  301 ttagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatc 398  Q
    ||||| |||||||  ||||  |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||    
T  25615881 ttagg-tttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatca-ttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatc 25615978  T
Q  399 tctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gta 496  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||   |||| | ||||  ||||||||||| |||| ||     
T  25615979 tctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggcgaacaa--tctttggtgtgtttgtttctctctt-cttctctctttatcttgtgcttgtggtt 25616075  T
Q  497 ttgtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 556  Q
    ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25616076 ttgtgcttttcacttcgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttg 25616137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34310884 - 34310712
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  34310884 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatct-ttttgtaagaact 34310787  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310786 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34310712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14070116 - 14069830
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaa-aacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  14070116 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggctgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggtaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 14070019  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  14070018 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgta 14069920  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14069919 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 14069830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14380144 - 14379858
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaa-aacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  14380144 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggctgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggtaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 14380047  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  14380046 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgta 14379948  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14379947 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 14379858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 539
Target Start/End: Original strand, 19502083 - 19502443
Alignment:
Q  186 aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------g 277  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| || |||||||||||||||||       |    
T  19502083 aactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgagaatcattgagtgtcttgttcagtgg 19502180  T
Q  278 tgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctt 373  Q
    |||||||| |||||  || ||||||||| |||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |    
T  19502181 tgagattgcgaaaaaaggttagaaattaaggtt-gttttttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcat 19502278  T
Q  374 tgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccct 472  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||   |||||  |    
T  19502279 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaagtcaagtttggaacgaagtgggtgaacaatct--ttggtgtgtttgtttctctcttc--t 19502374  T
Q  473 ctccttttatcttgtgattgtg-tattgtgtttctcactt-gtttcctagattagatctaggtggtgtt 539  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| | ||| |||| |||||| | || |||||||||||||||||| ||||    
T  19502375 ctccctttattttgtgcttgtggttttgagtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 19502443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 141
Target Start/End: Original strand, 20343625 - 20343762
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgattgcttca 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||  |||| |  ||    
T  20343625 tgggaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgcagatcgtgacacgatttcaaca 20343724  T
Q  104 gagggaggctagtataaagtgttcttgtgcagatttga 141  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343725 gaggaagactagtataaagtgttcttgtgcagatttga 20343762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30025015 - 30024729
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaa-catgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | | | ||||||||||   ||| |||||||    
T  30025015 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttaggttgaaaaacgttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 30024918  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  30024917 attgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 30024819  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  30024818 tctcttt-gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 30024729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 2058481 - 2058393
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2058481 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 2058393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 274 - 552
Target Start/End: Original strand, 27347817 - 27348095
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  27347817 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 27347914  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 469  Q
    | |||||||||||||| ||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||  ||| |||      
T  27347915 cattgatagtggattgcagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctct 27348009  T
Q  470 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 552  Q
     |||||  |||||||| || |||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27348010 tctctcactttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 27348095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 22269973 - 22270140
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  22269973 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 22270070  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
      |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22270071 gattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 22270140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 41317602 - 41317431
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  41317602 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatcccttt-gtaagaact 41317505  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41317504 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 41317431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 24789551 - 24789639
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24789551 ttgggaaatcgtgacacgattgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcttgac 24789639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 204 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 47674189 - 47673953
Alignment:
Q  204 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gg 293  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||| ||    
T  47674189 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgg 47674091  T
Q  294 gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 391  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47674090 gtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagag 47673993  T
Q  392 tacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactg 432  Q
      |||||||||| || | || |||||| |||||||||||||    
T  47673992 atcaatctctccccatattaagtcaag-ttggaccgaactg 47673953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 18126529 - 18126928
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||||| | ||||| ||||   ||| |||||||    
T  18126529 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcatgggttgggaaacattgtaaacaacttgggtgagtgaaaatc 18126626  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgt-caagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    ||||||||| |||       |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18126627 attgagtgttttgttcattggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgta 18126725  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||    |||||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||||    
T  18126726 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaggaatcaatctctcccccagactaggtcaagttt-gaccgacctgggtcaacaa--tctttggtg 18126821  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      ||||||    | ||  |||||| |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  18126822 tgtttgttcctctattttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattcttgatta 18126921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 8359485 - 8359316
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  8359485 ttggggagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 8359388  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  8359387 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 8359316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 41649292 - 41649008
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttg--tagagagaaaat 262  Q
    ||||||||||||||||    |||| ||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  || || ||||||    
T  41649292 cttgggaaatcaaaggagttaactttagggttaagg--tcttttattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggta-agtgaaaat 41649197  T
Q  263 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    ||||||||||||||       |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||  ||||||    
T  41649196 cattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaattggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttagctaatttcttgtaacccatttgta 41649098  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41649097 tcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 41649008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 274 - 436
Target Start/End: Original strand, 6431971 - 6432134
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  6431971 ttggttagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 6432068  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcc-tcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 436  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6432069 cgttgatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtg 6432134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 43864129 - 43864526
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  43864129 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 43864226  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       |||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  43864227 attgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgta 43864325  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctc-ctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| |||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |   |||||    
T  43864326 tctcttt-gtaaaaactaattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tagatggtg 43864421  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43864422 tgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgatta 43864519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 38671505 - 38671219
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  38671505 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagcgaaaatc 38671408  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||| | ||||||    
T  38671407 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacacatttgta 38671309  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||   ||||| | || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  38671308 tcacttt-gtaagaactcattgatagtggattgaagagataaatctatcccccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 38671219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 26417201 - 26417598
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    |||| |||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||  |||||| | ||||||||||   | | |||||||    
T  26417201 cttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgagcgggtgaaaatc 26417298  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||||  ||||||    
T  26417299 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccatttgta 26417397  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||||||| |||||| || ||||||     
T  26417398 tctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctccccaggttaggtcaa-attggaccaaactgggtcaacaatttc-ttggtgt 26417494  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
     ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| || ||| | || |||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  26417495 gtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattcatagattatatctaggtgctgttattgttgattat 26417592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 274 - 438
Target Start/End: Original strand, 29608737 - 29608902
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  29608737 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 29608834  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 438  Q
    | ||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29608835 cattgatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaa 29608902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 554
Target Start/End: Original strand, 48489316 - 48489711
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  48489316 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgatggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 48489413  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    ||| | |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  48489414 attaaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgaaaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 48489512  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| | || ||||| || ||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  48489513 tctcttt-gcaataactcattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaa--tctttggtg 48489608  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      ||||  ||| |||   ||| || |||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48489609 tgtttg--ttcctctcttctcgccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgatta 48489706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 172 - 420
Target Start/End: Original strand, 48491470 - 48491727
Alignment:
Q  172 aaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgag 269  Q
    ||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||| |||   ||| |||||||||||||    
T  48491470 aaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgag 48491567  T
Q  270 tgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatccctt 359  Q
    |||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  48491568 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctt 48491666  T
Q  360 ttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtt 420  Q
    | | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||    
T  48491667 t-gaaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 48491727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Original strand, 20357152 - 20357284
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgattgcttc 102  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||| |  |||||||||    
T  20357152 ttgggaaatcgtgacatgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaccggtcaaaccttgggtcagacgcaaatcgtggcacgattgcttc 20357251  T
Q  103 agagggaggctagtataaa--gtgttcttgtgc 133  Q
    ||||| || |||||||| |  ||||||||||||    
T  20357252 agaggaagactagtatatattgtgttcttgtgc 20357284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 166 - 403
Target Start/End: Original strand, 4586046 - 4586291
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| | |||||    
T  4586046 cttgggaaatcaaaggatgtaactttagggttgaggct-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgtaaatc 4586143  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||| ||    
T  4586144 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccattttta 4586242  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 403  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4586243 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 4586291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 204 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31733215 - 31732966
Alignment:
Q  204 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gg 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||       |||||| || ||||| ||    
T  31733215 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagactgagaaaatgg 31733117  T
Q  294 gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagag 391  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  31733116 gtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatactggattggagag 31733019  T
Q  392 tacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
      |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31733018 atcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 31732966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 3258995 - 3259162
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||| |||     
T  3258995 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaaaaacc 3259092  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3259093 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgaaccgaactgggtgaaca 3259162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4508874 - 4508707
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  4508874 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 4508777  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctc-tcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4508776 cattgagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtgaaca 4508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Original strand, 8153342 - 8153513
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  8153342 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaataact 8153439  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  8153440 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 8153513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 328 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 32358167 - 32358055
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggac 425  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32358167 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggac 32358070  T
Q  426 cgaactgggtgaaca 440  Q
    |||||||||||||||    
T  32358069 cgaactgggtgaaca 32358055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 47676419 - 47676133
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggaga-aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaat 262  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| ||||||    
T  47676419 cttgggaaatcaaagg-agataactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaat 47676323  T
Q  263 cattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgt 352  Q
    || |||||||||||       ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  47676322 caatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgt 47676224  T
Q  353 atcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||| |||| ||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  47676223 atctcttt-gtaagaactcaatgatagtggaatggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatct 47676133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 48599502 - 48599335
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| | |||| ||    
T  48599502 ttggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgg-aagagct 48599405  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48599404 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcagatcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 48599335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Original strand, 1113542 - 1113828
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||   ||| |||||||    
T  1113542 cttgggaaatcaaaggaagtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaacttgggtgagtgaaaatc 1113639  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||    
T  1113640 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccatttgta 1113738  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || || | |||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  1113739 tctcttt-gtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttt-gaccgaattgagtcaacaatct 1113828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4253697 - 4253529
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 371  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| | ||||||||    
T  4253697 ttggtgaaattggtaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttatatctctttggaaagaactc 4253598  T
Q  372 tttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
     |||||| |||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  4253597 attgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtaggtcaa-tttggaccgaactaggtaaaca 4253529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21640299 - 21640167
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgattgcttc 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||  |||||||||    
T  21640299 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcattaagtatcactgataaggactggtcatgccttggaacggacgcaaatcgtgacacgattgcttc 21640200  T
Q  103 agagggaggctagtataaa--gtgttcttgtgc 133  Q
    ||| |||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  21640199 agaaggagactagtatatattgtgttcttgtgc 21640167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 6592792 - 6592709
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  6592792 aaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 6592709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 6595008 - 6594925
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  6595008 aaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 6594925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 18389215 - 18389132
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  18389215 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 18389132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 18392651 - 18392568
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  18392651 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 18392568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 447
Target Start/End: Original strand, 2390301 - 2390456
Alignment:
Q  292 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggag 389  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  2390301 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaataactcatatatagtggattggag 2390398  T
Q  390 agtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 447  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2390399 agatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaataatctctt 2390456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 1562464 - 1562375
Alignment:
Q  2 tttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  | ||||||||||||||    
T  1562464 tttggtaaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgtgacggacgcaaatcgtgac 1562375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2361140 - 2360978
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  2361140 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 2361043  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 435  Q
    | ||||||||||||| ||||   |||||||| || |||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2361042 cattgatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 2360978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31105676 - 31105394
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    |||| |||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  31105676 cttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattatagt-tatcttggggtgagaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 31105579  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  31105578 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagatttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 31105480  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    ||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31105479 tct-ttttgtaagaactcattgatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 31105394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 1533028 - 1533116
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||    
T  1533028 ttgggaaatcgtgacacgattgtgaaacttactcgttaagtatccttgataaggactggttataccttgggacatacacaaatcgtgac 1533116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 36146576 - 36146405
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  36146576 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtttgttatttgtgagcttgttgaagctaatttct-gtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36146479  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | ||||||||||||| |||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  36146478 cattgatagtggatttgagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 36146405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 576
Target Start/End: Original strand, 24790230 - 24790303
Alignment:
Q  501 gtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcacacacactttgtttggtg 576  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  24790230 gtttctcacctgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattacttg--cacgcactttgtttggtg 24790303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 277 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 496148 - 495980
Alignment:
Q  277 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||  ||||||||| |    
T  496148 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggta-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttta-taagaactcat 496051  T
Q  374 tgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  496050 tgatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggtcaag-ttggacagaaccgggtcaacaatct 495980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 23565210 - 23565069
Alignment:
Q  293 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 390  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23565210 ggtagaaattaggtcttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaga 23565112  T
Q  391 gtacaatctctc-ctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 433  Q
    |  ||||||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23565111 gatcaatctctctcctagagtaggtcaag-ttggactgaactgg 23565069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24515043 - 24514934
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  24515043 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 24514946  T
Q  265 ttgagtgtcttg 276  Q
    ||||||||||||    
T  24514945 ttgagtgtcttg 24514934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 430
Target Start/End: Original strand, 23343975 - 23344130
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactc 371  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||||| |||||||    
T  23343975 ttggtgagatttggaaaagggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccctttagtatatc-tttgtgagaactc 23344073  T
Q  372 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaac 430  Q
     |||||| | |||||||||    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23344074 attgataatagattggagaaattaatctctcc-cagagtaggtcaag-ttggaccgaac 23344130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759195
Alignment:
Q  299 aattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaa 396  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  2759339 aattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaa 2759242  T
Q  397 tctc-tcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 443  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  2759241 tctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatc 2759195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4510716 - 4510549
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||    
T  4510716 ttggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttta-taagaact 4510619  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4510618 cattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttggaccgtactgggtgaaca 4510549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4512558 - 4512391
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||    
T  4512558 ttggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttta-taagaact 4512461  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||| |||   |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4512460 cattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaag-ttggaccgtactgggtgaaca 4512391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 21646518 - 21646448
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    |||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21646518 ttggaaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataagaactggtcataccttggg 21646448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22328556 - 22328395
Alignment:
Q  279 gagattgggaa--aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactcttt 374  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   | ||| || ||    
T  22328556 gagattgggaagaaaggttagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgcaaggaagtcatt 22328457  T
Q  375 gatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 435  Q
     |||||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22328456 aatagtggatttgagagatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 22328395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 21811863 - 21811924
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21811863 ttgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctagttaagtatctctgataaggactggtca 21811924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 24023943 - 24024004
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24023943 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggactggtca 24024004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 36574683 - 36574517
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactc 371  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||   ||||||||    
T  36574683 ttggagagattggggaaagg-tagaaattaagatttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaaagaactc 36574585  T
Q  372 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
     |||||||||| ||||||||  |||||  |||  |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  36574584 attgatagtggtttggagagatcaatccatccctagagtaggtcaa-tttggaccaaactgggtaaaca 36574517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12397381 - 12397311
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggt 74  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12397381 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggt 12397311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12406733 - 12406663
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggt 74  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12406733 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggt 12406663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 6360065 - 6359946
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctc-tcctcagagtaggtcaagtttggac 425  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| ||| || | ||||||||| |||||     
T  6360065 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttccccatattaggtcaag-ttggat 6359968  T
Q  426 cgaactgggtgaacaatctctt 447  Q
    |||||||||| |||||| ||||    
T  6359967 cgaactgggtcaacaatttctt 6359946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 24260945 - 24261006
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24260945 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 24261006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 24265801 - 24265862
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24265801 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 24265862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 24526065 - 24525992
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 345  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24526065 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaac 24525992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 43504595 - 43504526
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  43504595 tgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttggg 43504526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 339 - 440
Target Start/End: Original strand, 18396384 - 18396486
Alignment:
Q  339 ttgtaaccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 437  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   ||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |    
T  18396384 ttgtaacattttgtatctctttataaagaattcattgatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactgggtaa 18396483  T
Q  438 aca 440  Q
    |||    
T  18396484 aca 18396486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 359 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24525584 - 24525499
Alignment:
Q  359 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||    
T  24525584 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggacggaactgggtcaataatct 24525499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12098027 - 12097864
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||| || |||||||| ||        ||||    
T  12098027 ttggttagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctct--------aact 12097937  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  12097936 ctttg-tagtggattggagagatgaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 12097864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 433
Target Start/End: Original strand, 31518988 - 31519063
Alignment:
Q  359 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaa--tctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 433  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31518988 tttgtaagaactcattgacagtggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 31519063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 4873597 - 4873541
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggact 59  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4873597 ttgggaaatcgtgacacaattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggact 4873541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 73
Target Start/End: Original strand, 39731064 - 39731128
Alignment:
Q  9 aatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  39731064 aatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttggg 39731128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16880536 - 16880475
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16880536 ttgggaaattgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtttctctgataaggactggtca 16880475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16885391 - 16885330
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  16885391 ttgggaaattgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtttctctgataaggactggtca 16885330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18409270 - 18409206
Alignment:
Q  7 gaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18409270 gaaatcgtgacacgattctcaaacttgcttgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttg 18409206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18414150 - 18414082
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    |||||||||||| |||||||    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18414150 ttgggaaatcgtaacacgattctcaaacttgcttgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttg 18414082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 442
Target Start/End: Original strand, 30814530 - 30814605
Alignment:
Q  367 aactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 442  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30814530 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat 30814605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 59
Target Start/End: Original strand, 31109195 - 31109251
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggact 59  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  31109195 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtataactgataaggact 31109251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 383
Target Start/End: Original strand, 31518795 - 31518905
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaactt-gtcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||| |||  | |||||| ||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  31518795 ttggtgagattgggaaaataggtagaaatta-ggtttgttctttgtgagcttattgaagctagtttcttgtaactcatttgtatctc-tttgtaagaact 31518892  T
Q  371 ctttgatagtgga 383  Q
    | |||| ||||||    
T  31518893 cattgacagtgga 31518905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2058371 - 2058322
Alignment:
Q  94 gattgcttcagagggaggctagtataaa--gtgttcttgtgcagatttga 141  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  2058371 gattgcttcagaggaaggctagtatatattgtgttcttgtgcagatttga 2058322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 346
Target Start/End: Original strand, 28617182 - 28617234
Alignment:
Q  293 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc 346  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  28617182 ggtagaaattaggttttgttctttgtgagctt-ttaagctaatttcttgtaacc 28617234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 397 - 441
Target Start/End: Original strand, 28485811 - 28485854
Alignment:
Q  397 tctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 441  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28485811 tctctcctcagactaggtcaa-tttggaccgaactgggtcaacaa 28485854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Original strand, 48408527 - 48408591
Alignment:
Q  7 gaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||    
T  48408527 gaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttctaggataaggactggtcgtaccttg 48408591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 94)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 8395498 - 8395910
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  8395498 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcat 8395594  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395595 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa 8395694  T
Q  366 gaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtttt 462  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  8395695 gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgtttt 8395793  T
Q  463 cttcttccctctcc-ttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac- 559  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  8395794 cttcttccctctccattgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgttttttgcttgcaca 8395893  T
Q  560 acacactttgtttggtg 576  Q
    | | |||||||||||||    
T  8395894 ataaactttgtttggtg 8395910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 168 - 560
Target Start/End: Original strand, 8393291 - 8393684
Alignment:
Q  168 tgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattg 267  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  8393291 tgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttatggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattg 8393387  T
Q  268 agtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaaga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393388 agtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaaga 8393487  T
Q  368 actc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttct 464  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  8393488 actcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttttct 8393586  T
Q  465 tcttccctctcc-ttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 560  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8393587 tcttccctctccattgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 8393684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 166 - 560
Target Start/End: Original strand, 7124794 - 7125191
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7124794 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 7124892  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  7124893 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaa 7124992  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  7124993 agaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatctcttt-gtgtttattgttt 7125091  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 560  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7125092 tcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 7125191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 166 - 560
Target Start/End: Original strand, 7122575 - 7122972
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7122575 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcat 7122673  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  7122674 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaa 7122773  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||    
T  7122774 agaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccatagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatttcttt-gtgtttattgttt 7122872  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 560  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7122873 tcttcttccctccttgtttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttggttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 7122972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 166 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 31495593 - 31495177
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31495593 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttatagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatca 31495495  T
Q  265 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--ccttttgtatccctttt 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  31495494 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaatta-ggattgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctctttt 31495396  T
Q  362 gtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgtt 460  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  31495395 gtaagaactcattgatagttgattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtctttgtt 31495297  T
Q  461 ttcttcttccctc--------tccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattatt 551  Q
    ||| |||||||||        ||||||||||||||| |||||| || || || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31495296 ttcctcttccctctccttttatccttttatcttgtgcttgtgttttatgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgctgttttgttgattatt 31495197  T
Q  552 gcttgcacacacactttgtt 571  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31495196 gcttgcacacacactttgtt 31495177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 166 - 545
Target Start/End: Original strand, 5138183 - 5138565
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  5138183 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaataccttgtagagag--aatcat 5138279  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt- 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  5138280 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta 5138379  T
Q  364 aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgtt 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||    
T  5138380 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgtt 5138478  T
Q  461 ttcttcttccctctcct--tttatcttgtg-attgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 545  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  |||  |  | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5138479 ttcttcttccctctccttgtttatcttgtgttttggttgctttgtttcacacttggttcctagattagatcta-gtgatgttttgttg 5138565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 166 - 545
Target Start/End: Original strand, 5135957 - 5136340
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaa-catgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  5135957 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaaacatgggaaataccttgtagagagaa--tca 5136053  T
Q  265 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5136054 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgt 5136153  T
Q  364 -aagaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgt 459  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||    
T  5136154 aaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgt 5136252  T
Q  460 tttcttcttccctctcct--tttatcttgtg-attgtgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttg 545  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||  |  | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5136253 tttcttcttccctctccttgtttatcttgtgttttggttgctttgtttcacacttggttcctagattagatcta-gtgatgttttgttg 5136340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 166 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 13992569 - 13992174
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  13992569 cttgggaaatcaaaggtagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 13992471  T
Q  265 ttgagtgtcttggtgagattggg--aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||  || |    
T  13992470 ttgagtgtcttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtat--ctct 13992374  T
Q  361 tgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgt 459  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||    
T  13992373 tgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaacaa--tctttggtgtgtttgt 13992276  T
Q  460 tttcttcttccctctccttttatc-ttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 556  Q
    ||   ||||| ||| ||||||||| || || |||||  ||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13992275 ttctctcttctctc-ccttttatctttttgcttgtgatttgtgcttttcactttgatacctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttg 13992177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 56178919 - 56178522
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  56178919 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaaggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 56178822  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtat 354  Q
    ||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56178821 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtat 56178723  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  56178722 ctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgt 56178626  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
     |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  56178625 gtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttcattcctagattagatctaggtgttgttattgtttattat 56178528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 166 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 30000088 - 29999719
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggaga-aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatc 263  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||  ||| |||||||    
T  30000088 cttgggaaatcaaagg-agacaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatc 29999992  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtat 354  Q
     ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  29999991 gttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtat 29999893  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||     
T  29999892 cttttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca------ttggtgt 29999799  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtg 534  Q
     |||||||   ||||  |||||||||| |||| || |||||  |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  29999798 gtttgtttctctctt--ctctccttttgtcttttgcttgtggtttgtgtttttctctttgattcctagattagatctaggtg 29999719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Original strand, 48142927 - 48143330
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  48142927 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 48143024  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgt 352  Q
    |||||||||||||       |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  48143025 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgt 48143123  T
Q  353 atcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggt 451  Q
    ||| |||   ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  48143124 atctcttca-taagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaacaa--tctttggt 48143220  T
Q  452 gcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg-tattgtg----tttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgtt 544  Q
    |  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || ||||| | |||||    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  48143221 gtgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttgcttgtgattttgtgcttttttttcactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgtt 48143318  T
Q  545 gattattgcttg 556  Q
    ||||||||||||    
T  48143319 gattattgcttg 48143330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 52095645 - 52095248
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  52095645 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggga-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 52095548  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  52095547 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgta 52095449  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  52095448 tctcttt-gtaagaaatctttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg-caagtttggaccgaactgggtgaacaa--tttttggtg 52095353  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      |||||||   ||||  ||||||||||||||| |  |||| || ||||| || || | |||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  52095352 tgtttgtttctctctt--ctctccttttatcttttccttgtggttttgtgcttttctctttgactcctagattagatctaggtgttgttattgttgatta 52095255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 5370369 - 5369968
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggaga-aactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatc 263  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||| | |||||| |||  ||| |||||||    
T  5370369 cttgagaaatcaaagg-agacaactttagggtttagggt-ctttgattatagt-tctcttgggctgggaaacattgtaaacactttggtgagtgaaaatc 5370273  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag----ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa--gctaatttcttgtaacc-ttt 349  Q
    |||||||||||||       |||||||||| ||||     |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  5370272 attgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaaaagaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttt 5370174  T
Q  350 tgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttt 448  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  5370173 tgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggactagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa--tcttt 5370077  T
Q  449 ggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttg 545  Q
    | ||  |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5370076 gatgtgtttgtttatctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttg 5369979  T
Q  546 attattgcttg 556  Q
    |||||||||||    
T  5369978 attattgcttg 5369968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 9927740 - 9927345
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  9927740 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattaaagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 9927643  T
Q  265 ttgagtgtctt-------ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtat 354  Q
     ||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  9927642 ctgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 9927544  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||||     
T  9927543 ctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaa--tctttggtgt 9927448  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgta-ttgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
     ||||  ||| |||   |||||| |||||||| || ||||| | ||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  9927447 gtttg--ttcctctattctctcc-tttatcttttgcttgtggatttgtgcttttcactttgattcctagattaaatctaggtgctgttattgttgattat 9927351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 278 - 447
Target Start/End: Original strand, 2209717 - 2209889
Alignment:
Q  278 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaactctt 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |    
T  2209717 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaactcat 2209814  T
Q  374 tgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 447  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2209815 tgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 2209889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 34570697 - 34570304
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | | || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||   ||| |||||||    
T  34570697 cttgggaaatcaaaggaggtagctttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgaaaacatcttgggtgagtgaaaatc 34570600  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctt-ttgta 353  Q
    |||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||||    
T  34570599 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgta 34570501  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||  |||||||||    
T  34570500 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggatcgaactgggtcaacaa--tctttggtg 34570405  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      ||||  ||| |||   ||||||||||||||| || |||| || ||||| || |||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34570404 tgtttg--ttcctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattcttagattagatctaggtgttgttattgttgatta 34570307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12739833 - 12739547
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacctt-gtagagagaaaatc 263  Q
    |||| |||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| |  ||| | |||||    
T  12739833 cttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtggaaatc 12739736  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  12739735 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgta 12739637  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12739636 tctattt-gtatgaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12739547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 274 - 437
Target Start/End: Original strand, 41964415 - 41964580
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  41964415 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatcccttt-gtaagaac 41964512  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 437  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41964513 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 41964580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 29761134 - 29760995
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgacgtgattgcttc 102  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| |  |||| ||||    
T  29761134 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggtacggacgcaaatcgtggcacgatttcttc 29761035  T
Q  103 agagggaggctagtataaa--gtgttcttgtgcagatttg 140  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  29761034 agaggaagactagtatatattgtgttcttgtgcagatttg 29760995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 442
Target Start/End: Original strand, 37740511 - 37740794
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||  | || | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  37740511 cttgggaaatcaaaggaggtaagtttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 37740608  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtat 354  Q
     |||||||||||       |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  37740609 ctgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 37740707  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 442  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  37740708 ctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactgtgtcaacaat 37740794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Original strand, 5429564 - 5429850
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  5429564 cttgggaaatcaaaggaagtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 5429661  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  5429662 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtta-ttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta 5429760  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5429761 tctattt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 5429850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 169 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 47038689 - 47038408
Alignment:
Q  169 gggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcatt 266  Q
    |||||||||||||    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||   ||||||||||   ||| ||||||||||    
T  47038689 gggaaatcaaaggagttaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattataaacaccttgggtgagtgaaaatcatt 47038592  T
Q  267 gagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaaccttttgtatccct 358  Q
    ||||||||||       |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||  |    
T  47038591 gagtgtcttgttcattggtgagattggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcatttgtatctgt 47038493  T
Q  359 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  47038492 tt-gtaaggactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 47038408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 36463557 - 36463386
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  36463557 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggct-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 36463460  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36463459 ctttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36463386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 40632445 - 40632612
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  40632445 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaagaact 40632542  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40632543 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 40632612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Original strand, 5871705 - 5871991
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  5871705 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttatgggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 5871802  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||  ||| ||    
T  5871803 attgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagcaaatttcttgtaacccattttta 5871901  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| | |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5871902 tcacttt-gcaagaactctttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaatct 5871991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26175919 - 26175633
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  26175919 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagagttgagggt-ctttgattaaagt-tctgttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 26175822  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||  ||||||    
T  26175821 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggggagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgta 26175723  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26175722 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 26175633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 447
Target Start/End: Original strand, 26364236 - 26364410
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  26364236 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 26364333  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 447  Q
    | || ||||||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||    
T  26364334 cattaatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gactgaactgggtcaacaatttctt 26364410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 276 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 46147557 - 46147388
Alignment:
Q  276 ggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactct 372  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||    
T  46147557 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactct 46147460  T
Q  373 ttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46147459 ttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 46147388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 46703500 - 46703669
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--ttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  46703500 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaagaac 46703597  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    || || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  46703598 tcatttatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaattgggtgaaca 46703669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 52082940 - 52082549
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  52082940 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 52082843  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    ||||| |||||||       ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||    
T  52082842 attgactgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgta 52082744  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||       |||  || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  52082743 tctcttt-gtaagaaatctttgatagtg-------gagatcattctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgatttgggtgaacaa--tctttggtg 52082654  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctc-acttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgatta 549  Q
      |||||||   ||||  ||||||||||||||| || |||| || || || || ||   ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  52082653 tgtttgtttatctctt--ctctccttttatcttttgcttgtggttttatgcttttctttttgattcctagataagatctaggtgctgttattgttgatta 52082556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 12073392 - 12073560
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  12073392 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 12073489  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  12073490 cattgatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaaca 12073560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 276 - 447
Target Start/End: Original strand, 12119540 - 12119714
Alignment:
Q  276 ggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactct 372  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||     
T  12119540 ggtgagattggaaaaaagagtagaaattatggtttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactca 12119639  T
Q  373 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 447  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  12119640 tttatagtggattggagagatcaatctctcccaagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaacaatttctt 12119714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 293 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12744073 - 12743922
Alignment:
Q  293 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 390  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12744073 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaga 12743976  T
Q  391 gtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12743975 gatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12743922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 293 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12745462 - 12745311
Alignment:
Q  293 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 390  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12745462 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaga 12745365  T
Q  391 gtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |  |||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12745364 gatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12745311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 41639426 - 41639593
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||    
T  41639426 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt-gtaagaact 41639523  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | | |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  41639524 catcgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtgaaca 41639593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 37229890 - 37229722
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct-tttgtaagaactc 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||| |||  || |||||||||||||    
T  37229890 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtgtgttctttgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgtaagaactc 37229791  T
Q  372 tttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
     || ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  37229790 atttatagtggattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtaaaca 37229722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 48893810 - 48893635
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgt----gaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaag 366  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    || |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||    
T  48893810 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaag 48893713  T
Q  367 aactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  48893712 aactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 48893635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 447
Target Start/End: Original strand, 54883020 - 54883194
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  54883020 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 54883117  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 447  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  54883118 cattgatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttctt 54883194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 442
Target Start/End: Original strand, 36994524 - 36994693
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  36994524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaagaact 36994621  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 442  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || || | ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36994622 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat 36994693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 277 - 440
Target Start/End: Original strand, 379383 - 379548
Alignment:
Q  277 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctt 373  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||  |    
T  379383 gtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgcttt-gtaagaactaat 379480  T
Q  374 tgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||    
T  379481 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactggatgaaca 379548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 292 - 440
Target Start/End: Original strand, 6655975 - 6656123
Alignment:
Q  292 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggag 389  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6655975 gggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggag 6656072  T
Q  390 agtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    ||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6656073 agatcaatctctcatccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggtgaaca 6656123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Original strand, 7122392 - 7122479
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  7122392 tgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 7122479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 166 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12748039 - 12747794
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacctt-gtagagagaaaatc 263  Q
    |||| |||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||| |  ||| | |||||    
T  12748039 cttgagaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtggaaatc 12747942  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  12747941 attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgta 12747843  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 403  Q
    ||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12747842 tctattt-gtatgaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 12747794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 54200185 - 54199906
Alignment:
Q  170 ggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattg 267  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||| |||   ||| |||||||||||    
T  54200185 ggaaatcaaaggaggtaactttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattg 54200088  T
Q  268 agtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatccc 357  Q
    |||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  54200087 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc 54199989  T
Q  358 ttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 442  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||  || ||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  54199988 ttt-gtaagaactcattgatagtgaattagagagatcattctctcccccagattaggtcaag-ttgga-cgaactgggtcaacaat 54199906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 8648139 - 8648306
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  8648139 ttggtgagaatgggaaaatggatagaaattagggtt-gttcattgtgagtttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctcttt-gtaagaact 8648236  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8648237 cattgatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtgaaca 8648306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 420
Target Start/End: Original strand, 8665408 - 8665556
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  8665408 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 8665505  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtt 420  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8665506 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 8665556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 45687351 - 45687179
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||  ||| |||||||||    
T  45687351 ttggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttataactcatttgtatctattt-gtaagaact 45687253  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||||||||||||||||||  | ||||||||| || | || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  45687252 cattgatagtggattggagagatctatctctcctccatattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 45687179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6542349 - 6542180
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag--ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaac 369  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  || |||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  6542349 ttggggagattgggaaaaaatggtagaaattaggatttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgttagccttttgtatctcttt-gtaagaac 6542251  T
Q  370 tctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6542250 tcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagggtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 6542180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 257 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 52467546 - 52467351
Alignment:
Q  257 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 347  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||     
T  52467546 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgaggttgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaaccc 52467448  T
Q  348 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
     |||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  52467447 atttgtatcacttt-gtaataactttttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 52467351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 281 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5208003 - 5207843
Alignment:
Q  281 gattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccct-tttgtaagaactctttgata 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||  ||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  5208003 gattggaaaaagggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacc-cttgtatatctatttgtaagaactcattgata 5207905  T
Q  379 gtggattggagagtacaatctctc-ctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  5207904 gtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggtcaa-tttggactgaattgggtaaaca 5207843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24742453 - 24742387
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcatacct 69  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24742453 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcatacct 24742387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 27417133 - 27416962
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||    
T  27417133 ttggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaaaact 27417036  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  27417035 cattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatct 27416962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 328 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 50673960 - 50673848
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggac 425  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50673960 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggac 50673863  T
Q  426 cgaactgggtgaaca 440  Q
    |||||| ||||||||    
T  50673862 cgaactaggtgaaca 50673848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 50262865 - 50262694
Alignment:
Q  278 tgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 374  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||    
T  50262865 tgagattgggaaaatggatcgaaattacggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 50262768  T
Q  375 gatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctt 447  Q
    |||||| |||||||||   |||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50262767 gatagttgattggagatatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacaatctctt 50262694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 403
Target Start/End: Original strand, 4587958 - 4588089
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| | ||||||| |||| | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  4587958 ttggtgaaattgggaaaaaaggtagaaattaagatttgttctttgtaagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaact 4588056  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 403  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4588057 cattgatagtggattggagagaacaatctctcc 4588089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 5135779 - 5135862
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  5135779 aaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaccggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 5135862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 5138005 - 5138088
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  5138005 aaatcgtgacacgatcaagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggaccggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 5138088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Original strand, 7124614 - 7124673
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 63  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124614 tgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 7124673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 293 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744087
Alignment:
Q  293 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 390  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12744195 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggaga 12744098  T
Q  391 gtacaatctct 401  Q
    |  ||||||||    
T  12744097 gatcaatctct 12744087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12745604 - 12745476
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  12745604 ttggcgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 12745507  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct 401  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12745506 cattgatagtggattggagagatcaatctct 12745476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 274 - 432
Target Start/End: Original strand, 35662441 - 35662600
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  35662441 ttggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 35662538  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactg 432  Q
    | |||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  35662539 cattgatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtaggtcaag-ttggaccgaactg 35662600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Original strand, 56141636 - 56141723
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||    
T  56141636 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactggtc-taccttgggtcagatgcaaatcgtgac 56141723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 8393111 - 8393185
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgca 82  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  8393111 aaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccgtgataaggactggtcttttcttgggtggtacgca 8393185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 31474150 - 31474318
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| || |||  ||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  31474150 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtcttgttctttttgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 31474248  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcc-tcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||| ||||||||||   |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31474249 cattgatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 31474318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 289 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26699596 - 26699447
Alignment:
Q  289 aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattg 386  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||| || ||| |||||||    
T  26699596 aaagggtatagattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttataatggattg 26699497  T
Q  387 gagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 435  Q
    |||||  ||||||||  | ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26699496 gagagatcaatctctatcccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 26699447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 51520926 - 51520839
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||    
T  51520926 ttgggaaatcatgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatccctgataaggactgatc-taccttgggtcagacgcaaatcgtgac 51520839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Original strand, 8395320 - 8395394
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgca 82  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  8395320 aaatcgtgacacaatccagaaacttgctcgttaagtatccgtgataaggactggtcgtttcttgggtggtacgca 8395394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Original strand, 29254580 - 29254758
Alignment:
Q  359 tttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctc-ctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctttt 457  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| | || | ||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||    
T  29254580 tttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgttt 29254676  T
Q  458 gttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt 539  Q
    |  ||| |||   |||||| |||||||| || |||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  29254677 g--ttcctctattctctccatttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattactagattagatctaggtgttgtt 29254758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 391
Target Start/End: Original strand, 24969112 - 24969230
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  24969112 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaact 24969209  T
Q  371 ctttgatagtggattggagag 391  Q
      |||||||||||||||||||    
T  24969210 aattgatagtggattggagag 24969230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 440
Target Start/End: Original strand, 51337000 - 51337231
Alignment:
Q  219 tctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatcattgagtgtc-------ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattaggg-t 307  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||   ||| |||||||||||||||||       |||||||||||| ||||| |||||||||||| || |    
T  51337000 tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcctgttcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattacggat 51337099  T
Q  308 ttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-c 405  Q
    |||||| |||||| ||| | ||| |||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||  |    
T  51337100 ttgttctttgtgagctttt-aagataatttattataacccttttgtatctctttt-taagaactcattgatagtgtattagagagatcaatctctcccac 51337197  T
Q  406 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | | ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  51337198 acattaggtcaagtt-ggaccgaactgggtaaaca 51337231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 3814484 - 3814421
Alignment:
Q  1 atttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3814484 atttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtca 3814421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 9224023 - 9224093
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggt 74  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9224023 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggt 9224093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 9228810 - 9228880
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggt 74  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9228810 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggt 9228880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 18712379 - 18712449
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggt 74  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  18712379 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtca-accttgggt 18712449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 5733122 - 5733061
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5733122 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtca 5733061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 13992755 - 13992686
Alignment:
Q  2 tttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  13992755 tttgggaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagttttcatgataaggactggtcataccttg 13992686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18856185 - 18856124
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18856185 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtca 18856124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 45347441 - 45347502
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45347441 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtca 45347502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 45356922 - 45356983
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  45356922 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatcactgataaggactggtca 45356983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 444
Target Start/End: Original strand, 3913424 - 3913618
Alignment:
Q  257 gaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct 347  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| | ||||||||||| | | |||| ||||||  ||||  ||||||||||||| |||||     
T  3913424 gaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgagtagaaattagagct-gttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttttaaccc 3913522  T
Q  348 -tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
     |||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || ||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  3913523 atttgtatatcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccctagagtatgtaaag-ttgtatcgaactgggtcaacaatct 3913618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13009536 - 13009441
Alignment:
Q  348 tttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| || | ||||||||| || |||||||||| || ||||||||    
T  13009536 tttgtatcccttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggtcaag-ttagaccgaactgtgtcaacaatct 13009441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 31495776 - 31495717
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtc 63  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31495776 tgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtc 31495717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 35369653 - 35369614
Alignment:
Q  237 tgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg 276  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35369653 tgggaaacaccttgtagagtgaaaatcattgagtgtcttg 35369614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 416
Target Start/End: Original strand, 33989899 - 33989989
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcc-tcagagtaggtca 416  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   || ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||    
T  33989899 aagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaataactcgttaatagtggattggagagatcaatctctccaccagagtaggtca 33989989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 48142542 - 48142473
Alignment:
Q  278 tgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 346  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  48142542 tgagattgggaacatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacc 48142473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13009714 - 13009604
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgta-gagagaaaatc 263  Q
    |||||||||||||| |  | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   ||| |||||||    
T  13009714 cttgggaaatcaaatgaggtaactttagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 13009617  T
Q  264 attgagtgtcttg 276  Q
    |||||||||||||    
T  13009616 attgagtgtcttg 13009604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Original strand, 28468102 - 28468170
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttg 71  Q
    |||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  28468102 ttggaaaatcgtgacacgattttcaaacttgctcgttaagtttctatgataaggactggtcgtaccttg 28468170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 362
Target Start/End: Original strand, 41639263 - 41639353
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttg 362  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  41639263 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtaaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttttg 41639353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 346
Target Start/End: Original strand, 1983252 - 1983309
Alignment:
Q  288 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacc 346  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  1983252 aaaaggatagaaattatgttttgttctttgtgagcttg-caagctaatttcttgtaacc 1983309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 44967992 - 44967910
Alignment:
Q  279 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttt 360  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || | | || |||| | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44967992 gagattgggaaaatggtagaaattaggttttgctcttggagagcttgctgaagccaatttcttgtaaccatttgtatctcttt 44967910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 343
Target Start/End: Original strand, 5349929 - 5349980
Alignment:
Q  292 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgta 343  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5349929 gggtagaaattagg-tttgttctttgtgaacttgtcgaagctaattccttgta 5349980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 414
Target Start/End: Original strand, 33089933 - 33090021
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggt 414  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||| || |   |||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||    
T  33089933 aagctaatttattataaccattttgtatctctctgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctctagagtaggt 33090021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 52093947 - 52093885
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg 230  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  52093947 cttgggaaatcaaaggaggtaactttagggttgaggg-tctttgattagagt-tctcttgggttg 52093885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 55085532 - 55085445
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgt-aaccttttgtatcccttt 360  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  55085532 ttggtgagattggaaaataggtagaaattaagg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaaccatttgtatctcttt 55085445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 2878 - 2466
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  2878 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcat 2782  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  2781 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaa 2682  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||    
T  2681 agaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttttgtgtttattgttt 2583  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcac- 559  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  2582 tcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 2483  T
Q  560 acacactttgtttggtg 576  Q
    | | |||||||||||||    
T  2482 ataaactttgtttggtg 2466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 3060 - 2973
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  3060 tgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtattcttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 2973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 166 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 4000 - 3605
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  4000 cttgggaaatcaaaggg-gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcat 3904  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  3903 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaa 3804  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttt 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||    
T  3803 agaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttt 3705  T
Q  462 tcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 560  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3704 tcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 3605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 4185 - 4098
Alignment:
Q  4 tgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  4185 tgggaaatcgtgacacgatccagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 4098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 166 - 576
Target Start/End: Original strand, 6167 - 6581
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcat 265  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6167 cttgggaaatcaaaggg-gcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcat 6263  T
Q  266 tgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-a 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |    
T  6264 tgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaagcccttgtatcccttttgtaa 6363  T
Q  365 agaactc-tttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgtttt 462  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  6364 agaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgttattgtttt 6462  T
Q  463 cttcttccctctcc---ttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttctcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgca 558  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  6463 cttcttccctctccttgttttatcttgtgattgttgctttgtgtttcacacttgtttcctagattggatctaggtggtgtattgttgtttcttgcttgca 6562  T
Q  559 c-acacactttgtttggtg 576  Q
    | | | |||||||||||||    
T  6563 caataaactttgtttggtg 6581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 91
Target Start/End: Original strand, 5989 - 6072
Alignment:
Q  8 aaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgcaaatcgtgac 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||    
T  5989 aaatcgtgacacgatcgtgaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcgttccttgggacggacgcaaatcgtgac 6072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 4)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 166 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 11445 - 11042
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| | ||||||    
T  11445 cttgggaaatcaaagggagtaactctagggtttatggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatca 11347  T
Q  265 ttgagtgtcttg------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-ttttgtat 354  Q
    ||||||||||||      ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  11346 ttgagtgtcttgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtat 11248  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  11247 ctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgt 11150  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattatt 551  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11149 ctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtggtttgtgtttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattatt 11050  T
Q  552 gcttgcac 559  Q
    ||||||||    
T  11049 gcttgcac 11042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 166 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 9019 - 8616
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||| ||||||  ||| | ||| ||    
T  9019 cttgggaaatcaaagggagtaactctaggctttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaagaccttggtgagtgtaaacca 8921  T
Q  265 ttgagtgtcttg------gtgagattggga--aaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-ttttgtat 354  Q
    ||||||||||||      ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  8920 ttgagtgtcttgttcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtat 8822  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgc 453  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  8821 ctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgt 8724  T
Q  454 ttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattatt 551  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8723 ctttgttttcctcttccctcttcttttatcttgtgcttgtggtttgtgcttttcactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattatt 8624  T
Q  552 gcttgcac 559  Q
    ||||||||    
T  8623 gcttgcac 8616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 9186 - 9045
Alignment:
Q  1 atttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgca--aatcgtgacgtgattg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||||||||  ||||     
T  9186 atttgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgcaccaatcgtgacacgattt 9087  T
Q  99 cttcagagggaggctagta-taaagtgttcttgtgcagattt 139  Q
      |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9086 tatcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 9045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11631 - 11550
Alignment:
Q  1 atttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacgca 82  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  11631 atttgggaaatcgtgacacgatttgcaaacttgctcgttaagtttccatgataaggactggtcgtaccttgggacgtacgca 11550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 166 - 552
Target Start/End: Original strand, 434418 - 434812
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||    
T  434418 cttgggaaatcaaaggaagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacatggtaaataccttggtgagtgaaaatca 434515  T
Q  265 ttgagtgtcttg-------gtgagattggg--aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgta 353  Q
    ||||||||||||       |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  434516 ttgagtgtcttgttcattggtgagattggggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgta 434614  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg 452  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  434615 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tatttggtg 434711  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
      |||||||   ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  434712 tgtttgtttctctcttctctc-ccttttatcttgtgcttgtgttttgtgcttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattat 434810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 166 - 558
Target Start/End: Original strand, 802 - 1200
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatca 264  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||    
T  802 cttgggaaatcaaaggcagcaactttagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatca 899  T
Q  265 ttgagtgtcttg------gtgagattgggaaaa--gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtat 354  Q
    ||||||||||||      |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  900 ttgagtgtcttgttcttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat 998  T
Q  355 cccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtg- 452  Q
    | ||||   || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  999 ctctttg--aacaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa--tctttggtgt 1094  T
Q  453 cttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtgtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattat 550  Q
     ||||||||   ||||  ||||||||||||  | || |||||  ||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1095 gttttgtttctctctt--ctctccttttatactttgcttgtggtttgtgcttttcactttgatacctagattagatctaggtggtgttattgttgattat 1192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 232 - 563
Target Start/End: Original strand, 11508 - 11855
Alignment:
Q  232 aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaact 323  Q
    |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11508 aaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaact 11606  T
Q  324 tgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtt 420  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11607 tgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 11705  T
Q  421 tggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgtg---tattgtgtttct--cac-ttgt- 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||   ||||| ||| |||||||||||||| |||||   |||||| ||| |  ||| ||||     
T  11706 tggaccgaactgggtgaacaatctc-ttggtgtatttgtttatctcttctctc-ccttttatcttgtgcttgtgttttattgttttttttccactttgta 11803  T
Q  514 ttcctagattag-atctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttgcacacac 563  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11804 ttcctagattagtatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcacacac 11855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 22064 - 22205
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacg--caaatcgtgacgtgattgct 100  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| |  |||||  | |||||||||  ||||       
T  22064 ttgggaaatcgtgacacgattgtaaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacaggtcgtaccttgtgacgtacgtaccaatcgtgacacgatttta 22163  T
Q  101 tcagagggaggctagta-taaagtgttcttgtgcagatttga 141  Q
    |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22164 tcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagatttga 22205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 224
Target Start/End: Original strand, 22229 - 22286
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctctt 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22229 cttgggaaatcaaagggagcaactctagggtttaggg-tctttgattagagtttctctt 22286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 219 - 552
Target Start/End: Original strand, 114539 - 114881
Alignment:
Q  219 tctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttt 309  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  114539 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggtt- 114637  T
Q  310 gttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcct-ca 406  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  114638 gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 114736  T
Q  407 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattg-tgtattgtgtttc 505  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||   ||||||   ||||  ||||||||||||||| |  ||| ||| ||||| ||     
T  114737 gagtaggttaagtttagaccgaactggatgaacaa--tctttggtgtgcttgtttctctctt--ctctccttttatctttttcttgttgttttgtgcttt 114832  T
Q  506 tcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattg 552  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  114833 tcactttgattcctagattagatataggtgttgttattgttgattattg 114881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 355
Target Start/End: Original strand, 102450 - 102513
Alignment:
Q  292 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtatc 355  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  102450 gggtagaaattagggtttgttttttgtgagctt-ttaagataatttcttgtaacctctttgtatc 102513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 408 - 560
Target Start/End: Original strand, 1 - 154
Alignment:
Q  408 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttc 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  1 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttg-tgtttattgttttcttcttccctctccttgtatcttgtgattgttgctttgtgtttc 99  T
Q  506 tcacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgattattgcttgcaca 560  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  100 acacttgtttcctagattagatctaggtggtgttttgttgtttcttgcttgcaca 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 274 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 20583 - 20301
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaagg-gtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  20583 ttggtgagattgggaaaatgagcagaaattagg-tttgttttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 20486  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgcttttgttttcttcttc 469  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||  ||| |||      
T  20485 ctttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tttttggtgtgtttg--ttcctctct 20391  T
Q  470 cctctccttttatcttgtgattgt-gtattgtgtttctcac-ttgtttcctagattagatctaggtggtgtt-ttgttgattattgcttg 556  Q
     |||||| |||||||| || |||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  20390 tctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttaattattgcttg 20301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18171 - 18004
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaag-ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||    
T  18171 ttggtgagagtgggaaaattggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-aact 18075  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18074 cattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaaca 18004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 274 - 440
Target Start/End: Original strand, 7327 - 7494
Alignment:
Q  274 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaact 370  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  7327 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaagaact 7424  T
Q  371 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    | |||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7425 cattgatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtgaaca 7494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 149380 - 149094
Alignment:
Q  166 cttgggaaatcaaagggagaaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtag-agagaaaatc 263  Q
    ||||||||||||||||  | ||||   ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||||  | || |||||||    
T  149380 cttgggaaatcaaaggaggtaacttgtgggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatc 149283  T
Q  264 attgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaggg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgta 353  Q
    |||||||||||||       ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||| | |||||  ||||||||||||||| |||  ||| ||    
T  149282 attgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggtt-gttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttata 149184  T
Q  354 tcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctct-cctcagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 444  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  149183 tctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 149094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Original strand, 10515 - 10656
Alignment:
Q  298 aaattagggtttgttcattgtgaact--tgtcaagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtac 394  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||  |||   |||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  |    
T  10515 aaattagggtttgttctttgtgagctcttgt---gctaatttattgtaaccattttgtatctcttt-gtaagaactcgttgatagtggattgaagagatc 10610  T
Q  395 aatctctcct-cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 440  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10611 aatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 10656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Original strand, 17556 - 17695
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggttgtacg--caaatcgtgacgtgattgct 100  Q
    |||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||  | |||||||||  ||||       
T  17556 ttgggaaatcgtgacatgattttcaaacttgctcgttaagtatccttgataaggattggtcgtaccttgtgacgtacgttccaatcgtgacacgatttta 17655  T
Q  101 tcagagggaggctagta-taaagtgttcttgtgcagattt 139  Q
    |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17656 tcagtggaaggctagtatttaagtgttcttgtgcagattt 17695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Original strand, 34678 - 34748
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggt 74  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34678 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtc-taccttgggt 34748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 821 - 760
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  821 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 3461 - 3522
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  3461 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcaatgataaggactagtca 3522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 13908 - 13969
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  13908 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 13969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 65
Target Start/End: Original strand, 18788 - 18850
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcat 65  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  18788 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaagactggtcat 18850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Original strand, 176574 - 176635
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtca 64  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  176574 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtatctctgataaggactggtca 176635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 8168 - 8098
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttgggt 74  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  8168 ttggaaaatcgtgacacgattcagaaacttgctcgttaagtatcactgataaggacttgtca-accttgggt 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 73
Target Start/End: Original strand, 1863 - 1932
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  1863 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtttctctgataaggactggtca-accttggg 1932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 73
Target Start/End: Original strand, 148568 - 148637
Alignment:
Q  3 ttgggaaatcgtgacacgatcgagaaacttgctcgttaagtatccttgataaggactggtcataccttggg 73  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  148568 ttgggaaatcgtgacacgattcagaaacttgctggttaagtttctctgataaggactggtca-accttggg 148637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 80447 - 80338
Alignment:
Q  278 tgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactcttt 374  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||| |     
T  80447 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatct-ttttgtaagaactcata 80350  T
Q  375 gatagtggattg 386  Q
    ||||||| ||||    
T  80349 gatagtgaattg 80338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 328 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 27556 - 27480
Alignment:
Q  328 aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcc 403  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||   || ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27556 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaataacttattgatagtggattggagagatcaatctctcc 27480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University