View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7246_low_17 (Length: 403)

Name: NF7246_low_17
Description: NF7246
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7246_low_17
NF7246_low_17
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (52-273)||(13402848-13403069)
chr4 (37-314)||(15670083-15670360)
chr4 (37-324)||(17984662-17984949)
chr4 (37-324)||(40921827-40922114)
chr4 (37-324)||(5292886-5293173)
chr4 (37-324)||(5302545-5302832)
chr4 (37-324)||(21846087-21846374)
chr4 (37-324)||(21855679-21855966)
chr4 (37-324)||(21901950-21902237)
chr4 (37-324)||(21911542-21911829)
chr4 (37-324)||(27680549-27680836)
chr4 (37-324)||(27690204-27690491)
chr4 (37-324)||(16249430-16249717)
chr4 (37-324)||(18105212-18105500)
chr4 (37-324)||(6692202-6692489)
chr4 (37-324)||(6702608-6702895)
chr4 (52-324)||(52499110-52499379)
chr4 (37-324)||(3487425-3487712)
chr4 (37-324)||(3496748-3497035)
chr4 (37-324)||(17827963-17828250)
chr4 (37-324)||(17837354-17837641)
chr4 (52-315)||(17161230-17161479)
chr4 (40-308)||(9835860-9836128)
chr4 (124-314)||(16242056-16242246)
chr4 (153-314)||(16253407-16253568)
chr4 (52-111)||(16253578-16253637)
chr4 (37-98)||(13792849-13792910)
chr4 (214-308)||(6405817-6405912)
chr4 (1-59)||(16397132-16397190)
chr4 (210-284)||(13793032-13793107)
chr4 (1-59)||(16210962-16211020)
chr4 (37-91)||(19918396-19918450)
chr4 (1-59)||(44888950-44889008)
chr4 (1-55)||(7846542-7846596)
chr4 (73-138)||(14600515-14600580)
chr4 (210-259)||(19918219-19918267)
chr4 (210-251)||(41525909-41525949)
chr4 (1-37)||(14600466-14600502)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (52-273)||(22244750-22244971)
chr5 (37-323)||(27412133-27412419)
chr5 (37-324)||(18209439-18209726)
chr5 (37-324)||(18218777-18219064)
chr5 (37-324)||(18361261-18361548)
chr5 (37-324)||(26202395-26202682)
chr5 (37-324)||(18390218-18390505)
chr5 (37-324)||(32070424-32070711)
chr5 (37-317)||(21681989-21682269)
chr5 (37-324)||(8765155-8765442)
chr5 (37-324)||(11410899-11411186)
chr5 (37-324)||(33939301-33939588)
chr5 (37-324)||(33949701-33949988)
chr5 (52-324)||(26191806-26192078)
chr5 (37-324)||(30943449-30943736)
chr5 (37-324)||(30952871-30953158)
chr5 (37-324)||(21753427-21753714)
chr5 (37-324)||(21762714-21763001)
chr5 (52-324)||(19888014-19888286)
chr5 (52-314)||(37647662-37647924)
chr5 (52-182)||(27580230-27580360)
chr5 (52-195)||(37538551-37538694)
chr5 (229-314)||(37548445-37548530)
chr5 (214-309)||(23378551-23378647)
chr5 (1-58)||(20897160-20897217)
chr5 (59-187)||(31105544-31105673)
chr5 (1-57)||(21483795-21483851)
chr5 (1-59)||(37817807-37817866)
chr5 (1-59)||(205467-205525)
chr5 (224-261)||(31105460-31105497)
chr5 (1-59)||(34130477-34130536)
chr5 (1-59)||(37298802-37298861)
chr5 (1-59)||(19780794-19780852)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (52-315)||(7034561-7034823)
chr7 (29-324)||(5381598-5381893)
chr7 (29-324)||(5391236-5391531)
chr7 (37-324)||(5927119-5927406)
chr7 (37-324)||(16142254-16142541)
chr7 (37-324)||(16131705-16131992)
chr7 (37-324)||(32098364-32098651)
chr7 (37-324)||(32108801-32109088)
chr7 (37-314)||(42621173-42621450)
chr7 (37-324)||(46497098-46497385)
chr7 (37-324)||(46507710-46507997)
chr7 (52-324)||(14944263-14944533)
chr7 (52-324)||(15371856-15372126)
chr7 (37-324)||(26347940-26348227)
chr7 (37-324)||(44907704-44907991)
chr7 (37-320)||(8501037-8501320)
chr7 (37-320)||(8511507-8511790)
chr7 (37-324)||(11626155-11626442)
chr7 (37-324)||(26362992-26363279)
chr7 (37-324)||(43983461-43983748)
chr7 (37-324)||(6544789-6545076)
chr7 (37-324)||(9535031-9535318)
chr7 (37-324)||(9545314-9545601)
chr7 (52-324)||(44897301-44897573)
chr7 (52-324)||(6534490-6534762)
chr7 (52-324)||(27988849-27989119)
chr7 (34-286)||(14248343-14248595)
chr7 (52-129)||(7019199-7019276)
chr7 (210-303)||(2991876-2991968)
chr7 (1-60)||(9007144-9007203)
chr7 (3-59)||(12515348-12515404)
chr7 (1-59)||(12491540-12491598)
chr7 (37-82)||(14248324-14248369)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (37-315)||(8540243-8540521)
chr1 (37-315)||(8605482-8605760)
chr1 (37-322)||(16154869-16155154)
chr1 (52-286)||(13964906-13965139)
chr1 (37-315)||(18383351-18383628)
chr1 (52-314)||(42034188-42034450)
chr1 (37-308)||(2370196-2370466)
chr1 (37-324)||(21458612-21458899)
chr1 (37-324)||(25019452-25019739)
chr1 (54-314)||(30549412-30549672)
chr1 (37-286)||(18058869-18059117)
chr1 (1-60)||(22956796-22956855)
chr1 (1-60)||(21792952-21793011)
chr1 (229-310)||(2115998-2116079)
chr1 (1-60)||(21821229-21821288)
chr1 (210-273)||(34822980-34823042)
chr1 (1-59)||(22961099-22961157)
chr1 (1-59)||(49333555-49333613)
chr1 (7-59)||(37012201-37012253)
chr1 (2-59)||(25823246-25823303)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (37-314)||(16902285-16902562)
chr2 (37-314)||(16995676-16995953)
chr2 (37-324)||(2998405-2998692)
chr2 (29-324)||(17488674-17488969)
chr2 (40-273)||(44638732-44638964)
chr2 (37-324)||(4467804-4468091)
chr2 (37-324)||(5336843-5337130)
chr2 (37-324)||(5346696-5346983)
chr2 (37-324)||(4458179-4458466)
chr2 (37-322)||(24696293-24696578)
chr2 (37-324)||(18651202-18651489)
chr2 (37-324)||(18663320-18663607)
chr2 (37-324)||(45024793-45025080)
chr2 (37-324)||(9502468-9502755)
chr2 (37-324)||(9513834-9514121)
chr2 (52-324)||(29423348-29423620)
chr2 (52-324)||(45014716-45014988)
chr2 (52-304)||(38957552-38957803)
chr2 (52-314)||(38930204-38930466)
chr2 (1-60)||(69870-69929)
chr2 (1-60)||(21109493-21109552)
chr2 (1-59)||(3605716-3605774)
chr2 (30-61)||(44638744-44638775)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (37-324)||(309817-310104)
scaffold0005 (73-138)||(216798-216863)
scaffold0005 (1-37)||(216876-216912)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (37-324)||(1596790-1597077)
chr6 (37-324)||(12455037-12455324)
chr6 (37-324)||(14791586-14791873)
chr6 (37-324)||(20912266-20912553)
chr6 (37-324)||(31357544-31357831)
chr6 (37-324)||(31367273-31367560)
chr6 (37-324)||(3285830-3286117)
chr6 (37-324)||(18160045-18160332)
chr6 (37-324)||(18169857-18170144)
chr6 (37-324)||(24921791-24922078)
chr6 (37-324)||(24930827-24931114)
chr6 (37-306)||(14045316-14045583)
chr6 (37-324)||(16897930-16898217)
chr6 (37-324)||(16908583-16908870)
chr6 (37-315)||(29540444-29540711)
chr6 (52-322)||(18201201-18201469)
chr6 (37-314)||(26020554-26020831)
chr6 (59-138)||(27787368-27787447)
chr6 (1-59)||(791012-791070)
chr6 (1-59)||(26168589-26168647)
chr6 (1-59)||(24505193-24505252)
chr6 (210-257)||(28092638-28092684)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (37-314)||(11783-12060)
chr3 (59-315)||(20492040-20492295)
chr3 (37-324)||(1685048-1685335)
chr3 (37-320)||(16335241-16335522)
chr3 (37-324)||(6422285-6422572)
chr3 (37-324)||(8972830-8973117)
chr3 (37-324)||(8983385-8983672)
chr3 (37-314)||(13119411-13119688)
chr3 (37-318)||(6432718-6432999)
chr3 (37-324)||(4381080-4381367)
chr3 (37-324)||(9537119-9537406)
chr3 (37-324)||(9547445-9547732)
chr3 (37-324)||(5655423-5655710)
chr3 (37-320)||(10012025-10012308)
chr3 (52-324)||(4371361-4371633)
chr3 (52-324)||(2489016-2489288)
chr3 (52-317)||(25432850-25433113)
chr3 (37-314)||(4782414-4782691)
chr3 (52-183)||(4023921-4024052)
chr3 (185-286)||(4024349-4024449)
chr3 (1-59)||(51978550-51978608)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (37-324)||(233786-234073)
scaffold0014 (1-59)||(114334-114392)
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (37-324)||(9324824-9325111)
chr8 (37-324)||(21997262-21997549)
chr8 (37-320)||(21987728-21988011)
chr8 (37-324)||(13674570-13674857)
chr8 (37-324)||(21334282-21334569)
chr8 (52-314)||(791731-791993)
chr8 (52-324)||(21202617-21202889)
chr8 (52-324)||(21213033-21213305)
chr8 (59-315)||(17268834-17269089)
chr8 (168-308)||(22817599-22817738)
chr8 (1-60)||(31224494-31224553)
chr8 (1-59)||(11430461-11430519)
chr8 (1-59)||(5759608-5759667)
chr8 (1-59)||(20531113-20531172)
chr8 (263-315)||(7757741-7757793)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (37-317)||(20955-21234)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (37-324)||(7640-7927)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (52-314)||(92664-92926)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (37-320)||(74527-74810)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (52-314)||(55631-55893)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (52-314)||(15842-16103)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (37-217)||(17191-17370)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (37-324)||(19162-19450)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (1-57)||(197185-197241)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (1-60)||(11521-11580)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (214-309)||(13818-13914)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (1-60)||(15628-15687)
[»] scaffold1468 (1 HSPs)
scaffold1468 (1-59)||(1536-1594)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-59)||(7637-7695)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (19-60)||(28549-28590)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-61)||(16363-16422)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (214-299)||(65699-65783)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (8-60)||(54848-54900)
scaffold0018 (8-60)||(58800-58852)
scaffold0018 (8-60)||(60228-60280)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Original strand, 13402848 - 13403069
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  13402848 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgagtttttgggcgtgtcatatgcttttcatatgagtttctgggcaataaccaa 13402947  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13402948 agtatggacttttccacatacatcagaaagttgcttttccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 13403047  T
Q  252 gctttgagagtttgtgttgtcc 273  Q
    |||||||||| |||||| ||||    
T  13403048 gctttgagagattgtgtggtcc 13403069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15670360 - 15670083
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15670360 atgatcttcatctaggttcatcatgatcttcatctggattcatcatgtatgaatgaacacatgaatttatgggcgtgtcatatgcttttcatatgagttt 15670261  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctg 236  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||   |   ||||||||    
T  15670260 ctgggcaataaccaaagtatgggcttttccacatacatcagaatgttacttccccagatttgccttgggaccggtgcaggaaagatctagtgggattctg 15670161  T
Q  237 catcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||| | | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  15670160 catcttcatgtccatgctttgagggattgtgtggtccttctactgtaccaactcccatacgtgtctatctcttgttga 15670083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 17984662 - 17984949
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  17984662 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 17984760  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  17984761 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 17984859  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17984860 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 17984949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40922114 - 40921827
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  40922114 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 40922016  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  40922015 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 40921917  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40921916 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 40921827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 5292886 - 5293173
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  5292886 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 5292984  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  5292985 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 5293083  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5293084 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 5293173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 5302545 - 5302832
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  5302545 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 5302643  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  5302644 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 5302742  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5302743 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 5302832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21846374 - 21846087
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  21846374 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgctttccatatgaatt 21846276  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  21846275 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagaatttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 21846177  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21846176 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 21846087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21855966 - 21855679
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  21855966 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgctttccatatgaatt 21855868  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  21855867 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagaatttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 21855769  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21855768 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 21855679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21902237 - 21901950
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  21902237 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgctttccatatgaatt 21902139  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  21902138 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagaatttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 21902040  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21902039 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 21901950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21911829 - 21911542
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  21911829 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgctttccatatgaatt 21911731  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  21911730 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagaatttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 21911632  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21911631 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 21911542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 27680549 - 27680836
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  27680549 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 27680647  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  27680648 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 27680746  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27680747 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 27680836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 27690204 - 27690491
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  27690204 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 27690302  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  27690303 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 27690401  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27690402 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 27690491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16249717 - 16249430
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  16249717 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 16249619  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    | |   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| | |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  16249618 tttggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccaggttttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 16249520  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16249519 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 16249430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 18105212 - 18105500
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  18105212 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 18105310  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatggg-cttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggatt 233  Q
    |||   |||||||||  ||||||  ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   |||||    
T  18105311 tctggacaataaccaatgtatggtacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggatt 18105409  T
Q  234 ctgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18105410 ctgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgtttagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 18105500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6692489 - 6692202
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  6692489 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacatatgaagttctgggctatg-catatgtttttcatatgaatt 6692391  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  6692390 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 6692292  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6692291 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 6692202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6702895 - 6702608
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  6702895 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacatatgaagttctgggctatg-catatgtttttcatatgaatt 6702797  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  6702796 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 6702698  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6702697 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 6702608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52499379 - 52499110
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||     
T  52499379 gttcatgatgattttcatatgggttcataatgtatgaatgaacacatgaagttctgggcgtgtcatgtgcttttcat--gagtttctaggcaataaccaa 52499282  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52499281 agtattggctttttcacatacatcagaaagttactttcccaaatttgcctagggactggtgcaggagaga-taaagtggattctgcatcttcatgcccat 52499183  T
Q  252 gctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| | ||| || ||| ||  ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  52499182 gctttgagggattgtgtggtccttgtactgtatcaactcccatgcgtgtttatctcttgttgaacaagacaga 52499110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 3487425 - 3487712
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| ||||||| |||    
T  3487425 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatccatatgctttccatatgaattt 3487524  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattct 235  Q
    ||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| | |   || || || |||||||||| ||   |   |||||||    
T  3487525 ctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccaggttttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattct 3487623  T
Q  236 gcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3487624 gtatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 3487712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 3496748 - 3497035
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| ||||||| |||    
T  3496748 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatccatatgctttccatatgaattt 3496847  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattct 235  Q
    ||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| | |   || || || |||||||||| ||   |   |||||||    
T  3496848 ctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccaggttttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattct 3496946  T
Q  236 gcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3496947 gtatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 3497035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 17827963 - 17828250
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  17827963 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatccgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgctttccatatgaatt 17828061  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || |  |||||||||| ||   |   ||||||    
T  17828062 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttttcttggaatcggtgcaggag-gatttagtgggattc 17828160  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17828161 tgtatcttcatgcccatgctttgagagattgtattgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 17828250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 17837354 - 17837641
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  17837354 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatccgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgctttccatatgaatt 17837452  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || |  |||||||||| ||   |   ||||||    
T  17837453 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttttcttggaatcggtgcaggag-gatttagtgggattc 17837551  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17837552 tgtatcttcatgcccatgctttgagagattgtattgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 17837641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17161479 - 17161230
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||           |||||||  ||||||||||     
T  17161479 gttcatgatgatcttcatctgggttcttcatgtatgaatgaacac--gaatttctgggcgtgtcatatg-----------agtttctgggcaataaccaa 17161393  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||   ||  |||||||||||||||||||||||    
T  17161392 agtatgggcttttccacatacataagaaagttactttcccagatctgccttgggaccggtgcaggaaagatataatgggattctgcatcttcatgcccat 17161293  T
Q  252 gctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaa 315  Q
    | |||||| | |||||| |||||||  | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17161292 gttttgagggattgtgtggtccttg-actgtaccaactctcatacgtgtctatctcttgttgaa 17161230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 308
Target Start/End: Original strand, 9835860 - 9836128
Alignment:
Q  40 atcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttcta 139  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||   ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   |||||||| |||||||||| |||||     
T  9835860 atcttcatttgggttcatcatgatatttatccgagttgatcatgtatgaatgaacatatgaatttatgggctcatcatatgcgtttcatatgattttctg 9835959  T
Q  140 agcaataacc-acagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgca 238  Q
     |||||| || | ||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||    
T  9835960 ggcaatatccaagagtaatggtttttccacatacatcagaaagttgtttttccaaatttgcctagggactggtgtaggaga-cgtaaggtggattctgca 9836058  T
Q  239 tcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctct 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||  |||| ||| | ||| || ||||||  |||||||||||||    
T  9836059 tcttcatgcccgtgctttgagagattatgcggtccatgtactgtatcaactctcatgcgtgtctatctct 9836128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16242246 - 16242056
Alignment:
Q  124 ttcatatgagtttctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagagg 223  Q
    ||||||||| |||||  |||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||      
T  16242246 ttcatatgaatttctgggcaacaatcaaggtatgggcttttccacatacatcagaatcttccttccccagatttgccttgggaccggtgcaggaaagatc 16242147  T
Q  224 aaagtggattctgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
     |   ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||| | |||||| ||| || || |||||||||||||||||    
T  16242146 tagtgggattctgcatcttcatgcccatgctttgagggattctgtggtccttgtactgtaccaactcccatacatgtctatctcttgttga 16242056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16253568 - 16253407
Alignment:
Q  153 gtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccatg 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||   |   ||||||||||||||||||||||||    
T  16253568 gtatgggattttccacatacatcagaatgttccttccccagatttgccttgggaccggtgcaggaaagatctagtgggattctgcatcttcatgcccatg 16253469  T
Q  253 ctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    ||||||| | || ||| |||||||| | |||||| |||  | ||||||||||||||||||||    
T  16253468 ctttgagggattctgtggtccttgtactgtaccaactcctatacgtgtctatctcttgttga 16253407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16253637 - 16253578
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggca 111  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16253637 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacgcatgaatttctgggca 16253578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 98
Target Start/End: Original strand, 13792849 - 13792910
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacat 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  13792849 atgatcttcatctggattcatcatgatattcatctgggttcaccatgtatgaatgaagacat 13792910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 308
Target Start/End: Original strand, 6405817 - 6405912
Alignment:
Q  214 aggagagaggaaagtggattctgcat-cttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctct 308  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  6405817 aggagagagggaagtagattctgctttcttcatgtccatgctttgagagattgtgtggtccatgtacagtaccagctctcattcgtgtctaactct 6405912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 16397190 - 16397132
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16397190 gttgttgtgttcttcatcagaatgttgatatctatgatgttcttcatctgggttcatca 16397132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 284
Target Start/End: Original strand, 13793032 - 13793107
Alignment:
Q  210 gtgcaggagagaggaaagtggattctgc-atcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtac 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  13793032 gtgcaggagagaggaaattggattctgctttcttcatgccaattctttgagagattgtgtggtccatgtacagtac 13793107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 16210962 - 16211020
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  16210962 gttgatgtgttcttcatcagaatgttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 16211020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 19918450 - 19918396
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatg 91  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  19918450 atgatcttcatctaggttcatcatgatctttatttgggttcttcatgtatgaatg 19918396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 44889008 - 44888950
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  44889008 gttgctgtgttcttcatcagaatgttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 44888950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 7846542 - 7846596
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttc 55  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || || || ||| |||||||||||||||    
T  7846542 gttgttgtgttcttcatcagaatgttaatattcatgatgttcttcatctgggttc 7846596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 14600515 - 14600580
Alignment:
Q  73 ggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttct 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||||||  |||||||||| |||||    
T  14600515 ggtttatcatgtatgaatgaacacatgtgcttttgggcttgtcatatgtgtttcatatgattttct 14600580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19918267 - 19918219
Alignment:
Q  210 gtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccatgctttgag 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  19918267 gtgcatgagagaggaaagtggat-ctccatcttcatccccatgctttgag 19918219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41525949 - 41525909
Alignment:
Q  210 gtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41525949 gtgcaggagagaggaaagtggatt-tgaatcttcatgcccat 41525909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 14600466 - 14600502
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatca 37  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14600466 gttgttgtgttcttcatcagaatgttgatgttcatca 14600502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22244971 - 22244750
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||     
T  22244971 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcgtgtgatatgcttttcatatgagtttctgggcaataatcaa 22244872  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22244871 attatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaggtttgcctagggactggtgcaggagaaaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 22244772  T
Q  252 gctttgagagtttgtgttgtcc 273  Q
    |||||||||| |||||| ||||    
T  22244771 gctttgagagattgtgtggtcc 22244750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 27412419 - 27412133
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  27412419 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 27412321  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   ||  ||||||    
T  27412320 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttaatgggattc 27412222  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacag 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27412221 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaggatgacag 27412133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 18209439 - 18209726
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  18209439 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 18209537  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||       ||||||    
T  18209538 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gattttgtgggattc 18209636  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18209637 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 18209726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 18218777 - 18219064
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  18218777 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 18218875  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||       ||||||    
T  18218876 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gattttgtgggattc 18218974  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18218975 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 18219064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18361548 - 18361261
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  18361548 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 18361450  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  18361449 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 18361351  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18361350 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 18361261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 26202395 - 26202682
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  26202395 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 26202493  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  26202494 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 26202592  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26202593 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 26202682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18390505 - 18390218
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  18390505 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtaagaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 18390407  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  18390406 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 18390308  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18390307 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 18390218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32070711 - 32070424
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  32070711 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 32070613  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  32070612 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 32070514  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32070513 tgcatcttcatgcccatgctttaagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaggatgacaga 32070424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21682269 - 21681989
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  21682269 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 21682171  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||       ||||||    
T  21682170 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gattttgtgggattc 21682072  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaaga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21682071 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaaga 21681989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 8765155 - 8765442
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  8765155 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgctttccatatgaatt 8765253  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccag-atctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| || |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  8765254 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagaatttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 8765352  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8765353 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 8765442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 11410899 - 11411186
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  11410899 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcgtgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 11410997  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  11410998 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 11411096  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11411097 tgcatctttatgcccatgcttttagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 11411186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 33939588 - 33939301
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctggg-catgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| ||    
T  33939588 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggttatg-catatgcttttcatatgaatt 33939490  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  33939489 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 33939391  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33939390 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 33939301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 33949988 - 33949701
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctggg-catgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| ||    
T  33949988 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggttatg-catatgcttttcatatgaatt 33949890  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  33949889 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 33949791  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33949790 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 33949701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 324
Target Start/End: Original strand, 26191806 - 26192078
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataacca 150  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||   |||||||||    
T  26191806 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatttctggacaataacca 26191904  T
Q  151 cagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgccc 249  Q
      |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   |||||||||||||||||||||    
T  26191905 atgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattctgcatcttcatgccc 26192003  T
Q  250 atgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26192004 atgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 26192078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 30943449 - 30943736
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  30943449 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatccgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgctttccatatgaatt 30943547  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  30943548 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttttcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 30943646  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30943647 tgtatcttcatgcccatgctttgagagattgtattgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 30943736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 30952871 - 30953158
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  30952871 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatccgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgctttccatatgaatt 30952969  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  30952970 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttttcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 30953068  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30953069 tgtatcttcatgcccatgctttgagagattgtattgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 30953158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21753714 - 21753427
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  21753714 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacatatgaagttctgggctatg-catatgtttttcatatgaatt 21753616  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  21753615 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagaatttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 21753517  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21753516 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 21753427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21763001 - 21762714
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  21763001 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacatatgaagttctgggctatg-catatgtttttcatatgaatt 21762903  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  21762902 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagaatttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 21762804  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21762803 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 21762714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 324
Target Start/End: Original strand, 19888014 - 19888286
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataacca 150  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||   |||||||||    
T  19888014 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgtttttcatatgaatttctggacaataacca 19888112  T
Q  151 cagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgccc 249  Q
      |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   |||||||||||||||||||||    
T  19888113 atgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattctgcatcttcatgccc 19888211  T
Q  250 atgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19888212 atgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttaaagatgacaga 19888286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 314
Target Start/End: Original strand, 37647662 - 37647924
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctggg-catgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataacca 150  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||   |||||||||    
T  37647662 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggatatg-catatgcttttcatatgaatttctggacaataacca 37647760  T
Q  151 cagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagt-ggattctgcatcttcatgcc 248  Q
      |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | | ||| ||||| ||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||||||    
T  37647761 atgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgccttgggaccggtgcagga-aga-tatagtgggattctgcatcttcatgcc 37647858  T
Q  249 catgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||| |  ||||| ||| || | ||||||||||||||||||    
T  37647859 catgctttgagggattgtgtggtccttgtactataccaactcccatatgtgtctatctcttgttga 37647924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 182
Target Start/End: Original strand, 27580230 - 27580360
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |     
T  27580230 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgtacacatgaatttatgggcgtgtcatatgcttttcatatgagtttctgggcaataattaa 27580329  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27580330 agtatgggcttttccacatacatcataaagt 27580360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 195
Target Start/End: Original strand, 37538551 - 37538694
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataacca 150  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||   |||||||||    
T  37538551 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatttctggacaataacca 37538649  T
Q  151 cagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagat 195  Q
      |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  37538650 atgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagat 37538694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 314
Target Start/End: Original strand, 37548445 - 37548530
Alignment:
Q  229 ggattctgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| | |||||| ||| || | ||||||||||||| ||||    
T  37548445 ggattctgcatcttcatgcccatgctttgagggattgtgtggtccttgtactgtaccaactcccatatgtgtctatctcttattga 37548530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 309
Target Start/End: Original strand, 23378551 - 23378647
Alignment:
Q  214 aggagagaggaaagtggattctgcat-cttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctctt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||  |||| |||  |||| || |||||| ||||||||| |||||    
T  23378551 aggagagaggaaagtggattctgctttcttcacgcccatgctttgagagattgtgcggtccatgtatagtatcaactctcatacgtgtctaactctt 23378647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 20897217 - 20897160
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatc 58  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  20897217 gttgttgtgttcttcataagaatgatgatgtttatgatgttattcatctgggttcatc 20897160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 31105673 - 31105544
Alignment:
Q  59 atgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataacc-acagtatg 157  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||   |||||||  |||||| ||| |||||| |||||| || |  | |      
T  31105673 atgatcttcatatgggttcatcatgtataaatgaacgcatgagtttatgggctcatcatatgtgtttcatttgattttctaggcaatatccaagggcagt 31105574  T
Q  158 ggcttttccacatacatcagaaagttgctt 187  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31105573 ggcttttccacatacatcagaatgttgctt 31105544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 21483795 - 21483851
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcat 57  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  21483795 gttgttgtgttcttcatcaaaatgttgatgttcattatgatcttcatctaggttcat 21483851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 37817866 - 37817807
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatg-ttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  37817866 gttgttgtgttcttcattagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 37817807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 205467 - 205525
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||| |||||||||||    
T  205467 gttgttgtgttcttcatcagaatgttgatattcatgatgttcttcatttgggttcatca 205525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31105497 - 31105460
Alignment:
Q  224 aaagtggattctgcatcttcatgcccatgctttgagag 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31105497 aaagtggattctacatcttcatgcccatgctttgagag 31105460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 34130477 - 34130536
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatg-ttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  34130477 gttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 34130536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 37298802 - 37298861
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatg-ttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  37298802 gttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 37298861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 19780852 - 19780794
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||    
T  19780852 gttgctgtgttcttcatcagaatgttgatattcatgatgttcttcatctaggttcatca 19780794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 52 - 315
Target Start/End: Original strand, 7034561 - 7034823
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  7034561 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttatgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctgggcaataaccaa 7034660  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||    
T  7034661 agtatgggtttttccacatacatcagaaagttactttcccagatttgccttgggactggtgcaggagaga-taaagtggattatgcatcttcatgtcaat 7034759  T
Q  252 gctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaa 315  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| | |||||| || |||  ||||||||||||||||||||    
T  7034760 gctttgagggattgtgtggtccttgtactgtaccaactatcatgcgtgtctatctcttgttgaa 7034823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 5381598 - 5381893
Alignment:
Q  29 tgtttatcatgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttca 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  5381598 tgtttatgatgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttca 5381696  T
Q  128 tatgagtttctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaa 226  Q
    ||||| |||||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |     
T  5381697 tatgaatttctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttag 5381795  T
Q  227 gtggattctgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5381796 tgggattctgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 5381893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 5391236 - 5391531
Alignment:
Q  29 tgtttatcatgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttca 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  5391236 tgtttatgatgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttca 5391334  T
Q  128 tatgagtttctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaa 226  Q
    ||||| |||||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |     
T  5391335 tatgaatttctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttag 5391433  T
Q  227 gtggattctgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5391434 tgggattctgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 5391531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5927406 - 5927119
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  5927406 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 5927308  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  5927307 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 5927209  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5927208 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 5927119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 16142254 - 16142541
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  16142254 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 16142352  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  16142353 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 16142451  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16142452 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 16142541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 16131705 - 16131992
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  16131705 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 16131803  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  || ||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  16131804 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcaaacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 16131902  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16131903 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 16131992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32098651 - 32098364
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  32098651 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 32098553  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  32098552 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 32098454  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32098453 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 32098364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32109088 - 32108801
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  32109088 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 32108990  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  32108989 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 32108891  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32108890 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 32108801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42621450 - 42621173
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  42621450 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatttgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcgtgccatatgcttttcatatgaattt 42621351  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctg 236  Q
    ||  |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| | |   |   ||||||||    
T  42621350 ctgggcaacaatcaaggtatgggcttttccacatacatcagaacgttccttccccagatttgccttgggaccggtgcaggaaatatctagtgggattctg 42621251  T
Q  237 catcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  42621250 catcttcatgcccatgctttgagggattgtgttgtccatgtactgtaccaactcccatacgtgtctatctcttgttga 42621173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 46497385 - 46497098
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  46497385 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 46497287  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  46497286 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 46497188  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46497187 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 46497098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 46507997 - 46507710
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  46507997 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 46507899  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  46507898 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 46507800  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46507799 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 46507710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14944533 - 14944263
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  14944533 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatatatgaatgaacacatgaatttttgggcgtgtcatatgcttttcatatgagtttctaggcaataaccaa 14944434  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14944433 agtatgggcttttccacatacatcaaaaagttactttcccaggtttaccttgggcctggttctggagaga-taaagtgtattctgcatcttcatgcccat 14944335  T
Q  252 gctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    || ||||| | |||||| |||||||| | |||||| ||  ||  |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14944334 gc-ttgagggattgtgtggtccttgtactgtaccaactgccatgcgtgtctatctcttgttgaacaagacaga 14944263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15372126 - 15371856
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15372126 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatatatgaatgaacacatgaatttttgggcgtgtcatatgcttttcatatgagtttctaggcaataaccaa 15372027  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15372026 agtatgggcttttccacatacatcaaaaagttactttcccaggtttaccttgggcctggttctggagaga-taaagtgtattctgcatcttcatgcccat 15371928  T
Q  252 gctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    || ||||| | |||||| |||||||| | |||||| ||  ||  |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15371927 gc-ttgagggattgtgtggtccttgtactgtaccaactgccatgcgtgtctatctcttgttgaacaagacaga 15371856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 26347940 - 26348227
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  26347940 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 26348038  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  26348039 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 26348137  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26348138 tgcatcttcatgtccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 26348227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44907991 - 44907704
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  44907991 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 44907893  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  44907892 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 44907794  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44907793 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 44907704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8501320 - 8501037
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  8501320 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 8501222  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  8501221 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 8501123  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8501122 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatga 8501037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8511790 - 8511507
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  8511790 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 8511692  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  8511691 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 8511593  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8511592 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatga 8511507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 11626155 - 11626442
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  11626155 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaataaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 11626253  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   |||||     
T  11626254 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggatta 11626352  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11626353 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 11626442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 26362992 - 26363279
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||    
T  26362992 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatga-atatgcttttcatatgaatt 26363090  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  26363091 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 26363189  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26363190 tgcatcttcatgtccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 26363279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43983748 - 43983461
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| ||||||| |||    
T  43983748 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatccatatgctttccatatgaattt 43983649  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattct 235  Q
    ||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| | |   || || || |||||||||| ||   |   |||||||    
T  43983648 ctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccaggttttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattct 43983550  T
Q  236 gcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43983549 gtatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 43983461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6545076 - 6544789
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| ||    
T  6545076 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggttatg-catatgcttttcatatgaatt 6544978  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| || |||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  6544977 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctctcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 6544879  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6544878 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 6544789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 9535031 - 9535318
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  9535031 atgatcttcatctgggtttatcatgttcttcatctgggttcatcacgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgtttttcatatgaatt 9535129  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || |  |||||||||| ||   |   ||||||    
T  9535130 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaagcggtgcaggag-gatttagtgggattc 9535228  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535229 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 9535318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 9545314 - 9545601
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  9545314 atgatcttcatctgggtttatcatgttcttcatctgggttcatcacgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgtttttcatatgaatt 9545412  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || |  |||||||||| ||   |   ||||||    
T  9545413 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaagcggtgcaggag-gatttagtgggattc 9545511  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9545512 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 9545601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44897573 - 44897301
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataacca 150  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||   |||||||||    
T  44897573 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatttctggacaataacca 44897475  T
Q  151 cagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgccc 249  Q
      |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   |||||||||||||||||||||    
T  44897474 atgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattctgcatcttcatgccc 44897376  T
Q  250 atgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44897375 atgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 44897301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6534762 - 6534490
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataacca 150  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||   |||||||||    
T  6534762 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggttatg-catatgcttttcatatgaatttctggacaataacca 6534664  T
Q  151 cagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgccc 249  Q
      |||||| ||||||  |||||||||||| ||| || |||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   |||||||||||||||||||||    
T  6534663 atgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctctcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattctgcatcttcatgccc 6534565  T
Q  250 atgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6534564 atgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 6534490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27989119 - 27988849
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||| || ||     
T  27989119 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctaggcgtgtcatatgctgttcatatgaatttctgggcaacaatcaa 27989020  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||  | ||| ||||| ||||||||| |||   |   |||||||||||||||||||||||    
T  27989019 ggtatgggctttttcacatacatcagaatgttccttccccaga--tgccttgggaccggtgcaggaaagatctagtgggattctgcatcttcatgcccat 27988922  T
Q  252 gctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27988921 gctttgagggaatgtgtggtccttgtactgtaccaactcccatacgtgtctatctcttgttgaacaagacaga 27988849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Original strand, 14248343 - 14248595
Alignment:
Q  34 atcatgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgag 133  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||   |||||||  ||||||||||     
T  14248343 atcatgatattcatcagggttcatcataatattcatctgggttcatcatgtatgaatgaaaacatgagtttatgggctcatcatatgtgtttcatatgat 14248442  T
Q  134 tttctaagcaataacca-cagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggat 232  Q
    |||||  ||| || |||  || |  |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||| |  || || | | ||||||||||||  |||| ||||    
T  14248443 tttctgggcattatccataagcagtggcttttccataaacattagaatgttgctttcccagatttgtcttggaaatagtgcaggagaga-taaagcggat 14248541  T
Q  233 tctgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtacca 286  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||| || |||||    
T  14248542 tctgcatcttcatgcccttgctttgagggattgtgtggtccatgtacaatacca 14248595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 129
Target Start/End: Original strand, 7019199 - 7019276
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcata 129  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  7019199 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttatgggcatgtcatatgcttttcata 7019276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 210 - 303
Target Start/End: Original strand, 2991876 - 2991968
Alignment:
Q  210 gtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtcta 303  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||| ||||||||  || || |||||||||    
T  2991876 gtgcaggagagat-aaagtggattctgcatcttcatgcccatgctttgagggattgtgtggtccatgtacagtaccaaatcccatacgtgtcta 2991968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 9007203 - 9007144
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatcat 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9007203 gttgttgtgttcttcatcagaatgttgatgttcatcaagatcttcatttgggttcatcat 9007144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 12515404 - 12515348
Alignment:
Q  3 tgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  12515404 tgttgtgttcttcatcagaatgttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 12515348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 12491598 - 12491540
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  12491598 gttgctgtgttcttcatcagaatgttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 12491540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 82
Target Start/End: Original strand, 14248324 - 14248369
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcat 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  14248324 atgatcttcatctgggttcatcatgatattcatcagggttcatcat 14248369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8540521 - 8540243
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8540521 atgatcttcatttgggttcatcatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcgtgtcatatgcttttcatatgagttt 8540422  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctg 236  Q
    ||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||   |   ||||||||    
T  8540421 ctgggcaataaccaaaatatgggtttttccacatacatcataaagttactttcccagatctgccttgggaccggtgcaagaaagatatattgggattctg 8540322  T
Q  237 catcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaa 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| | ||| || ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  8540321 catcttcatgcccatgctttgagggattgtgtggtccttgtactgtagcaactcacatgcgtgtctatctcttgttgaa 8540243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8605760 - 8605482
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8605760 atgatcttcatttgggttcatcatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcgtgtcatatgcttttcatatgagttt 8605661  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctg 236  Q
    ||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||   |   ||||||||    
T  8605660 ctgggcaataaccaaaatatgggtttttccacatacatcataaagttactttcccagatctgccttgggaccggtgcaagaaagatatattgggattctg 8605561  T
Q  237 catcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaa 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| | ||| || ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  8605560 catcttcatgcccatgctttgagggattgtgtggtccttgtactgtagcaactcacatgcgtgtctatctcttgttgaa 8605482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16155154 - 16154869
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  16155154 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 16155056  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  16155055 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 16154957  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgaca 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16154956 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgaca 16154869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13965139 - 13964906
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  13965139 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttatgagcgtgtcatatgcttttcatatgagtttctgggcaataaccaa 13965040  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13965039 agtatgggcttttccacatacatcaaaaagttactttcccagatttgcctagggactggtgcaggagaga-gaaagtggattatgtatcttcatgcccat 13964941  T
Q  252 gctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtacca 286  Q
    | |||||| | |||||  |||||||| | ||||||    
T  13964940 gttttgagggattgtgcggtccttgtactgtacca 13964906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18383628 - 18383351
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||| |||    
T  18383628 atgatcttcacttgggttcatcatgatattcatctgagttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttataggcgtttcatatgctttacatatgaattt 18383529  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctg 236  Q
    ||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  18383528 ctgggcaataatcaaagtatgggcttttccacacacattagaaagttactttctcagatctgcctaaggactggtgcaggagaga-taaagtggattttg 18383430  T
Q  237 catcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaa 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  18383429 catcttcatgcccatgctttgagagattgtgtggtccatgtactgtaccaactcccatgcgtgtctatctcttgttgaa 18383351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42034450 - 42034188
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  42034450 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaataaacacatgaatttctgggcgtgtcatatgcttttcatatgagtttctgggcaataaccaa 42034351  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||   |   |||||||||||||||||| ||||    
T  42034350 agtatgagcttttccacatacatcagaaagttactttcccagattttccttgggaccggtgcaggaaagatctagtgggattctgcatcttcatgtccat 42034251  T
Q  252 gctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| | | |||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  42034250 gctttgagggattgtgtggtccttgtactggaccaactcccatacgtgtctatctcttgttga 42034188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 308
Target Start/End: Original strand, 2370196 - 2370466
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  2370196 atgatcttcatatgggttcatcatgatatttatctgggttcatcatgtatgaatgaacacgtgaatttctaggtttgtcatatgcttttcatatgaattt 2370295  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctg 236  Q
    ||  ||| || ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||     
T  2370296 ctgggcattatccaaagtagtggcttttccgcatacatcagaaagatgctttcccagatatgcctagggactggtgcatgagaga-taaagtggattcta 2370394  T
Q  237 catcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctct 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2370395 catcttcatgtccatgctttgagagattgtgtggtccatgtactgtaccaactctcatacgtgtctatctct 2370466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21458899 - 21458612
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  21458899 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacatatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 21458801  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  21458800 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 21458702  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21458701 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 21458612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25019739 - 25019452
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  25019739 atgatcttcatctaggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 25019641  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatct-acctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    | |   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| | | || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  25019640 tatggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttatcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 25019542  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25019541 tgcatcttcatgcccatgctttgaaagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 25019452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 314
Target Start/End: Original strand, 30549412 - 30549672
Alignment:
Q  54 tcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccacag 153  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  |||| || ||  |    
T  30549412 tcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcgtgacatatgcttttcatatgaatttctgggcaacaatcaagg 30549511  T
Q  154 tatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccatgc 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || | ||| ||||| |||| |||| | |   |   |||||||||||||||||||||||||    
T  30549512 tatgagcttttccacatacatcagaaagttccttccccaaatttgccttgggaccggtgaaggaaaaatctagtgggattctgcatcttcatgcccatgc 30549611  T
Q  254 tttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    |||||| | |||||| |||  ||| | |||||| ||| || |||||||||||| |||||||    
T  30549612 tttgagggattgtgtggtcaatgtactgtaccaactcccatacgtgtctatcttttgttga 30549672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 286
Target Start/End: Original strand, 18058869 - 18059117
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||  |||||||||| |||    
T  18058869 atgatcttcatatgggttcatcatgatattcatct-ggttcatcatgtatgaacgaacacatgaatttttgggcacatcatatgtgtttcatatgatttt 18058967  T
Q  137 ctaagcaataaccaca-gtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattct 235  Q
     |  |||||| | | | |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | | ||||||||| |||||||||||  |||||| ||| |    
T  18058968 atgggcaatatctaaaagtagtggcttttccacatacatcagaaagttgttttcccaaatttgcatagggactgatgcaggagaga-taaagtgaattat 18059066  T
Q  236 gcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtacca 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||| | ||||||    
T  18059067 gcatcttcatgcccatactttgagggattgtgtggtccatgtactgtacca 18059117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 22956855 - 22956796
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatcat 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22956855 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatcat 22956796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21793011 - 21792952
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatcat 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21793011 gttgttgtgttcttcataagaatgttgatgtttatgatgttcttcatctgggttcatcat 21792952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2116079 - 2115998
Alignment:
Q  229 ggattctgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  2116079 ggattctgcatcttcatgcccatgctttgagggattgtgtggtccatgtactgtaccaactcccatacgtgtctatctcttg 2115998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 21821229 - 21821288
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatcat 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21821229 gttgttgtgttcttcatcagaatgttaatgtttatgatgttcttcatctgggttcatcat 21821288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34823042 - 34822980
Alignment:
Q  210 gtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtcc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  34823042 gtgcaggagagaggaaagtggat-ctgcatcttcatgcccatgctttgagggattgtgtggtcc 34822980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 22961157 - 22961099
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  22961157 gttgttgtgttcttcatcagaatgttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 22961099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 49333613 - 49333555
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  49333613 gttgttgtgttcttcatcaaaatgttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 49333555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 37012253 - 37012201
Alignment:
Q  7 gtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  37012253 gtgttcttcatcagattgttgatgttcatgatgttcttcatctgggttcatca 37012201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Original strand, 25823246 - 25823303
Alignment:
Q  2 ttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||| |||||||||||    
T  25823246 ttgttgttttcttcatcagaatgttgatattcatgatgttcttcatatgggttcatca 25823303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 16902285 - 16902562
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  16902285 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctgggttcatcatatatgaatgaacacatgaatttctgggcgtgtcatatgcttttcatatgaattt 16902384  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctg 236  Q
    ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||   |   ||||||||    
T  16902385 ctgggcaacaaccaaagtatgggcttttccacatacatcagaatgttcctttcccagatttgccttgggactggtgcatgaaagatctagtgggattctg 16902484  T
Q  237 catcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| | |||||| ||| || | ||||||||||||||||||    
T  16902485 catcttcatgcccatgctttgagggattgtgtggtcgttgtactgtaccaactcccatatgtgtctatctcttgttga 16902562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 16995676 - 16995953
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  16995676 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctgggttcatcatatatgaatgaacacatgaatttctgggcgtgtcatatgcttttcatatgaattt 16995775  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctg 236  Q
    ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||   |   ||||||||    
T  16995776 ctgggcaacaaccaaagtatgggcttttccacatacatcagaatgttcctttcccagatttgccttgggactggtgcatgaaagatctagtgggattctg 16995875  T
Q  237 catcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| | |||||| ||| || | ||||||||||||||||||    
T  16995876 catcttcatgcccatgctttgagggattgtgtggtcgttgtactgtaccaactcccatatgtgtctatctcttgttga 16995953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 2998405 - 2998692
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  2998405 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 2998503  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  2998504 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 2998602  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2998603 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 2998692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17488969 - 17488674
Alignment:
Q  29 tgtttatcatgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttca 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  17488969 tgtttatgatgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttca 17488871  T
Q  128 tatgagtttctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaa 226  Q
    ||||| |||||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |     
T  17488870 tatgaatttctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttag 17488772  T
Q  227 gtggattctgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17488771 tgggattctgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaggatgacaga 17488674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 273
Target Start/End: Original strand, 44638732 - 44638964
Alignment:
Q  40 atcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttcta 139  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  44638732 atcttcatctaggtttatcatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcgtgttatatgcttttcatatgagtttctg 44638831  T
Q  140 agcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcat 239  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  44638832 ggcaataaccaacgtatgggcttttccacatacatcataaagttactttcccagatttttctagggactggtgcagaagaga-taaagtggattctgcat 44638930  T
Q  240 cttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtcc 273  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  44638931 cttcatgctaatgctttgagagattgtgtggtcc 44638964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4468091 - 4467804
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  4468091 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 4467993  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  4467992 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 4467894  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4467893 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 4467804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 5336843 - 5337130
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  5336843 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 5336941  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  5336942 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 5337040  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5337041 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 5337130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 5346696 - 5346983
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  5346696 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 5346794  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  5346795 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 5346893  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5346894 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 5346983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4458466 - 4458179
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  4458466 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 4458368  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  4458367 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 4458269  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4458268 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtactaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 4458179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 322
Target Start/End: Original strand, 24696293 - 24696578
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  24696293 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 24696391  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagt-ggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||  | ||| ||||||    
T  24696392 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttccttccccagatttaccttgggaccggtgcagga-aga-tatagtgggattc 24696489  T
Q  235 tgcatcttca-tgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgaca 322  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24696490 tgcatcttcattgcccatgctttgagggattgtgttgtccttgtacagtaccaactcccatacgtgtctatctcttgttgaagatgaca 24696578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18651489 - 18651202
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  18651489 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 18651391  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  18651390 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 18651292  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18651291 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 18651202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18663607 - 18663320
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  18663607 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 18663509  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  18663508 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 18663410  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18663409 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 18663320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45025080 - 45024793
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||    
T  45025080 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaacgaacacatgaagttctgggctatg-catatgttttacatatgaatt 45024982  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  45024981 tctggtcaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 45024883  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45024882 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 45024793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 9502468 - 9502755
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  9502468 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgctttccatatgaatt 9502566  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccag-atctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| || |  || || || |||| ||||| ||   |   ||||||    
T  9502567 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagaatttgtcttggaaccggtgtaggag-gatttagtgggattc 9502665  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9502666 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 9502755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 9513834 - 9514121
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  9513834 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgctttccatatgaatt 9513932  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccag-atctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| || |  || || || |||| ||||| ||   |   ||||||    
T  9513933 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagaatttgtcttggaaccggtgtaggag-gatttagtgggattc 9514031  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9514032 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 9514121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29423620 - 29423348
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||     
T  29423620 gttcatgatgattttcatctgggttcataatatatgaatgaacacatgaatttatgggcgtgtcatatgcttttcatatgagtttctggacaataaccaa 29423521  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagt-ggattctgcatcttcatgccca 250  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||| |||    
T  29423520 agtatggacttttccacatacatcagaaagttactttcccatatctgccttgggaccggtgcaggaaaga-tatagtgggattctgcatcttcatgtcca 29423422  T
Q  251 tgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||| | |||||| || ||||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29423421 tgctttgagggattgtgtggtacttgtactgtaccaactcccatacgtgtctatctcttgttgaacaagacaga 29423348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45014988 - 45014716
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataacca 150  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||   |||||||||    
T  45014988 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaacgaacacatgaagttctgggctatg-catatgttttacatatgaatttctggtcaataacca 45014890  T
Q  151 cagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgccc 249  Q
      |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || |  |||||||||| ||   |   |||||||||||||||||||||    
T  45014889 atgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaatcggtgcaggag-gatttagcgggattctgcatcttcatgccc 45014791  T
Q  250 atgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45014790 atgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttcttgaagatgacaga 45014716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 304
Target Start/End: Original strand, 38957552 - 38957803
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||     
T  38957552 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaataaacacatgaatttatgggcctgtcatatgctttccatatgaatttctgagcaacaatcaa 38957651  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||| || |  ||||||||| |||   |   ||||||||||||||||||||| |    
T  38957652 ggtatgagcttttccacatacatcagaatgttccttccccagatttgccttggaatcggtgcaggaaagatctagtgggattctgcatcttcatgccc-t 38957750  T
Q  252 gctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctat 304  Q
    |||||||| | |||||| || | ||| | |||||| ||| || ||||||||||    
T  38957751 gctttgagggattgtgtggtgcatgtactgtaccaactcccatacgtgtctat 38957803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 314
Target Start/End: Original strand, 38930204 - 38930466
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||   ||  |  ||     
T  38930204 gttcatgatgatcttcatttgggttcatcatgtatgaatgaacatatgcatttctgggcgtgccatatgcttttcttatgaatttctggacagcactcaa 38930303  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||   ||| ||||| ||||||||| |||   |   |||||||||||||||||||| |     
T  38930304 ggtatggacttttccacatacatcagaatgttccttccccagattcgccttgggaccggtgcaggaaagatctagtgggattctgcatcttcatgcctac 38930403  T
Q  252 gctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  38930404 gctttgagagattgtgtggtccatgtactgtaccaactcccatacgtgtctatctcttgttga 38930466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 69870 - 69929
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatcat 60  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  69870 gttgttatgttcttcatcagaatgttgatgttcatcatggtcttcatttgggttcatcat 69929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21109552 - 21109493
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatcat 60  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21109552 gttgttgtgttctttgtcagaatgttgatgttcatcatgatcttcatctgggtttatcat 21109493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 3605716 - 3605774
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||    
T  3605716 gttgttgtgttcttcatcagaatgttgatattcatgatgttcttcatctaggttcatca 3605774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 61
Target Start/End: Original strand, 44638744 - 44638775
Alignment:
Q  30 gtttatcatgatcttcatctgggttcatcatg 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44638744 gtttatcatgatcttcatctgggttcatcatg 44638775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 309817 - 310104
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  309817 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgagtt 309915  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  309916 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 310014  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  310015 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 310104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 216863 - 216798
Alignment:
Q  73 ggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttct 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||||||  |||||||||| |||||    
T  216863 ggtttatcatgtatgaatgaacacatgtgcttttgggcttgtcatatgtgtttcatatgattttct 216798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 216912 - 216876
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatca 37  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  216912 gttgttgtgttcttcatcagaatgttgatgttcatca 216876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1597077 - 1596790
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  1597077 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctgggttcatcatatatgaatgaacacatgaatttctgggcgtgtcatatgcttttcatatgaattt 1596978  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagt-ggattct 235  Q
    ||  |||| || || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||| ||||| | ||||||| |||  | ||| |||||||    
T  1596977 ctgggcaacaaacaaagtatggacttttcctcatacatcagaatgttccttccccagatttgccttgggaccgatgcagga-aga-tatagtgggattct 1596880  T
Q  236 gcatcttca-tgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1596879 gcatcttcattgcccatgctttgagggattgtgttgtccttgtacagtaccaactcccatacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 1596790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12455324 - 12455037
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  12455324 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 12455226  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  12455225 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 12455127  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12455126 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 12455037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14791873 - 14791586
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  14791873 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgtttttcatatgaatt 14791775  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  14791774 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 14791676  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14791675 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 14791586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20912553 - 20912266
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  20912553 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 20912455  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  20912454 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 20912356  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20912355 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 20912266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31357831 - 31357544
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31357831 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 31357733  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  31357732 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 31357634  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31357633 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 31357544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31367560 - 31367273
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31367560 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 31367462  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  31367461 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 31367363  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31367362 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 31367273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3286117 - 3285830
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  3286117 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 3286019  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  3286018 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 3285920  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3285919 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatttcttgttgaagatgacaga 3285830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18160332 - 18160045
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  18160332 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttatgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 18160234  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  18160233 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 18160135  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18160134 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 18160045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18170144 - 18169857
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  18170144 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttatgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 18170046  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  18170045 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 18169947  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169946 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 18169857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 24921791 - 24922078
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  24921791 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgattttcatatgaatt 24921889  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    | |   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  24921890 tatggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 24921988  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24921989 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 24922078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 24930827 - 24931114
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  24930827 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 24930925  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    | |   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  24930926 tatggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 24931024  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931025 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtatcaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 24931114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14045583 - 14045316
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  |||| |||    
T  14045583 atgatcttcatctgagttcatcatgatcttcatctgggttcatcatatataaatgaacacatgaatttctgaacgtgtcatatgcttttc--atgaattt 14045486  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagt-ggattct 235  Q
    ||  |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||  | ||| |||||||    
T  14045485 ctgggcaataactaaagtatgggcttttccacatatatcagaaagttactttcccagatctgccttgggaccggtgcaggaaaga-tatagtgggattct 14045387  T
Q  236 gcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatct 306  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||| ||  |||||||||||    
T  14045386 acatcttcatgcccatgctttgagggattgtgttgtccttgtactgtaccaactcccatgcgtgtctatct 14045316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16898217 - 16897930
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  16898217 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgctttccatatgaatt 16898119  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||| ||  |||||| ||||||  ||||||||| || ||| ||||||||| | |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  16898118 tctggacaataatcaatgtatggacttttcttcatacatcataatgttcctttcccaggttttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 16898020  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16898019 tgtatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 16897930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16908870 - 16908583
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  16908870 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgctttccatatgaatt 16908772  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||| ||  |||||| ||||||  ||||||||| || ||| ||||||||| | |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  16908771 tctggacaataatcaatgtatggacttttcttcatacatcataatgttcctttcccaggttttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 16908673  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16908672 tgtatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 16908583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29540711 - 29540444
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||           ||||||||||||    
T  29540711 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctgggttcatcatgtataaatgaacacatgaagttctgggcgtg-----------tcatatgagttt 29540623  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctg 236  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| ||||| |||||| || |||   |   |||||||     
T  29540622 ctgggcaataaccaaagtatgggcttttccacatacatcagaatgttgcttttccagatttgccttgggaccggtgcatgaaagatctagtgggattctt 29540523  T
Q  237 catcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaa 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29540522 catcttcatgcccattctttgagggattgtgtggtccttgtactgtaccaactctcatacgtgtctatctcatgttgaa 29540444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18201469 - 18201201
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| || ||||| |||||| ||||| ||||||  |||| ||||     
T  18201469 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttatcggcgtgccatatccttttcctatgaatttctagacaatgaccaa 18201370  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtgg-attctgcatcttcatgccca 250  Q
     ||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| || | ||| ||||| ||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18201369 tgtatgagcttttt-acatacatcagaatgttcctttcccaaatttgccttgggaccggtgcagga-agat-acagtgggattctgcatcttcatgccca 18201273  T
Q  251 tgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgaca 322  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18201272 tgctttgagggattgtgtggtccttgtacagtaccaactcccatacgtgtctatctcttgttgaagatgaca 18201201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 26020554 - 26020831
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||  |    
T  26020554 atgatcttcatctaggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgtttttcatatgaaat 26020652  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  26020653 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 26020751  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| | | |||||| ||| || | ||||||||||||||||||    
T  26020752 tgcatcttcatgcccatgctttgagggattgtgtggtccttttactgtaccaactcccatatgtgtctatctcttgttga 26020831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 138
Target Start/End: Original strand, 27787368 - 27787447
Alignment:
Q  59 atgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttct 138  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||    
T  27787368 atgatattcatatgggttcatgatgtatgaatgaagacatgaatttctaggcttatcatatgcgtttcatatgattttct 27787447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 791012 - 791070
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||| ||||||||    
T  791012 gttgttgtgttcttcatcagaatgttgatattcatgatgttcttcatctgagttcatca 791070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 26168647 - 26168589
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  26168647 gttgctgtgttcttcatcagaatgttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 26168589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 24505193 - 24505252
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatg-ttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  24505193 gttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 24505252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28092684 - 28092638
Alignment:
Q  210 gtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccatgctttg 257  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  28092684 gtgcaggagagaggaaagtgga-tctgcatcttcatgcttatgctttg 28092638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 11783 - 12060
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  11783 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcgtgtcatatgcttttcatatgaattt 11882  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctg 236  Q
    ||  |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||   |   ||||||||    
T  11883 ctgggcaacaatcaaggtatgggcttttccacatacatcagaatgttccttccccagatttgccttgggaccggtgcaggaaagatctagtgggattctg 11982  T
Q  237 catcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| | |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||    
T  11983 catcttcatgcccatgctttgagggattgtgtggtccttgtactgtaccaactcccatacgtgtctatctcttattga 12060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 59 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20492295 - 20492040
Alignment:
Q  59 atgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccacagtatgg 158  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||    
T  20492295 atgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcgtgtcatatgcttttcatatgagtttatgggcaataaccaaagtatgg 20492196  T
Q  159 gcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccatgctttga 258  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20492195 acttttccacatacatcagaaagttactttcccagatttgcattgggactggtgcaggagaga-taaagtggattttgcatcttcatgcccatgctttga 20492097  T
Q  259 gagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaa 315  Q
    | | |||||| ||||||||   |||||| ||| ||   |||||||||||||||||||    
T  20492096 gggattgtgtggtccttgtattgtaccaactcccatgtgtgtctatctcttgttgaa 20492040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 1685048 - 1685335
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  1685048 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 1685146  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  1685147 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 1685245  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1685246 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 1685335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 320
Target Start/End: Original strand, 16335241 - 16335522
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||    
T  16335241 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-gggcatatgcttttcatatgaattt 16335339  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctg 236  Q
    ||   |||||||||  | |||  ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||||    
T  16335340 ctggacaataaccaatgcatgaacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagatttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattctg 16335438  T
Q  237 catcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16335439 catcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatga 16335522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6422572 - 6422285
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  6422572 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 6422474  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  6422473 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagactttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 6422375  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6422374 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatcacaga 6422285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8973117 - 8972830
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  8973117 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 8973019  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  8973018 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 8972920  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8972919 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttaaagatgacaga 8972830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8983672 - 8983385
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  8983672 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 8983574  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  8983573 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 8983475  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8983474 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttaaagatgacaga 8983385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 13119411 - 13119688
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  13119411 atgatcttcctctaggttcatcatgatcttcatctgggttcatcatatatgaatgaacacatgaatttctgggcgtgtcatatgcttttcatatgaattt 13119510  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctg 236  Q
    ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||   |   ||||||||    
T  13119511 ctgggcaacaaccaaagtatgggcttttccacatacattagaatgttcctttcccagatttgccttgggactggtgcatgaaagatctagtgggattctg 13119610  T
Q  237 catcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| | |||||| ||| || | || |||||||||||||||    
T  13119611 catcttcatgcccatgctttgagggattgtatggtccttgtactgtaccaactcccatatgtttctatctcttgttga 13119688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6432999 - 6432718
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  6432999 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 6432901  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  6432900 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagactttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 6432802  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagat 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6432801 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagat 6432718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4381367 - 4381080
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||    
T  4381367 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgtatt 4381269  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  4381268 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 4381170  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4381169 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 4381080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9537406 - 9537119
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  9537406 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 9537308  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  9537307 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 9537209  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9537208 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 9537119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9547732 - 9547445
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  9547732 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 9547634  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  9547633 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 9547535  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9547534 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 9547445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 5655423 - 5655710
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctggg-catgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| ||    
T  5655423 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggttatg-catatgcttttcatatgaatt 5655521  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  5655522 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 5655620  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5655621 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagatgtgtctatctcttgttggagatgacaga 5655710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 320
Target Start/End: Original strand, 10012025 - 10012308
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||  ||    
T  10012025 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgagttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggcgggccatatgcttttcatatgaactt 10012124  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagt-ggattc 234  Q
    ||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | | ||| ||||| ||||||||| |||  | ||| ||||||    
T  10012125 ctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgccttgggaccggtgcagga-aga-tatagtgggattc 10012222  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatga 320  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10012223 tgcttcttcatgcccatgctttgagggattgtgttgtccttgtacagtaccaactctcatacgtgtctatctcttgttgaagatga 10012308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4371633 - 4371361
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataacca 150  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||   |||||||||    
T  4371633 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgtatttctggacaataacca 4371535  T
Q  151 cagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgccc 249  Q
      |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   |||||||||||||||||||||    
T  4371534 atgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattctgcatcttcatgccc 4371436  T
Q  250 atgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4371435 atgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 4371361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 324
Target Start/End: Original strand, 2489016 - 2489288
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||   |||| ||||     
T  2489016 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatatatgaatgaacacatgaagttctgggcgtgccatatacttttcatatgaatttctggacaatgaccaa 2489115  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgccca 250  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||| ||||| ||||||||| |||   |   ||||||||||||||||||||||    
T  2489116 tgtatgagctttt-cacatacatcagaatgttcctttcccagattttgccttgggaccggtgcaggaaagatctagtgggattctgcatcttcatgccca 2489214  T
Q  251 tgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2489215 tgctttgagggattgtgtggtccttgtactgtaccaactcccatacgtgtctatctcttgttgaacaagacaga 2489288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25433113 - 25432850
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||   |||| || |     
T  25433113 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggcgttacatatgcttttcatatgaatttctggacaatgactaa 25433014  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtgg-attctgcatcttcatgccca 250  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25433013 tgtatgagctttt-cacatacatcagaatgttcctttcccagatttgccttgggactggtgcagga-aga-tatagtggaattctgcctcttcatgccca 25432917  T
Q  251 tgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaaga 317  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||| |  ||||| ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  25432916 tgctttgagggattgtgtggtccttgtactataccaactcccatatgtgtctatctcttgttgaaga 25432850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 4782414 - 4782691
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||  |    
T  4782414 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgtttttcatatgaaat 4782512  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  4782513 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 4782611  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| | |||||| ||| || | ||||||||||||||||||    
T  4782612 tgcatcttcatgcccatgctttgagggattgtgtggtccttgtactgtaccaactcccatatgtgtctatctcttgttga 4782691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 183
Target Start/End: Original strand, 4023921 - 4024052
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  4023921 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttatgagcgtgtcatatgcttttcatatgagtttctgggcaataaccaa 4024020  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagtt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4024021 agtatgggcttttccacatacatcaaaaagtt 4024052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 286
Target Start/End: Original strand, 4024349 - 4024449
Alignment:
Q  185 ctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtac 284  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||||| | ||||    
T  4024349 ctttcccatatttgcctagggactggtgcaggagagat-aaagtggattttgtatcttcatgcccatgttttgagggattgtgcggtccttgtactgtac 4024447  T
Q  285 ca 286  Q
    ||    
T  4024448 ca 4024449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 51978550 - 51978608
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  51978550 gttgttgtgttcttcatcaaaatgttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 51978608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 233786 - 234073
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  233786 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 233884  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  233885 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 233983  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  233984 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 234073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 114334 - 114392
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||| ||||    
T  114334 gttgttgtgttcttcatcagaatgttgatattcatgatgttcttcatctgggtttatca 114392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 9324824 - 9325111
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  9324824 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 9324922  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  9324923 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 9325021  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9325022 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 9325111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 21997262 - 21997549
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  21997262 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 21997360  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  21997361 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 21997459  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997460 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 21997549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 320
Target Start/End: Original strand, 21987728 - 21988011
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  21987728 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatt 21987826  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  21987827 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 21987925  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatga 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21987926 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatga 21988011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13674857 - 13674570
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  13674857 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgctttccatatgaatt 13674759  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  13674758 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 13674660  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13674659 tgtatcttcatgcccatgctttgagagattgtattgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 13674570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21334569 - 21334282
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctggg-catgtcatatgcttttcatatgagtt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| ||    
T  21334569 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggttatg-catatgcttttcatatgaatt 21334471  T
Q  136 tctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattc 234  Q
    |||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || || || |||||||||| ||   |   ||||||    
T  21334470 tctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattc 21334372  T
Q  235 tgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21334371 tgcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttattggagatgacaga 21334282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 791993 - 791731
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||     
T  791993 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtattaatgaacacatgaatttatgggcgtgtcatatgcttttcatatgaatttctgggcaacaatcaa 791894  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||   |   |||||||||||||||||||||||    
T  791893 ggtatgggcttttccacatacatcagaatgttccttccccagatttgccttgggaccggtgcaggaaagatctagtgggattctgcatcttcatgcccat 791794  T
Q  252 gctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| | |||||| ||| || | ||||||||||||||||||    
T  791793 gctttgagggattgtgtggtccttgtactgtaccaactcccatatgtgtctatctcttgttga 791731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 324
Target Start/End: Original strand, 21202617 - 21202889
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataacca 150  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||   |||||||||    
T  21202617 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatttctggacaataacca 21202715  T
Q  151 cagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgccc 249  Q
      |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   |||||||||||||||||||||    
T  21202716 atgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattctgcatcttcatgccc 21202814  T
Q  250 atgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21202815 atgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 21202889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 324
Target Start/End: Original strand, 21213033 - 21213305
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggc-atgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataacca 150  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||   |||||||||    
T  21213033 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggctatg-catatgcttttcatatgaatttctggacaataacca 21213131  T
Q  151 cagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgccc 249  Q
      |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   |||||||||||||||||||||    
T  21213132 atgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattctgcatcttcatgccc 21213230  T
Q  250 atgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21213231 atgctttgagagattgtgttgtccttgatcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttggagatgacaga 21213305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17269089 - 17268834
Alignment:
Q  59 atgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccacagtatgg 158  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||| ||| || |||||||    
T  17269089 atgatcttcatatgggttcatcatgtgtgaatgaacacatgaatttctgggcgtgtcatatgcttttcatatgaattcctgggcagtaatcaaagtatgg 17268990  T
Q  159 gcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccatgctttga 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17268989 gcttttccacatacatcagaaagttattttcccagatttgccttgggactggcgcaggagaga-taaagtggattctgcatcttcatgctcatactttga 17268891  T
Q  259 gagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaa 315  Q
    ||| |||||| |||| ||| | ||| || ||||||  ||| ||||| | ||||||||    
T  17268890 gagattgtgtggtccatgtactgtagcaactctcatgcgtatctatttgttgttgaa 17268834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22817738 - 22817599
Alignment:
Q  168 catacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtg 267  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||    
T  22817738 catacatcagaaagttaatttcccatatttgcctagggactggtgcaggagaga-taaagtagattctgcatcttcattcccatgctttgggggattgtg 22817640  T
Q  268 ttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctct 308  Q
    | |||||||| | |||||| ||| ||   ||||||||||||    
T  22817639 tggtccttgtactgtaccaactcccatgtgtgtctatctct 22817599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 31224494 - 31224553
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatcat 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  31224494 gttgttgtgttcttcatcagaatgttgatgttcatcatgacattcatatgggttcatcat 31224553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 11430461 - 11430519
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||    
T  11430461 gttgttgtgttcttcatcagaatgttgatatccatgatgttcttcatctgggttcatca 11430519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 5759667 - 5759608
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatg-ttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  5759667 gttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 5759608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 20531113 - 20531172
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatg-ttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  20531113 gttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 20531172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7757793 - 7757741
Alignment:
Q  263 ttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaa 315  Q
    |||||| ||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7757793 ttgtgtggtcattgtactgtaccaactctcatacgtgtctatctcttgttgaa 7757741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 317
Target Start/End: Original strand, 20955 - 21234
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  20955 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatcagggttcatcatg-atgaatgaacacatgaatttctgggcgtgtcatatgcttttcatatgaattt 21053  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctg 236  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| || ||| ||||||||||| | |||  |||| ||||||||| |||   |   ||||||||    
T  21054 cttggcaataaccaaagtatgggcttttccataaacatcataatgttactttcccagattttccttcggaccggtgcaggaaagatctagtgggattctg 21153  T
Q  237 catcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaaga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |  ||||| ||| || | |||||||||||||||||||||    
T  21154 catcttcatgcccatgctttgagggattgtgtggtccttgtactataccaactcccatatgtgtctatctcttgttgaaga 21234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 7640 - 7927
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    |||||||||| ||||||| |||    
T  7640 atgatcttcatctgggttcatcacgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacatatgaagttctgggctatccatatgctttccatatgaattt 7739  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctac-ctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattct 235  Q
    ||   |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |   || || || |||||||||| ||   |   |||||||    
T  7740 ctggacaataaccaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttggaaccggtgcaggag-gatttagtgggattct 7838  T
Q  236 gcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7839 gcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgtccttgttcagtaccaactctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 7927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 314
Target Start/End: Original strand, 92664 - 92926
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |  |||| || ||     
T  92664 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcgcgtcatatgcttttcatatgaatttatgggcaacaatcaa 92763  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| | ||| ||||| ||||||||| |||   |   |||||||||||||||||||||||    
T  92764 ggtatgggcttttccacatacatcagaatgttccttcctcagatttgccttgggaccggtgcaggaaagatctagtgggattctgcatcttcatgcccat 92863  T
Q  252 gctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||   |||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  92864 gctttgagagattgtgtggtccttgtattgtaccaactcccatacgtgtctatctcttgttga 92926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 320
Target Start/End: Original strand, 74527 - 74810
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| |||    
T  74527 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctggtttcatcatatatggatgaacacatgaagttctgggcgtgccatatgctttccatatgaattt 74626  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagt-ggattct 235  Q
    ||  |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||| |  || ||||| ||||||||| |||  | ||| |||||||    
T  74627 ctgggcaacaaccaaagtatggacttttcctcatacatcaaaatgttccttccccagatttggcttgggaccggtgcagga-aga-tatagtgggattct 74724  T
Q  236 gcatcttca-tgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatga 320  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  74725 gcatcgtcattgcccatgctttgagggattgtgttgtccttgtacagtaccaactcccatacgtgtctatctcttgttgaagatga 74810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 314
Target Start/End: Original strand, 55631 - 55893
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||     
T  55631 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcgtgtcatatgcttttcatatgaatttctgggcaacaatcaa 55730  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||| ||||  ||||||||| |||   |   ||||| |||||||||||||||||    
T  55731 ggtatgggcttttcctcatacatcagaatgttccttccccagatttgccttgggatcggtgcaggaaagatctagtgggattatgcatcttcatgcccat 55830  T
Q  252 gctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    ||||| || | |||||| |||||||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  55831 gcttttagggattgtgtggtccttgtactgtaccaactcccatacgtgtctatctcttgttga 55893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16103 - 15842
Alignment:
Q  52 gttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagtttctaagcaataaccac 151  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| |||||   ||| || ||     
T  16103 gttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggcttgccatatgctttccatatgaatttctggacaacaatcaa 16004  T
Q  152 agtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccat 251  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||   |   |||||||||||||||||||||||    
T  16003 ggtatgggcttttccacatacatcagaatgttccttccccagatttgccttgggaccggtgcagga-agatttagtgggattctgcatcttcatgcccat 15905  T
Q  252 gctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctcttgttga 314  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  15904 gctttgagggattgtgtggtccttgtactgtaccaactcccatacgtgtctatctcttgttga 15842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 217
Target Start/End: Original strand, 17191 - 17370
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  17191 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctgggttcatcatatatgaatgaacacatgaatttctgggcgtgtcatatgcttttcatatgaattt 17290  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccagatctacctagggactggtgcagga 217  Q
    ||  |||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  17291 ctgggcaacaaccaaagtatggg-tttttcacatacatcagaatgttcctttcccagattttccttgggaccggtgcagga 17370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 19162 - 19450
Alignment:
Q  37 atgatcttcatctgggttcatcatgatcttcatctaggttcatcatgtatgaatgaacacatgaatttctgggcatgtcatatgcttttcatatgagttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| |||    
T  19162 atgatcttcatctgggttcatcatgttcttcatctgggttcatcatgtatgaatgaacacatgaagttctgggcaatgcatatgcttttcatatgaattt 19261  T
Q  137 ctaagcaataaccacagtatgggcttttccacatacatcagaaagttgctttcccaga-tctacctagggactggtgcaggagagaggaaagtggattct 235  Q
    ||   ||| ||| |  |||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | |  || |  || |||||||||| ||       |||||||    
T  19262 ctggacaacaactaatgtatggacttttcttcatacatcagaatgttcctttcccagattttgtcttgaaaccggtgcaggag-gattttgtgggattct 19360  T
Q  236 gcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcag-taccacctctcagacgtgtctatctcttgttgaagatgacaga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19361 gcatcttcatgcccatgctttgagagattgtgttgaccttgtacagttaccaactctcaaacgtgtctatcttttgttgaagatgacaga 19450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 197185 - 197241
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  197185 gttgttgtgttcttcattagaatattgatgttcatcatgatcttcacctgggttcat 197241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 11580 - 11521
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatcat 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11580 gttgttgtgttcttcatcagaatgttaatgtttatgatgttcttcatctgggttcatcat 11521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13914 - 13818
Alignment:
Q  214 aggagagaggaaagtggattctgcat-cttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtgtctatctctt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||  |||| |||  |||| || |||||| ||||||||| |||||    
T  13914 aggagagaggaaagtggattctgctttcttcacgcccatgctttgagagattgtgcggtccatgtatagtatcaactctcatacgtgtctaactctt 13818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 15687 - 15628
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatcat 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15687 gttgttgtgttcttcatcagaatgttcattttcatcatgttcttcatctgggttcatcat 15628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1468 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1468
Description:

Target: scaffold1468; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 1594 - 1536
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  1594 gttgttgtgttcttcatcaaaatgttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 1536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 7695 - 7637
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatca 59  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  7695 gttgttgtgttcttcatcaaaatgttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 7637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Original strand, 28549 - 28590
Alignment:
Q  19 agaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatcat 60  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  28549 agaatgttgatgttcattatgatcttcatctgggttcatcat 28590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 16363 - 16422
Alignment:
Q  1 gttgttgtgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatcatg 61  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  16363 gttgttgtgttcttcatcagaatgttgatgttcatca-gacattcatctaggttcatcatg 16422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 65783 - 65699
Alignment:
Q  214 aggagagaggaaagtggattctgcatcttcatgcccatgctttgagagtttgtgttgtccttgttcagtaccacctctcagacgtg 299  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||| |||   |||||| |||||| |||||    
T  65783 aggagagaggatagtggata-tgcatcttcatgctcatgctttgagggattgtgtggtccatgtattgtaccaactctcatacgtg 65699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 54900 - 54848
Alignment:
Q  8 tgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatcat 60  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  54900 tgttcttcatcaaaatgttgatgttcatgatgttcttcatctaggttcatcat 54848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 58852 - 58800
Alignment:
Q  8 tgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatcat 60  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  58852 tgttcttcatcaaaatgttgatgttcatgatgttcttcatctaggttcatcat 58800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 60280 - 60228
Alignment:
Q  8 tgttcttcattagaatgttgatgtttatcatgatcttcatctgggttcatcat 60  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  60280 tgttcttcatcaaaatgttgatgttcatgatgttcttcatctaggttcatcat 60228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University