View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7257_high_7 (Length: 506)

Name: NF7257_high_7
Description: NF7257
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7257_high_7
NF7257_high_7
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (16-490)||(48958819-48959293)
chr4 (28-487)||(48962972-48963432)
chr4 (34-487)||(48966025-48966478)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (37-472)||(12640532-12640967)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (35-485)||(12589225-12589660)
chr6 (355-487)||(12482491-12482623)
chr6 (41-181)||(12482797-12482937)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (252-487)||(13441114-13441349)
chr2 (246-487)||(13462292-13462533)
chr2 (259-487)||(13449284-13449512)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (246-487)||(3416566-3416807)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (373-481)||(12541708-12541816)
chr5 (373-487)||(28386363-28386477)
chr5 (252-321)||(12541599-12541668)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 455; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 490
Target Start/End: Original strand, 48958819 - 48959293
Alignment:
Q  16 gtgtgagaacaaaatgaagggtttattctaagggattccatgagggaaacggtaaagagggagaaaccagtgaaggcgatggtgggaatttgaagcttat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48958819 gtgtgagaacaaaatgaagggtttattctaagggattccatgagggagacggtaaagagggagaaaccagtgaaggcgatggtgggaatttgaagcttat 48958918  T
Q  116 gggccaagtcataaacccaggggtttttgcagtcagcgattatgcagtcaggtggatccttctccatgaaatcgtgaataggttcacgaaggagcattgc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48958919 gggccaagtcataaacccaggggtttatgcagtcagcgattatgcagtcaggtggatccttctccatgaaatcgtgaataggttcacggaggagcattgc 48959018  T
Q  216 cccgtagtatatcttgccggtggtgtcactgtcggaggtggaggacatagattcaacgccgtcagggaggccaacttgttgggagggaaagttgacaagg 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48959019 cccgtagtatatcttgccggaggtgtcaccgtcggaggtggaggacatagattcaacgccgtcagggaggccaacttgttgggagggaaagttgacaagg 48959118  T
Q  316 tgaaggcggaggaagaagggatcaacacttgagagagatttggtaaagaagtgggagttggagggagtggtgatgattgtcacttgttggccatgggatg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48959119 tgaaggcggaggaagaagggatcaacacttgagagagatttggtaaagaagtgggagttggagggagtggtgatgattgtcacttgttggccatgggatg 48959218  T
Q  416 caaacagagttgctatgtcacacatggggatcatatgcccaggtgctggatatggaatgaagtgaagtttcatag 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48959219 caaacagagttgctatgtcacacatggggatcatatgcccaggtgctggatatggaatgaagtgaagtttcatag 48959293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 487
Target Start/End: Original strand, 48962972 - 48963432
Alignment:
Q  28 aatgaagggtttattctaagggattccatgagggaaacggtaaagagggagaaaccagtgaaggcgatggtgggaatttgaagcttatgggccaagtcat 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  48962972 aatgaggggtttattctaagggattccatgagggagacagtaaatatggagaaaccagtgaaggcaatggtggggatctgaagcttatgacccaagtcat 48963071  T
Q  128 aaacccaggggtttttgcagtcagcgattatgcagtcaggtggatccttctccatgaaatcgtgaataggttcacgaaggagcattgccccgtagtatat 227  Q
    ||||||| |||| | | ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  | ||||||||||| |||||||||||    
T  48963072 aaacccatgggtatatacagtcggtgatgatgcagtcaggtggatccttctccatgaaatcctgaattggtccgtggaggagcattgcgccgtagtatat 48963171  T
Q  228 cttgccggtggtgtcactgtcggaggtggaggacatagattcaacgccgtcagggaggccaacttgttgggagggaaagttgacaaggtgaaggcggagg 327  Q
    |||| | | |||| |  |||| | ||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||    ||||| |||||| |||| ||     |||||||| |||    
T  48963172 cttggctgaggtggcgatgtcagtggtggaggacaaagattcaacaccatcaaggaggc--tgttgtttggaggggaagtcgatggtatgaaggcgaagg 48963269  T
Q  328 aagaagggatcaacacttgagagaga---tttggtaaagaagtgggagttggagggagtggtgatgattgtcacttgttggccatgggatgcaaacagag 424  Q
    |||| ||||||  ||   ||  ||||    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48963270 aagaggggatcggcaaaggaaggagacttattggtgaagaagtgggcgttggagggagtggtgatgattgtgacttgttggccacgggacgcaaacagag 48963369  T
Q  425 ttgctatgtcacacatggggatcatatgcccaggtgctggatatggaatgaagtgaagtttca 487  Q
     ||||||||||| ||  || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48963370 ctgctatgtcacccaaaggaatcatatgaccaggtgcaagatatggaatgaagtgaagtttca 48963432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 487
Target Start/End: Original strand, 48966025 - 48966478
Alignment:
Q  34 gggtttattctaagggattccatgagggaaacggtaaagagggagaaaccagtgaaggcgatggtgggaatttgaagcttatgggccaagtcataaaccc 133  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||  | |||||||| |||||||||||| |||||||||   | || |    |||||||  ||||||||||| |||||    
T  48966025 gggtttgttctaagggtttccatgagacatacggtaaacagggagaaaccattgaaggcgagattcgggacccaaagcttactggccaagtcatgaaccc 48966124  T
Q  134 aggggtttttgcagtcagcgattatgcagtcaggtggatccttctccatgaaatcgtgaataggttcacgaaggagcattgccccgtagtatatcttgcc 233  Q
    | ||||    | ||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||  | ||||||||||| ||   |||||  |||||    
T  48966125 aagggtacaagaagtcaccaatgatacagtcaggtggatctttctccatgaaattctgaattggttcttggaggagcattgctcctgcgtatagtttgcc 48966224  T
Q  234 ggtggtgtcactgtcggaggtggaggacatagattcaacgccgtcagggaggccaacttgttgggagggaaagttgacaaggtgaaggcggaggaagaag 333  Q
    || || | ||   || | ||||  |||||| ||||| || |||   ||||| |||||||||||| |||| || |  ||   ||||| |||||||||||      
T  48966225 ggaggaggcaagatcaggggtgttggacatggattcgacaccggaggggagaccaacttgttggtaggggaaatcaacggtgtgaatgcggaggaagaga 48966324  T
Q  334 ggatcaacacttgagagagatttggtaaagaagtgggagttggagggagtggtgatgattgtcacttgttggccatgggatgcaaacagagttgctatgt 433  Q
    ||||| |     |  |||||||||| || ||||| || ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  48966325 ggatctatggagggaagagatttggaaaggaagttggcgttagagggagttgtgatgatggtgacttgttggccatgagatgcaaagatagttgctatgt 48966424  T
Q  434 cacacatggggatcatatgcccaggtgctggatatggaatgaagtgaagtttca 487  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48966425 cacacatagggatcatatggcctggtgctagatatggaatgaagtgaagtttca 48966478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 12640967 - 12640532
Alignment:
Q  37 tttattctaagggattccatgagggaaacggtaaagagggagaaaccagtgaaggcgatggtgggaatttgaagcttatgggccaagtcataaacccagg 136  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| || ||||||||| ||||    |||||||| |||||||  || ||| |||||| ||||||||||| || ||| |    
T  12640967 tttattcttaaggattctatgagggatactgtaaagaggaagaatggggtgaaggcaatggtggagatatgaggcttattggccaagtcattaatccaag 12640868  T
Q  137 ggtttttgcagtcagcgattatgcagtcaggtggatccttctccatgaaatcgtgaataggttcacgaaggagcattgccccgtagtatatcttgccggt 236  Q
    ||| |   ||||| || || ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||   ||| |||||| | ||||||||||| || |   |||||||| |  |    
T  12640867 ggtatacacagtcggcaatgatgtagtcaggttgatccttctccacgaattctctaatgggttcatggaggagcattgcacctttacatatcttggccat 12640768  T
Q  237 ggtgtcactgtcggaggtggaggacatagattcaacgccgtcagggaggccaacttgttgggagggaaagttgacaaggtgaaggcggaggaagaaggga 336  Q
    |||||||  ||  | |||||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||| |||   ||||||||||||||| || |||    
T  12640767 ggtgtcagggttagtggtggaggacaatgattcaacgccgtcgggaagatcgacttgttgggaggggaagtcgacggtgtgaaggcggaggaaaaacgga 12640668  T
Q  337 tcaacacttgagagagatttggtaaagaagtgggagttggagggagtggtgatgattgtcacttgttggccatgggatgcaaacagagttgctatgtcac 436  Q
    || ||    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12640667 tcgacgaaggagagagatttggtaaagaaatgggcgttggagggagtggtgatgatcgtgacttgttggccatgggatgcaaacaaagctgctatgtcac 12640568  T
Q  437 acatggggatcatatgcccaggtgctggatatggaa 472  Q
     ||  || |||||||| ||||||||| || ||||||    
T  12640567 ccaaaggaatcatatgaccaggtgctagaaatggaa 12640532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 12589660 - 12589225
Alignment:
Q  35 ggtttattctaagggattccatgagggaaacggtaaagagggagaaaccagtgaaggcgatggtgggaatttgaagcttatgggccaagtcataaaccca 134  Q
    ||||| |||||||||||||||  || || || ||||||||||||||| | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  12589660 ggtttgttctaagggattccaaaagagagactgtaaagagggagaaaacggtgaaggcgaggatggggatttgaagcttatgggccatgtcataaacccc 12589561  T
Q  135 ggggtttttgcagtcagcgattatgcagtcaggtggatccttctccatgaaatcgtgaataggttcacgaaggagcattgcccc-gtagtatatcttgcc 233  Q
     |||| | |||| || || || ||| |||||||||||||||||| ||| |||||   ||| |||||| | |||||| ||||  | ||| || ||||||      
T  12589560 tgggtatatgcaatcggcaatgatgtagtcaggtggatccttctgcatcaaatccccaatgggttcaaggaggagctttgcggctgta-tagatcttgat 12589462  T
Q  234 ggtggtgtcactgtcggaggtggaggacatagattcaacgccgtcagggaggccaacttgttgggagggaaagttgacaaggtgaaggcggaggaagaag 333  Q
    || |||| |   ||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| || |  || | |||||||||||   |||||    
T  12589461 ggaggtggcgtggtcggtggtggaggacaaagattcgacaccgtcagggaggccgacttgtagggaggggaaatctacgatgtgaaggcgga---agaag 12589365  T
Q  334 ggatcaacacttgagagagatttggtaaagaagtgggagttggagggagtggtgatgattgtcacttgttggccatgggatgcaaacagagttgctatgt 433  Q
    |||     |||||        ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  12589364 ggag----acttg--------ttggtgaagaagtgggagttcaagggagtggtggtgattgtgacttgttggccacgggatgcaaacagggttgcaatgt 12589277  T
Q  434 cacacatggggatcatatgcccaggtgctggatatggaatgaagtgaagttt 485  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12589276 cacatagagggatcatatgcccaggtgatagatatggaatgaagtgaagttt 12589225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 355 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 12482623 - 12482491
Alignment:
Q  355 ttggtaaagaagtgggagttggagggagtggtgatgattgtcacttgttggccatgggatgcaaacagagttgctatgtcacacatggggatcatatgcc 454  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || |||||| | ||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||    
T  12482623 ttggtgaagaagtgggtgttggaaggagtggtgatgattgtgacatgatggccacgtgatgcaaacagagttgcaatcttgcacatagggatcatatgcc 12482524  T
Q  455 caggtgctggatatggaatgaagtgaagtttca 487  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12482523 caggtgctggaaatggaatgaagtgaagtttca 12482491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12482937 - 12482797
Alignment:
Q  41 ttctaagggattccatgagggaaacggtaaagagggagaaaccagtgaaggcgatggtgggaatttgaagcttatgggccaagtcataaacccaggggtt 140  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |   | || ||| | |||||||| || ||||||||||  |||||||||||||| |  || |     
T  12482937 ttctgagggattccaaaagggacacggtaaagagggacatcacggtaaagcctatggtgggtatatgaagcttatccgccaagtcataaactccaggata 12482838  T
Q  141 tttgcagtcagcgattatgcagtcaggtggatccttctcca 181  Q
    | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12482837 tatgcagtcaacgatgatgtagtcaggtggatccttctcca 12482797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 487
Target Start/End: Original strand, 13441114 - 13441349
Alignment:
Q  252 ggtggaggacatagattcaacgccgtcagggaggccaacttgttgggagggaaagttgacaaggtgaaggcggaggaagaagggatcaacacttgagaga 351  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||| | |  |   |||||||    
T  13441114 ggtggaagacatagattcaatgccttcagggaggtcgacttgttgggagggaaagtcgacggtgtggaagcggaggaagaaggaagccgcggatgagaga 13441213  T
Q  352 gatttggtaaagaagtgggagttggagggagtggtgatgattgtcacttgttggccatgggatgcaaacagagttgctatgtcacacatggggatcatat 451  Q
    |||||||| | | | || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  13441214 gatttggttagggattgagcgttggagggagtggtgatgattgtgacttgttggccacgggatgcaaacatagttgctatgtcacaaagagggatcatat 13441313  T
Q  452 gcccaggtgctggatatggaatgaagtgaagtttca 487  Q
    | |||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13441314 gtccagatgctagatatggaatgaagtgaattttca 13441349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 246 - 487
Target Start/End: Original strand, 13462292 - 13462533
Alignment:
Q  246 gtcggaggtggaggacatagattcaacgccgtcagggaggccaacttgttgggagggaaagttgacaaggtgaaggcggaggaagaagggatcaacactt 345  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||    ||||| ||| |||| | ||||| |  |   |    
T  13462292 gtcggtggtggaagacatagattcaatgccatcaggaaggccaacttgttgggaggggaattcgatggtgtgaaagcgaaggagggagggagcggcggat 13462391  T
Q  346 gagagagatttggtaaagaagtgggagttggagggagtggtgatgattgtcacttgttggccatgggatgcaaacagagttgctatgtcacacatgggga 445  Q
    |||||||||||||||| | | |||  |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| | |  ||||    
T  13462392 gagagagatttggtaagggattggacgttggagggagtggtgatgactgtgacgtgttggccacgggatgcaaacataattgctatgtcaaaaagaggga 13462491  T
Q  446 tcatatgcccaggtgctggatatggaatgaagtgaagtttca 487  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13462492 tcatatgtccagatgctagatatggaatgaagtgcagtttca 13462533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 259 - 487
Target Start/End: Original strand, 13449284 - 13449512
Alignment:
Q  259 gacatagattcaacgccgtcagggaggccaacttgttgggagggaaagttgacaaggtgaaggcggaggaagaagggatcaacacttgagagagatttgg 358  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||   |||||| || |||||  | ||| |  |   ||||||||||||||    
T  13449284 gacatagattcaataccttcagggaggccgacttgttgggaggggaagtcaacggtgtgaagacgaaggaatgaaggagcgtcggatgagagagatttgg 13449383  T
Q  359 taaagaagtgggagttggagggagtggtgatgattgtcacttgttggccatgggatgcaaacagagttgctatgtcacacatggggatcatatgcccagg 458  Q
    ||| | | |  | ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||| ||||     
T  13449384 taagggattttgcgttggcgggagtggtgatgactgttacttgctggccacgggatgcaaacatagttgctatgtcaaaaagagggatcatatgtccaga 13449483  T
Q  459 tgctggatatggaatgaagtgaagtttca 487  Q
    |||  || |||||||||||| || |||||    
T  13449484 tgcaagaaatggaatgaagtaaactttca 13449512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 246 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 3416807 - 3416566
Alignment:
Q  246 gtcggaggtggaggacatagattcaacgccgtcagggaggccaacttgttgggagggaaagttgacaaggtgaaggcggaggaagaagggatcaacactt 345  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | | ||||||  ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| |  ||       
T  3416807 gtcggtggtggaggatatagattcaatgccttcagggaggtccatttgttgaaagggaaagtcgacggtgtgaaggcggaggaagaagggagcggcataa 3416708  T
Q  346 gagagagatttggtaaagaagtgggagttggagggagtggtgatgattgtcacttgttggccatgggatgcaaacagagttgctatgtcacacatgggga 445  Q
    || |||||||| ||||  || | ||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |  ||||    
T  3416707 gaaagagattttgtaagaaatttggcattggagggagtggtgatgattgtgacatgttggccatgggatgcaaacatagctgctatatcagaaagaggga 3416608  T
Q  446 tcatatgcccaggtgctggatatggaatgaagtgaagtttca 487  Q
    ||||||| | || |||  |||| ||||||||||||| |||||    
T  3416607 tcatatggctagatgcaagataaggaatgaagtgaattttca 3416566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 373 - 481
Target Start/End: Original strand, 12541708 - 12541816
Alignment:
Q  373 ttggagggagtggtgatgattgtcacttgttggccatgggatgcaaacagagttgctatgtcacacatggggatcatatgcccaggtgctggatatggaa 472  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||| ||||  ||||||||    
T  12541708 ttggagggagtggtgatgattgtgacttgttggccatgtgatgcaaacaaagttgctatatcacaaagagggatcatatgtccagatgctaaatatggaa 12541807  T
Q  473 tgaagtgaa 481  Q
    |||||||||    
T  12541808 tgaagtgaa 12541816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 373 - 487
Target Start/End: Original strand, 28386363 - 28386477
Alignment:
Q  373 ttggagggagtggtgatgattgtcacttgttggccatgggatgcaaacagagttgctatgtcacacatggggatcatatgcccaggtgctggatatggaa 472  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |  || |||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  28386363 ttggagggagtggtgatgattgtgacatgttggccacgtgatgcaaacaaagttgctatatcacaaagtggcatcatatgtccagatgctggatacggaa 28386462  T
Q  473 tgaagtgaagtttca 487  Q
    |||||||||||||||    
T  28386463 tgaagtgaagtttca 28386477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 321
Target Start/End: Original strand, 12541599 - 12541668
Alignment:
Q  252 ggtggaggacatagattcaacgccgtcagggaggccaacttgttgggagggaaagttgacaaggtgaagg 321  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||  |||||||    
T  12541599 ggtggaggacatagattcaatgcctttagggaggtcgacttgttcggaggggaagtcgacagtgtgaagg 12541668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University