View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF7257_low_2 (Length: 673)

Name: NF7257_low_2
Description: NF7257
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF7257_low_2
NF7257_low_2
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (33-302)||(20499805-20500071)
chr1 (63-297)||(22459753-22459984)
chr1 (63-297)||(22470182-22470413)
chr1 (40-297)||(13462488-13462750)
chr1 (44-298)||(23020241-23020494)
chr1 (42-297)||(31550979-31551234)
chr1 (42-297)||(31560107-31560362)
chr1 (105-297)||(3353113-3353305)
chr1 (105-297)||(16132682-16132874)
chr1 (87-299)||(32607718-32607934)
chr1 (51-298)||(46779405-46779655)
chr1 (42-297)||(38126083-38126348)
chr1 (93-160)||(3253968-3254035)
chr1 (164-297)||(12465848-12465981)
chr1 (246-297)||(19259182-19259233)
chr1 (40-136)||(18700021-18700129)
chr1 (44-82)||(3353040-3353078)
chr1 (44-82)||(16132909-16132947)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (40-297)||(23037643-23037897)
chr5 (40-299)||(17638032-17638291)
chr5 (40-297)||(23028080-23028340)
chr5 (52-297)||(21852665-21852908)
chr5 (52-298)||(21869189-21869433)
chr5 (42-297)||(11814984-11815238)
chr5 (42-297)||(11804908-11805162)
chr5 (42-297)||(12172682-12172937)
chr5 (42-297)||(12182110-12182365)
chr5 (42-299)||(26090880-26091138)
chr5 (44-297)||(33846352-33846605)
chr5 (42-297)||(26080901-26081157)
chr5 (44-297)||(33837776-33838029)
chr5 (504-665)||(19725087-19725250)
chr5 (105-299)||(26174523-26174717)
chr5 (164-298)||(21997414-21997547)
chr5 (164-297)||(21988770-21988902)
chr5 (164-297)||(26756852-26756984)
chr5 (44-297)||(27222884-27223140)
chr5 (44-299)||(27061510-27061765)
chr5 (164-299)||(31550608-31550744)
chr5 (164-297)||(23634844-23634978)
chr5 (164-297)||(23829173-23829307)
chr5 (164-299)||(23606519-23606654)
chr5 (164-299)||(23837914-23838049)
chr5 (222-298)||(21873638-21873713)
chr5 (178-297)||(20375548-20375667)
chr5 (178-297)||(20384339-20384458)
chr5 (44-82)||(26174752-26174790)
[»] scaffold0903 (1 HSPs)
scaffold0903 (42-297)||(3029-3282)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (33-297)||(21401380-21401642)
chr4 (43-297)||(55589559-55589811)
chr4 (40-297)||(24922156-24922414)
chr4 (55-298)||(25249725-25249972)
chr4 (62-297)||(34839746-34839980)
chr4 (42-298)||(4750002-4750257)
chr4 (180-297)||(19647456-19647573)
chr4 (177-297)||(26213046-26213168)
chr4 (177-297)||(26221801-26221923)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (25-214)||(16543171-16543357)
chr7 (25-214)||(16622305-16622491)
chr7 (33-297)||(17208773-17209032)
chr7 (40-299)||(25729081-25729338)
chr7 (100-297)||(36478295-36478495)
chr7 (42-299)||(570806-571062)
chr7 (104-297)||(17599438-17599631)
chr7 (42-297)||(560897-561151)
chr7 (42-299)||(5210646-5210903)
chr7 (42-297)||(5201517-5201772)
chr7 (44-299)||(44077616-44077872)
chr7 (42-297)||(27968351-27968608)
chr7 (42-297)||(27977804-27978061)
chr7 (52-297)||(40677509-40677755)
chr7 (44-299)||(48504796-48505058)
chr7 (164-297)||(38247765-38247899)
chr7 (44-298)||(16149869-16150124)
chr7 (44-297)||(16123130-16123384)
chr7 (100-299)||(38416372-38416571)
chr7 (100-175)||(16225261-16225336)
chr7 (100-175)||(16242143-16242218)
chr7 (100-297)||(38410724-38410922)
chr7 (222-293)||(16242053-16242123)
chr7 (44-82)||(20114142-20114180)
chr7 (44-87)||(36478227-36478270)
chr7 (260-302)||(27433066-27433108)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (52-302)||(35457-35706)
scaffold0046 (55-297)||(61259-61500)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (40-298)||(23090335-23090593)
chr8 (43-286)||(36578960-36579201)
chr8 (44-297)||(16192948-16193202)
chr8 (105-299)||(36255090-36255283)
chr8 (63-286)||(6585300-6585527)
chr8 (52-298)||(25699999-25700243)
chr8 (148-297)||(19848734-19848891)
chr8 (222-295)||(36246766-36246840)
chr8 (538-587)||(6638547-6638597)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (40-297)||(16288404-16288659)
chr3 (43-297)||(31276311-31276563)
chr3 (100-293)||(12480030-12480225)
chr3 (44-298)||(17565259-17565512)
chr3 (42-298)||(1006817-1007073)
chr3 (42-297)||(10714644-10714900)
chr3 (42-208)||(10723341-10723506)
chr3 (105-298)||(25262240-25262431)
chr3 (105-297)||(25271782-25271972)
chr3 (44-297)||(18533562-18533823)
chr3 (44-297)||(29473523-29473784)
chr3 (164-297)||(4506129-4506263)
chr3 (44-297)||(6296119-6296372)
chr3 (44-82)||(25262471-25262509)
chr3 (44-82)||(25272012-25272050)
chr3 (262-298)||(27976288-27976324)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (40-297)||(21720040-21720296)
chr6 (55-298)||(25651467-25651709)
chr6 (52-297)||(24491012-24491256)
chr6 (55-297)||(18840817-18841053)
chr6 (40-299)||(16557872-16558127)
chr6 (40-299)||(16642867-16643122)
chr6 (100-297)||(16642113-16642310)
chr6 (42-297)||(27049673-27049927)
chr6 (42-297)||(27059917-27060171)
chr6 (105-297)||(16586802-16586995)
chr6 (105-297)||(16608385-16608578)
chr6 (42-299)||(30997969-30998227)
chr6 (40-159)||(16305427-16305544)
chr6 (164-297)||(24917971-24918103)
chr6 (177-297)||(15140493-15140613)
chr6 (180-297)||(28127561-28127679)
chr6 (44-297)||(18124029-18124289)
chr6 (44-299)||(18109470-18109732)
chr6 (260-299)||(16305592-16305631)
chr6 (40-89)||(24918133-24918182)
chr6 (44-82)||(23985123-23985161)
chr6 (262-299)||(336467-336504)
chr6 (45-82)||(21361028-21361065)
chr6 (45-82)||(23965010-23965047)
chr6 (222-297)||(16087194-16087267)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (63-298)||(13074-13306)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (40-282)||(49029-49269)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (52-297)||(28478789-28479033)
chr2 (105-297)||(38611645-38611836)
chr2 (52-270)||(21148922-21149140)
chr2 (40-297)||(22184825-22185069)
chr2 (42-299)||(28475876-28476132)
chr2 (42-297)||(3757474-3757728)
chr2 (42-297)||(3767540-3767794)
chr2 (68-297)||(25256347-25256575)
chr2 (105-299)||(30527018-30527212)
chr2 (42-298)||(2650472-2650729)
chr2 (44-297)||(11649170-11649422)
chr2 (164-299)||(27683531-27683666)
chr2 (44-297)||(16281356-16281615)
chr2 (44-298)||(16272196-16272456)
chr2 (44-297)||(29852777-29853031)
chr2 (44-175)||(25261523-25261653)
chr2 (164-297)||(31357263-31357398)
chr2 (88-297)||(34434526-34434747)
chr2 (178-297)||(30694664-30694783)
chr2 (44-82)||(30526945-30526983)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (40-298)||(60758-61014)
[»] scaffold0853 (1 HSPs)
scaffold0853 (40-297)||(3070-3326)
[»] scaffold1380 (1 HSPs)
scaffold1380 (63-297)||(320-552)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (100-297)||(10621-10818)
[»] scaffold0744 (1 HSPs)
scaffold0744 (44-297)||(4071-4323)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (55-299)||(860-1113)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (504-653)||(20515-20663)
scaffold0076 (298-415)||(20307-20423)
[»] scaffold2036 (1 HSPs)
scaffold2036 (52-297)||(781-1030)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (44-298)||(39555-39811)
[»] scaffold0455 (1 HSPs)
scaffold0455 (180-297)||(6160-6278)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (222-297)||(3000-3074)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (222-297)||(20596-20669)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 33 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20500071 - 20499805
Alignment:
Q  33 agaaatttacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattg 132  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20500071 agaagtttacaattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactat---aaaatgtgttataaaaatgcagatgaagtgattttaattg 20499975  T
Q  133 ttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaaga 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||       |||||||||||    
T  20499974 ttgtaaaaatgcaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttttaaatgattaaagacgaaaaacacgagttttacatggtaaaaaaacgaataaaaga 20499875  T
Q  233 gaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaatcat 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  20499874 gaatgtagacgattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtctaaatttggggtatgacagtcat 20499805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 63 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22459984 - 22459753
Alignment:
Q  63 tttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgc 162  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22459984 tttgactgttaagactaaaaacactat---aaaatgcgttataaaaatgcaaatgaagtgattttaaatgttgtaaaaatgcaagcggggacttaaatgc 22459888  T
Q  163 aagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaa 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  22459887 aagataaaagtttttaaatgattaaagacaaaaaacacaagttttaaatggtaaaaaaacgaataaaagagaatgtggactatttcaaaatatggacaaa 22459788  T
Q  263 aaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22459787 aaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 22459753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 63 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22470413 - 22470182
Alignment:
Q  63 tttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgc 162  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22470413 tttgactgttaagactaaaaacactat---aaaatgcgttataaaaatgcaaatgaagtgattttaaatgttgtaaaaatgcaagcggggacttaaatgc 22470317  T
Q  163 aagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaa 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  22470316 aagataaaagtttttaaatgattaaagacaaaaaacacaagttttaaatggtaaaaaaacgaataaaagagaatgtggactatttcaaaatatggacaaa 22470217  T
Q  263 aaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22470216 aaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 22470182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13462750 - 13462488
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataa------aatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgt 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |       ||   |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |    
T  13462750 tacgattagaccttttaaaatgatttggatgttatgactaaaaagaatataaaatgcgttcaaaaagttataaaaatgcaaatgaagtgattttaactat 13462651  T
Q  134 tgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagag 233  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |       ||||||||||||    
T  13462650 tgtaaaaatgcaagctgggacttaaatgcaagataaaagtttttaaatgattaaagacgaaaaacacgagttttaaatgat-aaaaaacgaataaaagag 13462552  T
Q  234 aatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13462551 aaagtggactattttaaaatatggacaaaaaatattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 13462488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 298
Target Start/End: Original strand, 23020241 - 23020494
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaa- 141  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||     
T  23020241 attagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaaaa 23020337  T
Q  142 tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtaga 241  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |  |    
T  23020338 tgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaatctgaa 23020437  T
Q  242 ctattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
    |||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23020438 ctattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaa 23020494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31551234 - 31550979
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  31551234 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 31551138  T
Q  141 a--tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    |  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |    
T  31551137 aaatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaatct 31551038  T
Q  239 agactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
      ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31551037 gaactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 31550979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31560362 - 31560107
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  31560362 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 31560266  T
Q  141 a--tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    |  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |    
T  31560265 aaatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaatct 31560166  T
Q  239 agactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
      ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31560165 gaactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 31560107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 297
Target Start/End: Original strand, 3353113 - 3353305
Alignment:
Q  105 aaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagt 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  || || | |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  3353113 aaaaatacagatgaagtgattttaactgttgtaaaaagcga-gcagagacttaaatgcaagatgacagtttttaaatgattaaagacgaaaaacacgagt 3353211  T
Q  205 tttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||| |||||        |||||||||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3353212 tttaaatggtaaaaaaaacgaataaaagagcaggtggactattataaaatatggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 3353305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16132874 - 16132682
Alignment:
Q  105 aaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagt 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  || || | |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  16132874 aaaaatacagatgaagtgattttaactgttgtaaaaagcga-gcagagacttaaatgcaagatgacagtttttaaatgattaaagacgaaaaacacgagt 16132776  T
Q  205 tttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||| |||||        |||||||||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16132775 tttaaatggtaaaaaaaacgaataaaagagcaggtggactattataaaatatggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 16132682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32607934 - 32607718
Alignment:
Q  87 tattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaa---tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatga 183  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||||||||   || ||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||    
T  32607934 tattataaaacgcgttataaaaatgcaaatggagtaattttaaatgttgtaaaaaaaatgcaagcgaggactcaaatgcaaggtgaaagtttttaaatga 32607835  T
Q  184 ttaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaa 282  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| | |||        ||||||||||||||| |  |||||| |||||| || ||||||||||||| ||| |||||||    
T  32607834 ttaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgaataaaagagaatctgaactattataaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaa 32607735  T
Q  283 atttggagtatgacaat 299  Q
    |||||| ||||||||||    
T  32607734 atttggggtatgacaat 32607718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 298
Target Start/End: Original strand, 46779405 - 46779655
Alignment:
Q  51 attttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aaaatggaagc 148  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  46779405 attttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtagaaaatgcaagc 46779501  T
Q  149 ggggacttaaatgcaagataaaag----tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagacta 244  Q
    | ||||||||||||||||| ||||    ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |  ||||    
T  46779502 gaggacttaaatgcaagatgaaagtttttttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggt-aaaaaacgaataaaagagaatctgaacta 46779600  T
Q  245 tt-ttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
    ||   ||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  46779601 ttaaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatgatccaaatttggggtatgacaa 46779655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 38126083 - 38126348
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtg-ttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||    
T  38126083 cgattagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagg---attataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtagaa 38126179  T
Q  140 aatggaagcggggacttaaatgcaagataaaag------------tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaata 227  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||            ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||    
T  38126180 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttttttttttttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggt-aaaaaacgaata 38126278  T
Q  228 aaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38126279 aaagagaatctgaactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 38126348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 160
Target Start/End: Original strand, 3253968 - 3254035
Alignment:
Q  93 aaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaat 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3253968 aaaatgcgttataaaaatgcagatgaagtgattttaattgttgtaaaaatgcaagcggggacttaaat 3254035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 297
Target Start/End: Original strand, 12465848 - 12465981
Alignment:
Q  164 agataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnn-cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaa 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||        |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  12465848 agataaaagtttttaaatgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaaacgaatagaagagaatgtggactatttcaaaatatggacaaa 12465947  T
Q  263 aaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  12465948 a-agattttaagtggtccaaatttggggtatgaca 12465981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 297
Target Start/End: Original strand, 19259182 - 19259233
Alignment:
Q  246 tttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19259182 tttaaaatatgaacaaaaaagattttaaatggtccaaatttggggtatgaca 19259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18700129 - 18700021
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagact----attataaaatgt--------gttataaaaatgcagatgaaatgatttt 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    | ||||||||||        |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18700129 tacgattagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaaaaacttttaaatataaaatgtgtttaaaagttataaaaatgcagatgaagtgatttt 18700030  T
Q  128 aattgttgt 136  Q
    || ||||||    
T  18700029 aactgttgt 18700021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 82
Target Start/End: Original strand, 3353040 - 3353078
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaa 82  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3353040 attagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaa 3353078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 16132947 - 16132909
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaa 82  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16132947 attagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaa 16132909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 40 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23037897 - 23037643
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23037897 tacgattagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaaagactat---aaaatgcgttataaaaatgcagatgaagtgatttgaattgttgtaaa 23037801  T
Q  140 aatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||       |||||||||||||||||     
T  23037800 aaagcaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttttaaatgattaaagacgaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaacgaataaaagagaatgtg 23037701  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23037700 gaatattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacgatccaaatttggggtatgaca 23037643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17638291 - 17638032
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17638291 tacgattagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaaagactat---aaaatgcgttataaaaatgcagatgaagtgattctaattgttgtaaa 17638195  T
Q  140 aatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatat-ggt--nnnnnnncgaataaaagagaat 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || || |||         |||||| |||||||     
T  17638194 aatgcaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttttaaatgattaaagacgaaaaacacgagttctaaataggtaaaaaaaaacgaatacaagagaaa 17638095  T
Q  237 gtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17638094 gtggactattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacgatccaaatttggggtatgacaat 17638032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 297
Target Start/End: Original strand, 23028080 - 23028340
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgt-aa 138  Q
    ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  23028080 tacgattagatgttttaaaatggcttgactgttatgactaaaaagactat---aaaatgcgttataaaaatgcagatgaagtgatttgaattgttgtaaa 23028176  T
Q  139 aaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt------nnnnnnncgaataaaaga 232  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||             |||||||||||    
T  23028177 aaaagcaagcggggacttaaatgcaagataaaa-tttttaaatgattaaagatgaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaaaaaaaacgaataaaaga 23028275  T
Q  233 gaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23028276 gaatgtggactattttaaaatatggacaaaaaaggttttaaacggtccaaatttggggtatgaca 23028340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 297
Target Start/End: Original strand, 21852665 - 21852908
Alignment:
Q  52 ttttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggg 151  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21852665 ttttaaaatgacttgactgttatgactaaaaaga---ttataaaatgcataataaaaatgcagataaagtgattttaattgttgtaaaaatgcaagcggg 21852761  T
Q  152 gacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacg-aaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgtagactatttta 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| | || ||        ||||||| |||||| || ||||||||||    
T  21852762 gacttaaatgcaagataaaaatttgtaaatgactaaagacgaaaaaacacgagtttcaaatagtaaaaaaaacgaataacagagaaagttgactatttta 21852861  T
Q  250 aaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21852862 aaatatggac-aaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 21852908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 298
Target Start/End: Original strand, 21869189 - 21869433
Alignment:
Q  52 ttttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggg 151  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21869189 ttttaaaatgacttgactgttatgactaaaaaga---ttataaaatgcataataaaaatgcagataaagtgattttaattgttgtaaaaatgcaagcggg 21869285  T
Q  152 gacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacg-aaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgtagactatttta 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| | || ||        ||||||| |||||| || ||||||||||    
T  21869286 gacttaaatgcaagataaaaatttgtaaatgactaaagacgaaaaaacacgagtttcaaatagtaaaaaaaacgaataacagagaaagttgactatttta 21869385  T
Q  250 aaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21869386 aaatatggac-aaaaagattttaaacgatccaaatttggggtatgacaa 21869433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 11814984 - 11815238
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  11814984 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaaaga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 11815080  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |     
T  11815081 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaatctg 11815180  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
     ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11815181 aactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 11815238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 11804908 - 11805162
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  11804908 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 11805004  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |     
T  11805005 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaatctg 11805104  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
     ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11805105 aactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 11805162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 12172682 - 12172937
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  12172682 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 12172778  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||        ||||||||||||||| |    
T  12172779 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgaataaaagagaatct 12172878  T
Q  239 agactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
      ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12172879 gaactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 12172937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 12182110 - 12182365
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  12182110 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 12182206  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||        ||||||||||||||| |    
T  12182207 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgaataaaagagaatct 12182306  T
Q  239 agactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
      ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12182307 gaactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 12182365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 299
Target Start/End: Original strand, 26090880 - 26091138
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||    
T  26090880 cgattagccattttaaaatgatttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaactggagtgattttaaatgttgtaaaa 26090976  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||        ||||||||||||||| |    
T  26090977 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgaataaaagagaatct 26091076  T
Q  239 agactattttaaaatatgaac-aaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
      ||||||  ||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26091077 gaactattaaaaaatgtggacaaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaat 26091138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 297
Target Start/End: Original strand, 33846352 - 33846605
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtg-ttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aaaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  33846352 attagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagg---attataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtagaaaa 33846448  T
Q  142 tggaagcggggacttaaatgcaagataaaag--tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| ||    
T  33846449 tgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggt-aaaaaacgaataaaagagaatcta 33846547  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
     ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33846548 aactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 33846605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 26080901 - 26081157
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||    
T  26080901 cgattagccattttaaaatgatttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaactggagtgattttaaatgttgtaaaa 26080997  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||        ||||||||||||||| |    
T  26080998 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgaataaaagagaatct 26081097  T
Q  239 agactattttaaaatatgaac-aaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
      ||||||  ||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26081098 gaactattaaaaaatgtggacaaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 26081157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 297
Target Start/End: Original strand, 33837776 - 33838029
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtg-ttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aaaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  33837776 attagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagg---attataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtagaaaa 33837872  T
Q  142 tggaagcggggacttaaatgcaagataaaag--tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |     
T  33837873 tgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggt-aaaaaacgaataaaagagaatctg 33837971  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
     ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33837972 aactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 33838029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 504 - 665
Target Start/End: Original strand, 19725087 - 19725250
Alignment:
Q  504 agtaaatctatcaaaggggccataacaaatggctgttcccaaattctctcacgaggtactgtgagaatatcagat-tgactttaaattgaacataaagta 602  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||    
T  19725087 agtaaatccatcaaaggggccatgacaaaaggtcgttcccaaattctttcatgaggtactgtgagaatatcagatctgactttaaatttaccatagaata 19725186  T
Q  603 aaatgtctaaat-aattggccgtggaccataccttgtaccgtcagtacggcccaagttcttctc 665  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  19725187 aaatgtctaagtccattggccttggaccataccttataccgtcagtacggcccatgtccttctc 19725250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26174717 - 26174523
Alignment:
Q  105 aaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagt 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  || || | |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  26174717 aaaaatacagatgaagtgattttaactgttgtaaaaagcga-gcagagacttaaatgcaagatgacagtttttaaatgattaaagacgaaaaacacgagt 26174619  T
Q  205 tttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
    |||| |||||        |||||||||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26174618 tttaaatggtaaaaaaaacgaataaaagagcaggtggactattataaaatatggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaat 26174523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 298
Target Start/End: Original strand, 21997414 - 21997547
Alignment:
Q  164 agataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaa 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||       |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||    
T  21997414 agataaaagtttttaaatgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaacgaatagaagagaatgtggactatttcaaaatatggac-aaa 21997512  T
Q  264 aagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21997513 aagattttaaatggtccaaatttggggtatgacaa 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 297
Target Start/End: Original strand, 21988770 - 21988902
Alignment:
Q  164 agataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaa 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||       |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||    
T  21988770 agataaaagtttttaaatgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaacgaatagaagagaatgtggactatttcaaaatatggac-aaa 21988868  T
Q  264 aagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21988869 aagattttaaatggtccaaatttggggtatgaca 21988902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 297
Target Start/End: Original strand, 26756852 - 26756984
Alignment:
Q  164 agataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaa 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||       |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |||    
T  26756852 agataaaagtttttaaatgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaacgaatagaagagaatgtggactatttcaaaatatggac-aaa 26756950  T
Q  264 aagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26756951 aagattttaaatggtccaaatttggggtatgaca 26756984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 297
Target Start/End: Original strand, 27222884 - 27223140
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtg-ttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aaaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  27222884 attagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagg---attataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtagaaaa 27222980  T
Q  142 tggaagcggggacttaaatgcaagataaaag----tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatg 237  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||    ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | |||       |||||||||||||||     
T  27222981 tgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttttttaaatgattaatgac-aaaaacacgagttttaaaaggt-aaaaaacgaataaaagagaatc 27223078  T
Q  238 tagactatt--ttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |  ||||||    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27223079 tgaactattaaaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 27223140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27061765 - 27061510
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaat 142  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||     
T  27061765 attagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaattcaaatgaagtgattttaaatattgtaaaaaa 27061669  T
Q  143 gga-agcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgtag 240  Q
     |  |||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||        || |||||||||||| | |    
T  27061668 agcgagcgaggacttaaatgccagatgaaagtctttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgcataaaagagaatctgg 27061569  T
Q  241 actattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
    |||| | ||||||  | |||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||    
T  27061568 actaatataaaatgcggacaagaaagatttcaaatggtccaaatttgggatatgacaat 27061510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 164 - 299
Target Start/End: Original strand, 31550608 - 31550744
Alignment:
Q  164 agataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnn--cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaa 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||         |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  31550608 agataaaagtttttaaatgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaaaacgaatagaagagaatgtggactatttcaaaatatggacaa 31550707  T
Q  262 aaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  31550708 aa-agattttaaatggtccaaatttggggtatgacaat 31550744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23634978 - 23634844
Alignment:
Q  164 agataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnn-cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaa 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | ||||||| |||||        |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  23634978 agataaaagtttttaaatgattaaaaaaaaaaaacgcgagttttaaatggtaaaaaaaacgaatagaagagaatgtggactatttcaaaatatggacaaa 23634879  T
Q  263 aaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23634878 aaagattttaaatggtccaaatttggggtatgaca 23634844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 297
Target Start/End: Original strand, 23829173 - 23829307
Alignment:
Q  164 agataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnn-cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaa 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | ||||||| |||||        |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  23829173 agataaaagtttttaaatgattaaaaaaaaaaaacgcgagttttaaatggtaaaaaaaacgaatagaagagaatgtggactatttcaaaatatggacaaa 23829272  T
Q  263 aaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23829273 aaagattttaaatggtccaaatttggggtatgaca 23829307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 299
Target Start/End: Original strand, 23606519 - 23606654
Alignment:
Q  164 agataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnn-cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaa 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | ||||||| |||||        |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  23606519 agataaaagtttttaaatgattaaaaaaaaaaaacgcgagttttaaatggtaaaaaaaacgaatagaagagaatgtggactatttcaaaatatggacaaa 23606618  T
Q  263 aaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23606619 aaaga-tttaaatggtccaaatttggggtatgacaat 23606654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 299
Target Start/End: Original strand, 23837914 - 23838049
Alignment:
Q  164 agataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnn-cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaa 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | ||||||| |||||        |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  23837914 agataaaagtttttaaatgattaaaaaaaaaaaacgcgagttttaaatggtaaaaaaaacgaatagaagagaatgtggactatttcaaaatatggacaaa 23838013  T
Q  263 aaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23838014 aaaga-tttaaatggtccaaatttggggtatgacaat 23838049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 298
Target Start/End: Original strand, 21873638 - 21873713
Alignment:
Q  222 cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21873638 cgaataacagagaaagttgactattttaaaatatggacaaaa-agattttaaacgatccaaatttggggtatgacaa 21873713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20375667 - 20375548
Alignment:
Q  178 aaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnn-cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacg 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||        | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  20375667 aaatgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaaacaaatagaagagaatgtggactatttttaaatatggacaaaaa-gattttaaatg 20375569  T
Q  277 gtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  20375568 gtccaaatttggggtatgaca 20375548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20384458 - 20384339
Alignment:
Q  178 aaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnn-cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacg 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||        | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  20384458 aaatgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaaacaaatagaagagaatgtggactatttttaaatatggacaaaaa-gattttaaatg 20384360  T
Q  277 gtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  20384359 gtccaaatttggggtatgaca 20384339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 26174790 - 26174752
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaa 82  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26174790 attagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaa 26174752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0903 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0903
Description:

Target: scaffold0903; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3282 - 3029
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaa 141  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3282 cgattagaccttttaaaatgacttgactgttatgattaaaaagactat---aaaatgcgttataaaaatgcagatgaattgattttaattgttgtaaaaa 3186  T
Q  142 -tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtag 240  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||       ||||||||||||||||| |    
T  3185 atgcaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttttaaatgattaaagacgaaaaacacgagttttacatggtaaaaaaacgaataaaagagaatgtgg 3086  T
Q  241 actattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3085 actattttaaaatatggacaaaaaagatcttaaacggtccaaatttggggtatgaca 3029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 33 - 297
Target Start/End: Original strand, 21401380 - 21401642
Alignment:
Q  33 agaaatttacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattg 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  21401380 agaaatttacgattagacattttaaaatgacttgactgttatgactaaaaagactat---aaaatgtgttataaaaataccgatgaagtgattttaattg 21401476  T
Q  133 ttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaag-tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaag 231  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||       | ||||||||    
T  21401477 ttgtaaaaatgcaagcggagacttaaatgcaagataaaagttttttaaatgattaaagacgaaaaacacgagttttacatggtaaaaaaacaaataaaag 21401576  T
Q  232 agaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  21401577 agaatgttgattattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggttcaaatttagggtatgaca 21401642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 43 - 297
Target Start/End: Original strand, 55589559 - 55589811
Alignment:
Q  43 gattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaat 142  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  55589559 gattagatcttttaaaatgacttgactgttataattaaaaagactat---aaaatacgttataaaaatgcagatgaagtgattttaattgttgtaaaact 55589655  T
Q  143 ggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagtttt-atatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtaga 241  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||       |||||||||||||| ||  |    
T  55589656 gcaagcgggtacttaaatgcaagataaaggtttttaaatgattaaagacgaaaaacacgagtttttaaatggtataaaaacgaataaaagagaaagtgaa 55589755  T
Q  242 ctattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55589756 ctattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 55589811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24922414 - 24922156
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24922414 tacgattagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaaaga---ttataaaatgcattataaaaatgcagatgaagtgattttaattgctgtaaa 24922318  T
Q  140 aatggaagcggggacttaaatgcaagataaaag-tttctaaatgattaaagacg-aaaaacacaagttttatatggt--nnnnnnncgaataaaagagaa 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| | || ||         ||||||| | ||||    
T  24922317 aatgcaagcggggacttaaatgcaagataaaagttttttaaatgactaaagacgaaaaaacacgagtttcaaatagtaaaaaaaaacgaataacaaagaa 24922218  T
Q  236 tgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24922217 agtggactattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttagagtatgaca 24922156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Original strand, 25249725 - 25249972
Alignment:
Q  55 taaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggac 154  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25249725 taaaatgacttgactgttatgactaaaaaaactat---aaaatgcgttataaaaatgcagatgaagtgattttaattgttgtaaaaatgcaagcggggac 25249821  T
Q  155 ttaaatgcaagataaaag-------tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgtagactatt 246  Q
    |||||||||| |||||||       ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        ||||||||||||||||| |||||||    
T  25249822 ttaaatgcaaaataaaagttttttttttttaaatgattaaagacaaaaaacacaagttttaaatggtaaaaaaaacgaataaaagagaatgtggactatt 25249921  T
Q  247 ttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
    | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25249922 tcaaaatatggac-aaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgacaa 25249972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34839980 - 34839746
Alignment:
Q  62 atttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatg 161  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||   |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34839980 atttgactgttaagactaaaaacactat---aaaatgcgttatataaatgcagatgaagtgattttaaatgttgtaaaaatgcaagcggggacttaaatg 34839884  T
Q  162 caagataaaag-tttctaaatgattaaagac-gaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaac 259  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||       ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||    
T  34839883 caagataaaagttttttaaatgattaaagacaaaaaaacacaagttttaaatggtaaaaaaacgaataaaagaaaaagtggactatttcaaaatatggac 34839784  T
Q  260 aaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34839783 aaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 34839746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 4750002 - 4750257
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4750002 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 4750098  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |     
T  4750099 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaatctg 4750198  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
     ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4750199 aactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaa 4750257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 297
Target Start/End: Original strand, 19647456 - 19647573
Alignment:
Q  180 atgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtc 279  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||       |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19647456 atgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaacgaatagaagagaatgtggactatttcaaaatatggacaaaaaagattttaaatggtc 19647555  T
Q  280 caaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  19647556 caaatttggggtatgaca 19647573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 297
Target Start/End: Original strand, 26213046 - 26213168
Alignment:
Q  177 taaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnn--cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaa 274  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||         | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  26213046 taaatgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaaaacaaatagaagagaatgtggactatttttaaatatggacaaaaaagattttaaa 26213145  T
Q  275 cggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
     ||||||||||||| ||||||||    
T  26213146 tggtccaaatttggggtatgaca 26213168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 177 - 297
Target Start/End: Original strand, 26221801 - 26221923
Alignment:
Q  177 taaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnn--cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaa 274  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||         | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  26221801 taaatgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaaaacaaatagaagagaatgtggactatttttaaatatggacaaaaaagattttaaa 26221900  T
Q  275 cggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
     ||||||||||||| ||||||||    
T  26221901 tggtccaaatttggggtatgaca 26221923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16543357 - 16543171
Alignment:
Q  25 aaagtaatagaaatttacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgat 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16543357 aaagtaacagaaatttacgattagacattttaaaatgacttgactgttatgactaaaaagactat---aaaatgtgttataaaaatgcagatgaagtgat 16543261  T
Q  125 tttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16543260 tttaattgttgtaaaaatgcaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttttaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt 16543171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 214
Target Start/End: Original strand, 16622305 - 16622491
Alignment:
Q  25 aaagtaatagaaatttacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgat 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16622305 aaagtaacagaaatttacgattagacattttaaaatgacttgactgttatgactaaaaagactat---aaaatgtgttataaaaatgcagatgaagtgat 16622401  T
Q  125 tttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16622402 tttaattgttgtaaaaatgcaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttttaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt 16622491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17209032 - 17208773
Alignment:
Q  33 agaaatttacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattg 132  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  17209032 agaaatttacgattagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaaagacta-----aaatgtgttattaatatgcaaatgaagtgattttaattg 17208938  T
Q  133 ttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaaga 232  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||       |||||||||||    
T  17208937 ttgtaaaaatgcaagcggagacttaaatgcaagataaatttttttaaatgattaaagacgaaaaatatgagttttaaatggtaaaaaaacgaataaaaga 17208838  T
Q  233 gaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17208837 gaaagtggattattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 17208773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Original strand, 25729081 - 25729338
Alignment:
Q  40 tacgattagacatttt-aaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaa 138  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25729081 tacgattagacctttttaaaataacttgactgttacgactaaaaagactat---aaaatgcgttataaaaatgcagacgaagtgattttaattgttgtaa 25729177  T
Q  139 aaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacg-aaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatg 237  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||       ||||||||||||||||    
T  25729178 aaatgcaagcggggacttaattgcaagataaatttttttaaatgattaaagacgaaaaaacacgagttttaaatggt-aaaaaacgaataaaagagaatg 25729276  T
Q  238 tagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25729277 tgaactattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgacaat 25729338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 297
Target Start/End: Original strand, 36478295 - 36478495
Alignment:
Q  100 gttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaa-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaac 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36478295 gttataaaaatgcagatgaagtgattttaactgttgtaaaaaatgcaaacggtgacctaaatgcaagataaaagtttttaaatgattaaagacgaaaaac 36478394  T
Q  199 acaagttttatatggt--nnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgac 296  Q
    |||||||||| |||||         | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36478395 acaagttttaaatggtaaaaaaaagcaaatgaaagagaatgtagactattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgac 36478494  T
Q  297 a 297  Q
    |    
T  36478495 a 36478495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 299
Target Start/End: Original strand, 570806 - 571062
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  570806 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 570902  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |     
T  570903 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaatctg 571002  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
     ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  571003 aactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaat 571062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 297
Target Start/End: Original strand, 17599438 - 17599631
Alignment:
Q  104 taaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaag 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17599438 taaaaatgcagatgaagtgattttaactgttgtaaaaatgcaagcgggaacgtaaatgcaagataaaagtttttaaatggttaaagacgaaaaacacgag 17599537  T
Q  204 ttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||| |||||       |||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  17599538 ttttaaatggtaaaaaaacgaataaaatggagtgtggactattttaaaatatggacagaaaagattttaaatggtccaaaattggggtatgaca 17599631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 560897 - 561151
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  560897 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 560993  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |     
T  560994 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaatctg 561093  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
     ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  561094 aactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 561151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 299
Target Start/End: Original strand, 5210646 - 5210903
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  5210646 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 5210742  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||        ||||||||||||||| |    
T  5210743 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgaataaaagagaatct 5210842  T
Q  239 agactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
      ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5210843 gaactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaat 5210903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 5201517 - 5201772
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |||| |||||    
T  5201517 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttataaaa 5201613  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||        ||||||||||||||| |    
T  5201614 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgaataaaagagaatct 5201713  T
Q  239 agactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
      |||||   ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5201714 gaactatcaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 5201772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 299
Target Start/End: Original strand, 44077616 - 44077872
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtg-ttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aaaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  44077616 attagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagg---attataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtagaaaa 44077712  T
Q  142 tggaagcggggacttaaatgcaagataaaag---tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |    
T  44077713 tgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagttttttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggt-aaaaaacgaataaaagagaatct 44077811  T
Q  239 agactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
      ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44077812 gaactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaat 44077872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 27968351 - 27968608
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtg-ttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||    
T  27968351 cgattagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagg---attataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtagaa 27968447  T
Q  140 aatggaagcggggacttaaatgcaagataaaag----tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaa 235  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||    
T  27968448 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttttttaaatgattaatgacg-aaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaa 27968546  T
Q  236 tgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    | |  ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27968547 tctgaactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 27968608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 27977804 - 27978061
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtg-ttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||    
T  27977804 cgattagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagg---attataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtagaa 27977900  T
Q  140 aatggaagcggggacttaaatgcaagataaaag----tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaa 235  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||    
T  27977901 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttttttaaatgattaatgacg-aaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaa 27977999  T
Q  236 tgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    | |  ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27978000 tctgaactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 27978061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 40677755 - 40677509
Alignment:
Q  52 ttttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aaaatggaagcg 149  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  40677755 ttttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtagaaaatgcaagcg 40677659  T
Q  150 gggacttaaatgcaagataaaag---tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactatt 246  Q
     ||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||| ||||| |  ||||||    
T  40677658 aggacttaaatgcaagatgaaagttttttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggt-aaaaaacgaataaaaaagaatctgaactatt 40677560  T
Q  247 ttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
      ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  40677559 aaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 40677509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 299
Target Start/End: Original strand, 48504796 - 48505058
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtg-ttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aaaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  48504796 attagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagg---attataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtagaaaa 48504892  T
Q  142 tggaagcggggacttaaatgcaagataaaag-------tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagaga 234  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||       ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||       |||||||||||||    
T  48504893 tgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagttttttttttttaaatgattaatgacgaaaaacacaagttttaaaaggt-aaaaaacgaataaaagaga 48504991  T
Q  235 atgtagactatt--ttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
    || |  ||||||    ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  48504992 atctgaactattaaaaaaaatgtggacaaacaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaat 48505058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38247899 - 38247765
Alignment:
Q  164 agataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnn-cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaa 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||        |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  38247899 agataaaagtttttaaatgattaaagaagaaaaacgcgagttttaaatggtaaaaaaaacgaatagaagagaatgtggactatttcaaaatatggacaaa 38247800  T
Q  263 aaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38247799 aaagattttaaatggtccaaatttggggtatgaca 38247765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 298
Target Start/End: Original strand, 16149869 - 16150124
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaat 142  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||     
T  16149869 attagccattttaaaatggcttgcctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaattcaaatgaagtgattttaaatattgtaaaaaa 16149965  T
Q  143 --ggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
      | ||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||        || |||||||||||| |     
T  16149966 aagcaagcgaggacttaaatgccagatgaaagtctttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgcataaaagagaatctg 16150065  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
    ||||| | ||||||  | |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16150066 gactaatataaaatgcggacaagaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaa 16150124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 297
Target Start/End: Original strand, 16123130 - 16123384
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaat 142  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||     
T  16123130 attagccattttaaaatggcttgcctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaattcaaatgaagtgattttaaatattgtaaaaaa 16123226  T
Q  143 --ggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
      | ||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||        || |||||||||||| |     
T  16123227 aagcaagcgaggacttaaatgccagatgaaagtctttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgcataaaagagaatctg 16123326  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||| | ||||||  | |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16123327 gactaatataaaatgcggacaagaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 16123384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 38416571 - 38416372
Alignment:
Q  100 gttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaaca 199  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |   | ||||||||||||||||     
T  38416571 gttataagaatgcagaagaggtgattttaactattg-aaaaatgcaagcggggacttaaatgtaagataaaagttttttttttattaaagacgaaaaacg 38416473  T
Q  200 caagttttatatggtnnnnnnn-cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
    | ||||||  |||||        | |||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38416472 cgagttttgaatggtaaaaaaaacaaataaaagagaatgtgaactatttaacaatatggacaaatagaattttaaacggtccaaatttggggtatgacaa 38416373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16225336 - 16225261
Alignment:
Q  100 gttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagttt 175  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16225336 gttataaaaaagcagatgaattgattttaactgttgtaaaaatgcgagcggagacttaaatgcaagatgaaagttt 16225261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16242218 - 16242143
Alignment:
Q  100 gttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagttt 175  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16242218 gttataaaaaagcagatgaattgattttaactgttgtaaaaatgcgagcggagacttaaatgcaagatgaaagttt 16242143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38410922 - 38410724
Alignment:
Q  100 gttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatg-attaaagacgaaaaac 198  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |   |  ||||||||||||||||    
T  38410922 gttataagaatgcagaagaggtgattttaactattg-aaaaatgcaagcgggaacttaaatgcaagataaaagtttttttttttattaaagacgaaaaac 38410824  T
Q  199 acaagttttatatggtnnnnnnn-cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
     | ||||||  |||||        | |||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38410823 gcgagttttgaatggtaaaaaaaacaaataaaagagaatgtgaactatttaacaatatggacaaatagaattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 38410724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16242123 - 16242053
Alignment:
Q  222 cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtat 293  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16242123 cgaataaaagagaaagtggactattttaaaatacggataaaaa-gattttaaacggtccaaatttggggtat 16242053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 82
Target Start/End: Original strand, 20114142 - 20114180
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaa 82  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20114142 attagaccttttaaaatgatttgactgttatgactaaaa 20114180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 87
Target Start/End: Original strand, 36478227 - 36478270
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagact 87  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36478227 attagaccttttaaaatgacttgattgttatgactaaaaagact 36478270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 27433108 - 27433066
Alignment:
Q  260 aaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaatcat 302  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27433108 aaaaaaaattttaaacgggccaaatttggggtatgacaatcat 27433066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 35706 - 35457
Alignment:
Q  52 ttttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggg 151  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  35706 ttttaaaatgacttgactgttatgactaaaaagactat---aaaatgcgttataaaaatgcagatgtagtgattttaattgttgtaaaaatgcaagcgga 35610  T
Q  152 gacttaaatgcaagataaaag-tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgtagactatttta 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||        ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35609 gacttaaatgcaagataaaagttttttaaatgattaaagacgaaaaacacgagttttacatggtaaaaaaaacgaataaaagagaatgttgactatttta 35510  T
Q  250 aaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaatcat 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35509 aaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgacaatcat 35457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 55 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 61500 - 61259
Alignment:
Q  55 taaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggac 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  61500 taaaatgacttgactgttatgactaaaaagactat---aaaatgcgttataaaaatgcagatggagtgattttaattgttgtaaaaatgcaagcggagac 61404  T
Q  155 ttaaatgcaagataaaag-tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaa 252  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  61403 ttaaatgcaagataaaagatttttaaatgattaaagacgaaaaacacgagttttacatggtaaaaaaaacgaataaaagagaatgttgactattttaaaa 61304  T
Q  253 tatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  61303 tatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 61259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 145; Significance: 6e-76; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 40 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23090593 - 23090335
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaa 139  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23090593 tacgattggactttttaaaatgacttgactattatgactaaaaagactat---aaaatgtgttatataaatgcagatgaagtgattttaattgttgtaaa 23090497  T
Q  140 aatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt---nnnnnnncgaataaaagagaat 236  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||          |||||||||||||||    
T  23090496 aatgcaaacggggacttaaatgcaagataaaagtttttaaatgattaaagacgaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaaaaacgaataaaagagaat 23090397  T
Q  237 gtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
    || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23090396 gtggactactttaaaatatagacaaaaaagattttaaacggtccaaatttgaggtatgacaa 23090335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 286
Target Start/End: Original strand, 36578960 - 36579201
Alignment:
Q  43 gattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaat 142  Q
    ||||| || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  36578960 gattaaactttttaaaatgacttgattattatgactaaaaaga---ttataaaatgcgttataaaaatgcagatgaaataattttaattgttgtaaaagt 36579056  T
Q  143 ggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgtaga 241  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||        |||||||||||| |||| ||    
T  36579057 gcaagcggcgacttaaatgcaagataaaagtttttaaatgactaaagactaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaaacgaataaaagaggatgtgga 36579156  T
Q  242 ctattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaattt 286  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36579157 caattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaattt 36579201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 297
Target Start/End: Original strand, 16192948 - 16193202
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgac-taaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaa- 141  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||     
T  16192948 attagacattttaaaatgacttgcctgttatgacataaaaaga---ttataaaatgcgttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaaaa 16193044  T
Q  142 tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt--nnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
    || ||||| |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||         ||||||||||||||| |     
T  16193045 tgcaagcgaggacttaaatgcaaaaagaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaaacgaataaaagagaatctg 16193144  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16193145 gactattataaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 16193202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 299
Target Start/End: Original strand, 36255090 - 36255283
Alignment:
Q  105 aaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagt 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36255090 aaaaatgcatatgaagtgattttaactgttgtaaaaatactagcggggacttaaatgcaagat-aaagcttttaaatgattaaagacgaaaaacacaagt 36255188  T
Q  205 tttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
    |||| |||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  36255189 tttaaatggtaaaaaaacgaataaaagagaatgtggactattttaaaatatgaacaattttttttttaaacggtccaaatttagggtatgacaat 36255283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 286
Target Start/End: Original strand, 6585300 - 6585527
Alignment:
Q  63 tttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgc 162  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6585300 tttgactgttatgactaaaaacactat---aaaatgcgttataaaaatgcagattaagtgattttaattgttgtaaaaatgcaagcggggacttaaatgc 6585396  T
Q  163 aagataaaag------tttctaaatgattaaagacgaa-aaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatat 255  Q
    ||||||||||      ||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| || ||       ||||||| ||||||  | || |||||| ||||||    
T  6585397 aagataaaagtttttttttttaaatgattaaagacgaagaaacacgaattttaaatagtaaaaaaacgaataacagagaaaatggattatttttaaatat 6585496  T
Q  256 gaacaaaaaagattttaaacggtccaaattt 286  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6585497 ggacaaaaaagattttaaatggtccaaattt 6585527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25700243 - 25699999
Alignment:
Q  52 ttttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggg 151  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||| ||  | ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  25700243 ttttaaaatgacttgactattatgactaaaaaga---ttataaattgcataataaaaatgtagataaagtgattttaattgttgtaaaaatgcaagctgg 25700147  T
Q  152 gacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacga-aaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaa 250  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | || ||       ||||||| |||||| || || ||||||||    
T  25700146 ggcttaaatgcaagataaaagtttttaaatgactaaagacgaaaaaacacgagtttcaaatagtaaaaaaacgaataacagagaaagtggattattttaa 25700047  T
Q  251 aatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
    |||||| ||||      ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25700046 aatatggacaattttttttttaaacggtccaaatttggtgtatgacaa 25699999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19848891 - 19848734
Alignment:
Q  148 cggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaa---------gttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||         |||||| |||||       |||||||||||||||||    
T  19848891 cggggacttaaatgcaagataaaagtttttaaatgattaaagacgagaaagaaaatgaaaaggagttttaaatggtaaaaaa-cgaataaaagagaatgt 19848793  T
Q  239 agactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
     ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19848792 ggactattttaagatacggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtctgaca 19848734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36246840 - 36246766
Alignment:
Q  222 cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaa-gattttaaacggtccaaatttggagtatga 295  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36246840 cgaataaaagagaatgtggattattttaagatacggacaaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatga 36246766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 538 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 6638597 - 6638547
Alignment:
Q  538 gttcccaaattctctcacgaggtactgtgagaatatcagat-tgactttaa 587  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6638597 gttcccaaattctttcatgaggtactgtgagaacatcagatctgactttaa 6638547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16288659 - 16288404
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16288659 tacgattagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaaaga---ttataaaatgcgttataaaaatgcagatgaagtgattttaattgttgtaaa 16288563  T
Q  140 aatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacg-aaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||| | || ||       ||||||| |||||| ||    
T  16288562 aatgcaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttttaaatgactaaaaacgaaaaaacacgagtttcaaatagtaaaaaagcgaataacagagaaagt 16288463  T
Q  239 agactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16288462 ggactattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttgggatatgaca 16288404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31276563 - 31276311
Alignment:
Q  43 gattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaat 142  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31276563 gattagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaaaga---ttataaaatgcgttataaaaatacagatgaagtgatttaaattgttgtaaaaat 31276467  T
Q  143 ggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaa-aacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtaga 241  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  | ||||| || ||       ||||||| |||||| ||  |    
T  31276466 gcaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttataaatgattaaagacgaaagaacatgaattttaaatagt-aaaaaacgaataacagagaaagtgaa 31276368  T
Q  242 ctattttaaaatatgaac-aaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  31276367 ctattttaaaatatggacaaaaaaagattttaaacggtctaaatttagggtatgaca 31276311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12480225 - 12480030
Alignment:
Q  100 gttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaag---tttctaaatgattaaagacgaaaa 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| ||||    
T  12480225 gttataaaaatgcagatgaagtgattttaattgttgtaaaaatgcaagcggggacttaaatgcaaaataaaagttttttttaaatgattaaagacaaaaa 12480126  T
Q  197 acacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtat 293  Q
    |||||||||||| |||||       |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12480125 acacaagttttaaatggtaaaaaaacgaataaaagagaatgtgtactatttcaaaatatggac-aaaaagattttaaacggtccaaatttggggtat 12480030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 298
Target Start/End: Original strand, 17565259 - 17565512
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgac-taaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaa- 141  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||     
T  17565259 attagacattttaaaatgacttgcctgttatgacataaaaaga---ttataaaatgcgttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaaaa 17565355  T
Q  142 tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtaga 241  Q
    || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| | ||    
T  17565356 tgcaagcgaggacttaaatgcaaaatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaatctgga 17565455  T
Q  242 ctattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17565456 ctattataaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaa 17565512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Original strand, 1006817 - 1007073
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  1006817 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 1006913  T
Q  141 a--tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    |  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |    
T  1006914 aaatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaatct 1007013  T
Q  239 agactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
      ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1007014 gaactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaa 1007073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 10714644 - 10714900
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  10714644 cgattagccattttaaaatgacttgcctgctatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 10714740  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||        |||||||||| |||| |    
T  10714741 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgaataaaagggaatct 10714840  T
Q  239 agactattttaaaata-tgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
      ||||||  |||| | || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  10714841 gaactattaaaaaaaagtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 10714900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 208
Target Start/End: Original strand, 10723341 - 10723506
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  10723341 cgattagccattttaaaatgacttgcctgctatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 10723437  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagtttta 208  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10723438 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagtttta 10723506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25262431 - 25262240
Alignment:
Q  105 aaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagt 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  || || | |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  25262431 aaaaatacagatgaagtgattttaactgttgtaaaaagcga-gcagagacttaaatgcaagatgacagtttttaaatgattaaagacgacaaacacgagt 25262333  T
Q  205 tttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
    |||| |||||       |||||||||||| | || ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25262332 tttaaatggtaaaaaaacgaataaaagagcaggtggactattataaaatatggac-aaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaa 25262240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25271972 - 25271782
Alignment:
Q  105 aaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagt 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  || || | |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  25271972 aaaaatacagatgaagtgattttaactgttgtaaaaagcga-gcagagacttaaatgcaagatgacagtttttaaatgattaaagacgacaaacacgagt 25271874  T
Q  205 tttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||| |||||       |||||||||||| | || ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25271873 tttaaatggtaaaaaaacgaataaaagagcaggtggactattataaaatatggac-aaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 25271782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 297
Target Start/End: Original strand, 18533562 - 18533823
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtg-ttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aaaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  18533562 attagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagg---attataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtagaaaa 18533658  T
Q  142 tggaagcggggacttaaatgcaagataaaag---------tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaag 231  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||         ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||        ||||||||||    
T  18533659 tgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagttttttttttttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgaataaaag 18533758  T
Q  232 agaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    || | || ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18533759 agcaggtggactattataaaatatggac-aaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 18533823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 297
Target Start/End: Original strand, 29473523 - 29473784
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtg-ttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aaaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  29473523 attagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagg---attataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtagaaaa 29473619  T
Q  142 tggaagcggggacttaaatgcaagataaaag---------tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaag 231  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||         ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||        ||||||||||    
T  29473620 tgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagttttttttttttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgaataaaag 29473719  T
Q  232 agaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    || | || ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29473720 agcaggtggactattataaaatatggac-aaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 29473784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 297
Target Start/End: Original strand, 4506129 - 4506263
Alignment:
Q  164 agataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnn-cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaa 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||        | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4506129 agataaaagtttttaaatgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaaacaaatagaagagaatgtggactattttaaaatatggacaaa 4506228  T
Q  263 aaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4506229 aaagattttaaatggtccaaatttggggtatgaca 4506263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 297
Target Start/End: Original strand, 6296119 - 6296372
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaat 142  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||     
T  6296119 attagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaattcaaatgaagtgattttaaatattgtaaaaaa 6296215  T
Q  143 gg-aagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgtag 240  Q
     | ||||| |||||||||||| |||| ||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||        || |||||||||||| | |    
T  6296216 agcaagcgaggacttaaatgccagatgaaagcctttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgcataaaagagaatctgg 6296315  T
Q  241 actattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||| | ||||||  | |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6296316 actaatataaaatgcggacaagaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 6296372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 25262509 - 25262471
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaa 82  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25262509 attagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaa 25262471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 25272050 - 25272012
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaa 82  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25272050 attagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaa 25272012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27976324 - 27976288
Alignment:
Q  262 aaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27976324 aaaagattttaaacgggccaaatttggggtatgacaa 27976288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 297
Target Start/End: Original strand, 21720040 - 21720296
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaa 139  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21720040 tacgattagaccttttgaaatgatttgactgttatgactaaaaaga---ttataaaatgcgttataaaaatgcagatgaagtgattttaattgttgtaaa 21720136  T
Q  140 aatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacg--aaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatg 237  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||| | || ||       ||||||| |||||| |    
T  21720137 aatgcaagcggggacttaaattgaagataaaagtttttaaatgactaaagacgaaaaaaacacgagtttcaaatagtaaaaaaacgaataacagagaaag 21720236  T
Q  238 tagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21720237 tggactattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 21720296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25651709 - 25651467
Alignment:
Q  55 taaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggac 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25651709 taaaatgacttgactgttatgactaaaaagactat---aaaatgcgttataaaaatgcagatgaagtgattttaattgttgtaaaaatgcaagcggggac 25651613  T
Q  155 ttaaatgcaagataaaag---tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaa 251  Q
    |||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  25651612 ttaaatgcaaaataaaagttttttttaaatgattaaagacaaaaaacacaagttttaaatggtaaaaaaacgaataaaagagaatgtggactatttcaaa 25651513  T
Q  252 atatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25651512 atatggac-aaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgacaa 25651467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 297
Target Start/End: Original strand, 24491012 - 24491256
Alignment:
Q  52 ttttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggg 151  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24491012 ttttaaaatgacttgattattatgactaaaaaaa--actataaaatgcgttataaaaatgcagatgaagttattttgattgttgtaaaaatgcaagcggg 24491109  T
Q  152 gacttaaatgcaagataaaag-tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||       |||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  24491110 gacttaaatgcaagataaaagttttttaaatgtttaaagactaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaacgaataaaagaggatgtggacaattttaa 24491209  T
Q  251 aatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24491210 aatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 24491256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18841053 - 18840817
Alignment:
Q  55 taaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggac 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||     |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| | || |||||    
T  18841053 taaaatgacttgactgttatgactaaaaagactat---aaaatgcgttt----aatgcagatggagtgattttaactgttgtaaaaatgcatgcagggac 18840961  T
Q  155 ttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaat 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18840960 ttaaatgcaagataaaagtttttaaatgattaaagacaaaaaacacaagttttaaatggtaaaaaaaacgaataaaagagaatgtagactatttcaaaat 18840861  T
Q  254 atgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18840860 atggacaaaaaagattttaaatggtccaaatttggggtatgaca 18840817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16558127 - 16557872
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatga-tttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaa 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |    | ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  16558127 tacgattagactttttaaaatgactttgactgttatgactaaaatgcgt----tcaaa-gagttataaaaatgcacatgaagtgattttaactgttgcaa 16558033  T
Q  139 aaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||| ||| |       |||||||||||| | ||    
T  16558032 aaatgcaagctgggacttaaatgcaagataaaagtttttgaatgattaaagatgaaaaatacgagttttaaatgataaaaaaacgaataaaagagcaagt 16557933  T
Q  239 agactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16557932 ggactattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgacaat 16557872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16643122 - 16642867
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatga-tttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaa 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |    | ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  16643122 tacgattagactttttaaaatgactttgactgttatgactaaaatgcgt----tcaaa-gagttataaaaatgcacatgaagtgattttaactgttgcaa 16643028  T
Q  139 aaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||| ||| |       |||||||||||| | ||    
T  16643027 aaatgcaagctgggacttaaatgcaagataaaagtttttgaatgattaaagatgaaaaatacgagttttaaatgataaaaaaacgaataaaagagcaagt 16642928  T
Q  239 agactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16642927 ggactattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgacaat 16642867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16642310 - 16642113
Alignment:
Q  100 gttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaaca 199  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |    
T  16642310 gttataaaaatgcacatgaagtgattttaactgttgcaaaaatgcaagctgggacttaaatgcaagataaaagtttttgaatgattaaagatgaaaaata 16642211  T
Q  200 caagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    | ||||||| ||| |       |||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16642210 cgagttttaaatgataaaaaaacgaataaaagagcaagtggactattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 16642113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 27049673 - 27049927
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  27049673 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 27049769  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |     
T  27049770 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaatctg 27049869  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
     ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27049870 aactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 27049927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 27059917 - 27060171
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  27059917 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 27060013  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |     
T  27060014 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaatctg 27060113  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
     ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27060114 aactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 27060171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16586995 - 16586802
Alignment:
Q  105 aaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacg--aaaaacacaa 202  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| |    
T  16586995 aaaaatgtagatgaagtgattttaattgttgtaaaaatgcaagcggagacttaattgcaagataaaagttt-tgaatgattaaagacgaaaaaaacacga 16586897  T
Q  203 gttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||| ||  |       ||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16586896 gttttaaataataaaaaaacgaataacagagaaagtggactattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 16586802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 297
Target Start/End: Original strand, 16608385 - 16608578
Alignment:
Q  105 aaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacg--aaaaacacaa 202  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| |    
T  16608385 aaaaatgtagatgaagtgattttaattgttgtaaaaatgcaagcggagacttaattgcaagataaaagttt-tgaatgattaaagacgaaaaaaacacga 16608483  T
Q  203 gttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||| ||  |       ||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16608484 gttttaaataataaaaaaacgaataacagagaaagtggactattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 16608578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 299
Target Start/End: Original strand, 30997969 - 30998227
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||    
T  30997969 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtagaa 30998065  T
Q  140 aatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |     
T  30998066 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaatctg 30998165  T
Q  240 gactatt--ttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
     ||||||    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30998166 aactattaaaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaat 30998227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 159
Target Start/End: Original strand, 16305427 - 16305544
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaa-atgcagatgaaatgattttaattgttgtaa 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16305427 tacgattagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaaagactat---aaaatgcgttataaaaaatgcagatgaagtgattttaattgttgtaa 16305523  T
Q  139 aaatggaagcggggacttaaa 159  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  16305524 aaatgcaagcggggacttaaa 16305544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24918103 - 24917971
Alignment:
Q  164 agataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaa 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||        |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  24918103 agataaaagtttttaaatgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaatgaataaaagagaatgttgactattttaaaatatgg-caaaa 24918005  T
Q  264 aagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24918004 aagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 24917971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 177 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15140613 - 15140493
Alignment:
Q  177 taaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacg 276  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||       |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15140613 taaacgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaacgaatagaagagaatgtggactatttcaaaatatggacaaaaaagattttaaatg 15140514  T
Q  277 gtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  15140513 gtccaaatttggggtatgaca 15140493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 297
Target Start/End: Original strand, 28127561 - 28127679
Alignment:
Q  180 atgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnn-cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggt 278  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||        |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28127561 atgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaaacgaatagaagagaatgtggactatttcaaaatatggacaaaaaagattttaaatggt 28127660  T
Q  279 ccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  28127661 ccaaatttggggtatgaca 28127679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18124289 - 18124029
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtg-ttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aaaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||| | ||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  18124289 attagccattttaaaatgacttgcctgttgtgactaaaagg---attataaaatgcgtttataaaaatgtaaatggagtgattttaaatgttgtagaaaa 18124193  T
Q  142 tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttct-------aaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagaga 234  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |       |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       |||||||||||||    
T  18124192 tgcgagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttttttttaaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggt-aaaaaacgaataaaagaga 18124094  T
Q  235 atgtagactattttaaaatat--gaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    || |  ||||||  |||| ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18124093 atctgaactattaaaaaaaatgcggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 18124029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18109732 - 18109470
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtg-ttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aaaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||| | ||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  18109732 attagccattttaaaatgacttgcctgttgtgactaaaagg---attataaaatgcgtttataaaaatgtaaatggagtgattttaaatgttgtagaaaa 18109636  T
Q  142 tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttct-------aaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagaga 234  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |       |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       |||||||||||||    
T  18109635 tgcgagcgaggacttaaatgcaagatgaaagttttttttttaaaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggt-aaaaaacgaataaaagaga 18109537  T
Q  235 atgtagactattttaaaatat--gaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
    || |  ||||||  |||| ||  | ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  18109536 atctgaactattaaaaaaaatgcggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttgaggtatgacaat 18109470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 299
Target Start/End: Original strand, 16305592 - 16305631
Alignment:
Q  260 aaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16305592 aaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgacaat 16305631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24918182 - 24918133
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactat 89  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24918182 tacgattaaaccttttaaaatgacttgactgttatgactaacaagactat 24918133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 82
Target Start/End: Original strand, 23985123 - 23985161
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaa 82  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23985123 attagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaa 23985161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 299
Target Start/End: Original strand, 336467 - 336504
Alignment:
Q  262 aaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  336467 aaaagattttaaacgggccaaatttggggtatgacaat 336504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 82
Target Start/End: Original strand, 21361028 - 21361065
Alignment:
Q  45 ttagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaa 82  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21361028 ttagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaa 21361065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 82
Target Start/End: Original strand, 23965010 - 23965047
Alignment:
Q  45 ttagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaa 82  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23965010 ttagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaa 23965047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16087267 - 16087194
Alignment:
Q  222 cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||||||||| ||  || ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  16087267 cgaataaaagagaacgtgaaccattttaaaatatggac--aaaagatcttaaacggtccaaaattagggtatgaca 16087194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 63 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13306 - 13074
Alignment:
Q  63 tttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgc 162  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13306 tttgactgttaagactaaaaacactat---aaaatgcgttataaaaatgcatatgaagtgattttaaatgttgtaaaaatgcaagcggggacttaaatgc 13210  T
Q  163 aagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaa 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  13209 aagataaaagtttttaaatgattaaagacaaaaaacacaagttttaaatggtaaaaaaacgaataaaagagaatgtggactatttcaaaatatggacata 13110  T
Q  263 aaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13109 aaagattttaaacggtccaaatttggggtatgacaa 13074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 40 - 282
Target Start/End: Original strand, 49029 - 49269
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaa 139  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49029 tacgattcgaccttttaaaatgacttgactgttacgactaaaaagactat---aaaatgcgttataaaaatgcagatgaagtgattttaattgttgtaaa 49125  T
Q  140 aatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |        |||||||||||||||||    
T  49126 aatgcaagcggagacttaaatgcaagataaaagtttttaaatgattaaaaatgaaaaacacgagttttaaatgttaaaaaaaacgaataaaagagaatgt 49225  T
Q  239 agactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaa 282  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49226 ggactattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaa 49269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28479033 - 28478789
Alignment:
Q  52 ttttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggg 151  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28479033 ttttaaaatgacttgactgttatgactaaaaaga---ttataaaatgcgttataaaaatgcagatgaagtgattttaattgttgtaaaaatgcaagcggg 28478937  T
Q  152 gacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacga--aaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactatttta 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||| | || ||       ||||||| ||| || || ||||||||||    
T  28478936 gacttaaatgcaagataaaagtttttaaatgactaaagacgaaaaaaacacgagtttcaaatagtaaaaaaacgaataacagaaaaagtggactatttta 28478837  T
Q  250 aaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28478836 aaatatggtcaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 28478789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 105 - 297
Target Start/End: Original strand, 38611645 - 38611836
Alignment:
Q  105 aaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagt 204  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  38611645 aaaaatgcagatgaagtgatttcaattgttgtaaaaatgcaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttttaaacgattaaagacgaaaaacacgagt 38611744  T
Q  205 tttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||| |||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38611745 tttaaatggtaaaaaaacgaataaaagagaatgtggactattttaaaatatggac-aaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 38611836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21149140 - 21148922
Alignment:
Q  52 ttttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggg 151  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21149140 ttttaaaatgacttgactattatgactaaaaaga---ttataaaatgcataataaaaatgcagataaagtgattttaattgttgtaaaaatgcaagcggg 21149044  T
Q  152 gacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt---nnnnnnncgaataaaagagaatgtagactatttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||          ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21149043 gacttaaatgcaagataaaagtttttaaatgattaaagacgaaaaccatgagttttaaatggtaaaaaaaaaacgaataaaagagaatgtggactatttt 21148944  T
Q  249 aaaatatgaacaaaaaagattt 270  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  21148943 aaaatatggacaaaaaagattt 21148922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22185069 - 22184825
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||               ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22185069 tacgattagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaaaga---------------ttataaaaatgcaaatgaaatgattttaattgttgtaaa 22184985  T
Q  140 aatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacga-aaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatg 237  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||| | || ||         |||||| |||||| |    
T  22184984 aatgcaagcggcgacttaaatgcaagataaaagtttttaaacgactaaagacgaaaaaacacgagtttcaaatagtaaaaaaaatgaataacagagaaag 22184885  T
Q  238 tagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22184884 tggactattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 22184825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 299
Target Start/End: Original strand, 28475876 - 28476132
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  28475876 cgattagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 28475972  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |     
T  28475973 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaatctg 28476072  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
     ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28476073 aactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaat 28476132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 3757474 - 3757728
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  3757474 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 3757570  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||        ||||||||||||||| |     
T  3757571 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggaaaaaaaacgaataaaagagaatctg 3757670  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
     ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3757671 aactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 3757728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 297
Target Start/End: Original strand, 3767540 - 3767794
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaa 140  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  3767540 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 3767636  T
Q  141 a-tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||        ||||||||||||||| |     
T  3767637 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggaaaaaaaacgaataaaagagaatctg 3767736  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
     |||| |  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3767737 aactactaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 3767794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25256575 - 25256347
Alignment:
Q  68 ctgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaa-tggaagcggggacttaaatgcaag 165  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  25256575 ctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaaaatgcaagcgaggacttaaatgcaag 25256479  T
Q  166 ataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaa 265  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |  ||||||  ||||| || ||||||||    
T  25256478 atgaaagtttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgaataaaagagaatctgaactattaaaaaatgtggacaaaaaa 25256379  T
Q  266 gattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25256378 gatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 25256347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 299
Target Start/End: Original strand, 30527018 - 30527212
Alignment:
Q  105 aaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagt 204  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||  || || | |||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  30527018 aaaaatacagatgaagtgattttaactgttgtaaaaagcga-gcagagacttaaatgcaagatgacagtttttaaatggttaaagacgaaaaacacgagt 30527116  T
Q  205 tttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
    |||| |||||        |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30527117 tttaaatggtaaaaaaaacgaataaaagagcaggtagactattataaaatatggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaat 30527212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2650729 - 2650472
Alignment:
Q  42 cgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtg-ttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgt-aaa 139  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||    
T  2650729 cgattagccattttaaaatgacttgtctgttatgactaaaagg---attataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtaaaa 2650633  T
Q  140 aatggaagcggggacttaaatgcaagataaaag--tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaat 236  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | |||        |||||||||||||||    
T  2650632 aatgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttttaaatgattaatgac-aaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgaataaaagagaat 2650534  T
Q  237 gtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
     |  ||||||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2650533 ctgaactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaa 2650472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 297
Target Start/End: Original strand, 11649170 - 11649422
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaat 142  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||     
T  11649170 attagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaattcaaatgaagtgattttaaatattgtaaaaaa 11649266  T
Q  143 ggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgtaga 241  Q
    | ||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||        || |||||||||||| | ||    
T  11649267 gcaagcgaggacttaaatgccagatgaaagtctttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgcataaaagagaatctgga 11649366  T
Q  242 ctattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||| | ||||||  | |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11649367 ctaatataaaatgcggacaagaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 11649422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 299
Target Start/End: Original strand, 27683531 - 27683666
Alignment:
Q  164 agataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaa 263  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||       |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||     
T  27683531 agataaaagtttttaaatgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaacgaatagaagagaatgtggactatttcaaaatatggacaaag 27683630  T
Q  264 aagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27683631 aagattttaaatggtccaaatttggggtatgacaat 27683666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16281615 - 16281356
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaat 142  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||     
T  16281615 attagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaattcaaatgaagtgattttaaatattgtaaaaaa 16281519  T
Q  143 ---ggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttct----aaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt--nnnnnnncgaataaaagag 233  Q
       | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||          |||||||||||    
T  16281518 aaagcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaaatgaataaaagag 16281419  T
Q  234 aatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||| | ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16281418 aatctggactattataaaatatggac-aaaaagattttaaatggtccaaatttggggtatgaca 16281356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16272456 - 16272196
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaat 142  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||     
T  16272456 attagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaattcaaatgaagtgattttaaatattgtaaaaaa 16272360  T
Q  143 ---ggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttct----aaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt--nnnnnnncgaataaaagag 233  Q
       | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||          |||||||||||    
T  16272359 aaagcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaaatgaataaaagag 16272260  T
Q  234 aatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
    ||| |  |||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16272259 aatctgaactattataaaatatggac-aaaaagattttaaatggtccaaatttggggtatgacaa 16272196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29853031 - 29852777
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaa-tgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||| | || ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  29853031 attagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaaattcaaatgaagtgattttaaatattgtaaaaa 29852935  T
Q  142 t--ggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgta 239  Q
       | ||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       || |||||||||||| |     
T  29852934 aaagcaagcgaggacttaaatgccagatgaaagtctttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaacgcataaaagagaatctg 29852835  T
Q  240 gactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||| | ||||||  | |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29852834 gactaatataaaatgcggacaagaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 29852777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25261653 - 25261523
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtg-ttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aaaa 141  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  25261653 attagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagg---attataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtagaaaa 25261557  T
Q  142 tggaagcggggacttaaatgcaagataaaagttt 175  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25261556 tgcaagcgaggacttaaatgcaagatgaaagttt 25261523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 297
Target Start/End: Original strand, 31357263 - 31357398
Alignment:
Q  164 agataaaagtttct-aaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnn-cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaa 261  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||        |||||| || ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  31357263 agataaaagttttttaaatgattaaagaagaaaaacgcgagttttaaatggtaaaaaaaacgaatagaaaagaatgtggactatttcaaaatatggacaa 31357362  T
Q  262 aaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31357363 aaaagattttaaatggtccaaatttggggtatgaca 31357398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34434747 - 34434526
Alignment:
Q  88 attataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaag---------tttc 176  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||         |||     
T  34434747 attataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtagaaaatgcaagcgaggacttaaatgcaatatgaaagttttttttttttt 34434648  T
Q  177 taaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaac 275  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||        ||||||||||||||| |  ||||||  ||||| || ||||||||||||| |||     
T  34434647 taaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgaataaaagagaatctgaactattaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaat 34434548  T
Q  276 ggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  34434547 ggtccaaatttggggtatgaca 34434526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 297
Target Start/End: Original strand, 30694664 - 30694783
Alignment:
Q  178 aaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnn-cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacg 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||        | |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |    
T  30694664 aaatgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaaacaaatagaagagaatgtggactatttttaaatatggacaaaa-agattttaaatg 30694762  T
Q  277 gtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  30694763 gtccaaatttggggtatgaca 30694783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 82
Target Start/End: Original strand, 30526945 - 30526983
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaa 82  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30526945 attagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaa 30526983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 40 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 61014 - 60758
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  61014 tacgattagaccttttaaaatgacttgactgttatgactaaaaaga---ttataaaatgtgttataaaaatacagatgaagtgatttaaattgttgtaaa 60918  T
Q  140 aatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaa-aacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||| | || ||       ||||||| ||| |||||    
T  60917 aatgcaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttataaatgattaaagacgaaagaacacgaatttcaaatagt-aaaaaacgaataacagaaaatgt 60819  T
Q  239 agactattttaaaatatgaac-aaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
     ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  60818 ggactattttaaaatatggacaaaaaaagattttaaacggtccaaatttagggtatgacaa 60758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0853 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0853
Description:

Target: scaffold0853; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3326 - 3070
Alignment:
Q  40 tacgattagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaa 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    ||| |  ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  3326 tacgattagaccttttaaaatgacttgactgttatgattaaaaagactat----aaaagcattataaaaatgcaaatgaagtgatttgaattgttgtaaa 3231  T
Q  140 aatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttct--aaatgattaaagacgaaaaa-cacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaat 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||       |||||||||||||||    
T  3230 aatgcaagcggagacttaaatgcgagataaaagtttttttaaatgactaaagacgaaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaacgaataaaagagaat 3131  T
Q  237 gtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3130 gtggactactttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 3070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1380 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1380
Description:

Target: scaffold1380; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 552 - 320
Alignment:
Q  63 tttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgc 162  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||   |||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  552 tttgactgttaagactaaaaacactat---aaaacgcgttatataaatgcagatgaagtgattttaaatgttgtaaaaatgcaagcggggacttaaatgc 456  T
Q  163 aagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt--nnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaaca 260  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||     
T  455 aacataaaagtttttaaatgattaaagacaaaaaacacaagttttaaatggtaaaaaaaaacgaataaaagagaatgtggactatttcaaaatatggac- 357  T
Q  261 aaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  356 aaaaagattttaaacggtccaaatttggtgtatgaca 320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10818 - 10621
Alignment:
Q  100 gttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaaca 199  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |    
T  10818 gttataaaaatgcacatgaagtgattttaactgttgcaaaaatgcaagctgggacttaaatgcaagataaaagtttttgaatgattaaagatgaaaaata 10719  T
Q  200 caagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    | ||||||| ||| |       |||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10718 cgagttttaaatgataaaaaaacgaataaaagagcaagtggactattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 10621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0744 (Bit Score: 102; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0744
Description:

Target: scaffold0744; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4323 - 4071
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatg 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4323 attagacattttaaaatgacttgtctgttatgattaaaaaga---ttataaaatgcgttataagaattcaaatgaagtgattttaaatgttgtaaaaatg 4227  T
Q  144 gaagcggggacttaaatgcaagataaaag--tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtaga 241  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||| | |||        |||||||||||||| | ||    
T  4226 caagcgaggacttaaatgcaagatgaaagtttttttaaatgattaatgacgaaaaacaggagttttaaaaggtaaaaaaatgaataaaagagaatctgga 4127  T
Q  242 ctattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4126 ctattataaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 4071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 299
Target Start/End: Original strand, 860 - 1113
Alignment:
Q  55 taaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgttataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaatggaagcggggac 154  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  860 taaaatgacttgactattatgactaaaaagactataa--aattgcgttataaaaatgcagatgaagtgattttaattgttgtaaaaatgcaagcggggac 957  T
Q  155 ttaaatgcaagataaaag-----------tttctaaatgattaaagacgaa-aaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagac 242  Q
    ||||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||       ||||||| ||||||  | ||     
T  958 ttaaatgcaagataaaagttttttttttttttttaaatgattaaagacgaagaaacacaaattttaaatagt-aaaaaacgaataacagagaaaatggat 1056  T
Q  243 tattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaat 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1057 tattttaaaatatggacaaaaaagattttaaacggtccaaatttagggtatgacaat 1113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 504 - 653
Target Start/End: Original strand, 20515 - 20663
Alignment:
Q  504 agtaaatctatcaaaggggccataacaaatggctgttcccaaattctctcacgaggtactgtgagaatatcagatt-gactttaaattgaacataaagta 602  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||    
T  20515 agtaaatctatcaaaggagccataacaaatggttgttcccaaattctctt--gaggtactgtaagaatatcagatttgactttaaatcgaccatagagta 20612  T
Q  603 aaatgtctaaataattggccgtggaccataccttgtaccgtcagtacggcc 653  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20613 aaatgtctcaataattggccgtgtaccataccttataccgtcagtatggcc 20663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 415
Target Start/End: Original strand, 20307 - 20423
Alignment:
Q  298 atcatagaatatttgttatgattcaaaccagctatttcnnnnnnnnnnnnncaggaagagtgaagacccattttggtccctcacagagaacacggaggac 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||    
T  20307 atcatagaatatttgttatgattcaaaccagctatttcaaaaaaaataaa-cagaaagattgaagacccattttggtccctgacagaaaacctggaggac 20405  T
Q  398 aggttagtccctaacaaa 415  Q
    || |||||||||||||||    
T  20406 agattagtccctaacaaa 20423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2036 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold2036
Description:

Target: scaffold2036; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1030 - 781
Alignment:
Q  52 ttttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgta-aaaatggaagcg 149  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  1030 ttttaaattgacttgcctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaatgcaaatggagtgattttaaatgttgtagaaaatgtaagcg 934  T
Q  150 gggacttaaatgcaagataaaag------tttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnncgaataaaagagaatgtagact 243  Q
     ||||||||||||||||| ||||      ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||       ||||||||||||||| |  |||    
T  933 aggacttaaatgcaagatgaaagtttttttttttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggt-aaaaaacgaataaaagagaatctgaact 835  T
Q  244 attttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||  ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  834 attaaaaaatgtggacaaaaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgaca 781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 39811 - 39555
Alignment:
Q  44 attagacattttaaaatgatttgactgttatgactaaaaagactattataaaatgtgtt-ataaaaatgcagatgaaatgattttaattgttgtaaaaat 142  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||||  || ||||| ||||||||| | |||||||||     
T  39811 attagccattttaaaatgacttgcctgttatgactaaaagga---ttataaaatgcgtttataaaaaatcaaatgaagtgattttaaatattgtaaaaaa 39715  T
Q  143 ---ggaagcggggacttaaatgcaagataaaagtttctaaatgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggt-nnnnnnncgaataaaagagaatgt 238  Q
       | ||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||        || |||||||||||| |    
T  39714 aaagcaagcgaggacttaaatgccagatgaaagtctttaaatgattaatgacgaaaaacacgagttttaaaaggtaaaaaaaacgcataaaagagaatct 39615  T
Q  239 agactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgacaa 298  Q
     || || | ||||||  | |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39614 ggattaatataaaatgcggacaagaaagatttcaaatggtccaaatttggggtatgacaa 39555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0455 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0455
Description:

Target: scaffold0455; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 297
Target Start/End: Original strand, 6160 - 6278
Alignment:
Q  180 atgattaaagacgaaaaacacaagttttatatggtnnnnnnn-cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggt 278  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||        |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  6160 atgattaaagaagaaaaacacgagttttaaatggtaaaaaaaacgaatagaagagaatgtggactatttcaaaatatggacaaaaaagattttaaatggt 6259  T
Q  279 ccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  6260 ccaaatttggggtatgaca 6278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3074 - 3000
Alignment:
Q  222 cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3074 cgaataaaagagaatgtggactatttcaaaatatggacaaaaa-gattttaaacggtccaaatttggggtatgaca 3000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 297
Target Start/End: Original strand, 20596 - 20669
Alignment:
Q  222 cgaataaaagagaatgtagactattttaaaatatgaacaaaaaagattttaaacggtccaaatttggagtatgaca 297  Q
    |||||||||| ||| ||  || ||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20596 cgaataaaagggaacgtgaaccattttaaaatacggacaaaa--gattttaaacggtccaaaattggggtatgaca 20669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University